Methanoregula B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
formicica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
, O O O O
a O O O O
methane O O O O
- O O O O
producing O O O O
archaeon O O O O
isolated O O O O
from O O O O
methanogenic O O O O
sludge O O O O
. O O O O
    
A O O O O
novel O O O O
methane O O O O
- O O O O
producing O O O O
archaeon O O O O
, O O O O
strain O O O O
SMSP B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
an O O O O
anaerobic O O O O
, O O O O
propionate O O O O
- O O O O
degrading O O O O
enrichment O O O O
culture O O O O
that O O O O
was O O O O
originally O O O O
obtained O O O O
from O O O O
granular O O O O
sludge O O O O
in O O O O
a O O O O
mesophilic O O O O
upflow O O O O
anaerobic O O O O
sludge O O O O
blanket O O O O
( O O O O
UASB O O O O
) O O O O
reactor O O O O
used O O O O
to O O O O
treat O O O O
a O O O O
beer O O O O
brewery O O O O
effluent O O O O
. O O O O
    
Cells O O O O
were O O O O
non O O O O
- O O O O
motile O O O O
, O O O O
blunt O O O O
- O O O O
ended O O O O
, O O O O
straight O O O O
rods O O O O
, O O O O
1 O O O O
. O O O O
0 O O O O
- O O O O
2 O O O O
. O O O O
6 O O O O
mum O O O O
long O O O O
by O O O O
0 O O O O
. O O O O
5 O O O O
mum O O O O
wide O O O O
; O O O O
cells O O O O
were O O O O
sometimes O O O O
up O O O O
to O O O O
7 O O O O
mum O O O O
long O O O O
. O O O O
    
Asymmetrical O O O O
cell O O O O
division O O O O
was O O O O
observed O O O O
in O O O O
rod O O O O
- O O O O
shaped O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Coccoid O O O O
cells O O O O
( O O O O
0 O O O O
. O O O O
5 O O O O
- O O O O
1 O O O O
. O O O O
0 O O O O
mum O O O O
in O O O O
diameter O O O O
) O O O O
were O O O O
also O O O O
observed O O O O
in O O O O
mid O O O O
- O O O O
to O O O O
late O O O O
- O O O O
exponential O O O O
phase O O O O
cultures O O O O
. O O O O
    
Growth O O O O
was O O O O
observed O O O O
between O O O O
10 O O O O
and O O O O
40 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
( O O O O
optimum O O O O
, O O O O
30 O O O O
- O O O O
33 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
) O O O O
and O O O O
pH O O O O
7 O O O O
. O O O O
0 O O O O
and O O O O
7 O O O O
. O O O O
6 O O O O
( O O O O
optimum O O O O
, O O O O
pH O O O O
7 O O O O
. O O O O
4 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
G O O O O
+ O O O O
C O O O O
content O O O O
of O O O O
the O O O O
genomic O O O O
DNA O O O O
was O O O O
56 O O O O
. O O O O
2 O O O O
mol O O O O
% O O O O
. O O O O
    
The O O O O
strain O O O O
utilized O O O O
formate O O O O
and O O O O
hydrogen O O O O
for O O O O
growth O O O O
and O O O O
methane O O O O
production O O O O
. O O O O
    
Based O O O O
on O O O O
comparative O O O O
sequence O O O O
analyses O O O O
of O O O O
the O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
and O O O O
mcrA O O O O
( O O O O
encoding O O O O
the O O O O
alpha O O O O
subunit O O O O
of O O O O
methyl O O O O
- O O O O
coenzyme O O O O
M O O O O
reductase O O O O
, O O O O
a O O O O
key O O O O
enzyme O O O O
in O O O O
the O O O O
methane O O O O
- O O O O
producing O O O O
pathway O O O O
) O O O O
genes O O O O
, O O O O
strain O O O O
SMSP B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
affiliated O O O O
with O O O O
group O O O O
E1 O O O O
/ O O O O
E2 O O O O
within O O O O
the O O O O
order O O O O
Methanomicrobiales O O O O
. O O O O
    
The O O O O
closest O O O O
relative O O O O
based O O O O
on O O O O
both O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
and O O O O
mcrA O O O O
gene O O O O
sequences O O O O
was O O O O
Methanoregula B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
boonei O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
6A8 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
( O O O O
96 O O O O
. O O O O
3 O O O O
% O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
similarity O O O O
, O O O O
85 O O O O
. O O O O
4 O O O O
% O O O O
deduced O O O O
McrA O O O O
amino O O O O
acid O O O O
sequence O O O O
similarity O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
percentage O O O O
of O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
similarity O O O O
indicates O O O O
that O O O O
strain O O O O
SMSP B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Methanoregula B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
boonei O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
6A8 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
represent O O O O
different O O O O
species O O O O
within O O O O
the O O O O
same O O O O
genus O O O O
. O O O O
    
This O O O O
is O O O O
supported O O O O
by O O O O
our O O O O
findings O O O O
of O O O O
shared O O O O
phenotypic O O O O
properties O O O O
, O O O O
including O O O O
cell O O O O
morphology O O O O
and O O O O
growth O O O O
temperature O O O O
range O O O O
, O O O O
and O O O O
phenotypic O O O O
differences O O O O
in O O O O
substrate O O O O
usage O O O O
and O O O O
pH O O O O
range O O O O
. O O O O
    
Based O O O O
on O O O O
these O O O O
genetic O O O O
and O O O O
phenotypic O O O O
properties O O O O
, O O O O
we O O O O
propose O O O O
that O O O O
strain O O O O
SMSP B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
represents O O O O
a O O O O
novel O O O O
species O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Methanoregula O O O O
, O O O O
for O O O O
which O O O O
we O O O O
propose O O O O
the O O O O
name O O O O
Methanoregula B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
formicica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
, O O O O
with O O O O
the O O O O
type O O O O
strain O O O O
SMSP B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
= O O O O
NBRC O O O O
105244 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
DSM O O O O
22288 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Characterizing O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
the O O O O
microtubule O O O O
binding O O O O
protein O O O O
Bim1 O O O O
in O O O O
Cryptococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
neoformans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
During O O O O
sexual O O O O
development O O O O
the O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fungal O O O O
pathogen O O O O
Cryptococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
neoformans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
undergoes O O O O
a O O O O
developmental O O O O
transition O O O O
from O O O O
yeast O O O O
- O O O O
form O O O O
growth O O O O
to O O O O
filamentous O O O O
growth O O O O
. O O O O
    
This O O O O
transition O O O O
requires O O O O
cellular O O O O
restructuring O O O O
to O O O O
form O O O O
a O O O O
filamentous O O O O
dikaryon O O O O
. O O O O
    
Dikaryotic O O O O
growth O O O O
also O O O O
requires O O O O
tightly O O O O
controlled O O O O
nuclear O O O O
migration O O O O
to O O O O
ensure O O O O
faithful O O O O
replication O O O O
and O O O O
dissemination O O O O
of O O O O
genetic O O O O
material O O O O
to O O O O
spore O O O O
progeny O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
the O O O O
gross O O O O
morphological O O O O
changes O O O O
that O O O O
take O O O O
place O O O O
during O O O O
dikaryotic O O O O
growth O O O O
are O O O O
largely O O O O
known O O O O
, O O O O
the O O O O
molecular O O O O
underpinnings O O O O
that O O O O
control O O O O
this O O O O
process O O O O
are O O O O
uncharacterized O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
identify O O O O
and O O O O
characterize O O O O
a O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
neoformans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
homolog O O O O
of O O O O
the O O O O
Saccharomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cerevisiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
BIM1 O O O O
gene O O O O
, O O O O
and O O O O
establish O O O O
the O O O O
importance O O O O
of O O O O
BIM1 O O O O
for O O O O
proper O O O O
filamentous O O O O
growth O O O O
of O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
neoformans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Deletion O O O O
of O O O O
BIM1 O O O O
leads O O O O
to O O O O
truncated O O O O
sexual O O O O
development O O O O
filaments O O O O
, O O O O
a O O O O
severe O O O O
defect O O O O
in O O O O
diploid O O O O
formation O O O O
, O O O O
and O O O O
a O O O O
block O O O O
in O O O O
monokaryotic O O O O
fruiting O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
findings O O O O
lead O O O O
to O O O O
a O O O O
model O O O O
consistent O O O O
with O O O O
a O O O O
critical O O O O
role O O O O
for O O O O
BIM1 O O O O
in O O O O
both O O O O
filament O O O O
integrity O O O O
and O O O O
nuclear O O O O
congression O O O O
that O O O O
is O O O O
mediated O O O O
through O O O O
the O O O O
microtubule O O O O
cytoskeleton O O O O
. O O O O
    
Serinicoccus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
profundi O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
an O O O O
actinomycete O O O O
isolated O O O O
from O O O O
deep O O O O
- O O O O
sea O O O O
sediment O O O O
, O O O O
and O O O O
emended O O O O
description O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Serinicoccus O O O O
. O O O O
    
A O O O O
Gram O O O O
- O O O O
reaction O O O O
- O O O O
positive O O O O
bacterial O O O O
strain O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Serinicoccus O O O O
, O O O O
designated O O O O
MCCC B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
1A05965 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
, O O O O
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
a O O O O
deep O O O O
- O O O O
sea O O O O
( O O O O
5368 O O O O
m O O O O
) O O O O
sediment O O O O
of O O O O
the O O O O
Indian O O O O
Ocean O O O O
. O O O O
    
Comparison O O O O
of O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequences O O O O
revealed O O O O
that O O O O
the O O O O
isolate O O O O
shared O O O O
97 O O O O
. O O O O
6 O O O O
% O O O O
sequence O O O O
similarity O O O O
with O O O O
Serinicoccus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
marinus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
JC1078 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
, O O O O
the O O O O
type O O O O
strain O O O O
of O O O O
the O O O O
only O O O O
described O O O O
species O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Serinicoccus O O O O
. O O O O
    
The O O O O
DNA O O O O
- O O O O
DNA O O O O
relatedness O O O O
between O O O O
these O O O O
two O O O O
strains O O O O
was O O O O
46 O O O O
. O O O O
2 O O O O
% O O O O
( O O O O
standard O O O O
deviation O O O O
1 O O O O
. O O O O
86 O O O O
% O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
cell O O O O
wall O O O O
contained O O O O
alanine O O O O
, O O O O
glycine O O O O
, O O O O
serine O O O O
, O O O O
l O O O O
- O O O O
ornithine O O O O
and O O O O
glutamic O O O O
acid O O O O
, O O O O
which O O O O
corresponds O O O O
to O O O O
the O O O O
description O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Serinicoccus O O O O
. O O O O
    
The O O O O
acyl O O O O
type O O O O
of O O O O
the O O O O
glycan O O O O
chain O O O O
of O O O O
the O O O O
peptidoglycan O O O O
was O O O O
glycolyl O O O O
. O O O O
    
Other O O O O
characteristics O O O O
of O O O O
strain O O O O
MCCC B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
1A05965 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
were O O O O
consistent O O O O
with O O O O
those O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Serinicoccus O O O O
. O O O O
    
Cells O O O O
were O O O O
coccoid O O O O
, O O O O
moderately O O O O
halophilic O O O O
, O O O O
oxidase O O O O
- O O O O
negative O O O O
, O O O O
catalase O O O O
- O O O O
positive O O O O
and O O O O
non O O O O
- O O O O
spore O O O O
- O O O O
forming O O O O
. O O O O
    
The O O O O
major O O O O
menaquinone O O O O
was O O O O
MK O O O O
- O O O O
8 O O O O
( O O O O
H O O O O
( O O O O
4 O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
predominant O O O O
cellular O O O O
fatty O O O O
acids O O O O
were O O O O
iso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
15 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
( O O O O
34 O O O O
. O O O O
7 O O O O
% O O O O
) O O O O
and O O O O
iso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
16 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
( O O O O
17 O O O O
. O O O O
0 O O O O
% O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
polar O O O O
lipids O O O O
were O O O O
phosphatidylglycerol O O O O
, O O O O
diphosphatidylglycerol O O O O
, O O O O
phosphatidylcholine O O O O
, O O O O
phosphatidylinositol O O O O
and O O O O
an O O O O
unknown O O O O
glycolipid O O O O
. O O O O
    
The O O O O
DNA O O O O
G O O O O
+ O O O O
C O O O O
content O O O O
was O O O O
72 O O O O
mol O O O O
% O O O O
. O O O O
    
Strain O O O O
MCCC B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
1A05965 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
( O O O O
= O O O O
0714S6 O O O O
- O O O O
1 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
DSM O O O O
21363 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
CGMCC O O O O
4 O O O O
. O O O O
5582 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
is O O O O
assigned O O O O
as O O O O
the O O O O
type O O O O
strain O O O O
of O O O O
a O O O O
novel O O O O
species O O O O
, O O O O
for O O O O
which O O O O
the O O O O
name O O O O
Serinicoccus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
profundi O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
is O O O O
proposed O O O O
. O O O O
    
Proposal O O O O
of O O O O
Mingxiaea O O O O
gen O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
for O O O O
the O O O O
anamorphic O O O O
basidiomycetous O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
species O O O O
in O O O O
the O O O O
Bulleribasidium O O O O
clade O O O O
( O O O O
Tremellales O O O O
) O O O O
based O O O O
on O O O O
molecular O O O O
phylogenetic O O O O
analysis O O O O
, O O O O
with O O O O
six O O O O
new O O O O
combinations O O O O
and O O O O
four O O O O
novel O O O O
species O O O O
. O O O O
    
The O O O O
distinction O O O O
and O O O O
monophyletic O O O O
property O O O O
of O O O O
the O O O O
basidiomycetous O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
species O O O O
in O O O O
the O O O O
Bulleribasidium O O O O
clade O O O O
of O O O O
the O O O O
order O O O O
Tremellales O O O O
was O O O O
resolved O O O O
by O O O O
molecular O O O O
phylogenetic O O O O
analysis O O O O
based O O O O
on O O O O
the O O O O
combined O O O O
sequences O O O O
of O O O O
the O O O O
18S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
, O O O O
internal O O O O
transcribed O O O O
spacer O O O O
( O O O O
ITS O O O O
) O O O O
region O O O O
including O O O O
5 O O O O
. O O O O
8S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
and O O O O
26S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
D1 O O O O
/ O O O O
D2 O O O O
domain O O O O
. O O O O
    
The O O O O
addition O O O O
to O O O O
the O O O O
clade O O O O
of O O O O
new O O O O
anamorphic O O O O
species O O O O
identified O O O O
among O O O O
ballistoconidium O O O O
- O O O O
forming O O O O
yeasts B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
isolated O O O O
from O O O O
China O O O O
confirmed O O O O
and O O O O
strengthened O O O O
the O O O O
separation O O O O
of O O O O
this O O O O
clade O O O O
from O O O O
other O O O O
clades O O O O
or O O O O
lineages O O O O
in O O O O
the O O O O
order O O O O
Tremellales O O O O
. O O O O
    
A O O O O
new O O O O
anamorphic O O O O
genus O O O O
, O O O O
Mingxiaea O O O O
gen O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
    
( O O O O
type O O O O
species O O O O
Mingxiaea O O O O
variabilis O O O O
comb O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
) O O O O
is O O O O
therefore O O O O
proposed O O O O
to O O O O
accommodate O O O O
the O O O O
anamorphic O O O O
species O O O O
in O O O O
the O O O O
Bulleribasidium O O O O
clade O O O O
. O O O O
    
Six O O O O
new O O O O
combinations O O O O
are O O O O
proposed O O O O
for O O O O
the O O O O
described O O O O
species O O O O
of O O O O
this O O O O
clade O O O O
which O O O O
were O O O O
formerly O O O O
assigned O O O O
to O O O O
the O O O O
genus O O O O
Bullera O O O O
. O O O O
    
Four O O O O
novel O O O O
species O O O O
in O O O O
the O O O O
new O O O O
genus O O O O
were O O O O
identified O O O O
among O O O O
16 O O O O
ballistoconidium O O O O
- O O O O
forming O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
strains O O O O
isolated O O O O
from O O O O
plant O O O O
leaves O O O O
collected O O O O
in O O O O
Hainan O O O O
province O O O O
, O O O O
southern O O O O
China O O O O
, O O O O
by O O O O
D1 O O O O
/ O O O O
D2 O O O O
and O O O O
ITS O O O O
sequence O O O O
analyses O O O O
. O O O O
    
The O O O O
novel O O O O
species O O O O
are O O O O
described O O O O
as O O O O
Mingxiaea O O O O
sanyaensis O O O O
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
    
( O O O O
type O O O O
strain O O O O
SY O O O O
- O O O O
3 O O O O
. O O O O
23 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
AS O O O O
2 O O O O
. O O O O
3623 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
CBS O O O O
11408 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
, O O O O
Mingxiaea O O O O
hainanensis O O O O
( O O O O
type O O O O
strain O O O O
WZS O O O O
- O O O O
8 O O O O
. O O O O
13 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
AS O O O O
2 O O O O
. O O O O
4161 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
CBS O O O O
11409 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
, O O O O
Mingxiaea O O O O
foliicola O O O O
( O O O O
type O O O O
strain O O O O
WZS O O O O
- O O O O
8 O O O O
. O O O O
14 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
AS O O O O
2 O O O O
. O O O O
3518 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
CBS O O O O
11407 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
and O O O O
Mingxiaea O O O O
wuzhishanensis O O O O
( O O O O
type O O O O
strain O O O O
WZS O O O O
- O O O O
29 O O O O
. O O O O
8 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
AS O O O O
2 O O O O
. O O O O
4163 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
CBS O O O O
11411 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Scardovia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
wiggsiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
, O O O O
isolated O O O O
from O O O O
the O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
oral O O O O
cavity O O O O
and O O O O
clinical O O O O
material O O O O
, O O O O
and O O O O
emended O O O O
descriptions O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Scardovia O O O O
and O O O O
Scardovia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
inopinata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Six O O O O
strains O O O O
of O O O O
anaerobic O O O O
, O O O O
pleomorphic O O O O
Gram O O O O
- O O O O
positive O O O O
bacilli O O O O
, O O O O
isolated O O O O
from O O O O
the O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
oral O O O O
cavity O O O O
and O O O O
an O O O O
infected O O O O
arm O O O O
wound O O O O
, O O O O
were O O O O
subjected O O O O
to O O O O
a O O O O
comprehensive O O O O
range O O O O
of O O O O
phenotypic O O O O
and O O O O
genotypic O O O O
tests O O O O
and O O O O
were O O O O
found O O O O
to O O O O
comprise O O O O
a O O O O
homogeneous O O O O
group O O O O
. O O O O
    
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
analysis O O O O
revealed O O O O
that O O O O
the O O O O
isolates O O O O
were O O O O
most O O O O
closely O O O O
related O O O O
to O O O O
Scardovia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
inopinata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
CCUG O O O O
35729 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
( O O O O
94 O O O O
. O O O O
8 O O O O
- O O O O
94 O O O O
. O O O O
9 O O O O
% O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
similarity O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
isolates O O O O
were O O O O
saccharolytic O O O O
and O O O O
produced O O O O
acetic O O O O
and O O O O
lactic O O O O
acids O O O O
as O O O O
end O O O O
products O O O O
of O O O O
fermentation O O O O
. O O O O
    
The O O O O
major O O O O
fatty O O O O
acids O O O O
were O O O O
C O O O O
( O O O O
16 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
( O O O O
49 O O O O
. O O O O
8 O O O O
% O O O O
) O O O O
and O O O O
C O O O O
( O O O O
18 O O O O
: O O O O
1 O O O O
) O O O O
omega9c O O O O
( O O O O
35 O O O O
. O O O O
8 O O O O
% O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Polar O O O O
lipid O O O O
analysis O O O O
revealed O O O O
a O O O O
variety O O O O
of O O O O
glycolipids O O O O
, O O O O
diphosphatidylglycerol O O O O
, O O O O
an O O O O
unidentified O O O O
phospholipid O O O O
and O O O O
an O O O O
unidentified O O O O
phosphoglycolipid O O O O
. O O O O
    
No O O O O
respiratory O O O O
quinones O O O O
were O O O O
detected O O O O
. O O O O
    
The O O O O
peptidoglycan O O O O
was O O O O
of O O O O
the O O O O
type O O O O
A4alpha O O O O
L O O O O
- O O O O
Lys O O O O
- O O O O
Thr O O O O
- O O O O
Glu O O O O
, O O O O
with O O O O
L O O O O
- O O O O
lysine O O O O
partially O O O O
replaced O O O O
by O O O O
L O O O O
- O O O O
ornithine O O O O
. O O O O
    
The O O O O
DNA O O O O
G O O O O
+ O O O O
C O O O O
content O O O O
of O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
strains O O O O
, O O O O
C1A O O O O
_ O O O O
55 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
( O O O O
, O O O O
) O O O O
was O O O O
55 O O O O
mol O O O O
% O O O O
. O O O O
    
A O O O O
novel O O O O
species O O O O
, O O O O
Scardovia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
wiggsiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
, O O O O
is O O O O
proposed O O O O
to O O O O
accommodate O O O O
the O O O O
six O O O O
isolates O O O O
, O O O O
with O O O O
the O O O O
type O O O O
strain O O O O
C1A O O O O
_ O O O O
55 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
( O O O O
= O O O O
DSM O O O O
22547 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
CCUG O O O O
58090 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Flavobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ponti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
isolated O O O O
from O O O O
seawater O O O O
. O O O O
    
A O O O O
Gram O O O O
- O O O O
stain O O O O
- O O O O
negative O O O O
, O O O O
non O O O O
- O O O O
flagellated O O O O
, O O O O
non O O O O
- O O O O
gliding O O O O
, O O O O
yellow O O O O
- O O O O
pigmented O O O O
and O O O O
rod O O O O
- O O O O
shaped O O O O
bacterial O O O O
strain O O O O
, O O O O
designated O O O O
GSW B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
R14 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
, O O O O
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
seawater O O O O
of O O O O
Geoje O O O O
Island O O O O
in O O O O
the O O O O
South O O O O
Sea O O O O
, O O O O
Korea O O O O
. O O O O
    
Strain O O O O
GSW B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
R14 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
grew O O O O
optimally O O O O
at O O O O
25 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
, O O O O
at O O O O
pH O O O O
7 O O O O
. O O O O
0 O O O O
- O O O O
8 O O O O
. O O O O
0 O O O O
and O O O O
in O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
2 O O O O
% O O O O
( O O O O
w O O O O
/ O O O O
v O O O O
) O O O O
NaCl O O O O
. O O O O
    
Phylogenetic O O O O
analyses O O O O
based O O O O
on O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequences O O O O
showed O O O O
that O O O O
strain O O O O
GSW B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
R14 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
belonged O O O O
to O O O O
the O O O O
genus O O O O
Flavobacterium O O O O
, O O O O
joining O O O O
Flavobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
gelidilacus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
LMG O O O O
21477 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
by O O O O
a O O O O
bootstrap O O O O
resampling O O O O
value O O O O
of O O O O
100 O O O O
% O O O O
. O O O O
    
Strain O O O O
GSW B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
R14 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
exhibited O O O O
97 O O O O
. O O O O
6 O O O O
% O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
similarity O O O O
to O O O O
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gelidilacus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
LMG O O O O
21477 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
and O O O O
similarities O O O O
of O O O O
91 O O O O
. O O O O
2 O O O O
- O O O O
95 O O O O
. O O O O
2 O O O O
% O O O O
to O O O O
other O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Flavobacterium O O O O
. O O O O
    
Strain O O O O
GSW B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
R14 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
contained O O O O
MK O O O O
- O O O O
6 O O O O
as O O O O
the O O O O
predominant O O O O
menaquinone O O O O
. O O O O
    
The O O O O
fatty O O O O
acid O O O O
profile O O O O
of O O O O
strain O O O O
GSW B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
R14 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
was O O O O
similar O O O O
to O O O O
that O O O O
of O O O O
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gelidilacus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
LMG O O O O
21477 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
DNA O O O O
G O O O O
+ O O O O
C O O O O
content O O O O
of O O O O
strain O O O O
GSW B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
R14 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
was O O O O
31 O O O O
. O O O O
4 O O O O
mol O O O O
% O O O O
and O O O O
its O O O O
DNA O O O O
- O O O O
DNA O O O O
relatedness O O O O
with O O O O
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gelidilacus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
LMG O O O O
21477 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
was O O O O
31 O O O O
% O O O O
. O O O O
    
Strain O O O O
GSW B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
R14 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
could O O O O
be O O O O
distinguished O O O O
from O O O O
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gelidilacus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
the O O O O
other O O O O
species O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Flavobacterium O O O O
by O O O O
its O O O O
phylogenetic O O O O
and O O O O
genetic O O O O
distinctiveness O O O O
and O O O O
by O O O O
several O O O O
phenotypic O O O O
properties O O O O
. O O O O
    
On O O O O
the O O O O
basis O O O O
of O O O O
these O O O O
data O O O O
, O O O O
strain O O O O
GSW B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
R14 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
is O O O O
considered O O O O
to O O O O
represent O O O O
a O O O O
novel O O O O
species O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Flavobacterium O O O O
, O O O O
for O O O O
which O O O O
the O O O O
name O O O O
Flavobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ponti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
    
is O O O O
proposed O O O O
; O O O O
the O O O O
type O O O O
strain O O O O
is O O O O
GSW B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
R14 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
( O O O O
= O O O O
KCTC O O O O
22802 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
CCUG O O O O
58402 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Thermasporomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
composti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gen O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
a O O O O
thermophilic O O O O
actinomycete O O O O
isolated O O O O
from O O O O
compost O O O O
. O O O O
    
A O O O O
thermophilic O O O O
, O O O O
Gram O O O O
- O O O O
positive O O O O
bacterium O O O O
that O O O O
formed O O O O
a O O O O
branched O O O O
vegetative O O O O
mycelium O O O O
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
compost O O O O
. O O O O
    
The O O O O
strain O O O O
, O O O O
designated O O O O
I3 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
, O O O O
grew O O O O
at O O O O
temperatures O O O O
between O O O O
35 O O O O
and O O O O
62 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
, O O O O
with O O O O
optimum O O O O
growth O O O O
at O O O O
50 O O O O
- O O O O
55 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
. O O O O
    
No O O O O
growth O O O O
was O O O O
observed O O O O
below O O O O
29 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
or O O O O
above O O O O
65 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
. O O O O
    
The O O O O
pH O O O O
range O O O O
for O O O O
growth O O O O
was O O O O
5 O O O O
. O O O O
7 O O O O
- O O O O
10 O O O O
. O O O O
0 O O O O
, O O O O
the O O O O
pH O O O O
for O O O O
optimum O O O O
growth O O O O
was O O O O
7 O O O O
. O O O O
0 O O O O
and O O O O
no O O O O
growth O O O O
was O O O O
observed O O O O
below O O O O
pH O O O O
5 O O O O
. O O O O
6 O O O O
or O O O O
above O O O O
pH O O O O
10 O O O O
. O O O O
8 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
DNA O O O O
G O O O O
+ O O O O
C O O O O
content O O O O
of O O O O
strain O O O O
I3 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
was O O O O
69 O O O O
. O O O O
2 O O O O
mol O O O O
% O O O O
. O O O O
    
The O O O O
major O O O O
fatty O O O O
acids O O O O
found O O O O
were O O O O
C O O O O
( O O O O
15 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
iso O O O O
( O O O O
14 O O O O
. O O O O
2 O O O O
% O O O O
) O O O O
, O O O O
C O O O O
( O O O O
15 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
anteiso O O O O
( O O O O
12 O O O O
. O O O O
1 O O O O
% O O O O
) O O O O
, O O O O
C O O O O
( O O O O
17 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
iso O O O O
( O O O O
16 O O O O
. O O O O
3 O O O O
% O O O O
) O O O O
and O O O O
C O O O O
( O O O O
17 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
anteiso O O O O
( O O O O
21 O O O O
. O O O O
7 O O O O
% O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
major O O O O
menaquinones O O O O
were O O O O
MK O O O O
- O O O O
9 O O O O
( O O O O
H O O O O
( O O O O
4 O O O O
) O O O O
) O O O O
, O O O O
MK O O O O
- O O O O
10 O O O O
( O O O O
H O O O O
( O O O O
4 O O O O
) O O O O
) O O O O
and O O O O
MK O O O O
- O O O O
11 O O O O
( O O O O
H O O O O
( O O O O
4 O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
cell O O O O
wall O O O O
contained O O O O
glutamic O O O O
acid O O O O
, O O O O
glycine O O O O
, O O O O
alanine O O O O
and O O O O
ll O O O O
- O O O O
diaminopimelic O O O O
acid O O O O
in O O O O
a O O O O
molar O O O O
ratio O O O O
of O O O O
1 O O O O
. O O O O
0 O O O O
: O O O O
3 O O O O
. O O O O
9 O O O O
: O O O O
0 O O O O
. O O O O
6 O O O O
: O O O O
0 O O O O
. O O O O
5 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
polar O O O O
lipids O O O O
consisted O O O O
of O O O O
ninhydrin O O O O
- O O O O
positive O O O O
phosphoglycolipids O O O O
, O O O O
phosphatidylglycerol O O O O
, O O O O
diphosphatidylglycerol O O O O
and O O O O
an O O O O
unknown O O O O
glycolipid O O O O
. O O O O
    
The O O O O
cell O O O O
- O O O O
wall O O O O
sugars O O O O
were O O O O
rhamnose O O O O
and O O O O
arabinose O O O O
. O O O O
    
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
analysis O O O O
assigned O O O O
this O O O O
actinomycete O O O O
to O O O O
the O O O O
family O O O O
Nocardioidaceae O O O O
, O O O O
but O O O O
its O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
shared O O O O
no O O O O
more O O O O
than O O O O
95 O O O O
. O O O O
5 O O O O
% O O O O
similarity O O O O
with O O O O
those O O O O
of O O O O
other O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
family O O O O
. O O O O
    
The O O O O
chemotaxonomic O O O O
and O O O O
phenotypic O O O O
characteristics O O O O
of O O O O
strain O O O O
I3 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
differed O O O O
in O O O O
some O O O O
respects O O O O
from O O O O
those O O O O
of O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Actinopolymorpha O O O O
, O O O O
the O O O O
most O O O O
closely O O O O
related O O O O
genus O O O O
. O O O O
    
Therefore O O O O
, O O O O
strain O O O O
I3 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
represents O O O O
a O O O O
novel O O O O
species O O O O
in O O O O
a O O O O
new O O O O
genus O O O O
of O O O O
the O O O O
family O O O O
Nocardioidaceae O O O O
, O O O O
for O O O O
which O O O O
the O O O O
name O O O O
Thermasporomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
composti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gen O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
    
is O O O O
proposed O O O O
. O O O O
    
The O O O O
type O O O O
strain O O O O
of O O O O
the O O O O
type O O O O
species O O O O
is O O O O
I3 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
( O O O O
= O O O O
JCM B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
16421 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
= O O O O
DSM O O O O
22891 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Phycicoccus O O O O
cremeus O O O O
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
, O O O O
isolated O O O O
from O O O O
forest O O O O
soil O O O O
, O O O O
and O O O O
emended O O O O
description O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Phycicoccus O O O O
. O O O O
    
A O O O O
bacterial O O O O
strain O O O O
, O O O O
designated O O O O
V2M29 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
, O O O O
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
forest O O O O
soil O O O O
collected O O O O
in O O O O
the O O O O
Changbai O O O O
Mountains O O O O
, O O O O
Heilongjiang O O O O
Province O O O O
, O O O O
China O O O O
. O O O O
    
Cells O O O O
of O O O O
strain O O O O
V2M29 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
were O O O O
Gram O O O O
- O O O O
positive O O O O
, O O O O
rod O O O O
- O O O O
shaped O O O O
( O O O O
0 O O O O
. O O O O
5 O O O O
- O O O O
0 O O O O
. O O O O
8 O O O O
mum O O O O
in O O O O
diameter O O O O
and O O O O
1 O O O O
. O O O O
5 O O O O
- O O O O
2 O O O O
. O O O O
0 O O O O
mum O O O O
in O O O O
length O O O O
) O O O O
, O O O O
strictly O O O O
aerobic O O O O
and O O O O
non O O O O
- O O O O
motile O O O O
. O O O O
    
Colonies O O O O
produced O O O O
on O O O O
R2A O O O O
agar O O O O
plates O O O O
were O O O O
creamy O O O O
, O O O O
smooth O O O O
, O O O O
circular O O O O
and O O O O
0 O O O O
. O O O O
3 O O O O
- O O O O
0 O O O O
. O O O O
8 O O O O
mm O O O O
in O O O O
diameter O O O O
. O O O O
    
Strain O O O O
V2M29 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
grew O O O O
at O O O O
14 O O O O
- O O O O
35 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
( O O O O
optimum O O O O
, O O O O
29 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
) O O O O
, O O O O
at O O O O
pH O O O O
4 O O O O
. O O O O
1 O O O O
- O O O O
10 O O O O
. O O O O
0 O O O O
( O O O O
optimum O O O O
, O O O O
pH O O O O
7 O O O O
. O O O O
0 O O O O
- O O O O
8 O O O O
. O O O O
0 O O O O
) O O O O
and O O O O
in O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
0 O O O O
- O O O O
7 O O O O
. O O O O
0 O O O O
% O O O O
( O O O O
w O O O O
/ O O O O
v O O O O
) O O O O
NaCl O O O O
( O O O O
optimum O O O O
, O O O O
0 O O O O
- O O O O
2 O O O O
. O O O O
0 O O O O
% O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Strain O O O O
V2M29 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
contained O O O O
MK O O O O
- O O O O
8 O O O O
( O O O O
H O O O O
( O O O O
4 O O O O
) O O O O
) O O O O
as O O O O
the O O O O
major O O O O
respiratory O O O O
quinone O O O O
and O O O O
iso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
15 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
( O O O O
20 O O O O
. O O O O
9 O O O O
% O O O O
) O O O O
, O O O O
iso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
16 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
( O O O O
18 O O O O
. O O O O
5 O O O O
% O O O O
) O O O O
, O O O O
C O O O O
( O O O O
17 O O O O
: O O O O
1 O O O O
) O O O O
omega8c O O O O
( O O O O
16 O O O O
. O O O O
7 O O O O
% O O O O
) O O O O
and O O O O
10 O O O O
- O O O O
methyl O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
17 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
( O O O O
9 O O O O
. O O O O
2 O O O O
% O O O O
) O O O O
as O O O O
the O O O O
major O O O O
cellular O O O O
fatty O O O O
acids O O O O
. O O O O
    
The O O O O
cell O O O O
- O O O O
wall O O O O
peptidoglycan O O O O
type O O O O
was O O O O
based O O O O
on O O O O
meso O O O O
- O O O O
2 O O O O
, O O O O
6 O O O O
- O O O O
diaminopimelic O O O O
acid O O O O
and O O O O
the O O O O
acyl O O O O
type O O O O
of O O O O
the O O O O
muramic O O O O
acid O O O O
was O O O O
acetyl O O O O
. O O O O
    
Diphosphatidylglycerol O O O O
, O O O O
phosphatidylinositol O O O O
and O O O O
six O O O O
unknown O O O O
glycolipids O O O O
were O O O O
the O O O O
major O O O O
polar O O O O
lipids O O O O
. O O O O
    
The O O O O
G O O O O
+ O O O O
C O O O O
content O O O O
of O O O O
the O O O O
DNA O O O O
was O O O O
72 O O O O
. O O O O
0 O O O O
mol O O O O
% O O O O
( O O O O
T O O O O
( O O O O
m O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
analysis O O O O
indicated O O O O
that O O O O
strain O O O O
V2M29 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
was O O O O
phylogenetically O O O O
related O O O O
to O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Phycicoccus O O O O
, O O O O
with O O O O
sequence O O O O
similarities O O O O
ranging O O O O
from O O O O
96 O O O O
. O O O O
6 O O O O
- O O O O
97 O O O O
. O O O O
8 O O O O
% O O O O
. O O O O
    
The O O O O
DNA O O O O
- O O O O
DNA O O O O
relatedness O O O O
values O O O O
of O O O O
strain O O O O
V2M29 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
to O O O O
Phycicoccus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
dokdonensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
DS O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
8 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Phycicoccus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bigeumensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
DSM O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
19264 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
were O O O O
32 O O O O
. O O O O
5 O O O O
+ O O O O
/ O O O O
- O O O O
3 O O O O
. O O O O
3 O O O O
% O O O O
and O O O O
29 O O O O
. O O O O
2 O O O O
+ O O O O
/ O O O O
- O O O O
2 O O O O
. O O O O
3 O O O O
% O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
Based O O O O
on O O O O
these O O O O
results O O O O
, O O O O
it O O O O
is O O O O
concluded O O O O
that O O O O
strain O O O O
V2M29 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
represents O O O O
a O O O O
novel O O O O
species O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Phycicoccus O O O O
, O O O O
for O O O O
which O O O O
the O O O O
name O O O O
Phycicoccus O O O O
cremeus O O O O
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
    
is O O O O
proposed O O O O
, O O O O
with O O O O
V2M29 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
( O O O O
= O O O O
CGMCC O O O O
1 O O O O
. O O O O
6963 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
NBRC O O O O
104261 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
as O O O O
the O O O O
type O O O O
strain O O O O
. O O O O
    
Streptomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
hyderabadensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
an O O O O
actinomycete O O O O
isolated O O O O
from O O O O
soil O O O O
. O O O O
    
A O O O O
novel O O O O
actinomycete O O O O
, O O O O
designated O O O O
strain O O O O
OU B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
40 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
, O O O O
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
farm O O O O
soil O O O O
collected O O O O
from O O O O
the O O O O
Hyderabad O O O O
region O O O O
of O O O O
Andhra O O O O
Pradesh O O O O
, O O O O
southern O O O O
India O O O O
. O O O O
    
The O O O O
strain O O O O
was O O O O
found O O O O
to O O O O
have O O O O
morphological O O O O
and O O O O
chemotaxonomic O O O O
characteristics O O O O
typical O O O O
of O O O O
species O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Streptomyces O O O O
. O O O O
    
Phylogenetic O O O O
analysis O O O O
based O O O O
on O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequences O O O O
indicated O O O O
that O O O O
strain O O O O
OU B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
40 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
belonged O O O O
to O O O O
the O O O O
genus O O O O
Streptomyces O O O O
, O O O O
and O O O O
was O O O O
related O O O O
most O O O O
closely O O O O
to O O O O
Streptomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pactum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
NBRC O O O O
13433 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
( O O O O
99 O O O O
. O O O O
0 O O O O
% O O O O
sequence O O O O
similarity O O O O
) O O O O
, O O O O
Streptomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
olivaceus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
NBRC O O O O
12805 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
( O O O O
99 O O O O
. O O O O
0 O O O O
% O O O O
) O O O O
and O O O O
Streptomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
parvulus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
NBRC O O O O
13193 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
( O O O O
98 O O O O
. O O O O
8 O O O O
% O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Strain O O O O
OU B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
40 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
could O O O O
be O O O O
distinguished O O O O
from O O O O
the O O O O
type O O O O
strains O O O O
of O O O O
its O O O O
closest O O O O
phylogenetic O O O O
relatives O O O O
based O O O O
on O O O O
levels O O O O
of O O O O
DNA O O O O
- O O O O
DNA O O O O
relatedness O O O O
and O O O O
comparison O O O O
of O O O O
morphological O O O O
and O O O O
phenotypic O O O O
data O O O O
. O O O O
    
It O O O O
is O O O O
therefore O O O O
concluded O O O O
that O O O O
strain O O O O
OU B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
40 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
represents O O O O
a O O O O
novel O O O O
species O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Streptomyces O O O O
, O O O O
for O O O O
which O O O O
the O O O O
name O O O O
Streptomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
hyderabadensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
    
is O O O O
proposed O O O O
. O O O O
    
The O O O O
type O O O O
strain O O O O
is O O O O
OU B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
40 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
( O O O O
= O O O O
CCTCC O O O O
AA O O O O
209024 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
PCM O O O O
2692 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Gordonia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
humi O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
isolated O O O O
from O O O O
soil O O O O
. O O O O
    
A O O O O
Gram O O O O
- O O O O
stain O O O O
- O O O O
positive O O O O
, O O O O
non O O O O
- O O O O
endospore O O O O
- O O O O
forming O O O O
actinobacterium O O O O
( O O O O
CC B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
12301 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
soil O O O O
attached O O O O
to O O O O
a O O O O
spawn O O O O
used O O O O
in O O O O
the O O O O
laboratory O O O O
to O O O O
grow O O O O
the O O O O
edible O O O O
mushroom O O O O
Agaricus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
brasiliensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Based O O O O
on O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
similarities O O O O
, O O O O
strain O O O O
CC B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
12301 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
shown O O O O
to O O O O
belong O O O O
to O O O O
the O O O O
genus O O O O
Gordonia O O O O
and O O O O
was O O O O
most O O O O
closely O O O O
related O O O O
to O O O O
the O O O O
type O O O O
strains O O O O
of O O O O
Gordonia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
hydrophobica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
97 O O O O
. O O O O
6 O O O O
% O O O O
similarity O O O O
) O O O O
, O O O O
Gordonia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
terrae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
97 O O O O
. O O O O
5 O O O O
% O O O O
) O O O O
, O O O O
Gordonia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
amarae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
97 O O O O
. O O O O
5 O O O O
% O O O O
) O O O O
and O O O O
Gordonia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
malaquae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
97 O O O O
. O O O O
4 O O O O
% O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
quinone O O O O
system O O O O
was O O O O
determined O O O O
to O O O O
consist O O O O
predominantly O O O O
of O O O O
menaquinone O O O O
MK O O O O
- O O O O
9 O O O O
( O O O O
H O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
) O O O O
, O O O O
minor O O O O
amounts O O O O
of O O O O
MK O O O O
- O O O O
8 O O O O
( O O O O
H O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
) O O O O
and O O O O
MK O O O O
- O O O O
7 O O O O
( O O O O
H O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
polar O O O O
lipid O O O O
profile O O O O
consisted O O O O
of O O O O
the O O O O
major O O O O
compounds O O O O
diphosphatidylglycerol O O O O
and O O O O
phosphatidylethanolamine O O O O
, O O O O
moderate O O O O
amounts O O O O
of O O O O
two O O O O
phosphatidylinositol O O O O
mannosides O O O O
and O O O O
phosphatidylinositol O O O O
and O O O O
minor O O O O
amounts O O O O
of O O O O
phosphatidylglycerol O O O O
, O O O O
three O O O O
unidentified O O O O
glycolipids O O O O
, O O O O
two O O O O
phosphoglycolipids O O O O
and O O O O
a O O O O
phospholipid O O O O
. O O O O
    
Mycolic O O O O
acids O O O O
were O O O O
present O O O O
. O O O O
    
These O O O O
chemotaxonomic O O O O
traits O O O O
and O O O O
the O O O O
major O O O O
fatty O O O O
acids O O O O
, O O O O
which O O O O
were O O O O
C O O O O
( O O O O
16 O O O O
: O O O O
1 O O O O
) O O O O
cis9 O O O O
, O O O O
C O O O O
( O O O O
16 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
, O O O O
C O O O O
( O O O O
18 O O O O
: O O O O
1 O O O O
) O O O O
and O O O O
tuberculostearic O O O O
acid O O O O
( O O O O
10 O O O O
- O O O O
methyl O O O O
C O O O O
( O O O O
18 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
) O O O O
, O O O O
supported O O O O
the O O O O
affiliation O O O O
of O O O O
strain O O O O
CC B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
12301 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
to O O O O
the O O O O
genus O O O O
Gordonia O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
of O O O O
physiological O O O O
and O O O O
biochemical O O O O
tests O O O O
allowed O O O O
clear O O O O
phenotypic O O O O
differentiation O O O O
of O O O O
strain O O O O
CC B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
12301 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
from O O O O
the O O O O
most O O O O
closely O O O O
related O O O O
Gordonia O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Strain O O O O
CC B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
12301 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
therefore O O O O
represents O O O O
a O O O O
novel O O O O
species O O O O
, O O O O
for O O O O
which O O O O
the O O O O
name O O O O
Gordonia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
humi O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
    
is O O O O
proposed O O O O
, O O O O
with O O O O
the O O O O
type O O O O
strain O O O O
CC B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
12301 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
= O O O O
DSM O O O O
45298 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
CCM O O O O
7727 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Methanoregula B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
boonei O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gen O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
an O O O O
acidiphilic O O O O
methanogen O O O O
isolated O O O O
from O O O O
an O O O O
acidic O O O O
peat O O O O
bog O O O O
. O O O O
    
A O O O O
novel O O O O
acidiphilic O O O O
, O O O O
hydrogenotrophic O O O O
methanogen O O O O
, O O O O
designated O O O O
strain O O O O
6A8 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
, O O O O
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
an O O O O
acidic O O O O
( O O O O
pH O O O O
4 O O O O
. O O O O
0 O O O O
- O O O O
4 O O O O
. O O O O
5 O O O O
) O O O O
and O O O O
ombrotrophic O O O O
( O O O O
rain O O O O
- O O O O
fed O O O O
) O O O O
bog O O O O
located O O O O
near O O O O
Ithaca O O O O
, O O O O
NY O O O O
, O O O O
USA O O O O
. O O O O
    
Cultures O O O O
were O O O O
dimorphic O O O O
, O O O O
containing O O O O
thin O O O O
rods O O O O
( O O O O
0 O O O O
. O O O O
2 O O O O
- O O O O
0 O O O O
. O O O O
3 O O O O
mum O O O O
in O O O O
diameter O O O O
and O O O O
0 O O O O
. O O O O
8 O O O O
- O O O O
3 O O O O
. O O O O
0 O O O O
mum O O O O
long O O O O
) O O O O
and O O O O
irregular O O O O
cocci O O O O
( O O O O
0 O O O O
. O O O O
2 O O O O
- O O O O
0 O O O O
. O O O O
8 O O O O
mum O O O O
in O O O O
diameter O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
culture O O O O
utilized O O O O
H O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
/ O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
to O O O O
produce O O O O
methane O O O O
but O O O O
did O O O O
not O O O O
utilize O O O O
formate O O O O
, O O O O
acetate O O O O
, O O O O
methanol O O O O
, O O O O
ethanol O O O O
, O O O O
2 O O O O
- O O O O
propanol O O O O
, O O O O
butanol O O O O
or O O O O
trimethylamine O O O O
. O O O O
    
Optimal O O O O
growth O O O O
conditions O O O O
were O O O O
near O O O O
pH O O O O
5 O O O O
. O O O O
1 O O O O
and O O O O
35 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
. O O O O
    
The O O O O
culture O O O O
grew O O O O
in O O O O
basal O O O O
medium O O O O
containing O O O O
as O O O O
little O O O O
as O O O O
0 O O O O
. O O O O
43 O O O O
mM O O O O
Na O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
and O O O O
growth O O O O
was O O O O
inhibited O O O O
completely O O O O
by O O O O
50 O O O O
mM O O O O
NaCl O O O O
. O O O O
    
To O O O O
our O O O O
knowledge O O O O
, O O O O
strain O O O O
6A8 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
is O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
most O O O O
acidiphilic O O O O
( O O O O
lowest O O O O
pH O O O O
optimum O O O O
) O O O O
and O O O O
salt O O O O
- O O O O
sensitive O O O O
methanogens O O O O
in O O O O
pure O O O O
culture O O O O
. O O O O
    
Acetate O O O O
, O O O O
coenzyme O O O O
M O O O O
, O O O O
vitamins O O O O
and O O O O
yeast O O O O
extract O O O O
were O O O O
required O O O O
for O O O O
growth O O O O
. O O O O
    
It O O O O
is O O O O
proposed O O O O
that O O O O
a O O O O
new O O O O
genus O O O O
and O O O O
species O O O O
be O O O O
established O O O O
for O O O O
this O O O O
organism O O O O
, O O O O
Methanoregula B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
boonei O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gen O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
    
The O O O O
type O O O O
strain O O O O
of O O O O
Methanoregula B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
boonei O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
6A8 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
( O O O O
= O O O O
DSM O O O O
21154 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
JCM O O O O
14090 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Marinobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coralli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
isolated O O O O
from O O O O
mucus O O O O
of O O O O
coral O O O O
( O O O O
Mussismilia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
hispida O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
. O O O O
    
A O O O O
Gram O O O O
- O O O O
negative O O O O
, O O O O
aerobic O O O O
bacterium O O O O
, O O O O
designated O O O O
R B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
40509 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
, O O O O
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
mucus O O O O
of O O O O
the O O O O
reef O O O O
builder O O O O
coral O O O O
( O O O O
Mussismilia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
hispida O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
located O O O O
in O O O O
the O O O O
Sao O O O O
Sebastiao O O O O
Channel O O O O
, O O O O
Sao O O O O
Paulo O O O O
, O O O O
Brazil O O O O
. O O O O
    
The O O O O
strain O O O O
was O O O O
oxidase O O O O
- O O O O
positive O O O O
and O O O O
catalase O O O O
- O O O O
negative O O O O
, O O O O
and O O O O
required O O O O
Na O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
for O O O O
growth O O O O
. O O O O
    
Its O O O O
phylogenetic O O O O
position O O O O
was O O O O
in O O O O
the O O O O
genus O O O O
Marinobacterium O O O O
and O O O O
the O O O O
closest O O O O
related O O O O
species O O O O
were O O O O
Marinobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sediminicola O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Marinobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
maritimum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Marinobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
stanieri O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
; O O O O
the O O O O
isolate O O O O
exhibited O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
similarities O O O O
of O O O O
97 O O O O
. O O O O
5 O O O O
- O O O O
98 O O O O
. O O O O
0 O O O O
% O O O O
with O O O O
the O O O O
type O O O O
strains O O O O
of O O O O
these O O O O
species O O O O
. O O O O
    
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
similarities O O O O
with O O O O
other O O O O
type O O O O
strains O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Marinobacterium O O O O
were O O O O
below O O O O
96 O O O O
% O O O O
. O O O O
    
DNA O O O O
- O O O O
DNA O O O O
hybridizations O O O O
between O O O O
strain O O O O
R B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
40509 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
and O O O O
the O O O O
type O O O O
strains O O O O
of O O O O
the O O O O
phylogenetically O O O O
closest O O O O
species O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Marinobacterium O O O O
revealed O O O O
less O O O O
than O O O O
70 O O O O
% O O O O
DNA O O O O
- O O O O
DNA O O O O
relatedness O O O O
, O O O O
supporting O O O O
the O O O O
novel O O O O
species O O O O
status O O O O
of O O O O
the O O O O
strain O O O O
. O O O O
    
Phenotypic O O O O
characterization O O O O
revealed O O O O
that O O O O
the O O O O
strain O O O O
was O O O O
able O O O O
to O O O O
grow O O O O
at O O O O
15 O O O O
- O O O O
42 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
and O O O O
in O O O O
medium O O O O
containing O O O O
up O O O O
to O O O O
9 O O O O
% O O O O
NaCl O O O O
. O O O O
    
The O O O O
isolate O O O O
could O O O O
be O O O O
differentiated O O O O
from O O O O
phenotypically O O O O
related O O O O
species O O O O
by O O O O
several O O O O
features O O O O
, O O O O
including O O O O
its O O O O
ability O O O O
to O O O O
utilize O O O O
d O O O O
- O O O O
alanine O O O O
, O O O O
l O O O O
- O O O O
alanine O O O O
, O O O O
bromosuccinic O O O O
acid O O O O
, O O O O
Beta O O O O
- O O O O
hydroxybutyric O O O O
acid O O O O
and O O O O
alpha O O O O
- O O O O
ketovaleric O O O O
acid O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
acetate O O O O
or O O O O
l O O O O
- O O O O
arabinose O O O O
. O O O O
    
It O O O O
produced O O O O
acetoin O O O O
( O O O O
Voges O O O O
- O O O O
Proskauer O O O O
) O O O O
, O O O O
but O O O O
did O O O O
not O O O O
have O O O O
esterase O O O O
lipase O O O O
( O O O O
C8 O O O O
) O O O O
or O O O O
catalase O O O O
activities O O O O
. O O O O
    
It O O O O
possessed O O O O
C O O O O
( O O O O
18 O O O O
: O O O O
1 O O O O
) O O O O
omega7c O O O O
( O O O O
35 O O O O
% O O O O
) O O O O
, O O O O
summed O O O O
feature O O O O
3 O O O O
( O O O O
iso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
15 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
2 O O O O
- O O O O
OH O O O O
and O O O O
/ O O O O
or O O O O
C O O O O
( O O O O
16 O O O O
: O O O O
1 O O O O
) O O O O
omega7c O O O O
; O O O O
25 O O O O
% O O O O
) O O O O
and O O O O
C O O O O
( O O O O
16 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
( O O O O
22 O O O O
% O O O O
) O O O O
as O O O O
major O O O O
cellular O O O O
fatty O O O O
acids O O O O
. O O O O
    
The O O O O
DNA O O O O
G O O O O
+ O O O O
C O O O O
content O O O O
was O O O O
58 O O O O
. O O O O
5 O O O O
mol O O O O
% O O O O
. O O O O
    
The O O O O
name O O O O
Marinobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coralli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
    
is O O O O
proposed O O O O
to O O O O
accommodate O O O O
this O O O O
novel O O O O
isolate O O O O
; O O O O
the O O O O
type O O O O
strain O O O O
is O O O O
R B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
40509 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
( O O O O
= O O O O
LMG B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
25435 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
= O O O O
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1449 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
. O O O O
    
Amnibacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
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gen O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
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. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
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. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
a O O O O
new O O O O
member O O O O
of O O O O
the O O O O
family O O O O
Microbacteriaceae O O O O
. O O O O
    
A O O O O
Gram O O O O
- O O O O
positive O O O O
, O O O O
non O O O O
- O O O O
motile O O O O
bacterium O O O O
, O O O O
designated O O O O
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- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
037 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
Anyang O O O O
stream O O O O
, O O O O
Republic O O O O
of O O O O
Korea O O O O
, O O O O
and O O O O
was O O O O
characterized O O O O
using O O O O
a O O O O
polyphasic O O O O
taxonomic O O O O
approach O O O O
. O O O O
    
Comparative O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
analysis O O O O
showed O O O O
that O O O O
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belonged O O O O
to O O O O
the O O O O
family O O O O
Microbacteriaceae O O O O
of O O O O
the O O O O
class O O O O
Actinobacteria O O O O
and O O O O
exhibited O O O O
96 O O O O
. O O O O
9 O O O O
% O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
similarity O O O O
to O O O O
Labedella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
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17 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
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T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
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, O O O O
96 O O O O
. O O O O
0 O O O O
% O O O O
to O O O O
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ginsengi O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
wged11 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
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and O O O O
95 O O O O
. O O O O
9 O O O O
% O O O O
to O O O O
Microterricola B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
viridarii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
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- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
677 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
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. O O O O
    
The O O O O
G O O O O
+ O O O O
C O O O O
content O O O O
of O O O O
the O O O O
genomic O O O O
DNA O O O O
was O O O O
72 O O O O
. O O O O
7 O O O O
mol O O O O
% O O O O
. O O O O
    
Strain O O O O
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037 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
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T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
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had O O O O
l O O O O
- O O O O
2 O O O O
, O O O O
4 O O O O
- O O O O
diaminobutyric O O O O
acid O O O O
as O O O O
the O O O O
diagnostic O O O O
cell O O O O
- O O O O
wall O O O O
diamino O O O O
acid O O O O
, O O O O
MK O O O O
- O O O O
11 O O O O
and O O O O
MK O O O O
- O O O O
12 O O O O
as O O O O
the O O O O
major O O O O
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, O O O O
anteiso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
15 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
( O O O O
47 O O O O
. O O O O
8 O O O O
% O O O O
) O O O O
and O O O O
iso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
16 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
( O O O O
24 O O O O
. O O O O
0 O O O O
% O O O O
) O O O O
as O O O O
the O O O O
major O O O O
fatty O O O O
acids O O O O
and O O O O
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and O O O O
three O O O O
unknown O O O O
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as O O O O
the O O O O
major O O O O
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. O O O O
    
On O O O O
the O O O O
basis O O O O
of O O O O
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and O O O O
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and O O O O
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, O O O O
it O O O O
is O O O O
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that O O O O
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a O O O O
novel O O O O
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a O O O O
new O O O O
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the O O O O
family O O O O
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the O O O O
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nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
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is O O O O
proposed O O O O
. O O O O
    
The O O O O
type O O O O
strain O O O O
of O O O O
the O O O O
type O O O O
species O O O O
is O O O O
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T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
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51201 O O O O
- O O O O
037 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
JCM O O O O
16463 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Miniimonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
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gen O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
, O O O O
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
, O O O O
an O O O O
actinobacterium O O O O
isolated O O O O
from O O O O
sea O O O O
sand O O O O
. O O O O
    
A O O O O
Gram O O O O
- O O O O
positive O O O O
, O O O O
non O O O O
- O O O O
motile O O O O
, O O O O
coccoid O O O O
- O O O O
to O O O O
rod O O O O
- O O O O
shaped O O O O
, O O O O
non O O O O
- O O O O
spore O O O O
- O O O O
forming O O O O
bacterium O O O O
, O O O O
designated O O O O
strain O O O O
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15 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
, O O O O
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
sea O O O O
sand O O O O
and O O O O
studied O O O O
using O O O O
a O O O O
polyphasic O O O O
taxonomic O O O O
approach O O O O
. O O O O
    
Strain O O O O
YM18 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
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( O O O O
T O O O O
) O O O O
grew O O O O
under O O O O
both O O O O
aerobic O O O O
and O O O O
anaerobic O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
The O O O O
cell O O O O
- O O O O
wall O O O O
peptidoglycan O O O O
type O O O O
was O O O O
A4Beta O O O O
and O O O O
ornithine O O O O
was O O O O
the O O O O
diagnostic O O O O
diamino O O O O
acid O O O O
. O O O O
    
The O O O O
polar O O O O
lipids O O O O
were O O O O
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, O O O O
diphosphatidylglycerol O O O O
, O O O O
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and O O O O
an O O O O
unknown O O O O
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, O O O O
MK O O O O
- O O O O
8 O O O O
( O O O O
H O O O O
( O O O O
4 O O O O
) O O O O
) O O O O
was O O O O
the O O O O
major O O O O
menaquinone O O O O
and O O O O
the O O O O
predominant O O O O
fatty O O O O
acids O O O O
were O O O O
anteiso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
15 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
and O O O O
C O O O O
( O O O O
16 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
DNA O O O O
G O O O O
+ O O O O
C O O O O
content O O O O
was O O O O
74 O O O O
. O O O O
2 O O O O
mol O O O O
% O O O O
. O O O O
    
High O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
similarities O O O O
( O O O O
96 O O O O
. O O O O
3 O O O O
- O O O O
97 O O O O
. O O O O
3 O O O O
% O O O O
) O O O O
were O O O O
found O O O O
with O O O O
the O O O O
sequences O O O O
of O O O O
the O O O O
type O O O O
strains O O O O
of O O O O
the O O O O
three O O O O
genera O O O O
of O O O O
the O O O O
family O O O O
Beutenbergiaceae O O O O
. O O O O
    
Phylogenetic O O O O
analysis O O O O
based O O O O
on O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequences O O O O
showed O O O O
that O O O O
strain O O O O
YM18 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
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( O O O O
T O O O O
) O O O O
formed O O O O
a O O O O
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with O O O O
Serinibacter B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
salmoneus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Salana B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
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and O O O O
Beutenbergia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cavernae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Strain O O O O
YM18 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
15 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
differed O O O O
from O O O O
these O O O O
three O O O O
type O O O O
strains O O O O
in O O O O
chemotaxonomic O O O O
characteristics O O O O
and O O O O
in O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
signature O O O O
nucleotides O O O O
. O O O O
    
Based O O O O
on O O O O
genetic O O O O
and O O O O
chemotaxonomic O O O O
evidence O O O O
, O O O O
it O O O O
is O O O O
suggested O O O O
that O O O O
strain O O O O
YM18 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
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15 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
represents O O O O
a O O O O
novel O O O O
species O O O O
of O O O O
a O O O O
new O O O O
genus O O O O
within O O O O
the O O O O
family O O O O
Beutenbergiaceae O O O O
, O O O O
for O O O O
which O O O O
the O O O O
name O O O O
Miniimonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
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gen O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
, O O O O
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
    
is O O O O
proposed O O O O
. O O O O
    
The O O O O
type O O O O
strain O O O O
of O O O O
the O O O O
type O O O O
species O O O O
is O O O O
YM18 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
15 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
( O O O O
= O O O O
NBRC O O O O
106267 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
KCTC O O O O
19750 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
MBIC O O O O
08348 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Anoxybacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tengchongensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
and O O O O
Anoxybacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
eryuanensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
, O O O O
facultatively O O O O
anaerobic O O O O
, O O O O
alkalitolerant O O O O
bacteria O O O O
from O O O O
hot O O O O
springs O O O O
. O O O O
    
Two O O O O
novel O O O O
thermophilic O O O O
, O O O O
spore O O O O
- O O O O
forming O O O O
bacterial O O O O
strains O O O O
, O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
11 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
and O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
112 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
, O O O O
were O O O O
isolated O O O O
from O O O O
hot O O O O
springs O O O O
in O O O O
Tengchong O O O O
and O O O O
Eryuan O O O O
counties O O O O
of O O O O
Yunnan O O O O
province O O O O
in O O O O
south O O O O
- O O O O
west O O O O
China O O O O
. O O O O
    
The O O O O
strains O O O O
were O O O O
Gram O O O O
- O O O O
stain O O O O
- O O O O
positive O O O O
rods O O O O
, O O O O
occurring O O O O
singly O O O O
or O O O O
in O O O O
chains O O O O
. O O O O
    
Growth O O O O
of O O O O
strain O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
11 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
was O O O O
observed O O O O
between O O O O
30 O O O O
and O O O O
75 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
( O O O O
optimum O O O O
50 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
) O O O O
and O O O O
at O O O O
pH O O O O
7 O O O O
- O O O O
11 O O O O
( O O O O
optimum O O O O
pH O O O O
8 O O O O
. O O O O
5 O O O O
) O O O O
, O O O O
while O O O O
the O O O O
temperature O O O O
range O O O O
for O O O O
strain O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
112 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
was O O O O
35 O O O O
- O O O O
70 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
( O O O O
optimum O O O O
55 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
) O O O O
and O O O O
the O O O O
pH O O O O
range O O O O
was O O O O
7 O O O O
. O O O O
0 O O O O
- O O O O
11 O O O O
. O O O O
0 O O O O
( O O O O
optimum O O O O
pH O O O O
8 O O O O
. O O O O
0 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
DNA O O O O
G O O O O
+ O O O O
C O O O O
contents O O O O
of O O O O
strains O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
11 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
and O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
112 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
were O O O O
41 O O O O
. O O O O
1 O O O O
and O O O O
42 O O O O
. O O O O
6 O O O O
mol O O O O
% O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
On O O O O
the O O O O
basis O O O O
of O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
similarity O O O O
, O O O O
the O O O O
two O O O O
strains O O O O
were O O O O
shown O O O O
to O O O O
be O O O O
related O O O O
most O O O O
closely O O O O
to O O O O
Anoxybacillus O O O O
species O O O O
. O O O O
    
The O O O O
chemotaxonomic O O O O
characteristics O O O O
[ O O O O
predominant O O O O
isoprenoid O O O O
quinone O O O O
menaquinone O O O O
7 O O O O
( O O O O
MK O O O O
- O O O O
7 O O O O
) O O O O
; O O O O
major O O O O
fatty O O O O
acids O O O O
iso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
15 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
and O O O O
iso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
17 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
] O O O O
also O O O O
supported O O O O
the O O O O
affiliation O O O O
of O O O O
strains O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
11 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
and O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
112 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
to O O O O
the O O O O
genus O O O O
Anoxybacillus O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
of O O O O
DNA O O O O
- O O O O
DNA O O O O
hybridization O O O O
and O O O O
physiological O O O O
and O O O O
biochemical O O O O
tests O O O O
allowed O O O O
genotypic O O O O
and O O O O
phenotypic O O O O
differentiation O O O O
of O O O O
strains O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
11 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
and O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
112 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
from O O O O
Anoxybacillus O O O O
species O O O O
with O O O O
validly O O O O
published O O O O
names O O O O
. O O O O
    
Strains O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
11 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
and O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
112 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
therefore O O O O
represent O O O O
two O O O O
novel O O O O
species O O O O
, O O O O
for O O O O
which O O O O
the O O O O
names O O O O
Anoxybacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tengchongensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
    
( O O O O
type O O O O
strain O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
11 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
CCTCC O O O O
AB209237 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
KCTC O O O O
13721 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
and O O O O
Anoxybacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
eryuanensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
    
( O O O O
type O O O O
strain O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
112 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
CCTCC O O O O
AB209236 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
KCTC O O O O
13720 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
are O O O O
proposed O O O O
. O O O O
    
Neisseria B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
wadsworthii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
and O O O O
Neisseria B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
shayeganii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
, O O O O
isolated O O O O
from O O O O
clinical O O O O
specimens O O O O
. O O O O
    
An O O O O
analysis O O O O
of O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequences O O O O
from O O O O
archived O O O O
clinical O O O O
reference O O O O
specimens O O O O
has O O O O
identified O O O O
two O O O O
novel O O O O
Neisseria O O O O
species O O O O
. O O O O
    
For O O O O
each O O O O
species O O O O
, O O O O
two O O O O
strains O O O O
from O O O O
independent O O O O
sources O O O O
were O O O O
identified O O O O
. O O O O
    
Amongst O O O O
species O O O O
with O O O O
validly O O O O
published O O O O
names O O O O
, O O O O
the O O O O
closest O O O O
species O O O O
to O O O O
the O O O O
newly O O O O
identified O O O O
organisms O O O O
were O O O O
Neisseria B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
canis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
N B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
dentiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
N B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
zoodegmatis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
N B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
animaloris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
N B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
weaveri O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
DNA O O O O
- O O O O
DNA O O O O
hybridization O O O O
studies O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
the O O O O
newly O O O O
identified O O O O
isolates O O O O
represent O O O O
species O O O O
that O O O O
are O O O O
distinct O O O O
from O O O O
these O O O O
nearest O O O O
neighbours O O O O
. O O O O
    
Analysis O O O O
of O O O O
partial O O O O
23S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequences O O O O
for O O O O
the O O O O
newly O O O O
identified O O O O
strains O O O O
and O O O O
their O O O O
nearest O O O O
neighbours O O O O
provided O O O O
additional O O O O
support O O O O
for O O O O
the O O O O
species O O O O
designation O O O O
. O O O O
    
Bayesian O O O O
analysis O O O O
of O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequences O O O O
suggested O O O O
that O O O O
the O O O O
newly O O O O
identified O O O O
isolates O O O O
belong O O O O
to O O O O
distinct O O O O
but O O O O
related O O O O
species O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Neisseria O O O O
, O O O O
and O O O O
are O O O O
members O O O O
of O O O O
a O O O O
clade O O O O
that O O O O
includes O O O O
N B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
dentiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
N B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bacilliformis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
N B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
canis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
predominant O O O O
cellular O O O O
fatty O O O O
acids O O O O
[ O O O O
16 O O O O
: O O O O
0 O O O O
, O O O O
summed O O O O
feature O O O O
3 O O O O
( O O O O
16 O O O O
: O O O O
1omega7c O O O O
and O O O O
/ O O O O
or O O O O
iso O O O O
- O O O O
15 O O O O
: O O O O
0 O O O O
2 O O O O
- O O O O
OH O O O O
) O O O O
and O O O O
18 O O O O
: O O O O
1omega7c O O O O
] O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
biochemical O O O O
and O O O O
morphological O O O O
analyses O O O O
further O O O O
support O O O O
the O O O O
designation O O O O
of O O O O
Neisseria B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
wadsworthii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
    
( O O O O
type O O O O
strain O O O O
9715 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
DSM O O O O
22247 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
CIP O O O O
109934 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
and O O O O
Neisseria B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
shayeganii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
    
( O O O O
type O O O O
strain O O O O
871 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
DSM O O O O
22246 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
CIP O O O O
109933 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Spirochaeta O O O O
perfilievii O O O O
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
, O O O O
an O O O O
oxygen O O O O
- O O O O
tolerant O O O O
, O O O O
sulfide O O O O
- O O O O
oxidizing O O O O
, O O O O
sulfur O O O O
- O O O O
and O O O O
thiosulfate O O O O
- O O O O
reducing O O O O
spirochaete O O O O
isolated O O O O
from O O O O
a O O O O
saline O O O O
spring O O O O
. O O O O
    
A O O O O
novel O O O O
strain O O O O
of O O O O
fermenting O O O O
, O O O O
aerotolerant O O O O
, O O O O
chemo O O O O
- O O O O
organoheterotrophic O O O O
spirochaete O O O O
designated O O O O
P O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
a O O O O
sulfur O O O O
' O O O O
Thiodendron O O O O
' O O O O
mat O O O O
in O O O O
a O O O O
saline O O O O
spring O O O O
at O O O O
the O O O O
Staraya O O O O
Russa O O O O
resort O O O O
( O O O O
Novgorod O O O O
Region O O O O
, O O O O
Russia O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Cells O O O O
of O O O O
strain O O O O
P O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
exhibited O O O O
a O O O O
helical O O O O
shape O O O O
. O O O O
    
The O O O O
spirochaete O O O O
required O O O O
sulfide O O O O
in O O O O
the O O O O
growth O O O O
medium O O O O
and O O O O
was O O O O
able O O O O
to O O O O
oxidize O O O O
it O O O O
non O O O O
- O O O O
enzymically O O O O
to O O O O
elemental O O O O
sulfur O O O O
via O O O O
the O O O O
interaction O O O O
of O O O O
H O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
O O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
with O O O O
sulfide O O O O
and O O O O
deposit O O O O
it O O O O
in O O O O
the O O O O
periplasmic O O O O
space O O O O
. O O O O
    
Growth O O O O
occurred O O O O
at O O O O
4 O O O O
- O O O O
32 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
( O O O O
optimum O O O O
at O O O O
28 O O O O
- O O O O
30 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
) O O O O
, O O O O
pH O O O O
6 O O O O
. O O O O
0 O O O O
- O O O O
8 O O O O
. O O O O
5 O O O O
( O O O O
optimum O O O O
pH O O O O
7 O O O O
. O O O O
0 O O O O
- O O O O
7 O O O O
. O O O O
5 O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
in O O O O
0 O O O O
. O O O O
1 O O O O
- O O O O
1 O O O O
M O O O O
NaCl O O O O
( O O O O
optimum O O O O
0 O O O O
. O O O O
35 O O O O
M O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
isolate O O O O
used O O O O
several O O O O
sugars O O O O
and O O O O
polysaccharides O O O O
as O O O O
carbon O O O O
or O O O O
energy O O O O
sources O O O O
but O O O O
did O O O O
not O O O O
use O O O O
peptides O O O O
, O O O O
amino O O O O
acids O O O O
, O O O O
organic O O O O
acids O O O O
or O O O O
alcohols O O O O
. O O O O
    
The O O O O
products O O O O
of O O O O
glucose O O O O
fermentation O O O O
were O O O O
formate O O O O
, O O O O
acetate O O O O
, O O O O
ethanol O O O O
, O O O O
pyruvate O O O O
, O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
and O O O O
H O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
genomic O O O O
DNA O O O O
G O O O O
+ O O O O
C O O O O
content O O O O
was O O O O
41 O O O O
. O O O O
7 O O O O
mol O O O O
% O O O O
. O O O O
    
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
analysis O O O O
showed O O O O
that O O O O
strain O O O O
P O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
fell O O O O
within O O O O
a O O O O
group O O O O
of O O O O
species O O O O
in O O O O
the O O O O
genus O O O O
Spirochaeta O O O O
, O O O O
including O O O O
Spirochaeta B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
litoralis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
isovalerica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cellobiosiphila O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
with O O O O
which O O O O
it O O O O
shared O O O O
less O O O O
then O O O O
89 O O O O
% O O O O
sequence O O O O
similarity O O O O
. O O O O
    
On O O O O
the O O O O
basis O O O O
of O O O O
its O O O O
morphology O O O O
, O O O O
physiology O O O O
and O O O O
other O O O O
phenotypic O O O O
properties O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
its O O O O
phylogenetic O O O O
position O O O O
, O O O O
the O O O O
new O O O O
isolate O O O O
is O O O O
considered O O O O
to O O O O
represent O O O O
a O O O O
novel O O O O
species O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Spirochaeta O O O O
, O O O O
for O O O O
which O O O O
the O O O O
name O O O O
Spirochaeta O O O O
perfilievii O O O O
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
    
is O O O O
proposed O O O O
. O O O O
    
The O O O O
type O O O O
strain O O O O
is O O O O
P O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
( O O O O
= O O O O
DSM O O O O
19205 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
VKM O O O O
B O O O O
- O O O O
2514 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Sporosalibacterium O O O O
faouarense O O O O
gen O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
, O O O O
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
, O O O O
a O O O O
moderately O O O O
halophilic O O O O
bacterium O O O O
isolated O O O O
from O O O O
oil O O O O
- O O O O
contaminated O O O O
soil O O O O
. O O O O
    
A O O O O
novel O O O O
strictly O O O O
anaerobic O O O O
, O O O O
moderately O O O O
halophilic O O O O
and O O O O
mesophilic O O O O
bacterium O O O O
, O O O O
designated O O O O
strain O O O O
SOL3f37 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
, O O O O
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
a O O O O
hydrocarbon O O O O
- O O O O
polluted O O O O
soil O O O O
surrounding O O O O
a O O O O
deep O O O O
petroleum O O O O
environment O O O O
located O O O O
in O O O O
south O O O O
Tunisia O O O O
. O O O O
    
Cells O O O O
of O O O O
strain O O O O
SOL3f37 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
stained O O O O
Gram O O O O
- O O O O
positive O O O O
and O O O O
were O O O O
motile O O O O
, O O O O
straight O O O O
and O O O O
spore O O O O
- O O O O
forming O O O O
. O O O O
    
Strain O O O O
SOL3f37 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
had O O O O
a O O O O
typical O O O O
Gram O O O O
- O O O O
positive O O O O
- O O O O
type O O O O
cell O O O O
- O O O O
wall O O O O
structure O O O O
, O O O O
unlike O O O O
the O O O O
thick O O O O
, O O O O
multilayered O O O O
cell O O O O
wall O O O O
of O O O O
its O O O O
closest O O O O
relative O O O O
Clostridiisalibacter B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
paucivorans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
major O O O O
fatty O O O O
acids O O O O
were O O O O
iso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
15 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
( O O O O
41 O O O O
% O O O O
) O O O O
, O O O O
iso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
14 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
3 O O O O
- O O O O
OH O O O O
and O O O O
/ O O O O
or O O O O
iso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
15 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
dimethyl O O O O
acetal O O O O
( O O O O
21 O O O O
. O O O O
6 O O O O
% O O O O
) O O O O
, O O O O
iso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
13 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
( O O O O
4 O O O O
. O O O O
4 O O O O
% O O O O
) O O O O
, O O O O
anteiso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
15 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
( O O O O
3 O O O O
. O O O O
9 O O O O
% O O O O
) O O O O
and O O O O
iso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
15 O O O O
: O O O O
1 O O O O
) O O O O
( O O O O
2 O O O O
. O O O O
8 O O O O
% O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Strain O O O O
SOL3f37 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
grew O O O O
between O O O O
20 O O O O
and O O O O
48 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
( O O O O
optimum O O O O
40 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
) O O O O
and O O O O
at O O O O
pH O O O O
6 O O O O
. O O O O
2 O O O O
- O O O O
8 O O O O
. O O O O
1 O O O O
( O O O O
optimum O O O O
pH O O O O
6 O O O O
. O O O O
9 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Strain O O O O
SOL3f37 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
required O O O O
at O O O O
least O O O O
0 O O O O
. O O O O
5 O O O O
NaCl O O O O
l O O O O
( O O O O
- O O O O
1 O O O O
) O O O O
and O O O O
grew O O O O
in O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
NaCl O O O O
concentrations O O O O
up O O O O
to O O O O
150 O O O O
g O O O O
l O O O O
( O O O O
- O O O O
1 O O O O
) O O O O
( O O O O
optimum O O O O
40 O O O O
g O O O O
l O O O O
( O O O O
- O O O O
1 O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Yeast O O O O
extract O O O O
( O O O O
2 O O O O
g O O O O
l O O O O
( O O O O
- O O O O
1 O O O O
) O O O O
) O O O O
was O O O O
required O O O O
for O O O O
degradation O O O O
of O O O O
pyruvate O O O O
, O O O O
fumarate O O O O
, O O O O
fructose O O O O
, O O O O
glucose O O O O
and O O O O
mannitol O O O O
. O O O O
    
Also O O O O
, O O O O
strain O O O O
SOL3f37 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
grew O O O O
heterotrophically O O O O
on O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
extract O O O O
, O O O O
peptone O O O O
and O O O O
bio O O O O
- O O O O
Trypticase O O O O
, O O O O
but O O O O
was O O O O
unable O O O O
to O O O O
grow O O O O
on O O O O
Casamino O O O O
acids O O O O
. O O O O
    
Sulfate O O O O
, O O O O
thiosulfate O O O O
, O O O O
sulfite O O O O
, O O O O
elemental O O O O
sulfur O O O O
, O O O O
fumarate O O O O
, O O O O
nitrate O O O O
and O O O O
nitrite O O O O
were O O O O
not O O O O
reduced O O O O
. O O O O
    
The O O O O
DNA O O O O
G O O O O
+ O O O O
C O O O O
content O O O O
was O O O O
30 O O O O
. O O O O
7 O O O O
mol O O O O
% O O O O
. O O O O
    
Phylogenetic O O O O
analysis O O O O
based O O O O
on O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequences O O O O
revealed O O O O
that O O O O
strain O O O O
SOL3f37 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
was O O O O
a O O O O
member O O O O
of O O O O
the O O O O
family O O O O
Clostridiaceae O O O O
in O O O O
the O O O O
order O O O O
Clostridiales O O O O
; O O O O
strain O O O O
SOL3f37 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
was O O O O
related O O O O
to O O O O
members O O O O
of O O O O
various O O O O
genera O O O O
of O O O O
the O O O O
family O O O O
Clostridiaceae O O O O
. O O O O
    
It O O O O
exhibited O O O O
highest O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
similarity O O O O
( O O O O
93 O O O O
. O O O O
4 O O O O
% O O O O
) O O O O
with O O O O
Clostridiisalibacter B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
paucivorans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
37HS60 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
, O O O O
91 O O O O
. O O O O
8 O O O O
% O O O O
with O O O O
Thermohalobacter B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
berrensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
CTT3 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
and O O O O
91 O O O O
. O O O O
7 O O O O
% O O O O
with O O O O
Caloranaerobacter B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
azorensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
MV1087 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
. O O O O
    
On O O O O
the O O O O
basis O O O O
of O O O O
genotypic O O O O
, O O O O
phenotypic O O O O
and O O O O
phylogenetic O O O O
data O O O O
, O O O O
it O O O O
is O O O O
suggested O O O O
that O O O O
strain O O O O
SOL3f37 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
represents O O O O
a O O O O
novel O O O O
species O O O O
in O O O O
a O O O O
new O O O O
genus O O O O
. O O O O
    
The O O O O
name O O O O
Sporosalibacterium O O O O
faouarense O O O O
gen O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
, O O O O
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
    
is O O O O
proposed O O O O
, O O O O
with O O O O
SOL3f37 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
( O O O O
= O O O O
DSM O O O O
21485 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
JCM O O O O
15487 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
as O O O O
the O O O O
type O O O O
strain O O O O
of O O O O
Sporosalibacterium O O O O
faouarense O O O O
. O O O O
    
Streptomyces O O O O
lacticiproducens O O O O
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
, O O O O
a O O O O
lactic O O O O
acid O O O O
- O O O O
producing O O O O
streptomycete O O O O
isolated O O O O
from O O O O
the O O O O
rhizosphere O O O O
of O O O O
tomato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
plants O O O O
. O O O O
    
A O O O O
novel O O O O
actinomycete O O O O
, O O O O
designated O O O O
strain O O O O
GIMN4 O O O O
. O O O O
001 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
, O O O O
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
the O O O O
rhizosphere O O O O
of O O O O
tomato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
plants O O O O
grown O O O O
in O O O O
Guangzhou O O O O
, O O O O
China O O O O
. O O O O
    
The O O O O
strain O O O O
produced O O O O
greyish O O O O
white O O O O
aerial O O O O
mycelia O O O O
, O O O O
lactic O O O O
acid O O O O
and O O O O
a O O O O
large O O O O
quantity O O O O
of O O O O
double O O O O
diamond O O O O
- O O O O
shaped O O O O
crystals O O O O
on O O O O
potato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
dextrose O O O O
agar O O O O
and O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
extract O O O O
- O O O O
malt O O O O
extract O O O O
agar O O O O
. O O O O
    
The O O O O
colour O O O O
of O O O O
the O O O O
substrate O O O O
mycelium O O O O
was O O O O
not O O O O
sensitive O O O O
to O O O O
pH O O O O
. O O O O
    
Microscopic O O O O
observations O O O O
revealed O O O O
that O O O O
strain O O O O
GIMN4 O O O O
. O O O O
001 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
produced O O O O
verticillate O O O O
chains O O O O
of O O O O
cylindrical O O O O
spores O O O O
. O O O O
    
Chemotaxonomic O O O O
data O O O O
confirmed O O O O
that O O O O
strain O O O O
GIMN4 O O O O
. O O O O
001 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
belonged O O O O
to O O O O
the O O O O
genus O O O O
Streptomyces O O O O
. O O O O
    
Melanin O O O O
pigments O O O O
were O O O O
not O O O O
produced O O O O
. O O O O
    
No O O O O
antibacterial O O O O
activity O O O O
was O O O O
observed O O O O
against O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Pseudomonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aeruginosa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Bacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
subtilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
or O O O O
Candida B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
but O O O O
inhibitory O O O O
activity O O O O
was O O O O
observed O O O O
against O O O O
Penicillium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
citrinum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
analysis O O O O
revealed O O O O
that O O O O
strain O O O O
GIMN4 O O O O
. O O O O
001 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
was O O O O
related O O O O
most O O O O
closely O O O O
to O O O O
Streptomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
morookaense O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ATCC B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
19166 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
98 O O O O
. O O O O
9 O O O O
% O O O O
similarity O O O O
) O O O O
and O O O O
Streptomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
lavenduligriseus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ATCC B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
13306 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
98 O O O O
. O O O O
7 O O O O
% O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Levels O O O O
of O O O O
DNA O O O O
- O O O O
DNA O O O O
relatedness O O O O
between O O O O
strain O O O O
GIMN4 O O O O
. O O O O
001 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
and O O O O
the O O O O
type O O O O
strains O O O O
of O O O O
these O O O O
species O O O O
were O O O O
low O O O O
( O O O O
14 O O O O
- O O O O
20 O O O O
% O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
strain O O O O
GIMN4 O O O O
. O O O O
001 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
could O O O O
be O O O O
differentiated O O O O
from O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
morookaense O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
S O O O O
. O O O O
lavenduligriseus O O O O
and O O O O
other O O O O
closely O O O O
related O O O O
species O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Streptomyces O O O O
based O O O O
on O O O O
morphological O O O O
, O O O O
physiological O O O O
and O O O O
biochemical O O O O
characteristics O O O O
. O O O O
    
On O O O O
the O O O O
basis O O O O
of O O O O
its O O O O
physiological O O O O
and O O O O
molecular O O O O
properties O O O O
, O O O O
strain O O O O
GIMN4 O O O O
. O O O O
001 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
is O O O O
considered O O O O
to O O O O
represent O O O O
a O O O O
novel O O O O
species O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Streptomyces O O O O
, O O O O
for O O O O
which O O O O
the O O O O
name O O O O
Streptomyces O O O O
lacticiproducens O O O O
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
    
is O O O O
proposed O O O O
. O O O O
    
The O O O O
type O O O O
strain O O O O
is O O O O
GIMN4 O O O O
. O O O O
001 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
( O O O O
= O O O O
CCTCC O O O O
M208214 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
NRRL O O O O
B O O O O
- O O O O
24800 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
An O O O O
rpoB O O O O
signature O O O O
sequence O O O O
provides O O O O
unique O O O O
resolution O O O O
for O O O O
the O O O O
molecular O O O O
typing O O O O
of O O O O
cyanobacteria O O O O
. O O O O
    
The O O O O
use O O O O
of O O O O
morphological O O O O
characters O O O O
for O O O O
the O O O O
classification O O O O
of O O O O
cyanobacteria O O O O
has O O O O
often O O O O
led O O O O
to O O O O
ambiguous O O O O
strain O O O O
assignment O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
past O O O O
two O O O O
decades O O O O
, O O O O
the O O O O
availability O O O O
of O O O O
sequences O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
those O O O O
of O O O O
the O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
, O O O O
nif O O O O
, O O O O
cpc O O O O
and O O O O
rpoC1 O O O O
genes O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
use O O O O
of O O O O
metagenomics O O O O
, O O O O
has O O O O
steadily O O O O
increased O O O O
and O O O O
has O O O O
made O O O O
the O O O O
reconstruction O O O O
of O O O O
evolutionary O O O O
relationships O O O O
of O O O O
some O O O O
cyanobacterial O O O O
groups O O O O
possible O O O O
in O O O O
addition O O O O
to O O O O
improving O O O O
strain O O O O
assignment O O O O
. O O O O
    
Conserved O O O O
indels O O O O
( O O O O
insertions O O O O
/ O O O O
deletions O O O O
) O O O O
are O O O O
present O O O O
in O O O O
all O O O O
cyanobacterial O O O O
RpoB O O O O
( O O O O
Beta O O O O
subunit O O O O
of O O O O
RNA O O O O
polymerase O O O O
) O O O O
sequences O O O O
presently O O O O
available O O O O
in O O O O
public O O O O
databases O O O O
. O O O O
    
These O O O O
indels O O O O
are O O O O
located O O O O
in O O O O
the O O O O
Rpb2 O O O O
_ O O O O
6 O O O O
domain O O O O
of O O O O
RpoB O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
involved O O O O
in O O O O
DNA O O O O
binding O O O O
and O O O O
DNA O O O O
- O O O O
directed O O O O
RNA O O O O
polymerase O O O O
activity O O O O
. O O O O
    
They O O O O
are O O O O
variable O O O O
in O O O O
length O O O O
( O O O O
6 O O O O
- O O O O
44 O O O O
aa O O O O
) O O O O
and O O O O
sequence O O O O
, O O O O
and O O O O
form O O O O
part O O O O
of O O O O
what O O O O
appears O O O O
to O O O O
be O O O O
a O O O O
longer O O O O
signature O O O O
sequence O O O O
( O O O O
43 O O O O
- O O O O
81 O O O O
aa O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Indeed O O O O
, O O O O
a O O O O
number O O O O
of O O O O
these O O O O
sequences O O O O
turn O O O O
out O O O O
to O O O O
be O O O O
distinctive O O O O
among O O O O
several O O O O
strains O O O O
of O O O O
a O O O O
given O O O O
genus O O O O
and O O O O
even O O O O
among O O O O
strains O O O O
of O O O O
a O O O O
given O O O O
species O O O O
. O O O O
    
These O O O O
signature O O O O
sequences O O O O
can O O O O
thus O O O O
be O O O O
used O O O O
to O O O O
identify O O O O
cyanobacteria O O O O
at O O O O
a O O O O
subgenus O O O O
level O O O O
and O O O O
can O O O O
be O O O O
useful O O O O
molecular O O O O
markers O O O O
to O O O O
establish O O O O
the O O O O
taxonomic O O O O
positions O O O O
of O O O O
cyanobacterial O O O O
isolates O O O O
in O O O O
laboratory O O O O
cultures O O O O
, O O O O
and O O O O
/ O O O O
or O O O O
to O O O O
assess O O O O
cyanobacterial O O O O
biodiversity O O O O
in O O O O
space O O O O
and O O O O
time O O O O
in O O O O
natural O O O O
ecosystems O O O O
. O O O O
    
Auritidibacter B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ignavus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gen O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
of O O O O
the O O O O
family O O O O
Micrococcaceae O O O O
isolated O O O O
from O O O O
an O O O O
ear O O O O
swab O O O O
of O O O O
a O O O O
man O O O O
with O O O O
otitis O O O O
externa O O O O
, O O O O
transfer O O O O
of O O O O
the O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
family O O O O
Yaniellaceae O O O O
Li O O O O
et O O O O
al O O O O
. O O O O
    
2008 O O O O
to O O O O
the O O O O
family O O O O
Micrococcaceae O O O O
and O O O O
emended O O O O
description O O O O
of O O O O
the O O O O
suborder O O O O
Micrococcineae O O O O
. O O O O
    
A O O O O
Gram O O O O
- O O O O
reaction O O O O
- O O O O
positive O O O O
, O O O O
aerobic O O O O
, O O O O
catalase O O O O
- O O O O
positive O O O O
, O O O O
non O O O O
- O O O O
spore O O O O
- O O O O
forming O O O O
, O O O O
rod O O O O
- O O O O
shaped O O O O
bacterium O O O O
designated O O O O
IMMIB B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
L O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1656 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
an O O O O
ear O O O O
swab O O O O
of O O O O
a O O O O
man O O O O
and O O O O
characterized O O O O
using O O O O
a O O O O
polyphasic O O O O
approach O O O O
. O O O O
    
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
analysis O O O O
indicated O O O O
that O O O O
strain O O O O
IMMIB B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
L O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1656 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
related O O O O
to O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
family O O O O
Micrococcaceae O O O O
( O O O O
& O O O O
lt O O O O
; O O O O
95 O O O O
. O O O O
1 O O O O
% O O O O
sequence O O O O
similarity O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Anaylsis O O O O
using O O O O
different O O O O
phylogenetic O O O O
algorithms O O O O
consistently O O O O
grouped O O O O
strain O O O O
IMMIB B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
L O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1656 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
with O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Yaniella O O O O
. O O O O
    
The O O O O
organism O O O O
posessed O O O O
a O O O O
cell O O O O
- O O O O
wall O O O O
murein O O O O
based O O O O
on O O O O
L O O O O
- O O O O
lysine O O O O
( O O O O
variation O O O O
A4alpha O O O O
, O O O O
type O O O O
L O O O O
- O O O O
Lys O O O O
- O O O O
Gly O O O O
- O O O O
L O O O O
- O O O O
Glu O O O O
) O O O O
, O O O O
MK O O O O
- O O O O
10 O O O O
as O O O O
the O O O O
predominant O O O O
menaquinone O O O O
and O O O O
long O O O O
- O O O O
chain O O O O
cellular O O O O
fatty O O O O
acids O O O O
of O O O O
straight O O O O
- O O O O
chain O O O O
and O O O O
branched O O O O
- O O O O
chain O O O O
saturated O O O O
types O O O O
( O O O O
with O O O O
iso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
15 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
and O O O O
anteiso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
17 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
predominating O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
polar O O O O
lipids O O O O
included O O O O
diphosphatidylglycerol O O O O
, O O O O
phosphatidylglycerol O O O O
and O O O O
phosphatidylinositol O O O O
in O O O O
addition O O O O
to O O O O
unknown O O O O
glycolipids O O O O
. O O O O
    
The O O O O
DNA O O O O
G O O O O
+ O O O O
C O O O O
content O O O O
was O O O O
59 O O O O
. O O O O
7 O O O O
mol O O O O
% O O O O
. O O O O
    
Based O O O O
on O O O O
its O O O O
distinctive O O O O
genotypic O O O O
and O O O O
phenotypic O O O O
characteristics O O O O
, O O O O
strain O O O O
IMMIB B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
L O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1656 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
represents O O O O
a O O O O
novel O O O O
species O O O O
in O O O O
a O O O O
novel O O O O
genus O O O O
, O O O O
for O O O O
which O O O O
the O O O O
name O O O O
Auritidibacter B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ignavus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gen O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
    
is O O O O
proposed O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
propose O O O O
that O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
family O O O O
Yaniellaceae O O O O
be O O O O
transferred O O O O
to O O O O
the O O O O
family O O O O
Micrococcaceae O O O O
with O O O O
amendments O O O O
to O O O O
the O O O O
description O O O O
of O O O O
the O O O O
suborder O O O O
Micrococcineae O O O O
. O O O O
    
The O O O O
type O O O O
strain O O O O
of O O O O
Auritidibacter B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ignavus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
IMMIB B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
L O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1656 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
= O O O O
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45359 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
= O O O O
CCUG B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
57943 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
. O O O O
    
Flavobacterium O O O O
beibuense O O O O
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
, O O O O
isolated O O O O
from O O O O
marine O O O O
sediment O O O O
. O O O O
    
A O O O O
taxonomic O O O O
study O O O O
was O O O O
carried O O O O
out O O O O
on O O O O
strain O O O O
F44 O O O O
- O O O O
8 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
, O O O O
which O O O O
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
a O O O O
crude O O O O
- O O O O
oil O O O O
- O O O O
degrading O O O O
consortium O O O O
, O O O O
enriched O O O O
from O O O O
marine O O O O
sediment O O O O
of O O O O
the O O O O
Beibu O O O O
Gulf O O O O
, O O O O
PR O O O O
China O O O O
. O O O O
    
The O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
of O O O O
strain O O O O
F44 O O O O
- O O O O
8 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
showed O O O O
highest O O O O
similarities O O O O
to O O O O
those O O O O
of O O O O
Flavobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
frigoris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
LMG O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
21922 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
93 O O O O
. O O O O
3 O O O O
% O O O O
) O O O O
, O O O O
Flavobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
terrae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
R2A1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
13 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
93 O O O O
. O O O O
3 O O O O
% O O O O
) O O O O
and O O O O
Flavobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
gelidilacus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
LMG O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
21477 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
93 O O O O
. O O O O
1 O O O O
% O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Sequence O O O O
similarities O O O O
to O O O O
other O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Flavobacterium O O O O
were O O O O
& O O O O
lt O O O O
; O O O O
93 O O O O
. O O O O
0 O O O O
% O O O O
. O O O O
    
The O O O O
dominant O O O O
fatty O O O O
acids O O O O
of O O O O
strain O O O O
F44 O O O O
- O O O O
8 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
were O O O O
iso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
15 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
, O O O O
summed O O O O
feature O O O O
3 O O O O
( O O O O
iso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
15 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
2 O O O O
- O O O O
OH O O O O
and O O O O
/ O O O O
or O O O O
C O O O O
( O O O O
16 O O O O
: O O O O
1 O O O O
) O O O O
omega7c O O O O
) O O O O
, O O O O
iso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
15 O O O O
: O O O O
1 O O O O
) O O O O
G O O O O
and O O O O
iso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
17 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
3 O O O O
- O O O O
OH O O O O
. O O O O
    
The O O O O
DNA O O O O
G O O O O
+ O O O O
C O O O O
content O O O O
of O O O O
strain O O O O
F44 O O O O
- O O O O
8 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
was O O O O
38 O O O O
. O O O O
6 O O O O
mol O O O O
% O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
are O O O O
consistent O O O O
with O O O O
characteristics O O O O
of O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Flavobacterium O O O O
. O O O O
    
Strain O O O O
F44 O O O O
- O O O O
8 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
could O O O O
, O O O O
however O O O O
, O O O O
be O O O O
readily O O O O
distinguished O O O O
from O O O O
all O O O O
known O O O O
Flavobacterium O O O O
species O O O O
by O O O O
a O O O O
number O O O O
of O O O O
phenotypic O O O O
features O O O O
. O O O O
    
Therefore O O O O
, O O O O
according O O O O
to O O O O
the O O O O
phenotypic O O O O
and O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
data O O O O
, O O O O
strain O O O O
F44 O O O O
- O O O O
8 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
represents O O O O
a O O O O
novel O O O O
species O O O O
in O O O O
the O O O O
genus O O O O
Flavobacterium O O O O
, O O O O
for O O O O
which O O O O
the O O O O
name O O O O
Flavobacterium O O O O
beibuense O O O O
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
    
is O O O O
proposed O O O O
( O O O O
type O O O O
strain O O O O
F44 O O O O
- O O O O
8 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
CCTCC O O O O
AB O O O O
209067 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
LMG O O O O
25233 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
MCCC O O O O
1A02877 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Fungal O O O O
secondary O O O O
metabolites O O O O
- O O O O
strategies O O O O
to O O O O
activate O O O O
silent O O O O
gene O O O O
clusters O O O O
. O O O O
    
Filamentous O O O O
fungi O O O O
produce O O O O
a O O O O
multitude O O O O
of O O O O
low O O O O
molecular O O O O
weight O O O O
bioactive O O O O
compounds O O O O
. O O O O
    
The O O O O
increasing O O O O
number O O O O
of O O O O
fungal O O O O
genome O O O O
sequences O O O O
impressively O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
their O O O O
biosynthetic O O O O
potential O O O O
is O O O O
far O O O O
from O O O O
being O O O O
exploited O O O O
. O O O O
    
In O O O O
fungi O O O O
, O O O O
the O O O O
genes O O O O
required O O O O
for O O O O
the O O O O
biosynthesis O O O O
of O O O O
a O O O O
secondary O O O O
metabolite O O O O
are O O O O
clustered O O O O
. O O O O
    
Many O O O O
of O O O O
these O O O O
bioinformatically O O O O
newly O O O O
discovered O O O O
secondary O O O O
metabolism O O O O
gene O O O O
clusters O O O O
are O O O O
silent O O O O
under O O O O
standard O O O O
laboratory O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
Consequently O O O O
, O O O O
no O O O O
product O O O O
can O O O O
be O O O O
found O O O O
. O O O O
    
This O O O O
review O O O O
summarizes O O O O
the O O O O
current O O O O
strategies O O O O
that O O O O
have O O O O
been O O O O
successfully O O O O
applied O O O O
during O O O O
the O O O O
last O O O O
years O O O O
to O O O O
activate O O O O
these O O O O
silent O O O O
gene O O O O
clusters O O O O
in O O O O
filamentous O O O O
fungi O O O O
, O O O O
especially O O O O
in O O O O
the O O O O
genus O O O O
Aspergillus O O O O
. O O O O
    
The O O O O
techniques O O O O
take O O O O
advantage O O O O
of O O O O
genome O O O O
mining O O O O
, O O O O
vary O O O O
from O O O O
the O O O O
simple O O O O
search O O O O
for O O O O
compounds O O O O
with O O O O
bioinformatically O O O O
predicted O O O O
physicochemical O O O O
properties O O O O
up O O O O
to O O O O
methods O O O O
that O O O O
exploit O O O O
a O O O O
probable O O O O
interaction O O O O
of O O O O
microorganisms O O O O
. O O O O
    
Until O O O O
now O O O O
, O O O O
the O O O O
majority O O O O
of O O O O
successful O O O O
approaches O O O O
have O O O O
been O O O O
based O O O O
on O O O O
molecular O O O O
biology O O O O
like O O O O
the O O O O
generation O O O O
of O O O O
gene O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
knock O O O O
outs O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
, O O O O
promoter O O O O
exchange O O O O
, O O O O
overexpression O O O O
of O O O O
transcription O O O O
factors O O O O
or O O O O
other O O O O
pleiotropic O O O O
regulators O O O O
. O O O O
    
Moreover O O O O
, O O O O
strategies O O O O
based O O O O
on O O O O
epigenetics O O O O
opened O O O O
a O O O O
new O O O O
avenue O O O O
for O O O O
the O O O O
elucidation O O O O
of O O O O
the O O O O
regulation O O O O
of O O O O
secondary O O O O
metabolite O O O O
formation O O O O
and O O O O
will O O O O
certainly O O O O
continue O O O O
to O O O O
play O O O O
a O O O O
significant O O O O
role O O O O
for O O O O
the O O O O
elucidation O O O O
of O O O O
cryptic O O O O
natural O O O O
products O O O O
. O O O O
    
The O O O O
conditions O O O O
under O O O O
which O O O O
a O O O O
given O O O O
gene O O O O
cluster O O O O
is O O O O
naturally O O O O
expressed O O O O
are O O O O
largely O O O O
unknown O O O O
. O O O O
    
One O O O O
technique O O O O
is O O O O
to O O O O
attempt O O O O
to O O O O
simulate O O O O
the O O O O
natural O O O O
habitat O O O O
by O O O O
co O O O O
- O O O O
cultivation O O O O
of O O O O
microorganisms O O O O
from O O O O
the O O O O
same O O O O
ecosystem O O O O
. O O O O
    
This O O O O
has O O O O
already O O O O
led O O O O
to O O O O
the O O O O
activation O O O O
of O O O O
silent O O O O
gene O O O O
clusters O O O O
and O O O O
the O O O O
identification O O O O
of O O O O
novel O O O O
compounds O O O O
in O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
These O O O O
simulation O O O O
strategies O O O O
will O O O O
help O O O O
discover O O O O
new O O O O
natural O O O O
products O O O O
in O O O O
the O O O O
future O O O O
, O O O O
and O O O O
may O O O O
also O O O O
provide O O O O
fundamental O O O O
new O O O O
insights O O O O
into O O O O
microbial O O O O
communication O O O O
. O O O O
    
Compartmentalization O O O O
and O O O O
molecular O O O O
traffic O O O O
in O O O O
secondary O O O O
metabolism O O O O
: O O O O
a O O O O
new O O O O
understanding O O O O
of O O O O
established O O O O
cellular O O O O
processes O O O O
. O O O O
    
Great O O O O
progress O O O O
has O O O O
been O O O O
made O O O O
in O O O O
understanding O O O O
the O O O O
regulation O O O O
of O O O O
expression O O O O
of O O O O
genes O O O O
involved O O O O
in O O O O
secondary O O O O
metabolism O O O O
. O O O O
    
Less O O O O
is O O O O
known O O O O
about O O O O
the O O O O
mechanisms O O O O
that O O O O
govern O O O O
the O O O O
spatial O O O O
distribution O O O O
of O O O O
the O O O O
enzymes O O O O
, O O O O
cofactors O O O O
, O O O O
and O O O O
substrates O O O O
that O O O O
mediate O O O O
catalysis O O O O
of O O O O
secondary O O O O
metabolites O O O O
within O O O O
the O O O O
cell O O O O
. O O O O
    
Filamentous O O O O
fungi O O O O
in O O O O
the O O O O
genus O O O O
Aspergillus O O O O
synthesize O O O O
an O O O O
array O O O O
of O O O O
secondary O O O O
metabolites O O O O
and O O O O
provide O O O O
useful O O O O
systems O O O O
to O O O O
analyze O O O O
the O O O O
mechanisms O O O O
that O O O O
mediate O O O O
the O O O O
temporal O O O O
and O O O O
spatial O O O O
regulation O O O O
of O O O O
secondary O O O O
metabolism O O O O
in O O O O
eukaryotes O O O O
. O O O O
    
For O O O O
example O O O O
, O O O O
aflatoxin O O O O
biosynthesis O O O O
in O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
parasiticus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
has O O O O
been O O O O
studied O O O O
intensively O O O O
because O O O O
this O O O O
mycotoxin O O O O
is O O O O
highly O O O O
toxic O O O O
, O O O O
mutagenic O O O O
, O O O O
and O O O O
carcinogenic O O O O
in O O O O
humans B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
animals O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
aflatoxin O O O O
synthesis O O O O
to O O O O
illustrate O O O O
key O O O O
concepts O O O O
, O O O O
this O O O O
review O O O O
focuses O O O O
on O O O O
the O O O O
mechanisms O O O O
by O O O O
which O O O O
sub O O O O
- O O O O
cellular O O O O
compartmentalization O O O O
and O O O O
intra O O O O
- O O O O
cellular O O O O
molecular O O O O
traffic O O O O
contribute O O O O
to O O O O
the O O O O
initiation O O O O
and O O O O
completion O O O O
of O O O O
secondary O O O O
metabolism O O O O
within O O O O
the O O O O
cell O O O O
. O O O O
    
We O O O O
discuss O O O O
the O O O O
recent O O O O
discovery O O O O
of O O O O
aflatoxisomes O O O O
, O O O O
specialized O O O O
trafficking O O O O
vesicles O O O O
that O O O O
participate O O O O
in O O O O
the O O O O
compartmentalization O O O O
of O O O O
aflatoxin O O O O
synthesis O O O O
and O O O O
export O O O O
of O O O O
the O O O O
toxin O O O O
to O O O O
the O O O O
cell O O O O
exterior O O O O
; O O O O
this O O O O
work O O O O
provides O O O O
a O O O O
new O O O O
and O O O O
clearer O O O O
understanding O O O O
of O O O O
how O O O O
cells O O O O
integrate O O O O
secondary O O O O
metabolism O O O O
into O O O O
basic O O O O
cellular O O O O
metabolism O O O O
via O O O O
the O O O O
intra O O O O
- O O O O
cellular O O O O
trafficking O O O O
machinery O O O O
. O O O O
    
The O O O O
lipid O O O O
language O O O O
of O O O O
plant O O O O
- O O O O
fungal O O O O
interactions O O O O
. O O O O
    
Lipid O O O O
mediated O O O O
cross O O O O
- O O O O
kingdom O O O O
communication O O O O
between O O O O
hosts O O O O
and O O O O
pathogens O O O O
is O O O O
a O O O O
rapidly O O O O
emerging O O O O
field O O O O
in O O O O
molecular O O O O
plant O O O O
- O O O O
fungal O O O O
interactions O O O O
. O O O O
    
Amidst O O O O
our O O O O
growing O O O O
understanding O O O O
of O O O O
fungal O O O O
and O O O O
plant O O O O
chemical O O O O
cross O O O O
- O O O O
talk O O O O
lies O O O O
the O O O O
distinct O O O O
, O O O O
yet O O O O
little O O O O
studied O O O O
, O O O O
role O O O O
for O O O O
a O O O O
group O O O O
of O O O O
oxygenated O O O O
lipids O O O O
derived O O O O
from O O O O
polyunsaturated O O O O
fatty O O O O
acids O O O O
, O O O O
termed O O O O
oxylipins O O O O
. O O O O
    
Endogenous O O O O
fungal O O O O
oxylipins O O O O
are O O O O
known O O O O
for O O O O
their O O O O
roles O O O O
in O O O O
carrying O O O O
out O O O O
pathogenic O O O O
strategies O O O O
to O O O O
successfully O O O O
colonize O O O O
their O O O O
host O O O O
, O O O O
reproduce O O O O
, O O O O
and O O O O
synthesize O O O O
toxins O O O O
. O O O O
    
While O O O O
plant O O O O
oxylipins O O O O
also O O O O
have O O O O
functions O O O O
in O O O O
reproduction O O O O
and O O O O
development O O O O
, O O O O
they O O O O
are O O O O
largely O O O O
recognized O O O O
as O O O O
agents O O O O
that O O O O
facilitate O O O O
resistance O O O O
to O O O O
pathogen O O O O
attack O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
review O O O O
the O O O O
composition O O O O
and O O O O
endogenous O O O O
functions O O O O
of O O O O
oxylipins O O O O
produced O O O O
by O O O O
both O O O O
plants O O O O
and O O O O
fungi O O O O
and O O O O
introduce O O O O
evidence O O O O
which O O O O
suggests O O O O
that O O O O
fungal O O O O
pathogens O O O O
exploit O O O O
host O O O O
oxylipins O O O O
to O O O O
facilitate O O O O
their O O O O
own O O O O
virulence O O O O
and O O O O
pathogenic O O O O
development O O O O
. O O O O
    
Specifically O O O O
, O O O O
we O O O O
describe O O O O
how O O O O
fungi O O O O
induce O O O O
plant O O O O
lipid O O O O
metabolism O O O O
to O O O O
utilize O O O O
plant O O O O
oxylipins O O O O
in O O O O
order O O O O
to O O O O
promote O O O O
G O O O O
- O O O O
protein O O O O
- O O O O
mediated O O O O
regulation O O O O
of O O O O
sporulation O O O O
and O O O O
mycotoxin O O O O
production O O O O
in O O O O
the O O O O
fungus O O O O
. O O O O
    
The O O O O
use O O O O
of O O O O
host O O O O
- O O O O
ligand O O O O
mimicry O O O O
( O O O O
i O O O O
. O O O O
e O O O O
. O O O O
coronatine O O O O
) O O O O
to O O O O
manipulate O O O O
plant O O O O
defense O O O O
responses O O O O
that O O O O
benefit O O O O
the O O O O
fungus O O O O
are O O O O
also O O O O
implicated O O O O
. O O O O
    
Treatment O O O O
non O O O O
- O O O O
adherence O O O O
in O O O O
teenage O O O O
and O O O O
young O O O O
adult O O O O
patients O O O O
with O O O O
cancer O O O O
. O O O O
    
Adhering O O O O
to O O O O
treatment O O O O
can O O O O
be O O O O
a O O O O
significant O O O O
issue O O O O
for O O O O
many O O O O
patients O O O O
diagnosed O O O O
with O O O O
chronic O O O O
health O O O O
conditions O O O O
and O O O O
this O O O O
has O O O O
been O O O O
reported O O O O
to O O O O
be O O O O
greater O O O O
during O O O O
the O O O O
adolescent O O O O
years O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
little O O O O
is O O O O
known O O O O
about O O O O
treatment O O O O
adherence O O O O
in O O O O
teenage O O O O
and O O O O
young O O O O
adult O O O O
( O O O O
TYA O O O O
) O O O O
patients O O O O
with O O O O
cancer O O O O
. O O O O
    
To O O O O
increase O O O O
awareness O O O O
of O O O O
the O O O O
adherence O O O O
challenges O O O O
faced O O O O
by O O O O
these O O O O
patients O O O O
, O O O O
we O O O O
have O O O O
reviewed O O O O
the O O O O
published O O O O
work O O O O
. O O O O
    
The O O O O
available O O O O
evidence O O O O
suggests O O O O
that O O O O
a O O O O
substantial O O O O
proportion O O O O
of O O O O
TYA O O O O
patients O O O O
with O O O O
cancer O O O O
do O O O O
have O O O O
difficulties O O O O
, O O O O
with O O O O
reports O O O O
that O O O O
up O O O O
to O O O O
63 O O O O
% O O O O
of O O O O
patients O O O O
do O O O O
not O O O O
adhere O O O O
to O O O O
their O O O O
treatment O O O O
regimens O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
with O O O O
inconsistent O O O O
findings O O O O
across O O O O
studies O O O O
, O O O O
the O O O O
true O O O O
extent O O O O
of O O O O
non O O O O
- O O O O
adherence O O O O
for O O O O
these O O O O
young O O O O
patients O O O O
is O O O O
still O O O O
unclear O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
it O O O O
is O O O O
apparent O O O O
that O O O O
there O O O O
are O O O O
many O O O O
components O O O O
of O O O O
the O O O O
cancer O O O O
treatment O O O O
regimen O O O O
that O O O O
have O O O O
yet O O O O
to O O O O
be O O O O
assessed O O O O
in O O O O
relation O O O O
to O O O O
patient O O O O
adherence O O O O
. O O O O
    
Factors O O O O
that O O O O
have O O O O
been O O O O
shown O O O O
to O O O O
affect O O O O
treatment O O O O
adherence O O O O
in O O O O
TYA O O O O
patients O O O O
include O O O O
patient O O O O
emotional O O O O
functioning O O O O
( O O O O
depression O O O O
and O O O O
self O O O O
- O O O O
esteem O O O O
) O O O O
, O O O O
patient O O O O
health O O O O
beliefs O O O O
( O O O O
perceived O O O O
illness O O O O
severity O O O O
and O O O O
vulnerability O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
family O O O O
environment O O O O
( O O O O
parental O O O O
support O O O O
and O O O O
parent O O O O
- O O O O
child O O O O
concordance O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Strategies O O O O
that O O O O
foster O O O O
greater O O O O
patient O O O O
adherence O O O O
are O O O O
also O O O O
identified O O O O
. O O O O
    
These O O O O
strategies O O O O
are O O O O
multifactorial O O O O
, O O O O
targeting O O O O
not O O O O
only O O O O
the O O O O
patient O O O O
, O O O O
but O O O O
the O O O O
health O O O O
professional O O O O
, O O O O
family O O O O
, O O O O
and O O O O
treatment O O O O
regimen O O O O
. O O O O
    
This O O O O
review O O O O
highlights O O O O
the O O O O
lack O O O O
of O O O O
interventional O O O O
studies O O O O
addressing O O O O
treatment O O O O
adherence O O O O
in O O O O
TYA O O O O
patients O O O O
with O O O O
cancer O O O O
, O O O O
with O O O O
only O O O O
one O O O O
such O O O O
intervention O O O O
being O O O O
identified O O O O
: O O O O
a O O O O
video O O O O
game O O O O
intervention O O O O
focusing O O O O
on O O O O
behavioural O O O O
issues O O O O
related O O O O
to O O O O
cancer O O O O
treatment O O O O
and O O O O
care O O O O
. O O O O
    
Methodological O O O O
issues O O O O
in O O O O
measuring O O O O
adherence O O O O
are O O O O
addressed O O O O
and O O O O
suggestions O O O O
for O O O O
improving O O O O
the O O O O
design O O O O
of O O O O
future O O O O
adherence O O O O
studies O O O O
highlighted O O O O
, O O O O
of O O O O
which O O O O
there O O O O
is O O O O
a O O O O
great O O O O
need O O O O
. O O O O
    
Monovalent O O O O
cations O O O O
regulate O O O O
expression O O O O
and O O O O
activity O O O O
of O O O O
the O O O O
Hak1 O O O O
potassium O O O O
transporter O O O O
in O O O O
Debaryomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
hansenii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Debaryomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
hansenii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
able O O O O
to O O O O
grow O O O O
in O O O O
a O O O O
medium O O O O
containing O O O O
residual O O O O
amounts O O O O
of O O O O
K O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
, O O O O
indicating O O O O
the O O O O
activity O O O O
of O O O O
high O O O O
affinity O O O O
K O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
transporters O O O O
. O O O O
    
Transcriptional O O O O
regulation O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
genes O O O O
encoding O O O O
the O O O O
two O O O O
potassium O O O O
uptake O O O O
systems O O O O
in O O O O
D B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
hansenii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
revealed O O O O
that O O O O
while O O O O
DhTRK1 O O O O
is O O O O
not O O O O
regulated O O O O
at O O O O
transcriptional O O O O
level O O O O
, O O O O
expression O O O O
of O O O O
DhHAK1 O O O O
required O O O O
starvation O O O O
in O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
K O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
and O O O O
Na O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
and O O O O
was O O O O
not O O O O
affected O O O O
by O O O O
changes O O O O
in O O O O
membrane O O O O
potential O O O O
. O O O O
    
Rb O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
transport O O O O
in O O O O
cells O O O O
expressing O O O O
DhHAK1 O O O O
was O O O O
activated O O O O
by O O O O
external O O O O
Na O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
or O O O O
acidic O O O O
pH O O O O
and O O O O
inhibited O O O O
by O O O O
high O O O O
pH O O O O
. O O O O
    
We O O O O
propose O O O O
a O O O O
K O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
- O O O O
H O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
symporter O O O O
that O O O O
, O O O O
under O O O O
certain O O O O
conditions O O O O
may O O O O
work O O O O
as O O O O
a O O O O
K O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
- O O O O
Na O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
transporter O O O O
, O O O O
as O O O O
the O O O O
mechanism O O O O
driving O O O O
K O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
influx O O O O
mediated O O O O
by O O O O
DhHak1p O O O O
. O O O O
    
Isocitrate O O O O
dehydrogenase O O O O
- O O O O
1 O O O O
mutations O O O O
: O O O O
a O O O O
fundamentally O O O O
new O O O O
understanding O O O O
of O O O O
diffuse O O O O
glioma O O O O
? O O O O
    
The O O O O
discovery O O O O
of O O O O
somatic O O O O
mutations O O O O
in O O O O
the O O O O
gene O O O O
encoding O O O O
isocitrate O O O O
dehydrogenase O O O O
- O O O O
1 O O O O
( O O O O
IDH1 O O O O
) O O O O
in O O O O
glioblastomas O O O O
was O O O O
remarkable O O O O
because O O O O
the O O O O
enzyme O O O O
was O O O O
not O O O O
previously O O O O
identified O O O O
with O O O O
any O O O O
known O O O O
oncogenic O O O O
pathway O O O O
. O O O O
    
IDH1 O O O O
is O O O O
mutated O O O O
in O O O O
up O O O O
to O O O O
75 O O O O
% O O O O
of O O O O
grade O O O O
II O O O O
and O O O O
grade O O O O
III O O O O
diffuse O O O O
gliomas O O O O
. O O O O
    
Apart O O O O
from O O O O
acute O O O O
myeloid O O O O
leukaemia O O O O
, O O O O
other O O O O
tumour O O O O
types O O O O
do O O O O
not O O O O
carry O O O O
IDH1 O O O O
mutations O O O O
. O O O O
    
Mutations O O O O
in O O O O
a O O O O
homologous O O O O
gene O O O O
, O O O O
IDH2 O O O O
, O O O O
have O O O O
also O O O O
been O O O O
identified O O O O
, O O O O
although O O O O
they O O O O
are O O O O
much O O O O
rarer O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
TP53 O O O O
mutations O O O O
and O O O O
1p O O O O
/ O O O O
19q O O O O
codeletions O O O O
are O O O O
mutually O O O O
exclusive O O O O
in O O O O
gliomas O O O O
, O O O O
in O O O O
both O O O O
of O O O O
these O O O O
genotypes O O O O
IDH1 O O O O
mutations O O O O
are O O O O
common O O O O
. O O O O
    
IDH1 O O O O
and O O O O
IDH2 O O O O
mutations O O O O
are O O O O
early O O O O
events O O O O
in O O O O
the O O O O
development O O O O
of O O O O
gliomas O O O O
. O O O O
    
Moreover O O O O
, O O O O
IDH1 O O O O
and O O O O
IDH2 O O O O
mutations O O O O
are O O O O
a O O O O
major O O O O
prognostic O O O O
marker O O O O
for O O O O
overall O O O O
and O O O O
progression O O O O
- O O O O
free O O O O
survival O O O O
in O O O O
grade O O O O
II O O O O
- O O O O
IV O O O O
gliomas O O O O
. O O O O
    
Mutated O O O O
IDH1 O O O O
has O O O O
an O O O O
altered O O O O
catalytic O O O O
activity O O O O
that O O O O
results O O O O
in O O O O
the O O O O
accumulation O O O O
of O O O O
2 O O O O
- O O O O
hydroxyglutarate O O O O
. O O O O
    
Molecularly O O O O
, O O O O
IDH1 O O O O
and O O O O
IDH2 O O O O
mutations O O O O
are O O O O
heterozygous O O O O
, O O O O
affect O O O O
only O O O O
a O O O O
single O O O O
codon O O O O
, O O O O
and O O O O
rarely O O O O
occur O O O O
together O O O O
. O O O O
    
Because O O O O
IDH1 O O O O
does O O O O
not O O O O
belong O O O O
to O O O O
a O O O O
traditional O O O O
oncogenic O O O O
pathway O O O O
and O O O O
is O O O O
specifically O O O O
and O O O O
commonly O O O O
mutated O O O O
in O O O O
gliomas O O O O
, O O O O
the O O O O
altered O O O O
enzymatic O O O O
activity O O O O
of O O O O
IDH1 O O O O
may O O O O
provide O O O O
a O O O O
fundamentally O O O O
new O O O O
understanding O O O O
of O O O O
diffuse O O O O
glioma O O O O
. O O O O
    
Characterization O O O O
of O O O O
the O O O O
GPI O O O O
- O O O O
anchored O O O O
endo O O O O
Beta O O O O
- O O O O
1 O O O O
, O O O O
3 O O O O
- O O O O
glucanase O O O O
Eng2 O O O O
of O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
A O O O O
GPI O O O O
- O O O O
anchored O O O O
endo O O O O
Beta O O O O
- O O O O
1 O O O O
, O O O O
3 O O O O
- O O O O
glucanase O O O O
of O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
characterized O O O O
. O O O O
    
The O O O O
enzyme O O O O
encoded O O O O
by O O O O
ENG2 O O O O
( O O O O
AFUA O O O O
_ O O O O
2g14360 O O O O
) O O O O
belongs O O O O
to O O O O
the O O O O
glycoside O O O O
hydrolase O O O O
family O O O O
16 O O O O
( O O O O
GH16 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
activity O O O O
was O O O O
characterized O O O O
using O O O O
a O O O O
recombinant O O O O
protein O O O O
produced O O O O
by O O O O
Pichiapastoris B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
recombinant O O O O
enzyme O O O O
preferentially O O O O
acts O O O O
on O O O O
soluble O O O O
Beta O O O O
- O O O O
1 O O O O
, O O O O
3 O O O O
- O O O O
glucans O O O O
. O O O O
    
Enzymatic O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
endoglucanase O O O O
activity O O O O
using O O O O
Carboxymethyl O O O O
- O O O O
Curdlan O O O O
- O O O O
Remazol O O O O
Brilliant O O O O
Blue O O O O
( O O O O
CM O O O O
- O O O O
Curdlan O O O O
- O O O O
RBB O O O O
) O O O O
as O O O O
a O O O O
substrate O O O O
revealed O O O O
a O O O O
wide O O O O
temperature O O O O
optimum O O O O
of O O O O
24 O O O O
- O O O O
40 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
, O O O O
a O O O O
pH O O O O
optimum O O O O
of O O O O
5 O O O O
. O O O O
0 O O O O
- O O O O
6 O O O O
. O O O O
5 O O O O
and O O O O
a O O O O
K O O O O
( O O O O
m O O O O
) O O O O
of O O O O
0 O O O O
. O O O O
8 O O O O
mg O O O O
ml O O O O
( O O O O
- O O O O
1 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
HPAEC O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
products O O O O
formed O O O O
by O O O O
Eng2 O O O O
when O O O O
acting O O O O
on O O O O
different O O O O
oligo O O O O
- O O O O
Beta O O O O
- O O O O
1 O O O O
, O O O O
3 O O O O
- O O O O
glucans O O O O
confirmed O O O O
the O O O O
predicted O O O O
endoglucanase O O O O
activity O O O O
and O O O O
also O O O O
revealed O O O O
a O O O O
transferase O O O O
activity O O O O
for O O O O
oligosaccharides O O O O
of O O O O
a O O O O
low O O O O
degree O O O O
of O O O O
polymerization O O O O
. O O O O
    
The O O O O
growth O O O O
phenotype O O O O
of O O O O
the O O O O
Afeng2 O O O O
mutant O O O O
was O O O O
identical O O O O
to O O O O
that O O O O
of O O O O
the O O O O
wt O O O O
strain O O O O
. O O O O
    
Measuring O O O O
impact O O O O
in O O O O
the O O O O
Millennium O O O O
Development O O O O
Goal O O O O
era O O O O
and O O O O
beyond O O O O
: O O O O
a O O O O
new O O O O
approach O O O O
to O O O O
large O O O O
- O O O O
scale O O O O
effectiveness O O O O
evaluations O O O O
. O O O O
    
Evaluation O O O O
of O O O O
large O O O O
- O O O O
scale O O O O
programmes O O O O
and O O O O
initiatives O O O O
aimed O O O O
at O O O O
improvement O O O O
of O O O O
health O O O O
in O O O O
countries O O O O
of O O O O
low O O O O
and O O O O
middle O O O O
income O O O O
needs O O O O
a O O O O
new O O O O
approach O O O O
. O O O O
    
Traditional O O O O
designs O O O O
, O O O O
which O O O O
compare O O O O
areas O O O O
with O O O O
and O O O O
without O O O O
a O O O O
given O O O O
programme O O O O
, O O O O
are O O O O
no O O O O
longer O O O O
relevant O O O O
at O O O O
a O O O O
time O O O O
when O O O O
many O O O O
programmes O O O O
are O O O O
being O O O O
scaled O O O O
up O O O O
in O O O O
virtually O O O O
every O O O O
district O O O O
in O O O O
the O O O O
world O O O O
. O O O O
    
We O O O O
propose O O O O
an O O O O
evolution O O O O
in O O O O
evaluation O O O O
design O O O O
, O O O O
a O O O O
national O O O O
platform O O O O
approach O O O O
that O O O O
: O O O O
uses O O O O
the O O O O
district O O O O
as O O O O
the O O O O
unit O O O O
of O O O O
design O O O O
and O O O O
analysis O O O O
; O O O O
is O O O O
based O O O O
on O O O O
continuous O O O O
monitoring O O O O
of O O O O
different O O O O
levels O O O O
of O O O O
indicators O O O O
; O O O O
gathers O O O O
additional O O O O
data O O O O
before O O O O
, O O O O
during O O O O
, O O O O
and O O O O
after O O O O
the O O O O
period O O O O
to O O O O
be O O O O
assessed O O O O
by O O O O
multiple O O O O
methods O O O O
; O O O O
uses O O O O
several O O O O
analytical O O O O
techniques O O O O
to O O O O
deal O O O O
with O O O O
various O O O O
data O O O O
gaps O O O O
and O O O O
biases O O O O
; O O O O
and O O O O
includes O O O O
interim O O O O
and O O O O
summative O O O O
evaluation O O O O
analyses O O O O
. O O O O
    
This O O O O
new O O O O
approach O O O O
will O O O O
promote O O O O
country O O O O
ownership O O O O
, O O O O
transparency O O O O
, O O O O
and O O O O
donor O O O O
coordination O O O O
while O O O O
providing O O O O
a O O O O
rigorous O O O O
comparison O O O O
of O O O O
the O O O O
cost O O O O
- O O O O
effectiveness O O O O
of O O O O
different O O O O
scale O O O O
- O O O O
up O O O O
approaches O O O O
. O O O O
    
UreA O O O O
, O O O O
the O O O O
major O O O O
urea O O O O
/ O O O O
H O O O O
+ O O O O
symporter O O O O
in O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
We O O O O
report O O O O
here O O O O
the O O O O
characterization O O O O
of O O O O
UreA O O O O
, O O O O
a O O O O
high O O O O
- O O O O
affinity O O O O
urea O O O O
/ O O O O
H O O O O
+ O O O O
symporter O O O O
of O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
deletion O O O O
of O O O O
the O O O O
encoding O O O O
gene O O O O
abolishes O O O O
urea O O O O
transport O O O O
at O O O O
low O O O O
substrate O O O O
concentrations O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
in O O O O
these O O O O
conditions O O O O
UreA O O O O
is O O O O
the O O O O
sole O O O O
transport O O O O
system O O O O
specific O O O O
for O O O O
urea O O O O
in O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
ureA O O O O
gene O O O O
is O O O O
not O O O O
inducible O O O O
by O O O O
urea O O O O
or O O O O
its O O O O
precursors O O O O
, O O O O
but O O O O
responds O O O O
to O O O O
nitrogen O O O O
metabolite O O O O
repression O O O O
, O O O O
necessitating O O O O
for O O O O
its O O O O
expression O O O O
the O O O O
AreA O O O O
GATA O O O O
factor O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
to O O O O
what O O O O
was O O O O
observed O O O O
for O O O O
other O O O O
transporters O O O O
in O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
repression O O O O
by O O O O
ammonium O O O O
is O O O O
also O O O O
operative O O O O
during O O O O
the O O O O
isotropic O O O O
growth O O O O
phase O O O O
. O O O O
    
The O O O O
activity O O O O
of O O O O
UreA O O O O
is O O O O
down O O O O
- O O O O
regulated O O O O
post O O O O
- O O O O
translationally O O O O
by O O O O
ammonium O O O O
- O O O O
promoted O O O O
endocytosis O O O O
. O O O O
    
A O O O O
number O O O O
of O O O O
homologues O O O O
of O O O O
UreA O O O O
have O O O O
been O O O O
identified O O O O
in O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
other O O O O
Aspergilli O O O O
, O O O O
which O O O O
cluster O O O O
in O O O O
four O O O O
groups O O O O
, O O O O
two O O O O
of O O O O
which O O O O
contain O O O O
the O O O O
urea O O O O
transporters O O O O
characterized O O O O
so O O O O
far O O O O
in O O O O
fungi O O O O
and O O O O
plants O O O O
. O O O O
    
This O O O O
phylogeny O O O O
may O O O O
have O O O O
arisen O O O O
by O O O O
gene O O O O
duplication O O O O
events O O O O
, O O O O
giving O O O O
place O O O O
to O O O O
putative O O O O
transport O O O O
proteins O O O O
that O O O O
could O O O O
have O O O O
acquired O O O O
novel O O O O
, O O O O
still O O O O
unidentified O O O O
functions O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Candida B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Rgd1 O O O O
is O O O O
a O O O O
RhoGAP O O O O
protein O O O O
involved O O O O
in O O O O
the O O O O
control O O O O
of O O O O
filamentous O O O O
growth O O O O
. O O O O
    
Rho O O O O
proteins O O O O
are O O O O
essential O O O O
regulators O O O O
of O O O O
polarized O O O O
growth O O O O
in O O O O
eukaryotic O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
These O O O O
proteins O O O O
are O O O O
down O O O O
- O O O O
regulated O O O O
in O O O O
vivo O O O O
by O O O O
specific O O O O
Rho O O O O
GTPase O O O O
Activating O O O O
Proteins O O O O
( O O O O
RhoGAP O O O O
) O O O O
. O O O O
    
We O O O O
investigated O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
Rgd1 O O O O
RhoGAP O O O O
, O O O O
encoded O O O O
by O O O O
the O O O O
Candida B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
RGD1 O O O O
gene O O O O
. O O O O
    
We O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
CaCdc42 O O O O
, O O O O
CaRho3 O O O O
and O O O O
CaRho4 O O O O
proteins O O O O
had O O O O
an O O O O
intrinsic O O O O
GTPase O O O O
activity O O O O
and O O O O
that O O O O
CaRgd1 O O O O
stimulates O O O O
in O O O O
vitro O O O O
GTP O O O O
hydrolysis O O O O
of O O O O
these O O O O
GTPases O O O O
. O O O O
    
Deletion O O O O
of O O O O
RGD1 O O O O
in O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
results O O O O
in O O O O
sensitivity O O O O
to O O O O
low O O O O
pH O O O O
as O O O O
already O O O O
described O O O O
for O O O O
rgd1Delta O O O O
in O O O O
Saccharomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cerevisiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
role O O O O
of O O O O
Rgd1 O O O O
in O O O O
survival O O O O
at O O O O
low O O O O
pH O O O O
is O O O O
conserved O O O O
in O O O O
the O O O O
two O O O O
yeast O O O O
species O O O O
as O O O O
the O O O O
CaRGD1 O O O O
gene O O O O
complements O O O O
the O O O O
Scrgd1Delta O O O O
sensitivity O O O O
. O O O O
    
By O O O O
tagging O O O O
the O O O O
RhoGAP O O O O
with O O O O
GFP O O O O
, O O O O
we O O O O
found O O O O
that O O O O
CaRgd1 O O O O
is O O O O
localized O O O O
at O O O O
the O O O O
tip O O O O
and O O O O
cortex O O O O
of O O O O
growing O O O O
cells O O O O
and O O O O
during O O O O
cytokinesis O O O O
at O O O O
the O O O O
septation O O O O
sites O O O O
in O O O O
yeast O O O O
and O O O O
filamentous O O O O
forms O O O O
. O O O O
    
We O O O O
investigated O O O O
the O O O O
effect O O O O
of O O O O
CaRgd1 O O O O
on O O O O
the O O O O
control O O O O
of O O O O
the O O O O
polarized O O O O
growth O O O O
. O O O O
    
Removing O O O O
CaRGD1 O O O O
alleles O O O O
increased O O O O
filamentous O O O O
growth O O O O
and O O O O
cells O O O O
lacking O O O O
CaRgd1 O O O O
presented O O O O
longer O O O O
germ O O O O
tubes O O O O
. O O O O
    
Conversely O O O O
, O O O O
RGD1 O O O O
overexpression O O O O
restricted O O O O
hyphae O O O O
growth O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
Rgd1 O O O O
is O O O O
critical O O O O
for O O O O
filamentous O O O O
formation O O O O
in O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
especially O O O O
for O O O O
filamentous O O O O
elongation O O O O
. O O O O
    
Surface O O O O
and O O O O
flagella O O O O
morphology O O O O
of O O O O
the O O O O
motile O O O O
form O O O O
of O O O O
Chromera B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
velia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
revealed O O O O
by O O O O
field O O O O
- O O O O
emission O O O O
scanning O O O O
electron O O O O
microscopy O O O O
. O O O O
    
Chromera B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
velia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Chromerida O O O O
; O O O O
Alveolata O O O O
) O O O O
is O O O O
an O O O O
autotrophic O O O O
protist O O O O
isolated O O O O
from O O O O
stony O O O O
corals O O O O
. O O O O
    
Ch B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
velia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
possesses O O O O
a O O O O
chloroplast O O O O
thought O O O O
to O O O O
be O O O O
most O O O O
closely O O O O
related O O O O
to O O O O
the O O O O
apicoplasts O O O O
of O O O O
non O O O O
- O O O O
photosynthetic O O O O
apicomplexa O O O O
. O O O O
    
Phylogenetic O O O O
analyses O O O O
place O O O O
Ch B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
velia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
as O O O O
a O O O O
close O O O O
relative O O O O
of O O O O
parasitic O O O O
apicomplexa O O O O
and O O O O
predatory O O O O
colpodellids O O O O
. O O O O
    
We O O O O
have O O O O
used O O O O
field O O O O
- O O O O
emission O O O O
scanning O O O O
electron O O O O
microscopy O O O O
of O O O O
cells O O O O
sputter O O O O
- O O O O
coated O O O O
with O O O O
gold O O O O
or O O O O
chromium O O O O
and O O O O
non O O O O
- O O O O
coated O O O O
cells O O O O
to O O O O
characterise O O O O
the O O O O
surface O O O O
ultrastructure O O O O
of O O O O
the O O O O
motile O O O O
form O O O O
of O O O O
Ch B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
velia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
In O O O O
overall O O O O
morphology O O O O
the O O O O
biflagellated O O O O
Ch B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
velia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cells O O O O
resemble O O O O
the O O O O
colpodellid O O O O
Colpodella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
edax O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
but O O O O
with O O O O
some O O O O
notable O O O O
differences O O O O
. O O O O
    
The O O O O
ventral O O O O
side O O O O
of O O O O
the O O O O
flagellated O O O O
Ch B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
velia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cell O O O O
has O O O O
two O O O O
grooves O O O O
extending O O O O
from O O O O
the O O O O
anterior O O O O
flagella O O O O
insertion O O O O
point O O O O
with O O O O
a O O O O
ridge O O O O
rising O O O O
towards O O O O
the O O O O
anterior O O O O
apex O O O O
of O O O O
the O O O O
cell O O O O
. O O O O
    
The O O O O
anterior O O O O
flagellum O O O O
is O O O O
shorter O O O O
than O O O O
the O O O O
posterior O O O O
flagellum O O O O
and O O O O
possesses O O O O
a O O O O
distinct O O O O
, O O O O
small O O O O
curved O O O O
appendage O O O O
. O O O O
    
The O O O O
insertion O O O O
point O O O O
of O O O O
the O O O O
anterior O O O O
flagellum O O O O
is O O O O
partly O O O O
enclosed O O O O
by O O O O
a O O O O
flap O O O O
extending O O O O
from O O O O
the O O O O
cell O O O O
. O O O O
    
The O O O O
posterior O O O O
flagellum O O O O
is O O O O
approximately O O O O
four O O O O
times O O O O
the O O O O
length O O O O
of O O O O
the O O O O
cell O O O O
and O O O O
possesses O O O O
mastigonemes O O O O
. O O O O
    
The O O O O
combination O O O O
of O O O O
coating O O O O
techniques O O O O
proved O O O O
superior O O O O
to O O O O
the O O O O
commonly O O O O
used O O O O
gold O O O O
coating O O O O
to O O O O
determine O O O O
fine O O O O
surface O O O O
ultrastructure O O O O
. O O O O
    
This O O O O
new O O O O
ultrastructural O O O O
information O O O O
for O O O O
Ch B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
velia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
allowed O O O O
us O O O O
to O O O O
emend O O O O
its O O O O
diagnosis O O O O
. O O O O
    
Stress O O O O
- O O O O
induced O O O O
pseudocyst O O O O
formation O O O O
- O O O O
- O O O O
a O O O O
newly O O O O
identified O O O O
mechanism O O O O
of O O O O
protection O O O O
against O O O O
organic O O O O
solvents O O O O
in O O O O
acanthamoebae O O O O
of O O O O
the O O O O
T4 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
genotype O O O O
. O O O O
    
Differentiation O O O O
into O O O O
highly O O O O
resistant O O O O
double O O O O
- O O O O
walled O O O O
cysts O O O O
is O O O O
a O O O O
major O O O O
mechanism O O O O
allowing O O O O
amphizoic O O O O
acanthamoebae O O O O
to O O O O
survive O O O O
under O O O O
long O O O O
- O O O O
lasting O O O O
, O O O O
unfavourable O O O O
environmental O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
that O O O O
relatively O O O O
low O O O O
concentrations O O O O
of O O O O
methanol O O O O
, O O O O
acetone O O O O
or O O O O
DMSO O O O O
stimulate O O O O
prompt O O O O
Acanthamoeba O O O O
differentiation O O O O
into O O O O
a O O O O
rounded O O O O
cyst O O O O
- O O O O
like O O O O
stage O O O O
with O O O O
a O O O O
single O O O O
envelope O O O O
. O O O O
    
To O O O O
address O O O O
whether O O O O
this O O O O
rapid O O O O
response O O O O
differs O O O O
from O O O O
the O O O O
encystment O O O O
, O O O O
time O O O O
- O O O O
dependent O O O O
changes O O O O
in O O O O
cell O O O O
surface O O O O
characteristics O O O O
and O O O O
cyst O O O O
- O O O O
specific O O O O
gene O O O O
expression O O O O
were O O O O
monitored O O O O
in O O O O
encystating O O O O
cells O O O O
and O O O O
cells O O O O
differentiating O O O O
under O O O O
methanol O O O O
treatment O O O O
using O O O O
microscopic O O O O
, O O O O
lectin O O O O
- O O O O
binding O O O O
, O O O O
PCR O O O O
and O O O O
resistance O O O O
studies O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
to O O O O
the O O O O
encystment O O O O
: O O O O
( O O O O
1 O O O O
) O O O O
a O O O O
single O O O O
- O O O O
layered O O O O
amorphous O O O O
mannose O O O O
/ O O O O
glucose O O O O
coat O O O O
was O O O O
the O O O O
only O O O O
envelope O O O O
assembled O O O O
on O O O O
the O O O O
surface O O O O
of O O O O
the O O O O
solvent O O O O
- O O O O
treated O O O O
cells O O O O
, O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
the O O O O
cyst O O O O
- O O O O
specific O O O O
protein O O O O
( O O O O
CSP21 O O O O
) O O O O
was O O O O
not O O O O
expressed O O O O
, O O O O
( O O O O
3 O O O O
) O O O O
the O O O O
coat O O O O
did O O O O
not O O O O
protect O O O O
cells O O O O
against O O O O
acidic O O O O
pH O O O O
and O O O O
( O O O O
4 O O O O
) O O O O
in O O O O
solvent O O O O
- O O O O
free O O O O
encystment O O O O
medium O O O O
, O O O O
the O O O O
coated O O O O
cells O O O O
did O O O O
not O O O O
assemble O O O O
the O O O O
double O O O O
- O O O O
layered O O O O
wall O O O O
, O O O O
thus O O O O
indicating O O O O
that O O O O
these O O O O
cells O O O O
were O O O O
not O O O O
immature O O O O
cysts O O O O
. O O O O
    
These O O O O
findings O O O O
lead O O O O
us O O O O
to O O O O
specify O O O O
a O O O O
terminal O O O O
stage O O O O
of O O O O
rapid O O O O
Acanthamoeba O O O O
differentiation O O O O
elicited O O O O
by O O O O
acute O O O O
organic O O O O
solvent O O O O
stress O O O O
as O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
pseudocyst O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
, O O O O
and O O O O
to O O O O
suggest O O O O
that O O O O
encystation O O O O
and O O O O
pseudocyst O O O O
formation O O O O
are O O O O
distinct O O O O
stress O O O O
responses O O O O
. O O O O
    
Moreover O O O O
, O O O O
the O O O O
possibility O O O O
exists O O O O
that O O O O
pseudocysts O O O O
might O O O O
form O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
certain O O O O
contact O O O O
lens O O O O
solutions O O O O
thus O O O O
increasing O O O O
resistance O O O O
of O O O O
acanthamoebae O O O O
to O O O O
disinfecting O O O O
agents O O O O
. O O O O
    
Possible O O O O
roles O O O O
of O O O O
phospholipase O O O O
A O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
in O O O O
the O O O O
biological O O O O
activities O O O O
of O O O O
Acanthamoeba B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
castellanii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T4 O O O O
Genotype O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
phospholipases O O O O
A O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
- O O O O
specific O O O O
spectrophotometric O O O O
assays O O O O
, O O O O
it O O O O
was O O O O
shown O O O O
that O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
castellanii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
lysates O O O O
and O O O O
their O O O O
conditioned O O O O
medium O O O O
exhibit O O O O
phospholipase O O O O
activities O O O O
. O O O O
    
The O O O O
extracellular O O O O
levels O O O O
of O O O O
PLA O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
detected O O O O
were O O O O
significantly O O O O
reduced O O O O
compared O O O O
with O O O O
the O O O O
cell O O O O
- O O O O
associated O O O O
enzyme O O O O
( O O O O
P O O O O
& O O O O
lt O O O O
; O O O O
0 O O O O
. O O O O
05 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Sphinganine O O O O
, O O O O
a O O O O
PLA O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
inhibitor O O O O
showed O O O O
robust O O O O
amoebistatic O O O O
properties O O O O
but O O O O
had O O O O
no O O O O
effect O O O O
on O O O O
the O O O O
viability O O O O
of O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
castellanii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
potency O O O O
of O O O O
sphinganine O O O O
was O O O O
demonstrated O O O O
effectively O O O O
towards O O O O
purified O O O O
PLA O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
derived O O O O
from O O O O
porcine O O O O
pancreas O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
sphinganine O O O O
, O O O O
it O O O O
was O O O O
observed O O O O
that O O O O
PLA O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
is O O O O
involved O O O O
in O O O O
neither O O O O
binding O O O O
nor O O O O
cytotoxicity O O O O
of O O O O
the O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
brain O O O O
microvascular O O O O
endothelial O O O O
cells O O O O
due O O O O
to O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
castellanii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Unlike O O O O
as O O O O
was O O O O
the O O O O
case O O O O
for O O O O
Dictyostelium O O O O
amoebae O O O O
, O O O O
PLA O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
appeared O O O O
to O O O O
be O O O O
involved O O O O
in O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
castellanii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
phagocytosis O O O O
of O O O O
the O O O O
fluorescently O O O O
- O O O O
labelled O O O O
polystyrene O O O O
beads O O O O
. O O O O
    
Horseradish B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
peroxidase O O O O
was O O O O
used O O O O
as O O O O
a O O O O
tracer O O O O
molecule O O O O
to O O O O
develop O O O O
assays O O O O
to O O O O
study O O O O
pinocytosis O O O O
in O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
castellanii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
findings O O O O
revealed O O O O
that O O O O
sphinganine O O O O
impedes O O O O
phagocytosis O O O O
but O O O O
augments O O O O
pinocytosis O O O O
in O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
castellanii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
suggesting O O O O
distinct O O O O
nature O O O O
of O O O O
processes O O O O
. O O O O
    
A O O O O
complete O O O O
understanding O O O O
of O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
phospholipases O O O O
in O O O O
the O O O O
biology O O O O
and O O O O
pathogenesis O O O O
of O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
castellanii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
infections O O O O
will O O O O
determine O O O O
their O O O O
potential O O O O
as O O O O
therapeutic O O O O
targets O O O O
. O O O O
    
The O O O O
roles O O O O
played O O O O
by O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
apoptosis O O O O
- O O O O
inducing O O O O
factor O O O O
( O O O O
AIF O O O O
) O O O O
- O O O O
like O O O O
mitochondrial O O O O
oxidoreductase O O O O
( O O O O
AifA O O O O
) O O O O
and O O O O
NADH O O O O
- O O O O
ubiquinone O O O O
oxidoreductases O O O O
( O O O O
NdeA O O O O
- O O O O
B O O O O
and O O O O
NdiA O O O O
) O O O O
in O O O O
farnesol O O O O
resistance O O O O
. O O O O
    
Farnesol O O O O
( O O O O
FOH O O O O
) O O O O
is O O O O
a O O O O
nonsterol O O O O
isoprenoid O O O O
produced O O O O
by O O O O
dephosphorylation O O O O
of O O O O
farnesyl O O O O
pyrophosphate O O O O
, O O O O
a O O O O
catabolite O O O O
of O O O O
the O O O O
cholesterol O O O O
biosynthetic O O O O
pathway O O O O
. O O O O
    
These O O O O
isoprenoids O O O O
inhibit O O O O
proliferation O O O O
and O O O O
induce O O O O
apoptosis O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
show O O O O
that O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
AifA O O O O
encoding O O O O
the O O O O
apoptosis O O O O
- O O O O
inducing O O O O
factor O O O O
( O O O O
AIF O O O O
) O O O O
- O O O O
like O O O O
mitochondrial O O O O
oxidoreductase O O O O
plays O O O O
a O O O O
role O O O O
in O O O O
the O O O O
function O O O O
of O O O O
the O O O O
mitochondrial O O O O
Complex O O O O
I O O O O
. O O O O
Additionally O O O O
, O O O O
we O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
ndeA O O O O
- O O O O
B O O O O
and O O O O
ndiA O O O O
encode O O O O
external O O O O
and O O O O
internal O O O O
alternative O O O O
NADH O O O O
dehydrogenases O O O O
, O O O O
respectively O O O O
, O O O O
that O O O O
have O O O O
a O O O O
function O O O O
in O O O O
FOH O O O O
resistance O O O O
. O O O O
    
When O O O O
exposed O O O O
to O O O O
FOH O O O O
, O O O O
the O O O O
DeltaaifA O O O O
and O O O O
DeltandeA O O O O
strains O O O O
have O O O O
increased O O O O
ROS O O O O
production O O O O
while O O O O
DeltandeB O O O O
, O O O O
DeltandeA O O O O
DeltandeB O O O O
, O O O O
and O O O O
DeltandiA O O O O
mutant O O O O
strains O O O O
showed O O O O
the O O O O
same O O O O
ROS O O O O
accumulation O O O O
than O O O O
in O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
FOH O O O O
. O O O O
    
We O O O O
observed O O O O
several O O O O
compensatory O O O O
mechanisms O O O O
affecting O O O O
the O O O O
differential O O O O
survival O O O O
of O O O O
these O O O O
mutants O O O O
to O O O O
FOH O O O O
. O O O O
    
Regulation O O O O
of O O O O
secondary O O O O
metabolism O O O O
by O O O O
chromatin O O O O
structure O O O O
and O O O O
epigenetic O O O O
codes O O O O
. O O O O
    
Chromatin O O O O
, O O O O
composed O O O O
of O O O O
DNA O O O O
wrapped O O O O
around O O O O
an O O O O
octamer O O O O
of O O O O
histones O O O O
, O O O O
is O O O O
the O O O O
relevant O O O O
substrate O O O O
for O O O O
all O O O O
genetic O O O O
processes O O O O
in O O O O
eukaryotic O O O O
nuclei O O O O
. O O O O
    
Changes O O O O
in O O O O
chromatin O O O O
structure O O O O
are O O O O
associated O O O O
with O O O O
the O O O O
activation O O O O
and O O O O
silencing O O O O
of O O O O
gene O O O O
transcription O O O O
and O O O O
reversible O O O O
post O O O O
- O O O O
translational O O O O
modifications O O O O
of O O O O
histones O O O O
are O O O O
now O O O O
known O O O O
to O O O O
direct O O O O
chromatin O O O O
structure O O O O
transitions O O O O
. O O O O
    
Recent O O O O
studies O O O O
in O O O O
several O O O O
fungal O O O O
species O O O O
have O O O O
identified O O O O
a O O O O
chromatin O O O O
- O O O O
based O O O O
regulation O O O O
of O O O O
secondary O O O O
metabolism O O O O
( O O O O
SM O O O O
) O O O O
gene O O O O
clusters O O O O
representing O O O O
an O O O O
upper O O O O
- O O O O
hierarchical O O O O
level O O O O
for O O O O
the O O O O
coordinated O O O O
control O O O O
of O O O O
large O O O O
chromosomal O O O O
elements O O O O
. O O O O
    
Regulation O O O O
by O O O O
chromatin O O O O
transition O O O O
processes O O O O
provides O O O O
a O O O O
mechanistic O O O O
model O O O O
to O O O O
explain O O O O
how O O O O
different O O O O
SM O O O O
clusters O O O O
located O O O O
at O O O O
dispersed O O O O
genomic O O O O
regions O O O O
can O O O O
be O O O O
simultaneously O O O O
silenced O O O O
during O O O O
primary O O O O
metabolism O O O O
. O O O O
    
Activation O O O O
of O O O O
SM O O O O
clusters O O O O
has O O O O
been O O O O
shown O O O O
to O O O O
be O O O O
associated O O O O
with O O O O
increased O O O O
acetylation O O O O
of O O O O
histones O O O O
H3 O O O O
and O O O O
H4 O O O O
and O O O O
, O O O O
consequently O O O O
, O O O O
inhibition O O O O
of O O O O
histone O O O O
de O O O O
- O O O O
acetylase O O O O
activities O O O O
also O O O O
leads O O O O
to O O O O
increased O O O O
production O O O O
of O O O O
secondary O O O O
metabolites O O O O
. O O O O
    
New O O O O
findings O O O O
suggest O O O O
that O O O O
SM O O O O
clusters O O O O
are O O O O
silenced O O O O
by O O O O
heterochromatic O O O O
histone O O O O
marks O O O O
and O O O O
that O O O O
the O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
closed O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
heterochromatic O O O O
structures O O O O
are O O O O
reversed O O O O
during O O O O
SM O O O O
activation O O O O
. O O O O
    
This O O O O
process O O O O
is O O O O
mediated O O O O
by O O O O
the O O O O
conserved O O O O
activator O O O O
of O O O O
SM O O O O
, O O O O
LaeA O O O O
. O O O O
    
Despite O O O O
the O O O O
increase O O O O
in O O O O
knowledge O O O O
about O O O O
these O O O O
processes O O O O
, O O O O
much O O O O
remains O O O O
to O O O O
be O O O O
learned O O O O
from O O O O
chromatin O O O O
- O O O O
level O O O O
regulation O O O O
of O O O O
SM O O O O
. O O O O
    
For O O O O
example O O O O
, O O O O
which O O O O
proteins O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
position O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
the O O O O
chromatin O O O O
restructuring O O O O
signal O O O O
onto O O O O
SM O O O O
clusters O O O O
or O O O O
how O O O O
exactly O O O O
LaeA O O O O
works O O O O
to O O O O
mediate O O O O
the O O O O
low O O O O
level O O O O
of O O O O
heterochromatic O O O O
marks O O O O
inside O O O O
different O O O O
clusters O O O O
remain O O O O
open O O O O
questions O O O O
. O O O O
    
Answers O O O O
to O O O O
these O O O O
and O O O O
other O O O O
chromatin O O O O
- O O O O
related O O O O
questions O O O O
would O O O O
certainly O O O O
complete O O O O
our O O O O
understanding O O O O
of O O O O
SM O O O O
gene O O O O
regulation O O O O
and O O O O
signaling O O O O
and O O O O
, O O O O
because O O O O
for O O O O
many O O O O
predicted O O O O
SM O O O O
clusters O O O O
corresponding O O O O
products O O O O
have O O O O
not O O O O
been O O O O
identified O O O O
so O O O O
far O O O O
, O O O O
anti O O O O
- O O O O
silencing O O O O
strategies O O O O
would O O O O
open O O O O
new O O O O
ways O O O O
for O O O O
the O O O O
identification O O O O
of O O O O
novel O O O O
bioactive O O O O
substances O O O O
. O O O O
    
Conservation O O O O
of O O O O
POPs O O O O
, O O O O
the O O O O
plant O O O O
organellar O O O O
DNA O O O O
polymerases O O O O
, O O O O
in O O O O
eukaryotes O O O O
. O O O O
    
POPs O O O O
, O O O O
plant O O O O
organellar O O O O
DNA O O O O
polymerases O O O O
, O O O O
have O O O O
been O O O O
isolated O O O O
from O O O O
various O O O O
photosynthetic O O O O
eukaryotes O O O O
. O O O O
    
Previously O O O O
, O O O O
we O O O O
purified O O O O
the O O O O
native O O O O
POP O O O O
of O O O O
Cyanidioschyzon B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
merolae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
CmPOP O O O O
) O O O O
from O O O O
whole O O O O
cellular O O O O
extracts O O O O
and O O O O
showed O O O O
that O O O O
CmPOP O O O O
has O O O O
DNA O O O O
polymerase O O O O
activity O O O O
with O O O O
a O O O O
high O O O O
processivity O O O O
and O O O O
a O O O O
3 O O O O
' O O O O
- O O O O
5 O O O O
' O O O O
exonuclease O O O O
activity O O O O
, O O O O
and O O O O
its O O O O
expression O O O O
is O O O O
related O O O O
to O O O O
cell O O O O
proliferation O O O O
. O O O O
    
In O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
the O O O O
recombinant O O O O
protein O O O O
of O O O O
POP O O O O
has O O O O
activities O O O O
found O O O O
in O O O O
CmPOP O O O O
, O O O O
and O O O O
high O O O O
fidelity O O O O
of O O O O
POP O O O O
has O O O O
also O O O O
been O O O O
demonstrated O O O O
. O O O O
    
These O O O O
facts O O O O
suggest O O O O
that O O O O
POPs O O O O
are O O O O
involved O O O O
in O O O O
the O O O O
replication O O O O
of O O O O
organellar O O O O
genomes O O O O
. O O O O
    
POPs O O O O
are O O O O
also O O O O
conserved O O O O
in O O O O
most O O O O
non O O O O
- O O O O
opisthokont O O O O
eukaryotes O O O O
, O O O O
which O O O O
lack O O O O
DNA O O O O
polymerase O O O O
gamma O O O O
( O O O O
Polgamma O O O O
) O O O O
, O O O O
a O O O O
mitochondrial O O O O
replication O O O O
enzyme O O O O
in O O O O
opisthokonts O O O O
( O O O O
fungi O O O O
and O O O O
animals O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
ciliate O O O O
Tetrahymena B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
thermophila O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
contains O O O O
a O O O O
single O O O O
gene O O O O
for O O O O
a O O O O
putative O O O O
POP O O O O
( O O O O
TetPOP O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Immunoblot O O O O
analysis O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
TetPOP O O O O
is O O O O
localized O O O O
in O O O O
mitochondria O O O O
, O O O O
and O O O O
TetPOP O O O O
has O O O O
been O O O O
purified O O O O
from O O O O
mitochondria O O O O
through O O O O
a O O O O
column O O O O
chromatography O O O O
series O O O O
. O O O O
    
Sensitivity O O O O
to O O O O
phosphonoacetate O O O O
and O O O O
dideoxyTTP O O O O
was O O O O
examined O O O O
in O O O O
POPs O O O O
( O O O O
TetPOP O O O O
and O O O O
CmPOP O O O O
) O O O O
or O O O O
POP O O O O
- O O O O
containing O O O O
organelles O O O O
( O O O O
chloroplasts O O O O
of O O O O
Arabidopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
and O O O O
other O O O O
polymerases O O O O
( O O O O
DNA O O O O
polymerase O O O O
I O O O O
and O O O O
mitochondria O O O O
of O O O O
rat B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
liver O O O O
, O O O O
which O O O O
contain O O O O
Polgamma O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
high O O O O
sensitivity O O O O
to O O O O
phosphonoacetate O O O O
is O O O O
unique O O O O
to O O O O
POPs O O O O
in O O O O
Family O O O O
- O O O O
A O O O O
DNA O O O O
polymerases O O O O
. O O O O
    
Finally O O O O
, O O O O
we O O O O
propose O O O O
a O O O O
model O O O O
for O O O O
the O O O O
succession O O O O
of O O O O
organellar O O O O
DNA O O O O
polymerases O O O O
. O O O O
    
Identification O O O O
of O O O O
a O O O O
mastigoneme O O O O
protein O O O O
from O O O O
Phytophthora B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nicotianae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Tripartite O O O O
tubular O O O O
hairs O O O O
( O O O O
mastigonemes O O O O
) O O O O
on O O O O
the O O O O
anterior O O O O
flagellum O O O O
of O O O O
protists O O O O
in O O O O
the O O O O
stramenopile O O O O
taxon O O O O
are O O O O
responsible O O O O
for O O O O
reversing O O O O
the O O O O
thrust O O O O
of O O O O
flagellar O O O O
beat O O O O
and O O O O
for O O O O
cell O O O O
motility O O O O
. O O O O
    
Immunoprecipitation O O O O
experiments O O O O
using O O O O
antibodies O O O O
directed O O O O
towards O O O O
mastigonemes O O O O
on O O O O
the O O O O
flagella O O O O
of O O O O
zoospores O O O O
of O O O O
Phytophthora B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nicotianae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
have O O O O
facilitated O O O O
the O O O O
cloning O O O O
of O O O O
a O O O O
gene O O O O
encoding O O O O
a O O O O
mastigoneme O O O O
shaft O O O O
protein O O O O
in O O O O
this O O O O
Oomycete O O O O
. O O O O
    
Expression O O O O
of O O O O
the O O O O
gene O O O O
, O O O O
designated O O O O
PnMas2 O O O O
, O O O O
is O O O O
up O O O O
- O O O O
regulated O O O O
during O O O O
asexual O O O O
sporulation O O O O
, O O O O
a O O O O
period O O O O
during O O O O
which O O O O
many O O O O
zoospore O O O O
components O O O O
are O O O O
synthesized O O O O
. O O O O
    
Analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
sequence O O O O
of O O O O
the O O O O
PnMas2 O O O O
protein O O O O
has O O O O
revealed O O O O
that O O O O
, O O O O
like O O O O
other O O O O
stramenopile O O O O
mastigoneme O O O O
proteins O O O O
, O O O O
PnMas2 O O O O
has O O O O
an O O O O
N O O O O
- O O O O
terminal O O O O
secretion O O O O
signal O O O O
and O O O O
contains O O O O
four O O O O
cysteine O O O O
- O O O O
rich O O O O
epidermal O O O O
growth O O O O
factor O O O O
( O O O O
EGF O O O O
) O O O O
- O O O O
like O O O O
domains O O O O
. O O O O
    
Evidence O O O O
from O O O O
non O O O O
- O O O O
denaturing O O O O
gels O O O O
indicates O O O O
that O O O O
PnMas2 O O O O
forms O O O O
large O O O O
oligomeric O O O O
complexes O O O O
, O O O O
most O O O O
likely O O O O
through O O O O
disulphide O O O O
bridging O O O O
. O O O O
    
Bioinformatic O O O O
analysis O O O O
has O O O O
revealed O O O O
that O O O O
Phytophthora O O O O
species O O O O
typically O O O O
contain O O O O
three O O O O
or O O O O
four O O O O
putative O O O O
mastigoneme O O O O
proteins O O O O
containing O O O O
the O O O O
four O O O O
EGF O O O O
- O O O O
like O O O O
domains O O O O
. O O O O
    
These O O O O
proteins O O O O
are O O O O
similar O O O O
in O O O O
sequence O O O O
to O O O O
mastigoneme O O O O
proteins O O O O
in O O O O
other O O O O
stramenopile O O O O
protists O O O O
including O O O O
the O O O O
algae O O O O
Ochromonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
danica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Aureococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
anophagefferens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Scytosiphon B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
lomentaria O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
the O O O O
diatoms O O O O
Thalassiosira B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pseudonana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
weissflogii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Prasinoderma O O O O
singularis O O O O
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
    
( O O O O
Prasinophyceae O O O O
, O O O O
Chlorophyta O O O O
) O O O O
, O O O O
a O O O O
solitary O O O O
coccoid O O O O
Prasinophyte O O O O
from O O O O
the O O O O
South O O O O
- O O O O
East O O O O
Pacific O O O O
Ocean O O O O
. O O O O
    
During O O O O
the O O O O
BIOSOPE O O O O
cruise O O O O
in O O O O
the O O O O
South O O O O
- O O O O
East O O O O
Pacific O O O O
Ocean O O O O
in O O O O
2004 O O O O
, O O O O
several O O O O
unidentified O O O O
strains O O O O
of O O O O
prasinophytes O O O O
were O O O O
isolated O O O O
into O O O O
culture O O O O
. O O O O
    
Of O O O O
these O O O O
, O O O O
nine O O O O
strains O O O O
composed O O O O
a O O O O
group O O O O
for O O O O
which O O O O
the O O O O
partial O O O O
18S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
was O O O O
related O O O O
to O O O O
Prasinoderma B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coloniale O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
ultrastructure O O O O
, O O O O
morphology O O O O
, O O O O
division O O O O
process O O O O
, O O O O
pigment O O O O
composition O O O O
, O O O O
genome O O O O
size O O O O
and O O O O
molecular O O O O
genetic O O O O
phylogeny O O O O
of O O O O
these O O O O
nine O O O O
strains O O O O
were O O O O
investigated O O O O
, O O O O
using O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
coloniale O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
as O O O O
a O O O O
reference O O O O
. O O O O
    
The O O O O
18S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
of O O O O
P O O O O
. O O O O
singularis O O O O
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
    
shares O O O O
only O O O O
96 O O O O
. O O O O
9 O O O O
% O O O O
of O O O O
identity O O O O
with O O O O
that O O O O
of O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
coloniale O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
contains O O O O
a O O O O
conserved O O O O
insertion O O O O
of O O O O
567bp O O O O
length O O O O
not O O O O
recorded O O O O
in O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
coloniale O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
When O O O O
compared O O O O
to O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
coloniale O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
P O O O O
. O O O O
singularis O O O O
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
    
is O O O O
morphologically O O O O
characterized O O O O
by O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
colonies O O O O
, O O O O
smaller O O O O
cells O O O O
with O O O O
a O O O O
thinner O O O O
cell O O O O
wall O O O O
, O O O O
and O O O O
a O O O O
second O O O O
cell O O O O
type O O O O
with O O O O
a O O O O
different O O O O
cell O O O O
covering O O O O
. O O O O
    
Dependence O O O O
between O O O O
volumes O O O O
of O O O O
protoplast O O O O
and O O O O
lorica O O O O
in O O O O
lugol O O O O
- O O O O
fixed O O O O
tintinnid O O O O
ciliates O O O O
. O O O O
    
The O O O O
relationship O O O O
between O O O O
the O O O O
volume O O O O
of O O O O
tintinnid O O O O
loricae O O O O
and O O O O
protoplasts O O O O
was O O O O
studied O O O O
on O O O O
the O O O O
basis O O O O
of O O O O
bulk O O O O
data O O O O
derived O O O O
from O O O O
samples O O O O
collected O O O O
in O O O O
a O O O O
range O O O O
of O O O O
temperate O O O O
environments O O O O
: O O O O
riverine O O O O
, O O O O
lacustrine O O O O
, O O O O
estuarine O O O O
, O O O O
and O O O O
marine O O O O
. O O O O
    
All O O O O
organisms O O O O
were O O O O
fixed O O O O
with O O O O
acid O O O O
Lugol O O O O
solution O O O O
( O O O O
0 O O O O
. O O O O
5 O O O O
- O O O O
1 O O O O
. O O O O
0 O O O O
% O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
dependence O O O O
was O O O O
described O O O O
with O O O O
the O O O O
allometric O O O O
equation O O O O
: O O O O
VL O O O O
= O O O O
2 O O O O
. O O O O
74xVP O O O O
( O O O O
1 O O O O
. O O O O
03 O O O O
) O O O O
, O O O O
where O O O O
VL O O O O
and O O O O
VP O O O O
are O O O O
volumes O O O O
[ O O O O
mum O O O O
( O O O O
3 O O O O
) O O O O
] O O O O
of O O O O
loricae O O O O
and O O O O
protoplasts O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
The O O O O
dependence O O O O
was O O O O
highly O O O O
significant O O O O
( O O O O
p O O O O
& O O O O
lt O O O O
; O O O O
0 O O O O
. O O O O
001 O O O O
, O O O O
n O O O O
= O O O O
417 O O O O
, O O O O
R O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
= O O O O
0 O O O O
. O O O O
85 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
On O O O O
average O O O O
, O O O O
protoplasts O O O O
occupied O O O O
31 O O O O
% O O O O
of O O O O
the O O O O
lorica O O O O
volume O O O O
. O O O O
    
One O O O O
species O O O O
, O O O O
Helicostomella O O O O
subulata O O O O
, O O O O
was O O O O
omitted O O O O
from O O O O
the O O O O
calculations O O O O
and O O O O
treated O O O O
separately O O O O
since O O O O
this O O O O
ciliate O O O O
has O O O O
a O O O O
relatively O O O O
large O O O O
lorica O O O O
. O O O O
    
The O O O O
relationship O O O O
identified O O O O
between O O O O
lorica O O O O
and O O O O
protoplast O O O O
volumes O O O O
permits O O O O
recalculating O O O O
incomplete O O O O
data O O O O
if O O O O
protoplasts O O O O
are O O O O
the O O O O
only O O O O
body O O O O
part O O O O
measured O O O O
. O O O O
    
PRP8 O O O O
intein O O O O
in O O O O
Ajellomycetaceae O O O O
family O O O O
pathogens O O O O
: O O O O
sequence O O O O
analysis O O O O
, O O O O
splicing O O O O
evaluation O O O O
and O O O O
homing O O O O
endonuclease O O O O
activity O O O O
. O O O O
    
Inteins O O O O
are O O O O
intervening O O O O
sequences O O O O
that O O O O
are O O O O
transcribed O O O O
and O O O O
translated O O O O
with O O O O
flanking O O O O
host O O O O
protein O O O O
sequences O O O O
and O O O O
then O O O O
self O O O O
- O O O O
excised O O O O
by O O O O
protein O O O O
splicing O O O O
. O O O O
    
Bi O O O O
- O O O O
functional O O O O
inteins O O O O
also O O O O
contain O O O O
a O O O O
homing O O O O
endonuclease O O O O
responsible O O O O
for O O O O
their O O O O
genetic O O O O
mobility O O O O
. O O O O
    
The O O O O
PRP8 O O O O
intein O O O O
, O O O O
the O O O O
most O O O O
widespread O O O O
among O O O O
fungi O O O O
, O O O O
occurs O O O O
in O O O O
important O O O O
pathogens O O O O
such O O O O
as O O O O
Histoplasma B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
capsulatum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Paracoccidioides B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
brasiliensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
from O O O O
the O O O O
Ajellomycetaceae O O O O
family O O O O
. O O O O
    
Herein O O O O
, O O O O
we O O O O
describe O O O O
the O O O O
bi O O O O
- O O O O
functional O O O O
PRP8 O O O O
intein O O O O
in O O O O
two O O O O
other O O O O
Ajellomycetacean O O O O
pathogens O O O O
, O O O O
Blastomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
dermatitidis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Emmonsia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
parva O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Sequence O O O O
analysis O O O O
and O O O O
experimental O O O O
evidence O O O O
suggest O O O O
that O O O O
the O O O O
homing O O O O
endonuclease O O O O
from O O O O
PbrPRP8 O O O O
is O O O O
inactive O O O O
. O O O O
    
The O O O O
splicing O O O O
activity O O O O
of O O O O
the O O O O
PRP8 O O O O
intein O O O O
from O O O O
the O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
dermatitidis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
parva O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
brasiliensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
species O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
complex O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
demonstrated O O O O
in O O O O
a O O O O
non O O O O
- O O O O
native O O O O
protein O O O O
context O O O O
in O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Since O O O O
the O O O O
PRP8 O O O O
intein O O O O
is O O O O
located O O O O
in O O O O
a O O O O
functionally O O O O
essential O O O O
nuclear O O O O
protein O O O O
, O O O O
it O O O O
can O O O O
be O O O O
considered O O O O
a O O O O
promising O O O O
therapeutic O O O O
target O O O O
for O O O O
anti O O O O
- O O O O
fungal O O O O
drugs O O O O
, O O O O
because O O O O
inhibition O O O O
of O O O O
intein O O O O
splicing O O O O
should O O O O
inhibit O O O O
proliferation O O O O
of O O O O
intein O O O O
- O O O O
containing O O O O
pathogens O O O O
. O O O O
    
Barcoding O O O O
Tetrahymena O O O O
: O O O O
discriminating O O O O
species O O O O
and O O O O
identifying O O O O
unknowns O O O O
using O O O O
the O O O O
cytochrome O O O O
c O O O O
oxidase O O O O
subunit O O O O
I O O O O
( O O O O
cox O O O O
- O O O O
1 O O O O
) O O O O
barcode O O O O
. O O O O
    
DNA O O O O
barcoding O O O O
using O O O O
the O O O O
mitochondrial O O O O
cytochromecoxidase O O O O
subunit O O O O
I O O O O
( O O O O
cox O O O O
- O O O O
1 O O O O
) O O O O
gene O O O O
has O O O O
recently O O O O
gained O O O O
popularity O O O O
as O O O O
a O O O O
tool O O O O
for O O O O
species O O O O
identification O O O O
of O O O O
a O O O O
variety O O O O
of O O O O
taxa O O O O
. O O O O
    
The O O O O
primary O O O O
objective O O O O
of O O O O
our O O O O
research O O O O
was O O O O
to O O O O
explore O O O O
the O O O O
efficacy O O O O
of O O O O
using O O O O
cox O O O O
- O O O O
1 O O O O
barcoding O O O O
for O O O O
species O O O O
identification O O O O
within O O O O
the O O O O
genus O O O O
Tetrahymena O O O O
. O O O O
    
We O O O O
first O O O O
increased O O O O
intraspecific O O O O
sampling O O O O
for O O O O
Tetrahymena B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
canadensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Tetrahymena B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
hegewischi O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Tetrahymena B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pyriformis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Tetrahymena B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
rostrata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Tetrahymena B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
thermophila O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
Tetrahymena B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tropicalis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Increased O O O O
sampling O O O O
efforts O O O O
show O O O O
that O O O O
intraspecific O O O O
sequence O O O O
divergence O O O O
is O O O O
typically O O O O
less O O O O
than O O O O
1 O O O O
% O O O O
, O O O O
though O O O O
it O O O O
may O O O O
be O O O O
more O O O O
in O O O O
some O O O O
species O O O O
. O O O O
    
The O O O O
barcoding O O O O
also O O O O
showed O O O O
that O O O O
some O O O O
strains O O O O
might O O O O
be O O O O
misidentified O O O O
or O O O O
mislabeled O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
used O O O O
cox O O O O
- O O O O
1 O O O O
barcodes O O O O
to O O O O
provide O O O O
species O O O O
identifications O O O O
for O O O O
51 O O O O
unidentified O O O O
environmental O O O O
isolates O O O O
, O O O O
with O O O O
a O O O O
success O O O O
rate O O O O
of O O O O
98 O O O O
% O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
cox O O O O
- O O O O
1 O O O O
barcoding O O O O
is O O O O
an O O O O
invaluable O O O O
tool O O O O
for O O O O
protistologists O O O O
, O O O O
especially O O O O
when O O O O
used O O O O
in O O O O
conjunction O O O O
with O O O O
morphological O O O O
studies O O O O
. O O O O
    
Facing O O O O
unknowns O O O O
: O O O O
living O O O O
cultures O O O O
( O O O O
Pirum B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
gemmata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gen O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
Abeoforma B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
whisleri O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gen O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
from O O O O
invertebrate O O O O
digestive O O O O
tracts O O O O
represent O O O O
an O O O O
undescribed O O O O
clade O O O O
within O O O O
the O O O O
unicellular O O O O
Opisthokont O O O O
lineage O O O O
ichthyosporea O O O O
( O O O O
Mesomycetozoea O O O O
) O O O O
. O O O O
    
During O O O O
a O O O O
culture O O O O
- O O O O
based O O O O
survey O O O O
of O O O O
opisthokonts O O O O
living O O O O
in O O O O
marine O O O O
invertebrate O O O O
digestive O O O O
tracts O O O O
, O O O O
we O O O O
isolated O O O O
two O O O O
new O O O O
eukaryotes O O O O
that O O O O
differed O O O O
from O O O O
described O O O O
taxa O O O O
by O O O O
more O O O O
than O O O O
10 O O O O
% O O O O
in O O O O
their O O O O
small O O O O
subunit O O O O
ribosomal O O O O
DNA O O O O
sequences O O O O
. O O O O
    
Phylogenetic O O O O
analysis O O O O
showed O O O O
that O O O O
the O O O O
two O O O O
isolates O O O O
represented O O O O
a O O O O
divergent O O O O
clade O O O O
of O O O O
ichthyosporeans O O O O
known O O O O
previously O O O O
only O O O O
from O O O O
environmental O O O O
clone O O O O
sequences O O O O
. O O O O
    
We O O O O
used O O O O
light O O O O
and O O O O
electron O O O O
microscopy O O O O
to O O O O
describe O O O O
the O O O O
isolates O O O O
as O O O O
new O O O O
genera O O O O
and O O O O
species O O O O
Pirum B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
gemmata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Abeoforma B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
whisleri O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
whisleri O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
had O O O O
a O O O O
complex O O O O
life O O O O
cycle O O O O
that O O O O
remains O O O O
incompletely O O O O
known O O O O
but O O O O
involved O O O O
walled O O O O
spherical O O O O
cells O O O O
, O O O O
plasmodia O O O O
and O O O O
amoebae O O O O
. O O O O
    
Asexual O O O O
reproduction O O O O
occurred O O O O
via O O O O
dispersal O O O O
amoebae O O O O
, O O O O
endospores O O O O
, O O O O
binary O O O O
fission O O O O
and O O O O
budding O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gemmata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
had O O O O
a O O O O
less O O O O
complex O O O O
life O O O O
cycle O O O O
with O O O O
no O O O O
amoeboid O O O O
or O O O O
plasmodial O O O O
stages O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
species O O O O
had O O O O
membrane O O O O
- O O O O
bound O O O O
tubular O O O O
extensions O O O O
of O O O O
the O O O O
cytoplasm O O O O
embedded O O O O
in O O O O
the O O O O
inner O O O O
layers O O O O
of O O O O
their O O O O
cell O O O O
walls O O O O
. O O O O
    
By O O O O
comparing O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gemmata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
whisleri O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
to O O O O
other O O O O
ichthyosporea O O O O
we O O O O
speculate O O O O
on O O O O
the O O O O
characters O O O O
that O O O O
may O O O O
have O O O O
been O O O O
present O O O O
in O O O O
the O O O O
ancestral O O O O
ichthyosporean O O O O
. O O O O
    
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gemmata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
whisleri O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
illustrate O O O O
the O O O O
unique O O O O
and O O O O
diverse O O O O
forms O O O O
that O O O O
can O O O O
be O O O O
found O O O O
by O O O O
capturing O O O O
taxa O O O O
belonging O O O O
to O O O O
divergent O O O O
and O O O O
uncultured O O O O
lineages O O O O
. O O O O
    
Does O O O O
climate O O O O
warming O O O O
stimulate O O O O
or O O O O
inhibit O O O O
soil O O O O
protist O O O O
communities O O O O
? O O O O
    
A O O O O
test O O O O
on O O O O
testate O O O O
amoebae O O O O
in O O O O
high O O O O
- O O O O
arctic O O O O
tundra O O O O
with O O O O
free O O O O
- O O O O
air O O O O
temperature O O O O
increase O O O O
. O O O O
    
Soil O O O O
testate O O O O
amoebae O O O O
assemblages O O O O
in O O O O
a O O O O
grassland O O O O
area O O O O
at O O O O
Zackenberg O O O O
( O O O O
Northeast O O O O
Greenland O O O O
) O O O O
were O O O O
subjected O O O O
to O O O O
simulated O O O O
climate O O O O
- O O O O
warming O O O O
during O O O O
the O O O O
growing O O O O
season O O O O
using O O O O
the O O O O
Free O O O O
- O O O O
Air O O O O
Temperature O O O O
Increase O O O O
technique O O O O
. O O O O
    
Samples O O O O
were O O O O
collected O O O O
in O O O O
upper O O O O
( O O O O
0 O O O O
- O O O O
3cm O O O O
) O O O O
and O O O O
deeper O O O O
( O O O O
3 O O O O
- O O O O
6cm O O O O
) O O O O
soil O O O O
horizons O O O O
. O O O O
    
Mean O O O O
temperature O O O O
elevations O O O O
at O O O O
2 O O O O
. O O O O
5 O O O O
and O O O O
7 O O O O
. O O O O
5 O O O O
cm O O O O
depth O O O O
were O O O O
2 O O O O
. O O O O
58 O O O O
+ O O O O
/ O O O O
- O O O O
SD O O O O
1 O O O O
. O O O O
11 O O O O
and O O O O
2 O O O O
. O O O O
13 O O O O
+ O O O O
/ O O O O
- O O O O
SD O O O O
0 O O O O
. O O O O
77 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
, O O O O
respectively O O O O
, O O O O
and O O O O
did O O O O
not O O O O
differ O O O O
significantly O O O O
. O O O O
    
Soil O O O O
moisture O O O O
in O O O O
the O O O O
top O O O O
11cm O O O O
was O O O O
not O O O O
affected O O O O
by O O O O
the O O O O
warming O O O O
. O O O O
    
During O O O O
the O O O O
manipulation O O O O
, O O O O
the O O O O
densities O O O O
of O O O O
living O O O O
amoebae O O O O
and O O O O
empty O O O O
shells O O O O
were O O O O
higher O O O O
in O O O O
the O O O O
experimental O O O O
plots O O O O
but O O O O
only O O O O
in O O O O
the O O O O
upper O O O O
layer O O O O
. O O O O
    
Possibly O O O O
, O O O O
testate O O O O
amoebae O O O O
in O O O O
the O O O O
deeper O O O O
layer O O O O
were O O O O
limited O O O O
by O O O O
other O O O O
factors O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
warming O O O O
enhances O O O O
the O O O O
carrying O O O O
capacity O O O O
only O O O O
in O O O O
favourable O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
Species O O O O
richness O O O O
, O O O O
on O O O O
the O O O O
other O O O O
hand O O O O
, O O O O
was O O O O
only O O O O
increased O O O O
in O O O O
the O O O O
deeper O O O O
horizon O O O O
. O O O O
    
Warming O O O O
did O O O O
not O O O O
change O O O O
the O O O O
percentage O O O O
of O O O O
individuals O O O O
belonging O O O O
to O O O O
small O O O O
- O O O O
sized O O O O
species O O O O
in O O O O
any O O O O
of O O O O
the O O O O
living O O O O
assemblages O O O O
, O O O O
contrary O O O O
to O O O O
our O O O O
expectation O O O O
that O O O O
those O O O O
species O O O O
would O O O O
quickly O O O O
increase O O O O
their O O O O
density O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
in O O O O
the O O O O
empty O O O O
shell O O O O
assemblages O O O O
, O O O O
the O O O O
proportion O O O O
of O O O O
small O O O O
- O O O O
sized O O O O
individuals O O O O
in O O O O
the O O O O
experimental O O O O
plots O O O O
was O O O O
higher O O O O
in O O O O
both O O O O
layers O O O O
, O O O O
indicating O O O O
a O O O O
rapid O O O O
, O O O O
transient O O O O
increase O O O O
in O O O O
small O O O O
amoebae O O O O
before O O O O
the O O O O
first O O O O
sampling O O O O
date O O O O
. O O O O
    
Changes O O O O
in O O O O
successional O O O O
state O O O O
of O O O O
testate O O O O
amoebae O O O O
assemblages O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
future O O O O
climate O O O O
change O O O O
might O O O O
thus O O O O
be O O O O
ephemeral O O O O
, O O O O
whereas O O O O
alterations O O O O
in O O O O
density O O O O
and O O O O
species O O O O
richness O O O O
might O O O O
be O O O O
more O O O O
sustained O O O O
. O O O O
    
Characterization O O O O
of O O O O
the O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
biotin O O O O
biosynthetic O O O O
gene O O O O
cluster O O O O
and O O O O
use O O O O
of O O O O
the O O O O
bioDA O O O O
gene O O O O
as O O O O
a O O O O
new O O O O
transformation O O O O
marker O O O O
. O O O O
    
The O O O O
genes O O O O
involved O O O O
in O O O O
the O O O O
biosynthesis O O O O
of O O O O
biotin O O O O
were O O O O
identified O O O O
in O O O O
the O O O O
hyphal O O O O
fungus O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
through O O O O
homology O O O O
searches O O O O
and O O O O
complementation O O O O
of O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
biotin O O O O
- O O O O
auxotrophic O O O O
mutants O O O O
. O O O O
    
Whereas O O O O
the O O O O
7 O O O O
, O O O O
8 O O O O
- O O O O
diaminopelargonic O O O O
acid O O O O
synthase O O O O
and O O O O
dethiobiotin O O O O
synthetase O O O O
are O O O O
encoded O O O O
by O O O O
distinct O O O O
genes O O O O
in O O O O
bacteria O O O O
and O O O O
the O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
Saccharomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cerevisiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
both O O O O
activities O O O O
are O O O O
performed O O O O
in O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
by O O O O
a O O O O
single O O O O
enzyme O O O O
, O O O O
encoded O O O O
by O O O O
the O O O O
bifunctional O O O O
gene O O O O
bioDA O O O O
. O O O O
    
Such O O O O
a O O O O
bifunctional O O O O
bioDA O O O O
gene O O O O
is O O O O
a O O O O
genetic O O O O
feature O O O O
common O O O O
to O O O O
numerous O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
ascomycete O O O O
filamentous O O O O
fungi O O O O
and O O O O
basidiomycetes O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
in O O O O
plants O O O O
and O O O O
oomycota O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
unlike O O O O
in O O O O
other O O O O
eukaryota O O O O
, O O O O
the O O O O
three O O O O
bio O O O O
genes O O O O
contributing O O O O
to O O O O
the O O O O
four O O O O
enzymatic O O O O
steps O O O O
from O O O O
pimeloyl O O O O
- O O O O
CoA O O O O
to O O O O
biotin O O O O
are O O O O
organized O O O O
in O O O O
a O O O O
gene O O O O
cluster O O O O
in O O O O
pezizomycotina O O O O
. O O O O
    
The O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
auxotrophic O O O O
mutants O O O O
biA1 O O O O
, O O O O
biA2 O O O O
and O O O O
biA3 O O O O
were O O O O
all O O O O
found O O O O
to O O O O
have O O O O
mutations O O O O
in O O O O
the O O O O
7 O O O O
, O O O O
8 O O O O
- O O O O
diaminopelargonic O O O O
acid O O O O
synthase O O O O
domain O O O O
of O O O O
the O O O O
bioDA O O O O
gene O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
biotin O O O O
auxotrophy O O O O
is O O O O
an O O O O
inconvenient O O O O
marker O O O O
in O O O O
classical O O O O
genetic O O O O
manipulations O O O O
due O O O O
to O O O O
cross O O O O
- O O O O
feeding O O O O
of O O O O
biotin O O O O
, O O O O
transformation O O O O
of O O O O
the O O O O
biA1 O O O O
mutant O O O O
with O O O O
the O O O O
bioDA O O O O
gene O O O O
from O O O O
either O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
or O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
led O O O O
to O O O O
the O O O O
recovery O O O O
of O O O O
well O O O O
- O O O O
defined O O O O
biotin O O O O
- O O O O
prototrophic O O O O
colonies O O O O
. O O O O
    
The O O O O
usefulness O O O O
of O O O O
bioDA O O O O
gene O O O O
as O O O O
a O O O O
novel O O O O
and O O O O
robust O O O O
transformation O O O O
marker O O O O
was O O O O
demonstrated O O O O
in O O O O
co O O O O
- O O O O
transformation O O O O
experiments O O O O
with O O O O
a O O O O
green O O O O
fluorescent O O O O
protein O O O O
reporter O O O O
, O O O O
and O O O O
in O O O O
the O O O O
efficient O O O O
deletion O O O O
of O O O O
the O O O O
laccase O O O O
( O O O O
yA O O O O
) O O O O
gene O O O O
via O O O O
homologous O O O O
recombination O O O O
in O O O O
a O O O O
mutant O O O O
lacking O O O O
non O O O O
- O O O O
homologous O O O O
end O O O O
- O O O O
joining O O O O
activity O O O O
. O O O O
    
Regulation O O O O
of O O O O
virulence O O O O
factors O O O O
, O O O O
carbon O O O O
utilization O O O O
and O O O O
virulence O O O O
by O O O O
SNF1 O O O O
in O O O O
Cryptococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
neoformans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
JEC21 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
divergent O O O O
actions O O O O
of O O O O
SNF1 O O O O
between O O O O
cryptococcal O O O O
strains O O O O
. O O O O
    
We O O O O
describe O O O O
here O O O O
the O O O O
functions O O O O
of O O O O
a O O O O
Snf1 O O O O
/ O O O O
AMPK O O O O
homolog O O O O
in O O O O
the O O O O
human O O O O
pathogenic O O O O
yeast O O O O
Cryptococcus O O O O
neoformans O O O O
, O O O O
strain O O O O
JEC21 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
that O O O O
JEC21 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
SNF1 O O O O
is O O O O
a O O O O
key O O O O
regulator O O O O
for O O O O
the O O O O
biosynthesis O O O O
of O O O O
the O O O O
major O O O O
virulence O O O O
factors O O O O
, O O O O
stress O O O O
resistance O O O O
and O O O O
alternative O O O O
carbon O O O O
source O O O O
utilization O O O O
. O O O O
    
Disruption O O O O
of O O O O
JEC21 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
SNF1 O O O O
results O O O O
in O O O O
defects O O O O
of O O O O
laccase O O O O
activity O O O O
and O O O O
capsule O O O O
production O O O O
, O O O O
sensitivity O O O O
to O O O O
cation O O O O
stress O O O O
. O O O O
    
Especially O O O O
, O O O O
we O O O O
found O O O O
that O O O O
JEC21 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
SNF1 O O O O
is O O O O
essential O O O O
for O O O O
growth O O O O
at O O O O
elevated O O O O
temperature O O O O
and O O O O
for O O O O
thermotolerance O O O O
. O O O O
    
To O O O O
our O O O O
knowledge O O O O
, O O O O
a O O O O
role O O O O
for O O O O
Snf1 O O O O
proteins O O O O
in O O O O
thermotolerance O O O O
has O O O O
not O O O O
been O O O O
reported O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
we O O O O
observed O O O O
a O O O O
functional O O O O
divergence O O O O
between O O O O
JEC21 O O O O
SNF1 O O O O
and O O O O
its O O O O
equivalent O O O O
from O O O O
serotype O O O O
A O O O O
strain O O O O
H99 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
A O O O O
high O O O O
temperature O O O O
is O O O O
needed O O O O
for O O O O
H99 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
SNF1 O O O O
to O O O O
function O O O O
in O O O O
stress O O O O
response O O O O
and O O O O
carbon O O O O
source O O O O
preference O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
for O O O O
the O O O O
JEC21 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
SNF1 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
confirmed O O O O
a O O O O
critical O O O O
role O O O O
of O O O O
JEC21 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
SNF1 O O O O
in O O O O
regulation O O O O
of O O O O
stress O O O O
response O O O O
and O O O O
virulence O O O O
. O O O O
    
Revelation O O O O
of O O O O
divergent O O O O
actions O O O O
of O O O O
SNF1 O O O O
may O O O O
help O O O O
to O O O O
understand O O O O
the O O O O
evolution O O O O
of O O O O
cryptococcal O O O O
pathogenesis O O O O
and O O O O
provides O O O O
insights O O O O
into O O O O
the O O O O
strain O O O O
- O O O O
associated O O O O
biosynthesis O O O O
of O O O O
virulence O O O O
factors O O O O
. O O O O
    
Gout O O O O
therapeutics O O O O
: O O O O
new O O O O
drugs O O O O
for O O O O
an O O O O
old O O O O
disease O O O O
. O O O O
    
The O O O O
approval O O O O
of O O O O
febuxostat O O O O
, O O O O
a O O O O
non O O O O
- O O O O
purine O O O O
- O O O O
analogue O O O O
inhibitor O O O O
of O O O O
xanthine O O O O
oxidase O O O O
, O O O O
by O O O O
the O O O O
European O O O O
Medicines O O O O
Agency O O O O
and O O O O
the O O O O
US O O O O
Food O O O O
and O O O O
Drug O O O O
Administration O O O O
heralds O O O O
a O O O O
new O O O O
era O O O O
in O O O O
the O O O O
treatment O O O O
of O O O O
gout O O O O
. O O O O
    
The O O O O
use O O O O
of O O O O
modified O O O O
uricases O O O O
to O O O O
rapidly O O O O
reduce O O O O
serum O O O O
urate O O O O
concentrations O O O O
in O O O O
patients O O O O
with O O O O
otherwise O O O O
untreatable O O O O
gout O O O O
is O O O O
progressing O O O O
. O O O O
    
Additionally O O O O
, O O O O
advances O O O O
in O O O O
our O O O O
understanding O O O O
of O O O O
the O O O O
transport O O O O
of O O O O
uric O O O O
acid O O O O
in O O O O
the O O O O
renal O O O O
proximal O O O O
tubule O O O O
and O O O O
the O O O O
inflammatory O O O O
response O O O O
to O O O O
monosodium O O O O
urate O O O O
crystals O O O O
are O O O O
translating O O O O
into O O O O
potential O O O O
new O O O O
treatments O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
Review O O O O
, O O O O
we O O O O
focus O O O O
on O O O O
the O O O O
clinical O O O O
trials O O O O
of O O O O
febuxostat O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
review O O O O
results O O O O
from O O O O
studies O O O O
of O O O O
pegloticase O O O O
, O O O O
a O O O O
pegylated O O O O
uricase O O O O
in O O O O
development O O O O
, O O O O
and O O O O
we O O O O
summarise O O O O
data O O O O
for O O O O
several O O O O
other O O O O
pipeline O O O O
drugs O O O O
for O O O O
gout O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
the O O O O
selective O O O O
uricosuric O O O O
drug O O O O
RDEA594 O O O O
and O O O O
various O O O O
interleukin O O O O
- O O O O
1 O O O O
inhibitors O O O O
. O O O O
    
Finally O O O O
, O O O O
we O O O O
issue O O O O
a O O O O
word O O O O
of O O O O
caution O O O O
about O O O O
the O O O O
proper O O O O
use O O O O
of O O O O
the O O O O
new O O O O
drugs O O O O
and O O O O
the O O O O
already O O O O
available O O O O
drugs O O O O
for O O O O
gout O O O O
. O O O O
    
At O O O O
a O O O O
time O O O O
of O O O O
important O O O O
advances O O O O
, O O O O
we O O O O
need O O O O
to O O O O
recommit O O O O
ourselves O O O O
to O O O O
a O O O O
rational O O O O
approach O O O O
to O O O O
the O O O O
treatment O O O O
of O O O O
gout O O O O
. O O O O
    
Carry O O O O
- O O O O
over O O O O
effects O O O O
as O O O O
drivers O O O O
of O O O O
fitness O O O O
differences O O O O
in O O O O
animals O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Carry O O O O
- O O O O
over O O O O
effects O O O O
occur O O O O
when O O O O
processes O O O O
in O O O O
one O O O O
season O O O O
influence O O O O
the O O O O
success O O O O
of O O O O
an O O O O
individual O O O O
in O O O O
the O O O O
following O O O O
season O O O O
. O O O O
    
This O O O O
phenomenon O O O O
has O O O O
the O O O O
potential O O O O
to O O O O
explain O O O O
a O O O O
large O O O O
amount O O O O
of O O O O
variation O O O O
in O O O O
individual O O O O
fitness O O O O
, O O O O
but O O O O
so O O O O
far O O O O
has O O O O
only O O O O
been O O O O
described O O O O
in O O O O
a O O O O
limited O O O O
number O O O O
of O O O O
species O O O O
. O O O O
    
This O O O O
is O O O O
largely O O O O
due O O O O
to O O O O
difficulties O O O O
associated O O O O
with O O O O
tracking O O O O
individuals O O O O
between O O O O
periods O O O O
of O O O O
the O O O O
annual O O O O
cycle O O O O
, O O O O
but O O O O
also O O O O
because O O O O
of O O O O
a O O O O
lack O O O O
of O O O O
research O O O O
specifically O O O O
designed O O O O
to O O O O
examine O O O O
hypotheses O O O O
related O O O O
to O O O O
carry O O O O
- O O O O
over O O O O
effects O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
review O O O O
the O O O O
known O O O O
mechanisms O O O O
that O O O O
drive O O O O
carry O O O O
- O O O O
over O O O O
effects O O O O
, O O O O
most O O O O
notably O O O O
macronutrient O O O O
supply O O O O
, O O O O
and O O O O
highlight O O O O
the O O O O
types O O O O
of O O O O
life O O O O
histories O O O O
and O O O O
ecological O O O O
situations O O O O
where O O O O
we O O O O
would O O O O
expect O O O O
them O O O O
to O O O O
most O O O O
often O O O O
occur O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
identify O O O O
a O O O O
number O O O O
of O O O O
other O O O O
potential O O O O
mechanisms O O O O
that O O O O
require O O O O
investigation O O O O
, O O O O
including O O O O
micronutrients O O O O
such O O O O
as O O O O
antioxidants O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
propose O O O O
a O O O O
series O O O O
of O O O O
experiments O O O O
designed O O O O
to O O O O
estimate O O O O
the O O O O
relative O O O O
contributions O O O O
of O O O O
extrinsic O O O O
and O O O O
intrinsic O O O O
quality O O O O
effects O O O O
in O O O O
the O O O O
pre O O O O
- O O O O
breeding O O O O
season O O O O
, O O O O
which O O O O
in O O O O
turn O O O O
will O O O O
allow O O O O
an O O O O
accurate O O O O
estimation O O O O
of O O O O
the O O O O
magnitude O O O O
of O O O O
carry O O O O
- O O O O
over O O O O
effects O O O O
. O O O O
    
To O O O O
date O O O O
this O O O O
has O O O O
proven O O O O
immensely O O O O
difficult O O O O
, O O O O
and O O O O
we O O O O
hope O O O O
that O O O O
the O O O O
experimental O O O O
frameworks O O O O
described O O O O
here O O O O
will O O O O
stimulate O O O O
new O O O O
avenues O O O O
of O O O O
research O O O O
vital O O O O
to O O O O
advancing O O O O
our O O O O
understanding O O O O
of O O O O
how O O O O
carry O O O O
- O O O O
over O O O O
effects O O O O
can O O O O
shape O O O O
animal O O O O
life O O O O
histories O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
explore O O O O
the O O O O
potential O O O O
of O O O O
state O O O O
- O O O O
dependent O O O O
modelling O O O O
as O O O O
a O O O O
tool O O O O
for O O O O
investigating O O O O
carry O O O O
- O O O O
over O O O O
effects O O O O
, O O O O
most O O O O
notably O O O O
for O O O O
its O O O O
ability O O O O
to O O O O
calculate O O O O
optimal O O O O
rates O O O O
of O O O O
acquisition O O O O
of O O O O
a O O O O
multitude O O O O
of O O O O
resources O O O O
over O O O O
the O O O O
course O O O O
of O O O O
the O O O O
annual O O O O
cycle O O O O
, O O O O
and O O O O
also O O O O
because O O O O
it O O O O
allows O O O O
us O O O O
to O O O O
vary O O O O
the O O O O
strength O O O O
of O O O O
density O O O O
- O O O O
dependent O O O O
relationships O O O O
which O O O O
can O O O O
alter O O O O
the O O O O
magnitude O O O O
of O O O O
carry O O O O
- O O O O
over O O O O
effects O O O O
in O O O O
either O O O O
a O O O O
synergistic O O O O
or O O O O
agonistic O O O O
fashion O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
In O O O O
conclusion O O O O
carry O O O O
- O O O O
over O O O O
effects O O O O
are O O O O
likely O O O O
to O O O O
be O O O O
far O O O O
more O O O O
widespread O O O O
than O O O O
currently O O O O
indicated O O O O
, O O O O
and O O O O
they O O O O
are O O O O
likely O O O O
to O O O O
be O O O O
driven O O O O
by O O O O
a O O O O
multitude O O O O
of O O O O
factors O O O O
including O O O O
both O O O O
macro O O O O
- O O O O
and O O O O
micronutrients O O O O
. O O O O
    
For O O O O
this O O O O
reason O O O O
they O O O O
could O O O O
feasibly O O O O
be O O O O
responsible O O O O
for O O O O
a O O O O
large O O O O
amount O O O O
of O O O O
the O O O O
observed O O O O
variation O O O O
in O O O O
performance O O O O
among O O O O
individuals O O O O
, O O O O
and O O O O
consequently O O O O
warrant O O O O
a O O O O
wealth O O O O
of O O O O
new O O O O
research O O O O
designed O O O O
specifically O O O O
to O O O O
decompose O O O O
components O O O O
of O O O O
variation O O O O
in O O O O
fitness O O O O
attributes O O O O
related O O O O
to O O O O
processes O O O O
across O O O O
and O O O O
within O O O O
seasons O O O O
. O O O O
    
General O O O O
factors O O O O
important O O O O
for O O O O
the O O O O
formation O O O O
of O O O O
structured O O O O
biofilm O O O O
- O O O O
like O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
colonies O O O O
. O O O O
    
The O O O O
lifestyle O O O O
of O O O O
wild O O O O
and O O O O
laboratory O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
strains O O O O
significantly O O O O
differs O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
to O O O O
the O O O O
smooth O O O O
colonies O O O O
of O O O O
laboratory O O O O
strains O O O O
, O O O O
wild O O O O
Saccharomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cerevisiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strains O O O O
form O O O O
biofilm O O O O
- O O O O
like O O O O
, O O O O
strikingly O O O O
structured O O O O
colonies O O O O
possessing O O O O
distinctive O O O O
traits O O O O
enabling O O O O
them O O O O
to O O O O
better O O O O
survive O O O O
in O O O O
hostile O O O O
environments O O O O
in O O O O
the O O O O
wild O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
comparing O O O O
three O O O O
sets O O O O
of O O O O
strains O O O O
forming O O O O
differently O O O O
structured O O O O
colonies O O O O
( O O O O
fluffy O O O O
, O O O O
semi O O O O
- O O O O
fluffy O O O O
and O O O O
smooth O O O O
) O O O O
, O O O O
each O O O O
derived O O O O
from O O O O
ancestors O O O O
with O O O O
distinct O O O O
genetic O O O O
backgrounds O O O O
isolated O O O O
from O O O O
natural O O O O
settings O O O O
( O O O O
BR O O O O
- O O O O
88 O O O O
, O O O O
BR O O O O
- O O O O
99 O O O O
and O O O O
BR O O O O
- O O O O
103 O O O O
) O O O O
, O O O O
we O O O O
specified O O O O
the O O O O
factors O O O O
essential O O O O
for O O O O
the O O O O
formation O O O O
of O O O O
structured O O O O
colonies O O O O
, O O O O
i O O O O
. O O O O
e O O O O
. O O O O
for O O O O
the O O O O
lifestyle O O O O
most O O O O
likely O O O O
to O O O O
be O O O O
preferred O O O O
in O O O O
the O O O O
wild O O O O
. O O O O
    
The O O O O
ability O O O O
to O O O O
form O O O O
an O O O O
abundant O O O O
extracellular O O O O
matrix O O O O
( O O O O
ECM O O O O
) O O O O
is O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
features O O O O
typical O O O O
for O O O O
structured O O O O
colonies O O O O
. O O O O
    
ECM O O O O
influences O O O O
colony O O O O
architecture O O O O
and O O O O
many O O O O
other O O O O
physiological O O O O
properties O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
the O O O O
capability O O O O
to O O O O
retain O O O O
water O O O O
in O O O O
a O O O O
2 O O O O
- O O O O
fold O O O O
surplus O O O O
to O O O O
wet O O O O
cell O O O O
biomass O O O O
. O O O O
    
ECM O O O O
composition O O O O
, O O O O
however O O O O
, O O O O
differs O O O O
among O O O O
distinct O O O O
strains O O O O
, O O O O
depending O O O O
on O O O O
their O O O O
particular O O O O
genetic O O O O
background O O O O
. O O O O
    
We O O O O
further O O O O
show O O O O
that O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
certain O O O O
genes O O O O
( O O O O
AQY1 O O O O
, O O O O
FLO11 O O O O
) O O O O
is O O O O
also O O O O
strictly O O O O
related O O O O
to O O O O
the O O O O
particular O O O O
colony O O O O
morphology O O O O
, O O O O
being O O O O
highest O O O O
in O O O O
the O O O O
most O O O O
structured O O O O
colonies O O O O
. O O O O
    
Flo11p O O O O
adhesin O O O O
, O O O O
important O O O O
for O O O O
cell O O O O
- O O O O
cell O O O O
and O O O O
cell O O O O
- O O O O
surface O O O O
adhesion O O O O
, O O O O
is O O O O
essential O O O O
for O O O O
the O O O O
formation O O O O
of O O O O
fluffy O O O O
colonies O O O O
and O O O O
thus O O O O
significantly O O O O
contributes O O O O
to O O O O
the O O O O
phenotype O O O O
variability O O O O
of O O O O
wild O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
strains O O O O
. O O O O
    
On O O O O
the O O O O
other O O O O
hand O O O O
, O O O O
surprisingly O O O O
, O O O O
neither O O O O
the O O O O
cell O O O O
shape O O O O
nor O O O O
budding O O O O
pattern O O O O
nor O O O O
the O O O O
ability O O O O
to O O O O
form O O O O
pseudohyphae O O O O
directly O O O O
influences O O O O
the O O O O
formation O O O O
of O O O O
three O O O O
- O O O O
dimensional O O O O
fluffy O O O O
colony O O O O
architecture O O O O
. O O O O
    
Parallel O O O O
evolution O O O O
of O O O O
cytochrome O O O O
b O O O O
mediated O O O O
bifenazate O O O O
resistance O O O O
in O O O O
the O O O O
citrus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
red O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
mite O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Panonychus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
citri O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Bifenazate O O O O
is O O O O
a O O O O
recently O O O O
developed O O O O
acaricide O O O O
that O O O O
is O O O O
mainly O O O O
used O O O O
to O O O O
control O O O O
spider O O O O
mites O O O O
on O O O O
a O O O O
variety O O O O
of O O O O
crops O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
first O O O O
thought O O O O
to O O O O
be O O O O
a O O O O
neurotoxin O O O O
, O O O O
genetic O O O O
evidence O O O O
obtained O O O O
from O O O O
bifenazate O O O O
resistant O O O O
Tetranychus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
urticae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strains O O O O
suggested O O O O
an O O O O
alternative O O O O
mode O O O O
of O O O O
action O O O O
as O O O O
a O O O O
Qo O O O O
pocket O O O O
inhibitor O O O O
of O O O O
the O O O O
mitochondrial O O O O
complex O O O O
III O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
reveal O O O O
how O O O O
bifenazate O O O O
resistance O O O O
in O O O O
strains O O O O
of O O O O
Panonychus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
citri O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
maternally O O O O
inherited O O O O
and O O O O
can O O O O
confer O O O O
cross O O O O
- O O O O
resistance O O O O
to O O O O
the O O O O
known O O O O
Qo O O O O
inhibitor O O O O
acequinocyl O O O O
. O O O O
    
The O O O O
mitochondrial O O O O
genome O O O O
of O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
citri O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
sequenced O O O O
and O O O O
Qo O O O O
pocket O O O O
mutations O O O O
were O O O O
shown O O O O
to O O O O
be O O O O
linked O O O O
with O O O O
the O O O O
resistant O O O O
trait O O O O
. O O O O
    
Parallel O O O O
evolution O O O O
of O O O O
cytochrome O O O O
b O O O O
mediated O O O O
bifenazate O O O O
resistance O O O O
corroborates O O O O
the O O O O
alternative O O O O
mode O O O O
of O O O O
action O O O O
and O O O O
yet O O O O
again O O O O
illustrates O O O O
that O O O O
care O O O O
should O O O O
be O O O O
taken O O O O
when O O O O
employing O O O O
Qo O O O O
inhibitors O O O O
as O O O O
crop O O O O
protection O O O O
compounds O O O O
. O O O O
    
Wildlife O O O O
diseases O O O O
: O O O O
from O O O O
individuals O O O O
to O O O O
ecosystems O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
review O O O O
our O O O O
ecological O O O O
understanding O O O O
of O O O O
wildlife O O O O
infectious O O O O
diseases O O O O
from O O O O
the O O O O
individual O O O O
host O O O O
to O O O O
the O O O O
ecosystem O O O O
scale O O O O
, O O O O
highlighting O O O O
where O O O O
conceptual O O O O
thinking O O O O
lacks O O O O
verification O O O O
, O O O O
discussing O O O O
difficulties O O O O
and O O O O
challenges O O O O
, O O O O
and O O O O
offering O O O O
potential O O O O
future O O O O
research O O O O
directions O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
New O O O O
molecular O O O O
approaches O O O O
hold O O O O
potential O O O O
to O O O O
increase O O O O
our O O O O
understanding O O O O
of O O O O
parasite O O O O
interactions O O O O
within O O O O
hosts O O O O
. O O O O
    
Also O O O O
, O O O O
advances O O O O
in O O O O
our O O O O
knowledge O O O O
of O O O O
immune O O O O
systems O O O O
makes O O O O
immunological O O O O
parameters O O O O
viable O O O O
measures O O O O
of O O O O
parasite O O O O
exposure O O O O
, O O O O
and O O O O
useful O O O O
tools O O O O
for O O O O
improving O O O O
our O O O O
understanding O O O O
of O O O O
causal O O O O
mechanisms O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Studies O O O O
of O O O O
transmission O O O O
dynamics O O O O
have O O O O
revealed O O O O
the O O O O
importance O O O O
of O O O O
heterogeneity O O O O
in O O O O
host O O O O
behaviour O O O O
and O O O O
physiology O O O O
, O O O O
and O O O O
of O O O O
contact O O O O
processes O O O O
operating O O O O
at O O O O
different O O O O
spatial O O O O
and O O O O
temporal O O O O
scales O O O O
. O O O O
    
An O O O O
important O O O O
future O O O O
challenge O O O O
is O O O O
to O O O O
determine O O O O
the O O O O
key O O O O
transmission O O O O
mechanisms O O O O
maintaining O O O O
the O O O O
persistence O O O O
of O O O O
different O O O O
types O O O O
of O O O O
diseases O O O O
in O O O O
the O O O O
wild O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Regulation O O O O
of O O O O
host O O O O
populations O O O O
is O O O O
too O O O O
complex O O O O
to O O O O
consider O O O O
parasite O O O O
effects O O O O
in O O O O
isolation O O O O
from O O O O
other O O O O
factors O O O O
. O O O O
    
One O O O O
solution O O O O
is O O O O
to O O O O
seek O O O O
a O O O O
unified O O O O
understanding O O O O
of O O O O
the O O O O
conditions O O O O
under O O O O
which O O O O
( O O O O
and O O O O
the O O O O
ecological O O O O
rules O O O O
determining O O O O
when O O O O
) O O O O
population O O O O
scale O O O O
impacts O O O O
of O O O O
parasites O O O O
can O O O O
occur O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Good O O O O
evidence O O O O
now O O O O
shows O O O O
that O O O O
both O O O O
direct O O O O
effects O O O O
of O O O O
parasites O O O O
, O O O O
and O O O O
trait O O O O
mediated O O O O
indirect O O O O
effects O O O O
, O O O O
frequently O O O O
mediate O O O O
the O O O O
success O O O O
of O O O O
invasive O O O O
species O O O O
and O O O O
their O O O O
impacts O O O O
on O O O O
recipient O O O O
communities O O O O
. O O O O
    
A O O O O
wider O O O O
exploration O O O O
of O O O O
these O O O O
effects O O O O
is O O O O
now O O O O
needed O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
At O O O O
the O O O O
ecosystem O O O O
scale O O O O
, O O O O
research O O O O
is O O O O
needed O O O O
to O O O O
characterize O O O O
the O O O O
circumstances O O O O
and O O O O
conditions O O O O
under O O O O
which O O O O
both O O O O
fluxes O O O O
in O O O O
parasite O O O O
biomass O O O O
, O O O O
and O O O O
trait O O O O
mediated O O O O
effects O O O O
, O O O O
are O O O O
significant O O O O
in O O O O
ecosystem O O O O
processes O O O O
, O O O O
and O O O O
to O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
parasites O O O O
do O O O O
indeed O O O O
increase O O O O
' O O O O
ecosystem O O O O
health O O O O
' O O O O
. O O O O
    
7 O O O O
. O O O O
    
There O O O O
is O O O O
a O O O O
general O O O O
need O O O O
for O O O O
more O O O O
empirical O O O O
testing O O O O
of O O O O
predictions O O O O
and O O O O
subsequent O O O O
development O O O O
of O O O O
theory O O O O
in O O O O
the O O O O
classic O O O O
research O O O O
cycle O O O O
. O O O O
    
Experimental O O O O
field O O O O
studies O O O O
, O O O O
meta O O O O
- O O O O
analyses O O O O
, O O O O
the O O O O
collection O O O O
and O O O O
analysis O O O O
of O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
data O O O O
sets O O O O
, O O O O
and O O O O
data O O O O
constrained O O O O
modelling O O O O
, O O O O
will O O O O
all O O O O
be O O O O
key O O O O
to O O O O
advancing O O O O
our O O O O
understanding O O O O
. O O O O
    
8 O O O O
. O O O O
    
Finally O O O O
, O O O O
we O O O O
are O O O O
only O O O O
now O O O O
beginning O O O O
to O O O O
understand O O O O
the O O O O
importance O O O O
of O O O O
cross O O O O
- O O O O
scale O O O O
interactions O O O O
associated O O O O
with O O O O
parasitism O O O O
. O O O O
    
Such O O O O
interactions O O O O
may O O O O
offer O O O O
key O O O O
insights O O O O
into O O O O
bigger O O O O
picture O O O O
questions O O O O
such O O O O
as O O O O
when O O O O
and O O O O
how O O O O
different O O O O
regulatory O O O O
factors O O O O
are O O O O
important O O O O
, O O O O
when O O O O
disease O O O O
can O O O O
cause O O O O
species O O O O
extinctions O O O O
, O O O O
and O O O O
what O O O O
characteristics O O O O
are O O O O
indicative O O O O
of O O O O
functionally O O O O
resilient O O O O
ecosystems O O O O
. O O O O
    
Can O O O O
we O O O O
predict O O O O
indirect O O O O
interactions O O O O
from O O O O
quantitative O O O O
food O O O O
webs O O O O
? O O O O
- O O O O
- O O O O
an O O O O
experimental O O O O
approach O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Shared O O O O
enemies O O O O
may O O O O
link O O O O
the O O O O
dynamics O O O O
of O O O O
their O O O O
prey O O O O
. O O O O
    
Recently O O O O
, O O O O
quantitative O O O O
food O O O O
webs O O O O
have O O O O
been O O O O
used O O O O
to O O O O
infer O O O O
that O O O O
herbivorous O O O O
insect O O O O
species O O O O
attacked O O O O
by O O O O
the O O O O
same O O O O
major O O O O
parasitoid O O O O
species O O O O
will O O O O
affect O O O O
each O O O O
other O O O O
negatively O O O O
through O O O O
apparent O O O O
competition O O O O
. O O O O
    
Nonetheless O O O O
, O O O O
theoretical O O O O
work O O O O
predicts O O O O
several O O O O
alternative O O O O
outcomes O O O O
, O O O O
including O O O O
positive O O O O
effects O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
paper O O O O
, O O O O
we O O O O
use O O O O
an O O O O
experimental O O O O
approach O O O O
to O O O O
link O O O O
food O O O O
web O O O O
patterns O O O O
to O O O O
realized O O O O
population O O O O
dynamics O O O O
. O O O O
    
First O O O O
, O O O O
we O O O O
construct O O O O
a O O O O
quantitative O O O O
food O O O O
web O O O O
for O O O O
three O O O O
dominant O O O O
leaf O O O O
miner O O O O
species O O O O
on O O O O
the O O O O
oak O O O O
Quercus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
robur O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
We O O O O
then O O O O
measure O O O O
short O O O O
- O O O O
and O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
indirect O O O O
effects O O O O
by O O O O
increasing O O O O
leaf O O O O
miner O O O O
densities O O O O
on O O O O
individual O O O O
trees O O O O
. O O O O
    
Finally O O O O
, O O O O
we O O O O
test O O O O
whether O O O O
experimental O O O O
results O O O O
are O O O O
consistent O O O O
with O O O O
natural O O O O
leaf O O O O
miner O O O O
dynamics O O O O
on O O O O
unmanipulated O O O O
trees O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
quantitative O O O O
food O O O O
web O O O O
shows O O O O
that O O O O
all O O O O
leaf O O O O
miner O O O O
species O O O O
share O O O O
a O O O O
minimum O O O O
of O O O O
four O O O O
parasitoid O O O O
species O O O O
. O O O O
    
While O O O O
only O O O O
a O O O O
small O O O O
fraction O O O O
of O O O O
the O O O O
parasitoid O O O O
pool O O O O
is O O O O
shared O O O O
among O O O O
Tischeria B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ekebladella O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
each O O O O
of O O O O
two O O O O
Phyllonorycter O O O O
species O O O O
, O O O O
the O O O O
parasitoid O O O O
communities O O O O
of O O O O
the O O O O
congeneric O O O O
Phyllonorycter O O O O
species O O O O
overlap O O O O
substantially O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Based O O O O
on O O O O
the O O O O
structure O O O O
of O O O O
the O O O O
food O O O O
web O O O O
, O O O O
we O O O O
predict O O O O
strong O O O O
short O O O O
- O O O O
and O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
indirect O O O O
interactions O O O O
between O O O O
the O O O O
Phyllonorycter O O O O
species O O O O
, O O O O
and O O O O
limited O O O O
interactions O O O O
between O O O O
them O O O O
and O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ekebladella O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
As O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ekebladella O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
the O O O O
main O O O O
source O O O O
of O O O O
its O O O O
own O O O O
parasitoids O O O O
, O O O O
we O O O O
expect O O O O
to O O O O
find O O O O
intraspecific O O O O
density O O O O
- O O O O
dependent O O O O
parasitism O O O O
in O O O O
this O O O O
species O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Consistent O O O O
with O O O O
these O O O O
predictions O O O O
, O O O O
parasitism O O O O
in O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ekebladella O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
high O O O O
on O O O O
trees O O O O
with O O O O
high O O O O
densities O O O O
of O O O O
conspecifics O O O O
in O O O O
the O O O O
previous O O O O
generation O O O O
. O O O O
    
Among O O O O
leaf O O O O
miner O O O O
species O O O O
sharing O O O O
more O O O O
parasitoids O O O O
, O O O O
we O O O O
found O O O O
positive O O O O
rather O O O O
than O O O O
negative O O O O
interactions O O O O
among O O O O
years O O O O
. O O O O
    
No O O O O
short O O O O
- O O O O
term O O O O
indirect O O O O
interactions O O O O
( O O O O
i O O O O
. O O O O
e O O O O
. O O O O
indirect O O O O
interactions O O O O
within O O O O
a O O O O
single O O O O
generation O O O O
) O O O O
were O O O O
detected O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
Overall O O O O
, O O O O
this O O O O
study O O O O
is O O O O
the O O O O
first O O O O
to O O O O
experimentally O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
herbivores O O O O
with O O O O
overlapping O O O O
parasitoid O O O O
communities O O O O
may O O O O
exhibit O O O O
independent O O O O
population O O O O
dynamics O O O O
- O O O O
or O O O O
even O O O O
apparent O O O O
mutualism O O O O
. O O O O
    
Hence O O O O
, O O O O
it O O O O
proves O O O O
the O O O O
potential O O O O
for O O O O
versatile O O O O
indirect O O O O
interactions O O O O
in O O O O
nature O O O O
, O O O O
and O O O O
suggests O O O O
that O O O O
the O O O O
link O O O O
between O O O O
patterns O O O O
in O O O O
food O O O O
web O O O O
structure O O O O
and O O O O
realized O O O O
population O O O O
dynamics O O O O
should O O O O
be O O O O
verified O O O O
by O O O O
rigorous O O O O
experiments O O O O
. O O O O
    
Comparison O O O O
of O O O O
transcriptional O O O O
and O O O O
translational O O O O
changes O O O O
caused O O O O
by O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
menadione O O O O
exposure O O O O
in O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Under O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
oxidative O O O O
stress O O O O
caused O O O O
by O O O O
menadione O O O O
sodium O O O O
bisulfite O O O O
, O O O O
genome O O O O
- O O O O
wide O O O O
transcriptional O O O O
and O O O O
proteome O O O O
- O O O O
wide O O O O
translational O O O O
changes O O O O
were O O O O
compared O O O O
in O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
vegetative O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
The O O O O
comparison O O O O
of O O O O
proteomic O O O O
and O O O O
DNA O O O O
microarray O O O O
expression O O O O
data O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
global O O O O
gene O O O O
expression O O O O
changes O O O O
recorded O O O O
with O O O O
either O O O O
flip O O O O
- O O O O
flop O O O O
or O O O O
dendrimer O O O O
cDNA O O O O
labeling O O O O
techniques O O O O
supported O O O O
proteome O O O O
changes O O O O
moderately O O O O
with O O O O
40 O O O O
% O O O O
and O O O O
34 O O O O
% O O O O
coincidence O O O O
coefficients O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
Enzyme O O O O
levels O O O O
in O O O O
the O O O O
glycolytic O O O O
pathway O O O O
were O O O O
alternating O O O O
, O O O O
which O O O O
was O O O O
a O O O O
direct O O O O
consequence O O O O
of O O O O
fluctuating O O O O
gene O O O O
expression O O O O
patterns O O O O
. O O O O
    
Surprisingly O O O O
, O O O O
enzymes O O O O
in O O O O
the O O O O
vitamin O O O O
B2 O O O O
and O O O O
B6 O O O O
biosynthetic O O O O
pathways O O O O
were O O O O
repressed O O O O
concomitantly O O O O
with O O O O
the O O O O
repression O O O O
of O O O O
some O O O O
protein O O O O
folding O O O O
chaperones O O O O
and O O O O
nuclear O O O O
transport O O O O
elements O O O O
. O O O O
    
Under O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
oxidative O O O O
stress O O O O
, O O O O
the O O O O
peroxide O O O O
- O O O O
detoxifying O O O O
peroxiredoxins O O O O
and O O O O
cytochrome O O O O
c O O O O
peroxidase O O O O
were O O O O
replaced O O O O
by O O O O
thioredoxin O O O O
reductase O O O O
, O O O O
a O O O O
nitroreductase O O O O
and O O O O
a O O O O
flavohemoprotein O O O O
, O O O O
and O O O O
protein O O O O
degradation O O O O
became O O O O
predominant O O O O
to O O O O
eliminate O O O O
damaged O O O O
proteins O O O O
. O O O O
    
Contrasting O O O O
impacts O O O O
of O O O O
climate O O O O
- O O O O
driven O O O O
flowering O O O O
phenology O O O O
on O O O O
changes O O O O
in O O O O
alien O O O O
and O O O O
native O O O O
plant O O O O
species O O O O
distributions O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Plant O O O O
phenology O O O O
is O O O O
particularly O O O O
sensitive O O O O
to O O O O
climate O O O O
and O O O O
a O O O O
key O O O O
indicator O O O O
of O O O O
environmental O O O O
change O O O O
. O O O O
    
Globally O O O O
, O O O O
first O O O O
flowering O O O O
dates O O O O
( O O O O
FFDs O O O O
) O O O O
have O O O O
advanced O O O O
by O O O O
several O O O O
days O O O O
per O O O O
decade O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
recent O O O O
climate O O O O
warming O O O O
, O O O O
but O O O O
, O O O O
while O O O O
earlier O O O O
flowering O O O O
should O O O O
allow O O O O
plant O O O O
distributions O O O O
to O O O O
increase O O O O
, O O O O
a O O O O
link O O O O
between O O O O
FFD O O O O
and O O O O
range O O O O
changes O O O O
has O O O O
not O O O O
been O O O O
observed O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Here O O O O
I O O O O
show O O O O
for O O O O
347 O O O O
species O O O O
that O O O O
the O O O O
extent O O O O
to O O O O
which O O O O
FFD O O O O
has O O O O
responded O O O O
to O O O O
climate O O O O
warming O O O O
is O O O O
linked O O O O
to O O O O
the O O O O
degree O O O O
to O O O O
which O O O O
their O O O O
relative O O O O
distributions O O O O
have O O O O
changed O O O O
over O O O O
30 O O O O
yr O O O O
across O O O O
the O O O O
British O O O O
Isles O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Native O O O O
plant O O O O
species O O O O
whose O O O O
phenology O O O O
did O O O O
not O O O O
track O O O O
climate O O O O
change O O O O
declined O O O O
in O O O O
distribution O O O O
, O O O O
whereas O O O O
species O O O O
that O O O O
became O O O O
more O O O O
widespread O O O O
all O O O O
exhibited O O O O
earlier O O O O
flowering O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
, O O O O
alien O O O O
neophytes O O O O
showed O O O O
both O O O O
a O O O O
stronger O O O O
phenological O O O O
response O O O O
to O O O O
warming O O O O
and O O O O
a O O O O
more O O O O
marked O O O O
increase O O O O
in O O O O
distribution O O O O
, O O O O
but O O O O
no O O O O
link O O O O
between O O O O
the O O O O
two O O O O
. O O O O
    
* O O O O
These O O O O
trends O O O O
were O O O O
consistent O O O O
both O O O O
for O O O O
relative O O O O
changes O O O O
in O O O O
the O O O O
national O O O O
distribution O O O O
and O O O O
for O O O O
local O O O O
abundance O O O O
. O O O O
    
At O O O O
the O O O O
national O O O O
scale O O O O
, O O O O
the O O O O
more O O O O
recently O O O O
an O O O O
alien O O O O
species O O O O
became O O O O
established O O O O
in O O O O
Britain O O O O
, O O O O
the O O O O
more O O O O
likely O O O O
it O O O O
was O O O O
to O O O O
increase O O O O
in O O O O
distribution O O O O
irrespective O O O O
of O O O O
FFD O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
recent O O O O
changes O O O O
in O O O O
alien O O O O
species O O O O
distributions O O O O
are O O O O
decoupled O O O O
from O O O O
climate O O O O
and O O O O
driven O O O O
by O O O O
other O O O O
factors O O O O
. O O O O
    
A O O O O
root O O O O
is O O O O
a O O O O
root O O O O
is O O O O
a O O O O
root O O O O
? O O O O
    
Water O O O O
uptake O O O O
rates O O O O
of O O O O
Citrus O O O O
root O O O O
orders O O O O
. O O O O
    
Knowledge O O O O
about O O O O
the O O O O
physiological O O O O
function O O O O
of O O O O
root O O O O
orders O O O O
is O O O O
scant O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
a O O O O
system O O O O
to O O O O
monitor O O O O
the O O O O
water O O O O
flux O O O O
among O O O O
root O O O O
orders O O O O
was O O O O
developed O O O O
using O O O O
miniaturized O O O O
chambers O O O O
. O O O O
    
Different O O O O
root O O O O
orders O O O O
of O O O O
4 O O O O
- O O O O
year O O O O
- O O O O
old O O O O
Citrus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
volkameriana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
trees O O O O
were O O O O
analysed O O O O
with O O O O
respect O O O O
to O O O O
root O O O O
morphology O O O O
and O O O O
water O O O O
flux O O O O
. O O O O
    
The O O O O
eight O O O O
root O O O O
orders O O O O
showed O O O O
a O O O O
broad O O O O
overlap O O O O
in O O O O
diameter O O O O
, O O O O
but O O O O
differences O O O O
in O O O O
tissue O O O O
densities O O O O
and O O O O
specific O O O O
root O O O O
area O O O O
( O O O O
SRA O O O O
) O O O O
were O O O O
clearly O O O O
distinguishable O O O O
. O O O O
    
Thirty O O O O
per O O O O
cent O O O O
of O O O O
the O O O O
root O O O O
branch O O O O
biomass O O O O
but O O O O
50 O O O O
% O O O O
of O O O O
the O O O O
surface O O O O
area O O O O
( O O O O
SA O O O O
) O O O O
was O O O O
possessed O O O O
by O O O O
the O O O O
first O O O O
root O O O O
order O O O O
, O O O O
while O O O O
the O O O O
fifth O O O O
accounted O O O O
for O O O O
5 O O O O
% O O O O
of O O O O
the O O O O
SA O O O O
( O O O O
20 O O O O
% O O O O
biomass O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
root O O O O
order O O O O
was O O O O
identified O O O O
as O O O O
a O O O O
determinant O O O O
of O O O O
water O O O O
flux O O O O
. O O O O
    
First O O O O
- O O O O
order O O O O
roots O O O O
showed O O O O
a O O O O
significantly O O O O
higher O O O O
rate O O O O
of O O O O
water O O O O
uptake O O O O
than O O O O
the O O O O
second O O O O
and O O O O
third O O O O
root O O O O
orders O O O O
, O O O O
whereas O O O O
the O O O O
fourth O O O O
and O O O O
fifth O O O O
root O O O O
orders O O O O
showed O O O O
water O O O O
excess O O O O
. O O O O
    
The O O O O
water O O O O
excess O O O O
suggested O O O O
the O O O O
occurrence O O O O
of O O O O
hydraulic O O O O
redistribution O O O O
( O O O O
HR O O O O
) O O O O
as O O O O
a O O O O
result O O O O
of O O O O
differences O O O O
in O O O O
osmotic O O O O
potentials O O O O
. O O O O
    
We O O O O
suggest O O O O
that O O O O
plants O O O O
may O O O O
utilize O O O O
hydraulic O O O O
redistribution O O O O
to O O O O
prevent O O O O
coarse O O O O
root O O O O
desiccation O O O O
and O O O O
/ O O O O
or O O O O
to O O O O
increase O O O O
nutrient O O O O
acquisition O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
study O O O O
showed O O O O
that O O O O
the O O O O
novel O O O O
' O O O O
miniature O O O O
depletion O O O O
chamber O O O O
' O O O O
method O O O O
enabled O O O O
direct O O O O
measurement O O O O
of O O O O
water O O O O
fluxes O O O O
per O O O O
root O O O O
order O O O O
and O O O O
can O O O O
be O O O O
a O O O O
major O O O O
tool O O O O
for O O O O
future O O O O
studies O O O O
on O O O O
root O O O O
order O O O O
traits O O O O
. O O O O
    
Increased O O O O
intracellular O O O O
H2O2 O O O O
availability O O O O
preferentially O O O O
drives O O O O
glutathione O O O O
accumulation O O O O
in O O O O
vacuoles O O O O
and O O O O
chloroplasts O O O O
. O O O O
    
One O O O O
biochemical O O O O
response O O O O
to O O O O
increased O O O O
H2O2 O O O O
availability O O O O
is O O O O
the O O O O
accumulation O O O O
of O O O O
glutathione O O O O
disulphide O O O O
( O O O O
GSSG O O O O
) O O O O
, O O O O
the O O O O
disulphide O O O O
form O O O O
of O O O O
the O O O O
key O O O O
redox O O O O
buffer O O O O
glutathione O O O O
. O O O O
    
It O O O O
remains O O O O
unclear O O O O
how O O O O
this O O O O
potentially O O O O
important O O O O
oxidative O O O O
stress O O O O
response O O O O
impacts O O O O
on O O O O
the O O O O
different O O O O
sub O O O O
- O O O O
cellular O O O O
glutathione O O O O
pools O O O O
. O O O O
    
We O O O O
addressed O O O O
this O O O O
question O O O O
by O O O O
using O O O O
two O O O O
independent O O O O
in O O O O
situ O O O O
glutathione O O O O
labelling O O O O
techniques O O O O
in O O O O
Arabidopsis O O O O
wild O O O O
type O O O O
( O O O O
Col O O O O
- O O O O
0 O O O O
) O O O O
and O O O O
the O O O O
GSSG O O O O
- O O O O
accumulating O O O O
cat2 O O O O
mutant O O O O
. O O O O
    
A O O O O
comparison O O O O
of O O O O
in O O O O
situ O O O O
labelling O O O O
with O O O O
monochlorobimane O O O O
( O O O O
MCB O O O O
) O O O O
and O O O O
in O O O O
vitro O O O O
labelling O O O O
with O O O O
monobromobimane O O O O
( O O O O
MBB O O O O
) O O O O
revealed O O O O
that O O O O
, O O O O
whereas O O O O
in O O O O
situ O O O O
labelling O O O O
of O O O O
Col O O O O
- O O O O
0 O O O O
leaf O O O O
glutathione O O O O
was O O O O
complete O O O O
within O O O O
2 O O O O
h O O O O
incubation O O O O
, O O O O
about O O O O
50 O O O O
% O O O O
of O O O O
leaf O O O O
glutathione O O O O
remained O O O O
inaccessible O O O O
to O O O O
MCB O O O O
in O O O O
cat2 O O O O
. O O O O
    
High O O O O
- O O O O
performance O O O O
liquid O O O O
chromatography O O O O
( O O O O
HPLC O O O O
) O O O O
and O O O O
enzymatic O O O O
assays O O O O
showed O O O O
that O O O O
this O O O O
correlated O O O O
tightly O O O O
with O O O O
the O O O O
glutathione O O O O
redox O O O O
state O O O O
, O O O O
pointing O O O O
to O O O O
significant O O O O
in O O O O
vivo O O O O
pools O O O O
of O O O O
GSSG O O O O
in O O O O
cat2 O O O O
that O O O O
were O O O O
unavailable O O O O
for O O O O
MCB O O O O
labelling O O O O
. O O O O
    
Immunogold O O O O
labelling O O O O
of O O O O
leaf O O O O
sections O O O O
to O O O O
estimate O O O O
sub O O O O
- O O O O
cellular O O O O
glutathione O O O O
distribution O O O O
showed O O O O
that O O O O
the O O O O
accumulated O O O O
GSSG O O O O
in O O O O
cat2 O O O O
was O O O O
associated O O O O
with O O O O
only O O O O
a O O O O
minor O O O O
increase O O O O
in O O O O
cytosolic O O O O
glutathione O O O O
but O O O O
with O O O O
a O O O O
3 O O O O
- O O O O
and O O O O
10 O O O O
- O O O O
fold O O O O
increase O O O O
in O O O O
plastid O O O O
and O O O O
vacuolar O O O O
pools O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
The O O O O
data O O O O
are O O O O
used O O O O
to O O O O
estimate O O O O
compartment O O O O
- O O O O
specific O O O O
glutathione O O O O
concentrations O O O O
under O O O O
optimal O O O O
and O O O O
oxidative O O O O
stress O O O O
conditions O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
implications O O O O
for O O O O
redox O O O O
homeostasis O O O O
and O O O O
signalling O O O O
are O O O O
discussed O O O O
. O O O O
    
Fungal O O O O
secondary O O O O
metabolites O O O O
as O O O O
modulators O O O O
of O O O O
interactions O O O O
with O O O O
insects O O O O
and O O O O
other O O O O
arthropods O O O O
. O O O O
    
Fungi O O O O
share O O O O
a O O O O
diverse O O O O
co O O O O
- O O O O
evolutionary O O O O
history O O O O
with O O O O
animals O O O O
, O O O O
especially O O O O
arthropods O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
review O O O O
, O O O O
we O O O O
focus O O O O
on O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
secondary O O O O
metabolism O O O O
in O O O O
driving O O O O
antagonistic O O O O
arthropod O O O O
- O O O O
fungus O O O O
interactions O O O O
, O O O O
i O O O O
. O O O O
e O O O O
. O O O O
, O O O O
where O O O O
fungi O O O O
serve O O O O
as O O O O
a O O O O
food O O O O
source O O O O
to O O O O
fungal O O O O
grazers O O O O
, O O O O
compete O O O O
with O O O O
saprophagous O O O O
insects O O O O
, O O O O
and O O O O
attack O O O O
insects O O O O
as O O O O
hosts O O O O
for O O O O
growth O O O O
and O O O O
reproduction O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
a O O O O
wealth O O O O
of O O O O
studies O O O O
on O O O O
animal O O O O
- O O O O
fungus O O O O
interactions O O O O
point O O O O
to O O O O
a O O O O
crucial O O O O
role O O O O
of O O O O
secondary O O O O
metabolites O O O O
in O O O O
deterring O O O O
animal O O O O
feeding O O O O
and O O O O
resisting O O O O
immune O O O O
defense O O O O
strategies O O O O
, O O O O
causal O O O O
evidence O O O O
often O O O O
remains O O O O
to O O O O
be O O O O
provided O O O O
. O O O O
    
Moreover O O O O
, O O O O
it O O O O
still O O O O
remains O O O O
an O O O O
unresolved O O O O
puzzle O O O O
as O O O O
to O O O O
what O O O O
extent O O O O
the O O O O
tight O O O O
regulatory O O O O
control O O O O
of O O O O
secondary O O O O
metabolite O O O O
formation O O O O
in O O O O
some O O O O
model O O O O
fungi O O O O
represents O O O O
an O O O O
evolved O O O O
chemical O O O O
defense O O O O
system O O O O
favored O O O O
by O O O O
selective O O O O
pressure O O O O
through O O O O
animal O O O O
antagonists O O O O
. O O O O
    
Given O O O O
these O O O O
gaps O O O O
in O O O O
knowledge O O O O
, O O O O
we O O O O
highlight O O O O
some O O O O
co O O O O
- O O O O
evolutionary O O O O
aspects O O O O
of O O O O
secondary O O O O
metabolism O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
induced O O O O
response O O O O
, O O O O
volatile O O O O
signaling O O O O
, O O O O
and O O O O
experimental O O O O
evolution O O O O
, O O O O
which O O O O
may O O O O
help O O O O
in O O O O
deciphering O O O O
the O O O O
ecological O O O O
importance O O O O
and O O O O
evolutionary O O O O
history O O O O
of O O O O
secondary O O O O
metabolite O O O O
production O O O O
in O O O O
fungi O O O O
. O O O O
    
A O O O O
multispecies O O O O
perspective O O O O
on O O O O
ecological O O O O
impacts O O O O
of O O O O
climatic O O O O
forcing O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
prevailing O O O O
context O O O O
of O O O O
concerns O O O O
over O O O O
climate O O O O
change O O O O
and O O O O
its O O O O
potential O O O O
impacts O O O O
on O O O O
ecosystems O O O O
, O O O O
evaluating O O O O
ecological O O O O
consequences O O O O
of O O O O
climatic O O O O
forcing O O O O
has O O O O
become O O O O
a O O O O
critical O O O O
issue O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Historical O O O O
data O O O O
on O O O O
the O O O O
abundance O O O O
of O O O O
organisms O O O O
have O O O O
been O O O O
extensively O O O O
used O O O O
to O O O O
characterize O O O O
the O O O O
ecological O O O O
effects O O O O
of O O O O
climatic O O O O
forcing O O O O
through O O O O
specific O O O O
weather O O O O
and O O O O
/ O O O O
or O O O O
climatic O O O O
variables O O O O
, O O O O
with O O O O
most O O O O
of O O O O
the O O O O
studies O O O O
confined O O O O
to O O O O
single O O O O
population O O O O
models O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
population O O O O
responses O O O O
to O O O O
environmental O O O O
fluctuations O O O O
typically O O O O
depend O O O O
upon O O O O
positive O O O O
and O O O O
negative O O O O
feedbacks O O O O
induced O O O O
by O O O O
interactions O O O O
with O O O O
other O O O O
species O O O O
. O O O O
    
It O O O O
is O O O O
therefore O O O O
important O O O O
to O O O O
integrate O O O O
the O O O O
insights O O O O
gained O O O O
from O O O O
single O O O O
population O O O O
approaches O O O O
into O O O O
a O O O O
multispecies O O O O
perspective O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
combine O O O O
the O O O O
hierarchical O O O O
Bayesian O O O O
modelling O O O O
approach O O O O
with O O O O
the O O O O
state O O O O
- O O O O
space O O O O
formulation O O O O
to O O O O
extend O O O O
the O O O O
scope O O O O
of O O O O
previously O O O O
proposed O O O O
models O O O O
of O O O O
population O O O O
dynamics O O O O
under O O O O
climatic O O O O
forcing O O O O
to O O O O
multi O O O O
- O O O O
species O O O O
systems O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
use O O O O
our O O O O
model O O O O
to O O O O
analyse O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
macro O O O O
- O O O O
moth O O O O
( O O O O
Lepidoptera O O O O
) O O O O
community O O O O
data O O O O
from O O O O
the O O O O
Rothamsted O O O O
Insect O O O O
Survey O O O O
network O O O O
in O O O O
the O O O O
UK O O O O
, O O O O
using O O O O
winter O O O O
rainfall O O O O
and O O O O
winter O O O O
temperature O O O O
as O O O O
environmental O O O O
covariates O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
effects O O O O
of O O O O
the O O O O
two O O O O
weather O O O O
variables O O O O
were O O O O
consistent O O O O
across O O O O
species O O O O
, O O O O
being O O O O
negative O O O O
for O O O O
winter O O O O
rainfall O O O O
and O O O O
positive O O O O
for O O O O
winter O O O O
temperature O O O O
. O O O O
    
The O O O O
two O O O O
weather O O O O
variables O O O O
jointly O O O O
explained O O O O
15 O O O O
- O O O O
40 O O O O
% O O O O
of O O O O
the O O O O
total O O O O
environmental O O O O
variation O O O O
affecting O O O O
the O O O O
dynamics O O O O
of O O O O
individual O O O O
species O O O O
, O O O O
and O O O O
could O O O O
explain O O O O
up O O O O
to O O O O
90 O O O O
% O O O O
of O O O O
covariances O O O O
in O O O O
species O O O O
dynamics O O O O
. O O O O
    
7 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
contribution O O O O
of O O O O
interspecific O O O O
interactions O O O O
to O O O O
community O O O O
- O O O O
level O O O O
variation O O O O
was O O O O
found O O O O
to O O O O
be O O O O
weak O O O O
compared O O O O
to O O O O
the O O O O
contributions O O O O
of O O O O
environmental O O O O
forcing O O O O
and O O O O
intraspecific O O O O
interactions O O O O
. O O O O
    
Cross O O O O
- O O O O
talk O O O O
between O O O O
light O O O O
and O O O O
glucose O O O O
regulation O O O O
controls O O O O
toxin O O O O
production O O O O
and O O O O
morphogenesis O O O O
in O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Light O O O O
is O O O O
a O O O O
major O O O O
environmental O O O O
stimulus O O O O
that O O O O
has O O O O
a O O O O
broad O O O O
effect O O O O
on O O O O
organisms O O O O
, O O O O
triggering O O O O
a O O O O
cellular O O O O
response O O O O
that O O O O
results O O O O
in O O O O
an O O O O
optimal O O O O
adaptation O O O O
enhancing O O O O
fitness O O O O
and O O O O
survival O O O O
. O O O O
    
In O O O O
fungi O O O O
, O O O O
light O O O O
affects O O O O
growth O O O O
, O O O O
and O O O O
causes O O O O
diverse O O O O
morphological O O O O
changes O O O O
such O O O O
as O O O O
those O O O O
leading O O O O
to O O O O
reproduction O O O O
. O O O O
    
Light O O O O
can O O O O
also O O O O
affect O O O O
fungal O O O O
metabolism O O O O
, O O O O
including O O O O
the O O O O
biosynthesis O O O O
of O O O O
natural O O O O
products O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
we O O O O
show O O O O
that O O O O
in O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
the O O O O
effect O O O O
of O O O O
light O O O O
on O O O O
the O O O O
production O O O O
of O O O O
the O O O O
sterigmatocystin O O O O
( O O O O
ST O O O O
) O O O O
toxin O O O O
depends O O O O
on O O O O
the O O O O
glucose O O O O
concentration O O O O
. O O O O
    
In O O O O
cultures O O O O
grown O O O O
with O O O O
1 O O O O
% O O O O
glucose O O O O
and O O O O
exposed O O O O
to O O O O
light O O O O
, O O O O
ST O O O O
production O O O O
was O O O O
lower O O O O
than O O O O
when O O O O
grown O O O O
in O O O O
the O O O O
dark O O O O
. O O O O
    
This O O O O
lower O O O O
ST O O O O
production O O O O
coincided O O O O
with O O O O
an O O O O
elevated O O O O
rate O O O O
of O O O O
cellular O O O O
damage O O O O
with O O O O
partial O O O O
loss O O O O
of O O O O
nuclear O O O O
integrity O O O O
and O O O O
vacuolated O O O O
cytoplasm O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
in O O O O
cultures O O O O
grown O O O O
with O O O O
2 O O O O
% O O O O
glucose O O O O
these O O O O
effects O O O O
were O O O O
reversed O O O O
and O O O O
light O O O O
enhanced O O O O
ST O O O O
production O O O O
. O O O O
    
Glucose O O O O
abundance O O O O
also O O O O
affected O O O O
the O O O O
light O O O O
- O O O O
dependent O O O O
subcellular O O O O
localization O O O O
of O O O O
the O O O O
VeA O O O O
( O O O O
velvet O O O O
) O O O O
protein O O O O
, O O O O
a O O O O
key O O O O
regulator O O O O
necessary O O O O
for O O O O
normal O O O O
light O O O O
- O O O O
dependent O O O O
morphogenesis O O O O
and O O O O
secondary O O O O
metabolism O O O O
in O O O O
Aspergilli O O O O
and O O O O
other O O O O
fungal O O O O
genera O O O O
. O O O O
    
The O O O O
role O O O O
of O O O O
other O O O O
VeA O O O O
- O O O O
associated O O O O
proteins O O O O
, O O O O
particularly O O O O
the O O O O
blue O O O O
- O O O O
light O O O O
- O O O O
sensing O O O O
proteins O O O O
LreA O O O O
and O O O O
LreB O O O O
( O O O O
WC O O O O
- O O O O
1 O O O O
and O O O O
WC O O O O
- O O O O
2 O O O O
orthologs O O O O
) O O O O
, O O O O
on O O O O
conidiation O O O O
could O O O O
also O O O O
be O O O O
modified O O O O
by O O O O
the O O O O
abundance O O O O
of O O O O
glucose O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
show O O O O
that O O O O
LreA O O O O
and O O O O
LreB O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
the O O O O
phytochrome O O O O
FphA O O O O
, O O O O
modulate O O O O
not O O O O
only O O O O
the O O O O
synthesis O O O O
of O O O O
sterigmatocystin O O O O
, O O O O
but O O O O
also O O O O
the O O O O
production O O O O
of O O O O
the O O O O
antibiotic O O O O
penicillin O O O O
. O O O O
    
Characterization O O O O
of O O O O
the O O O O
developmental O O O O
regulator O O O O
FlbE O O O O
in O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Several O O O O
upstream O O O O
developmental O O O O
activators O O O O
control O O O O
asexual O O O O
development O O O O
( O O O O
conidiation O O O O
) O O O O
in O O O O
Aspergillus O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
characterize O O O O
one O O O O
of O O O O
such O O O O
activators O O O O
called O O O O
flbE O O O O
in O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
predicted O O O O
FlbE O O O O
protein O O O O
is O O O O
composed O O O O
of O O O O
222 O O O O
and O O O O
201 O O O O
aa O O O O
in O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
While O O O O
flbE O O O O
is O O O O
transiently O O O O
expressed O O O O
during O O O O
early O O O O
phase O O O O
of O O O O
growth O O O O
in O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
it O O O O
is O O O O
somewhat O O O O
constitutively O O O O
expressed O O O O
during O O O O
the O O O O
lifecycle O O O O
of O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
deletion O O O O
of O O O O
flbE O O O O
causes O O O O
reduced O O O O
conidiation O O O O
and O O O O
delayed O O O O
expression O O O O
of O O O O
brlA O O O O
and O O O O
vosA O O O O
in O O O O
both O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Moreover O O O O
, O O O O
FlbE O O O O
is O O O O
necessary O O O O
for O O O O
salt O O O O
- O O O O
induced O O O O
development O O O O
in O O O O
liquid O O O O
submerged O O O O
culture O O O O
in O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
flbE O O O O
 O O O O
mutation O O O O
is O O O O
fully O O O O
complemented O O O O
by O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
flbE O O O O
, O O O O
indicating O O O O
a O O O O
functional O O O O
conservancy O O O O
of O O O O
FlbE O O O O
in O O O O
Aspergillus O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
the O O O O
deletion O O O O
and O O O O
overexpression O O O O
of O O O O
flbE O O O O
in O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
result O O O O
in O O O O
developmental O O O O
defects O O O O
, O O O O
enhanced O O O O
autolysis O O O O
, O O O O
precocious O O O O
cell O O O O
death O O O O
, O O O O
and O O O O
delayed O O O O
expression O O O O
of O O O O
brlA O O O O
/ O O O O
vosA O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
balanced O O O O
activity O O O O
of O O O O
FlbE O O O O
is O O O O
crucial O O O O
for O O O O
proper O O O O
growth O O O O
and O O O O
development O O O O
. O O O O
    
Importantly O O O O
, O O O O
the O O O O
N O O O O
- O O O O
terminal O O O O
portion O O O O
of O O O O
FlbE O O O O
exhibits O O O O
the O O O O
trans O O O O
- O O O O
activation O O O O
ability O O O O
in O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
whereas O O O O
the O O O O
C O O O O
- O O O O
terminal O O O O
half O O O O
negatively O O O O
affects O O O O
its O O O O
activity O O O O
. O O O O
    
Site O O O O
- O O O O
directed O O O O
mutagenesis O O O O
of O O O O
certain O O O O
conserved O O O O
N O O O O
- O O O O
terminal O O O O
amino O O O O
acids O O O O
abolishes O O O O
the O O O O
ability O O O O
of O O O O
trans O O O O
- O O O O
activation O O O O
, O O O O
overexpression O O O O
- O O O O
induced O O O O
autolysis O O O O
, O O O O
and O O O O
complementing O O O O
the O O O O
 O O O O
mutation O O O O
. O O O O
    
Finally O O O O
, O O O O
overexpression O O O O
of O O O O
flbD O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
flbB O O O O
or O O O O
flbC O O O O
, O O O O
restores O O O O
conidiation O O O O
in O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
DeltaflbE O O O O
, O O O O
generally O O O O
supporting O O O O
the O O O O
current O O O O
genetic O O O O
model O O O O
for O O O O
developmental O O O O
regulation O O O O
. O O O O
    
Dinoflagellates O O O O
associated O O O O
with O O O O
freshwater O O O O
sponges O O O O
from O O O O
the O O O O
ancient O O O O
lake O O O O
baikal O O O O
. O O O O
    
Dinoflagellates O O O O
are O O O O
a O O O O
diverse O O O O
group O O O O
of O O O O
protists O O O O
that O O O O
are O O O O
common O O O O
in O O O O
both O O O O
marine O O O O
and O O O O
freshwater O O O O
environments O O O O
. O O O O
    
While O O O O
the O O O O
biology O O O O
of O O O O
marine O O O O
dinoflagellates O O O O
has O O O O
been O O O O
the O O O O
focus O O O O
of O O O O
several O O O O
recent O O O O
studies O O O O
, O O O O
their O O O O
freshwater O O O O
relatives O O O O
remain O O O O
little O O O O
- O O O O
investigated O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
present O O O O
study O O O O
we O O O O
explore O O O O
the O O O O
diversity O O O O
of O O O O
dinoflagellates O O O O
in O O O O
Lake O O O O
Baikal O O O O
by O O O O
identifying O O O O
and O O O O
analyzing O O O O
dinoflagellate O O O O
sequences O O O O
for O O O O
18S O O O O
rDNA O O O O
and O O O O
ITS O O O O
- O O O O
2 O O O O
from O O O O
total O O O O
DNA O O O O
extracted O O O O
from O O O O
three O O O O
species O O O O
of O O O O
endemic O O O O
Baikalian O O O O
sponges O O O O
( O O O O
Baikalospongia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
intermedia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Baikalospongia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
recta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Lubomirskia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
incrustans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
. O O O O
    
Phylogenetic O O O O
analyses O O O O
of O O O O
these O O O O
sequences O O O O
revealed O O O O
extensive O O O O
dinoflagellate O O O O
diversity O O O O
in O O O O
Lake O O O O
Baikal O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
two O O O O
groups O O O O
of O O O O
sequences O O O O
clustering O O O O
within O O O O
the O O O O
order O O O O
Suessiales O O O O
, O O O O
known O O O O
for O O O O
its O O O O
symbiotic O O O O
relationships O O O O
with O O O O
various O O O O
invertebrates O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
they O O O O
may O O O O
be O O O O
regarded O O O O
as O O O O
potential O O O O
symbionts O O O O
of O O O O
Baikalian O O O O
sponges O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
, O O O O
Gyrodinium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
helveticum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
representatives O O O O
from O O O O
the O O O O
genus O O O O
Gymnodinium O O O O
, O O O O
dinoflagellates O O O O
close O O O O
to O O O O
the O O O O
family O O O O
Pfiesteriaceae O O O O
, O O O O
and O O O O
a O O O O
few O O O O
dinoflagellates O O O O
without O O O O
definite O O O O
affiliation O O O O
were O O O O
detected O O O O
. O O O O
    
No O O O O
pronounced O O O O
difference O O O O
in O O O O
the O O O O
distribution O O O O
of O O O O
dinoflagellates O O O O
among O O O O
the O O O O
studied O O O O
sponges O O O O
was O O O O
found O O O O
, O O O O
except O O O O
for O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
the O O O O
Piscinoodinium O O O O
- O O O O
like O O O O
dinoflagellates O O O O
in O O O O
L O O O O
. O O O O
incrustans O O O O
. O O O O
    
To O O O O
the O O O O
best O O O O
of O O O O
our O O O O
knowledge O O O O
, O O O O
this O O O O
is O O O O
the O O O O
first O O O O
study O O O O
of O O O O
the O O O O
diversity O O O O
of O O O O
dinoflagellates O O O O
in O O O O
freshwater O O O O
sponges O O O O
, O O O O
the O O O O
first O O O O
systematic O O O O
investigation O O O O
of O O O O
dinoflagellate O O O O
molecular O O O O
diversity O O O O
in O O O O
Lake O O O O
Baikal O O O O
and O O O O
the O O O O
first O O O O
finding O O O O
of O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
order O O O O
Suessiales O O O O
as O O O O
symbionts O O O O
of O O O O
freshwater O O O O
invertebrates O O O O
. O O O O
    
Transcription O O O O
factors O O O O
BmPOUM2 O O O O
and O O O O
BmBetaFTZ O O O O
- O O O O
F1 O O O O
are O O O O
involved O O O O
in O O O O
regulation O O O O
of O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
the O O O O
wing O O O O
cuticle O O O O
protein O O O O
gene O O O O
BmWCP4 O O O O
in O O O O
the O O O O
silkworm B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
Bombyx B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mori O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
In O O O O
Bombyx B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mori O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
the O O O O
wing O O O O
cuticle O O O O
protein O O O O
gene O O O O
BmWCP4 O O O O
is O O O O
expressed O O O O
specifically O O O O
in O O O O
the O O O O
epidermis O O O O
at O O O O
the O O O O
onset O O O O
and O O O O
mid O O O O
- O O O O
stage O O O O
of O O O O
pupation O O O O
and O O O O
is O O O O
responsible O O O O
for O O O O
the O O O O
formation O O O O
of O O O O
the O O O O
pupal O O O O
cuticle O O O O
during O O O O
the O O O O
larval O O O O
- O O O O
pupal O O O O
metamorphosis O O O O
. O O O O
    
The O O O O
gene O O O O
consists O O O O
of O O O O
four O O O O
exons O O O O
and O O O O
three O O O O
introns O O O O
and O O O O
is O O O O
present O O O O
as O O O O
a O O O O
single O O O O
copy O O O O
in O O O O
the O O O O
genome O O O O
. O O O O
    
Its O O O O
expression O O O O
was O O O O
up O O O O
- O O O O
regulated O O O O
by O O O O
20 O O O O
- O O O O
hydroxyecdysone O O O O
( O O O O
20E O O O O
) O O O O
and O O O O
the O O O O
20E O O O O
- O O O O
induced O O O O
expression O O O O
was O O O O
suppressed O O O O
by O O O O
juvenile O O O O
hormone O O O O
( O O O O
JH O O O O
) O O O O
III O O O O
. O O O O
    
The O O O O
upstream O O O O
regulatory O O O O
sequence O O O O
region O O O O
of O O O O
the O O O O
BmWCP4 O O O O
gene O O O O
was O O O O
cloned O O O O
and O O O O
the O O O O
regulatory O O O O
elements O O O O
responsible O O O O
for O O O O
20E O O O O
induction O O O O
were O O O O
identified O O O O
. O O O O
    
Two O O O O
cis O O O O
- O O O O
regulatory O O O O
elements O O O O
( O O O O
CREs O O O O
) O O O O
bound O O O O
by O O O O
the O O O O
transcription O O O O
factors O O O O
BmPOUM2 O O O O
and O O O O
BmBetaFTZ O O O O
- O O O O
F1 O O O O
were O O O O
identified O O O O
that O O O O
mediated O O O O
20E O O O O
- O O O O
regulated O O O O
expression O O O O
of O O O O
this O O O O
gene O O O O
. O O O O
    
An O O O O
electrophoretic O O O O
mobility O O O O
shift O O O O
assay O O O O
detected O O O O
two O O O O
nuclear O O O O
proteins O O O O
isolated O O O O
from O O O O
the O O O O
epidermis O O O O
and O O O O
the O O O O
BmN O O O O
cell O O O O
line O O O O
that O O O O
specifically O O O O
bound O O O O
to O O O O
the O O O O
POU O O O O
and O O O O
BetaFTZ O O O O
- O O O O
F1 O O O O
CREs O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
BmPOUM2 O O O O
recombinant O O O O
protein O O O O
explicitly O O O O
bound O O O O
to O O O O
the O O O O
POU O O O O
CRE O O O O
. O O O O
    
Developmental O O O O
and O O O O
20E O O O O
- O O O O
induced O O O O
expression O O O O
of O O O O
the O O O O
BmWCP4 O O O O
, O O O O
BmPOUM2 O O O O
and O O O O
BmBetaFTZ O O O O
- O O O O
F1 O O O O
genes O O O O
showed O O O O
that O O O O
BmPOUM2 O O O O
and O O O O
BmBetaFTZ O O O O
- O O O O
F1 O O O O
were O O O O
initially O O O O
expressed O O O O
, O O O O
followed O O O O
by O O O O
BmWCP4 O O O O
. O O O O
    
These O O O O
data O O O O
suggest O O O O
that O O O O
the O O O O
20E O O O O
- O O O O
induced O O O O
expression O O O O
of O O O O
BmWCP4 O O O O
is O O O O
mediated O O O O
by O O O O
the O O O O
transcription O O O O
factors O O O O
BmPOUM2 O O O O
and O O O O
BmBetaFTZ O O O O
- O O O O
F1 O O O O
binding O O O O
to O O O O
their O O O O
CREs O O O O
in O O O O
the O O O O
regulatory O O O O
sequence O O O O
region O O O O
of O O O O
the O O O O
BmWCP4 O O O O
gene O O O O
. O O O O
    
Drought O O O O
limitation O O O O
of O O O O
photosynthesis O O O O
differs O O O O
between O O O O
C3and O O O O
C4grass O O O O
species O O O O
in O O O O
a O O O O
comparative O O O O
experiment O O O O
. O O O O
    
Phylogenetic O O O O
analyses O O O O
show O O O O
that O O O O
C4 O O O O
grasses O O O O
typically O O O O
occupy O O O O
drier O O O O
habitats O O O O
than O O O O
their O O O O
C3 O O O O
relatives O O O O
, O O O O
but O O O O
recent O O O O
experiments O O O O
comparing O O O O
the O O O O
physiology O O O O
of O O O O
closely O O O O
related O O O O
C3 O O O O
and O O O O
C4 O O O O
species O O O O
have O O O O
shown O O O O
that O O O O
advantages O O O O
of O O O O
C4 O O O O
photosynthesis O O O O
can O O O O
be O O O O
lost O O O O
under O O O O
drought O O O O
. O O O O
    
We O O O O
tested O O O O
the O O O O
generality O O O O
of O O O O
these O O O O
paradoxical O O O O
findings O O O O
in O O O O
grass O O O O
species O O O O
representing O O O O
the O O O O
known O O O O
evolutionary O O O O
diversity O O O O
of O O O O
C4 O O O O
NADP O O O O
- O O O O
me O O O O
and O O O O
C3 O O O O
photosynthetic O O O O
types O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
experiment O O O O
investigated O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
drought O O O O
on O O O O
leaf O O O O
photosynthesis O O O O
, O O O O
water O O O O
potential O O O O
, O O O O
nitrogen O O O O
, O O O O
chlorophyll O O O O
content O O O O
and O O O O
mortality O O O O
. O O O O
    
C4 O O O O
grasses O O O O
in O O O O
control O O O O
treatments O O O O
were O O O O
characterized O O O O
by O O O O
higher O O O O
CO2 O O O O
assimilation O O O O
rates O O O O
and O O O O
water O O O O
potential O O O O
, O O O O
but O O O O
lower O O O O
stomatal O O O O
conductance O O O O
and O O O O
nitrogen O O O O
content O O O O
. O O O O
    
Under O O O O
drought O O O O
, O O O O
stomatal O O O O
conductance O O O O
declined O O O O
more O O O O
dramatically O O O O
in O O O O
C3 O O O O
than O O O O
C4 O O O O
species O O O O
, O O O O
and O O O O
photosynthetic O O O O
water O O O O
- O O O O
use O O O O
and O O O O
nitrogen O O O O
- O O O O
use O O O O
efficiency O O O O
advantages O O O O
held O O O O
by O O O O
C4 O O O O
species O O O O
under O O O O
control O O O O
conditions O O O O
were O O O O
each O O O O
diminished O O O O
by O O O O
40 O O O O
% O O O O
. O O O O
    
Leaf O O O O
mortality O O O O
was O O O O
slightly O O O O
higher O O O O
in O O O O
C4 O O O O
than O O O O
C3 O O O O
grasses O O O O
, O O O O
but O O O O
leaf O O O O
condition O O O O
under O O O O
drought O O O O
otherwise O O O O
showed O O O O
no O O O O
dependence O O O O
on O O O O
photosynthetic O O O O
- O O O O
type O O O O
. O O O O
    
This O O O O
phylogenetically O O O O
controlled O O O O
experiment O O O O
suggested O O O O
that O O O O
a O O O O
drought O O O O
- O O O O
induced O O O O
reduction O O O O
in O O O O
the O O O O
photosynthetic O O O O
performance O O O O
advantages O O O O
of O O O O
C4 O O O O
NADP O O O O
- O O O O
me O O O O
relative O O O O
to O O O O
C3 O O O O
grasses O O O O
is O O O O
a O O O O
general O O O O
phenomenon O O O O
. O O O O
    
OsRAN2 O O O O
, O O O O
essential O O O O
for O O O O
mitosis O O O O
, O O O O
enhances O O O O
cold O O O O
tolerance O O O O
in O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
by O O O O
promoting O O O O
export O O O O
of O O O O
intranuclear O O O O
tubulin O O O O
and O O O O
maintaining O O O O
cell O O O O
division O O O O
under O O O O
cold O O O O
stress O O O O
. O O O O
    
With O O O O
global O O O O
climate O O O O
change O O O O
, O O O O
abnormally O O O O
low O O O O
temperatures O O O O
have O O O O
affected O O O O
the O O O O
world O O O O
' O O O O
s O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
production O O O O
. O O O O
    
Many O O O O
genes O O O O
have O O O O
been O O O O
shown O O O O
to O O O O
be O O O O
essential O O O O
for O O O O
molecular O O O O
improvement O O O O
of O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cold O O O O
- O O O O
tolerance O O O O
traits O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
less O O O O
is O O O O
known O O O O
about O O O O
the O O O O
molecular O O O O
cellular O O O O
mechanism O O O O
of O O O O
their O O O O
response O O O O
to O O O O
cold O O O O
stress O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
investigated O O O O
OsRAN2 O O O O
involved O O O O
in O O O O
regulation O O O O
of O O O O
cell O O O O
division O O O O
during O O O O
cold O O O O
stress O O O O
in O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Expression O O O O
of O O O O
OsRAN2 O O O O
was O O O O
increased O O O O
under O O O O
cold O O O O
treatment O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
during O O O O
salt O O O O
and O O O O
drought O O O O
stress O O O O
. O O O O
    
The O O O O
mean O O O O
root O O O O
mitotic O O O O
index O O O O
was O O O O
closely O O O O
related O O O O
to O O O O
the O O O O
expression O O O O
level O O O O
of O O O O
OsRAN2 O O O O
. O O O O
    
Knockdown O O O O
transgenic O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
lines O O O O
showed O O O O
an O O O O
aberrant O O O O
organization O O O O
of O O O O
spindles O O O O
during O O O O
mitosis O O O O
and O O O O
stunted O O O O
growth O O O O
during O O O O
development O O O O
. O O O O
    
Overexpression O O O O
of O O O O
OsRAN2 O O O O
enhanced O O O O
cold O O O O
tolerance O O O O
in O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
transgenic O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
overexpressing O O O O
OsRAN2 O O O O
showed O O O O
maintained O O O O
cell O O O O
division O O O O
, O O O O
decreased O O O O
proportion O O O O
of O O O O
cells O O O O
with O O O O
intranuclear O O O O
tubulin O O O O
and O O O O
formation O O O O
of O O O O
a O O O O
normal O O O O
nuclear O O O O
envelope O O O O
under O O O O
the O O O O
cold O O O O
condition O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
study O O O O
suggests O O O O
a O O O O
mechanism O O O O
for O O O O
OsRAN2 O O O O
in O O O O
regulating O O O O
cold O O O O
resistance O O O O
in O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
by O O O O
maintaining O O O O
cell O O O O
division O O O O
through O O O O
promoting O O O O
the O O O O
normal O O O O
export O O O O
of O O O O
intranuclear O O O O
tubulin O O O O
at O O O O
the O O O O
end O O O O
of O O O O
mitosis O O O O
. O O O O
    
This O O O O
insight O O O O
could O O O O
help O O O O
improve O O O O
the O O O O
cold O O O O
- O O O O
tolerance O O O O
trait O O O O
in O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Drought O O O O
increases O O O O
freezing O O O O
tolerance O O O O
of O O O O
both O O O O
leaves O O O O
and O O O O
xylem O O O O
of O O O O
Larrea B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tridentata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Drought O O O O
and O O O O
freezing O O O O
are O O O O
both O O O O
known O O O O
to O O O O
limit O O O O
desert O O O O
plant O O O O
distributions O O O O
, O O O O
but O O O O
the O O O O
interaction O O O O
of O O O O
these O O O O
stressors O O O O
is O O O O
poorly O O O O
understood O O O O
. O O O O
    
Drought O O O O
may O O O O
increase O O O O
freezing O O O O
tolerance O O O O
in O O O O
leaves O O O O
while O O O O
decreasing O O O O
it O O O O
in O O O O
the O O O O
xylem O O O O
, O O O O
potentially O O O O
creating O O O O
a O O O O
mismatch O O O O
between O O O O
water O O O O
supply O O O O
and O O O O
demand O O O O
. O O O O
    
To O O O O
test O O O O
this O O O O
hypothesis O O O O
, O O O O
we O O O O
subjected O O O O
Larrea B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tridentata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
juveniles O O O O
grown O O O O
in O O O O
a O O O O
greenhouse O O O O
under O O O O
well O O O O
- O O O O
watered O O O O
or O O O O
drought O O O O
conditions O O O O
to O O O O
minimum O O O O
temperatures O O O O
ranging O O O O
from O O O O
- O O O O
8 O O O O
to O O O O
- O O O O
24 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
. O O O O
    
We O O O O
measured O O O O
survival O O O O
, O O O O
leaf O O O O
retention O O O O
, O O O O
gas O O O O
exchange O O O O
, O O O O
cell O O O O
death O O O O
, O O O O
freezing O O O O
point O O O O
depression O O O O
and O O O O
leaf O O O O
- O O O O
specific O O O O
xylem O O O O
hydraulic O O O O
conductance O O O O
( O O O O
k1 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Drought O O O O
- O O O O
exposed O O O O
plants O O O O
exhibited O O O O
smaller O O O O
decreases O O O O
in O O O O
gas O O O O
exchange O O O O
after O O O O
exposure O O O O
to O O O O
- O O O O
8 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
compared O O O O
to O O O O
well O O O O
- O O O O
watered O O O O
plants O O O O
. O O O O
    
Drought O O O O
also O O O O
conferred O O O O
a O O O O
significant O O O O
positive O O O O
effect O O O O
on O O O O
leaf O O O O
, O O O O
xylem O O O O
and O O O O
whole O O O O
- O O O O
plant O O O O
function O O O O
following O O O O
exposure O O O O
to O O O O
- O O O O
15 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
; O O O O
drought O O O O
- O O O O
exposed O O O O
plants O O O O
exhibited O O O O
less O O O O
cell O O O O
death O O O O
, O O O O
greater O O O O
leaf O O O O
retention O O O O
, O O O O
higher O O O O
k1 O O O O
and O O O O
higher O O O O
rates O O O O
of O O O O
gas O O O O
exchange O O O O
than O O O O
well O O O O
- O O O O
watered O O O O
plants O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
drought O O O O
- O O O O
exposed O O O O
and O O O O
well O O O O
- O O O O
watered O O O O
plants O O O O
experienced O O O O
100 O O O O
% O O O O
mortality O O O O
following O O O O
exposure O O O O
to O O O O
- O O O O
24 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
. O O O O
    
By O O O O
documenting O O O O
the O O O O
combined O O O O
effects O O O O
of O O O O
drought O O O O
and O O O O
freezing O O O O
stress O O O O
, O O O O
our O O O O
data O O O O
provide O O O O
insight O O O O
into O O O O
the O O O O
mechanisms O O O O
determining O O O O
plant O O O O
survival O O O O
and O O O O
performance O O O O
following O O O O
freezing O O O O
and O O O O
the O O O O
potential O O O O
for O O O O
shifts O O O O
in O O O O
L B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tridentata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
abundance O O O O
and O O O O
range O O O O
in O O O O
the O O O O
face O O O O
of O O O O
changing O O O O
temperature O O O O
and O O O O
precipitation O O O O
regimes O O O O
. O O O O
    
Nitrogen O O O O
source O O O O
interacts O O O O
with O O O O
ROP O O O O
signalling O O O O
in O O O O
root O O O O
hair O O O O
tip O O O O
- O O O O
growth O O O O
. O O O O
    
Root O O O O
hairs O O O O
elongate O O O O
in O O O O
a O O O O
highly O O O O
polarized O O O O
manner O O O O
known O O O O
as O O O O
tip O O O O
growth O O O O
. O O O O
    
Overexpression O O O O
of O O O O
constitutively O O O O
active O O O O
Rho O O O O
of O O O O
Plant O O O O
( O O O O
ROP O O O O
) O O O O
/ O O O O
RAC O O O O
GTPases O O O O
mutants O O O O
induces O O O O
swelling O O O O
of O O O O
root O O O O
hairs O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
Atrop11 O O O O
( O O O O
CA O O O O
) O O O O
- O O O O
induced O O O O
swelling O O O O
of O O O O
root O O O O
hairs O O O O
depends O O O O
on O O O O
the O O O O
composition O O O O
of O O O O
the O O O O
growth O O O O
medium O O O O
. O O O O
    
Depletion O O O O
of O O O O
ammonium O O O O
allowed O O O O
normal O O O O
root O O O O
hair O O O O
elongation O O O O
in O O O O
Atrop11 O O O O
( O O O O
CA O O O O
) O O O O
plants O O O O
, O O O O
induced O O O O
the O O O O
development O O O O
of O O O O
longer O O O O
root O O O O
hairs O O O O
in O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
plants O O O O
and O O O O
suppressed O O O O
the O O O O
effect O O O O
of O O O O
Atrop11 O O O O
( O O O O
CA O O O O
) O O O O
expression O O O O
on O O O O
actin O O O O
organization O O O O
and O O O O
reactive O O O O
oxygen O O O O
species O O O O
distribution O O O O
, O O O O
whereas O O O O
membrane O O O O
localization O O O O
of O O O O
the O O O O
protein O O O O
was O O O O
not O O O O
affected O O O O
. O O O O
    
Ammonium O O O O
at O O O O
concentrations O O O O
higher O O O O
than O O O O
1 O O O O
mM O O O O
and O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
nitrate O O O O
were O O O O
required O O O O
for O O O O
induction O O O O
of O O O O
swelling O O O O
. O O O O
    
Oscillations O O O O
in O O O O
wall O O O O
and O O O O
cytoplasmic O O O O
pH O O O O
are O O O O
known O O O O
to O O O O
accompany O O O O
tip O O O O
growth O O O O
in O O O O
root O O O O
hairs O O O O
, O O O O
and O O O O
buffering O O O O
of O O O O
the O O O O
growth O O O O
medium O O O O
decreased O O O O
Atrop11 O O O O
( O O O O
CA O O O O
) O O O O
- O O O O
induced O O O O
swelling O O O O
. O O O O
    
Fluorescence O O O O
ratio O O O O
imaging O O O O
experiments O O O O
revealed O O O O
that O O O O
in O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
root O O O O
hairs O O O O
, O O O O
the O O O O
addition O O O O
of O O O O
NH4NO3 O O O O
to O O O O
the O O O O
growth O O O O
medium O O O O
induced O O O O
an O O O O
increase O O O O
in O O O O
the O O O O
amplitude O O O O
of O O O O
extracellular O O O O
and O O O O
intracellular O O O O
pH O O O O
oscillations O O O O
and O O O O
an O O O O
overall O O O O
decrease O O O O
in O O O O
cytoplasmic O O O O
pH O O O O
at O O O O
the O O O O
cell O O O O
apex O O O O
. O O O O
    
Based O O O O
on O O O O
these O O O O
results O O O O
, O O O O
we O O O O
suggest O O O O
a O O O O
model O O O O
in O O O O
which O O O O
ROP O O O O
GTPases O O O O
and O O O O
nitrogen O O O O
- O O O O
dependent O O O O
pH O O O O
oscillations O O O O
function O O O O
in O O O O
parallel O O O O
pathways O O O O
, O O O O
creating O O O O
a O O O O
positive O O O O
feedback O O O O
loop O O O O
during O O O O
root O O O O
hair O O O O
growth O O O O
. O O O O
    
Green O O O O
- O O O O
colored O O O O
plastids O O O O
in O O O O
the O O O O
dinoflagellate O O O O
genus O O O O
Lepidodinium O O O O
are O O O O
of O O O O
core O O O O
chlorophyte O O O O
origin O O O O
. O O O O
    
Most O O O O
photosynthetic O O O O
dinoflagellates O O O O
possess O O O O
plastids O O O O
containing O O O O
chlorophyllsa O O O O
+ O O O O
c O O O O
, O O O O
but O O O O
species O O O O
belonging O O O O
to O O O O
the O O O O
genus O O O O
Lepidodinium O O O O
are O O O O
unique O O O O
in O O O O
bearing O O O O
non O O O O
- O O O O
canonical O O O O
plastids O O O O
containing O O O O
chlorophyllsa O O O O
+ O O O O
b O O O O
. O O O O
    
According O O O O
to O O O O
the O O O O
pioneering O O O O
works O O O O
on O O O O
pigment O O O O
composition O O O O
data O O O O
, O O O O
it O O O O
has O O O O
been O O O O
proposed O O O O
that O O O O
Lepidodinium O O O O
plastids O O O O
were O O O O
derived O O O O
from O O O O
a O O O O
prasinophyte O O O O
species O O O O
, O O O O
though O O O O
this O O O O
hypothesis O O O O
was O O O O
not O O O O
supported O O O O
by O O O O
a O O O O
recent O O O O
phylogenetic O O O O
analysis O O O O
based O O O O
on O O O O
an O O O O
alignment O O O O
comprised O O O O
of O O O O
eight O O O O
plastid O O O O
proteins O O O O
( O O O O
Takishita O O O O
et O O O O
al O O O O
. O O O O
2008 O O O O
, O O O O
Gene O O O O
410 O O O O
: O O O O
26 O O O O
- O O O O
26 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
This O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
8 O O O O
- O O O O
protein O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
analysis O O O O
however O O O O
was O O O O
insufficient O O O O
to O O O O
clarify O O O O
the O O O O
origin O O O O
of O O O O
Lepidodinium O O O O
plastids O O O O
for O O O O
two O O O O
major O O O O
reasons O O O O
: O O O O
First O O O O
, O O O O
the O O O O
alignment O O O O
lacked O O O O
sufficient O O O O
evolutionary O O O O
information O O O O
to O O O O
resolve O O O O
the O O O O
precise O O O O
origin O O O O
of O O O O
Lepidodinium O O O O
plastids O O O O
. O O O O
    
Second O O O O
, O O O O
the O O O O
taxa O O O O
considered O O O O
did O O O O
not O O O O
well O O O O
represent O O O O
the O O O O
diversity O O O O
of O O O O
Chlorophyta O O O O
. O O O O
    
Particularly O O O O
, O O O O
prasinophytes O O O O
were O O O O
poorly O O O O
sampled O O O O
in O O O O
the O O O O
alignment O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
sequenced O O O O
plastid O O O O
- O O O O
encoded O O O O
genes O O O O
from O O O O
L B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
chlorophorum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
one O O O O
pedinophyte O O O O
species O O O O
, O O O O
one O O O O
ulvophyte O O O O
species O O O O
, O O O O
and O O O O
six O O O O
prasinophyte O O O O
species O O O O
. O O O O
    
The O O O O
85 O O O O
sequences O O O O
newly O O O O
determined O O O O
in O O O O
this O O O O
study O O O O
and O O O O
recent O O O O
progress O O O O
in O O O O
plastid O O O O
genome O O O O
sequencing O O O O
enabled O O O O
us O O O O
to O O O O
prepare O O O O
an O O O O
alignment O O O O
comprised O O O O
of O O O O
11 O O O O
plastid O O O O
proteins O O O O
from O O O O
green O O O O
algal O O O O
taxa O O O O
that O O O O
appropriately O O O O
cover O O O O
the O O O O
diversity O O O O
of O O O O
Chlorophyta O O O O
. O O O O
    
All O O O O
the O O O O
analyses O O O O
of O O O O
the O O O O
11 O O O O
- O O O O
protein O O O O
data O O O O
set O O O O
robustly O O O O
grouped O O O O
L B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
chlorophorum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
with O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
core O O O O
chlorophytes O O O O
. O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
Thus O O O O
, O O O O
we O O O O
here O O O O
propose O O O O
that O O O O
Lepidodinium O O O O
plastids O O O O
are O O O O
of O O O O
core O O O O
chlorophyte O O O O
origin O O O O
. O O O O
    
Floret O O O O
initiation O O O O
, O O O O
tissue O O O O
expansion O O O O
and O O O O
carbon O O O O
availability O O O O
at O O O O
the O O O O
meristem O O O O
of O O O O
the O O O O
sunflower B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
capitulum O O O O
as O O O O
affected O O O O
by O O O O
water O O O O
or O O O O
light O O O O
deficits O O O O
. O O O O
    
* O O O O
The O O O O
co O O O O
- O O O O
ordination O O O O
between O O O O
floret O O O O
initiation O O O O
and O O O O
meristem O O O O
expansion O O O O
, O O O O
and O O O O
their O O O O
relationships O O O O
with O O O O
carbon O O O O
availability O O O O
, O O O O
were O O O O
studied O O O O
and O O O O
quantified O O O O
in O O O O
sunflower B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
Helianthus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
annuus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
plants O O O O
subjected O O O O
to O O O O
light O O O O
or O O O O
water O O O O
shortages O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Meristem O O O O
size O O O O
, O O O O
number O O O O
of O O O O
floret O O O O
primordia O O O O
, O O O O
primordium O O O O
size O O O O
, O O O O
rate O O O O
of O O O O
plant O O O O
biomass O O O O
accumulation O O O O
, O O O O
leaf O O O O
area O O O O
, O O O O
photosynthetic O O O O
rate O O O O
, O O O O
and O O O O
soluble O O O O
sugar O O O O
content O O O O
in O O O O
the O O O O
capitulum O O O O
were O O O O
measured O O O O
until O O O O
completion O O O O
of O O O O
floret O O O O
initiation O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Although O O O O
treatments O O O O
differentially O O O O
affected O O O O
tissue O O O O
expansion O O O O
and O O O O
biomass O O O O
acquisition O O O O
, O O O O
a O O O O
common O O O O
relationship O O O O
between O O O O
the O O O O
final O O O O
number O O O O
of O O O O
florets O O O O
and O O O O
the O O O O
rate O O O O
and O O O O
duration O O O O
of O O O O
meristem O O O O
expansion O O O O
was O O O O
conserved O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
water O O O O
deficit O O O O
, O O O O
changes O O O O
in O O O O
relative O O O O
expansion O O O O
rate O O O O
in O O O O
the O O O O
meristem O O O O
paralleled O O O O
changes O O O O
in O O O O
soluble O O O O
sugar O O O O
content O O O O
. O O O O
    
Water O O O O
deficit O O O O
reduced O O O O
tissue O O O O
expansion O O O O
both O O O O
in O O O O
leaves O O O O
and O O O O
in O O O O
the O O O O
capitulum O O O O
, O O O O
and O O O O
induced O O O O
the O O O O
accumulation O O O O
of O O O O
soluble O O O O
sugars O O O O
in O O O O
the O O O O
meristem O O O O
. O O O O
    
Use O O O O
of O O O O
these O O O O
sugars O O O O
at O O O O
re O O O O
- O O O O
watering O O O O
was O O O O
associated O O O O
with O O O O
increased O O O O
meristem O O O O
growth O O O O
and O O O O
higher O O O O
floret O O O O
numbers O O O O
compared O O O O
with O O O O
control O O O O
plants O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Floret O O O O
initiation O O O O
and O O O O
meristem O O O O
tissue O O O O
expansion O O O O
remained O O O O
strongly O O O O
co O O O O
- O O O O
ordinated O O O O
under O O O O
all O O O O
studied O O O O
circumstances O O O O
, O O O O
and O O O O
both O O O O
depended O O O O
on O O O O
local O O O O
carbon O O O O
availability O O O O
when O O O O
water O O O O
supply O O O O
was O O O O
unlimited O O O O
. O O O O
    
Transient O O O O
water O O O O
deficits O O O O
favoured O O O O
reproductive O O O O
meristem O O O O
growth O O O O
and O O O O
floret O O O O
production O O O O
. O O O O
    
Equations O O O O
accounting O O O O
for O O O O
these O O O O
results O O O O
constitute O O O O
a O O O O
framework O O O O
for O O O O
phenotyping O O O O
the O O O O
response O O O O
to O O O O
drought O O O O
. O O O O
    
A O O O O
hydraulic O O O O
explanation O O O O
for O O O O
size O O O O
- O O O O
specific O O O O
plant O O O O
shrinkage O O O O
: O O O O
developmental O O O O
hydraulic O O O O
sectoriality O O O O
. O O O O
    
* O O O O
While O O O O
great O O O O
attention O O O O
has O O O O
been O O O O
paid O O O O
to O O O O
the O O O O
mechanisms O O O O
controlling O O O O
plant O O O O
growth O O O O
, O O O O
much O O O O
less O O O O
is O O O O
known O O O O
about O O O O
why O O O O
and O O O O
how O O O O
plants O O O O
shrink O O O O
. O O O O
    
The O O O O
modular O O O O
design O O O O
of O O O O
plants O O O O
may O O O O
facilitate O O O O
the O O O O
independence O O O O
of O O O O
modules O O O O
if O O O O
the O O O O
xylem O O O O
vasculature O O O O
is O O O O
hydraulically O O O O
sectored O O O O
. O O O O
    
We O O O O
examined O O O O
the O O O O
hydraulic O O O O
connectivity O O O O
of O O O O
modules O O O O
comprising O O O O
juveniles O O O O
and O O O O
adults O O O O
of O O O O
the O O O O
aridland O O O O
chamaephyte O O O O
Cryptantha O O O O
flava O O O O
( O O O O
Boraginaceae O O O O
) O O O O
, O O O O
motivated O O O O
by O O O O
the O O O O
observation O O O O
that O O O O
rosette O O O O
mortality O O O O
is O O O O
spatially O O O O
aggregated O O O O
in O O O O
adults O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
in O O O O
juveniles O O O O
. O O O O
    
* O O O O
We O O O O
explored O O O O
spatial O O O O
patterns O O O O
of O O O O
leaf O O O O
wilting O O O O
after O O O O
clipping O O O O
a O O O O
single O O O O
lateral O O O O
root O O O O
, O O O O
tracked O O O O
physiological O O O O
dyes O O O O
taken O O O O
up O O O O
by O O O O
a O O O O
single O O O O
root O O O O
, O O O O
and O O O O
measured O O O O
within O O O O
- O O O O
plant O O O O
variation O O O O
in O O O O
leaf O O O O
water O O O O
potentials O O O O
after O O O O
watering O O O O
a O O O O
portion O O O O
of O O O O
the O O O O
root O O O O
system O O O O
. O O O O
    
We O O O O
then O O O O
measured O O O O
xylem O O O O
anatomical O O O O
features O O O O
related O O O O
to O O O O
hydraulic O O O O
connectivity O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Our O O O O
approaches O O O O
revealed O O O O
hydraulic O O O O
integration O O O O
in O O O O
juveniles O O O O
but O O O O
hydraulic O O O O
sectoriality O O O O
in O O O O
adults O O O O
. O O O O
    
We O O O O
attribute O O O O
such O O O O
developmental O O O O
changes O O O O
to O O O O
increasing O O O O
distances O O O O
between O O O O
xylem O O O O
bundles O O O O
, O O O O
and O O O O
larger O O O O
xylem O O O O
lumen O O O O
and O O O O
heartwood O O O O
areas O O O O
as O O O O
plants O O O O
age O O O O
. O O O O
    
* O O O O
We O O O O
have O O O O
demonstrated O O O O
functional O O O O
sectoriality O O O O
in O O O O
a O O O O
desert O O O O
chamaephyte O O O O
, O O O O
and O O O O
report O O O O
the O O O O
mechanism O O O O
by O O O O
which O O O O
sectoriality O O O O
occurs O O O O
, O O O O
offering O O O O
a O O O O
hydraulic O O O O
explanation O O O O
for O O O O
the O O O O
death O O O O
of O O O O
whole O O O O
plant O O O O
portions O O O O
resulting O O O O
in O O O O
shrinkage O O O O
of O O O O
large O O O O
plants O O O O
, O O O O
and O O O O
for O O O O
the O O O O
high O O O O
occurrence O O O O
of O O O O
this O O O O
design O O O O
in O O O O
deserts O O O O
. O O O O
    
Bird O O O O
community O O O O
specialization O O O O
, O O O O
bird O O O O
conservation O O O O
and O O O O
disturbance O O O O
: O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
wildfires O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
niche O O O O
theory O O O O
predicts O O O O
that O O O O
disturbance O O O O
should O O O O
favour O O O O
generalist O O O O
species O O O O
, O O O O
the O O O O
community O O O O
- O O O O
level O O O O
implications O O O O
of O O O O
this O O O O
pattern O O O O
have O O O O
been O O O O
sparsely O O O O
analysed O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
test O O O O
the O O O O
hypothesis O O O O
that O O O O
disturbance O O O O
favours O O O O
generalist O O O O
species O O O O
within O O O O
communities O O O O
, O O O O
analysing O O O O
effects O O O O
of O O O O
wildfires O O O O
in O O O O
bird O O O O
communities O O O O
in O O O O
a O O O O
Mediterranean O O O O
climate O O O O
area O O O O
as O O O O
a O O O O
case O O O O
study O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
use O O O O
bird O O O O
occurrence O O O O
data O O O O
in O O O O
more O O O O
than O O O O
500 O O O O
1 O O O O
x O O O O
1 O O O O
km O O O O
squares O O O O
forming O O O O
a O O O O
gradient O O O O
running O O O O
from O O O O
forest O O O O
to O O O O
completely O O O O
burnt O O O O
areas O O O O
. O O O O
    
The O O O O
level O O O O
of O O O O
specialization O O O O
of O O O O
bird O O O O
communities O O O O
was O O O O
estimated O O O O
by O O O O
means O O O O
of O O O O
three O O O O
complementary O O O O
species O O O O
specialization O O O O
indices O O O O
, O O O O
calculated O O O O
for O O O O
different O O O O
landscape O O O O
gradients O O O O
and O O O O
averaged O O O O
at O O O O
the O O O O
community O O O O
level O O O O
( O O O O
i O O O O
. O O O O
e O O O O
. O O O O
1 O O O O
x O O O O
1 O O O O
km O O O O
squares O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
mean O O O O
species O O O O
rarity O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
calculated O O O O
mean O O O O
habitat O O O O
preferences O O O O
along O O O O
landscape O O O O
gradients O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
an O O O O
index O O O O
of O O O O
conservation O O O O
value O O O O
and O O O O
total O O O O
species O O O O
richness O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Different O O O O
estimators O O O O
of O O O O
bird O O O O
community O O O O
specialization O O O O
varied O O O O
in O O O O
contrasting O O O O
fashion O O O O
along O O O O
the O O O O
wildfire O O O O
disturbance O O O O
gradient O O O O
, O O O O
and O O O O
thus O O O O
we O O O O
conclude O O O O
that O O O O
it O O O O
is O O O O
not O O O O
justified O O O O
to O O O O
expect O O O O
unique O O O O
community O O O O
responses O O O O
to O O O O
the O O O O
sharp O O O O
variations O O O O
in O O O O
habitat O O O O
characteristics O O O O
brought O O O O
by O O O O
wildfire O O O O
disturbances O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Burnt O O O O
areas O O O O
tended O O O O
to O O O O
have O O O O
rarer O O O O
and O O O O
urban O O O O
- O O O O
avoider O O O O
bird O O O O
species O O O O
, O O O O
whereas O O O O
unburnt O O O O
forests O O O O
tended O O O O
to O O O O
have O O O O
larger O O O O
proportions O O O O
of O O O O
forest O O O O
specialist O O O O
species O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
mean O O O O
conservation O O O O
value O O O O
of O O O O
communities O O O O
clearly O O O O
increased O O O O
towards O O O O
the O O O O
burnt O O O O
extreme O O O O
of O O O O
the O O O O
wildfire O O O O
disturbance O O O O
gradient O O O O
, O O O O
while O O O O
this O O O O
had O O O O
a O O O O
negligible O O O O
effect O O O O
on O O O O
species O O O O
richness O O O O
. O O O O
    
7 O O O O
. O O O O
    
Wildfires O O O O
seem O O O O
to O O O O
play O O O O
an O O O O
important O O O O
role O O O O
for O O O O
the O O O O
maintenance O O O O
of O O O O
open O O O O
- O O O O
habitat O O O O
, O O O O
urban O O O O
- O O O O
avoider O O O O
bird O O O O
populations O O O O
in O O O O
Mediterranean O O O O
landscapes O O O O
and O O O O
also O O O O
to O O O O
benefit O O O O
a O O O O
set O O O O
of O O O O
bird O O O O
species O O O O
of O O O O
unfavourable O O O O
European O O O O
conservation O O O O
status O O O O
. O O O O
    
8 O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
context O O O O
, O O O O
it O O O O
cannot O O O O
be O O O O
unambiguously O O O O
concluded O O O O
that O O O O
fire O O O O
disturbance O O O O
, O O O O
even O O O O
in O O O O
a O O O O
context O O O O
in O O O O
which O O O O
fires O O O O
are O O O O
greatly O O O O
favoured O O O O
by O O O O
human O O O O
- O O O O
related O O O O
activities O O O O
, O O O O
leads O O O O
to O O O O
more O O O O
functionally O O O O
simplified O O O O
communities O O O O
dominated O O O O
by O O O O
generalist O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Contrasting O O O O
patterns O O O O
of O O O O
individual O O O O
specialization O O O O
and O O O O
trophic O O O O
coupling O O O O
in O O O O
two O O O O
marine O O O O
apex O O O O
predators O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Apex O O O O
predators O O O O
are O O O O
often O O O O
assumed O O O O
to O O O O
be O O O O
dietary O O O O
generalists O O O O
and O O O O
, O O O O
by O O O O
feeding O O O O
on O O O O
prey O O O O
from O O O O
multiple O O O O
basal O O O O
nutrient O O O O
sources O O O O
, O O O O
serve O O O O
to O O O O
couple O O O O
discrete O O O O
food O O O O
webs O O O O
. O O O O
    
But O O O O
there O O O O
is O O O O
increasing O O O O
evidence O O O O
that O O O O
individual O O O O
level O O O O
dietary O O O O
specialization O O O O
may O O O O
be O O O O
common O O O O
in O O O O
many O O O O
species O O O O
, O O O O
and O O O O
this O O O O
has O O O O
not O O O O
been O O O O
investigated O O O O
for O O O O
many O O O O
marine O O O O
apex O O O O
predators O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Because O O O O
of O O O O
their O O O O
position O O O O
at O O O O
or O O O O
near O O O O
the O O O O
top O O O O
of O O O O
many O O O O
marine O O O O
food O O O O
webs O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
possibility O O O O
that O O O O
they O O O O
can O O O O
affect O O O O
populations O O O O
of O O O O
their O O O O
prey O O O O
and O O O O
induce O O O O
trophic O O O O
cascades O O O O
, O O O O
it O O O O
is O O O O
important O O O O
to O O O O
understand O O O O
patterns O O O O
of O O O O
dietary O O O O
specialization O O O O
in O O O O
shark O O O O
populations O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Stable O O O O
isotope O O O O
values O O O O
from O O O O
body O O O O
tissues O O O O
with O O O O
different O O O O
turnover O O O O
rates O O O O
were O O O O
used O O O O
to O O O O
quantify O O O O
patterns O O O O
of O O O O
individual O O O O
specialization O O O O
in O O O O
two O O O O
species O O O O
of O O O O
' O O O O
generalist O O O O
' O O O O
sharks O O O O
( O O O O
bull B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sharks O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Carcharhinus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
leucas O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
tiger B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sharks O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Galeocerdo B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cuvier O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Despite O O O O
wide O O O O
population O O O O
- O O O O
level O O O O
isotopic O O O O
niche O O O O
breadths O O O O
in O O O O
both O O O O
species O O O O
, O O O O
isotopic O O O O
values O O O O
of O O O O
individual O O O O
tiger B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sharks O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
varied O O O O
across O O O O
tissues O O O O
with O O O O
different O O O O
turnover O O O O
rates O O O O
. O O O O
    
The O O O O
population O O O O
niche O O O O
breadth O O O O
was O O O O
explained O O O O
mostly O O O O
by O O O O
variation O O O O
within O O O O
individuals O O O O
suggesting O O O O
tiger B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sharks O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
are O O O O
true O O O O
generalists O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
, O O O O
isotope O O O O
values O O O O
of O O O O
individual O O O O
bull B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sharks O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
were O O O O
stable O O O O
through O O O O
time O O O O
and O O O O
their O O O O
wide O O O O
population O O O O
level O O O O
niche O O O O
breadth O O O O
was O O O O
explained O O O O
by O O O O
variation O O O O
among O O O O
specialist O O O O
individuals O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Relative O O O O
resource O O O O
abundance O O O O
and O O O O
spatial O O O O
variation O O O O
in O O O O
food O O O O
- O O O O
predation O O O O
risk O O O O
tradeoffs O O O O
may O O O O
explain O O O O
the O O O O
differences O O O O
in O O O O
patterns O O O O
of O O O O
specialization O O O O
between O O O O
shark O O O O
species O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
differences O O O O
in O O O O
individual O O O O
dietary O O O O
specialization O O O O
between O O O O
tiger B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sharks O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
bull B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sharks O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
results O O O O
in O O O O
different O O O O
functional O O O O
roles O O O O
in O O O O
coupling O O O O
or O O O O
compartmentalizing O O O O
distinct O O O O
food O O O O
webs O O O O
. O O O O
    
7 O O O O
. O O O O
    
Individual O O O O
specialization O O O O
may O O O O
be O O O O
an O O O O
important O O O O
feature O O O O
of O O O O
trophic O O O O
dynamics O O O O
of O O O O
highly O O O O
mobile O O O O
marine O O O O
top O O O O
predators O O O O
and O O O O
should O O O O
be O O O O
explicitly O O O O
considered O O O O
in O O O O
studies O O O O
of O O O O
marine O O O O
food O O O O
webs O O O O
and O O O O
the O O O O
ecological O O O O
role O O O O
of O O O O
top O O O O
predators O O O O
. O O O O
    
Genetic O O O O
mapping O O O O
of O O O O
14 O O O O
avirulence O O O O
genes O O O O
in O O O O
an O O O O
EU O O O O
- O O O O
B04 O O O O
x O O O O
1639 O O O O
progeny O O O O
of O O O O
Venturia O O O O
inaequalis O O O O
. O O O O
    
Durable O O O O
resistance O O O O
to O O O O
apple B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
scab O O O O
( O O O O
Venturia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
inaequalis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Cke O O O O
) O O O O
Wint O O O O
; O O O O
anamorph O O O O
Spilocaea B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pomi O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Fries O O O O
) O O O O
is O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
major O O O O
goals O O O O
of O O O O
apple B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
Malus O O O O
) O O O O
breeding O O O O
programs O O O O
. O O O O
    
Since O O O O
current O O O O
scab O O O O
resistance O O O O
breeding O O O O
is O O O O
heavily O O O O
reliant O O O O
on O O O O
genes O O O O
with O O O O
gene O O O O
- O O O O
for O O O O
- O O O O
gene O O O O
relationships O O O O
, O O O O
a O O O O
good O O O O
understanding O O O O
of O O O O
the O O O O
genetic O O O O
basis O O O O
of O O O O
host O O O O
- O O O O
pathogen O O O O
interactions O O O O
needs O O O O
to O O O O
be O O O O
developed O O O O
for O O O O
this O O O O
strategy O O O O
to O O O O
be O O O O
successful O O O O
. O O O O
    
While O O O O
the O O O O
genomic O O O O
organization O O O O
of O O O O
apple B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
scab O O O O
resistance O O O O
genes O O O O
has O O O O
been O O O O
studied O O O O
extensively O O O O
, O O O O
little O O O O
is O O O O
known O O O O
about O O O O
the O O O O
avirulence O O O O
genes O O O O
in O O O O
the O O O O
pathogen O O O O
. O O O O
    
The O O O O
progeny O O O O
of O O O O
a O O O O
cross O O O O
of O O O O
European O O O O
V B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
inaequalis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
race O O O O
( O O O O
1 O O O O
) O O O O
isolate O O O O
EU O O O O
- O O O O
B04 O O O O
and O O O O
race O O O O
( O O O O
1 O O O O
, O O O O
2 O O O O
, O O O O
8 O O O O
, O O O O
9 O O O O
) O O O O
isolate O O O O
1639 O O O O
was O O O O
used O O O O
to O O O O
generate O O O O
a O O O O
genetic O O O O
map O O O O
based O O O O
on O O O O
microsatellite O O O O
and O O O O
AFLP O O O O
markers O O O O
, O O O O
and O O O O
investigated O O O O
for O O O O
inheritance O O O O
of O O O O
avirulence O O O O
traits O O O O
on O O O O
20 O O O O
Malus O O O O
accessions O O O O
representing O O O O
17 O O O O
scab O O O O
resistance O O O O
genes O O O O
. O O O O
    
The O O O O
accessions O O O O
comprised O O O O
scab O O O O
differential O O O O
hosts O O O O
( O O O O
0 O O O O
) O O O O
, O O O O
( O O O O
1 O O O O
) O O O O
, O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
, O O O O
( O O O O
8 O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
( O O O O
9 O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
hosts O O O O
carrying O O O O
known O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
not O O O O
previously O O O O
reported O O O O
secondary O O O O
resistance O O O O
genes O O O O
, O O O O
including O O O O
some O O O O
identified O O O O
in O O O O
crosses O O O O
that O O O O
have O O O O
resistant O O O O
accessions O O O O
' O O O O
Geneva O O O O
' O O O O
, O O O O
' O O O O
Dolgo O O O O
' O O O O
, O O O O
Malus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
baccata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
jackii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
micromalus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
or O O O O
' O O O O
Antonovka O O O O
' O O O O
in O O O O
their O O O O
pedigree O O O O
. O O O O
    
The O O O O
latter O O O O
genes O O O O
appear O O O O
to O O O O
be O O O O
narrow O O O O
spectrum O O O O
genes O O O O
that O O O O
showed O O O O
gene O O O O
- O O O O
for O O O O
- O O O O
gene O O O O
relationships O O O O
as O O O O
a O O O O
segregation O O O O
ratio O O O O
of O O O O
Avr O O O O
: O O O O
avr O O O O
= O O O O
1 O O O O
: O O O O
1 O O O O
was O O O O
observed O O O O
on O O O O
12 O O O O
accessions O O O O
, O O O O
while O O O O
a O O O O
ratio O O O O
of O O O O
3 O O O O
: O O O O
1 O O O O
was O O O O
observed O O O O
on O O O O
five O O O O
accessions O O O O
and O O O O
a O O O O
ratio O O O O
of O O O O
7 O O O O
: O O O O
1 O O O O
on O O O O
one O O O O
host O O O O
. O O O O
    
All O O O O
progenies O O O O
were O O O O
shown O O O O
to O O O O
be O O O O
pathogenic O O O O
, O O O O
as O O O O
all O O O O
of O O O O
them O O O O
were O O O O
able O O O O
to O O O O
infect O O O O
hosts O O O O
( O O O O
0 O O O O
) O O O O
and O O O O
( O O O O
1 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
A O O O O
genetic O O O O
map O O O O
consisting O O O O
of O O O O
15 O O O O
major O O O O
linkage O O O O
groups O O O O
( O O O O
LGs O O O O
) O O O O
and O O O O
spanning O O O O
972cM O O O O
was O O O O
generated O O O O
with O O O O
the O O O O
aid O O O O
of O O O O
156 O O O O
markers O O O O
. O O O O
    
The O O O O
map O O O O
position O O O O
of O O O O
12 O O O O
avirulence O O O O
traits O O O O
was O O O O
determined O O O O
: O O O O
eight O O O O
avirulence O O O O
genes O O O O
mapped O O O O
into O O O O
two O O O O
separate O O O O
clusters O O O O
( O O O O
1 O O O O
: O O O O
AvrVdg2 O O O O
, O O O O
AvrVv1 O O O O
, O O O O
AvrVu1 O O O O
, O O O O
AvrVrjrd O O O O
; O O O O
and O O O O
2 O O O O
: O O O O
AvrVu2 O O O O
, O O O O
AvrVh3 O O O O
. O O O O
2 O O O O
, O O O O
AvrVs1 O O O O
, O O O O
AvrVu4 O O O O
) O O O O
, O O O O
while O O O O
four O O O O
avirulence O O O O
genes O O O O
( O O O O
AvrRvi8 O O O O
, O O O O
AvrVv2 O O O O
, O O O O
AvrVt57 O O O O
and O O O O
AvrVsv O O O O
) O O O O
mapped O O O O
to O O O O
different O O O O
LGs O O O O
. O O O O
    
AvrRvi2 O O O O
and O O O O
AvrRvi9 O O O O
also O O O O
are O O O O
genetically O O O O
linked O O O O
, O O O O
but O O O O
showed O O O O
an O O O O
interaction O O O O
with O O O O
AvrRvi8 O O O O
, O O O O
the O O O O
nature O O O O
of O O O O
which O O O O
is O O O O
unclear O O O O
. O O O O
    
While O O O O
AvrRvi8 O O O O
segregated O O O O
at O O O O
1 O O O O
: O O O O
1 O O O O
ratio O O O O
, O O O O
the O O O O
other O O O O
two O O O O
Avrs O O O O
segregated O O O O
at O O O O
3 O O O O
: O O O O
1 O O O O
ratios O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
all O O O O
progeny O O O O
avirulent O O O O
on O O O O
hosts O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
and O O O O
( O O O O
9 O O O O
) O O O O
were O O O O
also O O O O
avirulent O O O O
on O O O O
host O O O O
( O O O O
8 O O O O
) O O O O
and O O O O
further O O O O
research O O O O
is O O O O
required O O O O
to O O O O
determine O O O O
the O O O O
avirulence O O O O
gene O O O O
relationships O O O O
. O O O O
    
A O O O O
further O O O O
two O O O O
independently O O O O
segregating O O O O
loci O O O O
, O O O O
AvrRvi1 O O O O
and O O O O
AvrRvi6 O O O O
, O O O O
identified O O O O
in O O O O
previous O O O O
studies O O O O
, O O O O
were O O O O
mapped O O O O
by O O O O
inference O O O O
based O O O O
on O O O O
their O O O O
known O O O O
linkage O O O O
to O O O O
SSR O O O O
markers O O O O
. O O O O
    
The O O O O
clustering O O O O
of O O O O
avirulence O O O O
genes O O O O
in O O O O
V O O O O
. O O O O
inaequalis O O O O
reflecting O O O O
the O O O O
clustering O O O O
of O O O O
resistance O O O O
genes O O O O
in O O O O
Malus O O O O
suggests O O O O
this O O O O
pathosystem O O O O
is O O O O
a O O O O
classical O O O O
example O O O O
of O O O O
an O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
arms O O O O
race O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
between O O O O
host O O O O
and O O O O
pathogen O O O O
. O O O O
    
This O O O O
also O O O O
seems O O O O
to O O O O
apply O O O O
to O O O O
the O O O O
narrow O O O O
spectrum O O O O
scab O O O O
resistance O O O O
genes O O O O
, O O O O
which O O O O
may O O O O
imply O O O O
a O O O O
larger O O O O
role O O O O
in O O O O
plant O O O O
defense O O O O
for O O O O
these O O O O
genes O O O O
than O O O O
has O O O O
been O O O O
assumed O O O O
to O O O O
date O O O O
. O O O O
    
Functional O O O O
characterization O O O O
of O O O O
Arabidopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
thaliana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
isopropylmalate O O O O
dehydrogenases O O O O
reveals O O O O
their O O O O
important O O O O
roles O O O O
in O O O O
gametophyte O O O O
development O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Isopropylmalate O O O O
dehydrogenases O O O O
( O O O O
IPMDHs O O O O
) O O O O
catalyze O O O O
the O O O O
oxidative O O O O
decarboxylation O O O O
of O O O O
3 O O O O
- O O O O
isopropylmalate O O O O
( O O O O
3 O O O O
- O O O O
IPM O O O O
) O O O O
in O O O O
leucine O O O O
biosynthesis O O O O
in O O O O
microorganisms O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Arabidopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
thaliana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
genome O O O O
contains O O O O
three O O O O
putative O O O O
IPMDH O O O O
genes O O O O
. O O O O
    
* O O O O
IPMDH2 O O O O
and O O O O
IPMDH3 O O O O
proteins O O O O
exhibited O O O O
significantly O O O O
higher O O O O
activity O O O O
toward O O O O
3 O O O O
- O O O O
IPM O O O O
than O O O O
IPMDH1 O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
indicative O O O O
of O O O O
a O O O O
pivotal O O O O
role O O O O
in O O O O
leucine O O O O
biosynthesis O O O O
. O O O O
    
Single O O O O
mutants O O O O
of O O O O
IPMDH2 O O O O
or O O O O
IPMDH3 O O O O
lacked O O O O
a O O O O
discernible O O O O
phenotype O O O O
. O O O O
    
Genetic O O O O
analysis O O O O
showed O O O O
that O O O O
ipmdh2 O O O O
ipmdh3 O O O O
was O O O O
lethal O O O O
in O O O O
male O O O O
gametophytes O O O O
and O O O O
had O O O O
reduced O O O O
transmission O O O O
through O O O O
female O O O O
gametophytes O O O O
. O O O O
    
The O O O O
aborted O O O O
pollen O O O O
grains O O O O
were O O O O
small O O O O
, O O O O
abnormal O O O O
in O O O O
cellular O O O O
structure O O O O
, O O O O
and O O O O
arrested O O O O
in O O O O
germination O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
, O O O O
half O O O O
of O O O O
the O O O O
double O O O O
mutant O O O O
embryo O O O O
sacs O O O O
exhibited O O O O
slowed O O O O
development O O O O
. O O O O
    
* O O O O
The O O O O
IPMDH2 O O O O
/ O O O O
ipmdh2 O O O O
ipmdh3 O O O O
/ O O O O
ipmdh3 O O O O
genotype O O O O
exhibited O O O O
abnormal O O O O
vegetative O O O O
phenotypes O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
haplo O O O O
- O O O O
insufficiency O O O O
of O O O O
IPMDH2 O O O O
in O O O O
the O O O O
ipmdh3 O O O O
background O O O O
. O O O O
    
This O O O O
mutant O O O O
and O O O O
a O O O O
triple O O O O
mutant O O O O
containing O O O O
one O O O O
allele O O O O
of O O O O
IPMDH2 O O O O
or O O O O
IPMDH3 O O O O
had O O O O
decreased O O O O
leucine O O O O
biosynthetic O O O O
enzyme O O O O
activities O O O O
and O O O O
lower O O O O
free O O O O
leucine O O O O
concentrations O O O O
. O O O O
    
The O O O O
latter O O O O
mutant O O O O
showed O O O O
changes O O O O
in O O O O
glucosinolate O O O O
profiles O O O O
different O O O O
from O O O O
those O O O O
in O O O O
the O O O O
ipmdh1 O O O O
mutant O O O O
. O O O O
    
* O O O O
The O O O O
results O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
IPMDH2 O O O O
and O O O O
IPMDH3 O O O O
primarily O O O O
function O O O O
in O O O O
leucine O O O O
biosynthesis O O O O
, O O O O
are O O O O
essential O O O O
for O O O O
pollen O O O O
development O O O O
and O O O O
are O O O O
needed O O O O
for O O O O
proper O O O O
embryo O O O O
sac O O O O
development O O O O
. O O O O
    
OsHMA3 O O O O
, O O O O
a O O O O
P1B O O O O
- O O O O
type O O O O
of O O O O
ATPase O O O O
affects O O O O
root O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
shoot O O O O
cadmium O O O O
translocation O O O O
in O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
by O O O O
mediating O O O O
efflux O O O O
into O O O O
vacuoles O O O O
. O O O O
    
* O O O O
The O O O O
cadmium O O O O
( O O O O
Cd O O O O
) O O O O
over O O O O
- O O O O
accumulating O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
Oryza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sativa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
cv B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
Cho O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Ko O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Koku O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
previously O O O O
shown O O O O
to O O O O
have O O O O
an O O O O
enhanced O O O O
rate O O O O
of O O O O
root O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
shoot O O O O
Cd O O O O
translocation O O O O
. O O O O
    
This O O O O
trait O O O O
is O O O O
controlled O O O O
by O O O O
a O O O O
single O O O O
recessive O O O O
allele O O O O
located O O O O
at O O O O
qCdT7 O O O O
. O O O O
    
* O O O O
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
using O O O O
positional O O O O
cloning O O O O
and O O O O
transgenic O O O O
strategies O O O O
, O O O O
heavy O O O O
metal O O O O
ATPase O O O O
3 O O O O
( O O O O
OsHMA3 O O O O
) O O O O
was O O O O
identified O O O O
as O O O O
the O O O O
gene O O O O
that O O O O
controls O O O O
root O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
shoot O O O O
Cd O O O O
translocation O O O O
rates O O O O
. O O O O
    
The O O O O
subcellular O O O O
localization O O O O
and O O O O
Cd O O O O
- O O O O
transporting O O O O
activity O O O O
of O O O O
the O O O O
gene O O O O
products O O O O
were O O O O
also O O O O
investigated O O O O
. O O O O
    
* O O O O
The O O O O
allele O O O O
of O O O O
OsHMA3 O O O O
that O O O O
confers O O O O
high O O O O
root O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
shoot O O O O
Cd O O O O
translocation O O O O
rates O O O O
( O O O O
OsHMA3mc O O O O
) O O O O
encodes O O O O
a O O O O
defective O O O O
P O O O O
( O O O O
1B O O O O
) O O O O
- O O O O
ATPase O O O O
transporter O O O O
. O O O O
    
OsHMA3 O O O O
fused O O O O
to O O O O
green O O O O
fluorescent O O O O
protein O O O O
was O O O O
localized O O O O
to O O O O
vacuolar O O O O
membranes O O O O
in O O O O
plants O O O O
and O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
An O O O O
OsHMA3 O O O O
transgene O O O O
complemented O O O O
Cd O O O O
sensitivity O O O O
in O O O O
a O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mutant O O O O
that O O O O
lacks O O O O
the O O O O
ability O O O O
to O O O O
transport O O O O
Cd O O O O
into O O O O
vacuoles O O O O
. O O O O
    
By O O O O
contrast O O O O
, O O O O
OsHMA3mc O O O O
did O O O O
not O O O O
complement O O O O
the O O O O
Cd O O O O
sensitivity O O O O
of O O O O
this O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mutant O O O O
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
the O O O O
OsHMA3mc O O O O
transport O O O O
function O O O O
was O O O O
lost O O O O
. O O O O
    
* O O O O
We O O O O
propose O O O O
that O O O O
the O O O O
root O O O O
cell O O O O
cytoplasm O O O O
of O O O O
Cd O O O O
- O O O O
overaccumulating O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
plants O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
has O O O O
more O O O O
Cd O O O O
available O O O O
for O O O O
loading O O O O
into O O O O
the O O O O
xylem O O O O
as O O O O
a O O O O
result O O O O
of O O O O
the O O O O
lack O O O O
of O O O O
OsHMA3 O O O O
- O O O O
mediated O O O O
transportation O O O O
of O O O O
Cd O O O O
to O O O O
the O O O O
vacuoles O O O O
. O O O O
    
This O O O O
defect O O O O
results O O O O
in O O O O
Cd O O O O
translocation O O O O
to O O O O
the O O O O
shoots O O O O
in O O O O
higher O O O O
concentrations O O O O
. O O O O
    
These O O O O
data O O O O
demonstrate O O O O
the O O O O
importance O O O O
of O O O O
vacuolar O O O O
sequestration O O O O
for O O O O
Cd O O O O
accumulation O O O O
in O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Spatial O O O O
distribution O O O O
of O O O O
arsenic O O O O
and O O O O
temporal O O O O
variation O O O O
of O O O O
its O O O O
concentration O O O O
in O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
* O O O O
In O O O O
order O O O O
to O O O O
gain O O O O
insights O O O O
into O O O O
the O O O O
transport O O O O
and O O O O
distribution O O O O
of O O O O
arsenic O O O O
( O O O O
As O O O O
) O O O O
in O O O O
intact O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
Oryza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sativa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
plants O O O O
and O O O O
its O O O O
unloading O O O O
into O O O O
the O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
grain O O O O
, O O O O
we O O O O
investigated O O O O
the O O O O
spatial O O O O
distribution O O O O
of O O O O
As O O O O
and O O O O
the O O O O
temporal O O O O
variation O O O O
of O O O O
As O O O O
concentration O O O O
in O O O O
whole O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
plants O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
at O O O O
different O O O O
growth O O O O
stages O O O O
. O O O O
    
To O O O O
the O O O O
best O O O O
of O O O O
our O O O O
knowledge O O O O
, O O O O
this O O O O
is O O O O
the O O O O
first O O O O
time O O O O
that O O O O
such O O O O
a O O O O
study O O O O
has O O O O
been O O O O
performed O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Inductively O O O O
coupled O O O O
plasma O O O O
mass O O O O
spectroscopy O O O O
( O O O O
ICP O O O O
- O O O O
MS O O O O
) O O O O
and O O O O
high O O O O
- O O O O
performance O O O O
liquid O O O O
chromatography O O O O
( O O O O
HPLC O O O O
) O O O O
- O O O O
ICP O O O O
- O O O O
MS O O O O
were O O O O
used O O O O
to O O O O
analyze O O O O
total O O O O
As O O O O
concentration O O O O
and O O O O
speciation O O O O
. O O O O
    
Moreover O O O O
, O O O O
synchrotron O O O O
- O O O O
based O O O O
X O O O O
- O O O O
ray O O O O
fluorescence O O O O
( O O O O
SXRF O O O O
) O O O O
was O O O O
used O O O O
to O O O O
investigate O O O O
in O O O O
situ O O O O
As O O O O
distribution O O O O
in O O O O
the O O O O
leaf O O O O
, O O O O
internode O O O O
, O O O O
node O O O O
and O O O O
grain O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Total O O O O
As O O O O
concentrations O O O O
of O O O O
vegetative O O O O
tissues O O O O
increased O O O O
during O O O O
the O O O O
2 O O O O
wk O O O O
after O O O O
flowering O O O O
. O O O O
    
The O O O O
concentration O O O O
of O O O O
dimethylarsinic O O O O
acid O O O O
( O O O O
DMA O O O O
) O O O O
in O O O O
the O O O O
caryopsis O O O O
decreased O O O O
progressively O O O O
with O O O O
its O O O O
development O O O O
, O O O O
whereas O O O O
inorganic O O O O
As O O O O
concentration O O O O
remained O O O O
stable O O O O
. O O O O
    
The O O O O
ratios O O O O
of O O O O
As O O O O
content O O O O
between O O O O
neighboring O O O O
leaves O O O O
or O O O O
between O O O O
neighboring O O O O
internodes O O O O
were O O O O
c O O O O
. O O O O
    
0 O O O O
. O O O O
6 O O O O
. O O O O
    
SXRF O O O O
revealed O O O O
As O O O O
accumulation O O O O
in O O O O
the O O O O
center O O O O
of O O O O
the O O O O
caryopsis O O O O
during O O O O
its O O O O
early O O O O
development O O O O
and O O O O
then O O O O
in O O O O
the O O O O
ovular O O O O
vascular O O O O
trace O O O O
. O O O O
    
* O O O O
These O O O O
results O O O O
indicate O O O O
that O O O O
there O O O O
are O O O O
different O O O O
controls O O O O
on O O O O
the O O O O
unloading O O O O
of O O O O
inorganic O O O O
As O O O O
and O O O O
DMA O O O O
; O O O O
the O O O O
latter O O O O
accumulated O O O O
mainly O O O O
in O O O O
the O O O O
caryopsis O O O O
before O O O O
flowering O O O O
, O O O O
whereas O O O O
inorganic O O O O
As O O O O
was O O O O
mainly O O O O
transported O O O O
into O O O O
the O O O O
caryopsis O O O O
during O O O O
grain O O O O
filling O O O O
. O O O O
    
Moreover O O O O
, O O O O
nodes O O O O
appeared O O O O
to O O O O
serve O O O O
as O O O O
a O O O O
check O O O O
- O O O O
point O O O O
in O O O O
As O O O O
distribution O O O O
in O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
shoots O O O O
. O O O O
    
Reduced O O O O
predator O O O O
species O O O O
richness O O O O
drives O O O O
the O O O O
body O O O O
gigantism O O O O
of O O O O
a O O O O
frog O O O O
species O O O O
on O O O O
the O O O O
Zhoushan O O O O
Archipelago O O O O
in O O O O
China O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Shifts O O O O
in O O O O
the O O O O
body O O O O
size O O O O
of O O O O
insular O O O O
vertebrates O O O O
have O O O O
been O O O O
an O O O O
interesting O O O O
theme O O O O
in O O O O
ecological O O O O
and O O O O
evolutionary O O O O
studies O O O O
. O O O O
    
Four O O O O
primary O O O O
factors O O O O
, O O O O
including O O O O
predation O O O O
pressures O O O O
, O O O O
resource O O O O
availability O O O O
, O O O O
inter O O O O
- O O O O
species O O O O
competition O O O O
and O O O O
immigrant O O O O
selection O O O O
, O O O O
have O O O O
been O O O O
proposed O O O O
to O O O O
explain O O O O
the O O O O
trend O O O O
in O O O O
insular O O O O
body O O O O
size O O O O
. O O O O
    
Life O O O O
- O O O O
history O O O O
theory O O O O
predicts O O O O
that O O O O
body O O O O
size O O O O
, O O O O
average O O O O
age O O O O
, O O O O
the O O O O
proportion O O O O
of O O O O
old O O O O
- O O O O
aged O O O O
members O O O O
and O O O O
the O O O O
density O O O O
of O O O O
insular O O O O
populations O O O O
are O O O O
negatively O O O O
correlated O O O O
with O O O O
predator O O O O
species O O O O
richness O O O O
, O O O O
and O O O O
that O O O O
body O O O O
size O O O O
and O O O O
population O O O O
density O O O O
are O O O O
positively O O O O
related O O O O
to O O O O
resource O O O O
availability O O O O
. O O O O
    
The O O O O
niche O O O O
expansion O O O O
hypothesis O O O O
argues O O O O
that O O O O
a O O O O
positive O O O O
relationship O O O O
is O O O O
expected O O O O
to O O O O
exist O O O O
between O O O O
insular O O O O
body O O O O
size O O O O
and O O O O
prey O O O O
size O O O O
, O O O O
which O O O O
varies O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
extinction O O O O
due O O O O
to O O O O
small O O O O
or O O O O
large O O O O
competitors O O O O
. O O O O
    
The O O O O
immigrant O O O O
hypothesis O O O O
predicts O O O O
that O O O O
insular O O O O
body O O O O
size O O O O
is O O O O
positively O O O O
correlated O O O O
with O O O O
distance O O O O
to O O O O
the O O O O
mainland O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
tested O O O O
these O O O O
hypotheses O O O O
by O O O O
using O O O O
populations O O O O
of O O O O
rice O O O O
frogs O O O O
Rana B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
limnocharis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
on O O O O
20 O O O O
islands O O O O
in O O O O
the O O O O
Zhoushan O O O O
Archipelago O O O O
and O O O O
two O O O O
sites O O O O
of O O O O
nearby O O O O
mainland O O O O
China O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
body O O O O
size O O O O
( O O O O
snout O O O O
- O O O O
vent O O O O
length O O O O
) O O O O
of O O O O
rice O O O O
frogs O O O O
on O O O O
half O O O O
of O O O O
the O O O O
islands O O O O
was O O O O
larger O O O O
before O O O O
and O O O O
after O O O O
the O O O O
variable O O O O
of O O O O
age O O O O
was O O O O
controlled O O O O
for O O O O
; O O O O
rice O O O O
frog O O O O
density O O O O
and O O O O
prey O O O O
availability O O O O
was O O O O
higher O O O O
and O O O O
prey O O O O
size O O O O
was O O O O
larger O O O O
on O O O O
most O O O O
of O O O O
the O O O O
islands O O O O
as O O O O
compared O O O O
to O O O O
the O O O O
two O O O O
mainland O O O O
sites O O O O
. O O O O
    
On O O O O
the O O O O
islands O O O O
, O O O O
the O O O O
body O O O O
size O O O O
and O O O O
other O O O O
features O O O O
[ O O O O
e O O O O
. O O O O
g O O O O
. O O O O
average O O O O
age O O O O
, O O O O
the O O O O
proportion O O O O
of O O O O
old O O O O
- O O O O
aged O O O O
frogs O O O O
( O O O O
ages O O O O
3 O O O O
and O O O O
4 O O O O
) O O O O
and O O O O
density O O O O
] O O O O
of O O O O
the O O O O
rice O O O O
frogs O O O O
were O O O O
negatively O O O O
associated O O O O
with O O O O
predator O O O O
species O O O O
richness O O O O
; O O O O
female O O O O
body O O O O
size O O O O
and O O O O
other O O O O
features O O O O
were O O O O
positively O O O O
associated O O O O
with O O O O
prey O O O O
availability O O O O
. O O O O
    
The O O O O
inference O O O O
of O O O O
multivariate O O O O
linear O O O O
models O O O O
based O O O O
on O O O O
corrected O O O O
Akaike O O O O
Information O O O O
Criterion O O O O
( O O O O
AIC O O O O
( O O O O
c O O O O
) O O O O
) O O O O
showed O O O O
that O O O O
the O O O O
relative O O O O
importance O O O O
of O O O O
predator O O O O
species O O O O
richness O O O O
on O O O O
body O O O O
size O O O O
and O O O O
each O O O O
of O O O O
the O O O O
other O O O O
features O O O O
was O O O O
larger O O O O
than O O O O
that O O O O
of O O O O
prey O O O O
availability O O O O
, O O O O
prey O O O O
size O O O O
and O O O O
distance O O O O
to O O O O
the O O O O
mainland O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
, O O O O
the O O O O
parameters O O O O
for O O O O
predator O O O O
species O O O O
richness O O O O
were O O O O
all O O O O
negative O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
provided O O O O
strong O O O O
support O O O O
for O O O O
the O O O O
life O O O O
- O O O O
history O O O O
theory O O O O
of O O O O
predation O O O O
pressures O O O O
, O O O O
but O O O O
weak O O O O
evidence O O O O
for O O O O
the O O O O
life O O O O
- O O O O
history O O O O
theory O O O O
of O O O O
prey O O O O
availability O O O O
, O O O O
the O O O O
niche O O O O
expansion O O O O
or O O O O
the O O O O
immigrant O O O O
hypothesis O O O O
. O O O O
    
The O O O O
reduced O O O O
predator O O O O
species O O O O
richness O O O O
was O O O O
a O O O O
dominant O O O O
factor O O O O
contributing O O O O
to O O O O
the O O O O
body O O O O
gigantism O O O O
of O O O O
rice O O O O
frogs O O O O
on O O O O
the O O O O
islands O O O O
. O O O O
    
Contrasted O O O O
demographic O O O O
responses O O O O
facing O O O O
future O O O O
climate O O O O
change O O O O
in O O O O
Southern O O O O
Ocean O O O O
seabirds O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Recent O O O O
climate O O O O
change O O O O
has O O O O
affected O O O O
a O O O O
wide O O O O
range O O O O
of O O O O
species O O O O
, O O O O
but O O O O
predicting O O O O
population O O O O
responses O O O O
to O O O O
projected O O O O
climate O O O O
change O O O O
using O O O O
population O O O O
dynamics O O O O
theory O O O O
and O O O O
models O O O O
remains O O O O
challenging O O O O
, O O O O
and O O O O
very O O O O
few O O O O
attempts O O O O
have O O O O
been O O O O
made O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Southern O O O O
Ocean O O O O
sea O O O O
surface O O O O
temperature O O O O
and O O O O
sea O O O O
ice O O O O
extent O O O O
are O O O O
projected O O O O
to O O O O
warm O O O O
and O O O O
shrink O O O O
as O O O O
concentrations O O O O
of O O O O
atmospheric O O O O
greenhouse O O O O
gases O O O O
increase O O O O
, O O O O
and O O O O
several O O O O
top O O O O
predator O O O O
species O O O O
are O O O O
affected O O O O
by O O O O
fluctuations O O O O
in O O O O
these O O O O
oceanographic O O O O
variables O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
compared O O O O
and O O O O
projected O O O O
the O O O O
population O O O O
responses O O O O
of O O O O
three O O O O
seabird O O O O
species O O O O
living O O O O
in O O O O
sub O O O O
- O O O O
tropical O O O O
, O O O O
sub O O O O
- O O O O
Antarctic O O O O
and O O O O
Antarctic O O O O
biomes O O O O
to O O O O
predicted O O O O
climate O O O O
change O O O O
over O O O O
the O O O O
next O O O O
50 O O O O
years O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
stochastic O O O O
population O O O O
models O O O O
we O O O O
combined O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
demographic O O O O
datasets O O O O
and O O O O
projections O O O O
of O O O O
sea O O O O
surface O O O O
temperature O O O O
and O O O O
sea O O O O
ice O O O O
extent O O O O
for O O O O
three O O O O
different O O O O
IPCC O O O O
emission O O O O
scenarios O O O O
( O O O O
from O O O O
most O O O O
to O O O O
least O O O O
severe O O O O
: O O O O
A1B O O O O
, O O O O
A2 O O O O
, O O O O
B1 O O O O
) O O O O
from O O O O
general O O O O
circulation O O O O
models O O O O
of O O O O
Earth O O O O
' O O O O
s O O O O
climate O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
that O O O O
climate O O O O
mostly O O O O
affected O O O O
the O O O O
probability O O O O
to O O O O
breed O O O O
successfully O O O O
, O O O O
and O O O O
in O O O O
one O O O O
case O O O O
adult O O O O
survival O O O O
. O O O O
    
Interestingly O O O O
, O O O O
frequent O O O O
nonlinear O O O O
relationships O O O O
in O O O O
demographic O O O O
responses O O O O
to O O O O
climate O O O O
were O O O O
detected O O O O
. O O O O
    
Models O O O O
forced O O O O
by O O O O
future O O O O
predicted O O O O
climatic O O O O
change O O O O
provided O O O O
contrasted O O O O
population O O O O
responses O O O O
depending O O O O
on O O O O
the O O O O
species O O O O
considered O O O O
. O O O O
    
The O O O O
northernmost O O O O
distributed O O O O
species O O O O
was O O O O
predicted O O O O
to O O O O
be O O O O
little O O O O
affected O O O O
by O O O O
a O O O O
future O O O O
warming O O O O
of O O O O
the O O O O
Southern O O O O
Ocean O O O O
, O O O O
whereas O O O O
steep O O O O
declines O O O O
were O O O O
projected O O O O
for O O O O
the O O O O
more O O O O
southerly O O O O
distributed O O O O
species O O O O
due O O O O
to O O O O
sea O O O O
surface O O O O
temperature O O O O
warming O O O O
and O O O O
decrease O O O O
in O O O O
sea O O O O
ice O O O O
extent O O O O
. O O O O
    
For O O O O
the O O O O
most O O O O
southerly O O O O
distributed O O O O
species O O O O
, O O O O
the O O O O
A1B O O O O
and O O O O
B1 O O O O
emission O O O O
scenarios O O O O
were O O O O
respectively O O O O
the O O O O
most O O O O
and O O O O
less O O O O
damaging O O O O
. O O O O
    
For O O O O
the O O O O
two O O O O
other O O O O
species O O O O
, O O O O
population O O O O
responses O O O O
were O O O O
similar O O O O
for O O O O
all O O O O
emission O O O O
scenarios O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
This O O O O
is O O O O
among O O O O
the O O O O
first O O O O
attempts O O O O
to O O O O
study O O O O
the O O O O
demographic O O O O
responses O O O O
for O O O O
several O O O O
populations O O O O
with O O O O
contrasted O O O O
environmental O O O O
conditions O O O O
, O O O O
which O O O O
illustrates O O O O
that O O O O
investigating O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
climate O O O O
change O O O O
on O O O O
core O O O O
population O O O O
dynamics O O O O
is O O O O
feasible O O O O
for O O O O
different O O O O
populations O O O O
using O O O O
a O O O O
common O O O O
methodological O O O O
framework O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
approach O O O O
was O O O O
limited O O O O
to O O O O
single O O O O
populations O O O O
and O O O O
have O O O O
neglected O O O O
population O O O O
settlement O O O O
in O O O O
new O O O O
favourable O O O O
habitats O O O O
or O O O O
changes O O O O
in O O O O
inter O O O O
- O O O O
specific O O O O
relations O O O O
as O O O O
a O O O O
potential O O O O
response O O O O
to O O O O
future O O O O
climate O O O O
change O O O O
. O O O O
    
Predictions O O O O
may O O O O
be O O O O
enhanced O O O O
by O O O O
merging O O O O
demographic O O O O
population O O O O
models O O O O
and O O O O
climatic O O O O
envelope O O O O
models O O O O
. O O O O
    
The O O O O
role O O O O
of O O O O
abscisic O O O O
acid O O O O
and O O O O
water O O O O
stress O O O O
in O O O O
root O O O O
herbivore O O O O
- O O O O
induced O O O O
leaf O O O O
resistance O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Herbivore O O O O
- O O O O
induced O O O O
systemic O O O O
resistance O O O O
occurs O O O O
in O O O O
many O O O O
plants O O O O
and O O O O
is O O O O
commonly O O O O
assumed O O O O
to O O O O
be O O O O
adaptive O O O O
. O O O O
    
The O O O O
mechanisms O O O O
triggered O O O O
by O O O O
leaf O O O O
- O O O O
herbivores O O O O
that O O O O
lead O O O O
to O O O O
systemic O O O O
resistance O O O O
are O O O O
largely O O O O
understood O O O O
, O O O O
but O O O O
it O O O O
remains O O O O
unknown O O O O
how O O O O
and O O O O
why O O O O
root O O O O
herbivory O O O O
also O O O O
increases O O O O
resistance O O O O
in O O O O
leaves O O O O
. O O O O
    
* O O O O
To O O O O
resolve O O O O
this O O O O
, O O O O
we O O O O
investigated O O O O
the O O O O
mechanism O O O O
by O O O O
which O O O O
the O O O O
root O O O O
herbivore O O O O
Diabrotica B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virgifera O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
induces O O O O
resistance O O O O
against O O O O
lepidopteran O O O O
herbivores O O O O
in O O O O
the O O O O
leaves O O O O
of O O O O
Zea B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mays O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
* O O O O
Diabrotica B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virgifera O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
infested O O O O
plants O O O O
suffered O O O O
less O O O O
aboveground O O O O
herbivory O O O O
in O O O O
the O O O O
field O O O O
and O O O O
showed O O O O
reduced O O O O
growth O O O O
of O O O O
Spodoptera B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
littoralis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
caterpillars O O O O
in O O O O
the O O O O
laboratory O O O O
. O O O O
    
Root O O O O
herbivory O O O O
did O O O O
not O O O O
lead O O O O
to O O O O
a O O O O
jasmonate O O O O
- O O O O
dependent O O O O
response O O O O
in O O O O
the O O O O
leaves O O O O
, O O O O
but O O O O
specifically O O O O
triggered O O O O
water O O O O
loss O O O O
and O O O O
abscisic O O O O
acid O O O O
( O O O O
ABA O O O O
) O O O O
accumulation O O O O
. O O O O
    
The O O O O
induction O O O O
of O O O O
ABA O O O O
by O O O O
itself O O O O
was O O O O
partly O O O O
responsible O O O O
for O O O O
the O O O O
induction O O O O
of O O O O
leaf O O O O
defenses O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
for O O O O
the O O O O
resistance O O O O
against O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
littoralis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Root O O O O
- O O O O
herbivore O O O O
induced O O O O
hydraulic O O O O
changes O O O O
in O O O O
the O O O O
leaves O O O O
, O O O O
however O O O O
, O O O O
were O O O O
crucial O O O O
for O O O O
the O O O O
increase O O O O
in O O O O
insect O O O O
resistance O O O O
. O O O O
    
* O O O O
We O O O O
conclude O O O O
that O O O O
the O O O O
induced O O O O
leaf O O O O
resistance O O O O
after O O O O
root O O O O
feeding O O O O
is O O O O
the O O O O
result O O O O
of O O O O
hydraulic O O O O
changes O O O O
, O O O O
which O O O O
reduce O O O O
the O O O O
quality O O O O
of O O O O
the O O O O
leaves O O O O
for O O O O
chewing O O O O
herbivores O O O O
. O O O O
    
This O O O O
finding O O O O
calls O O O O
into O O O O
question O O O O
whether O O O O
root O O O O
- O O O O
herbivore O O O O
induced O O O O
leaf O O O O
- O O O O
resistance O O O O
is O O O O
an O O O O
evolved O O O O
response O O O O
. O O O O
    
Do O O O O
quantitative O O O O
vessel O O O O
and O O O O
pit O O O O
characters O O O O
account O O O O
for O O O O
ion O O O O
- O O O O
mediated O O O O
changes O O O O
in O O O O
the O O O O
hydraulic O O O O
conductance O O O O
of O O O O
angiosperm O O O O
xylem O O O O
? O O O O
    
* O O O O
The O O O O
hydraulic O O O O
conductance O O O O
of O O O O
angiosperm O O O O
xylem O O O O
has O O O O
been O O O O
suggested O O O O
to O O O O
vary O O O O
with O O O O
changes O O O O
in O O O O
sap O O O O
solute O O O O
concentrations O O O O
because O O O O
of O O O O
intervessel O O O O
pit O O O O
properties O O O O
. O O O O
    
* O O O O
The O O O O
magnitude O O O O
of O O O O
the O O O O
' O O O O
ionic O O O O
effect O O O O
' O O O O
was O O O O
linked O O O O
with O O O O
vessel O O O O
and O O O O
pit O O O O
dimensions O O O O
in O O O O
20 O O O O
angiosperm O O O O
species O O O O
covering O O O O
13 O O O O
families O O O O
including O O O O
six O O O O
Lauraceae O O O O
species O O O O
. O O O O
    
* O O O O
A O O O O
positive O O O O
correlation O O O O
was O O O O
found O O O O
between O O O O
ionic O O O O
effect O O O O
and O O O O
vessel O O O O
grouping O O O O
parameters O O O O
, O O O O
especially O O O O
the O O O O
portion O O O O
of O O O O
vessel O O O O
walls O O O O
in O O O O
contact O O O O
with O O O O
neighbouring O O O O
vessels O O O O
. O O O O
    
Species O O O O
with O O O O
intervessel O O O O
contact O O O O
fraction O O O O
( O O O O
F O O O O
( O O O O
C O O O O
) O O O O
) O O O O
values O O O O
& O O O O
lt O O O O
; O O O O
0 O O O O
. O O O O
1 O O O O
showed O O O O
an O O O O
ionic O O O O
effect O O O O
between O O O O
2 O O O O
% O O O O
and O O O O
17 O O O O
% O O O O
, O O O O
while O O O O
species O O O O
with O O O O
F O O O O
( O O O O
C O O O O
) O O O O
values O O O O
> O O O O
0 O O O O
. O O O O
1 O O O O
exhibited O O O O
a O O O O
response O O O O
between O O O O
10 O O O O
% O O O O
and O O O O
32 O O O O
% O O O O
. O O O O
    
The O O O O
ionic O O O O
effect O O O O
increased O O O O
linearly O O O O
with O O O O
the O O O O
mean O O O O
fraction O O O O
of O O O O
the O O O O
total O O O O
vessel O O O O
wall O O O O
area O O O O
occupied O O O O
by O O O O
intervessel O O O O
pits O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
with O O O O
the O O O O
intervessel O O O O
contact O O O O
length O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
no O O O O
significant O O O O
correlation O O O O
occurred O O O O
between O O O O
the O O O O
ionic O O O O
effect O O O O
and O O O O
total O O O O
intervessel O O O O
pit O O O O
membrane O O O O
area O O O O
per O O O O
vessel O O O O
, O O O O
vessel O O O O
diameter O O O O
, O O O O
vessel O O O O
length O O O O
, O O O O
vessel O O O O
wall O O O O
area O O O O
, O O O O
and O O O O
intervessel O O O O
pit O O O O
membrane O O O O
thickness O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Quantitative O O O O
vessel O O O O
and O O O O
pit O O O O
characters O O O O
are O O O O
suggested O O O O
to O O O O
contribute O O O O
to O O O O
interspecific O O O O
variation O O O O
of O O O O
the O O O O
ionic O O O O
effect O O O O
, O O O O
whereas O O O O
chemical O O O O
properties O O O O
of O O O O
intervessel O O O O
pit O O O O
membranes O O O O
are O O O O
likely O O O O
to O O O O
play O O O O
an O O O O
additional O O O O
role O O O O
. O O O O
    
Identification O O O O
and O O O O
characterization O O O O
of O O O O
genes O O O O
responsible O O O O
for O O O O
biosynthesis O O O O
of O O O O
kojic O O O O
acid O O O O
, O O O O
an O O O O
industrially O O O O
important O O O O
compound O O O O
from O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
oryzae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Kojic O O O O
acid O O O O
is O O O O
produced O O O O
in O O O O
large O O O O
amounts O O O O
by O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
oryzae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
as O O O O
a O O O O
secondary O O O O
metabolite O O O O
and O O O O
is O O O O
widely O O O O
used O O O O
in O O O O
the O O O O
cosmetic O O O O
industry O O O O
. O O O O
    
Glucose O O O O
can O O O O
be O O O O
converted O O O O
to O O O O
kojic O O O O
acid O O O O
, O O O O
perhaps O O O O
by O O O O
only O O O O
a O O O O
few O O O O
steps O O O O
, O O O O
but O O O O
no O O O O
genes O O O O
for O O O O
the O O O O
conversion O O O O
have O O O O
thus O O O O
far O O O O
been O O O O
revealed O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
a O O O O
DNA O O O O
microarray O O O O
, O O O O
gene O O O O
expression O O O O
profiles O O O O
under O O O O
three O O O O
pairs O O O O
of O O O O
conditions O O O O
significantly O O O O
affecting O O O O
kojic O O O O
acid O O O O
production O O O O
were O O O O
compared O O O O
. O O O O
    
All O O O O
genes O O O O
were O O O O
ranked O O O O
using O O O O
an O O O O
index O O O O
parameter O O O O
reflecting O O O O
both O O O O
high O O O O
amounts O O O O
of O O O O
transcription O O O O
and O O O O
a O O O O
high O O O O
induction O O O O
ratio O O O O
under O O O O
producing O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
After O O O O
disruption O O O O
of O O O O
nine O O O O
candidate O O O O
genes O O O O
selected O O O O
from O O O O
the O O O O
top O O O O
of O O O O
the O O O O
list O O O O
, O O O O
two O O O O
genes O O O O
of O O O O
unknown O O O O
function O O O O
were O O O O
found O O O O
to O O O O
be O O O O
responsible O O O O
for O O O O
kojic O O O O
acid O O O O
biosynthesis O O O O
, O O O O
one O O O O
having O O O O
an O O O O
oxidoreductase O O O O
motif O O O O
and O O O O
the O O O O
other O O O O
a O O O O
transporter O O O O
motif O O O O
. O O O O
    
These O O O O
two O O O O
genes O O O O
are O O O O
closely O O O O
associated O O O O
in O O O O
the O O O O
genome O O O O
, O O O O
showing O O O O
typical O O O O
characteristics O O O O
of O O O O
genes O O O O
involved O O O O
in O O O O
secondary O O O O
metabolism O O O O
. O O O O
    
Identification O O O O
of O O O O
the O O O O
structural O O O O
proteins O O O O
of O O O O
VP1 O O O O
and O O O O
VP2 O O O O
of O O O O
a O O O O
novel O O O O
mud B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
crab O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
dicistrovirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Mud B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
crab O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
dicistrovirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
MCDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
, O O O O
a O O O O
newly O O O O
identified O O O O
single O O O O
- O O O O
stranded O O O O
positive O O O O
RNA O O O O
virus O O O O
, O O O O
is O O O O
an O O O O
important O O O O
pathogen O O O O
that O O O O
causes O O O O
serious O O O O
economic O O O O
losses O O O O
to O O O O
mud B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
crab O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
aquaculture O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
MCDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
was O O O O
purified O O O O
, O O O O
and O O O O
three O O O O
structural O O O O
proteins O O O O
of O O O O
MCDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
were O O O O
separated O O O O
by O O O O
SDS O O O O
- O O O O
PAGE O O O O
. O O O O
    
The O O O O
N O O O O
- O O O O
terminal O O O O
15 O O O O
amino O O O O
acids O O O O
were O O O O
sequenced O O O O
and O O O O
aligned O O O O
with O O O O
the O O O O
main O O O O
structural O O O O
proteins O O O O
of O O O O
other O O O O
dicistrovirus O O O O
. O O O O
    
The O O O O
three O O O O
structural O O O O
proteins O O O O
were O O O O
named O O O O
VP1 O O O O
, O O O O
VP2 O O O O
and O O O O
VP3 O O O O
. O O O O
    
Monoclonal O O O O
antibodies O O O O
( O O O O
MAbs O O O O
) O O O O
against O O O O
the O O O O
two O O O O
main O O O O
structural O O O O
proteins O O O O
, O O O O
VP1 O O O O
and O O O O
VP2 O O O O
, O O O O
were O O O O
prepared O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
two O O O O
structural O O O O
proteins O O O O
were O O O O
then O O O O
identified O O O O
using O O O O
these O O O O
MAbs O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
of O O O O
Western O O O O
blot O O O O
analyses O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
five O O O O
MAbs O O O O
recognised O O O O
VP1 O O O O
and O O O O
two O O O O
recognised O O O O
VP2 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
of O O O O
immunogold O O O O
transmission O O O O
electron O O O O
microscopy O O O O
( O O O O
IEM O O O O
) O O O O
revealed O O O O
that O O O O
the O O O O
epitopes O O O O
of O O O O
the O O O O
two O O O O
structural O O O O
proteins O O O O
recognised O O O O
by O O O O
the O O O O
MAbs O O O O
were O O O O
located O O O O
at O O O O
the O O O O
outer O O O O
surface O O O O
of O O O O
the O O O O
virions O O O O
, O O O O
which O O O O
suggested O O O O
that O O O O
the O O O O
two O O O O
structural O O O O
proteins O O O O
are O O O O
MCDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
capsid O O O O
proteins O O O O
. O O O O
    
The O O O O
identification O O O O
of O O O O
the O O O O
two O O O O
structural O O O O
proteins O O O O
of O O O O
MCDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
is O O O O
useful O O O O
for O O O O
studying O O O O
their O O O O
functions O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
the O O O O
mechanism O O O O
of O O O O
infection O O O O
and O O O O
the O O O O
pathogenesis O O O O
of O O O O
MCDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
SGT1 O O O O
contributes O O O O
to O O O O
coronatine O O O O
signaling O O O O
and O O O O
Pseudomonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
syringae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pv O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tomato O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
disease O O O O
symptom O O O O
development O O O O
in O O O O
tomato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
Arabidopsis O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Pseudomonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
syringae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pv O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tomato O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
DC3000 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Pst B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
DC3000 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
causes O O O O
an O O O O
economically O O O O
important O O O O
bacterial O O O O
speck O O O O
disease O O O O
on O O O O
tomato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
produces O O O O
symptoms O O O O
with O O O O
necrotic O O O O
lesions O O O O
surrounded O O O O
by O O O O
chlorosis O O O O
. O O O O
    
The O O O O
chlorosis O O O O
is O O O O
mainly O O O O
attributed O O O O
to O O O O
a O O O O
jasmonic O O O O
acid O O O O
( O O O O
JA O O O O
) O O O O
- O O O O
isoleucine O O O O
analogue O O O O
, O O O O
coronatine O O O O
( O O O O
COR O O O O
) O O O O
, O O O O
produced O O O O
by O O O O
Pst B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
DC3000 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
molecular O O O O
processes O O O O
underlying O O O O
lesion O O O O
development O O O O
and O O O O
COR O O O O
- O O O O
induced O O O O
chlorosis O O O O
are O O O O
poorly O O O O
understood O O O O
. O O O O
    
* O O O O
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
took O O O O
advantage O O O O
of O O O O
a O O O O
chlorotic O O O O
phenotype O O O O
elicited O O O O
by O O O O
COR O O O O
on O O O O
Nicotiana B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
benthamiana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
leaves O O O O
and O O O O
virus O O O O
- O O O O
induced O O O O
gene O O O O
silencing O O O O
( O O O O
VIGS O O O O
) O O O O
as O O O O
a O O O O
rapid O O O O
reverse O O O O
genetic O O O O
screening O O O O
tool O O O O
and O O O O
identified O O O O
a O O O O
role O O O O
for O O O O
SGT1 O O O O
( O O O O
suppressor O O O O
of O O O O
G2 O O O O
allele O O O O
of O O O O
skp1 O O O O
) O O O O
in O O O O
COR O O O O
- O O O O
induced O O O O
chlorosis O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Silencing O O O O
of O O O O
SGT1 O O O O
in O O O O
tomato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
resulted O O O O
in O O O O
reduction O O O O
of O O O O
disease O O O O
- O O O O
associated O O O O
symptoms O O O O
( O O O O
cell O O O O
death O O O O
and O O O O
chlorosis O O O O
) O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
a O O O O
molecular O O O O
connection O O O O
between O O O O
COR O O O O
- O O O O
induced O O O O
chlorosis O O O O
and O O O O
cell O O O O
death O O O O
. O O O O
    
In O O O O
Arabidopsis O O O O
, O O O O
AtSGT1b O O O O
but O O O O
not O O O O
AtSGT1a O O O O
was O O O O
required O O O O
for O O O O
COR O O O O
responses O O O O
, O O O O
including O O O O
root O O O O
growth O O O O
inhibition O O O O
and O O O O
Pst B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
DC3000 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
symptom O O O O
( O O O O
water O O O O
soaked O O O O
lesion O O O O
) O O O O
development O O O O
. O O O O
    
Notably O O O O
, O O O O
overexpression O O O O
of O O O O
AtSGT1b O O O O
did O O O O
not O O O O
alter O O O O
Pst B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
DC3000 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
symptoms O O O O
or O O O O
sensitivity O O O O
to O O O O
COR O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Taken O O O O
together O O O O
, O O O O
our O O O O
results O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
SGT1 O O O O
/ O O O O
SGT1b O O O O
is O O O O
required O O O O
for O O O O
COR O O O O
- O O O O
induced O O O O
chlorosis O O O O
and O O O O
subsequent O O O O
necrotic O O O O
disease O O O O
development O O O O
in O O O O
tomato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
Arabidopsis O O O O
. O O O O
    
SGT1 O O O O
is O O O O
therefore O O O O
a O O O O
component O O O O
of O O O O
the O O O O
COR O O O O
/ O O O O
JA O O O O
- O O O O
mediated O O O O
signal O O O O
transduction O O O O
pathway O O O O
. O O O O
    
Growth O O O O
- O O O O
mediated O O O O
stress O O O O
escape O O O O
: O O O O
convergence O O O O
of O O O O
signal O O O O
transduction O O O O
pathways O O O O
activated O O O O
upon O O O O
exposure O O O O
to O O O O
two O O O O
different O O O O
environmental O O O O
stresses O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Plants O O O O
can O O O O
escape O O O O
from O O O O
specific O O O O
environmental O O O O
stresses O O O O
through O O O O
active O O O O
growth O O O O
strategies O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
compared O O O O
two O O O O
such O O O O
stress O O O O
- O O O O
escape O O O O
syndromes O O O O
to O O O O
investigate O O O O
whether O O O O
plants O O O O
use O O O O
conserved O O O O
signal O O O O
transduction O O O O
pathways O O O O
to O O O O
escape O O O O
from O O O O
different O O O O
stresses O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Full O O O O
submergence O O O O
is O O O O
a O O O O
threat O O O O
to O O O O
terrestrial O O O O
plants O O O O
as O O O O
it O O O O
cuts O O O O
off O O O O
their O O O O
access O O O O
to O O O O
oxygen O O O O
and O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Proximate O O O O
neighbors O O O O
, O O O O
in O O O O
contrast O O O O
, O O O O
take O O O O
away O O O O
resources O O O O
such O O O O
as O O O O
light O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
submergence O O O O
and O O O O
shade O O O O
can O O O O
be O O O O
escaped O O O O
through O O O O
rapid O O O O
shoot O O O O
elongation O O O O
. O O O O
    
We O O O O
analysed O O O O
the O O O O
precise O O O O
kinetics O O O O
and O O O O
physiological O O O O
control O O O O
of O O O O
petiole O O O O
elongation O O O O
responses O O O O
to O O O O
shade O O O O
and O O O O
submergence O O O O
in O O O O
the O O O O
flood O O O O
- O O O O
tolerant O O O O
species O O O O
Rumex B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
palustris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
* O O O O
We O O O O
found O O O O
that O O O O
petiole O O O O
elongation O O O O
induced O O O O
by O O O O
submergence O O O O
and O O O O
that O O O O
induced O O O O
by O O O O
shade O O O O
occurred O O O O
with O O O O
similar O O O O
kinetics O O O O
, O O O O
both O O O O
involving O O O O
cell O O O O
expansion O O O O
. O O O O
    
These O O O O
responses O O O O
were O O O O
induced O O O O
by O O O O
two O O O O
different O O O O
signals O O O O
, O O O O
elevated O O O O
ethylene O O O O
and O O O O
a O O O O
reduced O O O O
red O O O O
: O O O O
far O O O O
- O O O O
red O O O O
light O O O O
ratio O O O O
( O O O O
R O O O O
: O O O O
FR O O O O
) O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
A O O O O
downstream O O O O
target O O O O
for O O O O
ethylene O O O O
was O O O O
abscisic O O O O
acid O O O O
, O O O O
but O O O O
low O O O O
R O O O O
: O O O O
FR O O O O
appeared O O O O
to O O O O
act O O O O
independently O O O O
of O O O O
this O O O O
hormone O O O O
. O O O O
    
Gibberellin O O O O
, O O O O
however O O O O
, O O O O
appeared O O O O
to O O O O
be O O O O
essential O O O O
to O O O O
both O O O O
ethylene O O O O
- O O O O
and O O O O
low O O O O
R O O O O
: O O O O
FR O O O O
- O O O O
induced O O O O
petiole O O O O
elongation O O O O
. O O O O
    
* O O O O
We O O O O
propose O O O O
that O O O O
gibberellin O O O O
and O O O O
expansins O O O O
, O O O O
a O O O O
family O O O O
of O O O O
cell O O O O
wall O O O O
- O O O O
loosening O O O O
proteins O O O O
, O O O O
represent O O O O
elements O O O O
of O O O O
a O O O O
conserved O O O O
growth O O O O
machinery O O O O
that O O O O
is O O O O
activated O O O O
by O O O O
stress O O O O
- O O O O
specific O O O O
signaling O O O O
events O O O O
to O O O O
regulate O O O O
escape O O O O
from O O O O
stress O O O O
. O O O O
    
PsOr1 O O O O
, O O O O
a O O O O
potential O O O O
target O O O O
for O O O O
RNA O O O O
interference O O O O
- O O O O
based O O O O
pest O O O O
management O O O O
. O O O O
    
Insect O O O O
pests O O O O
cause O O O O
billions O O O O
of O O O O
dollars O O O O
in O O O O
agricultural O O O O
losses O O O O
, O O O O
and O O O O
attempts O O O O
to O O O O
kill O O O O
them O O O O
have O O O O
resulted O O O O
in O O O O
growing O O O O
threats O O O O
from O O O O
insecticide O O O O
resistance O O O O
, O O O O
dietary O O O O
pesticide O O O O
pollution O O O O
and O O O O
environmental O O O O
destruction O O O O
. O O O O
    
New O O O O
approaches O O O O
to O O O O
control O O O O
refractory O O O O
insect O O O O
pests O O O O
are O O O O
therefore O O O O
needed O O O O
. O O O O
    
The O O O O
host O O O O
- O O O O
plant O O O O
preferences O O O O
of O O O O
insect O O O O
pests O O O O
rely O O O O
on O O O O
olfaction O O O O
and O O O O
are O O O O
mediated O O O O
via O O O O
a O O O O
seven O O O O
transmembrane O O O O
- O O O O
domain O O O O
odorant O O O O
receptor O O O O
( O O O O
Or O O O O
) O O O O
family O O O O
. O O O O
    
The O O O O
present O O O O
study O O O O
reports O O O O
the O O O O
cloning O O O O
and O O O O
characterization O O O O
of O O O O
PsOr1 O O O O
, O O O O
the O O O O
first O O O O
candidate O O O O
member O O O O
of O O O O
the O O O O
Or O O O O
gene O O O O
family O O O O
from O O O O
Phyllotreta B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
striolata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
a O O O O
devastating O O O O
beetle O O O O
pest O O O O
that O O O O
causes O O O O
damage O O O O
worldwide O O O O
. O O O O
    
PsOr1 O O O O
is O O O O
remarkably O O O O
well O O O O
conserved O O O O
with O O O O
respect O O O O
to O O O O
other O O O O
insect O O O O
orthologues O O O O
, O O O O
including O O O O
DmOr83b O O O O
from O O O O
Drosophila B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
melanogaster O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
These O O O O
insect O O O O
orthologues O O O O
form O O O O
an O O O O
essential O O O O
non O O O O
- O O O O
conventional O O O O
Or O O O O
sub O O O O
- O O O O
family O O O O
and O O O O
may O O O O
play O O O O
an O O O O
important O O O O
and O O O O
generalized O O O O
role O O O O
in O O O O
insect O O O O
olfaction O O O O
. O O O O
    
We O O O O
designed O O O O
double O O O O
- O O O O
stranded O O O O
( O O O O
ds O O O O
) O O O O
RNA O O O O
directly O O O O
against O O O O
the O O O O
PsOr1 O O O O
gene O O O O
and O O O O
exploited O O O O
RNA O O O O
interference O O O O
( O O O O
RNAi O O O O
) O O O O
to O O O O
control O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
striolata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
chemotactic O O O O
behavioural O O O O
measurements O O O O
showed O O O O
that O O O O
adult O O O O
beetles O O O O
were O O O O
unable O O O O
to O O O O
sense O O O O
the O O O O
attractant O O O O
or O O O O
repellent O O O O
odour O O O O
stimulus O O O O
after O O O O
microinjection O O O O
of O O O O
dsRNA O O O O
against O O O O
PsOr1 O O O O
. O O O O
    
Reverse O O O O
Transcription O O O O
( O O O O
RT O O O O
) O O O O
- O O O O
PCR O O O O
analysis O O O O
showed O O O O
specific O O O O
down O O O O
- O O O O
regulation O O O O
of O O O O
mRNA O O O O
transcript O O O O
levels O O O O
for O O O O
this O O O O
gene O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
host O O O O
- O O O O
plant O O O O
preference O O O O
experiments O O O O
confirmed O O O O
that O O O O
silencing O O O O
PsOr1 O O O O
by O O O O
RNAi O O O O
treatment O O O O
impaired O O O O
the O O O O
host O O O O
- O O O O
plant O O O O
preferences O O O O
of O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
striolata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
for O O O O
cruciferous O O O O
vegetables O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
this O O O O
insect O O O O
control O O O O
approach O O O O
of O O O O
using O O O O
RNAi O O O O
to O O O O
target O O O O
PsOr1 O O O O
and O O O O
its O O O O
orthologues O O O O
might O O O O
be O O O O
effective O O O O
in O O O O
blocking O O O O
host O O O O
- O O O O
plant O O O O
- O O O O
seeking O O O O
behaviours O O O O
in O O O O
diverse O O O O
insect O O O O
pests O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
also O O O O
support O O O O
the O O O O
theory O O O O
that O O O O
this O O O O
unique O O O O
receptor O O O O
type O O O O
plays O O O O
an O O O O
essential O O O O
general O O O O
role O O O O
in O O O O
insect O O O O
olfaction O O O O
. O O O O
    
Expression O O O O
of O O O O
diverse O O O O
midgut O O O O
serine O O O O
proteinases O O O O
in O O O O
the O O O O
sericigenous O O O O
Lepidoptera O O O O
Antheraea B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
assamensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Helfer O O O O
) O O O O
is O O O O
influenced O O O O
by O O O O
choice O O O O
of O O O O
host O O O O
plant O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Antheraea B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
assamensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
reared O O O O
on O O O O
various O O O O
species O O O O
of O O O O
the O O O O
Lauraceae O O O O
family O O O O
from O O O O
north O O O O
- O O O O
east O O O O
India O O O O
for O O O O
its O O O O
distinctive O O O O
cocoon O O O O
silk O O O O
. O O O O
    
We O O O O
demonstrate O O O O
differential O O O O
expression O O O O
of O O O O
digestive O O O O
trypsin O O O O
and O O O O
chymotrypsins O O O O
in O O O O
larvae O O O O
feeding O O O O
on O O O O
a O O O O
primary O O O O
host O O O O
, O O O O
Persea B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bombycina O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Kosterm O O O O
. O O O O
, O O O O
in O O O O
comparison O O O O
to O O O O
larvae O O O O
feeding O O O O
on O O O O
Litsea B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
monopetala O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Roxb O O O O
. O O O O
using O O O O
in O O O O
vitro O O O O
proteolytic O O O O
assays O O O O
, O O O O
zymogram O O O O
analyses O O O O
with O O O O
proteinase O O O O
inhibitors O O O O
, O O O O
restriction O O O O
digestion O O O O
of O O O O
RNA O O O O
- O O O O
PCR O O O O
amplicons O O O O
and O O O O
quantitative O O O O
real O O O O
- O O O O
time O O O O
PCR O O O O
( O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Eight O O O O
novel O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
serine O O O O
proteinase O O O O
gene O O O O
family O O O O
were O O O O
identified O O O O
, O O O O
including O O O O
an O O O O
intron O O O O
- O O O O
spliced O O O O
trypsin O O O O
( O O O O
AaPb4 O O O O
) O O O O
and O O O O
seven O O O O
putative O O O O
chymotrypsins O O O O
( O O O O
AaPb2 O O O O
, O O O O
AaPb4 O O O O
, O O O O
AaPb12 O O O O
, O O O O
AaLm4 O O O O
, O O O O
AaLm6 O O O O
, O O O O
AaLm19 O O O O
and O O O O
AaLm29 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Midgut O O O O
transcript O O O O
levels O O O O
of O O O O
the O O O O
putative O O O O
trypsin O O O O
were O O O O
higher O O O O
in O O O O
larvae O O O O
fed O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bombycina O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
whereas O O O O
levels O O O O
of O O O O
transcripts O O O O
encoding O O O O
putative O O O O
chymotrypsins O O O O
were O O O O
higher O O O O
in O O O O
larvae O O O O
reared O O O O
on O O O O
L B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
monopetala O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Complex O O O O
, O O O O
differential O O O O
expression O O O O
of O O O O
sequence O O O O
divergent O O O O
midgut O O O O
serine O O O O
proteinases O O O O
may O O O O
reflect O O O O
the O O O O
ability O O O O
of O O O O
lepidopteran O O O O
larvae O O O O
to O O O O
feed O O O O
on O O O O
different O O O O
species O O O O
of O O O O
host O O O O
plants O O O O
. O O O O
    
Possible O O O O
implications O O O O
of O O O O
host O O O O
plant O O O O
choice O O O O
on O O O O
the O O O O
digestive O O O O
physiology O O O O
of O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
assamensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
are O O O O
discussed O O O O
. O O O O
    
Functional O O O O
test O O O O
of O O O O
the O O O O
influence O O O O
of O O O O
Wolbachia O O O O
genes O O O O
on O O O O
cytoplasmic O O O O
incompatibility O O O O
expression O O O O
in O O O O
Drosophila B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
melanogaster O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Wolbachia O O O O
are O O O O
inherited O O O O
intracellular O O O O
bacteria O O O O
that O O O O
infect O O O O
a O O O O
broad O O O O
range O O O O
of O O O O
invertebrate O O O O
hosts O O O O
. O O O O
    
They O O O O
commonly O O O O
manipulate O O O O
host O O O O
reproduction O O O O
in O O O O
a O O O O
variety O O O O
of O O O O
ways O O O O
and O O O O
thereby O O O O
favour O O O O
their O O O O
invasion O O O O
into O O O O
host O O O O
populations O O O O
. O O O O
    
While O O O O
the O O O O
biology O O O O
of O O O O
Wolbachia O O O O
has O O O O
been O O O O
extensively O O O O
studied O O O O
at O O O O
the O O O O
ecological O O O O
and O O O O
phenotypic O O O O
level O O O O
, O O O O
little O O O O
is O O O O
known O O O O
about O O O O
the O O O O
molecular O O O O
mechanisms O O O O
underlying O O O O
the O O O O
interaction O O O O
between O O O O
Wolbachia O O O O
and O O O O
their O O O O
hosts O O O O
. O O O O
    
Recent O O O O
comparative O O O O
genomics O O O O
studies O O O O
of O O O O
Wolbachia O O O O
strains O O O O
have O O O O
revealed O O O O
putative O O O O
candidate O O O O
genes O O O O
involved O O O O
in O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
cytoplasmic O O O O
incompatibility O O O O
( O O O O
CI O O O O
) O O O O
in O O O O
insects O O O O
. O O O O
    
However O O O O
the O O O O
functional O O O O
testing O O O O
of O O O O
these O O O O
genes O O O O
is O O O O
hindered O O O O
by O O O O
the O O O O
lack O O O O
of O O O O
available O O O O
genetic O O O O
tools O O O O
in O O O O
Wolbachia O O O O
. O O O O
    
To O O O O
circumvent O O O O
this O O O O
problem O O O O
we O O O O
generated O O O O
transgenic O O O O
Drosophila O O O O
lines O O O O
expressing O O O O
various O O O O
Wolbachia O O O O
CI O O O O
candidate O O O O
genes O O O O
under O O O O
the O O O O
control O O O O
of O O O O
the O O O O
GAL4 O O O O
/ O O O O
UAS O O O O
system O O O O
in O O O O
order O O O O
to O O O O
evaluate O O O O
their O O O O
possible O O O O
role O O O O
in O O O O
Wolbachia O O O O
- O O O O
related O O O O
phenotypes O O O O
in O O O O
Drosophila O O O O
. O O O O
    
The O O O O
expression O O O O
of O O O O
a O O O O
number O O O O
of O O O O
these O O O O
genes O O O O
in O O O O
Drosophila B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
melanogaster O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
failed O O O O
to O O O O
mimic O O O O
or O O O O
alter O O O O
CI O O O O
phenotypes O O O O
across O O O O
a O O O O
range O O O O
of O O O O
Wolbachia O O O O
backgrounds O O O O
or O O O O
in O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
Wolbachia O O O O
. O O O O
    
Differential O O O O
transcription O O O O
of O O O O
two O O O O
highly O O O O
divergent O O O O
gut O O O O
- O O O O
expressed O O O O
Bm86 O O O O
antigen O O O O
gene O O O O
homologues O O O O
in O O O O
the O O O O
tick O O O O
Rhipicephalus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
appendiculatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Acari O O O O
: O O O O
Ixodida O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
transcriptional O O O O
control O O O O
of O O O O
gene O O O O
expression O O O O
is O O O O
not O O O O
well O O O O
documented O O O O
in O O O O
the O O O O
Arthropoda O O O O
. O O O O
    
We O O O O
describe O O O O
transcriptional O O O O
analysis O O O O
of O O O O
two O O O O
exceptionally O O O O
divergent O O O O
homologues O O O O
( O O O O
Ra86 O O O O
) O O O O
of O O O O
the O O O O
Bm86 O O O O
gut O O O O
antigen O O O O
from O O O O
Rhipicephalus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
appendiculatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Bm86 O O O O
forms O O O O
the O O O O
basis O O O O
of O O O O
a O O O O
commercial O O O O
vaccine O O O O
for O O O O
the O O O O
control O O O O
of O O O O
Rhipicephalus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Boophilus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
microplus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
R B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
appendiculatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Ra86 O O O O
proteins O O O O
contain O O O O
654 O O O O
and O O O O
693 O O O O
amino O O O O
acids O O O O
, O O O O
with O O O O
only O O O O
80 O O O O
% O O O O
amino O O O O
acid O O O O
sequence O O O O
identity O O O O
. O O O O
    
Reverse O O O O
- O O O O
transcription O O O O
PCR O O O O
of O O O O
gut O O O O
cDNA O O O O
showed O O O O
transcription O O O O
of O O O O
only O O O O
one O O O O
genotype O O O O
in O O O O
individual O O O O
female O O O O
ticks O O O O
. O O O O
    
PCR O O O O
amplification O O O O
of O O O O
3 O O O O
' O O O O
untranslated O O O O
sequences O O O O
from O O O O
genomic O O O O
DNA O O O O
indicated O O O O
that O O O O
both O O O O
variants O O O O
could O O O O
be O O O O
encoded O O O O
within O O O O
a O O O O
single O O O O
genome O O O O
. O O O O
    
When O O O O
both O O O O
variants O O O O
were O O O O
present O O O O
, O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
two O O O O
Ra86 O O O O
genotypes O O O O
was O O O O
transcriptionally O O O O
dominant O O O O
. O O O O
    
Detection O O O O
and O O O O
quantitation O O O O
of O O O O
infectious O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
adenoviruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
JC B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
polyomaviruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
water O O O O
by O O O O
immunofluorescence O O O O
assay O O O O
. O O O O
    
Human O O O O
adenoviruses O O O O
( O O O O
HAdV O O O O
) O O O O
and O O O O
JC O O O O
polyomaviruses O O O O
( O O O O
JCPyV O O O O
) O O O O
have O O O O
been O O O O
proposed O O O O
as O O O O
markers O O O O
of O O O O
fecal O O O O
/ O O O O
urine O O O O
contamination O O O O
of O O O O
human O O O O
origin O O O O
. O O O O
    
An O O O O
indirect O O O O
immunofluorescence O O O O
assay O O O O
has O O O O
been O O O O
developed O O O O
to O O O O
quantify O O O O
infectious O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
adenoviruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
types O O O O
2 O O O O
and O O O O
41 O O O O
and O O O O
JC B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
polyomaviruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O O O O
Mad O O O O
- O O O O
4 O O O O
in O O O O
water O O O O
samples O O O O
. O O O O
    
The O O O O
immunofluorescence O O O O
assay O O O O
was O O O O
compared O O O O
with O O O O
other O O O O
quantitative O O O O
techniques O O O O
used O O O O
commonly O O O O
such O O O O
as O O O O
plaque O O O O
assay O O O O
, O O O O
tissue O O O O
culture O O O O
infectious O O O O
dose O O O O
- O O O O
50 O O O O
and O O O O
quantitative O O O O
PCR O O O O
( O O O O
qPCR O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
immunofluorescence O O O O
assays O O O O
showed O O O O
to O O O O
be O O O O
specific O O O O
for O O O O
the O O O O
detection O O O O
of O O O O
infectious O O O O
viruses O O O O
, O O O O
obtaining O O O O
negative O O O O
results O O O O
when O O O O
UV O O O O
or O O O O
heat O O O O
- O O O O
inactivated O O O O
viruses O O O O
were O O O O
analyzed O O O O
. O O O O
    
The O O O O
assays O O O O
required O O O O
less O O O O
time O O O O
and O O O O
showed O O O O
higher O O O O
sensitivity O O O O
for O O O O
the O O O O
detection O O O O
of O O O O
infectious O O O O
viral O O O O
particles O O O O
than O O O O
other O O O O
cell O O O O
culture O O O O
techniques O O O O
( O O O O
1 O O O O
log O O O O
( O O O O
10 O O O O
) O O O O
more O O O O
) O O O O
evaluated O O O O
. O O O O
    
River O O O O
water O O O O
samples O O O O
spiked O O O O
previously O O O O
with O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
adenoviruses O O O O
and O O O O
raw O O O O
sewage O O O O
samples O O O O
were O O O O
also O O O O
analyzed O O O O
using O O O O
the O O O O
proposed O O O O
immunofluorescence O O O O
assay O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
by O O O O
qPCR O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
show O O O O
quantitations O O O O
with O O O O
2 O O O O
log O O O O
( O O O O
10 O O O O
) O O O O
reduction O O O O
in O O O O
the O O O O
numbers O O O O
of O O O O
infectious O O O O
viruses O O O O
compared O O O O
with O O O O
the O O O O
number O O O O
of O O O O
genome O O O O
copies O O O O
detected O O O O
by O O O O
qPCR O O O O
. O O O O
    
The O O O O
immunofluorescence O O O O
assay O O O O
developed O O O O
is O O O O
fast O O O O
, O O O O
sensitive O O O O
, O O O O
specific O O O O
, O O O O
and O O O O
a O O O O
standardizable O O O O
technique O O O O
for O O O O
the O O O O
quantitation O O O O
and O O O O
detection O O O O
of O O O O
infectious O O O O
viruses O O O O
in O O O O
water O O O O
samples O O O O
. O O O O
    
Expression O O O O
of O O O O
the O O O O
C O O O O
- O O O O
terminal O O O O
ORF2 O O O O
protein O O O O
of O O O O
duck B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
astrovirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
for O O O O
application O O O O
in O O O O
a O O O O
serological O O O O
test O O O O
. O O O O
    
Duck B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
astrovirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
DAstV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
is O O O O
an O O O O
important O O O O
pathogen O O O O
causing O O O O
duck O O O O
viral O O O O
hepatitis O O O O
( O O O O
DVH O O O O
) O O O O
, O O O O
a O O O O
highly O O O O
contagious O O O O
and O O O O
fatal O O O O
disease O O O O
in O O O O
young O O O O
ducklings O O O O
. O O O O
    
To O O O O
provide O O O O
an O O O O
antigen O O O O
for O O O O
a O O O O
diagnostic O O O O
serum O O O O
test O O O O
, O O O O
the O O O O
C O O O O
- O O O O
terminus O O O O
of O O O O
DAstV O O O O
ORF2 O O O O
protein O O O O
was O O O O
expressed O O O O
in O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Four O O O O
positive O O O O
and O O O O
30 O O O O
negative O O O O
sera O O O O
were O O O O
used O O O O
to O O O O
validate O O O O
the O O O O
purified O O O O
ORF2 O O O O
protein O O O O
by O O O O
developing O O O O
an O O O O
indirect O O O O
enzyme O O O O
- O O O O
linked O O O O
immunosorbent O O O O
assay O O O O
( O O O O
ELISA O O O O
) O O O O
. O O O O
    
No O O O O
cross O O O O
- O O O O
reactions O O O O
were O O O O
found O O O O
against O O O O
other O O O O
duck O O O O
pathogens O O O O
, O O O O
including O O O O
duck B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
hepatitis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
duck B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
plague O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
herpesvirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
duck B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
reovirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Newcastle B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
disease O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
Riemerella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
anatipestifer O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
12 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
19 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
63 O O O O
. O O O O
2 O O O O
% O O O O
) O O O O
and O O O O
26 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
51 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
51 O O O O
% O O O O
) O O O O
sera O O O O
samples O O O O
from O O O O
two O O O O
flocks O O O O
of O O O O
ducks O O O O
that O O O O
survived O O O O
DAstV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infections O O O O
in O O O O
commercial O O O O
duck O O O O
farms O O O O
were O O O O
positive O O O O
for O O O O
DAstV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
by O O O O
this O O O O
method O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
Interestingly O O O O
, O O O O
DAstV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
specific O O O O
antibodies O O O O
were O O O O
also O O O O
detected O O O O
in O O O O
12 O O O O
( O O O O
28 O O O O
. O O O O
6 O O O O
% O O O O
) O O O O
of O O O O
42 O O O O
sera O O O O
samples O O O O
from O O O O
a O O O O
different O O O O
flock O O O O
without O O O O
DVH O O O O
, O O O O
indicating O O O O
a O O O O
wide O O O O
distribution O O O O
of O O O O
subclinical O O O O
infections O O O O
caused O O O O
by O O O O
DAstV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
A O O O O
fundamental O O O O
, O O O O
eco O O O O
- O O O O
hydrological O O O O
basis O O O O
for O O O O
niche O O O O
segregation O O O O
in O O O O
plant O O O O
communities O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Ecologists O O O O
still O O O O
puzzle O O O O
over O O O O
how O O O O
plant O O O O
species O O O O
manage O O O O
to O O O O
coexist O O O O
with O O O O
one O O O O
another O O O O
while O O O O
competing O O O O
for O O O O
the O O O O
same O O O O
essential O O O O
resources O O O O
. O O O O
    
The O O O O
classic O O O O
answer O O O O
for O O O O
animal O O O O
communities O O O O
is O O O O
that O O O O
species O O O O
occupy O O O O
different O O O O
niches O O O O
, O O O O
but O O O O
how O O O O
plants O O O O
do O O O O
this O O O O
is O O O O
more O O O O
difficult O O O O
to O O O O
determine O O O O
. O O O O
    
We O O O O
previously O O O O
found O O O O
niche O O O O
segregation O O O O
along O O O O
fine O O O O
- O O O O
scale O O O O
hydrological O O O O
gradients O O O O
in O O O O
European O O O O
wet O O O O
meadows O O O O
and O O O O
proposed O O O O
that O O O O
the O O O O
mechanism O O O O
might O O O O
be O O O O
a O O O O
general O O O O
one O O O O
, O O O O
especially O O O O
in O O O O
communities O O O O
that O O O O
experience O O O O
seasonal O O O O
saturation O O O O
. O O O O
    
* O O O O
We O O O O
quantified O O O O
the O O O O
hydrological O O O O
niches O O O O
of O O O O
96 O O O O
species O O O O
from O O O O
eight O O O O
fynbos O O O O
communities O O O O
in O O O O
the O O O O
biodiversity O O O O
hotspot O O O O
of O O O O
the O O O O
Cape O O O O
Floristic O O O O
Region O O O O
, O O O O
South O O O O
Africa O O O O
and O O O O
99 O O O O
species O O O O
from O O O O
18 O O O O
lowland O O O O
wet O O O O
meadow O O O O
communities O O O O
in O O O O
the O O O O
UK O O O O
. O O O O
    
Niche O O O O
overlap O O O O
was O O O O
computed O O O O
for O O O O
all O O O O
combinations O O O O
of O O O O
species O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Despite O O O O
the O O O O
extreme O O O O
functional O O O O
and O O O O
phylogenetic O O O O
differences O O O O
between O O O O
the O O O O
fynbos O O O O
and O O O O
wet O O O O
meadow O O O O
communities O O O O
, O O O O
an O O O O
identical O O O O
trade O O O O
- O O O O
off O O O O
( O O O O
i O O O O
. O O O O
e O O O O
. O O O O
specialization O O O O
of O O O O
species O O O O
towards O O O O
tolerance O O O O
of O O O O
aeration O O O O
and O O O O
/ O O O O
or O O O O
drying O O O O
stress O O O O
) O O O O
was O O O O
found O O O O
to O O O O
cause O O O O
segregation O O O O
along O O O O
fine O O O O
- O O O O
scale O O O O
hydrological O O O O
gradients O O O O
. O O O O
    
* O O O O
This O O O O
study O O O O
not O O O O
only O O O O
confirms O O O O
the O O O O
predicted O O O O
generality O O O O
of O O O O
hydrological O O O O
niche O O O O
segregation O O O O
, O O O O
but O O O O
also O O O O
emphasizes O O O O
its O O O O
importance O O O O
for O O O O
structuring O O O O
plant O O O O
communities O O O O
. O O O O
    
Eco O O O O
- O O O O
hydrological O O O O
niche O O O O
segregation O O O O
will O O O O
have O O O O
implications O O O O
for O O O O
conservation O O O O
in O O O O
habitats O O O O
that O O O O
face O O O O
changing O O O O
hydrology O O O O
caused O O O O
by O O O O
water O O O O
abstraction O O O O
and O O O O
climate O O O O
change O O O O
. O O O O
    
Role O O O O
of O O O O
lupeol O O O O
synthase O O O O
in O O O O
Lotus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
japonicus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nodule O O O O
formation O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Triterpenes O O O O
are O O O O
plant O O O O
secondary O O O O
metabolites O O O O
, O O O O
derived O O O O
from O O O O
the O O O O
cyclization O O O O
of O O O O
2 O O O O
, O O O O
3 O O O O
- O O O O
oxidosqualene O O O O
by O O O O
oxidosqualene O O O O
cyclases O O O O
( O O O O
OSCs O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
investigated O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
lupeol O O O O
synthase O O O O
, O O O O
encoded O O O O
by O O O O
OSC3 O O O O
, O O O O
and O O O O
its O O O O
product O O O O
, O O O O
lupeol O O O O
, O O O O
in O O O O
developing O O O O
roots O O O O
and O O O O
nodules O O O O
of O O O O
the O O O O
model O O O O
legume O O O O
Lotus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
japonicus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
* O O O O
The O O O O
expression O O O O
patterns O O O O
of O O O O
OSC3 O O O O
in O O O O
different O O O O
developmental O O O O
stages O O O O
of O O O O
uninfected O O O O
roots O O O O
and O O O O
in O O O O
roots O O O O
infected O O O O
with O O O O
Mesorhizobium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
loti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
were O O O O
determined O O O O
. O O O O
    
The O O O O
tissue O O O O
specificity O O O O
of O O O O
OSC3 O O O O
expression O O O O
was O O O O
analysed O O O O
by O O O O
in O O O O
situ O O O O
hybridization O O O O
. O O O O
    
Functional O O O O
analysis O O O O
, O O O O
in O O O O
which O O O O
transgenic O O O O
L B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
japonicus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
roots O O O O
silenced O O O O
for O O O O
OSC3 O O O O
were O O O O
generated O O O O
, O O O O
was O O O O
performed O O O O
. O O O O
    
The O O O O
absence O O O O
of O O O O
lupeol O O O O
in O O O O
the O O O O
silenced O O O O
plant O O O O
lines O O O O
was O O O O
determined O O O O
by O O O O
GC O O O O
- O O O O
MS O O O O
. O O O O
    
* O O O O
The O O O O
expression O O O O
of O O O O
ENOD40 O O O O
, O O O O
a O O O O
marker O O O O
gene O O O O
for O O O O
nodule O O O O
primordia O O O O
initiation O O O O
, O O O O
was O O O O
increased O O O O
significantly O O O O
in O O O O
the O O O O
OSC3 O O O O
- O O O O
silenced O O O O
plant O O O O
lines O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
lupeol O O O O
influences O O O O
nodule O O O O
formation O O O O
. O O O O
    
Silenced O O O O
plants O O O O
also O O O O
showed O O O O
a O O O O
more O O O O
rapid O O O O
nodulation O O O O
phenotype O O O O
, O O O O
consistent O O O O
with O O O O
this O O O O
. O O O O
    
Exogenous O O O O
application O O O O
of O O O O
lupeol O O O O
to O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
loti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O O O O
infected O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
plants O O O O
provided O O O O
further O O O O
evidence O O O O
for O O O O
a O O O O
negative O O O O
regulatory O O O O
effect O O O O
of O O O O
lupeol O O O O
on O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
ENOD40 O O O O
. O O O O
    
* O O O O
The O O O O
synthesis O O O O
of O O O O
lupeol O O O O
in O O O O
L B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
japonicus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
roots O O O O
and O O O O
nodules O O O O
can O O O O
be O O O O
solely O O O O
attributed O O O O
to O O O O
OSC3 O O O O
. O O O O
    
Taken O O O O
together O O O O
, O O O O
our O O O O
data O O O O
suggest O O O O
a O O O O
role O O O O
for O O O O
lupeol O O O O
biosynthesis O O O O
in O O O O
nodule O O O O
formation O O O O
through O O O O
the O O O O
regulation O O O O
of O O O O
ENOD40 O O O O
gene O O O O
expression O O O O
. O O O O
    
Drug O O O O
interactions O O O O
in O O O O
childhood O O O O
cancer O O O O
. O O O O
    
Children O O O O
with O O O O
cancer O O O O
are O O O O
increasingly O O O O
benefiting O O O O
from O O O O
new O O O O
treatment O O O O
strategies O O O O
and O O O O
advances O O O O
in O O O O
supportive O O O O
care O O O O
, O O O O
as O O O O
shown O O O O
by O O O O
improvements O O O O
in O O O O
both O O O O
survival O O O O
and O O O O
quality O O O O
- O O O O
of O O O O
- O O O O
life O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
continuous O O O O
emergence O O O O
of O O O O
new O O O O
cancer O O O O
drugs O O O O
and O O O O
supportive O O O O
- O O O O
care O O O O
drugs O O O O
has O O O O
increased O O O O
the O O O O
possibility O O O O
of O O O O
harmful O O O O
drug O O O O
interactions O O O O
; O O O O
health O O O O
- O O O O
care O O O O
providers O O O O
need O O O O
to O O O O
be O O O O
very O O O O
cautious O O O O
when O O O O
combining O O O O
drugs O O O O
. O O O O
    
We O O O O
discuss O O O O
the O O O O
most O O O O
common O O O O
interactions O O O O
between O O O O
chemotherapeutic O O O O
drugs O O O O
and O O O O
supportive O O O O
- O O O O
care O O O O
drugs O O O O
- O O O O
such O O O O
as O O O O
anticonvulsants O O O O
, O O O O
antiemetics O O O O
, O O O O
uric O O O O
- O O O O
acid O O O O
- O O O O
lowering O O O O
compounds O O O O
, O O O O
acid O O O O
suppressants O O O O
, O O O O
antimicrobials O O O O
, O O O O
and O O O O
pain O O O O
- O O O O
management O O O O
medications O O O O
in O O O O
paediatric O O O O
patients O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
review O O O O
the O O O O
interactions O O O O
between O O O O
chemotherapy O O O O
drugs O O O O
and O O O O
food O O O O
and O O O O
herbal O O O O
supplements O O O O
, O O O O
and O O O O
provide O O O O
recommendations O O O O
to O O O O
avoid O O O O
unwanted O O O O
and O O O O
potentially O O O O
fatal O O O O
interactions O O O O
in O O O O
children O O O O
with O O O O
cancer O O O O
. O O O O
    
Because O O O O
of O O O O
the O O O O
constant O O O O
release O O O O
of O O O O
new O O O O
drugs O O O O
, O O O O
health O O O O
- O O O O
care O O O O
providers O O O O
need O O O O
to O O O O
check O O O O
the O O O O
most O O O O
recent O O O O
references O O O O
before O O O O
making O O O O
recommendations O O O O
about O O O O
drug O O O O
interactions O O O O
. O O O O
    
Mutational O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
transmembrane O O O O
helix O O O O
2 O O O O
- O O O O
HAMP O O O O
domain O O O O
connection O O O O
in O O O O
the O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
aspartate O O O O
chemoreceptor O O O O
tar O O O O
. O O O O
    
Transmembrane O O O O
helix O O O O
2 O O O O
( O O O O
TM2 O O O O
) O O O O
of O O O O
the O O O O
Tar O O O O
chemoreceptor O O O O
undergoes O O O O
an O O O O
inward O O O O
piston O O O O
- O O O O
like O O O O
displacement O O O O
of O O O O
1 O O O O
to O O O O
3 O O O O
A O O O O
upon O O O O
binding O O O O
aspartate O O O O
. O O O O
    
This O O O O
signal O O O O
is O O O O
transmitted O O O O
to O O O O
the O O O O
kinase O O O O
- O O O O
control O O O O
module O O O O
via O O O O
the O O O O
HAMP O O O O
domain O O O O
. O O O O
    
Within O O O O
Tar O O O O
, O O O O
the O O O O
HAMP O O O O
domain O O O O
forms O O O O
a O O O O
parallel O O O O
four O O O O
- O O O O
helix O O O O
bundle O O O O
consisting O O O O
of O O O O
a O O O O
dimer O O O O
of O O O O
two O O O O
amphipathic O O O O
helices O O O O
connected O O O O
by O O O O
a O O O O
flexible O O O O
linker O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
nuclear O O O O
magnetic O O O O
resonance O O O O
structure O O O O
of O O O O
an O O O O
archaeal O O O O
HAMP O O O O
domain O O O O
, O O O O
residues O O O O
corresponding O O O O
to O O O O
the O O O O
MLLT O O O O
sequence O O O O
between O O O O
Arg O O O O
- O O O O
214 O O O O
at O O O O
the O O O O
end O O O O
of O O O O
TM2 O O O O
and O O O O
Pro O O O O
- O O O O
219 O O O O
of O O O O
Tar O O O O
are O O O O
an O O O O
N O O O O
- O O O O
terminal O O O O
helical O O O O
extension O O O O
of O O O O
AS1 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
modified O O O O
this O O O O
region O O O O
to O O O O
test O O O O
whether O O O O
it O O O O
behaves O O O O
as O O O O
a O O O O
continuous O O O O
helical O O O O
connection O O O O
between O O O O
TM2 O O O O
and O O O O
HAMP O O O O
. O O O O
    
First O O O O
, O O O O
one O O O O
to O O O O
four O O O O
Gly O O O O
residues O O O O
were O O O O
inserted O O O O
between O O O O
Thr O O O O
- O O O O
218 O O O O
and O O O O
Pro O O O O
- O O O O
219 O O O O
. O O O O
    
Second O O O O
, O O O O
the O O O O
MLLT O O O O
sequence O O O O
was O O O O
replaced O O O O
with O O O O
one O O O O
to O O O O
nine O O O O
Gly O O O O
residues O O O O
. O O O O
    
Third O O O O
, O O O O
the O O O O
sequence O O O O
was O O O O
shortened O O O O
or O O O O
extended O O O O
with O O O O
residues O O O O
compatible O O O O
with O O O O
helix O O O O
formation O O O O
. O O O O
    
Cells O O O O
expressing O O O O
receptors O O O O
in O O O O
which O O O O
the O O O O
MLLT O O O O
sequence O O O O
was O O O O
shortened O O O O
to O O O O
MLL O O O O
or O O O O
in O O O O
which O O O O
the O O O O
MLLT O O O O
sequence O O O O
was O O O O
replaced O O O O
by O O O O
four O O O O
Gly O O O O
residues O O O O
performed O O O O
good O O O O
aspartate O O O O
chemotaxis O O O O
. O O O O
    
Other O O O O
mutant O O O O
receptors O O O O
supported O O O O
diminished O O O O
aspartate O O O O
taxis O O O O
. O O O O
    
Most O O O O
mutant O O O O
receptors O O O O
had O O O O
biased O O O O
signal O O O O
outputs O O O O
and O O O O
/ O O O O
or O O O O
abnormal O O O O
patterns O O O O
of O O O O
adaptive O O O O
methylation O O O O
. O O O O
    
We O O O O
interpret O O O O
these O O O O
results O O O O
to O O O O
indicate O O O O
that O O O O
a O O O O
strong O O O O
, O O O O
permanent O O O O
helical O O O O
connection O O O O
between O O O O
TM2 O O O O
and O O O O
the O O O O
HAMP O O O O
domain O O O O
is O O O O
not O O O O
necessary O O O O
for O O O O
normal O O O O
transmembrane O O O O
signaling O O O O
. O O O O
    
Dissection O O O O
of O O O O
the O O O O
phytohormonal O O O O
regulation O O O O
of O O O O
trichome O O O O
formation O O O O
and O O O O
biosynthesis O O O O
of O O O O
the O O O O
antimalarial O O O O
compound O O O O
artemisinin O O O O
in O O O O
Artemisia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
annua O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
plants O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
* O O O O
Biosynthesis O O O O
of O O O O
the O O O O
sesquiterpene O O O O
lactone O O O O
and O O O O
potent O O O O
antimalarial O O O O
drug O O O O
artemisinin O O O O
occurs O O O O
in O O O O
glandular O O O O
trichomes O O O O
of O O O O
Artemisia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
annua O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
plants O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
is O O O O
subjected O O O O
to O O O O
a O O O O
strict O O O O
network O O O O
of O O O O
developmental O O O O
and O O O O
other O O O O
regulatory O O O O
cues O O O O
. O O O O
    
* O O O O
The O O O O
effects O O O O
of O O O O
three O O O O
hormones O O O O
, O O O O
jasmonate O O O O
, O O O O
gibberellin O O O O
and O O O O
cytokinin O O O O
, O O O O
were O O O O
studied O O O O
at O O O O
the O O O O
structural O O O O
and O O O O
molecular O O O O
levels O O O O
in O O O O
two O O O O
different O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
annua O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
chemotypes O O O O
by O O O O
microscopic O O O O
analysis O O O O
of O O O O
gland O O O O
development O O O O
, O O O O
and O O O O
by O O O O
targeted O O O O
metabolite O O O O
and O O O O
transcript O O O O
profiling O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
a O O O O
genome O O O O
- O O O O
wide O O O O
cDNA O O O O
- O O O O
amplified O O O O
fragment O O O O
length O O O O
polymorphism O O O O
( O O O O
AFLP O O O O
) O O O O
- O O O O
based O O O O
transcriptome O O O O
profiling O O O O
was O O O O
carried O O O O
out O O O O
of O O O O
jasmonate O O O O
- O O O O
elicited O O O O
leaves O O O O
at O O O O
different O O O O
developmental O O O O
stages O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Although O O O O
cytokinin O O O O
and O O O O
gibberellin O O O O
positively O O O O
affected O O O O
at O O O O
least O O O O
one O O O O
aspect O O O O
of O O O O
gland O O O O
formation O O O O
, O O O O
these O O O O
two O O O O
hormones O O O O
did O O O O
not O O O O
stimulate O O O O
artemisinin O O O O
biosynthesis O O O O
. O O O O
    
Only O O O O
jasmonate O O O O
simultaneously O O O O
promoted O O O O
gland O O O O
formation O O O O
and O O O O
coordinated O O O O
transcriptional O O O O
activation O O O O
of O O O O
biosynthetic O O O O
gene O O O O
expression O O O O
, O O O O
which O O O O
ultimately O O O O
led O O O O
to O O O O
increased O O O O
sesquiterpenoid O O O O
accumulation O O O O
with O O O O
chemotype O O O O
- O O O O
dependent O O O O
effects O O O O
on O O O O
the O O O O
distinct O O O O
pathway O O O O
branches O O O O
. O O O O
    
Transcriptome O O O O
profiling O O O O
revealed O O O O
a O O O O
trichome O O O O
- O O O O
specific O O O O
fatty O O O O
acyl O O O O
- O O O O
coenzyme O O O O
A O O O O
reductase O O O O
, O O O O
trichome O O O O
- O O O O
specific O O O O
fatty O O O O
acyl O O O O
- O O O O
CoA O O O O
reductase O O O O
1 O O O O
( O O O O
TFAR1 O O O O
) O O O O
, O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
which O O O O
correlates O O O O
with O O O O
trichome O O O O
development O O O O
and O O O O
sesquiterpenoid O O O O
biosynthesis O O O O
. O O O O
    
* O O O O
TFAR1 O O O O
is O O O O
potentially O O O O
involved O O O O
in O O O O
cuticular O O O O
wax O O O O
formation O O O O
during O O O O
glandular O O O O
trichome O O O O
expansion O O O O
in O O O O
leaves O O O O
and O O O O
flowers O O O O
of O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
annua O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
plants O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Analysis O O O O
of O O O O
phytohormone O O O O
- O O O O
modulated O O O O
transcriptional O O O O
regulons O O O O
provides O O O O
clues O O O O
to O O O O
dissect O O O O
the O O O O
concerted O O O O
regulation O O O O
of O O O O
metabolism O O O O
and O O O O
development O O O O
of O O O O
plant O O O O
trichomes O O O O
. O O O O
    
Climate O O O O
effects O O O O
on O O O O
population O O O O
fluctuations O O O O
of O O O O
the O O O O
white B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
throated O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
dipper O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Cinclus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cinclus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Climate O O O O
change O O O O
may O O O O
have O O O O
profound O O O O
consequences O O O O
for O O O O
many O O O O
organisms O O O O
. O O O O
    
We O O O O
have O O O O
studied O O O O
fluctuations O O O O
in O O O O
a O O O O
population O O O O
of O O O O
the O O O O
white B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
throated O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
dipper O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Cinclus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cinclus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
during O O O O
31 O O O O
years O O O O
( O O O O
1978 O O O O
- O O O O
2008 O O O O
) O O O O
in O O O O
a O O O O
river O O O O
system O O O O
in O O O O
southern O O O O
Norway O O O O
in O O O O
relation O O O O
to O O O O
both O O O O
large O O O O
- O O O O
scale O O O O
and O O O O
local O O O O
weather O O O O
conditions O O O O
occurring O O O O
during O O O O
the O O O O
non O O O O
- O O O O
breeding O O O O
season O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Multiple O O O O
regression O O O O
and O O O O
partial O O O O
least O O O O
squares O O O O
regression O O O O
were O O O O
used O O O O
to O O O O
model O O O O
the O O O O
growth O O O O
rate O O O O
of O O O O
the O O O O
population O O O O
, O O O O
accounting O O O O
for O O O O
population O O O O
size O O O O
in O O O O
the O O O O
previous O O O O
year O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Population O O O O
growth O O O O
was O O O O
influenced O O O O
by O O O O
North O O O O
Atlantic O O O O
Oscillation O O O O
( O O O O
NAO O O O O
) O O O O
, O O O O
mean O O O O
winter O O O O
temperature O O O O
, O O O O
precipitation O O O O
and O O O O
timing O O O O
of O O O O
ice O O O O
formation O O O O
on O O O O
the O O O O
main O O O O
lake O O O O
in O O O O
the O O O O
river O O O O
system O O O O
in O O O O
autumn O O O O
. O O O O
    
These O O O O
variables O O O O
explained O O O O
84 O O O O
% O O O O
of O O O O
the O O O O
variation O O O O
in O O O O
population O O O O
growth O O O O
over O O O O
the O O O O
31 O O O O
- O O O O
year O O O O
study O O O O
period O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Local O O O O
winter O O O O
conditions O O O O
played O O O O
a O O O O
prominent O O O O
role O O O O
in O O O O
explaining O O O O
the O O O O
population O O O O
fluctuations O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
plausible O O O O
because O O O O
the O O O O
dipper O O O O
depends O O O O
on O O O O
open O O O O
water O O O O
for O O O O
foraging O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
study O O O O
area O O O O
, O O O O
winters O O O O
can O O O O
be O O O O
harsh O O O O
and O O O O
rivers O O O O
and O O O O
lakes O O O O
may O O O O
freeze O O O O
and O O O O
severely O O O O
affect O O O O
the O O O O
subsequent O O O O
population O O O O
size O O O O
of O O O O
the O O O O
dipper O O O O
in O O O O
spring O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
breeding O O O O
population O O O O
of O O O O
the O O O O
dipper O O O O
does O O O O
not O O O O
seem O O O O
yet O O O O
to O O O O
have O O O O
reached O O O O
a O O O O
level O O O O
where O O O O
all O O O O
possible O O O O
territories O O O O
in O O O O
the O O O O
area O O O O
have O O O O
been O O O O
occupied O O O O
, O O O O
even O O O O
after O O O O
mild O O O O
winters O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
estimated O O O O
carrying O O O O
capacity O O O O
is O O O O
also O O O O
decidedly O O O O
lower O O O O
( O O O O
66 O O O O
breeding O O O O
pairs O O O O
) O O O O
than O O O O
the O O O O
number O O O O
of O O O O
available O O O O
territories O O O O
. O O O O
    
If O O O O
the O O O O
trend O O O O
of O O O O
milder O O O O
winters O O O O
continues O O O O
, O O O O
the O O O O
population O O O O
might O O O O
increase O O O O
in O O O O
the O O O O
future O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
strong O O O O
climate O O O O
variation O O O O
is O O O O
expected O O O O
to O O O O
continue O O O O
in O O O O
the O O O O
future O O O O
, O O O O
and O O O O
hence O O O O
periods O O O O
of O O O O
rapid O O O O
growth O O O O
of O O O O
the O O O O
dipper O O O O
population O O O O
will O O O O
probably O O O O
be O O O O
followed O O O O
by O O O O
severe O O O O
declines O O O O
. O O O O
    
Interference O O O O
from O O O O
long B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tailed O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
finches O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
constrains O O O O
reproduction O O O O
in O O O O
the O O O O
endangered O O O O
Gouldian B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
finch O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Interspecific O O O O
interference O O O O
competition O O O O
for O O O O
nest O O O O
- O O O O
sites O O O O
among O O O O
cavity O O O O
- O O O O
nesting O O O O
birds O O O O
can O O O O
have O O O O
important O O O O
effects O O O O
on O O O O
reproductive O O O O
fitness O O O O
and O O O O
the O O O O
distribution O O O O
of O O O O
competing O O O O
species O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
observed O O O O
interference O O O O
at O O O O
nest O O O O
- O O O O
sites O O O O
in O O O O
free O O O O
- O O O O
living O O O O
populations O O O O
of O O O O
the O O O O
endangered O O O O
Gouldian B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
finch O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Erythrura B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
gouldiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
and O O O O
sympatric O O O O
long B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tailed O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
finch O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Poephila B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
acuticauda O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
, O O O O
and O O O O
also O O O O
experimentally O O O O
tested O O O O
the O O O O
relative O O O O
strength O O O O
and O O O O
effect O O O O
of O O O O
interference O O O O
at O O O O
nest O O O O
- O O O O
sites O O O O
in O O O O
captive O O O O
populations O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Levels O O O O
of O O O O
competitive O O O O
interference O O O O
at O O O O
nest O O O O
- O O O O
sites O O O O
in O O O O
the O O O O
wild O O O O
were O O O O
high O O O O
for O O O O
Gouldian B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
but O O O O
not O O O O
long B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tailed O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
finches O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
interference O O O O
frequency O O O O
was O O O O
inversely O O O O
related O O O O
to O O O O
Gouldian B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
finch O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
reproductive O O O O
success O O O O
. O O O O
    
High O O O O
levels O O O O
of O O O O
interference O O O O
conferred O O O O
reduced O O O O
fledging O O O O
success O O O O
but O O O O
did O O O O
not O O O O
affect O O O O
offspring O O O O
condition O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Captive O O O O
experiments O O O O
corroborated O O O O
the O O O O
field O O O O
data O O O O
, O O O O
also O O O O
demonstrating O O O O
fitness O O O O
costs O O O O
of O O O O
interspecific O O O O
competition O O O O
, O O O O
and O O O O
that O O O O
long B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tailed O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
finches O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
dominated O O O O
resources O O O O
under O O O O
standardized O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Such O O O O
asymmetrical O O O O
competition O O O O
dynamics O O O O
are O O O O
likely O O O O
to O O O O
constrain O O O O
reproduction O O O O
in O O O O
Gouldian B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
finch O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
populations O O O O
, O O O O
potentially O O O O
affecting O O O O
recruitment O O O O
and O O O O
hindering O O O O
the O O O O
recovery O O O O
of O O O O
remaining O O O O
populations O O O O
of O O O O
this O O O O
endangered O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Predation O O O O
is O O O O
associated O O O O
with O O O O
variation O O O O
in O O O O
colour O O O O
pattern O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
body O O O O
shape O O O O
or O O O O
colour O O O O
reflectance O O O O
, O O O O
in O O O O
a O O O O
rainbowfish B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
Melanotaenia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
australis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
In O O O O
freshwater O O O O
fishes O O O O
, O O O O
inter O O O O
- O O O O
population O O O O
variation O O O O
in O O O O
male O O O O
phenotype O O O O
is O O O O
often O O O O
associated O O O O
with O O O O
differences O O O O
in O O O O
predation O O O O
intensity O O O O
, O O O O
but O O O O
these O O O O
effects O O O O
can O O O O
be O O O O
difficult O O O O
to O O O O
disentangle O O O O
from O O O O
environmental O O O O
influences O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
western B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
rainbowfish O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Melanotaenia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
australis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
exhibits O O O O
marked O O O O
sexual O O O O
dimorphism O O O O
- O O O O
females O O O O
are O O O O
plain O O O O
with O O O O
a O O O O
slender O O O O
body O O O O
, O O O O
while O O O O
males O O O O
have O O O O
striking O O O O
coloration O O O O
and O O O O
are O O O O
deeper O O O O
in O O O O
the O O O O
body O O O O
. O O O O
    
Male O O O O
traits O O O O
differ O O O O
in O O O O
expression O O O O
among O O O O
populations O O O O
, O O O O
but O O O O
this O O O O
has O O O O
not O O O O
been O O O O
described O O O O
or O O O O
explored O O O O
in O O O O
the O O O O
literature O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
This O O O O
paper O O O O
describes O O O O
a O O O O
study O O O O
designed O O O O
to O O O O
test O O O O
for O O O O
geographic O O O O
structuring O O O O
of O O O O
male O O O O
phenotype O O O O
in O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
australis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
to O O O O
determine O O O O
whether O O O O
between O O O O
- O O O O
population O O O O
variation O O O O
in O O O O
male O O O O
phenotype O O O O
is O O O O
attributable O O O O
to O O O O
variation O O O O
in O O O O
predation O O O O
regime O O O O
, O O O O
after O O O O
accounting O O O O
for O O O O
environment O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
collected O O O O
data O O O O
describing O O O O
habitat O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
size O O O O
, O O O O
activity O O O O
and O O O O
abundance O O O O
of O O O O
predators O O O O
at O O O O
sites O O O O
containing O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
australis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
populations O O O O
. O O O O
    
We O O O O
then O O O O
used O O O O
photography O O O O
, O O O O
spectrometry O O O O
and O O O O
geometric O O O O
morphometrics O O O O
to O O O O
describe O O O O
colour O O O O
pattern O O O O
, O O O O
spectral O O O O
reflectance O O O O
and O O O O
body O O O O
shape O O O O
in O O O O
males O O O O
from O O O O
these O O O O
populations O O O O
. O O O O
    
Finally O O O O
, O O O O
we O O O O
used O O O O
permutation O O O O
- O O O O
based O O O O
multivariate O O O O
statistics O O O O
to O O O O
partition O O O O
variance O O O O
in O O O O
these O O O O
traits O O O O
according O O O O
to O O O O
environment O O O O
and O O O O
predation O O O O
regime O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Downstream O O O O
environments O O O O
posed O O O O
higher O O O O
predation O O O O
risk O O O O
to O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
australis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
males O O O O
from O O O O
these O O O O
sites O O O O
consistently O O O O
exhibited O O O O
larger O O O O
cheek O O O O
spots O O O O
and O O O O
fewer O O O O
coloured O O O O
lateral O O O O
stripes O O O O
than O O O O
those O O O O
from O O O O
upstream O O O O
sites O O O O
. O O O O
    
Variation O O O O
in O O O O
predation O O O O
regime O O O O
accounted O O O O
for O O O O
a O O O O
significant O O O O
proportion O O O O
of O O O O
the O O O O
total O O O O
variance O O O O
in O O O O
these O O O O
traits O O O O
( O O O O
30 O O O O
* O O O O
9 O O O O
% O O O O
) O O O O
, O O O O
after O O O O
controlling O O O O
for O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
environment O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
Variation O O O O
in O O O O
predation O O O O
regime O O O O
did O O O O
not O O O O
explain O O O O
variation O O O O
in O O O O
reflectance O O O O
or O O O O
shape O O O O
. O O O O
    
Environmental O O O O
variation O O O O
, O O O O
however O O O O
, O O O O
explained O O O O
a O O O O
significant O O O O
portion O O O O
of O O O O
the O O O O
total O O O O
variance O O O O
in O O O O
reflectance O O O O
( O O O O
74 O O O O
* O O O O
9 O O O O
% O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
there O O O O
was O O O O
a O O O O
strong O O O O
trend O O O O
towards O O O O
it O O O O
explaining O O O O
a O O O O
portion O O O O
of O O O O
the O O O O
total O O O O
variance O O O O
in O O O O
body O O O O
shape O O O O
( O O O O
34 O O O O
* O O O O
9 O O O O
% O O O O
) O O O O
. O O O O
    
7 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
conclude O O O O
that O O O O
natural O O O O
selection O O O O
by O O O O
predators O O O O
may O O O O
be O O O O
an O O O O
important O O O O
determinant O O O O
of O O O O
the O O O O
evolution O O O O
of O O O O
colour O O O O
pattern O O O O
variation O O O O
in O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
australis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
but O O O O
not O O O O
of O O O O
that O O O O
of O O O O
body O O O O
shape O O O O
or O O O O
colour O O O O
reflectance O O O O
. O O O O
    
8 O O O O
. O O O O
    
Further O O O O
study O O O O
of O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
australis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
will O O O O
complement O O O O
existing O O O O
models O O O O
, O O O O
which O O O O
show O O O O
complex O O O O
relationships O O O O
between O O O O
predation O O O O
regime O O O O
, O O O O
environment O O O O
and O O O O
phenotype O O O O
. O O O O
    
Understanding O O O O
these O O O O
relationships O O O O
is O O O O
prerequisite O O O O
to O O O O
predicting O O O O
the O O O O
evolution O O O O
of O O O O
phenotypic O O O O
variation O O O O
in O O O O
natural O O O O
systems O O O O
. O O O O
    
Adult O O O O
predation O O O O
risk O O O O
drives O O O O
shifts O O O O
in O O O O
parental O O O O
care O O O O
strategies O O O O
: O O O O
a O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
study O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Grouping O O O O
provides O O O O
antipredatory O O O O
benefits O O O O
, O O O O
and O O O O
therefore O O O O
aggregation O O O O
tendencies O O O O
increase O O O O
under O O O O
heightened O O O O
predation O O O O
risk O O O O
. O O O O
    
In O O O O
socially O O O O
breeding O O O O
groups O O O O
, O O O O
however O O O O
, O O O O
conflicts O O O O
over O O O O
reproductive O O O O
shares O O O O
or O O O O
safety O O O O
tend O O O O
to O O O O
disintegrate O O O O
groups O O O O
. O O O O
    
Group O O O O
formation O O O O
thereby O O O O
involves O O O O
a O O O O
balance O O O O
between O O O O
the O O O O
antipredatory O O O O
benefits O O O O
of O O O O
aggregation O O O O
and O O O O
the O O O O
destabilizing O O O O
effect O O O O
of O O O O
reproductive O O O O
conflict O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
study O O O O
the O O O O
grouping O O O O
behaviour O O O O
of O O O O
a O O O O
facultatively O O O O
social O O O O
precocial O O O O
sea O O O O
duck O O O O
with O O O O
uniparental O O O O
female O O O O
care O O O O
, O O O O
the O O O O
eider O O O O
( O O O O
Somateria B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mollissima O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Linnaeus O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Females O O O O
tend O O O O
their O O O O
young O O O O
solitarily O O O O
or O O O O
in O O O O
groups O O O O
of O O O O
2 O O O O
- O O O O
5 O O O O
females O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
focus O O O O
on O O O O
the O O O O
effect O O O O
predation O O O O
on O O O O
adults O O O O
has O O O O
on O O O O
group O O O O
- O O O O
formation O O O O
decisions O O O O
of O O O O
brood O O O O
- O O O O
caring O O O O
females O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
By O O O O
modifying O O O O
an O O O O
existing O O O O
bidding O O O O
game O O O O
over O O O O
care O O O O
, O O O O
we O O O O
model O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
predation O O O O
risk O O O O
on O O O O
the O O O O
width O O O O
of O O O O
the O O O O
window O O O O
of O O O O
selfishness O O O O
, O O O O
which O O O O
delimits O O O O
the O O O O
reproductive O O O O
sharing O O O O
allowing O O O O
cooperation O O O O
within O O O O
brood O O O O
- O O O O
rearing O O O O
coalitions O O O O
, O O O O
and O O O O
generate O O O O
predictions O O O O
about O O O O
the O O O O
relative O O O O
frequencies O O O O
of O O O O
solitary O O O O
versus O O O O
cooperative O O O O
parental O O O O
care O O O O
modes O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
we O O O O
model O O O O
the O O O O
dilution O O O O
effect O O O O
as O O O O
a O O O O
function O O O O
of O O O O
female O O O O
group O O O O
size O O O O
and O O O O
predation O O O O
risk O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
window O O O O
of O O O O
selfishness O O O O
widens O O O O
with O O O O
increasing O O O O
predation O O O O
risk O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
dilution O O O O
of O O O O
predation O O O O
risk O O O O
increases O O O O
with O O O O
both O O O O
female O O O O
group O O O O
size O O O O
and O O O O
increasing O O O O
predation O O O O
risk O O O O
, O O O O
yielding O O O O
the O O O O
following O O O O
predictions O O O O
: O O O O
( O O O O
i O O O O
) O O O O
cooperative O O O O
brood O O O O
care O O O O
becomes O O O O
more O O O O
prevalent O O O O
and O O O O
, O O O O
conversely O O O O
, O O O O
solitary O O O O
brood O O O O
care O O O O
less O O O O
prevalent O O O O
under O O O O
heightened O O O O
predation O O O O
risk O O O O
and O O O O
( O O O O
ii O O O O
) O O O O
group O O O O
sizes O O O O
increase O O O O
concomitantly O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
tested O O O O
these O O O O
predictions O O O O
using O O O O
13 O O O O
years O O O O
of O O O O
data O O O O
on O O O O
female O O O O
grouping O O O O
decisions O O O O
and O O O O
annual O O O O
predation O O O O
rates O O O O
, O O O O
while O O O O
controlling O O O O
for O O O O
the O O O O
potentially O O O O
confounding O O O O
effect O O O O
of O O O O
female O O O O
body O O O O
condition O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
data O O O O
supported O O O O
both O O O O
predictions O O O O
, O O O O
where O O O O
heightened O O O O
predation O O O O
risk O O O O
of O O O O
nesting O O O O
females O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
changes O O O O
in O O O O
their O O O O
condition O O O O
, O O O O
increased O O O O
the O O O O
relative O O O O
frequency O O O O
of O O O O
cooperative O O O O
brood O O O O
care O O O O
. O O O O
    
Increased O O O O
female O O O O
nesting O O O O
mortality O O O O
also O O O O
resulted O O O O
in O O O O
larger O O O O
groups O O O O
of O O O O
cooperative O O O O
females O O O O
. O O O O
    
7 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
predation O O O O
risk O O O O
of O O O O
incubating O O O O
females O O O O
has O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
implications O O O O
for O O O O
later O O O O
parental O O O O
care O O O O
decisions O O O O
. O O O O
    
We O O O O
discuss O O O O
the O O O O
potential O O O O
consequences O O O O
of O O O O
predation O O O O
- O O O O
induced O O O O
shifts O O O O
in O O O O
group O O O O
size O O O O
on O O O O
per O O O O
capita O O O O
fitness O O O O
and O O O O
population O O O O
- O O O O
wide O O O O
productivity O O O O
. O O O O
    
Evidence O O O O
for O O O O
functional O O O O
divergence O O O O
in O O O O
arbuscular O O O O
mycorrhizal O O O O
fungi O O O O
from O O O O
contrasting O O O O
climatic O O O O
origins O O O O
. O O O O
    
A O O O O
considerable O O O O
amount O O O O
of O O O O
phenotypic O O O O
, O O O O
genetic O O O O
and O O O O
symbiotic O O O O
functional O O O O
variability O O O O
has O O O O
been O O O O
documented O O O O
in O O O O
arbuscular O O O O
mycorrhizal O O O O
fungi O O O O
( O O O O
AMF O O O O
) O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
little O O O O
is O O O O
known O O O O
about O O O O
whether O O O O
distinct O O O O
AMF O O O O
ecotypes O O O O
have O O O O
evolved O O O O
within O O O O
their O O O O
geographic O O O O
range O O O O
. O O O O
    
We O O O O
tested O O O O
the O O O O
hypothesis O O O O
that O O O O
AMF O O O O
growing O O O O
at O O O O
temperatures O O O O
closer O O O O
to O O O O
those O O O O
prevalent O O O O
within O O O O
their O O O O
origin O O O O
would O O O O
benefit O O O O
their O O O O
host O O O O
and O O O O
grow O O O O
more O O O O
than O O O O
isolates O O O O
distant O O O O
from O O O O
their O O O O
native O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
For O O O O
each O O O O
of O O O O
six O O O O
AMF O O O O
species O O O O
, O O O O
we O O O O
chose O O O O
pairs O O O O
of O O O O
isolates O O O O
that O O O O
originated O O O O
from O O O O
distant O O O O
areas O O O O
with O O O O
contrasting O O O O
climates O O O O
. O O O O
    
Each O O O O
isolate O O O O
was O O O O
grown O O O O
in O O O O
association O O O O
with O O O O
two O O O O
grass O O O O
species O O O O
of O O O O
different O O O O
thermal O O O O
optima O O O O
at O O O O
two O O O O
temperature O O O O
settings O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
we O O O O
also O O O O
tested O O O O
whether O O O O
AMF O O O O
from O O O O
different O O O O
climatic O O O O
origins O O O O
were O O O O
dependent O O O O
on O O O O
the O O O O
thermal O O O O
adaptation O O O O
of O O O O
the O O O O
host O O O O
plant O O O O
species O O O O
or O O O O
to O O O O
temperature O O O O
per O O O O
se O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
fungal O O O O
growth O O O O
was O O O O
not O O O O
directly O O O O
affected O O O O
by O O O O
temperature O O O O
, O O O O
we O O O O
found O O O O
that O O O O
AMF O O O O
isolates O O O O
originating O O O O
from O O O O
contrasting O O O O
climates O O O O
consistently O O O O
and O O O O
differentially O O O O
altered O O O O
plant O O O O
growth O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
AMF O O O O
from O O O O
contrasting O O O O
climates O O O O
have O O O O
altered O O O O
symbiotic O O O O
function O O O O
, O O O O
thus O O O O
linking O O O O
an O O O O
abiotic O O O O
factor O O O O
to O O O O
ecotypic O O O O
differentiation O O O O
of O O O O
putatively O O O O
important O O O O
symbionts O O O O
. O O O O
    
A O O O O
new O O O O
, O O O O
vapour O O O O
- O O O O
phase O O O O
mechanism O O O O
for O O O O
stomatal O O O O
responses O O O O
to O O O O
humidity O O O O
and O O O O
temperature O O O O
. O O O O
    
A O O O O
new O O O O
mechanism O O O O
for O O O O
stomatal O O O O
responses O O O O
to O O O O
humidity O O O O
and O O O O
temperature O O O O
is O O O O
proposed O O O O
. O O O O
    
Unlike O O O O
previously O O O O
- O O O O
proposed O O O O
mechanisms O O O O
, O O O O
which O O O O
rely O O O O
on O O O O
liquid O O O O
water O O O O
transport O O O O
to O O O O
create O O O O
water O O O O
potential O O O O
gradients O O O O
within O O O O
the O O O O
leaf O O O O
, O O O O
the O O O O
new O O O O
mechanism O O O O
assumes O O O O
that O O O O
water O O O O
transport O O O O
to O O O O
the O O O O
guard O O O O
cells O O O O
is O O O O
primarily O O O O
through O O O O
the O O O O
vapour O O O O
phase O O O O
. O O O O
    
Under O O O O
steady O O O O
- O O O O
state O O O O
conditions O O O O
, O O O O
guard O O O O
cells O O O O
are O O O O
assumed O O O O
to O O O O
be O O O O
in O O O O
near O O O O
- O O O O
equilibrium O O O O
with O O O O
the O O O O
water O O O O
vapour O O O O
in O O O O
the O O O O
air O O O O
near O O O O
the O O O O
bottom O O O O
of O O O O
the O O O O
stomatal O O O O
pore O O O O
. O O O O
    
As O O O O
the O O O O
water O O O O
potential O O O O
of O O O O
this O O O O
air O O O O
varies O O O O
with O O O O
changing O O O O
air O O O O
humidity O O O O
and O O O O
leaf O O O O
temperature O O O O
, O O O O
the O O O O
resultant O O O O
changes O O O O
in O O O O
guard O O O O
cell O O O O
water O O O O
potential O O O O
produce O O O O
stomatal O O O O
movements O O O O
. O O O O
    
A O O O O
simple O O O O
, O O O O
closed O O O O
- O O O O
form O O O O
, O O O O
mathematical O O O O
model O O O O
based O O O O
on O O O O
this O O O O
idea O O O O
is O O O O
derived O O O O
. O O O O
    
The O O O O
new O O O O
model O O O O
is O O O O
parameterized O O O O
for O O O O
a O O O O
previously O O O O
published O O O O
set O O O O
of O O O O
data O O O O
and O O O O
is O O O O
shown O O O O
to O O O O
fit O O O O
the O O O O
data O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
or O O O O
better O O O O
than O O O O
existing O O O O
models O O O O
. O O O O
    
The O O O O
model O O O O
contains O O O O
mathematical O O O O
elements O O O O
that O O O O
are O O O O
consistent O O O O
with O O O O
previously O O O O
- O O O O
proposed O O O O
mechanistic O O O O
models O O O O
based O O O O
on O O O O
liquid O O O O
flow O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
empirical O O O O
models O O O O
based O O O O
on O O O O
relative O O O O
humidity O O O O
. O O O O
    
As O O O O
such O O O O
, O O O O
it O O O O
provides O O O O
a O O O O
mechanistic O O O O
explanation O O O O
for O O O O
the O O O O
realm O O O O
of O O O O
validity O O O O
for O O O O
each O O O O
of O O O O
these O O O O
approaches O O O O
. O O O O
    
Cadmium O O O O
uptake O O O O
and O O O O
sequestration O O O O
kinetics O O O O
in O O O O
individual O O O O
leaf O O O O
cell O O O O
protoplasts O O O O
of O O O O
the O O O O
Cd O O O O
/ O O O O
Zn O O O O
hyperaccumulator O O O O
Thlaspi B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
caerulescens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Hyperaccumulators O O O O
store O O O O
accumulated O O O O
metals O O O O
in O O O O
the O O O O
vacuoles O O O O
of O O O O
large O O O O
leaf O O O O
epidermal O O O O
cells O O O O
( O O O O
storage O O O O
cells O O O O
) O O O O
. O O O O
    
For O O O O
investigating O O O O
cadmium O O O O
uptake O O O O
, O O O O
we O O O O
incubated O O O O
protoplasts O O O O
obtained O O O O
from O O O O
leaves O O O O
of O O O O
Thlaspi B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
caerulescens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Ganges O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ecotype O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
with O O O O
a O O O O
Cd O O O O
- O O O O
specific O O O O
fluorescent O O O O
dye O O O O
. O O O O
    
A O O O O
fluorescence O O O O
kinetic O O O O
microscope O O O O
was O O O O
used O O O O
for O O O O
selectively O O O O
measuring O O O O
Cd O O O O
- O O O O
uptake O O O O
and O O O O
photosynthesis O O O O
in O O O O
different O O O O
cell O O O O
types O O O O
, O O O O
so O O O O
that O O O O
physical O O O O
separation O O O O
of O O O O
cell O O O O
types O O O O
was O O O O
not O O O O
necessary O O O O
. O O O O
    
Few O O O O
minutes O O O O
after O O O O
its O O O O
addition O O O O
, O O O O
cadmium O O O O
accumulated O O O O
in O O O O
the O O O O
cytoplasm O O O O
before O O O O
its O O O O
transport O O O O
into O O O O
the O O O O
vacuole O O O O
. O O O O
    
This O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
vacuolar O O O O
sequestration O O O O
is O O O O
the O O O O
rate O O O O
- O O O O
limiting O O O O
step O O O O
in O O O O
cadmium O O O O
uptake O O O O
into O O O O
protoplasts O O O O
of O O O O
all O O O O
leaf O O O O
cell O O O O
types O O O O
. O O O O
    
During O O O O
accumulation O O O O
in O O O O
the O O O O
cytoplasm O O O O
, O O O O
Cd O O O O
- O O O O
rich O O O O
vesicle O O O O
- O O O O
like O O O O
structures O O O O
were O O O O
observed O O O O
. O O O O
    
Cd O O O O
uptake O O O O
rates O O O O
into O O O O
epidermal O O O O
storage O O O O
cells O O O O
were O O O O
higher O O O O
than O O O O
into O O O O
standard O O O O
- O O O O
sized O O O O
epidermal O O O O
cells O O O O
and O O O O
mesophyll O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
This O O O O
shows O O O O
that O O O O
the O O O O
preferential O O O O
heavy O O O O
metal O O O O
accumulation O O O O
in O O O O
epidermal O O O O
storage O O O O
cells O O O O
, O O O O
previously O O O O
observed O O O O
for O O O O
several O O O O
metals O O O O
in O O O O
intact O O O O
leaves O O O O
of O O O O
various O O O O
hyperaccumulator O O O O
species O O O O
, O O O O
is O O O O
due O O O O
to O O O O
differences O O O O
in O O O O
active O O O O
metal O O O O
transport O O O O
and O O O O
not O O O O
differences O O O O
in O O O O
passive O O O O
mechanisms O O O O
like O O O O
transpiration O O O O
stream O O O O
transport O O O O
or O O O O
cell O O O O
wall O O O O
adhesion O O O O
. O O O O
    
Combining O O O O
this O O O O
with O O O O
previous O O O O
studies O O O O
, O O O O
it O O O O
seems O O O O
likely O O O O
that O O O O
the O O O O
transport O O O O
steps O O O O
over O O O O
the O O O O
plasma O O O O
and O O O O
tonoplast O O O O
membranes O O O O
of O O O O
leaf O O O O
epidermal O O O O
storage O O O O
cells O O O O
are O O O O
driving O O O O
forces O O O O
behind O O O O
the O O O O
hyperaccumulation O O O O
phenotype O O O O
. O O O O
    
Factors O O O O
required O O O O
for O O O O
the O O O O
high O O O O
CO2 O O O O
specificity O O O O
of O O O O
the O O O O
anaerobically O O O O
induced O O O O
maize B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
GapC4 O O O O
promoter O O O O
in O O O O
transgenic O O O O
tobacco B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Flooding O O O O
, O O O O
a O O O O
natural O O O O
cause O O O O
of O O O O
anaerobiosis O O O O
, O O O O
is O O O O
often O O O O
accompanied O O O O
by O O O O
high O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
concentrations O O O O
in O O O O
the O O O O
flood O O O O
water O O O O
. O O O O
    
Plants O O O O
need O O O O
to O O O O
respond O O O O
to O O O O
these O O O O
environmental O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
Strong O O O O
anaerobic O O O O
reporter O O O O
gene O O O O
activity O O O O
in O O O O
tobacco B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
Nicotiana B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tabacum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
controlled O O O O
by O O O O
the O O O O
glycolytic O O O O
glyceraldehyde O O O O
- O O O O
3 O O O O
- O O O O
phosphate O O O O
dehydrogenase O O O O
( O O O O
GapC4 O O O O
) O O O O
promoter O O O O
from O O O O
maize B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
Zea B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mays O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
depends O O O O
on O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
and O O O O
light O O O O
. O O O O
    
To O O O O
identify O O O O
factors O O O O
required O O O O
for O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
regulated O O O O
gene O O O O
expression O O O O
, O O O O
promoter O O O O
deletions O O O O
fused O O O O
to O O O O
the O O O O
Beta O O O O
- O O O O
glucuronidase O O O O
reporter O O O O
gene O O O O
were O O O O
studied O O O O
in O O O O
transgenic O O O O
tobacco B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Deletion O O O O
of O O O O
a O O O O
40 O O O O
bp O O O O
fragment O O O O
directly O O O O
upstream O O O O
of O O O O
the O O O O
TATA O O O O
box O O O O
leads O O O O
to O O O O
increased O O O O
anaerobic O O O O
reporter O O O O
gene O O O O
activity O O O O
both O O O O
, O O O O
in O O O O
the O O O O
presence O O O O
and O O O O
absence O O O O
of O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
This O O O O
deletion O O O O
does O O O O
not O O O O
affect O O O O
light O O O O
specific O O O O
anaerobic O O O O
expression O O O O
. O O O O
    
A O O O O
positive O O O O
correlation O O O O
between O O O O
increasing O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
concentrations O O O O
and O O O O
gene O O O O
activity O O O O
is O O O O
observed O O O O
. O O O O
    
Electrophoretic O O O O
mobility O O O O
shift O O O O
experiments O O O O
indicate O O O O
that O O O O
tobacco B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nuclear O O O O
extracts O O O O
harbour O O O O
proteins O O O O
that O O O O
bind O O O O
to O O O O
part O O O O
of O O O O
the O O O O
40 O O O O
bp O O O O
fragment O O O O
. O O O O
    
Database O O O O
assisted O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
experimental O O O O
analysis O O O O
reveal O O O O
a O O O O
role O O O O
for O O O O
AP2 O O O O
/ O O O O
EREBP O O O O
transcription O O O O
factors O O O O
for O O O O
conferring O O O O
the O O O O
high O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
specificity O O O O
to O O O O
the O O O O
GapC4 O O O O
promoter O O O O
in O O O O
tobacco B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
leaves O O O O
. O O O O
    
This O O O O
work O O O O
highlights O O O O
the O O O O
importance O O O O
for O O O O
plants O O O O
to O O O O
respond O O O O
to O O O O
high O O O O
environmental O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
concentrations O O O O
under O O O O
anaerobic O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
Arabidopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
thaliana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
populations O O O O
show O O O O
clinal O O O O
variation O O O O
in O O O O
a O O O O
climatic O O O O
gradient O O O O
associated O O O O
with O O O O
altitude O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Understanding O O O O
the O O O O
adaptive O O O O
basis O O O O
of O O O O
life O O O O
history O O O O
variation O O O O
is O O O O
a O O O O
central O O O O
goal O O O O
in O O O O
evolutionary O O O O
ecology O O O O
. O O O O
    
The O O O O
use O O O O
of O O O O
model O O O O
species O O O O
enables O O O O
the O O O O
combination O O O O
of O O O O
molecular O O O O
mechanistic O O O O
knowledge O O O O
with O O O O
ecological O O O O
and O O O O
evolutionary O O O O
questions O O O O
, O O O O
but O O O O
the O O O O
study O O O O
of O O O O
life O O O O
history O O O O
variation O O O O
in O O O O
natural O O O O
environments O O O O
is O O O O
required O O O O
to O O O O
merge O O O O
these O O O O
disciplines O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
tested O O O O
for O O O O
clinal O O O O
variation O O O O
in O O O O
life O O O O
history O O O O
and O O O O
associated O O O O
traits O O O O
along O O O O
an O O O O
environmental O O O O
and O O O O
altitudinal O O O O
gradient O O O O
in O O O O
the O O O O
model O O O O
species O O O O
Arabidopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
thaliana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Seventeen O O O O
natural O O O O
populations O O O O
of O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
thaliana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
were O O O O
geo O O O O
- O O O O
referenced O O O O
in O O O O
north O O O O
- O O O O
eastern O O O O
Spain O O O O
on O O O O
a O O O O
gradient O O O O
in O O O O
which O O O O
precipitation O O O O
increases O O O O
but O O O O
maximum O O O O
spring O O O O
temperature O O O O
and O O O O
minimum O O O O
winter O O O O
temperature O O O O
decrease O O O O
with O O O O
altitude O O O O
. O O O O
    
* O O O O
One O O O O
hundred O O O O
and O O O O
eighty O O O O
- O O O O
nine O O O O
genotypes O O O O
from O O O O
the O O O O
17 O O O O
populations O O O O
were O O O O
grown O O O O
under O O O O
uniform O O O O
controlled O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
Variations O O O O
in O O O O
traits O O O O
related O O O O
to O O O O
biomass O O O O
allocation O O O O
, O O O O
fecundity O O O O
, O O O O
phenology O O O O
and O O O O
vegetative O O O O
growth O O O O
were O O O O
tested O O O O
for O O O O
relationships O O O O
with O O O O
the O O O O
altitude O O O O
and O O O O
climatic O O O O
variables O O O O
associated O O O O
with O O O O
the O O O O
home O O O O
sites O O O O
. O O O O
    
Above O O O O
- O O O O
ground O O O O
mass O O O O
, O O O O
number O O O O
of O O O O
rosette O O O O
leaves O O O O
at O O O O
bolting O O O O
, O O O O
developmental O O O O
time O O O O
and O O O O
seed O O O O
weight O O O O
increased O O O O
with O O O O
the O O O O
home O O O O
site O O O O
' O O O O
s O O O O
altitude O O O O
. O O O O
    
Root O O O O
allocation O O O O
, O O O O
vegetative O O O O
growth O O O O
during O O O O
winter O O O O
and O O O O
number O O O O
of O O O O
seeds O O O O
decreased O O O O
with O O O O
altitude O O O O
. O O O O
    
* O O O O
We O O O O
suggest O O O O
that O O O O
the O O O O
differences O O O O
among O O O O
home O O O O
sites O O O O
provide O O O O
clues O O O O
to O O O O
the O O O O
variation O O O O
in O O O O
adaptive O O O O
strategies O O O O
associated O O O O
with O O O O
the O O O O
climatic O O O O
gradient O O O O
. O O O O
    
We O O O O
compared O O O O
these O O O O
results O O O O
with O O O O
adaptations O O O O
and O O O O
clinal O O O O
relationships O O O O
reported O O O O
for O O O O
other O O O O
species O O O O
and O O O O
with O O O O
molecular O O O O
mechanisms O O O O
described O O O O
in O O O O
Arabidopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Recovery O O O O
of O O O O
ectomycorrhiza O O O O
after O O O O
' O O O O
nitrogen O O O O
saturation O O O O
' O O O O
of O O O O
a O O O O
conifer O O O O
forest O O O O
. O O O O
    
Trees O O O O
reduce O O O O
their O O O O
carbon O O O O
( O O O O
C O O O O
) O O O O
allocation O O O O
to O O O O
roots O O O O
and O O O O
mycorrhizal O O O O
fungi O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
high O O O O
nitrogen O O O O
( O O O O
N O O O O
) O O O O
additions O O O O
, O O O O
which O O O O
should O O O O
reduce O O O O
the O O O O
N O O O O
retention O O O O
capacity O O O O
of O O O O
forests O O O O
. O O O O
    
The O O O O
time O O O O
needed O O O O
for O O O O
recovery O O O O
of O O O O
mycorrhizas O O O O
after O O O O
termination O O O O
of O O O O
N O O O O
loading O O O O
remains O O O O
unknown O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
report O O O O
the O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
impact O O O O
of O O O O
N O O O O
loading O O O O
and O O O O
the O O O O
recovery O O O O
of O O O O
ectomycorrhiza O O O O
after O O O O
high O O O O
N O O O O
loading O O O O
on O O O O
a O O O O
Pinus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sylvestris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
forest O O O O
. O O O O
    
We O O O O
analysed O O O O
the O O O O
N O O O O
% O O O O
and O O O O
abundance O O O O
of O O O O
the O O O O
stable O O O O
isotope O O O O
( O O O O
15 O O O O
) O O O O
N O O O O
in O O O O
tree O O O O
needles O O O O
and O O O O
soil O O O O
, O O O O
soil O O O O
microbial O O O O
fatty O O O O
acid O O O O
biomarkers O O O O
and O O O O
fungal O O O O
DNA O O O O
. O O O O
    
Needles O O O O
in O O O O
N O O O O
- O O O O
loaded O O O O
plots O O O O
became O O O O
enriched O O O O
in O O O O
( O O O O
15 O O O O
) O O O O
N O O O O
, O O O O
reflecting O O O O
decreased O O O O
N O O O O
retention O O O O
by O O O O
mycorrhizal O O O O
fungi O O O O
and O O O O
isotopic O O O O
discrimination O O O O
against O O O O
( O O O O
15 O O O O
) O O O O
N O O O O
during O O O O
loss O O O O
of O O O O
N O O O O
. O O O O
    
Meanwhile O O O O
, O O O O
needles O O O O
in O O O O
N O O O O
- O O O O
limited O O O O
( O O O O
control O O O O
) O O O O
plots O O O O
became O O O O
depleted O O O O
in O O O O
( O O O O
15 O O O O
) O O O O
N O O O O
, O O O O
reflecting O O O O
high O O O O
retention O O O O
of O O O O
( O O O O
15 O O O O
) O O O O
N O O O O
by O O O O
mycorrhizal O O O O
fungi O O O O
. O O O O
    
N O O O O
loading O O O O
was O O O O
terminated O O O O
after O O O O
20yr O O O O
. O O O O
    
The O O O O
delta O O O O
( O O O O
15 O O O O
) O O O O
N O O O O
and O O O O
N O O O O
% O O O O
of O O O O
the O O O O
needles O O O O
decreased O O O O
6yr O O O O
after O O O O
N O O O O
loading O O O O
had O O O O
been O O O O
terminated O O O O
, O O O O
and O O O O
approached O O O O
values O O O O
in O O O O
control O O O O
plots O O O O
after O O O O
15yr O O O O
. O O O O
    
This O O O O
decrease O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
larger O O O O
contributions O O O O
compared O O O O
with O O O O
N O O O O
- O O O O
loaded O O O O
plots O O O O
of O O O O
a O O O O
fungal O O O O
fatty O O O O
acid O O O O
biomarker O O O O
and O O O O
ectomycorrhizal O O O O
sequences O O O O
, O O O O
suggest O O O O
recovery O O O O
of O O O O
ectomycorrhiza O O O O
. O O O O
    
High O O O O
N O O O O
loading O O O O
rapidly O O O O
decreased O O O O
the O O O O
functional O O O O
role O O O O
of O O O O
ectomycorrhiza O O O O
in O O O O
the O O O O
forest O O O O
N O O O O
cycle O O O O
, O O O O
but O O O O
significant O O O O
recovery O O O O
occurred O O O O
within O O O O
6 O O O O
- O O O O
15yr O O O O
after O O O O
termination O O O O
of O O O O
N O O O O
loading O O O O
. O O O O
    
Structural O O O O
and O O O O
hydraulic O O O O
correlates O O O O
of O O O O
heterophylly O O O O
in O O O O
Ginkgo B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
biloba O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
investigates O O O O
the O O O O
functional O O O O
significance O O O O
of O O O O
heterophylly O O O O
in O O O O
Ginkgo B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
biloba O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
where O O O O
leaves O O O O
borne O O O O
on O O O O
short O O O O
shoots O O O O
are O O O O
ontogenetically O O O O
distinct O O O O
from O O O O
those O O O O
on O O O O
long O O O O
shoots O O O O
. O O O O
    
Short O O O O
shoots O O O O
are O O O O
compact O O O O
, O O O O
with O O O O
minimal O O O O
internodal O O O O
elongation O O O O
; O O O O
their O O O O
leaves O O O O
are O O O O
supplied O O O O
with O O O O
water O O O O
through O O O O
mature O O O O
branches O O O O
. O O O O
    
Long O O O O
shoots O O O O
extend O O O O
the O O O O
canopy O O O O
and O O O O
have O O O O
significant O O O O
internodal O O O O
elongation O O O O
; O O O O
their O O O O
expanding O O O O
leaves O O O O
receive O O O O
water O O O O
from O O O O
a O O O O
shoot O O O O
that O O O O
is O O O O
itself O O O O
maturing O O O O
. O O O O
    
Morphology O O O O
, O O O O
stomatal O O O O
traits O O O O
, O O O O
hydraulic O O O O
architecture O O O O
, O O O O
Huber O O O O
values O O O O
, O O O O
water O O O O
transport O O O O
efficiency O O O O
, O O O O
in O O O O
situ O O O O
gas O O O O
exchange O O O O
and O O O O
laboratory O O O O
- O O O O
based O O O O
steady O O O O
- O O O O
state O O O O
hydraulic O O O O
conductance O O O O
were O O O O
examined O O O O
for O O O O
each O O O O
leaf O O O O
type O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
structure O O O O
and O O O O
physiology O O O O
differed O O O O
markedly O O O O
between O O O O
the O O O O
two O O O O
leaf O O O O
types O O O O
. O O O O
    
Short O O O O
- O O O O
shoot O O O O
leaves O O O O
were O O O O
thinner O O O O
and O O O O
had O O O O
higher O O O O
vein O O O O
density O O O O
, O O O O
lower O O O O
stomatal O O O O
pore O O O O
index O O O O
, O O O O
smaller O O O O
bundle O O O O
sheath O O O O
extensions O O O O
and O O O O
lower O O O O
hydraulic O O O O
conductance O O O O
than O O O O
long O O O O
- O O O O
shoot O O O O
leaves O O O O
. O O O O
    
Long O O O O
shoots O O O O
had O O O O
lower O O O O
xylem O O O O
area O O O O
: O O O O
leaf O O O O
area O O O O
ratios O O O O
than O O O O
short O O O O
shoots O O O O
during O O O O
leaf O O O O
expansion O O O O
, O O O O
but O O O O
this O O O O
ratio O O O O
was O O O O
reversed O O O O
at O O O O
shoot O O O O
maturity O O O O
. O O O O
    
Long O O O O
- O O O O
shoot O O O O
leaves O O O O
had O O O O
higher O O O O
rates O O O O
of O O O O
photosynthesis O O O O
, O O O O
stomatal O O O O
conductance O O O O
and O O O O
transpiration O O O O
than O O O O
short O O O O
- O O O O
shoot O O O O
leaves O O O O
. O O O O
    
We O O O O
propose O O O O
that O O O O
structural O O O O
differences O O O O
between O O O O
the O O O O
two O O O O
G B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
biloba O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
leaf O O O O
types O O O O
reflect O O O O
greater O O O O
hydraulic O O O O
limitation O O O O
of O O O O
long O O O O
- O O O O
shoot O O O O
leaves O O O O
during O O O O
expansion O O O O
. O O O O
    
In O O O O
turn O O O O
, O O O O
differences O O O O
in O O O O
physiological O O O O
performance O O O O
of O O O O
short O O O O
- O O O O
and O O O O
long O O O O
- O O O O
shoot O O O O
leaves O O O O
correspond O O O O
to O O O O
their O O O O
distinct O O O O
ontogeny O O O O
and O O O O
architecture O O O O
. O O O O
    
Symbiotic O O O O
Chlorella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
vulgaris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
of O O O O
the O O O O
ciliate O O O O
Paramecium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bursaria O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
plays O O O O
an O O O O
important O O O O
role O O O O
in O O O O
maintaining O O O O
perialgal O O O O
vacuole O O O O
membrane O O O O
functions O O O O
. O O O O
    
Treatment O O O O
of O O O O
symbiotic O O O O
alga O O O O
- O O O O
bearing O O O O
Paramecium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bursaria O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cells O O O O
with O O O O
a O O O O
protein O O O O
synthesis O O O O
inhibitor O O O O
, O O O O
cycloheximide O O O O
, O O O O
induces O O O O
synchronous O O O O
swelling O O O O
of O O O O
all O O O O
perialgal O O O O
vacuoles O O O O
at O O O O
about O O O O
24h O O O O
after O O O O
treatment O O O O
under O O O O
a O O O O
constant O O O O
light O O O O
condition O O O O
. O O O O
    
Subsequently O O O O
, O O O O
the O O O O
vacuoles O O O O
detach O O O O
from O O O O
the O O O O
host O O O O
cell O O O O
cortex O O O O
. O O O O
    
The O O O O
algae O O O O
in O O O O
the O O O O
vacuoles O O O O
are O O O O
digested O O O O
by O O O O
the O O O O
host O O O O
' O O O O
s O O O O
lysosomal O O O O
fusion O O O O
to O O O O
the O O O O
vacuoles O O O O
. O O O O
    
To O O O O
elucidate O O O O
the O O O O
timing O O O O
of O O O O
algal O O O O
degeneration O O O O
, O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bursaria O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cells O O O O
were O O O O
treated O O O O
with O O O O
cycloheximide O O O O
under O O O O
a O O O O
constant O O O O
light O O O O
condition O O O O
. O O O O
    
Then O O O O
the O O O O
cells O O O O
were O O O O
observed O O O O
using O O O O
transmission O O O O
electron O O O O
microscopy O O O O
. O O O O
    
Results O O O O
show O O O O
that O O O O
algal O O O O
chloroplasts O O O O
and O O O O
nuclei O O O O
degenerated O O O O
within O O O O
9h O O O O
after O O O O
treatment O O O O
, O O O O
but O O O O
before O O O O
the O O O O
synchronous O O O O
swelling O O O O
of O O O O
the O O O O
perialgal O O O O
vacuole O O O O
and O O O O
appearance O O O O
of O O O O
acid O O O O
phosphatase O O O O
activity O O O O
in O O O O
the O O O O
perialgal O O O O
vacuole O O O O
by O O O O
lysosomal O O O O
fusion O O O O
. O O O O
    
Treatment O O O O
with O O O O
cycloheximide O O O O
under O O O O
a O O O O
constant O O O O
dark O O O O
condition O O O O
and O O O O
treatment O O O O
with O O O O
chloramphenicol O O O O
under O O O O
a O O O O
constant O O O O
light O O O O
condition O O O O
induced O O O O
neither O O O O
synchronous O O O O
swelling O O O O
of O O O O
the O O O O
vacuoles O O O O
nor O O O O
digestion O O O O
of O O O O
the O O O O
algae O O O O
inside O O O O
the O O O O
vacuoles O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
algal O O O O
proteins O O O O
synthesized O O O O
during O O O O
photosynthesis O O O O
are O O O O
necessary O O O O
to O O O O
maintain O O O O
chloroplastic O O O O
and O O O O
nuclear O O O O
structures O O O O
, O O O O
and O O O O
that O O O O
inhibition O O O O
of O O O O
protein O O O O
synthesis O O O O
induces O O O O
rapid O O O O
lysis O O O O
of O O O O
these O O O O
organelles O O O O
, O O O O
after O O O O
which O O O O
synchronous O O O O
swelling O O O O
of O O O O
the O O O O
perialgal O O O O
vacuole O O O O
and O O O O
fusion O O O O
occur O O O O
with O O O O
the O O O O
host O O O O
lysosomes O O O O
. O O O O
    
Rapid O O O O
and O O O O
sensitive O O O O
detection O O O O
of O O O O
infectious B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
hypodermal O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
hematopoietic O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
necrosis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
by O O O O
loop O O O O
- O O O O
mediated O O O O
isothermal O O O O
amplification O O O O
combined O O O O
with O O O O
a O O O O
lateral O O O O
flow O O O O
dipstick O O O O
. O O O O
    
Infectious B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
hypodermal O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
hematopoietic O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
necrosis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
IHHNV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
is O O O O
an O O O O
important O O O O
shrimp O O O O
pathogen O O O O
that O O O O
causes O O O O
mortality O O O O
in O O O O
Penaeus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
stylirostris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
stunting O O O O
( O O O O
called O O O O
runt O O O O
deformity O O O O
syndrome O O O O
or O O O O
RDS O O O O
) O O O O
in O O O O
Penaeus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
vannamei O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Loop O O O O
- O O O O
mediated O O O O
isothermal O O O O
amplification O O O O
( O O O O
LAMP O O O O
) O O O O
allows O O O O
rapid O O O O
amplification O O O O
of O O O O
nucleic O O O O
acids O O O O
under O O O O
isothermal O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
It O O O O
can O O O O
be O O O O
combined O O O O
with O O O O
a O O O O
chromatographic O O O O
lateral O O O O
flow O O O O
dipstick O O O O
( O O O O
LFD O O O O
) O O O O
for O O O O
highly O O O O
specific O O O O
, O O O O
rapid O O O O
and O O O O
simple O O O O
visual O O O O
detection O O O O
of O O O O
IHHNV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
specific O O O O
amplicons O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
this O O O O
protocol O O O O
, O O O O
a O O O O
30 O O O O
- O O O O
min O O O O
amplification O O O O
followed O O O O
by O O O O
5 O O O O
min O O O O
hybridization O O O O
with O O O O
an O O O O
FITC O O O O
- O O O O
labeled O O O O
DNA O O O O
probe O O O O
and O O O O
5 O O O O
min O O O O
LFD O O O O
resulted O O O O
in O O O O
visualization O O O O
of O O O O
DNA O O O O
amplicons O O O O
trapped O O O O
at O O O O
the O O O O
LFD O O O O
test O O O O
line O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
10 O O O O
min O O O O
for O O O O
rapid O O O O
DNA O O O O
extraction O O O O
followed O O O O
by O O O O
LAMP O O O O
combined O O O O
with O O O O
LFD O O O O
detection O O O O
resulted O O O O
in O O O O
a O O O O
total O O O O
assay O O O O
time O O O O
of O O O O
approximately O O O O
50 O O O O
min O O O O
. O O O O
    
Detection O O O O
sensitivity O O O O
was O O O O
comparable O O O O
to O O O O
other O O O O
methods O O O O
used O O O O
commonly O O O O
for O O O O
nested O O O O
PCR O O O O
detection O O O O
of O O O O
IHHNV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
but O O O O
had O O O O
the O O O O
additional O O O O
advantages O O O O
of O O O O
reduced O O O O
assay O O O O
time O O O O
, O O O O
confirmation O O O O
of O O O O
amplicon O O O O
identity O O O O
by O O O O
hybridization O O O O
and O O O O
elimination O O O O
of O O O O
electrophoresis O O O O
with O O O O
carcinogenic O O O O
ethidium O O O O
bromide O O O O
. O O O O
    
The O O O O
FvMK1 O O O O
mitogen O O O O
- O O O O
activated O O O O
protein O O O O
kinase O O O O
gene O O O O
regulates O O O O
conidiation O O O O
, O O O O
pathogenesis O O O O
, O O O O
and O O O O
fumonisin O O O O
production O O O O
in O O O O
Fusarium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
verticillioides O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Fusarium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
verticillioides O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
most O O O O
important O O O O
fungal O O O O
pathogens O O O O
to O O O O
cause O O O O
destructive O O O O
diseases O O O O
of O O O O
maize B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
worldwide O O O O
. O O O O
    
Fumonisins O O O O
produced O O O O
by O O O O
the O O O O
fungus O O O O
are O O O O
harmful O O O O
to O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
animal O O O O
health O O O O
. O O O O
    
To O O O O
date O O O O
, O O O O
our O O O O
understanding O O O O
of O O O O
the O O O O
molecular O O O O
mechanisms O O O O
associated O O O O
with O O O O
pathogenicity O O O O
and O O O O
fumonisin O O O O
biosynthesis O O O O
in O O O O
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
verticillioides O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
limited O O O O
. O O O O
    
Because O O O O
MAP O O O O
kinase O O O O
pathways O O O O
have O O O O
been O O O O
implicated O O O O
in O O O O
regulating O O O O
diverse O O O O
processes O O O O
important O O O O
for O O O O
plant O O O O
infection O O O O
in O O O O
phytopathogenic O O O O
fungi O O O O
, O O O O
in O O O O
this O O O O
study O O O O
we O O O O
identified O O O O
and O O O O
functionally O O O O
characterized O O O O
the O O O O
FvMK1 O O O O
gene O O O O
in O O O O
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
verticillioides O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
FvMK1 O O O O
is O O O O
orthologous O O O O
to O O O O
FMK1 O O O O
in O O O O
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
oxysporum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
GPMK1 O O O O
in O O O O
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
graminearum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
Fvmk1 O O O O
deletion O O O O
mutant O O O O
was O O O O
reduced O O O O
in O O O O
vegetative O O O O
growth O O O O
and O O O O
production O O O O
of O O O O
microconidia O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
it O O O O
was O O O O
normal O O O O
in O O O O
sexual O O O O
reproduction O O O O
and O O O O
increased O O O O
in O O O O
the O O O O
production O O O O
of O O O O
macroconidia O O O O
. O O O O
    
In O O O O
infection O O O O
assays O O O O
with O O O O
developing O O O O
corn B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
kernels O O O O
, O O O O
the O O O O
Fvmk1 O O O O
mutant O O O O
was O O O O
non O O O O
- O O O O
pathogenic O O O O
and O O O O
failed O O O O
to O O O O
colonize O O O O
through O O O O
wounding O O O O
sites O O O O
. O O O O
    
It O O O O
also O O O O
failed O O O O
to O O O O
cause O O O O
stalk O O O O
rot O O O O
symptoms O O O O
beyond O O O O
the O O O O
inoculation O O O O
sites O O O O
on O O O O
corn B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
stalks O O O O
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
FvMK1 O O O O
is O O O O
essential O O O O
for O O O O
plant O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
the O O O O
Fvmk1 O O O O
mutant O O O O
was O O O O
significantly O O O O
reduced O O O O
in O O O O
fumonisin O O O O
production O O O O
and O O O O
expression O O O O
levels O O O O
of O O O O
FUM1 O O O O
and O O O O
FUM8 O O O O
, O O O O
two O O O O
genes O O O O
involved O O O O
in O O O O
fumonisin O O O O
biosynthesis O O O O
. O O O O
    
The O O O O
defects O O O O
of O O O O
the O O O O
Fvmk1 O O O O
mutant O O O O
were O O O O
fully O O O O
complemented O O O O
by O O O O
re O O O O
- O O O O
introducing O O O O
the O O O O
wild O O O O
type O O O O
FvMK1 O O O O
allele O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
FvMK1 O O O O
plays O O O O
critical O O O O
roles O O O O
in O O O O
the O O O O
regulation O O O O
of O O O O
vegetative O O O O
growth O O O O
, O O O O
asexual O O O O
reproduction O O O O
, O O O O
fumonisin O O O O
biosynthesis O O O O
, O O O O
and O O O O
pathogenicity O O O O
. O O O O
    
Phylogeny O O O O
and O O O O
historical O O O O
biogeography O O O O
of O O O O
true O O O O
morels B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
Morchella O O O O
) O O O O
reveals O O O O
an O O O O
early O O O O
Cretaceous O O O O
origin O O O O
and O O O O
high O O O O
continental O O O O
endemism O O O O
and O O O O
provincialism O O O O
in O O O O
the O O O O
Holarctic O O O O
. O O O O
    
True O O O O
morels B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
Morchella O O O O
, O O O O
Ascomycota O O O O
) O O O O
are O O O O
arguably O O O O
the O O O O
most O O O O
highly O O O O
- O O O O
prized O O O O
of O O O O
the O O O O
estimated O O O O
1 O O O O
. O O O O
5 O O O O
million O O O O
fungi O O O O
that O O O O
inhabit O O O O
our O O O O
planet O O O O
. O O O O
    
Field O O O O
guides O O O O
treat O O O O
these O O O O
epicurean O O O O
macrofungi O O O O
as O O O O
belonging O O O O
to O O O O
a O O O O
few O O O O
species O O O O
with O O O O
cosmopolitan O O O O
distributions O O O O
, O O O O
but O O O O
this O O O O
hypothesis O O O O
has O O O O
not O O O O
been O O O O
tested O O O O
. O O O O
    
Prompted O O O O
by O O O O
the O O O O
results O O O O
of O O O O
a O O O O
growing O O O O
number O O O O
of O O O O
molecular O O O O
studies O O O O
, O O O O
which O O O O
have O O O O
shown O O O O
many O O O O
microbes O O O O
exhibit O O O O
strong O O O O
biogeographic O O O O
structure O O O O
and O O O O
cryptic O O O O
speciation O O O O
, O O O O
we O O O O
constructed O O O O
a O O O O
4 O O O O
- O O O O
gene O O O O
dataset O O O O
for O O O O
177 O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
Morchellaceae O O O O
to O O O O
elucidate O O O O
their O O O O
origin O O O O
, O O O O
evolutionary O O O O
diversification O O O O
and O O O O
historical O O O O
biogeography O O O O
. O O O O
    
Diversification O O O O
time O O O O
estimates O O O O
place O O O O
the O O O O
origin O O O O
of O O O O
the O O O O
Morchellaceae O O O O
in O O O O
the O O O O
middle O O O O
Triassic O O O O
243 O O O O
. O O O O
63 O O O O
( O O O O
95 O O O O
% O O O O
highest O O O O
posterior O O O O
density O O O O
[ O O O O
HPD O O O O
] O O O O
interval O O O O
: O O O O
169 O O O O
. O O O O
35 O O O O
- O O O O
319 O O O O
. O O O O
89 O O O O
) O O O O
million O O O O
years O O O O
ago O O O O
( O O O O
Mya O O O O
) O O O O
and O O O O
the O O O O
divergence O O O O
of O O O O
Morchella O O O O
from O O O O
its O O O O
closest O O O O
relatives O O O O
in O O O O
the O O O O
early O O O O
Cretaceous O O O O
129 O O O O
. O O O O
61 O O O O
( O O O O
95 O O O O
% O O O O
HPD O O O O
interval O O O O
: O O O O
90 O O O O
. O O O O
26 O O O O
- O O O O
173 O O O O
. O O O O
16 O O O O
) O O O O
Mya O O O O
, O O O O
both O O O O
within O O O O
western O O O O
North O O O O
America O O O O
. O O O O
    
Phylogenetic O O O O
analyses O O O O
identified O O O O
three O O O O
lineages O O O O
within O O O O
Morchella O O O O
: O O O O
a O O O O
basal O O O O
monotypic O O O O
lineage O O O O
represented O O O O
by O O O O
Morchella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
rufobrunnea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
two O O O O
sister O O O O
clades O O O O
comprising O O O O
the O O O O
black B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
morels O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Elata O O O O
Clade O O O O
, O O O O
26 O O O O
species O O O O
) O O O O
and O O O O
yellow B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
morels O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Esculenta O O O O
Clade O O O O
, O O O O
16 O O O O
species O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Morchella O O O O
possesses O O O O
a O O O O
Laurasian O O O O
distribution O O O O
with O O O O
37 O O O O
/ O O O O
41 O O O O
species O O O O
restricted O O O O
to O O O O
the O O O O
Holarctic O O O O
. O O O O
    
All O O O O
33 O O O O
Holarctic O O O O
species O O O O
represented O O O O
by O O O O
multiple O O O O
collections O O O O
exhibited O O O O
continental O O O O
endemism O O O O
. O O O O
    
Moreover O O O O
, O O O O
16 O O O O
/ O O O O
18 O O O O
North O O O O
American O O O O
and O O O O
13 O O O O
/ O O O O
15 O O O O
Eurasian O O O O
species O O O O
appeared O O O O
to O O O O
exhibit O O O O
provincialism O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
morel O O O O
fruit O O O O
bodies O O O O
produce O O O O
thousands O O O O
of O O O O
explosively O O O O
discharged O O O O
spores O O O O
that O O O O
are O O O O
well O O O O
suited O O O O
to O O O O
aerial O O O O
dispersal O O O O
, O O O O
our O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
they O O O O
are O O O O
poorly O O O O
adapted O O O O
at O O O O
invading O O O O
novel O O O O
niches O O O O
. O O O O
    
Morels B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
also O O O O
appear O O O O
to O O O O
have O O O O
retained O O O O
the O O O O
ancestral O O O O
fruit O O O O
body O O O O
plan O O O O
, O O O O
which O O O O
has O O O O
remained O O O O
remarkably O O O O
static O O O O
since O O O O
the O O O O
Cretaceous O O O O
. O O O O
    
A O O O O
genomic O O O O
map O O O O
enriched O O O O
for O O O O
markers O O O O
linked O O O O
to O O O O
Avr1 O O O O
in O O O O
Cronartium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
quercuum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
f O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fusiforme O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
A O O O O
novel O O O O
approach O O O O
is O O O O
presented O O O O
to O O O O
map O O O O
avirulence O O O O
gene O O O O
Avr1 O O O O
in O O O O
the O O O O
basidiomycete O O O O
Cronartium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
quercuum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
f O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fusiforme O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
the O O O O
causal O O O O
agent O O O O
of O O O O
fusiform O O O O
rust O O O O
disease O O O O
in O O O O
pines O O O O
. O O O O
    
DNA O O O O
markers O O O O
tightly O O O O
linked O O O O
to O O O O
resistance O O O O
gene O O O O
Fr1 O O O O
in O O O O
loblolly B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pine O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tree O O O O
10 O O O O
- O O O O
5 O O O O
were O O O O
used O O O O
to O O O O
classify O O O O
10 O O O O
- O O O O
5 O O O O
seedling O O O O
progeny O O O O
as O O O O
either O O O O
resistant O O O O
or O O O O
susceptible O O O O
. O O O O
    
A O O O O
single O O O O
dikaryotic O O O O
isolate O O O O
( O O O O
P2 O O O O
) O O O O
heterozygous O O O O
at O O O O
the O O O O
corresponding O O O O
Avr1 O O O O
gene O O O O
was O O O O
developed O O O O
by O O O O
crossing O O O O
Fr1 O O O O
avirulent O O O O
isolate O O O O
SC20 O O O O
- O O O O
21 O O O O
with O O O O
Fr1 O O O O
virulent O O O O
isolate O O O O
NC2 O O O O
- O O O O
40 O O O O
. O O O O
    
Bulk O O O O
basidiospore O O O O
inoculum O O O O
derived O O O O
from O O O O
isolate O O O O
P2 O O O O
was O O O O
used O O O O
to O O O O
challenge O O O O
the O O O O
pine O O O O
progeny O O O O
. O O O O
    
The O O O O
ability O O O O
to O O O O
unambiguously O O O O
marker O O O O
classify O O O O
10 O O O O
- O O O O
5 O O O O
progeny O O O O
as O O O O
resistant O O O O
( O O O O
selecting O O O O
for O O O O
virulence O O O O
) O O O O
or O O O O
susceptible O O O O
( O O O O
non O O O O
- O O O O
selecting O O O O
) O O O O
permitted O O O O
the O O O O
genetic O O O O
mapping O O O O
of O O O O
the O O O O
corresponding O O O O
Avr1 O O O O
gene O O O O
by O O O O
bulked O O O O
segregant O O O O
analysis O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
this O O O O
approach O O O O
, O O O O
14 O O O O
genetic O O O O
markers O O O O
significantly O O O O
linked O O O O
to O O O O
Avr1 O O O O
were O O O O
identified O O O O
and O O O O
placed O O O O
within O O O O
the O O O O
context O O O O
of O O O O
a O O O O
genome O O O O
- O O O O
wide O O O O
linkage O O O O
map O O O O
produced O O O O
for O O O O
isolate O O O O
P2 O O O O
using O O O O
samples O O O O
from O O O O
susceptible O O O O
seedlings O O O O
. O O O O
    
Universal O O O O
primers O O O O
for O O O O
rapid O O O O
detection O O O O
of O O O O
hytrosaviruses O O O O
. O O O O
    
Hytrosaviridae O O O O
is O O O O
a O O O O
proposed O O O O
virus O O O O
family O O O O
encompassing O O O O
viruses O O O O
that O O O O
cause O O O O
salivary O O O O
gland O O O O
hypertrophy O O O O
( O O O O
SGH O O O O
) O O O O
syndrome O O O O
in O O O O
infected O O O O
insects O O O O
and O O O O
reduce O O O O
the O O O O
fertility O O O O
in O O O O
their O O O O
dipteran O O O O
insect O O O O
hosts O O O O
. O O O O
    
They O O O O
contain O O O O
a O O O O
large O O O O
, O O O O
double O O O O
stranded O O O O
DNA O O O O
genome O O O O
of O O O O
120 O O O O
- O O O O
190 O O O O
kbp O O O O
. O O O O
    
To O O O O
date O O O O
, O O O O
these O O O O
viruses O O O O
have O O O O
been O O O O
detected O O O O
only O O O O
in O O O O
adult O O O O
Diptera O O O O
. O O O O
    
These O O O O
include O O O O
hytrosaviruses O O O O
detected O O O O
in O O O O
various O O O O
tsetse O O O O
fly O O O O
species O O O O
( O O O O
Glossina O O O O
spp O O O O
. O O O O
) O O O O
, O O O O
the O O O O
narcissus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bulb O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fly O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Merodon B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
equestris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
the O O O O
house B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fly O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Musca B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
domestica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
limited O O O O
number O O O O
of O O O O
hytrosaviruses O O O O
reported O O O O
to O O O O
date O O O O
may O O O O
be O O O O
a O O O O
reflection O O O O
of O O O O
the O O O O
frequent O O O O
absence O O O O
of O O O O
external O O O O
symptoms O O O O
in O O O O
infected O O O O
adult O O O O
flies O O O O
and O O O O
the O O O O
fact O O O O
that O O O O
the O O O O
virus O O O O
does O O O O
not O O O O
cause O O O O
rapid O O O O
mortality O O O O
. O O O O
    
Based O O O O
on O O O O
the O O O O
complete O O O O
genome O O O O
sequence O O O O
of O O O O
Glossinia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pallidipes O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
GpSGHV O O O O
) O O O O
and O O O O
Musca B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
domestica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
MdSGHV O O O O
) O O O O
salivary O O O O
gland O O O O
hypertrophy O O O O
viruses O O O O
, O O O O
a O O O O
PCR O O O O
based O O O O
methodology O O O O
was O O O O
developed O O O O
to O O O O
detect O O O O
the O O O O
viruses O O O O
in O O O O
these O O O O
species O O O O
. O O O O
    
To O O O O
be O O O O
able O O O O
to O O O O
detect O O O O
hytrosaviruses O O O O
in O O O O
other O O O O
Diptera O O O O
, O O O O
five O O O O
degenerate O O O O
primer O O O O
pairs O O O O
were O O O O
designed O O O O
and O O O O
tested O O O O
on O O O O
GpSGHV O O O O
and O O O O
MdSGHV O O O O
DNA O O O O
using O O O O
gradient O O O O
PCR O O O O
with O O O O
annealing O O O O
temperatures O O O O
from O O O O
37 O O O O
to O O O O
61 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
. O O O O
    
Two O O O O
pairs O O O O
of O O O O
primers O O O O
were O O O O
selected O O O O
from O O O O
p74 O O O O
, O O O O
two O O O O
pairs O O O O
from O O O O
PIF O O O O
- O O O O
1 O O O O
and O O O O
one O O O O
pair O O O O
from O O O O
ODV O O O O
- O O O O
e66 O O O O
homologous O O O O
proteins O O O O
. O O O O
    
Four O O O O
primer O O O O
pairs O O O O
generated O O O O
a O O O O
virus O O O O
specific O O O O
PCR O O O O
product O O O O
on O O O O
both O O O O
MdSGHV O O O O
and O O O O
GpSGHV O O O O
at O O O O
all O O O O
tested O O O O
annealing O O O O
temperatures O O O O
, O O O O
while O O O O
the O O O O
ODV O O O O
- O O O O
e66 O O O O
based O O O O
primers O O O O
did O O O O
not O O O O
generate O O O O
a O O O O
virus O O O O
specific O O O O
product O O O O
with O O O O
annealing O O O O
temperatures O O O O
higher O O O O
that O O O O
47 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
. O O O O
    
No O O O O
non O O O O
- O O O O
specific O O O O
PCR O O O O
product O O O O
was O O O O
found O O O O
when O O O O
using O O O O
genomic O O O O
DNA O O O O
of O O O O
infected O O O O
flies O O O O
as O O O O
template O O O O
DNA O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
offer O O O O
new O O O O
sets O O O O
of O O O O
primers O O O O
that O O O O
could O O O O
be O O O O
used O O O O
to O O O O
detect O O O O
hytrosaviruses O O O O
in O O O O
other O O O O
insects O O O O
. O O O O
    
Simultaneous O O O O
virus O O O O
- O O O O
specific O O O O
detection O O O O
of O O O O
the O O O O
two O O O O
cassava B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
brown O O O O
streak O O O O
- O O O O
associated O O O O
viruses O O O O
by O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
reveals O O O O
wide O O O O
distribution O O O O
in O O O O
East O O O O
Africa O O O O
, O O O O
mixed O O O O
infections O O O O
, O O O O
and O O O O
infections O O O O
in O O O O
Manihot B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
glaziovii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
expanding O O O O
cassava B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
brown O O O O
streak O O O O
disease O O O O
( O O O O
CBSD O O O O
) O O O O
epidemic O O O O
in O O O O
East O O O O
Africa O O O O
is O O O O
caused O O O O
by O O O O
two O O O O
ipomoviruses O O O O
( O O O O
genus O O O O
Ipomovirus O O O O
; O O O O
Potyviridae O O O O
) O O O O
, O O O O
namely O O O O
, O O O O
Cassava B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
brown O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
streak O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
CBSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
, O O O O
and O O O O
Ugandan B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cassava O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
brown O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
streak O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
UCBSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
that O O O O
was O O O O
described O O O O
recently O O O O
. O O O O
    
A O O O O
reverse O O O O
transcription O O O O
polymerase O O O O
chain O O O O
reaction O O O O
( O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
) O O O O
based O O O O
diagnostic O O O O
method O O O O
was O O O O
developed O O O O
in O O O O
this O O O O
study O O O O
for O O O O
simultaneous O O O O
virus O O O O
- O O O O
specific O O O O
detection O O O O
of O O O O
the O O O O
two O O O O
viruses O O O O
. O O O O
    
Results O O O O
showed O O O O
that O O O O
CBSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
UCBSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
are O O O O
distributed O O O O
widely O O O O
in O O O O
the O O O O
highlands O O O O
( O O O O
> O O O O
1000 O O O O
m O O O O
above O O O O
the O O O O
sea O O O O
level O O O O
) O O O O
of O O O O
the O O O O
Lake O O O O
Victoria O O O O
zone O O O O
in O O O O
Uganda O O O O
and O O O O
Tanzania O O O O
and O O O O
also O O O O
in O O O O
the O O O O
Indian O O O O
Ocean O O O O
costal O O O O
lowlands O O O O
of O O O O
Tanzania O O O O
. O O O O
    
Isolates O O O O
of O O O O
UCBSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
from O O O O
the O O O O
Lake O O O O
Victoria O O O O
zone O O O O
were O O O O
placed O O O O
to O O O O
two O O O O
phylogenetic O O O O
clusters O O O O
in O O O O
accordance O O O O
with O O O O
their O O O O
origin O O O O
in O O O O
Uganda O O O O
or O O O O
Tanzania O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
Mixed O O O O
infections O O O O
with O O O O
CBSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
UCBSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
were O O O O
detected O O O O
in O O O O
many O O O O
cassava B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
plants O O O O
in O O O O
the O O O O
areas O O O O
surveyed O O O O
. O O O O
    
CBSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
was O O O O
also O O O O
detected O O O O
in O O O O
the O O O O
perennial O O O O
species O O O O
Manihot B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
glaziovii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
DNA O O O O
- O O O O
barcoded O O O O
in O O O O
this O O O O
study O O O O
) O O O O
in O O O O
Tanzania O O O O
, O O O O
which O O O O
revealed O O O O
the O O O O
first O O O O
virus O O O O
reservoir O O O O
other O O O O
than O O O O
cassava B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
method O O O O
for O O O O
detection O O O O
of O O O O
CBSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
UCBSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
described O O O O
in O O O O
this O O O O
study O O O O
has O O O O
important O O O O
applications O O O O
for O O O O
plant O O O O
quarantine O O O O
, O O O O
resistance O O O O
breeding O O O O
of O O O O
cassava B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
and O O O O
studies O O O O
on O O O O
epidemiology O O O O
and O O O O
control O O O O
of O O O O
CBSD O O O O
in O O O O
East O O O O
Africa O O O O
. O O O O
    
Development O O O O
of O O O O
a O O O O
blocking O O O O
ELISA O O O O
for O O O O
detection O O O O
of O O O O
serum O O O O
neutralizing O O O O
antibodies O O O O
against O O O O
porcine B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
circovirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
type O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
2 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
A O O O O
monoclonal O O O O
antibody O O O O
( O O O O
Mab O O O O
) O O O O
- O O O O
based O O O O
blocking O O O O
ELISA O O O O
was O O O O
developed O O O O
for O O O O
the O O O O
detection O O O O
of O O O O
serum O O O O
neutralizing O O O O
antibodies O O O O
to O O O O
porcine B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
circovirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
type O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
2 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
PCV2 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
Mab O O O O
with O O O O
neutralizing O O O O
activity O O O O
, O O O O
which O O O O
was O O O O
produced O O O O
by O O O O
immunizing O O O O
a O O O O
recombinant O O O O
capsid O O O O
protein O O O O
of O O O O
PCV2 O O O O
expressed O O O O
in O O O O
insect O O O O
cells O O O O
, O O O O
was O O O O
used O O O O
as O O O O
the O O O O
detector O O O O
antibody O O O O
. O O O O
    
The O O O O
assay O O O O
was O O O O
evaluated O O O O
in O O O O
comparison O O O O
with O O O O
a O O O O
serum O O O O
neutralization O O O O
assay O O O O
, O O O O
and O O O O
its O O O O
sensitivity O O O O
and O O O O
specificity O O O O
were O O O O
determined O O O O
to O O O O
be O O O O
98 O O O O
. O O O O
8 O O O O
% O O O O
and O O O O
88 O O O O
. O O O O
5 O O O O
% O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
A O O O O
significant O O O O
positive O O O O
correlation O O O O
was O O O O
found O O O O
between O O O O
results O O O O
of O O O O
the O O O O
blocking O O O O
ELISA O O O O
and O O O O
the O O O O
serum O O O O
neutralization O O O O
assay O O O O
( O O O O
r O O O O
= O O O O
0 O O O O
. O O O O
9381 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
assay O O O O
was O O O O
verified O O O O
by O O O O
testing O O O O
experimental O O O O
and O O O O
commercial O O O O
pig B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sera O O O O
. O O O O
    
A O O O O
longitudinal O O O O
antibody O O O O
profile O O O O
showed O O O O
that O O O O
serum O O O O
neutralizing O O O O
antibodies O O O O
were O O O O
detected O O O O
2 O O O O
weeks O O O O
after O O O O
vaccination O O O O
and O O O O
that O O O O
the O O O O
detection O O O O
rate O O O O
reached O O O O
100 O O O O
% O O O O
at O O O O
4 O O O O
weeks O O O O
. O O O O
    
The O O O O
serum O O O O
neutralizing O O O O
antibody O O O O
profile O O O O
showed O O O O
a O O O O
decrease O O O O
from O O O O
the O O O O
age O O O O
of O O O O
4 O O O O
to O O O O
13 O O O O
weeks O O O O
, O O O O
and O O O O
seroconversion O O O O
after O O O O
13 O O O O
weeks O O O O
in O O O O
pigs B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
from O O O O
a O O O O
commercial O O O O
pig B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
farm O O O O
. O O O O
    
Additionally O O O O
, O O O O
the O O O O
positive O O O O
detection O O O O
rate O O O O
in O O O O
703 O O O O
sera O O O O
collected O O O O
from O O O O
nine O O O O
commercial O O O O
pig B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
farms O O O O
was O O O O
73 O O O O
% O O O O
. O O O O
    
This O O O O
report O O O O
demonstrates O O O O
that O O O O
the O O O O
assay O O O O
is O O O O
a O O O O
simple O O O O
, O O O O
specific O O O O
, O O O O
sensitive O O O O
and O O O O
convenient O O O O
method O O O O
for O O O O
epidemiological O O O O
surveys O O O O
and O O O O
evaluations O O O O
of O O O O
serum O O O O
neutralizing O O O O
antibodies O O O O
against O O O O
PCV2 O O O O
. O O O O
    
Oramoeba B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fumarolia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gen O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
, O O O O
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
, O O O O
a O O O O
new O O O O
marine O O O O
heterolobosean O O O O
amoeboflagellate O O O O
growing O O O O
at O O O O
54 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
. O O O O
    
An O O O O
amoeba O O O O
strain O O O O
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
marine O O O O
sediment O O O O
taken O O O O
from O O O O
the O O O O
beach O O O O
near O O O O
a O O O O
fumarole O O O O
in O O O O
Italy O O O O
. O O O O
    
The O O O O
trophozoites O O O O
of O O O O
this O O O O
new O O O O
marine O O O O
species O O O O
transforms O O O O
into O O O O
flagellates O O O O
with O O O O
variable O O O O
numbers O O O O
of O O O O
flagella O O O O
, O O O O
from O O O O
2 O O O O
to O O O O
10 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
strain O O O O
forms O O O O
round O O O O
to O O O O
oval O O O O
cysts O O O O
. O O O O
    
This O O O O
thermophilic O O O O
amoeboflagellate O O O O
grows O O O O
at O O O O
temperatures O O O O
up O O O O
to O O O O
54 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
. O O O O
    
Molecular O O O O
phylogenetic O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
small O O O O
subunit O O O O
ribosomal O O O O
DNA O O O O
( O O O O
SSU O O O O
rDNA O O O O
) O O O O
places O O O O
the O O O O
amoeboflagellate O O O O
in O O O O
the O O O O
Heterolobosea O O O O
. O O O O
    
The O O O O
closest O O O O
relatives O O O O
are O O O O
Stachyamoeba B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ATCC50324 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
a O O O O
strain O O O O
isolated O O O O
from O O O O
an O O O O
ocean O O O O
sample O O O O
, O O O O
and O O O O
Vrihiamoeba B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
italica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
a O O O O
recent O O O O
isolate O O O O
from O O O O
a O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
field O O O O
. O O O O
    
Like O O O O
some O O O O
other O O O O
heterolobosean O O O O
species O O O O
, O O O O
this O O O O
new O O O O
isolate O O O O
has O O O O
a O O O O
group O O O O
I O O O O
intron O O O O
in O O O O
the O O O O
SSU O O O O
rDNA O O O O
. O O O O
    
Because O O O O
of O O O O
the O O O O
unique O O O O
place O O O O
in O O O O
the O O O O
molecular O O O O
phylogenetic O O O O
tree O O O O
, O O O O
and O O O O
because O O O O
there O O O O
is O O O O
no O O O O
species O O O O
found O O O O
in O O O O
the O O O O
literature O O O O
with O O O O
similar O O O O
morphological O O O O
and O O O O
physiological O O O O
characteristics O O O O
, O O O O
this O O O O
isolate O O O O
is O O O O
considered O O O O
to O O O O
be O O O O
a O O O O
new O O O O
genus O O O O
and O O O O
a O O O O
new O O O O
species O O O O
, O O O O
Oramoeba B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fumarolia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gen O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
, O O O O
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
    
Monoclonal O O O O
antibody O O O O
- O O O O
based O O O O
triple O O O O
antibody O O O O
sandwich O O O O
- O O O O
enzyme O O O O
- O O O O
linked O O O O
immunosorbent O O O O
assay O O O O
and O O O O
immunocapture O O O O
reverse O O O O
transcription O O O O
- O O O O
polymerase O O O O
chain O O O O
reaction O O O O
for O O O O
Odontoglossum B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ringspot O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
detection O O O O
. O O O O
    
Odontoglossum B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ringspot O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
ORSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
infects O O O O
numerous O O O O
commercially O O O O
important O O O O
orchids O O O O
and O O O O
causes O O O O
significant O O O O
losses O O O O
worldwide O O O O
. O O O O
    
The O O O O
coat O O O O
protein O O O O
( O O O O
CP O O O O
) O O O O
gene O O O O
of O O O O
ORSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
was O O O O
cloned O O O O
and O O O O
expressed O O O O
in O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
by O O O O
using O O O O
the O O O O
pET O O O O
- O O O O
32a O O O O
expression O O O O
vector O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
recombinant O O O O
protein O O O O
was O O O O
confirmed O O O O
by O O O O
Western O O O O
blotting O O O O
using O O O O
anti O O O O
- O O O O
ORSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
antibodies O O O O
. O O O O
    
The O O O O
recombinant O O O O
protein O O O O
was O O O O
purified O O O O
using O O O O
Ni O O O O
- O O O O
NTA O O O O
agarose O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
purified O O O O
protein O O O O
was O O O O
used O O O O
as O O O O
an O O O O
immunogen O O O O
to O O O O
produce O O O O
monoclonal O O O O
antibodies O O O O
( O O O O
MAbs O O O O
) O O O O
and O O O O
polyclonal O O O O
antibodies O O O O
( O O O O
PAbs O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Five O O O O
murine O O O O
MAbs O O O O
against O O O O
ORSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
CP O O O O
were O O O O
obtained O O O O
. O O O O
    
Among O O O O
them O O O O
, O O O O
two O O O O
MAbs O O O O
( O O O O
6B4 O O O O
and O O O O
1D1 O O O O
) O O O O
also O O O O
reacted O O O O
with O O O O
TMV O O O O
CP O O O O
. O O O O
    
The O O O O
triple O O O O
antibody O O O O
sandwich O O O O
enzyme O O O O
- O O O O
linked O O O O
immunosorbent O O O O
assay O O O O
( O O O O
TAS O O O O
- O O O O
ELISA O O O O
) O O O O
and O O O O
immunocapture O O O O
reverse O O O O
transcription O O O O
- O O O O
polymerase O O O O
chain O O O O
reaction O O O O
( O O O O
IC O O O O
- O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
) O O O O
methods O O O O
using O O O O
the O O O O
MAb O O O O
( O O O O
8A5 O O O O
) O O O O
were O O O O
then O O O O
developed O O O O
for O O O O
sensitive O O O O
, O O O O
specific O O O O
, O O O O
and O O O O
rapid O O O O
detection O O O O
of O O O O
ORSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
TAS O O O O
- O O O O
ELISA O O O O
and O O O O
IC O O O O
- O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
could O O O O
detect O O O O
ORSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
in O O O O
the O O O O
infected O O O O
leaf O O O O
saps O O O O
with O O O O
dilutions O O O O
of O O O O
1 O O O O
: O O O O
10 O O O O
, O O O O
240 O O O O
and O O O O
1 O O O O
: O O O O
81 O O O O
, O O O O
920 O O O O
( O O O O
w O O O O
/ O O O O
v O O O O
, O O O O
g O O O O
mL O O O O
( O O O O
- O O O O
1 O O O O
) O O O O
) O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
TAS O O O O
- O O O O
ELISA O O O O
and O O O O
IC O O O O
- O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
detections O O O O
indicated O O O O
that O O O O
ORSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
was O O O O
prevalent O O O O
in O O O O
orchids O O O O
in O O O O
the O O O O
Zhejiang O O O O
Province O O O O
of O O O O
China O O O O
. O O O O
    
Detection O O O O
and O O O O
discrimination O O O O
of O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
family O O O O
Luteoviridae O O O O
by O O O O
real O O O O
- O O O O
time O O O O
PCR O O O O
and O O O O
SYBR O O O O
( O O O O
R O O O O
) O O O O
GreenER O O O O
( O O O O
TM O O O O
) O O O O
melting O O O O
curve O O O O
analysis O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
investigated O O O O
the O O O O
suitability O O O O
of O O O O
a O O O O
two O O O O
step O O O O
real O O O O
- O O O O
time O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
melting O O O O
curve O O O O
analysis O O O O
as O O O O
a O O O O
tool O O O O
for O O O O
the O O O O
detection O O O O
and O O O O
discrimination O O O O
of O O O O
nine O O O O
species O O O O
in O O O O
the O O O O
plant O O O O
virus O O O O
family O O O O
Luteoviridae O O O O
, O O O O
being O O O O
Soybean B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
dwarf O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
[ O O O O
SbDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
] O O O O
, O O O O
Bean B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
leafroll O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
[ O O O O
BLRV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
] O O O O
, O O O O
Beet B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
chlorosis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
[ O O O O
BChV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
] O O O O
, O O O O
Beet B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mild O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
yellowing O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
[ O O O O
BMYV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
] O O O O
, O O O O
Beet B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
western O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
yellows O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
[ O O O O
BWYV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
] O O O O
, O O O O
Cereal B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
yellow O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
dwarf O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
RPV O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
[ O O O O
CYDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
RPV O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
] O O O O
, O O O O
Cucurbit B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aphid O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
borne O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
yellows O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
[ O O O O
CABYV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
] O O O O
, O O O O
Potato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
leafroll O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
[ O O O O
PLRV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
] O O O O
and O O O O
Turnip B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
yellows O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
[ O O O O
TuYV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
] O O O O
. O O O O
    
Melting O O O O
temperature O O O O
and O O O O
shape O O O O
of O O O O
the O O O O
melting O O O O
peak O O O O
were O O O O
analysed O O O O
for O O O O
68 O O O O
bp O O O O
and O O O O
148 O O O O
bp O O O O
coat O O O O
protein O O O O
gene O O O O
amplicons O O O O
using O O O O
SYBR O O O O
( O O O O
R O O O O
) O O O O
GreenER O O O O
( O O O O
TM O O O O
) O O O O
fluorescent O O O O
dye O O O O
. O O O O
    
Specific O O O O
melting O O O O
peaks O O O O
with O O O O
unique O O O O
melting O O O O
temperature O O O O
were O O O O
observed O O O O
for O O O O
the O O O O
various O O O O
species O O O O
of O O O O
the O O O O
family O O O O
Luteoviridae O O O O
using O O O O
the O O O O
68 O O O O
bp O O O O
amplicon O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
with O O O O
the O O O O
148 O O O O
bp O O O O
amplicon O O O O
. O O O O
    
Due O O O O
to O O O O
the O O O O
high O O O O
variability O O O O
of O O O O
sequences O O O O
for O O O O
some O O O O
members O O O O
of O O O O
this O O O O
family O O O O
, O O O O
different O O O O
melting O O O O
temperatures O O O O
were O O O O
also O O O O
observed O O O O
between O O O O
different O O O O
isolates O O O O
of O O O O
the O O O O
species O O O O
CYDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
RPV O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
TuYV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Nevertheless O O O O
, O O O O
discrimination O O O O
between O O O O
species O O O O
was O O O O
achieved O O O O
for O O O O
SbDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
BLRV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
BChV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
BMYV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
CABYV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
either O O O O
PLRV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
or O O O O
BWYV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Melting O O O O
curve O O O O
analysis O O O O
, O O O O
in O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
is O O O O
a O O O O
faster O O O O
and O O O O
more O O O O
discriminatory O O O O
alternative O O O O
to O O O O
gel O O O O
electrophoresis O O O O
of O O O O
end O O O O
- O O O O
point O O O O
PCR O O O O
products O O O O
for O O O O
the O O O O
detection O O O O
of O O O O
Luteoviridae O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
Detection O O O O
and O O O O
differentiation O O O O
of O O O O
tick B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
borne O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
encephalitis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
subtypes O O O O
by O O O O
a O O O O
reverse O O O O
transcription O O O O
quantitative O O O O
real O O O O
- O O O O
time O O O O
PCR O O O O
and O O O O
pyrosequencing O O O O
. O O O O
    
Tick B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
borne O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
encephalitis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
TBE O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
causes O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
most O O O O
important O O O O
flaviviral O O O O
infections O O O O
of O O O O
the O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
central O O O O
nervous O O O O
system O O O O
in O O O O
Europe O O O O
and O O O O
Asia O O O O
. O O O O
    
In O O O O
recent O O O O
years O O O O
the O O O O
rate O O O O
of O O O O
TBE B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infection O O O O
has O O O O
been O O O O
raising O O O O
and O O O O
the O O O O
virus O O O O
has O O O O
been O O O O
spreading O O O O
to O O O O
new O O O O
areas O O O O
. O O O O
    
Currently O O O O
, O O O O
the O O O O
diagnosis O O O O
of O O O O
TBE B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
is O O O O
based O O O O
on O O O O
detection O O O O
of O O O O
specific O O O O
antibodies O O O O
in O O O O
patients O O O O
' O O O O
sera O O O O
which O O O O
appear O O O O
as O O O O
late O O O O
as O O O O
about O O O O
2 O O O O
weeks O O O O
post O O O O
- O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
For O O O O
a O O O O
timely O O O O
diagnosis O O O O
of O O O O
TBE B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
infections O O O O
and O O O O
epidemiological O O O O
studies O O O O
, O O O O
a O O O O
TBE B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O O O O
specific O O O O
reverse O O O O
transcription O O O O
quantitative O O O O
real O O O O
- O O O O
time O O O O
PCR O O O O
( O O O O
RT O O O O
- O O O O
qPCR O O O O
) O O O O
followed O O O O
by O O O O
pyrosequencing O O O O
was O O O O
developed O O O O
. O O O O
    
The O O O O
assay O O O O
is O O O O
based O O O O
on O O O O
one O O O O
degenerated O O O O
primer O O O O
pair O O O O
detecting O O O O
all O O O O
three O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
pathogenic O O O O
TBE B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
subtypes O O O O
with O O O O
a O O O O
detection O O O O
limit O O O O
of O O O O
10 O O O O
copies O O O O
. O O O O
    
Even O O O O
though O O O O
primers O O O O
and O O O O
probe O O O O
are O O O O
highly O O O O
degenerated O O O O
, O O O O
the O O O O
assay O O O O
is O O O O
specific O O O O
for O O O O
TBE B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
species O O O O
and O O O O
detects O O O O
all O O O O
subtypes O O O O
with O O O O
a O O O O
comparable O O O O
sensitivity O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
TBE B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
RT O O O O
- O O O O
qPCR O O O O
could O O O O
be O O O O
carried O O O O
out O O O O
as O O O O
one O O O O
- O O O O
step O O O O
or O O O O
two O O O O
- O O O O
step O O O O
assay O O O O
. O O O O
    
RT O O O O
- O O O O
qPCR O O O O
can O O O O
be O O O O
followed O O O O
by O O O O
pyrosequencing O O O O
which O O O O
allows O O O O
a O O O O
rapid O O O O
subtyping O O O O
of O O O O
TBE B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
viruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
For O O O O
detection O O O O
purposes O O O O
an O O O O
internal O O O O
control O O O O
to O O O O
monitor O O O O
RNA O O O O
extraction O O O O
, O O O O
cDNA O O O O
synthesis O O O O
and O O O O
amplification O O O O
is O O O O
included O O O O
. O O O O
    
In O O O O
summary O O O O
, O O O O
the O O O O
method O O O O
is O O O O
sensitive O O O O
, O O O O
highly O O O O
specific O O O O
and O O O O
easy O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
handle O O O O
tool O O O O
for O O O O
the O O O O
detection O O O O
and O O O O
differentiation O O O O
of O O O O
TBE B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
the O O O O
early O O O O
phase O O O O
of O O O O
illness O O O O
or O O O O
in O O O O
TBE B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
host O O O O
animal O O O O
species O O O O
and O O O O
ticks O O O O
. O O O O
    
Adaptation O O O O
of O O O O
a O O O O
Madin O O O O
- O O O O
Darby O O O O
canine B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
kidney O O O O
cell O O O O
line O O O O
to O O O O
suspension O O O O
growth O O O O
in O O O O
serum O O O O
- O O O O
free O O O O
media O O O O
and O O O O
comparison O O O O
of O O O O
its O O O O
ability O O O O
to O O O O
produce O O O O
avian O O O O
influenza O O O O
virus O O O O
to O O O O
Vero O O O O
and O O O O
BHK21 O O O O
cell O O O O
lines O O O O
. O O O O
    
Madin O O O O
- O O O O
Darby O O O O
canine B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
kidney O O O O
( O O O O
MDCK O O O O
) O O O O
cells O O O O
are O O O O
currently O O O O
considered O O O O
for O O O O
influenza O O O O
vaccine O O O O
manufacturing O O O O
. O O O O
    
A O O O O
drawback O O O O
of O O O O
these O O O O
cells O O O O
is O O O O
their O O O O
anchorage O O O O
dependent O O O O
growth O O O O
, O O O O
which O O O O
greatly O O O O
complicates O O O O
process O O O O
scale O O O O
- O O O O
up O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
paper O O O O
a O O O O
novel O O O O
MDCK O O O O
cell O O O O
line O O O O
( O O O O
MDCK O O O O
- O O O O
SFS O O O O
) O O O O
is O O O O
described O O O O
that O O O O
grows O O O O
efficiently O O O O
in O O O O
suspension O O O O
and O O O O
retained O O O O
high O O O O
expression O O O O
levels O O O O
of O O O O
both O O O O
alpha O O O O
- O O O O
2 O O O O
, O O O O
6 O O O O
and O O O O
alpha O O O O
- O O O O
2 O O O O
, O O O O
3 O O O O
sialic O O O O
acid O O O O
receptors O O O O
, O O O O
which O O O O
bind O O O O
preferably O O O O
to O O O O
human O O O O
and O O O O
avian O O O O
influenza O O O O
viruses O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
The O O O O
production O O O O
of O O O O
avian O O O O
influenza O O O O
virus O O O O
by O O O O
BHK21 O O O O
, O O O O
Vero O O O O
and O O O O
MDCK O O O O
- O O O O
SFS O O O O
cell O O O O
lines O O O O
was O O O O
compared O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
BHK21 O O O O
cells O O O O
consisted O O O O
of O O O O
two O O O O
populations O O O O
, O O O O
one O O O O
of O O O O
which O O O O
lacks O O O O
the O O O O
alpha O O O O
- O O O O
2 O O O O
, O O O O
3 O O O O
receptor O O O O
, O O O O
they O O O O
supported O O O O
the O O O O
replication O O O O
of O O O O
two O O O O
influenza O O O O
strains O O O O
to O O O O
high O O O O
titres O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
BHK21 O O O O
cells O O O O
are O O O O
generally O O O O
not O O O O
applicable O O O O
for O O O O
influenza O O O O
production O O O O
since O O O O
they O O O O
supported O O O O
the O O O O
replication O O O O
of O O O O
six O O O O
further O O O O
strains O O O O
poorly O O O O
. O O O O
    
MDCK O O O O
- O O O O
SFS O O O O
cells O O O O
yielded O O O O
the O O O O
highest O O O O
infectious O O O O
virus O O O O
titres O O O O
and O O O O
virus O O O O
genome O O O O
equivalent O O O O
concentration O O O O
for O O O O
five O O O O
of O O O O
the O O O O
eight O O O O
influenza O O O O
strains O O O O
analyzed O O O O
and O O O O
the O O O O
highest O O O O
hemagglutination O O O O
activity O O O O
for O O O O
all O O O O
eight O O O O
virus O O O O
strains O O O O
. O O O O
    
Taken O O O O
together O O O O
with O O O O
their O O O O
suitability O O O O
for O O O O
suspension O O O O
growth O O O O
this O O O O
makes O O O O
the O O O O
MDCK O O O O
- O O O O
SFS O O O O
cell O O O O
line O O O O
potentially O O O O
useful O O O O
for O O O O
large O O O O
scale O O O O
influenza O O O O
virus O O O O
production O O O O
. O O O O
    
Cyanobacterial O O O O
endosymbionts O O O O
in O O O O
the O O O O
benthic O O O O
dinoflagellate O O O O
Sinophysis O O O O
canaliculata O O O O
( O O O O
Dinophysiales O O O O
, O O O O
Dinophyceae O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Photosynthetic O O O O
dinoflagellates O O O O
possess O O O O
a O O O O
great O O O O
diversity O O O O
of O O O O
plastids O O O O
that O O O O
have O O O O
been O O O O
acquired O O O O
through O O O O
successful O O O O
serial O O O O
endosymbiosis O O O O
. O O O O
    
The O O O O
peridinin O O O O
- O O O O
containing O O O O
plastid O O O O
in O O O O
dinoflagellates O O O O
is O O O O
canonical O O O O
, O O O O
but O O O O
many O O O O
other O O O O
types O O O O
are O O O O
known O O O O
within O O O O
this O O O O
group O O O O
. O O O O
    
Within O O O O
the O O O O
Dinophysiales O O O O
, O O O O
several O O O O
species O O O O
of O O O O
Dinophysis O O O O
contain O O O O
plastids O O O O
, O O O O
derived O O O O
from O O O O
cryptophytes O O O O
or O O O O
haptophytes O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
work O O O O
, O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
numerous O O O O
intracellular O O O O
cyanobacteria O O O O
- O O O O
like O O O O
microorganisms O O O O
compartmentalized O O O O
by O O O O
a O O O O
separate O O O O
membrane O O O O
is O O O O
reported O O O O
for O O O O
the O O O O
first O O O O
time O O O O
within O O O O
the O O O O
benthic O O O O
dinophysoid O O O O
dinoflagellate O O O O
Sinophysis O O O O
canaliculata O O O O
Quod O O O O
et O O O O
al O O O O
. O O O O
, O O O O
a O O O O
species O O O O
from O O O O
a O O O O
genus O O O O
morphologically O O O O
close O O O O
to O O O O
Dinophysis O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
the O O O O
contribution O O O O
of O O O O
these O O O O
cyanobacterial O O O O
endosymbionts O O O O
to O O O O
S O O O O
. O O O O
canaliculata O O O O
is O O O O
still O O O O
unknown O O O O
, O O O O
this O O O O
finding O O O O
suggests O O O O
a O O O O
possible O O O O
undergoing O O O O
primary O O O O
endosymbiosis O O O O
in O O O O
a O O O O
dinoflagellate O O O O
. O O O O
    
Roles O O O O
of O O O O
vaccinia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
genes O O O O
E3L O O O O
and O O O O
K3L O O O O
and O O O O
host O O O O
genes O O O O
PKR O O O O
and O O O O
RNase O O O O
L O O O O
during O O O O
intratracheal O O O O
infection O O O O
of O O O O
C57BL O O O O
/ O O O O
6 O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
importance O O O O
of O O O O
the O O O O
2 O O O O
' O O O O
- O O O O
5 O O O O
' O O O O
oligoadenylate O O O O
synthetase O O O O
( O O O O
OAS O O O O
) O O O O
/ O O O O
RNase O O O O
L O O O O
and O O O O
double O O O O
- O O O O
stranded O O O O
RNA O O O O
( O O O O
dsRNA O O O O
) O O O O
- O O O O
dependent O O O O
protein O O O O
kinase O O O O
( O O O O
PKR O O O O
) O O O O
pathways O O O O
in O O O O
host O O O O
interferon O O O O
induction O O O O
resulting O O O O
from O O O O
virus O O O O
infection O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
dsRNA O O O O
has O O O O
been O O O O
well O O O O
documented O O O O
. O O O O
    
In O O O O
poxvirus O O O O
infections O O O O
, O O O O
the O O O O
interactions O O O O
between O O O O
the O O O O
vaccinia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
VV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
genes O O O O
E3L O O O O
and O O O O
K3L O O O O
, O O O O
which O O O O
target O O O O
RNase O O O O
L O O O O
and O O O O
PKR O O O O
, O O O O
respectively O O O O
, O O O O
serve O O O O
to O O O O
prevent O O O O
the O O O O
induction O O O O
of O O O O
the O O O O
dsRNA O O O O
- O O O O
dependent O O O O
induced O O O O
interferon O O O O
response O O O O
in O O O O
cell O O O O
culture O O O O
. O O O O
    
To O O O O
determine O O O O
the O O O O
importance O O O O
of O O O O
these O O O O
host O O O O
genes O O O O
in O O O O
controlling O O O O
VV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infections O O O O
, O O O O
mouse B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
single O O O O
- O O O O
gene O O O O
knockouts O O O O
of O O O O
RNase O O O O
L O O O O
and O O O O
PKR O O O O
and O O O O
double O O O O
- O O O O
knockout O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
were O O O O
studied O O O O
following O O O O
intratracheal O O O O
infection O O O O
with O O O O
VV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
VVDeltaK3L B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
or O O O O
VVDeltaE3L O O O O
. O O O O
    
VV O O O O
caused O O O O
lethal O O O O
disease O O O O
in O O O O
all O O O O
mouse B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
strains O O O O
. O O O O
    
The O O O O
single O O O O
- O O O O
knockout O O O O
animals O O O O
were O O O O
more O O O O
susceptible O O O O
than O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
animals O O O O
, O O O O
while O O O O
the O O O O
RNase O O O O
L O O O O
( O O O O
- O O O O
/ O O O O
- O O O O
) O O O O
PKR O O O O
( O O O O
- O O O O
/ O O O O
- O O O O
) O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
were O O O O
the O O O O
most O O O O
susceptible O O O O
. O O O O
    
VVDeltaE3L O O O O
infections O O O O
of O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
were O O O O
asymptomatic O O O O
, O O O O
demonstrating O O O O
that O O O O
E3L O O O O
plays O O O O
a O O O O
critical O O O O
role O O O O
in O O O O
controlling O O O O
the O O O O
host O O O O
immune O O O O
response O O O O
. O O O O
    
RNase O O O O
L O O O O
( O O O O
- O O O O
/ O O O O
- O O O O
) O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
showed O O O O
no O O O O
disease O O O O
, O O O O
whereas O O O O
20 O O O O
% O O O O
of O O O O
the O O O O
PKR O O O O
( O O O O
- O O O O
/ O O O O
- O O O O
) O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
succumbed O O O O
at O O O O
a O O O O
dose O O O O
of O O O O
10 O O O O
( O O O O
8 O O O O
) O O O O
PFU O O O O
. O O O O
    
Lethal O O O O
disease O O O O
was O O O O
routinely O O O O
observed O O O O
in O O O O
RNase O O O O
L O O O O
( O O O O
- O O O O
/ O O O O
- O O O O
) O O O O
PKR O O O O
( O O O O
- O O O O
/ O O O O
- O O O O
) O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
inoculated O O O O
with O O O O
10 O O O O
( O O O O
8 O O O O
) O O O O
PFU O O O O
of O O O O
VVDeltaE3L O O O O
, O O O O
with O O O O
a O O O O
distinct O O O O
pathology O O O O
. O O O O
    
VVDeltaK3L O O O O
infections O O O O
exhibited O O O O
no O O O O
differences O O O O
in O O O O
virulence O O O O
among O O O O
any O O O O
of O O O O
the O O O O
mouse B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
constructs O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
PKR O O O O
is O O O O
not O O O O
the O O O O
exclusive O O O O
target O O O O
of O O O O
K3L O O O O
. O O O O
    
Surprisingly O O O O
, O O O O
VVDeltaK3L O O O O
did O O O O
not O O O O
disseminate O O O O
to O O O O
other O O O O
tissues O O O O
from O O O O
the O O O O
lung O O O O
. O O O O
    
Hence O O O O
, O O O O
the O O O O
cause O O O O
of O O O O
death O O O O
in O O O O
this O O O O
model O O O O
is O O O O
respiratory O O O O
disease O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
also O O O O
suggest O O O O
that O O O O
an O O O O
unanticipated O O O O
role O O O O
of O O O O
the O O O O
K3L O O O O
gene O O O O
is O O O O
to O O O O
facilitate O O O O
virus O O O O
dissemination O O O O
. O O O O
    
Host O O O O
plant O O O O
secondary O O O O
metabolite O O O O
profiling O O O O
shows O O O O
a O O O O
complex O O O O
, O O O O
strain O O O O
- O O O O
dependent O O O O
response O O O O
of O O O O
maize B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
to O O O O
plant O O O O
growth O O O O
- O O O O
promoting O O O O
rhizobacteria O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Azospirillum O O O O
. O O O O
    
Most O O O O
Azospirillum O O O O
plant O O O O
growth O O O O
- O O O O
promoting O O O O
rhizobacteria O O O O
( O O O O
PGPR O O O O
) O O O O
benefit O O O O
plant O O O O
growth O O O O
through O O O O
source O O O O
effects O O O O
related O O O O
to O O O O
free O O O O
nitrogen O O O O
fixation O O O O
and O O O O
/ O O O O
or O O O O
phytohormone O O O O
production O O O O
, O O O O
but O O O O
little O O O O
is O O O O
known O O O O
about O O O O
their O O O O
potential O O O O
effects O O O O
on O O O O
plant O O O O
physiology O O O O
. O O O O
    
These O O O O
effects O O O O
were O O O O
assessed O O O O
by O O O O
comparing O O O O
the O O O O
early O O O O
impacts O O O O
of O O O O
three O O O O
Azospirillum O O O O
inoculant O O O O
strains O O O O
on O O O O
secondary O O O O
metabolite O O O O
profiles O O O O
of O O O O
two O O O O
different O O O O
maize B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
Zea B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mays O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
cultivars O O O O
. O O O O
    
After O O O O
10d O O O O
of O O O O
growth O O O O
in O O O O
nonsterile O O O O
soil O O O O
, O O O O
maize B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
methanolic O O O O
extracts O O O O
were O O O O
analyzed O O O O
by O O O O
reverse O O O O
- O O O O
phase O O O O
high O O O O
- O O O O
performance O O O O
liquid O O O O
chromatography O O O O
( O O O O
RP O O O O
- O O O O
HPLC O O O O
) O O O O
and O O O O
secondary O O O O
metabolites O O O O
identified O O O O
by O O O O
liquid O O O O
chromatography O O O O
/ O O O O
mass O O O O
spectrometry O O O O
( O O O O
LC O O O O
/ O O O O
MS O O O O
) O O O O
and O O O O
nuclear O O O O
magnetic O O O O
resonance O O O O
( O O O O
NMR O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Seed O O O O
inoculation O O O O
resulted O O O O
in O O O O
increased O O O O
shoot O O O O
biomass O O O O
( O O O O
and O O O O
also O O O O
root O O O O
biomass O O O O
with O O O O
one O O O O
strain O O O O
) O O O O
of O O O O
hybrid O O O O
PR37Y15 O O O O
but O O O O
had O O O O
no O O O O
stimulatory O O O O
effect O O O O
on O O O O
hybrid O O O O
DK315 O O O O
. O O O O
    
In O O O O
parallel O O O O
, O O O O
Azospirillum O O O O
inoculation O O O O
led O O O O
to O O O O
major O O O O
qualitative O O O O
and O O O O
quantitative O O O O
modifications O O O O
of O O O O
the O O O O
contents O O O O
of O O O O
secondary O O O O
metabolites O O O O
, O O O O
especially O O O O
benzoxazinoids O O O O
, O O O O
in O O O O
the O O O O
maize B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
plants O O O O
. O O O O
    
These O O O O
modifications O O O O
depended O O O O
on O O O O
the O O O O
PGPR O O O O
strainxplant O O O O
cultivar O O O O
combination O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
Azospirillum O O O O
inoculation O O O O
resulted O O O O
in O O O O
early O O O O
, O O O O
strain O O O O
- O O O O
dependent O O O O
modifications O O O O
in O O O O
the O O O O
biosynthetic O O O O
pathways O O O O
of O O O O
benzoxazine O O O O
derivatives O O O O
in O O O O
maize B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
in O O O O
compatible O O O O
interactions O O O O
. O O O O
    
This O O O O
is O O O O
the O O O O
first O O O O
study O O O O
documenting O O O O
a O O O O
PGPR O O O O
effect O O O O
on O O O O
plant O O O O
secondary O O O O
metabolite O O O O
profiles O O O O
, O O O O
and O O O O
suggests O O O O
the O O O O
establishment O O O O
of O O O O
complex O O O O
interactions O O O O
between O O O O
Azospirillum O O O O
PGPR O O O O
and O O O O
maize O O O O
. O O O O
    
A O O O O
seed O O O O
high O O O O
- O O O O
lysine O O O O
trait O O O O
is O O O O
negatively O O O O
associated O O O O
with O O O O
the O O O O
TCA O O O O
cycle O O O O
and O O O O
slows O O O O
down O O O O
Arabidopsis O O O O
seed O O O O
germination O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Lysine O O O O
is O O O O
a O O O O
nutritionally O O O O
important O O O O
essential O O O O
amino O O O O
acid O O O O
, O O O O
but O O O O
significant O O O O
elevation O O O O
of O O O O
its O O O O
levels O O O O
in O O O O
Arabidopsis O O O O
seeds O O O O
, O O O O
by O O O O
enhancing O O O O
its O O O O
synthesis O O O O
and O O O O
blocking O O O O
its O O O O
catabolism O O O O
, O O O O
causes O O O O
a O O O O
retardation O O O O
of O O O O
germination O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
hypothesized O O O O
that O O O O
this O O O O
negative O O O O
effect O O O O
is O O O O
associated O O O O
with O O O O
changes O O O O
in O O O O
primary O O O O
metabolism O O O O
and O O O O
gene O O O O
expression O O O O
programs O O O O
that O O O O
are O O O O
essential O O O O
for O O O O
early O O O O
germination O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Seeds O O O O
at O O O O
different O O O O
stages O O O O
of O O O O
germination O O O O
sensu O O O O
stricto O O O O
of O O O O
the O O O O
seed O O O O
- O O O O
high O O O O
- O O O O
lysine O O O O
genotype O O O O
were O O O O
subjected O O O O
to O O O O
detailed O O O O
analysis O O O O
of O O O O
primary O O O O
metabolism O O O O
, O O O O
using O O O O
GC O O O O
- O O O O
MS O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
microarray O O O O
analysis O O O O
and O O O O
two O O O O
- O O O O
dimensional O O O O
, O O O O
isoelectric O O O O
focusing O O O O
, O O O O
sodium O O O O
dodecylsulfate O O O O
polyacrylamide O O O O
gel O O O O
electrophoresis O O O O
, O O O O
to O O O O
detect O O O O
storage O O O O
protein O O O O
mobilization O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Our O O O O
results O O O O
exposed O O O O
a O O O O
major O O O O
negative O O O O
effect O O O O
of O O O O
the O O O O
seed O O O O
- O O O O
specific O O O O
increased O O O O
lysine O O O O
synthesis O O O O
and O O O O
knockout O O O O
of O O O O
its O O O O
catabolism O O O O
on O O O O
the O O O O
levels O O O O
of O O O O
a O O O O
number O O O O
of O O O O
TCA O O O O
cycle O O O O
metabolites O O O O
. O O O O
    
This O O O O
metabolic O O O O
alteration O O O O
also O O O O
influences O O O O
significantly O O O O
the O O O O
transcriptome O O O O
, O O O O
primarily O O O O
attenuating O O O O
the O O O O
boost O O O O
of O O O O
specific O O O O
transcriptional O O O O
programs O O O O
that O O O O
are O O O O
essential O O O O
for O O O O
seedling O O O O
establishment O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
the O O O O
onset O O O O
of O O O O
photosynthesis O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
the O O O O
turnover O O O O
of O O O O
specific O O O O
transcriptional O O O O
programs O O O O
associated O O O O
with O O O O
seed O O O O
embryonic O O O O
traits O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Our O O O O
results O O O O
indicate O O O O
that O O O O
catabolism O O O O
of O O O O
the O O O O
aspartic O O O O
acid O O O O
family O O O O
of O O O O
amino O O O O
acids O O O O
is O O O O
an O O O O
important O O O O
contributor O O O O
to O O O O
the O O O O
energy O O O O
status O O O O
of O O O O
plants O O O O
, O O O O
and O O O O
hence O O O O
to O O O O
the O O O O
onset O O O O
of O O O O
autotrophic O O O O
growth O O O O
- O O O O
associated O O O O
processes O O O O
during O O O O
germination O O O O
. O O O O
    
Functional O O O O
characterization O O O O
of O O O O
pheromone O O O O
receptors O O O O
in O O O O
the O O O O
tobacco B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
budworm O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Heliothis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virescens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Functional O O O O
analyses O O O O
of O O O O
candidate O O O O
Heliothis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virescens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pheromone O O O O
odorant O O O O
receptors O O O O
( O O O O
HvORs O O O O
) O O O O
were O O O O
conducted O O O O
using O O O O
heterologous O O O O
expression O O O O
in O O O O
Xenopus O O O O
oocytes O O O O
. O O O O
    
HvOR6 O O O O
was O O O O
found O O O O
to O O O O
be O O O O
highly O O O O
tuned O O O O
to O O O O
Z9 O O O O
- O O O O
14 O O O O
: O O O O
Ald O O O O
, O O O O
while O O O O
HvOR13 O O O O
, O O O O
HvOR14 O O O O
and O O O O
HvOR16 O O O O
showed O O O O
specificity O O O O
for O O O O
Z11 O O O O
- O O O O
16 O O O O
: O O O O
Ald O O O O
, O O O O
Z11 O O O O
- O O O O
16 O O O O
: O O O O
OAc O O O O
and O O O O
Z11 O O O O
- O O O O
16 O O O O
: O O O O
OH O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
HvOR15 O O O O
, O O O O
which O O O O
had O O O O
been O O O O
considered O O O O
a O O O O
candidate O O O O
receptor O O O O
for O O O O
Z9 O O O O
- O O O O
14 O O O O
: O O O O
Ald O O O O
did O O O O
not O O O O
respond O O O O
to O O O O
any O O O O
of O O O O
the O O O O
pheromone O O O O
compounds O O O O
tested O O O O
, O O O O
nor O O O O
to O O O O
50 O O O O
other O O O O
general O O O O
odorants O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
while O O O O
HvOR15 O O O O
is O O O O
specifically O O O O
expressed O O O O
in O O O O
H B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virescens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
male O O O O
antennae O O O O
, O O O O
its O O O O
role O O O O
in O O O O
pheromone O O O O
reception O O O O
remains O O O O
unknown O O O O
. O O O O
    
Based O O O O
on O O O O
our O O O O
results O O O O
and O O O O
previous O O O O
research O O O O
we O O O O
can O O O O
now O O O O
assign O O O O
pheromone O O O O
receptors O O O O
in O O O O
H B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virescens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
males O O O O
to O O O O
each O O O O
of O O O O
the O O O O
critical O O O O
H B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virescens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
agonistic O O O O
pheromone O O O O
compounds O O O O
and O O O O
two O O O O
antagonistic O O O O
compounds O O O O
produced O O O O
by O O O O
heterospecific O O O O
females O O O O
. O O O O
    
Glycinebetaine O O O O
protects O O O O
plants O O O O
against O O O O
abiotic O O O O
stress O O O O
: O O O O
mechanisms O O O O
and O O O O
biotechnological O O O O
applications O O O O
. O O O O
    
Various O O O O
compatible O O O O
solutes O O O O
enable O O O O
plants O O O O
to O O O O
tolerate O O O O
abiotic O O O O
stress O O O O
, O O O O
and O O O O
glycinebetaine O O O O
( O O O O
GB O O O O
) O O O O
is O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
most O O O O
- O O O O
studied O O O O
among O O O O
such O O O O
solutes O O O O
. O O O O
    
Early O O O O
research O O O O
on O O O O
GB O O O O
focused O O O O
on O O O O
the O O O O
maintenance O O O O
of O O O O
cellular O O O O
osmotic O O O O
potential O O O O
in O O O O
plant O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Subsequent O O O O
genetically O O O O
engineered O O O O
synthesis O O O O
of O O O O
GB O O O O
- O O O O
biosynthetic O O O O
enzymes O O O O
and O O O O
studies O O O O
of O O O O
transgenic O O O O
plants O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
accumulation O O O O
of O O O O
GB O O O O
increases O O O O
tolerance O O O O
of O O O O
plants O O O O
to O O O O
various O O O O
abiotic O O O O
stresses O O O O
at O O O O
all O O O O
stages O O O O
of O O O O
their O O O O
life O O O O
cycle O O O O
. O O O O
    
Such O O O O
GB O O O O
- O O O O
accumulating O O O O
plants O O O O
exhibit O O O O
various O O O O
advantageous O O O O
traits O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
enlarged O O O O
fruits O O O O
and O O O O
flowers O O O O
and O O O O
/ O O O O
or O O O O
increased O O O O
seed O O O O
number O O O O
under O O O O
non O O O O
- O O O O
stress O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
levels O O O O
of O O O O
GB O O O O
in O O O O
transgenic O O O O
GB O O O O
- O O O O
accumulating O O O O
plants O O O O
are O O O O
relatively O O O O
low O O O O
being O O O O
, O O O O
generally O O O O
, O O O O
in O O O O
the O O O O
millimolar O O O O
range O O O O
. O O O O
    
Nonetheless O O O O
, O O O O
these O O O O
low O O O O
levels O O O O
of O O O O
GB O O O O
confer O O O O
considerable O O O O
tolerance O O O O
to O O O O
various O O O O
stresses O O O O
, O O O O
without O O O O
necessarily O O O O
contributing O O O O
significantly O O O O
to O O O O
cellular O O O O
osmotic O O O O
potential O O O O
. O O O O
    
Moreover O O O O
, O O O O
low O O O O
levels O O O O
of O O O O
GB O O O O
, O O O O
applied O O O O
exogenously O O O O
or O O O O
generated O O O O
by O O O O
transgenes O O O O
for O O O O
GB O O O O
biosynthesis O O O O
, O O O O
can O O O O
induce O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
certain O O O O
stress O O O O
- O O O O
responsive O O O O
genes O O O O
, O O O O
including O O O O
those O O O O
for O O O O
enzymes O O O O
that O O O O
scavenge O O O O
reactive O O O O
oxygen O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
transgenic O O O O
approaches O O O O
that O O O O
increase O O O O
tolerance O O O O
to O O O O
abiotic O O O O
stress O O O O
have O O O O
enhanced O O O O
our O O O O
understanding O O O O
of O O O O
mechanisms O O O O
that O O O O
protect O O O O
plants O O O O
against O O O O
such O O O O
stress O O O O
. O O O O
    
Evaluation O O O O
of O O O O
an O O O O
immunoglobulin O O O O
M O O O O
- O O O O
specific O O O O
capture O O O O
enzyme O O O O
- O O O O
linked O O O O
immunosorbent O O O O
assay O O O O
for O O O O
rapid O O O O
diagnosis O O O O
of O O O O
dengue B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infection O O O O
. O O O O
    
Various O O O O
assays O O O O
have O O O O
been O O O O
developed O O O O
to O O O O
diagnose O O O O
dengue B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
infection O O O O
, O O O O
relying O O O O
on O O O O
techniques O O O O
from O O O O
the O O O O
fields O O O O
of O O O O
serology O O O O
and O O O O
molecular O O O O
biology O O O O
. O O O O
    
Many O O O O
of O O O O
these O O O O
assays O O O O
have O O O O
been O O O O
successful O O O O
, O O O O
but O O O O
there O O O O
is O O O O
still O O O O
an O O O O
urgent O O O O
need O O O O
for O O O O
accurate O O O O
, O O O O
simple O O O O
and O O O O
rapid O O O O
diagnostic O O O O
assays O O O O
to O O O O
diagnose O O O O
dengue B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
infection O O O O
and O O O O
to O O O O
assist O O O O
in O O O O
patient O O O O
management O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
a O O O O
panel O O O O
of O O O O
well O O O O
- O O O O
characterized O O O O
sera O O O O
and O O O O
a O O O O
collection O O O O
of O O O O
retrospective O O O O
samples O O O O
obtained O O O O
during O O O O
the O O O O
dengue B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
epidemics O O O O
that O O O O
occurred O O O O
in O O O O
Belem O O O O
, O O O O
Brazil O O O O
, O O O O
between O O O O
2002 O O O O
and O O O O
2009 O O O O
, O O O O
a O O O O
modified O O O O
immunoglobulin O O O O
M O O O O
- O O O O
specific O O O O
capture O O O O
enzyme O O O O
- O O O O
linked O O O O
immunosorbent O O O O
assay O O O O
( O O O O
Rapid O O O O
- O O O O
MAC O O O O
- O O O O
ELISA O O O O
) O O O O
was O O O O
evaluated O O O O
and O O O O
compared O O O O
with O O O O
the O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
gold O O O O
standard O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
MAC O O O O
- O O O O
ELISA O O O O
, O O O O
in O O O O
order O O O O
to O O O O
assess O O O O
the O O O O
specificity O O O O
, O O O O
sensitivity O O O O
, O O O O
stability O O O O
, O O O O
reproducibility O O O O
and O O O O
cost O O O O
- O O O O
effectiveness O O O O
of O O O O
this O O O O
new O O O O
assay O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
the O O O O
Rapid O O O O
- O O O O
MAC O O O O
- O O O O
ELISA O O O O
is O O O O
comparable O O O O
to O O O O
the O O O O
MAC O O O O
- O O O O
ELISA O O O O
in O O O O
terms O O O O
of O O O O
sensitivity O O O O
and O O O O
specificity O O O O
and O O O O
is O O O O
highly O O O O
reproducible O O O O
; O O O O
additionally O O O O
, O O O O
it O O O O
is O O O O
easily O O O O
performed O O O O
, O O O O
less O O O O
expensive O O O O
than O O O O
other O O O O
available O O O O
formats O O O O
and O O O O
can O O O O
be O O O O
completed O O O O
within O O O O
three O O O O
hours O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
the O O O O
Rapid O O O O
- O O O O
MAC O O O O
- O O O O
ELISA O O O O
can O O O O
be O O O O
used O O O O
for O O O O
the O O O O
diagnosis O O O O
of O O O O
dengue B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
infections O O O O
in O O O O
resource O O O O
- O O O O
limited O O O O
areas O O O O
where O O O O
dengue B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
is O O O O
endemic O O O O
. O O O O
    
Rapid O O O O
detection O O O O
of O O O O
Newcastle B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
disease O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
replication O O O O
in O O O O
embryonated O O O O
chicken B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
eggs O O O O
using O O O O
quantitative O O O O
real O O O O
time O O O O
polymerase O O O O
chain O O O O
reaction O O O O
. O O O O
    
Newcastle B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
disease O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
NDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
, O O O O
an O O O O
avian O O O O
paramyxovirus O O O O
, O O O O
is O O O O
an O O O O
economically O O O O
important O O O O
disease O O O O
of O O O O
poultry B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
globally O O O O
. O O O O
    
Rapid O O O O
methods O O O O
to O O O O
detect O O O O
and O O O O
differentiate O O O O
the O O O O
virus O O O O
are O O O O
important O O O O
to O O O O
curtail O O O O
the O O O O
spread O O O O
of O O O O
this O O O O
virus O O O O
. O O O O
    
Nucleic O O O O
acid O O O O
based O O O O
detection O O O O
methods O O O O
are O O O O
routinely O O O O
employed O O O O
for O O O O
diagnosis O O O O
that O O O O
suffer O O O O
from O O O O
the O O O O
disadvantage O O O O
of O O O O
failure O O O O
to O O O O
discriminate O O O O
viable O O O O
virus O O O O
and O O O O
non O O O O
- O O O O
infectious O O O O
genome O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
virus O O O O
isolation O O O O
remains O O O O
the O O O O
gold O O O O
standard O O O O
for O O O O
diagnosis O O O O
of O O O O
field O O O O
outbreaks O O O O
. O O O O
    
The O O O O
sensitivity O O O O
of O O O O
virus O O O O
isolation O O O O
was O O O O
combined O O O O
with O O O O
nucleic O O O O
acid O O O O
based O O O O
detection O O O O
methods O O O O
so O O O O
that O O O O
the O O O O
time O O O O
taken O O O O
for O O O O
confirmatory O O O O
diagnosis O O O O
could O O O O
be O O O O
considerably O O O O
reduced O O O O
while O O O O
increasing O O O O
sensitivity O O O O
. O O O O
    
Quantitative O O O O
real O O O O
time O O O O
reverse O O O O
transcription O O O O
polymerase O O O O
chain O O O O
reaction O O O O
( O O O O
qRT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
) O O O O
and O O O O
conventional O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
techniques O O O O
were O O O O
compared O O O O
for O O O O
the O O O O
detection O O O O
of O O O O
NDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
genome O O O O
replication O O O O
in O O O O
9 O O O O
- O O O O
11 O O O O
- O O O O
day O O O O
- O O O O
old O O O O
embryonated O O O O
chicken B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
eggs O O O O
( O O O O
ECE O O O O
) O O O O
using O O O O
the O O O O
nucleoprotein O O O O
( O O O O
NP O O O O
) O O O O
gene O O O O
of O O O O
the O O O O
virus O O O O
as O O O O
a O O O O
target O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
at O O O O
least O O O O
two O O O O
to O O O O
fourfold O O O O
increase O O O O
in O O O O
cycle O O O O
threshold O O O O
( O O O O
C O O O O
( O O O O
t O O O O
) O O O O
) O O O O
values O O O O
over O O O O
the O O O O
baseline O O O O
C O O O O
( O O O O
t O O O O
) O O O O
value O O O O
of O O O O
samples O O O O
lacking O O O O
infectious O O O O
virus O O O O
, O O O O
would O O O O
indicate O O O O
live O O O O
NDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
replication O O O O
. O O O O
    
The O O O O
limit O O O O
of O O O O
detection O O O O
of O O O O
NDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
replication O O O O
using O O O O
qRT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
was O O O O
1x10 O O O O
( O O O O
4 O O O O
. O O O O
0 O O O O
) O O O O
mean O O O O
embryo O O O O
infective O O O O
doses O O O O
( O O O O
EID O O O O
( O O O O
50 O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
earliest O O O O
time O O O O
point O O O O
when O O O O
live O O O O
virus O O O O
replication O O O O
was O O O O
detectable O O O O
by O O O O
qRT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
or O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
was O O O O
30h O O O O
post O O O O
- O O O O
inoculation O O O O
in O O O O
ECE O O O O
. O O O O
    
Development O O O O
of O O O O
a O O O O
polyprobe O O O O
to O O O O
detect O O O O
six O O O O
viroids O O O O
of O O O O
pome O O O O
and O O O O
stone O O O O
fruit O O O O
trees O O O O
. O O O O
    
A O O O O
simple O O O O
and O O O O
sensitive O O O O
dot O O O O
blot O O O O
hybridization O O O O
assay O O O O
using O O O O
a O O O O
digoxigenin O O O O
- O O O O
labeled O O O O
cRNA O O O O
polyprobe O O O O
was O O O O
developed O O O O
for O O O O
the O O O O
simultaneous O O O O
detection O O O O
of O O O O
six O O O O
viroids O O O O
that O O O O
infect O O O O
pome O O O O
and O O O O
stone O O O O
fruit O O O O
trees O O O O
. O O O O
    
The O O O O
polyprobe O O O O
was O O O O
constructed O O O O
by O O O O
cloning O O O O
sequentially O O O O
partial O O O O
sequences O O O O
of O O O O
each O O O O
viroid O O O O
into O O O O
a O O O O
single O O O O
vector O O O O
, O O O O
with O O O O
run O O O O
- O O O O
off O O O O
transcription O O O O
driven O O O O
by O O O O
the O O O O
T7 O O O O
promoter O O O O
. O O O O
    
All O O O O
six O O O O
viroids O O O O
were O O O O
detectable O O O O
within O O O O
a O O O O
dilution O O O O
range O O O O
of O O O O
5 O O O O
( O O O O
- O O O O
3 O O O O
) O O O O
to O O O O
5 O O O O
( O O O O
- O O O O
4 O O O O
) O O O O
in O O O O
total O O O O
nucleic O O O O
acid O O O O
extracts O O O O
from O O O O
infected O O O O
trees O O O O
. O O O O
    
Individual O O O O
trees O O O O
were O O O O
co O O O O
- O O O O
inoculated O O O O
to O O O O
create O O O O
mixed O O O O
infections O O O O
and O O O O
all O O O O
four O O O O
pome O O O O
fruit O O O O
viroids O O O O
and O O O O
both O O O O
stone O O O O
fruit O O O O
viroids O O O O
could O O O O
be O O O O
detected O O O O
in O O O O
pear O O O O
and O O O O
peach B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trees O O O O
, O O O O
respectively O O O O
, O O O O
using O O O O
the O O O O
polyprobe O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
of O O O O
the O O O O
assays O O O O
using O O O O
the O O O O
polyprobe O O O O
were O O O O
comparable O O O O
to O O O O
those O O O O
using O O O O
single O O O O
probes O O O O
. O O O O
    
The O O O O
methods O O O O
were O O O O
validated O O O O
by O O O O
testing O O O O
geographically O O O O
diverse O O O O
isolates O O O O
of O O O O
viroids O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
field O O O O
samples O O O O
from O O O O
several O O O O
collections O O O O
in O O O O
the O O O O
US O O O O
. O O O O
    
The O O O O
assay O O O O
offers O O O O
a O O O O
rapid O O O O
, O O O O
reliable O O O O
and O O O O
cost O O O O
- O O O O
effective O O O O
approach O O O O
to O O O O
the O O O O
simultaneous O O O O
detection O O O O
of O O O O
six O O O O
fruit O O O O
trees O O O O
viroids O O O O
and O O O O
has O O O O
the O O O O
potential O O O O
for O O O O
routine O O O O
use O O O O
in O O O O
quarantine O O O O
, O O O O
certification O O O O
, O O O O
and O O O O
plant O O O O
genebank O O O O
programs O O O O
where O O O O
many O O O O
samples O O O O
are O O O O
tested O O O O
and O O O O
distributed O O O O
worldwide O O O O
. O O O O
    
Development O O O O
and O O O O
validation O O O O
of O O O O
a O O O O
lateral O O O O
flow O O O O
immunoassay O O O O
using O O O O
colloidal O O O O
gold O O O O
for O O O O
the O O O O
identification O O O O
of O O O O
serotype O O O O
- O O O O
specific O O O O
foot B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
mouth O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
disease O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
O O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
Asia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
A O O O O
lateral O O O O
flow O O O O
immunoassay O O O O
( O O O O
LFI O O O O
) O O O O
was O O O O
developed O O O O
to O O O O
identify O O O O
and O O O O
diagnose O O O O
foot B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
mouth O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
disease O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
FMDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
serotypes O O O O
O B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
Asia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Antibodies O O O O
obtained O O O O
from O O O O
rabbits B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
guinea O O O O
pigs O O O O
immunized O O O O
with O O O O
cell O O O O
- O O O O
culture O O O O
- O O O O
adapted O O O O
virus O O O O
strains O O O O
( O O O O
O B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
CHA O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
99 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
GS O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
LX O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
66 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Asia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
CHN O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
05 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
and O O O O
suckling O O O O
- O O O O
mouse B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
adapted O O O O
virus O O O O
strains O O O O
( O O O O
O B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
AV99 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
L O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
AV88 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
L O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Asia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
YNBS O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
58 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
were O O O O
used O O O O
as O O O O
capture O O O O
antibodies O O O O
. O O O O
    
The O O O O
diagnostic O O O O
kit O O O O
included O O O O
three O O O O
immunochromatographic O O O O
strips O O O O
of O O O O
types O O O O
O B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
Asia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
the O O O O
type O O O O
- O O O O
specific O O O O
results O O O O
were O O O O
confirmed O O O O
by O O O O
color O O O O
on O O O O
the O O O O
test O O O O
lines O O O O
of O O O O
the O O O O
three O O O O
strips O O O O
. O O O O
    
The O O O O
LFI O O O O
was O O O O
evaluated O O O O
using O O O O
epithelial O O O O
and O O O O
vesicular O O O O
samples O O O O
( O O O O
n O O O O
= O O O O
396 O O O O
) O O O O
prepared O O O O
from O O O O
current O O O O
and O O O O
historical O O O O
field O O O O
samples O O O O
( O O O O
provide O O O O
by O O O O
the O O O O
National O O O O
Foot O O O O
- O O O O
and O O O O
- O O O O
Mouth O O O O
Disease O O O O
Reference O O O O
Laboratory O O O O
of O O O O
China O O O O
at O O O O
Lanzhou O O O O
Veterinary O O O O
Research O O O O
Institute O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Negative O O O O
samples O O O O
( O O O O
n O O O O
= O O O O
95 O O O O
) O O O O
were O O O O
collected O O O O
from O O O O
healthy O O O O
animals O O O O
. O O O O
    
The O O O O
diagnostic O O O O
sensitivity O O O O
of O O O O
the O O O O
LFI O O O O
for O O O O
FMDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
serotypes O O O O
O B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
Asia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
88 O O O O
. O O O O
3 O O O O
% O O O O
compared O O O O
to O O O O
89 O O O O
. O O O O
7 O O O O
% O O O O
obtained O O O O
by O O O O
the O O O O
reference O O O O
method O O O O
of O O O O
indirect O O O O
- O O O O
sandwich O O O O
ELISA O O O O
. O O O O
    
The O O O O
sensitivity O O O O
of O O O O
the O O O O
LFI O O O O
for O O O O
FMDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
type O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Asia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
higher O O O O
at O O O O
92 O O O O
. O O O O
1 O O O O
% O O O O
compared O O O O
to O O O O
90 O O O O
. O O O O
5 O O O O
% O O O O
for O O O O
the O O O O
ELISA O O O O
. O O O O
    
The O O O O
specificity O O O O
of O O O O
the O O O O
LFI O O O O
was O O O O
97 O O O O
. O O O O
1 O O O O
% O O O O
compared O O O O
with O O O O
97 O O O O
. O O O O
4 O O O O
% O O O O
. O O O O
    
Implementation O O O O
and O O O O
validation O O O O
of O O O O
a O O O O
sensitive O O O O
PCR O O O O
detection O O O O
method O O O O
in O O O O
the O O O O
eradication O O O O
campaign O O O O
against O O O O
Aleutian B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mink O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
disease O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Aleutian B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mink O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
disease O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
AMDV O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
a O O O O
severe O O O O
progressive O O O O
disease O O O O
causing O O O O
multiple O O O O
different O O O O
clinical O O O O
syndromes O O O O
in O O O O
mink B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
In O O O O
Denmark O O O O
, O O O O
the O O O O
disease O O O O
is O O O O
notifiable O O O O
and O O O O
under O O O O
official O O O O
control O O O O
. O O O O
    
The O O O O
control O O O O
programme O O O O
, O O O O
based O O O O
on O O O O
serological O O O O
screening O O O O
, O O O O
has O O O O
confined O O O O
successfully O O O O
AMDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
to O O O O
the O O O O
northern O O O O
part O O O O
of O O O O
Denmark O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
re O O O O
- O O O O
infections O O O O
and O O O O
new O O O O
introductions O O O O
of O O O O
virus O O O O
into O O O O
farms O O O O
require O O O O
a O O O O
confirmatory O O O O
virological O O O O
test O O O O
to O O O O
verify O O O O
the O O O O
positive O O O O
test O O O O
results O O O O
of O O O O
single O O O O
animals O O O O
and O O O O
ultimately O O O O
to O O O O
investigate O O O O
disease O O O O
transmission O O O O
. O O O O
    
A O O O O
one O O O O
step O O O O
PCR O O O O
amplifying O O O O
a O O O O
374 O O O O
- O O O O
base O O O O
fragment O O O O
of O O O O
the O O O O
NS1 O O O O
gene O O O O
of O O O O
AMDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
was O O O O
compared O O O O
to O O O O
the O O O O
counter O O O O
- O O O O
current O O O O
immune O O O O
electrophoresis O O O O
( O O O O
CIE O O O O
) O O O O
routinely O O O O
used O O O O
in O O O O
the O O O O
serological O O O O
screening O O O O
programme O O O O
. O O O O
    
Mink B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
organs O O O O
( O O O O
n O O O O
= O O O O
299 O O O O
) O O O O
obtained O O O O
from O O O O
55 O O O O
recently O O O O
infected O O O O
farms O O O O
and O O O O
8 O O O O
non O O O O
- O O O O
infected O O O O
farms O O O O
from O O O O
2008 O O O O
to O O O O
2010 O O O O
were O O O O
tested O O O O
by O O O O
PCR O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
results O O O O
were O O O O
found O O O O
to O O O O
have O O O O
a O O O O
high O O O O
correlation O O O O
with O O O O
the O O O O
serological O O O O
status O O O O
of O O O O
the O O O O
mink B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
relative O O O O
diagnostic O O O O
sensitivity O O O O
of O O O O
the O O O O
PCR O O O O
was O O O O
94 O O O O
. O O O O
7 O O O O
% O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
relative O O O O
diagnostic O O O O
specificity O O O O
was O O O O
97 O O O O
. O O O O
9 O O O O
% O O O O
when O O O O
read O O O O
in O O O O
parallel O O O O
with O O O O
the O O O O
CIE O O O O
. O O O O
    
PCR O O O O
positive O O O O
samples O O O O
were O O O O
sequenced O O O O
and O O O O
phylogenetic O O O O
analysis O O O O
revealed O O O O
high O O O O
similarity O O O O
within O O O O
the O O O O
analysed O O O O
AMDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
strains O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
to O O O O
AMDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
strains O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
described O O O O
previously O O O O
. O O O O
    
A O O O O
new O O O O
method O O O O
for O O O O
detection O O O O
of O O O O
pandemic B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
influenza O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
using O O O O
High O O O O
Resolution O O O O
Melting O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
neuraminidase O O O O
gene O O O O
. O O O O
    
Diagnostic O O O O
methods O O O O
based O O O O
upon O O O O
exclusive O O O O
detection O O O O
of O O O O
haemagglutinin O O O O
do O O O O
not O O O O
detect O O O O
sequence O O O O
variation O O O O
in O O O O
other O O O O
gene O O O O
segments O O O O
of O O O O
the O O O O
Influenza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
A O O O O
complementary O O O O
approach O O O O
is O O O O
described O O O O
based O O O O
upon O O O O
high O O O O
- O O O O
resolution O O O O
melting O O O O
curve O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
neuraminidase O O O O
gene O O O O
, O O O O
an O O O O
approach O O O O
with O O O O
the O O O O
potential O O O O
ability O O O O
to O O O O
detect O O O O
small O O O O
changes O O O O
in O O O O
the O O O O
neuraminidase O O O O
sequence O O O O
without O O O O
the O O O O
need O O O O
for O O O O
specific O O O O
probes O O O O
. O O O O
    
Physiological O O O O
and O O O O
morphological O O O O
adaptations O O O O
in O O O O
relation O O O O
to O O O O
water O O O O
use O O O O
efficiency O O O O
in O O O O
Mediterranean O O O O
accessions O O O O
of O O O O
Solanum B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
lycopersicum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
physiological O O O O
traits O O O O
underlying O O O O
the O O O O
apparent O O O O
drought O O O O
resistance O O O O
of O O O O
' O O O O
Tomatiga O O O O
de O O O O
Ramellet O O O O
' O O O O
( O O O O
TR O O O O
) O O O O
cultivars O O O O
, O O O O
a O O O O
population O O O O
of O O O O
Mediterranean O O O O
tomato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cultivars O O O O
with O O O O
delayed O O O O
fruit O O O O
deterioration O O O O
( O O O O
DFD O O O O
) O O O O
phenotype O O O O
and O O O O
typically O O O O
grown O O O O
under O O O O
non O O O O
- O O O O
irrigation O O O O
conditions O O O O
, O O O O
are O O O O
evaluated O O O O
. O O O O
    
Eight O O O O
different O O O O
tomato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
accessions O O O O
were O O O O
selected O O O O
and O O O O
included O O O O
six O O O O
TR O O O O
accessions O O O O
, O O O O
one O O O O
Mediterranean O O O O
non O O O O
- O O O O
TR O O O O
accession O O O O
( O O O O
NTR O O O O
( O O O O
M O O O O
) O O O O
) O O O O
and O O O O
a O O O O
processing O O O O
cultivar O O O O
( O O O O
NTR O O O O
( O O O O
O O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Among O O O O
the O O O O
TR O O O O
accessions O O O O
two O O O O
leaf O O O O
morphology O O O O
types O O O O
, O O O O
normal O O O O
divided O O O O
leaves O O O O
and O O O O
potato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
leaf O O O O
, O O O O
were O O O O
selected O O O O
. O O O O
    
Plants O O O O
were O O O O
field O O O O
grown O O O O
under O O O O
well O O O O
- O O O O
watered O O O O
( O O O O
WW O O O O
) O O O O
and O O O O
water O O O O
- O O O O
stressed O O O O
( O O O O
WS O O O O
) O O O O
treatments O O O O
, O O O O
with O O O O
30 O O O O
and O O O O
10 O O O O
% O O O O
of O O O O
soil O O O O
water O O O O
capacity O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
Accessions O O O O
were O O O O
clustered O O O O
according O O O O
to O O O O
the O O O O
leaf O O O O
type O O O O
and O O O O
TR O O O O
phenotype O O O O
under O O O O
WW O O O O
and O O O O
WS O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
Correlation O O O O
among O O O O
parameters O O O O
under O O O O
the O O O O
different O O O O
water O O O O
treatments O O O O
suggested O O O O
that O O O O
potential O O O O
improvements O O O O
in O O O O
the O O O O
intrinsic O O O O
water O O O O
- O O O O
use O O O O
efficiency O O O O
( O O O O
A O O O O
( O O O O
N O O O O
) O O O O
/ O O O O
g O O O O
( O O O O
s O O O O
) O O O O
) O O O O
are O O O O
possible O O O O
without O O O O
negative O O O O
impacts O O O O
on O O O O
yield O O O O
. O O O O
    
Under O O O O
WS O O O O
TR O O O O
accessions O O O O
displayed O O O O
higher O O O O
A O O O O
( O O O O
N O O O O
) O O O O
/ O O O O
g O O O O
( O O O O
s O O O O
) O O O O
, O O O O
which O O O O
was O O O O
not O O O O
due O O O O
to O O O O
differences O O O O
in O O O O
Rubisco O O O O
- O O O O
related O O O O
parameters O O O O
, O O O O
but O O O O
correlated O O O O
with O O O O
the O O O O
ratio O O O O
between O O O O
the O O O O
leaf O O O O
mesophyll O O O O
and O O O O
stomatal O O O O
conductances O O O O
( O O O O
g O O O O
( O O O O
m O O O O
) O O O O
/ O O O O
g O O O O
( O O O O
s O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
confirm O O O O
the O O O O
existence O O O O
of O O O O
differential O O O O
traits O O O O
in O O O O
the O O O O
response O O O O
to O O O O
drought O O O O
stress O O O O
in O O O O
Mediterranean O O O O
accessions O O O O
of O O O O
tomato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
and O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
increases O O O O
in O O O O
the O O O O
g O O O O
( O O O O
m O O O O
) O O O O
/ O O O O
g O O O O
( O O O O
s O O O O
) O O O O
ratio O O O O
would O O O O
allow O O O O
improvements O O O O
in O O O O
A O O O O
( O O O O
N O O O O
) O O O O
/ O O O O
g O O O O
( O O O O
s O O O O
) O O O O
in O O O O
horticultural O O O O
crops O O O O
. O O O O
    
A O O O O
new O O O O
filter O O O O
that O O O O
accurately O O O O
mimics O O O O
the O O O O
solar O O O O
UV O O O O
- O O O O
B O O O O
spectrum O O O O
using O O O O
standard O O O O
UV O O O O
lamps O O O O
: O O O O
the O O O O
photochemical O O O O
properties O O O O
, O O O O
stabilization O O O O
and O O O O
use O O O O
of O O O O
the O O O O
urate O O O O
anion O O O O
liquid O O O O
filter O O O O
. O O O O
    
The O O O O
physiological O O O O
effects O O O O
unique O O O O
to O O O O
solar O O O O
ultraviolet O O O O
( O O O O
UV O O O O
) O O O O
- O O O O
B O O O O
exposure O O O O
( O O O O
280 O O O O
- O O O O
315 O O O O
nm O O O O
) O O O O
are O O O O
difficult O O O O
to O O O O
accurately O O O O
replicate O O O O
in O O O O
the O O O O
laboratory O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
evaluates O O O O
the O O O O
effectiveness O O O O
of O O O O
the O O O O
sodium O O O O
urate O O O O
anion O O O O
in O O O O
a O O O O
liquid O O O O
filter O O O O
that O O O O
yields O O O O
a O O O O
spectrum O O O O
nearly O O O O
indistinguishable O O O O
from O O O O
the O O O O
solar O O O O
UV O O O O
- O O O O
B O O O O
spectrum O O O O
while O O O O
filtering O O O O
the O O O O
emissions O O O O
of O O O O
widely O O O O
used O O O O
UV O O O O
- O O O O
B O O O O
lamps O O O O
. O O O O
    
The O O O O
photochemical O O O O
properties O O O O
and O O O O
stability O O O O
of O O O O
this O O O O
filter O O O O
are O O O O
examined O O O O
and O O O O
weighed O O O O
against O O O O
a O O O O
typical O O O O
spectrum O O O O
of O O O O
ground O O O O
- O O O O
level O O O O
solar O O O O
UV O O O O
- O O O O
B O O O O
radiation O O O O
. O O O O
    
To O O O O
test O O O O
the O O O O
effectiveness O O O O
of O O O O
this O O O O
filter O O O O
, O O O O
light O O O O
- O O O O
saturated O O O O
photosynthetic O O O O
oxygen O O O O
evolution O O O O
rates O O O O
were O O O O
measured O O O O
following O O O O
exposure O O O O
to O O O O
UV O O O O
- O O O O
B O O O O
filtered O O O O
either O O O O
by O O O O
this O O O O
urate O O O O
filter O O O O
or O O O O
the O O O O
widely O O O O
used O O O O
cellulose O O O O
acetate O O O O
( O O O O
CA O O O O
) O O O O
filter O O O O
. O O O O
    
The O O O O
ubiquitous O O O O
marine O O O O
Chlorophyte O O O O
alga O O O O
Dunaliella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tertiolecta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
tested O O O O
under O O O O
identical O O O O
UV O O O O
- O O O O
B O O O O
flux O O O O
densities O O O O
coupled O O O O
with O O O O
ecologically O O O O
realistic O O O O
fluxes O O O O
of O O O O
UV O O O O
- O O O O
A O O O O
and O O O O
visible O O O O
radiation O O O O
for O O O O
6 O O O O
and O O O O
12 O O O O
h O O O O
exposures O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
indicate O O O O
that O O O O
the O O O O
urate O O O O
- O O O O
filtered O O O O
UV O O O O
- O O O O
B O O O O
radiation O O O O
yields O O O O
minor O O O O
photosynthetic O O O O
inhibition O O O O
when O O O O
compared O O O O
with O O O O
exposures O O O O
lacking O O O O
in O O O O
UV O O O O
- O O O O
B O O O O
. O O O O
    
This O O O O
is O O O O
in O O O O
agreement O O O O
with O O O O
published O O O O
experiments O O O O
using O O O O
solar O O O O
radiation O O O O
. O O O O
    
In O O O O
sharp O O O O
contrast O O O O
, O O O O
radiation O O O O
filtered O O O O
by O O O O
CA O O O O
filters O O O O
produced O O O O
large O O O O
inhibition O O O O
of O O O O
photosynthesis O O O O
. O O O O
    
The O O O O
13C O O O O
/ O O O O
12C O O O O
isotopic O O O O
signal O O O O
of O O O O
day O O O O
- O O O O
respired O O O O
CO2 O O O O
in O O O O
variegated O O O O
leaves O O O O
of O O O O
Pelargonium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
x O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
hortorum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
In O O O O
leaves O O O O
, O O O O
although O O O O
it O O O O
is O O O O
accepted O O O O
that O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
evolved O O O O
by O O O O
dark O O O O
respiration O O O O
after O O O O
illumination O O O O
is O O O O
naturally O O O O
( O O O O
13 O O O O
) O O O O
C O O O O
- O O O O
enriched O O O O
compared O O O O
to O O O O
organic O O O O
matter O O O O
or O O O O
substrate O O O O
sucrose O O O O
, O O O O
much O O O O
uncertainty O O O O
remains O O O O
on O O O O
whether O O O O
day O O O O
respiration O O O O
produces O O O O
( O O O O
13 O O O O
) O O O O
C O O O O
- O O O O
depleted O O O O
or O O O O
( O O O O
13 O O O O
) O O O O
C O O O O
- O O O O
enriched O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
applied O O O O
equations O O O O
described O O O O
previously O O O O
for O O O O
mesocosm O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
exchange O O O O
to O O O O
investigate O O O O
the O O O O
carbon O O O O
isotope O O O O
composition O O O O
of O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
respired O O O O
by O O O O
autotrophic O O O O
and O O O O
heterotrophic O O O O
tissues O O O O
of O O O O
Pelargonium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
x O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
hortorum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
leaves O O O O
, O O O O
taking O O O O
advantage O O O O
of O O O O
leaf O O O O
variegation O O O O
. O O O O
    
Day O O O O
- O O O O
respired O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
was O O O O
slightly O O O O
( O O O O
13 O O O O
) O O O O
C O O O O
- O O O O
depleted O O O O
compared O O O O
to O O O O
organic O O O O
matter O O O O
both O O O O
under O O O O
21 O O O O
% O O O O
O O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
and O O O O
2 O O O O
% O O O O
O O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
most O O O O
, O O O O
if O O O O
not O O O O
all O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
molecules O O O O
evolved O O O O
in O O O O
the O O O O
light O O O O
came O O O O
from O O O O
carbon O O O O
atoms O O O O
that O O O O
had O O O O
been O O O O
fixed O O O O
previously O O O O
before O O O O
the O O O O
experiments O O O O
, O O O O
in O O O O
both O O O O
variegated O O O O
and O O O O
green O O O O
leaves O O O O
. O O O O
    
We O O O O
conclude O O O O
that O O O O
the O O O O
usual O O O O
definition O O O O
of O O O O
day O O O O
respiratory O O O O
fractionation O O O O
, O O O O
that O O O O
assumes O O O O
carbon O O O O
fixed O O O O
by O O O O
current O O O O
net O O O O
photosynthesis O O O O
is O O O O
the O O O O
respiratory O O O O
substrate O O O O
, O O O O
is O O O O
not O O O O
valid O O O O
in O O O O
Pelargonium O O O O
leaves O O O O
under O O O O
our O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
In O O O O
variegated O O O O
leaves O O O O
, O O O O
total O O O O
organic O O O O
matter O O O O
was O O O O
slightly O O O O
( O O O O
13 O O O O
) O O O O
C O O O O
- O O O O
depleted O O O O
in O O O O
white O O O O
areas O O O O
and O O O O
so O O O O
were O O O O
most O O O O
primary O O O O
metabolites O O O O
. O O O O
    
This O O O O
small O O O O
isotopic O O O O
difference O O O O
between O O O O
white O O O O
and O O O O
green O O O O
areas O O O O
probably O O O O
came O O O O
from O O O O
the O O O O
small O O O O
contribution O O O O
of O O O O
photosynthetic O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
refixation O O O O
and O O O O
the O O O O
specific O O O O
nitrogen O O O O
metabolism O O O O
in O O O O
white O O O O
leaf O O O O
areas O O O O
. O O O O
    
Auxin O O O O
depletion O O O O
in O O O O
barley B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
plants O O O O
under O O O O
high O O O O
- O O O O
temperature O O O O
conditions O O O O
represses O O O O
DNA O O O O
proliferation O O O O
in O O O O
organelles O O O O
and O O O O
nuclei O O O O
via O O O O
transcriptional O O O O
alterations O O O O
. O O O O
    
Many O O O O
plant O O O O
species O O O O
are O O O O
susceptible O O O O
to O O O O
high O O O O
- O O O O
temperature O O O O
( O O O O
HT O O O O
) O O O O
injury O O O O
during O O O O
reproductive O O O O
development O O O O
. O O O O
    
We O O O O
recently O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
HT O O O O
represses O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
YUCCA O O O O
auxin O O O O
biosynthesis O O O O
genes O O O O
and O O O O
reduces O O O O
endogenous O O O O
auxin O O O O
in O O O O
the O O O O
developing O O O O
anthers O O O O
of O O O O
barley B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
Arabidopsis O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
show O O O O
that O O O O
DNA O O O O
proliferation O O O O
in O O O O
mitochondria O O O O
, O O O O
chloroplasts O O O O
and O O O O
nuclei O O O O
of O O O O
developing O O O O
panicles O O O O
is O O O O
inhibited O O O O
with O O O O
increasing O O O O
temperatures O O O O
in O O O O
barley B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Following O O O O
DNA O O O O
proliferation O O O O
suppression O O O O
, O O O O
terminal O O O O
abnormalities O O O O
were O O O O
observed O O O O
in O O O O
the O O O O
organelles O O O O
of O O O O
anther O O O O
wall O O O O
cells O O O O
, O O O O
including O O O O
mitochondrial O O O O
swelling O O O O
and O O O O
overdevelopment O O O O
of O O O O
chloroplasts O O O O
. O O O O
    
Comprehensive O O O O
transcriptome O O O O
analyses O O O O
using O O O O
both O O O O
reproductive O O O O
organs O O O O
and O O O O
vegetative O O O O
tissues O O O O
showed O O O O
high O O O O
and O O O O
positive O O O O
pairwise O O O O
correlations O O O O
between O O O O
the O O O O
expression O O O O
profiles O O O O
of O O O O
auxin O O O O
- O O O O
induced O O O O
genes O O O O
, O O O O
DNA O O O O
replication O O O O
- O O O O
related O O O O
genes O O O O
and O O O O
mitochondrial O O O O
- O O O O
related O O O O
genes O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
, O O O O
the O O O O
expression O O O O
profiles O O O O
of O O O O
auxin O O O O
- O O O O
repressed O O O O
protein O O O O
genes O O O O
and O O O O
photosynthesis O O O O
- O O O O
/ O O O O
chloroplast O O O O
- O O O O
related O O O O
genes O O O O
were O O O O
negatively O O O O
correlated O O O O
with O O O O
those O O O O
of O O O O
the O O O O
previously O O O O
mentioned O O O O
genes O O O O
. O O O O
    
Under O O O O
HT O O O O
conditions O O O O
, O O O O
the O O O O
former O O O O
was O O O O
repressed O O O O
and O O O O
the O O O O
latter O O O O
was O O O O
up O O O O
- O O O O
regulated O O O O
in O O O O
the O O O O
developing O O O O
panicles O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
application O O O O
of O O O O
exogenous O O O O
auxin O O O O
promoted O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
DNA O O O O
replication O O O O
- O O O O
related O O O O
genes O O O O
under O O O O
HT O O O O
conditions O O O O
, O O O O
inducing O O O O
anther O O O O
cell O O O O
proliferation O O O O
. O O O O
    
These O O O O
suggest O O O O
that O O O O
compromised O O O O
auxin O O O O
biosynthesis O O O O
/ O O O O
IAA O O O O
level O O O O
under O O O O
HT O O O O
condition O O O O
results O O O O
in O O O O
nuclear O O O O
and O O O O
organellar O O O O
DNA O O O O
proliferation O O O O
arrest O O O O
due O O O O
to O O O O
co O O O O
- O O O O
transcriptional O O O O
alterations O O O O
. O O O O
    
Minimum O O O O
hydraulic O O O O
safety O O O O
leads O O O O
to O O O O
maximum O O O O
water O O O O
- O O O O
use O O O O
efficiency O O O O
in O O O O
a O O O O
forage O O O O
grass O O O O
. O O O O
    
Understanding O O O O
how O O O O
water O O O O
- O O O O
use O O O O
regulation O O O O
relates O O O O
to O O O O
biomass O O O O
accumulation O O O O
is O O O O
imperative O O O O
for O O O O
improving O O O O
crop O O O O
production O O O O
in O O O O
water O O O O
- O O O O
limited O O O O
environments O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
examine O O O O
how O O O O
the O O O O
vulnerability O O O O
of O O O O
xylem O O O O
to O O O O
water O O O O
stress O O O O
- O O O O
induced O O O O
cavitation O O O O
and O O O O
the O O O O
coordination O O O O
between O O O O
water O O O O
transport O O O O
capacity O O O O
and O O O O
assimilation O O O O
( O O O O
A O O O O
) O O O O
influences O O O O
diurnal O O O O
water O O O O
- O O O O
use O O O O
efficiency O O O O
( O O O O
WUE O O O O
) O O O O
and O O O O
dry O O O O
- O O O O
matter O O O O
production O O O O
in O O O O
Lolium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
perenne O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
L O O O O
. O O O O
    
- O O O O
a O O O O
commercial O O O O
forage O O O O
grass O O O O
. O O O O
    
Plants O O O O
were O O O O
exposed O O O O
to O O O O
a O O O O
range O O O O
of O O O O
water O O O O
stresses O O O O
, O O O O
causing O O O O
up O O O O
to O O O O
90 O O O O
% O O O O
leaf O O O O
death O O O O
, O O O O
by O O O O
withholding O O O O
water O O O O
and O O O O
then O O O O
rewatering O O O O
to O O O O
observe O O O O
the O O O O
recovery O O O O
process O O O O
. O O O O
    
Leaf O O O O
hydraulic O O O O
conductance O O O O
( O O O O
K O O O O
( O O O O
leaf O O O O
) O O O O
) O O O O
declined O O O O
to O O O O
50 O O O O
% O O O O
of O O O O
maximum O O O O
at O O O O
a O O O O
leaf O O O O
water O O O O
potential O O O O
( O O O O
psi O O O O
( O O O O
leaf O O O O
) O O O O
) O O O O
of O O O O
- O O O O
1 O O O O
MPa O O O O
, O O O O
whereas O O O O
complete O O O O
stomatal O O O O
closure O O O O
occurred O O O O
well O O O O
after O O O O
this O O O O
point O O O O
, O O O O
at O O O O
- O O O O
2 O O O O
. O O O O
35 O O O O
MPa O O O O
, O O O O
providing O O O O
no O O O O
protection O O O O
against O O O O
hydraulic O O O O
dysfunction O O O O
. O O O O
    
Instantaneous O O O O
A O O O O
remained O O O O
maximal O O O O
until O O O O
& O O O O
gt O O O O
; O O O O
70 O O O O
% O O O O
of O O O O
hydraulic O O O O
conductivity O O O O
had O O O O
been O O O O
lost O O O O
. O O O O
    
Post O O O O
- O O O O
stress O O O O
rewatering O O O O
showed O O O O
that O O O O
95 O O O O
% O O O O
loss O O O O
of O O O O
K O O O O
( O O O O
leaf O O O O
) O O O O
could O O O O
be O O O O
incurred O O O O
before O O O O
the O O O O
recovery O O O O
of O O O O
gas O O O O
exchange O O O O
exceeded O O O O
1 O O O O
d O O O O
, O O O O
with O O O O
a O O O O
rapid O O O O
transition O O O O
to O O O O
leaf O O O O
death O O O O
after O O O O
this O O O O
point O O O O
. O O O O
    
Plants O O O O
exposed O O O O
to O O O O
sustained O O O O
soil O O O O
water O O O O
deficits O O O O
through O O O O
restricted O O O O
nightly O O O O
watering O O O O
regimes O O O O
did O O O O
not O O O O
suffer O O O O
cumulative O O O O
losses O O O O
in O O O O
K O O O O
( O O O O
leaf O O O O
) O O O O
; O O O O
instead O O O O
, O O O O
psi O O O O
( O O O O
leaf O O O O
) O O O O
and O O O O
gas O O O O
exchange O O O O
recovered O O O O
diurnally O O O O
. O O O O
    
The O O O O
effect O O O O
was O O O O
improved O O O O
WUE O O O O
during O O O O
the O O O O
day O O O O
and O O O O
optimal O O O O
psi O O O O
( O O O O
leaf O O O O
) O O O O
during O O O O
the O O O O
night O O O O
for O O O O
the O O O O
maintenance O O O O
of O O O O
growth O O O O
. O O O O
    
Novel O O O O
mutations O O O O
reveal O O O O
two O O O O
important O O O O
regions O O O O
in O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
transcriptional O O O O
activator O O O O
MetR O O O O
. O O O O
    
Expression O O O O
of O O O O
the O O O O
sulfur O O O O
assimilation O O O O
pathway O O O O
in O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
under O O O O
control O O O O
of O O O O
sulfur O O O O
metabolite O O O O
repression O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
composed O O O O
of O O O O
scon O O O O
genes O O O O
encoding O O O O
subunits O O O O
of O O O O
ubiquitin O O O O
ligase O O O O
and O O O O
the O O O O
metR O O O O
gene O O O O
coding O O O O
for O O O O
a O O O O
transcriptional O O O O
activator O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
paper O O O O
we O O O O
report O O O O
three O O O O
dominant O O O O
suppressors O O O O
of O O O O
methionine O O O O
requirement O O O O
isolated O O O O
from O O O O
a O O O O
metB3 O O O O
diploid O O O O
strain O O O O
. O O O O
    
All O O O O
three O O O O
mutations O O O O
lead O O O O
to O O O O
the O O O O
substitution O O O O
of O O O O
phenylalanine O O O O
48 O O O O
by O O O O
serine O O O O
or O O O O
leucine O O O O
in O O O O
the O O O O
conserved O O O O
N O O O O
- O O O O
terminal O O O O
region O O O O
of O O O O
the O O O O
MetR O O O O
protein O O O O
. O O O O
    
Strains O O O O
carrying O O O O
the O O O O
dominant O O O O
suppressor O O O O
mutations O O O O
exhibit O O O O
increased O O O O
activities O O O O
of O O O O
homocysteine O O O O
synthase O O O O
and O O O O
sulfur O O O O
assimilation O O O O
enzymes O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
elevated O O O O
levels O O O O
of O O O O
the O O O O
corresponding O O O O
transcripts O O O O
. O O O O
    
These O O O O
changes O O O O
are O O O O
observed O O O O
even O O O O
under O O O O
conditions O O O O
of O O O O
methionine O O O O
repression O O O O
, O O O O
which O O O O
suggests O O O O
that O O O O
the O O O O
mutated O O O O
MetR O O O O
protein O O O O
may O O O O
be O O O O
resistant O O O O
to O O O O
inactivation O O O O
or O O O O
degradation O O O O
mediated O O O O
by O O O O
sulfur O O O O
metabolite O O O O
repression O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
found O O O O
that O O O O
a O O O O
mutant O O O O
impaired O O O O
in O O O O
sulfite O O O O
reductase O O O O
activity O O O O
, O O O O
known O O O O
until O O O O
now O O O O
as O O O O
sG8 O O O O
, O O O O
has O O O O
a O O O O
frameshift O O O O
which O O O O
changes O O O O
41 O O O O
C O O O O
- O O O O
terminal O O O O
amino O O O O
acids O O O O
. O O O O
    
Therefore O O O O
, O O O O
it O O O O
is O O O O
now O O O O
designated O O O O
metR18 O O O O
. O O O O
    
This O O O O
mutant O O O O
has O O O O
elevated O O O O
levels O O O O
of O O O O
MetR O O O O
- O O O O
regulated O O O O
transcripts O O O O
and O O O O
of O O O O
activities O O O O
of O O O O
sulfur O O O O
assimilation O O O O
enzymes O O O O
( O O O O
except O O O O
sulfite O O O O
reductase O O O O
) O O O O
, O O O O
which O O O O
can O O O O
be O O O O
repressed O O O O
to O O O O
the O O O O
wild O O O O
type O O O O
level O O O O
by O O O O
exogenous O O O O
methionine O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
metR18 O O O O
and O O O O
the O O O O
three O O O O
dominant O O O O
suppressors O O O O
represent O O O O
new O O O O
types O O O O
of O O O O
mutations O O O O
affecting O O O O
different O O O O
parts O O O O
of O O O O
the O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
MetR O O O O
protein O O O O
. O O O O
    
Paralogous O O O O
cyp51 O O O O
genes O O O O
in O O O O
Fusarium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
graminearum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
mediate O O O O
differential O O O O
sensitivity O O O O
to O O O O
sterol O O O O
demethylation O O O O
inhibitors O O O O
. O O O O
    
Analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
genome O O O O
sequence O O O O
of O O O O
Fusarium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
graminearum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
revealed O O O O
three O O O O
paralogous O O O O
cyp51 O O O O
genes O O O O
( O O O O
designated O O O O
cyp51A O O O O
, O O O O
- O O O O
B O O O O
, O O O O
and O O O O
- O O O O
C O O O O
) O O O O
encoding O O O O
14 O O O O
- O O O O
alpha O O O O
demethylases O O O O
in O O O O
this O O O O
fungus O O O O
. O O O O
    
Targeted O O O O
gene O O O O
disruption O O O O
showed O O O O
that O O O O
the O O O O
cyp51A O O O O
, O O O O
- O O O O
B O O O O
or O O O O
- O O O O
C O O O O
disruption O O O O
mutants O O O O
were O O O O
morphologically O O O O
indistinguishable O O O O
from O O O O
the O O O O
parent O O O O
isolate O O O O
on O O O O
potato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
dextrose O O O O
agar O O O O
medium O O O O
, O O O O
which O O O O
indicates O O O O
that O O O O
none O O O O
of O O O O
these O O O O
genes O O O O
is O O O O
essential O O O O
for O O O O
mycelial O O O O
growth O O O O
. O O O O
    
The O O O O
sensitivity O O O O
of O O O O
cyp51A O O O O
deletion O O O O
mutants O O O O
to O O O O
seven O O O O
sterol O O O O
demethylation O O O O
inhibitor O O O O
( O O O O
DMI O O O O
) O O O O
fungicides O O O O
increased O O O O
significantly O O O O
compared O O O O
to O O O O
the O O O O
parent O O O O
strain O O O O
, O O O O
while O O O O
sensitivity O O O O
of O O O O
cyp51C O O O O
deletion O O O O
mutants O O O O
increased O O O O
to O O O O
some O O O O
but O O O O
not O O O O
all O O O O
DMIs O O O O
. O O O O
    
No O O O O
change O O O O
in O O O O
DMI O O O O
sensitivity O O O O
was O O O O
observed O O O O
for O O O O
cyp51B O O O O
deletion O O O O
mutants O O O O
. O O O O
    
The O O O O
parental O O O O
phenotypes O O O O
of O O O O
cyp51A O O O O
and O O O O
cyp51C O O O O
deletion O O O O
mutants O O O O
were O O O O
completely O O O O
restored O O O O
by O O O O
genetic O O O O
complementation O O O O
with O O O O
the O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
cyp51A O O O O
and O O O O
cyp51C O O O O
genes O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
The O O O O
sensitivity O O O O
of O O O O
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
graminearum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
isolates O O O O
increased O O O O
significantly O O O O
when O O O O
subjected O O O O
in O O O O
vitro O O O O
to O O O O
a O O O O
mixture O O O O
of O O O O
DMI O O O O
fungicides O O O O
triadimefon O O O O
and O O O O
tebuconazole O O O O
as O O O O
compared O O O O
to O O O O
the O O O O
individual O O O O
components O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
indicate O O O O
that O O O O
different O O O O
DMI O O O O
fungicides O O O O
target O O O O
different O O O O
CYP51 O O O O
proteins O O O O
in O O O O
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
graminearum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
that O O O O
a O O O O
mixture O O O O
of O O O O
DMI O O O O
fungicides O O O O
can O O O O
result O O O O
in O O O O
synergistic O O O O
effects O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
findings O O O O
have O O O O
directly O O O O
implications O O O O
on O O O O
chemical O O O O
management O O O O
strategies O O O O
of O O O O
plant O O O O
diseases O O O O
caused O O O O
by O O O O
Fusarium O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Comparative O O O O
sequence O O O O
analysis O O O O
of O O O O
wheat B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
barley B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
powdery O O O O
mildew O O O O
fungi O O O O
reveals O O O O
gene O O O O
colinearity O O O O
, O O O O
dates O O O O
divergence O O O O
and O O O O
indicates O O O O
host O O O O
- O O O O
pathogen O O O O
co O O O O
- O O O O
evolution O O O O
. O O O O
    
The O O O O
two O O O O
fungal O O O O
pathogens O O O O
Blumeria B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
graminis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
f O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tritici O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
g O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tritici O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
and O O O O
hordei B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
g O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
hordei O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
cause O O O O
powdery O O O O
mildew O O O O
specifically O O O O
in O O O O
wheat B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
or O O O O
barley B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
They O O O O
have O O O O
the O O O O
same O O O O
life O O O O
cycle O O O O
, O O O O
but O O O O
their O O O O
growth O O O O
is O O O O
restricted O O O O
to O O O O
the O O O O
respective O O O O
host O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
compared O O O O
the O O O O
sequences O O O O
of O O O O
two O O O O
loci O O O O
in O O O O
both O O O O
cereal O O O O
mildews O O O O
to O O O O
determine O O O O
their O O O O
divergence O O O O
time O O O O
and O O O O
their O O O O
relationship O O O O
with O O O O
the O O O O
evolution O O O O
of O O O O
their O O O O
hosts O O O O
. O O O O
    
We O O O O
sequenced O O O O
a O O O O
total O O O O
of O O O O
273 O O O O
. O O O O
3kb O O O O
derived O O O O
from O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
g O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tritici O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
BAC O O O O
sequences O O O O
and O O O O
compared O O O O
them O O O O
with O O O O
the O O O O
orthologous O O O O
regions O O O O
in O O O O
the O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
g O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
hordei O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
genome O O O O
. O O O O
    
Protein O O O O
- O O O O
coding O O O O
genes O O O O
were O O O O
colinear O O O O
and O O O O
well O O O O
conserved O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
, O O O O
the O O O O
intergenic O O O O
regions O O O O
showed O O O O
very O O O O
low O O O O
conservation O O O O
mostly O O O O
due O O O O
to O O O O
different O O O O
integration O O O O
patterns O O O O
of O O O O
transposable O O O O
elements O O O O
. O O O O
    
To O O O O
estimate O O O O
the O O O O
divergence O O O O
time O O O O
of O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
g O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tritici O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
g O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
hordei O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
we O O O O
used O O O O
conserved O O O O
intergenic O O O O
sequences O O O O
including O O O O
orthologous O O O O
transposable O O O O
elements O O O O
. O O O O
    
This O O O O
revealed O O O O
that O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
g O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tritici O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
g O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
hordei O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
have O O O O
diverged O O O O
about O O O O
10 O O O O
million O O O O
years O O O O
ago O O O O
( O O O O
MYA O O O O
) O O O O
, O O O O
two O O O O
million O O O O
years O O O O
after O O O O
wheat B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
barley B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
12 O O O O
MYA O O O O
) O O O O
. O O O O
    
These O O O O
data O O O O
suggest O O O O
that O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
g O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tritici O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
g O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
hordei O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
have O O O O
co O O O O
- O O O O
evolved O O O O
with O O O O
their O O O O
hosts O O O O
during O O O O
most O O O O
of O O O O
their O O O O
evolutionary O O O O
history O O O O
after O O O O
host O O O O
divergence O O O O
, O O O O
possibly O O O O
after O O O O
a O O O O
short O O O O
phase O O O O
of O O O O
host O O O O
expansion O O O O
when O O O O
the O O O O
same O O O O
pathogen O O O O
could O O O O
still O O O O
grow O O O O
on O O O O
the O O O O
two O O O O
diverged O O O O
hosts O O O O
. O O O O
    
Can O O O O
we O O O O
predict O O O O
carbon O O O O
stocks O O O O
in O O O O
tropical O O O O
ecosystems O O O O
from O O O O
tree O O O O
diversity O O O O
? O O O O
    
Comparing O O O O
species O O O O
and O O O O
functional O O O O
diversity O O O O
in O O O O
a O O O O
plantation O O O O
and O O O O
a O O O O
natural O O O O
forest O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Linking O O O O
tree O O O O
diversity O O O O
to O O O O
carbon O O O O
storage O O O O
can O O O O
provide O O O O
further O O O O
motivation O O O O
to O O O O
conserve O O O O
tropical O O O O
forests O O O O
and O O O O
to O O O O
design O O O O
carbon O O O O
- O O O O
enriched O O O O
plantations O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
examine O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
tree O O O O
diversity O O O O
and O O O O
functional O O O O
traits O O O O
in O O O O
determining O O O O
carbon O O O O
storage O O O O
in O O O O
a O O O O
mixed O O O O
- O O O O
species O O O O
plantation O O O O
and O O O O
in O O O O
a O O O O
natural O O O O
tropical O O O O
forest O O O O
in O O O O
Panama O O O O
. O O O O
    
* O O O O
We O O O O
used O O O O
species O O O O
richness O O O O
, O O O O
functional O O O O
trait O O O O
diversity O O O O
, O O O O
species O O O O
dominance O O O O
and O O O O
functional O O O O
trait O O O O
dominance O O O O
to O O O O
predict O O O O
tree O O O O
carbon O O O O
storage O O O O
across O O O O
these O O O O
two O O O O
forests O O O O
. O O O O
    
Then O O O O
we O O O O
compared O O O O
the O O O O
species O O O O
ranking O O O O
based O O O O
on O O O O
wood O O O O
density O O O O
, O O O O
maximum O O O O
diameter O O O O
, O O O O
maximum O O O O
height O O O O
, O O O O
and O O O O
leaf O O O O
mass O O O O
per O O O O
area O O O O
( O O O O
LMA O O O O
) O O O O
between O O O O
sites O O O O
to O O O O
reveal O O O O
how O O O O
these O O O O
values O O O O
changed O O O O
between O O O O
different O O O O
forests O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Increased O O O O
species O O O O
richness O O O O
, O O O O
a O O O O
higher O O O O
proportion O O O O
of O O O O
nitrogen O O O O
fixers O O O O
and O O O O
species O O O O
with O O O O
low O O O O
LMA O O O O
increased O O O O
carbon O O O O
storage O O O O
in O O O O
the O O O O
mixed O O O O
- O O O O
species O O O O
plantation O O O O
, O O O O
while O O O O
a O O O O
higher O O O O
proportion O O O O
of O O O O
large O O O O
trees O O O O
and O O O O
species O O O O
with O O O O
high O O O O
LMA O O O O
increased O O O O
tree O O O O
carbon O O O O
storage O O O O
in O O O O
the O O O O
natural O O O O
forest O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
we O O O O
found O O O O
that O O O O
tree O O O O
species O O O O
varied O O O O
greatly O O O O
in O O O O
their O O O O
absolute O O O O
and O O O O
relative O O O O
values O O O O
between O O O O
study O O O O
sites O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Different O O O O
results O O O O
in O O O O
different O O O O
forests O O O O
mean O O O O
that O O O O
we O O O O
cannot O O O O
easily O O O O
predict O O O O
carbon O O O O
storage O O O O
capacity O O O O
in O O O O
natural O O O O
forests O O O O
using O O O O
data O O O O
from O O O O
experimental O O O O
plantations O O O O
. O O O O
    
Managers O O O O
should O O O O
be O O O O
cautious O O O O
when O O O O
applying O O O O
functional O O O O
traits O O O O
measured O O O O
in O O O O
natural O O O O
populations O O O O
in O O O O
the O O O O
design O O O O
of O O O O
carbon O O O O
- O O O O
enriched O O O O
plantations O O O O
. O O O O
    
Profile O O O O
of O O O O
the O O O O
mosaic O O O O
element O O O O
BTMR1 O O O O
in O O O O
the O O O O
genome O O O O
of O O O O
the O O O O
bumble O O O O
bee O O O O
Bombus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
terrestris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Hymenoptera O O O O
: O O O O
Apidae O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Co O O O O
- O O O O
evolution O O O O
involving O O O O
a O O O O
mariner O O O O
transposon O O O O
, O O O O
Botmar1 O O O O
and O O O O
the O O O O
other O O O O
repeats O O O O
contained O O O O
in O O O O
the O O O O
Bombus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
terrestris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
genome O O O O
was O O O O
investigated O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
that O O O O
the O O O O
5 O O O O
' O O O O
- O O O O
region O O O O
of O O O O
Botmar1 O O O O
forms O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
components O O O O
of O O O O
a O O O O
mosaic O O O O
element O O O O
, O O O O
known O O O O
as O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
terrestris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
mosaic O O O O
repeat O O O O
1 O O O O
( O O O O
BTMR1 O O O O
) O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
also O O O O
composed O O O O
of O O O O
inner O O O O
segments O O O O
originating O O O O
from O O O O
two O O O O
different O O O O
retrotransposons O O O O
and O O O O
a O O O O
pseudogene O O O O
corresponding O O O O
to O O O O
an O O O O
RNA O O O O
methyltransferase O O O O
cDNA O O O O
. O O O O
    
The O O O O
fact O O O O
that O O O O
BTMR1 O O O O
is O O O O
interspersed O O O O
within O O O O
chromosomes O O O O
and O O O O
the O O O O
differences O O O O
in O O O O
its O O O O
abundance O O O O
in O O O O
different O O O O
species O O O O
indicate O O O O
that O O O O
it O O O O
is O O O O
very O O O O
probably O O O O
a O O O O
mobile O O O O
element O O O O
. O O O O
    
Nevertheless O O O O
, O O O O
the O O O O
absences O O O O
of O O O O
direct O O O O
or O O O O
inverted O O O O
repeats O O O O
at O O O O
its O O O O
ends O O O O
and O O O O
of O O O O
target O O O O
site O O O O
duplication O O O O
indicate O O O O
that O O O O
its O O O O
mobility O O O O
is O O O O
not O O O O
ensured O O O O
by O O O O
a O O O O
cardinal O O O O
transposable O O O O
element O O O O
, O O O O
but O O O O
putatively O O O O
by O O O O
a O O O O
Crypton O O O O
- O O O O
like O O O O
element O O O O
. O O O O
    
The O O O O
RNA O O O O
- O O O O
Seq O O O O
approach O O O O
to O O O O
studying O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
mosquito O O O O
mitochondrial O O O O
genes O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
used O O O O
extensive O O O O
expressed O O O O
sequence O O O O
tag O O O O
evidence O O O O
obtained O O O O
through O O O O
454 O O O O
and O O O O
Solexa O O O O
next O O O O
- O O O O
generation O O O O
sequencing O O O O
to O O O O
explore O O O O
mtDNA O O O O
transcription O O O O
in O O O O
male O O O O
and O O O O
female O O O O
first O O O O
instar O O O O
larvae O O O O
of O O O O
Aedes B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aegypti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
adults O O O O
of O O O O
Aedes B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aegypti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Anopheles B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
gambiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
Anopheles B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
quadrimaculatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Relative O O O O
abundances O O O O
of O O O O
individual O O O O
transcripts O O O O
differed O O O O
considerably O O O O
within O O O O
each O O O O
sample O O O O
, O O O O
consistent O O O O
with O O O O
the O O O O
differential O O O O
stability O O O O
of O O O O
messenger O O O O
RNA O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Large O O O O
differences O O O O
were O O O O
also O O O O
observed O O O O
between O O O O
species O O O O
and O O O O
between O O O O
larval O O O O
and O O O O
adult O O O O
stages O O O O
; O O O O
however O O O O
, O O O O
the O O O O
male O O O O
and O O O O
female O O O O
larval O O O O
samples O O O O
were O O O O
remarkably O O O O
similar O O O O
. O O O O
    
Quantitative O O O O
PCR O O O O
analysis O O O O
of O O O O
selected O O O O
genes O O O O
, O O O O
cox1 O O O O
, O O O O
l O O O O
- O O O O
rRNA O O O O
and O O O O
nd5 O O O O
, O O O O
in O O O O
larvae O O O O
and O O O O
adults O O O O
of O O O O
Ae B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
aegypti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
in O O O O
An B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gambiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
adults O O O O
was O O O O
consistent O O O O
with O O O O
the O O O O
RNA O O O O
- O O O O
Seq O O O O
- O O O O
based O O O O
quantification O O O O
of O O O O
expression O O O O
. O O O O
    
Finally O O O O
, O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
a O O O O
conserved O O O O
mtDNA O O O O
region O O O O
involved O O O O
in O O O O
transcriptional O O O O
control O O O O
in O O O O
other O O O O
dipterans O O O O
suggests O O O O
that O O O O
mosquitoes O O O O
have O O O O
evolved O O O O
a O O O O
distinct O O O O
mechanism O O O O
of O O O O
regulation O O O O
of O O O O
gene O O O O
expression O O O O
in O O O O
the O O O O
mitochondrion O O O O
. O O O O
    
Isolation O O O O
and O O O O
characterization O O O O
of O O O O
MAT O O O O
genes O O O O
in O O O O
the O O O O
symbiotic O O O O
ascomycete O O O O
Tuber B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
melanosporum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
* O O O O
The O O O O
genome O O O O
of O O O O
Tuber B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
melanosporum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
has O O O O
recently O O O O
been O O O O
sequenced O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
used O O O O
this O O O O
information O O O O
to O O O O
identify O O O O
genes O O O O
involved O O O O
in O O O O
the O O O O
reproductive O O O O
processes O O O O
of O O O O
this O O O O
edible O O O O
fungus O O O O
. O O O O
    
The O O O O
sequenced O O O O
strain O O O O
( O O O O
Mel28 O O O O
) O O O O
possesses O O O O
only O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
two O O O O
master O O O O
genes O O O O
required O O O O
for O O O O
mating O O O O
, O O O O
that O O O O
is O O O O
, O O O O
the O O O O
gene O O O O
that O O O O
codes O O O O
for O O O O
the O O O O
high O O O O
mobility O O O O
group O O O O
( O O O O
HMG O O O O
) O O O O
transcription O O O O
factor O O O O
( O O O O
MAT1 O O O O
- O O O O
2 O O O O
- O O O O
1 O O O O
) O O O O
, O O O O
whereas O O O O
it O O O O
lacks O O O O
the O O O O
gene O O O O
that O O O O
codes O O O O
for O O O O
the O O O O
protein O O O O
containing O O O O
the O O O O
alpha O O O O
- O O O O
box O O O O
- O O O O
domain O O O O
( O O O O
MAT1 O O O O
- O O O O
1 O O O O
- O O O O
1 O O O O
) O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
this O O O O
fungus O O O O
is O O O O
heterothallic O O O O
. O O O O
    
* O O O O
A O O O O
PCR O O O O
- O O O O
based O O O O
approach O O O O
was O O O O
initially O O O O
employed O O O O
to O O O O
screen O O O O
truffles O O O O
for O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
the O O O O
MAT1 O O O O
- O O O O
2 O O O O
- O O O O
1 O O O O
gene O O O O
and O O O O
amplify O O O O
the O O O O
conserved O O O O
regions O O O O
flanking O O O O
the O O O O
mating O O O O
type O O O O
( O O O O
MAT O O O O
) O O O O
locus O O O O
. O O O O
    
The O O O O
MAT1 O O O O
- O O O O
1 O O O O
- O O O O
1 O O O O
gene O O O O
was O O O O
finally O O O O
identified O O O O
using O O O O
primers O O O O
designed O O O O
from O O O O
the O O O O
conserved O O O O
regions O O O O
of O O O O
strains O O O O
that O O O O
lack O O O O
the O O O O
MAT1 O O O O
- O O O O
2 O O O O
- O O O O
1 O O O O
gene O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Mating O O O O
type O O O O
- O O O O
specific O O O O
primer O O O O
pairs O O O O
were O O O O
developed O O O O
to O O O O
screen O O O O
asci O O O O
and O O O O
gleba O O O O
from O O O O
truffles O O O O
of O O O O
different O O O O
origins O O O O
and O O O O
to O O O O
genotype O O O O
single O O O O
ascospores O O O O
within O O O O
the O O O O
asci O O O O
. O O O O
    
These O O O O
analyses O O O O
provided O O O O
definitive O O O O
evidence O O O O
that O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
melanosporum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
a O O O O
heterothallic O O O O
species O O O O
with O O O O
a O O O O
MAT O O O O
locus O O O O
that O O O O
is O O O O
organized O O O O
similarly O O O O
to O O O O
those O O O O
of O O O O
ancient O O O O
fungal O O O O
lineages O O O O
. O O O O
    
* O O O O
A O O O O
greater O O O O
understanding O O O O
of O O O O
the O O O O
reproductive O O O O
mechanisms O O O O
that O O O O
exist O O O O
in O O O O
Tuber O O O O
spp O O O O
. O O O O
allows O O O O
for O O O O
optimization O O O O
of O O O O
truffle O O O O
plantation O O O O
management O O O O
strategies O O O O
. O O O O
    
Updated O O O O
hypothesis O O O O
on O O O O
the O O O O
evolution O O O O
of O O O O
oligotrichid O O O O
ciliates O O O O
( O O O O
Ciliophora O O O O
, O O O O
Spirotricha O O O O
, O O O O
Oligotrichida O O O O
) O O O O
based O O O O
on O O O O
somatic O O O O
ciliary O O O O
patterns O O O O
and O O O O
ontogenetic O O O O
data O O O O
. O O O O
    
The O O O O
two O O O O
recently O O O O
established O O O O
genera O O O O
Apostrombidium O O O O
Xu O O O O
et O O O O
al O O O O
. O O O O
, O O O O
2009 O O O O
and O O O O
Varistrombidium O O O O
Xu O O O O
et O O O O
al O O O O
. O O O O
, O O O O
2009 O O O O
and O O O O
the O O O O
analysis O O O O
of O O O O
ontogenetic O O O O
data O O O O
in O O O O
Strombidium O O O O
constrictum O O O O
, O O O O
S O O O O
. O O O O
montagnesi O O O O
, O O O O
S O O O O
. O O O O
wilberti O O O O
, O O O O
Omegastrombidium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
elegans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
Paratontonia O O O O
gracillima O O O O
necessitated O O O O
a O O O O
revision O O O O
of O O O O
the O O O O
hypothesis O O O O
about O O O O
the O O O O
somatic O O O O
ciliary O O O O
pattern O O O O
evolution O O O O
in O O O O
oligotrichid O O O O
ciliates O O O O
. O O O O
    
As O O O O
a O O O O
consequence O O O O
, O O O O
the O O O O
species O O O O
- O O O O
rich O O O O
genus O O O O
Strombidium O O O O
was O O O O
split O O O O
, O O O O
establishing O O O O
two O O O O
genera O O O O
for O O O O
species O O O O
with O O O O
a O O O O
horizontal O O O O
girdle O O O O
kinety O O O O
posterior O O O O
to O O O O
the O O O O
oral O O O O
primordium O O O O
: O O O O
Opisthostrombidium O O O O
nov O O O O
. O O O O
gen O O O O
. O O O O
with O O O O
the O O O O
extrusome O O O O
attachment O O O O
sites O O O O
along O O O O
the O O O O
anterior O O O O
margin O O O O
of O O O O
the O O O O
girdle O O O O
kinety O O O O
and O O O O
posterior O O O O
to O O O O
the O O O O
oral O O O O
primordium O O O O
and O O O O
Foissneridium O O O O
nov O O O O
. O O O O
gen O O O O
. O O O O
with O O O O
the O O O O
extrusome O O O O
attachment O O O O
sites O O O O
distinctly O O O O
apart O O O O
from O O O O
the O O O O
girdle O O O O
kinety O O O O
and O O O O
anterior O O O O
to O O O O
the O O O O
oral O O O O
primordium O O O O
. O O O O
    
The O O O O
ontogenetic O O O O
data O O O O
revealed O O O O
that O O O O
the O O O O
Omega O O O O
- O O O O
shaped O O O O
girdle O O O O
kinety O O O O
pattern O O O O
evolved O O O O
convergently O O O O
from O O O O
the O O O O
Pseudotontonia O O O O
pattern O O O O
with O O O O
its O O O O
horizontal O O O O
girdle O O O O
kinety O O O O
in O O O O
the O O O O
tailed O O O O
genus O O O O
Paratontonia O O O O
and O O O O
from O O O O
the O O O O
Novistrombidium O O O O
pattern O O O O
with O O O O
its O O O O
dextrally O O O O
spiralled O O O O
girdle O O O O
kinety O O O O
in O O O O
the O O O O
tailless O O O O
genus O O O O
Omegastrombidium O O O O
. O O O O
    
The O O O O
somatic O O O O
ciliary O O O O
pattern O O O O
of O O O O
the O O O O
latter O O O O
genus O O O O
probably O O O O
gave O O O O
rise O O O O
to O O O O
the O O O O
patterns O O O O
of O O O O
Apostrombidium O O O O
and O O O O
Varistrombidium O O O O
. O O O O
    
Neutralizing O O O O
antibody O O O O
- O O O O
resistant O O O O
hepatitis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
C O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cell O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
cell O O O O
transmission O O O O
. O O O O
    
Hepatitis O O O O
C O O O O
virus O O O O
( O O O O
HCV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
can O O O O
initiate O O O O
infection O O O O
by O O O O
cell O O O O
- O O O O
free O O O O
particle O O O O
and O O O O
cell O O O O
- O O O O
cell O O O O
contact O O O O
- O O O O
dependent O O O O
transmission O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
we O O O O
use O O O O
a O O O O
novel O O O O
infectious O O O O
coculture O O O O
system O O O O
to O O O O
examine O O O O
these O O O O
alternative O O O O
modes O O O O
of O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
Cell O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
cell O O O O
transmission O O O O
is O O O O
relatively O O O O
resistant O O O O
to O O O O
anti B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
HCV O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
glycoprotein O O O O
monoclonal O O O O
antibodies O O O O
and O O O O
polyclonal O O O O
immunoglobulin O O O O
isolated O O O O
from O O O O
infected O O O O
individuals O O O O
, O O O O
providing O O O O
an O O O O
effective O O O O
strategy O O O O
for O O O O
escaping O O O O
host O O O O
humoral O O O O
immune O O O O
responses O O O O
. O O O O
    
Chimeric O O O O
viruses O O O O
expressing O O O O
the O O O O
structural O O O O
proteins O O O O
representing O O O O
the O O O O
seven O O O O
major O O O O
HCV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
genotypes O O O O
demonstrate O O O O
neutralizing O O O O
antibody O O O O
- O O O O
resistant O O O O
cell O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
cell O O O O
transmission O O O O
. O O O O
    
HCV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
entry O O O O
is O O O O
a O O O O
multistep O O O O
process O O O O
involving O O O O
numerous O O O O
receptors O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
we O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
, O O O O
in O O O O
contrast O O O O
to O O O O
earlier O O O O
reports O O O O
, O O O O
CD81 O O O O
and O O O O
the O O O O
tight O O O O
- O O O O
junction O O O O
components O O O O
claudin O O O O
- O O O O
1 O O O O
and O O O O
occludin O O O O
are O O O O
all O O O O
essential O O O O
for O O O O
both O O O O
cell O O O O
- O O O O
free O O O O
and O O O O
cell O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
cell O O O O
viral O O O O
transmission O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
scavenger O O O O
receptor O O O O
BI O O O O
( O O O O
SR O O O O
- O O O O
BI O O O O
) O O O O
has O O O O
a O O O O
more O O O O
prominent O O O O
role O O O O
in O O O O
cell O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
cell O O O O
transmission O O O O
of O O O O
the O O O O
virus O O O O
, O O O O
with O O O O
SR O O O O
- O O O O
BI O O O O
- O O O O
specific O O O O
antibodies O O O O
and O O O O
small O O O O
- O O O O
molecule O O O O
inhibitors O O O O
showing O O O O
preferential O O O O
inhibition O O O O
of O O O O
this O O O O
infection O O O O
route O O O O
. O O O O
    
These O O O O
observations O O O O
highlight O O O O
the O O O O
importance O O O O
of O O O O
targeting O O O O
host O O O O
cell O O O O
receptors O O O O
, O O O O
in O O O O
particular O O O O
SR O O O O
- O O O O
BI O O O O
, O O O O
to O O O O
control O O O O
viral O O O O
infection O O O O
and O O O O
spread O O O O
in O O O O
the O O O O
liver O O O O
. O O O O
    
Chikungunya B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
induces O O O O
IPS O O O O
- O O O O
1 O O O O
- O O O O
dependent O O O O
innate O O O O
immune O O O O
activation O O O O
and O O O O
protein O O O O
kinase O O O O
R O O O O
- O O O O
independent O O O O
translational O O O O
shutoff O O O O
. O O O O
    
Chikungunya B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
CHIKV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
is O O O O
an O O O O
arthritogenic O O O O
mosquito O O O O
- O O O O
transmitted O O O O
alphavirus O O O O
that O O O O
is O O O O
undergoing O O O O
reemergence O O O O
in O O O O
areas O O O O
around O O O O
the O O O O
Indian O O O O
Ocean O O O O
. O O O O
    
Despite O O O O
the O O O O
current O O O O
and O O O O
potential O O O O
danger O O O O
posed O O O O
by O O O O
this O O O O
virus O O O O
, O O O O
we O O O O
know O O O O
surprisingly O O O O
little O O O O
about O O O O
the O O O O
induction O O O O
and O O O O
evasion O O O O
of O O O O
CHIKV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
associated O O O O
antiviral O O O O
immune O O O O
responses O O O O
. O O O O
    
With O O O O
this O O O O
in O O O O
mind O O O O
we O O O O
investigated O O O O
innate O O O O
immune O O O O
reactions O O O O
to O O O O
CHIKV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
in O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fibroblasts O O O O
, O O O O
a O O O O
demonstrable O O O O
in O O O O
vivo O O O O
target O O O O
of O O O O
virus O O O O
replication O O O O
and O O O O
spread O O O O
. O O O O
    
We O O O O
show O O O O
that O O O O
CHIKV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infection O O O O
leads O O O O
to O O O O
activation O O O O
of O O O O
the O O O O
transcription O O O O
factor O O O O
interferon O O O O
regulatory O O O O
factor O O O O
3 O O O O
( O O O O
IRF3 O O O O
) O O O O
and O O O O
subsequent O O O O
transcription O O O O
of O O O O
IRF3 O O O O
- O O O O
dependent O O O O
antiviral O O O O
genes O O O O
, O O O O
including O O O O
beta O O O O
interferon O O O O
( O O O O
IFN O O O O
- O O O O
Beta O O O O
) O O O O
. O O O O
    
IRF3 O O O O
activation O O O O
occurs O O O O
by O O O O
way O O O O
of O O O O
a O O O O
virus O O O O
- O O O O
induced O O O O
innate O O O O
immune O O O O
signaling O O O O
pathway O O O O
that O O O O
includes O O O O
the O O O O
adaptor O O O O
molecule O O O O
interferon O O O O
promoter O O O O
stimulator O O O O
1 O O O O
( O O O O
IPS O O O O
- O O O O
1 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Despite O O O O
strong O O O O
transcriptional O O O O
upregulation O O O O
of O O O O
these O O O O
genes O O O O
, O O O O
however O O O O
, O O O O
translation O O O O
of O O O O
the O O O O
corresponding O O O O
proteins O O O O
is O O O O
not O O O O
observed O O O O
. O O O O
    
We O O O O
further O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
translation O O O O
of O O O O
cellular O O O O
( O O O O
but O O O O
not O O O O
viral O O O O
) O O O O
genes O O O O
is O O O O
blocked O O O O
during O O O O
infection O O O O
and O O O O
that O O O O
although O O O O
CHIKV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
is O O O O
found O O O O
to O O O O
trigger O O O O
inactivation O O O O
of O O O O
the O O O O
translational O O O O
molecule O O O O
eukaryotic O O O O
initiation O O O O
factor O O O O
subunit O O O O
2alpha O O O O
by O O O O
way O O O O
of O O O O
the O O O O
double O O O O
- O O O O
stranded O O O O
RNA O O O O
sensor O O O O
protein O O O O
kinase O O O O
R O O O O
, O O O O
this O O O O
response O O O O
is O O O O
not O O O O
required O O O O
for O O O O
the O O O O
block O O O O
to O O O O
protein O O O O
synthesis O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
overall O O O O
diminution O O O O
of O O O O
cellular O O O O
RNA O O O O
synthesis O O O O
is O O O O
also O O O O
observed O O O O
in O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
CHIKV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
transcription O O O O
of O O O O
IRF3 O O O O
- O O O O
dependent O O O O
antiviral O O O O
genes O O O O
appears O O O O
specifically O O O O
blocked O O O O
late O O O O
in O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
We O O O O
hypothesize O O O O
that O O O O
the O O O O
observed O O O O
absence O O O O
of O O O O
IFN O O O O
- O O O O
Beta O O O O
and O O O O
antiviral O O O O
proteins O O O O
during O O O O
infection O O O O
results O O O O
from O O O O
an O O O O
evasion O O O O
mechanism O O O O
exhibited O O O O
by O O O O
CHIKV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
that O O O O
is O O O O
dependent O O O O
on O O O O
widespread O O O O
shutoff O O O O
of O O O O
cellular O O O O
protein O O O O
synthesis O O O O
and O O O O
a O O O O
targeted O O O O
block O O O O
to O O O O
late O O O O
synthesis O O O O
of O O O O
antiviral O O O O
mRNA O O O O
transcripts O O O O
. O O O O
    
Blood O O O O
myeloid O O O O
dendritic O O O O
cells O O O O
from O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O O O O
infected O O O O
individuals O O O O
display O O O O
a O O O O
proapoptotic O O O O
profile O O O O
characterized O O O O
by O O O O
decreased O O O O
Bcl O O O O
- O O O O
2 O O O O
levels O O O O
and O O O O
by O O O O
caspase O O O O
- O O O O
3 O O O O
+ O O O O
frequencies O O O O
that O O O O
are O O O O
associated O O O O
with O O O O
levels O O O O
of O O O O
plasma O O O O
viremia O O O O
and O O O O
T O O O O
cell O O O O
activation O O O O
in O O O O
an O O O O
exploratory O O O O
study O O O O
. O O O O
    
Reduced O O O O
frequencies O O O O
of O O O O
myeloid O O O O
and O O O O
plasmacytoid O O O O
dendritic O O O O
cell O O O O
( O O O O
DC O O O O
) O O O O
subsets O O O O
( O O O O
mDCs O O O O
and O O O O
pDCs O O O O
, O O O O
respectively O O O O
) O O O O
have O O O O
been O O O O
observed O O O O
in O O O O
the O O O O
peripheral O O O O
blood O O O O
of O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O O O O
infected O O O O
individuals O O O O
throughout O O O O
the O O O O
course O O O O
of O O O O
disease O O O O
. O O O O
    
Accumulation O O O O
of O O O O
DCs O O O O
in O O O O
lymph O O O O
nodes O O O O
( O O O O
LNs O O O O
) O O O O
may O O O O
partly O O O O
account O O O O
for O O O O
the O O O O
decreased O O O O
numbers O O O O
observed O O O O
in O O O O
blood O O O O
, O O O O
but O O O O
increased O O O O
DC O O O O
death O O O O
may O O O O
also O O O O
be O O O O
a O O O O
contributing O O O O
factor O O O O
. O O O O
    
We O O O O
used O O O O
multiparameter O O O O
flow O O O O
cytometry O O O O
to O O O O
evaluate O O O O
pro O O O O
- O O O O
and O O O O
antiapoptotic O O O O
markers O O O O
in O O O O
blood O O O O
mDCs O O O O
and O O O O
pDCs O O O O
from O O O O
untreated O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O O O O
infected O O O O
donors O O O O
, O O O O
from O O O O
a O O O O
subset O O O O
of O O O O
infected O O O O
donors O O O O
before O O O O
and O O O O
after O O O O
receiving O O O O
antiretroviral O O O O
therapy O O O O
( O O O O
ART O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
from O O O O
uninfected O O O O
control O O O O
donors O O O O
. O O O O
    
Blood O O O O
mDCs O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
pDCs O O O O
, O O O O
from O O O O
untreated O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O O O O
infected O O O O
donors O O O O
expressed O O O O
lower O O O O
levels O O O O
of O O O O
antiapoptotic O O O O
Bcl O O O O
- O O O O
2 O O O O
than O O O O
DCs O O O O
from O O O O
uninfected O O O O
donors O O O O
. O O O O
    
A O O O O
subset O O O O
of O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O O O O
infected O O O O
donors O O O O
had O O O O
elevated O O O O
frequencies O O O O
of O O O O
proapoptotic O O O O
caspase O O O O
- O O O O
3 O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
blood O O O O
mDCs O O O O
, O O O O
and O O O O
positive O O O O
correlations O O O O
were O O O O
observed O O O O
between O O O O
caspase O O O O
- O O O O
3 O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
mDC O O O O
frequencies O O O O
and O O O O
plasma O O O O
viral O O O O
load O O O O
and O O O O
CD8 O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
T O O O O
- O O O O
cell O O O O
activation O O O O
levels O O O O
. O O O O
    
Caspase O O O O
- O O O O
3 O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
mDC O O O O
frequencies O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
mDC O O O O
Bcl O O O O
- O O O O
2 O O O O
expression O O O O
, O O O O
were O O O O
reduced O O O O
with O O O O
viral O O O O
suppression O O O O
on O O O O
ART O O O O
. O O O O
    
Apoptosis O O O O
markers O O O O
on O O O O
DCs O O O O
in O O O O
blood O O O O
and O O O O
LN O O O O
samples O O O O
from O O O O
a O O O O
cohort O O O O
of O O O O
untreated O O O O
, O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O O O O
infected O O O O
donors O O O O
with O O O O
chronic O O O O
disease O O O O
were O O O O
also O O O O
evaluated O O O O
. O O O O
    
LN O O O O
mDCs O O O O
displayed O O O O
higher O O O O
levels O O O O
of O O O O
Bcl O O O O
- O O O O
2 O O O O
and O O O O
lower O O O O
caspase O O O O
- O O O O
3 O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
frequencies O O O O
than O O O O
did O O O O
matched O O O O
blood O O O O
mDCs O O O O
. O O O O
    
Conversely O O O O
, O O O O
LN O O O O
pDCs O O O O
expressed O O O O
lower O O O O
Bcl O O O O
- O O O O
2 O O O O
levels O O O O
than O O O O
their O O O O
blood O O O O
counterparts O O O O
. O O O O
    
In O O O O
summary O O O O
, O O O O
blood O O O O
mDCs O O O O
from O O O O
untreated O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O O O O
infected O O O O
subjects O O O O
displayed O O O O
a O O O O
proapoptotic O O O O
profile O O O O
that O O O O
was O O O O
partially O O O O
reversed O O O O
with O O O O
viral O O O O
suppression O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
DC O O O O
death O O O O
may O O O O
be O O O O
a O O O O
factor O O O O
contributing O O O O
to O O O O
blood O O O O
DC O O O O
depletion O O O O
in O O O O
the O O O O
setting O O O O
of O O O O
chronic O O O O
, O O O O
untreated O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
disease O O O O
. O O O O
    
Identification O O O O
of O O O O
binary O O O O
interactions O O O O
between O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cytomegalovirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virion O O O O
proteins O O O O
. O O O O
    
Human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cytomegalovirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
HCMV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
virions O O O O
are O O O O
composed O O O O
of O O O O
a O O O O
DNA O O O O
- O O O O
containing O O O O
nucleocapsid O O O O
surrounded O O O O
by O O O O
a O O O O
tegument O O O O
layer O O O O
and O O O O
host O O O O
- O O O O
derived O O O O
lipid O O O O
envelope O O O O
studded O O O O
with O O O O
virally O O O O
encoded O O O O
glycoproteins O O O O
. O O O O
    
These O O O O
complex O O O O
virions O O O O
are O O O O
estimated O O O O
to O O O O
be O O O O
composed O O O O
of O O O O
more O O O O
than O O O O
50 O O O O
viral O O O O
proteins O O O O
. O O O O
    
Assembly O O O O
of O O O O
HCMV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virions O O O O
is O O O O
poorly O O O O
understood O O O O
, O O O O
especially O O O O
with O O O O
respect O O O O
to O O O O
acquisition O O O O
of O O O O
the O O O O
tegument O O O O
; O O O O
however O O O O
, O O O O
it O O O O
is O O O O
thought O O O O
to O O O O
involve O O O O
the O O O O
stepwise O O O O
addition O O O O
of O O O O
virion O O O O
components O O O O
through O O O O
protein O O O O
- O O O O
protein O O O O
interactions O O O O
. O O O O
    
We O O O O
sought O O O O
to O O O O
identify O O O O
interactions O O O O
among O O O O
HCMV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virion O O O O
proteins O O O O
using O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
two O O O O
- O O O O
hybrid O O O O
analysis O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
33 O O O O
known O O O O
capsid O O O O
and O O O O
tegument O O O O
proteins O O O O
, O O O O
we O O O O
tested O O O O
1 O O O O
, O O O O
089 O O O O
pairwise O O O O
combinations O O O O
for O O O O
binary O O O O
interaction O O O O
in O O O O
the O O O O
two O O O O
- O O O O
hybrid O O O O
assay O O O O
. O O O O
    
We O O O O
identified O O O O
24 O O O O
interactions O O O O
among O O O O
HCMV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virion O O O O
proteins O O O O
, O O O O
including O O O O
13 O O O O
novel O O O O
interactions O O O O
among O O O O
tegument O O O O
proteins O O O O
and O O O O
one O O O O
novel O O O O
interaction O O O O
between O O O O
capsid O O O O
proteins O O O O
. O O O O
    
Several O O O O
of O O O O
these O O O O
novel O O O O
interactions O O O O
were O O O O
confirmed O O O O
by O O O O
coimmunoprecipitation O O O O
of O O O O
protein O O O O
complexes O O O O
from O O O O
transfected O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
, O O O O
we O O O O
demonstrate O O O O
three O O O O
of O O O O
these O O O O
interactions O O O O
in O O O O
the O O O O
context O O O O
of O O O O
HCMV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infection O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
reveals O O O O
several O O O O
new O O O O
protein O O O O
- O O O O
protein O O O O
interactions O O O O
among O O O O
HCMV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tegument O O O O
proteins O O O O
, O O O O
some O O O O
of O O O O
which O O O O
are O O O O
likely O O O O
important O O O O
for O O O O
HCMV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
replication O O O O
and O O O O
pathogenesis O O O O
. O O O O
    
Modifications O O O O
in O O O O
the O O O O
polymerase O O O O
genes O O O O
of O O O O
a O O O O
swine B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
like O O O O
triple O O O O
- O O O O
reassortant O O O O
influenza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
to O O O O
generate O O O O
live O O O O
attenuated O O O O
vaccines O O O O
against O O O O
2009 O O O O
pandemic O O O O
H1N1 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
viruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
On O O O O
11 O O O O
June O O O O
2009 O O O O
, O O O O
the O O O O
World O O O O
Health O O O O
Organization O O O O
( O O O O
WHO O O O O
) O O O O
declared O O O O
that O O O O
the O O O O
outbreaks O O O O
caused O O O O
by O O O O
novel O O O O
swine B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
origin O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
influenza O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H1N1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
had O O O O
reached O O O O
pandemic O O O O
proportions O O O O
. O O O O
    
The O O O O
pandemic O O O O
H1N1 O O O O
( O O O O
H1N1pdm O O O O
) O O O O
virus O O O O
is O O O O
the O O O O
predominant O O O O
influenza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O O O O
in O O O O
the O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
population O O O O
. O O O O
    
It O O O O
has O O O O
also O O O O
crossed O O O O
the O O O O
species O O O O
barriers O O O O
and O O O O
infected O O O O
turkeys O O O O
and O O O O
swine B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
in O O O O
several O O O O
countries O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
the O O O O
development O O O O
of O O O O
a O O O O
vaccine O O O O
that O O O O
is O O O O
effective O O O O
in O O O O
multiple O O O O
animal O O O O
species O O O O
is O O O O
urgently O O O O
needed O O O O
. O O O O
    
We O O O O
have O O O O
previously O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
the O O O O
introduction O O O O
of O O O O
temperature O O O O
- O O O O
sensitive O O O O
mutations O O O O
into O O O O
the O O O O
PB2 O O O O
and O O O O
PB1 O O O O
genes O O O O
of O O O O
an O O O O
avian O O O O
H9N2 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
combined O O O O
with O O O O
the O O O O
insertion O O O O
of O O O O
a O O O O
hemagglutinin O O O O
( O O O O
HA O O O O
) O O O O
tag O O O O
in O O O O
PB1 O O O O
, O O O O
resulted O O O O
in O O O O
an O O O O
attenuated O O O O
( O O O O
att O O O O
) O O O O
vaccine O O O O
backbone O O O O
for O O O O
both O O O O
chickens B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
mice O O O O
. O O O O
    
Because O O O O
the O O O O
new O O O O
pandemic O O O O
strain O O O O
is O O O O
a O O O O
triple O O O O
- O O O O
reassortant O O O O
( O O O O
TR O O O O
) O O O O
virus O O O O
, O O O O
we O O O O
chose O O O O
to O O O O
introduce O O O O
the O O O O
double O O O O
attenuating O O O O
modifications O O O O
into O O O O
a O O O O
swine B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
like O O O O
TR O O O O
virus O O O O
isolate O O O O
, O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
turkey O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
OH O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
313053 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
04 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H3N2 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
ty O O O O
/ O O O O
04 O O O O
) O O O O
, O O O O
with O O O O
the O O O O
goal O O O O
of O O O O
producing O O O O
live O O O O
attenuated O O O O
influenza O O O O
vaccines O O O O
( O O O O
LAIV O O O O
) O O O O
. O O O O
    
This O O O O
genetically O O O O
modified O O O O
backbone O O O O
had O O O O
impaired O O O O
polymerase O O O O
activity O O O O
and O O O O
restricted O O O O
virus O O O O
growth O O O O
at O O O O
elevated O O O O
temperatures O O O O
. O O O O
    
In O O O O
vivo O O O O
characterization O O O O
of O O O O
two O O O O
H1N1 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
vaccine O O O O
candidates O O O O
generated O O O O
using O O O O
the O O O O
ty O O O O
/ O O O O
04 O O O O
att O O O O
backbone O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
this O O O O
vaccine O O O O
is O O O O
highly O O O O
attenuated O O O O
in O O O O
mice O O O O
, O O O O
as O O O O
indicated O O O O
by O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
signs O O O O
of O O O O
disease O O O O
, O O O O
limited O O O O
replication O O O O
, O O O O
and O O O O
minimum O O O O
histopathological O O O O
alterations O O O O
in O O O O
the O O O O
respiratory O O O O
tract O O O O
. O O O O
    
A O O O O
single O O O O
immunization O O O O
with O O O O
the O O O O
ty O O O O
/ O O O O
04 O O O O
att O O O O
- O O O O
based O O O O
vaccines O O O O
conferred O O O O
complete O O O O
protection O O O O
against O O O O
a O O O O
lethal O O O O
H1N1pdm O O O O
virus O O O O
infection O O O O
in O O O O
mice O O O O
. O O O O
    
More O O O O
importantly O O O O
, O O O O
vaccination O O O O
of O O O O
pigs O O O O
with O O O O
a O O O O
ty O O O O
/ O O O O
04 O O O O
att O O O O
- O O O O
H1N1 O O O O
vaccine O O O O
candidate O O O O
resulted O O O O
in O O O O
sterilizing O O O O
immunity O O O O
upon O O O O
an O O O O
aggressive O O O O
intratracheal O O O O
challenge O O O O
with O O O O
the O O O O
2009 O O O O
H1N1 O O O O
pandemic O O O O
virus O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
studies O O O O
highlight O O O O
the O O O O
safety O O O O
of O O O O
the O O O O
ty O O O O
/ O O O O
04 O O O O
att O O O O
vaccine O O O O
platform O O O O
and O O O O
its O O O O
potential O O O O
as O O O O
a O O O O
master O O O O
donor O O O O
strain O O O O
for O O O O
the O O O O
generation O O O O
of O O O O
live O O O O
attenuated O O O O
vaccines O O O O
for O O O O
humans B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
livestock O O O O
. O O O O
    
Novel O O O O
F141L O O O O
pre O O O O
- O O O O
S2 O O O O
mutation O O O O
in O O O O
hepatitis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
B O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
increases O O O O
the O O O O
risk O O O O
of O O O O
hepatocellular O O O O
carcinoma O O O O
in O O O O
patients O O O O
with O O O O
chronic O O O O
genotype O O O O
C O O O O
infections O O O O
. O O O O
    
Several O O O O
lines O O O O
of O O O O
evidence O O O O
have O O O O
suggested O O O O
that O O O O
some O O O O
naturally O O O O
occurring O O O O
mutations O O O O
of O O O O
hepatitis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
B O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
HBV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
play O O O O
a O O O O
critical O O O O
role O O O O
in O O O O
hepatocellular O O O O
carcinoma O O O O
( O O O O
HCC O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
describe O O O O
a O O O O
novel O O O O
HCC O O O O
- O O O O
related O O O O
pre O O O O
- O O O O
S2 O O O O
mutation O O O O
, O O O O
F141L O O O O
. O O O O
    
To O O O O
prove O O O O
the O O O O
relationship O O O O
between O O O O
the O O O O
F141L O O O O
mutation O O O O
and O O O O
HCC O O O O
, O O O O
molecular O O O O
epidemiology O O O O
studies O O O O
using O O O O
MboII O O O O
PCR O O O O
restriction O O O O
analysis O O O O
( O O O O
PRA O O O O
) O O O O
were O O O O
performed O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
molecular O O O O
mechanism O O O O
was O O O O
investigated O O O O
through O O O O
construction O O O O
of O O O O
a O O O O
stable O O O O
hepatocyte O O O O
cell O O O O
line O O O O
expressing O O O O
the O O O O
large O O O O
surface O O O O
HB O O O O
protein O O O O
( O O O O
LHB O O O O
) O O O O
with O O O O
the O O O O
F141L O O O O
mutation O O O O
( O O O O
F141L O O O O
- O O O O
LHB O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Application O O O O
of O O O O
MboII O O O O
PRA O O O O
to O O O O
samples O O O O
from O O O O
241 O O O O
Korean O O O O
patients O O O O
with O O O O
chronic O O O O
liver O O O O
diseases O O O O
of O O O O
different O O O O
clinical O O O O
stages O O O O
confirmed O O O O
that O O O O
F141L O O O O
mutants O O O O
were O O O O
significantly O O O O
related O O O O
to O O O O
HCC O O O O
, O O O O
even O O O O
in O O O O
comparison O O O O
to O O O O
liver O O O O
cirrhosis O O O O
( O O O O
HCC O O O O
, O O O O
26 O O O O
. O O O O
3 O O O O
% O O O O
of O O O O
patients O O O O
, O O O O
or O O O O
26 O O O O
/ O O O O
99 O O O O
; O O O O
liver O O O O
cirrhosis O O O O
, O O O O
3 O O O O
. O O O O
8 O O O O
% O O O O
of O O O O
patients O O O O
, O O O O
or O O O O
2 O O O O
/ O O O O
52 O O O O
; O O O O
P O O O O
= O O O O
0 O O O O
. O O O O
001 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
By O O O O
studying O O O O
stable O O O O
cell O O O O
lines O O O O
, O O O O
we O O O O
found O O O O
that O O O O
F141L O O O O
- O O O O
LHBs O O O O
could O O O O
induce O O O O
cell O O O O
cycle O O O O
progression O O O O
by O O O O
downregulating O O O O
the O O O O
p53 O O O O
and O O O O
p21 O O O O
pathways O O O O
and O O O O
upregulating O O O O
CDK4 O O O O
and O O O O
cyclin O O O O
A O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
we O O O O
found O O O O
that O O O O
in O O O O
a O O O O
colony O O O O
- O O O O
forming O O O O
assay O O O O
, O O O O
the O O O O
colony O O O O
- O O O O
forming O O O O
rates O O O O
in O O O O
cell O O O O
lines O O O O
expressing O O O O
F141L O O O O
- O O O O
LHBs O O O O
were O O O O
about O O O O
twice O O O O
as O O O O
high O O O O
as O O O O
those O O O O
of O O O O
the O O O O
wild O O O O
type O O O O
. O O O O
    
In O O O O
conclusion O O O O
, O O O O
our O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
F141L O O O O
- O O O O
LHBs O O O O
may O O O O
contribute O O O O
importantly O O O O
to O O O O
the O O O O
pathogenesis O O O O
of O O O O
HCC O O O O
by O O O O
inducing O O O O
cell O O O O
proliferation O O O O
and O O O O
transformation O O O O
. O O O O
    
So O O O O
, O O O O
the O O O O
F141L O O O O
mutation O O O O
examined O O O O
in O O O O
this O O O O
study O O O O
could O O O O
serve O O O O
as O O O O
a O O O O
diagnostic O O O O
marker O O O O
for O O O O
the O O O O
prognosis O O O O
of O O O O
HCC O O O O
. O O O O
    
Poliovirus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
mediated O O O O
disruption O O O O
of O O O O
cytoplasmic O O O O
processing O O O O
bodies O O O O
. O O O O
    
Metazoan O O O O
cells O O O O
form O O O O
cytoplasmic O O O O
mRNA O O O O
granules O O O O
such O O O O
as O O O O
stress O O O O
granules O O O O
( O O O O
SG O O O O
) O O O O
and O O O O
processing O O O O
bodies O O O O
( O O O O
P O O O O
bodies O O O O
) O O O O
that O O O O
are O O O O
proposed O O O O
to O O O O
be O O O O
sites O O O O
of O O O O
aggregated O O O O
, O O O O
translationally O O O O
silenced O O O O
mRNAs O O O O
and O O O O
mRNA O O O O
degradation O O O O
. O O O O
    
Poliovirus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
PV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
is O O O O
a O O O O
plus O O O O
- O O O O
strand O O O O
RNA O O O O
virus O O O O
containing O O O O
a O O O O
genome O O O O
that O O O O
is O O O O
a O O O O
functional O O O O
mRNA O O O O
; O O O O
thus O O O O
, O O O O
we O O O O
investigated O O O O
if O O O O
PV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
antagonizes O O O O
the O O O O
processes O O O O
that O O O O
lead O O O O
to O O O O
formation O O O O
of O O O O
these O O O O
structures O O O O
. O O O O
    
We O O O O
have O O O O
previously O O O O
shown O O O O
that O O O O
PV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infection O O O O
inhibits O O O O
the O O O O
ability O O O O
of O O O O
cells O O O O
to O O O O
form O O O O
stress O O O O
granules O O O O
by O O O O
cleaving O O O O
RasGAP O O O O
- O O O O
SH3 O O O O
- O O O O
binding O O O O
protein O O O O
( O O O O
G3BP O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
show O O O O
that O O O O
P O O O O
bodies O O O O
are O O O O
also O O O O
disrupted O O O O
during O O O O
PV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infection O O O O
in O O O O
cells O O O O
by O O O O
4 O O O O
h O O O O
postinfection O O O O
. O O O O
    
The O O O O
disruption O O O O
of O O O O
P O O O O
bodies O O O O
is O O O O
more O O O O
rapid O O O O
and O O O O
more O O O O
complete O O O O
than O O O O
disruption O O O O
of O O O O
stress O O O O
granules O O O O
. O O O O
    
The O O O O
kinetics O O O O
of O O O O
P O O O O
body O O O O
disruption O O O O
correlated O O O O
with O O O O
production O O O O
of O O O O
viral O O O O
proteinases O O O O
and O O O O
required O O O O
substantial O O O O
viral O O O O
gene O O O O
product O O O O
expression O O O O
. O O O O
    
The O O O O
organizing O O O O
mechanism O O O O
that O O O O
forms O O O O
P O O O O
body O O O O
foci O O O O
in O O O O
cells O O O O
is O O O O
unknown O O O O
; O O O O
however O O O O
, O O O O
potential O O O O
scaffolding O O O O
, O O O O
aggregating O O O O
, O O O O
or O O O O
other O O O O
regulatory O O O O
proteins O O O O
found O O O O
in O O O O
P O O O O
bodies O O O O
were O O O O
investigated O O O O
for O O O O
degradation O O O O
. O O O O
    
Two O O O O
factors O O O O
involved O O O O
in O O O O
5 O O O O
' O O O O
- O O O O
end O O O O
mRNA O O O O
decapping O O O O
and O O O O
degradation O O O O
, O O O O
Xrn1 O O O O
and O O O O
Dcp1a O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
3 O O O O
' O O O O
deadenylase O O O O
complex O O O O
component O O O O
Pan3 O O O O
underwent O O O O
accelerated O O O O
degradation O O O O
during O O O O
infection O O O O
, O O O O
and O O O O
Dcp1a O O O O
may O O O O
be O O O O
a O O O O
direct O O O O
substrate O O O O
of O O O O
PV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
3C O O O O
proteinase O O O O
. O O O O
    
Several O O O O
other O O O O
key O O O O
factors O O O O
proposed O O O O
to O O O O
be O O O O
essential O O O O
for O O O O
P O O O O
body O O O O
formation O O O O
, O O O O
GW182 O O O O
, O O O O
Edc3 O O O O
, O O O O
and O O O O
Edc4 O O O O
, O O O O
were O O O O
unaffected O O O O
by O O O O
poliovirus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infection O O O O
. O O O O
    
Since O O O O
deadenylation O O O O
has O O O O
been O O O O
reported O O O O
to O O O O
be O O O O
required O O O O
for O O O O
P O O O O
body O O O O
formation O O O O
, O O O O
viral O O O O
inhibition O O O O
of O O O O
deadenylation O O O O
, O O O O
through O O O O
Pan3 O O O O
degradation O O O O
, O O O O
is O O O O
a O O O O
potential O O O O
mechanism O O O O
of O O O O
P O O O O
body O O O O
disruption O O O O
. O O O O
    
The O O O O
magnitude O O O O
of O O O O
local O O O O
immunity O O O O
in O O O O
the O O O O
lungs O O O O
of O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
induced O O O O
by O O O O
live O O O O
attenuated O O O O
influenza O O O O
vaccines O O O O
is O O O O
determined O O O O
by O O O O
local O O O O
viral O O O O
replication O O O O
and O O O O
induction O O O O
of O O O O
cytokines O O O O
. O O O O
    
While O O O O
live O O O O
attenuated O O O O
influenza O O O O
vaccines O O O O
( O O O O
LAIVs O O O O
) O O O O
have O O O O
been O O O O
shown O O O O
to O O O O
be O O O O
efficacious O O O O
and O O O O
have O O O O
been O O O O
licensed O O O O
for O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
use O O O O
, O O O O
the O O O O
surface O O O O
glycoproteins O O O O
hemagglutinin O O O O
( O O O O
HA O O O O
) O O O O
and O O O O
neuraminidase O O O O
( O O O O
 O O O O
) O O O O
have O O O O
to O O O O
be O O O O
updated O O O O
for O O O O
optimal O O O O
protective O O O O
efficacy O O O O
. O O O O
    
Little O O O O
is O O O O
known O O O O
about O O O O
the O O O O
effect O O O O
of O O O O
different O O O O
HA O O O O
and O O O O
 O O O O
proteins O O O O
on O O O O
the O O O O
immunogenicity O O O O
of O O O O
LAIVs O O O O
developed O O O O
using O O O O
the O O O O
same O O O O
backbone O O O O
. O O O O
    
A O O O O
panel O O O O
of O O O O
LAIVs O O O O
that O O O O
share O O O O
the O O O O
internal O O O O
protein O O O O
genes O O O O
, O O O O
with O O O O
unique O O O O
HA O O O O
and O O O O
 O O O O
gene O O O O
segments O O O O
from O O O O
different O O O O
influenza O O O O
subtypes O O O O
, O O O O
was O O O O
rescued O O O O
by O O O O
reverse O O O O
genetics O O O O
, O O O O
and O O O O
a O O O O
comparative O O O O
study O O O O
of O O O O
immune O O O O
responses O O O O
induced O O O O
by O O O O
these O O O O
vaccines O O O O
was O O O O
conducted O O O O
in O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
the O O O O
magnitude O O O O
of O O O O
lung O O O O
immunity O O O O
, O O O O
including O O O O
pulmonary O O O O
IgA O O O O
antibody O O O O
and O O O O
memory O O O O
CD8 O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
T O O O O
lymphocytes O O O O
, O O O O
induced O O O O
by O O O O
the O O O O
vaccines O O O O
depends O O O O
on O O O O
the O O O O
replication O O O O
efficiency O O O O
of O O O O
the O O O O
LAIVs O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
the O O O O
induction O O O O
of O O O O
cytokines O O O O
/ O O O O
chemokines O O O O
in O O O O
the O O O O
lungs O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
these O O O O
factors O O O O
are O O O O
not O O O O
important O O O O
in O O O O
determining O O O O
systemic O O O O
immunity O O O O
such O O O O
as O O O O
serum O O O O
antibody O O O O
titers O O O O
and O O O O
memory O O O O
CD8 O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
T O O O O
cells O O O O
in O O O O
the O O O O
spleen O O O O
. O O O O
    
A O O O O
qualitative O O O O
analysis O O O O
of O O O O
immune O O O O
responses O O O O
induced O O O O
by O O O O
a O O O O
single O O O O
dose O O O O
of O O O O
an O O O O
H5N1 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
LAIV O O O O
revealed O O O O
that O O O O
the O O O O
vaccine O O O O
induced O O O O
robust O O O O
systemic O O O O
and O O O O
mucosal O O O O
immunity O O O O
in O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
, O O O O
antibodies O O O O
and O O O O
memory O O O O
lymphocytes O O O O
established O O O O
in O O O O
the O O O O
lungs O O O O
following O O O O
vaccination O O O O
were O O O O
required O O O O
for O O O O
protection O O O O
against O O O O
lethal O O O O
challenge O O O O
with O O O O
homologous O O O O
and O O O O
heterologous O O O O
H5N1 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
viruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
highlight O O O O
the O O O O
different O O O O
requirements O O O O
for O O O O
inducing O O O O
systemic O O O O
and O O O O
lung O O O O
immunity O O O O
that O O O O
can O O O O
be O O O O
explored O O O O
for O O O O
the O O O O
development O O O O
of O O O O
pulmonary O O O O
immunity O O O O
for O O O O
protection O O O O
against O O O O
respiratory O O O O
pathogens O O O O
. O O O O
    
Multiple O O O O
innate O O O O
immune O O O O
pathways O O O O
contribute O O O O
to O O O O
the O O O O
immunogenicity O O O O
of O O O O
recombinant O O O O
adenovirus O O O O
vaccine O O O O
vectors O O O O
. O O O O
    
The O O O O
innate O O O O
immune O O O O
pathways O O O O
that O O O O
contribute O O O O
to O O O O
the O O O O
potent O O O O
immunogenicity O O O O
of O O O O
recombinant O O O O
adenovirus O O O O
( O O O O
rAd O O O O
) O O O O
vaccine O O O O
vectors O O O O
remain O O O O
largely O O O O
undefined O O O O
. O O O O
    
Previous O O O O
studies O O O O
assessing O O O O
innate O O O O
immunity O O O O
triggered O O O O
by O O O O
vaccine O O O O
vectors O O O O
have O O O O
largely O O O O
focused O O O O
on O O O O
in O O O O
vitro O O O O
studies O O O O
involving O O O O
antigen O O O O
- O O O O
presenting O O O O
cells O O O O
and O O O O
on O O O O
early O O O O
in O O O O
vivo O O O O
inflammatory O O O O
responses O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
systematically O O O O
explore O O O O
the O O O O
Toll O O O O
- O O O O
like O O O O
receptor O O O O
( O O O O
TLR O O O O
) O O O O
signaling O O O O
requirements O O O O
for O O O O
the O O O O
generation O O O O
of O O O O
cellular O O O O
immune O O O O
responses O O O O
by O O O O
intramuscular O O O O
immunization O O O O
with O O O O
common O O O O
and O O O O
alternative O O O O
serotype O O O O
rAd O O O O
vectors O O O O
in O O O O
mice O O O O
. O O O O
    
Antigen O O O O
- O O O O
specific O O O O
CD8 O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
T O O O O
- O O O O
lymphocyte O O O O
responses O O O O
elicited O O O O
by O O O O
these O O O O
rAd O O O O
vectors O O O O
were O O O O
significantly O O O O
diminished O O O O
in O O O O
MyD88 O O O O
( O O O O
- O O O O
/ O O O O
- O O O O
) O O O O
mice O O O O
but O O O O
not O O O O
in O O O O
TRIF O O O O
( O O O O
- O O O O
/ O O O O
- O O O O
) O O O O
or O O O O
TLR3 O O O O
( O O O O
- O O O O
/ O O O O
- O O O O
) O O O O
mice O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
the O O O O
importance O O O O
of O O O O
MyD88 O O O O
- O O O O
dependent O O O O
TLR O O O O
signaling O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
each O O O O
individual O O O O
TLR O O O O
resulted O O O O
in O O O O
minimal O O O O
to O O O O
no O O O O
effect O O O O
on O O O O
vaccine O O O O
- O O O O
elicited O O O O
cellular O O O O
immune O O O O
responses O O O O
. O O O O
    
Moreover O O O O
, O O O O
responses O O O O
were O O O O
not O O O O
diminished O O O O
in O O O O
IL O O O O
- O O O O
1R O O O O
( O O O O
- O O O O
/ O O O O
- O O O O
) O O O O
or O O O O
IL O O O O
- O O O O
18R O O O O
( O O O O
- O O O O
/ O O O O
- O O O O
) O O O O
mice O O O O
. O O O O
    
These O O O O
data O O O O
suggest O O O O
that O O O O
rAd O O O O
vectors O O O O
engage O O O O
multiple O O O O
MyD88 O O O O
- O O O O
dependent O O O O
signaling O O O O
pathways O O O O
, O O O O
none O O O O
of O O O O
which O O O O
are O O O O
individually O O O O
critical O O O O
; O O O O
rather O O O O
, O O O O
they O O O O
are O O O O
integrated O O O O
to O O O O
contribute O O O O
to O O O O
the O O O O
potent O O O O
immunogenicity O O O O
of O O O O
rAd O O O O
vectors O O O O
. O O O O
    
Stimulation O O O O
of O O O O
multiple O O O O
innate O O O O
immune O O O O
mechanisms O O O O
may O O O O
prove O O O O
a O O O O
generalizable O O O O
property O O O O
of O O O O
potent O O O O
vaccines O O O O
, O O O O
and O O O O
this O O O O
strategy O O O O
could O O O O
be O O O O
harnessed O O O O
in O O O O
the O O O O
development O O O O
of O O O O
next O O O O
- O O O O
generation O O O O
vaccine O O O O
vectors O O O O
and O O O O
adjuvants O O O O
. O O O O
    
Marek B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
' O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
s O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
disease O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
type O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
microRNA O O O O
miR O O O O
- O O O O
M3 O O O O
suppresses O O O O
cisplatin O O O O
- O O O O
induced O O O O
apoptosis O O O O
by O O O O
targeting O O O O
Smad2 O O O O
of O O O O
the O O O O
transforming O O O O
growth O O O O
factor O O O O
beta O O O O
signal O O O O
pathway O O O O
. O O O O
    
Viruses O O O O
cause O O O O
about O O O O
15 O O O O
% O O O O
of O O O O
the O O O O
cancers O O O O
that O O O O
are O O O O
still O O O O
the O O O O
leading O O O O
causes O O O O
of O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mortality O O O O
. O O O O
    
The O O O O
discovery O O O O
of O O O O
viral O O O O
oncogenes O O O O
has O O O O
enhanced O O O O
our O O O O
understanding O O O O
of O O O O
viral O O O O
oncogenesis O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
underlying O O O O
molecular O O O O
mechanisms O O O O
of O O O O
virus O O O O
- O O O O
induced O O O O
cancers O O O O
are O O O O
complex O O O O
and O O O O
require O O O O
further O O O O
investigation O O O O
. O O O O
    
The O O O O
present O O O O
study O O O O
has O O O O
attempted O O O O
to O O O O
investigate O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
the O O O O
microRNAs O O O O
( O O O O
miRNAs O O O O
) O O O O
encoded O O O O
by O O O O
Marek B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
' O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
s O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
disease O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
MDV1 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
, O O O O
a O O O O
chicken B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
herpesvirus O O O O
causing O O O O
acute O O O O
T O O O O
- O O O O
cell O O O O
lymphomas O O O O
and O O O O
solid O O O O
visceral O O O O
tumors O O O O
in O O O O
chickens B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
on O O O O
anti O O O O
- O O O O
cancer O O O O
drug O O O O
- O O O O
induced O O O O
apoptosis O O O O
and O O O O
identify O O O O
the O O O O
targets O O O O
of O O O O
the O O O O
miRNAs O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
showed O O O O
that O O O O
of O O O O
the O O O O
total O O O O
14 O O O O
miRNAs O O O O
encoded O O O O
by O O O O
MDV1 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
MDV1 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
miR O O O O
- O O O O
M3 O O O O
significantly O O O O
promoted O O O O
cell O O O O
survival O O O O
under O O O O
treatment O O O O
with O O O O
cisplatin O O O O
, O O O O
a O O O O
widely O O O O
used O O O O
chemotherapy O O O O
drug O O O O
. O O O O
    
MDV1 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
miR O O O O
- O O O O
M3 O O O O
suppressed O O O O
cisplatin O O O O
- O O O O
induced O O O O
apoptosis O O O O
by O O O O
directly O O O O
downregulating O O O O
expression O O O O
at O O O O
the O O O O
protein O O O O
but O O O O
not O O O O
the O O O O
mRNA O O O O
level O O O O
of O O O O
Smad2 O O O O
, O O O O
a O O O O
critical O O O O
component O O O O
in O O O O
the O O O O
transforming O O O O
growth O O O O
factor O O O O
Beta O O O O
signal O O O O
pathway O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
data O O O O
suggest O O O O
that O O O O
latent O O O O
/ O O O O
oncogenic O O O O
viruses O O O O
may O O O O
encode O O O O
miRNAs O O O O
to O O O O
directly O O O O
target O O O O
cellular O O O O
factors O O O O
involved O O O O
in O O O O
antiviral O O O O
processes O O O O
including O O O O
apoptosis O O O O
, O O O O
thus O O O O
proactively O O O O
creating O O O O
a O O O O
cellular O O O O
environment O O O O
beneficial O O O O
to O O O O
viral O O O O
latency O O O O
and O O O O
oncogenesis O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
the O O O O
knowledge O O O O
of O O O O
the O O O O
apoptosis O O O O
resistance O O O O
conferred O O O O
by O O O O
viral O O O O
miRNAs O O O O
has O O O O
great O O O O
practical O O O O
implications O O O O
for O O O O
improving O O O O
the O O O O
efficacy O O O O
of O O O O
chemotherapies O O O O
for O O O O
treating O O O O
cancers O O O O
, O O O O
especially O O O O
those O O O O
induced O O O O
by O O O O
oncogenic O O O O
viruses O O O O
. O O O O
    
Macaque O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
nonprogressors O O O O
resist O O O O
superinfection O O O O
with O O O O
multiple O O O O
CD8 O O O O
+ O O O O
T O O O O
cell O O O O
escape O O O O
variants O O O O
of O O O O
simian B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
immunodeficiency O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
immunodeficiency O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
- O O O O
positive O O O O
individuals O O O O
can O O O O
be O O O O
superinfected O O O O
with O O O O
different O O O O
virus O O O O
strains O O O O
. O O O O
    
Individuals O O O O
who O O O O
control O O O O
an O O O O
initial O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infection O O O O
are O O O O
therefore O O O O
still O O O O
at O O O O
risk O O O O
for O O O O
subsequent O O O O
infection O O O O
with O O O O
divergent O O O O
viruses O O O O
, O O O O
but O O O O
the O O O O
barriers O O O O
to O O O O
such O O O O
superinfection O O O O
remain O O O O
unclear O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
tested O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
nonprogressors O O O O
' O O O O
( O O O O
LTNPs O O O O
' O O O O
) O O O O
susceptibility O O O O
to O O O O
superinfection O O O O
using O O O O
Indian B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
rhesus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
macaques O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
that O O O O
express O O O O
the O O O O
major O O O O
histocompatibility O O O O
complex O O O O
class O O O O
I O O O O
( O O O O
MHC O O O O
- O O O O
I O O O O
) O O O O
allele O O O O
Mamu O O O O
- O O O O
B O O O O
17 O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
associated O O O O
with O O O O
control O O O O
of O O O O
the O O O O
pathogenic O O O O
AIDS O O O O
virus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
SIVmac239 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
Mamu O O O O
- O O O O
B O O O O
17 O O O O
- O O O O
restricted O O O O
CD8 O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
T O O O O
cell O O O O
repertoire O O O O
is O O O O
focused O O O O
almost O O O O
entirely O O O O
on O O O O
5 O O O O
epitopes O O O O
. O O O O
    
We O O O O
engineered O O O O
a O O O O
series O O O O
of O O O O
SIVmac239 O O O O
variants O O O O
bearing O O O O
mutations O O O O
in O O O O
3 O O O O
, O O O O
4 O O O O
, O O O O
or O O O O
all O O O O
5 O O O O
of O O O O
these O O O O
epitopes O O O O
and O O O O
used O O O O
them O O O O
to O O O O
serially O O O O
challenge O O O O
2 O O O O
Mamu O O O O
- O O O O
B O O O O
17 O O O O
- O O O O
positive O O O O
LTNPs O O O O
. O O O O
    
None O O O O
of O O O O
the O O O O
escape O O O O
variants O O O O
caused O O O O
breakthrough O O O O
replication O O O O
in O O O O
LTNPs O O O O
, O O O O
although O O O O
they O O O O
readily O O O O
infected O O O O
Mamu O O O O
- O O O O
B O O O O
17 O O O O
- O O O O
negative O O O O
naive O O O O
macaques O O O O
. O O O O
    
In O O O O
vitro O O O O
competing O O O O
coculture O O O O
assays O O O O
and O O O O
examination O O O O
of O O O O
viral O O O O
evolution O O O O
in O O O O
hosts O O O O
lacking O O O O
Mamu O O O O
- O O O O
B O O O O
17 O O O O
suggested O O O O
that O O O O
the O O O O
mutant O O O O
viruses O O O O
had O O O O
negligible O O O O
defects O O O O
in O O O O
replicative O O O O
fitness O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
LTNPs O O O O
maintained O O O O
robust O O O O
immune O O O O
responses O O O O
, O O O O
including O O O O
simian B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
immunodeficiency O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
SIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
- O O O O
specific O O O O
CD8 O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
and O O O O
CD4 O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
T O O O O
cells O O O O
and O O O O
neutralizing O O O O
antibodies O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
escape O O O O
mutations O O O O
in O O O O
epitopes O O O O
bound O O O O
by O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
protective O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
MHC O O O O
- O O O O
I O O O O
molecules O O O O
may O O O O
not O O O O
be O O O O
sufficient O O O O
to O O O O
establish O O O O
superinfection O O O O
in O O O O
LTNPs O O O O
. O O O O
    
Induction O O O O
of O O O O
type O O O O
I O O O O
interferon O O O O
secretion O O O O
through O O O O
recombinant O O O O
Newcastle B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
disease O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
expressing O O O O
measles B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
hemagglutinin O O O O
stimulates O O O O
antibody O O O O
secretion O O O O
in O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
maternal O O O O
antibodies O O O O
. O O O O
    
Measles B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
MV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
vaccine O O O O
effectively O O O O
protects O O O O
seronegative O O O O
individuals O O O O
against O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
inhibition O O O O
of O O O O
vaccine O O O O
- O O O O
induced O O O O
seroconversion O O O O
by O O O O
maternal O O O O
antibodies O O O O
after O O O O
vaccination O O O O
remains O O O O
a O O O O
problem O O O O
, O O O O
as O O O O
it O O O O
leaves O O O O
infants O O O O
susceptible O O O O
to O O O O
MV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infection O O O O
. O O O O
    
In O O O O
cotton O O O O
rats O O O O
, O O O O
passive O O O O
transfer O O O O
of O O O O
MV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
specific O O O O
IgG O O O O
mimics O O O O
maternal O O O O
antibodies O O O O
and O O O O
inhibits O O O O
vaccine O O O O
- O O O O
induced O O O O
seroconversion O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
report O O O O
that O O O O
immunization O O O O
in O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
passively O O O O
transferred O O O O
IgG O O O O
inhibits O O O O
the O O O O
secretion O O O O
of O O O O
neutralizing O O O O
antibodies O O O O
but O O O O
not O O O O
the O O O O
generation O O O O
of O O O O
MV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
specific O O O O
B O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
This O O O O
finding O O O O
suggested O O O O
that O O O O
MV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
specific O O O O
B O O O O
cells O O O O
require O O O O
an O O O O
additional O O O O
stimulus O O O O
to O O O O
mature O O O O
into O O O O
antibody O O O O
- O O O O
secreting O O O O
plasma O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
In O O O O
order O O O O
to O O O O
provide O O O O
such O O O O
a O O O O
stimulus O O O O
, O O O O
we O O O O
generated O O O O
a O O O O
recombinant O O O O
Newcastle B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
disease O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
NDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
expressing O O O O
the O O O O
MV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
hemagglutinin O O O O
( O O O O
NDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
to O O O O
MV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
NDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
induced O O O O
high O O O O
levels O O O O
of O O O O
type O O O O
I O O O O
interferon O O O O
in O O O O
plasmacytoid O O O O
dendritic O O O O
cells O O O O
and O O O O
in O O O O
lung O O O O
tissue O O O O
. O O O O
    
In O O O O
cotton O O O O
rats O O O O
immunized O O O O
with O O O O
NDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
neutralizing O O O O
antibodies O O O O
were O O O O
also O O O O
generated O O O O
in O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
passively O O O O
transferred O O O O
antibodies O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
latter O O O O
case O O O O
, O O O O
however O O O O
, O O O O
the O O O O
level O O O O
and O O O O
kinetics O O O O
of O O O O
antibody O O O O
generation O O O O
were O O O O
reduced O O O O
. O O O O
    
In O O O O
vitro O O O O
, O O O O
alpha O O O O
interferon O O O O
stimulated O O O O
the O O O O
activation O O O O
of O O O O
MV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
specific O O O O
B O O O O
cells O O O O
from O O O O
MV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
immune O O O O
spleen O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
NDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infection O O O O
( O O O O
which O O O O
induces O O O O
alpha O O O O
interferon O O O O
) O O O O
had O O O O
the O O O O
same O O O O
effect O O O O
, O O O O
and O O O O
stimulation O O O O
could O O O O
be O O O O
abrogated O O O O
by O O O O
antibodies O O O O
neutralizing O O O O
alpha O O O O
interferon O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
interleukin O O O O
6 O O O O
( O O O O
IL O O O O
- O O O O
6 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
In O O O O
vivo O O O O
, O O O O
coapplication O O O O
of O O O O
UV O O O O
- O O O O
inactivated O O O O
MV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
with O O O O
NDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
led O O O O
to O O O O
increased O O O O
MV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
specific O O O O
antibody O O O O
production O O O O
in O O O O
the O O O O
presence O O O O
and O O O O
absence O O O O
of O O O O
passively O O O O
transferred O O O O
antibodies O O O O
. O O O O
    
These O O O O
data O O O O
indicate O O O O
that O O O O
MV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
specific O O O O
B O O O O
cells O O O O
are O O O O
being O O O O
generated O O O O
after O O O O
immunization O O O O
in O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
maternal O O O O
antibodies O O O O
and O O O O
that O O O O
the O O O O
provision O O O O
of O O O O
alpha O O O O
interferon O O O O
as O O O O
an O O O O
additional O O O O
signal O O O O
leads O O O O
to O O O O
antibody O O O O
secretion O O O O
. O O O O
    
Human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pluripotent O O O O
stem O O O O
cells O O O O
produce O O O O
natural O O O O
killer O O O O
cells O O O O
that O O O O
mediate O O O O
anti O O O O
- O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
activity O O O O
by O O O O
utilizing O O O O
diverse O O O O
cellular O O O O
mechanisms O O O O
. O O O O
    
Cell O O O O
- O O O O
based O O O O
therapies O O O O
against O O O O
HIV O O O O
/ O O O O
AIDS O O O O
have O O O O
been O O O O
gaining O O O O
increased O O O O
interest O O O O
. O O O O
    
Natural O O O O
killer O O O O
( O O O O
NK O O O O
) O O O O
cells O O O O
are O O O O
a O O O O
key O O O O
component O O O O
of O O O O
the O O O O
innate O O O O
immune O O O O
system O O O O
with O O O O
the O O O O
ability O O O O
to O O O O
kill O O O O
diverse O O O O
tumor O O O O
cells O O O O
and O O O O
virus O O O O
- O O O O
infected O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
While O O O O
NK O O O O
cells O O O O
have O O O O
been O O O O
shown O O O O
to O O O O
play O O O O
an O O O O
important O O O O
role O O O O
in O O O O
the O O O O
control O O O O
of O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
replication O O O O
, O O O O
their O O O O
functional O O O O
activities O O O O
are O O O O
often O O O O
compromised O O O O
in O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O O O O
infected O O O O
individuals O O O O
. O O O O
    
We O O O O
have O O O O
previously O O O O
demonstrated O O O O
the O O O O
derivation O O O O
of O O O O
NK O O O O
cells O O O O
from O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
embryonic O O O O
stem O O O O
cells O O O O
( O O O O
hESCs O O O O
) O O O O
with O O O O
the O O O O
ability O O O O
to O O O O
potently O O O O
kill O O O O
multiple O O O O
types O O O O
of O O O O
tumor O O O O
cells O O O O
both O O O O
in O O O O
vitro O O O O
and O O O O
in O O O O
vivo O O O O
. O O O O
    
We O O O O
now O O O O
demonstrate O O O O
the O O O O
derivation O O O O
of O O O O
functional O O O O
NK O O O O
cells O O O O
from O O O O
human O O O O
induced O O O O
pluripotent O O O O
stem O O O O
cells O O O O
( O O O O
iPSCs O O O O
) O O O O
. O O O O
    
More O O O O
importantly O O O O
, O O O O
both O O O O
hESC O O O O
- O O O O
and O O O O
iPSC O O O O
- O O O O
derived O O O O
NK O O O O
cells O O O O
are O O O O
able O O O O
to O O O O
inhibit O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
NL4 O O O O
- O O O O
3 O O O O
infection O O O O
of O O O O
CEM O O O O
- O O O O
GFP O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Additional O O O O
studies O O O O
using O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O O O O
infected O O O O
human O O O O
primary O O O O
CD4 O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
T O O O O
cells O O O O
illustrated O O O O
that O O O O
hESC O O O O
- O O O O
and O O O O
iPSC O O O O
- O O O O
derived O O O O
NK O O O O
cells O O O O
suppress O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
infection O O O O
by O O O O
at O O O O
least O O O O
three O O O O
distinct O O O O
cellular O O O O
mechanisms O O O O
: O O O O
killing O O O O
of O O O O
infected O O O O
targets O O O O
through O O O O
direct O O O O
lysis O O O O
, O O O O
antibody O O O O
- O O O O
dependent O O O O
cellular O O O O
cytotoxicity O O O O
, O O O O
and O O O O
production O O O O
of O O O O
chemokines O O O O
and O O O O
cytokines O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
establish O O O O
the O O O O
potential O O O O
to O O O O
utilize O O O O
hESC O O O O
- O O O O
and O O O O
iPSC O O O O
- O O O O
derived O O O O
NK O O O O
cells O O O O
to O O O O
better O O O O
understand O O O O
anti O O O O
- O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
immunity O O O O
and O O O O
provide O O O O
a O O O O
novel O O O O
cellular O O O O
immunotherapeutic O O O O
approach O O O O
to O O O O
treat O O O O
HIV O O O O
/ O O O O
AIDS O O O O
. O O O O
    
Yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
elicited O O O O
cross O O O O
- O O O O
reactive O O O O
antibodies O O O O
to O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
Env O O O O
glycans O O O O
efficiently O O O O
neutralize O O O O
virions O O O O
expressing O O O O
exclusively O O O O
high O O O O
- O O O O
mannose O O O O
N O O O O
- O O O O
linked O O O O
glycans O O O O
. O O O O
    
The O O O O
HIV O O O O
envelope O O O O
( O O O O
Env O O O O
) O O O O
protein O O O O
uses O O O O
a O O O O
dense O O O O
coat O O O O
of O O O O
glycans O O O O
to O O O O
mask O O O O
conserved O O O O
domains O O O O
and O O O O
evade O O O O
host O O O O
humoral O O O O
immune O O O O
responses O O O O
. O O O O
    
The O O O O
broadly O O O O
neutralizing O O O O
antibody O O O O
2G12 O O O O
, O O O O
which O O O O
binds O O O O
a O O O O
specific O O O O
cluster O O O O
of O O O O
high O O O O
- O O O O
mannose O O O O
glycans O O O O
on O O O O
HIV O O O O
Env O O O O
, O O O O
shows O O O O
that O O O O
the O O O O
glycan O O O O
shield O O O O
can O O O O
also O O O O
serve O O O O
as O O O O
a O O O O
target O O O O
for O O O O
neutralizing O O O O
antibodies O O O O
. O O O O
    
We O O O O
have O O O O
described O O O O
a O O O O
triple O O O O
mutant O O O O
Saccharomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cerevisiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O O O O
that O O O O
expresses O O O O
high O O O O
- O O O O
mannose O O O O
glycoproteins O O O O
that O O O O
bind O O O O
to O O O O
2G12 O O O O
. O O O O
    
When O O O O
used O O O O
to O O O O
immunize O O O O
rabbits B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
this O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
elicits O O O O
antibodies O O O O
that O O O O
bind O O O O
to O O O O
gp120 O O O O
- O O O O
associated O O O O
glycans O O O O
but O O O O
fail O O O O
to O O O O
neutralize O O O O
virus O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
sought O O O O
to O O O O
determine O O O O
the O O O O
reason O O O O
for O O O O
these O O O O
discordant O O O O
results O O O O
. O O O O
    
Affinity O O O O
purification O O O O
of O O O O
sera O O O O
over O O O O
columns O O O O
conjugated O O O O
with O O O O
three O O O O
2G12 O O O O
- O O O O
reactive O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
glycoproteins O O O O
showed O O O O
that O O O O
these O O O O
proteins O O O O
could O O O O
adsorb O O O O
80 O O O O
% O O O O
of O O O O
the O O O O
antibodies O O O O
that O O O O
bind O O O O
to O O O O
gp120 O O O O
glycans O O O O
. O O O O
    
Despite O O O O
binding O O O O
to O O O O
monomeric O O O O
gp120 O O O O
, O O O O
these O O O O
mannose O O O O
- O O O O
specific O O O O
antibodies O O O O
failed O O O O
to O O O O
bind O O O O
cell O O O O
surface O O O O
- O O O O
expressed O O O O
trimeric O O O O
Env O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
when O O O O
Env O O O O
was O O O O
expressed O O O O
in O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
the O O O O
mannosidase O O O O
inhibitor O O O O
kifunensine O O O O
to O O O O
force O O O O
retention O O O O
of O O O O
high O O O O
- O O O O
mannose O O O O
glycans O O O O
at O O O O
all O O O O
sites O O O O
, O O O O
the O O O O
purified O O O O
antibodies O O O O
gained O O O O
the O O O O
abilities O O O O
to O O O O
bind O O O O
trimeric O O O O
Env O O O O
and O O O O
to O O O O
strongly O O O O
and O O O O
broadly O O O O
neutralize O O O O
viruses O O O O
produced O O O O
under O O O O
these O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
Combined O O O O
, O O O O
these O O O O
data O O O O
show O O O O
that O O O O
the O O O O
triple O O O O
mutant O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
strain O O O O
elicits O O O O
antibodies O O O O
that O O O O
bind O O O O
to O O O O
high O O O O
- O O O O
mannose O O O O
glycans O O O O
presented O O O O
on O O O O
the O O O O
HIV O O O O
envelope O O O O
, O O O O
but O O O O
only O O O O
when O O O O
they O O O O
are O O O O
displayed O O O O
in O O O O
a O O O O
manner O O O O
not O O O O
found O O O O
on O O O O
native O O O O
Env O O O O
trimers O O O O
. O O O O
    
This O O O O
implies O O O O
that O O O O
the O O O O
underlying O O O O
structure O O O O
of O O O O
the O O O O
protein O O O O
scaffold O O O O
used O O O O
to O O O O
present O O O O
the O O O O
high O O O O
- O O O O
mannose O O O O
glycans O O O O
may O O O O
be O O O O
critical O O O O
to O O O O
allow O O O O
elicitation O O O O
of O O O O
antibodies O O O O
that O O O O
recognize O O O O
trimeric O O O O
Env O O O O
and O O O O
neutralize O O O O
virus O O O O
. O O O O
    
Role O O O O
of O O O O
RNase O O O O
MRP O O O O
in O O O O
viral O O O O
RNA O O O O
degradation O O O O
and O O O O
RNA O O O O
recombination O O O O
. O O O O
    
RNA O O O O
degradation O O O O
, O O O O
together O O O O
with O O O O
RNA O O O O
synthesis O O O O
, O O O O
controls O O O O
the O O O O
steady O O O O
- O O O O
state O O O O
level O O O O
of O O O O
viral O O O O
RNAs O O O O
in O O O O
infected O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
The O O O O
endoribonucleolytic O O O O
cleavage O O O O
of O O O O
viral O O O O
RNA O O O O
is O O O O
important O O O O
not O O O O
only O O O O
for O O O O
viral O O O O
RNA O O O O
degradation O O O O
but O O O O
for O O O O
RNA O O O O
recombination O O O O
as O O O O
well O O O O
, O O O O
due O O O O
to O O O O
the O O O O
participation O O O O
of O O O O
some O O O O
RNA O O O O
degradation O O O O
products O O O O
in O O O O
the O O O O
RNA O O O O
recombination O O O O
process O O O O
. O O O O
    
To O O O O
identify O O O O
host O O O O
endoribonucleases O O O O
involved O O O O
in O O O O
degradation O O O O
of O O O O
Tomato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bushy O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
stunt O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
TBSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
in O O O O
a O O O O
Saccharomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cerevisiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
model O O O O
host O O O O
, O O O O
we O O O O
tested O O O O
eight O O O O
known O O O O
endoribonucleases O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
report O O O O
that O O O O
downregulation O O O O
of O O O O
SNM1 O O O O
, O O O O
encoding O O O O
a O O O O
component O O O O
of O O O O
the O O O O
RNase O O O O
MRP O O O O
, O O O O
and O O O O
a O O O O
temperature O O O O
- O O O O
sensitive O O O O
mutation O O O O
in O O O O
the O O O O
NME1 O O O O
gene O O O O
, O O O O
coding O O O O
for O O O O
the O O O O
RNA O O O O
component O O O O
of O O O O
RNase O O O O
MRP O O O O
, O O O O
lead O O O O
to O O O O
reduced O O O O
production O O O O
of O O O O
the O O O O
endoribonucleolytically O O O O
cleaved O O O O
TBSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
RNA O O O O
in O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
show O O O O
that O O O O
the O O O O
highly O O O O
purified O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
RNase O O O O
MRP O O O O
cleaves O O O O
the O O O O
TBSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
RNA O O O O
in O O O O
vitro O O O O
, O O O O
resulting O O O O
in O O O O
TBSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
RNA O O O O
degradation O O O O
products O O O O
similar O O O O
in O O O O
size O O O O
to O O O O
those O O O O
observed O O O O
in O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cells O O O O
. O O O O
    
Knocking O O O O
down O O O O
the O O O O
NME1 O O O O
homolog O O O O
in O O O O
Nicotiana B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
benthamiana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
also O O O O
led O O O O
to O O O O
decreased O O O O
production O O O O
of O O O O
the O O O O
cleaved O O O O
TBSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
RNA O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
in O O O O
plants O O O O
, O O O O
RNase O O O O
MRP O O O O
is O O O O
involved O O O O
in O O O O
TBSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
RNA O O O O
degradation O O O O
. O O O O
    
Altogether O O O O
, O O O O
this O O O O
work O O O O
suggests O O O O
a O O O O
role O O O O
for O O O O
the O O O O
host O O O O
endoribonuclease O O O O
RNase O O O O
MRP O O O O
in O O O O
viral O O O O
RNA O O O O
degradation O O O O
and O O O O
recombination O O O O
. O O O O
    
Identification O O O O
and O O O O
structural O O O O
characterization O O O O
of O O O O
the O O O O
ALIX O O O O
- O O O O
binding O O O O
late O O O O
domains O O O O
of O O O O
simian B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
immunodeficiency O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
SIVmac239 O O O O
and O O O O
SIVagmTan B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Retroviral B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
Gag O O O O
proteins O O O O
contain O O O O
short O O O O
late O O O O
- O O O O
domain O O O O
motifs O O O O
that O O O O
recruit O O O O
cellular O O O O
ESCRT O O O O
pathway O O O O
proteins O O O O
to O O O O
facilitate O O O O
virus O O O O
budding O O O O
. O O O O
    
ALIX O O O O
- O O O O
binding O O O O
late O O O O
domains O O O O
often O O O O
contain O O O O
the O O O O
core O O O O
consensus O O O O
sequence O O O O
YPX O O O O
( O O O O
n O O O O
) O O O O
L O O O O
( O O O O
where O O O O
X O O O O
( O O O O
n O O O O
) O O O O
can O O O O
vary O O O O
in O O O O
sequence O O O O
and O O O O
length O O O O
) O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
some O O O O
simian B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
immunodeficiency O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
SIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
Gag O O O O
proteins O O O O
lack O O O O
this O O O O
consensus O O O O
sequence O O O O
, O O O O
yet O O O O
still O O O O
bind O O O O
ALIX O O O O
. O O O O
    
We O O O O
mapped O O O O
divergent O O O O
, O O O O
ALIX O O O O
- O O O O
binding O O O O
late O O O O
domains O O O O
within O O O O
the O O O O
p6 O O O O
( O O O O
Gag O O O O
) O O O O
proteins O O O O
of O O O O
SIV O O O O
( O O O O
mac239 O O O O
) O O O O
( O O O O
( O O O O
40 O O O O
) O O O O
SREKPYKEVTEDLLHLNSLF O O O O
( O O O O
59 O O O O
) O O O O
) O O O O
and O O O O
SIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
agmTan O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
( O O O O
24 O O O O
) O O O O
AAGAYDPARKLLEQYAKK O O O O
( O O O O
41 O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Crystal O O O O
structures O O O O
revealed O O O O
that O O O O
anchoring O O O O
tyrosines O O O O
( O O O O
in O O O O
lightface O O O O
) O O O O
and O O O O
nearby O O O O
hydrophobic O O O O
residues O O O O
( O O O O
underlined O O O O
) O O O O
contact O O O O
the O O O O
ALIX O O O O
V O O O O
domain O O O O
, O O O O
revealing O O O O
how O O O O
lentiviruses O O O O
employ O O O O
a O O O O
diverse O O O O
family O O O O
of O O O O
late O O O O
- O O O O
domain O O O O
sequences O O O O
to O O O O
bind O O O O
ALIX O O O O
and O O O O
promote O O O O
virus O O O O
budding O O O O
. O O O O
    
Variola B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
monkeypox B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
viruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
utilize O O O O
conserved O O O O
mechanisms O O O O
of O O O O
virion O O O O
motility O O O O
and O O O O
release O O O O
that O O O O
depend O O O O
on O O O O
abl O O O O
and O O O O
SRC O O O O
family O O O O
tyrosine O O O O
kinases O O O O
. O O O O
    
Vaccinia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
VacV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
enters O O O O
mammalian O O O O
cells O O O O
, O O O O
replicates O O O O
extranuclearly O O O O
, O O O O
and O O O O
produces O O O O
virions O O O O
that O O O O
move O O O O
to O O O O
the O O O O
cell O O O O
surface O O O O
along O O O O
microtubules O O O O
, O O O O
fuse O O O O
with O O O O
the O O O O
plasma O O O O
membrane O O O O
, O O O O
and O O O O
move O O O O
from O O O O
infected O O O O
cells O O O O
toward O O O O
apposing O O O O
cells O O O O
on O O O O
actin O O O O
- O O O O
filled O O O O
membranous O O O O
protrusions O O O O
or O O O O
actin O O O O
tails O O O O
. O O O O
    
To O O O O
form O O O O
actin O O O O
tails O O O O
, O O O O
cell O O O O
- O O O O
associated O O O O
enveloped O O O O
virions O O O O
( O O O O
CEV O O O O
) O O O O
require O O O O
Abl O O O O
and O O O O
Src O O O O
family O O O O
tyrosine O O O O
kinases O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
release O O O O
of O O O O
CEV O O O O
from O O O O
the O O O O
cell O O O O
requires O O O O
Abl O O O O
but O O O O
not O O O O
Src O O O O
family O O O O
tyrosine O O O O
kinases O O O O
and O O O O
is O O O O
blocked O O O O
by O O O O
imatinib O O O O
mesylate O O O O
( O O O O
STI O O O O
- O O O O
571 O O O O
; O O O O
Gleevec O O O O
) O O O O
, O O O O
an O O O O
Abl O O O O
family O O O O
kinase O O O O
inhibitor O O O O
used O O O O
to O O O O
treat O O O O
chronic O O O O
myelogenous O O O O
leukemia O O O O
in O O O O
humans B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
the O O O O
Poxviridae O O O O
family O O O O
members O O O O
monkeypox B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
MPX B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
and O O O O
variola B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
VarV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
use O O O O
conserved O O O O
mechanisms O O O O
for O O O O
actin O O O O
motility O O O O
and O O O O
extracellular O O O O
enveloped O O O O
virion O O O O
( O O O O
EEV O O O O
) O O O O
release O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
we O O O O
show O O O O
that O O O O
imatinib O O O O
mesylate O O O O
is O O O O
effective O O O O
in O O O O
a O O O O
mouse B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
model O O O O
of O O O O
infection O O O O
with O O O O
VacV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
whether O O O O
delivered O O O O
prophylactically O O O O
or O O O O
postinfection O O O O
, O O O O
and O O O O
restricts O O O O
spread O O O O
of O O O O
virions O O O O
from O O O O
the O O O O
site O O O O
of O O O O
inoculation O O O O
. O O O O
    
While O O O O
inhibitors O O O O
of O O O O
both O O O O
Src O O O O
and O O O O
Abl O O O O
family O O O O
kinases O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
dasatinib O O O O
( O O O O
BMS O O O O
- O O O O
354825 O O O O
; O O O O
Sprycel O O O O
) O O O O
, O O O O
are O O O O
effective O O O O
in O O O O
limiting O O O O
dissemination O O O O
of O O O O
VacV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
VarV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
and O O O O
MPX B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
in O O O O
vitro O O O O
, O O O O
members O O O O
of O O O O
this O O O O
class O O O O
of O O O O
drugs O O O O
appear O O O O
to O O O O
have O O O O
immunosuppressive O O O O
effects O O O O
in O O O O
vivo O O O O
that O O O O
preclude O O O O
their O O O O
use O O O O
as O O O O
anti O O O O
- O O O O
infectives O O O O
. O O O O
    
Together O O O O
, O O O O
these O O O O
data O O O O
suggest O O O O
a O O O O
possible O O O O
utility O O O O
for O O O O
imatinib O O O O
mesylate O O O O
in O O O O
treating O O O O
smallpox O O O O
or O O O O
MPX B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infections O O O O
or O O O O
complications O O O O
associated O O O O
with O O O O
vaccination O O O O
. O O O O
    
Replicative O O O O
and O O O O
transcriptional O O O O
activities O O O O
of O O O O
hepatitis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
B O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
patients O O O O
coinfected O O O O
with O O O O
hepatitis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
B O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
hepatitis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
delta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
viruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Hepatitis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
B O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
HBV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
and O O O O
hepatitis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
delta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
HDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
interplay O O O O
was O O O O
investigated O O O O
by O O O O
examining O O O O
liver O O O O
and O O O O
serum O O O O
samples O O O O
from O O O O
21 O O O O
coinfected O O O O
and O O O O
22 O O O O
HBV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
monoinfected O O O O
patients O O O O
with O O O O
chronic O O O O
liver O O O O
disease O O O O
. O O O O
    
Different O O O O
real O O O O
- O O O O
time O O O O
PCR O O O O
assays O O O O
were O O O O
applied O O O O
to O O O O
evaluate O O O O
intrahepatic O O O O
amounts O O O O
of O O O O
HBV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
DNA O O O O
, O O O O
covalently O O O O
closed O O O O
circular O O O O
DNA O O O O
( O O O O
cccDNA O O O O
) O O O O
, O O O O
pregenomic O O O O
RNA O O O O
( O O O O
pgRNA O O O O
) O O O O
, O O O O
pre O O O O
- O O O O
S O O O O
/ O O O O
S O O O O
RNAs O O O O
, O O O O
and O O O O
HDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
RNA O O O O
. O O O O
    
Besides O O O O
HBV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
DNA O O O O
and O O O O
HDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
RNA O O O O
levels O O O O
, O O O O
HBsAg O O O O
concentrations O O O O
in O O O O
the O O O O
sera O O O O
were O O O O
also O O O O
determined O O O O
. O O O O
    
HDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
coinfected O O O O
cases O O O O
showed O O O O
significantly O O O O
lower O O O O
median O O O O
levels O O O O
of O O O O
serum O O O O
HBV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
DNA O O O O
( O O O O
- O O O O
5 O O O O
log O O O O
) O O O O
, O O O O
intrahepatic O O O O
relaxed O O O O
- O O O O
circular O O O O
DNA O O O O
( O O O O
- O O O O
2 O O O O
log O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
cccDNA O O O O
( O O O O
- O O O O
2 O O O O
log O O O O
) O O O O
than O O O O
those O O O O
of O O O O
HBV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
monoinfected O O O O
cases O O O O
. O O O O
    
Interestingly O O O O
, O O O O
pgRNA O O O O
and O O O O
pre O O O O
- O O O O
S O O O O
/ O O O O
S O O O O
RNA O O O O
amounts O O O O
were O O O O
significantly O O O O
lower O O O O
( O O O O
both O O O O
- O O O O
1 O O O O
log O O O O
) O O O O
in O O O O
HDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
positive O O O O
patients O O O O
, O O O O
whereas O O O O
serum O O O O
HBsAg O O O O
concentrations O O O O
were O O O O
comparable O O O O
between O O O O
the O O O O
two O O O O
patient O O O O
groups O O O O
. O O O O
    
Pre O O O O
- O O O O
S O O O O
/ O O O O
S O O O O
RNA O O O O
and O O O O
HBsAg O O O O
amounts O O O O
per O O O O
cccDNA O O O O
molecule O O O O
were O O O O
higher O O O O
in O O O O
HDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
positive O O O O
patients O O O O
( O O O O
3 O O O O
- O O O O
fold O O O O
and O O O O
1 O O O O
log O O O O
, O O O O
respectively O O O O
) O O O O
, O O O O
showing O O O O
that O O O O
HBV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
replication O O O O
was O O O O
reduced O O O O
, O O O O
whereas O O O O
synthesis O O O O
of O O O O
envelope O O O O
proteins O O O O
was O O O O
not O O O O
specifically O O O O
decreased O O O O
. O O O O
    
The O O O O
ratios O O O O
of O O O O
cccDNA O O O O
to O O O O
intracellular O O O O
total O O O O
HBV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
DNA O O O O
showed O O O O
a O O O O
larger O O O O
proportion O O O O
of O O O O
cccDNA O O O O
molecules O O O O
in O O O O
HDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
positive O O O O
cases O O O O
. O O O O
    
For O O O O
these O O O O
patients O O O O
, O O O O
both O O O O
intrahepatic O O O O
and O O O O
serum O O O O
HDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
RNA O O O O
amounts O O O O
were O O O O
associated O O O O
with O O O O
cccDNA O O O O
but O O O O
not O O O O
with O O O O
HBsAg O O O O
or O O O O
HBV O O O O
DNA O O O O
levels O O O O
. O O O O
    
Finally O O O O
, O O O O
HBV O O O O
genomes O O O O
with O O O O
large O O O O
deletions O O O O
in O O O O
the O O O O
basal O O O O
core O O O O
promoter O O O O
/ O O O O
precore O O O O
region O O O O
were O O O O
detected O O O O
in O O O O
5 O O O O
/ O O O O
21 O O O O
HDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
positive O O O O
patients O O O O
but O O O O
in O O O O
no O O O O
HDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
negative O O O O
patients O O O O
and O O O O
were O O O O
associated O O O O
with O O O O
lower O O O O
viremia O O O O
levels O O O O
. O O O O
    
These O O O O
findings O O O O
provide O O O O
significant O O O O
information O O O O
about O O O O
the O O O O
interference O O O O
exerted O O O O
by O O O O
HDV O O O O
on O O O O
HBV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
replication O O O O
and O O O O
transcription O O O O
activities O O O O
in O O O O
the O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
liver O O O O
. O O O O
    
Dynamics O O O O
of O O O O
two O O O O
separate O O O O
but O O O O
linked O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
CRF01 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
_ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
AE O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
outbreaks O O O O
among O O O O
injection O O O O
drug O O O O
users O O O O
in O O O O
Stockholm O O O O
, O O O O
Sweden O O O O
, O O O O
and O O O O
Helsinki O O O O
, O O O O
Finland O O O O
. O O O O
    
Detailed O O O O
phylogenetic O O O O
analyses O O O O
were O O O O
performed O O O O
to O O O O
characterize O O O O
an O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
outbreak O O O O
among O O O O
injection O O O O
drug O O O O
users O O O O
( O O O O
IDUs O O O O
) O O O O
in O O O O
Stockholm O O O O
, O O O O
Sweden O O O O
, O O O O
in O O O O
2006 O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
investigated O O O O
the O O O O
source O O O O
and O O O O
dynamics O O O O
of O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
spread O O O O
during O O O O
the O O O O
outbreak O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
associated O O O O
demographic O O O O
and O O O O
clinical O O O O
factors O O O O
. O O O O
    
Seventy O O O O
Swedish O O O O
IDUs O O O O
diagnosed O O O O
during O O O O
2004 O O O O
to O O O O
2007 O O O O
were O O O O
studied O O O O
. O O O O
    
Demographic O O O O
, O O O O
clinical O O O O
, O O O O
and O O O O
laboratory O O O O
data O O O O
were O O O O
collected O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
V3 O O O O
region O O O O
of O O O O
the O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
envelope O O O O
gene O O O O
was O O O O
sequenced O O O O
to O O O O
allow O O O O
detailed O O O O
phylogenetic O O O O
analyses O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
showed O O O O
that O O O O
the O O O O
Stockholm O O O O
outbreak O O O O
was O O O O
caused O O O O
by O O O O
a O O O O
CRF01 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
_ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
AE O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
variant O O O O
imported O O O O
from O O O O
Helsinki O O O O
, O O O O
Finland O O O O
, O O O O
around O O O O
2003 O O O O
, O O O O
which O O O O
was O O O O
quiescent O O O O
until O O O O
the O O O O
outbreak O O O O
started O O O O
in O O O O
2006 O O O O
. O O O O
    
Local O O O O
Swedish O O O O
subtype B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
B O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
variants O O O O
continued O O O O
to O O O O
spread O O O O
at O O O O
a O O O O
lower O O O O
rate O O O O
. O O O O
    
The O O O O
number O O O O
of O O O O
new O O O O
CRF01 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
_ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
AE O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cases O O O O
over O O O O
a O O O O
rooted O O O O
phylogenetic O O O O
tree O O O O
accurately O O O O
reflected O O O O
the O O O O
transmission O O O O
dynamics O O O O
and O O O O
showed O O O O
a O O O O
temporary O O O O
increase O O O O
, O O O O
by O O O O
a O O O O
factor O O O O
of O O O O
12 O O O O
, O O O O
in O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
incidence O O O O
during O O O O
the O O O O
outbreak O O O O
. O O O O
    
Virus O O O O
levels O O O O
were O O O O
similar O O O O
in O O O O
CRF01 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
_ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
AE O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
subtype B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
B O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
infections O O O O
, O O O O
arguing O O O O
against O O O O
differences O O O O
in O O O O
contagiousness O O O O
. O O O O
    
Similarly O O O O
, O O O O
there O O O O
were O O O O
no O O O O
major O O O O
differences O O O O
in O O O O
other O O O O
baseline O O O O
characteristics O O O O
. O O O O
    
Instead O O O O
, O O O O
the O O O O
outbreak O O O O
in O O O O
Stockholm O O O O
( O O O O
and O O O O
Helsinki O O O O
) O O O O
was O O O O
best O O O O
explained O O O O
by O O O O
an O O O O
introduction O O O O
of O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
into O O O O
a O O O O
standing O O O O
network O O O O
of O O O O
previously O O O O
uninfected O O O O
IDUs O O O O
. O O O O
    
The O O O O
combination O O O O
of O O O O
phylogenetics O O O O
and O O O O
epidemiological O O O O
data O O O O
creates O O O O
a O O O O
powerful O O O O
tool O O O O
for O O O O
investigating O O O O
outbreaks O O O O
of O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
other O O O O
infectious O O O O
diseases O O O O
that O O O O
could O O O O
improve O O O O
surveillance O O O O
and O O O O
prevention O O O O
. O O O O
    
Thermally O O O O
contingent O O O O
plasticity O O O O
: O O O O
temperature O O O O
alters O O O O
expression O O O O
of O O O O
predator O O O O
- O O O O
induced O O O O
colour O O O O
and O O O O
morphology O O O O
in O O O O
a O O O O
Neotropical O O O O
treefrog O O O O
tadpole O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Behavioural O O O O
, O O O O
morphological O O O O
and O O O O
coloration O O O O
plasticity O O O O
are O O O O
common O O O O
responses O O O O
of O O O O
prey O O O O
to O O O O
predation O O O O
risk O O O O
. O O O O
    
Theory O O O O
predicts O O O O
that O O O O
prey O O O O
should O O O O
respond O O O O
to O O O O
the O O O O
relative O O O O
magnitude O O O O
of O O O O
risk O O O O
, O O O O
rather O O O O
than O O O O
a O O O O
single O O O O
level O O O O
of O O O O
response O O O O
to O O O O
any O O O O
risk O O O O
level O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
to O O O O
conspecific O O O O
and O O O O
predator O O O O
densities O O O O
, O O O O
prey O O O O
growth O O O O
and O O O O
differentiation O O O O
rates O O O O
affect O O O O
the O O O O
duration O O O O
of O O O O
vulnerability O O O O
to O O O O
size O O O O
- O O O O
and O O O O
stage O O O O
- O O O O
limited O O O O
predators O O O O
and O O O O
therefore O O O O
the O O O O
relative O O O O
value O O O O
of O O O O
defences O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
reared O O O O
tadpoles O O O O
of O O O O
the O O O O
Neotropical O O O O
treefrog O O O O
Dendropsophus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ebraccatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
with O O O O
or O O O O
without O O O O
cues O O O O
from O O O O
a O O O O
predator O O O O
( O O O O
Belostoma O O O O
sp O O O O
. O O O O
) O O O O
in O O O O
ecologically O O O O
relevant O O O O
warm O O O O
or O O O O
cool O O O O
temperatures O O O O
. O O O O
    
To O O O O
track O O O O
phenotypic O O O O
changes O O O O
, O O O O
we O O O O
measured O O O O
morphology O O O O
, O O O O
tail O O O O
coloration O O O O
and O O O O
developmental O O O O
stage O O O O
at O O O O
three O O O O
points O O O O
during O O O O
the O O O O
larval O O O O
period O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Cues O O O O
from O O O O
predators O O O O
interacted O O O O
with O O O O
growth O O O O
conditions O O O O
causing O O O O
tadpoles O O O O
to O O O O
alter O O O O
their O O O O
phenotype O O O O
, O O O O
changing O O O O
only O O O O
tail O O O O
colour O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
predators O O O O
in O O O O
warm O O O O
water O O O O
, O O O O
but O O O O
both O O O O
morphology O O O O
and O O O O
colour O O O O
in O O O O
cool O O O O
growth O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
Tadpoles O O O O
with O O O O
predators O O O O
in O O O O
warm O O O O
water O O O O
altered O O O O
coloration O O O O
early O O O O
but O O O O
converged O O O O
on O O O O
the O O O O
morphology O O O O
of O O O O
predator O O O O
- O O O O
free O O O O
controls O O O O
. O O O O
    
Water O O O O
temperature O O O O
alone O O O O
had O O O O
no O O O O
effect O O O O
on O O O O
tadpole O O O O
phenotype O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
seemingly O O O O
small O O O O
variation O O O O
in O O O O
abiotic O O O O
environmental O O O O
conditions O O O O
can O O O O
alter O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
phenotypic O O O O
plasticity O O O O
, O O O O
consistent O O O O
with O O O O
predictions O O O O
about O O O O
how O O O O
growth O O O O
rate O O O O
affects O O O O
risk O O O O
. O O O O
    
Predator O O O O
- O O O O
induced O O O O
tadpole O O O O
phenotypes O O O O
depended O O O O
on O O O O
temperature O O O O
, O O O O
with O O O O
strong O O O O
expression O O O O
only O O O O
in O O O O
temperatures O O O O
that O O O O
slow O O O O
development O O O O
. O O O O
    
Thermal O O O O
modulation O O O O
of O O O O
plastic O O O O
responses O O O O
to O O O O
predators O O O O
may O O O O
be O O O O
broadly O O O O
relevant O O O O
to O O O O
poikilotherm O O O O
development O O O O
. O O O O
    
It O O O O
is O O O O
important O O O O
to O O O O
include O O O O
a O O O O
range O O O O
of O O O O
realistic O O O O
growth O O O O
conditions O O O O
in O O O O
experiments O O O O
to O O O O
more O O O O
fully O O O O
understand O O O O
the O O O O
ecological O O O O
and O O O O
evolutionary O O O O
significance O O O O
of O O O O
plasticity O O O O
. O O O O
    
Contrasting O O O O
covariation O O O O
of O O O O
above O O O O
- O O O O
and O O O O
belowground O O O O
invertebrate O O O O
species O O O O
across O O O O
plant O O O O
genotypes O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Invertebrate O O O O
species O O O O
generally O O O O
do O O O O
not O O O O
respond O O O O
independently O O O O
to O O O O
genotypic O O O O
variation O O O O
in O O O O
plants O O O O
, O O O O
giving O O O O
rise O O O O
to O O O O
clusters O O O O
of O O O O
species O O O O
that O O O O
naturally O O O O
associate O O O O
with O O O O
or O O O O
avoid O O O O
certain O O O O
genotypes O O O O
. O O O O
    
This O O O O
covariation O O O O
causes O O O O
coevolution O O O O
to O O O O
be O O O O
diffuse O O O O
rather O O O O
than O O O O
pairwise O O O O
. O O O O
    
Studies O O O O
on O O O O
this O O O O
topic O O O O
, O O O O
however O O O O
, O O O O
have O O O O
never O O O O
considered O O O O
the O O O O
belowground O O O O
invertebrate O O O O
community O O O O
, O O O O
leaving O O O O
a O O O O
critical O O O O
gap O O O O
in O O O O
our O O O O
understanding O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
investigated O O O O
the O O O O
covariation O O O O
among O O O O
naturally O O O O
colonising O O O O
above O O O O
- O O O O
and O O O O
belowground O O O O
invertebrate O O O O
species O O O O
across O O O O
six O O O O
genetically O O O O
distinct O O O O
populations O O O O
of O O O O
the O O O O
dune O O O O
grass O O O O
Ammophila B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
arenaria O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
After O O O O
having O O O O
grown O O O O
from O O O O
seed O O O O
in O O O O
a O O O O
common O O O O
garden O O O O
, O O O O
plants O O O O
were O O O O
randomised O O O O
in O O O O
a O O O O
single O O O O
field O O O O
site O O O O
to O O O O
exclude O O O O
all O O O O
but O O O O
broad O O O O
- O O O O
sense O O O O
genetic O O O O
variation O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Strong O O O O
positive O O O O
covariation O O O O
across O O O O
genotypes O O O O
among O O O O
both O O O O
above O O O O
- O O O O
and O O O O
belowground O O O O
invertebrates O O O O
was O O O O
detected O O O O
, O O O O
while O O O O
correlations O O O O
between O O O O
these O O O O
two O O O O
groups O O O O
were O O O O
negative O O O O
. O O O O
    
This O O O O
clustering O O O O
of O O O O
above O O O O
- O O O O
and O O O O
belowground O O O O
species O O O O
matched O O O O
well O O O O
with O O O O
order O O O O
level O O O O
taxonomy O O O O
. O O O O
    
Host O O O O
range O O O O
, O O O O
trophic O O O O
level O O O O
and O O O O
food O O O O
type O O O O
on O O O O
the O O O O
other O O O O
hand O O O O
did O O O O
not O O O O
correspond O O O O
well O O O O
with O O O O
the O O O O
clusters O O O O
. O O O O
    
Within O O O O
the O O O O
cluster O O O O
of O O O O
aboveground O O O O
fauna O O O O
, O O O O
subsequent O O O O
groupings O O O O
were O O O O
not O O O O
related O O O O
to O O O O
any O O O O
phylogenetic O O O O
or O O O O
ecological O O O O
characteristic O O O O
, O O O O
although O O O O
correlations O O O O
within O O O O
these O O O O
subgroups O O O O
were O O O O
very O O O O
high O O O O
. O O O O
    
We O O O O
furthermore O O O O
demonstrated O O O O
significant O O O O
differences O O O O
in O O O O
multiple O O O O
invertebrate O O O O
species O O O O
occurrence O O O O
between O O O O
plant O O O O
genotypes O O O O
, O O O O
in O O O O
general O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
at O O O O
the O O O O
above O O O O
- O O O O
and O O O O
belowground O O O O
level O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
observed O O O O
strong O O O O
covariation O O O O
suggests O O O O
diffuse O O O O
coevolution O O O O
between O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
arenaria O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
its O O O O
associated O O O O
invertebrate O O O O
species O O O O
. O O O O
    
The O O O O
trade O O O O
- O O O O
off O O O O
between O O O O
root O O O O
and O O O O
shoot O O O O
invertebrates O O O O
could O O O O
however O O O O
hamper O O O O
directional O O O O
selection O O O O
on O O O O
resistance O O O O
to O O O O
either O O O O
group O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
clearly O O O O
demonstrate O O O O
the O O O O
need O O O O
for O O O O
studies O O O O
of O O O O
plant O O O O
- O O O O
animal O O O O
interactions O O O O
to O O O O
include O O O O
the O O O O
belowground O O O O
fauna O O O O
, O O O O
as O O O O
this O O O O
might O O O O
drastically O O O O
alter O O O O
our O O O O
general O O O O
conception O O O O
of O O O O
how O O O O
plants O O O O
and O O O O
their O O O O
associated O O O O
animal O O O O
communities O O O O
interact O O O O
and O O O O
how O O O O
these O O O O
interactions O O O O
shape O O O O
the O O O O
process O O O O
of O O O O
evolution O O O O
. O O O O
    
Density O O O O
- O O O O
dependent O O O O
population O O O O
dynamics O O O O
and O O O O
dispersal O O O O
in O O O O
heterogeneous O O O O
metapopulations O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Metapopulation O O O O
microcosms O O O O
were O O O O
constructed O O O O
to O O O O
test O O O O
the O O O O
effect O O O O
of O O O O
four O O O O
different O O O O
types O O O O
of O O O O
habitat O O O O
heterogeneity O O O O
on O O O O
the O O O O
dynamics O O O O
and O O O O
dispersal O O O O
in O O O O
spatially O O O O
extended O O O O
systems O O O O
; O O O O
homogeneity O O O O
, O O O O
spatial O O O O
heterogeneity O O O O
, O O O O
temporal O O O O
heterogeneity O O O O
and O O O O
spatio O O O O
- O O O O
temporal O O O O
heterogeneity O O O O
. O O O O
    
Resources O O O O
were O O O O
distributed O O O O
across O O O O
discrete O O O O
habitat O O O O
patches O O O O
in O O O O
bruchid O O O O
beetle O O O O
( O O O O
Callosobruchus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
maculatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
metapopulations O O O O
, O O O O
and O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
time O O O O
series O O O O
were O O O O
recorded O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Mathematical O O O O
models O O O O
were O O O O
fitted O O O O
to O O O O
the O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
time O O O O
series O O O O
from O O O O
the O O O O
experimental O O O O
systems O O O O
using O O O O
a O O O O
maximum O O O O
likelihood O O O O
approach O O O O
. O O O O
    
Models O O O O
were O O O O
composed O O O O
of O O O O
separate O O O O
birth O O O O
, O O O O
death O O O O
, O O O O
emigration O O O O
and O O O O
immigration O O O O
terms O O O O
all O O O O
of O O O O
which O O O O
incorporated O O O O
stochasticity O O O O
drawn O O O O
from O O O O
different O O O O
probability O O O O
distributions O O O O
. O O O O
    
Models O O O O
with O O O O
density O O O O
- O O O O
dependent O O O O
and O O O O
density O O O O
- O O O O
independent O O O O
birth O O O O
, O O O O
death O O O O
and O O O O
emigration O O O O
terms O O O O
were O O O O
investigated O O O O
and O O O O
, O O O O
in O O O O
each O O O O
case O O O O
, O O O O
the O O O O
model O O O O
that O O O O
best O O O O
described O O O O
the O O O O
empirical O O O O
data O O O O
was O O O O
identified O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
At O O O O
the O O O O
local O O O O
scale O O O O
, O O O O
population O O O O
sizes O O O O
differed O O O O
between O O O O
patches O O O O
depending O O O O
on O O O O
the O O O O
type O O O O
of O O O O
heterogeneity O O O O
. O O O O
    
Larger O O O O
populations O O O O
were O O O O
associated O O O O
with O O O O
higher O O O O
resource O O O O
availabilities O O O O
. O O O O
    
As O O O O
a O O O O
result O O O O
of O O O O
this O O O O
, O O O O
the O O O O
variation O O O O
between O O O O
local O O O O
population O O O O
sizes O O O O
was O O O O
greatest O O O O
when O O O O
there O O O O
was O O O O
spatial O O O O
heterogeneity O O O O
in O O O O
which O O O O
mean O O O O
resource O O O O
abundance O O O O
varied O O O O
from O O O O
patch O O O O
to O O O O
patch O O O O
. O O O O
    
Variation O O O O
in O O O O
population O O O O
sizes O O O O
within O O O O
patches O O O O
was O O O O
largest O O O O
when O O O O
there O O O O
was O O O O
temporal O O O O
heterogeneity O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Density O O O O
- O O O O
dependent O O O O
processes O O O O
leading O O O O
to O O O O
the O O O O
regulation O O O O
of O O O O
local O O O O
population O O O O
dynamics O O O O
in O O O O
our O O O O
experimental O O O O
systems O O O O
were O O O O
strongest O O O O
in O O O O
homogeneity O O O O
or O O O O
temporal O O O O
heterogeneity O O O O
treatments O O O O
. O O O O
    
Associated O O O O
with O O O O
this O O O O
, O O O O
we O O O O
found O O O O
that O O O O
these O O O O
systems O O O O
were O O O O
best O O O O
described O O O O
using O O O O
mathematical O O O O
models O O O O
with O O O O
density O O O O
dependence O O O O
acting O O O O
on O O O O
mortality O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
, O O O O
spatial O O O O
and O O O O
spatio O O O O
- O O O O
temporal O O O O
time O O O O
series O O O O
were O O O O
adequately O O O O
described O O O O
using O O O O
density O O O O
- O O O O
independent O O O O
population O O O O
processes O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Experimental O O O O
metapopulations O O O O
showed O O O O
varying O O O O
degrees O O O O
of O O O O
density O O O O
- O O O O
dependent O O O O
dispersal O O O O
. O O O O
    
Local O O O O
net O O O O
dispersal O O O O
each O O O O
week O O O O
was O O O O
primarily O O O O
driven O O O O
by O O O O
the O O O O
local O O O O
population O O O O
size O O O O
and O O O O
secondarily O O O O
affected O O O O
by O O O O
neighbourhood O O O O
population O O O O
density O O O O
. O O O O
    
Mathematical O O O O
population O O O O
models O O O O
illustrated O O O O
the O O O O
importance O O O O
of O O O O
explicit O O O O
description O O O O
of O O O O
density O O O O
- O O O O
dependent O O O O
dispersal O O O O
in O O O O
all O O O O
systems O O O O
except O O O O
the O O O O
homogeneous O O O O
metapopulations O O O O
. O O O O
    
Tuber B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
melanosporum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
: O O O O
mating O O O O
type O O O O
distribution O O O O
in O O O O
a O O O O
natural O O O O
plantation O O O O
and O O O O
dynamics O O O O
of O O O O
strains O O O O
of O O O O
different O O O O
mating O O O O
types O O O O
on O O O O
the O O O O
roots O O O O
of O O O O
nursery O O O O
- O O O O
inoculated O O O O
host O O O O
plants O O O O
. O O O O
    
* O O O O
In O O O O
light O O O O
of O O O O
the O O O O
recent O O O O
finding O O O O
that O O O O
Tuber B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
melanosporum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
the O O O O
ectomycorrhizal O O O O
ascomycete O O O O
that O O O O
produces O O O O
the O O O O
most O O O O
highly O O O O
prized O O O O
black B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
truffles O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
is O O O O
a O O O O
heterothallic O O O O
species O O O O
, O O O O
we O O O O
monitored O O O O
the O O O O
spatial O O O O
distribution O O O O
of O O O O
strains O O O O
with O O O O
opposite O O O O
mating O O O O
types O O O O
( O O O O
MAT O O O O
) O O O O
in O O O O
a O O O O
natural O O O O
truffle B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ground O O O O
and O O O O
followed O O O O
strain O O O O
dynamics O O O O
in O O O O
artificially O O O O
inoculated O O O O
host O O O O
plants O O O O
grown O O O O
under O O O O
controlled O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
* O O O O
In O O O O
a O O O O
natural O O O O
truffle B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ground O O O O
, O O O O
ectomycorrhizas O O O O
( O O O O
ECMs O O O O
) O O O O
, O O O O
soil O O O O
samples O O O O
and O O O O
fruit O O O O
bodies O O O O
were O O O O
sampled O O O O
and O O O O
genotyped O O O O
to O O O O
determine O O O O
mating O O O O
types O O O O
. O O O O
    
Simple O O O O
sequence O O O O
repeat O O O O
( O O O O
SSR O O O O
) O O O O
markers O O O O
were O O O O
also O O O O
used O O O O
to O O O O
fingerprint O O O O
ECMs O O O O
and O O O O
fruit O O O O
bodies O O O O
. O O O O
    
The O O O O
ECMs O O O O
from O O O O
nursery O O O O
- O O O O
inoculated O O O O
host O O O O
plants O O O O
were O O O O
analysed O O O O
for O O O O
mating O O O O
type O O O O
at O O O O
6 O O O O
months O O O O
and O O O O
19 O O O O
months O O O O
post O O O O
- O O O O
inoculation O O O O
. O O O O
    
* O O O O
In O O O O
open O O O O
- O O O O
field O O O O
conditions O O O O
, O O O O
all O O O O
ECMs O O O O
from O O O O
the O O O O
same O O O O
sampling O O O O
site O O O O
showed O O O O
an O O O O
identical O O O O
mating O O O O
type O O O O
and O O O O
an O O O O
identical O O O O
haploid O O O O
genotype O O O O
, O O O O
based O O O O
on O O O O
SSR O O O O
analysis O O O O
. O O O O
    
Interestingly O O O O
, O O O O
the O O O O
gleba O O O O
of O O O O
fruit O O O O
bodies O O O O
always O O O O
demonstrated O O O O
the O O O O
same O O O O
genotype O O O O
as O O O O
the O O O O
surrounding O O O O
ECMs O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
root O O O O
tips O O O O
from O O O O
nursery O O O O
- O O O O
grown O O O O
plants O O O O
initially O O O O
developed O O O O
ECMs O O O O
of O O O O
both O O O O
mating O O O O
types O O O O
, O O O O
a O O O O
dominance O O O O
of O O O O
ECMs O O O O
of O O O O
the O O O O
same O O O O
MAT O O O O
were O O O O
found O O O O
after O O O O
several O O O O
months O O O O
. O O O O
    
* O O O O
The O O O O
present O O O O
study O O O O
deepens O O O O
our O O O O
understanding O O O O
of O O O O
the O O O O
vegetative O O O O
and O O O O
sexual O O O O
propagation O O O O
modes O O O O
of O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
melanosporum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
are O O O O
highly O O O O
relevant O O O O
for O O O O
truffle B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cultivation O O O O
. O O O O
    
Jasmonate O O O O
biosynthesis O O O O
in O O O O
legume O O O O
and O O O O
actinorhizal O O O O
nodules O O O O
. O O O O
    
Jasmonic O O O O
acid O O O O
( O O O O
JA O O O O
) O O O O
is O O O O
a O O O O
plant O O O O
signalling O O O O
compound O O O O
that O O O O
has O O O O
been O O O O
implicated O O O O
in O O O O
the O O O O
regulation O O O O
of O O O O
mutualistic O O O O
symbioses O O O O
. O O O O
    
In O O O O
order O O O O
to O O O O
understand O O O O
the O O O O
spatial O O O O
distribution O O O O
of O O O O
JA O O O O
biosynthetic O O O O
capacity O O O O
in O O O O
nodules O O O O
of O O O O
two O O O O
actinorhizal O O O O
species O O O O
, O O O O
Casaurina B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
glauca O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Datisca B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
glomerata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
one O O O O
legume O O O O
, O O O O
Medicago B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
truncatula O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
we O O O O
determined O O O O
the O O O O
localization O O O O
of O O O O
allene O O O O
oxide O O O O
cyclase O O O O
( O O O O
AOC O O O O
) O O O O
which O O O O
catalyses O O O O
a O O O O
committed O O O O
step O O O O
in O O O O
JA O O O O
biosynthesis O O O O
. O O O O
    
In O O O O
all O O O O
nodule O O O O
types O O O O
analysed O O O O
, O O O O
AOC O O O O
was O O O O
detected O O O O
exclusively O O O O
in O O O O
uninfected O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
The O O O O
levels O O O O
of O O O O
JA O O O O
were O O O O
compared O O O O
in O O O O
the O O O O
roots O O O O
and O O O O
nodules O O O O
of O O O O
the O O O O
three O O O O
plant O O O O
species O O O O
. O O O O
    
The O O O O
nodules O O O O
and O O O O
noninoculated O O O O
roots O O O O
of O O O O
the O O O O
two O O O O
actinorhizal O O O O
species O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
root O O O O
systems O O O O
of O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
truncatula O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
noninoculated O O O O
or O O O O
nodulated O O O O
with O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
Sinorhizobium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
meliloti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
or O O O O
with O O O O
mutants O O O O
unable O O O O
to O O O O
fix O O O O
nitrogen O O O O
, O O O O
did O O O O
not O O O O
show O O O O
significant O O O O
differences O O O O
in O O O O
JA O O O O
levels O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
JA O O O O
levels O O O O
in O O O O
all O O O O
plant O O O O
organs O O O O
examined O O O O
increased O O O O
significantly O O O O
on O O O O
mechanical O O O O
disturbance O O O O
. O O O O
    
To O O O O
study O O O O
whether O O O O
JA O O O O
played O O O O
a O O O O
regulatory O O O O
role O O O O
in O O O O
the O O O O
nodules O O O O
of O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
truncatula O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
composite O O O O
plants O O O O
containing O O O O
roots O O O O
expressing O O O O
an O O O O
MtAOC1 O O O O
- O O O O
sense O O O O
or O O O O
MtAOC1 O O O O
- O O O O
RNAi O O O O
construct O O O O
were O O O O
inoculated O O O O
with O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
meliloti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Neither O O O O
an O O O O
increase O O O O
nor O O O O
reduction O O O O
in O O O O
AOC O O O O
levels O O O O
resulted O O O O
in O O O O
altered O O O O
nodule O O O O
formation O O O O
. O O O O
    
These O O O O
data O O O O
suggest O O O O
that O O O O
jasmonates O O O O
are O O O O
not O O O O
involved O O O O
in O O O O
the O O O O
development O O O O
and O O O O
function O O O O
of O O O O
root O O O O
nodules O O O O
. O O O O
    
Distribution O O O O
and O O O O
localization O O O O
of O O O O
microsatellites O O O O
in O O O O
the O O O O
Perigord B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
black O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
truffle O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
genome O O O O
and O O O O
identification O O O O
of O O O O
new O O O O
molecular O O O O
markers O O O O
. O O O O
    
The O O O O
level O O O O
of O O O O
genetic O O O O
diversity O O O O
and O O O O
genetic O O O O
structure O O O O
in O O O O
the O O O O
Perigord B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
black O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
truffle O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Tuber B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
melanosporum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Vittad O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
has O O O O
been O O O O
debated O O O O
for O O O O
several O O O O
years O O O O
, O O O O
mainly O O O O
due O O O O
to O O O O
the O O O O
lack O O O O
of O O O O
appropriate O O O O
genetic O O O O
markers O O O O
. O O O O
    
Microsatellites O O O O
or O O O O
simple O O O O
sequence O O O O
repeats O O O O
( O O O O
SSRs O O O O
) O O O O
are O O O O
important O O O O
for O O O O
the O O O O
genome O O O O
organisation O O O O
, O O O O
phenotypic O O O O
diversity O O O O
and O O O O
are O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
most O O O O
popular O O O O
molecular O O O O
markers O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
surveyed O O O O
the O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
melanosporum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
genome O O O O
( O O O O
1 O O O O
) O O O O
to O O O O
characterise O O O O
its O O O O
SSR O O O O
pattern O O O O
; O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
to O O O O
compare O O O O
it O O O O
with O O O O
SSR O O O O
patterns O O O O
found O O O O
in O O O O
48 O O O O
other O O O O
fungal O O O O
and O O O O
three O O O O
oomycetes O O O O
genomes O O O O
and O O O O
( O O O O
3 O O O O
) O O O O
to O O O O
identify O O O O
new O O O O
polymorphic O O O O
SSR O O O O
markers O O O O
for O O O O
population O O O O
genetics O O O O
. O O O O
    
The O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
melanosporum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
genome O O O O
is O O O O
rich O O O O
in O O O O
SSRs O O O O
with O O O O
22 O O O O
, O O O O
425 O O O O
SSRs O O O O
with O O O O
mono O O O O
- O O O O
nucleotides O O O O
being O O O O
the O O O O
most O O O O
frequent O O O O
motifs O O O O
. O O O O
    
SSRs O O O O
were O O O O
found O O O O
in O O O O
all O O O O
genomic O O O O
regions O O O O
although O O O O
they O O O O
are O O O O
more O O O O
frequent O O O O
in O O O O
non O O O O
- O O O O
coding O O O O
regions O O O O
( O O O O
introns O O O O
and O O O O
intergenic O O O O
regions O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Sixty O O O O
out O O O O
of O O O O
135 O O O O
PCR O O O O
- O O O O
amplified O O O O
mono O O O O
- O O O O
, O O O O
di O O O O
- O O O O
, O O O O
tri O O O O
- O O O O
, O O O O
tetra O O O O
, O O O O
penta O O O O
, O O O O
and O O O O
hexa O O O O
- O O O O
nucleotides O O O O
were O O O O
polymorphic O O O O
( O O O O
44 O O O O
% O O O O
) O O O O
within O O O O
black B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
truffle O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
populations O O O O
and O O O O
27 O O O O
were O O O O
randomly O O O O
selected O O O O
and O O O O
analysed O O O O
on O O O O
139 O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
melanosporum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
isolates O O O O
from O O O O
France O O O O
, O O O O
Italy O O O O
and O O O O
Spain O O O O
. O O O O
    
The O O O O
number O O O O
of O O O O
alleles O O O O
varied O O O O
from O O O O
2 O O O O
to O O O O
18 O O O O
and O O O O
the O O O O
expected O O O O
heterozygosity O O O O
from O O O O
0 O O O O
. O O O O
124 O O O O
to O O O O
0 O O O O
. O O O O
815 O O O O
. O O O O
    
One O O O O
hundred O O O O
and O O O O
thirty O O O O
- O O O O
two O O O O
different O O O O
multilocus O O O O
genotypes O O O O
out O O O O
of O O O O
the O O O O
139 O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
melanosporum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
isolates O O O O
were O O O O
identified O O O O
and O O O O
the O O O O
genotypic O O O O
diversity O O O O
was O O O O
high O O O O
( O O O O
0 O O O O
. O O O O
999 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Polymorphic O O O O
SSRs O O O O
were O O O O
found O O O O
in O O O O
UTR O O O O
regulatory O O O O
regions O O O O
of O O O O
fruiting O O O O
bodies O O O O
and O O O O
ectomycorrhiza O O O O
regulated O O O O
genes O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
they O O O O
may O O O O
play O O O O
a O O O O
role O O O O
in O O O O
phenotypic O O O O
variation O O O O
. O O O O
    
In O O O O
conclusion O O O O
, O O O O
SSRs O O O O
developed O O O O
in O O O O
this O O O O
study O O O O
were O O O O
highly O O O O
polymorphic O O O O
and O O O O
our O O O O
results O O O O
showed O O O O
that O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
melanosporum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
a O O O O
species O O O O
with O O O O
an O O O O
important O O O O
genetic O O O O
diversity O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
in O O O O
agreement O O O O
with O O O O
its O O O O
recently O O O O
uncovered O O O O
heterothallic O O O O
mating O O O O
system O O O O
. O O O O
    
Proteotyping O O O O
to O O O O
establish O O O O
the O O O O
lineage O O O O
of O O O O
type B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H1N1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
type B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
B O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
human O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
influenza O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
ability O O O O
to O O O O
establish O O O O
the O O O O
lineage O O O O
of O O O O
type B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H1N1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
type B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
B O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
human O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
influenza O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strains O O O O
using O O O O
a O O O O
new O O O O
proteotyping O O O O
approach O O O O
is O O O O
demonstrated O O O O
. O O O O
    
Lineage O O O O
- O O O O
specific O O O O
signature O O O O
peptides O O O O
have O O O O
been O O O O
determined O O O O
for O O O O
the O O O O
hemagglutinin O O O O
antigen O O O O
of O O O O
type B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H1N1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
type B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
B O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
influenza O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
viruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
detection O O O O
of O O O O
these O O O O
peptides O O O O
alone O O O O
within O O O O
the O O O O
high O O O O
resolution O O O O
mass O O O O
spectra O O O O
of O O O O
whole O O O O
antigen O O O O
digests O O O O
enables O O O O
the O O O O
lineage O O O O
of O O O O
the O O O O
strain O O O O
to O O O O
be O O O O
rapidly O O O O
and O O O O
unequivocally O O O O
assigned O O O O
. O O O O
    
This O O O O
proteotyping O O O O
approach O O O O
complements O O O O
conventional O O O O
PCR O O O O
approaches O O O O
and O O O O
should O O O O
aid O O O O
in O O O O
the O O O O
monitoring O O O O
of O O O O
the O O O O
evolution O O O O
of O O O O
the O O O O
influenza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
both O O O O
humans B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
animals O O O O
. O O O O
    
Development O O O O
of O O O O
an O O O O
IgM O O O O
- O O O O
capture O O O O
ELISA O O O O
for O O O O
Coxsackievirus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A16 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
infection O O O O
. O O O O
    
Diagnosis O O O O
of O O O O
Coxsackievirus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A16 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
CA16 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
infection O O O O
in O O O O
China O O O O
relies O O O O
mainly O O O O
on O O O O
reverse O O O O
transcription O O O O
- O O O O
polymerase O O O O
chain O O O O
reaction O O O O
( O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
) O O O O
that O O O O
require O O O O
expensive O O O O
equipment O O O O
and O O O O
special O O O O
trained O O O O
personnel O O O O
, O O O O
thus O O O O
making O O O O
its O O O O
wide O O O O
application O O O O
in O O O O
health O O O O
care O O O O
settings O O O O
unlikely O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
a O O O O
novel O O O O
IgM O O O O
anti O O O O
- O O O O
CA16 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
assay O O O O
was O O O O
developed O O O O
for O O O O
the O O O O
detection O O O O
of O O O O
IgM O O O O
antibodies O O O O
to O O O O
CA16 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
in O O O O
serum O O O O
. O O O O
    
The O O O O
responses O O O O
and O O O O
diagnostic O O O O
value O O O O
of O O O O
IgM O O O O
for O O O O
the O O O O
CA16 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infection O O O O
were O O O O
assessed O O O O
by O O O O
testing O O O O
1970 O O O O
serum O O O O
samples O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
showed O O O O
that O O O O
sensitivity O O O O
of O O O O
IgM O O O O
test O O O O
was O O O O
84 O O O O
. O O O O
6 O O O O
% O O O O
( O O O O
259 O O O O
/ O O O O
306 O O O O
, O O O O
95 O O O O
% O O O O
CI O O O O
: O O O O
80 O O O O
. O O O O
1 O O O O
- O O O O
88 O O O O
. O O O O
5 O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
specificity O O O O
in O O O O
control O O O O
subjects O O O O
and O O O O
patients O O O O
with O O O O
CA16 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
HFMD O O O O
was O O O O
99 O O O O
. O O O O
2 O O O O
% O O O O
( O O O O
1508 O O O O
/ O O O O
1520 O O O O
, O O O O
95 O O O O
% O O O O
CI O O O O
: O O O O
98 O O O O
. O O O O
6 O O O O
- O O O O
99 O O O O
. O O O O
6 O O O O
) O O O O
and O O O O
90 O O O O
. O O O O
3 O O O O
% O O O O
( O O O O
14 O O O O
/ O O O O
144 O O O O
, O O O O
95 O O O O
% O O O O
CI O O O O
: O O O O
84 O O O O
. O O O O
2 O O O O
- O O O O
94 O O O O
. O O O O
6 O O O O
) O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
The O O O O
IgM O O O O
positive O O O O
rate O O O O
reached O O O O
56 O O O O
. O O O O
3 O O O O
% O O O O
in O O O O
the O O O O
sera O O O O
collected O O O O
within O O O O
the O O O O
first O O O O
day O O O O
after O O O O
onset O O O O
, O O O O
increased O O O O
continuously O O O O
to O O O O
95 O O O O
. O O O O
3 O O O O
% O O O O
at O O O O
day O O O O
5 O O O O
to O O O O
day O O O O
7 O O O O
after O O O O
onset O O O O
, O O O O
and O O O O
then O O O O
reached O O O O
100 O O O O
% O O O O
after O O O O
more O O O O
than O O O O
8 O O O O
days O O O O
. O O O O
    
The O O O O
cross O O O O
- O O O O
reaction O O O O
rate O O O O
in O O O O
patients O O O O
infected O O O O
with O O O O
other O O O O
non O O O O
- O O O O
CA16 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
enteroviruses O O O O
was O O O O
9 O O O O
. O O O O
7 O O O O
% O O O O
( O O O O
14 O O O O
/ O O O O
144 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
the O O O O
IgM O O O O
anti O O O O
- O O O O
CA16 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
assay O O O O
offers O O O O
a O O O O
rapid O O O O
, O O O O
convenient O O O O
, O O O O
and O O O O
reliable O O O O
method O O O O
to O O O O
detect O O O O
acute O O O O
CA16 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infections O O O O
. O O O O
    
A O O O O
study O O O O
of O O O O
conflict O O O O
between O O O O
molecular O O O O
phylogeny O O O O
and O O O O
taxonomy O O O O
in O O O O
the O O O O
Desmidiaceae O O O O
( O O O O
Streptophyta O O O O
, O O O O
Viridiplantae O O O O
) O O O O
: O O O O
analyses O O O O
of O O O O
291 O O O O
rbcL O O O O
sequences O O O O
. O O O O
    
Molecular O O O O
phylogenetic O O O O
analyses O O O O
of O O O O
93 O O O O
new O O O O
and O O O O
198 O O O O
non O O O O
- O O O O
redundant O O O O
GenBank O O O O
rbcL O O O O
sequences O O O O
of O O O O
the O O O O
family O O O O
Desmidiaceae O O O O
( O O O O
Zygnematophyceae O O O O
, O O O O
Streptophyta O O O O
) O O O O
established O O O O
22 O O O O
mostly O O O O
highly O O O O
supported O O O O
clades O O O O
, O O O O
in O O O O
addition O O O O
to O O O O
four O O O O
non O O O O
- O O O O
supported O O O O
lineages O O O O
and O O O O
eight O O O O
single O O O O
- O O O O
taxon O O O O
branches O O O O
within O O O O
the O O O O
family O O O O
. O O O O
    
Nine O O O O
novel O O O O
clades O O O O
and O O O O
single O O O O
- O O O O
taxon O O O O
branches O O O O
were O O O O
identified O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
current O O O O
taxon O O O O
sampling O O O O
has O O O O
not O O O O
reached O O O O
saturation O O O O
in O O O O
the O O O O
family O O O O
. O O O O
    
The O O O O
highly O O O O
polyphyletic O O O O
nature O O O O
of O O O O
most O O O O
desmid O O O O
genera O O O O
corroborated O O O O
in O O O O
this O O O O
study O O O O
using O O O O
a O O O O
large O O O O
taxon O O O O
set O O O O
, O O O O
calls O O O O
for O O O O
re O O O O
- O O O O
evaluation O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
concept O O O O
in O O O O
the O O O O
family O O O O
Desmidiaceae O O O O
that O O O O
traditionally O O O O
relied O O O O
on O O O O
features O O O O
of O O O O
cell O O O O
morphology O O O O
. O O O O
    
Molecular O O O O
phylogenetic O O O O
data O O O O
have O O O O
shown O O O O
that O O O O
these O O O O
morphological O O O O
characters O O O O
are O O O O
highly O O O O
homoplastic O O O O
or O O O O
plesiomorphic O O O O
and O O O O
thus O O O O
cannot O O O O
be O O O O
used O O O O
to O O O O
delineate O O O O
genera O O O O
. O O O O
    
The O O O O
dramatic O O O O
discrepancy O O O O
between O O O O
the O O O O
currently O O O O
practised O O O O
systematic O O O O
treatment O O O O
of O O O O
the O O O O
family O O O O
and O O O O
the O O O O
composition O O O O
of O O O O
the O O O O
clades O O O O
based O O O O
on O O O O
sequence O O O O
comparisons O O O O
requires O O O O
emendation O O O O
of O O O O
almost O O O O
all O O O O
existing O O O O
genera O O O O
and O O O O
description O O O O
of O O O O
a O O O O
larger O O O O
number O O O O
of O O O O
novel O O O O
genera O O O O
. O O O O
    
The O O O O
clades O O O O
identified O O O O
during O O O O
this O O O O
study O O O O
provide O O O O
a O O O O
framework O O O O
for O O O O
the O O O O
future O O O O
emendation O O O O
/ O O O O
description O O O O
of O O O O
genera O O O O
in O O O O
the O O O O
Desmidiaceae O O O O
. O O O O
    
Ste50 O O O O
adaptor O O O O
protein O O O O
governs O O O O
sexual O O O O
differentiation O O O O
of O O O O
Cryptococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
neoformans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
via O O O O
the O O O O
pheromone O O O O
- O O O O
response O O O O
MAPK O O O O
signaling O O O O
pathway O O O O
. O O O O
    
The O O O O
mitogen O O O O
- O O O O
activated O O O O
protein O O O O
kinase O O O O
( O O O O
MAPK O O O O
) O O O O
pathways O O O O
control O O O O
diverse O O O O
cellular O O O O
functions O O O O
in O O O O
pathogenic O O O O
fungi O O O O
, O O O O
including O O O O
sexual O O O O
differentiation O O O O
, O O O O
stress O O O O
response O O O O
, O O O O
and O O O O
maintenance O O O O
of O O O O
cell O O O O
wall O O O O
integrity O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
characterized O O O O
a O O O O
Cryptococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
neoformans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gene O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
homologous O O O O
to O O O O
the O O O O
yeast O O O O
Ste50 O O O O
that O O O O
is O O O O
known O O O O
to O O O O
play O O O O
an O O O O
important O O O O
role O O O O
in O O O O
mating O O O O
pheromone O O O O
response O O O O
and O O O O
stress O O O O
response O O O O
as O O O O
an O O O O
adaptor O O O O
protein O O O O
to O O O O
the O O O O
Ste11 O O O O
MAPK O O O O
kinase O O O O
kinase O O O O
in O O O O
Saccharomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cerevisiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
neoformans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Ste50 O O O O
was O O O O
not O O O O
involved O O O O
in O O O O
any O O O O
of O O O O
the O O O O
stress O O O O
responses O O O O
or O O O O
virulence O O O O
factor O O O O
production O O O O
( O O O O
capsule O O O O
and O O O O
melanin O O O O
) O O O O
that O O O O
are O O O O
controlled O O O O
by O O O O
the O O O O
HOG O O O O
and O O O O
Ras O O O O
/ O O O O
cAMP O O O O
signaling O O O O
pathways O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
Ste50 O O O O
was O O O O
required O O O O
for O O O O
mating O O O O
in O O O O
both O O O O
serotype B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
serotype B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
D O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
C O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
neoformans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strains O O O O
. O O O O
    
The O O O O
ste50Delta O O O O
mutant O O O O
was O O O O
completely O O O O
defective O O O O
in O O O O
cell O O O O
- O O O O
cell O O O O
fusion O O O O
and O O O O
mating O O O O
pheromone O O O O
production O O O O
. O O O O
    
Double O O O O
mutation O O O O
of O O O O
the O O O O
STE50 O O O O
gene O O O O
blocked O O O O
increased O O O O
production O O O O
of O O O O
pheromone O O O O
and O O O O
the O O O O
hyper O O O O
- O O O O
filamentation O O O O
phenotype O O O O
of O O O O
cells O O O O
deleted O O O O
of O O O O
the O O O O
CRG1 O O O O
gene O O O O
, O O O O
which O O O O
encodes O O O O
the O O O O
RGS O O O O
protein O O O O
that O O O O
negatively O O O O
regulates O O O O
pheromone O O O O
responsive O O O O
G O O O O
- O O O O
protein O O O O
signaling O O O O
via O O O O
the O O O O
MAPK O O O O
pathway O O O O
. O O O O
    
Regardless O O O O
of O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
the O O O O
basidiomycota O O O O
- O O O O
specific O O O O
SH3 O O O O
domains O O O O
of O O O O
Ste50 O O O O
that O O O O
are O O O O
known O O O O
to O O O O
be O O O O
required O O O O
for O O O O
full O O O O
virulence O O O O
of O O O O
Ustilago B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
maydis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Ste50 O O O O
was O O O O
dispensable O O O O
for O O O O
virulence O O O O
of O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
neoformans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
a O O O O
murine O O O O
model O O O O
of O O O O
cryptococcosis O O O O
. O O O O
    
In O O O O
conclusion O O O O
, O O O O
the O O O O
Ste50 O O O O
adaptor O O O O
protein O O O O
controls O O O O
sexual O O O O
differentiation O O O O
of O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
neoformans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
via O O O O
the O O O O
pheromone O O O O
- O O O O
responsive O O O O
MAPK O O O O
pathway O O O O
but O O O O
is O O O O
not O O O O
required O O O O
for O O O O
virulence O O O O
. O O O O
    
Nucleotide O O O O
parasitism O O O O
by O O O O
Simkania B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
negevensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Chlamydiae O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Intracellular O O O O
bacteria O O O O
live O O O O
in O O O O
an O O O O
environment O O O O
rich O O O O
in O O O O
most O O O O
essential O O O O
metabolites O O O O
but O O O O
need O O O O
special O O O O
mechanisms O O O O
to O O O O
access O O O O
these O O O O
substrates O O O O
. O O O O
    
Nucleotide O O O O
transport O O O O
proteins O O O O
( O O O O
NTTs O O O O
) O O O O
catalyze O O O O
the O O O O
import O O O O
of O O O O
ATP O O O O
and O O O O
other O O O O
nucleotides O O O O
from O O O O
the O O O O
eukaryotic O O O O
host O O O O
into O O O O
the O O O O
bacterial O O O O
cell O O O O
and O O O O
render O O O O
de O O O O
novo O O O O
synthesis O O O O
of O O O O
these O O O O
compounds O O O O
dispensable O O O O
. O O O O
    
The O O O O
draft O O O O
genome O O O O
sequence O O O O
of O O O O
Simkania B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
negevensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Z O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
a O O O O
chlamydial O O O O
organism O O O O
considered O O O O
a O O O O
newly O O O O
emerging O O O O
pathogen O O O O
, O O O O
revealed O O O O
four O O O O
genes O O O O
encoding O O O O
putative O O O O
nucleotide O O O O
transport O O O O
proteins O O O O
( O O O O
SnNTT1 O O O O
to O O O O
SnNTT4 O O O O
) O O O O
, O O O O
all O O O O
of O O O O
which O O O O
are O O O O
transcribed O O O O
during O O O O
growth O O O O
of O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
negevensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
Acanthamoeba O O O O
host O O O O
cells O O O O
, O O O O
as O O O O
confirmed O O O O
by O O O O
reverse O O O O
transcription O O O O
- O O O O
PCR O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
heterologous O O O O
expression O O O O
in O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
we O O O O
could O O O O
show O O O O
that O O O O
SnNTT1 O O O O
functions O O O O
as O O O O
an O O O O
ATP O O O O
/ O O O O
ADP O O O O
antiporter O O O O
, O O O O
SnNTT2 O O O O
as O O O O
a O O O O
guanine O O O O
nucleotide O O O O
/ O O O O
ATP O O O O
/ O O O O
H O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
symporter O O O O
driven O O O O
by O O O O
the O O O O
membrane O O O O
potential O O O O
, O O O O
and O O O O
SnNTT3 O O O O
as O O O O
a O O O O
nucleotide O O O O
triphosphate O O O O
antiporter O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
, O O O O
SnNTT3 O O O O
is O O O O
able O O O O
to O O O O
transport O O O O
dCTP O O O O
, O O O O
which O O O O
has O O O O
not O O O O
been O O O O
shown O O O O
for O O O O
a O O O O
prokaryotic O O O O
transport O O O O
protein O O O O
before O O O O
. O O O O
    
No O O O O
substrate O O O O
could O O O O
be O O O O
identified O O O O
for O O O O
SnNTT4 O O O O
. O O O O
    
Taking O O O O
these O O O O
data O O O O
together O O O O
, O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
negevensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
employs O O O O
a O O O O
set O O O O
of O O O O
nucleotide O O O O
transport O O O O
proteins O O O O
to O O O O
efficiently O O O O
tap O O O O
its O O O O
host O O O O
' O O O O
s O O O O
energy O O O O
and O O O O
nucleotide O O O O
pools O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
similar O O O O
to O O O O
other O O O O
chlamydiae O O O O
, O O O O
these O O O O
transporters O O O O
show O O O O
distinct O O O O
and O O O O
unique O O O O
adaptations O O O O
with O O O O
respect O O O O
to O O O O
substrate O O O O
specificities O O O O
and O O O O
mode O O O O
of O O O O
transport O O O O
. O O O O
    
Insights O O O O
into O O O O
the O O O O
extracytoplasmic O O O O
stress O O O O
response O O O O
of O O O O
Xanthomonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
campestris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pv O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
campestris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
: O O O O
role O O O O
and O O O O
regulation O O O O
of O O O O
{ O O O O
sigma O O O O
} O O O O
E O O O O
- O O O O
dependent O O O O
activity O O O O
. O O O O
    
Xanthomonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
campestris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pv O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
campestris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
an O O O O
epiphytic O O O O
bacterium O O O O
that O O O O
can O O O O
become O O O O
a O O O O
vascular O O O O
pathogen O O O O
responsible O O O O
for O O O O
black O O O O
rot O O O O
disease O O O O
of O O O O
crucifers O O O O
. O O O O
    
To O O O O
adapt O O O O
gene O O O O
expression O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
ever O O O O
- O O O O
changing O O O O
habitats O O O O
, O O O O
phytopathogenic O O O O
bacteria O O O O
have O O O O
evolved O O O O
signal O O O O
transduction O O O O
regulatory O O O O
pathways O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
extracytoplasmic O O O O
function O O O O
( O O O O
ECF O O O O
) O O O O
sigma O O O O
factors O O O O
. O O O O
    
The O O O O
alternative O O O O
sigma O O O O
factor O O O O
sigma O O O O
( O O O O
E O O O O
) O O O O
, O O O O
encoded O O O O
by O O O O
rpoE O O O O
, O O O O
is O O O O
crucial O O O O
for O O O O
envelope O O O O
stress O O O O
response O O O O
and O O O O
plays O O O O
a O O O O
role O O O O
in O O O O
the O O O O
pathogenicity O O O O
of O O O O
many O O O O
bacterial O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
combine O O O O
different O O O O
approaches O O O O
to O O O O
investigate O O O O
the O O O O
role O O O O
and O O O O
mechanism O O O O
of O O O O
sigma O O O O
( O O O O
E O O O O
) O O O O
- O O O O
dependent O O O O
activation O O O O
in O O O O
X B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
campestris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pv O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
campestris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
We O O O O
show O O O O
that O O O O
the O O O O
rpoE O O O O
gene O O O O
is O O O O
organized O O O O
as O O O O
a O O O O
single O O O O
transcription O O O O
unit O O O O
with O O O O
the O O O O
anti O O O O
- O O O O
sigma O O O O
gene O O O O
rseA O O O O
and O O O O
the O O O O
protease O O O O
gene O O O O
mucD O O O O
and O O O O
that O O O O
rpoE O O O O
transcription O O O O
is O O O O
autoregulated O O O O
. O O O O
    
rseA O O O O
and O O O O
mucD O O O O
transcription O O O O
is O O O O
also O O O O
controlled O O O O
by O O O O
a O O O O
highly O O O O
conserved O O O O
sigma O O O O
( O O O O
E O O O O
) O O O O
- O O O O
dependent O O O O
promoter O O O O
within O O O O
the O O O O
sigma O O O O
( O O O O
E O O O O
) O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
. O O O O
    
The O O O O
sigma O O O O
( O O O O
E O O O O
) O O O O
- O O O O
mediated O O O O
stress O O O O
response O O O O
is O O O O
required O O O O
for O O O O
stationary O O O O
- O O O O
phase O O O O
survival O O O O
, O O O O
resistance O O O O
to O O O O
cadmium O O O O
, O O O O
and O O O O
adaptation O O O O
to O O O O
membrane O O O O
- O O O O
perturbing O O O O
stresses O O O O
( O O O O
elevated O O O O
temperature O O O O
and O O O O
ethanol O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
microarray O O O O
technology O O O O
, O O O O
we O O O O
started O O O O
to O O O O
define O O O O
the O O O O
sigma O O O O
( O O O O
E O O O O
) O O O O
regulon O O O O
of O O O O
X B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
campestris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pv O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
campestris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
These O O O O
genes O O O O
encode O O O O
proteins O O O O
belonging O O O O
to O O O O
different O O O O
classes O O O O
, O O O O
including O O O O
periplasmic O O O O
or O O O O
membrane O O O O
proteins O O O O
, O O O O
biosynthetic O O O O
enzymes O O O O
, O O O O
classical O O O O
heat O O O O
shock O O O O
proteins O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
heat O O O O
stress O O O O
sigma O O O O
factor O O O O
sigma O O O O
( O O O O
H O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
consensus O O O O
sequence O O O O
for O O O O
the O O O O
predicted O O O O
sigma O O O O
( O O O O
E O O O O
) O O O O
- O O O O
regulated O O O O
promoter O O O O
elements O O O O
is O O O O
GGAACTN O O O O
( O O O O
15 O O O O
- O O O O
17 O O O O
) O O O O
GTCNNA O O O O
. O O O O
    
Determination O O O O
of O O O O
the O O O O
rpoH O O O O
transcription O O O O
start O O O O
site O O O O
revealed O O O O
that O O O O
rpoH O O O O
was O O O O
directly O O O O
regulated O O O O
by O O O O
sigma O O O O
( O O O O
E O O O O
) O O O O
under O O O O
both O O O O
normal O O O O
and O O O O
heat O O O O
stress O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
Finally O O O O
, O O O O
sigma O O O O
( O O O O
E O O O O
) O O O O
activity O O O O
is O O O O
regulated O O O O
by O O O O
the O O O O
putative O O O O
regulated O O O O
intramembrane O O O O
proteolysis O O O O
( O O O O
RIP O O O O
) O O O O
proteases O O O O
RseP O O O O
and O O O O
DegS O O O O
, O O O O
as O O O O
previously O O O O
described O O O O
in O O O O
many O O O O
other O O O O
bacteria O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
our O O O O
data O O O O
suggest O O O O
that O O O O
RseP O O O O
and O O O O
DegS O O O O
are O O O O
not O O O O
only O O O O
dedicated O O O O
to O O O O
RseA O O O O
cleavage O O O O
and O O O O
that O O O O
the O O O O
proteolytic O O O O
cascade O O O O
of O O O O
RseA O O O O
could O O O O
involve O O O O
other O O O O
proteases O O O O
. O O O O
    
Regulation O O O O
and O O O O
function O O O O
of O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sugar O O O O
efflux O O O O
transporter O O O O
A O O O O
( O O O O
SetA O O O O
) O O O O
during O O O O
glucose O O O O
- O O O O
phosphate O O O O
stress O O O O
. O O O O
    
Accumulation O O O O
of O O O O
certain O O O O
nonmetabolizable O O O O
sugar O O O O
- O O O O
phosphates O O O O
( O O O O
including O O O O
alpha O O O O
- O O O O
methyl O O O O
glucoside O O O O
- O O O O
6 O O O O
- O O O O
phosphate O O O O
) O O O O
in O O O O
Escherichia O O O O
coli O O O O
is O O O O
growth O O O O
inhibitory O O O O
and O O O O
elicits O O O O
the O O O O
glucose O O O O
- O O O O
phosphate O O O O
stress O O O O
response O O O O
. O O O O
    
The O O O O
transcription O O O O
factor O O O O
SgrR O O O O
activates O O O O
transcription O O O O
of O O O O
the O O O O
small O O O O
RNA O O O O
SgrS O O O O
under O O O O
stress O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
SgrS O O O O
represses O O O O
translation O O O O
of O O O O
mRNAs O O O O
encoding O O O O
sugar O O O O
transporters O O O O
. O O O O
    
The O O O O
sgrR O O O O
and O O O O
sgrS O O O O
genes O O O O
are O O O O
located O O O O
directly O O O O
upstream O O O O
of O O O O
setA O O O O
, O O O O
and O O O O
this O O O O
gene O O O O
organization O O O O
is O O O O
conserved O O O O
in O O O O
numerous O O O O
enteric O O O O
species O O O O
, O O O O
prompting O O O O
the O O O O
hypothesis O O O O
that O O O O
SetA O O O O
contributes O O O O
to O O O O
the O O O O
glucose O O O O
- O O O O
phosphate O O O O
stress O O O O
response O O O O
. O O O O
    
SetA O O O O
is O O O O
a O O O O
proton O O O O
motive O O O O
force O O O O
- O O O O
driven O O O O
efflux O O O O
pump O O O O
capable O O O O
of O O O O
transporting O O O O
various O O O O
sugars O O O O
and O O O O
sugar O O O O
analogs O O O O
in O O O O
vitro O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
demonstrates O O O O
that O O O O
setA O O O O
expression O O O O
is O O O O
induced O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
glucose O O O O
- O O O O
phosphate O O O O
stress O O O O
, O O O O
and O O O O
this O O O O
requires O O O O
SgrR O O O O
. O O O O
    
Under O O O O
stress O O O O
conditions O O O O
, O O O O
setA O O O O
is O O O O
cotranscribed O O O O
with O O O O
sgrS O O O O
from O O O O
the O O O O
sgrS O O O O
promoter O O O O
. O O O O
    
A O O O O
setA O O O O
mutant O O O O
exhibits O O O O
a O O O O
growth O O O O
defect O O O O
under O O O O
stress O O O O
conditions O O O O
that O O O O
can O O O O
be O O O O
complemented O O O O
by O O O O
setA O O O O
in O O O O
trans O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
SetA O O O O
contributes O O O O
to O O O O
the O O O O
optimal O O O O
cellular O O O O
recovery O O O O
from O O O O
stress O O O O
. O O O O
    
Despite O O O O
previous O O O O
in O O O O
vitro O O O O
evidence O O O O
that O O O O
SetA O O O O
can O O O O
promote O O O O
efflux O O O O
of O O O O
the O O O O
stress O O O O
- O O O O
causing O O O O
glucose O O O O
analog O O O O
alpha O O O O
- O O O O
methyl O O O O
glucoside O O O O
, O O O O
in O O O O
vivo O O O O
data O O O O
in O O O O
this O O O O
study O O O O
indicate O O O O
that O O O O
SetA O O O O
is O O O O
not O O O O
the O O O O
major O O O O
efflux O O O O
pump O O O O
responsible O O O O
for O O O O
removal O O O O
of O O O O
alpha O O O O
- O O O O
methyl O O O O
glucoside O O O O
under O O O O
stress O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
Mapping O O O O
of O O O O
the O O O O
Neisseria B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
meningitidis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
NadA O O O O
cell O O O O
- O O O O
binding O O O O
site O O O O
: O O O O
relevance O O O O
of O O O O
predicted O O O O
{ O O O O
alpha O O O O
} O O O O
- O O O O
helices O O O O
in O O O O
the O O O O
NH2 O O O O
- O O O O
terminal O O O O
and O O O O
dimeric O O O O
coiled O O O O
- O O O O
coil O O O O
regions O O O O
. O O O O
    
NadA O O O O
is O O O O
a O O O O
trimeric O O O O
autotransporter O O O O
protein O O O O
of O O O O
Neisseria B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
meningitidis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
belonging O O O O
to O O O O
the O O O O
group O O O O
of O O O O
oligomeric O O O O
coiled O O O O
- O O O O
coil O O O O
adhesins O O O O
. O O O O
    
It O O O O
is O O O O
implicated O O O O
in O O O O
the O O O O
colonization O O O O
of O O O O
the O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
upper O O O O
respiratory O O O O
tract O O O O
by O O O O
hypervirulent O O O O
serogroup O O O O
B O O O O
N B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
meningitidis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strains O O O O
and O O O O
is O O O O
part O O O O
of O O O O
a O O O O
multiantigen O O O O
anti O O O O
- O O O O
serogroup O O O O
B O O O O
vaccine O O O O
. O O O O
    
Structure O O O O
prediction O O O O
indicates O O O O
that O O O O
NadA O O O O
is O O O O
made O O O O
by O O O O
a O O O O
COOH O O O O
- O O O O
terminal O O O O
membrane O O O O
anchor O O O O
( O O O O
also O O O O
necessary O O O O
for O O O O
autotranslocation O O O O
to O O O O
the O O O O
bacterial O O O O
surface O O O O
) O O O O
, O O O O
an O O O O
intermediate O O O O
elongated O O O O
coiled O O O O
- O O O O
coil O O O O
- O O O O
rich O O O O
stalk O O O O
, O O O O
and O O O O
an O O O O
NH O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
- O O O O
terminal O O O O
region O O O O
involved O O O O
in O O O O
cell O O O O
interaction O O O O
. O O O O
    
Electron O O O O
microscopy O O O O
analysis O O O O
and O O O O
structure O O O O
prediction O O O O
suggest O O O O
that O O O O
the O O O O
apical O O O O
region O O O O
of O O O O
NadA O O O O
forms O O O O
a O O O O
compact O O O O
and O O O O
globular O O O O
domain O O O O
. O O O O
    
Deletion O O O O
studies O O O O
proved O O O O
that O O O O
the O O O O
NH O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
- O O O O
terminal O O O O
sequence O O O O
( O O O O
residues O O O O
24 O O O O
to O O O O
87 O O O O
) O O O O
is O O O O
necessary O O O O
for O O O O
cell O O O O
adhesion O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
to O O O O
better O O O O
define O O O O
the O O O O
NadA O O O O
cell O O O O
binding O O O O
site O O O O
, O O O O
we O O O O
exploited O O O O
( O O O O
i O O O O
) O O O O
a O O O O
panel O O O O
of O O O O
NadA O O O O
mutants O O O O
lacking O O O O
sequences O O O O
along O O O O
the O O O O
coiled O O O O
- O O O O
coil O O O O
stalk O O O O
and O O O O
( O O O O
ii O O O O
) O O O O
several O O O O
oligoclonal O O O O
rabbit B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
antibodies O O O O
, O O O O
and O O O O
their O O O O
relative O O O O
Fab O O O O
fragments O O O O
, O O O O
directed O O O O
to O O O O
linear O O O O
epitopes O O O O
distributed O O O O
along O O O O
the O O O O
NadA O O O O
ectodomain O O O O
. O O O O
    
We O O O O
identified O O O O
two O O O O
critical O O O O
regions O O O O
for O O O O
the O O O O
NadA O O O O
- O O O O
cell O O O O
receptor O O O O
interaction O O O O
with O O O O
Chang O O O O
cells O O O O
: O O O O
the O O O O
NH O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
globular O O O O
head O O O O
domain O O O O
and O O O O
the O O O O
NH O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
dimeric O O O O
intrachain O O O O
coiled O O O O
- O O O O
coil O O O O
alpha O O O O
- O O O O
helices O O O O
stemming O O O O
from O O O O
the O O O O
stalk O O O O
. O O O O
    
This O O O O
raises O O O O
the O O O O
importance O O O O
of O O O O
different O O O O
modules O O O O
within O O O O
the O O O O
predicted O O O O
NadA O O O O
structure O O O O
. O O O O
    
The O O O O
identification O O O O
of O O O O
linear O O O O
epitopes O O O O
involved O O O O
in O O O O
receptor O O O O
binding O O O O
that O O O O
are O O O O
able O O O O
to O O O O
induce O O O O
interfering O O O O
antibodies O O O O
reinforces O O O O
the O O O O
importance O O O O
of O O O O
NadA O O O O
as O O O O
a O O O O
vaccine O O O O
antigen O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Burkholderia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cenocepacia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
LysR O O O O
- O O O O
type O O O O
transcriptional O O O O
regulator O O O O
ShvR O O O O
influences O O O O
expression O O O O
of O O O O
quorum O O O O
- O O O O
sensing O O O O
, O O O O
protease O O O O
, O O O O
type O O O O
II O O O O
secretion O O O O
, O O O O
and O O O O
afc O O O O
genes O O O O
. O O O O
    
Burkholderia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cenocepacia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
a O O O O
significant O O O O
opportunistic O O O O
pathogen O O O O
in O O O O
individuals O O O O
with O O O O
cystic O O O O
fibrosis O O O O
. O O O O
    
ShvR O O O O
, O O O O
a O O O O
LysR O O O O
- O O O O
type O O O O
transcriptional O O O O
regulator O O O O
, O O O O
has O O O O
previously O O O O
been O O O O
shown O O O O
to O O O O
influence O O O O
colony O O O O
morphology O O O O
, O O O O
biofilm O O O O
formation O O O O
, O O O O
virulence O O O O
in O O O O
plant O O O O
and O O O O
animal O O O O
infection O O O O
models O O O O
, O O O O
and O O O O
some O O O O
quorum O O O O
- O O O O
sensing O O O O
- O O O O
dependent O O O O
phenotypes O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
present O O O O
study O O O O
, O O O O
it O O O O
was O O O O
shown O O O O
that O O O O
ShvR O O O O
negatively O O O O
regulates O O O O
its O O O O
own O O O O
expression O O O O
, O O O O
as O O O O
is O O O O
typical O O O O
for O O O O
LysR O O O O
- O O O O
type O O O O
regulators O O O O
. O O O O
    
The O O O O
production O O O O
of O O O O
quorum O O O O
- O O O O
sensing O O O O
signal O O O O
molecules O O O O
was O O O O
detected O O O O
earlier O O O O
in O O O O
growth O O O O
in O O O O
the O O O O
shvR O O O O
mutant O O O O
than O O O O
in O O O O
the O O O O
wild O O O O
type O O O O
, O O O O
and O O O O
ShvR O O O O
repressed O O O O
expression O O O O
of O O O O
the O O O O
quorum O O O O
- O O O O
sensing O O O O
regulatory O O O O
genes O O O O
cepIR O O O O
and O O O O
cciIR O O O O
. O O O O
    
Microarray O O O O
analysis O O O O
and O O O O
transcriptional O O O O
fusions O O O O
revealed O O O O
that O O O O
ShvR O O O O
regulated O O O O
over O O O O
1 O O O O
, O O O O
000 O O O O
genes O O O O
, O O O O
including O O O O
the O O O O
zinc O O O O
metalloproteases O O O O
zmpA O O O O
and O O O O
zmpB O O O O
. O O O O
    
The O O O O
shvR O O O O
mutant O O O O
displayed O O O O
increased O O O O
gene O O O O
expression O O O O
of O O O O
the O O O O
type O O O O
II O O O O
secretion O O O O
system O O O O
and O O O O
significantly O O O O
increased O O O O
protease O O O O
and O O O O
lipase O O O O
activities O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
ShvR O O O O
and O O O O
CepR O O O O
influence O O O O
expression O O O O
of O O O O
a O O O O
24 O O O O
- O O O O
kb O O O O
genomic O O O O
region O O O O
adjacent O O O O
to O O O O
shvR O O O O
that O O O O
includes O O O O
the O O O O
afcA O O O O
and O O O O
afcC O O O O
operons O O O O
, O O O O
required O O O O
for O O O O
the O O O O
production O O O O
of O O O O
an O O O O
antifungal O O O O
agent O O O O
; O O O O
however O O O O
, O O O O
the O O O O
reduction O O O O
in O O O O
expression O O O O
was O O O O
substantially O O O O
greater O O O O
in O O O O
the O O O O
shvR O O O O
mutant O O O O
than O O O O
in O O O O
the O O O O
cepR O O O O
mutant O O O O
. O O O O
    
Only O O O O
the O O O O
shvR O O O O
mutation O O O O
resulted O O O O
in O O O O
reduced O O O O
antifungal O O O O
activity O O O O
against O O O O
Rhizoctonia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
solani O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
ShvR O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
CepR O O O O
, O O O O
was O O O O
shown O O O O
to O O O O
directly O O O O
regulate O O O O
expression O O O O
of O O O O
the O O O O
afcA O O O O
and O O O O
afcC O O O O
promoters O O O O
. O O O O
    
In O O O O
summary O O O O
, O O O O
ShvR O O O O
was O O O O
determined O O O O
to O O O O
have O O O O
a O O O O
significant O O O O
influence O O O O
on O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
quorum O O O O
- O O O O
sensing O O O O
, O O O O
protease O O O O
, O O O O
lipase O O O O
, O O O O
type O O O O
II O O O O
secretion O O O O
, O O O O
and O O O O
afc O O O O
genes O O O O
. O O O O
    
Functional O O O O
analysis O O O O
of O O O O
molybdopterin O O O O
biosynthesis O O O O
in O O O O
mycobacteria O O O O
identifies O O O O
a O O O O
fused O O O O
molybdopterin O O O O
synthase O O O O
in O O O O
Mycobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tuberculosis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Most O O O O
mycobacterial O O O O
species O O O O
possess O O O O
a O O O O
full O O O O
complement O O O O
of O O O O
genes O O O O
for O O O O
the O O O O
biosynthesis O O O O
of O O O O
molybdenum O O O O
cofactor O O O O
( O O O O
MoCo O O O O
) O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
a O O O O
distinguishing O O O O
feature O O O O
of O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
Mycobacterium O O O O
tuberculosis O O O O
complex O O O O
is O O O O
their O O O O
possession O O O O
of O O O O
multiple O O O O
homologs O O O O
associated O O O O
with O O O O
the O O O O
first O O O O
two O O O O
steps O O O O
of O O O O
the O O O O
MoCo O O O O
biosynthetic O O O O
pathway O O O O
. O O O O
    
A O O O O
mutant O O O O
of O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tuberculosis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
lacking O O O O
the O O O O
moaA1 O O O O
- O O O O
moaD1 O O O O
gene O O O O
cluster O O O O
and O O O O
a O O O O
derivative O O O O
in O O O O
which O O O O
moaD2 O O O O
was O O O O
also O O O O
deleted O O O O
were O O O O
significantly O O O O
impaired O O O O
for O O O O
growth O O O O
in O O O O
media O O O O
containing O O O O
nitrate O O O O
as O O O O
a O O O O
sole O O O O
nitrogen O O O O
source O O O O
, O O O O
indicating O O O O
a O O O O
reduced O O O O
availability O O O O
of O O O O
MoCo O O O O
to O O O O
support O O O O
the O O O O
assimilatory O O O O
function O O O O
of O O O O
the O O O O
MoCo O O O O
- O O O O
dependent O O O O
nitrate O O O O
reductase O O O O
, O O O O
NarGHI O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
double O O O O
mutant O O O O
displayed O O O O
residual O O O O
respiratory O O O O
nitrate O O O O
reductase O O O O
activity O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
it O O O O
retains O O O O
the O O O O
capacity O O O O
to O O O O
produce O O O O
MoCo O O O O
. O O O O
    
The O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tuberculosis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
moaD O O O O
and O O O O
moaE O O O O
homologs O O O O
were O O O O
further O O O O
analyzed O O O O
by O O O O
expressing O O O O
these O O O O
genes O O O O
in O O O O
mutant O O O O
strains O O O O
of O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
smegmatis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
that O O O O
lacked O O O O
one O O O O
or O O O O
both O O O O
of O O O O
the O O O O
sole O O O O
molybdopterin O O O O
( O O O O
MPT O O O O
) O O O O
synthase O O O O
- O O O O
encoding O O O O
genes O O O O
, O O O O
moaD2 O O O O
and O O O O
moaE2 O O O O
, O O O O
and O O O O
were O O O O
unable O O O O
to O O O O
grow O O O O
on O O O O
nitrate O O O O
, O O O O
presumably O O O O
as O O O O
a O O O O
result O O O O
of O O O O
the O O O O
loss O O O O
of O O O O
MoCo O O O O
- O O O O
dependent O O O O
nitrate O O O O
assimilatory O O O O
activity O O O O
. O O O O
    
Expression O O O O
of O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tuberculosis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
moaD2 O O O O
in O O O O
the O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
smegmatis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
moaD2 O O O O
mutant O O O O
and O O O O
of O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tuberculosis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
moaE1 O O O O
or O O O O
moaE2 O O O O
in O O O O
the O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
smegmatis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
moaE2 O O O O
mutant O O O O
restored O O O O
nitrate O O O O
assimilation O O O O
, O O O O
confirming O O O O
the O O O O
functionality O O O O
of O O O O
these O O O O
genes O O O O
in O O O O
MPT O O O O
synthesis O O O O
. O O O O
    
Expression O O O O
of O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tuberculosis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
moaX O O O O
also O O O O
restored O O O O
MoCo O O O O
biosynthesis O O O O
in O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
smegmatis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
mutants O O O O
lacking O O O O
moaD2 O O O O
, O O O O
moaE2 O O O O
, O O O O
or O O O O
both O O O O
, O O O O
thus O O O O
identifying O O O O
MoaX O O O O
as O O O O
a O O O O
fused O O O O
MPT O O O O
synthase O O O O
. O O O O
    
By O O O O
implicating O O O O
multiple O O O O
synthase O O O O
- O O O O
encoding O O O O
homologs O O O O
in O O O O
MoCo O O O O
biosynthesis O O O O
, O O O O
these O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
important O O O O
cellular O O O O
functions O O O O
may O O O O
be O O O O
served O O O O
by O O O O
their O O O O
expansion O O O O
in O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tuberculosis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Plantazolicin O O O O
, O O O O
a O O O O
novel O O O O
microcin O O O O
B17 O O O O
/ O O O O
streptolysin O O O O
S O O O O
- O O O O
like O O O O
natural O O O O
product O O O O
from O O O O
Bacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
amyloliquefaciens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
FZB42 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
report O O O O
on O O O O
a O O O O
novel O O O O
thiazole O O O O
/ O O O O
oxazole O O O O
- O O O O
modified O O O O
microcin O O O O
( O O O O
TOMM O O O O
) O O O O
from O O O O
Bacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
amyloliquefaciens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
FZB42 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
a O O O O
Gram O O O O
- O O O O
positive O O O O
soil O O O O
bacterium O O O O
. O O O O
    
This O O O O
organism O O O O
is O O O O
well O O O O
known O O O O
for O O O O
stimulating O O O O
plant O O O O
growth O O O O
and O O O O
biosynthesizing O O O O
complex O O O O
small O O O O
molecules O O O O
that O O O O
suppress O O O O
the O O O O
growth O O O O
of O O O O
bacterial O O O O
and O O O O
fungal O O O O
plant O O O O
pathogens O O O O
. O O O O
    
Like O O O O
microcin O O O O
B17 O O O O
and O O O O
streptolysin O O O O
S O O O O
, O O O O
the O O O O
TOMM O O O O
from O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
amyloliquefaciens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
FZB42 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
undergoes O O O O
extensive O O O O
posttranslational O O O O
modification O O O O
to O O O O
become O O O O
a O O O O
bioactive O O O O
natural O O O O
product O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
data O O O O
show O O O O
that O O O O
the O O O O
modified O O O O
peptide O O O O
bears O O O O
a O O O O
molecular O O O O
mass O O O O
of O O O O
1 O O O O
, O O O O
335 O O O O
Da O O O O
and O O O O
displays O O O O
antibacterial O O O O
activity O O O O
toward O O O O
closely O O O O
related O O O O
Gram O O O O
- O O O O
positive O O O O
bacteria O O O O
. O O O O
    
A O O O O
cluster O O O O
of O O O O
12 O O O O
genes O O O O
that O O O O
covers O O O O
- O O O O
10 O O O O
kb O O O O
is O O O O
essential O O O O
for O O O O
the O O O O
production O O O O
, O O O O
modification O O O O
, O O O O
export O O O O
, O O O O
and O O O O
self O O O O
- O O O O
immunity O O O O
of O O O O
this O O O O
natural O O O O
product O O O O
. O O O O
    
We O O O O
have O O O O
named O O O O
this O O O O
compound O O O O
plantazolicin O O O O
( O O O O
PZN O O O O
) O O O O
, O O O O
based O O O O
on O O O O
the O O O O
association O O O O
of O O O O
several O O O O
producing O O O O
organisms O O O O
with O O O O
plants O O O O
and O O O O
the O O O O
incorporation O O O O
of O O O O
azole O O O O
heterocycles O O O O
, O O O O
which O O O O
derive O O O O
from O O O O
Cys O O O O
, O O O O
Ser O O O O
, O O O O
and O O O O
Thr O O O O
residues O O O O
of O O O O
the O O O O
precursor O O O O
peptide O O O O
. O O O O
    
Mismatch O O O O
repair O O O O
modulation O O O O
of O O O O
MutY O O O O
activity O O O O
drives O O O O
Bacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
subtilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
stationary O O O O
- O O O O
phase O O O O
mutagenesis O O O O
. O O O O
    
Stress O O O O
- O O O O
promoted O O O O
mutations O O O O
that O O O O
occur O O O O
in O O O O
nondividing O O O O
cells O O O O
( O O O O
adaptive O O O O
mutations O O O O
) O O O O
have O O O O
been O O O O
implicated O O O O
strongly O O O O
in O O O O
causing O O O O
genetic O O O O
variability O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
in O O O O
species O O O O
survival O O O O
and O O O O
evolutionary O O O O
processes O O O O
. O O O O
    
Oxidative O O O O
stress O O O O
- O O O O
induced O O O O
DNA O O O O
damage O O O O
has O O O O
been O O O O
associated O O O O
with O O O O
generation O O O O
of O O O O
adaptive O O O O
His O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
and O O O O
Met O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
but O O O O
not O O O O
Leu O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
revertants O O O O
in O O O O
strain B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
Bacillus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
subtilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
YB955 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
hisC952 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
metB5 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
leuC427 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
report O O O O
that O O O O
an O O O O
interplay O O O O
between O O O O
MutY O O O O
and O O O O
MutSL O O O O
( O O O O
mismatch O O O O
repair O O O O
system O O O O
[ O O O O
MMR O O O O
] O O O O
) O O O O
plays O O O O
a O O O O
pivotal O O O O
role O O O O
in O O O O
the O O O O
production O O O O
of O O O O
adaptive O O O O
Leu O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
revertants O O O O
. O O O O
    
Essentially O O O O
, O O O O
the O O O O
genetic O O O O
disruption O O O O
of O O O O
MutY O O O O
dramatically O O O O
reduced O O O O
the O O O O
reversion O O O O
frequency O O O O
to O O O O
the O O O O
leu O O O O
allele O O O O
in O O O O
this O O O O
model O O O O
system O O O O
. O O O O
    
Moreover O O O O
, O O O O
the O O O O
increased O O O O
rate O O O O
of O O O O
adaptive O O O O
Leu O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
revertants O O O O
produced O O O O
by O O O O
a O O O O
MutSL B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
knockout O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
significantly O O O O
diminished O O O O
following O O O O
mutY O O O O
disruption O O O O
. O O O O
    
Interestingly O O O O
, O O O O
although O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
mutY O O O O
took O O O O
place O O O O
during O O O O
growth O O O O
and O O O O
stationary O O O O
phase O O O O
and O O O O
was O O O O
not O O O O
under O O O O
the O O O O
control O O O O
of O O O O
RecA O O O O
, O O O O
PerR O O O O
, O O O O
or O O O O
sigma O O O O
( O O O O
B O O O O
) O O O O
, O O O O
a O O O O
 O O O O
mutation O O O O
in O O O O
the O O O O
mutSL O O O O
operon O O O O
increased O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
mutY O O O O
several O O O O
times O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
in O O O O
starved O O O O
cells O O O O
, O O O O
saturation O O O O
of O O O O
the O O O O
MMR O O O O
system O O O O
may O O O O
induce O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
mutY O O O O
, O O O O
disturbing O O O O
the O O O O
balance O O O O
between O O O O
MutY O O O O
and O O O O
MMR O O O O
proteins O O O O
and O O O O
aiding O O O O
in O O O O
the O O O O
production O O O O
of O O O O
types O O O O
of O O O O
mutations O O O O
detected O O O O
by O O O O
reversion O O O O
to O O O O
leucine O O O O
prototrophy O O O O
. O O O O
    
In O O O O
conclusion O O O O
, O O O O
our O O O O
results O O O O
support O O O O
the O O O O
idea O O O O
that O O O O
MMR O O O O
regulation O O O O
of O O O O
the O O O O
mutagenic O O O O
/ O O O O
antimutagenic O O O O
properties O O O O
of O O O O
MutY O O O O
promotes O O O O
stationary O O O O
- O O O O
phase O O O O
mutagenesis O O O O
in O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
subtilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cells O O O O
. O O O O
    
Mapping O O O O
interactions O O O O
between O O O O
germinants O O O O
and O O O O
Clostridium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
difficile O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
spores O O O O
. O O O O
    
Germination O O O O
of O O O O
Clostridium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
difficile O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
spores O O O O
is O O O O
the O O O O
first O O O O
required O O O O
step O O O O
in O O O O
establishing O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
difficile O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O O O O
associated O O O O
disease O O O O
( O O O O
CDAD O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Taurocholate O O O O
( O O O O
a O O O O
bile O O O O
salt O O O O
) O O O O
and O O O O
glycine O O O O
( O O O O
an O O O O
amino O O O O
acid O O O O
) O O O O
have O O O O
been O O O O
shown O O O O
to O O O O
be O O O O
important O O O O
germinants O O O O
of O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
difficile O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
spores O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
present O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
tested O O O O
a O O O O
series O O O O
of O O O O
glycine O O O O
and O O O O
taurocholate O O O O
analogs O O O O
for O O O O
the O O O O
ability O O O O
to O O O O
induce O O O O
or O O O O
inhibit O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
difficile O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
spore O O O O
germination O O O O
. O O O O
    
Testing O O O O
of O O O O
glycine O O O O
analogs O O O O
revealed O O O O
that O O O O
both O O O O
the O O O O
carboxy O O O O
and O O O O
amino O O O O
groups O O O O
are O O O O
important O O O O
epitopes O O O O
for O O O O
recognition O O O O
and O O O O
that O O O O
the O O O O
glycine O O O O
binding O O O O
site O O O O
can O O O O
accommodate O O O O
compounds O O O O
with O O O O
more O O O O
widely O O O O
separated O O O O
termini O O O O
. O O O O
    
The O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
difficile O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
germination O O O O
machinery O O O O
also O O O O
recognizes O O O O
other O O O O
hydrophobic O O O O
amino O O O O
acids O O O O
. O O O O
    
In O O O O
general O O O O
, O O O O
linear O O O O
alkyl O O O O
side O O O O
chains O O O O
are O O O O
better O O O O
activators O O O O
of O O O O
spore O O O O
germination O O O O
than O O O O
their O O O O
branched O O O O
analogs O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
L O O O O
- O O O O
phenylalanine O O O O
and O O O O
L O O O O
- O O O O
arginine O O O O
are O O O O
also O O O O
good O O O O
germinants O O O O
and O O O O
are O O O O
probably O O O O
recognized O O O O
by O O O O
distinct O O O O
binding O O O O
sites O O O O
. O O O O
    
Testing O O O O
of O O O O
taurocholate O O O O
analogs O O O O
revealed O O O O
that O O O O
the O O O O
12 O O O O
- O O O O
hydroxyl O O O O
group O O O O
of O O O O
taurocholate O O O O
is O O O O
necessary O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
sufficient O O O O
, O O O O
to O O O O
activate O O O O
spore O O O O
germination O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
, O O O O
the O O O O
6 O O O O
- O O O O
and O O O O
7 O O O O
- O O O O
hydroxyl O O O O
groups O O O O
are O O O O
required O O O O
for O O O O
inhibition O O O O
of O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
difficile O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
spore O O O O
germination O O O O
. O O O O
    
Similarly O O O O
, O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
difficile O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
spores O O O O
are O O O O
able O O O O
to O O O O
detect O O O O
taurocholate O O O O
analogs O O O O
with O O O O
shorter O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
longer O O O O
, O O O O
alkyl O O O O
amino O O O O
sulfonic O O O O
acid O O O O
side O O O O
chains O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
the O O O O
sulfonic O O O O
acid O O O O
group O O O O
can O O O O
be O O O O
partially O O O O
substituted O O O O
with O O O O
other O O O O
acidic O O O O
groups O O O O
. O O O O
    
Finally O O O O
, O O O O
a O O O O
taurocholate O O O O
analog O O O O
with O O O O
an O O O O
m O O O O
- O O O O
aminobenzenesulfonic O O O O
acid O O O O
side O O O O
chain O O O O
is O O O O
a O O O O
strong O O O O
inhibitor O O O O
of O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
difficile O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
spore O O O O
germination O O O O
. O O O O
    
In O O O O
conclusion O O O O
, O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
difficile O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
spores O O O O
recognize O O O O
both O O O O
amino O O O O
acids O O O O
and O O O O
taurocholate O O O O
through O O O O
multiple O O O O
interactions O O O O
that O O O O
are O O O O
required O O O O
to O O O O
bind O O O O
the O O O O
germinants O O O O
and O O O O
/ O O O O
or O O O O
activate O O O O
the O O O O
germination O O O O
machinery O O O O
. O O O O
    
In O O O O
vitro O O O O
studies O O O O
of O O O O
peptidoglycan O O O O
binding O O O O
and O O O O
hydrolysis O O O O
by O O O O
the O O O O
Bacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
anthracis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
germination O O O O
- O O O O
specific O O O O
lytic O O O O
enzyme O O O O
SleB O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Bacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
anthracis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
endospore O O O O
loses O O O O
resistance O O O O
properties O O O O
during O O O O
germination O O O O
when O O O O
its O O O O
cortex O O O O
peptidoglycan O O O O
is O O O O
degraded O O O O
by O O O O
germination O O O O
- O O O O
specific O O O O
lytic O O O O
enzymes O O O O
( O O O O
GSLEs O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
this O O O O
event O O O O
normally O O O O
employs O O O O
several O O O O
GSLEs O O O O
for O O O O
complete O O O O
cortex O O O O
removal O O O O
, O O O O
the O O O O
SleB O O O O
protein O O O O
alone O O O O
can O O O O
facilitate O O O O
enough O O O O
cortex O O O O
hydrolysis O O O O
to O O O O
produce O O O O
vulnerable O O O O
spores O O O O
. O O O O
    
As O O O O
a O O O O
means O O O O
to O O O O
better O O O O
understand O O O O
its O O O O
enzymatic O O O O
function O O O O
, O O O O
SleB O O O O
was O O O O
overexpressed O O O O
, O O O O
purified O O O O
, O O O O
and O O O O
tested O O O O
in O O O O
vitro O O O O
for O O O O
depolymerization O O O O
of O O O O
cortex O O O O
by O O O O
measurement O O O O
of O O O O
optical O O O O
density O O O O
loss O O O O
and O O O O
the O O O O
solubilization O O O O
of O O O O
substrate O O O O
. O O O O
    
Its O O O O
ability O O O O
to O O O O
bind O O O O
peptidoglycan O O O O
was O O O O
also O O O O
investigated O O O O
. O O O O
    
SleB O O O O
functions O O O O
independently O O O O
as O O O O
a O O O O
lytic O O O O
transglycosylase O O O O
on O O O O
both O O O O
intact O O O O
and O O O O
fragmented O O O O
cortex O O O O
. O O O O
    
Most O O O O
of O O O O
the O O O O
muropeptide O O O O
products O O O O
that O O O O
SleB O O O O
generates O O O O
are O O O O
large O O O O
and O O O O
are O O O O
potential O O O O
substrates O O O O
for O O O O
other O O O O
GSLEs O O O O
present O O O O
in O O O O
the O O O O
spore O O O O
. O O O O
    
Study O O O O
of O O O O
a O O O O
truncated O O O O
protein O O O O
revealed O O O O
that O O O O
SleB O O O O
has O O O O
two O O O O
domains O O O O
. O O O O
    
The O O O O
N O O O O
- O O O O
terminal O O O O
domain O O O O
is O O O O
required O O O O
for O O O O
stable O O O O
peptidoglycan O O O O
binding O O O O
, O O O O
while O O O O
the O O O O
C O O O O
- O O O O
terminal O O O O
domain O O O O
is O O O O
the O O O O
region O O O O
of O O O O
peptidoglycan O O O O
hydrolytic O O O O
activity O O O O
. O O O O
    
The O O O O
C O O O O
- O O O O
terminal O O O O
domain O O O O
also O O O O
exhibits O O O O
dependence O O O O
on O O O O
cortex O O O O
containing O O O O
muramic O O O O
- O O O O
delta O O O O
- O O O O
lactam O O O O
in O O O O
order O O O O
to O O O O
carry O O O O
out O O O O
hydrolysis O O O O
. O O O O
    
As O O O O
the O O O O
conditions O O O O
and O O O O
limitations O O O O
for O O O O
SleB O O O O
activity O O O O
are O O O O
further O O O O
elucidated O O O O
, O O O O
they O O O O
will O O O O
enable O O O O
the O O O O
development O O O O
of O O O O
treatments O O O O
that O O O O
stimulate O O O O
premature O O O O
germination O O O O
of O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
anthracis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
spores O O O O
, O O O O
greatly O O O O
simplifying O O O O
decontamination O O O O
measures O O O O
. O O O O
    
Glucose O O O O
- O O O O
dependent O O O O
activation O O O O
of O O O O
Bacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
anthracis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
toxin O O O O
gene O O O O
expression O O O O
and O O O O
virulence O O O O
requires O O O O
the O O O O
carbon O O O O
catabolite O O O O
protein O O O O
CcpA O O O O
. O O O O
    
Sensing O O O O
environmental O O O O
conditions O O O O
is O O O O
an O O O O
essential O O O O
aspect O O O O
of O O O O
bacterial O O O O
physiology O O O O
and O O O O
virulence O O O O
. O O O O
    
In O O O O
Bacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
anthracis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
the O O O O
causative O O O O
agent O O O O
of O O O O
anthrax B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
transcription O O O O
of O O O O
the O O O O
two O O O O
major O O O O
virulence O O O O
factors O O O O
, O O O O
toxin O O O O
and O O O O
capsule O O O O
, O O O O
is O O O O
triggered O O O O
by O O O O
bicarbonate O O O O
, O O O O
a O O O O
major O O O O
compound O O O O
in O O O O
the O O O O
mammalian O O O O
body O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
it O O O O
is O O O O
shown O O O O
that O O O O
glucose O O O O
is O O O O
an O O O O
additional O O O O
signaling O O O O
molecule O O O O
recognized O O O O
by O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
anthracis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
for O O O O
toxin O O O O
synthesis O O O O
. O O O O
    
The O O O O
presence O O O O
of O O O O
glucose O O O O
increased O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
the O O O O
protective O O O O
antigen O O O O
toxin O O O O
component O O O O
- O O O O
encoding O O O O
gene O O O O
( O O O O
pagA O O O O
) O O O O
by O O O O
stimulating O O O O
induction O O O O
of O O O O
transcription O O O O
of O O O O
the O O O O
AtxA O O O O
virulence O O O O
transcription O O O O
factor O O O O
. O O O O
    
Induction O O O O
of O O O O
atxA O O O O
transcription O O O O
by O O O O
glucose O O O O
required O O O O
the O O O O
carbon O O O O
catabolite O O O O
protein O O O O
CcpA O O O O
via O O O O
an O O O O
indirect O O O O
mechanism O O O O
. O O O O
    
CcpA O O O O
did O O O O
not O O O O
bind O O O O
specifically O O O O
to O O O O
any O O O O
region O O O O
of O O O O
the O O O O
extended O O O O
atxA O O O O
promoter O O O O
. O O O O
    
The O O O O
virulence O O O O
of O O O O
a O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
anthracis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
from O O O O
which O O O O
the O O O O
ccpA O O O O
gene O O O O
was O O O O
deleted O O O O
was O O O O
significantly O O O O
attenuated O O O O
in O O O O
a O O O O
mouse B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
model O O O O
of O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
The O O O O
data O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
glucose O O O O
is O O O O
an O O O O
important O O O O
host O O O O
environment O O O O
- O O O O
derived O O O O
signaling O O O O
molecule O O O O
and O O O O
that O O O O
CcpA O O O O
is O O O O
a O O O O
molecular O O O O
link O O O O
between O O O O
environmental O O O O
sensing O O O O
and O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
anthracis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pathogenesis O O O O
. O O O O
    
Structural O O O O
and O O O O
functional O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
type O O O O
III O O O O
secretion O O O O
system O O O O
from O O O O
Pseudomonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fluorescens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Q8r1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
96 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Pseudomonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fluorescens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Q8r1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
96 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
represents O O O O
a O O O O
group O O O O
of O O O O
rhizosphere O O O O
strains O O O O
responsible O O O O
for O O O O
the O O O O
suppressiveness O O O O
of O O O O
agricultural O O O O
soils O O O O
to O O O O
take O O O O
- O O O O
all O O O O
disease O O O O
of O O O O
wheat O O O O
. O O O O
    
It O O O O
produces O O O O
the O O O O
antibiotic O O O O
2 O O O O
, O O O O
4 O O O O
- O O O O
diacetylphloroglucinol O O O O
and O O O O
aggressively O O O O
colonizes O O O O
the O O O O
roots O O O O
of O O O O
cereal O O O O
crops O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
analyzed O O O O
the O O O O
genome O O O O
of O O O O
Q8r1 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
96 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
identified O O O O
a O O O O
type O O O O
III O O O O
protein O O O O
secretion O O O O
system O O O O
( O O O O
T3SS O O O O
) O O O O
gene O O O O
cluster O O O O
that O O O O
has O O O O
overall O O O O
organization O O O O
similar O O O O
to O O O O
that O O O O
of O O O O
the O O O O
T3SS O O O O
gene O O O O
cluster O O O O
of O O O O
the O O O O
plant O O O O
pathogen O O O O
Pseudomonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
syringae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
screened O O O O
a O O O O
collection O O O O
of O O O O
30 O O O O
closely O O O O
related O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fluorescens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strains O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
detected O O O O
the O O O O
T3SS O O O O
genes O O O O
in O O O O
all O O O O
but O O O O
one O O O O
of O O O O
them O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Q8r1 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
96 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
genome O O O O
contained O O O O
ropAA O O O O
and O O O O
ropM O O O O
type O O O O
III O O O O
effector O O O O
genes O O O O
, O O O O
which O O O O
are O O O O
orthologs O O O O
of O O O O
the O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
syringae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
effector O O O O
genes O O O O
hopAA1 O O O O
- O O O O
1 O O O O
and O O O O
hopM1 O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
a O O O O
novel O O O O
type O O O O
III O O O O
effector O O O O
gene O O O O
designated O O O O
ropB O O O O
. O O O O
    
These O O O O
type O O O O
III O O O O
effector O O O O
genes O O O O
encoded O O O O
proteins O O O O
that O O O O
were O O O O
secreted O O O O
in O O O O
culture O O O O
and O O O O
injected O O O O
into O O O O
plant O O O O
cells O O O O
by O O O O
both O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
syringae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Q8r1 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
96 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T3SSs O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Q8r1 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
96 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T3SS O O O O
was O O O O
expressed O O O O
in O O O O
the O O O O
rhizosphere O O O O
, O O O O
but O O O O
mutants O O O O
lacking O O O O
a O O O O
functional O O O O
T3SS O O O O
were O O O O
not O O O O
altered O O O O
in O O O O
their O O O O
rhizosphere O O O O
competence O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Q8r1 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
96 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
type O O O O
III O O O O
effectors O O O O
RopAA O O O O
, O O O O
RopB O O O O
, O O O O
and O O O O
RopM O O O O
were O O O O
capable O O O O
of O O O O
suppressing O O O O
the O O O O
hypersensitive O O O O
response O O O O
and O O O O
production O O O O
of O O O O
reactive O O O O
oxygen O O O O
species O O O O
, O O O O
two O O O O
plant O O O O
immune O O O O
responses O O O O
. O O O O
    
C O O O O
- O O O O
terminal O O O O
domain O O O O
residues O O O O
important O O O O
for O O O O
secretion O O O O
and O O O O
attachment O O O O
of O O O O
RgpB O O O O
in O O O O
Porphyromonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
gingivalis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Porphyromonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
gingivalis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
a O O O O
periodontal O O O O
pathogen O O O O
, O O O O
expresses O O O O
a O O O O
group O O O O
of O O O O
surface O O O O
proteins O O O O
with O O O O
a O O O O
common O O O O
C O O O O
- O O O O
terminal O O O O
domain O O O O
( O O O O
CTD O O O O
) O O O O
that O O O O
are O O O O
exported O O O O
by O O O O
a O O O O
novel O O O O
secretion O O O O
system O O O O
to O O O O
the O O O O
surface O O O O
, O O O O
where O O O O
they O O O O
are O O O O
covalently O O O O
attached O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
RgpB O O O O
as O O O O
a O O O O
model O O O O
CTD O O O O
protein O O O O
, O O O O
we O O O O
have O O O O
produced O O O O
a O O O O
series O O O O
of O O O O
site O O O O
- O O O O
directed O O O O
mutations O O O O
in O O O O
the O O O O
CTD O O O O
sequence O O O O
at O O O O
conserved O O O O
residues O O O O
and O O O O
at O O O O
residues O O O O
that O O O O
may O O O O
be O O O O
modified O O O O
and O O O O
, O O O O
hence O O O O
, O O O O
surface O O O O
attached O O O O
. O O O O
    
The O O O O
mutant O O O O
RgpB O O O O
proteins O O O O
were O O O O
expressed O O O O
in O O O O
a O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gingivalis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
host O O O O
lacking O O O O
functional O O O O
RgpB O O O O
and O O O O
RgpA O O O O
Arg O O O O
- O O O O
specific O O O O
proteases O O O O
. O O O O
    
The O O O O
RgpB O O O O
mutants O O O O
produced O O O O
were O O O O
Y674F O O O O
, O O O O
Y674F O O O O
Y718F O O O O
, O O O O
T675Q O O O O
S679Q O O O O
T682Q O O O O
T684Q O O O O
, O O O O
T693Q O O O O
, O O O O
F695A O O O O
, O O O O
D696A O O O O
, O O O O
N698A O O O O
, O O O O
G699P O O O O
, O O O O
G716P O O O O
, O O O O
T724Q O O O O
, O O O O
T728Q O O O O
T730Q O O O O
, O O O O
and O O O O
K732Q O O O O
and O O O O
a O O O O
protein O O O O
with O O O O
a O O O O
deletion O O O O
of O O O O
residues O O O O
692 O O O O
to O O O O
702 O O O O
( O O O O
Delta692 O O O O
- O O O O
702 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
mutants O O O O
were O O O O
characterized O O O O
for O O O O
cell O O O O
- O O O O
associated O O O O
Arg O O O O
- O O O O
specific O O O O
protease O O O O
activity O O O O
and O O O O
for O O O O
cellular O O O O
distribution O O O O
using O O O O
anti O O O O
- O O O O
Rgp O O O O
antibodies O O O O
and O O O O
Western O O O O
blotting O O O O
of O O O O
culture O O O O
fractions O O O O
. O O O O
    
All O O O O
the O O O O
mutants O O O O
exhibited O O O O
cell O O O O
- O O O O
associated O O O O
Arg O O O O
- O O O O
specific O O O O
activity O O O O
similar O O O O
to O O O O
that O O O O
of O O O O
the O O O O
positive O O O O
control O O O O
except O O O O
for O O O O
the O O O O
D696A O O O O
and O O O O
Delta692 O O O O
- O O O O
702 O O O O
mutants O O O O
. O O O O
    
For O O O O
all O O O O
mutants O O O O
, O O O O
except O O O O
D696A O O O O
and O O O O
Delta692 O O O O
- O O O O
702 O O O O
, O O O O
the O O O O
RgpB O O O O
proteins O O O O
were O O O O
found O O O O
modified O O O O
and O O O O
attached O O O O
to O O O O
the O O O O
cell O O O O
surface O O O O
, O O O O
which O O O O
was O O O O
the O O O O
same O O O O
profile O O O O
found O O O O
in O O O O
the O O O O
positive O O O O
- O O O O
control O O O O
strain O O O O
. O O O O
    
Only O O O O
trace O O O O
amounts O O O O
of O O O O
the O O O O
precursor O O O O
form O O O O
of O O O O
the O O O O
Delta692 O O O O
- O O O O
702 O O O O
mutant O O O O
were O O O O
detected O O O O
in O O O O
the O O O O
outer O O O O
membrane O O O O
, O O O O
with O O O O
none O O O O
detected O O O O
in O O O O
the O O O O
periplasm O O O O
or O O O O
culture O O O O
fluid O O O O
although O O O O
cell O O O O
transcript O O O O
levels O O O O
were O O O O
normal O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
residues O O O O
692 O O O O
to O O O O
702 O O O O
of O O O O
the O O O O
CTD O O O O
, O O O O
in O O O O
particular O O O O
, O O O O
residue O O O O
D696 O O O O
, O O O O
have O O O O
an O O O O
important O O O O
role O O O O
in O O O O
the O O O O
attachment O O O O
of O O O O
RgpB O O O O
at O O O O
the O O O O
cell O O O O
surface O O O O
and O O O O
that O O O O
without O O O O
attachment O O O O
secretion O O O O
does O O O O
not O O O O
occur O O O O
. O O O O
    
Effects O O O O
of O O O O
deficiency O O O O
and O O O O
overdose O O O O
of O O O O
group O O O O
2 O O O O
sigma O O O O
factors O O O O
in O O O O
triple O O O O
inactivation O O O O
strains O O O O
of O O O O
Synechocystis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
PCC O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
6803 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Acclimation O O O O
of O O O O
cyanobacteria O O O O
to O O O O
environmental O O O O
changes O O O O
includes O O O O
major O O O O
changes O O O O
in O O O O
the O O O O
gene O O O O
expression O O O O
patterns O O O O
partly O O O O
orchestrated O O O O
by O O O O
the O O O O
replacement O O O O
of O O O O
a O O O O
particular O O O O
sigma O O O O
subunit O O O O
with O O O O
another O O O O
in O O O O
the O O O O
RNA O O O O
polymerase O O O O
holoenzyme O O O O
. O O O O
    
The O O O O
cyanobacterium O O O O
Synechocystis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
PCC O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
6803 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
encodes O O O O
nine O O O O
sigma O O O O
factors O O O O
, O O O O
all O O O O
belonging O O O O
to O O O O
the O O O O
sigma O O O O
( O O O O
70 O O O O
) O O O O
family O O O O
. O O O O
    
Cyanobacteria O O O O
typically O O O O
encode O O O O
many O O O O
group O O O O
2 O O O O
sigma O O O O
factors O O O O
that O O O O
closely O O O O
resemble O O O O
the O O O O
principal O O O O
sigma O O O O
factor O O O O
. O O O O
    
We O O O O
inactivated O O O O
three O O O O
out O O O O
of O O O O
the O O O O
four O O O O
group O O O O
2 O O O O
sigma O O O O
factors O O O O
of O O O O
Synechocystis O O O O
simultaneously O O O O
in O O O O
all O O O O
possible O O O O
combinations O O O O
and O O O O
found O O O O
that O O O O
all O O O O
triple O O O O
inactivation O O O O
strains O O O O
grow O O O O
well O O O O
under O O O O
standard O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
Unlike O O O O
the O O O O
other O O O O
strains O O O O
, O O O O
the O O O O
DeltasigBCD O O O O
strain O O O O
, O O O O
which O O O O
contains O O O O
SigE O O O O
as O O O O
the O O O O
only O O O O
functional O O O O
group O O O O
2 O O O O
sigma O O O O
factor O O O O
, O O O O
did O O O O
not O O O O
grow O O O O
faster O O O O
under O O O O
mixotrophic O O O O
than O O O O
under O O O O
autotrophic O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
The O O O O
SigB O O O O
and O O O O
SigD O O O O
factors O O O O
were O O O O
important O O O O
in O O O O
low O O O O
- O O O O
temperature O O O O
acclimation O O O O
, O O O O
especially O O O O
under O O O O
diurnal O O O O
light O O O O
rhythm O O O O
. O O O O
    
The O O O O
DeltasigBCD O O O O
, O O O O
DeltasigBCE O O O O
, O O O O
and O O O O
DeltasigBDE O O O O
strains O O O O
were O O O O
sensitive O O O O
to O O O O
high O O O O
- O O O O
light O O O O
- O O O O
induced O O O O
photoinhibition O O O O
, O O O O
indicating O O O O
a O O O O
central O O O O
role O O O O
of O O O O
the O O O O
SigB O O O O
factor O O O O
in O O O O
high O O O O
- O O O O
light O O O O
tolerance O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
the O O O O
DeltasigBCE O O O O
strain O O O O
( O O O O
SigD O O O O
is O O O O
the O O O O
only O O O O
functional O O O O
group O O O O
2 O O O O
sigma O O O O
factor O O O O
) O O O O
appeared O O O O
to O O O O
be O O O O
locked O O O O
in O O O O
the O O O O
high O O O O
- O O O O
fluorescence O O O O
state O O O O
( O O O O
state O O O O
1 O O O O
) O O O O
and O O O O
grew O O O O
slowly O O O O
in O O O O
blue O O O O
but O O O O
not O O O O
in O O O O
orange O O O O
or O O O O
white O O O O
light O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
features O O O O
of O O O O
the O O O O
triple O O O O
inactivation O O O O
strains O O O O
can O O O O
be O O O O
categorized O O O O
as O O O O
( O O O O
i O O O O
) O O O O
direct O O O O
consequences O O O O
of O O O O
the O O O O
inactivation O O O O
of O O O O
a O O O O
particular O O O O
sigma O O O O
factor O O O O
( O O O O
s O O O O
) O O O O
and O O O O
( O O O O
ii O O O O
) O O O O
effects O O O O
resulting O O O O
from O O O O
the O O O O
higher O O O O
probability O O O O
that O O O O
the O O O O
remaining O O O O
group O O O O
2 O O O O
sigma O O O O
factors O O O O
associate O O O O
with O O O O
the O O O O
RNA O O O O
polymerase O O O O
core O O O O
. O O O O
    
A O O O O
combined O O O O
method O O O O
for O O O O
rescue O O O O
of O O O O
modified O O O O
enteroviruses O O O O
by O O O O
mutagenic O O O O
primers O O O O
, O O O O
long O O O O
PCR O O O O
and O O O O
T7 O O O O
RNA O O O O
polymerase O O O O
- O O O O
driven O O O O
in O O O O
vivo O O O O
transcription O O O O
. O O O O
    
The O O O O
current O O O O
methods O O O O
for O O O O
manipulation O O O O
of O O O O
enteroviral O O O O
RNA O O O O
genomes O O O O
and O O O O
production O O O O
of O O O O
modified O O O O
virus O O O O
particles O O O O
include O O O O
stepwise O O O O
subcloning O O O O
procedures O O O O
and O O O O
in O O O O
vitro O O O O
transcription O O O O
and O O O O
RNA O O O O
transfection O O O O
steps O O O O
that O O O O
are O O O O
both O O O O
time O O O O
- O O O O
consuming O O O O
and O O O O
inefficient O O O O
. O O O O
    
Several O O O O
enteroviral O O O O
cDNA O O O O
clones O O O O
with O O O O
5 O O O O
' O O O O
- O O O O
terminal O O O O
T7 O O O O
promoter O O O O
and O O O O
coxsackievirus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A9 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
CAV9 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
PCR O O O O
product O O O O
with O O O O
the O O O O
T7 O O O O
promoter O O O O
were O O O O
transfected O O O O
successfully O O O O
into O O O O
target O O O O
cells O O O O
expressing O O O O
T7 O O O O
RNA O O O O
polymerase O O O O
for O O O O
the O O O O
rescue O O O O
of O O O O
virus O O O O
particles O O O O
. O O O O
    
This O O O O
demonstrated O O O O
the O O O O
overall O O O O
feasibility O O O O
of O O O O
the O O O O
in O O O O
vivo O O O O
transcription O O O O
method O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
a O O O O
rapid O O O O
method O O O O
using O O O O
high O O O O
- O O O O
fidelity O O O O
DNA O O O O
polymerase O O O O
, O O O O
Phusion O O O O
( O O O O
TM O O O O
) O O O O
, O O O O
for O O O O
amplification O O O O
and O O O O
mutagenesis O O O O
of O O O O
CAV9 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cDNA O O O O
was O O O O
generated O O O O
. O O O O
    
A O O O O
long O O O O
PCR O O O O
method O O O O
was O O O O
employed O O O O
together O O O O
with O O O O
mutagenic O O O O
primers O O O O
for O O O O
direct O O O O
introduction O O O O
of O O O O
a O O O O
unique O O O O
restriction O O O O
enzyme O O O O
site O O O O
into O O O O
the O O O O
VP1 O O O O
- O O O O
2A O O O O
junction O O O O
of O O O O
the O O O O
CAV9 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cDNA O O O O
clone O O O O
during O O O O
the O O O O
PCR O O O O
amplification O O O O
process O O O O
. O O O O
    
Enhanced O O O O
green O O O O
fluorescent O O O O
protein O O O O
was O O O O
subcloned O O O O
to O O O O
that O O O O
site O O O O
, O O O O
and O O O O
CAV9 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
eGFP O O O O
cDNA O O O O
was O O O O
transfected O O O O
to O O O O
the O O O O
target O O O O
cells O O O O
for O O O O
in O O O O
vivo O O O O
transcription O O O O
and O O O O
successful O O O O
rescue O O O O
of O O O O
CAV9 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
eGFP O O O O
particles O O O O
. O O O O
    
The O O O O
method O O O O
allowed O O O O
a O O O O
straightforward O O O O
mutagenesis O O O O
and O O O O
in O O O O
vivo O O O O
production O O O O
of O O O O
infectious O O O O
enteroviral O O O O
particles O O O O
, O O O O
and O O O O
may O O O O
be O O O O
applicable O O O O
routinely O O O O
for O O O O
rapid O O O O
production O O O O
of O O O O
the O O O O
modified O O O O
picornaviruses O O O O
over O O O O
the O O O O
use O O O O
of O O O O
the O O O O
traditional O O O O
subcloning O O O O
protocols O O O O
. O O O O
    
A O O O O
novel O O O O
class O O O O
of O O O O
miniature O O O O
inverted O O O O
repeat O O O O
transposable O O O O
elements O O O O
( O O O O
MITEs O O O O
) O O O O
that O O O O
contain O O O O
hitchhiking O O O O
( O O O O
GTCY O O O O
) O O O O
( O O O O
n O O O O
) O O O O
microsatellites O O O O
. O O O O
    
The O O O O
movement O O O O
of O O O O
miniature O O O O
inverted O O O O
repeat O O O O
transposable O O O O
elements O O O O
( O O O O
MITEs O O O O
) O O O O
modifies O O O O
genome O O O O
structure O O O O
and O O O O
function O O O O
. O O O O
    
We O O O O
describe O O O O
the O O O O
microsatellite O O O O
- O O O O
associated O O O O
interspersed O O O O
nuclear O O O O
element O O O O
2 O O O O
( O O O O
MINE O O O O
- O O O O
2 O O O O
) O O O O
, O O O O
that O O O O
integrates O O O O
at O O O O
consensus O O O O
WTTTT O O O O
target O O O O
sites O O O O
, O O O O
creates O O O O
dinucleotide O O O O
TT O O O O
target O O O O
site O O O O
duplications O O O O
( O O O O
TSDs O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
forms O O O O
predicted O O O O
MITE O O O O
- O O O O
like O O O O
secondary O O O O
structures O O O O
; O O O O
a O O O O
5 O O O O
' O O O O
subterminal O O O O
inverted O O O O
repeat O O O O
( O O O O
SIR O O O O
; O O O O
AGGGTTCCGTAG O O O O
) O O O O
that O O O O
is O O O O
partially O O O O
complementary O O O O
to O O O O
a O O O O
5 O O O O
' O O O O
inverted O O O O
repeat O O O O
( O O O O
IR O O O O
; O O O O
ACGAAGCCCT O O O O
) O O O O
and O O O O
3 O O O O
' O O O O
- O O O O
SIRs O O O O
( O O O O
TTACGGAACCCT O O O O
) O O O O
. O O O O
    
A O O O O
( O O O O
GTCY O O O O
) O O O O
( O O O O
n O O O O
) O O O O
microsatellite O O O O
is O O O O
hitchhiking O O O O
downstream O O O O
of O O O O
conserved O O O O
5 O O O O
' O O O O
MINE O O O O
- O O O O
2 O O O O
secondary O O O O
structures O O O O
, O O O O
causing O O O O
flanking O O O O
sequence O O O O
similarity O O O O
amongst O O O O
mobile O O O O
microsatellite O O O O
loci O O O O
. O O O O
    
Transfection O O O O
of O O O O
insect O O O O
cell O O O O
lines O O O O
indicates O O O O
that O O O O
MITE O O O O
- O O O O
like O O O O
secondary O O O O
structures O O O O
are O O O O
sufficient O O O O
to O O O O
mediate O O O O
genome O O O O
integration O O O O
, O O O O
and O O O O
provides O O O O
insight O O O O
into O O O O
the O O O O
transposition O O O O
mechanism O O O O
used O O O O
by O O O O
MINE O O O O
- O O O O
2s O O O O
. O O O O
    
DNA O O O O
modifications O O O O
and O O O O
genome O O O O
rearrangements O O O O
during O O O O
the O O O O
development O O O O
and O O O O
sex O O O O
differentiation O O O O
of O O O O
the O O O O
bumble O O O O
bee O O O O
Bombus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
terrestris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Bombus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
terrestris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
a O O O O
bumble O O O O
bee O O O O
that O O O O
, O O O O
like O O O O
most O O O O
hymenopteran O O O O
species O O O O
, O O O O
exhibits O O O O
ploidy O O O O
- O O O O
specific O O O O
sex O O O O
determination O O O O
controlled O O O O
by O O O O
a O O O O
single O O O O
sex O O O O
gene O O O O
. O O O O
    
Depending O O O O
on O O O O
their O O O O
ploidy O O O O
and O O O O
the O O O O
queen O O O O
pheromone O O O O
repression O O O O
, O O O O
the O O O O
imagoes O O O O
differentiate O O O O
into O O O O
three O O O O
castes O O O O
: O O O O
males O O O O
, O O O O
workers O O O O
and O O O O
queens O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
focus O O O O
on O O O O
the O O O O
differences O O O O
of O O O O
genome O O O O
organization O O O O
that O O O O
occur O O O O
during O O O O
development O O O O
and O O O O
sex O O O O
differentiation O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
that O O O O
cytosine O O O O
methylation O O O O
is O O O O
a O O O O
significant O O O O
epigenetic O O O O
factor O O O O
with O O O O
profiles O O O O
that O O O O
can O O O O
be O O O O
correlated O O O O
with O O O O
both O O O O
processes O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
showed O O O O
that O O O O
two O O O O
kinds O O O O
of O O O O
genomic O O O O
rearrangement O O O O
occur O O O O
. O O O O
    
The O O O O
first O O O O
consists O O O O
of O O O O
important O O O O
DNA O O O O
amplifications O O O O
that O O O O
have O O O O
sequence O O O O
profiles O O O O
that O O O O
differ O O O O
in O O O O
the O O O O
different O O O O
developmental O O O O
instars O O O O
and O O O O
sexes O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
second O O O O
kind O O O O
, O O O O
DNA O O O O
losses O O O O
also O O O O
occur O O O O
, O O O O
at O O O O
least O O O O
involving O O O O
the O O O O
mosaic O O O O
transposable O O O O
element O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
terrestris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
mosaic O O O O
repeat O O O O
1 O O O O
( O O O O
BTMR1 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
A O O O O
vaccinia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
deletion O O O O
mutant O O O O
reveals O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
additional O O O O
inhibitors O O O O
of O O O O
NF O O O O
- O O O O
kappaB O O O O
. O O O O
    
The O O O O
classical O O O O
nuclear O O O O
factor O O O O
kappa O O O O
B O O O O
( O O O O
NF O O O O
- O O O O
kappaB O O O O
) O O O O
signaling O O O O
pathway O O O O
is O O O O
an O O O O
important O O O O
regulator O O O O
of O O O O
inflammation O O O O
and O O O O
innate O O O O
immunity O O O O
that O O O O
is O O O O
activated O O O O
by O O O O
a O O O O
wide O O O O
variety O O O O
of O O O O
stimuli O O O O
, O O O O
including O O O O
virus O O O O
infection O O O O
, O O O O
tumor O O O O
necrosis O O O O
factor O O O O
alpha O O O O
( O O O O
TNF O O O O
- O O O O
alpha O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
interleukin O O O O
1Beta O O O O
( O O O O
IL O O O O
- O O O O
1Beta O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Poxviruses O O O O
, O O O O
including O O O O
vaccinia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
VV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
and O O O O
ectromelia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
encode O O O O
multiple O O O O
proteins O O O O
that O O O O
function O O O O
in O O O O
immune O O O O
evasion O O O O
. O O O O
    
Recently O O O O
, O O O O
a O O O O
growing O O O O
number O O O O
of O O O O
genes O O O O
encoded O O O O
by O O O O
poxviruses O O O O
have O O O O
been O O O O
shown O O O O
to O O O O
target O O O O
and O O O O
disrupt O O O O
the O O O O
NF O O O O
- O O O O
kappaB O O O O
signaling O O O O
pathway O O O O
. O O O O
    
To O O O O
determine O O O O
if O O O O
additional O O O O
gene O O O O
products O O O O
that O O O O
interfere O O O O
with O O O O
NF O O O O
- O O O O
kappaB O O O O
signaling O O O O
existed O O O O
, O O O O
we O O O O
used O O O O
a O O O O
vaccinia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
deletion O O O O
mutant O O O O
, O O O O
VV811 O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
missing O O O O
55 O O O O
open O O O O
reading O O O O
frames O O O O
lacking O O O O
all O O O O
known O O O O
inhibitors O O O O
of O O O O
TNF O O O O
- O O O O
alpha O O O O
- O O O O
induced O O O O
NF O O O O
- O O O O
kappaB O O O O
activation O O O O
. O O O O
    
Immunofluorescence O O O O
analysis O O O O
of O O O O
HeLa O O O O
cells O O O O
treated O O O O
with O O O O
TNF O O O O
- O O O O
alpha O O O O
and O O O O
IL O O O O
- O O O O
1Beta O O O O
revealed O O O O
that O O O O
NF O O O O
- O O O O
kappaB O O O O
translocation O O O O
to O O O O
the O O O O
nucleus O O O O
was O O O O
inhibited O O O O
in O O O O
VV811 O O O O
- O O O O
infected O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
This O O O O
was O O O O
further O O O O
confirmed O O O O
through O O O O
Western O O O O
blotting O O O O
of O O O O
cytoplasmic O O O O
and O O O O
nuclear O O O O
extracts O O O O
for O O O O
NF O O O O
- O O O O
kappaB O O O O
. O O O O
    
Additionally O O O O
, O O O O
VV811 O O O O
infection O O O O
inhibited O O O O
TNF O O O O
- O O O O
alpha O O O O
- O O O O
induced O O O O
IkappaBalpha O O O O
degradation O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
to O O O O
vaccinia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Copenhagen O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
VVCop B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
- O O O O
infected O O O O
cells O O O O
, O O O O
VV811 O O O O
infection O O O O
resulted O O O O
in O O O O
the O O O O
dramatic O O O O
accumulation O O O O
of O O O O
phosphorylated O O O O
IkappaBalpha O O O O
. O O O O
    
Correspondingly O O O O
, O O O O
coimmunoprecipitation O O O O
assays O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
the O O O O
NF O O O O
- O O O O
kappaB O O O O
- O O O O
inhibitory O O O O
IkappaBalpha O O O O
- O O O O
p65 O O O O
- O O O O
p50 O O O O
complex O O O O
was O O O O
intact O O O O
in O O O O
VV811 O O O O
- O O O O
infected O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Significantly O O O O
, O O O O
cells O O O O
treated O O O O
with O O O O
1 O O O O
- O O O O
Beta O O O O
- O O O O
d O O O O
- O O O O
arabinofuranosylcytosine O O O O
, O O O O
an O O O O
inhibitor O O O O
of O O O O
poxvirus O O O O
late O O O O
gene O O O O
expression O O O O
, O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
an O O O O
additional O O O O
vaccinia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
late O O O O
gene O O O O
was O O O O
involved O O O O
in O O O O
the O O O O
stabilization O O O O
of O O O O
IkappaBalpha O O O O
. O O O O
    
Overall O O O O
, O O O O
this O O O O
work O O O O
indicates O O O O
that O O O O
unidentified O O O O
inhibitors O O O O
of O O O O
NF O O O O
- O O O O
kappaB O O O O
exist O O O O
in O O O O
vaccinia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
complex O O O O
inhibition O O O O
of O O O O
NF O O O O
- O O O O
kappaB O O O O
by O O O O
vaccinia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
illustrates O O O O
the O O O O
importance O O O O
of O O O O
NF O O O O
- O O O O
kappaB O O O O
activation O O O O
in O O O O
the O O O O
antiviral O O O O
response O O O O
. O O O O
    
Template O O O O
recognition O O O O
mechanisms O O O O
by O O O O
replicase O O O O
proteins O O O O
differ O O O O
between O O O O
bipartite O O O O
positive O O O O
- O O O O
strand O O O O
genomic O O O O
RNAs O O O O
of O O O O
a O O O O
plant O O O O
virus O O O O
. O O O O
    
Recognition O O O O
of O O O O
RNA O O O O
templates O O O O
by O O O O
viral O O O O
replicase O O O O
proteins O O O O
is O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
key O O O O
steps O O O O
in O O O O
the O O O O
replication O O O O
process O O O O
of O O O O
all O O O O
RNA O O O O
viruses O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
mechanisms O O O O
underlying O O O O
this O O O O
phenomenon O O O O
, O O O O
including O O O O
primary O O O O
RNA O O O O
elements O O O O
that O O O O
are O O O O
recognized O O O O
by O O O O
the O O O O
viral O O O O
replicase O O O O
proteins O O O O
, O O O O
are O O O O
not O O O O
well O O O O
understood O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
used O O O O
aptamer O O O O
pulldown O O O O
assays O O O O
with O O O O
membrane O O O O
fractionation O O O O
and O O O O
protein O O O O
- O O O O
RNA O O O O
coimmunoprecipitation O O O O
in O O O O
a O O O O
cell O O O O
- O O O O
free O O O O
viral O O O O
translation O O O O
/ O O O O
replication O O O O
system O O O O
to O O O O
investigate O O O O
how O O O O
viral O O O O
replicase O O O O
proteins O O O O
recognize O O O O
the O O O O
bipartite O O O O
genomic O O O O
RNAs O O O O
of O O O O
the O O O O
Red B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
clover O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
necrotic O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
mosaic O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
RCNMV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
. O O O O
    
RCNMV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
replicase O O O O
proteins O O O O
bound O O O O
specifically O O O O
to O O O O
a O O O O
Y O O O O
- O O O O
shaped O O O O
RNA O O O O
element O O O O
( O O O O
YRE O O O O
) O O O O
located O O O O
in O O O O
the O O O O
3 O O O O
' O O O O
untranslated O O O O
region O O O O
( O O O O
UTR O O O O
) O O O O
of O O O O
RNA2 O O O O
, O O O O
which O O O O
also O O O O
interacted O O O O
with O O O O
the O O O O
480 O O O O
- O O O O
kDa O O O O
replicase O O O O
complexes O O O O
that O O O O
contain O O O O
viral O O O O
and O O O O
host O O O O
proteins O O O O
. O O O O
    
The O O O O
replicase O O O O
- O O O O
YRE O O O O
interaction O O O O
recruited O O O O
RNA2 O O O O
to O O O O
the O O O O
membrane O O O O
fraction O O O O
. O O O O
    
Conversely O O O O
, O O O O
RNA1 O O O O
fragments O O O O
failed O O O O
to O O O O
interact O O O O
with O O O O
the O O O O
replicase O O O O
proteins O O O O
supplied O O O O
in O O O O
trans O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
of O O O O
protein O O O O
- O O O O
RNA O O O O
coimmunoprecipitation O O O O
assays O O O O
suggest O O O O
that O O O O
RNA1 O O O O
interacts O O O O
with O O O O
the O O O O
replicase O O O O
proteins O O O O
coupled O O O O
with O O O O
their O O O O
translation O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
the O O O O
initial O O O O
template O O O O
recognition O O O O
mechanisms O O O O
employed O O O O
by O O O O
the O O O O
replicase O O O O
differ O O O O
between O O O O
RCNMV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bipartite O O O O
genomic O O O O
RNAs O O O O
and O O O O
RNA O O O O
elements O O O O
are O O O O
primary O O O O
determinants O O O O
of O O O O
the O O O O
differential O O O O
replication O O O O
mechanism O O O O
. O O O O
    
Poliovirus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
RNA O O O O
is O O O O
released O O O O
from O O O O
the O O O O
capsid O O O O
near O O O O
a O O O O
twofold O O O O
symmetry O O O O
axis O O O O
. O O O O
    
After O O O O
recognizing O O O O
and O O O O
binding O O O O
to O O O O
its O O O O
host O O O O
cell O O O O
, O O O O
poliovirus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
like O O O O
other O O O O
nonenveloped O O O O
viruses O O O O
) O O O O
faces O O O O
the O O O O
challenge O O O O
of O O O O
translocating O O O O
its O O O O
genome O O O O
across O O O O
a O O O O
cellular O O O O
membrane O O O O
and O O O O
into O O O O
the O O O O
cytoplasm O O O O
. O O O O
    
To O O O O
avoid O O O O
entanglement O O O O
with O O O O
the O O O O
capsid O O O O
, O O O O
the O O O O
RNA O O O O
must O O O O
exit O O O O
via O O O O
a O O O O
single O O O O
site O O O O
on O O O O
the O O O O
virion O O O O
surface O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
mechanism O O O O
by O O O O
which O O O O
a O O O O
single O O O O
site O O O O
is O O O O
selected O O O O
( O O O O
from O O O O
among O O O O
60 O O O O
equivalents O O O O
) O O O O
is O O O O
unknown O O O O
; O O O O
and O O O O
until O O O O
now O O O O
, O O O O
even O O O O
its O O O O
location O O O O
on O O O O
the O O O O
virion O O O O
surface O O O O
has O O O O
been O O O O
controversial O O O O
. O O O O
    
To O O O O
help O O O O
to O O O O
elucidate O O O O
the O O O O
mechanism O O O O
of O O O O
infection O O O O
, O O O O
we O O O O
have O O O O
used O O O O
single O O O O
- O O O O
particle O O O O
cryo O O O O
- O O O O
electron O O O O
microscopy O O O O
and O O O O
tomography O O O O
to O O O O
reconstruct O O O O
conformationally O O O O
altered O O O O
intermediates O O O O
that O O O O
are O O O O
formed O O O O
by O O O O
the O O O O
poliovirion O O O O
at O O O O
various O O O O
stages O O O O
of O O O O
the O O O O
poliovirus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infection O O O O
process O O O O
. O O O O
    
Recently O O O O
, O O O O
we O O O O
reported O O O O
icosahedrally O O O O
symmetric O O O O
structures O O O O
for O O O O
two O O O O
forms O O O O
of O O O O
the O O O O
end O O O O
- O O O O
state O O O O
80S O O O O
empty O O O O
capsid O O O O
particle O O O O
. O O O O
    
Surprisingly O O O O
, O O O O
RNA O O O O
was O O O O
frequently O O O O
visible O O O O
near O O O O
the O O O O
capsid O O O O
; O O O O
and O O O O
in O O O O
a O O O O
subset O O O O
of O O O O
the O O O O
virions O O O O
, O O O O
RNA O O O O
was O O O O
seen O O O O
on O O O O
both O O O O
the O O O O
inside O O O O
and O O O O
outside O O O O
of O O O O
the O O O O
capsid O O O O
, O O O O
caught O O O O
in O O O O
the O O O O
act O O O O
of O O O O
exiting O O O O
. O O O O
    
To O O O O
visualize O O O O
RNA O O O O
exiting O O O O
, O O O O
we O O O O
have O O O O
now O O O O
determined O O O O
asymmetric O O O O
reconstructions O O O O
from O O O O
that O O O O
subset O O O O
, O O O O
using O O O O
both O O O O
single O O O O
- O O O O
particle O O O O
cryo O O O O
- O O O O
electron O O O O
microscopy O O O O
and O O O O
cryo O O O O
- O O O O
electron O O O O
tomographic O O O O
methods O O O O
, O O O O
producing O O O O
independent O O O O
reconstructions O O O O
at O O O O
- O O O O
50 O O O O
- O O O O
A O O O O
resolution O O O O
. O O O O
    
Contrary O O O O
to O O O O
predictions O O O O
in O O O O
the O O O O
literature O O O O
, O O O O
the O O O O
footprint O O O O
of O O O O
RNA O O O O
on O O O O
the O O O O
capsid O O O O
surface O O O O
is O O O O
located O O O O
close O O O O
to O O O O
a O O O O
viral O O O O
2 O O O O
- O O O O
fold O O O O
axis O O O O
, O O O O
covering O O O O
a O O O O
slot O O O O
- O O O O
shaped O O O O
area O O O O
of O O O O
reduced O O O O
density O O O O
that O O O O
is O O O O
present O O O O
in O O O O
both O O O O
of O O O O
the O O O O
symmetrized O O O O
80S O O O O
reconstructions O O O O
and O O O O
which O O O O
extends O O O O
by O O O O
about O O O O
20 O O O O
A O O O O
away O O O O
from O O O O
the O O O O
2 O O O O
- O O O O
fold O O O O
axis O O O O
toward O O O O
each O O O O
neighboring O O O O
5 O O O O
- O O O O
fold O O O O
axis O O O O
. O O O O
    
Differential O O O O
regulation O O O O
of O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
papillomavirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
type O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
8 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
by O O O O
interferon O O O O
regulatory O O O O
factors O O O O
3 O O O O
and O O O O
7 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
genus O O O O
Beta B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
human O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
papillomavirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
HPV O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
type O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
8 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
associated O O O O
with O O O O
nonmelanoma O O O O
skin O O O O
cancer O O O O
in O O O O
patients O O O O
with O O O O
epidermodysplasia O O O O
verruciformis O O O O
, O O O O
and O O O O
evidence O O O O
for O O O O
its O O O O
protumorigenic O O O O
potential O O O O
in O O O O
the O O O O
general O O O O
population O O O O
increases O O O O
. O O O O
    
To O O O O
date O O O O
, O O O O
strategies O O O O
to O O O O
suppress O O O O
genus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
Beta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
HPV O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
infections O O O O
are O O O O
limited O O O O
. O O O O
    
Interferon O O O O
regulatory O O O O
factors O O O O
IRF O O O O
- O O O O
3 O O O O
and O O O O
IRF O O O O
- O O O O
7 O O O O
play O O O O
key O O O O
roles O O O O
in O O O O
the O O O O
activation O O O O
of O O O O
the O O O O
innate O O O O
immune O O O O
response O O O O
to O O O O
viral O O O O
infections O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
show O O O O
for O O O O
the O O O O
first O O O O
time O O O O
that O O O O
both O O O O
IRF O O O O
- O O O O
3 O O O O
and O O O O
IRF O O O O
- O O O O
7 O O O O
regulate O O O O
transcription O O O O
of O O O O
a O O O O
papillomavirus O O O O
, O O O O
but O O O O
with O O O O
opposing O O O O
effects O O O O
. O O O O
    
IRF O O O O
- O O O O
7 O O O O
, O O O O
expressed O O O O
in O O O O
the O O O O
suprabasal O O O O
layers O O O O
of O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
epidermis O O O O
, O O O O
increased O O O O
HPV8 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
late O O O O
promoter O O O O
activity O O O O
via O O O O
direct O O O O
binding O O O O
to O O O O
viral O O O O
DNA O O O O
. O O O O
    
UV O O O O
- O O O O
B O O O O
light O O O O
- O O O O
induced O O O O
activation O O O O
of O O O O
the O O O O
HPV8 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
promoter O O O O
involved O O O O
IRF O O O O
- O O O O
7 O O O O
as O O O O
a O O O O
downstream O O O O
effector O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
, O O O O
IRF O O O O
- O O O O
3 O O O O
, O O O O
expressed O O O O
in O O O O
all O O O O
layers O O O O
of O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
epidermis O O O O
, O O O O
induced O O O O
strong O O O O
HPV8 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
suppression O O O O
in O O O O
primary O O O O
keratinocytes O O O O
. O O O O
    
IRF O O O O
- O O O O
3 O O O O
- O O O O
mediated O O O O
suppression O O O O
prevailed O O O O
over O O O O
IRF O O O O
- O O O O
7 O O O O
- O O O O
induced O O O O
HPV8 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
transcription O O O O
. O O O O
    
Unlike O O O O
the O O O O
E6 O O O O
oncoprotein O O O O
of O O O O
the O O O O
mucosal O O O O
high O O O O
- O O O O
risk O O O O
HPV16 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
the O O O O
HPV8 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
E6 O O O O
protein O O O O
did O O O O
not O O O O
bind O O O O
to O O O O
IRF O O O O
- O O O O
3 O O O O
and O O O O
only O O O O
weakly O O O O
antagonized O O O O
its O O O O
activity O O O O
. O O O O
    
Strong O O O O
antiviral O O O O
activity O O O O
was O O O O
also O O O O
observed O O O O
, O O O O
when O O O O
keratinocytes O O O O
were O O O O
treated O O O O
with O O O O
potent O O O O
IRF O O O O
- O O O O
3 O O O O
activators O O O O
, O O O O
poly O O O O
( O O O O
I O O O O
: O O O O
C O O O O
) O O O O
or O O O O
RNA O O O O
bearing O O O O
5 O O O O
' O O O O
phosphates O O O O
. O O O O
    
In O O O O
conclusion O O O O
, O O O O
we O O O O
show O O O O
that O O O O
IRF O O O O
- O O O O
3 O O O O
activation O O O O
induces O O O O
a O O O O
state O O O O
of O O O O
cell O O O O
- O O O O
autonomous O O O O
immunity O O O O
against O O O O
HPV O O O O
in O O O O
primary O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
keratinocytes O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
study O O O O
suggests O O O O
that O O O O
local O O O O
application O O O O
of O O O O
IRF O O O O
- O O O O
3 O O O O
- O O O O
activating O O O O
compounds O O O O
might O O O O
constitute O O O O
an O O O O
attractive O O O O
novel O O O O
therapeutic O O O O
strategy O O O O
against O O O O
HPV8 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
associated O O O O
diseases O O O O
, O O O O
particularly O O O O
in O O O O
epidermodysplasia O O O O
verruciformis O O O O
patients O O O O
. O O O O
    
Cytomegalovirus O O O O
microRNA O O O O
expression O O O O
is O O O O
tissue O O O O
specific O O O O
and O O O O
is O O O O
associated O O O O
with O O O O
persistence O O O O
. O O O O
    
MicroRNAs O O O O
( O O O O
miRNAs O O O O
) O O O O
are O O O O
a O O O O
class O O O O
of O O O O
small O O O O
noncoding O O O O
RNAs O O O O
involved O O O O
in O O O O
posttranscriptional O O O O
regulation O O O O
. O O O O
    
miRNAs O O O O
are O O O O
utilized O O O O
in O O O O
organisms O O O O
ranging O O O O
from O O O O
plants O O O O
to O O O O
higher O O O O
mammals O O O O
, O O O O
and O O O O
data O O O O
have O O O O
shown O O O O
that O O O O
DNA O O O O
viruses O O O O
also O O O O
use O O O O
this O O O O
method O O O O
for O O O O
host O O O O
and O O O O
viral O O O O
gene O O O O
regulation O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
report O O O O
the O O O O
sequencing O O O O
of O O O O
the O O O O
small O O O O
RNAs O O O O
in O O O O
rat B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cytomegalovirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
RCMV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
- O O O O
infected O O O O
fibroblasts O O O O
and O O O O
persistently O O O O
infected O O O O
salivary O O O O
glands O O O O
. O O O O
    
We O O O O
identified O O O O
24 O O O O
unique O O O O
miRNAs O O O O
that O O O O
mapped O O O O
to O O O O
hairpin O O O O
structures O O O O
found O O O O
within O O O O
the O O O O
viral O O O O
genome O O O O
. O O O O
    
While O O O O
most O O O O
miRNAs O O O O
were O O O O
detected O O O O
in O O O O
both O O O O
samples O O O O
, O O O O
four O O O O
were O O O O
detected O O O O
exclusively O O O O
in O O O O
the O O O O
infected O O O O
fibroblasts O O O O
and O O O O
two O O O O
were O O O O
specific O O O O
for O O O O
the O O O O
infected O O O O
salivary O O O O
glands O O O O
. O O O O
    
The O O O O
RCMV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
miRNAs O O O O
are O O O O
distributed O O O O
across O O O O
the O O O O
viral O O O O
genome O O O O
on O O O O
both O O O O
the O O O O
positive O O O O
and O O O O
negative O O O O
strands O O O O
, O O O O
with O O O O
clusters O O O O
of O O O O
miRNAs O O O O
at O O O O
a O O O O
number O O O O
of O O O O
locations O O O O
, O O O O
including O O O O
near O O O O
viral O O O O
genes O O O O
r1 O O O O
and O O O O
r111 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
RCMV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
miRNAs O O O O
have O O O O
a O O O O
genomic O O O O
positional O O O O
orientation O O O O
similar O O O O
to O O O O
that O O O O
of O O O O
the O O O O
miRNAs O O O O
described O O O O
for O O O O
mouse B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cytomegalovirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
but O O O O
they O O O O
do O O O O
not O O O O
share O O O O
any O O O O
substantial O O O O
sequence O O O O
conservation O O O O
. O O O O
    
Similar O O O O
to O O O O
other O O O O
reported O O O O
miRNAs O O O O
, O O O O
the O O O O
RCMV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
miRNAs O O O O
had O O O O
considerable O O O O
variation O O O O
at O O O O
their O O O O
3 O O O O
' O O O O
and O O O O
5 O O O O
' O O O O
ends O O O O
. O O O O
    
Interestingly O O O O
, O O O O
we O O O O
found O O O O
a O O O O
number O O O O
of O O O O
specific O O O O
examples O O O O
of O O O O
differential O O O O
isoform O O O O
usage O O O O
between O O O O
the O O O O
fibroblast O O O O
and O O O O
salivary O O O O
gland O O O O
samples O O O O
. O O O O
    
We O O O O
determined O O O O
by O O O O
real O O O O
- O O O O
time O O O O
PCR O O O O
that O O O O
expression O O O O
of O O O O
the O O O O
RCMV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
miRNA O O O O
miR O O O O
- O O O O
r111 O O O O
. O O O O
1 O O O O
- O O O O
2 O O O O
is O O O O
highly O O O O
expressed O O O O
in O O O O
the O O O O
salivary O O O O
glands O O O O
and O O O O
that O O O O
miR O O O O
- O O O O
R87 O O O O
- O O O O
1 O O O O
is O O O O
expressed O O O O
in O O O O
most O O O O
tissues O O O O
during O O O O
the O O O O
acute O O O O
infection O O O O
phase O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
study O O O O
identified O O O O
the O O O O
miRNAs O O O O
expressed O O O O
by O O O O
RCMV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
in O O O O
vitro O O O O
and O O O O
in O O O O
vivo O O O O
and O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
expression O O O O
is O O O O
tissue O O O O
specific O O O O
and O O O O
associated O O O O
with O O O O
a O O O O
stage O O O O
of O O O O
viral O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
Adenovirus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
membrane O O O O
penetration O O O O
activates O O O O
the O O O O
NLRP3 O O O O
inflammasome O O O O
. O O O O
    
Adenovirus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
type O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
5 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Ad5 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
infection O O O O
of O O O O
macrophages O O O O
results O O O O
in O O O O
rapid O O O O
secretion O O O O
of O O O O
interleukin O O O O
- O O O O
1Beta O O O O
( O O O O
IL O O O O
- O O O O
1Beta O O O O
) O O O O
and O O O O
is O O O O
dependent O O O O
on O O O O
the O O O O
inflammasome O O O O
components O O O O
NLRP3 O O O O
and O O O O
ASC O O O O
and O O O O
the O O O O
catalytic O O O O
activity O O O O
of O O O O
caspase O O O O
- O O O O
1 O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
lentivirus O O O O
- O O O O
expressed O O O O
short O O O O
hairpin O O O O
RNA O O O O
( O O O O
shRNA O O O O
) O O O O
and O O O O
competitive O O O O
inhibitors O O O O
, O O O O
we O O O O
show O O O O
that O O O O
Ad O O O O
- O O O O
induced O O O O
IL O O O O
- O O O O
1Beta O O O O
release O O O O
is O O O O
dependent O O O O
upon O O O O
Toll O O O O
- O O O O
like O O O O
receptor O O O O
9 O O O O
( O O O O
TLR9 O O O O
) O O O O
sensing O O O O
of O O O O
the O O O O
Ad5 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
double O O O O
- O O O O
stranded O O O O
DNA O O O O
( O O O O
dsDNA O O O O
) O O O O
genome O O O O
in O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cell O O O O
lines O O O O
and O O O O
primary O O O O
monocyte O O O O
- O O O O
derived O O O O
macrophages O O O O
but O O O O
not O O O O
in O O O O
mouse B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
macrophages O O O O
. O O O O
    
Additionally O O O O
, O O O O
a O O O O
temperature O O O O
- O O O O
sensitive O O O O
mutant O O O O
of O O O O
Ad5 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
unable O O O O
to O O O O
penetrate O O O O
endosomal O O O O
membranes O O O O
, O O O O
ts1 O O O O
, O O O O
is O O O O
unable O O O O
to O O O O
induce O O O O
IL O O O O
- O O O O
1Beta O O O O
release O O O O
in O O O O
TLR2 O O O O
- O O O O
primed O O O O
THP O O O O
- O O O O
1 O O O O
cells O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
penetration O O O O
of O O O O
endosomal O O O O
membranes O O O O
is O O O O
required O O O O
for O O O O
IL O O O O
- O O O O
1Beta O O O O
release O O O O
. O O O O
    
Disruption O O O O
of O O O O
lysosomal O O O O
membranes O O O O
and O O O O
the O O O O
release O O O O
of O O O O
cathepsin O O O O
B O O O O
into O O O O
the O O O O
cytoplasm O O O O
are O O O O
required O O O O
for O O O O
Ad B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
induced O O O O
NLRP3 O O O O
activation O O O O
. O O O O
    
Ad5 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cell O O O O
entry O O O O
also O O O O
induces O O O O
reactive O O O O
oxygen O O O O
species O O O O
( O O O O
ROS O O O O
) O O O O
production O O O O
, O O O O
and O O O O
inhibitors O O O O
of O O O O
ROS O O O O
prevent O O O O
Ad B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
induced O O O O
IL O O O O
- O O O O
1Beta O O O O
release O O O O
. O O O O
    
Ad5 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
activation O O O O
of O O O O
NLRP3 O O O O
also O O O O
induces O O O O
necrotic O O O O
cell O O O O
death O O O O
, O O O O
resulting O O O O
in O O O O
the O O O O
release O O O O
of O O O O
the O O O O
proinflammatory O O O O
molecule O O O O
HMGB1 O O O O
. O O O O
    
This O O O O
work O O O O
further O O O O
defines O O O O
the O O O O
mechanisms O O O O
of O O O O
virally O O O O
induced O O O O
inflammasome O O O O
activation O O O O
. O O O O
    
Function O O O O
of O O O O
the O O O O
small O O O O
hydrophobic O O O O
protein O O O O
of O O O O
J O O O O
paramyxovirus O O O O
. O O O O
    
At O O O O
18 O O O O
, O O O O
954 O O O O
nucleotides O O O O
, O O O O
the O O O O
J O O O O
paramyxovirus O O O O
( O O O O
JPV O O O O
) O O O O
genome O O O O
is O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
largest O O O O
in O O O O
the O O O O
family O O O O
Paramyxoviridae O O O O
, O O O O
consisting O O O O
of O O O O
eight O O O O
genes O O O O
in O O O O
the O O O O
order O O O O
3 O O O O
' O O O O
- O O O O
N O O O O
- O O O O
P O O O O
/ O O O O
V O O O O
/ O O O O
C O O O O
- O O O O
M O O O O
- O O O O
F O O O O
- O O O O
SH O O O O
- O O O O
TM O O O O
- O O O O
G O O O O
- O O O O
L O O O O
- O O O O
5 O O O O
' O O O O
. O O O O
    
To O O O O
study O O O O
the O O O O
function O O O O
of O O O O
novel O O O O
paramyxovirus O O O O
genes O O O O
in O O O O
JPV O O O O
, O O O O
a O O O O
plasmid O O O O
containing O O O O
a O O O O
full O O O O
- O O O O
length O O O O
cDNA O O O O
clone O O O O
of O O O O
the O O O O
genome O O O O
of O O O O
JPV O O O O
was O O O O
constructed O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
the O O O O
function O O O O
of O O O O
the O O O O
small O O O O
hydrophobic O O O O
( O O O O
SH O O O O
) O O O O
protein O O O O
of O O O O
JPV O O O O
was O O O O
examined O O O O
by O O O O
generating O O O O
a O O O O
recombinant O O O O
JPV O O O O
lacking O O O O
the O O O O
coding O O O O
sequence O O O O
of O O O O
the O O O O
SH O O O O
protein O O O O
( O O O O
rJPVDeltaSH O O O O
) O O O O
. O O O O
    
rJPVDeltaSH O O O O
was O O O O
viable O O O O
and O O O O
had O O O O
no O O O O
growth O O O O
defect O O O O
in O O O O
tissue O O O O
culture O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
more O O O O
tumor O O O O
necrosis O O O O
factor O O O O
alpha O O O O
( O O O O
TNF O O O O
- O O O O
alpha O O O O
) O O O O
was O O O O
produced O O O O
during O O O O
rJPVDeltaSH O O O O
infection O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
SH O O O O
plays O O O O
a O O O O
role O O O O
in O O O O
inhibiting O O O O
TNF O O O O
- O O O O
alpha O O O O
production O O O O
. O O O O
    
rJPVDeltaSH O O O O
induced O O O O
more O O O O
apoptosis O O O O
in O O O O
tissue O O O O
culture O O O O
cells O O O O
than O O O O
rJPV O O O O
. O O O O
    
Virus O O O O
- O O O O
induced O O O O
apoptosis O O O O
was O O O O
inhibited O O O O
by O O O O
neutralizing O O O O
antibody O O O O
against O O O O
TNF O O O O
- O O O O
alpha O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
TNF O O O O
- O O O O
alpha O O O O
contributes O O O O
to O O O O
JPV O O O O
- O O O O
induced O O O O
apoptosis O O O O
in O O O O
vitro O O O O
. O O O O
    
The O O O O
expression O O O O
of O O O O
JPV O O O O
SH O O O O
protein O O O O
inhibited O O O O
TNF O O O O
- O O O O
alpha O O O O
- O O O O
induced O O O O
NF O O O O
- O O O O
kappaB O O O O
activation O O O O
in O O O O
a O O O O
reporter O O O O
gene O O O O
assay O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
JPV O O O O
SH O O O O
protein O O O O
can O O O O
inhibit O O O O
TNF O O O O
- O O O O
alpha O O O O
signaling O O O O
in O O O O
vitro O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
infection O O O O
of O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
with O O O O
rJPVDeltaSH O O O O
induced O O O O
more O O O O
TNF O O O O
- O O O O
alpha O O O O
expression O O O O
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
SH O O O O
plays O O O O
a O O O O
role O O O O
in O O O O
blocking O O O O
TNF O O O O
- O O O O
alpha O O O O
expression O O O O
in O O O O
vivo O O O O
. O O O O
    
Successful O O O O
vaccination O O O O
strategies O O O O
that O O O O
protect O O O O
aged O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
from O O O O
lethal O O O O
challenge O O O O
from O O O O
influenza O O O O
virus O O O O
and O O O O
heterologous O O O O
severe B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
acute O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
respiratory O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
syndrome O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
coronavirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Newly O O O O
emerging O O O O
viruses O O O O
often O O O O
circulate O O O O
as O O O O
a O O O O
heterogeneous O O O O
swarm O O O O
in O O O O
wild O O O O
animal O O O O
reservoirs O O O O
prior O O O O
to O O O O
their O O O O
emergence O O O O
in O O O O
humans B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
and O O O O
their O O O O
antigenic O O O O
identities O O O O
are O O O O
often O O O O
unknown O O O O
until O O O O
an O O O O
outbreak O O O O
situation O O O O
. O O O O
    
The O O O O
newly O O O O
emerging O O O O
severe B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
acute O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
respiratory O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
syndrome O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
coronavirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
SARS B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
CoV O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
and O O O O
reemerging O O O O
influenza O O O O
virus O O O O
cause O O O O
disproportionate O O O O
disease O O O O
in O O O O
the O O O O
aged O O O O
, O O O O
who O O O O
are O O O O
also O O O O
notoriously O O O O
difficult O O O O
to O O O O
successfully O O O O
vaccinate O O O O
, O O O O
likely O O O O
due O O O O
to O O O O
immunosenescence O O O O
. O O O O
    
To O O O O
protect O O O O
against O O O O
future O O O O
emerging O O O O
strains O O O O
, O O O O
vaccine O O O O
platforms O O O O
should O O O O
induce O O O O
broad O O O O
cross O O O O
- O O O O
reactive O O O O
immunity O O O O
that O O O O
is O O O O
sufficient O O O O
to O O O O
protect O O O O
from O O O O
homologous O O O O
and O O O O
heterologous O O O O
challenge O O O O
in O O O O
all O O O O
ages O O O O
. O O O O
    
From O O O O
initial O O O O
studies O O O O
, O O O O
we O O O O
hypothesized O O O O
that O O O O
attenuated O O O O
Venezuelan B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
equine O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
encephalitis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
VEE B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
replicon O O O O
particle O O O O
( O O O O
VRP O O O O
) O O O O
vaccine O O O O
glycoproteins O O O O
mediated O O O O
vaccine O O O O
failure O O O O
in O O O O
the O O O O
aged O O O O
. O O O O
    
We O O O O
then O O O O
compared O O O O
the O O O O
efficacies O O O O
of O O O O
vaccines O O O O
bearing O O O O
attenuated O O O O
( O O O O
VRP O O O O
( O O O O
3014 O O O O
) O O O O
) O O O O
or O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
VEE B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
glycoproteins O O O O
( O O O O
VRP O O O O
( O O O O
3000 O O O O
) O O O O
) O O O O
in O O O O
young O O O O
and O O O O
aged O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
within O O O O
novel O O O O
models O O O O
of O O O O
severe O O O O
SARS B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
CoV O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pathogenesis O O O O
. O O O O
    
Aged O O O O
animals O O O O
receiving O O O O
VRP O O O O
( O O O O
3000 O O O O
) O O O O
- O O O O
based O O O O
vaccines O O O O
were O O O O
protected O O O O
from O O O O
SARS B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
CoV O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
disease O O O O
, O O O O
while O O O O
animals O O O O
receiving O O O O
the O O O O
VRP O O O O
( O O O O
3014 O O O O
) O O O O
- O O O O
based O O O O
vaccines O O O O
were O O O O
not O O O O
. O O O O
    
The O O O O
superior O O O O
protection O O O O
for O O O O
the O O O O
aged O O O O
observed O O O O
with O O O O
VRP O O O O
( O O O O
3000 O O O O
) O O O O
- O O O O
based O O O O
vaccines O O O O
was O O O O
confirmed O O O O
in O O O O
a O O O O
lethal O O O O
influenza O O O O
virus O O O O
challenge O O O O
model O O O O
. O O O O
    
While O O O O
the O O O O
VRP O O O O
( O O O O
3000 O O O O
) O O O O
vaccine O O O O
' O O O O
s O O O O
immune O O O O
responses O O O O
in O O O O
the O O O O
aged O O O O
were O O O O
sufficient O O O O
to O O O O
protect O O O O
against O O O O
lethal O O O O
homologous O O O O
and O O O O
heterologous O O O O
challenge O O O O
, O O O O
our O O O O
data O O O O
suggest O O O O
that O O O O
innate O O O O
defects O O O O
within O O O O
the O O O O
VRP O O O O
( O O O O
3014 O O O O
) O O O O
platform O O O O
mediate O O O O
vaccine O O O O
failure O O O O
. O O O O
    
Exploration O O O O
into O O O O
the O O O O
mechanism O O O O
( O O O O
s O O O O
) O O O O
of O O O O
successful O O O O
vaccination O O O O
in O O O O
the O O O O
immunosenescent O O O O
should O O O O
aid O O O O
in O O O O
the O O O O
development O O O O
of O O O O
successful O O O O
vaccine O O O O
strategies O O O O
for O O O O
other O O O O
viral O O O O
diseases O O O O
disproportionately O O O O
affecting O O O O
the O O O O
elderly O O O O
, O O O O
like O O O O
West B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
Nile O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
influenza O O O O
virus O O O O
, O O O O
norovirus O O O O
, O O O O
or O O O O
other O O O O
emerging O O O O
viruses O O O O
of O O O O
the O O O O
future O O O O
. O O O O
    
Reovirus O O O O
infection O O O O
or O O O O
ectopic O O O O
expression O O O O
of O O O O
outer O O O O
capsid O O O O
protein O O O O
micro1 O O O O
induces O O O O
apoptosis O O O O
independently O O O O
of O O O O
the O O O O
cellular O O O O
proapoptotic O O O O
proteins O O O O
Bax O O O O
and O O O O
Bak O O O O
. O O O O
    
Mammalian B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
orthoreoviruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
induce O O O O
apoptosis O O O O
in O O O O
vivo O O O O
and O O O O
in O O O O
vitro O O O O
; O O O O
however O O O O
, O O O O
the O O O O
specific O O O O
mechanism O O O O
by O O O O
which O O O O
apoptosis O O O O
is O O O O
induced O O O O
is O O O O
not O O O O
fully O O O O
understood O O O O
. O O O O
    
Recent O O O O
studies O O O O
have O O O O
indicated O O O O
that O O O O
the O O O O
reovirus O O O O
outer O O O O
capsid O O O O
protein O O O O
mu1 O O O O
is O O O O
the O O O O
primary O O O O
determinant O O O O
of O O O O
reovirus O O O O
- O O O O
induced O O O O
apoptosis O O O O
. O O O O
    
Ectopically O O O O
expressed O O O O
mu1 O O O O
induces O O O O
apoptosis O O O O
and O O O O
localizes O O O O
to O O O O
intracellular O O O O
membranes O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
report O O O O
that O O O O
ectopic O O O O
expression O O O O
of O O O O
mu1 O O O O
activated O O O O
both O O O O
the O O O O
extrinsic O O O O
and O O O O
intrinsic O O O O
apoptotic O O O O
pathways O O O O
with O O O O
activation O O O O
of O O O O
initiator O O O O
caspases O O O O
- O O O O
8 O O O O
and O O O O
- O O O O
9 O O O O
and O O O O
downstream O O O O
effector O O O O
caspase O O O O
- O O O O
3 O O O O
. O O O O
    
Activation O O O O
of O O O O
both O O O O
pathways O O O O
was O O O O
required O O O O
for O O O O
mu1 O O O O
- O O O O
induced O O O O
apoptosis O O O O
, O O O O
as O O O O
specific O O O O
inhibition O O O O
of O O O O
either O O O O
caspase O O O O
- O O O O
8 O O O O
or O O O O
caspase O O O O
- O O O O
9 O O O O
abolished O O O O
downstream O O O O
effector O O O O
caspase O O O O
- O O O O
3 O O O O
activation O O O O
. O O O O
    
Similar O O O O
to O O O O
reovirus O O O O
infection O O O O
, O O O O
ectopic O O O O
expression O O O O
of O O O O
mu1 O O O O
caused O O O O
release O O O O
into O O O O
the O O O O
cytosol O O O O
of O O O O
cytochrome O O O O
c O O O O
and O O O O
smac O O O O
/ O O O O
DIABLO O O O O
from O O O O
the O O O O
mitochondrial O O O O
intermembrane O O O O
space O O O O
. O O O O
    
Pancaspase O O O O
inhibitors O O O O
did O O O O
not O O O O
prevent O O O O
cytochrome O O O O
c O O O O
release O O O O
from O O O O
cells O O O O
expressing O O O O
mu1 O O O O
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
caspases O O O O
were O O O O
not O O O O
required O O O O
. O O O O
    
Additionally O O O O
, O O O O
mu1 O O O O
- O O O O
or O O O O
reovirus O O O O
- O O O O
induced O O O O
release O O O O
of O O O O
cytochrome O O O O
c O O O O
occurred O O O O
efficiently O O O O
in O O O O
Bax O O O O
( O O O O
- O O O O
/ O O O O
- O O O O
) O O O O
Bak O O O O
( O O O O
- O O O O
/ O O O O
- O O O O
) O O O O
mouse B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
embryonic O O O O
fibroblasts O O O O
( O O O O
MEFs O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Finally O O O O
, O O O O
we O O O O
found O O O O
that O O O O
reovirus O O O O
- O O O O
induced O O O O
apoptosis O O O O
occurred O O O O
in O O O O
Bax O O O O
( O O O O
- O O O O
/ O O O O
- O O O O
) O O O O
Bak O O O O
( O O O O
- O O O O
/ O O O O
- O O O O
) O O O O
MEFs O O O O
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
reovirus O O O O
- O O O O
induced O O O O
apoptosis O O O O
occurs O O O O
independently O O O O
of O O O O
the O O O O
proapoptotic O O O O
Bcl O O O O
- O O O O
2 O O O O
family O O O O
members O O O O
Bax O O O O
and O O O O
Bak O O O O
. O O O O
    
Assembly O O O O
and O O O O
immunological O O O O
properties O O O O
of O O O O
Newcastle B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
disease O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O O O O
like O O O O
particles O O O O
containing O O O O
the O O O O
respiratory B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
syncytial O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
F O O O O
and O O O O
G O O O O
proteins O O O O
. O O O O
    
Human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
respiratory O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
syncytial O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
RSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
is O O O O
a O O O O
serious O O O O
respiratory O O O O
pathogen O O O O
in O O O O
infants O O O O
and O O O O
young O O O O
children O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
elderly O O O O
and O O O O
immunocompromised O O O O
populations O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
no O O O O
RSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
vaccines O O O O
are O O O O
available O O O O
. O O O O
    
We O O O O
have O O O O
explored O O O O
the O O O O
potential O O O O
of O O O O
virus O O O O
- O O O O
like O O O O
particles O O O O
( O O O O
VLPs O O O O
) O O O O
as O O O O
an O O O O
RSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
vaccine O O O O
candidate O O O O
. O O O O
    
VLPs O O O O
composed O O O O
entirely O O O O
of O O O O
RSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
proteins O O O O
were O O O O
produced O O O O
at O O O O
levels O O O O
inadequate O O O O
for O O O O
their O O O O
preparation O O O O
as O O O O
immunogens O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
VLPs O O O O
composed O O O O
of O O O O
the O O O O
Newcastle B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
disease O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
NDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
nucleocapsid O O O O
and O O O O
membrane O O O O
proteins O O O O
and O O O O
chimera O O O O
proteins O O O O
containing O O O O
the O O O O
ectodomains O O O O
of O O O O
RSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
F O O O O
and O O O O
G O O O O
proteins O O O O
fused O O O O
to O O O O
the O O O O
transmembrane O O O O
and O O O O
cytoplasmic O O O O
domains O O O O
of O O O O
NDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
F O O O O
and O O O O
HN O O O O
proteins O O O O
, O O O O
respectively O O O O
, O O O O
were O O O O
quantitatively O O O O
prepared O O O O
from O O O O
avian O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Immunization O O O O
of O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
with O O O O
these O O O O
VLPs O O O O
, O O O O
without O O O O
adjuvant O O O O
, O O O O
stimulated O O O O
robust O O O O
, O O O O
anti O O O O
- O O O O
RSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
F O O O O
and O O O O
G O O O O
protein O O O O
antibody O O O O
responses O O O O
. O O O O
    
IgG2a O O O O
/ O O O O
IgG1 O O O O
ratios O O O O
were O O O O
very O O O O
high O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
predominantly O O O O
T O O O O
( O O O O
H O O O O
) O O O O
1 O O O O
responses O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
to O O O O
infectious O O O O
RSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
immunization O O O O
, O O O O
neutralization O O O O
antibody O O O O
titers O O O O
were O O O O
robust O O O O
and O O O O
stable O O O O
for O O O O
4 O O O O
months O O O O
. O O O O
    
Immunization O O O O
with O O O O
a O O O O
single O O O O
dose O O O O
of O O O O
VLPs O O O O
resulted O O O O
in O O O O
the O O O O
complete O O O O
protection O O O O
of O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
from O O O O
RSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
replication O O O O
in O O O O
lungs O O O O
. O O O O
    
Upon O O O O
RSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
intranasal O O O O
challenge O O O O
of O O O O
VLP O O O O
- O O O O
immunized O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
no O O O O
enhanced O O O O
lung O O O O
pathology O O O O
was O O O O
observed O O O O
, O O O O
in O O O O
contrast O O O O
to O O O O
the O O O O
pathology O O O O
observed O O O O
in O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
immunized O O O O
with O O O O
formalin O O O O
- O O O O
inactivated O O O O
RSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
these O O O O
VLPs O O O O
are O O O O
effective O O O O
RSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
vaccines O O O O
in O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
in O O O O
contrast O O O O
to O O O O
other O O O O
nonreplicating O O O O
RSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
vaccine O O O O
candidates O O O O
. O O O O
    
Domain O O O O
structure O O O O
of O O O O
Lassa B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
L O O O O
protein O O O O
. O O O O
    
The O O O O
200 O O O O
- O O O O
kDa O O O O
L O O O O
protein O O O O
of O O O O
arenaviruses O O O O
plays O O O O
a O O O O
central O O O O
role O O O O
in O O O O
viral O O O O
genome O O O O
replication O O O O
and O O O O
transcription O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
aimed O O O O
at O O O O
providing O O O O
evidence O O O O
for O O O O
the O O O O
domain O O O O
structure O O O O
of O O O O
L O O O O
protein O O O O
by O O O O
combining O O O O
bioinformatics O O O O
with O O O O
a O O O O
stepwise O O O O
mutagenesis O O O O
approach O O O O
using O O O O
the O O O O
Lassa B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
minireplicon O O O O
system O O O O
. O O O O
    
Potential O O O O
interdomain O O O O
linkers O O O O
were O O O O
predicted O O O O
using O O O O
various O O O O
algorithms O O O O
. O O O O
    
The O O O O
prediction O O O O
was O O O O
challenged O O O O
by O O O O
insertion O O O O
of O O O O
flexible O O O O
sequences O O O O
into O O O O
the O O O O
predicted O O O O
linkers O O O O
. O O O O
    
Insertion O O O O
of O O O O
5 O O O O
or O O O O
10 O O O O
amino O O O O
acid O O O O
residues O O O O
was O O O O
tolerated O O O O
at O O O O
seven O O O O
sites O O O O
( O O O O
S407 O O O O
, O O O O
G446 O O O O
, O O O O
G467 O O O O
, O O O O
G774 O O O O
, O O O O
G939 O O O O
, O O O O
S1952 O O O O
, O O O O
and O O O O
V2074 O O O O
in O O O O
Lassa B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
AV O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
. O O O O
    
At O O O O
two O O O O
of O O O O
these O O O O
sites O O O O
, O O O O
G467 O O O O
and O O O O
G939 O O O O
, O O O O
L O O O O
protein O O O O
could O O O O
be O O O O
split O O O O
into O O O O
an O O O O
N O O O O
- O O O O
terminal O O O O
and O O O O
a O O O O
C O O O O
- O O O O
terminal O O O O
part O O O O
, O O O O
which O O O O
were O O O O
able O O O O
to O O O O
trans O O O O
- O O O O
complement O O O O
each O O O O
other O O O O
and O O O O
reconstitute O O O O
a O O O O
functional O O O O
complex O O O O
upon O O O O
coexpression O O O O
. O O O O
    
Coimmunoprecipitation O O O O
studies O O O O
revealed O O O O
physical O O O O
interaction O O O O
between O O O O
the O O O O
N O O O O
- O O O O
and O O O O
C O O O O
- O O O O
terminal O O O O
domains O O O O
, O O O O
irrespective O O O O
of O O O O
whether O O O O
L O O O O
protein O O O O
was O O O O
split O O O O
at O O O O
G467 O O O O
or O O O O
G939 O O O O
. O O O O
    
In O O O O
confocal O O O O
immunofluorescence O O O O
microscopy O O O O
, O O O O
the O O O O
N O O O O
- O O O O
terminal O O O O
domains O O O O
showed O O O O
a O O O O
dot O O O O
- O O O O
like O O O O
, O O O O
sometimes O O O O
perinuclear O O O O
, O O O O
cytoplasmic O O O O
distribution O O O O
similar O O O O
to O O O O
that O O O O
of O O O O
full O O O O
- O O O O
length O O O O
L O O O O
protein O O O O
, O O O O
while O O O O
the O O O O
C O O O O
- O O O O
terminal O O O O
domains O O O O
were O O O O
homogenously O O O O
distributed O O O O
in O O O O
cytoplasm O O O O
. O O O O
    
The O O O O
latter O O O O
were O O O O
redistributed O O O O
into O O O O
the O O O O
dot O O O O
- O O O O
like O O O O
structures O O O O
upon O O O O
coexpression O O O O
with O O O O
the O O O O
corresponding O O O O
N O O O O
- O O O O
terminal O O O O
domain O O O O
. O O O O
    
In O O O O
conclusion O O O O
, O O O O
this O O O O
study O O O O
demonstrates O O O O
two O O O O
interdomain O O O O
linkers O O O O
in O O O O
Lassa B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
L O O O O
protein O O O O
, O O O O
at O O O O
G467 O O O O
and O O O O
G939 O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
L O O O O
protein O O O O
is O O O O
composed O O O O
of O O O O
at O O O O
least O O O O
three O O O O
structural O O O O
domains O O O O
spanning O O O O
residues O O O O
1 O O O O
to O O O O
467 O O O O
, O O O O
467 O O O O
to O O O O
939 O O O O
, O O O O
and O O O O
939 O O O O
to O O O O
2220 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
first O O O O
domain O O O O
seems O O O O
to O O O O
mediate O O O O
accumulation O O O O
of O O O O
L O O O O
protein O O O O
into O O O O
cytoplasmic O O O O
dot O O O O
- O O O O
like O O O O
structures O O O O
. O O O O
    
Reverse O O O O
genetics O O O O
generation O O O O
of O O O O
chimeric O O O O
infectious O O O O
Junin O O O O
/ O O O O
Lassa O O O O
virus O O O O
is O O O O
dependent O O O O
on O O O O
interaction O O O O
of O O O O
homologous O O O O
glycoprotein O O O O
stable O O O O
signal O O O O
peptide O O O O
and O O O O
G2 O O O O
cytoplasmic O O O O
domains O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Arenaviridae O O O O
are O O O O
a O O O O
diverse O O O O
and O O O O
globally O O O O
distributed O O O O
collection O O O O
of O O O O
viruses O O O O
that O O O O
are O O O O
maintained O O O O
primarily O O O O
by O O O O
rodent O O O O
reservoirs O O O O
. O O O O
    
Junin B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
JUNV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
and O O O O
Lassa B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
LASV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
can O O O O
both O O O O
cause O O O O
significant O O O O
outbreaks O O O O
of O O O O
severe O O O O
and O O O O
often O O O O
fatal O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
disease O O O O
throughout O O O O
their O O O O
respective O O O O
areas O O O O
of O O O O
endemicity O O O O
. O O O O
    
In O O O O
an O O O O
effort O O O O
to O O O O
improve O O O O
upon O O O O
the O O O O
existing O O O O
live O O O O
attenuated O O O O
JUNV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
Candid1 O O O O
vaccine O O O O
, O O O O
we O O O O
generated O O O O
a O O O O
genetically O O O O
homogenous O O O O
stock O O O O
of O O O O
this O O O O
virus O O O O
from O O O O
cDNA O O O O
copies O O O O
of O O O O
the O O O O
virus O O O O
S O O O O
and O O O O
L O O O O
segments O O O O
by O O O O
using O O O O
a O O O O
reverse O O O O
genetics O O O O
system O O O O
. O O O O
    
Further O O O O
, O O O O
these O O O O
cDNAs O O O O
were O O O O
used O O O O
in O O O O
combination O O O O
with O O O O
LASV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cDNAs O O O O
to O O O O
successfully O O O O
generate O O O O
two O O O O
recombinant O O O O
Candid1 O O O O
JUNV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
/ O O O O
LASV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
chimeric O O O O
viruses O O O O
( O O O O
via O O O O
envelope O O O O
glycoprotein O O O O
[ O O O O
GPC O O O O
] O O O O
exchange O O O O
) O O O O
. O O O O
    
It O O O O
was O O O O
found O O O O
that O O O O
while O O O O
the O O O O
GPC O O O O
extravirion O O O O
domains O O O O
were O O O O
readily O O O O
exchangeable O O O O
, O O O O
homologous O O O O
stable O O O O
signal O O O O
peptide O O O O
( O O O O
SSP O O O O
) O O O O
and O O O O
G2 O O O O
transmembrane O O O O
and O O O O
cytoplasmic O O O O
tail O O O O
domains O O O O
were O O O O
essential O O O O
for O O O O
correct O O O O
GPC O O O O
maturation O O O O
and O O O O
production O O O O
of O O O O
infectious O O O O
chimeric O O O O
viruses O O O O
. O O O O
    
The O O O O
switching O O O O
of O O O O
the O O O O
JUNV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
LASV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
G1 O O O O
/ O O O O
G2 O O O O
ectodomains O O O O
within O O O O
the O O O O
Candid1 O O O O
vaccine O O O O
background O O O O
did O O O O
not O O O O
alter O O O O
the O O O O
attenuated O O O O
phenotype O O O O
of O O O O
the O O O O
vaccine O O O O
strain O O O O
in O O O O
a O O O O
lethal O O O O
mouse B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
model O O O O
. O O O O
    
These O O O O
recombinant O O O O
chimeric O O O O
viruses O O O O
shed O O O O
light O O O O
on O O O O
the O O O O
fundamental O O O O
requirements O O O O
of O O O O
arenavirus O O O O
GPC O O O O
maturation O O O O
and O O O O
may O O O O
serve O O O O
as O O O O
a O O O O
strategy O O O O
for O O O O
the O O O O
development O O O O
of O O O O
bivalent O O O O
JUNV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
LASV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
vaccine O O O O
candidates O O O O
. O O O O
    
B7 O O O O
- O O O O
mediated O O O O
costimulation O O O O
of O O O O
CD4 O O O O
T O O O O
cells O O O O
constrains O O O O
cytomegalovirus O O O O
persistence O O O O
. O O O O
    
Cytomegalovirus O O O O
( O O O O
CMV O O O O
) O O O O
utilizes O O O O
multiple O O O O
strategies O O O O
to O O O O
modulate O O O O
immunity O O O O
and O O O O
promote O O O O
lifelong O O O O
, O O O O
persistent O O O O
/ O O O O
latent O O O O
infection O O O O
, O O O O
including O O O O
suppressing O O O O
T O O O O
cell O O O O
activation O O O O
pathways O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
examined O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
B7 O O O O
costimulatory O O O O
ligands O O O O
in O O O O
establishing O O O O
immune O O O O
detente O O O O
from O O O O
both O O O O
the O O O O
host O O O O
and O O O O
virus O O O O
perspectives O O O O
. O O O O
    
Mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
lacking O O O O
both O O O O
B7 O O O O
. O O O O
1 O O O O
and O O O O
B7 O O O O
. O O O O
2 O O O O
showed O O O O
reduced O O O O
early O O O O
expansion O O O O
of O O O O
CMV O O O O
- O O O O
specific O O O O
CD4 O O O O
T O O O O
cells O O O O
, O O O O
consequently O O O O
allowing O O O O
for O O O O
enhanced O O O O
levels O O O O
of O O O O
persistent O O O O
virus O O O O
replication O O O O
. O O O O
    
In O O O O
turn O O O O
, O O O O
a O O O O
CMV O O O O
mutant O O O O
lacking O O O O
expression O O O O
of O O O O
the O O O O
m138 O O O O
and O O O O
m147 O O O O
. O O O O
5 O O O O
gene O O O O
products O O O O
, O O O O
which O O O O
restrict O O O O
B7 O O O O
. O O O O
1 O O O O
and O O O O
B7 O O O O
. O O O O
2 O O O O
expression O O O O
in O O O O
infected O O O O
antigen O O O O
- O O O O
presenting O O O O
cells O O O O
, O O O O
induced O O O O
a O O O O
more O O O O
robust O O O O
CD4 O O O O
T O O O O
cell O O O O
response O O O O
and O O O O
showed O O O O
decreased O O O O
persistence O O O O
. O O O O
    
Together O O O O
, O O O O
these O O O O
data O O O O
reveal O O O O
a O O O O
requirement O O O O
for O O O O
B7 O O O O
- O O O O
mediated O O O O
signaling O O O O
in O O O O
regulating O O O O
the O O O O
CMV O O O O
- O O O O
specific O O O O
CD4 O O O O
T O O O O
cell O O O O
response O O O O
and O O O O
establishing O O O O
host O O O O
- O O O O
virus O O O O
equilibrium O O O O
. O O O O
    
Upregulation O O O O
of O O O O
CXCL10 O O O O
in O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
dorsal O O O O
root O O O O
ganglia O O O O
during O O O O
experimental O O O O
and O O O O
natural O O O O
varicella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
zoster O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
infection O O O O
. O O O O
    
Varicella O O O O
- O O O O
zoster O O O O
virus O O O O
( O O O O
VZV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
reactivation O O O O
causes O O O O
herpes O O O O
zoster O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
accompanied O O O O
by O O O O
an O O O O
influx O O O O
of O O O O
lymphocytes O O O O
into O O O O
affected O O O O
ganglia O O O O
, O O O O
but O O O O
the O O O O
stimulus O O O O
for O O O O
this O O O O
infiltrate O O O O
is O O O O
not O O O O
known O O O O
. O O O O
    
We O O O O
report O O O O
that O O O O
VZV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infection O O O O
of O O O O
ganglia O O O O
leads O O O O
to O O O O
increased O O O O
CXCL10 O O O O
production O O O O
in O O O O
vitro O O O O
, O O O O
in O O O O
an O O O O
explant O O O O
ganglion O O O O
model O O O O
and O O O O
in O O O O
naturally O O O O
infected O O O O
dorsal O O O O
root O O O O
ganglia O O O O
( O O O O
DRG O O O O
) O O O O
during O O O O
herpes O O O O
zoster O O O O
. O O O O
    
Lymphocytes O O O O
expressing O O O O
the O O O O
receptor O O O O
for O O O O
CXCL10 O O O O
, O O O O
CXCR3 O O O O
, O O O O
were O O O O
also O O O O
observed O O O O
throughout O O O O
naturally O O O O
infected O O O O
ganglia O O O O
during O O O O
herpes O O O O
zoster O O O O
, O O O O
including O O O O
immediately O O O O
adjacent O O O O
to O O O O
neurons O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
identifies O O O O
VZV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
induced O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
CXCL10 O O O O
as O O O O
a O O O O
potential O O O O
driver O O O O
of O O O O
T O O O O
lymphocyte O O O O
recruitment O O O O
into O O O O
DRG O O O O
during O O O O
herpes O O O O
zoster O O O O
. O O O O
    
Persistent O O O O
Friend B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
replication O O O O
and O O O O
disease O O O O
in O O O O
Apobec3 O O O O
- O O O O
deficient O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
expressing O O O O
functional O O O O
B O O O O
- O O O O
cell O O O O
- O O O O
activating O O O O
factor O O O O
receptor O O O O
. O O O O
    
Rfv3 O O O O
is O O O O
an O O O O
autosomal O O O O
dominant O O O O
gene O O O O
that O O O O
influences O O O O
the O O O O
recovery O O O O
of O O O O
resistant O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
from O O O O
Friend B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
retrovirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
FV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
infection O O O O
by O O O O
limiting O O O O
viremia O O O O
and O O O O
promoting O O O O
a O O O O
more O O O O
potent O O O O
neutralizing O O O O
antibody O O O O
response O O O O
. O O O O
    
We O O O O
previously O O O O
reported O O O O
that O O O O
Rfv3 O O O O
is O O O O
encoded O O O O
by O O O O
Apobec3 O O O O
, O O O O
an O O O O
innate O O O O
retrovirus O O O O
restriction O O O O
factor O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
it O O O O
was O O O O
recently O O O O
suggested O O O O
that O O O O
the O O O O
Rfv3 O O O O
susceptible O O O O
phenotype O O O O
of O O O O
high O O O O
viremia O O O O
at O O O O
28 O O O O
days O O O O
postinfection O O O O
( O O O O
dpi O O O O
) O O O O
was O O O O
more O O O O
dominantly O O O O
controlled O O O O
by O O O O
the O O O O
B O O O O
- O O O O
cell O O O O
- O O O O
activating O O O O
factor O O O O
receptor O O O O
( O O O O
BAFF O O O O
- O O O O
R O O O O
) O O O O
, O O O O
a O O O O
gene O O O O
that O O O O
is O O O O
linked O O O O
to O O O O
but O O O O
located O O O O
outside O O O O
the O O O O
genetically O O O O
mapped O O O O
region O O O O
containing O O O O
Rfv3 O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
one O O O O
prototypical O O O O
Rfv3 O O O O
susceptible O O O O
mouse B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
strain O O O O
, O O O O
A O O O O
/ O O O O
WySn O O O O
, O O O O
indeed O O O O
contains O O O O
a O O O O
dysfunctional O O O O
BAFF O O O O
- O O O O
R O O O O
, O O O O
two O O O O
other O O O O
Rfv3 O O O O
susceptible O O O O
strains O O O O
, O O O O
BALB O O O O
/ O O O O
c O O O O
and O O O O
A O O O O
. O O O O
BY O O O O
, O O O O
express O O O O
functional O O O O
BAFF O O O O
- O O O O
R O O O O
genes O O O O
, O O O O
determined O O O O
on O O O O
the O O O O
basis O O O O
of O O O O
genotyping O O O O
and O O O O
B O O O O
- O O O O
cell O O O O
immunophenotyping O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
transcomplementation O O O O
studies O O O O
in O O O O
( O O O O
C57BL O O O O
/ O O O O
6 O O O O
[ O O O O
B6 O O O O
] O O O O
x O O O O
BALB O O O O
/ O O O O
c O O O O
) O O O O
F O O O O
( O O O O
1 O O O O
) O O O O
and O O O O
( O O O O
B6 O O O O
x O O O O
A O O O O
. O O O O
BY O O O O
) O O O O
F O O O O
( O O O O
1 O O O O
) O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
revealed O O O O
that O O O O
the O O O O
B6 O O O O
Apobec3 O O O O
gene O O O O
significantly O O O O
influences O O O O
recovery O O O O
from O O O O
FV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
viremia O O O O
, O O O O
cellular O O O O
infection O O O O
, O O O O
and O O O O
disease O O O O
at O O O O
28 O O O O
dpi O O O O
. O O O O
    
Finally O O O O
, O O O O
the O O O O
Rfv3 O O O O
phenotypes O O O O
of O O O O
prototypic O O O O
B6 O O O O
, O O O O
A O O O O
. O O O O
BY O O O O
, O O O O
A O O O O
/ O O O O
WySn O O O O
, O O O O
and O O O O
BALB O O O O
/ O O O O
c O O O O
mouse B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
strains O O O O
correlate O O O O
with O O O O
reported O O O O
Apobec3 O O O O
mRNA O O O O
expression O O O O
levels O O O O
. O O O O
    
Overall O O O O
, O O O O
these O O O O
findings O O O O
argue O O O O
against O O O O
the O O O O
generality O O O O
of O O O O
BAFF O O O O
- O O O O
R O O O O
polymorphisms O O O O
as O O O O
a O O O O
dominant O O O O
mechanism O O O O
to O O O O
explain O O O O
the O O O O
Rfv3 O O O O
recovery O O O O
phenotype O O O O
and O O O O
further O O O O
strengthen O O O O
the O O O O
evidence O O O O
that O O O O
Apobec3 O O O O
encodes O O O O
Rfv3 O O O O
. O O O O
    
Characterization O O O O
of O O O O
cross O O O O
- O O O O
reactive O O O O
CD8 O O O O
+ O O O O
T O O O O
- O O O O
cell O O O O
recognition O O O O
of O O O O
HLA O O O O
- O O O O
A2 O O O O
- O O O O
restricted O O O O
HIV O O O O
- O O O O
Gag O O O O
( O O O O
SLYNTVATL O O O O
) O O O O
and O O O O
HCV O O O O
- O O O O
NS5b O O O O
( O O O O
ALYDVVSKL O O O O
) O O O O
epitopes O O O O
in O O O O
individuals O O O O
infected O O O O
with O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
immunodeficiency O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
hepatitis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
C O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
viruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
immunologic O O O O
mechanisms O O O O
underlying O O O O
the O O O O
faster O O O O
progression O O O O
of O O O O
hepatitis O O O O
C O O O O
virus O O O O
( O O O O
HCV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
disease O O O O
in O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
immunodeficiency O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
coinfection O O O O
are O O O O
not O O O O
clearly O O O O
understood O O O O
. O O O O
    
T O O O O
- O O O O
cell O O O O
cross O O O O
- O O O O
reactivity O O O O
between O O O O
HCV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
influenza O O O O
virus O O O O
- O O O O
specific O O O O
epitopes O O O O
has O O O O
been O O O O
associated O O O O
with O O O O
rapid O O O O
progression O O O O
of O O O O
HCV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
disease O O O O
( O O O O
S O O O O
. O O O O
Urbani O O O O
, O O O O
B O O O O
. O O O O
Amadei O O O O
, O O O O
P O O O O
. O O O O
Fisicaro O O O O
, O O O O
M O O O O
. O O O O
Pilli O O O O
, O O O O
G O O O O
. O O O O
Missale O O O O
, O O O O
A O O O O
. O O O O
Bertoletti O O O O
, O O O O
and O O O O
C O O O O
. O O O O
Ferrari O O O O
, O O O O
J O O O O
. O O O O
Exp O O O O
. O O O O
Med O O O O
. O O O O
201 O O O O
: O O O O
675 O O O O
- O O O O
680 O O O O
, O O O O
2005 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
We O O O O
asked O O O O
whether O O O O
T O O O O
- O O O O
cell O O O O
cross O O O O
- O O O O
reactivity O O O O
between O O O O
HCV O O O O
and O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
could O O O O
exist O O O O
during O O O O
HCV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
/ O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coinfection O O O O
and O O O O
affect O O O O
pathogenesis O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
search O O O O
for O O O O
amino O O O O
acid O O O O
sequence O O O O
homology O O O O
between O O O O
the O O O O
HCV O O O O
and O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
proteomes O O O O
revealed O O O O
two O O O O
similar O O O O
HLA O O O O
- O O O O
A2 O O O O
- O O O O
restricted O O O O
epitopes O O O O
, O O O O
HIV O O O O
- O O O O
Gag O O O O
( O O O O
SLYNTVATL O O O O
[ O O O O
HIV O O O O
- O O O O
SL9 O O O O
] O O O O
) O O O O
and O O O O
HCV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
NS5b O O O O
( O O O O
ALYDVVSKL O O O O
[ O O O O
HCV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
AL9 O O O O
] O O O O
) O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
that O O O O
4 O O O O
out O O O O
of O O O O
20 O O O O
HLA O O O O
- O O O O
A2 O O O O
- O O O O
positive O O O O
( O O O O
HLA O O O O
- O O O O
A2 O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
) O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
infected O O O O
individuals O O O O
had O O O O
CD8 O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
T O O O O
cells O O O O
that O O O O
recognized O O O O
both O O O O
the O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
SL9 O O O O
and O O O O
HCV O O O O
- O O O O
AL9 O O O O
epitopes O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
AL9 O O O O
epitope O O O O
was O O O O
generally O O O O
shown O O O O
to O O O O
be O O O O
a O O O O
weak O O O O
agonist O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
HCV O O O O
- O O O O
monoinfected O O O O
individuals O O O O
in O O O O
our O O O O
study O O O O
did O O O O
not O O O O
show O O O O
AL9 O O O O
- O O O O
specific O O O O
responses O O O O
, O O O O
we O O O O
found O O O O
that O O O O
about O O O O
half O O O O
of O O O O
HCV O O O O
/ O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
coinfected O O O O
individuals O O O O
had O O O O
dual O O O O
responses O O O O
to O O O O
both O O O O
epitopes O O O O
. O O O O
    
High O O O O
dual O O O O
T O O O O
- O O O O
cell O O O O
recognition O O O O
among O O O O
coinfected O O O O
subjects O O O O
was O O O O
usually O O O O
due O O O O
to O O O O
separate O O O O
T O O O O
- O O O O
cell O O O O
populations O O O O
targeting O O O O
each O O O O
epitope O O O O
, O O O O
as O O O O
determined O O O O
by O O O O
pentamer O O O O
staining O O O O
. O O O O
    
The O O O O
one O O O O
individual O O O O
demonstrating O O O O
cross O O O O
- O O O O
reactive O O O O
T O O O O
cells O O O O
to O O O O
both O O O O
epitopes O O O O
showed O O O O
the O O O O
most O O O O
advanced O O O O
degree O O O O
of O O O O
liver O O O O
disease O O O O
. O O O O
    
In O O O O
coinfected O O O O
individuals O O O O
, O O O O
we O O O O
observed O O O O
a O O O O
positive O O O O
correlation O O O O
between O O O O
the O O O O
magnitudes O O O O
of O O O O
T O O O O
- O O O O
cell O O O O
responses O O O O
to O O O O
both O O O O
the O O O O
SL9 O O O O
and O O O O
the O O O O
AL9 O O O O
epitopes O O O O
, O O O O
which O O O O
was O O O O
also O O O O
positively O O O O
associated O O O O
with O O O O
the O O O O
clinical O O O O
parameter O O O O
of O O O O
liver O O O O
damage O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
we O O O O
find O O O O
that O O O O
HIV O O O O
infection O O O O
induces O O O O
T O O O O
cells O O O O
that O O O O
can O O O O
cross O O O O
- O O O O
react O O O O
to O O O O
heterologous O O O O
viruses O O O O
or O O O O
prime O O O O
for O O O O
T O O O O
cells O O O O
that O O O O
are O O O O
closely O O O O
related O O O O
in O O O O
sequence O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
induction O O O O
of O O O O
cross O O O O
- O O O O
reactive O O O O
T O O O O
cells O O O O
may O O O O
not O O O O
be O O O O
associated O O O O
with O O O O
control O O O O
of O O O O
disease O O O O
caused O O O O
by O O O O
the O O O O
heterologous O O O O
virus O O O O
. O O O O
    
This O O O O
demonstrates O O O O
that O O O O
degeneracy O O O O
of O O O O
HIV O O O O
- O O O O
specific O O O O
T O O O O
cells O O O O
may O O O O
play O O O O
a O O O O
role O O O O
in O O O O
the O O O O
immunopathology O O O O
of O O O O
HCV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
/ O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coinfection O O O O
. O O O O
    
T O O O O
cell O O O O
- O O O O
mediated O O O O
protection O O O O
against O O O O
lethal B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
2009 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pandemic O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H1N1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
influenza O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
infection O O O O
in O O O O
a O O O O
mouse O O O O
model O O O O
. O O O O
    
Genetic O O O O
mutation O O O O
and O O O O
reassortment O O O O
of O O O O
influenza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gene O O O O
segments O O O O
, O O O O
in O O O O
particular O O O O
those O O O O
of O O O O
hemagglutinin O O O O
( O O O O
HA O O O O
) O O O O
and O O O O
neuraminidase O O O O
( O O O O
 O O O O
) O O O O
, O O O O
that O O O O
lead O O O O
to O O O O
antigenic O O O O
drift O O O O
and O O O O
shift O O O O
are O O O O
the O O O O
major O O O O
strategies O O O O
for O O O O
influenza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
to O O O O
escape O O O O
preexisting O O O O
immunity O O O O
. O O O O
    
The O O O O
most O O O O
recent O O O O
example O O O O
of O O O O
such O O O O
phenomena O O O O
is O O O O
the O O O O
first O O O O
pandemic O O O O
of O O O O
H1N1 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
influenza O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
of O O O O
the O O O O
21st O O O O
century O O O O
, O O O O
which O O O O
started O O O O
in O O O O
2009 O O O O
. O O O O
    
Cross O O O O
- O O O O
reactive O O O O
antibodies O O O O
raised O O O O
against O O O O
H1N1 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
viruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
circulating O O O O
before O O O O
1930 O O O O
show O O O O
protective O O O O
activity O O O O
against O O O O
the O O O O
2009 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pandemic O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Cross O O O O
- O O O O
reactive O O O O
T O O O O
- O O O O
cell O O O O
responses O O O O
can O O O O
also O O O O
contribute O O O O
to O O O O
protection O O O O
, O O O O
but O O O O
in O O O O
vivo O O O O
support O O O O
of O O O O
this O O O O
view O O O O
is O O O O
lacking O O O O
. O O O O
    
To O O O O
explore O O O O
the O O O O
protection O O O O
mechanisms O O O O
in O O O O
vivo O O O O
, O O O O
we O O O O
primed O O O O
mice O O O O
with O O O O
H1 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
H3 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
influenza O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
isolates O O O O
and O O O O
rechallenged O O O O
them O O O O
with O O O O
a O O O O
virus O O O O
derived O O O O
from O O O O
the O O O O
2009 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
H1N1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
CA O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
04 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
09 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
named O O O O
CA O O O O
/ O O O O
E3 O O O O
/ O O O O
09 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
that O O O O
priming O O O O
with O O O O
influenza O O O O
viruses O O O O
of O O O O
both O O O O
H1 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
H3 O O O O
homo O O O O
- O O O O
and O O O O
heterosubtypes O O O O
protected O O O O
against O O O O
lethal O O O O
CA O O O O
/ O O O O
E3 O O O O
/ O O O O
09 O O O O
virus O O O O
challenge O O O O
. O O O O
    
Convalescent O O O O
- O O O O
phase O O O O
sera O O O O
from O O O O
these O O O O
primed O O O O
mice O O O O
conferred O O O O
no O O O O
neutralization O O O O
activity O O O O
in O O O O
vitro O O O O
and O O O O
no O O O O
protection O O O O
in O O O O
vivo O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
T O O O O
- O O O O
cell O O O O
depletion O O O O
studies O O O O
suggested O O O O
that O O O O
both O O O O
CD4 O O O O
and O O O O
CD8 O O O O
T O O O O
cells O O O O
contributed O O O O
to O O O O
the O O O O
protection O O O O
. O O O O
    
Taken O O O O
together O O O O
, O O O O
these O O O O
results O O O O
indicate O O O O
that O O O O
cross O O O O
- O O O O
reactive O O O O
T O O O O
cells O O O O
established O O O O
after O O O O
initial O O O O
priming O O O O
with O O O O
distally O O O O
related O O O O
viruses O O O O
can O O O O
be O O O O
a O O O O
vital O O O O
component O O O O
for O O O O
prevention O O O O
of O O O O
disease O O O O
and O O O O
control O O O O
of O O O O
pandemic B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
H1N1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
influenza O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
infection O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
highlight O O O O
the O O O O
importance O O O O
of O O O O
establishing O O O O
cross O O O O
- O O O O
reactive O O O O
T O O O O
- O O O O
cell O O O O
responses O O O O
for O O O O
protecting O O O O
against O O O O
existing O O O O
or O O O O
newly O O O O
emerging O O O O
pandemic O O O O
influenza O O O O
viruses O O O O
. O O O O
    
Association O O O O
of O O O O
TRIM22 O O O O
with O O O O
the O O O O
type O O O O
1 O O O O
interferon O O O O
response O O O O
and O O O O
viral O O O O
control O O O O
during O O O O
primary O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
infection O O O O
. O O O O
    
Type O O O O
1 O O O O
interferons O O O O
( O O O O
IFNs O O O O
) O O O O
induce O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
the O O O O
tripartite O O O O
interaction O O O O
motif O O O O
( O O O O
TRIM O O O O
) O O O O
family O O O O
of O O O O
E3 O O O O
ligases O O O O
, O O O O
but O O O O
the O O O O
contribution O O O O
of O O O O
these O O O O
antiviral O O O O
factors O O O O
to O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pathogenesis O O O O
is O O O O
not O O O O
completely O O O O
understood O O O O
. O O O O
    
We O O O O
hypothesized O O O O
that O O O O
the O O O O
increased O O O O
expression O O O O
of O O O O
select O O O O
type O O O O
1 O O O O
IFN O O O O
and O O O O
TRIM O O O O
isoforms O O O O
is O O O O
associated O O O O
with O O O O
a O O O O
significantly O O O O
lower O O O O
likelihood O O O O
of O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
acquisition O O O O
and O O O O
viral O O O O
control O O O O
during O O O O
primary O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
infection O O O O
. O O O O
    
We O O O O
measured O O O O
IFN O O O O
- O O O O
alpha O O O O
, O O O O
IFN O O O O
- O O O O
Beta O O O O
, O O O O
myxovirus O O O O
resistance O O O O
protein O O O O
A O O O O
( O O O O
MxA O O O O
) O O O O
, O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
TRIM5alpha O O O O
( O O O O
huTRIM5alpha O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
TRIM22 O O O O
mRNA O O O O
levels O O O O
in O O O O
peripheral O O O O
blood O O O O
mononuclear O O O O
cells O O O O
( O O O O
PBMCs O O O O
) O O O O
of O O O O
high O O O O
- O O O O
risk O O O O
, O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O O O O
uninfected O O O O
participants O O O O
and O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O O O O
positive O O O O
study O O O O
participants O O O O
. O O O O
    
Samples O O O O
were O O O O
available O O O O
for O O O O
32 O O O O
uninfected O O O O
subjects O O O O
and O O O O
28 O O O O
infected O O O O
persons O O O O
, O O O O
all O O O O
within O O O O
1 O O O O
year O O O O
of O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O O O O
positive O O O O
participants O O O O
had O O O O
higher O O O O
levels O O O O
of O O O O
IFN O O O O
- O O O O
Beta O O O O
( O O O O
P O O O O
= O O O O
0 O O O O
. O O O O
0005 O O O O
) O O O O
, O O O O
MxA O O O O
( O O O O
P O O O O
= O O O O
0 O O O O
. O O O O
007 O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
TRIM22 O O O O
( O O O O
P O O O O
= O O O O
0 O O O O
. O O O O
01 O O O O
) O O O O
and O O O O
lower O O O O
levels O O O O
of O O O O
huTRIM5alpha O O O O
( O O O O
P O O O O
& O O O O
lt O O O O
; O O O O
0 O O O O
. O O O O
001 O O O O
) O O O O
than O O O O
did O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O O O O
negative O O O O
participants O O O O
. O O O O
    
TRIM22 O O O O
but O O O O
not O O O O
huTRIM5alpha O O O O
correlated O O O O
positively O O O O
with O O O O
type O O O O
1 O O O O
IFN O O O O
( O O O O
IFN O O O O
- O O O O
alpha O O O O
, O O O O
IFN O O O O
- O O O O
Beta O O O O
, O O O O
and O O O O
MxA O O O O
) O O O O
( O O O O
all O O O O
P O O O O
& O O O O
lt O O O O
; O O O O
0 O O O O
. O O O O
0001 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
In O O O O
a O O O O
multivariate O O O O
model O O O O
, O O O O
increased O O O O
MxA O O O O
expression O O O O
showed O O O O
a O O O O
significant O O O O
positive O O O O
association O O O O
with O O O O
viral O O O O
load O O O O
( O O O O
P O O O O
= O O O O
0 O O O O
. O O O O
0418 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
TRIM22 O O O O
but O O O O
not O O O O
huTRIM5alpha O O O O
, O O O O
IFN O O O O
- O O O O
alpha O O O O
, O O O O
IFN O O O O
- O O O O
Beta O O O O
, O O O O
or O O O O
MxA O O O O
showed O O O O
a O O O O
negative O O O O
correlation O O O O
with O O O O
plasma O O O O
viral O O O O
load O O O O
( O O O O
P O O O O
= O O O O
0 O O O O
. O O O O
0307 O O O O
) O O O O
and O O O O
a O O O O
positive O O O O
correlation O O O O
with O O O O
CD4 O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
T O O O O
- O O O O
cell O O O O
counts O O O O
( O O O O
P O O O O
= O O O O
0 O O O O
. O O O O
0281 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
In O O O O
vitro O O O O
studies O O O O
revealed O O O O
that O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infection O O O O
induced O O O O
TRIM22 O O O O
expression O O O O
in O O O O
PBMCs O O O O
obtained O O O O
from O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
negative O O O O
donors O O O O
. O O O O
    
Stable O O O O
TRIM22 O O O O
knockdown O O O O
resulted O O O O
in O O O O
increased O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
particle O O O O
release O O O O
and O O O O
replication O O O O
in O O O O
Jurkat O O O O
reporter O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Collectively O O O O
, O O O O
these O O O O
data O O O O
suggest O O O O
concordance O O O O
between O O O O
type O O O O
1 O O O O
IFN O O O O
and O O O O
TRIM22 O O O O
but O O O O
not O O O O
huTRIM5alpha O O O O
expression O O O O
in O O O O
PBMCs O O O O
and O O O O
that O O O O
TRIM22 O O O O
likely O O O O
acts O O O O
as O O O O
an O O O O
antiviral O O O O
effector O O O O
in O O O O
vivo O O O O
. O O O O
    
Determinants O O O O
that O O O O
specify O O O O
the O O O O
integration O O O O
pattern O O O O
of O O O O
retrotransposon O O O O
Tf1 O O O O
in O O O O
the O O O O
fbp1 O O O O
promoter O O O O
of O O O O
Schizosaccharomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pombe O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Long O O O O
terminal O O O O
repeat O O O O
( O O O O
LTR O O O O
) O O O O
retrotransposons O O O O
are O O O O
closely O O O O
related O O O O
to O O O O
retroviruses O O O O
and O O O O
, O O O O
as O O O O
such O O O O
, O O O O
are O O O O
important O O O O
models O O O O
for O O O O
the O O O O
study O O O O
of O O O O
viral O O O O
integration O O O O
and O O O O
target O O O O
site O O O O
selection O O O O
. O O O O
    
The O O O O
transposon O O O O
Tf1 O O O O
of O O O O
Schizosaccharomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pombe O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
integrates O O O O
with O O O O
a O O O O
strong O O O O
preference O O O O
for O O O O
the O O O O
promoters O O O O
of O O O O
polymerase O O O O
II O O O O
( O O O O
Pol O O O O
II O O O O
) O O O O
- O O O O
transcribed O O O O
genes O O O O
. O O O O
    
Previous O O O O
work O O O O
in O O O O
vivo O O O O
with O O O O
plasmid O O O O
- O O O O
based O O O O
targets O O O O
revealed O O O O
that O O O O
the O O O O
patterns O O O O
of O O O O
insertion O O O O
were O O O O
promoter O O O O
specific O O O O
and O O O O
highly O O O O
reproducible O O O O
. O O O O
    
To O O O O
determine O O O O
which O O O O
features O O O O
of O O O O
promoters O O O O
are O O O O
recognized O O O O
by O O O O
Tf1 O O O O
, O O O O
we O O O O
studied O O O O
integration O O O O
in O O O O
a O O O O
promoter O O O O
that O O O O
has O O O O
been O O O O
characterized O O O O
. O O O O
    
The O O O O
promoter O O O O
of O O O O
fbp1 O O O O
has O O O O
two O O O O
upstream O O O O
activating O O O O
sequences O O O O
, O O O O
UAS1 O O O O
and O O O O
UAS2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
that O O O O
integration O O O O
was O O O O
targeted O O O O
to O O O O
two O O O O
windows O O O O
, O O O O
one O O O O
180 O O O O
nucleotides O O O O
( O O O O
nt O O O O
) O O O O
upstream O O O O
and O O O O
the O O O O
other O O O O
30 O O O O
to O O O O
40 O O O O
nt O O O O
downstream O O O O
of O O O O
UAS1 O O O O
. O O O O
    
A O O O O
series O O O O
of O O O O
deletions O O O O
in O O O O
the O O O O
promoter O O O O
showed O O O O
that O O O O
the O O O O
integration O O O O
activities O O O O
of O O O O
these O O O O
two O O O O
regions O O O O
functioned O O O O
autonomously O O O O
. O O O O
    
Integration O O O O
assays O O O O
of O O O O
UAS2 O O O O
and O O O O
of O O O O
a O O O O
synthetic O O O O
promoter O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
strong O O O O
promoter O O O O
activity O O O O
alone O O O O
was O O O O
not O O O O
sufficient O O O O
to O O O O
direct O O O O
integration O O O O
. O O O O
    
The O O O O
factors O O O O
that O O O O
modulate O O O O
the O O O O
transcription O O O O
activities O O O O
of O O O O
UAS1 O O O O
and O O O O
UAS2 O O O O
include O O O O
the O O O O
activators O O O O
Atf1p O O O O
, O O O O
Pcr1p O O O O
, O O O O
and O O O O
Rst2p O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
the O O O O
repressors O O O O
Tup11p O O O O
, O O O O
Tup12p O O O O
, O O O O
and O O O O
Pka1p O O O O
. O O O O
    
Strains O O O O
lacking O O O O
each O O O O
of O O O O
these O O O O
proteins O O O O
revealed O O O O
that O O O O
Atf1p O O O O
alone O O O O
mediated O O O O
the O O O O
sites O O O O
of O O O O
integration O O O O
. O O O O
    
These O O O O
data O O O O
indicate O O O O
that O O O O
Atf1p O O O O
plays O O O O
a O O O O
direct O O O O
and O O O O
specific O O O O
role O O O O
in O O O O
targeting O O O O
integration O O O O
in O O O O
the O O O O
promoter O O O O
of O O O O
fbp1 O O O O
. O O O O
    
Phylloplane O O O O
location O O O O
of O O O O
glucosinolates O O O O
in O O O O
Barbarea O O O O
spp O O O O
. O O O O
    
( O O O O
Brassicaceae O O O O
) O O O O
and O O O O
misleading O O O O
assessment O O O O
of O O O O
host O O O O
suitability O O O O
by O O O O
a O O O O
specialist O O O O
herbivore O O O O
. O O O O
    
Glucosinolates O O O O
are O O O O
plant O O O O
secondary O O O O
metabolites O O O O
used O O O O
in O O O O
host O O O O
plant O O O O
recognition O O O O
by O O O O
insects O O O O
specialized O O O O
on O O O O
Brassicaceae O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
the O O O O
diamondback B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
moth O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
DBM B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
, O O O O
Plutella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
xylostella O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Their O O O O
perception O O O O
as O O O O
oviposition O O O O
cues O O O O
by O O O O
females O O O O
would O O O O
seem O O O O
to O O O O
require O O O O
their O O O O
occurrence O O O O
on O O O O
the O O O O
leaf O O O O
surface O O O O
, O O O O
yet O O O O
previous O O O O
studies O O O O
have O O O O
reached O O O O
opposite O O O O
conclusions O O O O
about O O O O
whether O O O O
glucosinolates O O O O
are O O O O
actually O O O O
present O O O O
on O O O O
the O O O O
surface O O O O
of O O O O
crucifer O O O O
leaves O O O O
. O O O O
    
DBM B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
oviposits O O O O
extensively O O O O
on O O O O
Barbarea B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
vulgaris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
despite O O O O
its O O O O
larvae O O O O
not O O O O
being O O O O
able O O O O
to O O O O
survive O O O O
on O O O O
this O O O O
plant O O O O
because O O O O
of O O O O
its O O O O
content O O O O
of O O O O
feeding O O O O
- O O O O
deterrent O O O O
saponins O O O O
. O O O O
    
Glucosinolates O O O O
and O O O O
saponins O O O O
in O O O O
plant O O O O
tissue O O O O
and O O O O
mechanically O O O O
removed O O O O
surface O O O O
waxes O O O O
from O O O O
leaves O O O O
of O O O O
Barbarea O O O O
spp O O O O
. O O O O
were O O O O
analyzed O O O O
with O O O O
high O O O O
- O O O O
performance O O O O
liquid O O O O
chromatography O O O O
( O O O O
HPLC O O O O
) O O O O
and O O O O
liquid O O O O
chromatography O O O O
- O O O O
mass O O O O
spectrometry O O O O
( O O O O
LC O O O O
- O O O O
MS O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Surface O O O O
waxes O O O O
from O O O O
leaves O O O O
of O O O O
Barbarea O O O O
spp O O O O
. O O O O
contained O O O O
glucosinolates O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
feeding O O O O
- O O O O
deterrent O O O O
saponins O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
research O O O O
is O O O O
the O O O O
first O O O O
to O O O O
show O O O O
that O O O O
glucosinolates O O O O
are O O O O
present O O O O
on O O O O
the O O O O
leaf O O O O
surface O O O O
of O O O O
Barbarea O O O O
spp O O O O
. O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
in O O O O
other O O O O
crucifers O O O O
investigated O O O O
, O O O O
resolving O O O O
some O O O O
conflicting O O O O
results O O O O
from O O O O
previous O O O O
studies O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
research O O O O
is O O O O
also O O O O
the O O O O
first O O O O
to O O O O
quantify O O O O
glucosinolates O O O O
on O O O O
the O O O O
leaf O O O O
surface O O O O
of O O O O
a O O O O
crucifer O O O O
, O O O O
and O O O O
to O O O O
show O O O O
that O O O O
the O O O O
concentrations O O O O
of O O O O
glucosinolates O O O O
found O O O O
on O O O O
the O O O O
leaf O O O O
surface O O O O
of O O O O
Barbarea O O O O
spp O O O O
. O O O O
are O O O O
sufficient O O O O
to O O O O
be O O O O
perceived O O O O
by O O O O
ovipositing O O O O
DBM B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Improved O O O O
nitrogen O O O O
nutrition O O O O
enhances O O O O
root O O O O
uptake O O O O
, O O O O
root O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
shoot O O O O
translocation O O O O
and O O O O
remobilization O O O O
of O O O O
zinc O O O O
( O O O O
( O O O O
65 O O O O
) O O O O
Zn O O O O
) O O O O
in O O O O
wheat O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
focussed O O O O
on O O O O
the O O O O
effect O O O O
of O O O O
increasing O O O O
nitrogen O O O O
( O O O O
N O O O O
) O O O O
supply O O O O
on O O O O
root O O O O
uptake O O O O
and O O O O
root O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
shoot O O O O
translocation O O O O
of O O O O
zinc O O O O
( O O O O
Zn O O O O
) O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
retranslocation O O O O
of O O O O
foliar O O O O
- O O O O
applied O O O O
Zn O O O O
in O O O O
durum B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
wheat O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Triticum B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
durum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
. O O O O
    
Nutrient O O O O
solution O O O O
experiments O O O O
were O O O O
conducted O O O O
to O O O O
examine O O O O
the O O O O
root O O O O
uptake O O O O
and O O O O
root O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
shoot O O O O
translocation O O O O
of O O O O
( O O O O
65 O O O O
) O O O O
Zn O O O O
in O O O O
seedlings O O O O
precultured O O O O
with O O O O
different O O O O
N O O O O
supplies O O O O
. O O O O
    
In O O O O
additional O O O O
experiments O O O O
, O O O O
the O O O O
effect O O O O
of O O O O
varied O O O O
N O O O O
nutrition O O O O
on O O O O
retranslocation O O O O
of O O O O
foliar O O O O
- O O O O
applied O O O O
( O O O O
65 O O O O
) O O O O
Zn O O O O
was O O O O
tested O O O O
at O O O O
both O O O O
the O O O O
vegetative O O O O
and O O O O
generative O O O O
stages O O O O
. O O O O
    
When O O O O
N O O O O
supply O O O O
was O O O O
increased O O O O
, O O O O
the O O O O
( O O O O
65 O O O O
) O O O O
Zn O O O O
uptake O O O O
by O O O O
roots O O O O
was O O O O
enhanced O O O O
by O O O O
up O O O O
to O O O O
threefold O O O O
and O O O O
the O O O O
( O O O O
65 O O O O
) O O O O
Zn O O O O
translocation O O O O
from O O O O
roots O O O O
to O O O O
shoots O O O O
increased O O O O
by O O O O
up O O O O
to O O O O
eightfold O O O O
, O O O O
while O O O O
plant O O O O
growth O O O O
was O O O O
affected O O O O
to O O O O
a O O O O
much O O O O
smaller O O O O
degree O O O O
. O O O O
    
Retranslocation O O O O
of O O O O
( O O O O
65 O O O O
) O O O O
Zn O O O O
from O O O O
old O O O O
into O O O O
young O O O O
leaves O O O O
and O O O O
from O O O O
flag O O O O
leaves O O O O
to O O O O
grains O O O O
also O O O O
showed O O O O
marked O O O O
positive O O O O
responses O O O O
to O O O O
increasing O O O O
N O O O O
supply O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
the O O O O
N O O O O
- O O O O
nutritional O O O O
status O O O O
of O O O O
wheat O O O O
affects O O O O
major O O O O
steps O O O O
in O O O O
the O O O O
route O O O O
of O O O O
Zn O O O O
from O O O O
the O O O O
growth O O O O
medium O O O O
to O O O O
the O O O O
grain O O O O
, O O O O
including O O O O
its O O O O
uptake O O O O
, O O O O
xylem O O O O
transport O O O O
and O O O O
remobilization O O O O
via O O O O
phloem O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
N O O O O
is O O O O
a O O O O
critical O O O O
player O O O O
in O O O O
the O O O O
uptake O O O O
and O O O O
accumulation O O O O
of O O O O
Zn O O O O
in O O O O
plants O O O O
, O O O O
which O O O O
deserves O O O O
special O O O O
attention O O O O
in O O O O
biofortification O O O O
of O O O O
food O O O O
crops O O O O
with O O O O
Zn O O O O
. O O O O
    
Dynamic O O O O
changes O O O O
of O O O O
canopy O O O O
- O O O O
scale O O O O
mesophyll O O O O
conductance O O O O
to O O O O
CO2 O O O O
diffusion O O O O
of O O O O
flower O O O O
as O O O O
affected O O O O
by O O O O
CO2 O O O O
concentration O O O O
and O O O O
abscisic O O O O
acid O O O O
. O O O O
    
Leaf O O O O
- O O O O
level O O O O
measurements O O O O
have O O O O
shown O O O O
that O O O O
mesophyll O O O O
conductance O O O O
( O O O O
g O O O O
( O O O O
m O O O O
) O O O O
) O O O O
can O O O O
vary O O O O
rapidly O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
CO2 O O O O
and O O O O
other O O O O
environmental O O O O
factors O O O O
, O O O O
but O O O O
similar O O O O
studies O O O O
at O O O O
the O O O O
canopy O O O O
- O O O O
scale O O O O
are O O O O
missing O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
report O O O O
the O O O O
effect O O O O
of O O O O
short O O O O
- O O O O
term O O O O
variation O O O O
of O O O O
CO2 O O O O
concentration O O O O
on O O O O
canopy O O O O
- O O O O
scale O O O O
g O O O O
( O O O O
m O O O O
) O O O O
and O O O O
other O O O O
CO2 O O O O
exchange O O O O
parameters O O O O
of O O O O
sunflower B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
Helianthus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
annuus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
L O O O O
. O O O O
) O O O O
stands O O O O
in O O O O
the O O O O
presence O O O O
and O O O O
absence O O O O
of O O O O
abscisic O O O O
acid O O O O
( O O O O
ABA O O O O
) O O O O
in O O O O
their O O O O
nutrient O O O O
solution O O O O
. O O O O
    
g O O O O
( O O O O
m O O O O
) O O O O
was O O O O
estimated O O O O
from O O O O
gas O O O O
exchange O O O O
and O O O O
on O O O O
- O O O O
line O O O O
carbon O O O O
isotope O O O O
discrimination O O O O
( O O O O
Delta O O O O
( O O O O
obs O O O O
) O O O O
) O O O O
in O O O O
a O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
3CO2 O O O O
/ O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
2CO2 O O O O
) O O O O
gas O O O O
exchange O O O O
mesocosm O O O O
. O O O O
    
The O O O O
isotopic O O O O
contribution O O O O
of O O O O
( O O O O
photo O O O O
) O O O O
respiration O O O O
to O O O O
stand O O O O
- O O O O
scale O O O O
Delta O O O O
( O O O O
obs O O O O
) O O O O
was O O O O
determined O O O O
with O O O O
the O O O O
experimental O O O O
approach O O O O
of O O O O
Tcherkez O O O O
et O O O O
al O O O O
. O O O O
    
Without O O O O
ABA O O O O
, O O O O
short O O O O
- O O O O
term O O O O
exposures O O O O
to O O O O
different O O O O
CO2 O O O O
concentrations O O O O
( O O O O
C O O O O
( O O O O
a O O O O
) O O O O
100 O O O O
to O O O O
900 O O O O
mumol O O O O
mol O O O O
- O O O O
^ O O O O
1 O O O O
) O O O O
had O O O O
little O O O O
effect O O O O
on O O O O
canopy O O O O
- O O O O
scale O O O O
g O O O O
( O O O O
m O O O O
) O O O O
. O O O O
    
But O O O O
, O O O O
addition O O O O
of O O O O
ABA O O O O
strongly O O O O
altered O O O O
the O O O O
CO2 O O O O
- O O O O
response O O O O
: O O O O
g O O O O
( O O O O
m O O O O
) O O O O
was O O O O
high O O O O
( O O O O
approx O O O O
. O O O O
0 O O O O
. O O O O
5 O O O O
mol O O O O
CO2 O O O O
m O O O O
- O O O O
^ O O O O
2 O O O O
s O O O O
- O O O O
^ O O O O
1 O O O O
) O O O O
at O O O O
C O O O O
( O O O O
a O O O O
) O O O O
& O O O O
lt O O O O
; O O O O
200 O O O O
mumol O O O O
mol O O O O
- O O O O
^ O O O O
1 O O O O
and O O O O
decreased O O O O
to O O O O
& O O O O
lt O O O O
; O O O O
0 O O O O
. O O O O
1 O O O O
mol O O O O
CO2 O O O O
m O O O O
- O O O O
^ O O O O
2 O O O O
s O O O O
- O O O O
^ O O O O
1 O O O O
at O O O O
C O O O O
( O O O O
a O O O O
) O O O O
> O O O O
400 O O O O
mumol O O O O
mol O O O O
- O O O O
^ O O O O
1 O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
ABA O O O O
, O O O O
the O O O O
contribution O O O O
of O O O O
( O O O O
photo O O O O
) O O O O
respiration O O O O
to O O O O
stand O O O O
- O O O O
scale O O O O
Delta O O O O
( O O O O
obs O O O O
) O O O O
was O O O O
high O O O O
at O O O O
low O O O O
C O O O O
( O O O O
a O O O O
) O O O O
( O O O O
7 O O O O
. O O O O
2 O O O O
% O O O O
) O O O O
and O O O O
decreased O O O O
to O O O O
& O O O O
lt O O O O
; O O O O
2 O O O O
% O O O O
at O O O O
C O O O O
( O O O O
a O O O O
) O O O O
> O O O O
400 O O O O
mumol O O O O
mol O O O O
- O O O O
^ O O O O
1 O O O O
. O O O O
    
Treatment O O O O
with O O O O
ABA O O O O
halved O O O O
this O O O O
effect O O O O
at O O O O
all O O O O
C O O O O
( O O O O
a O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Hormone O O O O
receptor O O O O
- O O O O
like O O O O
in O O O O
96 O O O O
and O O O O
Broad O O O O
- O O O O
Complex O O O O
modulate O O O O
phenobarbital O O O O
induced O O O O
transcription O O O O
of O O O O
cytochrome O O O O
P450 O O O O
CYP6D1 O O O O
in O O O O
Drosophila B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
S2 O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Phenobarbital O O O O
( O O O O
PB O O O O
) O O O O
is O O O O
a O O O O
prototypical O O O O
inducer O O O O
for O O O O
studies O O O O
of O O O O
xenobiotic O O O O
responses O O O O
in O O O O
animals O O O O
. O O O O
    
In O O O O
mammals O O O O
, O O O O
the O O O O
nuclear O O O O
receptors O O O O
constitutive O O O O
androstane O O O O
receptor O O O O
( O O O O
CAR O O O O
) O O O O
and O O O O
pregnane O O O O
X O O O O
receptor O O O O
( O O O O
PXR O O O O
) O O O O
have O O O O
been O O O O
identified O O O O
as O O O O
key O O O O
transcription O O O O
factors O O O O
regulating O O O O
PB O O O O
induced O O O O
transcription O O O O
of O O O O
xenobiotic O O O O
responsive O O O O
genes O O O O
. O O O O
    
In O O O O
insects O O O O
, O O O O
much O O O O
less O O O O
is O O O O
known O O O O
about O O O O
the O O O O
transcription O O O O
factors O O O O
involved O O O O
in O O O O
regulating O O O O
PB O O O O
induced O O O O
transcription O O O O
, O O O O
although O O O O
CAR O O O O
and O O O O
PXR O O O O
have O O O O
a O O O O
single O O O O
orthologue O O O O
hormone O O O O
receptor O O O O
- O O O O
like O O O O
in O O O O
96 O O O O
( O O O O
HR96 O O O O
) O O O O
in O O O O
Drosophila B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
melanogaster O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Using O O O O
dual O O O O
luciferase O O O O
reporter O O O O
assays O O O O
in O O O O
Drosophila B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
Schneider O O O O
( O O O O
S2 O O O O
) O O O O
cells O O O O
, O O O O
constructs O O O O
containing O O O O
variable O O O O
lengths O O O O
of O O O O
the O O O O
promoter O O O O
of O O O O
the O O O O
PB O O O O
inducible O O O O
cytochrome O O O O
P450 O O O O
CYP6D1 O O O O
were O O O O
evaluated O O O O
in O O O O
the O O O O
presence O O O O
and O O O O
absence O O O O
of O O O O
PB O O O O
. O O O O
    
The O O O O
promoter O O O O
region O O O O
between O O O O
- O O O O
330 O O O O
and O O O O
- O O O O
280 O O O O
( O O O O
relative O O O O
to O O O O
the O O O O
position O O O O
of O O O O
transcription O O O O
start O O O O
site O O O O
, O O O O
+ O O O O
1 O O O O
) O O O O
was O O O O
found O O O O
to O O O O
be O O O O
critical O O O O
for O O O O
PB O O O O
induction O O O O
. O O O O
    
Putative O O O O
binding O O O O
sites O O O O
for O O O O
Drosophila B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
Broad O O O O
- O O O O
Complex O O O O
( O O O O
BR O O O O
- O O O O
C O O O O
) O O O O
and O O O O
deformed O O O O
( O O O O
Dfd O O O O
) O O O O
were O O O O
identified O O O O
within O O O O
this O O O O
promoter O O O O
region O O O O
using O O O O
TFsearch O O O O
. O O O O
    
RNA O O O O
interference O O O O
( O O O O
RNAi O O O O
) O O O O
treatment O O O O
of O O O O
S2 O O O O
cells O O O O
in O O O O
conjunction O O O O
with O O O O
CYP6D1 O O O O
promoter O O O O
assays O O O O
showed O O O O
that O O O O
suppression O O O O
of O O O O
Drosophila B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
HR96 O O O O
and O O O O
BR O O O O
- O O O O
C O O O O
transcription O O O O
in O O O O
S2 O O O O
cells O O O O
resulted O O O O
in O O O O
a O O O O
significant O O O O
decrease O O O O
and O O O O
increase O O O O
, O O O O
respectively O O O O
, O O O O
of O O O O
PB O O O O
induction O O O O
. O O O O
    
Effects O O O O
of O O O O
HR96 O O O O
and O O O O
BR O O O O
- O O O O
C O O O O
in O O O O
mediating O O O O
PB O O O O
induction O O O O
were O O O O
PB O O O O
specific O O O O
and O O O O
PB O O O O
dependent O O O O
. O O O O
    
This O O O O
represents O O O O
new O O O O
functional O O O O
evidence O O O O
that O O O O
Drosophila B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
HR96 O O O O
and O O O O
BR O O O O
- O O O O
C O O O O
can O O O O
act O O O O
as O O O O
an O O O O
activator O O O O
and O O O O
repressor O O O O
, O O O O
respectively O O O O
, O O O O
in O O O O
regulating O O O O
PB O O O O
induced O O O O
transcription O O O O
in O O O O
insects O O O O
. O O O O
    
Double O O O O
- O O O O
antigen O O O O
sandwich O O O O
ELISA O O O O
for O O O O
the O O O O
detection O O O O
of O O O O
anti O O O O
- O O O O
hepatitis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
C O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
antibodies O O O O
. O O O O
    
A O O O O
double O O O O
- O O O O
antigen O O O O
sandwich O O O O
ELISA O O O O
was O O O O
developed O O O O
a O O O O
detection O O O O
of O O O O
HCV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
antibodies O O O O
by O O O O
a O O O O
recombinant O O O O
multi O O O O
- O O O O
epitope O O O O
HCV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
antigen O O O O
and O O O O
a O O O O
biotin O O O O
- O O O O
streptavidin O O O O
amplification O O O O
system O O O O
. O O O O
    
Three O O O O
plasma O O O O
specimens O O O O
from O O O O
1708 O O O O
individuals O O O O
who O O O O
were O O O O
suspected O O O O
previously O O O O
to O O O O
be O O O O
HCV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
positive O O O O
using O O O O
an O O O O
HCV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
antibody O O O O
diagnostic O O O O
kit O O O O
( O O O O
Chuangxin O O O O
, O O O O
Xiamen O O O O
, O O O O
China O O O O
) O O O O
displayed O O O O
negative O O O O
results O O O O
when O O O O
using O O O O
the O O O O
ELISA O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
were O O O O
validated O O O O
by O O O O
a O O O O
recombinant O O O O
immunoblotting O O O O
assay O O O O
( O O O O
two O O O O
were O O O O
negative O O O O
, O O O O
and O O O O
one O O O O
was O O O O
indeterminate O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Among O O O O
889 O O O O
blood O O O O
specimens O O O O
donated O O O O
for O O O O
clinical O O O O
evaluation O O O O
, O O O O
246 O O O O
were O O O O
positive O O O O
and O O O O
630 O O O O
were O O O O
negative O O O O
using O O O O
the O O O O
ELISA O O O O
. O O O O
    
The O O O O
sensitivity O O O O
and O O O O
specificity O O O O
of O O O O
the O O O O
ELISA O O O O
were O O O O
98 O O O O
. O O O O
7 O O O O
% O O O O
and O O O O
100 O O O O
% O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
In O O O O
43 O O O O
donors O O O O
and O O O O
14 O O O O
patients O O O O
with O O O O
chronic O O O O
hepatitis O O O O
C O O O O
, O O O O
the O O O O
detectable O O O O
rates O O O O
for O O O O
HCV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
IgM O O O O
by O O O O
both O O O O
ELISA O O O O
and O O O O
the O O O O
HCV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
anti O O O O
- O O O O
IgM O O O O
detection O O O O
reagents O O O O
( O O O O
Huimin O O O O
, O O O O
Shenyang O O O O
, O O O O
China O O O O
) O O O O
were O O O O
100 O O O O
% O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
detectable O O O O
rate O O O O
for O O O O
HCV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
IgG O O O O
using O O O O
an O O O O
indirect O O O O
HCV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
antibody O O O O
detection O O O O
kit O O O O
( O O O O
GWK O O O O
, O O O O
Beijing O O O O
, O O O O
China O O O O
) O O O O
was O O O O
98 O O O O
. O O O O
3 O O O O
% O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
the O O O O
double O O O O
- O O O O
antigen O O O O
sandwich O O O O
ELISA O O O O
exhibits O O O O
strong O O O O
specificity O O O O
and O O O O
sensitivity O O O O
and O O O O
has O O O O
been O O O O
approved O O O O
by O O O O
the O O O O
China O O O O
State O O O O
Food O O O O
and O O O O
Drug O O O O
Administration O O O O
( O O O O
SFDA O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
performance O O O O
of O O O O
the O O O O
double O O O O
- O O O O
antigen O O O O
sandwich O O O O
ELISA O O O O
was O O O O
similar O O O O
to O O O O
the O O O O
Ortho O O O O
ELISA O O O O
3 O O O O
. O O O O
0 O O O O
. O O O O
    
It O O O O
did O O O O
not O O O O
give O O O O
false O O O O
- O O O O
negative O O O O
results O O O O
otherwise O O O O
IgM O O O O
was O O O O
undetectable O O O O
using O O O O
an O O O O
indirect O O O O
HCV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
antibody O O O O
detection O O O O
kit O O O O
. O O O O
    
This O O O O
ELISA O O O O
provides O O O O
another O O O O
method O O O O
for O O O O
the O O O O
detection O O O O
of O O O O
HCV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
antibodies O O O O
. O O O O
    
Detection O O O O
of O O O O
infectious B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
myonecrosis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
using O O O O
monoclonal O O O O
antibody O O O O
specific O O O O
to O O O O
N O O O O
and O O O O
C O O O O
fragments O O O O
of O O O O
the O O O O
capsid O O O O
protein O O O O
expressed O O O O
heterologously O O O O
. O O O O
    
The O O O O
gene O O O O
encoding O O O O
the O O O O
capsid O O O O
protein O O O O
in O O O O
ORF1 O O O O
of O O O O
the O O O O
genome O O O O
of O O O O
infectious B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
myonecrosis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
IMNV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
( O O O O
GenBank O O O O
AY570982 O O O O
) O O O O
was O O O O
amplified O O O O
into O O O O
three O O O O
parts O O O O
named O O O O
CP O O O O
- O O O O
N O O O O
( O O O O
nucleotides O O O O
2248 O O O O
- O O O O
3045 O O O O
) O O O O
, O O O O
CP O O O O
- O O O O
I O O O O
( O O O O
nucleotides O O O O
3046 O O O O
- O O O O
3954 O O O O
) O O O O
and O O O O
CP O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
nucleotides O O O O
3955 O O O O
- O O O O
4953 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
CP O O O O
- O O O O
N O O O O
fragment O O O O
was O O O O
inserted O O O O
into O O O O
expression O O O O
vector O O O O
pTYB1 O O O O
while O O O O
CP O O O O
- O O O O
I O O O O
and O O O O
CP O O O O
- O O O O
C O O O O
were O O O O
each O O O O
inserted O O O O
into O O O O
expression O O O O
vector O O O O
pGEX O O O O
- O O O O
6P O O O O
- O O O O
1 O O O O
for O O O O
transformation O O O O
of O O O O
BL21 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
E O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O O O O
. O O O O
    
After O O O O
induction O O O O
, O O O O
intein O O O O
- O O O O
CP O O O O
- O O O O
N O O O O
( O O O O
84 O O O O
kDa O O O O
) O O O O
, O O O O
glutathione O O O O
- O O O O
S O O O O
- O O O O
transferase O O O O
( O O O O
GST O O O O
) O O O O
- O O O O
CP O O O O
- O O O O
I O O O O
( O O O O
60 O O O O
kDa O O O O
) O O O O
and O O O O
GST O O O O
- O O O O
CP O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
62 O O O O
kDa O O O O
) O O O O
fusion O O O O
proteins O O O O
were O O O O
produced O O O O
. O O O O
    
They O O O O
were O O O O
separated O O O O
by O O O O
SDS O O O O
- O O O O
PAGE O O O O
and O O O O
electroeluted O O O O
before O O O O
immunization O O O O
of O O O O
Swiss O O O O
mice O O O O
for O O O O
monoclonal O O O O
antibody O O O O
( O O O O
MAb O O O O
) O O O O
production O O O O
. O O O O
    
Two O O O O
MAbs O O O O
specific O O O O
to O O O O
CP O O O O
- O O O O
N O O O O
and O O O O
one O O O O
MAb O O O O
specific O O O O
to O O O O
CP O O O O
- O O O O
C O O O O
were O O O O
selected O O O O
for O O O O
use O O O O
for O O O O
detection O O O O
of O O O O
natural O O O O
IMNV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infections O O O O
in O O O O
Penaeus O O O O
vannamei O O O O
by O O O O
dot O O O O
blotting O O O O
, O O O O
Western O O O O
blotting O O O O
and O O O O
immunohistochemistry O O O O
. O O O O
    
There O O O O
was O O O O
no O O O O
cross O O O O
- O O O O
reaction O O O O
with O O O O
shrimp O O O O
tissues O O O O
or O O O O
common O O O O
shrimp O O O O
viruses O O O O
including O O O O
white B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
spot O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
syndrome O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
WSSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
, O O O O
yellow B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
head O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
YHV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
, O O O O
Taura B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
syndrome O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
TSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
, O O O O
Penaeus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
monodon O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nucleopolyhedrovirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
PemoNPV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
, O O O O
Penaeus O O O O
stylirostris O O O O
densovirus O O O O
( O O O O
PstDNV O O O O
) O O O O
and O O O O
Penaeus O O O O
monodon O O O O
densovirus O O O O
( O O O O
PmDNV O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
detection O O O O
sensitivities O O O O
of O O O O
the O O O O
MAbs O O O O
were O O O O
approximately O O O O
6 O O O O
fmol O O O O
/ O O O O
spot O O O O
of O O O O
purified O O O O
recombinant O O O O
intein O O O O
- O O O O
CP O O O O
- O O O O
N O O O O
protein O O O O
and O O O O
8 O O O O
fmol O O O O
/ O O O O
spot O O O O
of O O O O
GST O O O O
- O O O O
CP O O O O
- O O O O
C O O O O
as O O O O
determined O O O O
by O O O O
dot O O O O
blotting O O O O
. O O O O
    
A O O O O
combination O O O O
of O O O O
all O O O O
three O O O O
MAbs O O O O
resulted O O O O
in O O O O
a O O O O
twofold O O O O
increase O O O O
in O O O O
sensitivity O O O O
over O O O O
use O O O O
of O O O O
any O O O O
single O O O O
MAb O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
this O O O O
sensitivity O O O O
was O O O O
approximately O O O O
10 O O O O
times O O O O
lower O O O O
than O O O O
that O O O O
of O O O O
one O O O O
- O O O O
step O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
using O O O O
the O O O O
same O O O O
sample O O O O
. O O O O
    
Immunohistochemical O O O O
analysis O O O O
using O O O O
MAbs O O O O
specific O O O O
to O O O O
CP O O O O
- O O O O
N O O O O
and O O O O
CP O O O O
- O O O O
C O O O O
in O O O O
IMNV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
infected O O O O
shrimp O O O O
revealed O O O O
intense O O O O
staining O O O O
patterns O O O O
in O O O O
muscles O O O O
, O O O O
the O O O O
lymphoid O O O O
organ O O O O
, O O O O
gills O O O O
, O O O O
the O O O O
heart O O O O
, O O O O
hemocytes O O O O
and O O O O
connective O O O O
tissue O O O O
. O O O O
    
Real O O O O
time O O O O
PCR O O O O
method O O O O
for O O O O
simultaneous O O O O
detection O O O O
, O O O O
quantitation O O O O
and O O O O
differentiation O O O O
of O O O O
capripoxviruses O O O O
. O O O O
    
The O O O O
genus O O O O
Capripoxvirus O O O O
( O O O O
CaPV O O O O
) O O O O
comprises O O O O
three O O O O
members O O O O
namely O O O O
, O O O O
sheep B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
poxvirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
SPPV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
, O O O O
goat B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
poxvirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
GTPV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
and O O O O
lumpy B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
skin O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
disease O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
LSDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
affecting O O O O
sheep B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
goats B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
cattle B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
CaPV O O O O
infections O O O O
produce O O O O
similar O O O O
symptoms O O O O
in O O O O
sheep B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
goats B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
and O O O O
the O O O O
three O O O O
viruses O O O O
cannot O O O O
be O O O O
distinguished O O O O
serologically O O O O
. O O O O
    
Since O O O O
there O O O O
are O O O O
conflicting O O O O
opinions O O O O
regarding O O O O
the O O O O
host O O O O
specificity O O O O
of O O O O
CaPVs O O O O
, O O O O
particularly O O O O
for O O O O
goatpox B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
sheeppox B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
viruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
the O O O O
development O O O O
of O O O O
rapid O O O O
genotyping O O O O
tools O O O O
will O O O O
facilitate O O O O
more O O O O
accurate O O O O
disease O O O O
diagnosis O O O O
and O O O O
surveillance O O O O
for O O O O
better O O O O
management O O O O
of O O O O
capripox O O O O
outbreaks O O O O
. O O O O
    
This O O O O
paper O O O O
describes O O O O
a O O O O
species O O O O
- O O O O
specific O O O O
, O O O O
real O O O O
time O O O O
polymerase O O O O
chain O O O O
reaction O O O O
( O O O O
PCR O O O O
) O O O O
, O O O O
based O O O O
on O O O O
unique O O O O
molecular O O O O
markers O O O O
that O O O O
were O O O O
found O O O O
in O O O O
the O O O O
G O O O O
- O O O O
protein O O O O
- O O O O
coupled O O O O
chemokine O O O O
receptor O O O O
( O O O O
GPCR O O O O
) O O O O
gene O O O O
sequences O O O O
of O O O O
CaPVs O O O O
, O O O O
that O O O O
uses O O O O
dual O O O O
hybridization O O O O
probes O O O O
for O O O O
their O O O O
simultaneous O O O O
detection O O O O
, O O O O
quantitation O O O O
and O O O O
genotyping O O O O
. O O O O
    
The O O O O
assay O O O O
can O O O O
differentiate O O O O
between O O O O
CaPV O O O O
strains O O O O
based O O O O
on O O O O
differences O O O O
in O O O O
the O O O O
melting O O O O
point O O O O
temperature O O O O
( O O O O
Tm O O O O
) O O O O
obtained O O O O
after O O O O
fluorescence O O O O
melting O O O O
curve O O O O
analysis O O O O
( O O O O
FMCA O O O O
) O O O O
. O O O O
    
It O O O O
is O O O O
highly O O O O
sensitive O O O O
and O O O O
presents O O O O
low O O O O
intra O O O O
- O O O O
and O O O O
inter O O O O
- O O O O
run O O O O
variation O O O O
. O O O O
    
This O O O O
real O O O O
time O O O O
PCR O O O O
assay O O O O
will O O O O
make O O O O
a O O O O
significant O O O O
contribution O O O O
to O O O O
CaPV O O O O
diagnosis O O O O
and O O O O
to O O O O
the O O O O
better O O O O
understanding O O O O
of O O O O
the O O O O
epidemiology O O O O
of O O O O
CaPVs O O O O
by O O O O
enabling O O O O
rapid O O O O
genotyping O O O O
and O O O O
gene O O O O
- O O O O
based O O O O
classification O O O O
of O O O O
viral O O O O
strains O O O O
and O O O O
unequivocal O O O O
identification O O O O
of O O O O
isolates O O O O
. O O O O
    
Multiplex O O O O
PCR O O O O
for O O O O
rapid O O O O
detection O O O O
of O O O O
serotype B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
foot O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
mouth O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
disease O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
variants O O O O
with O O O O
amino O O O O
acid O O O O
deletion O O O O
at O O O O
position O O O O
59 O O O O
of O O O O
the O O O O
capsid O O O O
protein O O O O
VP3 O O O O
. O O O O
    
In O O O O
India O O O O
, O O O O
there O O O O
has O O O O
been O O O O
co O O O O
- O O O O
circulation O O O O
, O O O O
extinction O O O O
and O O O O
emergence O O O O
of O O O O
genotypes O O O O
/ O O O O
lineages O O O O
within O O O O
serotype O O O O
A O O O O
foot O O O O
- O O O O
and O O O O
- O O O O
mouth O O O O
disease O O O O
( O O O O
FMD B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
virus O O O O
. O O O O
    
At O O O O
present O O O O
an O O O O
antigenically O O O O
heterogeneous O O O O
, O O O O
unique O O O O
lineage O O O O
within O O O O
genotype O O O O
VII O O O O
dominates O O O O
the O O O O
field O O O O
outbreaks O O O O
. O O O O
    
This O O O O
genetic O O O O
cluster O O O O
has O O O O
amino O O O O
acid O O O O
deletion O O O O
at O O O O
position O O O O
59 O O O O
of O O O O
VP3 O O O O
( O O O O
VP3 O O O O
( O O O O
59 O O O O
) O O O O
- O O O O
deletion O O O O
group O O O O
) O O O O
, O O O O
considered O O O O
to O O O O
be O O O O
critical O O O O
antigenically O O O O
. O O O O
    
The O O O O
emergence O O O O
of O O O O
this O O O O
group O O O O
warrants O O O O
rapid O O O O
and O O O O
accurate O O O O
detection O O O O
to O O O O
facilitate O O O O
early O O O O
planning O O O O
and O O O O
implementation O O O O
of O O O O
an O O O O
effective O O O O
control O O O O
policy O O O O
. O O O O
    
A O O O O
rapid O O O O
multiplex O O O O
PCR O O O O
assay O O O O
was O O O O
developed O O O O
for O O O O
detection O O O O
of O O O O
the O O O O
dominating O O O O
VP3 O O O O
( O O O O
59 O O O O
) O O O O
- O O O O
deletion O O O O
group O O O O
with O O O O
100 O O O O
% O O O O
sensitivity O O O O
and O O O O
specificity O O O O
, O O O O
even O O O O
before O O O O
generating O O O O
sequence O O O O
data O O O O
and O O O O
confirmatory O O O O
phylogenetic O O O O
analysis O O O O
. O O O O
    
This O O O O
development O O O O
is O O O O
important O O O O
for O O O O
surveillance O O O O
of O O O O
FMD B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
in O O O O
India O O O O
. O O O O
    
Multiplex O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
for O O O O
rapid O O O O
detection O O O O
and O O O O
differentiation O O O O
of O O O O
class B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
I O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
class B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
II O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Newcastle O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
disease O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
viruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
A O O O O
multiplex O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
was O O O O
developed O O O O
for O O O O
detection O O O O
and O O O O
differentiation O O O O
of O O O O
class B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
I O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
class B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
II O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strains O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
of O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Newcastle O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
disease O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
NDV O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
method O O O O
was O O O O
shown O O O O
to O O O O
have O O O O
high O O O O
specificity O O O O
and O O O O
sensitivity O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
obtained O O O O
from O O O O
the O O O O
multiplex O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
for O O O O
a O O O O
total O O O O
of O O O O
67 O O O O
NDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
field O O O O
isolates O O O O
obtained O O O O
in O O O O
2009 O O O O
were O O O O
consistent O O O O
with O O O O
those O O O O
obtained O O O O
by O O O O
nucleotide O O O O
sequencing O O O O
and O O O O
phylogenetic O O O O
analysis O O O O
. O O O O
    
A O O O O
phylogenetic O O O O
tree O O O O
based O O O O
on O O O O
the O O O O
partial O O O O
sequences O O O O
of O O O O
the O O O O
F O O O O
gene O O O O
revealed O O O O
that O O O O
the O O O O
67 O O O O
field O O O O
isolates O O O O
of O O O O
NDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
could O O O O
be O O O O
divided O O O O
into O O O O
two O O O O
classes O O O O
. O O O O
    
Twenty O O O O
- O O O O
seven O O O O
NDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
isolates O O O O
were O O O O
grouped O O O O
into O O O O
class B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
I O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
two O O O O
genotypes O O O O
were O O O O
identified O O O O
. O O O O
    
Most O O O O
of O O O O
the O O O O
class B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
I O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
isolates O O O O
were O O O O
determined O O O O
to O O O O
be O O O O
of O O O O
genotype O O O O
3 O O O O
, O O O O
with O O O O
the O O O O
exception O O O O
of O O O O
isolate O O O O
NDV09 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
034 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
which O O O O
belonged O O O O
to O O O O
genotype O O O O
2 O O O O
. O O O O
    
Forty O O O O
class B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
II O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
NDV O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
isolates O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
were O O O O
divided O O O O
into O O O O
three O O O O
genotypes O O O O
, O O O O
namely O O O O
genotype O O O O
VII O O O O
( O O O O
27 O O O O
isolates O O O O
) O O O O
, O O O O
genotype O O O O
I O O O O
( O O O O
2 O O O O
isolates O O O O
) O O O O
and O O O O
genotype O O O O
II O O O O
( O O O O
11 O O O O
isolates O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Isolates O O O O
of O O O O
genotypes O O O O
I O O O O
and O O O O
II O O O O
in O O O O
class O O O O
II O O O O
were O O O O
shown O O O O
to O O O O
be O O O O
related O O O O
to O O O O
commercial O O O O
vaccine O O O O
strains O O O O
used O O O O
commonly O O O O
in O O O O
China O O O O
. O O O O
    
All O O O O
isolates O O O O
of O O O O
genotype O O O O
VII O O O O
were O O O O
predicted O O O O
to O O O O
be O O O O
virulent O O O O
, O O O O
on O O O O
the O O O O
basis O O O O
of O O O O
the O O O O
sequence O O O O
motif O O O O
at O O O O
the O O O O
cleavage O O O O
site O O O O
of O O O O
the O O O O
F O O O O
gene O O O O
. O O O O
    
This O O O O
genotype O O O O
has O O O O
become O O O O
predominantly O O O O
responsible O O O O
for O O O O
most O O O O
outbreaks O O O O
of O O O O
ND O O O O
in O O O O
China O O O O
in O O O O
recent O O O O
years O O O O
. O O O O
    
In O O O O
conclusion O O O O
, O O O O
this O O O O
multiplex O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
provides O O O O
a O O O O
new O O O O
assay O O O O
for O O O O
rapid O O O O
detection O O O O
and O O O O
differentiation O O O O
of O O O O
both O O O O
classes O O O O
of O O O O
NDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
isolates O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Detection O O O O
of O O O O
Tomato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
black O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ring O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
by O O O O
real O O O O
- O O O O
time O O O O
one O O O O
- O O O O
step O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
. O O O O
    
A O O O O
TaqMan O O O O
- O O O O
based O O O O
real O O O O
- O O O O
time O O O O
one O O O O
- O O O O
step O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
assay O O O O
was O O O O
developed O O O O
for O O O O
the O O O O
rapid O O O O
detection O O O O
of O O O O
Tomato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
black O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ring O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
TBRV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
, O O O O
a O O O O
significant O O O O
plant O O O O
pathogen O O O O
which O O O O
infects O O O O
a O O O O
wide O O O O
range O O O O
of O O O O
economically O O O O
important O O O O
crops O O O O
. O O O O
    
Primers O O O O
and O O O O
a O O O O
probe O O O O
were O O O O
designed O O O O
against O O O O
existing O O O O
genomic O O O O
sequences O O O O
to O O O O
amplify O O O O
a O O O O
72 O O O O
bp O O O O
fragment O O O O
from O O O O
RNA O O O O
- O O O O
2 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
assay O O O O
amplified O O O O
all O O O O
isolates O O O O
of O O O O
TBRV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tested O O O O
, O O O O
but O O O O
no O O O O
amplification O O O O
was O O O O
observed O O O O
from O O O O
the O O O O
RNA O O O O
of O O O O
other O O O O
nepovirus O O O O
species O O O O
or O O O O
healthy O O O O
host O O O O
plants O O O O
. O O O O
    
The O O O O
detection O O O O
limit O O O O
of O O O O
the O O O O
assay O O O O
was O O O O
estimated O O O O
to O O O O
be O O O O
around O O O O
nine O O O O
copies O O O O
of O O O O
the O O O O
TBRV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
target O O O O
region O O O O
in O O O O
total O O O O
RNA O O O O
. O O O O
    
A O O O O
comparison O O O O
with O O O O
conventional O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
and O O O O
ELISA O O O O
, O O O O
indicated O O O O
that O O O O
ELISA O O O O
, O O O O
the O O O O
current O O O O
standard O O O O
test O O O O
method O O O O
, O O O O
lacked O O O O
specificity O O O O
and O O O O
reacted O O O O
to O O O O
all O O O O
nepovirus O O O O
species O O O O
tested O O O O
, O O O O
while O O O O
conventional O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
was O O O O
approximately O O O O
ten O O O O
- O O O O
fold O O O O
less O O O O
sensitive O O O O
than O O O O
the O O O O
real O O O O
- O O O O
time O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
assay O O O O
. O O O O
    
Finally O O O O
, O O O O
the O O O O
real O O O O
- O O O O
time O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
assay O O O O
was O O O O
tested O O O O
using O O O O
five O O O O
different O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
reagent O O O O
kits O O O O
and O O O O
was O O O O
found O O O O
to O O O O
be O O O O
robust O O O O
and O O O O
reliable O O O O
, O O O O
with O O O O
no O O O O
significant O O O O
differences O O O O
in O O O O
sensitivity O O O O
being O O O O
found O O O O
. O O O O
    
The O O O O
development O O O O
of O O O O
this O O O O
rapid O O O O
assay O O O O
should O O O O
aid O O O O
in O O O O
quarantine O O O O
and O O O O
post O O O O
- O O O O
border O O O O
surveys O O O O
for O O O O
regulatory O O O O
agencies O O O O
. O O O O
    
Cross O O O O
- O O O O
genotypic O O O O
polyclonal O O O O
anti O O O O
- O O O O
HCV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
antibodies O O O O
from O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ascitic O O O O
fluid O O O O
. O O O O
    
Many O O O O
anti O O O O
- O O O O
HCV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
antibodies O O O O
are O O O O
available O O O O
, O O O O
but O O O O
more O O O O
are O O O O
needed O O O O
for O O O O
research O O O O
and O O O O
clinical O O O O
applications O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
examines O O O O
whether O O O O
ascitic O O O O
fluid O O O O
from O O O O
cirrhotic O O O O
patients O O O O
could O O O O
be O O O O
a O O O O
source O O O O
of O O O O
reagent O O O O
- O O O O
grade O O O O
antibodies O O O O
. O O O O
    
Ascitic O O O O
fluid O O O O
from O O O O
29 O O O O
HCV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
patients O O O O
was O O O O
screened O O O O
by O O O O
ELISA O O O O
for O O O O
anti O O O O
- O O O O
HCV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
antibodies O O O O
against O O O O
three O O O O
viral O O O O
proteins O O O O
: O O O O
core O O O O
, O O O O
NS4B O O O O
, O O O O
and O O O O
NS5A O O O O
. O O O O
    
Significant O O O O
patient O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
patient O O O O
variability O O O O
in O O O O
anti O O O O
- O O O O
HCV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
antibody O O O O
titers O O O O
was O O O O
observed O O O O
. O O O O
    
Total O O O O
ascitic O O O O
fluid O O O O
IgG O O O O
purified O O O O
by O O O O
Protein O O O O
- O O O O
A O O O O
chromatography O O O O
reacted O O O O
with O O O O
HCV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
proteins O O O O
in O O O O
immunoblots O O O O
, O O O O
cell O O O O
extracts O O O O
, O O O O
and O O O O
replicon O O O O
- O O O O
expressing O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Affinity O O O O
- O O O O
purification O O O O
using O O O O
synthetic O O O O
peptides O O O O
as O O O O
bait O O O O
allowed O O O O
the O O O O
preparation O O O O
of O O O O
cross O O O O
- O O O O
genotypic O O O O
antibodies O O O O
directed O O O O
against O O O O
pre O O O O
- O O O O
selected O O O O
regions O O O O
of O O O O
HCV O O O O
core O O O O
, O O O O
NS4B O O O O
, O O O O
and O O O O
NS5A O O O O
proteins O O O O
. O O O O
    
The O O O O
performance O O O O
of O O O O
the O O O O
polyclonal O O O O
antibodies O O O O
was O O O O
comparable O O O O
to O O O O
that O O O O
of O O O O
monoclonal O O O O
antibodies O O O O
. O O O O
    
Anti O O O O
- O O O O
NS4B O O O O
antibody O O O O
preparations O O O O
reacted O O O O
with O O O O
genotype O O O O
1a O O O O
, O O O O
1b O O O O
, O O O O
and O O O O
2a O O O O
NS4B O O O O
proteins O O O O
in O O O O
immunoblots O O O O
and O O O O
allowed O O O O
NS4B O O O O
to O O O O
be O O O O
localized O O O O
in O O O O
replicon O O O O
- O O O O
expressing O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Ascitic O O O O
fluid O O O O
is O O O O
an O O O O
abundant O O O O
source O O O O
of O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
polyclonal O O O O
cross O O O O
- O O O O
genotypic O O O O
antibodies O O O O
that O O O O
can O O O O
be O O O O
used O O O O
as O O O O
an O O O O
alternative O O O O
to O O O O
blood O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
shows O O O O
the O O O O
utility O O O O
of O O O O
selectively O O O O
purifying O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
polyclonal O O O O
antibodies O O O O
from O O O O
ascitic O O O O
fluid O O O O
. O O O O
    
Affinity O O O O
purification O O O O
allows O O O O
antibodies O O O O
to O O O O
be O O O O
selected O O O O
that O O O O
are O O O O
comparable O O O O
to O O O O
monoclonal O O O O
antibodies O O O O
in O O O O
their O O O O
ability O O O O
to O O O O
react O O O O
with O O O O
targeted O O O O
regions O O O O
of O O O O
viral O O O O
proteins O O O O
. O O O O
    
A O O O O
versatile O O O O
vector O O O O
for O O O O
the O O O O
production O O O O
of O O O O
pseudotyped O O O O
viruses O O O O
expressing O O O O
gp120 O O O O
antigens O O O O
from O O O O
different O O O O
clades O O O O
of O O O O
primary O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
isolates O O O O
. O O O O
    
A O O O O
novel O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Env O O O O
expression O O O O
vector O O O O
( O O O O
SF162 O O O O
- O O O O
Z O O O O
) O O O O
was O O O O
developed O O O O
by O O O O
introducing O O O O
two O O O O
new O O O O
cloning O O O O
sites O O O O
on O O O O
the O O O O
backbone O O O O
of O O O O
an O O O O
existing O O O O
vector O O O O
that O O O O
produces O O O O
a O O O O
full O O O O
length O O O O
Env O O O O
from O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
SF162 O O O O
isolate O O O O
. O O O O
    
These O O O O
sites O O O O
facilitate O O O O
the O O O O
swapping O O O O
of O O O O
the O O O O
gp120 O O O O
portion O O O O
of O O O O
the O O O O
SF162 O O O O
Env O O O O
with O O O O
matching O O O O
gp120 O O O O
antigens O O O O
from O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
isolates O O O O
of O O O O
different O O O O
genetic O O O O
clades O O O O
. O O O O
    
Final O O O O
production O O O O
of O O O O
functional O O O O
pseudotyped O O O O
viruses O O O O
will O O O O
express O O O O
chimeric O O O O
Env O O O O
antigens O O O O
, O O O O
including O O O O
gp41 O O O O
of O O O O
the O O O O
parental O O O O
SF162 O O O O
and O O O O
gp120 O O O O
from O O O O
other O O O O
primary O O O O
isolates O O O O
. O O O O
    
This O O O O
system O O O O
is O O O O
useful O O O O
for O O O O
testing O O O O
the O O O O
neutralizing O O O O
sensitivity O O O O
of O O O O
partial O O O O
env O O O O
gene O O O O
products O O O O
frequently O O O O
identified O O O O
in O O O O
viral O O O O
quasi O O O O
species O O O O
in O O O O
patients O O O O
infected O O O O
with O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
or O O O O
when O O O O
only O O O O
partial O O O O
gp120 O O O O
gene O O O O
products O O O O
are O O O O
available O O O O
. O O O O
    
Catabolite O O O O
control O O O O
protein O O O O
A O O O O
controls O O O O
hydrogen O O O O
peroxide O O O O
production O O O O
and O O O O
cell O O O O
death O O O O
in O O O O
Streptococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sanguinis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Streptococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sanguinis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
a O O O O
commensal O O O O
oral O O O O
bacterium O O O O
producing O O O O
hydrogen O O O O
peroxide O O O O
( O O O O
H2O2 O O O O
) O O O O
that O O O O
is O O O O
dependent O O O O
on O O O O
pyruvate O O O O
oxidase O O O O
( O O O O
Spx O O O O
) O O O O
activity O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
to O O O O
its O O O O
well O O O O
- O O O O
known O O O O
role O O O O
in O O O O
bacterial O O O O
antagonism O O O O
during O O O O
interspecies O O O O
competition O O O O
, O O O O
H2O2 O O O O
causes O O O O
cell O O O O
death O O O O
in O O O O
about O O O O
10 O O O O
% O O O O
of O O O O
the O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sanguinis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
population O O O O
. O O O O
    
As O O O O
a O O O O
consequence O O O O
of O O O O
H2O2 O O O O
- O O O O
induced O O O O
cell O O O O
death O O O O
, O O O O
largely O O O O
intact O O O O
chromosomal O O O O
DNA O O O O
is O O O O
released O O O O
into O O O O
the O O O O
environment O O O O
. O O O O
    
This O O O O
extracellular O O O O
DNA O O O O
( O O O O
eDNA O O O O
) O O O O
contributes O O O O
to O O O O
the O O O O
self O O O O
- O O O O
aggregation O O O O
phenotype O O O O
under O O O O
aerobic O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
To O O O O
further O O O O
investigate O O O O
the O O O O
regulation O O O O
of O O O O
spx O O O O
gene O O O O
expression O O O O
, O O O O
we O O O O
assessed O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
catabolite O O O O
control O O O O
protein O O O O
A O O O O
( O O O O
CcpA O O O O
) O O O O
in O O O O
spx O O O O
expression O O O O
control O O O O
. O O O O
    
We O O O O
report O O O O
here O O O O
that O O O O
CcpA O O O O
represses O O O O
spx O O O O
expression O O O O
. O O O O
    
An O O O O
isogenic O O O O
DeltaccpA O O O O
mutant O O O O
showed O O O O
elevated O O O O
spx O O O O
expression O O O O
, O O O O
increased O O O O
Spx O O O O
abundance O O O O
, O O O O
and O O O O
H2O2 O O O O
production O O O O
, O O O O
whereas O O O O
the O O O O
wild O O O O
type O O O O
did O O O O
not O O O O
respond O O O O
with O O O O
altered O O O O
spx O O O O
expression O O O O
in O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
glucose O O O O
and O O O O
other O O O O
carbohydrates O O O O
. O O O O
    
Since O O O O
H2O2 O O O O
is O O O O
directly O O O O
involved O O O O
in O O O O
the O O O O
release O O O O
of O O O O
eDNA O O O O
and O O O O
bacterial O O O O
cell O O O O
death O O O O
, O O O O
the O O O O
presented O O O O
data O O O O
suggest O O O O
that O O O O
CcpA O O O O
is O O O O
a O O O O
central O O O O
control O O O O
element O O O O
in O O O O
this O O O O
important O O O O
developmental O O O O
process O O O O
in O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sanguinis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Genome O O O O
sequence O O O O
of O O O O
strain O O O O
HTCC2083 O O O O
, O O O O
a O O O O
novel O O O O
member O O O O
of O O O O
the O O O O
marine O O O O
clade O O O O
Roseobacter O O O O
. O O O O
    
Strain O O O O
HTCC2083 O O O O
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
Oregon O O O O
seawater O O O O
using O O O O
dilution O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
extinction O O O O
culturing O O O O
and O O O O
represents O O O O
a O O O O
novel O O O O
member O O O O
of O O O O
the O O O O
Roseobacter O O O O
clade O O O O
. O O O O
    
The O O O O
draft O O O O
genome O O O O
sequence O O O O
of O O O O
HTCC2083 O O O O
is O O O O
presented O O O O
here O O O O
. O O O O
    
The O O O O
genome O O O O
is O O O O
predicted O O O O
to O O O O
contain O O O O
genes O O O O
for O O O O
aerobic O O O O
anoxygenic O O O O
phototrophy O O O O
, O O O O
sulfite O O O O
- O O O O
oxidizing O O O O
chemolithotrophy O O O O
, O O O O
anapleurotic O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
fixation O O O O
, O O O O
carbon O O O O
monoxide O O O O
oxidation O O O O
, O O O O
and O O O O
dimethylsulfoniopropionate O O O O
( O O O O
DMSP O O O O
) O O O O
utilization O O O O
. O O O O
    
Cadherin O O O O
domains O O O O
in O O O O
the O O O O
polysaccharide O O O O
- O O O O
degrading O O O O
marine O O O O
bacterium O O O O
Saccharophagus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
degradans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
2 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
40 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
are O O O O
carbohydrate O O O O
- O O O O
binding O O O O
modules O O O O
. O O O O
    
The O O O O
complex O O O O
polysaccharide O O O O
- O O O O
degrading O O O O
marine O O O O
bacterium O O O O
Saccharophagus O O O O
degradans O O O O
strain O O O O
2 O O O O
- O O O O
40 O O O O
produces O O O O
putative O O O O
proteins O O O O
that O O O O
contain O O O O
numerous O O O O
cadherin O O O O
and O O O O
cadherin O O O O
- O O O O
like O O O O
domains O O O O
involved O O O O
in O O O O
intercellular O O O O
contact O O O O
interactions O O O O
. O O O O
    
The O O O O
current O O O O
study O O O O
reveals O O O O
that O O O O
both O O O O
domain O O O O
types O O O O
exhibit O O O O
reversible O O O O
calcium O O O O
- O O O O
dependent O O O O
binding O O O O
to O O O O
different O O O O
complex O O O O
polysaccharides O O O O
which O O O O
serve O O O O
as O O O O
growth O O O O
substrates O O O O
for O O O O
the O O O O
bacterium O O O O
. O O O O
    
Distinct O O O O
roles O O O O
of O O O O
multiple O O O O
NDH O O O O
- O O O O
1 O O O O
complexes O O O O
in O O O O
the O O O O
cyanobacterial O O O O
electron O O O O
transport O O O O
network O O O O
as O O O O
revealed O O O O
by O O O O
kinetic O O O O
analysis O O O O
of O O O O
P700 O O O O
+ O O O O
reduction O O O O
in O O O O
various O O O O
Ndh O O O O
- O O O O
deficient O O O O
mutants O O O O
of O O O O
Synechocystis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
PCC6803 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
While O O O O
methyl O O O O
viologen O O O O
had O O O O
only O O O O
a O O O O
small O O O O
effect O O O O
on O O O O
P700 O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
rereduction O O O O
kinetics O O O O
after O O O O
far O O O O
- O O O O
red O O O O
pulses O O O O
in O O O O
KCN O O O O
- O O O O
treated O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
Synechocystis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
PCC6803 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
an O O O O
NdhF3 O O O O
/ O O O O
NdhF4 O O O O
( O O O O
NdhF3 O O O O
/ O O O O
F4 O O O O
) O O O O
- O O O O
defective O O O O
mutant O O O O
, O O O O
it O O O O
involved O O O O
a O O O O
rather O O O O
slow O O O O
P700 O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
rereduction O O O O
in O O O O
an O O O O
NdhF1 O O O O
- O O O O
defective O O O O
mutant O O O O
. O O O O
    
This O O O O
strongly O O O O
indicates O O O O
that O O O O
( O O O O
i O O O O
) O O O O
active O O O O
electron O O O O
flow O O O O
from O O O O
metabolites O O O O
to O O O O
plastoquinone O O O O
is O O O O
suppressed O O O O
upon O O O O
deletion O O O O
of O O O O
ndhF1 O O O O
and O O O O
( O O O O
ii O O O O
) O O O O
photosystem O O O O
1 O O O O
- O O O O
mediated O O O O
cyclic O O O O
electron O O O O
transport O O O O
is O O O O
dependent O O O O
on O O O O
NdhF3 O O O O
/ O O O O
F4 O O O O
- O O O O
type O O O O
NDH O O O O
- O O O O
1 O O O O
complexes O O O O
. O O O O
    
Adhesive O O O O
activity O O O O
of O O O O
the O O O O
haemophilus O O O O
cryptic O O O O
genospecies O O O O
cha O O O O
autotransporter O O O O
is O O O O
modulated O O O O
by O O O O
variation O O O O
in O O O O
tandem O O O O
Peptide O O O O
repeats O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Haemophilus O O O O
cryptic O O O O
genospecies O O O O
is O O O O
an O O O O
important O O O O
cause O O O O
of O O O O
maternal O O O O
genital O O O O
tract O O O O
and O O O O
neonatal O O O O
systemic O O O O
infections O O O O
and O O O O
initiates O O O O
infection O O O O
by O O O O
colonizing O O O O
the O O O O
genital O O O O
or O O O O
respiratory O O O O
epithelium O O O O
. O O O O
    
In O O O O
recent O O O O
work O O O O
, O O O O
we O O O O
identified O O O O
a O O O O
unique O O O O
Haemophilus O O O O
cryptic O O O O
genospecies O O O O
protein O O O O
called O O O O
Cha O O O O
, O O O O
which O O O O
mediates O O O O
efficient O O O O
adherence O O O O
to O O O O
genital O O O O
and O O O O
respiratory O O O O
epithelia O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Cha O O O O
adhesin O O O O
belongs O O O O
to O O O O
the O O O O
trimeric O O O O
autotransporter O O O O
family O O O O
and O O O O
contains O O O O
an O O O O
N O O O O
- O O O O
terminal O O O O
signal O O O O
peptide O O O O
, O O O O
an O O O O
internal O O O O
passenger O O O O
domain O O O O
that O O O O
harbors O O O O
adhesive O O O O
activity O O O O
, O O O O
and O O O O
a O O O O
C O O O O
- O O O O
terminal O O O O
membrane O O O O
anchor O O O O
domain O O O O
. O O O O
    
The O O O O
passenger O O O O
domain O O O O
in O O O O
Cha O O O O
contains O O O O
clusters O O O O
of O O O O
YadA O O O O
- O O O O
like O O O O
head O O O O
domains O O O O
and O O O O
neck O O O O
motifs O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
a O O O O
series O O O O
of O O O O
tandem O O O O
28 O O O O
- O O O O
amino O O O O
- O O O O
acid O O O O
peptide O O O O
repeats O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
current O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
report O O O O
that O O O O
variation O O O O
in O O O O
peptide O O O O
repeat O O O O
number O O O O
gradually O O O O
modulates O O O O
Cha O O O O
adhesive O O O O
activity O O O O
, O O O O
associated O O O O
with O O O O
a O O O O
direct O O O O
effect O O O O
on O O O O
the O O O O
length O O O O
of O O O O
Cha O O O O
fibers O O O O
on O O O O
the O O O O
bacterial O O O O
cell O O O O
surface O O O O
. O O O O
    
The O O O O
N O O O O
- O O O O
terminal O O O O
404 O O O O
residues O O O O
of O O O O
the O O O O
Cha O O O O
passenger O O O O
domain O O O O
mediate O O O O
binding O O O O
to O O O O
host O O O O
cells O O O O
and O O O O
also O O O O
facilitate O O O O
bacterial O O O O
aggregation O O O O
through O O O O
intermolecular O O O O
Cha O O O O
- O O O O
Cha O O O O
binding O O O O
. O O O O
    
As O O O O
the O O O O
tandem O O O O
peptide O O O O
repeats O O O O
expand O O O O
, O O O O
the O O O O
Cha O O O O
fiber O O O O
becomes O O O O
longer O O O O
and O O O O
Cha O O O O
adherence O O O O
activity O O O O
decreases O O O O
. O O O O
    
The O O O O
expansion O O O O
and O O O O
contraction O O O O
of O O O O
peptide O O O O
repeats O O O O
represent O O O O
a O O O O
novel O O O O
mechanism O O O O
for O O O O
modulating O O O O
adhesive O O O O
capacity O O O O
, O O O O
potentially O O O O
balancing O O O O
the O O O O
need O O O O
of O O O O
the O O O O
organism O O O O
to O O O O
colonize O O O O
the O O O O
genital O O O O
and O O O O
respiratory O O O O
tracts O O O O
with O O O O
the O O O O
ability O O O O
to O O O O
attach O O O O
to O O O O
alternative O O O O
substrates O O O O
, O O O O
disperse O O O O
within O O O O
the O O O O
host O O O O
, O O O O
or O O O O
evade O O O O
the O O O O
host O O O O
immune O O O O
system O O O O
. O O O O
    
Complete O O O O
genome O O O O
sequence O O O O
of O O O O
strain O O O O
HTCC2503T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
of O O O O
Parvularcula B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bermudensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
the O O O O
type O O O O
species O O O O
of O O O O
the O O O O
order O O O O
Parvularculales O O O O
in O O O O
the O O O O
class O O O O
Alphaproteobacteria O O O O
. O O O O
    
The O O O O
order O O O O
Parvularculales O O O O
represents O O O O
the O O O O
seventh O O O O
order O O O O
in O O O O
the O O O O
class O O O O
Alphaproteobacteria O O O O
. O O O O
    
Parvularcula B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bermudensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
the O O O O
type O O O O
species O O O O
of O O O O
the O O O O
order O O O O
, O O O O
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
the O O O O
Sargasso O O O O
Sea O O O O
using O O O O
dilution O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
extinction O O O O
culturing O O O O
. O O O O
    
We O O O O
present O O O O
here O O O O
the O O O O
complete O O O O
genome O O O O
sequence O O O O
of O O O O
Parvularcula B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bermudensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
HTCC2503 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
which O O O O
contains O O O O
genes O O O O
for O O O O
carotenoid O O O O
biosynthesis O O O O
, O O O O
dimethylsulfoniopropionate O O O O
demethylase O O O O
, O O O O
and O O O O
transduction O O O O
- O O O O
like O O O O
gene O O O O
transfer O O O O
agents O O O O
. O O O O
    
Complete O O O O
genome O O O O
sequence O O O O
of O O O O
Corynebacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pseudotuberculosis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
I19 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
a O O O O
strain O O O O
isolated O O O O
from O O O O
a O O O O
cow B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
in O O O O
Israel O O O O
with O O O O
bovine O O O O
mastitis O O O O
. O O O O
    
This O O O O
work O O O O
reports O O O O
the O O O O
completion O O O O
and O O O O
annotation O O O O
of O O O O
the O O O O
genome O O O O
sequence O O O O
of O O O O
Corynebacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pseudotuberculosis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
I19 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
isolated O O O O
from O O O O
an O O O O
Israeli O O O O
dairy O O O O
cow B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
with O O O O
severe O O O O
clinical O O O O
mastitis O O O O
. O O O O
    
To O O O O
present O O O O
the O O O O
whole O O O O
- O O O O
genome O O O O
sequence O O O O
, O O O O
a O O O O
de O O O O
novo O O O O
assembly O O O O
approach O O O O
using O O O O
33 O O O O
million O O O O
short O O O O
( O O O O
25 O O O O
- O O O O
bp O O O O
) O O O O
mate O O O O
- O O O O
paired O O O O
SOLiD O O O O
reads O O O O
only O O O O
was O O O O
applied O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
the O O O O
automatic O O O O
, O O O O
functional O O O O
, O O O O
and O O O O
manual O O O O
annotations O O O O
were O O O O
attained O O O O
with O O O O
the O O O O
use O O O O
of O O O O
several O O O O
algorithms O O O O
in O O O O
a O O O O
multistep O O O O
process O O O O
. O O O O
    
X O O O O
- O O O O
ray O O O O
structure O O O O
and O O O O
site O O O O
- O O O O
directed O O O O
mutagenesis O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
colicin O O O O
M O O O O
immunity O O O O
protein O O O O
. O O O O
    
Colicin O O O O
M O O O O
( O O O O
ColM O O O O
) O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
produced O O O O
by O O O O
some O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strains O O O O
to O O O O
kill O O O O
competitor O O O O
strains O O O O
from O O O O
the O O O O
same O O O O
or O O O O
related O O O O
species O O O O
, O O O O
was O O O O
recently O O O O
shown O O O O
to O O O O
inhibit O O O O
cell O O O O
wall O O O O
peptidoglycan O O O O
biosynthesis O O O O
through O O O O
enzymatic O O O O
degradation O O O O
of O O O O
its O O O O
lipid O O O O
II O O O O
precursor O O O O
. O O O O
    
ColM O O O O
- O O O O
producing O O O O
strains O O O O
are O O O O
protected O O O O
from O O O O
the O O O O
toxin O O O O
that O O O O
they O O O O
produce O O O O
by O O O O
coexpression O O O O
of O O O O
a O O O O
specific O O O O
immunity O O O O
protein O O O O
, O O O O
named O O O O
Cmi O O O O
, O O O O
whose O O O O
mode O O O O
of O O O O
action O O O O
still O O O O
remains O O O O
to O O O O
be O O O O
identified O O O O
. O O O O
    
We O O O O
report O O O O
here O O O O
the O O O O
resolution O O O O
of O O O O
the O O O O
crystal O O O O
structure O O O O
of O O O O
Cmi O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
composed O O O O
of O O O O
four O O O O
Beta O O O O
strands O O O O
and O O O O
four O O O O
alpha O O O O
helices O O O O
. O O O O
    
This O O O O
rather O O O O
compact O O O O
structure O O O O
revealed O O O O
a O O O O
disulfide O O O O
bond O O O O
between O O O O
residues O O O O
Cys31 O O O O
and O O O O
Cys107 O O O O
. O O O O
    
Interestingly O O O O
, O O O O
these O O O O
two O O O O
cysteines O O O O
and O O O O
several O O O O
other O O O O
residues O O O O
appeared O O O O
to O O O O
be O O O O
conserved O O O O
in O O O O
the O O O O
sequences O O O O
of O O O O
several O O O O
proteins O O O O
of O O O O
unknown O O O O
function O O O O
belonging O O O O
to O O O O
the O O O O
YebF O O O O
family O O O O
which O O O O
exhibit O O O O
25 O O O O
to O O O O
35 O O O O
% O O O O
overall O O O O
sequence O O O O
similarity O O O O
with O O O O
Cmi O O O O
. O O O O
    
Site O O O O
- O O O O
directed O O O O
mutagenesis O O O O
was O O O O
performed O O O O
to O O O O
assess O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
these O O O O
residues O O O O
in O O O O
the O O O O
ColM O O O O
immunity O O O O
- O O O O
conferring O O O O
activity O O O O
of O O O O
Cmi O O O O
, O O O O
which O O O O
showed O O O O
that O O O O
the O O O O
disulfide O O O O
bond O O O O
and O O O O
residues O O O O
from O O O O
the O O O O
C O O O O
- O O O O
terminal O O O O
extremity O O O O
of O O O O
the O O O O
protein O O O O
were O O O O
functionally O O O O
essential O O O O
. O O O O
    
The O O O O
involvement O O O O
of O O O O
DsbA O O O O
oxidase O O O O
in O O O O
the O O O O
formation O O O O
of O O O O
the O O O O
Cmi O O O O
disulfide O O O O
bond O O O O
is O O O O
also O O O O
demonstrated O O O O
. O O O O
    
Complete O O O O
genome O O O O
sequence O O O O
of O O O O
Bifidobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bifidum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
S17 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
report O O O O
on O O O O
the O O O O
first O O O O
completely O O O O
annotated O O O O
genome O O O O
sequence O O O O
of O O O O
a O O O O
Bifidobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bifidum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O O O O
. O O O O
    
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bifidum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
S17 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
isolated O O O O
from O O O O
feces O O O O
of O O O O
a O O O O
breast O O O O
- O O O O
fed O O O O
infant O O O O
, O O O O
was O O O O
shown O O O O
to O O O O
strongly O O O O
adhere O O O O
to O O O O
intestinal O O O O
epithelial O O O O
cells O O O O
and O O O O
has O O O O
potent O O O O
anti O O O O
- O O O O
inflammatory O O O O
activity O O O O
in O O O O
vitro O O O O
and O O O O
in O O O O
vivo O O O O
. O O O O
    
The O O O O
genome O O O O
sequence O O O O
will O O O O
provide O O O O
new O O O O
insights O O O O
into O O O O
the O O O O
biology O O O O
of O O O O
this O O O O
potential O O O O
probiotic O O O O
organism O O O O
and O O O O
allow O O O O
for O O O O
the O O O O
characterization O O O O
of O O O O
the O O O O
molecular O O O O
mechanisms O O O O
underlying O O O O
its O O O O
beneficial O O O O
properties O O O O
. O O O O
    
Complete O O O O
genome O O O O
sequence O O O O
of O O O O
strain O O O O
HTCC2170 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
a O O O O
novel O O O O
member O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Maribacter O O O O
in O O O O
the O O O O
family O O O O
Flavobacteriaceae O O O O
. O O O O
    
Strain O O O O
HTCC2170 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
surface O O O O
waters O O O O
off O O O O
the O O O O
Oregon O O O O
coast O O O O
using O O O O
dilution O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
extinction O O O O
culturing O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
present O O O O
the O O O O
finished O O O O
genome O O O O
sequence O O O O
of O O O O
a O O O O
marine B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bacterium O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Maribacter B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
HTCC2170 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Strain O O O O
sp O O O O
. O O O O
    
HTCC2170 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
is O O O O
predicted O O O O
to O O O O
be O O O O
a O O O O
facultatively O O O O
aerobic O O O O
chemoorganotroph O O O O
that O O O O
, O O O O
based O O O O
on O O O O
genomic O O O O
sequence O O O O
analysis O O O O
, O O O O
is O O O O
capable O O O O
of O O O O
macromolecule O O O O
degradation O O O O
and O O O O
anaerobic O O O O
respiration O O O O
. O O O O
    
Characterization O O O O
of O O O O
the O O O O
Bacteroides O O O O
CTnDOT O O O O
regulatory O O O O
protein O O O O
RteC O O O O
. O O O O
    
Excision O O O O
of O O O O
the O O O O
Bacteroides O O O O
conjugative O O O O
transposon O O O O
CTnDOT O O O O
is O O O O
stimulated O O O O
by O O O O
tetracycline O O O O
. O O O O
    
It O O O O
was O O O O
shown O O O O
previously O O O O
that O O O O
a O O O O
gene O O O O
, O O O O
rteC O O O O
, O O O O
is O O O O
necessary O O O O
for O O O O
tetracycline O O O O
- O O O O
stimulated O O O O
transcriptional O O O O
regulation O O O O
of O O O O
the O O O O
orf2c O O O O
operon O O O O
, O O O O
which O O O O
contains O O O O
the O O O O
excision O O O O
genes O O O O
. O O O O
    
The O O O O
protein O O O O
encoded O O O O
by O O O O
this O O O O
gene O O O O
, O O O O
RteC O O O O
, O O O O
did O O O O
not O O O O
have O O O O
primary O O O O
amino O O O O
acid O O O O
sequence O O O O
homology O O O O
to O O O O
any O O O O
known O O O O
proteins O O O O
in O O O O
the O O O O
databases O O O O
. O O O O
    
Accordingly O O O O
, O O O O
we O O O O
sought O O O O
structural O O O O
homologs O O O O
of O O O O
RteC O O O O
. O O O O
    
A O O O O
three O O O O
- O O O O
dimensional O O O O
structure O O O O
prediction O O O O
by O O O O
Robetta O O O O
suggested O O O O
that O O O O
RteC O O O O
might O O O O
have O O O O
two O O O O
domains O O O O
and O O O O
that O O O O
the O O O O
C O O O O
- O O O O
terminal O O O O
domain O O O O
might O O O O
have O O O O
a O O O O
winged O O O O
helix O O O O
motif O O O O
. O O O O
    
Based O O O O
on O O O O
the O O O O
Robetta O O O O
prediction O O O O
, O O O O
the O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
transcriptional O O O O
factors O O O O
E2F O O O O
- O O O O
4 O O O O
and O O O O
DP2 O O O O
were O O O O
identified O O O O
as O O O O
the O O O O
most O O O O
likely O O O O
structural O O O O
homologs O O O O
of O O O O
RteC O O O O
. O O O O
    
We O O O O
made O O O O
alanine O O O O
substitutions O O O O
within O O O O
the O O O O
putative O O O O
DNA O O O O
binding O O O O
helix O O O O
3 O O O O
region O O O O
of O O O O
RteC O O O O
. O O O O
    
Assays O O O O
of O O O O
orf2c O O O O
: O O O O
: O O O O
uidA O O O O
activation O O O O
by O O O O
alanine O O O O
mutants O O O O
indicated O O O O
that O O O O
residues O O O O
174 O O O O
, O O O O
175 O O O O
, O O O O
178 O O O O
, O O O O
180 O O O O
, O O O O
and O O O O
184 O O O O
in O O O O
helix O O O O
3 O O O O
might O O O O
contact O O O O
the O O O O
upstream O O O O
region O O O O
of O O O O
P O O O O
( O O O O
E O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
upstream O O O O
region O O O O
of O O O O
orf2c O O O O
contained O O O O
two O O O O
inverted O O O O
- O O O O
repeat O O O O
half O O O O
sites O O O O
. O O O O
    
Mutational O O O O
analysis O O O O
of O O O O
these O O O O
half O O O O
sites O O O O
showed O O O O
that O O O O
both O O O O
half O O O O
sites O O O O
are O O O O
important O O O O
for O O O O
activity O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
we O O O O
have O O O O
identified O O O O
the O O O O
DNA O O O O
binding O O O O
portion O O O O
of O O O O
RteC O O O O
and O O O O
the O O O O
DNA O O O O
site O O O O
to O O O O
which O O O O
it O O O O
binds O O O O
. O O O O
    
Draft O O O O
genome O O O O
sequence O O O O
of O O O O
the O O O O
anoxygenic O O O O
filamentous O O O O
phototrophic O O O O
bacterium O O O O
Oscillochloris B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trichoides O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
subsp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
DG O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
6 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Oscillochloris B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trichoides O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
a O O O O
mesophilic O O O O
, O O O O
filamentous O O O O
, O O O O
photoautotrophic O O O O
, O O O O
nonsulfur O O O O
, O O O O
diazotrophic O O O O
bacterium O O O O
which O O O O
is O O O O
capable O O O O
of O O O O
carbon O O O O
dioxide O O O O
fixation O O O O
via O O O O
the O O O O
reductive O O O O
pentose O O O O
phosphate O O O O
cycle O O O O
and O O O O
possesses O O O O
no O O O O
assimilative O O O O
sulfate O O O O
reduction O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
present O O O O
the O O O O
draft O O O O
genome O O O O
sequence O O O O
of O O O O
Oscillochloris B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trichoides O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
subsp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
DG O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
6 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
the O O O O
type O O O O
strain O O O O
of O O O O
the O O O O
species O O O O
, O O O O
which O O O O
has O O O O
permitted O O O O
the O O O O
prediction O O O O
of O O O O
genes O O O O
for O O O O
carbon O O O O
and O O O O
nitrogen O O O O
metabolism O O O O
and O O O O
for O O O O
the O O O O
light O O O O
- O O O O
harvesting O O O O
apparatus O O O O
. O O O O
    
Impact O O O O
of O O O O
density O O O O
and O O O O
environmental O O O O
factors O O O O
on O O O O
population O O O O
fluctuations O O O O
in O O O O
a O O O O
migratory O O O O
passerine O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Populations O O O O
of O O O O
plants O O O O
and O O O O
animals O O O O
typically O O O O
fluctuate O O O O
because O O O O
of O O O O
the O O O O
combined O O O O
effects O O O O
of O O O O
density O O O O
- O O O O
dependent O O O O
and O O O O
density O O O O
- O O O O
independent O O O O
processes O O O O
. O O O O
    
The O O O O
study O O O O
of O O O O
these O O O O
processes O O O O
is O O O O
complicated O O O O
by O O O O
the O O O O
fact O O O O
that O O O O
population O O O O
sizes O O O O
are O O O O
typically O O O O
not O O O O
known O O O O
exactly O O O O
, O O O O
because O O O O
population O O O O
counts O O O O
are O O O O
subject O O O O
to O O O O
sampling O O O O
variance O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
the O O O O
existence O O O O
of O O O O
sampling O O O O
variance O O O O
is O O O O
broadly O O O O
acknowledged O O O O
, O O O O
relatively O O O O
few O O O O
studies O O O O
on O O O O
time O O O O
- O O O O
series O O O O
data O O O O
have O O O O
accounted O O O O
for O O O O
it O O O O
, O O O O
which O O O O
can O O O O
result O O O O
in O O O O
wrong O O O O
inferences O O O O
about O O O O
population O O O O
processes O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
To O O O O
increase O O O O
our O O O O
understanding O O O O
of O O O O
population O O O O
dynamics O O O O
, O O O O
we O O O O
analysed O O O O
time O O O O
series O O O O
from O O O O
six O O O O
Central O O O O
European O O O O
populations O O O O
of O O O O
the O O O O
migratory O O O O
red B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
backed O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
shrike O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Lanius B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
collurio O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
by O O O O
simultaneously O O O O
assessing O O O O
the O O O O
strength O O O O
of O O O O
density O O O O
dependence O O O O
, O O O O
process O O O O
and O O O O
sampling O O O O
variance O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
, O O O O
we O O O O
evaluated O O O O
hypotheses O O O O
predicting O O O O
effects O O O O
of O O O O
factors O O O O
presumed O O O O
to O O O O
operate O O O O
on O O O O
the O O O O
breeding O O O O
grounds O O O O
, O O O O
at O O O O
stopover O O O O
sites O O O O
in O O O O
eastern O O O O
Africa O O O O
during O O O O
fall O O O O
and O O O O
spring O O O O
migration O O O O
and O O O O
in O O O O
the O O O O
wintering O O O O
grounds O O O O
in O O O O
southern O O O O
Africa O O O O
. O O O O
    
We O O O O
used O O O O
both O O O O
simple O O O O
and O O O O
state O O O O
- O O O O
space O O O O
formulations O O O O
of O O O O
the O O O O
Gompertz O O O O
equation O O O O
to O O O O
model O O O O
population O O O O
size O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Across O O O O
populations O O O O
and O O O O
modelling O O O O
approaches O O O O
, O O O O
we O O O O
found O O O O
consistent O O O O
evidence O O O O
for O O O O
negative O O O O
density O O O O
- O O O O
dependent O O O O
population O O O O
regulation O O O O
. O O O O
    
Further O O O O
, O O O O
process O O O O
variance O O O O
contributed O O O O
substantially O O O O
to O O O O
variation O O O O
in O O O O
population O O O O
size O O O O
, O O O O
while O O O O
sampling O O O O
variance O O O O
did O O O O
not O O O O
. O O O O
    
Environmental O O O O
conditions O O O O
in O O O O
eastern O O O O
and O O O O
southern O O O O
Africa O O O O
appear O O O O
to O O O O
influence O O O O
breeding O O O O
population O O O O
size O O O O
, O O O O
as O O O O
rainfall O O O O
in O O O O
the O O O O
Sahel O O O O
during O O O O
fall O O O O
migration O O O O
and O O O O
in O O O O
the O O O O
south O O O O
African O O O O
wintering O O O O
areas O O O O
were O O O O
positively O O O O
related O O O O
to O O O O
population O O O O
size O O O O
in O O O O
the O O O O
following O O O O
spring O O O O
in O O O O
four O O O O
of O O O O
six O O O O
populations O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
, O O O O
environmental O O O O
conditions O O O O
in O O O O
the O O O O
breeding O O O O
grounds O O O O
were O O O O
not O O O O
related O O O O
to O O O O
population O O O O
size O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
findings O O O O
suggest O O O O
negative O O O O
density O O O O
- O O O O
dependent O O O O
regulation O O O O
of O O O O
red B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
backed O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
shrike O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
breeding O O O O
populations O O O O
and O O O O
are O O O O
consistent O O O O
with O O O O
the O O O O
long O O O O
- O O O O
standing O O O O
hypothesis O O O O
that O O O O
conditions O O O O
in O O O O
the O O O O
African O O O O
staging O O O O
and O O O O
wintering O O O O
areas O O O O
influence O O O O
population O O O O
numbers O O O O
of O O O O
species O O O O
breeding O O O O
in O O O O
Europe O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
highlights O O O O
the O O O O
importance O O O O
of O O O O
jointly O O O O
investigating O O O O
density O O O O
- O O O O
dependent O O O O
and O O O O
density O O O O
- O O O O
independent O O O O
processes O O O O
to O O O O
improve O O O O
our O O O O
understanding O O O O
of O O O O
factors O O O O
influencing O O O O
population O O O O
fluctuations O O O O
in O O O O
space O O O O
and O O O O
time O O O O
. O O O O
    
Intraspecific O O O O
trait O O O O
variation O O O O
and O O O O
covariation O O O O
in O O O O
a O O O O
widespread O O O O
tree O O O O
species O O O O
( O O O O
Nothofagus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pumilio O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
in O O O O
southern O O O O
Chile O O O O
. O O O O
    
* O O O O
The O O O O
focus O O O O
of O O O O
the O O O O
trait O O O O
- O O O O
based O O O O
approach O O O O
to O O O O
study O O O O
community O O O O
ecology O O O O
has O O O O
mostly O O O O
been O O O O
on O O O O
trait O O O O
comparisons O O O O
at O O O O
the O O O O
interspecific O O O O
level O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
quantified O O O O
intraspecific O O O O
variation O O O O
and O O O O
covariation O O O O
of O O O O
leaf O O O O
mass O O O O
per O O O O
area O O O O
( O O O O
LMA O O O O
) O O O O
and O O O O
wood O O O O
density O O O O
( O O O O
WD O O O O
) O O O O
in O O O O
monospecific O O O O
forests O O O O
of O O O O
the O O O O
widespread O O O O
tree O O O O
species O O O O
Nothofagus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pumilio O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
to O O O O
determine O O O O
its O O O O
magnitude O O O O
and O O O O
whether O O O O
it O O O O
is O O O O
related O O O O
to O O O O
environmental O O O O
conditions O O O O
and O O O O
ontogeny O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
discuss O O O O
probable O O O O
mechanisms O O O O
controlling O O O O
the O O O O
trait O O O O
variation O O O O
found O O O O
. O O O O
    
* O O O O
We O O O O
collected O O O O
leaf O O O O
and O O O O
stem O O O O
woody O O O O
tissues O O O O
from O O O O
30 O O O O
- O O O O
50 O O O O
trees O O O O
of O O O O
different O O O O
ages O O O O
( O O O O
ontogeny O O O O
) O O O O
from O O O O
each O O O O
of O O O O
four O O O O
populations O O O O
at O O O O
differing O O O O
elevations O O O O
( O O O O
i O O O O
. O O O O
e O O O O
. O O O O
temperatures O O O O
) O O O O
and O O O O
placed O O O O
at O O O O
each O O O O
of O O O O
three O O O O
locations O O O O
differing O O O O
in O O O O
soil O O O O
moisture O O O O
. O O O O
    
* O O O O
The O O O O
total O O O O
variation O O O O
in O O O O
LMA O O O O
( O O O O
coefficient O O O O
of O O O O
variation O O O O
( O O O O
CV O O O O
) O O O O
= O O O O
21 O O O O
. O O O O
14 O O O O
% O O O O
) O O O O
was O O O O
twice O O O O
that O O O O
of O O O O
WD O O O O
( O O O O
CV O O O O
= O O O O
10 O O O O
. O O O O
52 O O O O
% O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
total O O O O
variation O O O O
in O O O O
traits O O O O
was O O O O
never O O O O
less O O O O
than O O O O
23 O O O O
% O O O O
when O O O O
compared O O O O
with O O O O
interspecific O O O O
studies O O O O
. O O O O
    
Differences O O O O
in O O O O
elevation O O O O
( O O O O
temperature O O O O
) O O O O
for O O O O
the O O O O
most O O O O
part O O O O
explained O O O O
variation O O O O
in O O O O
LMA O O O O
, O O O O
while O O O O
differences O O O O
in O O O O
soil O O O O
moisture O O O O
and O O O O
ontogeny O O O O
explained O O O O
the O O O O
variation O O O O
in O O O O
WD O O O O
. O O O O
    
Traits O O O O
covaried O O O O
similarly O O O O
in O O O O
the O O O O
altitudinal O O O O
gradient O O O O
only O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Functional O O O O
traits O O O O
of O O O O
N B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pumilio O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
exhibited O O O O
nonnegligible O O O O
variation O O O O
; O O O O
LMA O O O O
varied O O O O
for O O O O
the O O O O
most O O O O
part O O O O
with O O O O
temperature O O O O
, O O O O
while O O O O
WD O O O O
mostly O O O O
varied O O O O
with O O O O
moisture O O O O
and O O O O
ontogeny O O O O
. O O O O
    
We O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
environmental O O O O
variation O O O O
can O O O O
cause O O O O
important O O O O
trait O O O O
variation O O O O
without O O O O
species O O O O
turnover O O O O
. O O O O
    
Systemic O O O O
virus O O O O
- O O O O
induced O O O O
gene O O O O
silencing O O O O
allows O O O O
functional O O O O
characterization O O O O
of O O O O
maize B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
genes O O O O
during O O O O
biotrophic O O O O
interaction O O O O
with O O O O
Ustilago B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
maydis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Infection O O O O
of O O O O
maize B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
Zea B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mays O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
plants O O O O
with O O O O
the O O O O
corn B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
smut O O O O
fungus O O O O
Ustilago B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
maydis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
leads O O O O
to O O O O
the O O O O
formation O O O O
of O O O O
large O O O O
tumors O O O O
on O O O O
the O O O O
stem O O O O
, O O O O
leaves O O O O
and O O O O
inflorescences O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
biotrophic O O O O
interaction O O O O
, O O O O
plant O O O O
defense O O O O
responses O O O O
are O O O O
actively O O O O
suppressed O O O O
by O O O O
the O O O O
pathogen O O O O
, O O O O
and O O O O
previous O O O O
transcriptome O O O O
analyses O O O O
of O O O O
infected O O O O
maize B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
plants O O O O
showed O O O O
massive O O O O
and O O O O
stage O O O O
- O O O O
specific O O O O
changes O O O O
in O O O O
host O O O O
gene O O O O
expression O O O O
during O O O O
disease O O O O
progression O O O O
. O O O O
    
To O O O O
identify O O O O
maize B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
genes O O O O
that O O O O
are O O O O
functionally O O O O
involved O O O O
in O O O O
the O O O O
interaction O O O O
with O O O O
U B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
maydis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
we O O O O
adapted O O O O
a O O O O
virus O O O O
- O O O O
induced O O O O
gene O O O O
silencing O O O O
( O O O O
VIGS O O O O
) O O O O
system O O O O
based O O O O
on O O O O
the O O O O
brome O O O O
mosaic O O O O
virus O O O O
( O O O O
BMV O O O O
) O O O O
for O O O O
maize B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Conditions O O O O
were O O O O
established O O O O
that O O O O
allowed O O O O
successful O O O O
U B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
maydis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
infection O O O O
of O O O O
BMV O O O O
- O O O O
preinfected O O O O
maize O O O O
plants O O O O
. O O O O
    
This O O O O
set O O O O
- O O O O
up O O O O
enabled O O O O
quantification O O O O
of O O O O
VIGS O O O O
and O O O O
its O O O O
impact O O O O
on O O O O
U B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
maydis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
infection O O O O
using O O O O
a O O O O
quantitative O O O O
real O O O O
- O O O O
time O O O O
PCR O O O O
( O O O O
qRT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
) O O O O
- O O O O
based O O O O
readout O O O O
. O O O O
    
In O O O O
proof O O O O
- O O O O
of O O O O
- O O O O
principle O O O O
experiments O O O O
, O O O O
an O O O O
U B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
maydis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O O O O
induced O O O O
terpene O O O O
synthase O O O O
was O O O O
shown O O O O
to O O O O
negatively O O O O
regulate O O O O
disease O O O O
development O O O O
while O O O O
a O O O O
protein O O O O
involved O O O O
in O O O O
cell O O O O
death O O O O
inhibition O O O O
was O O O O
required O O O O
for O O O O
full O O O O
virulence O O O O
of O O O O
U O O O O
. O O O O
maydis O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
this O O O O
system O O O O
is O O O O
a O O O O
versatile O O O O
tool O O O O
for O O O O
the O O O O
rapid O O O O
identification O O O O
of O O O O
maize B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
genes O O O O
that O O O O
determine O O O O
compatibility O O O O
with O O O O
U B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
maydis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
second O O O O
face O O O O
of O O O O
a O O O O
known O O O O
player O O O O
: O O O O
Arabidopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
silencing O O O O
suppressor O O O O
AtXRN4 O O O O
acts O O O O
organ O O O O
- O O O O
specifically O O O O
. O O O O
    
Plant O O O O
viruses O O O O
exploit O O O O
the O O O O
symplastic O O O O
transport O O O O
pathway O O O O
provided O O O O
by O O O O
plasmodesmata O O O O
by O O O O
encoding O O O O
for O O O O
specialized O O O O
movement O O O O
proteins O O O O
, O O O O
which O O O O
interact O O O O
with O O O O
host O O O O
factors O O O O
to O O O O
enable O O O O
viral O O O O
intracellular O O O O
and O O O O
intercellular O O O O
spread O O O O
. O O O O
    
Stable O O O O
expression O O O O
of O O O O
the O O O O
Potato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
leaf O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
roll O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
movement O O O O
protein O O O O
MP17 O O O O
in O O O O
Arabidopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
results O O O O
in O O O O
a O O O O
carbohydrate O O O O
export O O O O
block O O O O
and O O O O
stunted O O O O
growth O O O O
. O O O O
    
To O O O O
identify O O O O
host O O O O
factors O O O O
essential O O O O
for O O O O
viral O O O O
infection O O O O
, O O O O
we O O O O
screened O O O O
a O O O O
progeny O O O O
population O O O O
of O O O O
EMS O O O O
( O O O O
ethyl O O O O
methanesulfonate O O O O
) O O O O
- O O O O
mutagenized O O O O
Arabidopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
expressing O O O O
a O O O O
MP17 O O O O
: O O O O
GFP O O O O
fusion O O O O
for O O O O
suppressor O O O O
mutants O O O O
with O O O O
restored O O O O
wild O O O O
type O O O O
- O O O O
like O O O O
phenotype O O O O
. O O O O
    
Two O O O O
suppressor O O O O
mutants O O O O
showed O O O O
decreased O O O O
susceptibility O O O O
against O O O O
Turnip B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mosaic O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
post O O O O
- O O O O
transcriptional O O O O
silencing O O O O
of O O O O
MP17 O O O O
: O O O O
GFP O O O O
RNA O O O O
in O O O O
source O O O O
leaves O O O O
. O O O O
    
Map O O O O
based O O O O
cloning O O O O
identified O O O O
in O O O O
both O O O O
lines O O O O
mutations O O O O
in O O O O
XRN4 O O O O
( O O O O
Exoribonuclease O O O O
4 O O O O
) O O O O
, O O O O
which O O O O
was O O O O
previously O O O O
described O O O O
as O O O O
a O O O O
suppressor O O O O
of O O O O
transgene O O O O
silencing O O O O
in O O O O
source O O O O
leaves O O O O
. O O O O
    
Importantly O O O O
, O O O O
silencing O O O O
of O O O O
MP17 O O O O
: O O O O
GFP O O O O
was O O O O
not O O O O
present O O O O
in O O O O
cotyledons O O O O
and O O O O
roots O O O O
of O O O O
the O O O O
two O O O O
suppressor O O O O
mutants O O O O
, O O O O
which O O O O
was O O O O
confirmed O O O O
in O O O O
a O O O O
third O O O O
xrn4 O O O O
T O O O O
- O O O O
DNA O O O O
knock O O O O
out O O O O
line O O O O
. O O O O
    
Subsequent O O O O
analysis O O O O
of O O O O
MP17 O O O O
: O O O O
GFP O O O O
transcript O O O O
stability O O O O
in O O O O
xrn2 O O O O
and O O O O
xrn3 O O O O
mutants O O O O
indicated O O O O
an O O O O
essential O O O O
role O O O O
of O O O O
AtXRN2 O O O O
for O O O O
silencing O O O O
suppression O O O O
in O O O O
roots O O O O
/ O O O O
cotyledons O O O O
while O O O O
AtXRN3 O O O O
appears O O O O
to O O O O
act O O O O
similar O O O O
to O O O O
AtXRN4 O O O O
in O O O O
source O O O O
leaves O O O O
, O O O O
only O O O O
. O O O O
    
Overall O O O O
, O O O O
these O O O O
findings O O O O
point O O O O
towards O O O O
an O O O O
organ O O O O
- O O O O
specific O O O O
regulation O O O O
of O O O O
gene O O O O
silencing O O O O
in O O O O
Arabidopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Haplotype O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
genes O O O O
encoding O O O O
glutamine O O O O
synthetase O O O O
plastic O O O O
isoforms O O O O
and O O O O
their O O O O
association O O O O
with O O O O
nitrogen O O O O
- O O O O
use O O O O
- O O O O
and O O O O
yield O O O O
- O O O O
related O O O O
traits O O O O
in O O O O
bread B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
wheat O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Glutamine O O O O
synthetase O O O O
( O O O O
GS O O O O
) O O O O
plays O O O O
a O O O O
key O O O O
role O O O O
in O O O O
the O O O O
growth O O O O
, O O O O
nitrogen O O O O
( O O O O
N O O O O
) O O O O
use O O O O
and O O O O
yield O O O O
potential O O O O
of O O O O
cereal O O O O
crops O O O O
. O O O O
    
Investigating O O O O
the O O O O
haplotype O O O O
variation O O O O
of O O O O
GS O O O O
genes O O O O
and O O O O
its O O O O
association O O O O
with O O O O
agronomic O O O O
traits O O O O
may O O O O
provide O O O O
useful O O O O
information O O O O
for O O O O
improving O O O O
wheat B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
N O O O O
- O O O O
use O O O O
efficiency O O O O
and O O O O
yield O O O O
. O O O O
    
We O O O O
isolated O O O O
the O O O O
promoter O O O O
and O O O O
coding O O O O
region O O O O
sequences O O O O
of O O O O
the O O O O
plastic O O O O
glutamine O O O O
synthetase O O O O
isoform O O O O
( O O O O
GS2 O O O O
) O O O O
genes O O O O
located O O O O
on O O O O
chromosomes O O O O
2A O O O O
, O O O O
2B O O O O
and O O O O
2D O O O O
in O O O O
bread B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
wheat O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
By O O O O
analyzing O O O O
nucleotide O O O O
sequence O O O O
variations O O O O
of O O O O
the O O O O
coding O O O O
region O O O O
, O O O O
two O O O O
, O O O O
six O O O O
and O O O O
two O O O O
haplotypes O O O O
were O O O O
distinguished O O O O
for O O O O
TaGS2 O O O O
- O O O O
A1 O O O O
( O O O O
a O O O O
and O O O O
b O O O O
) O O O O
, O O O O
TaGS2 O O O O
- O O O O
B1 O O O O
( O O O O
a O O O O
- O O O O
f O O O O
) O O O O
and O O O O
TaGS2 O O O O
- O O O O
D1 O O O O
( O O O O
a O O O O
and O O O O
b O O O O
) O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
By O O O O
analyzing O O O O
the O O O O
frequency O O O O
data O O O O
of O O O O
different O O O O
haplotypes O O O O
and O O O O
their O O O O
association O O O O
with O O O O
N O O O O
use O O O O
and O O O O
agronomic O O O O
traits O O O O
, O O O O
four O O O O
major O O O O
and O O O O
favorable O O O O
TaGS2 O O O O
haplotypes O O O O
( O O O O
A1b O O O O
, O O O O
B1a O O O O
, O O O O
B1b O O O O
, O O O O
D1a O O O O
) O O O O
were O O O O
revealed O O O O
. O O O O
    
These O O O O
favorable O O O O
haplotypes O O O O
may O O O O
confer O O O O
better O O O O
seedling O O O O
growth O O O O
, O O O O
better O O O O
agronomic O O O O
performance O O O O
, O O O O
and O O O O
improved O O O O
N O O O O
uptake O O O O
during O O O O
vegetative O O O O
growth O O O O
or O O O O
grain O O O O
N O O O O
concentration O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
data O O O O
suggest O O O O
that O O O O
certain O O O O
TaGS2 O O O O
haplotypes O O O O
may O O O O
be O O O O
valuable O O O O
in O O O O
breeding O O O O
wheat B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
varieties O O O O
with O O O O
improved O O O O
agronomic O O O O
performance O O O O
and O O O O
N O O O O
- O O O O
use O O O O
efficiency O O O O
. O O O O
    
The O O O O
molecular O O O O
basis O O O O
for O O O O
venation O O O O
patterning O O O O
of O O O O
pigmentation O O O O
and O O O O
its O O O O
effect O O O O
on O O O O
pollinator O O O O
attraction O O O O
in O O O O
flowers O O O O
of O O O O
Antirrhinum O O O O
. O O O O
    
Pigment O O O O
stripes O O O O
associated O O O O
with O O O O
veins O O O O
( O O O O
venation O O O O
) O O O O
is O O O O
a O O O O
common O O O O
flower O O O O
colour O O O O
pattern O O O O
. O O O O
    
The O O O O
molecular O O O O
genetics O O O O
and O O O O
function O O O O
of O O O O
venation O O O O
were O O O O
investigated O O O O
in O O O O
the O O O O
genus O O O O
Antirrhinum O O O O
, O O O O
in O O O O
which O O O O
venation O O O O
is O O O O
determined O O O O
by O O O O
Venosa O O O O
( O O O O
encoding O O O O
an O O O O
R2R3MYB O O O O
transcription O O O O
factor O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Pollinator O O O O
preferences O O O O
were O O O O
measured O O O O
by O O O O
field O O O O
tests O O O O
with O O O O
Antirrhinum O O O O
majus O O O O
. O O O O
    
Venosa O O O O
function O O O O
was O O O O
examined O O O O
using O O O O
in O O O O
situ O O O O
hybridization O O O O
and O O O O
transient O O O O
overexpression O O O O
. O O O O
    
The O O O O
origin O O O O
of O O O O
the O O O O
venation O O O O
trait O O O O
was O O O O
examined O O O O
by O O O O
molecular O O O O
phylogenetics O O O O
. O O O O
    
Venation O O O O
and O O O O
full O O O O
- O O O O
red O O O O
flower O O O O
colouration O O O O
provide O O O O
a O O O O
comparable O O O O
level O O O O
of O O O O
advantage O O O O
for O O O O
pollinator O O O O
attraction O O O O
relative O O O O
to O O O O
palely O O O O
pigmented O O O O
or O O O O
white O O O O
lines O O O O
. O O O O
    
Ectopic O O O O
expression O O O O
of O O O O
Venosa O O O O
confers O O O O
pigmentation O O O O
outside O O O O
the O O O O
veins O O O O
. O O O O
    
Venosa O O O O
transcript O O O O
is O O O O
produced O O O O
only O O O O
in O O O O
small O O O O
areas O O O O
of O O O O
the O O O O
corolla O O O O
between O O O O
the O O O O
veins O O O O
and O O O O
the O O O O
adaxial O O O O
epidermis O O O O
. O O O O
    
Phylogenetic O O O O
analyses O O O O
suggest O O O O
that O O O O
venation O O O O
patterning O O O O
is O O O O
an O O O O
ancestral O O O O
trait O O O O
in O O O O
Antirrhinum O O O O
. O O O O
    
Different O O O O
accessions O O O O
of O O O O
three O O O O
species O O O O
with O O O O
full O O O O
- O O O O
red O O O O
pigmentation O O O O
with O O O O
or O O O O
without O O O O
venation O O O O
patterning O O O O
have O O O O
been O O O O
found O O O O
. O O O O
    
Epidermal O O O O
- O O O O
specific O O O O
venation O O O O
is O O O O
defined O O O O
through O O O O
overlapping O O O O
expression O O O O
domains O O O O
of O O O O
the O O O O
MYB O O O O
( O O O O
myoblastoma O O O O
) O O O O
and O O O O
bHLH O O O O
( O O O O
basic O O O O
Helix O O O O
- O O O O
Loop O O O O
- O O O O
Helix O O O O
) O O O O
co O O O O
- O O O O
regulators O O O O
of O O O O
anthocyanin O O O O
biosynthesis O O O O
, O O O O
with O O O O
the O O O O
bHLH O O O O
providing O O O O
epidermal O O O O
specificity O O O O
and O O O O
Venosa O O O O
vein O O O O
specificity O O O O
. O O O O
    
Venation O O O O
may O O O O
be O O O O
the O O O O
ancestral O O O O
trait O O O O
, O O O O
with O O O O
full O O O O
- O O O O
red O O O O
pigmentation O O O O
a O O O O
derived O O O O
, O O O O
polyphyletic O O O O
trait O O O O
. O O O O
    
Venation O O O O
patterning O O O O
is O O O O
probably O O O O
not O O O O
fixed O O O O
once O O O O
species O O O O
evolve O O O O
full O O O O
- O O O O
red O O O O
floral O O O O
pigmentation O O O O
. O O O O
    
High O O O O
homologous O O O O
gene O O O O
conservation O O O O
despite O O O O
extreme O O O O
autopolyploid O O O O
redundancy O O O O
in O O O O
sugarcane B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Modern O O O O
sugarcane B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
Saccharum B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
spp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
is O O O O
the O O O O
leading O O O O
sugar O O O O
crop O O O O
and O O O O
a O O O O
primary O O O O
energy O O O O
crop O O O O
. O O O O
    
It O O O O
has O O O O
the O O O O
highest O O O O
level O O O O
of O O O O
' O O O O
vertical O O O O
' O O O O
redundancy O O O O
( O O O O
2n O O O O
= O O O O
12x O O O O
= O O O O
120 O O O O
) O O O O
of O O O O
all O O O O
polyploid O O O O
plants O O O O
studied O O O O
to O O O O
date O O O O
. O O O O
    
It O O O O
was O O O O
produced O O O O
about O O O O
a O O O O
century O O O O
ago O O O O
through O O O O
hybridization O O O O
between O O O O
two O O O O
autopolyploid O O O O
species O O O O
, O O O O
namely O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
officinarum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
spontaneum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
In O O O O
order O O O O
to O O O O
investigate O O O O
the O O O O
genome O O O O
dynamics O O O O
in O O O O
this O O O O
highly O O O O
polyploid O O O O
context O O O O
, O O O O
we O O O O
sequenced O O O O
and O O O O
compared O O O O
seven O O O O
hom O O O O
( O O O O
oe O O O O
) O O O O
ologous O O O O
haplotypes O O O O
( O O O O
bacterial O O O O
artificial O O O O
chromosome O O O O
clones O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
analysis O O O O
revealed O O O O
a O O O O
high O O O O
level O O O O
of O O O O
gene O O O O
retention O O O O
and O O O O
colinearity O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
high O O O O
gene O O O O
structure O O O O
and O O O O
sequence O O O O
conservation O O O O
, O O O O
with O O O O
an O O O O
average O O O O
sequence O O O O
divergence O O O O
of O O O O
4 O O O O
% O O O O
for O O O O
exons O O O O
. O O O O
    
Remarkably O O O O
, O O O O
all O O O O
of O O O O
the O O O O
hom O O O O
( O O O O
oe O O O O
) O O O O
ologous O O O O
genes O O O O
were O O O O
predicted O O O O
as O O O O
being O O O O
functional O O O O
( O O O O
except O O O O
for O O O O
one O O O O
gene O O O O
fragment O O O O
) O O O O
and O O O O
showed O O O O
signs O O O O
of O O O O
evolving O O O O
under O O O O
purifying O O O O
selection O O O O
, O O O O
with O O O O
the O O O O
exception O O O O
of O O O O
genes O O O O
within O O O O
segmental O O O O
duplications O O O O
. O O O O
    
By O O O O
contrast O O O O
, O O O O
transposable O O O O
elements O O O O
displayed O O O O
a O O O O
general O O O O
absence O O O O
of O O O O
colinearity O O O O
among O O O O
hom O O O O
( O O O O
oe O O O O
) O O O O
ologous O O O O
haplotypes O O O O
and O O O O
appeared O O O O
to O O O O
have O O O O
undergone O O O O
dynamic O O O O
expansion O O O O
in O O O O
Saccharum O O O O
, O O O O
compared O O O O
with O O O O
sorghum O O O O
, O O O O
its O O O O
close O O O O
relative O O O O
in O O O O
the O O O O
Andropogonea O O O O
tribe O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
reinforce O O O O
the O O O O
general O O O O
trend O O O O
emerging O O O O
from O O O O
recent O O O O
studies O O O O
indicating O O O O
the O O O O
diverse O O O O
and O O O O
nuanced O O O O
effect O O O O
of O O O O
polyploidy O O O O
on O O O O
genome O O O O
dynamics O O O O
. O O O O
    
Aerenchyma O O O O
formation O O O O
in O O O O
the O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
stem O O O O
and O O O O
its O O O O
promotion O O O O
by O O O O
H2O2 O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Gas O O O O
spaces O O O O
( O O O O
aerenchyma O O O O
) O O O O
form O O O O
as O O O O
an O O O O
adaptation O O O O
to O O O O
submergence O O O O
to O O O O
facilitate O O O O
gas O O O O
exchange O O O O
. O O O O
    
In O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
Oryza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sativa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
, O O O O
aerenchyma O O O O
develop O O O O
by O O O O
cell O O O O
death O O O O
and O O O O
lysis O O O O
, O O O O
which O O O O
are O O O O
poorly O O O O
understood O O O O
at O O O O
the O O O O
cellular O O O O
level O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Aerenchyma O O O O
formation O O O O
was O O O O
studied O O O O
in O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
stems O O O O
by O O O O
light O O O O
microscopy O O O O
. O O O O
    
It O O O O
was O O O O
analyzed O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
submergence O O O O
, O O O O
ethylene O O O O
and O O O O
hydrogen O O O O
peroxide O O O O
( O O O O
H O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
O O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
) O O O O
treatment O O O O
, O O O O
and O O O O
in O O O O
the O O O O
MT2b O O O O
: O O O O
: O O O O
Tos17 O O O O
mutant O O O O
. O O O O
    
O O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
* O O O O
( O O O O
- O O O O
) O O O O
was O O O O
detected O O O O
with O O O O
nitroblue O O O O
tetrazolium O O O O
and O O O O
an O O O O
epinephrine O O O O
assay O O O O
. O O O O
    
H O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
O O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
was O O O O
detected O O O O
with O O O O
3 O O O O
, O O O O
3 O O O O
' O O O O
- O O O O
diaminobenzidine O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Aerenchyma O O O O
develop O O O O
constitutively O O O O
in O O O O
all O O O O
internodes O O O O
of O O O O
the O O O O
deep O O O O
- O O O O
water O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
variety O O O O
Pin O O O O
Gaew O O O O
56 O O O O
, O O O O
but O O O O
are O O O O
absent O O O O
from O O O O
the O O O O
nodes O O O O
. O O O O
    
Constitutive O O O O
aerenchyma O O O O
formation O O O O
was O O O O
also O O O O
observed O O O O
in O O O O
two O O O O
lowland O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
varieties O O O O
, O O O O
albeit O O O O
to O O O O
a O O O O
lesser O O O O
degree O O O O
. O O O O
    
A O O O O
larger O O O O
number O O O O
of O O O O
aerenchyma O O O O
are O O O O
present O O O O
in O O O O
older O O O O
internodes O O O O
, O O O O
and O O O O
at O O O O
the O O O O
top O O O O
of O O O O
each O O O O
internode O O O O
, O O O O
revealing O O O O
developmental O O O O
gradients O O O O
. O O O O
    
Submergence O O O O
or O O O O
treatment O O O O
with O O O O
the O O O O
ethylene O O O O
- O O O O
releasing O O O O
compound O O O O
ethephon O O O O
promoted O O O O
aerenchyma O O O O
formation O O O O
in O O O O
all O O O O
genotypes O O O O
analyzed O O O O
. O O O O
    
Pre O O O O
- O O O O
aerenchymal O O O O
cells O O O O
contain O O O O
less O O O O
starch O O O O
, O O O O
no O O O O
chloroplasts O O O O
, O O O O
thinner O O O O
cell O O O O
walls O O O O
and O O O O
produce O O O O
elevated O O O O
levels O O O O
of O O O O
O O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
* O O O O
( O O O O
- O O O O
) O O O O
and O O O O
H O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
O O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
compared O O O O
with O O O O
other O O O O
parenchymal O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Ethephon O O O O
promotes O O O O
O O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
* O O O O
( O O O O
- O O O O
) O O O O
formation O O O O
and O O O O
H O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
O O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
promotes O O O O
aerenchyma O O O O
formation O O O O
in O O O O
a O O O O
dose O O O O
- O O O O
dependent O O O O
manner O O O O
. O O O O
    
Further O O O O
- O O O O
more O O O O
, O O O O
genetic O O O O
downregulation O O O O
of O O O O
the O O O O
H O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
O O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
scavenger O O O O
MT2b O O O O
enhances O O O O
aerenchyma O O O O
formation O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Aerenchyma O O O O
formation O O O O
is O O O O
mediated O O O O
by O O O O
reactive O O O O
oxygen O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Nitric O O O O
oxide O O O O
participates O O O O
in O O O O
cold O O O O
- O O O O
responsive O O O O
phosphosphingolipid O O O O
formation O O O O
and O O O O
gene O O O O
expression O O O O
in O O O O
Arabidopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
thaliana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Chilling O O O O
triggers O O O O
rapid O O O O
molecular O O O O
responses O O O O
that O O O O
permit O O O O
the O O O O
maintenance O O O O
of O O O O
plant O O O O
cell O O O O
homeostasis O O O O
and O O O O
plant O O O O
adaptation O O O O
. O O O O
    
Recent O O O O
data O O O O
showed O O O O
that O O O O
nitric O O O O
oxide O O O O
( O O O O
NO O O O O
) O O O O
is O O O O
involved O O O O
in O O O O
plant O O O O
acclimation O O O O
and O O O O
tolerance O O O O
to O O O O
cold O O O O
. O O O O
    
The O O O O
participation O O O O
of O O O O
NO O O O O
in O O O O
the O O O O
early O O O O
transduction O O O O
of O O O O
the O O O O
cold O O O O
signal O O O O
in O O O O
Arabidopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
thaliana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
investigated O O O O
. O O O O
    
The O O O O
production O O O O
of O O O O
NO O O O O
after O O O O
a O O O O
short O O O O
exposure O O O O
to O O O O
cold O O O O
was O O O O
assessed O O O O
using O O O O
the O O O O
NO O O O O
- O O O O
sensitive O O O O
fluorescent O O O O
probe O O O O
4 O O O O
, O O O O
5 O O O O
- O O O O
diamino O O O O
fluoresceine O O O O
diacetate O O O O
and O O O O
chemiluminescence O O O O
. O O O O
    
Pharmacological O O O O
and O O O O
genetic O O O O
approaches O O O O
were O O O O
used O O O O
to O O O O
analyze O O O O
NO O O O O
sources O O O O
and O O O O
NO O O O O
- O O O O
mediated O O O O
changes O O O O
in O O O O
cold O O O O
- O O O O
regulated O O O O
gene O O O O
expression O O O O
, O O O O
phosphatidic O O O O
acid O O O O
( O O O O
PtdOH O O O O
) O O O O
synthesis O O O O
and O O O O
sphingolipid O O O O
phosphorylation O O O O
. O O O O
    
NO O O O O
production O O O O
was O O O O
detected O O O O
after O O O O
1 O O O O
- O O O O
4h O O O O
of O O O O
chilling O O O O
. O O O O
    
It O O O O
was O O O O
impaired O O O O
in O O O O
the O O O O
nia1nia2 O O O O
nitrate O O O O
reductase O O O O
mutant O O O O
. O O O O
    
Moreover O O O O
, O O O O
NO O O O O
accumulation O O O O
was O O O O
not O O O O
observed O O O O
in O O O O
H7 O O O O
plants O O O O
overexpressing O O O O
the O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
thaliana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nonsymbiotic O O O O
hemoglobin O O O O
Arabidopsis O O O O
haemoglobin O O O O
1 O O O O
( O O O O
AHb1 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Cold O O O O
- O O O O
regulated O O O O
gene O O O O
expression O O O O
was O O O O
affected O O O O
in O O O O
nia1nia2 O O O O
and O O O O
H7 O O O O
plants O O O O
. O O O O
    
The O O O O
synthesis O O O O
of O O O O
PtdOH O O O O
upon O O O O
chilling O O O O
was O O O O
not O O O O
modified O O O O
by O O O O
NO O O O O
depletion O O O O
. O O O O
    
By O O O O
contrast O O O O
, O O O O
the O O O O
formation O O O O
of O O O O
phytosphingosine O O O O
phosphate O O O O
and O O O O
ceramide O O O O
phosphate O O O O
, O O O O
two O O O O
phosphorylated O O O O
sphingolipids O O O O
that O O O O
are O O O O
transiently O O O O
synthesized O O O O
upon O O O O
chilling O O O O
, O O O O
was O O O O
negatively O O O O
regulated O O O O
by O O O O
NO O O O O
. O O O O
    
Taken O O O O
together O O O O
, O O O O
these O O O O
data O O O O
suggest O O O O
a O O O O
new O O O O
function O O O O
for O O O O
NO O O O O
as O O O O
an O O O O
intermediate O O O O
in O O O O
gene O O O O
regulation O O O O
and O O O O
lipid O O O O
- O O O O
based O O O O
signaling O O O O
during O O O O
cold O O O O
transduction O O O O
. O O O O
    
Identification O O O O
of O O O O
a O O O O
novel O O O O
mitochondrial O O O O
protein O O O O
, O O O O
short O O O O
postembryonic O O O O
roots O O O O
1 O O O O
( O O O O
SPR1 O O O O
) O O O O
, O O O O
involved O O O O
in O O O O
root O O O O
development O O O O
and O O O O
iron O O O O
homeostasis O O O O
in O O O O
Oryza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sativa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
* O O O O
A O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mutant O O O O
, O O O O
Oryza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sativa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
short O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
postembryonic O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
roots O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Osspr1 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
, O O O O
has O O O O
been O O O O
characterized O O O O
. O O O O
    
It O O O O
has O O O O
short O O O O
postembryonic O O O O
roots O O O O
, O O O O
including O O O O
adventitious O O O O
and O O O O
lateral O O O O
roots O O O O
, O O O O
and O O O O
a O O O O
lower O O O O
iron O O O O
content O O O O
in O O O O
its O O O O
leaves O O O O
. O O O O
    
* O O O O
OsSPR1 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
was O O O O
identified O O O O
by O O O O
map O O O O
- O O O O
based O O O O
cloning O O O O
. O O O O
    
It O O O O
encodes O O O O
a O O O O
novel O O O O
mitochondrial O O O O
protein O O O O
with O O O O
the O O O O
Armadillo O O O O
- O O O O
like O O O O
repeat O O O O
domain O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Osspr1 O O O O
mutants O O O O
exhibited O O O O
decreased O O O O
root O O O O
cell O O O O
elongation O O O O
. O O O O
    
The O O O O
iron O O O O
content O O O O
of O O O O
the O O O O
mutant O O O O
shoots O O O O
was O O O O
significantly O O O O
altered O O O O
compared O O O O
with O O O O
that O O O O
of O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
shoots O O O O
. O O O O
    
A O O O O
similar O O O O
pattern O O O O
of O O O O
alteration O O O O
of O O O O
manganese O O O O
and O O O O
zinc O O O O
concentrations O O O O
in O O O O
shoots O O O O
was O O O O
also O O O O
observed O O O O
. O O O O
    
Complementation O O O O
of O O O O
the O O O O
mutant O O O O
confirmed O O O O
that O O O O
OsSPR1 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
is O O O O
involved O O O O
in O O O O
post O O O O
- O O O O
embryonic O O O O
root O O O O
elongation O O O O
and O O O O
iron O O O O
homeostasis O O O O
in O O O O
rice O O O O
. O O O O
    
OsSPR1 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
was O O O O
found O O O O
to O O O O
be O O O O
ubiquitously O O O O
expressed O O O O
in O O O O
various O O O O
tissues O O O O
throughout O O O O
the O O O O
plant O O O O
. O O O O
    
The O O O O
transcript O O O O
abundance O O O O
of O O O O
various O O O O
genes O O O O
involved O O O O
in O O O O
iron O O O O
uptake O O O O
and O O O O
signaling O O O O
via O O O O
both O O O O
strategies O O O O
I O O O O
and O O O O
II O O O O
was O O O O
similar O O O O
in O O O O
roots O O O O
of O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
and O O O O
mutant O O O O
plants O O O O
, O O O O
but O O O O
was O O O O
higher O O O O
in O O O O
the O O O O
leaves O O O O
of O O O O
mutant O O O O
plants O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Thus O O O O
, O O O O
a O O O O
novel O O O O
mitochondrial O O O O
protein O O O O
that O O O O
is O O O O
involved O O O O
in O O O O
root O O O O
elongation O O O O
and O O O O
plays O O O O
a O O O O
role O O O O
in O O O O
metal O O O O
ion O O O O
homeostasis O O O O
has O O O O
been O O O O
identified O O O O
. O O O O
    
Genomic O O O O
profiling O O O O
of O O O O
carbohydrate O O O O
metabolism O O O O
in O O O O
the O O O O
ectomycorrhizal O O O O
fungus O O O O
Tuber B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
melanosporum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
* O O O O
Primary O O O O
carbohydrate O O O O
metabolism O O O O
plays O O O O
a O O O O
special O O O O
role O O O O
related O O O O
to O O O O
carbon O O O O
/ O O O O
nitrogen O O O O
exchange O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
metabolic O O O O
support O O O O
of O O O O
fruiting O O O O
body O O O O
development O O O O
, O O O O
in O O O O
ectomycorrhizal O O O O
macrofungi O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
used O O O O
information O O O O
retrieved O O O O
from O O O O
the O O O O
recently O O O O
sequenced O O O O
Tuber B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
melanosporum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
genome O O O O
, O O O O
together O O O O
with O O O O
transcriptome O O O O
analysis O O O O
data O O O O
and O O O O
targeted O O O O
validation O O O O
experiments O O O O
, O O O O
to O O O O
construct O O O O
the O O O O
first O O O O
genome O O O O
- O O O O
wide O O O O
catalogue O O O O
of O O O O
the O O O O
proteins O O O O
supporting O O O O
carbohydrate O O O O
metabolism O O O O
in O O O O
a O O O O
plant O O O O
- O O O O
symbiotic O O O O
ascomycete O O O O
. O O O O
    
* O O O O
More O O O O
than O O O O
100 O O O O
genes O O O O
coding O O O O
for O O O O
enzymes O O O O
of O O O O
the O O O O
glycolysis O O O O
, O O O O
pentose O O O O
phosphate O O O O
, O O O O
tricarboxylic O O O O
acid O O O O
, O O O O
glyoxylate O O O O
and O O O O
methylcitrate O O O O
pathways O O O O
, O O O O
glycogen O O O O
, O O O O
trehalose O O O O
and O O O O
mannitol O O O O
metabolism O O O O
and O O O O
cell O O O O
wall O O O O
precursor O O O O
were O O O O
annotated O O O O
. O O O O
    
Transcriptional O O O O
regulation O O O O
of O O O O
these O O O O
pathways O O O O
in O O O O
different O O O O
stages O O O O
of O O O O
the O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
melanosporum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
lifecycle O O O O
was O O O O
investigated O O O O
using O O O O
whole O O O O
- O O O O
genome O O O O
oligoarray O O O O
expression O O O O
data O O O O
together O O O O
with O O O O
real O O O O
- O O O O
time O O O O
reverse O O O O
transcription O O O O
- O O O O
polymerase O O O O
chain O O O O
reaction O O O O
analysis O O O O
of O O O O
selected O O O O
genes O O O O
. O O O O
    
* O O O O
The O O O O
most O O O O
significant O O O O
results O O O O
were O O O O
the O O O O
identification O O O O
of O O O O
methylcitrate O O O O
cycle O O O O
genes O O O O
and O O O O
of O O O O
an O O O O
acid O O O O
invertase O O O O
, O O O O
the O O O O
first O O O O
enzyme O O O O
of O O O O
this O O O O
kind O O O O
to O O O O
be O O O O
described O O O O
in O O O O
a O O O O
plant O O O O
- O O O O
symbiotic O O O O
filamentous O O O O
fungus O O O O
. O O O O
    
* O O O O
A O O O O
subset O O O O
of O O O O
transcripts O O O O
coding O O O O
for O O O O
trehalose O O O O
, O O O O
glyoxylate O O O O
and O O O O
methylcitrate O O O O
enzymes O O O O
was O O O O
up O O O O
- O O O O
regulated O O O O
in O O O O
fruiting O O O O
bodies O O O O
, O O O O
whereas O O O O
genes O O O O
involved O O O O
in O O O O
mannitol O O O O
and O O O O
glycogen O O O O
metabolism O O O O
were O O O O
preferentially O O O O
expressed O O O O
in O O O O
mycelia O O O O
and O O O O
ectomycorrhizas O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
These O O O O
data O O O O
indicate O O O O
a O O O O
high O O O O
degree O O O O
of O O O O
lifecycle O O O O
stage O O O O
specialization O O O O
for O O O O
particular O O O O
branches O O O O
of O O O O
carbohydrate O O O O
metabolism O O O O
in O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
melanosporum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
An O O O O
analytical O O O O
model O O O O
of O O O O
non O O O O
- O O O O
photorespiratory O O O O
CO2release O O O O
in O O O O
the O O O O
light O O O O
and O O O O
dark O O O O
in O O O O
leaves O O O O
of O O O O
C3species O O O O
based O O O O
on O O O O
stoichiometric O O O O
flux O O O O
balance O O O O
. O O O O
    
Leaf O O O O
respiration O O O O
continues O O O O
in O O O O
the O O O O
light O O O O
but O O O O
at O O O O
a O O O O
reduced O O O O
rate O O O O
. O O O O
    
This O O O O
inhibition O O O O
is O O O O
highly O O O O
variable O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
mechanisms O O O O
are O O O O
poorly O O O O
known O O O O
, O O O O
partly O O O O
due O O O O
to O O O O
the O O O O
lack O O O O
of O O O O
a O O O O
formal O O O O
model O O O O
that O O O O
can O O O O
generate O O O O
testable O O O O
hypotheses O O O O
. O O O O
    
We O O O O
derived O O O O
an O O O O
analytical O O O O
model O O O O
for O O O O
non O O O O
- O O O O
photorespiratory O O O O
CO2 O O O O
release O O O O
by O O O O
solving O O O O
steady O O O O
- O O O O
state O O O O
supply O O O O
/ O O O O
demand O O O O
equations O O O O
for O O O O
ATP O O O O
, O O O O
NADH O O O O
and O O O O
NADPH O O O O
, O O O O
coupled O O O O
to O O O O
a O O O O
widely O O O O
used O O O O
photosynthesis O O O O
model O O O O
. O O O O
    
We O O O O
used O O O O
this O O O O
model O O O O
to O O O O
evaluate O O O O
causes O O O O
for O O O O
suppression O O O O
of O O O O
respiration O O O O
by O O O O
light O O O O
. O O O O
    
The O O O O
model O O O O
agrees O O O O
with O O O O
many O O O O
observations O O O O
, O O O O
including O O O O
highly O O O O
variable O O O O
suppression O O O O
at O O O O
saturating O O O O
light O O O O
, O O O O
greater O O O O
suppression O O O O
in O O O O
mature O O O O
leaves O O O O
, O O O O
reduced O O O O
assimilatory O O O O
quotient O O O O
( O O O O
ratio O O O O
of O O O O
net O O O O
CO2 O O O O
and O O O O
O2 O O O O
exchange O O O O
) O O O O
concurrent O O O O
with O O O O
nitrate O O O O
reduction O O O O
and O O O O
a O O O O
Kok O O O O
effect O O O O
( O O O O
discrete O O O O
change O O O O
in O O O O
quantum O O O O
yield O O O O
at O O O O
low O O O O
light O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
model O O O O
predicts O O O O
engagement O O O O
of O O O O
non O O O O
- O O O O
phosphorylating O O O O
pathways O O O O
at O O O O
moderate O O O O
to O O O O
high O O O O
light O O O O
, O O O O
or O O O O
concurrent O O O O
with O O O O
processes O O O O
that O O O O
yield O O O O
ATP O O O O
and O O O O
NADH O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
fatty O O O O
acid O O O O
or O O O O
terpenoid O O O O
synthesis O O O O
. O O O O
    
Suppression O O O O
of O O O O
respiration O O O O
is O O O O
governed O O O O
largely O O O O
by O O O O
photosynthetic O O O O
adenylate O O O O
balance O O O O
, O O O O
although O O O O
photorespiratory O O O O
NADH O O O O
may O O O O
contribute O O O O
at O O O O
sub O O O O
- O O O O
saturating O O O O
light O O O O
. O O O O
    
Key O O O O
questions O O O O
include O O O O
the O O O O
precise O O O O
diel O O O O
variation O O O O
of O O O O
anabolism O O O O
and O O O O
the O O O O
ATP O O O O
: O O O O
2e O O O O
- O O O O
ratio O O O O
for O O O O
photophosphorylation O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
model O O O O
can O O O O
focus O O O O
experimental O O O O
research O O O O
and O O O O
is O O O O
a O O O O
step O O O O
towards O O O O
a O O O O
fully O O O O
process O O O O
- O O O O
based O O O O
model O O O O
of O O O O
CO2 O O O O
exchange O O O O
. O O O O
    
Complement O O O O
opsonization O O O O
enhances O O O O
friend O O O O
virus O O O O
infection O O O O
of O O O O
B O O O O
cells O O O O
and O O O O
thereby O O O O
amplifies O O O O
the O O O O
virus O O O O
- O O O O
specific O O O O
CD8 O O O O
+ O O O O
T O O O O
cell O O O O
response O O O O
. O O O O
    
B O O O O
cells O O O O
are O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
targets O O O O
of O O O O
Friend O O O O
virus O O O O
( O O O O
FV O O O O
) O O O O
infection O O O O
, O O O O
a O O O O
well O O O O
- O O O O
established O O O O
mouse O O O O
model O O O O
often O O O O
used O O O O
to O O O O
study O O O O
retroviral B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infections O O O O
in O O O O
vivo O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
B O O O O
cells O O O O
may O O O O
be O O O O
effective O O O O
in O O O O
stimulating O O O O
cytotoxic O O O O
T O O O O
lymphocyte O O O O
responses O O O O
, O O O O
studies O O O O
involving O O O O
their O O O O
role O O O O
in O O O O
FV O O O O
infection O O O O
have O O O O
mainly O O O O
focused O O O O
on O O O O
neutralizing O O O O
antibody O O O O
production O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
show O O O O
that O O O O
polyclonal O O O O
activation O O O O
of O O O O
B O O O O
cells O O O O
promotes O O O O
their O O O O
infection O O O O
with O O O O
FV O O O O
both O O O O
in O O O O
vitro O O O O
and O O O O
in O O O O
vivo O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
we O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
complement O O O O
opsonization O O O O
of O O O O
Friend O O O O
murine B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
leukemia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
F O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
MuLV O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
enhances O O O O
infection O O O O
of O O O O
B O O O O
cells O O O O
, O O O O
which O O O O
correlates O O O O
with O O O O
increased O O O O
potency O O O O
of O O O O
B O O O O
cells O O O O
to O O O O
activate O O O O
FV O O O O
- O O O O
specific O O O O
CD8 O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
T O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Genetic O O O O
analysis O O O O
of O O O O
B55alpha O O O O
/ O O O O
Cdc55 O O O O
protein O O O O
phosphatase O O O O
2A O O O O
subunits O O O O
: O O O O
association O O O O
with O O O O
the O O O O
adenovirus O O O O
E4orf4 O O O O
protein O O O O
. O O O O
    
The O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
adenovirus O O O O
E4orf4 O O O O
protein O O O O
is O O O O
toxic O O O O
in O O O O
both O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tumor O O O O
cells O O O O
and O O O O
Saccharomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cerevisiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Previous O O O O
studies O O O O
indicated O O O O
that O O O O
most O O O O
of O O O O
this O O O O
toxicity O O O O
is O O O O
dependent O O O O
on O O O O
an O O O O
interaction O O O O
of O O O O
E4orf4 O O O O
protein O O O O
with O O O O
the O O O O
B55 O O O O
class O O O O
of O O O O
regulatory O O O O
subunits O O O O
of O O O O
protein O O O O
phosphatase O O O O
2A O O O O
( O O O O
PP2A O O O O
) O O O O
and O O O O
in O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
with O O O O
the O O O O
B55 O O O O
homolog O O O O
Cdc55 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
have O O O O
found O O O O
previously O O O O
that O O O O
E4orf4 O O O O
inhibits O O O O
PP2A O O O O
activity O O O O
against O O O O
at O O O O
least O O O O
some O O O O
substrates O O O O
. O O O O
    
In O O O O
an O O O O
attempt O O O O
to O O O O
understand O O O O
the O O O O
mechanism O O O O
of O O O O
this O O O O
inhibition O O O O
, O O O O
we O O O O
used O O O O
a O O O O
genetic O O O O
approach O O O O
to O O O O
identify O O O O
residues O O O O
in O O O O
the O O O O
seven O O O O
- O O O O
bladed O O O O
Beta O O O O
- O O O O
propeller O O O O
proteins O O O O
B55alpha O O O O
and O O O O
Cdc55 O O O O
required O O O O
for O O O O
E4orf4 O O O O
binding O O O O
. O O O O
    
In O O O O
both O O O O
cases O O O O
, O O O O
amino O O O O
- O O O O
terminal O O O O
polypeptides O O O O
composed O O O O
only O O O O
of O O O O
blade O O O O
1 O O O O
and O O O O
at O O O O
least O O O O
part O O O O
of O O O O
blade O O O O
2 O O O O
were O O O O
found O O O O
to O O O O
bind O O O O
E4orf4 O O O O
and O O O O
overexpression O O O O
blocked O O O O
E4orf4 O O O O
toxicity O O O O
in O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
certain O O O O
amino O O O O
acid O O O O
substitutions O O O O
in O O O O
blades O O O O
1 O O O O
and O O O O
2 O O O O
within O O O O
full O O O O
- O O O O
length O O O O
B55alpha O O O O
and O O O O
Cdc55 O O O O
resulted O O O O
in O O O O
loss O O O O
of O O O O
E4orf4 O O O O
binding O O O O
. O O O O
    
Recent O O O O
mutational O O O O
analysis O O O O
has O O O O
suggested O O O O
that O O O O
segments O O O O
of O O O O
blades O O O O
1 O O O O
and O O O O
2 O O O O
present O O O O
on O O O O
the O O O O
top O O O O
face O O O O
of O O O O
B55alpha O O O O
form O O O O
part O O O O
of O O O O
the O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
substrate O O O O
- O O O O
binding O O O O
groove O O O O
. O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
Additionally O O O O
, O O O O
these O O O O
segments O O O O
are O O O O
in O O O O
close O O O O
proximity O O O O
to O O O O
the O O O O
catalytic O O O O
C O O O O
subunit O O O O
of O O O O
the O O O O
PP2A O O O O
holoenzyme O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
our O O O O
results O O O O
are O O O O
consistent O O O O
with O O O O
the O O O O
hypothesis O O O O
that O O O O
E4orf4 O O O O
binding O O O O
could O O O O
affect O O O O
the O O O O
access O O O O
of O O O O
substrates O O O O
, O O O O
resulting O O O O
in O O O O
the O O O O
failure O O O O
to O O O O
dephosphorylate O O O O
some O O O O
PP2A O O O O
substrates O O O O
. O O O O
    
Stepwise O O O O
loss O O O O
of O O O O
fluorescent O O O O
core O O O O
protein O O O O
V O O O O
from O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
adenovirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
during O O O O
entry O O O O
into O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
adenoviruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Ads O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
replicate O O O O
and O O O O
assemble O O O O
particles O O O O
in O O O O
the O O O O
nucleus O O O O
. O O O O
    
They O O O O
organize O O O O
a O O O O
linear O O O O
double O O O O
- O O O O
strand O O O O
DNA O O O O
genome O O O O
into O O O O
a O O O O
condensed O O O O
core O O O O
with O O O O
about O O O O
180 O O O O
nucleosomes O O O O
, O O O O
by O O O O
the O O O O
viral O O O O
proteins O O O O
VII O O O O
( O O O O
pVII O O O O
) O O O O
, O O O O
pX O O O O
, O O O O
and O O O O
pV O O O O
attaching O O O O
the O O O O
DNA O O O O
to O O O O
the O O O O
capsid O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
reverse O O O O
genetics O O O O
, O O O O
we O O O O
generated O O O O
a O O O O
novel O O O O
, O O O O
nonconditionally O O O O
replicating O O O O
Ad O O O O
reporter O O O O
by O O O O
inserting O O O O
green O O O O
fluorescent O O O O
protein O O O O
( O O O O
GFP O O O O
) O O O O
at O O O O
the O O O O
amino O O O O
terminus O O O O
of O O O O
pV O O O O
. O O O O
    
Purified O O O O
Ad2 O O O O
- O O O O
GFP O O O O
- O O O O
pV O O O O
virions O O O O
had O O O O
an O O O O
oversized O O O O
complete O O O O
genome O O O O
and O O O O
incorporated O O O O
about O O O O
38 O O O O
GFP O O O O
- O O O O
pV O O O O
molecules O O O O
per O O O O
virion O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
about O O O O
25 O O O O
% O O O O
of O O O O
the O O O O
pV O O O O
levels O O O O
in O O O O
Ad2 O O O O
. O O O O
    
GFP O O O O
- O O O O
pV O O O O
cofractionated O O O O
with O O O O
the O O O O
DNA O O O O
core O O O O
, O O O O
like O O O O
pV O O O O
, O O O O
and O O O O
newly O O O O
synthesized O O O O
GFP O O O O
- O O O O
pV O O O O
had O O O O
a O O O O
subcellular O O O O
localization O O O O
indistinguishable O O O O
from O O O O
that O O O O
of O O O O
pV O O O O
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
GFP O O O O
- O O O O
pV O O O O
is O O O O
a O O O O
valid O O O O
reporter O O O O
for O O O O
pV O O O O
. O O O O
    
Ad2 O O O O
- O O O O
GFP O O O O
- O O O O
pV O O O O
completed O O O O
the O O O O
replication O O O O
cycle O O O O
, O O O O
although O O O O
at O O O O
lower O O O O
yields O O O O
than O O O O
Ad2 O O O O
. O O O O
    
Incoming O O O O
GFP O O O O
- O O O O
pV O O O O
( O O O O
or O O O O
pV O O O O
) O O O O
was O O O O
not O O O O
imported O O O O
into O O O O
the O O O O
nucleus O O O O
. O O O O
    
Virions O O O O
lost O O O O
GFP O O O O
- O O O O
pV O O O O
at O O O O
two O O O O
points O O O O
during O O O O
the O O O O
infection O O O O
process O O O O
: O O O O
at O O O O
entry O O O O
into O O O O
the O O O O
cytosol O O O O
and O O O O
at O O O O
the O O O O
nuclear O O O O
pore O O O O
complex O O O O
, O O O O
where O O O O
capsids O O O O
disassemble O O O O
. O O O O
    
Disassembled O O O O
capsids O O O O
, O O O O
positive O O O O
for O O O O
the O O O O
conformation O O O O
- O O O O
specific O O O O
antihexon O O O O
antibody O O O O
R70 O O O O
, O O O O
were O O O O
devoid O O O O
of O O O O
GFP O O O O
- O O O O
pV O O O O
. O O O O
    
The O O O O
loss O O O O
of O O O O
GFP O O O O
- O O O O
pV O O O O
was O O O O
reduced O O O O
by O O O O
the O O O O
macrolide O O O O
antibiotic O O O O
leptomycin O O O O
B O O O O
( O O O O
LMB O O O O
) O O O O
, O O O O
which O O O O
blocks O O O O
nuclear O O O O
export O O O O
and O O O O
adenovirus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
attachment O O O O
to O O O O
the O O O O
nuclear O O O O
pore O O O O
complex O O O O
. O O O O
    
LMB O O O O
inhibited O O O O
the O O O O
appearance O O O O
of O O O O
R70 O O O O
epitopes O O O O
on O O O O
Ad2 O O O O
and O O O O
Ad2 O O O O
- O O O O
GFP O O O O
- O O O O
pV O O O O
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
the O O O O
loss O O O O
of O O O O
GFP O O O O
- O O O O
pV O O O O
from O O O O
Ad2 O O O O
- O O O O
GFP O O O O
- O O O O
pV O O O O
is O O O O
an O O O O
authentic O O O O
step O O O O
in O O O O
the O O O O
adenovirus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
uncoating O O O O
program O O O O
. O O O O
    
Ad2 O O O O
- O O O O
GFP O O O O
- O O O O
pV O O O O
is O O O O
genetically O O O O
complete O O O O
and O O O O
hence O O O O
enables O O O O
detailed O O O O
analyses O O O O
of O O O O
infection O O O O
and O O O O
spreading O O O O
dynamics O O O O
in O O O O
cells O O O O
and O O O O
model O O O O
organisms O O O O
or O O O O
assessment O O O O
of O O O O
oncolytic O O O O
adenoviral B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
potential O O O O
. O O O O
    
The O O O O
spatial O O O O
scaling O O O O
of O O O O
habitat O O O O
selection O O O O
by O O O O
African O O O O
elephants O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Understanding O O O O
and O O O O
accurately O O O O
predicting O O O O
the O O O O
spatial O O O O
patterns O O O O
of O O O O
habitat O O O O
use O O O O
by O O O O
organisms O O O O
is O O O O
important O O O O
for O O O O
ecological O O O O
research O O O O
, O O O O
biodiversity O O O O
conservation O O O O
and O O O O
ecosystem O O O O
management O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
this O O O O
understanding O O O O
is O O O O
complicated O O O O
by O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
spatial O O O O
scale O O O O
, O O O O
because O O O O
the O O O O
scale O O O O
of O O O O
analysis O O O O
affects O O O O
the O O O O
quantification O O O O
of O O O O
species O O O O
- O O O O
environment O O O O
relationships O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
therefore O O O O
assessed O O O O
the O O O O
influence O O O O
of O O O O
environmental O O O O
context O O O O
( O O O O
i O O O O
. O O O O
e O O O O
. O O O O
the O O O O
characteristics O O O O
of O O O O
the O O O O
landscape O O O O
surrounding O O O O
a O O O O
site O O O O
) O O O O
, O O O O
varied O O O O
over O O O O
a O O O O
large O O O O
range O O O O
of O O O O
scales O O O O
( O O O O
i O O O O
. O O O O
e O O O O
. O O O O
ambit O O O O
radii O O O O
around O O O O
focal O O O O
sites O O O O
) O O O O
, O O O O
on O O O O
the O O O O
analysis O O O O
and O O O O
prediction O O O O
of O O O O
habitat O O O O
selection O O O O
by O O O O
African O O O O
elephants O O O O
in O O O O
Kruger O O O O
National O O O O
Park O O O O
, O O O O
South O O O O
Africa O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
focused O O O O
on O O O O
the O O O O
spatial O O O O
scaling O O O O
of O O O O
the O O O O
elephants O O O O
' O O O O
response O O O O
to O O O O
their O O O O
main O O O O
resources O O O O
, O O O O
forage O O O O
and O O O O
water O O O O
, O O O O
and O O O O
found O O O O
that O O O O
the O O O O
quantification O O O O
of O O O O
habitat O O O O
selection O O O O
strongly O O O O
depended O O O O
on O O O O
the O O O O
scales O O O O
at O O O O
which O O O O
environmental O O O O
context O O O O
was O O O O
considered O O O O
. O O O O
    
Moreover O O O O
, O O O O
the O O O O
inclusion O O O O
of O O O O
environmental O O O O
context O O O O
at O O O O
characteristic O O O O
scales O O O O
( O O O O
i O O O O
. O O O O
e O O O O
. O O O O
those O O O O
at O O O O
which O O O O
habitat O O O O
selectivity O O O O
was O O O O
maximized O O O O
) O O O O
increased O O O O
the O O O O
predictive O O O O
capacity O O O O
of O O O O
habitat O O O O
suitability O O O O
models O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
elephants O O O O
responded O O O O
to O O O O
their O O O O
environment O O O O
in O O O O
a O O O O
scale O O O O
- O O O O
dependent O O O O
and O O O O
perhaps O O O O
hierarchical O O O O
manner O O O O
, O O O O
with O O O O
forage O O O O
characteristics O O O O
driving O O O O
habitat O O O O
selection O O O O
at O O O O
coarse O O O O
spatial O O O O
scales O O O O
, O O O O
and O O O O
surface O O O O
water O O O O
at O O O O
fine O O O O
spatial O O O O
scales O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
the O O O O
elephants O O O O
exhibited O O O O
sexual O O O O
habitat O O O O
segregation O O O O
, O O O O
mainly O O O O
in O O O O
relation O O O O
to O O O O
vegetation O O O O
characteristics O O O O
. O O O O
    
Male O O O O
elephants O O O O
preferred O O O O
areas O O O O
with O O O O
high O O O O
tree O O O O
cover O O O O
and O O O O
low O O O O
herbaceous O O O O
biomass O O O O
, O O O O
whereas O O O O
this O O O O
pattern O O O O
was O O O O
reversed O O O O
for O O O O
female O O O O
elephants O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
show O O O O
that O O O O
the O O O O
spatial O O O O
distribution O O O O
of O O O O
elephants O O O O
can O O O O
be O O O O
better O O O O
understood O O O O
and O O O O
predicted O O O O
when O O O O
scale O O O O
- O O O O
dependent O O O O
species O O O O
- O O O O
environment O O O O
relationships O O O O
are O O O O
explicitly O O O O
considered O O O O
. O O O O
    
This O O O O
demonstrates O O O O
the O O O O
importance O O O O
of O O O O
considering O O O O
the O O O O
influence O O O O
of O O O O
spatial O O O O
scale O O O O
on O O O O
the O O O O
analysis O O O O
of O O O O
spatial O O O O
patterning O O O O
in O O O O
ecological O O O O
phenomena O O O O
. O O O O
    
Is O O O O
hunting O O O O
mortality O O O O
additive O O O O
or O O O O
compensatory O O O O
to O O O O
natural O O O O
mortality O O O O
? O O O O
    
Effects O O O O
of O O O O
experimental O O O O
harvest O O O O
on O O O O
the O O O O
survival O O O O
and O O O O
cause O O O O
- O O O O
specific O O O O
mortality O O O O
of O O O O
willow B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ptarmigan O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
effects O O O O
of O O O O
harvest O O O O
on O O O O
the O O O O
annual O O O O
and O O O O
seasonal O O O O
survival O O O O
of O O O O
willow B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ptarmigan O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Lagopus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
lagopus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
L O O O O
. O O O O
were O O O O
tested O O O O
in O O O O
a O O O O
large O O O O
- O O O O
scale O O O O
harvest O O O O
experiment O O O O
. O O O O
    
Management O O O O
units O O O O
were O O O O
randomly O O O O
assigned O O O O
to O O O O
one O O O O
of O O O O
three O O O O
experimental O O O O
treatments O O O O
: O O O O
0 O O O O
% O O O O
, O O O O
15 O O O O
% O O O O
or O O O O
30 O O O O
% O O O O
harvest O O O O
. O O O O
    
Seasonal O O O O
quotas O O O O
were O O O O
based O O O O
on O O O O
the O O O O
experimental O O O O
treatment O O O O
and O O O O
estimates O O O O
of O O O O
bird O O O O
density O O O O
before O O O O
the O O O O
hunting O O O O
season O O O O
. O O O O
    
Survival O O O O
rates O O O O
and O O O O
hazard O O O O
functions O O O O
for O O O O
radio O O O O
- O O O O
marked O O O O
ptarmigan O O O O
were O O O O
then O O O O
estimated O O O O
under O O O O
the O O O O
competing O O O O
risks O O O O
of O O O O
harvest O O O O
and O O O O
natural O O O O
mortality O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
partially O O O O
compensatory O O O O
mortality O O O O
hypothesis O O O O
was O O O O
supported O O O O
: O O O O
annual O O O O
survival O O O O
of O O O O
ptarmigan O O O O
was O O O O
0 O O O O
* O O O O
54 O O O O
+ O O O O
/ O O O O
- O O O O
0 O O O O
* O O O O
08 O O O O
SE O O O O
under O O O O
0 O O O O
% O O O O
harvest O O O O
, O O O O
0 O O O O
* O O O O
47 O O O O
+ O O O O
/ O O O O
- O O O O
0 O O O O
* O O O O
06 O O O O
under O O O O
15 O O O O
% O O O O
harvest O O O O
, O O O O
and O O O O
was O O O O
reduced O O O O
to O O O O
0 O O O O
* O O O O
30 O O O O
+ O O O O
/ O O O O
- O O O O
0 O O O O
* O O O O
05 O O O O
under O O O O
30 O O O O
% O O O O
harvest O O O O
. O O O O
    
Harvest O O O O
mortality O O O O
increased O O O O
linearly O O O O
from O O O O
0 O O O O
* O O O O
08 O O O O
+ O O O O
/ O O O O
- O O O O
0 O O O O
* O O O O
05 O O O O
, O O O O
0 O O O O
* O O O O
27 O O O O
+ O O O O
/ O O O O
- O O O O
0 O O O O
* O O O O
05 O O O O
and O O O O
0 O O O O
* O O O O
42 O O O O
+ O O O O
/ O O O O
- O O O O
0 O O O O
* O O O O
06 O O O O
from O O O O
0 O O O O
% O O O O
to O O O O
30 O O O O
% O O O O
harvest O O O O
, O O O O
whereas O O O O
natural O O O O
mortality O O O O
was O O O O
0 O O O O
* O O O O
38 O O O O
+ O O O O
/ O O O O
- O O O O
0 O O O O
* O O O O
08 O O O O
, O O O O
0 O O O O
* O O O O
25 O O O O
+ O O O O
/ O O O O
- O O O O
0 O O O O
* O O O O
05 O O O O
and O O O O
0 O O O O
* O O O O
28 O O O O
+ O O O O
/ O O O O
- O O O O
0 O O O O
* O O O O
06 O O O O
under O O O O
the O O O O
same O O O O
treatments O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Realized O O O O
risk O O O O
of O O O O
harvest O O O O
mortality O O O O
was O O O O
0 O O O O
* O O O O
08 O O O O
- O O O O
0 O O O O
* O O O O
12 O O O O
points O O O O
higher O O O O
than O O O O
our O O O O
set O O O O
harvest O O O O
treatments O O O O
of O O O O
0 O O O O
- O O O O
30 O O O O
% O O O O
because O O O O
birds O O O O
were O O O O
exposed O O O O
to O O O O
risk O O O O
if O O O O
they O O O O
moved O O O O
out O O O O
of O O O O
protected O O O O
areas O O O O
. O O O O
    
The O O O O
superadditive O O O O
hypothesis O O O O
was O O O O
supported O O O O
because O O O O
birds O O O O
in O O O O
the O O O O
30 O O O O
% O O O O
harvest O O O O
treatment O O O O
had O O O O
higher O O O O
natural O O O O
mortality O O O O
during O O O O
winter O O O O
after O O O O
the O O O O
hunting O O O O
season O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Natural O O O O
mortality O O O O
was O O O O
mainly O O O O
because O O O O
of O O O O
raptor O O O O
predation O O O O
, O O O O
with O O O O
two O O O O
seasonal O O O O
peaks O O O O
in O O O O
fall O O O O
and O O O O
spring O O O O
. O O O O
    
Natural O O O O
and O O O O
harvest O O O O
mortality O O O O
coincided O O O O
during O O O O
early O O O O
autumn O O O O
with O O O O
little O O O O
potential O O O O
for O O O O
compensation O O O O
during O O O O
winter O O O O
months O O O O
. O O O O
    
Peak O O O O
risk O O O O
of O O O O
harvest O O O O
mortality O O O O
was O O O O
5x O O O O
higher O O O O
than O O O O
natural O O O O
mortality O O O O
. O O O O
    
Low O O O O
natural O O O O
mortality O O O O
during O O O O
winter O O O O
suggests O O O O
that O O O O
most O O O O
late O O O O
season O O O O
harvest O O O O
would O O O O
be O O O O
additive O O O O
mortality O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Environmental O O O O
correlates O O O O
of O O O O
natural O O O O
mortality O O O O
of O O O O
ptarmigan O O O O
included O O O O
seasonal O O O O
changes O O O O
in O O O O
snow O O O O
cover O O O O
, O O O O
onset O O O O
of O O O O
juvenile O O O O
dispersal O O O O
, O O O O
and O O O O
periods O O O O
of O O O O
territorial O O O O
activity O O O O
. O O O O
    
Natural O O O O
mortality O O O O
of O O O O
ptarmigan O O O O
was O O O O
highest O O O O
during O O O O
autumn O O O O
movements O O O O
and O O O O
nesting O O O O
by O O O O
gyrfalcons B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
Falco B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
rusticolus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
L O O O O
. O O O O
    
Mortality O O O O
was O O O O
low O O O O
when O O O O
gyrfalcons B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
had O O O O
departed O O O O
for O O O O
coastal O O O O
wintering O O O O
sites O O O O
, O O O O
and O O O O
during O O O O
summer O O O O
when O O O O
ptarmigan O O O O
were O O O O
attending O O O O
nests O O O O
and O O O O
broods O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
experimental O O O O
results O O O O
have O O O O
important O O O O
implications O O O O
for O O O O
harvest O O O O
management O O O O
of O O O O
upland O O O O
gamebirds O O O O
. O O O O
    
Seasonal O O O O
quotas O O O O
based O O O O
on O O O O
proportional O O O O
harvest O O O O
were O O O O
effective O O O O
and O O O O
should O O O O
be O O O O
set O O O O
at O O O O
= O O O O
< O O O O
15 O O O O
% O O O O
of O O O O
August O O O O
populations O O O O
for O O O O
regional O O O O
management O O O O
plans O O O O
. O O O O
    
Under O O O O
threshold O O O O
harvest O O O O
of O O O O
a O O O O
reproductive O O O O
surplus O O O O
, O O O O
15 O O O O
% O O O O
harvest O O O O
would O O O O
be O O O O
sustainable O O O O
at O O O O
productivity O O O O
rates O O O O
> O O O O
= O O O O
2 O O O O
* O O O O
5 O O O O
young O O O O
per O O O O
pair O O O O
. O O O O
    
Impacts O O O O
of O O O O
winter O O O O
harvest O O O O
could O O O O
be O O O O
minimized O O O O
by O O O O
closing O O O O
the O O O O
hunting O O O O
season O O O O
in O O O O
early O O O O
November O O O O
or O O O O
by O O O O
reducing O O O O
late O O O O
season O O O O
quotas O O O O
. O O O O
    
Possible O O O O
contributions O O O O
of O O O O
TERMINAL O O O O
FLOWER O O O O
1 O O O O
to O O O O
the O O O O
evolution O O O O
of O O O O
rosette O O O O
flowering O O O O
in O O O O
Leavenworthia O O O O
( O O O O
Brassicaceae O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Leavenworthia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
crassa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
a O O O O
rosette O O O O
flowering O O O O
species O O O O
that O O O O
differs O O O O
from O O O O
inflorescence O O O O
flowering O O O O
species O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
Arabidopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
thaliana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
in O O O O
having O O O O
elongated O O O O
pedicels O O O O
and O O O O
shortened O O O O
interfloral O O O O
internodes O O O O
on O O O O
the O O O O
main O O O O
axis O O O O
. O O O O
    
Based O O O O
on O O O O
previous O O O O
experiments O O O O
, O O O O
we O O O O
hypothesized O O O O
that O O O O
changes O O O O
to O O O O
the O O O O
L O O O O
. O O O O
crassa O O O O
TFL1 O O O O
ortholog O O O O
, O O O O
LcrTFL1 O O O O
, O O O O
were O O O O
important O O O O
in O O O O
the O O O O
evolution O O O O
of O O O O
rosette O O O O
flowering O O O O
. O O O O
    
We O O O O
isolated O O O O
LcrTFL1 O O O O
and O O O O
introduced O O O O
a O O O O
genomic O O O O
construct O O O O
into O O O O
tfl1 O O O O
mutant O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
thaliana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
plants O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
generated O O O O
and O O O O
analyzed O O O O
EGFP O O O O
- O O O O
LcrTFL1 O O O O
reporter O O O O
- O O O O
fusion O O O O
lines O O O O
, O O O O
and O O O O
LcrTFL1 O O O O
/ O O O O
LcrLFY O O O O
doubly O O O O
transgenic O O O O
lines O O O O
. O O O O
    
The O O O O
transgene O O O O
rescued O O O O
the O O O O
mutant O O O O
defects O O O O
, O O O O
but O O O O
manifested O O O O
gain O O O O
- O O O O
of O O O O
- O O O O
function O O O O
phenotypes O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
LcrTFL1 O O O O
lines O O O O
differed O O O O
from O O O O
35S O O O O
: O O O O
TFL1 O O O O
lines O O O O
in O O O O
several O O O O
regards O O O O
. O O O O
    
Defects O O O O
in O O O O
floral O O O O
meristem O O O O
identity O O O O
establishment O O O O
were O O O O
observed O O O O
, O O O O
as O O O O
was O O O O
the O O O O
production O O O O
of O O O O
flowers O O O O
with O O O O
extra O O O O
petals O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
noted O O O O
features O O O O
that O O O O
resemble O O O O
rosette O O O O
flowering O O O O
: O O O O
LcrTFL1 O O O O
lines O O O O
produced O O O O
significantly O O O O
shorter O O O O
interfloral O O O O
internodes O O O O
and O O O O
significantly O O O O
longer O O O O
pedicels O O O O
than O O O O
either O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
or O O O O
35S O O O O
: O O O O
TFL1 O O O O
plants O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
data O O O O
show O O O O
that O O O O
there O O O O
are O O O O
substantive O O O O
differences O O O O
in O O O O
the O O O O
regulation O O O O
and O O O O
/ O O O O
or O O O O
function O O O O
of O O O O
TFL1 O O O O
orthologs O O O O
between O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
thaliana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
L B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
crassa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
These O O O O
may O O O O
reflect O O O O
changes O O O O
that O O O O
occurred O O O O
during O O O O
the O O O O
evolution O O O O
of O O O O
rosette O O O O
flowering O O O O
in O O O O
Leavenworthia O O O O
, O O O O
but O O O O
, O O O O
if O O O O
so O O O O
, O O O O
our O O O O
results O O O O
show O O O O
that O O O O
additional O O O O
, O O O O
as O O O O
- O O O O
yet O O O O
- O O O O
unidentified O O O O
genes O O O O
were O O O O
involved O O O O
in O O O O
this O O O O
instance O O O O
of O O O O
architectural O O O O
evolution O O O O
. O O O O
    
Gene O O O O
expression O O O O
changes O O O O
during O O O O
short O O O O
day O O O O
induced O O O O
terminal O O O O
bud O O O O
formation O O O O
in O O O O
Norway B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
spruce O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
molecular O O O O
basis O O O O
for O O O O
terminal O O O O
bud O O O O
formation O O O O
in O O O O
autumn O O O O
is O O O O
not O O O O
well O O O O
understood O O O O
in O O O O
conifers O O O O
. O O O O
    
By O O O O
combining O O O O
suppression O O O O
subtractive O O O O
hybridization O O O O
and O O O O
monitoring O O O O
of O O O O
gene O O O O
expression O O O O
by O O O O
qRT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
analysis O O O O
, O O O O
we O O O O
aimed O O O O
to O O O O
identify O O O O
genes O O O O
involved O O O O
in O O O O
photoperiodic O O O O
control O O O O
of O O O O
growth O O O O
cessation O O O O
and O O O O
bud O O O O
set O O O O
in O O O O
Norway B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
spruce O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Close O O O O
to O O O O
1400 O O O O
ESTs O O O O
were O O O O
generated O O O O
and O O O O
their O O O O
functional O O O O
distribution O O O O
differed O O O O
between O O O O
short O O O O
day O O O O
( O O O O
SD O O O O
- O O O O
12 O O O O
h O O O O
photoperiod O O O O
) O O O O
and O O O O
long O O O O
day O O O O
( O O O O
LD O O O O
- O O O O
24 O O O O
h O O O O
photoperiod O O O O
) O O O O
libraries O O O O
. O O O O
    
Many O O O O
genes O O O O
with O O O O
putative O O O O
roles O O O O
in O O O O
protection O O O O
against O O O O
stress O O O O
appeared O O O O
differentially O O O O
regulated O O O O
under O O O O
SD O O O O
and O O O O
LD O O O O
, O O O O
and O O O O
also O O O O
differed O O O O
in O O O O
transcript O O O O
levels O O O O
between O O O O
6 O O O O
and O O O O
20 O O O O
SDs O O O O
. O O O O
    
Of O O O O
these O O O O
, O O O O
PaTFL1 O O O O
( O O O O
TERMINAL O O O O
FLOWER O O O O
LIKE O O O O
1 O O O O
) O O O O
showed O O O O
strongly O O O O
increased O O O O
transcript O O O O
levels O O O O
at O O O O
6 O O O O
SDs O O O O
. O O O O
    
PaCCCH O O O O
( O O O O
CCCH O O O O
- O O O O
TYPE O O O O
ZINC O O O O
FINGER O O O O
) O O O O
and O O O O
PaCBF2 O O O O
& O O O O
amp O O O O
; O O O O
3 O O O O
( O O O O
C O O O O
- O O O O
REPEAT O O O O
BINDING O O O O
FACTOR O O O O
2 O O O O
& O O O O
amp O O O O
; O O O O
3 O O O O
) O O O O
showed O O O O
a O O O O
later O O O O
response O O O O
at O O O O
20 O O O O
SDs O O O O
, O O O O
with O O O O
increased O O O O
and O O O O
decreased O O O O
transcript O O O O
levels O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
For O O O O
rhythmically O O O O
expressed O O O O
genes O O O O
such O O O O
as O O O O
CBFs O O O O
, O O O O
such O O O O
differences O O O O
might O O O O
represent O O O O
a O O O O
phase O O O O
shift O O O O
in O O O O
peak O O O O
expression O O O O
, O O O O
but O O O O
might O O O O
also O O O O
suggest O O O O
a O O O O
putative O O O O
role O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
SD O O O O
. O O O O
    
Multivariate O O O O
analyses O O O O
revealed O O O O
strong O O O O
differences O O O O
in O O O O
gene O O O O
expression O O O O
between O O O O
LD O O O O
, O O O O
6 O O O O
SD O O O O
and O O O O
20 O O O O
SD O O O O
. O O O O
    
The O O O O
robustness O O O O
of O O O O
the O O O O
gene O O O O
expression O O O O
patterns O O O O
was O O O O
verified O O O O
in O O O O
6 O O O O
families O O O O
differing O O O O
in O O O O
bud O O O O
- O O O O
set O O O O
timing O O O O
under O O O O
natural O O O O
light O O O O
with O O O O
gradually O O O O
decreasing O O O O
photoperiod O O O O
. O O O O
    
Role O O O O
of O O O O
nitric O O O O
oxide O O O O
in O O O O
hydrogen O O O O
peroxide O O O O
- O O O O
dependent O O O O
induction O O O O
of O O O O
abiotic O O O O
stress O O O O
tolerance O O O O
by O O O O
brassinosteroids O O O O
in O O O O
cucumber B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Brassinosteroids O O O O
( O O O O
BRs O O O O
) O O O O
can O O O O
induce O O O O
plant O O O O
tolerance O O O O
to O O O O
a O O O O
variety O O O O
of O O O O
abiotic O O O O
stresses O O O O
by O O O O
triggering O O O O
the O O O O
generation O O O O
of O O O O
H O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
O O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
as O O O O
a O O O O
signalling O O O O
molecule O O O O
in O O O O
cucumber B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
leaves O O O O
. O O O O
    
Whether O O O O
nitric O O O O
oxide O O O O
( O O O O
NO O O O O
) O O O O
also O O O O
plays O O O O
a O O O O
signalling O O O O
role O O O O
and O O O O
, O O O O
if O O O O
so O O O O
, O O O O
what O O O O
is O O O O
the O O O O
relationship O O O O
between O O O O
NO O O O O
and O O O O
H O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
O O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
in O O O O
BR O O O O
- O O O O
induced O O O O
stress O O O O
tolerance O O O O
are O O O O
unknown O O O O
. O O O O
    
Involvement O O O O
of O O O O
NO O O O O
and O O O O
H O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
O O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
in O O O O
BR O O O O
- O O O O
induced O O O O
tolerance O O O O
was O O O O
examined O O O O
. O O O O
    
NO O O O O
accumulation O O O O
and O O O O
defence O O O O
related O O O O
gene O O O O
transcripts O O O O
were O O O O
monitored O O O O
by O O O O
confocal O O O O
laser O O O O
- O O O O
scanning O O O O
microscopy O O O O
and O O O O
qRT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
NO O O O O
content O O O O
was O O O O
elevated O O O O
after O O O O
treatment O O O O
with O O O O
24 O O O O
- O O O O
epibrassinolide O O O O
( O O O O
EBR O O O O
) O O O O
and O O O O
reduced O O O O
with O O O O
the O O O O
inhibition O O O O
of O O O O
BR O O O O
biosynthesis O O O O
. O O O O
    
EBR O O O O
- O O O O
induced O O O O
NO O O O O
production O O O O
was O O O O
blocked O O O O
by O O O O
pre O O O O
- O O O O
treatment O O O O
with O O O O
inhibitor O O O O
of O O O O
NADPH O O O O
oxidase O O O O
and O O O O
a O O O O
reactive O O O O
oxygen O O O O
species O O O O
scavenger O O O O
. O O O O
    
On O O O O
the O O O O
other O O O O
hand O O O O
, O O O O
EBR O O O O
- O O O O
induced O O O O
H O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
O O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
generation O O O O
was O O O O
not O O O O
sensitive O O O O
to O O O O
NO O O O O
scavenger O O O O
or O O O O
inhibitor O O O O
of O O O O
NO O O O O
production O O O O
. O O O O
    
Scavenging O O O O
or O O O O
inhibition O O O O
of O O O O
NO O O O O
production O O O O
inhibited O O O O
EBR O O O O
- O O O O
induced O O O O
tolerance O O O O
to O O O O
photo O O O O
- O O O O
oxidative O O O O
and O O O O
cold O O O O
stress O O O O
and O O O O
partly O O O O
blocked O O O O
EBR O O O O
- O O O O
induced O O O O
expression O O O O
and O O O O
activities O O O O
of O O O O
several O O O O
antioxidant O O O O
enzymes O O O O
. O O O O
    
Pre O O O O
- O O O O
treatment O O O O
of O O O O
the O O O O
exogenous O O O O
NO O O O O
precursor O O O O
, O O O O
on O O O O
the O O O O
other O O O O
hand O O O O
, O O O O
led O O O O
to O O O O
both O O O O
increased O O O O
stress O O O O
tolerance O O O O
and O O O O
increased O O O O
expression O O O O
of O O O O
antioxidant O O O O
enzymes O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
strongly O O O O
suggest O O O O
that O O O O
NO O O O O
plays O O O O
an O O O O
important O O O O
role O O O O
in O O O O
H O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
O O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
- O O O O
dependent O O O O
induction O O O O
of O O O O
plant O O O O
stress O O O O
tolerance O O O O
by O O O O
BR O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Arabidopsis O O O O
tt19 O O O O
- O O O O
4 O O O O
mutant O O O O
differentially O O O O
accumulates O O O O
proanthocyanidin O O O O
and O O O O
anthocyanin O O O O
through O O O O
a O O O O
3 O O O O
' O O O O
amino O O O O
acid O O O O
substitution O O O O
in O O O O
glutathione O O O O
S O O O O
- O O O O
transferase O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Arabidopsis O O O O
transparent O O O O
testa O O O O
( O O O O
tt O O O O
) O O O O
mutant O O O O
tt19 O O O O
- O O O O
4 O O O O
shows O O O O
reduced O O O O
seed O O O O
coat O O O O
colour O O O O
, O O O O
but O O O O
stains O O O O
darkly O O O O
with O O O O
DMACA O O O O
and O O O O
accumulates O O O O
anthocyanins O O O O
in O O O O
aerial O O O O
tissues O O O O
. O O O O
    
Positional O O O O
cloning O O O O
showed O O O O
that O O O O
tt19 O O O O
- O O O O
4 O O O O
was O O O O
allelic O O O O
to O O O O
tt19 O O O O
- O O O O
1 O O O O
and O O O O
has O O O O
a O O O O
G O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
T O O O O
mutation O O O O
in O O O O
a O O O O
conserved O O O O
3 O O O O
' O O O O
- O O O O
domain O O O O
in O O O O
the O O O O
TT19 O O O O
- O O O O
4 O O O O
gene O O O O
. O O O O
    
Soluble O O O O
and O O O O
unextractable O O O O
seed O O O O
proanthocyanidins O O O O
and O O O O
hydrolysis O O O O
of O O O O
unextractable O O O O
proanthocyanidin O O O O
differ O O O O
between O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
Col O O O O
- O O O O
4 O O O O
and O O O O
both O O O O
mutants O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
seed O O O O
quercetins O O O O
, O O O O
unextractable O O O O
proanthocyanidin O O O O
hydrolysis O O O O
, O O O O
and O O O O
seedling O O O O
anthocyanin O O O O
content O O O O
, O O O O
and O O O O
flavonoid O O O O
gene O O O O
expression O O O O
differ O O O O
between O O O O
tt19 O O O O
- O O O O
1 O O O O
and O O O O
tt19 O O O O
- O O O O
4 O O O O
. O O O O
    
Transformation O O O O
of O O O O
tt19 O O O O
- O O O O
1 O O O O
with O O O O
a O O O O
TT19 O O O O
- O O O O
4 O O O O
cDNA O O O O
results O O O O
in O O O O
vegetative O O O O
anthocyanins O O O O
, O O O O
whereas O O O O
TT19 O O O O
- O O O O
4 O O O O
cDNA O O O O
cannot O O O O
complement O O O O
the O O O O
proanthocyanidin O O O O
and O O O O
pale O O O O
seed O O O O
coat O O O O
phenotype O O O O
of O O O O
tt19 O O O O
- O O O O
1 O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
recombinant O O O O
TT19 O O O O
and O O O O
TT19 O O O O
- O O O O
4 O O O O
enzymes O O O O
are O O O O
functional O O O O
GSTs O O O O
and O O O O
are O O O O
localized O O O O
in O O O O
the O O O O
cytosol O O O O
, O O O O
but O O O O
TT19 O O O O
did O O O O
not O O O O
function O O O O
with O O O O
wide O O O O
range O O O O
of O O O O
flavonoids O O O O
and O O O O
natural O O O O
products O O O O
to O O O O
produce O O O O
conjugation O O O O
products O O O O
. O O O O
    
We O O O O
suggest O O O O
that O O O O
the O O O O
dark O O O O
seed O O O O
coat O O O O
of O O O O
Arabidopsis O O O O
is O O O O
related O O O O
to O O O O
soluble O O O O
proanthocyanidin O O O O
content O O O O
and O O O O
that O O O O
quercetin O O O O
holds O O O O
the O O O O
key O O O O
to O O O O
the O O O O
function O O O O
of O O O O
TT19 O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
, O O O O
TT19 O O O O
appears O O O O
to O O O O
have O O O O
a O O O O
5 O O O O
' O O O O
GSH O O O O
- O O O O
binding O O O O
domain O O O O
influencing O O O O
both O O O O
anthocyanin O O O O
and O O O O
proanthocyanidin O O O O
accumulation O O O O
and O O O O
a O O O O
3 O O O O
' O O O O
domain O O O O
affecting O O O O
proanthocyanidin O O O O
accumulation O O O O
by O O O O
a O O O O
single O O O O
amino O O O O
acid O O O O
substitution O O O O
. O O O O
    
Insights O O O O
into O O O O
membrane O O O O
association O O O O
of O O O O
Klebsiella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pneumoniae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
NifL O O O O
under O O O O
nitrogen O O O O
- O O O O
fixing O O O O
conditions O O O O
from O O O O
mutational O O O O
analysis O O O O
. O O O O
    
In O O O O
Klebsiella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pneumoniae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nitrogen O O O O
fixation O O O O
is O O O O
tightly O O O O
controlled O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
ammonium O O O O
and O O O O
molecular O O O O
oxygen O O O O
by O O O O
the O O O O
NifL O O O O
/ O O O O
NifA O O O O
regulatory O O O O
system O O O O
. O O O O
    
Under O O O O
repressing O O O O
conditions O O O O
, O O O O
NifL O O O O
inhibits O O O O
the O O O O
nif O O O O
- O O O O
specific O O O O
transcriptional O O O O
activator O O O O
NifA O O O O
by O O O O
direct O O O O
protein O O O O
- O O O O
protein O O O O
interaction O O O O
, O O O O
whereas O O O O
under O O O O
anaerobic O O O O
and O O O O
nitrogen O O O O
- O O O O
limited O O O O
conditions O O O O
sequestration O O O O
of O O O O
reduced O O O O
NifL O O O O
to O O O O
the O O O O
cytoplasmic O O O O
membrane O O O O
impairs O O O O
inhibition O O O O
of O O O O
cytoplasmic O O O O
NifA O O O O
by O O O O
NifL O O O O
. O O O O
    
We O O O O
report O O O O
here O O O O
on O O O O
a O O O O
genetic O O O O
screen O O O O
to O O O O
identify O O O O
amino O O O O
acids O O O O
of O O O O
NifL O O O O
essential O O O O
for O O O O
sequestration O O O O
to O O O O
the O O O O
cytoplasmic O O O O
membrane O O O O
under O O O O
nitrogen O O O O
- O O O O
fixing O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
Overall O O O O
, O O O O
11 O O O O
, O O O O
500 O O O O
mutated O O O O
nifL O O O O
genes O O O O
of O O O O
three O O O O
independently O O O O
generated O O O O
pools O O O O
were O O O O
screened O O O O
for O O O O
those O O O O
conferring O O O O
a O O O O
Nif O O O O
( O O O O
- O O O O
) O O O O
phenotype O O O O
. O O O O
    
Based O O O O
on O O O O
the O O O O
respective O O O O
amino O O O O
acid O O O O
changes O O O O
of O O O O
nonfunctional O O O O
derivatives O O O O
obtained O O O O
in O O O O
the O O O O
screen O O O O
, O O O O
and O O O O
taking O O O O
structural O O O O
data O O O O
into O O O O
account O O O O
as O O O O
well O O O O
, O O O O
several O O O O
point O O O O
mutations O O O O
were O O O O
introduced O O O O
into O O O O
nifL O O O O
by O O O O
site O O O O
- O O O O
directed O O O O
mutagenesis O O O O
. O O O O
    
The O O O O
majority O O O O
of O O O O
amino O O O O
acid O O O O
changes O O O O
resulting O O O O
in O O O O
a O O O O
significant O O O O
nif O O O O
gene O O O O
inhibition O O O O
were O O O O
located O O O O
in O O O O
the O O O O
N O O O O
- O O O O
terminal O O O O
domain O O O O
( O O O O
N46D O O O O
, O O O O
Q57L O O O O
, O O O O
Q64R O O O O
, O O O O
N67S O O O O
, O O O O
N69S O O O O
, O O O O
R80C O O O O
, O O O O
and O O O O
W87G O O O O
) O O O O
and O O O O
the O O O O
Q O O O O
- O O O O
linker O O O O
( O O O O
K271E O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Further O O O O
analyses O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
positions O O O O
N69 O O O O
, O O O O
R80 O O O O
, O O O O
and O O O O
W87 O O O O
are O O O O
essential O O O O
for O O O O
binding O O O O
the O O O O
FAD O O O O
cofactor O O O O
, O O O O
whereas O O O O
primarily O O O O
Q64 O O O O
and O O O O
N46 O O O O
, O O O O
but O O O O
also O O O O
Q57 O O O O
and O O O O
N67 O O O O
, O O O O
appear O O O O
to O O O O
be O O O O
crucial O O O O
for O O O O
direct O O O O
membrane O O O O
contact O O O O
of O O O O
NifL O O O O
under O O O O
oxygen O O O O
and O O O O
nitrogen O O O O
limitation O O O O
. O O O O
    
Based O O O O
on O O O O
these O O O O
findings O O O O
, O O O O
we O O O O
propose O O O O
that O O O O
those O O O O
four O O O O
amino O O O O
acids O O O O
most O O O O
likely O O O O
located O O O O
on O O O O
the O O O O
protein O O O O
surface O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
the O O O O
FAD O O O O
cofactor O O O O
, O O O O
are O O O O
crucial O O O O
for O O O O
the O O O O
correct O O O O
overall O O O O
protein O O O O
conformation O O O O
and O O O O
respective O O O O
surface O O O O
charge O O O O
, O O O O
allowing O O O O
NifL O O O O
sequestration O O O O
to O O O O
the O O O O
cytoplasmic O O O O
membrane O O O O
under O O O O
derepressing O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
Complex O O O O
regulation O O O O
of O O O O
symbiotic O O O O
functions O O O O
is O O O O
coordinated O O O O
by O O O O
MucR O O O O
and O O O O
quorum O O O O
sensing O O O O
in O O O O
Sinorhizobium O O O O
meliloti O O O O
. O O O O
    
In O O O O
Sinorhizobium O O O O
meliloti O O O O
, O O O O
the O O O O
production O O O O
of O O O O
exopolysaccharides O O O O
such O O O O
as O O O O
succinoglycan O O O O
and O O O O
exopolysaccharide O O O O
II O O O O
( O O O O
EPS O O O O
II O O O O
) O O O O
enables O O O O
the O O O O
bacterium O O O O
to O O O O
invade O O O O
root O O O O
nodules O O O O
on O O O O
Medicago B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sativa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
establish O O O O
a O O O O
nitrogen O O O O
- O O O O
fixing O O O O
symbiosis O O O O
. O O O O
    
While O O O O
extensive O O O O
research O O O O
has O O O O
focused O O O O
on O O O O
succinoglycan O O O O
, O O O O
less O O O O
is O O O O
known O O O O
concerning O O O O
the O O O O
regulation O O O O
of O O O O
EPS O O O O
II O O O O
or O O O O
the O O O O
mechanism O O O O
by O O O O
which O O O O
it O O O O
mediates O O O O
entrance O O O O
into O O O O
the O O O O
host O O O O
plant O O O O
. O O O O
    
Previously O O O O
, O O O O
we O O O O
reported O O O O
that O O O O
the O O O O
ExpR O O O O
/ O O O O
Sin O O O O
quorum O O O O
- O O O O
sensing O O O O
system O O O O
is O O O O
required O O O O
to O O O O
produce O O O O
the O O O O
symbiotically O O O O
active O O O O
low O O O O
- O O O O
molecular O O O O
- O O O O
weight O O O O
fraction O O O O
of O O O O
this O O O O
exopolysaccharide O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
show O O O O
that O O O O
this O O O O
system O O O O
induces O O O O
EPS O O O O
II O O O O
production O O O O
by O O O O
increasing O O O O
expression O O O O
of O O O O
the O O O O
expG O O O O
- O O O O
expC O O O O
operon O O O O
, O O O O
encoding O O O O
both O O O O
a O O O O
transcriptional O O O O
regulator O O O O
( O O O O
ExpG O O O O
) O O O O
and O O O O
a O O O O
glycosyl O O O O
transferase O O O O
( O O O O
ExpC O O O O
) O O O O
. O O O O
    
ExpG O O O O
derepresses O O O O
EPS O O O O
II O O O O
production O O O O
at O O O O
the O O O O
transcriptional O O O O
level O O O O
from O O O O
MucR O O O O
, O O O O
a O O O O
RosR O O O O
homolog O O O O
, O O O O
while O O O O
concurrently O O O O
elevating O O O O
expression O O O O
of O O O O
expC O O O O
, O O O O
resulting O O O O
in O O O O
the O O O O
synthesis O O O O
of O O O O
the O O O O
low O O O O
- O O O O
molecular O O O O
- O O O O
weight O O O O
form O O O O
. O O O O
    
While O O O O
the O O O O
ExpR O O O O
/ O O O O
Sin O O O O
system O O O O
abolishes O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
MucR O O O O
on O O O O
EPS O O O O
II O O O O
production O O O O
, O O O O
it O O O O
preserves O O O O
a O O O O
multitude O O O O
of O O O O
other O O O O
quorum O O O O
- O O O O
sensing O O O O
- O O O O
independent O O O O
regulatory O O O O
functions O O O O
which O O O O
promote O O O O
the O O O O
establishment O O O O
of O O O O
symbiosis O O O O
. O O O O
    
In O O O O
planktonic O O O O
S O O O O
. O O O O
meliloti O O O O
, O O O O
MucR O O O O
properly O O O O
coordinates O O O O
a O O O O
diverse O O O O
set O O O O
of O O O O
bacterial O O O O
behaviors O O O O
by O O O O
repressing O O O O
a O O O O
variety O O O O
of O O O O
genes O O O O
intended O O O O
for O O O O
expression O O O O
during O O O O
symbiosis O O O O
and O O O O
enhancing O O O O
the O O O O
bacterial O O O O
ability O O O O
to O O O O
induce O O O O
root O O O O
nodule O O O O
formation O O O O
. O O O O
    
Quorum O O O O
sensing O O O O
precisely O O O O
modulates O O O O
the O O O O
functions O O O O
of O O O O
MucR O O O O
to O O O O
take O O O O
advantage O O O O
of O O O O
both O O O O
the O O O O
production O O O O
of O O O O
symbiotically O O O O
active O O O O
EPS O O O O
II O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
the O O O O
proper O O O O
coordination O O O O
of O O O O
bacterial O O O O
behavior O O O O
required O O O O
to O O O O
promote O O O O
symbiosis O O O O
. O O O O
    
Biochemical O O O O
characterization O O O O
of O O O O
UDP O O O O
- O O O O
Gal O O O O
: O O O O
GlcNAc O O O O
- O O O O
pyrophosphate O O O O
- O O O O
lipid O O O O
Beta O O O O
- O O O O
1 O O O O
, O O O O
4 O O O O
- O O O O
Galactosyltransferase O O O O
WfeD O O O O
, O O O O
a O O O O
new O O O O
enzyme O O O O
from O O O O
Shigella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
boydii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
type O O O O
14 O O O O
that O O O O
catalyzes O O O O
the O O O O
second O O O O
step O O O O
in O O O O
O O O O O
- O O O O
antigen O O O O
repeating O O O O
- O O O O
unit O O O O
synthesis O O O O
. O O O O
    
The O O O O
O O O O O
antigen O O O O
is O O O O
the O O O O
outer O O O O
part O O O O
of O O O O
the O O O O
lipopolysaccharide O O O O
( O O O O
LPS O O O O
) O O O O
in O O O O
the O O O O
outer O O O O
membrane O O O O
of O O O O
Gram O O O O
- O O O O
negative O O O O
bacteria O O O O
and O O O O
contains O O O O
many O O O O
repeats O O O O
of O O O O
an O O O O
oligosaccharide O O O O
unit O O O O
. O O O O
    
It O O O O
contributes O O O O
to O O O O
antigenic O O O O
variability O O O O
and O O O O
is O O O O
essential O O O O
to O O O O
the O O O O
full O O O O
function O O O O
and O O O O
virulence O O O O
of O O O O
bacteria O O O O
. O O O O
    
Shigella O O O O
is O O O O
a O O O O
Gram O O O O
- O O O O
negative O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pathogen O O O O
that O O O O
causes O O O O
diarrhea O O O O
in O O O O
humans B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
O O O O O
antigen O O O O
of O O O O
Shigella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
boydii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
type O O O O
14 O O O O
consists O O O O
of O O O O
repeating O O O O
oligosaccharide O O O O
units O O O O
with O O O O
the O O O O
structure O O O O
[ O O O O
- O O O O
> O O O O
6 O O O O
- O O O O
d O O O O
- O O O O
Galpalpha1 O O O O
- O O O O
> O O O O
4 O O O O
- O O O O
d O O O O
- O O O O
GlcpABeta1 O O O O
- O O O O
> O O O O
6 O O O O
- O O O O
d O O O O
- O O O O
GalpBeta1 O O O O
- O O O O
> O O O O
4 O O O O
- O O O O
d O O O O
- O O O O
GalpBeta1 O O O O
- O O O O
> O O O O
4 O O O O
- O O O O
d O O O O
- O O O O
GlcpNAcBeta1 O O O O
- O O O O
> O O O O
] O O O O
n O O O O
. O O O O
    
The O O O O
wfeD O O O O
gene O O O O
in O O O O
the O O O O
O O O O O
- O O O O
antigen O O O O
gene O O O O
cluster O O O O
of O O O O
Shigella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
boydii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
type O O O O
14 O O O O
was O O O O
proposed O O O O
to O O O O
encode O O O O
a O O O O
galactosyltransferase O O O O
( O O O O
GalT O O O O
) O O O O
involved O O O O
in O O O O
O O O O O
- O O O O
antigen O O O O
synthesis O O O O
. O O O O
    
We O O O O
confirmed O O O O
here O O O O
that O O O O
the O O O O
wfeD O O O O
gene O O O O
product O O O O
is O O O O
a O O O O
Beta4 O O O O
- O O O O
GalT O O O O
that O O O O
synthesizes O O O O
the O O O O
GalBeta1 O O O O
- O O O O
4GlcNAcalpha O O O O
- O O O O
R O O O O
linkage O O O O
. O O O O
    
WfeD O O O O
was O O O O
expressed O O O O
in O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
the O O O O
activity O O O O
was O O O O
characterized O O O O
by O O O O
using O O O O
UDP O O O O
- O O O O
[ O O O O
^ O O O O
3H O O O O
] O O O O
Gal O O O O
as O O O O
the O O O O
donor O O O O
substrate O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
the O O O O
synthetic O O O O
acceptor O O O O
substrate O O O O
GlcNAcalpha O O O O
- O O O O
pyrophosphate O O O O
- O O O O
( O O O O
CH2 O O O O
) O O O O
11 O O O O
- O O O O
O O O O O
- O O O O
phenyl O O O O
. O O O O
    
The O O O O
enzyme O O O O
product O O O O
was O O O O
analyzed O O O O
by O O O O
liquid O O O O
chromatography O O O O
- O O O O
mass O O O O
spectrometry O O O O
( O O O O
LC O O O O
- O O O O
MS O O O O
) O O O O
, O O O O
high O O O O
- O O O O
performance O O O O
liquid O O O O
chromatography O O O O
( O O O O
HPLC O O O O
) O O O O
, O O O O
nuclear O O O O
magnetic O O O O
resonance O O O O
( O O O O
NMR O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
galactosidase O O O O
digestion O O O O
. O O O O
    
The O O O O
enzyme O O O O
was O O O O
shown O O O O
to O O O O
be O O O O
specific O O O O
for O O O O
the O O O O
UDP O O O O
- O O O O
Gal O O O O
donor O O O O
substrate O O O O
and O O O O
required O O O O
pyrophosphate O O O O
in O O O O
the O O O O
acceptor O O O O
substrate O O O O
. O O O O
    
Divalent O O O O
metal O O O O
ions O O O O
such O O O O
as O O O O
Mn O O O O
^ O O O O
2 O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
, O O O O
Ni O O O O
^ O O O O
2 O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
, O O O O
surprisingly O O O O
, O O O O
also O O O O
Pb O O O O
^ O O O O
2 O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
enhanced O O O O
the O O O O
enzyme O O O O
activity O O O O
. O O O O
    
Mutational O O O O
analysis O O O O
showed O O O O
that O O O O
the O O O O
Glu101 O O O O
residue O O O O
within O O O O
a O O O O
DxD O O O O
motif O O O O
is O O O O
essential O O O O
for O O O O
activity O O O O
, O O O O
possibly O O O O
by O O O O
forming O O O O
the O O O O
catalytic O O O O
nucleophile O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Lys211 O O O O
residue O O O O
was O O O O
also O O O O
shown O O O O
to O O O O
be O O O O
required O O O O
for O O O O
activity O O O O
and O O O O
may O O O O
be O O O O
involved O O O O
in O O O O
the O O O O
binding O O O O
of O O O O
the O O O O
negatively O O O O
charged O O O O
acceptor O O O O
substrate O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
study O O O O
revealed O O O O
that O O O O
the O O O O
Beta4 O O O O
- O O O O
GalT O O O O
WfeD O O O O
is O O O O
a O O O O
novel O O O O
enzyme O O O O
that O O O O
has O O O O
virtually O O O O
no O O O O
sequence O O O O
similarity O O O O
to O O O O
mammalian O O O O
Beta4 O O O O
- O O O O
GalT O O O O
, O O O O
although O O O O
it O O O O
catalyzes O O O O
a O O O O
similar O O O O
reaction O O O O
. O O O O
    
Plasma O O O O
membrane O O O O
Ca O O O O
^ O O O O
2 O O O O
+ O O O O
transporters O O O O
mediate O O O O
virus O O O O
- O O O O
induced O O O O
acquired O O O O
resistance O O O O
to O O O O
oxidative O O O O
stress O O O O
. O O O O
    
This O O O O
paper O O O O
reports O O O O
the O O O O
phenomenon O O O O
of O O O O
acquired O O O O
cross O O O O
- O O O O
tolerance O O O O
to O O O O
oxidative O O O O
stress O O O O
in O O O O
plants O O O O
and O O O O
investigates O O O O
the O O O O
activity O O O O
of O O O O
specific O O O O
Ca O O O O
^ O O O O
2 O O O O
+ O O O O
transport O O O O
systems O O O O
mediating O O O O
this O O O O
phenomenon O O O O
. O O O O
    
Nicotiana B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
benthamiana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
plants O O O O
were O O O O
infected O O O O
with O O O O
Potato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
X O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
PVX B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
and O O O O
exposed O O O O
to O O O O
oxidative O O O O
[ O O O O
either O O O O
ultraviolet O O O O
( O O O O
UV O O O O
- O O O O
C O O O O
) O O O O
or O O O O
H2O2 O O O O
] O O O O
stress O O O O
. O O O O
    
Plant O O O O
adaptive O O O O
responses O O O O
were O O O O
assessed O O O O
by O O O O
the O O O O
combined O O O O
application O O O O
of O O O O
a O O O O
range O O O O
of O O O O
electrophysiological O O O O
( O O O O
non O O O O
- O O O O
invasive O O O O
microelectrode O O O O
ion O O O O
flux O O O O
measurements O O O O
) O O O O
, O O O O
biochemical O O O O
( O O O O
Ca O O O O
^ O O O O
2 O O O O
+ O O O O
- O O O O
and O O O O
H O O O O
+ O O O O
- O O O O
ATPase O O O O
activity O O O O
) O O O O
, O O O O
imaging O O O O
( O O O O
fluorescence O O O O
lifetime O O O O
imaging O O O O
measurements O O O O
of O O O O
changes O O O O
in O O O O
intracellular O O O O
Ca O O O O
^ O O O O
2 O O O O
+ O O O O
concentrations O O O O
) O O O O
, O O O O
pharmacological O O O O
and O O O O
cytological O O O O
transmission O O O O
electrone O O O O
microscopy O O O O
techniques O O O O
. O O O O
    
Virus O O O O
- O O O O
infected O O O O
plants O O O O
had O O O O
a O O O O
better O O O O
ability O O O O
to O O O O
control O O O O
UV O O O O
- O O O O
induced O O O O
elevations O O O O
in O O O O
cytosolic O O O O
- O O O O
free O O O O
Ca O O O O
^ O O O O
2 O O O O
+ O O O O
and O O O O
prevent O O O O
structural O O O O
and O O O O
functional O O O O
damage O O O O
of O O O O
chloroplasts O O O O
. O O O O
    
Taken O O O O
together O O O O
, O O O O
our O O O O
results O O O O
suggest O O O O
a O O O O
high O O O O
degree O O O O
of O O O O
crosstalk O O O O
between O O O O
UV O O O O
and O O O O
pathogen O O O O
- O O O O
induced O O O O
oxidative O O O O
stresses O O O O
, O O O O
and O O O O
highlight O O O O
the O O O O
crucial O O O O
role O O O O
of O O O O
Ca O O O O
^ O O O O
2 O O O O
+ O O O O
efflux O O O O
systems O O O O
in O O O O
acquired O O O O
resistance O O O O
to O O O O
oxidative O O O O
stress O O O O
in O O O O
plants O O O O
. O O O O
    
Involvement O O O O
of O O O O
extracellular O O O O
oxidative O O O O
burst O O O O
in O O O O
salicylic O O O O
acid O O O O
- O O O O
induced O O O O
stomatal O O O O
closure O O O O
in O O O O
Arabidopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Salicylic O O O O
acid O O O O
( O O O O
SA O O O O
) O O O O
, O O O O
a O O O O
ubiquitous O O O O
phenolic O O O O
phytohormone O O O O
, O O O O
is O O O O
involved O O O O
in O O O O
many O O O O
plant O O O O
physiological O O O O
processes O O O O
including O O O O
stomatal O O O O
movement O O O O
. O O O O
    
We O O O O
analysed O O O O
SA O O O O
- O O O O
induced O O O O
stomatal O O O O
closure O O O O
, O O O O
production O O O O
of O O O O
reactive O O O O
oxygen O O O O
species O O O O
( O O O O
ROS O O O O
) O O O O
and O O O O
nitric O O O O
oxide O O O O
( O O O O
NO O O O O
) O O O O
, O O O O
cytosolic O O O O
calcium O O O O
ion O O O O
( O O O O
[ O O O O
Ca O O O O
^ O O O O
2 O O O O
+ O O O O
] O O O O
( O O O O
cyt O O O O
) O O O O
) O O O O
oscillations O O O O
and O O O O
inward O O O O
- O O O O
rectifying O O O O
potassium O O O O
( O O O O
K O O O O
+ O O O O
( O O O O
in O O O O
) O O O O
) O O O O
channel O O O O
activity O O O O
in O O O O
Arabidopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
SA O O O O
- O O O O
induced O O O O
stomatal O O O O
closure O O O O
was O O O O
inhibited O O O O
by O O O O
pre O O O O
- O O O O
treatment O O O O
with O O O O
catalase O O O O
( O O O O
CAT O O O O
) O O O O
and O O O O
superoxide O O O O
dismutase O O O O
( O O O O
SOD O O O O
) O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
the O O O O
involvement O O O O
of O O O O
extracellular O O O O
ROS O O O O
. O O O O
    
A O O O O
peroxidase O O O O
inhibitor O O O O
, O O O O
SHAM O O O O
( O O O O
salicylhydroxamic O O O O
acid O O O O
) O O O O
completely O O O O
abolished O O O O
SA O O O O
- O O O O
induced O O O O
stomatal O O O O
closure O O O O
whereas O O O O
neither O O O O
an O O O O
inhibitor O O O O
of O O O O
NADPH O O O O
oxidase O O O O
( O O O O
DPI O O O O
) O O O O
nor O O O O
atrbohD O O O O
atrbohF O O O O
mutation O O O O
impairs O O O O
SA O O O O
- O O O O
induced O O O O
stomatal O O O O
closures O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
, O O O O
3 O O O O
' O O O O
- O O O O
Diaminobenzidine O O O O
( O O O O
DAB O O O O
) O O O O
and O O O O
nitroblue O O O O
tetrazolium O O O O
( O O O O
NBT O O O O
) O O O O
stainings O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
SA O O O O
induced O O O O
H2O2 O O O O
and O O O O
O2 O O O O
- O O O O
production O O O O
. O O O O
    
Guard O O O O
cell O O O O
ROS O O O O
accumulation O O O O
was O O O O
significantly O O O O
increased O O O O
by O O O O
SA O O O O
, O O O O
but O O O O
that O O O O
ROS O O O O
was O O O O
suppressed O O O O
by O O O O
exogenous O O O O
CAT O O O O
, O O O O
SOD O O O O
and O O O O
SHAM O O O O
. O O O O
    
NO O O O O
scavenger O O O O
2 O O O O
- O O O O
( O O O O
4 O O O O
- O O O O
carboxyphenyl O O O O
) O O O O
- O O O O
4 O O O O
, O O O O
4 O O O O
, O O O O
5 O O O O
, O O O O
5 O O O O
- O O O O
tetramethylimidazoline O O O O
- O O O O
1 O O O O
- O O O O
oxyl O O O O
- O O O O
3 O O O O
- O O O O
oxide O O O O
( O O O O
cPTIO O O O O
) O O O O
suppressed O O O O
the O O O O
SA O O O O
- O O O O
induced O O O O
stomatal O O O O
closure O O O O
but O O O O
did O O O O
not O O O O
suppress O O O O
guard O O O O
cell O O O O
ROS O O O O
accumulation O O O O
whereas O O O O
SHAM O O O O
suppressed O O O O
SA O O O O
- O O O O
induced O O O O
NO O O O O
production O O O O
. O O O O
    
SA O O O O
failed O O O O
to O O O O
induce O O O O
[ O O O O
Ca O O O O
^ O O O O
2 O O O O
+ O O O O
] O O O O
( O O O O
cyt O O O O
) O O O O
oscillations O O O O
in O O O O
guard O O O O
cells O O O O
whereas O O O O
K O O O O
+ O O O O
( O O O O
in O O O O
) O O O O
channel O O O O
activity O O O O
was O O O O
suppressed O O O O
by O O O O
SA O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
indicate O O O O
that O O O O
SA O O O O
induces O O O O
stomatal O O O O
closure O O O O
accompanied O O O O
with O O O O
extracellular O O O O
ROS O O O O
production O O O O
mediated O O O O
by O O O O
SHAM O O O O
- O O O O
sensitive O O O O
peroxidase O O O O
, O O O O
intracellular O O O O
ROS O O O O
accumulation O O O O
and O O O O
K O O O O
+ O O O O
( O O O O
in O O O O
) O O O O
channel O O O O
inactivation O O O O
. O O O O
    
Effect O O O O
of O O O O
soil O O O O
acidity O O O O
, O O O O
soil O O O O
strength O O O O
and O O O O
macropores O O O O
on O O O O
root O O O O
growth O O O O
and O O O O
morphology O O O O
of O O O O
perennial O O O O
grass O O O O
species O O O O
differing O O O O
in O O O O
acid O O O O
- O O O O
soil O O O O
resistance O O O O
. O O O O
    
It O O O O
is O O O O
unclear O O O O
whether O O O O
roots O O O O
of O O O O
acid O O O O
- O O O O
soil O O O O
resistant O O O O
plants O O O O
have O O O O
significant O O O O
advantages O O O O
, O O O O
compared O O O O
with O O O O
acid O O O O
- O O O O
soil O O O O
sensitive O O O O
genotypes O O O O
, O O O O
when O O O O
growing O O O O
in O O O O
high O O O O
- O O O O
strength O O O O
, O O O O
acid O O O O
soils O O O O
or O O O O
in O O O O
acid O O O O
soils O O O O
where O O O O
macropores O O O O
may O O O O
allow O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
soil O O O O
acidity O O O O
and O O O O
strength O O O O
to O O O O
be O O O O
avoided O O O O
. O O O O
    
The O O O O
responses O O O O
of O O O O
root O O O O
growth O O O O
and O O O O
morphology O O O O
to O O O O
soil O O O O
acidity O O O O
, O O O O
soil O O O O
strength O O O O
and O O O O
macropores O O O O
by O O O O
seedlings O O O O
of O O O O
five O O O O
perennial O O O O
grass O O O O
genotypes O O O O
differing O O O O
in O O O O
acid O O O O
- O O O O
soil O O O O
resistance O O O O
were O O O O
determined O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
interaction O O O O
of O O O O
soil O O O O
acidity O O O O
and O O O O
strength O O O O
for O O O O
growth O O O O
and O O O O
morphology O O O O
of O O O O
roots O O O O
was O O O O
investigated O O O O
. O O O O
    
Soil O O O O
acidity O O O O
and O O O O
strength O O O O
altered O O O O
root O O O O
length O O O O
and O O O O
architecture O O O O
, O O O O
root O O O O
hair O O O O
development O O O O
, O O O O
and O O O O
deformed O O O O
the O O O O
root O O O O
tip O O O O
, O O O O
especially O O O O
in O O O O
acid O O O O
- O O O O
soil O O O O
sensitive O O O O
genotypes O O O O
. O O O O
    
Root O O O O
length O O O O
was O O O O
restricted O O O O
to O O O O
some O O O O
extent O O O O
by O O O O
soil O O O O
acidity O O O O
in O O O O
all O O O O
genotypes O O O O
, O O O O
but O O O O
the O O O O
adverse O O O O
impact O O O O
of O O O O
soil O O O O
acidity O O O O
on O O O O
root O O O O
growth O O O O
by O O O O
acid O O O O
- O O O O
soil O O O O
resistant O O O O
genotypes O O O O
was O O O O
greater O O O O
at O O O O
high O O O O
levels O O O O
of O O O O
soil O O O O
strength O O O O
. O O O O
    
Roots O O O O
reacted O O O O
to O O O O
soil O O O O
acidity O O O O
when O O O O
growing O O O O
in O O O O
macropores O O O O
, O O O O
but O O O O
elongation O O O O
through O O O O
high O O O O
- O O O O
strength O O O O
soil O O O O
was O O O O
improved O O O O
. O O O O
    
Soil O O O O
strength O O O O
can O O O O
confound O O O O
the O O O O
effect O O O O
of O O O O
acidity O O O O
on O O O O
root O O O O
growth O O O O
, O O O O
with O O O O
the O O O O
sensitivity O O O O
of O O O O
acid O O O O
- O O O O
resistant O O O O
genotypes O O O O
being O O O O
greater O O O O
in O O O O
high O O O O
- O O O O
strength O O O O
soils O O O O
. O O O O
    
This O O O O
highlights O O O O
the O O O O
need O O O O
to O O O O
select O O O O
for O O O O
genotypes O O O O
that O O O O
resist O O O O
both O O O O
acidity O O O O
and O O O O
high O O O O
soil O O O O
strength O O O O
. O O O O
    
Enhanced O O O O
formation O O O O
of O O O O
methane O O O O
in O O O O
plant O O O O
cell O O O O
cultures O O O O
by O O O O
inhibition O O O O
of O O O O
cytochrome O O O O
c O O O O
oxidase O O O O
. O O O O
    
The O O O O
claim O O O O
of O O O O
methane O O O O
( O O O O
CH4 O O O O
) O O O O
formation O O O O
in O O O O
plants O O O O
has O O O O
caused O O O O
much O O O O
controversy O O O O
and O O O O
debate O O O O
within O O O O
the O O O O
scientific O O O O
community O O O O
over O O O O
the O O O O
past O O O O
4 O O O O
years O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
using O O O O
both O O O O
stable O O O O
isotope O O O O
and O O O O
concentration O O O O
measurements O O O O
, O O O O
we O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
CH4 O O O O
formation O O O O
occurs O O O O
in O O O O
plant O O O O
cell O O O O
cultures O O O O
that O O O O
were O O O O
grown O O O O
in O O O O
the O O O O
dark O O O O
under O O O O
sterile O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
Under O O O O
non O O O O
- O O O O
stress O O O O
conditions O O O O
the O O O O
plant O O O O
cell O O O O
cultures O O O O
produced O O O O
trace O O O O
amounts O O O O
[ O O O O
0 O O O O
. O O O O
3 O O O O
- O O O O
0 O O O O
. O O O O
6 O O O O
ng O O O O
g O O O O
- O O O O
^ O O O O
1 O O O O
dry O O O O
weight O O O O
( O O O O
DW O O O O
) O O O O
h O O O O
- O O O O
^ O O O O
1 O O O O
] O O O O
of O O O O
CH4 O O O O
but O O O O
these O O O O
could O O O O
be O O O O
increased O O O O
by O O O O
one O O O O
to O O O O
two O O O O
orders O O O O
of O O O O
magnitude O O O O
( O O O O
up O O O O
to O O O O
12 O O O O
ng O O O O
g O O O O
- O O O O
^ O O O O
1 O O O O
DW O O O O
h O O O O
- O O O O
^ O O O O
1 O O O O
) O O O O
when O O O O
sodium O O O O
azide O O O O
, O O O O
a O O O O
compound O O O O
known O O O O
to O O O O
disrupt O O O O
electron O O O O
transport O O O O
flow O O O O
at O O O O
the O O O O
cytochrome O O O O
c O O O O
oxidase O O O O
( O O O O
complex O O O O
IV O O O O
) O O O O
in O O O O
plant O O O O
mitochondria O O O O
, O O O O
was O O O O
added O O O O
to O O O O
the O O O O
cell O O O O
cultures O O O O
. O O O O
    
The O O O O
addition O O O O
of O O O O
other O O O O
electron O O O O
transport O O O O
chain O O O O
( O O O O
ETC O O O O
) O O O O
inhibitors O O O O
did O O O O
not O O O O
result O O O O
in O O O O
significant O O O O
CH4 O O O O
formation O O O O
indicating O O O O
that O O O O
a O O O O
site O O O O
- O O O O
specific O O O O
disturbance O O O O
of O O O O
the O O O O
ETC O O O O
at O O O O
complex O O O O
IV O O O O
causes O O O O
CH4 O O O O
formation O O O O
in O O O O
plant O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
study O O O O
is O O O O
an O O O O
important O O O O
first O O O O
step O O O O
in O O O O
providing O O O O
more O O O O
information O O O O
on O O O O
non O O O O
- O O O O
microbial O O O O
CH4 O O O O
formation O O O O
from O O O O
living O O O O
plants O O O O
particularly O O O O
under O O O O
abiotic O O O O
stress O O O O
conditions O O O O
that O O O O
might O O O O
affect O O O O
the O O O O
electron O O O O
transport O O O O
flow O O O O
at O O O O
the O O O O
cytochrome O O O O
c O O O O
oxidase O O O O
in O O O O
plant O O O O
mitochondria O O O O
. O O O O
    
Microbial O O O O
and O O O O
viral O O O O
pathogens O O O O
in O O O O
colorectal O O O O
cancer O O O O
. O O O O
    
The O O O O
heterogenetic O O O O
and O O O O
sporadic O O O O
nature O O O O
of O O O O
colorectal O O O O
cancer O O O O
has O O O O
led O O O O
to O O O O
many O O O O
epidemiological O O O O
associations O O O O
with O O O O
causes O O O O
of O O O O
this O O O O
disease O O O O
. O O O O
    
As O O O O
our O O O O
understanding O O O O
of O O O O
the O O O O
underlying O O O O
molecular O O O O
processes O O O O
in O O O O
colorectal O O O O
- O O O O
cancer O O O O
develops O O O O
, O O O O
the O O O O
concept O O O O
of O O O O
microbial O O O O
- O O O O
epithelial O O O O
interactions O O O O
as O O O O
an O O O O
oncogenic O O O O
trigger O O O O
might O O O O
provide O O O O
a O O O O
plausible O O O O
hypothesis O O O O
for O O O O
the O O O O
pathogenesis O O O O
of O O O O
colorectal O O O O
cancer O O O O
. O O O O
    
By O O O O
contrast O O O O
with O O O O
other O O O O
cancers O O O O
of O O O O
the O O O O
gastrointestinal O O O O
tract O O O O
( O O O O
gastric O O O O
carcinoma O O O O
, O O O O
mucosa O O O O
- O O O O
associated O O O O
lymphoid O O O O
- O O O O
tissue O O O O
lymphoma O O O O
) O O O O
, O O O O
a O O O O
direct O O O O
causal O O O O
link O O O O
between O O O O
microbial O O O O
infection O O O O
( O O O O
bacteria O O O O
and O O O O
viruses O O O O
) O O O O
and O O O O
colorectal O O O O
carcinoma O O O O
has O O O O
not O O O O
been O O O O
established O O O O
. O O O O
    
Studies O O O O
support O O O O
the O O O O
involvement O O O O
of O O O O
these O O O O
organisms O O O O
in O O O O
oncogenesis O O O O
, O O O O
however O O O O
, O O O O
in O O O O
colorectal O O O O
cancer O O O O
, O O O O
clinical O O O O
data O O O O
are O O O O
lacking O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
discuss O O O O
current O O O O
evidence O O O O
( O O O O
both O O O O
in O O O O
vitro O O O O
and O O O O
clinical O O O O
studies O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
focus O O O O
on O O O O
a O O O O
putative O O O O
role O O O O
for O O O O
bacterial O O O O
and O O O O
viral O O O O
pathogens O O O O
as O O O O
a O O O O
cause O O O O
of O O O O
colorectal O O O O
cancer O O O O
. O O O O
    
Activation O O O O
and O O O O
localization O O O O
of O O O O
protein O O O O
kinase O O O O
C O O O O
in O O O O
Neurospora B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
crassa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
Neurosporacrassa B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
protein O O O O
kinase O O O O
C O O O O
( O O O O
NPKC O O O O
) O O O O
is O O O O
reported O O O O
to O O O O
be O O O O
a O O O O
regulator O O O O
of O O O O
light O O O O
responsive O O O O
genes O O O O
. O O O O
    
It O O O O
phosphorylates O O O O
the O O O O
light O O O O
receptor O O O O
WC O O O O
- O O O O
1 O O O O
and O O O O
regulates O O O O
the O O O O
levels O O O O
of O O O O
the O O O O
circadian O O O O
clock O O O O
protein O O O O
FRQ O O O O
and O O O O
transcription O O O O
of O O O O
the O O O O
light O O O O
- O O O O
induced O O O O
albino O O O O
- O O O O
2 O O O O
gene O O O O
. O O O O
    
In O O O O
mammals O O O O
, O O O O
the O O O O
conventional O O O O
and O O O O
novel O O O O
isoforms O O O O
of O O O O
PKC O O O O
are O O O O
activated O O O O
by O O O O
diacylglycerol O O O O
( O O O O
DAG O O O O
) O O O O
, O O O O
which O O O O
induces O O O O
PKC O O O O
translocation O O O O
from O O O O
the O O O O
cytoplasm O O O O
to O O O O
membranes O O O O
. O O O O
    
To O O O O
investigate O O O O
the O O O O
interaction O O O O
of O O O O
NPKC O O O O
and O O O O
DAG O O O O
in O O O O
Neurospora O O O O
, O O O O
we O O O O
constructed O O O O
a O O O O
strain O O O O
that O O O O
expresses O O O O
a O O O O
PKC O O O O
- O O O O
GFP O O O O
fusion O O O O
protein O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
that O O O O
NPKC O O O O
localizes O O O O
to O O O O
growing O O O O
tips O O O O
and O O O O
sub O O O O
- O O O O
apical O O O O
plasma O O O O
membrane O O O O
in O O O O
actively O O O O
growing O O O O
hyphae O O O O
, O O O O
and O O O O
actively O O O O
participates O O O O
in O O O O
septum O O O O
development O O O O
. O O O O
    
NPKC O O O O
is O O O O
activated O O O O
by O O O O
exogenous O O O O
DAG O O O O
and O O O O
phorbol O O O O
esters O O O O
, O O O O
and O O O O
translocates O O O O
to O O O O
the O O O O
plasma O O O O
membrane O O O O
from O O O O
the O O O O
cytoplasm O O O O
. O O O O
    
We O O O O
have O O O O
previously O O O O
reported O O O O
that O O O O
choline O O O O
depletion O O O O
of O O O O
the O O O O
chol O O O O
- O O O O
1 O O O O
mutant O O O O
of O O O O
Neurospora O O O O
increases O O O O
DAG O O O O
levels O O O O
and O O O O
lengthens O O O O
the O O O O
period O O O O
of O O O O
the O O O O
circadian O O O O
rhythm O O O O
of O O O O
conidiation O O O O
. O O O O
    
We O O O O
have O O O O
found O O O O
that O O O O
the O O O O
activity O O O O
of O O O O
NPKC O O O O
is O O O O
rhythmic O O O O
, O O O O
and O O O O
that O O O O
NPKC O O O O
levels O O O O
are O O O O
increased O O O O
on O O O O
choline O O O O
depletion O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
over O O O O
- O O O O
expression O O O O
of O O O O
NPKC O O O O
did O O O O
not O O O O
lengthen O O O O
the O O O O
conidiation O O O O
period O O O O
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
PKC O O O O
in O O O O
Neurospora O O O O
may O O O O
not O O O O
be O O O O
responsible O O O O
for O O O O
the O O O O
lengthened O O O O
period O O O O
in O O O O
low O O O O
choline O O O O
cultures O O O O
. O O O O
    
Cercozoa O O O O
comprises O O O O
both O O O O
EF O O O O
- O O O O
1alpha O O O O
- O O O O
containing O O O O
and O O O O
EFL O O O O
- O O O O
containing O O O O
members O O O O
. O O O O
    
Elongation O O O O
factor O O O O
1alpha O O O O
( O O O O
EF O O O O
- O O O O
1alpha O O O O
) O O O O
and O O O O
elongation O O O O
factor O O O O
- O O O O
like O O O O
protein O O O O
( O O O O
EFL O O O O
) O O O O
are O O O O
considered O O O O
to O O O O
be O O O O
functionally O O O O
equivalent O O O O
proteins O O O O
involved O O O O
in O O O O
peptide O O O O
synthesis O O O O
. O O O O
    
Eukaryotes O O O O
can O O O O
be O O O O
fundamentally O O O O
divided O O O O
into O O O O
' O O O O
EF O O O O
- O O O O
1alpha O O O O
- O O O O
containing O O O O
' O O O O
and O O O O
' O O O O
EFL O O O O
- O O O O
containing O O O O
' O O O O
types O O O O
. O O O O
    
Recently O O O O
, O O O O
EF O O O O
- O O O O
1alpha O O O O
and O O O O
EFL O O O O
genes O O O O
have O O O O
been O O O O
surveyed O O O O
across O O O O
the O O O O
diversity O O O O
of O O O O
eukaryotes O O O O
to O O O O
explore O O O O
the O O O O
origin O O O O
and O O O O
evolution O O O O
of O O O O
EFL O O O O
genes O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
the O O O O
phylum O O O O
Cercozoa O O O O
is O O O O
a O O O O
diverse O O O O
group O O O O
, O O O O
gene O O O O
data O O O O
for O O O O
either O O O O
EFL O O O O
or O O O O
EF O O O O
- O O O O
1alpha O O O O
are O O O O
absent O O O O
from O O O O
all O O O O
cercozoans O O O O
except O O O O
chlorarachniophytes O O O O
which O O O O
were O O O O
previously O O O O
defined O O O O
as O O O O
EFL O O O O
- O O O O
containing O O O O
members O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
survey O O O O
revealed O O O O
that O O O O
two O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
cercozoan O O O O
subphylum O O O O
Filosa O O O O
( O O O O
Thaumatomastix O O O O
sp O O O O
. O O O O
and O O O O
strain O O O O
YPF610 O O O O
) O O O O
are O O O O
EFL O O O O
- O O O O
containing O O O O
members O O O O
. O O O O
    
Importantly O O O O
, O O O O
we O O O O
identified O O O O
EF O O O O
- O O O O
1alpha O O O O
genes O O O O
from O O O O
two O O O O
members O O O O
of O O O O
Filosa O O O O
( O O O O
Paracercomonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
marina O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Paulinella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
chromatophora O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
and O O O O
a O O O O
member O O O O
of O O O O
the O O O O
other O O O O
subphylum O O O O
Endomyxa O O O O
( O O O O
Filoreta B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
japonica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
. O O O O
    
All O O O O
cercozoan O O O O
EFL O O O O
homologues O O O O
could O O O O
not O O O O
be O O O O
recovered O O O O
as O O O O
a O O O O
monophyletic O O O O
group O O O O
in O O O O
maximum O O O O
- O O O O
likelihood O O O O
and O O O O
Bayesian O O O O
analyses O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
lateral O O O O
gene O O O O
transfer O O O O
was O O O O
involved O O O O
in O O O O
the O O O O
EFL O O O O
evolution O O O O
in O O O O
this O O O O
protist O O O O
assemblage O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
, O O O O
EF O O O O
- O O O O
1alpha O O O O
analysis O O O O
successfully O O O O
recovered O O O O
a O O O O
monophyly O O O O
of O O O O
three O O O O
homologues O O O O
sampled O O O O
from O O O O
the O O O O
two O O O O
cercozoan O O O O
subphyla O O O O
. O O O O
    
Based O O O O
on O O O O
the O O O O
results O O O O
, O O O O
we O O O O
postulate O O O O
that O O O O
cercozoan O O O O
EF O O O O
- O O O O
1alpha O O O O
genes O O O O
have O O O O
been O O O O
vertically O O O O
inherited O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
current O O O O
EFL O O O O
- O O O O
containing O O O O
species O O O O
may O O O O
have O O O O
secondarily O O O O
lost O O O O
their O O O O
EF O O O O
- O O O O
1alpha O O O O
genes O O O O
. O O O O
    
Ecological O O O O
conditions O O O O
in O O O O
wintering O O O O
and O O O O
passage O O O O
areas O O O O
as O O O O
determinants O O O O
of O O O O
timing O O O O
of O O O O
spring O O O O
migration O O O O
in O O O O
trans O O O O
- O O O O
Saharan O O O O
migratory O O O O
birds O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Climate O O O O
change O O O O
has O O O O
been O O O O
associated O O O O
with O O O O
shifts O O O O
in O O O O
the O O O O
timing O O O O
of O O O O
biological O O O O
events O O O O
, O O O O
including O O O O
the O O O O
spring O O O O
arrival O O O O
of O O O O
migratory O O O O
birds O O O O
. O O O O
    
Early O O O O
arrival O O O O
at O O O O
breeding O O O O
sites O O O O
is O O O O
an O O O O
important O O O O
life O O O O
- O O O O
history O O O O
trait O O O O
, O O O O
usually O O O O
associated O O O O
with O O O O
higher O O O O
breeding O O O O
success O O O O
and O O O O
therefore O O O O
, O O O O
susceptible O O O O
to O O O O
selection O O O O
and O O O O
evolution O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
changing O O O O
climatic O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
examine O O O O
the O O O O
effect O O O O
of O O O O
changes O O O O
in O O O O
the O O O O
environmental O O O O
conditions O O O O
of O O O O
wintering O O O O
and O O O O
passage O O O O
areas O O O O
on O O O O
the O O O O
mean O O O O
passage O O O O
time O O O O
of O O O O
13 O O O O
trans O O O O
- O O O O
Saharan O O O O
passerines O O O O
during O O O O
their O O O O
spring O O O O
migration O O O O
through O O O O
the O O O O
western O O O O
Mediterranean O O O O
over O O O O
the O O O O
15 O O O O
years O O O O
from O O O O
1993 O O O O
to O O O O
2007 O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
that O O O O
most O O O O
of O O O O
the O O O O
species O O O O
studied O O O O
have O O O O
been O O O O
advancing O O O O
the O O O O
timing O O O O
of O O O O
their O O O O
passage O O O O
in O O O O
recent O O O O
years O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
annual O O O O
variation O O O O
in O O O O
the O O O O
mean O O O O
date O O O O
of O O O O
passage O O O O
was O O O O
positively O O O O
correlated O O O O
with O O O O
vegetation O O O O
growth O O O O
( O O O O
measured O O O O
as O O O O
the O O O O
normalized O O O O
difference O O O O
vegetation O O O O
index O O O O
[ O O O O
NDVI O O O O
] O O O O
) O O O O
both O O O O
in O O O O
the O O O O
Sahel O O O O
( O O O O
the O O O O
region O O O O
of O O O O
departure O O O O
) O O O O
and O O O O
in O O O O
northern O O O O
Africa O O O O
( O O O O
the O O O O
passage O O O O
area O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
migration O O O O
dates O O O O
were O O O O
delayed O O O O
in O O O O
years O O O O
with O O O O
high O O O O
primary O O O O
productivity O O O O
in O O O O
passage O O O O
and O O O O
wintering O O O O
zones O O O O
. O O O O
    
All O O O O
species O O O O
seem O O O O
to O O O O
respond O O O O
similarly O O O O
to O O O O
NDVI O O O O
in O O O O
the O O O O
Sahel O O O O
; O O O O
however O O O O
, O O O O
late O O O O
migrants O O O O
were O O O O
less O O O O
affected O O O O
by O O O O
ecological O O O O
conditions O O O O
in O O O O
northern O O O O
Africa O O O O
than O O O O
those O O O O
migrating O O O O
earlier O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
differences O O O O
based O O O O
on O O O O
species O O O O
ecology O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Mean O O O O
timing O O O O
of O O O O
passage O O O O
was O O O O
not O O O O
related O O O O
to O O O O
the O O O O
North O O O O
Atlantic O O O O
Oscillation O O O O
( O O O O
NAO O O O O
) O O O O
, O O O O
El O O O O
Nino O O O O
- O O O O
Southern O O O O
Oscillation O O O O
( O O O O
ENSO O O O O
) O O O O
, O O O O
temperature O O O O
or O O O O
NDVI O O O O
in O O O O
the O O O O
species O O O O
- O O O O
specific O O O O
wintering O O O O
areas O O O O
( O O O O
the O O O O
overwintering O O O O
region O O O O
) O O O O
when O O O O
analysed O O O O
in O O O O
combination O O O O
with O O O O
the O O O O
other O O O O
covariates O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
findings O O O O
show O O O O
that O O O O
ecological O O O O
conditions O O O O
in O O O O
the O O O O
winter O O O O
quarters O O O O
( O O O O
specifically O O O O
the O O O O
Sahel O O O O
) O O O O
and O O O O
en O O O O
route O O O O
are O O O O
relevant O O O O
factors O O O O
influencing O O O O
trends O O O O
in O O O O
the O O O O
passage O O O O
dates O O O O
of O O O O
trans O O O O
- O O O O
Saharan O O O O
migratory O O O O
birds O O O O
on O O O O
the O O O O
southern O O O O
fringe O O O O
of O O O O
Europe O O O O
. O O O O
    
Possible O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
consequences O O O O
for O O O O
late O O O O
arriving O O O O
spring O O O O
migrants O O O O
are O O O O
discussed O O O O
. O O O O
    
Effects O O O O
of O O O O
early O O O O
horn O O O O
growth O O O O
on O O O O
reproduction O O O O
and O O O O
hunting O O O O
mortality O O O O
in O O O O
female O O O O
chamois B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Environmental O O O O
conditions O O O O
during O O O O
early O O O O
development O O O O
can O O O O
affect O O O O
the O O O O
growth O O O O
patterns O O O O
of O O O O
vertebrates O O O O
, O O O O
influencing O O O O
future O O O O
survival O O O O
and O O O O
reproduction O O O O
. O O O O
    
In O O O O
long O O O O
- O O O O
lived O O O O
mammals O O O O
, O O O O
females O O O O
that O O O O
experience O O O O
poor O O O O
environmental O O O O
conditions O O O O
early O O O O
in O O O O
life O O O O
may O O O O
delay O O O O
primiparity O O O O
. O O O O
    
In O O O O
female O O O O
bovids O O O O
, O O O O
annual O O O O
horn O O O O
growth O O O O
increments O O O O
may O O O O
provide O O O O
a O O O O
record O O O O
of O O O O
age O O O O
- O O O O
specific O O O O
reproduction O O O O
and O O O O
body O O O O
growth O O O O
. O O O O
    
Horn O O O O
length O O O O
, O O O O
however O O O O
, O O O O
may O O O O
also O O O O
be O O O O
a O O O O
criterion O O O O
used O O O O
by O O O O
hunters O O O O
in O O O O
selecting O O O O
animals O O O O
to O O O O
harvest O O O O
, O O O O
possibly O O O O
leading O O O O
to O O O O
artificial O O O O
selection O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
studied O O O O
three O O O O
populations O O O O
of O O O O
chamois B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
Rupicapra B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
rupicapra O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
in O O O O
the O O O O
western O O O O
Alps O O O O
to O O O O
explore O O O O
the O O O O
relationships O O O O
between O O O O
female O O O O
horn O O O O
length O O O O
and O O O O
early O O O O
growth O O O O
, O O O O
age O O O O
of O O O O
primiparity O O O O
and O O O O
age O O O O
- O O O O
specific O O O O
reproduction O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
compared O O O O
the O O O O
risk O O O O
of O O O O
harvest O O O O
to O O O O
reproductive O O O O
status O O O O
and O O O O
horn O O O O
length O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Early O O O O
horn O O O O
growth O O O O
was O O O O
positively O O O O
correlated O O O O
with O O O O
body O O O O
mass O O O O
in O O O O
pre O O O O
- O O O O
reproductive O O O O
females O O O O
and O O O O
with O O O O
reproduction O O O O
in O O O O
very O O O O
young O O O O
and O O O O
senescent O O O O
adults O O O O
. O O O O
    
Females O O O O
with O O O O
strong O O O O
early O O O O
horn O O O O
growth O O O O
attained O O O O
primiparity O O O O
at O O O O
an O O O O
earlier O O O O
age O O O O
than O O O O
those O O O O
with O O O O
weak O O O O
early O O O O
growth O O O O
. O O O O
    
Horn O O O O
length O O O O
did O O O O
not O O O O
affect O O O O
hunter O O O O
selection O O O O
, O O O O
but O O O O
we O O O O
found O O O O
a O O O O
strong O O O O
hunter O O O O
preference O O O O
for O O O O
nonlactating O O O O
females O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
research O O O O
highlights O O O O
the O O O O
persistent O O O O
effects O O O O
of O O O O
early O O O O
development O O O O
on O O O O
reproductive O O O O
performance O O O O
in O O O O
mammals O O O O
. O O O O
    
Moderate O O O O
sport O O O O
harvests O O O O
are O O O O
unlikely O O O O
to O O O O
affect O O O O
the O O O O
evolution O O O O
of O O O O
phenotypic O O O O
traits O O O O
and O O O O
reproductive O O O O
strategies O O O O
in O O O O
female O O O O
chamois B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
A O O O O
policy O O O O
of O O O O
penalizing O O O O
hunters O O O O
that O O O O
harvest O O O O
lactating O O O O
females O O O O
, O O O O
however O O O O
, O O O O
may O O O O
increase O O O O
the O O O O
harvest O O O O
of O O O O
2 O O O O
- O O O O
year O O O O
- O O O O
old O O O O
females O O O O
, O O O O
which O O O O
have O O O O
high O O O O
reproductive O O O O
potential O O O O
. O O O O
    
FungiFun O O O O
: O O O O
a O O O O
web O O O O
- O O O O
based O O O O
application O O O O
for O O O O
functional O O O O
categorization O O O O
of O O O O
fungal O O O O
genes O O O O
and O O O O
proteins O O O O
. O O O O
    
FungiFun O O O O
assigns O O O O
functional O O O O
annotations O O O O
to O O O O
fungal O O O O
genes O O O O
or O O O O
proteins O O O O
and O O O O
performs O O O O
gene O O O O
set O O O O
enrichment O O O O
analysis O O O O
. O O O O
    
Based O O O O
on O O O O
three O O O O
different O O O O
classification O O O O
methods O O O O
( O O O O
FunCat O O O O
, O O O O
GO O O O O
and O O O O
KEGG O O O O
) O O O O
, O O O O
FungiFun O O O O
categorizes O O O O
genes O O O O
and O O O O
proteins O O O O
for O O O O
several O O O O
fungal O O O O
species O O O O
on O O O O
different O O O O
levels O O O O
of O O O O
annotation O O O O
detail O O O O
. O O O O
    
It O O O O
is O O O O
web O O O O
- O O O O
based O O O O
and O O O O
accessible O O O O
to O O O O
users O O O O
without O O O O
any O O O O
programming O O O O
skills O O O O
. O O O O
    
FungiFun O O O O
is O O O O
the O O O O
first O O O O
tool O O O O
offering O O O O
gene O O O O
set O O O O
enrichment O O O O
analysis O O O O
including O O O O
the O O O O
FunCat O O O O
categorization O O O O
. O O O O
    
Two O O O O
biological O O O O
datasets O O O O
for O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Candida B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
were O O O O
analyzed O O O O
using O O O O
FungiFun O O O O
, O O O O
providing O O O O
an O O O O
overview O O O O
of O O O O
the O O O O
usage O O O O
and O O O O
functions O O O O
of O O O O
the O O O O
tool O O O O
. O O O O
    
FungiFun O O O O
is O O O O
freely O O O O
accessible O O O O
at O O O O
https O O O O
: O O O O
/ O O O O
/ O O O O
www O O O O
. O O O O
omnifung O O O O
. O O O O
hki O O O O
- O O O O
jena O O O O
. O O O O
de O O O O
/ O O O O
FungiFun O O O O
/ O O O O
. O O O O
    
Cleavage O O O O
of O O O O
resveratrol O O O O
in O O O O
fungi O O O O
: O O O O
characterization O O O O
of O O O O
the O O O O
enzyme O O O O
Rco1 O O O O
from O O O O
Ustilago B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
maydis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Ustilago B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
maydis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
the O O O O
causative O O O O
agent O O O O
of O O O O
corn B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
smut O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
disease O O O O
, O O O O
contains O O O O
two O O O O
genes O O O O
encoding O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
carotenoid O O O O
cleavage O O O O
oxygenase O O O O
family O O O O
, O O O O
a O O O O
group O O O O
of O O O O
enzymes O O O O
that O O O O
cleave O O O O
double O O O O
bonds O O O O
in O O O O
different O O O O
substrates O O O O
. O O O O
    
One O O O O
of O O O O
them O O O O
, O O O O
Cco1 O O O O
, O O O O
was O O O O
formerly O O O O
identified O O O O
as O O O O
a O O O O
Beta O O O O
- O O O O
carotene O O O O
cleaving O O O O
enzyme O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
elucidate O O O O
the O O O O
function O O O O
of O O O O
the O O O O
protein O O O O
encoded O O O O
by O O O O
the O O O O
second O O O O
gene O O O O
, O O O O
termed O O O O
here O O O O
as O O O O
Ustilago B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
maydis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Resveratrol O O O O
cleavage O O O O
oxygenase O O O O
1 O O O O
( O O O O
Um O O O O
Rco1 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
In O O O O
vitro O O O O
incubations O O O O
of O O O O
heterologously O O O O
expressed O O O O
and O O O O
purified O O O O
UM O O O O
Rco1 O O O O
with O O O O
different O O O O
carotenoid O O O O
and O O O O
stilbene O O O O
substrates O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
it O O O O
cleaves O O O O
the O O O O
interphenyl O O O O
Calpha O O O O
- O O O O
CBeta O O O O
double O O O O
bond O O O O
of O O O O
the O O O O
phytoalexin O O O O
resveratrol O O O O
and O O O O
its O O O O
derivative O O O O
piceatannol O O O O
. O O O O
    
Um O O O O
Rco1 O O O O
exhibits O O O O
a O O O O
high O O O O
degree O O O O
of O O O O
substrate O O O O
specificity O O O O
, O O O O
as O O O O
suggested O O O O
by O O O O
the O O O O
lack O O O O
of O O O O
activity O O O O
on O O O O
carotenoids O O O O
and O O O O
the O O O O
other O O O O
resveratrol O O O O
- O O O O
related O O O O
compounds O O O O
tested O O O O
. O O O O
    
The O O O O
activity O O O O
of O O O O
Um O O O O
Rco1 O O O O
was O O O O
confirmed O O O O
by O O O O
incubation O O O O
of O O O O
U B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
maydis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
rco1 O O O O
deletion O O O O
and O O O O
over O O O O
- O O O O
expression O O O O
strains O O O O
with O O O O
resveratrol O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
treatment O O O O
with O O O O
resveratrol O O O O
resulted O O O O
in O O O O
striking O O O O
alterations O O O O
of O O O O
cell O O O O
morphology O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
pathogenicity O O O O
assays O O O O
indicated O O O O
that O O O O
Um O O O O
rco1 O O O O
is O O O O
largely O O O O
dispensable O O O O
for O O O O
biotrophic O O O O
development O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
work O O O O
reveals O O O O
Um O O O O
Rco1 O O O O
as O O O O
the O O O O
first O O O O
eukaryotic O O O O
resveratrol O O O O
cleavage O O O O
enzyme O O O O
identified O O O O
so O O O O
far O O O O
. O O O O
    
Moreover O O O O
, O O O O
Um O O O O
Rco1 O O O O
represents O O O O
a O O O O
subfamily O O O O
of O O O O
fungal O O O O
enzymes O O O O
likely O O O O
involved O O O O
in O O O O
the O O O O
degradation O O O O
of O O O O
stilbene O O O O
compounds O O O O
, O O O O
as O O O O
suggested O O O O
by O O O O
the O O O O
cleavage O O O O
of O O O O
resveratrol O O O O
by O O O O
homologs O O O O
from O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Chaetomium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
globosum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Botryotinia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fuckeliana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Medical O O O O
schools O O O O
in O O O O
sub O O O O
- O O O O
Saharan O O O O
Africa O O O O
. O O O O
    
Small O O O O
numbers O O O O
of O O O O
graduates O O O O
from O O O O
few O O O O
medical O O O O
schools O O O O
, O O O O
and O O O O
emigration O O O O
of O O O O
graduates O O O O
to O O O O
other O O O O
countries O O O O
, O O O O
contribute O O O O
to O O O O
low O O O O
physician O O O O
presence O O O O
in O O O O
sub O O O O
- O O O O
Saharan O O O O
Africa O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Sub O O O O
- O O O O
Saharan O O O O
African O O O O
Medical O O O O
School O O O O
Study O O O O
examined O O O O
the O O O O
challenges O O O O
, O O O O
innovations O O O O
, O O O O
and O O O O
emerging O O O O
trends O O O O
in O O O O
medical O O O O
education O O O O
in O O O O
the O O O O
region O O O O
. O O O O
    
We O O O O
identified O O O O
168 O O O O
medical O O O O
schools O O O O
; O O O O
of O O O O
the O O O O
146 O O O O
surveyed O O O O
, O O O O
105 O O O O
( O O O O
72 O O O O
% O O O O
) O O O O
responded O O O O
. O O O O
    
Findings O O O O
from O O O O
the O O O O
study O O O O
showed O O O O
that O O O O
countries O O O O
are O O O O
prioritising O O O O
medical O O O O
education O O O O
scale O O O O
- O O O O
up O O O O
as O O O O
part O O O O
of O O O O
health O O O O
- O O O O
system O O O O
strengthening O O O O
, O O O O
and O O O O
we O O O O
identified O O O O
many O O O O
innovations O O O O
in O O O O
premedical O O O O
preparation O O O O
, O O O O
team O O O O
- O O O O
based O O O O
education O O O O
, O O O O
and O O O O
creative O O O O
use O O O O
of O O O O
scarce O O O O
research O O O O
support O O O O
. O O O O
    
The O O O O
study O O O O
also O O O O
drew O O O O
attention O O O O
to O O O O
ubiquitous O O O O
faculty O O O O
shortages O O O O
in O O O O
basic O O O O
and O O O O
clinical O O O O
sciences O O O O
, O O O O
weak O O O O
physical O O O O
infrastructure O O O O
, O O O O
and O O O O
little O O O O
use O O O O
of O O O O
external O O O O
accreditation O O O O
. O O O O
    
Patterns O O O O
recorded O O O O
include O O O O
the O O O O
growth O O O O
of O O O O
private O O O O
medical O O O O
schools O O O O
, O O O O
community O O O O
- O O O O
based O O O O
education O O O O
, O O O O
and O O O O
international O O O O
partnerships O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
benefit O O O O
of O O O O
research O O O O
for O O O O
faculty O O O O
development O O O O
. O O O O
    
Ten O O O O
recommendations O O O O
provide O O O O
guidance O O O O
for O O O O
efforts O O O O
to O O O O
strengthen O O O O
medical O O O O
education O O O O
in O O O O
sub O O O O
- O O O O
Saharan O O O O
Africa O O O O
. O O O O
    
Diversity O O O O
, O O O O
distribution O O O O
and O O O O
biogeography O O O O
of O O O O
testate O O O O
amoebae O O O O
in O O O O
China O O O O
: O O O O
implications O O O O
for O O O O
ecological O O O O
studies O O O O
in O O O O
Asia O O O O
. O O O O
    
Testate O O O O
amoebae O O O O
are O O O O
a O O O O
group O O O O
of O O O O
shelled O O O O
protozoa O O O O
that O O O O
occur O O O O
in O O O O
high O O O O
density O O O O
populations O O O O
in O O O O
wet O O O O
environments O O O O
. O O O O
    
More O O O O
than O O O O
1900 O O O O
testate O O O O
amoebae O O O O
species O O O O
or O O O O
subspecies O O O O
have O O O O
been O O O O
reported O O O O
in O O O O
published O O O O
literature O O O O
over O O O O
the O O O O
last O O O O
200 O O O O
years O O O O
, O O O O
from O O O O
many O O O O
regions O O O O
of O O O O
the O O O O
world O O O O
. O O O O
    
Testate O O O O
amoebae O O O O
are O O O O
classified O O O O
as O O O O
Lobosea O O O O
or O O O O
Filosea O O O O
respectively O O O O
, O O O O
according O O O O
to O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
lobose O O O O
or O O O O
filiform O O O O
pseudopodia O O O O
. O O O O
    
Testate O O O O
amoebae O O O O
have O O O O
proved O O O O
an O O O O
interesting O O O O
group O O O O
of O O O O
indicator O O O O
organisms O O O O
in O O O O
palaeoenvironmental O O O O
studies O O O O
and O O O O
have O O O O
also O O O O
been O O O O
used O O O O
as O O O O
bioindicators O O O O
of O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
impact O O O O
on O O O O
ecosystems O O O O
. O O O O
    
Until O O O O
recently O O O O
, O O O O
the O O O O
testate O O O O
amoebae O O O O
of O O O O
China O O O O
were O O O O
unknown O O O O
to O O O O
most O O O O
western O O O O
scientists O O O O
, O O O O
but O O O O
our O O O O
knowledge O O O O
has O O O O
improved O O O O
greatly O O O O
over O O O O
the O O O O
past O O O O
20 O O O O
years O O O O
. O O O O
    
This O O O O
paper O O O O
summarizes O O O O
the O O O O
testate O O O O
amoebae O O O O
research O O O O
in O O O O
China O O O O
along O O O O
with O O O O
relevant O O O O
data O O O O
from O O O O
other O O O O
countries O O O O
in O O O O
Asia O O O O
, O O O O
and O O O O
provides O O O O
the O O O O
necessary O O O O
context O O O O
for O O O O
future O O O O
research O O O O
. O O O O
    
Translation O O O O
efficiency O O O O
of O O O O
antiterminator O O O O
proteins O O O O
is O O O O
a O O O O
determinant O O O O
for O O O O
the O O O O
difference O O O O
in O O O O
glucose O O O O
repression O O O O
of O O O O
two O O O O
Beta O O O O
- O O O O
glucoside O O O O
phosphotransferase O O O O
system O O O O
gene O O O O
clusters O O O O
in O O O O
Corynebacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
glutamicum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
R O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Corynebacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
glutamicum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
R O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
has O O O O
two O O O O
Beta O O O O
- O O O O
glucoside O O O O
phosphoenolpyruvate O O O O
, O O O O
carbohydrate O O O O
phosphotransferase O O O O
systems O O O O
( O O O O
PTS O O O O
) O O O O
encoded O O O O
by O O O O
bglF O O O O
and O O O O
bglF2 O O O O
located O O O O
in O O O O
the O O O O
respective O O O O
clusters O O O O
, O O O O
bglF O O O O
- O O O O
bglA O O O O
- O O O O
bglG O O O O
and O O O O
bglF2 O O O O
- O O O O
bglA2 O O O O
- O O O O
bglG2 O O O O
. O O O O
    
Previously O O O O
, O O O O
we O O O O
reported O O O O
that O O O O
whereas O O O O
Beta O O O O
- O O O O
glucoside O O O O
- O O O O
dependent O O O O
induction O O O O
of O O O O
bglF O O O O
is O O O O
strongly O O O O
repressed O O O O
by O O O O
glucose O O O O
, O O O O
glucose O O O O
repression O O O O
of O O O O
bglF2 O O O O
is O O O O
very O O O O
weak O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
reveal O O O O
the O O O O
mechanism O O O O
behind O O O O
the O O O O
different O O O O
effects O O O O
of O O O O
glucose O O O O
on O O O O
the O O O O
two O O O O
bgl O O O O
genes O O O O
. O O O O
    
Deletion O O O O
of O O O O
the O O O O
ribonucleic O O O O
antiterminator O O O O
sequence O O O O
and O O O O
transcriptional O O O O
terminator O O O O
located O O O O
upstream O O O O
of O O O O
the O O O O
translation O O O O
initiation O O O O
codon O O O O
of O O O O
bglF O O O O
markedly O O O O
relieved O O O O
the O O O O
glucose O O O O
repression O O O O
of O O O O
a O O O O
bglF O O O O
- O O O O
lacZ O O O O
fusion O O O O
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
glucose O O O O
affects O O O O
the O O O O
antitermination O O O O
mechanism O O O O
that O O O O
is O O O O
responsible O O O O
for O O O O
the O O O O
Beta O O O O
- O O O O
glucoside O O O O
- O O O O
dependent O O O O
induction O O O O
of O O O O
the O O O O
bglF O O O O
cluster O O O O
. O O O O
    
The O O O O
glucose O O O O
repression O O O O
of O O O O
bglF O O O O
mRNA O O O O
was O O O O
also O O O O
relieved O O O O
by O O O O
introducing O O O O
a O O O O
multicopy O O O O
plasmid O O O O
carrying O O O O
the O O O O
bglG O O O O
gene O O O O
encoding O O O O
an O O O O
antiterminator O O O O
of O O O O
the O O O O
bglF O O O O
cluster O O O O
. O O O O
    
Moreover O O O O
, O O O O
replacement O O O O
of O O O O
the O O O O
GUG O O O O
translation O O O O
initiation O O O O
codon O O O O
of O O O O
bglG O O O O
with O O O O
AUG O O O O
was O O O O
effective O O O O
in O O O O
relieving O O O O
the O O O O
glucose O O O O
repression O O O O
of O O O O
bglF O O O O
and O O O O
bglG O O O O
. O O O O
    
Inversely O O O O
, O O O O
expression O O O O
of O O O O
bglF2 O O O O
and O O O O
bglG2 O O O O
was O O O O
subject O O O O
to O O O O
strict O O O O
glucose O O O O
repression O O O O
in O O O O
a O O O O
mutant O O O O
strain O O O O
in O O O O
which O O O O
the O O O O
AUG O O O O
translation O O O O
initiation O O O O
codon O O O O
of O O O O
bglG2 O O O O
encoding O O O O
antiterminator O O O O
of O O O O
the O O O O
bglF2 O O O O
cluster O O O O
was O O O O
replaced O O O O
with O O O O
GUG O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
the O O O O
translation O O O O
initiation O O O O
efficiency O O O O
of O O O O
the O O O O
antiterminator O O O O
proteins O O O O
, O O O O
at O O O O
least O O O O
in O O O O
part O O O O
, O O O O
determines O O O O
whether O O O O
the O O O O
target O O O O
genes O O O O
are O O O O
subject O O O O
to O O O O
glucose O O O O
repression O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
found O O O O
that O O O O
bglF O O O O
expression O O O O
was O O O O
induced O O O O
by O O O O
glucose O O O O
in O O O O
the O O O O
BglG O O O O
- O O O O
overexpressing O O O O
strains O O O O
, O O O O
which O O O O
may O O O O
be O O O O
explained O O O O
by O O O O
the O O O O
ability O O O O
of O O O O
BglF O O O O
to O O O O
transport O O O O
glucose O O O O
. O O O O
    
argC O O O O
Orthologs O O O O
from O O O O
Rhizobiales O O O O
show O O O O
diverse O O O O
profiles O O O O
of O O O O
transcriptional O O O O
efficiency O O O O
and O O O O
functionality O O O O
in O O O O
Sinorhizobium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
meliloti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Several O O O O
factors O O O O
can O O O O
influence O O O O
ortholog O O O O
replacement O O O O
between O O O O
closely O O O O
related O O O O
species O O O O
. O O O O
    
We O O O O
evaluated O O O O
the O O O O
transcriptional O O O O
expression O O O O
and O O O O
metabolic O O O O
performance O O O O
of O O O O
ortholog O O O O
substitution O O O O
complementing O O O O
a O O O O
Sinorhizobium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
meliloti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
argC O O O O
mutant O O O O
with O O O O
argC O O O O
from O O O O
Rhizobiales O O O O
( O O O O
Agrobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tumefaciens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Rhizobium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
etli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
Mesorhizobium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
loti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
argC O O O O
gene O O O O
is O O O O
necessary O O O O
for O O O O
the O O O O
synthesis O O O O
of O O O O
arginine O O O O
, O O O O
an O O O O
amino O O O O
acid O O O O
that O O O O
is O O O O
central O O O O
to O O O O
protein O O O O
and O O O O
cellular O O O O
metabolism O O O O
. O O O O
    
Strains O O O O
were O O O O
obtained O O O O
carrying O O O O
plasmids O O O O
with O O O O
argC O O O O
orthologs O O O O
expressed O O O O
under O O O O
the O O O O
speB O O O O
and O O O O
argC O O O O
( O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
meliloti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
and O O O O
lac O O O O
( O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
promoters O O O O
. O O O O
    
Complementation O O O O
analysis O O O O
was O O O O
assessed O O O O
by O O O O
growth O O O O
, O O O O
transcriptional O O O O
activity O O O O
, O O O O
enzymatic O O O O
activity O O O O
, O O O O
mRNA O O O O
levels O O O O
, O O O O
specific O O O O
detection O O O O
of O O O O
ArgC O O O O
proteomic O O O O
protein O O O O
, O O O O
and O O O O
translational O O O O
efficiency O O O O
. O O O O
    
The O O O O
argC O O O O
orthologs O O O O
performed O O O O
differently O O O O
in O O O O
each O O O O
complementation O O O O
, O O O O
reflecting O O O O
the O O O O
diverse O O O O
factors O O O O
influencing O O O O
gene O O O O
expression O O O O
and O O O O
the O O O O
ability O O O O
of O O O O
the O O O O
ortholog O O O O
product O O O O
to O O O O
function O O O O
in O O O O
a O O O O
foreign O O O O
metabolic O O O O
background O O O O
. O O O O
    
Optimal O O O O
complementation O O O O
was O O O O
directly O O O O
related O O O O
to O O O O
sequence O O O O
similarity O O O O
with O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
meliloti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
was O O O O
inversely O O O O
related O O O O
to O O O O
species O O O O
signature O O O O
, O O O O
with O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
loti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
argC O O O O
showing O O O O
the O O O O
poorest O O O O
performance O O O O
, O O O O
followed O O O O
by O O O O
R B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
etli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tumefaciens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Different O O O O
copy O O O O
numbers O O O O
of O O O O
genes O O O O
and O O O O
amounts O O O O
of O O O O
mRNA O O O O
and O O O O
protein O O O O
were O O O O
produced O O O O
, O O O O
even O O O O
with O O O O
genes O O O O
transcribed O O O O
from O O O O
the O O O O
same O O O O
promoter O O O O
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
coding O O O O
sequences O O O O
play O O O O
a O O O O
role O O O O
in O O O O
the O O O O
transcription O O O O
and O O O O
translation O O O O
processes O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
provide O O O O
relevant O O O O
information O O O O
for O O O O
further O O O O
genomic O O O O
analyses O O O O
and O O O O
suggest O O O O
that O O O O
orthologous O O O O
gene O O O O
substitutions O O O O
between O O O O
closely O O O O
related O O O O
species O O O O
are O O O O
not O O O O
completely O O O O
functionally O O O O
equivalent O O O O
. O O O O
    
Genetic O O O O
and O O O O
mass O O O O
spectrometry O O O O
analyses O O O O
of O O O O
the O O O O
unusual O O O O
type O O O O
IV O O O O
- O O O O
like O O O O
pili O O O O
of O O O O
the O O O O
archaeon O O O O
Methanococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
maripaludis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
structure O O O O
of O O O O
pili O O O O
from O O O O
the O O O O
archaeon O O O O
Methanococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
maripaludis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
unlike O O O O
that O O O O
of O O O O
any O O O O
bacterial O O O O
pili O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
genetic O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
genes O O O O
involved O O O O
in O O O O
the O O O O
formation O O O O
of O O O O
these O O O O
pili O O O O
has O O O O
been O O O O
lacking O O O O
until O O O O
this O O O O
study O O O O
. O O O O
    
Pili O O O O
were O O O O
isolated O O O O
from O O O O
a O O O O
nonflagellated O O O O
( O O O O
DeltaflaK O O O O
) O O O O
mutant O O O O
and O O O O
shown O O O O
by O O O O
sodium O O O O
dodecyl O O O O
sulfate O O O O
- O O O O
polyacrylamide O O O O
gel O O O O
electrophoresis O O O O
to O O O O
consist O O O O
primarily O O O O
of O O O O
subunits O O O O
with O O O O
an O O O O
apparent O O O O
molecular O O O O
mass O O O O
of O O O O
17 O O O O
kDa O O O O
. O O O O
    
In O O O O
- O O O O
frame O O O O
deletions O O O O
were O O O O
created O O O O
in O O O O
three O O O O
genes O O O O
, O O O O
MMP0233 O O O O
, O O O O
MMP0236 O O O O
, O O O O
and O O O O
MMP0237 O O O O
, O O O O
which O O O O
encode O O O O
proteins O O O O
with O O O O
bacterial O O O O
type O O O O
IV O O O O
pilin O O O O
- O O O O
like O O O O
signal O O O O
peptides O O O O
previously O O O O
identified O O O O
by O O O O
in O O O O
silico O O O O
methodology O O O O
as O O O O
likely O O O O
candidates O O O O
for O O O O
pilus O O O O
structural O O O O
proteins O O O O
. O O O O
    
Deletion O O O O
of O O O O
MMP0236 O O O O
or O O O O
MMP0237 O O O O
resulted O O O O
in O O O O
mutant O O O O
cells O O O O
completely O O O O
devoid O O O O
of O O O O
pili O O O O
on O O O O
the O O O O
cell O O O O
surface O O O O
, O O O O
while O O O O
deletion O O O O
of O O O O
the O O O O
third O O O O
pilin O O O O
- O O O O
like O O O O
gene O O O O
, O O O O
MMP0233 O O O O
, O O O O
resulted O O O O
in O O O O
cells O O O O
greatly O O O O
reduced O O O O
in O O O O
the O O O O
number O O O O
of O O O O
pili O O O O
on O O O O
the O O O O
surface O O O O
. O O O O
    
Complementation O O O O
with O O O O
the O O O O
deleted O O O O
gene O O O O
in O O O O
each O O O O
case O O O O
returned O O O O
the O O O O
cells O O O O
to O O O O
a O O O O
piliated O O O O
state O O O O
. O O O O
    
Surprisingly O O O O
, O O O O
mass O O O O
spectrometry O O O O
analysis O O O O
of O O O O
purified O O O O
pili O O O O
identified O O O O
the O O O O
major O O O O
structural O O O O
pilin O O O O
as O O O O
another O O O O
type O O O O
IV O O O O
pilin O O O O
- O O O O
like O O O O
protein O O O O
, O O O O
MMP1685 O O O O
, O O O O
whose O O O O
gene O O O O
is O O O O
located O O O O
outside O O O O
the O O O O
first O O O O
pilus O O O O
locus O O O O
. O O O O
    
This O O O O
protein O O O O
was O O O O
found O O O O
to O O O O
be O O O O
glycosylated O O O O
with O O O O
an O O O O
N O O O O
- O O O O
linked O O O O
branched O O O O
pentasaccharide O O O O
glycan O O O O
. O O O O
    
Deletion O O O O
and O O O O
complementation O O O O
analysis O O O O
confirmed O O O O
that O O O O
MMP1685 O O O O
is O O O O
required O O O O
for O O O O
piliation O O O O
. O O O O
    
XerCD O O O O
- O O O O
mediated O O O O
site O O O O
- O O O O
specific O O O O
recombination O O O O
leads O O O O
to O O O O
loss O O O O
of O O O O
the O O O O
57 O O O O
- O O O O
kilobase O O O O
gonococcal O O O O
genetic O O O O
island O O O O
. O O O O
    
Most O O O O
strains O O O O
of O O O O
Neisseria B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
gonorrhoeae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
carry O O O O
the O O O O
57 O O O O
- O O O O
kb O O O O
gonococcal O O O O
genetic O O O O
island O O O O
( O O O O
GGI O O O O
) O O O O
, O O O O
as O O O O
do O O O O
a O O O O
few O O O O
strains O O O O
of O O O O
Neisseria B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
meningitidis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
GGI O O O O
is O O O O
inserted O O O O
into O O O O
the O O O O
chromosome O O O O
at O O O O
the O O O O
dif O O O O
site O O O O
( O O O O
difA O O O O
) O O O O
and O O O O
is O O O O
flanked O O O O
by O O O O
a O O O O
partial O O O O
repeat O O O O
of O O O O
the O O O O
dif O O O O
site O O O O
( O O O O
difB O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Since O O O O
dif O O O O
is O O O O
a O O O O
sequence O O O O
recognized O O O O
by O O O O
the O O O O
site O O O O
- O O O O
specific O O O O
recombinases O O O O
XerC O O O O
and O O O O
XerD O O O O
and O O O O
the O O O O
GGI O O O O
shows O O O O
evidence O O O O
of O O O O
horizontal O O O O
acquisition O O O O
, O O O O
we O O O O
hypothesized O O O O
that O O O O
the O O O O
GGI O O O O
may O O O O
be O O O O
acquired O O O O
or O O O O
lost O O O O
by O O O O
XerCD O O O O
- O O O O
mediated O O O O
site O O O O
- O O O O
specific O O O O
recombination O O O O
. O O O O
    
We O O O O
show O O O O
that O O O O
while O O O O
the O O O O
GGI O O O O
flanked O O O O
by O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
dif O O O O
sites O O O O
, O O O O
difA O O O O
and O O O O
difB O O O O
, O O O O
is O O O O
not O O O O
readily O O O O
lost O O O O
from O O O O
the O O O O
gonococcal O O O O
chromosome O O O O
, O O O O
the O O O O
substitution O O O O
of O O O O
difB O O O O
with O O O O
another O O O O
copy O O O O
of O O O O
difA O O O O
allows O O O O
the O O O O
frequent O O O O
excision O O O O
and O O O O
loss O O O O
of O O O O
the O O O O
GGI O O O O
. O O O O
    
In O O O O
mutants O O O O
carrying O O O O
two O O O O
difA O O O O
sites O O O O
( O O O O
difA O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
difA O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
) O O O O
, O O O O
the O O O O
GGI O O O O
can O O O O
be O O O O
detected O O O O
as O O O O
an O O O O
extrachromosomal O O O O
circle O O O O
that O O O O
exists O O O O
transiently O O O O
. O O O O
    
A O O O O
mutation O O O O
of O O O O
xerD O O O O
diminished O O O O
GGI O O O O
excision O O O O
from O O O O
the O O O O
chromosome O O O O
of O O O O
a O O O O
difA O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
difA O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
strain O O O O
, O O O O
while O O O O
mutations O O O O
in O O O O
recA O O O O
or O O O O
type O O O O
IV O O O O
secretion O O O O
genes O O O O
had O O O O
no O O O O
effect O O O O
on O O O O
the O O O O
loss O O O O
of O O O O
the O O O O
GGI O O O O
. O O O O
    
These O O O O
data O O O O
indicate O O O O
that O O O O
the O O O O
GGI O O O O
is O O O O
maintained O O O O
by O O O O
the O O O O
replication O O O O
of O O O O
the O O O O
chromosome O O O O
and O O O O
that O O O O
GGI O O O O
excision O O O O
and O O O O
loss O O O O
are O O O O
dependent O O O O
upon O O O O
the O O O O
dif O O O O
sequence O O O O
and O O O O
xerD O O O O
. O O O O
    
The O O O O
detection O O O O
of O O O O
a O O O O
circular O O O O
form O O O O
of O O O O
the O O O O
GGI O O O O
in O O O O
a O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
strain O O O O
suggests O O O O
that O O O O
GGI O O O O
excision O O O O
may O O O O
occur O O O O
naturally O O O O
and O O O O
could O O O O
function O O O O
to O O O O
facilitate O O O O
GGI O O O O
transfer O O O O
. O O O O
    
These O O O O
data O O O O
suggest O O O O
a O O O O
model O O O O
of O O O O
GGI O O O O
excision O O O O
and O O O O
loss O O O O
explaining O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
the O O O O
GGI O O O O
from O O O O
some O O O O
gonococcal O O O O
strains O O O O
and O O O O
the O O O O
maintenance O O O O
of O O O O
variant O O O O
GGIs O O O O
in O O O O
some O O O O
gonococcal O O O O
and O O O O
meningococcal B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
isolates O O O O
. O O O O
    
Opposing O O O O
contributions O O O O
of O O O O
polynucleotide O O O O
phosphorylase O O O O
and O O O O
the O O O O
membrane O O O O
protein O O O O
NlpI O O O O
to O O O O
biofilm O O O O
formation O O O O
by O O O O
Salmonella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
enterica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
serovar O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Typhimurium O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
CsgD O O O O
and O O O O
cyclic O O O O
- O O O O
3 O O O O
' O O O O
, O O O O
5 O O O O
' O O O O
- O O O O
di O O O O
- O O O O
guanylate O O O O
are O O O O
key O O O O
regulators O O O O
of O O O O
biofilm O O O O
formation O O O O
in O O O O
Salmonella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
enterica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
serovar O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Typhimurium O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
show O O O O
that O O O O
polynucleotide O O O O
phosphorylase O O O O
and O O O O
NlpI O O O O
oppositely O O O O
altered O O O O
expression O O O O
of O O O O
CsgD O O O O
. O O O O
    
Polynucleotide O O O O
phosphorylase O O O O
and O O O O
NlpI O O O O
also O O O O
had O O O O
opposite O O O O
effects O O O O
on O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
yjcC O O O O
, O O O O
which O O O O
codes O O O O
for O O O O
a O O O O
cyclic O O O O
- O O O O
3 O O O O
' O O O O
, O O O O
5 O O O O
' O O O O
- O O O O
di O O O O
- O O O O
guanylate O O O O
phosphodiesterase O O O O
affecting O O O O
CsgD O O O O
expression O O O O
. O O O O
    
Demographic O O O O
consequences O O O O
of O O O O
adult O O O O
sex O O O O
ratio O O O O
in O O O O
a O O O O
reintroduced O O O O
hihi B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
population O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Male O O O O
- O O O O
biased O O O O
adult O O O O
sex O O O O
ratios O O O O
are O O O O
frequently O O O O
observed O O O O
in O O O O
free O O O O
- O O O O
ranging O O O O
populations O O O O
and O O O O
are O O O O
known O O O O
to O O O O
cause O O O O
changes O O O O
in O O O O
mating O O O O
behaviours O O O O
including O O O O
increased O O O O
male O O O O
harassment O O O O
of O O O O
females O O O O
, O O O O
which O O O O
can O O O O
cause O O O O
injury O O O O
to O O O O
females O O O O
and O O O O
/ O O O O
or O O O O
alter O O O O
female O O O O
behaviour O O O O
during O O O O
breeding O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
we O O O O
can O O O O
explain O O O O
why O O O O
such O O O O
behaviours O O O O
may O O O O
evolve O O O O
and O O O O
have O O O O
studied O O O O
their O O O O
impacts O O O O
on O O O O
individuals O O O O
when O O O O
it O O O O
does O O O O
, O O O O
we O O O O
know O O O O
very O O O O
little O O O O
about O O O O
the O O O O
demographic O O O O
consequences O O O O
of O O O O
harassment O O O O
caused O O O O
by O O O O
changes O O O O
in O O O O
adult O O O O
sex O O O O
ratio O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
a O O O O
12 O O O O
- O O O O
year O O O O
longitudinal O O O O
data O O O O
set O O O O
of O O O O
a O O O O
free O O O O
- O O O O
living O O O O
and O O O O
endangered O O O O
New O O O O
Zealand O O O O
passerine O O O O
, O O O O
the O O O O
hihi B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
Notiomystis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cincta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
, O O O O
we O O O O
show O O O O
that O O O O
a O O O O
changing O O O O
adult O O O O
sex O O O O
ratio O O O O
has O O O O
little O O O O
or O O O O
no O O O O
effect O O O O
on O O O O
adult O O O O
female O O O O
survival O O O O
or O O O O
the O O O O
number O O O O
of O O O O
fledglings O O O O
produced O O O O
per O O O O
female O O O O
. O O O O
    
This O O O O
is O O O O
despite O O O O
clear O O O O
evidence O O O O
of O O O O
male O O O O
harassment O O O O
of O O O O
breeding O O O O
females O O O O
when O O O O
the O O O O
sex O O O O
ratio O O O O
was O O O O
male O O O O
biased O O O O
( O O O O
up O O O O
to O O O O
three O O O O
males O O O O
per O O O O
female O O O O
) O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
length O O O O
of O O O O
the O O O O
study O O O O
and O O O O
major O O O O
fluctuations O O O O
in O O O O
sex O O O O
ratio O O O O
observed O O O O
made O O O O
it O O O O
possible O O O O
to O O O O
obtain O O O O
narrow O O O O
confidence O O O O
or O O O O
credible O O O O
intervals O O O O
for O O O O
effect O O O O
sizes O O O O
, O O O O
showing O O O O
that O O O O
any O O O O
effect O O O O
of O O O O
sex O O O O
ratio O O O O
on O O O O
demographic O O O O
rates O O O O
were O O O O
small O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
provide O O O O
rare O O O O
empirical O O O O
evidence O O O O
for O O O O
the O O O O
demographic O O O O
consequences O O O O
of O O O O
biased O O O O
adult O O O O
sex O O O O
ratios O O O O
in O O O O
the O O O O
wild O O O O
and O O O O
particularly O O O O
in O O O O
a O O O O
conservation O O O O
context O O O O
. O O O O
    
Ebola O O O O
haemorrhagic O O O O
fever O O O O
. O O O O
    
Ebola B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
viruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
are O O O O
the O O O O
causative O O O O
agents O O O O
of O O O O
a O O O O
severe O O O O
form O O O O
of O O O O
viral O O O O
haemorrhagic O O O O
fever O O O O
in O O O O
man O O O O
, O O O O
designated O O O O
Ebola O O O O
haemorrhagic O O O O
fever O O O O
, O O O O
and O O O O
are O O O O
endemic O O O O
in O O O O
regions O O O O
of O O O O
central O O O O
Africa O O O O
. O O O O
    
The O O O O
exception O O O O
is O O O O
the O O O O
species O O O O
Reston B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
Ebola O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
which O O O O
has O O O O
not O O O O
been O O O O
associated O O O O
with O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
disease O O O O
and O O O O
is O O O O
found O O O O
in O O O O
the O O O O
Philippines O O O O
. O O O O
    
Ebola B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
constitutes O O O O
an O O O O
important O O O O
local O O O O
public O O O O
health O O O O
threat O O O O
in O O O O
Africa O O O O
, O O O O
with O O O O
a O O O O
worldwide O O O O
effect O O O O
through O O O O
imported O O O O
infections O O O O
and O O O O
through O O O O
the O O O O
fear O O O O
of O O O O
misuse O O O O
for O O O O
biological O O O O
terrorism O O O O
. O O O O
    
Ebola B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
thought O O O O
to O O O O
also O O O O
have O O O O
a O O O O
detrimental O O O O
effect O O O O
on O O O O
the O O O O
great O O O O
ape O O O O
population O O O O
in O O O O
Africa O O O O
. O O O O
    
Case O O O O
- O O O O
fatality O O O O
rates O O O O
of O O O O
the O O O O
African O O O O
species O O O O
in O O O O
man O O O O
are O O O O
as O O O O
high O O O O
as O O O O
90 O O O O
% O O O O
, O O O O
with O O O O
no O O O O
prophylaxis O O O O
or O O O O
treatment O O O O
available O O O O
. O O O O
    
Ebola B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
infections O O O O
are O O O O
characterised O O O O
by O O O O
immune O O O O
suppression O O O O
and O O O O
a O O O O
systemic O O O O
inflammatory O O O O
response O O O O
that O O O O
causes O O O O
impairment O O O O
of O O O O
the O O O O
vascular O O O O
, O O O O
coagulation O O O O
, O O O O
and O O O O
immune O O O O
systems O O O O
, O O O O
leading O O O O
to O O O O
multiorgan O O O O
failure O O O O
and O O O O
shock O O O O
, O O O O
and O O O O
thus O O O O
, O O O O
in O O O O
some O O O O
ways O O O O
, O O O O
resembling O O O O
septic O O O O
shock O O O O
. O O O O
    
Primate O O O O
communities O O O O
are O O O O
structured O O O O
more O O O O
by O O O O
dispersal O O O O
limitation O O O O
than O O O O
by O O O O
niches O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
A O O O O
major O O O O
goal O O O O
in O O O O
community O O O O
ecology O O O O
is O O O O
to O O O O
identify O O O O
mechanisms O O O O
that O O O O
govern O O O O
the O O O O
assembly O O O O
and O O O O
maintenance O O O O
of O O O O
ecological O O O O
communities O O O O
. O O O O
    
Current O O O O
models O O O O
of O O O O
metacommunity O O O O
dynamics O O O O
differ O O O O
chiefly O O O O
in O O O O
the O O O O
relative O O O O
emphasis O O O O
placed O O O O
on O O O O
dispersal O O O O
limitation O O O O
and O O O O
niche O O O O
differentiation O O O O
as O O O O
causal O O O O
mechanisms O O O O
structuring O O O O
ecological O O O O
communities O O O O
. O O O O
    
Herein O O O O
we O O O O
investigate O O O O
the O O O O
relative O O O O
roles O O O O
of O O O O
these O O O O
two O O O O
mechanisms O O O O
in O O O O
structuring O O O O
primate O O O O
communities O O O O
in O O O O
Africa O O O O
, O O O O
South O O O O
America O O O O
, O O O O
Madagascar O O O O
and O O O O
Borneo O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
hypothesized O O O O
that O O O O
if O O O O
dispersal O O O O
limitation O O O O
is O O O O
important O O O O
in O O O O
structuring O O O O
communities O O O O
, O O O O
then O O O O
community O O O O
similarity O O O O
should O O O O
depend O O O O
on O O O O
geographical O O O O
proximity O O O O
even O O O O
after O O O O
controlling O O O O
for O O O O
ecological O O O O
similarity O O O O
. O O O O
    
Conversely O O O O
, O O O O
if O O O O
communities O O O O
are O O O O
assembled O O O O
primarily O O O O
through O O O O
niche O O O O
processes O O O O
, O O O O
then O O O O
community O O O O
similarity O O O O
should O O O O
be O O O O
determined O O O O
by O O O O
ecological O O O O
similarity O O O O
regardless O O O O
of O O O O
geographical O O O O
proximity O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
performed O O O O
Mantel O O O O
and O O O O
partial O O O O
Mantel O O O O
tests O O O O
to O O O O
investigate O O O O
correlations O O O O
among O O O O
primate O O O O
community O O O O
similarity O O O O
, O O O O
ecological O O O O
distance O O O O
and O O O O
geographical O O O O
distance O O O O
. O O O O
    
Results O O O O
showed O O O O
significant O O O O
and O O O O
strongly O O O O
negative O O O O
relationships O O O O
between O O O O
diurnal O O O O
primate O O O O
community O O O O
similarity O O O O
and O O O O
both O O O O
ecological O O O O
similarity O O O O
and O O O O
geographical O O O O
distance O O O O
in O O O O
Madagascar O O O O
, O O O O
but O O O O
significant O O O O
and O O O O
stronger O O O O
negative O O O O
relationships O O O O
between O O O O
community O O O O
similarity O O O O
and O O O O
geographical O O O O
distance O O O O
in O O O O
African O O O O
, O O O O
South O O O O
American O O O O
and O O O O
Bornean O O O O
metacommunities O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
conclude O O O O
that O O O O
dispersal O O O O
limitation O O O O
is O O O O
an O O O O
important O O O O
determinant O O O O
of O O O O
primate O O O O
community O O O O
structure O O O O
and O O O O
may O O O O
play O O O O
a O O O O
stronger O O O O
role O O O O
in O O O O
shaping O O O O
the O O O O
structure O O O O
of O O O O
some O O O O
terrestrial O O O O
vertebrate O O O O
communities O O O O
than O O O O
niche O O O O
differentiation O O O O
. O O O O
    
These O O O O
patterns O O O O
are O O O O
consistent O O O O
with O O O O
neutral O O O O
theory O O O O
. O O O O
    
We O O O O
recommend O O O O
tests O O O O
of O O O O
functional O O O O
equivalence O O O O
to O O O O
determine O O O O
the O O O O
extent O O O O
to O O O O
which O O O O
neutral O O O O
theory O O O O
may O O O O
explain O O O O
primate O O O O
community O O O O
composition O O O O
. O O O O
    
Candidate O O O O
chemosensory O O O O
ionotropic O O O O
receptors O O O O
in O O O O
a O O O O
Lepidoptera O O O O
. O O O O
    
A O O O O
new O O O O
family O O O O
of O O O O
candidate O O O O
chemosensory O O O O
ionotropic O O O O
receptors O O O O
( O O O O
IRs O O O O
) O O O O
related O O O O
to O O O O
ionotropic O O O O
glutamate O O O O
receptors O O O O
( O O O O
iGluRs O O O O
) O O O O
was O O O O
recently O O O O
discovered O O O O
in O O O O
Drosophila B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
melanogaster O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Through O O O O
Blast O O O O
analyses O O O O
of O O O O
an O O O O
expressed O O O O
sequenced O O O O
tag O O O O
library O O O O
prepared O O O O
from O O O O
male O O O O
antennae O O O O
of O O O O
the O O O O
noctuid O O O O
moth O O O O
Spodoptera B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
littoralis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
we O O O O
identified O O O O
12 O O O O
unigenes O O O O
encoding O O O O
proteins O O O O
related O O O O
to O O O O
D B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
melanogaster O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Bombyx B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mori O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
IRs O O O O
. O O O O
    
Their O O O O
full O O O O
length O O O O
sequences O O O O
were O O O O
obtained O O O O
and O O O O
the O O O O
analyses O O O O
of O O O O
their O O O O
expression O O O O
patterns O O O O
suggest O O O O
that O O O O
they O O O O
were O O O O
exclusively O O O O
expressed O O O O
or O O O O
clearly O O O O
enriched O O O O
in O O O O
chemosensory O O O O
organs O O O O
. O O O O
    
The O O O O
deduced O O O O
protein O O O O
sequences O O O O
were O O O O
more O O O O
similar O O O O
to O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
mori O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
D B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
melanogaster O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
IRs O O O O
than O O O O
to O O O O
iGluRs O O O O
and O O O O
showed O O O O
considerable O O O O
variations O O O O
in O O O O
the O O O O
predicted O O O O
ligand O O O O
- O O O O
binding O O O O
domains O O O O
; O O O O
none O O O O
have O O O O
the O O O O
three O O O O
glutamate O O O O
- O O O O
interacting O O O O
residues O O O O
found O O O O
in O O O O
iGluRs O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
different O O O O
binding O O O O
specificities O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
data O O O O
suggest O O O O
that O O O O
we O O O O
identified O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
insect O O O O
IR O O O O
chemosensory O O O O
receptor O O O O
family O O O O
in O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
littoralis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
we O O O O
report O O O O
here O O O O
the O O O O
first O O O O
demonstration O O O O
of O O O O
IR O O O O
expression O O O O
in O O O O
Lepidoptera O O O O
. O O O O
    
The O O O O
health O O O O
of O O O O
prisoners O O O O
. O O O O
    
More O O O O
than O O O O
10 O O O O
million O O O O
people O O O O
are O O O O
incarcerated O O O O
worldwide O O O O
; O O O O
this O O O O
number O O O O
has O O O O
increased O O O O
by O O O O
about O O O O
a O O O O
million O O O O
in O O O O
the O O O O
past O O O O
decade O O O O
. O O O O
    
Mental O O O O
disorders O O O O
and O O O O
infectious O O O O
diseases O O O O
are O O O O
more O O O O
common O O O O
in O O O O
prisoners O O O O
than O O O O
in O O O O
the O O O O
general O O O O
population O O O O
. O O O O
    
High O O O O
rates O O O O
of O O O O
suicide O O O O
within O O O O
prison O O O O
and O O O O
increased O O O O
mortality O O O O
from O O O O
all O O O O
causes O O O O
on O O O O
release O O O O
have O O O O
been O O O O
documented O O O O
in O O O O
many O O O O
countries O O O O
. O O O O
    
The O O O O
contribution O O O O
of O O O O
prisons O O O O
to O O O O
illness O O O O
is O O O O
unknown O O O O
, O O O O
although O O O O
shortcomings O O O O
in O O O O
treatment O O O O
and O O O O
aftercare O O O O
provision O O O O
contribute O O O O
to O O O O
adverse O O O O
outcomes O O O O
. O O O O
    
Research O O O O
has O O O O
highlighted O O O O
that O O O O
women O O O O
, O O O O
prisoners O O O O
aged O O O O
55 O O O O
years O O O O
and O O O O
older O O O O
, O O O O
and O O O O
juveniles O O O O
present O O O O
with O O O O
higher O O O O
rates O O O O
of O O O O
many O O O O
disorders O O O O
than O O O O
do O O O O
other O O O O
prisoners O O O O
. O O O O
    
The O O O O
contribution O O O O
of O O O O
initiatives O O O O
to O O O O
improve O O O O
the O O O O
health O O O O
of O O O O
prisoners O O O O
by O O O O
reducing O O O O
the O O O O
burden O O O O
of O O O O
infectious O O O O
and O O O O
chronic O O O O
diseases O O O O
, O O O O
suicide O O O O
, O O O O
other O O O O
causes O O O O
of O O O O
premature O O O O
mortality O O O O
and O O O O
violence O O O O
, O O O O
and O O O O
counteracting O O O O
the O O O O
cycle O O O O
of O O O O
reoffending O O O O
should O O O O
be O O O O
further O O O O
examined O O O O
. O O O O
    
Genome O O O O
- O O O O
wide O O O O
inventory O O O O
of O O O O
metal O O O O
homeostasis O O O O
- O O O O
related O O O O
gene O O O O
products O O O O
including O O O O
a O O O O
functional O O O O
phytochelatin O O O O
synthase O O O O
in O O O O
the O O O O
hypogeous O O O O
mycorrhizal O O O O
fungus O O O O
Tuber B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
melanosporum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Ectomycorrhizal O O O O
fungi O O O O
are O O O O
thought O O O O
to O O O O
enhance O O O O
mineral O O O O
nutrition O O O O
of O O O O
their O O O O
host O O O O
plants O O O O
and O O O O
to O O O O
confer O O O O
increased O O O O
tolerance O O O O
toward O O O O
toxic O O O O
metals O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
a O O O O
global O O O O
view O O O O
of O O O O
metal O O O O
homeostasis O O O O
- O O O O
related O O O O
genes O O O O
and O O O O
pathways O O O O
in O O O O
these O O O O
organisms O O O O
is O O O O
still O O O O
lacking O O O O
. O O O O
    
Building O O O O
upon O O O O
the O O O O
genome O O O O
sequence O O O O
of O O O O
Tuber B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
melanosporum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
on O O O O
transcriptome O O O O
analyses O O O O
, O O O O
we O O O O
set O O O O
out O O O O
to O O O O
systematically O O O O
identify O O O O
metal O O O O
homeostasis O O O O
- O O O O
related O O O O
genes O O O O
in O O O O
this O O O O
plant O O O O
- O O O O
symbiotic O O O O
ascomycete O O O O
. O O O O
    
Candidate O O O O
gene O O O O
products O O O O
( O O O O
101 O O O O
) O O O O
were O O O O
subdivided O O O O
into O O O O
three O O O O
major O O O O
functional O O O O
classes O O O O
: O O O O
( O O O O
i O O O O
) O O O O
metal O O O O
transport O O O O
( O O O O
58 O O O O
) O O O O
; O O O O
( O O O O
ii O O O O
) O O O O
oxidative O O O O
stress O O O O
defence O O O O
( O O O O
32 O O O O
) O O O O
; O O O O
( O O O O
iii O O O O
) O O O O
metal O O O O
detoxification O O O O
( O O O O
11 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
latter O O O O
class O O O O
includes O O O O
a O O O O
small O O O O
- O O O O
size O O O O
metallothionein O O O O
( O O O O
TmelMT O O O O
) O O O O
that O O O O
was O O O O
functionally O O O O
validated O O O O
in O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
and O O O O
phytochelatin O O O O
synthase O O O O
( O O O O
TmelPCS O O O O
) O O O O
, O O O O
the O O O O
first O O O O
enzyme O O O O
of O O O O
this O O O O
kind O O O O
to O O O O
be O O O O
described O O O O
in O O O O
filamentous O O O O
ascomycetes O O O O
. O O O O
    
Recombinant O O O O
TmelPCS O O O O
was O O O O
shown O O O O
to O O O O
support O O O O
GSH O O O O
- O O O O
dependent O O O O
, O O O O
metal O O O O
- O O O O
activated O O O O
phytochelatin O O O O
synthesis O O O O
in O O O O
vitro O O O O
and O O O O
to O O O O
afford O O O O
increased O O O O
Cd O O O O
/ O O O O
Cu O O O O
tolerance O O O O
to O O O O
metal O O O O
hypersensitive O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
strains O O O O
. O O O O
    
Metal O O O O
transporters O O O O
, O O O O
especially O O O O
those O O O O
related O O O O
to O O O O
Cu O O O O
and O O O O
Zn O O O O
trafficking O O O O
, O O O O
displayed O O O O
the O O O O
highest O O O O
expression O O O O
levels O O O O
in O O O O
mycorrhizae O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
extensive O O O O
translocation O O O O
of O O O O
both O O O O
metals O O O O
to O O O O
root O O O O
cells O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
to O O O O
fungal O O O O
metalloenzymes O O O O
( O O O O
e O O O O
. O O O O
g O O O O
. O O O O
, O O O O
laccase O O O O
) O O O O
that O O O O
are O O O O
strongly O O O O
upregulated O O O O
in O O O O
symbiotic O O O O
hyphae O O O O
. O O O O
    
Structural O O O O
and O O O O
functional O O O O
insights O O O O
into O O O O
Aeropyrum B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pernix O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
OppA O O O O
, O O O O
a O O O O
member O O O O
of O O O O
a O O O O
novel O O O O
archaeal O O O O
OppA O O O O
subfamily O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
we O O O O
gain O O O O
insight O O O O
into O O O O
the O O O O
structural O O O O
and O O O O
functional O O O O
characterization O O O O
of O O O O
the O O O O
Aeropyrum B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pernix O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
oligopeptide O O O O
- O O O O
binding O O O O
protein O O O O
( O O O O
OppA O O O O
( O O O O
Ap O O O O
) O O O O
) O O O O
previously O O O O
identified O O O O
from O O O O
the O O O O
extracellular O O O O
medium O O O O
of O O O O
an O O O O
Aeropyrum B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pernix O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cell O O O O
culture O O O O
at O O O O
late O O O O
stationary O O O O
phase O O O O
. O O O O
    
OppA O O O O
( O O O O
Ap O O O O
) O O O O
showed O O O O
an O O O O
N O O O O
- O O O O
terminal O O O O
Q32 O O O O
in O O O O
a O O O O
pyroglutamate O O O O
form O O O O
and O O O O
C O O O O
- O O O O
terminal O O O O
processing O O O O
at O O O O
the O O O O
level O O O O
of O O O O
a O O O O
threonine O O O O
- O O O O
rich O O O O
region O O O O
probably O O O O
involved O O O O
in O O O O
protein O O O O
membrane O O O O
anchoring O O O O
. O O O O
    
Moreover O O O O
, O O O O
the O O O O
OppA O O O O
( O O O O
Ap O O O O
) O O O O
protein O O O O
released O O O O
into O O O O
the O O O O
medium O O O O
was O O O O
identified O O O O
as O O O O
a O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
nicked O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
form O O O O
composed O O O O
of O O O O
two O O O O
tightly O O O O
associated O O O O
fragments O O O O
detachable O O O O
only O O O O
under O O O O
strong O O O O
denaturing O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
The O O O O
cleavage O O O O
site O O O O
E569 O O O O
- O O O O
G570 O O O O
seems O O O O
be O O O O
located O O O O
on O O O O
an O O O O
exposed O O O O
surface O O O O
loop O O O O
that O O O O
is O O O O
highly O O O O
conserved O O O O
in O O O O
several O O O O
three O O O O
- O O O O
dimensional O O O O
( O O O O
3D O O O O
) O O O O
structures O O O O
of O O O O
dipeptide O O O O
/ O O O O
oligopeptide O O O O
- O O O O
binding O O O O
proteins O O O O
from O O O O
different O O O O
sources O O O O
. O O O O
    
Structural O O O O
and O O O O
biochemical O O O O
properties O O O O
of O O O O
the O O O O
nicked O O O O
protein O O O O
were O O O O
virtually O O O O
indistinguishable O O O O
from O O O O
those O O O O
of O O O O
the O O O O
intact O O O O
form O O O O
. O O O O
    
Indeed O O O O
, O O O O
studies O O O O
of O O O O
the O O O O
entire O O O O
bacterially O O O O
expressed O O O O
OppA O O O O
( O O O O
Ap O O O O
) O O O O
protein O O O O
owning O O O O
the O O O O
same O O O O
N O O O O
and O O O O
C O O O O
termini O O O O
of O O O O
the O O O O
nicked O O O O
form O O O O
supported O O O O
these O O O O
findings O O O O
. O O O O
    
Moreover O O O O
, O O O O
in O O O O
the O O O O
middle O O O O
exponential O O O O
growth O O O O
phase O O O O
, O O O O
OppA O O O O
( O O O O
Ap O O O O
) O O O O
was O O O O
found O O O O
as O O O O
an O O O O
intact O O O O
cell O O O O
membrane O O O O
- O O O O
associated O O O O
protein O O O O
. O O O O
    
Interestingly O O O O
, O O O O
the O O O O
native O O O O
exoprotein O O O O
OppA O O O O
( O O O O
Ap O O O O
) O O O O
was O O O O
copurified O O O O
with O O O O
a O O O O
hexapeptide O O O O
( O O O O
EKFKIV O O O O
) O O O O
showing O O O O
both O O O O
lysines O O O O
methylated O O O O
and O O O O
possibly O O O O
originating O O O O
from O O O O
an O O O O
A O O O O
. O O O O
pernix O O O O
endogenous O O O O
stress O O O O
- O O O O
induced O O O O
lipoprotein O O O O
. O O O O
    
Therefore O O O O
, O O O O
the O O O O
involvement O O O O
of O O O O
OppA O O O O
( O O O O
Ap O O O O
) O O O O
in O O O O
the O O O O
recycling O O O O
of O O O O
endogenous O O O O
proteins O O O O
was O O O O
suggested O O O O
to O O O O
be O O O O
a O O O O
potential O O O O
physiological O O O O
function O O O O
. O O O O
    
Finally O O O O
, O O O O
a O O O O
new O O O O
OppA O O O O
from O O O O
Sulfolobus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
solfataricus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
SSO1288 O O O O
, O O O O
was O O O O
purified O O O O
and O O O O
preliminarily O O O O
characterized O O O O
, O O O O
allowing O O O O
the O O O O
identification O O O O
of O O O O
a O O O O
common O O O O
structural O O O O
/ O O O O
genetic O O O O
organization O O O O
shared O O O O
by O O O O
all O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
true O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
archaeal O O O O
OppA O O O O
proteins O O O O
of O O O O
the O O O O
dipeptide O O O O
/ O O O O
oligopeptide O O O O
class O O O O
. O O O O
    
Differential O O O O
responses O O O O
of O O O O
Bacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
subtilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
rRNA O O O O
promoters O O O O
to O O O O
nutritional O O O O
stress O O O O
. O O O O
    
The O O O O
in O O O O
vivo O O O O
expression O O O O
levels O O O O
of O O O O
four O O O O
rRNA O O O O
promoter O O O O
pairs O O O O
( O O O O
rrnp O O O O
( O O O O
1 O O O O
) O O O O
p O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
) O O O O
of O O O O
Bacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
subtilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
were O O O O
determined O O O O
by O O O O
employing O O O O
single O O O O
- O O O O
copy O O O O
lacZ O O O O
fusions O O O O
integrated O O O O
at O O O O
the O O O O
amyE O O O O
locus O O O O
. O O O O
    
The O O O O
rrnO O O O O
, O O O O
rrnJ O O O O
, O O O O
rrnD O O O O
, O O O O
and O O O O
rrnB O O O O
promoters O O O O
displayed O O O O
unique O O O O
growth O O O O
rate O O O O
regulation O O O O
and O O O O
stringent O O O O
responses O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
lacZ O O O O
activity O O O O
and O O O O
mRNA O O O O
levels O O O O
were O O O O
highest O O O O
for O O O O
rrnO O O O O
under O O O O
all O O O O
growth O O O O
conditions O O O O
tested O O O O
, O O O O
while O O O O
rrnJ O O O O
, O O O O
rrnB O O O O
, O O O O
and O O O O
rrnD O O O O
showed O O O O
decreasing O O O O
levels O O O O
of O O O O
activity O O O O
. O O O O
    
During O O O O
amino O O O O
acid O O O O
starvation O O O O
induced O O O O
by O O O O
serine O O O O
hydroxamate O O O O
( O O O O
SHX O O O O
) O O O O
, O O O O
only O O O O
the O O O O
strong O O O O
rrnO O O O O
and O O O O
rrnJ O O O O
promoters O O O O
demonstrated O O O O
stringent O O O O
responses O O O O
. O O O O
    
Under O O O O
the O O O O
growth O O O O
conditions O O O O
used O O O O
, O O O O
the O O O O
rrn O O O O
promoters O O O O
showed O O O O
responses O O O O
similar O O O O
to O O O O
the O O O O
responses O O O O
to O O O O
carbon O O O O
source O O O O
limitation O O O O
induced O O O O
by O O O O
alpha O O O O
- O O O O
methyl O O O O
glucoside O O O O
( O O O O
alpha O O O O
- O O O O
MG O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
ratio O O O O
of O O O O
P2 O O O O
to O O O O
P1 O O O O
transcripts O O O O
, O O O O
determined O O O O
by O O O O
primer O O O O
extension O O O O
analysis O O O O
, O O O O
was O O O O
high O O O O
for O O O O
the O O O O
strong O O O O
rrnO O O O O
and O O O O
rrnJ O O O O
promoters O O O O
, O O O O
while O O O O
only O O O O
P2 O O O O
transcripts O O O O
were O O O O
detected O O O O
for O O O O
the O O O O
weak O O O O
rrnD O O O O
and O O O O
rrnB O O O O
promoters O O O O
. O O O O
    
Cloned O O O O
P1 O O O O
or O O O O
P2 O O O O
promoter O O O O
fragments O O O O
of O O O O
rrnO O O O O
or O O O O
rrnJ O O O O
were O O O O
differentially O O O O
regulated O O O O
. O O O O
    
In O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
( O O O O
relA O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
) O O O O
and O O O O
suppressor O O O O
[ O O O O
relA O O O O
( O O O O
S O O O O
) O O O O
] O O O O
strains O O O O
under O O O O
the O O O O
conditions O O O O
tested O O O O
, O O O O
only O O O O
P2 O O O O
responded O O O O
to O O O O
carbon O O O O
source O O O O
limitation O O O O
by O O O O
a O O O O
decrease O O O O
in O O O O
RNA O O O O
synthesis O O O O
, O O O O
correlating O O O O
with O O O O
an O O O O
increase O O O O
in O O O O
( O O O O
p O O O O
) O O O O
ppGpp O O O O
levels O O O O
and O O O O
a O O O O
decrease O O O O
in O O O O
the O O O O
GTP O O O O
concentration O O O O
. O O O O
    
The O O O O
weak O O O O
P1 O O O O
promoter O O O O
elements O O O O
remain O O O O
relaxed O O O O
in O O O O
the O O O O
three O O O O
genetic O O O O
backgrounds O O O O
[ O O O O
relA O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
, O O O O
relA O O O O
, O O O O
relA O O O O
( O O O O
S O O O O
) O O O O
] O O O O
in O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
alpha O O O O
- O O O O
MG O O O O
. O O O O
    
During O O O O
amino O O O O
acid O O O O
starvation O O O O
, O O O O
P2 O O O O
was O O O O
stringently O O O O
regulated O O O O
in O O O O
relA O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
and O O O O
relA O O O O
( O O O O
S O O O O
) O O O O
cells O O O O
, O O O O
while O O O O
only O O O O
rrnJp O O O O
( O O O O
1 O O O O
) O O O O
was O O O O
also O O O O
regulated O O O O
, O O O O
but O O O O
to O O O O
a O O O O
lesser O O O O
extent O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
the O O O O
relA O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
and O O O O
relA O O O O
( O O O O
S O O O O
) O O O O
strains O O O O
showed O O O O
( O O O O
p O O O O
) O O O O
ppGpp O O O O
accumulation O O O O
after O O O O
alpha O O O O
- O O O O
MG O O O O
treatment O O O O
but O O O O
not O O O O
after O O O O
SHX O O O O
treatment O O O O
. O O O O
    
These O O O O
data O O O O
reveal O O O O
the O O O O
complex O O O O
nature O O O O
of O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
subtilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
rrn O O O O
promoter O O O O
regulation O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
stress O O O O
, O O O O
and O O O O
they O O O O
suggest O O O O
that O O O O
the O O O O
P2 O O O O
promoters O O O O
may O O O O
play O O O O
a O O O O
more O O O O
prominent O O O O
role O O O O
in O O O O
the O O O O
stringent O O O O
response O O O O
. O O O O
    
Primosomal O O O O
proteins O O O O
DnaD O O O O
and O O O O
DnaB O O O O
are O O O O
recruited O O O O
to O O O O
chromosomal O O O O
regions O O O O
bound O O O O
by O O O O
DnaA O O O O
in O O O O
Bacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
subtilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
initiation O O O O
of O O O O
DNA O O O O
replication O O O O
requires O O O O
the O O O O
binding O O O O
of O O O O
the O O O O
initiator O O O O
protein O O O O
, O O O O
DnaA O O O O
, O O O O
to O O O O
specific O O O O
binding O O O O
sites O O O O
in O O O O
the O O O O
chromosomal O O O O
origin O O O O
of O O O O
replication O O O O
, O O O O
oriC O O O O
. O O O O
    
DnaA O O O O
also O O O O
binds O O O O
to O O O O
many O O O O
sites O O O O
around O O O O
the O O O O
chromosome O O O O
, O O O O
outside O O O O
oriC O O O O
, O O O O
and O O O O
acts O O O O
as O O O O
a O O O O
transcription O O O O
factor O O O O
at O O O O
several O O O O
of O O O O
these O O O O
. O O O O
    
In O O O O
low O O O O
- O O O O
G O O O O
+ O O O O
C O O O O
Gram O O O O
- O O O O
positive O O O O
bacteria O O O O
, O O O O
the O O O O
primosomal O O O O
proteins O O O O
DnaD O O O O
and O O O O
DnaB O O O O
, O O O O
in O O O O
conjunction O O O O
with O O O O
loader O O O O
ATPase O O O O
DnaI O O O O
, O O O O
load O O O O
the O O O O
replicative O O O O
helicase O O O O
at O O O O
oriC O O O O
, O O O O
and O O O O
this O O O O
depends O O O O
on O O O O
DnaA O O O O
. O O O O
    
DnaD O O O O
and O O O O
DnaB O O O O
also O O O O
are O O O O
required O O O O
to O O O O
load O O O O
the O O O O
replicative O O O O
helicase O O O O
outside O O O O
oriC O O O O
during O O O O
replication O O O O
restart O O O O
, O O O O
independently O O O O
of O O O O
DnaA O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
chromatin O O O O
immunoprecipitation O O O O
, O O O O
we O O O O
found O O O O
that O O O O
DnaD O O O O
and O O O O
DnaB O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
the O O O O
replicative O O O O
helicase O O O O
, O O O O
are O O O O
associated O O O O
with O O O O
many O O O O
of O O O O
the O O O O
chromosomal O O O O
regions O O O O
bound O O O O
by O O O O
DnaA O O O O
in O O O O
Bacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
subtilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
This O O O O
association O O O O
was O O O O
dependent O O O O
on O O O O
DnaA O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
order O O O O
of O O O O
recruitment O O O O
was O O O O
the O O O O
same O O O O
as O O O O
that O O O O
at O O O O
oriC O O O O
, O O O O
but O O O O
it O O O O
was O O O O
independent O O O O
of O O O O
a O O O O
functional O O O O
oriC O O O O
and O O O O
suggests O O O O
that O O O O
DnaD O O O O
and O O O O
DnaB O O O O
do O O O O
not O O O O
require O O O O
open O O O O
complex O O O O
formation O O O O
for O O O O
the O O O O
stable O O O O
association O O O O
with O O O O
DNA O O O O
. O O O O
    
These O O O O
secondary O O O O
binding O O O O
regions O O O O
for O O O O
DnaA O O O O
could O O O O
be O O O O
serving O O O O
as O O O O
a O O O O
reservoir O O O O
for O O O O
excess O O O O
DnaA O O O O
, O O O O
DnaD O O O O
, O O O O
and O O O O
DnaB O O O O
to O O O O
help O O O O
properly O O O O
regulate O O O O
replication O O O O
initiation O O O O
and O O O O
perhaps O O O O
are O O O O
analogous O O O O
to O O O O
the O O O O
proposed O O O O
function O O O O
of O O O O
the O O O O
datA O O O O
locus O O O O
in O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Alternatively O O O O
, O O O O
DnaD O O O O
and O O O O
DnaB O O O O
might O O O O
modulate O O O O
the O O O O
activity O O O O
of O O O O
DnaA O O O O
at O O O O
the O O O O
secondary O O O O
binding O O O O
regions O O O O
. O O O O
    
All O O O O
three O O O O
of O O O O
these O O O O
proteins O O O O
are O O O O
widely O O O O
conserved O O O O
and O O O O
likely O O O O
have O O O O
similar O O O O
functions O O O O
in O O O O
a O O O O
range O O O O
of O O O O
organisms O O O O
. O O O O
    
A O O O O
LytM O O O O
domain O O O O
dictates O O O O
the O O O O
localization O O O O
of O O O O
proteins O O O O
to O O O O
the O O O O
mother O O O O
cell O O O O
- O O O O
forespore O O O O
interface O O O O
during O O O O
bacterial O O O O
endospore O O O O
formation O O O O
. O O O O
    
A O O O O
large O O O O
number O O O O
of O O O O
proteins O O O O
are O O O O
known O O O O
to O O O O
reside O O O O
at O O O O
specific O O O O
subcellular O O O O
locations O O O O
in O O O O
bacterial O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
molecular O O O O
mechanisms O O O O
by O O O O
which O O O O
many O O O O
of O O O O
these O O O O
proteins O O O O
are O O O O
anchored O O O O
at O O O O
these O O O O
locations O O O O
remains O O O O
unclear O O O O
. O O O O
    
During O O O O
endospore O O O O
formation O O O O
in O O O O
Bacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
subtilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
several O O O O
integral O O O O
membrane O O O O
proteins O O O O
are O O O O
located O O O O
specifically O O O O
at O O O O
the O O O O
interface O O O O
of O O O O
the O O O O
two O O O O
adjacent O O O O
cells O O O O
of O O O O
the O O O O
developing O O O O
sporangium O O O O
, O O O O
the O O O O
mother O O O O
cell O O O O
and O O O O
forespore O O O O
. O O O O
    
The O O O O
mother O O O O
cell O O O O
membrane O O O O
protein O O O O
SpoIIIAH O O O O
recognizes O O O O
the O O O O
cell O O O O
- O O O O
cell O O O O
interface O O O O
through O O O O
an O O O O
interaction O O O O
with O O O O
the O O O O
forespore O O O O
membrane O O O O
protein O O O O
SpoIIQ O O O O
, O O O O
and O O O O
then O O O O
the O O O O
other O O O O
proteins O O O O
are O O O O
positioned O O O O
there O O O O
by O O O O
the O O O O
SpoIIIAH O O O O
- O O O O
SpoIIQ O O O O
complex O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
investigated O O O O
the O O O O
molecular O O O O
mechanisms O O O O
underlying O O O O
the O O O O
formation O O O O
of O O O O
the O O O O
SpoIIIAH O O O O
- O O O O
SpoIIQ O O O O
complex O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
gel O O O O
filtration O O O O
chromatography O O O O
and O O O O
isothermal O O O O
titration O O O O
calorimetry O O O O
, O O O O
we O O O O
measured O O O O
the O O O O
binding O O O O
parameters O O O O
that O O O O
characterize O O O O
the O O O O
SpoIIIAH O O O O
- O O O O
SpoIIQ O O O O
interaction O O O O
in O O O O
vitro O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
the O O O O
interaction O O O O
of O O O O
SpoIIIAH O O O O
and O O O O
SpoIIQ O O O O
is O O O O
governed O O O O
by O O O O
their O O O O
YscJ O O O O
and O O O O
degenerate O O O O
LytM O O O O
domains O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
Therefore O O O O
, O O O O
the O O O O
LytM O O O O
domain O O O O
of O O O O
SpoIIQ O O O O
provides O O O O
the O O O O
positional O O O O
cue O O O O
that O O O O
dictates O O O O
the O O O O
localization O O O O
of O O O O
mother O O O O
cell O O O O
membrane O O O O
proteins O O O O
to O O O O
the O O O O
mother O O O O
cell O O O O
- O O O O
forespore O O O O
interface O O O O
. O O O O
    
Spatial O O O O
regulation O O O O
of O O O O
histidine O O O O
kinases O O O O
governing O O O O
biofilm O O O O
formation O O O O
in O O O O
Bacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
subtilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Bacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
subtilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
able O O O O
to O O O O
form O O O O
architecturally O O O O
complex O O O O
biofilms O O O O
on O O O O
solid O O O O
medium O O O O
due O O O O
to O O O O
the O O O O
production O O O O
of O O O O
an O O O O
extracellular O O O O
matrix O O O O
. O O O O
    
A O O O O
master O O O O
regulator O O O O
that O O O O
controls O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
the O O O O
genes O O O O
involved O O O O
in O O O O
matrix O O O O
synthesis O O O O
is O O O O
Spo0A O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
activated O O O O
by O O O O
phosphorylation O O O O
via O O O O
a O O O O
phosphorelay O O O O
involving O O O O
multiple O O O O
histidine O O O O
kinases O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
report O O O O
that O O O O
four O O O O
kinases O O O O
, O O O O
KinA O O O O
, O O O O
KinB O O O O
, O O O O
KinC O O O O
, O O O O
and O O O O
KinD O O O O
, O O O O
help O O O O
govern O O O O
biofilm O O O O
formation O O O O
but O O O O
that O O O O
their O O O O
contributions O O O O
are O O O O
partially O O O O
masked O O O O
by O O O O
redundancy O O O O
. O O O O
    
We O O O O
show O O O O
that O O O O
the O O O O
kinases O O O O
fall O O O O
into O O O O
two O O O O
categories O O O O
and O O O O
that O O O O
the O O O O
members O O O O
of O O O O
each O O O O
pair O O O O
( O O O O
one O O O O
pair O O O O
comprising O O O O
KinA O O O O
and O O O O
KinB O O O O
and O O O O
the O O O O
other O O O O
comprising O O O O
KinC O O O O
and O O O O
KinD O O O O
) O O O O
are O O O O
partially O O O O
redundant O O O O
with O O O O
each O O O O
other O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
show O O O O
that O O O O
the O O O O
kinases O O O O
are O O O O
spatially O O O O
regulated O O O O
: O O O O
KinA O O O O
and O O O O
KinB O O O O
are O O O O
active O O O O
principally O O O O
in O O O O
the O O O O
older O O O O
, O O O O
inner O O O O
regions O O O O
of O O O O
the O O O O
colony O O O O
, O O O O
and O O O O
KinC O O O O
and O O O O
KinD O O O O
function O O O O
chiefly O O O O
in O O O O
the O O O O
younger O O O O
, O O O O
outer O O O O
regions O O O O
. O O O O
    
These O O O O
conclusions O O O O
are O O O O
based O O O O
on O O O O
the O O O O
morphology O O O O
of O O O O
kinase O O O O
mutants O O O O
, O O O O
real O O O O
- O O O O
time O O O O
measurements O O O O
of O O O O
gene O O O O
expression O O O O
using O O O O
luciferase O O O O
as O O O O
a O O O O
reporter O O O O
, O O O O
and O O O O
confocal O O O O
microscopy O O O O
using O O O O
a O O O O
fluorescent O O O O
protein O O O O
as O O O O
a O O O O
reporter O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
findings O O O O
suggest O O O O
that O O O O
multiple O O O O
signals O O O O
from O O O O
the O O O O
older O O O O
and O O O O
younger O O O O
regions O O O O
of O O O O
the O O O O
colony O O O O
are O O O O
integrated O O O O
by O O O O
the O O O O
kinases O O O O
to O O O O
determine O O O O
the O O O O
overall O O O O
architecture O O O O
of O O O O
the O O O O
biofilm O O O O
community O O O O
. O O O O
    
Contributions O O O O
of O O O O
multiple O O O O
binding O O O O
sites O O O O
and O O O O
effector O O O O
- O O O O
independent O O O O
binding O O O O
to O O O O
CodY O O O O
- O O O O
mediated O O O O
regulation O O O O
in O O O O
Bacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
subtilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
CodY O O O O
is O O O O
a O O O O
branched O O O O
- O O O O
chain O O O O
amino O O O O
acid O O O O
- O O O O
responsive O O O O
transcriptional O O O O
regulator O O O O
that O O O O
controls O O O O
, O O O O
directly O O O O
or O O O O
indirectly O O O O
, O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
more O O O O
than O O O O
100 O O O O
genes O O O O
and O O O O
operons O O O O
in O O O O
Bacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
subtilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Using O O O O
DNase O O O O
I O O O O
footprinting O O O O
and O O O O
gel O O O O
- O O O O
shift O O O O
experiments O O O O
, O O O O
we O O O O
identified O O O O
two O O O O
CodY O O O O
- O O O O
binding O O O O
regions O O O O
upstream O O O O
of O O O O
a O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
subtilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gene O O O O
( O O O O
bcaP O O O O
, O O O O
previously O O O O
known O O O O
as O O O O
yhdG O O O O
) O O O O
that O O O O
encodes O O O O
a O O O O
transporter O O O O
of O O O O
branched O O O O
- O O O O
chain O O O O
amino O O O O
acids O O O O
. O O O O
    
Mutational O O O O
analysis O O O O
revealed O O O O
that O O O O
both O O O O
CodY O O O O
- O O O O
binding O O O O
regions O O O O
contribute O O O O
to O O O O
repression O O O O
in O O O O
vivo O O O O
and O O O O
do O O O O
so O O O O
independently O O O O
of O O O O
each O O O O
other O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
a O O O O
single O O O O
CodY O O O O
- O O O O
binding O O O O
site O O O O
is O O O O
apparently O O O O
sufficient O O O O
for O O O O
substantial O O O O
CodY O O O O
- O O O O
dependent O O O O
regulation O O O O
. O O O O
    
By O O O O
analyzing O O O O
affinities O O O O
of O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
and O O O O
mutant O O O O
CodY O O O O
- O O O O
binding O O O O
sites O O O O
for O O O O
CodY O O O O
and O O O O
their O O O O
regulation O O O O
by O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
CodY O O O O
and O O O O
forms O O O O
of O O O O
CodY O O O O
with O O O O
various O O O O
levels O O O O
of O O O O
activation O O O O
by O O O O
branched O O O O
- O O O O
chain O O O O
amino O O O O
acids O O O O
, O O O O
we O O O O
concluded O O O O
that O O O O
unliganded O O O O
CodY O O O O
cannot O O O O
repress O O O O
transcription O O O O
in O O O O
vivo O O O O
and O O O O
that O O O O
the O O O O
level O O O O
of O O O O
endogenously O O O O
produced O O O O
effectors O O O O
is O O O O
sufficient O O O O
for O O O O
CodY O O O O
- O O O O
mediated O O O O
regulation O O O O
of O O O O
promoters O O O O
with O O O O
stronger O O O O
sites O O O O
. O O O O
    
Because O O O O
the O O O O
sites O O O O
with O O O O
higher O O O O
affinity O O O O
apparently O O O O
respond O O O O
to O O O O
lower O O O O
concentrations O O O O
of O O O O
CodY O O O O
effectors O O O O
and O O O O
saturate O O O O
faster O O O O
as O O O O
the O O O O
concentrations O O O O
of O O O O
effectors O O O O
increase O O O O
, O O O O
having O O O O
two O O O O
sites O O O O
of O O O O
binding O O O O
with O O O O
different O O O O
affinities O O O O
for O O O O
CodY O O O O
permits O O O O
a O O O O
promoter O O O O
to O O O O
respond O O O O
to O O O O
a O O O O
wider O O O O
range O O O O
of O O O O
intracellular O O O O
concentrations O O O O
of O O O O
effectors O O O O
. O O O O
    
Differences O O O O
in O O O O
MinC O O O O
/ O O O O
MinD O O O O
sensitivity O O O O
between O O O O
polar O O O O
and O O O O
internal O O O O
Z O O O O
rings O O O O
in O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
In O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
the O O O O
Z O O O O
ring O O O O
has O O O O
the O O O O
potential O O O O
to O O O O
assemble O O O O
anywhere O O O O
along O O O O
the O O O O
cell O O O O
length O O O O
but O O O O
is O O O O
restricted O O O O
to O O O O
midcell O O O O
by O O O O
the O O O O
action O O O O
of O O O O
negative O O O O
regulatory O O O O
systems O O O O
, O O O O
including O O O O
Min O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
current O O O O
model O O O O
for O O O O
the O O O O
Min O O O O
system O O O O
, O O O O
the O O O O
MinC O O O O
/ O O O O
MinD O O O O
division O O O O
inhibitory O O O O
complex O O O O
is O O O O
evenly O O O O
distributed O O O O
on O O O O
the O O O O
membrane O O O O
and O O O O
can O O O O
disrupt O O O O
Z O O O O
rings O O O O
anywhere O O O O
in O O O O
the O O O O
cell O O O O
; O O O O
however O O O O
, O O O O
MinE O O O O
spatially O O O O
regulates O O O O
MinC O O O O
/ O O O O
MinD O O O O
by O O O O
restricting O O O O
it O O O O
to O O O O
the O O O O
cell O O O O
poles O O O O
, O O O O
thus O O O O
allowing O O O O
Z O O O O
ring O O O O
formation O O O O
at O O O O
midcell O O O O
. O O O O
    
This O O O O
model O O O O
assumes O O O O
that O O O O
Z O O O O
rings O O O O
formed O O O O
at O O O O
different O O O O
cellular O O O O
locations O O O O
have O O O O
equal O O O O
sensitivity O O O O
to O O O O
MinC O O O O
/ O O O O
MinD O O O O
in O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
MinE O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
here O O O O
we O O O O
report O O O O
evidence O O O O
that O O O O
differences O O O O
in O O O O
MinC O O O O
/ O O O O
MinD O O O O
sensitivity O O O O
between O O O O
polar O O O O
and O O O O
nonpolar O O O O
Z O O O O
rings O O O O
exists O O O O
even O O O O
when O O O O
there O O O O
is O O O O
no O O O O
MinE O O O O
. O O O O
    
MinC O O O O
/ O O O O
MinD O O O O
at O O O O
proper O O O O
levels O O O O
is O O O O
able O O O O
to O O O O
block O O O O
minicell O O O O
production O O O O
in O O O O
Deltamin O O O O
strains O O O O
without O O O O
increasing O O O O
the O O O O
cell O O O O
length O O O O
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
polar O O O O
Z O O O O
rings O O O O
are O O O O
preferentially O O O O
blocked O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
FtsZ B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
I374V O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
which O O O O
is O O O O
resistant O O O O
to O O O O
MinC O O O O
( O O O O
C O O O O
) O O O O
/ O O O O
MinD O O O O
) O O O O
, O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
morphology O O O O
can O O O O
be O O O O
easily O O O O
achieved O O O O
with O O O O
MinC O O O O
/ O O O O
MinD O O O O
in O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
MinE O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
show O O O O
that O O O O
MinC O O O O
/ O O O O
MinD O O O O
at O O O O
proper O O O O
levels O O O O
can O O O O
rescue O O O O
the O O O O
lethal O O O O
phenotype O O O O
of O O O O
a O O O O
min O O O O
slmA O O O O
double O O O O
deletion O O O O
mutant O O O O
, O O O O
which O O O O
we O O O O
think O O O O
is O O O O
due O O O O
to O O O O
the O O O O
elimination O O O O
of O O O O
polar O O O O
Z O O O O
rings O O O O
( O O O O
or O O O O
FtsZ O O O O
structures O O O O
) O O O O
, O O O O
which O O O O
frees O O O O
up O O O O
FtsZ O O O O
molecules O O O O
for O O O O
assembly O O O O
of O O O O
Z O O O O
rings O O O O
at O O O O
internal O O O O
sites O O O O
to O O O O
rescue O O O O
division O O O O
and O O O O
growth O O O O
. O O O O
    
Taken O O O O
together O O O O
, O O O O
these O O O O
data O O O O
indicate O O O O
that O O O O
polar O O O O
Z O O O O
rings O O O O
are O O O O
more O O O O
susceptible O O O O
to O O O O
MinC O O O O
/ O O O O
MinD O O O O
than O O O O
internal O O O O
Z O O O O
rings O O O O
, O O O O
even O O O O
when O O O O
MinE O O O O
is O O O O
absent O O O O
. O O O O
    
Altered O O O O
regulation O O O O
of O O O O
the O O O O
OmpF O O O O
porin O O O O
by O O O O
Fis O O O O
in O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
during O O O O
an O O O O
evolution O O O O
experiment O O O O
and O O O O
between O O O O
B O O O O
and O O O O
K O O O O
- O O O O
12 O O O O
strains O O O O
. O O O O
    
The O O O O
phenotypic O O O O
plasticity O O O O
of O O O O
global O O O O
regulatory O O O O
networks O O O O
provides O O O O
bacteria O O O O
with O O O O
rapid O O O O
acclimation O O O O
to O O O O
a O O O O
wide O O O O
range O O O O
of O O O O
environmental O O O O
conditions O O O O
, O O O O
while O O O O
genetic O O O O
changes O O O O
in O O O O
those O O O O
networks O O O O
provide O O O O
additional O O O O
flexibility O O O O
as O O O O
bacteria O O O O
evolve O O O O
across O O O O
long O O O O
time O O O O
scales O O O O
. O O O O
    
We O O O O
previously O O O O
identified O O O O
mutations O O O O
in O O O O
the O O O O
global O O O O
regulator O O O O
- O O O O
encoding O O O O
gene O O O O
fis O O O O
that O O O O
enhanced O O O O
organismal O O O O
fitness O O O O
during O O O O
a O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
evolution O O O O
experiment O O O O
with O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
To O O O O
gain O O O O
insight O O O O
into O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
these O O O O
mutations O O O O
, O O O O
we O O O O
produced O O O O
two O O O O
- O O O O
dimensional O O O O
protein O O O O
gels O O O O
with O O O O
strains O O O O
carrying O O O O
different O O O O
fis O O O O
alleles O O O O
, O O O O
including O O O O
a O O O O
beneficial O O O O
evolved O O O O
allele O O O O
and O O O O
one O O O O
with O O O O
an O O O O
in O O O O
- O O O O
frame O O O O
deletion O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
that O O O O
Fis O O O O
controls O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
the O O O O
major O O O O
porin O O O O
- O O O O
encoding O O O O
gene O O O O
ompF O O O O
in O O O O
the O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
B O O O O
- O O O O
derived O O O O
ancestral O O O O
strain O O O O
used O O O O
in O O O O
the O O O O
evolution O O O O
experiment O O O O
, O O O O
a O O O O
relationship O O O O
that O O O O
has O O O O
not O O O O
been O O O O
described O O O O
before O O O O
. O O O O
    
We O O O O
further O O O O
showed O O O O
that O O O O
this O O O O
regulatory O O O O
connection O O O O
evolved O O O O
over O O O O
two O O O O
different O O O O
time O O O O
scales O O O O
, O O O O
perhaps O O O O
explaining O O O O
why O O O O
it O O O O
was O O O O
not O O O O
observed O O O O
before O O O O
. O O O O
    
On O O O O
the O O O O
longer O O O O
time O O O O
scale O O O O
, O O O O
we O O O O
showed O O O O
that O O O O
this O O O O
regulation O O O O
of O O O O
ompF O O O O
by O O O O
Fis O O O O
is O O O O
absent O O O O
from O O O O
the O O O O
more O O O O
widely O O O O
studied O O O O
K B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
12 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
thus O O O O
is O O O O
specific O O O O
to O O O O
the O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
strain O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
On O O O O
a O O O O
shorter O O O O
time O O O O
scale O O O O
, O O O O
this O O O O
regulatory O O O O
linkage O O O O
was O O O O
lost O O O O
during O O O O
20 O O O O
, O O O O
000 O O O O
generations O O O O
of O O O O
experimental O O O O
evolution O O O O
of O O O O
the O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
strain O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Finally O O O O
, O O O O
we O O O O
mapped O O O O
the O O O O
Fis O O O O
binding O O O O
sites O O O O
in O O O O
the O O O O
ompF O O O O
regulatory O O O O
region O O O O
, O O O O
and O O O O
we O O O O
present O O O O
a O O O O
hypothetical O O O O
model O O O O
of O O O O
ompF O O O O
expression O O O O
that O O O O
includes O O O O
its O O O O
other O O O O
known O O O O
regulators O O O O
. O O O O
    
Fur O O O O
and O O O O
the O O O O
novel O O O O
regulator O O O O
YqjI O O O O
control O O O O
transcription O O O O
of O O O O
the O O O O
ferric O O O O
reductase O O O O
gene O O O O
yqjH O O O O
in O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Iron O O O O
acquisition O O O O
in O O O O
aerobic O O O O
habitats O O O O
is O O O O
complicated O O O O
by O O O O
the O O O O
low O O O O
solubility O O O O
of O O O O
ferric O O O O
hydroxides O O O O
. O O O O
    
Siderophores O O O O
that O O O O
bind O O O O
ferric O O O O
iron O O O O
with O O O O
high O O O O
affinity O O O O
are O O O O
used O O O O
to O O O O
mobilize O O O O
iron O O O O
. O O O O
    
The O O O O
reduction O O O O
of O O O O
ferric O O O O
iron O O O O
to O O O O
the O O O O
ferrous O O O O
form O O O O
can O O O O
be O O O O
coupled O O O O
to O O O O
the O O O O
release O O O O
of O O O O
iron O O O O
from O O O O
siderophores O O O O
. O O O O
    
Iron O O O O
is O O O O
also O O O O
stored O O O O
intracellularly O O O O
as O O O O
a O O O O
ferric O O O O
mineral O O O O
in O O O O
proteins O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
ferritin O O O O
, O O O O
and O O O O
must O O O O
be O O O O
reduced O O O O
during O O O O
release O O O O
. O O O O
    
In O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
the O O O O
yqjH O O O O
gene O O O O
encodes O O O O
a O O O O
putative O O O O
ferric O O O O
siderophore O O O O
reductase O O O O
that O O O O
is O O O O
also O O O O
part O O O O
of O O O O
the O O O O
Fur O O O O
regulon O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
show O O O O
that O O O O
YqjH O O O O
has O O O O
ferric O O O O
reductase O O O O
activity O O O O
and O O O O
is O O O O
required O O O O
for O O O O
iron O O O O
homeostasis O O O O
in O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Divergently O O O O
transcribed O O O O
from O O O O
yqjH O O O O
is O O O O
the O O O O
yqjI O O O O
gene O O O O
, O O O O
which O O O O
encodes O O O O
a O O O O
novel O O O O
member O O O O
of O O O O
the O O O O
winged O O O O
- O O O O
helix O O O O
family O O O O
of O O O O
transcriptional O O O O
regulators O O O O
and O O O O
also O O O O
contains O O O O
an O O O O
N O O O O
- O O O O
terminal O O O O
extension O O O O
similar O O O O
to O O O O
the O O O O
Ni O O O O
( O O O O
2 O O O O
+ O O O O
) O O O O
- O O O O
binding O O O O
C O O O O
- O O O O
terminal O O O O
tail O O O O
of O O O O
SlyD O O O O
. O O O O
    
Deletion O O O O
of O O O O
yqjI O O O O
leads O O O O
to O O O O
constitutive O O O O
high O O O O
- O O O O
level O O O O
activity O O O O
of O O O O
the O O O O
yqjH O O O O
and O O O O
yqjI O O O O
promoters O O O O
. O O O O
    
Purified O O O O
YqjI O O O O
binds O O O O
inverted O O O O
repeat O O O O
target O O O O
sequences O O O O
within O O O O
the O O O O
yqjH O O O O
and O O O O
yqjI O O O O
promoters O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
observed O O O O
that O O O O
YqjI O O O O
- O O O O
dependent O O O O
transcriptional O O O O
repression O O O O
is O O O O
reduced O O O O
when O O O O
cells O O O O
are O O O O
exposed O O O O
to O O O O
elevated O O O O
nickel O O O O
levels O O O O
, O O O O
resulting O O O O
in O O O O
increased O O O O
expression O O O O
of O O O O
yqjH O O O O
and O O O O
yqjI O O O O
. O O O O
    
YqjI O O O O
binding O O O O
to O O O O
nickel O O O O
or O O O O
iron O O O O
reduces O O O O
YqjI O O O O
DNA O O O O
- O O O O
binding O O O O
activity O O O O
in O O O O
vitro O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
we O O O O
found O O O O
that O O O O
elevated O O O O
nickel O O O O
stress O O O O
levels O O O O
disrupt O O O O
iron O O O O
homeostasis O O O O
in O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
that O O O O
deletion O O O O
of O O O O
yqjH O O O O
increases O O O O
nickel O O O O
toxicity O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
the O O O O
YqjI O O O O
protein O O O O
controls O O O O
expression O O O O
of O O O O
yqjH O O O O
to O O O O
help O O O O
maintain O O O O
iron O O O O
homeostasis O O O O
under O O O O
conditions O O O O
( O O O O
such O O O O
as O O O O
elevated O O O O
cellular O O O O
nickel O O O O
levels O O O O
) O O O O
that O O O O
disrupt O O O O
iron O O O O
metabolism O O O O
. O O O O
    
Genome O O O O
copy O O O O
numbers O O O O
and O O O O
gene O O O O
conversion O O O O
in O O O O
methanogenic B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
archaea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Previous O O O O
studies O O O O
revealed O O O O
that O O O O
one O O O O
species O O O O
of O O O O
methanogenic B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
archaea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Methanocaldococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
jannaschii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
is O O O O
polyploid O O O O
, O O O O
while O O O O
a O O O O
second O O O O
species O O O O
, O O O O
Methanothermobacter B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
thermoautotrophicus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
is O O O O
diploid O O O O
. O O O O
    
To O O O O
further O O O O
investigate O O O O
the O O O O
distribution O O O O
of O O O O
ploidy O O O O
in O O O O
methanogenic B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
archaea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
species O O O O
of O O O O
two O O O O
additional O O O O
genera O O O O
- O O O O
Methanosarcina B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
acetivorans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Methanococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
maripaludis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O O O O
were O O O O
investigated O O O O
. O O O O
    
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
acetivorans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
found O O O O
to O O O O
be O O O O
polyploid O O O O
during O O O O
fast O O O O
growth O O O O
( O O O O
t O O O O
( O O O O
D O O O O
) O O O O
= O O O O
6 O O O O
h O O O O
; O O O O
17 O O O O
genome O O O O
copies O O O O
) O O O O
and O O O O
oligoploid O O O O
during O O O O
slow O O O O
growth O O O O
( O O O O
doubling O O O O
time O O O O
= O O O O
49 O O O O
h O O O O
; O O O O
3 O O O O
genome O O O O
copies O O O O
) O O O O
. O O O O
    
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
maripaludis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
has O O O O
the O O O O
highest O O O O
ploidy O O O O
level O O O O
found O O O O
for O O O O
any O O O O
archaeal O O O O
species O O O O
, O O O O
with O O O O
up O O O O
to O O O O
55 O O O O
genome O O O O
copies O O O O
in O O O O
exponential O O O O
phase O O O O
and O O O O
ca O O O O
. O O O O
    
30 O O O O
in O O O O
stationary O O O O
phase O O O O
. O O O O
    
A O O O O
compilation O O O O
of O O O O
archaeal O O O O
species O O O O
with O O O O
quantified O O O O
ploidy O O O O
levels O O O O
reveals O O O O
a O O O O
clear O O O O
dichotomy O O O O
between O O O O
Euryarchaeota O O O O
and O O O O
Crenarchaeota O O O O
: O O O O
none O O O O
of O O O O
seven O O O O
euryarchaeal O O O O
species O O O O
of O O O O
six O O O O
genera O O O O
is O O O O
monoploid O O O O
( O O O O
haploid O O O O
) O O O O
, O O O O
while O O O O
, O O O O
in O O O O
contrast O O O O
, O O O O
all O O O O
six O O O O
crenarchaeal O O O O
species O O O O
of O O O O
four O O O O
genera O O O O
are O O O O
monoploid O O O O
, O O O O
indicating O O O O
significant O O O O
genetic O O O O
differences O O O O
between O O O O
these O O O O
two O O O O
kingdoms O O O O
. O O O O
    
Polyploidy O O O O
in O O O O
asexual O O O O
species O O O O
should O O O O
lead O O O O
to O O O O
accumulation O O O O
of O O O O
inactivating O O O O
mutations O O O O
until O O O O
the O O O O
number O O O O
of O O O O
intact O O O O
chromosomes O O O O
per O O O O
cell O O O O
drops O O O O
to O O O O
zero O O O O
( O O O O
called O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
Muller O O O O
' O O O O
s O O O O
ratchet O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
) O O O O
. O O O O
    
A O O O O
mechanism O O O O
to O O O O
equalize O O O O
the O O O O
genome O O O O
copies O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
gene O O O O
conversion O O O O
, O O O O
would O O O O
counteract O O O O
this O O O O
phenomenon O O O O
. O O O O
    
Making O O O O
use O O O O
of O O O O
a O O O O
previously O O O O
constructed O O O O
heterozygous O O O O
mutant O O O O
strain O O O O
of O O O O
the O O O O
polyploid O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
maripaludis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
we O O O O
could O O O O
show O O O O
that O O O O
in O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
selection O O O O
very O O O O
fast O O O O
equalization O O O O
of O O O O
genomes O O O O
in O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
maripaludis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
took O O O O
place O O O O
probably O O O O
via O O O O
a O O O O
gene O O O O
conversion O O O O
mechanism O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
, O O O O
it O O O O
was O O O O
shown O O O O
that O O O O
the O O O O
velocity O O O O
of O O O O
this O O O O
phenomenon O O O O
is O O O O
inversely O O O O
correlated O O O O
to O O O O
the O O O O
strength O O O O
of O O O O
selection O O O O
. O O O O
    
Membrane O O O O
topology O O O O
and O O O O
DNA O O O O
- O O O O
binding O O O O
ability O O O O
of O O O O
the O O O O
Streptococcal O O O O
CpsA O O O O
protein O O O O
. O O O O
    
Many O O O O
streptococcal O O O O
pathogens O O O O
require O O O O
a O O O O
polysaccharide O O O O
capsule O O O O
for O O O O
survival O O O O
in O O O O
the O O O O
host O O O O
during O O O O
systemic O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
The O O O O
highly O O O O
conserved O O O O
CpsA O O O O
protein O O O O
is O O O O
proposed O O O O
to O O O O
be O O O O
a O O O O
transcriptional O O O O
regulator O O O O
of O O O O
capsule O O O O
production O O O O
in O O O O
streptococci O O O O
, O O O O
although O O O O
the O O O O
regulatory O O O O
mechanism O O O O
is O O O O
unknown O O O O
. O O O O
    
Hydropathy O O O O
plots O O O O
of O O O O
CpsA O O O O
predict O O O O
an O O O O
integral O O O O
membrane O O O O
protein O O O O
with O O O O
3 O O O O
transmembrane O O O O
domains O O O O
and O O O O
only O O O O
27 O O O O
cytoplasmic O O O O
residues O O O O
, O O O O
whereas O O O O
other O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
LytR O O O O
_ O O O O
cpsA O O O O
_ O O O O
psr O O O O
protein O O O O
family O O O O
are O O O O
predicted O O O O
to O O O O
have O O O O
a O O O O
single O O O O
transmembrane O O O O
domain O O O O
. O O O O
    
This O O O O
unique O O O O
topology O O O O
, O O O O
with O O O O
the O O O O
short O O O O
cytoplasmic O O O O
domain O O O O
, O O O O
membrane O O O O
localization O O O O
, O O O O
and O O O O
large O O O O
extracellular O O O O
domain O O O O
, O O O O
suggests O O O O
a O O O O
novel O O O O
mechanism O O O O
of O O O O
transcriptional O O O O
regulation O O O O
. O O O O
    
Therefore O O O O
, O O O O
to O O O O
determine O O O O
the O O O O
actual O O O O
membrane O O O O
topology O O O O
of O O O O
CpsA O O O O
, O O O O
specific O O O O
protein O O O O
domains O O O O
were O O O O
fused O O O O
to O O O O
beta O O O O
- O O O O
galactosidase O O O O
or O O O O
alkaline O O O O
phosphatase O O O O
. O O O O
    
Enzymatic O O O O
assays O O O O
confirmed O O O O
that O O O O
the O O O O
predicted O O O O
membrane O O O O
topology O O O O
for O O O O
CpsA O O O O
is O O O O
correct O O O O
. O O O O
    
To O O O O
investigate O O O O
how O O O O
this O O O O
integral O O O O
membrane O O O O
protein O O O O
may O O O O
be O O O O
functioning O O O O
in O O O O
regulation O O O O
of O O O O
capsule O O O O
transcription O O O O
, O O O O
purified O O O O
full O O O O
- O O O O
length O O O O
and O O O O
truncated O O O O
forms O O O O
of O O O O
CpsA O O O O
were O O O O
used O O O O
in O O O O
electrophoretic O O O O
mobility O O O O
shift O O O O
assays O O O O
to O O O O
characterize O O O O
the O O O O
ability O O O O
to O O O O
bind O O O O
the O O O O
capsule O O O O
operon O O O O
promoter O O O O
. O O O O
    
Assays O O O O
revealed O O O O
that O O O O
full O O O O
- O O O O
length O O O O
, O O O O
purified O O O O
CpsA O O O O
protein O O O O
binds O O O O
specifically O O O O
to O O O O
DNA O O O O
containing O O O O
the O O O O
capsule O O O O
promoter O O O O
region O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
the O O O O
large O O O O
extracellular O O O O
domain O O O O
is O O O O
not O O O O
required O O O O
for O O O O
DNA O O O O
binding O O O O
, O O O O
but O O O O
all O O O O
cytoplasmic O O O O
regions O O O O
of O O O O
CpsA O O O O
are O O O O
necessary O O O O
and O O O O
sufficient O O O O
for O O O O
specific O O O O
binding O O O O
to O O O O
the O O O O
capsule O O O O
operon O O O O
promoter O O O O
. O O O O
    
This O O O O
is O O O O
the O O O O
first O O O O
demonstration O O O O
of O O O O
a O O O O
member O O O O
of O O O O
this O O O O
protein O O O O
family O O O O
interacting O O O O
with O O O O
its O O O O
target O O O O
DNA O O O O
. O O O O
    
Taken O O O O
together O O O O
, O O O O
CpsA O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
other O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
LytR O O O O
_ O O O O
cpsA O O O O
_ O O O O
psr O O O O
protein O O O O
family O O O O
, O O O O
appears O O O O
to O O O O
utilize O O O O
a O O O O
unique O O O O
mechanism O O O O
of O O O O
transcriptional O O O O
regulation O O O O
. O O O O
    
Identification O O O O
of O O O O
nocobactin O O O O
 O O O O
biosynthetic O O O O
gene O O O O
clusters O O O O
in O O O O
Nocardia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
farcinica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
We O O O O
identified O O O O
the O O O O
biosynthetic O O O O
gene O O O O
clusters O O O O
of O O O O
the O O O O
siderophore O O O O
nocobactin O O O O
 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
nbt O O O O
clusters O O O O
, O O O O
which O O O O
were O O O O
discovered O O O O
as O O O O
genes O O O O
highly O O O O
homologous O O O O
to O O O O
the O O O O
mycobactin O O O O
biosynthesis O O O O
genes O O O O
by O O O O
the O O O O
genomic O O O O
sequencing O O O O
of O O O O
Nocardia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
farcinica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
IFM O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
10152 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
consist O O O O
of O O O O
10 O O O O
genes O O O O
separately O O O O
located O O O O
at O O O O
two O O O O
genomic O O O O
regions O O O O
. O O O O
    
The O O O O
gene O O O O
organization O O O O
of O O O O
the O O O O
nbt O O O O
clusters O O O O
and O O O O
the O O O O
predicted O O O O
functions O O O O
of O O O O
the O O O O
nbt O O O O
genes O O O O
, O O O O
particularly O O O O
the O O O O
cyclization O O O O
and O O O O
epimerization O O O O
domains O O O O
, O O O O
were O O O O
in O O O O
good O O O O
agreement O O O O
with O O O O
the O O O O
chemical O O O O
structure O O O O
of O O O O
nocobactin O O O O
 O O O O
. O O O O
    
Disruptions O O O O
of O O O O
the O O O O
nbtA O O O O
and O O O O
nbtE O O O O
genes O O O O
, O O O O
respectively O O O O
, O O O O
reduced O O O O
and O O O O
abolished O O O O
the O O O O
productivity O O O O
of O O O O
nocobactin O O O O
 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
heterologous O O O O
expression O O O O
of O O O O
the O O O O
nbtS O O O O
gene O O O O
revealed O O O O
that O O O O
this O O O O
gene O O O O
encoded O O O O
a O O O O
salicylate O O O O
synthase O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
indicate O O O O
that O O O O
the O O O O
nbt O O O O
clusters O O O O
are O O O O
responsible O O O O
for O O O O
the O O O O
biosynthesis O O O O
of O O O O
nocobactin O O O O
 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
found O O O O
putative O O O O
IdeR O O O O
- O O O O
binding O O O O
sequences O O O O
upstream O O O O
of O O O O
the O O O O
nbtA O O O O
, O O O O
- O O O O
G O O O O
, O O O O
- O O O O
H O O O O
, O O O O
- O O O O
S O O O O
, O O O O
and O O O O
- O O O O
T O O O O
genes O O O O
, O O O O
whose O O O O
expression O O O O
was O O O O
more O O O O
than O O O O
10 O O O O
- O O O O
fold O O O O
higher O O O O
in O O O O
the O O O O
low O O O O
- O O O O
iron O O O O
condition O O O O
than O O O O
in O O O O
the O O O O
high O O O O
- O O O O
iron O O O O
condition O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
nbt O O O O
genes O O O O
are O O O O
regulated O O O O
coordinately O O O O
by O O O O
IdeR O O O O
protein O O O O
in O O O O
an O O O O
iron O O O O
- O O O O
dependent O O O O
manner O O O O
. O O O O
    
The O O O O
DeltanbtE O O O O
mutant O O O O
was O O O O
found O O O O
to O O O O
be O O O O
impaired O O O O
in O O O O
cytotoxicity O O O O
against O O O O
J774A O O O O
. O O O O
1 O O O O
cells O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
nocobactin O O O O
 O O O O
production O O O O
is O O O O
required O O O O
for O O O O
virulence O O O O
of O O O O
N B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
farcinica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Acyl O O O O
- O O O O
homoserine O O O O
lactone O O O O
binding O O O O
to O O O O
and O O O O
stability O O O O
of O O O O
the O O O O
orphan O O O O
Pseudomonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aeruginosa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
quorum O O O O
- O O O O
sensing O O O O
signal O O O O
receptor O O O O
QscR O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Pseudomonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aeruginosa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
transcription O O O O
factor O O O O
QscR O O O O
responds O O O O
to O O O O
a O O O O
variety O O O O
of O O O O
fatty O O O O
acyl O O O O
- O O O O
homoserine O O O O
lactones O O O O
( O O O O
HSLs O O O O
) O O O O
, O O O O
including O O O O
N O O O O
- O O O O
3 O O O O
- O O O O
oxododecanoyl O O O O
- O O O O
HSL O O O O
( O O O O
3OC12 O O O O
- O O O O
HSL O O O O
) O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
produced O O O O
and O O O O
detected O O O O
by O O O O
the O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
aeruginosa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
quorum O O O O
- O O O O
sensing O O O O
circuit O O O O
LasI O O O O
and O O O O
LasR O O O O
. O O O O
    
As O O O O
is O O O O
true O O O O
for O O O O
LasR O O O O
and O O O O
many O O O O
other O O O O
acyl O O O O
- O O O O
HSL O O O O
- O O O O
dependent O O O O
transcription O O O O
factors O O O O
, O O O O
production O O O O
of O O O O
soluble O O O O
QscR O O O O
in O O O O
sufficient O O O O
amounts O O O O
for O O O O
purification O O O O
requires O O O O
growth O O O O
of O O O O
recombinant O O O O
bacteria O O O O
in O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
an O O O O
appropriate O O O O
acyl O O O O
- O O O O
HSL O O O O
. O O O O
    
QscR O O O O
is O O O O
thought O O O O
to O O O O
bind O O O O
3OC12 O O O O
- O O O O
HSL O O O O
relatively O O O O
weakly O O O O
compared O O O O
to O O O O
LasR O O O O
, O O O O
and O O O O
unlike O O O O
LasR O O O O
, O O O O
binding O O O O
of O O O O
purified O O O O
QscR O O O O
to O O O O
target O O O O
DNA O O O O
was O O O O
shown O O O O
to O O O O
strongly O O O O
depend O O O O
on O O O O
exogenously O O O O
added O O O O
3OC12 O O O O
- O O O O
HSL O O O O
. O O O O
    
We O O O O
show O O O O
that O O O O
purified O O O O
QscR O O O O
is O O O O
dimeric O O O O
at O O O O
sufficiently O O O O
high O O O O
concentrations O O O O
and O O O O
monomeric O O O O
at O O O O
lower O O O O
concentrations O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
QscR O O O O
bound O O O O
3OC12 O O O O
- O O O O
HSL O O O O
more O O O O
tightly O O O O
than O O O O
previously O O O O
believed O O O O
. O O O O
    
Purified O O O O
QscR O O O O
retained O O O O
3OC12 O O O O
- O O O O
HSL O O O O
, O O O O
and O O O O
at O O O O
sufficiently O O O O
high O O O O
concentrations O O O O
, O O O O
it O O O O
bound O O O O
target O O O O
DNA O O O O
in O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
added O O O O
3OC12 O O O O
- O O O O
HSL O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
obtained O O O O
soluble O O O O
QscR O O O O
from O O O O
recombinant O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
grown O O O O
in O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
N O O O O
- O O O O
3 O O O O
- O O O O
oxohexanoyl O O O O
- O O O O
HSL O O O O
( O O O O
3OC6 O O O O
- O O O O
HSL O O O O
) O O O O
instead O O O O
of O O O O
3OC12 O O O O
- O O O O
HSL O O O O
, O O O O
and O O O O
because O O O O
3OC6 O O O O
- O O O O
HSL O O O O
bound O O O O
much O O O O
more O O O O
loosely O O O O
to O O O O
QscR O O O O
than O O O O
other O O O O
acyl O O O O
- O O O O
HSLs O O O O
tested O O O O
, O O O O
we O O O O
were O O O O
able O O O O
to O O O O
exchange O O O O
3OC6 O O O O
- O O O O
HSL O O O O
with O O O O
other O O O O
acyl O O O O
- O O O O
HSLs O O O O
in O O O O
vitro O O O O
and O O O O
then O O O O
estimate O O O O
binding O O O O
affinities O O O O
of O O O O
QscR O O O O
for O O O O
different O O O O
acyl O O O O
- O O O O
HSLs O O O O
and O O O O
for O O O O
target O O O O
DNA O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
data O O O O
support O O O O
a O O O O
model O O O O
whereby O O O O
QscR O O O O
polypeptides O O O O
fold O O O O
properly O O O O
in O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
an O O O O
acyl O O O O
- O O O O
HSL O O O O
, O O O O
but O O O O
soluble O O O O
, O O O O
acyl O O O O
- O O O O
HSL O O O O
- O O O O
free O O O O
QscR O O O O
does O O O O
not O O O O
accumulate O O O O
because O O O O
it O O O O
is O O O O
subject O O O O
to O O O O
rapid O O O O
aggregation O O O O
or O O O O
proteolysis O O O O
. O O O O
    
Genome O O O O
annotation O O O O
and O O O O
intraviral O O O O
interactome O O O O
for O O O O
the O O O O
Streptococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pneumoniae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virulent O O O O
phage O O O O
Dp O O O O
- O O O O
1 O O O O
. O O O O
    
Streptococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pneumoniae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
causes O O O O
several O O O O
diseases O O O O
, O O O O
including O O O O
pneumonia O O O O
, O O O O
septicemia O O O O
, O O O O
and O O O O
meningitis O O O O
. O O O O
    
Phage O O O O
Dp O O O O
- O O O O
1 O O O O
is O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
very O O O O
few O O O O
isolated O O O O
virulent O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pneumoniae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bacteriophages O O O O
, O O O O
but O O O O
only O O O O
a O O O O
partial O O O O
characterization O O O O
is O O O O
currently O O O O
available O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
confirmed O O O O
that O O O O
Dp O O O O
- O O O O
1 O O O O
belongs O O O O
to O O O O
the O O O O
family O O O O
Siphoviridae O O O O
. O O O O
    
Then O O O O
, O O O O
we O O O O
determined O O O O
its O O O O
complete O O O O
genomic O O O O
sequence O O O O
of O O O O
56 O O O O
, O O O O
506 O O O O
bp O O O O
. O O O O
    
It O O O O
encodes O O O O
72 O O O O
open O O O O
reading O O O O
frames O O O O
, O O O O
of O O O O
which O O O O
44 O O O O
have O O O O
been O O O O
assigned O O O O
a O O O O
function O O O O
. O O O O
    
We O O O O
have O O O O
identified O O O O
putative O O O O
promoters O O O O
, O O O O
Rho O O O O
- O O O O
independent O O O O
terminators O O O O
, O O O O
and O O O O
several O O O O
genomic O O O O
clusters O O O O
. O O O O
    
We O O O O
provide O O O O
evidence O O O O
that O O O O
Dp O O O O
- O O O O
1 O O O O
may O O O O
be O O O O
using O O O O
a O O O O
novel O O O O
DNA O O O O
replication O O O O
system O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
redirecting O O O O
host O O O O
protein O O O O
synthesis O O O O
through O O O O
queuosine O O O O
- O O O O
containing O O O O
tRNAs O O O O
. O O O O
    
Liquid O O O O
chromatography O O O O
- O O O O
mass O O O O
spectrometry O O O O
analysis O O O O
of O O O O
purified O O O O
phage O O O O
Dp O O O O
- O O O O
1 O O O O
particles O O O O
identified O O O O
at O O O O
least O O O O
eight O O O O
structural O O O O
proteins O O O O
. O O O O
    
Finally O O O O
, O O O O
using O O O O
comprehensive O O O O
yeast O O O O
two O O O O
- O O O O
hybrid O O O O
screens O O O O
, O O O O
we O O O O
identified O O O O
156 O O O O
phage O O O O
protein O O O O
interactions O O O O
, O O O O
and O O O O
this O O O O
intraviral O O O O
interactome O O O O
was O O O O
used O O O O
to O O O O
propose O O O O
a O O O O
structural O O O O
model O O O O
of O O O O
Dp O O O O
- O O O O
1 O O O O
. O O O O
    
Role O O O O
of O O O O
the O O O O
F1 O O O O
region O O O O
in O O O O
the O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
aerotaxis O O O O
receptor O O O O
Aer O O O O
. O O O O
    
In O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
the O O O O
aerotaxis O O O O
receptor O O O O
Aer O O O O
is O O O O
an O O O O
atypical O O O O
receptor O O O O
because O O O O
it O O O O
senses O O O O
intracellular O O O O
redox O O O O
potential O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Aer O O O O
sensor O O O O
is O O O O
a O O O O
cytoplasmic O O O O
, O O O O
N O O O O
- O O O O
terminal O O O O
PAS O O O O
domain O O O O
that O O O O
is O O O O
tethered O O O O
to O O O O
the O O O O
membrane O O O O
by O O O O
a O O O O
47 O O O O
- O O O O
residue O O O O
F1 O O O O
linker O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
investigated O O O O
the O O O O
function O O O O
, O O O O
topology O O O O
, O O O O
and O O O O
orientation O O O O
of O O O O
F1 O O O O
by O O O O
employing O O O O
random O O O O
mutagenesis O O O O
, O O O O
cysteine O O O O
scanning O O O O
, O O O O
and O O O O
disulfide O O O O
cross O O O O
- O O O O
linking O O O O
. O O O O
    
No O O O O
native O O O O
residue O O O O
was O O O O
obligatory O O O O
for O O O O
function O O O O
, O O O O
most O O O O
deleterious O O O O
substitutions O O O O
had O O O O
radically O O O O
different O O O O
side O O O O
chain O O O O
properties O O O O
, O O O O
and O O O O
all O O O O
F1 O O O O
mutants O O O O
but O O O O
one O O O O
were O O O O
functionally O O O O
rescued O O O O
by O O O O
the O O O O
chemoreceptor O O O O
Tar O O O O
. O O O O
    
Cross O O O O
- O O O O
linking O O O O
studies O O O O
were O O O O
consistent O O O O
with O O O O
the O O O O
predicted O O O O
alpha O O O O
- O O O O
helical O O O O
structure O O O O
in O O O O
the O O O O
N O O O O
- O O O O
terminal O O O O
F1 O O O O
region O O O O
and O O O O
demonstrated O O O O
trigonal O O O O
interactions O O O O
among O O O O
the O O O O
F1 O O O O
linkers O O O O
from O O O O
three O O O O
Aer O O O O
monomers O O O O
, O O O O
presumably O O O O
within O O O O
trimer O O O O
- O O O O
of O O O O
- O O O O
dimer O O O O
units O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
binary O O O O
interactions O O O O
between O O O O
subunits O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
heterodimer O O O O
analyses O O O O
, O O O O
we O O O O
also O O O O
demonstrated O O O O
the O O O O
importance O O O O
of O O O O
arginine O O O O
residues O O O O
near O O O O
the O O O O
membrane O O O O
interface O O O O
, O O O O
which O O O O
may O O O O
properly O O O O
anchor O O O O
the O O O O
Aer O O O O
protein O O O O
in O O O O
the O O O O
membrane O O O O
. O O O O
    
By O O O O
incorporating O O O O
these O O O O
data O O O O
into O O O O
a O O O O
homology O O O O
model O O O O
of O O O O
Aer O O O O
, O O O O
we O O O O
developed O O O O
a O O O O
model O O O O
for O O O O
the O O O O
orientation O O O O
of O O O O
the O O O O
Aer O O O O
F1 O O O O
and O O O O
PAS O O O O
regions O O O O
in O O O O
an O O O O
Aer O O O O
lattice O O O O
that O O O O
is O O O O
compatible O O O O
with O O O O
the O O O O
known O O O O
dimensions O O O O
of O O O O
the O O O O
chemoreceptor O O O O
lattice O O O O
. O O O O
    
We O O O O
propose O O O O
that O O O O
the O O O O
F1 O O O O
region O O O O
facilitates O O O O
the O O O O
orientation O O O O
of O O O O
PAS O O O O
and O O O O
HAMP O O O O
domains O O O O
during O O O O
folding O O O O
and O O O O
thereby O O O O
promotes O O O O
the O O O O
stability O O O O
of O O O O
the O O O O
PAS O O O O
and O O O O
HAMP O O O O
domains O O O O
in O O O O
Aer O O O O
. O O O O
    
Genome O O O O
- O O O O
wide O O O O
identification O O O O
of O O O O
Phytophthora B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sojae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
SNARE O O O O
genes O O O O
and O O O O
functional O O O O
characterization O O O O
of O O O O
the O O O O
conserved O O O O
SNARE O O O O
PsYKT6 O O O O
. O O O O
    
Soluble O O O O
N O O O O
- O O O O
ethylmaleimide O O O O
- O O O O
sensitive O O O O
factor O O O O
attachment O O O O
protein O O O O
receptors O O O O
( O O O O
SNAREs O O O O
) O O O O
are O O O O
central O O O O
components O O O O
of O O O O
the O O O O
machinery O O O O
mediating O O O O
membrane O O O O
fusion O O O O
and O O O O
key O O O O
factors O O O O
for O O O O
vesicular O O O O
trafficking O O O O
in O O O O
all O O O O
eukaryotic O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Taking O O O O
advantage O O O O
of O O O O
the O O O O
available O O O O
whole O O O O
genome O O O O
sequence O O O O
of O O O O
the O O O O
oomycete O O O O
plant O O O O
pathogen O O O O
Phytophthora B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sojae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
35 O O O O
genes O O O O
encoding O O O O
putative O O O O
SNARE O O O O
proteins O O O O
were O O O O
identified O O O O
in O O O O
the O O O O
genome O O O O
of O O O O
this O O O O
organism O O O O
. O O O O
    
PsYKT6 O O O O
, O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
most O O O O
conserved O O O O
SNARE O O O O
proteins O O O O
, O O O O
was O O O O
functionally O O O O
characterized O O O O
by O O O O
homology O O O O
- O O O O
dependent O O O O
gene O O O O
silencing O O O O
. O O O O
    
The O O O O
phenotype O O O O
analysis O O O O
showed O O O O
that O O O O
PsYKT6 O O O O
is O O O O
important O O O O
for O O O O
proper O O O O
asexual O O O O
development O O O O
, O O O O
sexual O O O O
reproduction O O O O
, O O O O
and O O O O
pathogenesis O O O O
on O O O O
host O O O O
soybean B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cultivars O O O O
. O O O O
    
Oesophagogastric O O O O
junction O O O O
adenocarcinoma O O O O
: O O O O
which O O O O
therapeutic O O O O
approach O O O O
? O O O O
    
Gastric O O O O
and O O O O
oesophageal O O O O
cancers O O O O
are O O O O
among O O O O
the O O O O
leading O O O O
causes O O O O
of O O O O
cancer O O O O
- O O O O
related O O O O
death O O O O
worldwide O O O O
. O O O O
    
By O O O O
contrast O O O O
with O O O O
the O O O O
decreasing O O O O
prevalence O O O O
of O O O O
gastric O O O O
cancer O O O O
, O O O O
incidence O O O O
and O O O O
prevalence O O O O
of O O O O
oesophagogastric O O O O
junction O O O O
adenocarcinoma O O O O
( O O O O
OGJA O O O O
) O O O O
are O O O O
rising O O O O
rapidly O O O O
in O O O O
developed O O O O
countries O O O O
. O O O O
    
We O O O O
provide O O O O
an O O O O
update O O O O
about O O O O
treatment O O O O
strategies O O O O
for O O O O
resectable O O O O
OGJA O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
review O O O O
findings O O O O
from O O O O
the O O O O
latest O O O O
randomised O O O O
trials O O O O
and O O O O
meta O O O O
- O O O O
analyses O O O O
, O O O O
and O O O O
propose O O O O
guidelines O O O O
regarding O O O O
endoscopic O O O O
, O O O O
surgical O O O O
, O O O O
and O O O O
perioperative O O O O
treatments O O O O
. O O O O
    
Through O O O O
a O O O O
team O O O O
approach O O O O
, O O O O
members O O O O
from O O O O
all O O O O
diagnostic O O O O
and O O O O
therapeutic O O O O
disciplines O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
gastroenterologists O O O O
, O O O O
surgeons O O O O
, O O O O
oncologists O O O O
, O O O O
radiologists O O O O
, O O O O
and O O O O
radiotherapists O O O O
, O O O O
can O O O O
effectively O O O O
administer O O O O
a O O O O
range O O O O
of O O O O
treatment O O O O
modalities O O O O
. O O O O
    
Mating O O O O
differentiation O O O O
in O O O O
Cryptococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
neoformans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
negatively O O O O
regulated O O O O
by O O O O
the O O O O
Crk1 O O O O
protein O O O O
kinase O O O O
. O O O O
    
Cryptococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
neoformans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
a O O O O
heterothallic O O O O
basidiomycete O O O O
that O O O O
grows O O O O
vegetatively O O O O
as O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
filamentous O O O O
hyphae O O O O
are O O O O
produced O O O O
in O O O O
the O O O O
sexual O O O O
state O O O O
. O O O O
    
Previous O O O O
studies O O O O
have O O O O
shown O O O O
that O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
neoformans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Cwc1 O O O O
and O O O O
Cwc2 O O O O
are O O O O
two O O O O
central O O O O
photoregulators O O O O
which O O O O
form O O O O
a O O O O
complex O O O O
to O O O O
inhibit O O O O
the O O O O
production O O O O
of O O O O
sexual O O O O
filaments O O O O
upon O O O O
light O O O O
treatment O O O O
. O O O O
    
To O O O O
reveal O O O O
the O O O O
detailed O O O O
regulatory O O O O
mechanisms O O O O
, O O O O
a O O O O
genome O O O O
wide O O O O
mutagenesis O O O O
screen O O O O
was O O O O
conducted O O O O
and O O O O
components O O O O
in O O O O
the O O O O
Cwc1 O O O O
/ O O O O
Cwc2 O O O O
complex O O O O
mediated O O O O
pathway O O O O
have O O O O
been O O O O
identified O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
one O O O O
suppressor O O O O
mutant O O O O
, O O O O
DJ22 O O O O
, O O O O
is O O O O
characterized O O O O
and O O O O
T O O O O
- O O O O
DNA O O O O
is O O O O
found O O O O
to O O O O
disrupt O O O O
the O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
neoformans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
CRK1 O O O O
gene O O O O
, O O O O
a O O O O
homologue O O O O
of O O O O
Saccharomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cerevisiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
IME2 O O O O
and O O O O
Ustilago B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
maydis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
crk1 O O O O
. O O O O
    
Ime2 O O O O
is O O O O
a O O O O
meiosis O O O O
- O O O O
specific O O O O
gene O O O O
with O O O O
the O O O O
conserved O O O O
Ser O O O O
/ O O O O
Thr O O O O
kinase O O O O
domain O O O O
and O O O O
TXY O O O O
dual O O O O
phosphorylation O O O O
site O O O O
. O O O O
    
Consistent O O O O
with O O O O
the O O O O
findings O O O O
of O O O O
other O O O O
suppressors O O O O
in O O O O
our O O O O
screen O O O O
, O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
neoformans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Crk1 O O O O
plays O O O O
a O O O O
negative O O O O
role O O O O
in O O O O
the O O O O
mating O O O O
process O O O O
. O O O O
    
Dikaryotic O O O O
filaments O O O O
, O O O O
basidia O O O O
, O O O O
and O O O O
basidiospores O O O O
are O O O O
produced O O O O
earlier O O O O
in O O O O
the O O O O
crk1 O O O O
mutant O O O O
crosses O O O O
and O O O O
mating O O O O
efficiency O O O O
is O O O O
also O O O O
increased O O O O
. O O O O
    
Artificial O O O O
elevation O O O O
of O O O O
the O O O O
CRK1 O O O O
mRNA O O O O
level O O O O
inhibits O O O O
mating O O O O
. O O O O
    
Interestingly O O O O
, O O O O
monokaryotic O O O O
fruiting O O O O
is O O O O
defective O O O O
both O O O O
in O O O O
the O O O O
MATalpha O O O O
crk1 O O O O
mutant O O O O
and O O O O
CRK1 O O O O
overexpression O O O O
strains O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
studies O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
C O O O O
. O O O O
neoformans O O O O
CRK1 O O O O
gene O O O O
functions O O O O
as O O O O
a O O O O
negative O O O O
regulator O O O O
in O O O O
the O O O O
mating O O O O
differentiation O O O O
. O O O O
    
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
Slime O O O O
molds O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
among O O O O
the O O O O
Tubulinea O O O O
( O O O O
Amoebozoa O O O O
) O O O O
: O O O O
molecular O O O O
systematics O O O O
and O O O O
taxonomy O O O O
of O O O O
Copromyxa O O O O
. O O O O
    
Copromyxa B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
protea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
a O O O O
dung O O O O
- O O O O
inhabiting O O O O
amoeboid O O O O
organism O O O O
that O O O O
aggregates O O O O
to O O O O
form O O O O
simple O O O O
macroscopic O O O O
fruiting O O O O
structures O O O O
, O O O O
sorocarps O O O O
, O O O O
which O O O O
are O O O O
composed O O O O
of O O O O
a O O O O
single O O O O
cell O O O O
type O O O O
. O O O O
    
In O O O O
a O O O O
recent O O O O
effort O O O O
to O O O O
find O O O O
the O O O O
phylogenetic O O O O
positions O O O O
of O O O O
the O O O O
less O O O O
well O O O O
- O O O O
known O O O O
sorocarpic O O O O
protists O O O O
considered O O O O
to O O O O
be O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
cellular O O O O
slime O O O O
molds O O O O
, O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
or O O O O
aggregatively O O O O
fruiting O O O O
amoebae O O O O
, O O O O
we O O O O
isolated O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
protea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
sequenced O O O O
the O O O O
nuclear O O O O
- O O O O
encoded O O O O
small O O O O
subunit O O O O
ribosomal O O O O
RNA O O O O
gene O O O O
from O O O O
four O O O O
samples O O O O
collected O O O O
from O O O O
cattle B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
farms O O O O
in O O O O
the O O O O
central O O O O
USA O O O O
. O O O O
    
Phylogenetic O O O O
analyses O O O O
of O O O O
these O O O O
data O O O O
place O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
protea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
the O O O O
eukaryotic O O O O
supergroup O O O O
Amoebozoa O O O O
together O O O O
with O O O O
the O O O O
Tubulinea O O O O
, O O O O
in O O O O
which O O O O
there O O O O
has O O O O
been O O O O
no O O O O
previous O O O O
report O O O O
of O O O O
an O O O O
aggregative O O O O
fruiting O O O O
habit O O O O
. O O O O
    
This O O O O
is O O O O
consistent O O O O
with O O O O
the O O O O
morphology O O O O
of O O O O
the O O O O
trophozoites O O O O
. O O O O
    
In O O O O
fact O O O O
, O O O O
Copromyxa B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
protea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
found O O O O
to O O O O
be O O O O
very O O O O
closely O O O O
related O O O O
to O O O O
Hartmannella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cantabrigiensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
to O O O O
a O O O O
since O O O O
lost O O O O
amoeba O O O O
isolate O O O O
, O O O O
Hartmannella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
4 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
3Da O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
10 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
This O O O O
new O O O O
grouping O O O O
of O O O O
Copromyxa O O O O
+ O O O O
H B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cantabrigiensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
sister O O O O
to O O O O
Glaeseria O O O O
, O O O O
which O O O O
together O O O O
are O O O O
sister O O O O
to O O O O
the O O O O
Amoebidae O O O O
( O O O O
Amoeba O O O O
+ O O O O
Chaos O O O O
) O O O O
. O O O O
    
We O O O O
suggest O O O O
renaming O O O O
, O O O O
H O O O O
. O O O O
cantabrigiensis O O O O
as O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cantabrigiensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
designate O O O O
isolate O O O O
4 O O O O
/ O O O O
3Da O O O O
/ O O O O
10 O O O O
as O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
protea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Future O O O O
work O O O O
is O O O O
needed O O O O
to O O O O
see O O O O
if O O O O
these O O O O
newly O O O O
assigned O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Copromyxa O O O O
also O O O O
show O O O O
evidence O O O O
of O O O O
an O O O O
ability O O O O
to O O O O
fruit O O O O
. O O O O
    
Improved O O O O
accuracy O O O O
of O O O O
the O O O O
transcriptional O O O O
profiling O O O O
method O O O O
of O O O O
age O O O O
grading O O O O
in O O O O
Aedes B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aegypti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
mosquitoes O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
under O O O O
laboratory O O O O
and O O O O
semi O O O O
- O O O O
field O O O O
cage O O O O
conditions O O O O
and O O O O
in O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
Wolbachia O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
Transcriptional O O O O
profiling O O O O
is O O O O
an O O O O
effective O O O O
method O O O O
of O O O O
predicting O O O O
age O O O O
in O O O O
the O O O O
mosquito O O O O
Aedes B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aegypti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
the O O O O
laboratory O O O O
, O O O O
however O O O O
, O O O O
its O O O O
effectiveness O O O O
is O O O O
limited O O O O
to O O O O
younger O O O O
mosquitoes O O O O
. O O O O
    
To O O O O
address O O O O
this O O O O
we O O O O
used O O O O
a O O O O
microarray O O O O
to O O O O
identify O O O O
new O O O O
gene O O O O
candidates O O O O
that O O O O
show O O O O
significant O O O O
expression O O O O
changes O O O O
in O O O O
older O O O O
mosquitoes O O O O
. O O O O
    
These O O O O
genes O O O O
were O O O O
then O O O O
used O O O O
to O O O O
create O O O O
a O O O O
revised O O O O
model O O O O
, O O O O
which O O O O
upon O O O O
evaluation O O O O
in O O O O
both O O O O
laboratory O O O O
and O O O O
semi O O O O
- O O O O
field O O O O
conditions O O O O
, O O O O
proved O O O O
to O O O O
have O O O O
improved O O O O
accuracy O O O O
overall O O O O
and O O O O
for O O O O
older O O O O
mosquitoes O O O O
. O O O O
    
In O O O O
association O O O O
with O O O O
the O O O O
development O O O O
of O O O O
symbiont O O O O
- O O O O
based O O O O
control O O O O
strategies O O O O
for O O O O
Ae B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
aegypti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
we O O O O
also O O O O
tested O O O O
the O O O O
model O O O O
' O O O O
s O O O O
accuracy O O O O
for O O O O
Wolbachia O O O O
- O O O O
infected O O O O
mosquitoes O O O O
and O O O O
found O O O O
no O O O O
decline O O O O
in O O O O
performance O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
findings O O O O
suggest O O O O
that O O O O
the O O O O
new O O O O
model O O O O
is O O O O
a O O O O
robust O O O O
and O O O O
powerful O O O O
tool O O O O
for O O O O
age O O O O
determination O O O O
in O O O O
Australian O O O O
Ae B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
aegypti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
populations O O O O
. O O O O
    
Novel O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
Cra O O O O
regulon O O O O
involved O O O O
in O O O O
carbon O O O O
metabolism O O O O
in O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Cra O O O O
( O O O O
catabolite O O O O
repressor O O O O
activator O O O O
) O O O O
is O O O O
a O O O O
global O O O O
regulator O O O O
of O O O O
the O O O O
genes O O O O
for O O O O
carbon O O O O
metabolism O O O O
in O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
To O O O O
gain O O O O
insights O O O O
into O O O O
the O O O O
regulatory O O O O
roles O O O O
of O O O O
Cra O O O O
, O O O O
attempts O O O O
were O O O O
made O O O O
to O O O O
identify O O O O
the O O O O
whole O O O O
set O O O O
of O O O O
regulation O O O O
targets O O O O
using O O O O
an O O O O
improved O O O O
genomic O O O O
SELEX O O O O
( O O O O
systematic O O O O
evolution O O O O
of O O O O
ligands O O O O
by O O O O
exponential O O O O
enrichment O O O O
) O O O O
system O O O O
. O O O O
    
Surprisingly O O O O
, O O O O
a O O O O
total O O O O
of O O O O
164 O O O O
binding O O O O
sites O O O O
were O O O O
identified O O O O
for O O O O
Cra O O O O
, O O O O
144 O O O O
( O O O O
88 O O O O
% O O O O
) O O O O
of O O O O
which O O O O
were O O O O
newly O O O O
identified O O O O
. O O O O
    
The O O O O
majority O O O O
of O O O O
known O O O O
targets O O O O
were O O O O
included O O O O
in O O O O
the O O O O
SELEX O O O O
chip O O O O
pattern O O O O
. O O O O
    
The O O O O
promoters O O O O
examined O O O O
by O O O O
the O O O O
lacZ O O O O
reporter O O O O
assay O O O O
in O O O O
vivo O O O O
were O O O O
all O O O O
regulated O O O O
by O O O O
Cra O O O O
. O O O O
    
These O O O O
two O O O O
lines O O O O
of O O O O
evidence O O O O
indicate O O O O
that O O O O
a O O O O
total O O O O
of O O O O
as O O O O
many O O O O
as O O O O
178 O O O O
promoters O O O O
are O O O O
under O O O O
the O O O O
control O O O O
of O O O O
Cra O O O O
. O O O O
    
The O O O O
majority O O O O
of O O O O
Cra O O O O
targets O O O O
are O O O O
the O O O O
genes O O O O
coding O O O O
for O O O O
the O O O O
enzymes O O O O
involved O O O O
in O O O O
central O O O O
carbon O O O O
metabolism O O O O
, O O O O
covering O O O O
all O O O O
the O O O O
genes O O O O
for O O O O
the O O O O
enzymes O O O O
involved O O O O
in O O O O
glycolysis O O O O
and O O O O
metabolism O O O O
downstream O O O O
of O O O O
glycolysis O O O O
, O O O O
including O O O O
the O O O O
tricarboxylic O O O O
acid O O O O
( O O O O
TCA O O O O
) O O O O
cycle O O O O
and O O O O
aerobic O O O O
respiration O O O O
. O O O O
    
Taken O O O O
together O O O O
, O O O O
we O O O O
propose O O O O
that O O O O
Cra O O O O
plays O O O O
a O O O O
key O O O O
role O O O O
in O O O O
balancing O O O O
the O O O O
levels O O O O
of O O O O
the O O O O
enzymes O O O O
for O O O O
carbon O O O O
metabolism O O O O
. O O O O
    
The O O O O
three O O O O
vibrio B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cholerae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
chromosome O O O O
II O O O O
- O O O O
encoded O O O O
ParE O O O O
toxins O O O O
degrade O O O O
chromosome O O O O
I O O O O
following O O O O
loss O O O O
of O O O O
chromosome O O O O
II O O O O
. O O O O
    
Three O O O O
homologues O O O O
of O O O O
the O O O O
plasmid O O O O
RK2 O O O O
ParDE O O O O
toxin O O O O
- O O O O
antitoxin O O O O
system O O O O
are O O O O
present O O O O
in O O O O
the O O O O
Vibrio B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cholerae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
genome O O O O
within O O O O
the O O O O
superintegron O O O O
on O O O O
chromosome O O O O
II O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
found O O O O
that O O O O
these O O O O
three O O O O
loci O O O O
- O O O O
two O O O O
of O O O O
which O O O O
have O O O O
identical O O O O
open O O O O
reading O O O O
frames O O O O
and O O O O
regulatory O O O O
sequences O O O O
- O O O O
encode O O O O
functional O O O O
toxin O O O O
- O O O O
antitoxin O O O O
systems O O O O
. O O O O
    
The O O O O
ParE O O O O
toxins O O O O
inhibit O O O O
bacterial O O O O
division O O O O
and O O O O
reduce O O O O
viability O O O O
, O O O O
presumably O O O O
due O O O O
to O O O O
their O O O O
capacity O O O O
to O O O O
damage O O O O
DNA O O O O
. O O O O
    
The O O O O
in O O O O
vivo O O O O
effects O O O O
of O O O O
ParE1 O O O O
/ O O O O
3 O O O O
mimic O O O O
those O O O O
of O O O O
ParE2 O O O O
, O O O O
which O O O O
we O O O O
have O O O O
previously O O O O
demonstrated O O O O
to O O O O
be O O O O
a O O O O
DNA O O O O
gyrase O O O O
inhibitor O O O O
in O O O O
vitro O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
ParE1 O O O O
/ O O O O
3 O O O O
is O O O O
likewise O O O O
a O O O O
gyrase O O O O
inhibitor O O O O
, O O O O
despite O O O O
its O O O O
relatively O O O O
low O O O O
degree O O O O
of O O O O
sequence O O O O
identity O O O O
. O O O O
    
ParE O O O O
- O O O O
mediated O O O O
DNA O O O O
damage O O O O
activates O O O O
the O O O O
V B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cholerae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
SOS O O O O
response O O O O
, O O O O
which O O O O
in O O O O
turn O O O O
likely O O O O
accounts O O O O
for O O O O
ParE O O O O
' O O O O
s O O O O
inhibition O O O O
of O O O O
cell O O O O
division O O O O
. O O O O
    
Each O O O O
toxin O O O O
' O O O O
s O O O O
effects O O O O
can O O O O
be O O O O
prevented O O O O
by O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
its O O O O
cognate O O O O
ParD O O O O
antitoxin O O O O
, O O O O
which O O O O
acts O O O O
in O O O O
a O O O O
toxin O O O O
- O O O O
specific O O O O
fashion O O O O
both O O O O
to O O O O
block O O O O
toxicity O O O O
and O O O O
to O O O O
repress O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
its O O O O
parDE O O O O
operon O O O O
. O O O O
    
Derepression O O O O
of O O O O
ParE O O O O
activity O O O O
in O O O O
DeltaparAB2 O O O O
mutant O O O O
V B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cholerae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cells O O O O
that O O O O
have O O O O
lost O O O O
chromosome O O O O
II O O O O
contributes O O O O
to O O O O
the O O O O
prominent O O O O
DNA O O O O
degradation O O O O
that O O O O
accompanies O O O O
the O O O O
death O O O O
of O O O O
these O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Overall O O O O
, O O O O
our O O O O
findings O O O O
suggest O O O O
that O O O O
the O O O O
ParE O O O O
toxins O O O O
lead O O O O
to O O O O
the O O O O
postsegregational O O O O
killing O O O O
of O O O O
cells O O O O
missing O O O O
chromosome O O O O
II O O O O
in O O O O
a O O O O
manner O O O O
that O O O O
closely O O O O
mimics O O O O
postsegregational O O O O
killing O O O O
mediated O O O O
by O O O O
plasmid O O O O
- O O O O
encoded O O O O
homologs O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
the O O O O
parDE O O O O
loci O O O O
aid O O O O
in O O O O
the O O O O
maintenance O O O O
of O O O O
the O O O O
integrity O O O O
of O O O O
the O O O O
V B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cholerae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
superintegron O O O O
and O O O O
in O O O O
ensuring O O O O
the O O O O
inheritance O O O O
of O O O O
chromosome O O O O
II O O O O
. O O O O
    
Climatic O O O O
constraints O O O O
on O O O O
wintering O O O O
bird O O O O
distributions O O O O
are O O O O
modified O O O O
by O O O O
urbanization O O O O
and O O O O
weather O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Ecologists O O O O
have O O O O
long O O O O
been O O O O
interested O O O O
in O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
climate O O O O
in O O O O
shaping O O O O
species O O O O
' O O O O
ranges O O O O
, O O O O
and O O O O
in O O O O
recent O O O O
years O O O O
, O O O O
this O O O O
relationship O O O O
has O O O O
taken O O O O
on O O O O
greater O O O O
significance O O O O
because O O O O
of O O O O
the O O O O
need O O O O
for O O O O
accurate O O O O
predictions O O O O
of O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
climate O O O O
change O O O O
on O O O O
wildlife O O O O
populations O O O O
. O O O O
    
Bioclimatic O O O O
relationships O O O O
, O O O O
however O O O O
, O O O O
are O O O O
potentially O O O O
complicated O O O O
by O O O O
various O O O O
environmental O O O O
factors O O O O
operating O O O O
at O O O O
multiple O O O O
spatial O O O O
and O O O O
temporal O O O O
scales O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
test O O O O
the O O O O
hypothesis O O O O
that O O O O
climatic O O O O
constraints O O O O
on O O O O
bird O O O O
distributions O O O O
are O O O O
modified O O O O
by O O O O
species O O O O
- O O O O
specific O O O O
responses O O O O
to O O O O
weather O O O O
, O O O O
urbanization O O O O
and O O O O
use O O O O
of O O O O
supplemental O O O O
food O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
analyses O O O O
focused O O O O
on O O O O
18 O O O O
bird O O O O
species O O O O
with O O O O
data O O O O
from O O O O
over O O O O
3000 O O O O
sites O O O O
across O O O O
the O O O O
north O O O O
- O O O O
eastern O O O O
United O O O O
States O O O O
and O O O O
adjacent O O O O
Canadian O O O O
provinces O O O O
. O O O O
    
We O O O O
use O O O O
hierarchal O O O O
occupancy O O O O
modelling O O O O
to O O O O
quantify O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
short O O O O
- O O O O
term O O O O
weather O O O O
variation O O O O
and O O O O
surrounding O O O O
urbanization O O O O
on O O O O
food O O O O
stress O O O O
and O O O O
probabilities O O O O
of O O O O
detection O O O O
, O O O O
and O O O O
how O O O O
these O O O O
fine O O O O
- O O O O
scale O O O O
changes O O O O
modify O O O O
the O O O O
role O O O O
that O O O O
climate O O O O
has O O O O
on O O O O
the O O O O
distributions O O O O
of O O O O
wintering O O O O
bird O O O O
populations O O O O
at O O O O
regional O O O O
scales O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Examining O O O O
site O O O O
occupancy O O O O
and O O O O
supplemental O O O O
food O O O O
use O O O O
across O O O O
the O O O O
study O O O O
region O O O O
, O O O O
we O O O O
found O O O O
that O O O O
average O O O O
minimum O O O O
temperature O O O O
was O O O O
an O O O O
important O O O O
factor O O O O
limiting O O O O
bird O O O O
distributions O O O O
, O O O O
supporting O O O O
the O O O O
hypothesis O O O O
that O O O O
the O O O O
occupancy O O O O
of O O O O
wintering O O O O
birds O O O O
is O O O O
limited O O O O
by O O O O
climatic O O O O
constraints O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
that O O O O
15 O O O O
of O O O O
18 O O O O
species O O O O
( O O O O
83 O O O O
% O O O O
) O O O O
were O O O O
more O O O O
energetically O O O O
stressed O O O O
( O O O O
had O O O O
a O O O O
higher O O O O
likelihood O O O O
of O O O O
visiting O O O O
a O O O O
feeder O O O O
station O O O O
) O O O O
as O O O O
minimum O O O O
temperature O O O O
declined O O O O
from O O O O
the O O O O
seasonal O O O O
average O O O O
. O O O O
    
Because O O O O
we O O O O
found O O O O
these O O O O
patterns O O O O
in O O O O
populations O O O O
that O O O O
regularly O O O O
visit O O O O
supplemental O O O O
food O O O O
sites O O O O
and O O O O
were O O O O
likely O O O O
not O O O O
food O O O O
- O O O O
limited O O O O
, O O O O
we O O O O
suggest O O O O
that O O O O
resource O O O O
availability O O O O
is O O O O
less O O O O
important O O O O
than O O O O
climate O O O O
in O O O O
constraining O O O O
wintering O O O O
bird O O O O
distributions O O O O
. O O O O
    
Across O O O O
a O O O O
winter O O O O
season O O O O
, O O O O
local O O O O
within O O O O
- O O O O
winter O O O O
extinction O O O O
probabilities O O O O
were O O O O
lower O O O O
and O O O O
colonization O O O O
probabilities O O O O
higher O O O O
at O O O O
warmer O O O O
sites O O O O
supporting O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
climate O O O O
- O O O O
mediated O O O O
range O O O O
shifts O O O O
. O O O O
    
Importantly O O O O
, O O O O
however O O O O
, O O O O
these O O O O
relationships O O O O
were O O O O
modified O O O O
by O O O O
the O O O O
degree O O O O
of O O O O
urbanization O O O O
and O O O O
species O O O O
' O O O O
abilities O O O O
to O O O O
persist O O O O
in O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
modified O O O O
landscapes O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
urbanization O O O O
and O O O O
behavioural O O O O
adaptation O O O O
can O O O O
modify O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
climate O O O O
on O O O O
bird O O O O
ranges O O O O
and O O O O
should O O O O
be O O O O
included O O O O
in O O O O
future O O O O
analyses O O O O
of O O O O
range O O O O
shifts O O O O
because O O O O
of O O O O
climate O O O O
change O O O O
. O O O O
    
Molecular O O O O
structure O O O O
of O O O O
the O O O O
prothoracicotropic O O O O
hormone O O O O
gene O O O O
in O O O O
the O O O O
northern B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
house O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
mosquito O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Culex B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pipiens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
its O O O O
expression O O O O
analysis O O O O
in O O O O
association O O O O
with O O O O
diapause O O O O
and O O O O
blood O O O O
feeding O O O O
. O O O O
    
We O O O O
cloned O O O O
the O O O O
gene O O O O
that O O O O
encodes O O O O
prothoracicotropic O O O O
hormone O O O O
( O O O O
PTTH O O O O
) O O O O
in O O O O
the O O O O
northern B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
house O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
mosquito O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Culex B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pipiens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
investigated O O O O
its O O O O
expression O O O O
profile O O O O
in O O O O
short O O O O
- O O O O
day O O O O
( O O O O
diapause O O O O
- O O O O
destined O O O O
) O O O O
and O O O O
long O O O O
- O O O O
day O O O O
( O O O O
nondiapause O O O O
- O O O O
destined O O O O
) O O O O
individuals O O O O
from O O O O
the O O O O
fourth O O O O
- O O O O
instar O O O O
larval O O O O
stage O O O O
to O O O O
2 O O O O
months O O O O
of O O O O
adulthood O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
after O O O O
a O O O O
blood O O O O
meal O O O O
. O O O O
    
The O O O O
deduced O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pipiens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
PTTH O O O O
( O O O O
Cupip O O O O
- O O O O
PTTH O O O O
) O O O O
amino O O O O
acid O O O O
sequence O O O O
contains O O O O
seven O O O O
cysteines O O O O
with O O O O
a O O O O
specific O O O O
spacing O O O O
pattern O O O O
. O O O O
    
Sequence O O O O
alignment O O O O
suggests O O O O
that O O O O
Cupip O O O O
- O O O O
PTTH O O O O
is O O O O
23 O O O O
% O O O O
identical O O O O
to O O O O
Drosophila B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
melanogaster O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
PTTH O O O O
, O O O O
but O O O O
is O O O O
> O O O O
= O O O O
59 O O O O
% O O O O
identical O O O O
to O O O O
the O O O O
PTTHs O O O O
of O O O O
other O O O O
mosquitoes O O O O
. O O O O
    
Cupip O O O O
- O O O O
PTTH O O O O
has O O O O
structural O O O O
characteristics O O O O
similar O O O O
to O O O O
those O O O O
of O O O O
Bombyx B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mori O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
PTTH O O O O
and O O O O
some O O O O
vertebrate O O O O
nerve O O O O
growth O O O O
factors O O O O
with O O O O
cysteine O O O O
- O O O O
knot O O O O
motifs O O O O
. O O O O
    
PTTH O O O O
transcripts O O O O
exhibit O O O O
a O O O O
daily O O O O
cycling O O O O
profile O O O O
during O O O O
the O O O O
final O O O O
( O O O O
fourth O O O O
) O O O O
larval O O O O
instar O O O O
, O O O O
with O O O O
peak O O O O
abundance O O O O
occurring O O O O
late O O O O
in O O O O
the O O O O
scotophase O O O O
. O O O O
    
The O O O O
fourth O O O O
- O O O O
larval O O O O
instar O O O O
stage O O O O
is O O O O
one O O O O
day O O O O
longer O O O O
in O O O O
short O O O O
- O O O O
day O O O O
larvae O O O O
than O O O O
in O O O O
long O O O O
- O O O O
day O O O O
larvae O O O O
, O O O O
resulting O O O O
in O O O O
larger O O O O
larvae O O O O
and O O O O
adults O O O O
. O O O O
    
This O O O O
additional O O O O
day O O O O
of O O O O
larval O O O O
development O O O O
is O O O O
associated O O O O
with O O O O
one O O O O
extra O O O O
PTTH O O O O
cycle O O O O
. O O O O
    
No O O O O
cycling O O O O
was O O O O
observed O O O O
in O O O O
pupae O O O O
, O O O O
but O O O O
PTTH O O O O
transcripts O O O O
were O O O O
slightly O O O O
higher O O O O
in O O O O
short O O O O
- O O O O
day O O O O
pupae O O O O
than O O O O
in O O O O
long O O O O
- O O O O
day O O O O
pupae O O O O
throughout O O O O
much O O O O
of O O O O
the O O O O
pupal O O O O
stage O O O O
. O O O O
    
PTTH O O O O
expression O O O O
persisted O O O O
at O O O O
a O O O O
nearly O O O O
constant O O O O
level O O O O
in O O O O
diapausing O O O O
adult O O O O
females O O O O
for O O O O
the O O O O
first O O O O
month O O O O
but O O O O
then O O O O
dropped O O O O
by O O O O
- O O O O
50 O O O O
% O O O O
, O O O O
while O O O O
expression O O O O
decreased O O O O
at O O O O
the O O O O
beginning O O O O
of O O O O
adulthood O O O O
in O O O O
nondiapausing O O O O
females O O O O
and O O O O
then O O O O
remained O O O O
at O O O O
a O O O O
low O O O O
level O O O O
as O O O O
long O O O O
as O O O O
the O O O O
females O O O O
were O O O O
denied O O O O
a O O O O
blood O O O O
meal O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
when O O O O
nondiapausing O O O O
females O O O O
were O O O O
offered O O O O
a O O O O
blood O O O O
meal O O O O
, O O O O
PTTH O O O O
transcripts O O O O
rose O O O O
approximately O O O O
7 O O O O
fold O O O O
in O O O O
2 O O O O
h O O O O
and O O O O
remained O O O O
elevated O O O O
for O O O O
24 O O O O
h O O O O
. O O O O
    
A O O O O
few O O O O
diapausing O O O O
females O O O O
( O O O O
- O O O O
10 O O O O
% O O O O
) O O O O
will O O O O
take O O O O
a O O O O
blood O O O O
meal O O O O
when O O O O
placed O O O O
in O O O O
close O O O O
proximity O O O O
to O O O O
a O O O O
host O O O O
, O O O O
but O O O O
much O O O O
of O O O O
the O O O O
blood O O O O
is O O O O
ejected O O O O
and O O O O
such O O O O
meals O O O O
do O O O O
not O O O O
result O O O O
in O O O O
mature O O O O
eggs O O O O
. O O O O
    
Yet O O O O
, O O O O
elevated O O O O
PTTH O O O O
mRNA O O O O
expression O O O O
was O O O O
also O O O O
observed O O O O
in O O O O
diapausing O O O O
females O O O O
that O O O O
were O O O O
force O O O O
fed O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
thus O O O O
point O O O O
to O O O O
several O O O O
distinctions O O O O
in O O O O
PTTH O O O O
expression O O O O
between O O O O
short O O O O
- O O O O
day O O O O
and O O O O
long O O O O
- O O O O
day O O O O
mosquitoes O O O O
, O O O O
but O O O O
both O O O O
types O O O O
of O O O O
females O O O O
responded O O O O
to O O O O
a O O O O
blood O O O O
meal O O O O
by O O O O
elevating O O O O
levels O O O O
of O O O O
PTTH O O O O
mRNA O O O O
. O O O O
    
Molecular O O O O
events O O O O
of O O O O
apical O O O O
bud O O O O
formation O O O O
in O O O O
white B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
spruce O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Picea B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
glauca O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Bud O O O O
formation O O O O
is O O O O
an O O O O
adaptive O O O O
trait O O O O
that O O O O
temperate O O O O
forest O O O O
trees O O O O
have O O O O
acquired O O O O
to O O O O
facilitate O O O O
seasonal O O O O
synchronization O O O O
. O O O O
    
We O O O O
have O O O O
characterized O O O O
transcriptome O O O O
- O O O O
level O O O O
changes O O O O
that O O O O
occur O O O O
during O O O O
bud O O O O
formation O O O O
of O O O O
white B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
spruce O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
[ B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
Picea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
glauca O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Moench O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Voss O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
] O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
a O O O O
primarily O O O O
determinate O O O O
species O O O O
in O O O O
which O O O O
preformed O O O O
stem O O O O
units O O O O
contained O O O O
within O O O O
the O O O O
apical O O O O
bud O O O O
constitute O O O O
most O O O O
of O O O O
next O O O O
season O O O O
' O O O O
s O O O O
growth O O O O
. O O O O
    
Microarray O O O O
analysis O O O O
identified O O O O
4460 O O O O
differentially O O O O
expressed O O O O
sequences O O O O
in O O O O
shoot O O O O
tips O O O O
during O O O O
short O O O O
day O O O O
- O O O O
induced O O O O
bud O O O O
formation O O O O
. O O O O
    
Cluster O O O O
analysis O O O O
revealed O O O O
distinct O O O O
temporal O O O O
patterns O O O O
of O O O O
expression O O O O
, O O O O
and O O O O
functional O O O O
classification O O O O
of O O O O
genes O O O O
in O O O O
these O O O O
clusters O O O O
implied O O O O
molecular O O O O
processes O O O O
that O O O O
coincide O O O O
with O O O O
anatomical O O O O
changes O O O O
occurring O O O O
in O O O O
the O O O O
developing O O O O
bud O O O O
. O O O O
    
Comparing O O O O
expression O O O O
profiles O O O O
in O O O O
developing O O O O
buds O O O O
under O O O O
long O O O O
day O O O O
and O O O O
short O O O O
day O O O O
conditions O O O O
identified O O O O
possible O O O O
photoperiod O O O O
- O O O O
responsive O O O O
genes O O O O
that O O O O
may O O O O
not O O O O
be O O O O
essential O O O O
for O O O O
bud O O O O
development O O O O
. O O O O
    
Several O O O O
genes O O O O
putatively O O O O
associated O O O O
with O O O O
hormone O O O O
signalling O O O O
were O O O O
identified O O O O
, O O O O
and O O O O
hormone O O O O
quantification O O O O
revealed O O O O
distinct O O O O
profiles O O O O
for O O O O
abscisic O O O O
acid O O O O
( O O O O
ABA O O O O
) O O O O
, O O O O
cytokinins O O O O
, O O O O
auxin O O O O
and O O O O
their O O O O
metabolites O O O O
that O O O O
can O O O O
be O O O O
related O O O O
to O O O O
morphological O O O O
changes O O O O
to O O O O
the O O O O
bud O O O O
. O O O O
    
Comparison O O O O
of O O O O
gene O O O O
expression O O O O
profiles O O O O
during O O O O
bud O O O O
formation O O O O
in O O O O
different O O O O
tissues O O O O
revealed O O O O
108 O O O O
genes O O O O
that O O O O
are O O O O
differentially O O O O
expressed O O O O
only O O O O
in O O O O
developing O O O O
buds O O O O
and O O O O
show O O O O
greater O O O O
transcript O O O O
abundance O O O O
in O O O O
developing O O O O
buds O O O O
than O O O O
other O O O O
tissues O O O O
. O O O O
    
These O O O O
findings O O O O
provide O O O O
a O O O O
temporal O O O O
roadmap O O O O
of O O O O
bud O O O O
formation O O O O
in O O O O
white B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
spruce O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Linking O O O O
irradiance O O O O
- O O O O
induced O O O O
changes O O O O
in O O O O
pit O O O O
membrane O O O O
ultrastructure O O O O
with O O O O
xylem O O O O
vulnerability O O O O
to O O O O
cavitation O O O O
. O O O O
    
The O O O O
effect O O O O
of O O O O
shading O O O O
on O O O O
xylem O O O O
hydraulic O O O O
traits O O O O
and O O O O
xylem O O O O
anatomy O O O O
was O O O O
studied O O O O
in O O O O
hybrid O O O O
poplar O O O O
( O O O O
Populus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trichocarpa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
x O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
deltoides O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
clone O O O O
H11 O O O O
- O O O O
11 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Hydraulic O O O O
measurements O O O O
conducted O O O O
on O O O O
stem O O O O
segments O O O O
of O O O O
3 O O O O
- O O O O
month O O O O
- O O O O
old O O O O
saplings O O O O
grown O O O O
in O O O O
shaded O O O O
( O O O O
SH O O O O
) O O O O
or O O O O
control O O O O
light O O O O
( O O O O
C O O O O
) O O O O
conditions O O O O
indicated O O O O
that O O O O
shading O O O O
resulted O O O O
in O O O O
more O O O O
vulnerable O O O O
and O O O O
less O O O O
efficient O O O O
xylem O O O O
. O O O O
    
Air O O O O
is O O O O
thought O O O O
to O O O O
enter O O O O
vessels O O O O
through O O O O
pores O O O O
in O O O O
inter O O O O
- O O O O
vessel O O O O
pit O O O O
membranes O O O O
, O O O O
thereby O O O O
nucleating O O O O
cavitation O O O O
. O O O O
    
Therefore O O O O
, O O O O
we O O O O
tested O O O O
if O O O O
the O O O O
ultrastructure O O O O
and O O O O
/ O O O O
or O O O O
chemistry O O O O
of O O O O
pit O O O O
membranes O O O O
differed O O O O
in O O O O
SH O O O O
and O O O O
C O O O O
plants O O O O
. O O O O
    
Transmission O O O O
electron O O O O
micrographs O O O O
revealed O O O O
that O O O O
pit O O O O
membranes O O O O
were O O O O
thinner O O O O
in O O O O
SH O O O O
, O O O O
which O O O O
was O O O O
paralleled O O O O
by O O O O
lower O O O O
compound O O O O
middle O O O O
lamella O O O O
thickness O O O O
. O O O O
    
Immunolabelling O O O O
with O O O O
JIM5 O O O O
and O O O O
JIM7 O O O O
monoclonal O O O O
antibodies O O O O
surprisingly O O O O
indicated O O O O
that O O O O
pectic O O O O
homogalacturonans O O O O
were O O O O
not O O O O
present O O O O
in O O O O
the O O O O
mature O O O O
pit O O O O
membrane O O O O
regardless O O O O
of O O O O
the O O O O
light O O O O
treatment O O O O
. O O O O
    
Porosity O O O O
measurements O O O O
conducted O O O O
with O O O O
scanning O O O O
electron O O O O
microscopy O O O O
were O O O O
significantly O O O O
affected O O O O
by O O O O
the O O O O
method O O O O
used O O O O
for O O O O
sample O O O O
dehydration O O O O
. O O O O
    
Drying O O O O
through O O O O
a O O O O
gradual O O O O
ethanol O O O O
series O O O O
seems O O O O
to O O O O
be O O O O
a O O O O
better O O O O
alternative O O O O
to O O O O
drying O O O O
directly O O O O
from O O O O
a O O O O
hydrated O O O O
state O O O O
for O O O O
pit O O O O
membrane O O O O
observations O O O O
in O O O O
poplar O O O O
. O O O O
    
Scanning O O O O
electron O O O O
microscopy O O O O
based O O O O
estimates O O O O
of O O O O
pit O O O O
membrane O O O O
porosity O O O O
probably O O O O
overestimated O O O O
real O O O O
porosity O O O O
as O O O O
suggested O O O O
by O O O O
the O O O O
results O O O O
from O O O O
the O O O O
' O O O O
rare O O O O
pit O O O O
' O O O O
model O O O O
. O O O O
    
Sensing O O O O
embolism O O O O
in O O O O
xylem O O O O
vessels O O O O
: O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
sucrose O O O O
as O O O O
a O O O O
trigger O O O O
for O O O O
refilling O O O O
. O O O O
    
Refilling O O O O
of O O O O
embolized O O O O
vessels O O O O
requires O O O O
a O O O O
source O O O O
of O O O O
water O O O O
and O O O O
the O O O O
release O O O O
of O O O O
energy O O O O
stored O O O O
in O O O O
xylem O O O O
parenchyma O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Past O O O O
evidence O O O O
suggests O O O O
that O O O O
embolism O O O O
presence O O O O
can O O O O
trigger O O O O
a O O O O
biological O O O O
response O O O O
that O O O O
is O O O O
switched O O O O
off O O O O
upon O O O O
successful O O O O
vessel O O O O
refilling O O O O
. O O O O
    
As O O O O
embolism O O O O
formation O O O O
is O O O O
a O O O O
purely O O O O
physical O O O O
process O O O O
and O O O O
most O O O O
biological O O O O
triggers O O O O
rely O O O O
on O O O O
chemical O O O O
sensors O O O O
, O O O O
we O O O O
hypothesized O O O O
that O O O O
accumulation O O O O
of O O O O
osmotic O O O O
compounds O O O O
in O O O O
walls O O O O
of O O O O
embolized O O O O
vessels O O O O
are O O O O
involved O O O O
in O O O O
the O O O O
embolism O O O O
sensing O O O O
mechanism O O O O
. O O O O
    
Analysis O O O O
of O O O O
Populus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trichocarpa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
' O O O O
s O O O O
response O O O O
to O O O O
infiltration O O O O
of O O O O
sucrose O O O O
, O O O O
monosaccharides O O O O
, O O O O
polyethylene O O O O
glycol O O O O
and O O O O
potassium O O O O
chloride O O O O
into O O O O
the O O O O
xylem O O O O
revealed O O O O
that O O O O
only O O O O
presence O O O O
of O O O O
sucrose O O O O
resulted O O O O
in O O O O
a O O O O
simultaneous O O O O
physiological O O O O
and O O O O
molecular O O O O
response O O O O
similar O O O O
to O O O O
that O O O O
induced O O O O
by O O O O
embolism O O O O
. O O O O
    
This O O O O
response O O O O
included O O O O
reduction O O O O
of O O O O
the O O O O
starch O O O O
pool O O O O
in O O O O
xylem O O O O
parenchyma O O O O
cells O O O O
and O O O O
significant O O O O
correlation O O O O
of O O O O
gene O O O O
expression O O O O
from O O O O
aquaporins O O O O
, O O O O
amylases O O O O
and O O O O
sugar O O O O
transporter O O O O
families O O O O
. O O O O
    
The O O O O
work O O O O
provides O O O O
evidence O O O O
of O O O O
the O O O O
ability O O O O
of O O O O
plants O O O O
to O O O O
sense O O O O
embolism O O O O
and O O O O
suggests O O O O
that O O O O
sucrose O O O O
concentration O O O O
is O O O O
the O O O O
stimulus O O O O
that O O O O
allows O O O O
plants O O O O
to O O O O
trigger O O O O
a O O O O
biological O O O O
response O O O O
to O O O O
embolism O O O O
. O O O O
    
Constrained O O O O
preferences O O O O
in O O O O
nitrogen O O O O
uptake O O O O
across O O O O
plant O O O O
species O O O O
and O O O O
environments O O O O
. O O O O
    
Knowledge O O O O
of O O O O
determining O O O O
factors O O O O
for O O O O
nitrogen O O O O
uptake O O O O
preferences O O O O
and O O O O
how O O O O
they O O O O
are O O O O
modified O O O O
in O O O O
changing O O O O
environments O O O O
are O O O O
critical O O O O
to O O O O
understand O O O O
ecosystem O O O O
nitrogen O O O O
cycling O O O O
and O O O O
to O O O O
predict O O O O
plant O O O O
responses O O O O
to O O O O
future O O O O
environmental O O O O
changes O O O O
. O O O O
    
Two O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
5N O O O O
tracer O O O O
experiments O O O O
utilizing O O O O
a O O O O
unique O O O O
differential O O O O
labelled O O O O
nitrogen O O O O
source O O O O
were O O O O
employed O O O O
in O O O O
both O O O O
African O O O O
savannas O O O O
and O O O O
greenhouse O O O O
settings O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
nitrogen O O O O
uptake O O O O
preferences O O O O
were O O O O
constrained O O O O
by O O O O
the O O O O
climatic O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
As O O O O
mainly O O O O
indicated O O O O
by O O O O
root O O O O
delta O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
5N O O O O
signatures O O O O
at O O O O
1 O O O O
: O O O O
1 O O O O
ammonium O O O O
/ O O O O
nitrate O O O O
ratio O O O O
, O O O O
in O O O O
the O O O O
drier O O O O
environments O O O O
, O O O O
plants O O O O
preferred O O O O
nitrate O O O O
and O O O O
in O O O O
the O O O O
wetter O O O O
environments O O O O
they O O O O
preferred O O O O
ammonium O O O O
. O O O O
    
Nitrogen O O O O
uptake O O O O
preferences O O O O
were O O O O
different O O O O
across O O O O
different O O O O
ecosystems O O O O
( O O O O
e O O O O
. O O O O
g O O O O
. O O O O
from O O O O
drier O O O O
to O O O O
wetter O O O O
environments O O O O
) O O O O
even O O O O
for O O O O
the O O O O
same O O O O
species O O O O
. O O O O
    
More O O O O
significantly O O O O
, O O O O
our O O O O
experiments O O O O
showed O O O O
that O O O O
the O O O O
plant O O O O
progeny O O O O
continued O O O O
to O O O O
exhibit O O O O
the O O O O
same O O O O
nitrogen O O O O
preference O O O O
as O O O O
the O O O O
parent O O O O
plants O O O O
in O O O O
the O O O O
field O O O O
, O O O O
even O O O O
when O O O O
removed O O O O
from O O O O
their O O O O
native O O O O
environment O O O O
and O O O O
the O O O O
nitrogen O O O O
source O O O O
was O O O O
changed O O O O
dramatically O O O O
. O O O O
    
The O O O O
climatic O O O O
constraint O O O O
of O O O O
nitrogen O O O O
uptake O O O O
preference O O O O
is O O O O
likely O O O O
influenced O O O O
by O O O O
ammonium O O O O
/ O O O O
nitrate O O O O
ratios O O O O
in O O O O
the O O O O
native O O O O
habitats O O O O
of O O O O
the O O O O
plants O O O O
. O O O O
    
The O O O O
constancy O O O O
in O O O O
nitrogen O O O O
preference O O O O
has O O O O
important O O O O
implications O O O O
in O O O O
predicting O O O O
the O O O O
success O O O O
of O O O O
plant O O O O
communities O O O O
in O O O O
their O O O O
response O O O O
to O O O O
climate O O O O
change O O O O
, O O O O
to O O O O
seed O O O O
bank O O O O
use O O O O
and O O O O
to O O O O
reforestation O O O O
efforts O O O O
. O O O O
    
Molecular O O O O
identification O O O O
of O O O O
sequestered O O O O
diatom O O O O
chloroplasts O O O O
and O O O O
kleptoplastidy O O O O
in O O O O
foraminifera O O O O
. O O O O
    
Kleptoplastidy O O O O
is O O O O
the O O O O
ability O O O O
of O O O O
heterotrophic O O O O
organisms O O O O
to O O O O
preserve O O O O
chloroplasts O O O O
of O O O O
algal O O O O
preys O O O O
they O O O O
eat O O O O
and O O O O
partially O O O O
digest O O O O
. O O O O
    
As O O O O
the O O O O
sequestered O O O O
chloroplasts O O O O
stay O O O O
functional O O O O
for O O O O
months O O O O
, O O O O
the O O O O
"""" O O O O
host O O O O
"""" O O O O
becomes O O O O
photosynthetically O O O O
active O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
remaining O O O O
a O O O O
marginal O O O O
process O O O O
, O O O O
kleptoplastidy O O O O
was O O O O
observed O O O O
in O O O O
different O O O O
protist O O O O
lineages O O O O
, O O O O
including O O O O
foraminifera O O O O
. O O O O
    
Previous O O O O
studies O O O O
showed O O O O
at O O O O
least O O O O
eight O O O O
species O O O O
of O O O O
the O O O O
foraminiferal O O O O
genera O O O O
Haynesina O O O O
and O O O O
Elphidium O O O O
grazing O O O O
on O O O O
diatoms O O O O
and O O O O
husbanding O O O O
their O O O O
chloroplasts O O O O
. O O O O
    
In O O O O
order O O O O
to O O O O
characterize O O O O
more O O O O
precisely O O O O
the O O O O
origin O O O O
of O O O O
kleptochloroplasts O O O O
in O O O O
these O O O O
genera O O O O
, O O O O
we O O O O
obtained O O O O
1027 O O O O
chloroplastic O O O O
16S O O O O
rDNA O O O O
sequences O O O O
from O O O O
13 O O O O
specimens O O O O
of O O O O
two O O O O
Haynesina O O O O
and O O O O
five O O O O
Elphidium O O O O
species O O O O
. O O O O
    
We O O O O
identified O O O O
the O O O O
foraminiferal O O O O
kleptochloroplasts O O O O
using O O O O
a O O O O
reference O O O O
phylogeny O O O O
made O O O O
of O O O O
87 O O O O
chloroplastic O O O O
sequences O O O O
of O O O O
known O O O O
species O O O O
of O O O O
diatoms O O O O
and O O O O
brown O O O O
algae O O O O
. O O O O
    
All O O O O
the O O O O
analyzed O O O O
specimens O O O O
were O O O O
performing O O O O
kleptoplastidy O O O O
and O O O O
according O O O O
to O O O O
our O O O O
phylogenetic O O O O
analyses O O O O
they O O O O
seem O O O O
to O O O O
retain O O O O
exclusively O O O O
chloroplasts O O O O
of O O O O
diatom O O O O
origin O O O O
. O O O O
    
There O O O O
is O O O O
no O O O O
apparent O O O O
specificity O O O O
for O O O O
the O O O O
type O O O O
of O O O O
diatom O O O O
from O O O O
which O O O O
chloroplasts O O O O
originated O O O O
, O O O O
however O O O O
some O O O O
foraminiferal O O O O
species O O O O
seem O O O O
to O O O O
accept O O O O
a O O O O
wider O O O O
range O O O O
of O O O O
diatoms O O O O
than O O O O
others O O O O
. O O O O
    
Possibly O O O O
the O O O O
diversity O O O O
of O O O O
kleptochloroplasts O O O O
depends O O O O
on O O O O
the O O O O
type O O O O
of O O O O
diatoms O O O O
the O O O O
foraminiferans O O O O
feed O O O O
on O O O O
. O O O O
    
Constitutive O O O O
expression O O O O
of O O O O
the O O O O
maltoporin O O O O
LamB O O O O
in O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
OmpR O O O O
damages O O O O
the O O O O
cell O O O O
envelope O O O O
. O O O O
    
Cells O O O O
experience O O O O
multiple O O O O
environmental O O O O
stimuli O O O O
simultaneously O O O O
. O O O O
    
To O O O O
survive O O O O
, O O O O
they O O O O
must O O O O
respond O O O O
accordingly O O O O
. O O O O
    
Unfortunately O O O O
, O O O O
the O O O O
proper O O O O
response O O O O
to O O O O
one O O O O
stress O O O O
easily O O O O
could O O O O
make O O O O
the O O O O
cell O O O O
more O O O O
susceptible O O O O
to O O O O
a O O O O
second O O O O
coexistent O O O O
stress O O O O
. O O O O
    
To O O O O
deal O O O O
with O O O O
such O O O O
a O O O O
problem O O O O
, O O O O
a O O O O
cell O O O O
must O O O O
possess O O O O
a O O O O
mechanism O O O O
that O O O O
balances O O O O
the O O O O
need O O O O
to O O O O
respond O O O O
simultaneously O O O O
to O O O O
both O O O O
stresses O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
recent O O O O
studies O O O O
of O O O O
ompR O O O O
malT O O O O
( O O O O
Con O O O O
) O O O O
double O O O O
mutants O O O O
show O O O O
that O O O O
elevated O O O O
expression O O O O
of O O O O
LamB O O O O
, O O O O
the O O O O
outer O O O O
membrane O O O O
porin O O O O
responsible O O O O
for O O O O
maltose O O O O
uptake O O O O
, O O O O
causes O O O O
cell O O O O
death O O O O
when O O O O
the O O O O
osmoregulator O O O O
OmpR O O O O
is O O O O
disabled O O O O
. O O O O
    
To O O O O
obtain O O O O
insight O O O O
into O O O O
the O O O O
nature O O O O
of O O O O
the O O O O
death O O O O
experienced O O O O
by O O O O
ompR O O O O
malT O O O O
( O O O O
Con O O O O
) O O O O
mutants O O O O
, O O O O
we O O O O
described O O O O
the O O O O
death O O O O
process O O O O
. O O O O
    
On O O O O
the O O O O
basis O O O O
of O O O O
microscopic O O O O
and O O O O
biochemical O O O O
approaches O O O O
, O O O O
we O O O O
conclude O O O O
that O O O O
death O O O O
results O O O O
from O O O O
a O O O O
loss O O O O
of O O O O
membrane O O O O
integrity O O O O
. O O O O
    
On O O O O
the O O O O
basis O O O O
of O O O O
an O O O O
unbiased O O O O
genome O O O O
- O O O O
wide O O O O
search O O O O
for O O O O
suppressor O O O O
mutations O O O O
, O O O O
we O O O O
conclude O O O O
that O O O O
this O O O O
loss O O O O
of O O O O
membrane O O O O
integrity O O O O
results O O O O
from O O O O
a O O O O
LamB O O O O
- O O O O
induced O O O O
envelope O O O O
stress O O O O
that O O O O
the O O O O
cells O O O O
do O O O O
not O O O O
sufficiently O O O O
perceive O O O O
and O O O O
thus O O O O
do O O O O
not O O O O
adequately O O O O
accommodate O O O O
. O O O O
    
Finally O O O O
, O O O O
we O O O O
conclude O O O O
that O O O O
this O O O O
envelope O O O O
stress O O O O
involves O O O O
an O O O O
imbalance O O O O
in O O O O
the O O O O
lipopolysaccharide O O O O
/ O O O O
porin O O O O
composition O O O O
of O O O O
the O O O O
outer O O O O
membrane O O O O
and O O O O
an O O O O
increased O O O O
requirement O O O O
for O O O O
inorganic O O O O
phosphate O O O O
. O O O O
    
Regulation O O O O
of O O O O
nleA O O O O
in O O O O
Shiga O O O O
toxin O O O O
- O O O O
producing O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
O84 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
: O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H4 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
4795 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
97 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Many O O O O
Shiga O O O O
toxin O O O O
- O O O O
producing O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
STEC B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
strains O O O O
express O O O O
a O O O O
type O O O O
III O O O O
secretion O O O O
system O O O O
( O O O O
TTSS O O O O
) O O O O
encoded O O O O
by O O O O
the O O O O
locus O O O O
of O O O O
enterocyte O O O O
effacement O O O O
( O O O O
LEE O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
the O O O O
TTSS O O O O
, O O O O
STEC B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
is O O O O
able O O O O
to O O O O
inject O O O O
effector O O O O
proteins O O O O
directly O O O O
into O O O O
eukaryotic O O O O
host O O O O
cells O O O O
, O O O O
where O O O O
they O O O O
cause O O O O
characteristic O O O O
attaching O O O O
and O O O O
effacing O O O O
( O O O O
A O O O O
/ O O O O
E O O O O
) O O O O
lesions O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
to O O O O
the O O O O
LEE O O O O
- O O O O
encoded O O O O
effectors O O O O
, O O O O
a O O O O
number O O O O
of O O O O
non O O O O
- O O O O
LEE O O O O
- O O O O
encoded O O O O
effectors O O O O
, O O O O
located O O O O
on O O O O
phage O O O O
- O O O O
associated O O O O
elements O O O O
, O O O O
have O O O O
been O O O O
described O O O O
. O O O O
    
One O O O O
of O O O O
them O O O O
, O O O O
the O O O O
non O O O O
- O O O O
LEE O O O O
- O O O O
encoded O O O O
effector O O O O
A O O O O
( O O O O
NleA O O O O
) O O O O
, O O O O
is O O O O
widely O O O O
distributed O O O O
among O O O O
pathogenic O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
investigated O O O O
the O O O O
influence O O O O
of O O O O
environmental O O O O
conditions O O O O
on O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
the O O O O
phage O O O O
- O O O O
encoded O O O O
effector O O O O
nleA O O O O
gene O O O O
( O O O O
designated O O O O
nleA O O O O
( O O O O
4795 O O O O
) O O O O
) O O O O
present O O O O
in O O O O
STEC B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
O84 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
: O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H4 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
4795 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
97 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
We O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
a O O O O
particular O O O O
NaCl O O O O
concentration O O O O
and O O O O
starvation O O O O
stress O O O O
increase O O O O
the O O O O
activity O O O O
of O O O O
the O O O O
nleA O O O O
( O O O O
4795 O O O O
) O O O O
promoter O O O O
. O O O O
    
Moreover O O O O
, O O O O
several O O O O
regulators O O O O
that O O O O
control O O O O
nleA O O O O
( O O O O
4795 O O O O
) O O O O
expression O O O O
were O O O O
identified O O O O
. O O O O
    
The O O O O
involvement O O O O
of O O O O
the O O O O
LEE O O O O
regulators O O O O
Ler O O O O
, O O O O
GrlA O O O O
, O O O O
and O O O O
GrlR O O O O
show O O O O
that O O O O
nleA O O O O
( O O O O
4795 O O O O
) O O O O
is O O O O
integrated O O O O
in O O O O
the O O O O
LEE O O O O
regulation O O O O
circuit O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
the O O O O
binding O O O O
of O O O O
Ler O O O O
to O O O O
sequences O O O O
upstream O O O O
of O O O O
nleA O O O O
( O O O O
4795 O O O O
) O O O O
underlined O O O O
these O O O O
findings O O O O
. O O O O
    
Bacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
anthracis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sin O O O O
locus O O O O
and O O O O
regulation O O O O
of O O O O
secreted O O O O
proteases O O O O
. O O O O
    
Bacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
anthracis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
shares O O O O
many O O O O
regulatory O O O O
loci O O O O
with O O O O
the O O O O
nonpathogenic O O O O
Bacillus O O O O
species O O O O
Bacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
subtilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
One O O O O
such O O O O
locus O O O O
is O O O O
sinIR O O O O
, O O O O
which O O O O
in O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
subtilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
controls O O O O
sporulation O O O O
, O O O O
biofilm O O O O
formation O O O O
, O O O O
motility O O O O
, O O O O
and O O O O
competency O O O O
. O O O O
    
As O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
anthracis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
not O O O O
known O O O O
to O O O O
be O O O O
motile O O O O
, O O O O
to O O O O
be O O O O
naturally O O O O
competent O O O O
, O O O O
or O O O O
to O O O O
readily O O O O
form O O O O
biofilms O O O O
, O O O O
we O O O O
hypothesized O O O O
that O O O O
the O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
anthracis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sinIR O O O O
regulon O O O O
is O O O O
distinct O O O O
from O O O O
that O O O O
of O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
subtilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
A O O O O
genome O O O O
- O O O O
wide O O O O
expression O O O O
microarray O O O O
analysis O O O O
of O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
anthracis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
parental O O O O
and O O O O
sinR O O O O
mutant O O O O
strains O O O O
indicated O O O O
limited O O O O
convergence O O O O
of O O O O
the O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
anthracis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
subtilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
SinR O O O O
regulons O O O O
. O O O O
    
The O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
anthracis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
regulon O O O O
includes O O O O
homologues O O O O
of O O O O
some O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
subtilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
SinR O O O O
- O O O O
regulated O O O O
genes O O O O
, O O O O
including O O O O
the O O O O
signal O O O O
peptidase O O O O
gene O O O O
sipW O O O O
near O O O O
the O O O O
sinIR O O O O
locus O O O O
and O O O O
the O O O O
sporulation O O O O
gene O O O O
spoIIE O O O O
. O O O O
    
The O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
anthracis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
SinR O O O O
protein O O O O
also O O O O
negatively O O O O
regulates O O O O
transcription O O O O
of O O O O
genes O O O O
adjacent O O O O
to O O O O
the O O O O
sinIR O O O O
locus O O O O
that O O O O
are O O O O
unique O O O O
to O O O O
the O O O O
Bacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cereus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
group O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
species O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
These O O O O
include O O O O
calY O O O O
and O O O O
inhA1 O O O O
, O O O O
structural O O O O
genes O O O O
for O O O O
the O O O O
metalloproteases O O O O
camelysin O O O O
and O O O O
immune O O O O
inhibitor O O O O
A1 O O O O
( O O O O
InhA1 O O O O
) O O O O
, O O O O
which O O O O
have O O O O
been O O O O
suggested O O O O
to O O O O
be O O O O
associated O O O O
with O O O O
virulence O O O O
in O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cereus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
anthracis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
Electrophoretic O O O O
mobility O O O O
shift O O O O
assays O O O O
revealed O O O O
direct O O O O
binding O O O O
of O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
anthracis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
SinR O O O O
to O O O O
promoter O O O O
DNA O O O O
from O O O O
strongly O O O O
regulated O O O O
genes O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
calY O O O O
and O O O O
sipW O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
to O O O O
the O O O O
weakly O O O O
regulated O O O O
inhA1 O O O O
gene O O O O
. O O O O
    
Assessment O O O O
of O O O O
camelysin O O O O
and O O O O
InhA1 O O O O
levels O O O O
in O O O O
culture O O O O
supernates O O O O
from O O O O
sinR O O O O
- O O O O
, O O O O
inhA1 O O O O
- O O O O
, O O O O
and O O O O
calY O O O O
- O O O O
 O O O O
mutants O O O O
showed O O O O
that O O O O
the O O O O
concentration O O O O
of O O O O
InhA1 O O O O
in O O O O
the O O O O
culture O O O O
supernatant O O O O
is O O O O
inversely O O O O
proportional O O O O
to O O O O
the O O O O
concentration O O O O
of O O O O
camelysin O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
data O O O O
are O O O O
consistent O O O O
with O O O O
a O O O O
model O O O O
in O O O O
which O O O O
InhA1 O O O O
protease O O O O
levels O O O O
are O O O O
controlled O O O O
at O O O O
the O O O O
transcriptional O O O O
level O O O O
by O O O O
SinR O O O O
and O O O O
at O O O O
the O O O O
posttranslational O O O O
level O O O O
by O O O O
camelysin O O O O
. O O O O
    
DifA O O O O
, O O O O
a O O O O
methyl O O O O
- O O O O
accepting O O O O
chemoreceptor O O O O
protein O O O O
- O O O O
like O O O O
sensory O O O O
protein O O O O
, O O O O
uses O O O O
a O O O O
novel O O O O
signaling O O O O
mechanism O O O O
to O O O O
regulate O O O O
exopolysaccharide O O O O
production O O O O
in O O O O
Myxococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
xanthus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
DifA O O O O
is O O O O
a O O O O
methyl O O O O
- O O O O
accepting O O O O
chemotaxis O O O O
protein O O O O
( O O O O
MCP O O O O
) O O O O
- O O O O
like O O O O
sensory O O O O
transducer O O O O
that O O O O
regulates O O O O
exopolysaccharide O O O O
( O O O O
EPS O O O O
) O O O O
production O O O O
in O O O O
Myxococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
xanthus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Here O O O O
mutational O O O O
analysis O O O O
and O O O O
molecular O O O O
biology O O O O
were O O O O
used O O O O
to O O O O
probe O O O O
the O O O O
signaling O O O O
mechanisms O O O O
of O O O O
DifA O O O O
in O O O O
EPS O O O O
regulation O O O O
. O O O O
    
We O O O O
first O O O O
identified O O O O
the O O O O
start O O O O
codon O O O O
of O O O O
DifA O O O O
experimentally O O O O
; O O O O
this O O O O
identification O O O O
extended O O O O
the O O O O
N O O O O
terminus O O O O
of O O O O
DifA O O O O
for O O O O
45 O O O O
amino O O O O
acids O O O O
( O O O O
aa O O O O
) O O O O
from O O O O
the O O O O
previous O O O O
bioinformatics O O O O
prediction O O O O
. O O O O
    
This O O O O
extension O O O O
helped O O O O
to O O O O
address O O O O
the O O O O
outstanding O O O O
question O O O O
of O O O O
how O O O O
DifA O O O O
receives O O O O
input O O O O
signals O O O O
from O O O O
type O O O O
4 O O O O
pili O O O O
without O O O O
a O O O O
prominent O O O O
periplasmic O O O O
domain O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
DifA O O O O
uses O O O O
its O O O O
N O O O O
- O O O O
terminus O O O O
extension O O O O
to O O O O
sense O O O O
an O O O O
upstream O O O O
signal O O O O
in O O O O
EPS O O O O
regulation O O O O
. O O O O
    
We O O O O
suggest O O O O
that O O O O
the O O O O
perception O O O O
of O O O O
the O O O O
input O O O O
signal O O O O
by O O O O
DifA O O O O
is O O O O
mediated O O O O
by O O O O
protein O O O O
- O O O O
protein O O O O
interactions O O O O
with O O O O
upstream O O O O
components O O O O
. O O O O
    
Subsequent O O O O
signal O O O O
transmission O O O O
likely O O O O
involves O O O O
transmembrane O O O O
signaling O O O O
instead O O O O
of O O O O
direct O O O O
intramolecular O O O O
interactions O O O O
between O O O O
the O O O O
input O O O O
and O O O O
the O O O O
output O O O O
modules O O O O
in O O O O
the O O O O
cytoplasm O O O O
. O O O O
    
The O O O O
basic O O O O
functional O O O O
unit O O O O
of O O O O
DifA O O O O
for O O O O
signal O O O O
transduction O O O O
is O O O O
likely O O O O
dimeric O O O O
as O O O O
mutational O O O O
alteration O O O O
of O O O O
the O O O O
predicted O O O O
dimeric O O O O
interface O O O O
of O O O O
DifA O O O O
significantly O O O O
affected O O O O
EPS O O O O
production O O O O
. O O O O
    
Deletions O O O O
of O O O O
14 O O O O
- O O O O
aa O O O O
segments O O O O
in O O O O
the O O O O
C O O O O
terminus O O O O
suggest O O O O
that O O O O
the O O O O
newly O O O O
defined O O O O
flexible O O O O
bundle O O O O
subdomain O O O O
in O O O O
MCPs O O O O
is O O O O
likely O O O O
critical O O O O
for O O O O
DifA O O O O
function O O O O
because O O O O
shortening O O O O
of O O O O
this O O O O
bundle O O O O
can O O O O
lead O O O O
to O O O O
constitutively O O O O
active O O O O
mutations O O O O
. O O O O
    
The O O O O
SMC O O O O
- O O O O
like O O O O
protein O O O O
complex O O O O
SbcCD O O O O
enhances O O O O
DNA O O O O
polymerase O O O O
IV O O O O
- O O O O
dependent O O O O
spontaneous O O O O
mutation O O O O
in O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
In O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
RpoS O O O O
, O O O O
the O O O O
general O O O O
stress O O O O
response O O O O
sigma O O O O
factor O O O O
, O O O O
regulates O O O O
the O O O O
activity O O O O
of O O O O
the O O O O
specialized O O O O
DNA O O O O
polymerase O O O O
DNA O O O O
polymerase O O O O
IV O O O O
( O O O O
Pol O O O O
IV O O O O
) O O O O
both O O O O
in O O O O
stationary O O O O
- O O O O
phase O O O O
and O O O O
in O O O O
exponential O O O O
- O O O O
phase O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Because O O O O
during O O O O
exponential O O O O
phase O O O O
dinB O O O O
, O O O O
the O O O O
gene O O O O
encoding O O O O
Pol O O O O
IV O O O O
, O O O O
is O O O O
transcribed O O O O
independently O O O O
of O O O O
RpoS O O O O
, O O O O
RpoS O O O O
must O O O O
regulate O O O O
Pol O O O O
IV O O O O
activity O O O O
in O O O O
growing O O O O
cells O O O O
indirectly O O O O
via O O O O
one O O O O
or O O O O
more O O O O
intermediate O O O O
factors O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
presented O O O O
here O O O O
show O O O O
that O O O O
one O O O O
of O O O O
these O O O O
intermediate O O O O
factors O O O O
is O O O O
SbcCD O O O O
, O O O O
an O O O O
SMC O O O O
- O O O O
like O O O O
protein O O O O
and O O O O
an O O O O
ATP O O O O
- O O O O
dependent O O O O
nuclease O O O O
. O O O O
    
By O O O O
initiating O O O O
or O O O O
participating O O O O
in O O O O
double O O O O
- O O O O
strand O O O O
break O O O O
repair O O O O
, O O O O
SbcCD O O O O
may O O O O
provide O O O O
DNA O O O O
substrates O O O O
for O O O O
Pol O O O O
IV O O O O
polymerase O O O O
activity O O O O
. O O O O
    
Staphylococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aureus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ClpC O O O O
divergently O O O O
regulates O O O O
capsule O O O O
via O O O O
sae O O O O
and O O O O
codY O O O O
in O O O O
strain O O O O
newman B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
but O O O O
activates O O O O
capsule O O O O
via O O O O
codY O O O O
in O O O O
strain O O O O
UAMS B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
in O O O O
strain O O O O
Newman B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
with O O O O
repaired O O O O
saeS O O O O
. O O O O
    
ClpC O O O O
is O O O O
an O O O O
ATPase O O O O
chaperone O O O O
found O O O O
in O O O O
most O O O O
Gram O O O O
- O O O O
positive O O O O
low O O O O
- O O O O
GC O O O O
bacteria O O O O
. O O O O
    
It O O O O
has O O O O
been O O O O
recently O O O O
reported O O O O
that O O O O
ClpC O O O O
affected O O O O
virulence O O O O
gene O O O O
expression O O O O
in O O O O
Staphylococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aureus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
report O O O O
that O O O O
ClpC O O O O
regulates O O O O
transcription O O O O
of O O O O
the O O O O
cap O O O O
operon O O O O
and O O O O
accumulation O O O O
of O O O O
capsule O O O O
, O O O O
a O O O O
major O O O O
virulence O O O O
factor O O O O
for O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
aureus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
As O O O O
virulence O O O O
genes O O O O
are O O O O
regulated O O O O
by O O O O
a O O O O
complex O O O O
regulatory O O O O
network O O O O
in O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
aureus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
we O O O O
have O O O O
used O O O O
capsule O O O O
as O O O O
a O O O O
model O O O O
to O O O O
understand O O O O
this O O O O
regulation O O O O
. O O O O
    
By O O O O
microarray O O O O
analyses O O O O
of O O O O
strain O O O O
Newman B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
we O O O O
found O O O O
that O O O O
ClpC O O O O
strongly O O O O
activates O O O O
transcription O O O O
of O O O O
the O O O O
sae O O O O
operon O O O O
, O O O O
whose O O O O
products O O O O
are O O O O
known O O O O
to O O O O
negatively O O O O
regulate O O O O
capsule O O O O
synthesis O O O O
in O O O O
this O O O O
strain O O O O
. O O O O
    
Further O O O O
studies O O O O
indicated O O O O
that O O O O
ClpC O O O O
repressed O O O O
capsule O O O O
production O O O O
by O O O O
activating O O O O
the O O O O
sae O O O O
operon O O O O
in O O O O
strain O O O O
Newman B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Interestingly O O O O
, O O O O
the O O O O
clpC O O O O
gene O O O O
cloned O O O O
into O O O O
a O O O O
multiple O O O O
- O O O O
copy O O O O
plasmid O O O O
vector O O O O
exhibited O O O O
an O O O O
activation O O O O
phenotype O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
ClpC O O O O
overexpression O O O O
has O O O O
a O O O O
net O O O O
positive O O O O
effect O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
sae O O O O
function O O O O
, O O O O
by O O O O
either O O O O
deletion O O O O
or O O O O
correction O O O O
of O O O O
a O O O O
native O O O O
mutation O O O O
within O O O O
saeS O O O O
, O O O O
we O O O O
found O O O O
that O O O O
ClpC O O O O
had O O O O
a O O O O
positive O O O O
effect O O O O
on O O O O
capsule O O O O
production O O O O
. O O O O
    
Indeed O O O O
, O O O O
in O O O O
the O O O O
UAMS B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O O O O
, O O O O
which O O O O
does O O O O
not O O O O
have O O O O
the O O O O
saeS O O O O
mutation O O O O
, O O O O
ClpC O O O O
functioned O O O O
as O O O O
an O O O O
activator O O O O
of O O O O
capsule O O O O
production O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
microarray O O O O
analyses O O O O
of O O O O
strain O O O O
Newman B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
also O O O O
revealed O O O O
that O O O O
CodY O O O O
, O O O O
a O O O O
repressor O O O O
of O O O O
capsule O O O O
production O O O O
, O O O O
was O O O O
repressed O O O O
by O O O O
ClpC O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
genetic O O O O
approaches O O O O
, O O O O
we O O O O
showed O O O O
that O O O O
CodY O O O O
functioned O O O O
downstream O O O O
of O O O O
ClpC O O O O
, O O O O
leading O O O O
to O O O O
capsule O O O O
activation O O O O
both O O O O
in O O O O
Newman B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
in O O O O
UAMS B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
ClpC O O O O
functions O O O O
in O O O O
two O O O O
opposite O O O O
pathways O O O O
in O O O O
capsule O O O O
regulation O O O O
in O O O O
strain O O O O
Newman B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
but O O O O
functions O O O O
as O O O O
a O O O O
positive O O O O
activator O O O O
in O O O O
strain O O O O
UAMS B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Flavobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
johnsoniae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sprB O O O O
is O O O O
part O O O O
of O O O O
an O O O O
operon O O O O
spanning O O O O
the O O O O
additional O O O O
gliding O O O O
motility O O O O
genes O O O O
sprC O O O O
, O O O O
sprD O O O O
, O O O O
and O O O O
sprF O O O O
. O O O O
    
Cells O O O O
of O O O O
Flavobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
johnsoniae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
move O O O O
rapidly O O O O
over O O O O
surfaces O O O O
by O O O O
a O O O O
process O O O O
known O O O O
as O O O O
gliding O O O O
motility O O O O
. O O O O
    
Gld O O O O
proteins O O O O
are O O O O
thought O O O O
to O O O O
comprise O O O O
the O O O O
gliding O O O O
motor O O O O
that O O O O
propels O O O O
cell O O O O
surface O O O O
adhesins O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
the O O O O
669 O O O O
- O O O O
kDa O O O O
SprB O O O O
. O O O O
    
A O O O O
novel O O O O
protein O O O O
secretion O O O O
apparatus O O O O
called O O O O
the O O O O
Por O O O O
secretion O O O O
system O O O O
( O O O O
PorSS O O O O
) O O O O
is O O O O
required O O O O
for O O O O
assembly O O O O
of O O O O
SprB O O O O
on O O O O
the O O O O
cell O O O O
surface O O O O
. O O O O
    
Genetic O O O O
and O O O O
molecular O O O O
analyses O O O O
revealed O O O O
that O O O O
sprB O O O O
is O O O O
part O O O O
of O O O O
a O O O O
seven O O O O
- O O O O
gene O O O O
operon O O O O
spanning O O O O
29 O O O O
. O O O O
3 O O O O
kbp O O O O
of O O O O
DNA O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
to O O O O
sprB O O O O
, O O O O
three O O O O
other O O O O
genes O O O O
of O O O O
this O O O O
operon O O O O
( O O O O
sprC O O O O
, O O O O
sprD O O O O
, O O O O
and O O O O
sprF O O O O
) O O O O
are O O O O
involved O O O O
in O O O O
gliding O O O O
. O O O O
    
Mutations O O O O
in O O O O
sprB O O O O
, O O O O
sprC O O O O
, O O O O
sprD O O O O
, O O O O
and O O O O
sprF O O O O
resulted O O O O
in O O O O
cells O O O O
that O O O O
failed O O O O
to O O O O
form O O O O
spreading O O O O
colonies O O O O
on O O O O
agar O O O O
but O O O O
that O O O O
exhibited O O O O
some O O O O
motility O O O O
on O O O O
glass O O O O
in O O O O
wet O O O O
mounts O O O O
. O O O O
    
SprF O O O O
exhibits O O O O
some O O O O
similarity O O O O
to O O O O
Porphyromonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
gingivalis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
PorP O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
required O O O O
for O O O O
secretion O O O O
of O O O O
gingipain O O O O
protease O O O O
virulence O O O O
factors O O O O
via O O O O
the O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gingivalis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
PorSS O O O O
. O O O O
    
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
johnsoniae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sprF O O O O
mutants O O O O
produced O O O O
SprB O O O O
protein O O O O
but O O O O
were O O O O
defective O O O O
in O O O O
localization O O O O
of O O O O
SprB O O O O
to O O O O
the O O O O
cell O O O O
surface O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
a O O O O
role O O O O
for O O O O
SprF O O O O
in O O O O
secretion O O O O
of O O O O
SprB O O O O
. O O O O
    
The O O O O
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
johnsoniae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
PorSS O O O O
is O O O O
involved O O O O
in O O O O
secretion O O O O
of O O O O
extracellular O O O O
chitinase O O O O
in O O O O
addition O O O O
to O O O O
its O O O O
role O O O O
in O O O O
secretion O O O O
of O O O O
SprB O O O O
. O O O O
    
SprF O O O O
was O O O O
not O O O O
needed O O O O
for O O O O
chitinase O O O O
secretion O O O O
and O O O O
may O O O O
be O O O O
specifically O O O O
required O O O O
for O O O O
SprB O O O O
secretion O O O O
by O O O O
the O O O O
PorSS O O O O
. O O O O
    
Cells O O O O
with O O O O
nonpolar O O O O
mutations O O O O
in O O O O
sprC O O O O
or O O O O
sprD O O O O
produced O O O O
and O O O O
secreted O O O O
SprB O O O O
and O O O O
propelled O O O O
it O O O O
rapidly O O O O
along O O O O
the O O O O
cell O O O O
surface O O O O
. O O O O
    
Multiple O O O O
paralogs O O O O
of O O O O
sprB O O O O
, O O O O
sprC O O O O
, O O O O
sprD O O O O
, O O O O
and O O O O
sprF O O O O
are O O O O
present O O O O
in O O O O
the O O O O
genome O O O O
, O O O O
which O O O O
may O O O O
explain O O O O
why O O O O
mutations O O O O
in O O O O
sprB O O O O
, O O O O
sprC O O O O
, O O O O
sprD O O O O
, O O O O
and O O O O
sprF O O O O
do O O O O
not O O O O
result O O O O
in O O O O
complete O O O O
loss O O O O
of O O O O
motility O O O O
and O O O O
suggests O O O O
the O O O O
possibility O O O O
that O O O O
semiredundant O O O O
SprB O O O O
- O O O O
like O O O O
adhesins O O O O
may O O O O
allow O O O O
movement O O O O
of O O O O
cells O O O O
over O O O O
different O O O O
surfaces O O O O
. O O O O
    
Perithecium O O O O
morphogenesis O O O O
in O O O O
Sordaria B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
macrospora O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
perithecium O O O O
of O O O O
the O O O O
self O O O O
- O O O O
fertile O O O O
ascomycete O O O O
Sordaria B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
macrospora O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
provides O O O O
an O O O O
excellent O O O O
model O O O O
in O O O O
which O O O O
to O O O O
analyse O O O O
fungal O O O O
multicellular O O O O
development O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
provides O O O O
a O O O O
detailed O O O O
analysis O O O O
of O O O O
perithecium O O O O
morphogenesis O O O O
in O O O O
the O O O O
wild O O O O
type O O O O
and O O O O
eight O O O O
developmental O O O O
mutants O O O O
of O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
macrospora O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
using O O O O
a O O O O
range O O O O
of O O O O
correlative O O O O
microscopical O O O O
techniques O O O O
. O O O O
    
Fundamentally O O O O
, O O O O
perithecia O O O O
and O O O O
other O O O O
complex O O O O
multicellular O O O O
structures O O O O
produced O O O O
by O O O O
fungi O O O O
arise O O O O
by O O O O
hyphal O O O O
aggregation O O O O
and O O O O
adhesion O O O O
, O O O O
and O O O O
these O O O O
processes O O O O
are O O O O
followed O O O O
by O O O O
specialization O O O O
and O O O O
septation O O O O
of O O O O
hyphal O O O O
compartments O O O O
within O O O O
the O O O O
aggregates O O O O
. O O O O
    
Perithecial O O O O
morphogenesis O O O O
can O O O O
be O O O O
divided O O O O
into O O O O
the O O O O
ascogonial O O O O
, O O O O
protoperithecial O O O O
, O O O O
and O O O O
perithecial O O O O
stages O O O O
of O O O O
development O O O O
. O O O O
    
At O O O O
least O O O O
13 O O O O
specialized O O O O
, O O O O
morphologically O O O O
distinct O O O O
cell O O O O
- O O O O
types O O O O
are O O O O
involved O O O O
in O O O O
perithecium O O O O
morphogenesis O O O O
, O O O O
and O O O O
these O O O O
fall O O O O
into O O O O
three O O O O
basic O O O O
classes O O O O
: O O O O
hyphae O O O O
, O O O O
conglutinate O O O O
cells O O O O
and O O O O
spores O O O O
. O O O O
    
Conglutinate O O O O
cells O O O O
arise O O O O
from O O O O
hyphal O O O O
adhesion O O O O
and O O O O
certain O O O O
perithecial O O O O
hyphae O O O O
develop O O O O
from O O O O
conglutinate O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Various O O O O
hypha O O O O
- O O O O
conglutinate O O O O
cell O O O O
transitions O O O O
play O O O O
important O O O O
roles O O O O
during O O O O
the O O O O
development O O O O
of O O O O
the O O O O
perithecial O O O O
wall O O O O
and O O O O
neck O O O O
. O O O O
    
Overexpression O O O O
of O O O O
the O O O O
trichodiene O O O O
synthase O O O O
gene O O O O
tri5 O O O O
increases O O O O
trichodermin O O O O
production O O O O
and O O O O
antimicrobial O O O O
activity O O O O
in O O O O
Trichoderma B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
brevicompactum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Trichoderma B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
brevicompactum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
produces O O O O
trichodermin O O O O
, O O O O
a O O O O
simple O O O O
trichothecene O O O O
- O O O O
type O O O O
toxin O O O O
that O O O O
shares O O O O
the O O O O
first O O O O
steps O O O O
of O O O O
the O O O O
sesquiterpene O O O O
biosynthetic O O O O
pathway O O O O
with O O O O
other O O O O
phytotoxic O O O O
trichothecenes O O O O
from O O O O
Fusarium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
spp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Trichodiene O O O O
synthase O O O O
catalyses O O O O
the O O O O
conversion O O O O
of O O O O
farnesyl O O O O
pyrophosphate O O O O
to O O O O
trichodiene O O O O
and O O O O
it O O O O
is O O O O
encoded O O O O
by O O O O
the O O O O
tri5 O O O O
gene O O O O
that O O O O
was O O O O
cloned O O O O
and O O O O
analysed O O O O
functionally O O O O
by O O O O
homologous O O O O
overexpression O O O O
in O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
brevicompactum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
tri5 O O O O
expression O O O O
was O O O O
up O O O O
- O O O O
regulated O O O O
in O O O O
media O O O O
with O O O O
glucose O O O O
, O O O O
H O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
O O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
or O O O O
glycerol O O O O
. O O O O
    
tri5 O O O O
repression O O O O
was O O O O
observed O O O O
in O O O O
cultures O O O O
supplemented O O O O
with O O O O
the O O O O
antioxidants O O O O
ferulic O O O O
acid O O O O
and O O O O
tyrosol O O O O
. O O O O
    
Acetone O O O O
extracts O O O O
of O O O O
tri5 O O O O
- O O O O
overexpressing O O O O
transformants O O O O
displayed O O O O
higher O O O O
antifungal O O O O
activity O O O O
than O O O O
those O O O O
from O O O O
the O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
. O O O O
    
Chromatographic O O O O
and O O O O
spectroscopic O O O O
analyses O O O O
revealed O O O O
that O O O O
tri5 O O O O
overexpression O O O O
led O O O O
to O O O O
an O O O O
increased O O O O
production O O O O
of O O O O
trichodermin O O O O
and O O O O
tyrosol O O O O
. O O O O
    
Agar O O O O
diffusion O O O O
assays O O O O
with O O O O
these O O O O
two O O O O
purified O O O O
metabolites O O O O
from O O O O
the O O O O
tri5 O O O O
- O O O O
overexpressing O O O O
transformant O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
brevicompactum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Tb41tri5 O O O O
showed O O O O
that O O O O
only O O O O
trichodermin O O O O
had O O O O
antifungal O O O O
activity O O O O
against O O O O
Saccharomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cerevisiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Kluyveromyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
marxianus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Candida B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Candida B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
glabrata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Candida B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tropicalis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
in O O O O
most O O O O
cases O O O O
such O O O O
activity O O O O
being O O O O
higher O O O O
than O O O O
that O O O O
observed O O O O
for O O O O
amphotericin O O O O
B O O O O
and O O O O
hygromycin O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
point O O O O
to O O O O
the O O O O
significant O O O O
role O O O O
of O O O O
tri5 O O O O
in O O O O
the O O O O
production O O O O
of O O O O
trichodermin O O O O
and O O O O
in O O O O
the O O O O
antifungal O O O O
activity O O O O
of O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
brevicompactum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Heterotrimeric O O O O
Galpha O O O O
protein O O O O
Pga1 O O O O
from O O O O
Penicillium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
chrysogenum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
triggers O O O O
germination O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
carbon O O O O
sources O O O O
and O O O O
affects O O O O
negatively O O O O
resistance O O O O
to O O O O
different O O O O
stress O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
Heterotrimeric O O O O
Galpha O O O O
protein O O O O
Pga1 O O O O
of O O O O
Penicillium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
chrysogenum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
controls O O O O
vegetative O O O O
growth O O O O
, O O O O
conidiation O O O O
and O O O O
secondary O O O O
metabolite O O O O
production O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
work O O O O
we O O O O
studied O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
Pga1 O O O O
in O O O O
spore O O O O
germination O O O O
and O O O O
resistance O O O O
to O O O O
different O O O O
stress O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
Strains B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
G203R O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
expressing O O O O
the O O O O
dominant O O O O
inactivating O O O O
pga1 O O O O
( O O O O
G203R O O O O
) O O O O
allele O O O O
) O O O O
and O O O O
Deltapga1 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
deleted O O O O
pga1 O O O O
) O O O O
showed O O O O
a O O O O
delayed O O O O
and O O O O
asynchronic O O O O
germination O O O O
pattern O O O O
, O O O O
and O O O O
a O O O O
decrease O O O O
in O O O O
the O O O O
percentage O O O O
of O O O O
germination O O O O
, O O O O
which O O O O
occurred O O O O
in O O O O
only O O O O
70 O O O O
- O O O O
80 O O O O
% O O O O
of O O O O
the O O O O
total O O O O
conidia O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
, O O O O
in O O O O
strains O O O O
expressing O O O O
the O O O O
dominant O O O O
activating O O O O
pga1 O O O O
( O O O O
G42R O O O O
) O O O O
allele O O O O
, O O O O
germination O O O O
occurred O O O O
at O O O O
earlier O O O O
times O O O O
and O O O O
in O O O O
100 O O O O
% O O O O
of O O O O
conidia O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
, O O O O
strains B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
with O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
the O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pga1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
G42R O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
allele O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
were O O O O
able O O O O
to O O O O
bypass O O O O
the O O O O
carbon O O O O
source O O O O
( O O O O
glucose O O O O
or O O O O
sucrose O O O O
) O O O O
requirement O O O O
for O O O O
germination O O O O
in O O O O
about O O O O
64 O O O O
% O O O O
of O O O O
conidia O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
Pga1 O O O O
plays O O O O
an O O O O
important O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
essential O O O O
, O O O O
role O O O O
in O O O O
germination O O O O
, O O O O
mediating O O O O
carbon O O O O
source O O O O
sensing O O O O
. O O O O
    
Regulation O O O O
of O O O O
germination O O O O
by O O O O
Pga1 O O O O
is O O O O
probably O O O O
mediated O O O O
by O O O O
cAMP O O O O
, O O O O
as O O O O
intracellular O O O O
levels O O O O
of O O O O
this O O O O
secondary O O O O
messenger O O O O
undergo O O O O
a O O O O
peak O O O O
before O O O O
the O O O O
onset O O O O
of O O O O
germination O O O O
only O O O O
in O O O O
strains B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
with O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
an O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
active O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Pga1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Pga1 O O O O
activity O O O O
is O O O O
also O O O O
a O O O O
determinant O O O O
factor O O O O
in O O O O
the O O O O
resistance O O O O
to O O O O
different O O O O
stress O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
Absence O O O O
or O O O O
inactivation O O O O
of O O O O
Pga1 O O O O
allow O O O O
growth O O O O
on O O O O
SDS O O O O
- O O O O
containing O O O O
minimal O O O O
medium O O O O
, O O O O
increase O O O O
resistance O O O O
of O O O O
conidia O O O O
to O O O O
thermal O O O O
and O O O O
oxidative O O O O
stress O O O O
, O O O O
and O O O O
increase O O O O
resistance O O O O
of O O O O
vegetative O O O O
mycelium O O O O
to O O O O
thermal O O O O
and O O O O
osmotic O O O O
stress O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
, O O O O
constitutive O O O O
activation O O O O
of O O O O
Pga1 O O O O
causes O O O O
a O O O O
decrease O O O O
in O O O O
the O O O O
resistance O O O O
of O O O O
conidia O O O O
to O O O O
thermal O O O O
stress O O O O
and O O O O
of O O O O
vegetative O O O O
mycelium O O O O
to O O O O
thermal O O O O
and O O O O
osmotic O O O O
stress O O O O
. O O O O
    
Together O O O O
with O O O O
our O O O O
previously O O O O
reported O O O O
results O O O O
, O O O O
we O O O O
show O O O O
in O O O O
this O O O O
work O O O O
that O O O O
Pga1 O O O O
plays O O O O
a O O O O
central O O O O
role O O O O
in O O O O
the O O O O
regulation O O O O
of O O O O
the O O O O
whole O O O O
growth O O O O
- O O O O
developmental O O O O
program O O O O
of O O O O
this O O O O
biotechnologically O O O O
important O O O O
fungus O O O O
. O O O O
    
Systemic O O O O
therapy O O O O
in O O O O
the O O O O
management O O O O
of O O O O
metastatic O O O O
or O O O O
locally O O O O
recurrent O O O O
adenoid O O O O
cystic O O O O
carcinoma O O O O
of O O O O
the O O O O
salivary O O O O
glands O O O O
: O O O O
a O O O O
systematic O O O O
review O O O O
. O O O O
    
Adenoid O O O O
cystic O O O O
carcinomas O O O O
( O O O O
ACC O O O O
) O O O O
are O O O O
rare O O O O
cancers O O O O
usually O O O O
arising O O O O
in O O O O
the O O O O
salivary O O O O
glands O O O O
. O O O O
    
Once O O O O
metastatic O O O O
, O O O O
the O O O O
natural O O O O
history O O O O
can O O O O
vary O O O O
; O O O O
some O O O O
patients O O O O
with O O O O
indolent O O O O
cancer O O O O
remain O O O O
asymptomatic O O O O
for O O O O
long O O O O
periods O O O O
, O O O O
whereas O O O O
others O O O O
have O O O O
rapidly O O O O
progressive O O O O
disease O O O O
. O O O O
    
Chemotherapy O O O O
is O O O O
generally O O O O
reserved O O O O
for O O O O
the O O O O
palliative O O O O
treatment O O O O
of O O O O
symptomatic O O O O
locally O O O O
recurrent O O O O
or O O O O
metastatic O O O O
disease O O O O
that O O O O
is O O O O
not O O O O
amenable O O O O
to O O O O
further O O O O
surgery O O O O
or O O O O
radiation O O O O
. O O O O
    
Prospective O O O O
trials O O O O
of O O O O
chemotherapy O O O O
in O O O O
advanced O O O O
ACC O O O O
are O O O O
limited O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
optimum O O O O
regimen O O O O
is O O O O
unclear O O O O
. O O O O
    
The O O O O
aim O O O O
of O O O O
this O O O O
systematic O O O O
review O O O O
is O O O O
to O O O O
summarise O O O O
and O O O O
rate O O O O
the O O O O
quality O O O O
of O O O O
trials O O O O
assessing O O O O
chemotherapy O O O O
for O O O O
treatment O O O O
of O O O O
ACC O O O O
, O O O O
by O O O O
use O O O O
of O O O O
the O O O O
European O O O O
Lung O O O O
Cancer O O O O
Working O O O O
Party O O O O
scoring O O O O
system O O O O
. O O O O
    
Endpoints O O O O
evaluated O O O O
include O O O O
tumour O O O O
response O O O O
and O O O O
rates O O O O
of O O O O
symptomatic O O O O
improvement O O O O
. O O O O
    
34 O O O O
trials O O O O
involving O O O O
441 O O O O
patients O O O O
are O O O O
included O O O O
. O O O O
    
We O O O O
give O O O O
evidence O O O O
- O O O O
based O O O O
recommendations O O O O
for O O O O
management O O O O
of O O O O
ACC O O O O
with O O O O
chemotherapy O O O O
, O O O O
along O O O O
with O O O O
considerations O O O O
for O O O O
the O O O O
design O O O O
of O O O O
future O O O O
clinical O O O O
trials O O O O
in O O O O
this O O O O
disease O O O O
. O O O O
    
Disrupted O O O O
energy O O O O
metabolism O O O O
and O O O O
neuronal O O O O
circuit O O O O
dysfunction O O O O
in O O O O
cognitive O O O O
impairment O O O O
and O O O O
Alzheimer O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
. O O O O
    
Epidemiological O O O O
, O O O O
neuropathological O O O O
, O O O O
and O O O O
functional O O O O
neuroimaging O O O O
evidence O O O O
implicates O O O O
global O O O O
and O O O O
regional O O O O
disruptions O O O O
in O O O O
brain O O O O
metabolism O O O O
and O O O O
energetics O O O O
in O O O O
the O O O O
pathogenesis O O O O
of O O O O
cognitive O O O O
impairment O O O O
. O O O O
    
Nerve O O O O
cell O O O O
microcircuits O O O O
are O O O O
modified O O O O
by O O O O
excitatory O O O O
and O O O O
inhibitory O O O O
synaptic O O O O
activity O O O O
and O O O O
neurotrophic O O O O
factors O O O O
. O O O O
    
Ageing O O O O
and O O O O
Alzheimer O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
cause O O O O
perturbations O O O O
in O O O O
cellular O O O O
energy O O O O
metabolism O O O O
, O O O O
level O O O O
of O O O O
excitation O O O O
or O O O O
inhibition O O O O
, O O O O
and O O O O
neurotrophic O O O O
factor O O O O
release O O O O
, O O O O
which O O O O
overwhelm O O O O
compensatory O O O O
mechanisms O O O O
and O O O O
result O O O O
in O O O O
dysfunction O O O O
of O O O O
neuronal O O O O
microcircuits O O O O
and O O O O
brain O O O O
networks O O O O
. O O O O
    
A O O O O
prolonged O O O O
positive O O O O
energy O O O O
balance O O O O
impairs O O O O
the O O O O
ability O O O O
of O O O O
neurons O O O O
to O O O O
adapt O O O O
to O O O O
oxidative O O O O
and O O O O
metabolic O O O O
stress O O O O
. O O O O
    
Results O O O O
from O O O O
experimental O O O O
studies O O O O
in O O O O
animals O O O O
show O O O O
how O O O O
disruptions O O O O
caused O O O O
by O O O O
chronic O O O O
positive O O O O
energy O O O O
balance O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
diabetes O O O O
, O O O O
lead O O O O
to O O O O
accelerated O O O O
cognitive O O O O
ageing O O O O
and O O O O
Alzheimer O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
. O O O O
    
Therapeutic O O O O
interventions O O O O
to O O O O
allay O O O O
cognitive O O O O
dysfunction O O O O
that O O O O
target O O O O
energy O O O O
metabolism O O O O
and O O O O
adaptive O O O O
stress O O O O
responses O O O O
( O O O O
such O O O O
as O O O O
neurotrophin O O O O
signalling O O O O
) O O O O
have O O O O
been O O O O
effective O O O O
in O O O O
animal O O O O
models O O O O
and O O O O
in O O O O
preliminary O O O O
studies O O O O
in O O O O
humans B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Behavioural O O O O
- O O O O
variant O O O O
frontotemporal O O O O
dementia O O O O
: O O O O
diagnosis O O O O
, O O O O
clinical O O O O
staging O O O O
, O O O O
and O O O O
management O O O O
. O O O O
    
Patients O O O O
with O O O O
behavioural O O O O
- O O O O
variant O O O O
frontotemporal O O O O
dementia O O O O
( O O O O
bvFTD O O O O
) O O O O
present O O O O
with O O O O
insidious O O O O
changes O O O O
in O O O O
personality O O O O
and O O O O
interpersonal O O O O
conduct O O O O
that O O O O
indicate O O O O
progressive O O O O
disintegration O O O O
of O O O O
the O O O O
neural O O O O
circuits O O O O
involved O O O O
in O O O O
social O O O O
cognition O O O O
, O O O O
emotion O O O O
regulation O O O O
, O O O O
motivation O O O O
, O O O O
and O O O O
decision O O O O
making O O O O
. O O O O
    
The O O O O
underlying O O O O
pathological O O O O
changes O O O O
are O O O O
heterogeneous O O O O
and O O O O
are O O O O
characterised O O O O
by O O O O
various O O O O
intraneuronal O O O O
inclusions O O O O
. O O O O
    
Biomarkers O O O O
to O O O O
detect O O O O
these O O O O
histopathological O O O O
changes O O O O
in O O O O
life O O O O
are O O O O
becoming O O O O
increasingly O O O O
important O O O O
with O O O O
the O O O O
development O O O O
of O O O O
disease O O O O
- O O O O
modifying O O O O
drugs O O O O
. O O O O
    
Gene O O O O
mutations O O O O
have O O O O
been O O O O
found O O O O
that O O O O
collectively O O O O
account O O O O
for O O O O
around O O O O
10 O O O O
- O O O O
20 O O O O
% O O O O
of O O O O
cases O O O O
. O O O O
    
Recently O O O O
, O O O O
criteria O O O O
proposed O O O O
for O O O O
bvFTD O O O O
define O O O O
three O O O O
levels O O O O
of O O O O
diagnostic O O O O
certainty O O O O
: O O O O
possible O O O O
, O O O O
probable O O O O
, O O O O
and O O O O
definite O O O O
. O O O O
    
Detailed O O O O
history O O O O
taking O O O O
from O O O O
family O O O O
members O O O O
to O O O O
elicit O O O O
behavioural O O O O
features O O O O
underpins O O O O
the O O O O
diagnostic O O O O
process O O O O
, O O O O
with O O O O
support O O O O
from O O O O
neuropsychological O O O O
testing O O O O
designed O O O O
to O O O O
detect O O O O
impairment O O O O
in O O O O
decision O O O O
making O O O O
, O O O O
emotion O O O O
processing O O O O
, O O O O
and O O O O
social O O O O
cognition O O O O
. O O O O
    
Brain O O O O
imaging O O O O
is O O O O
important O O O O
for O O O O
increasing O O O O
the O O O O
level O O O O
of O O O O
diagnostic O O O O
certainty O O O O
. O O O O
    
A O O O O
recently O O O O
developed O O O O
staging O O O O
instrument O O O O
shows O O O O
much O O O O
promise O O O O
for O O O O
monitoring O O O O
patients O O O O
and O O O O
evaluating O O O O
therapies O O O O
, O O O O
which O O O O
at O O O O
present O O O O
are O O O O
aimed O O O O
at O O O O
symptom O O O O
amelioration O O O O
. O O O O
    
Carer O O O O
education O O O O
and O O O O
support O O O O
remain O O O O
of O O O O
paramount O O O O
importance O O O O
. O O O O
    
Spiral O O O O
architecture O O O O
of O O O O
the O O O O
nucleoid O O O O
in O O O O
Bdellovibrio B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bacteriovorus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
We O O O O
present O O O O
a O O O O
cryo O O O O
- O O O O
electron O O O O
tomographic O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
three O O O O
- O O O O
dimensional O O O O
architecture O O O O
of O O O O
a O O O O
strain O O O O
of O O O O
the O O O O
Gram O O O O
- O O O O
negative O O O O
bacterium O O O O
Bdellovibrio B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bacteriovorus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
which O O O O
endogenous O O O O
MreB2 O O O O
was O O O O
replaced O O O O
with O O O O
monomeric O O O O
teal O O O O
fluorescent O O O O
protein O O O O
( O O O O
mTFP O O O O
) O O O O
- O O O O
labeled O O O O
MreB2 O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
to O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
Bdellovibrio O O O O
cells O O O O
that O O O O
predominantly O O O O
displayed O O O O
a O O O O
compact O O O O
nucleoid O O O O
region O O O O
, O O O O
cells O O O O
expressing O O O O
mTFP O O O O
- O O O O
labeled O O O O
MreB2 O O O O
displayed O O O O
a O O O O
twisted O O O O
spiral O O O O
organization O O O O
of O O O O
the O O O O
nucleoid O O O O
. O O O O
    
The O O O O
more O O O O
open O O O O
structure O O O O
of O O O O
the O O O O
MreB2 O O O O
- O O O O
mTFP O O O O
nucleoids O O O O
enabled O O O O
clear O O O O
in O O O O
situ O O O O
visualization O O O O
of O O O O
ribosomes O O O O
decorating O O O O
the O O O O
periphery O O O O
of O O O O
the O O O O
nucleoid O O O O
. O O O O
    
Ribosomes O O O O
also O O O O
bordered O O O O
the O O O O
edges O O O O
of O O O O
more O O O O
compact O O O O
nucleoids O O O O
from O O O O
both O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
cells O O O O
and O O O O
mutant O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Surprisingly O O O O
, O O O O
MreB2 O O O O
- O O O O
mTFP O O O O
localized O O O O
to O O O O
the O O O O
interface O O O O
between O O O O
the O O O O
spiral O O O O
nucleoid O O O O
and O O O O
the O O O O
cytoplasm O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
an O O O O
intimate O O O O
connection O O O O
between O O O O
nucleoid O O O O
architecture O O O O
and O O O O
MreB O O O O
arrangement O O O O
. O O O O
    
Further O O O O
, O O O O
in O O O O
contrast O O O O
to O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
cells O O O O
, O O O O
where O O O O
a O O O O
single O O O O
tight O O O O
chemoreceptor O O O O
cluster O O O O
localizes O O O O
close O O O O
to O O O O
the O O O O
single O O O O
polar O O O O
flagellum O O O O
, O O O O
MreB2 O O O O
- O O O O
mTFP O O O O
cells O O O O
often O O O O
displayed O O O O
extended O O O O
chemoreceptor O O O O
arrays O O O O
present O O O O
at O O O O
one O O O O
or O O O O
both O O O O
poles O O O O
and O O O O
displayed O O O O
multiple O O O O
or O O O O
inaccurately O O O O
positioned O O O O
flagella O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
findings O O O O
provide O O O O
direct O O O O
structural O O O O
evidence O O O O
for O O O O
spiral O O O O
organization O O O O
of O O O O
the O O O O
bacterial O O O O
nucleoid O O O O
and O O O O
suggest O O O O
a O O O O
possible O O O O
role O O O O
for O O O O
MreB O O O O
in O O O O
regulation O O O O
of O O O O
nucleoid O O O O
architecture O O O O
and O O O O
localization O O O O
of O O O O
the O O O O
chemotaxis O O O O
apparatus O O O O
. O O O O
    
A O O O O
transcriptional O O O O
regulator O O O O
and O O O O
ABC O O O O
transporters O O O O
link O O O O
stress O O O O
tolerance O O O O
, O O O O
( O O O O
p O O O O
) O O O O
ppGpp O O O O
, O O O O
and O O O O
genetic O O O O
competence O O O O
in O O O O
Streptococcus O O O O
mutans O O O O
. O O O O
    
Streptococcus O O O O
mutans O O O O
, O O O O
a O O O O
primary O O O O
agent O O O O
of O O O O
dental O O O O
caries O O O O
, O O O O
has O O O O
three O O O O
( O O O O
p O O O O
) O O O O
ppGpp O O O O
synthases O O O O
: O O O O
RelA O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
required O O O O
for O O O O
a O O O O
mupirocin O O O O
- O O O O
induced O O O O
stringent O O O O
response O O O O
; O O O O
RelP O O O O
, O O O O
which O O O O
produces O O O O
( O O O O
p O O O O
) O O O O
ppGpp O O O O
during O O O O
exponential O O O O
growth O O O O
and O O O O
is O O O O
regulated O O O O
by O O O O
the O O O O
RelRS O O O O
two O O O O
- O O O O
component O O O O
system O O O O
; O O O O
and O O O O
RelQ O O O O
. O O O O
    
Transcription O O O O
of O O O O
relPRS O O O O
and O O O O
a O O O O
gene O O O O
cluster O O O O
( O O O O
SMu0835 O O O O
to O O O O
SMu0837 O O O O
) O O O O
located O O O O
immediately O O O O
upstream O O O O
was O O O O
activated O O O O
in O O O O
cells O O O O
grown O O O O
with O O O O
aeration O O O O
and O O O O
during O O O O
a O O O O
stringent O O O O
response O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
Bioinformatic O O O O
analysis O O O O
predicted O O O O
that O O O O
SMu0836 O O O O
and O O O O
SMu0837 O O O O
encode O O O O
ABC O O O O
exporters O O O O
, O O O O
which O O O O
we O O O O
designated O O O O
rcrPQ O O O O
( O O O O
rel O O O O
competence O O O O
- O O O O
related O O O O
) O O O O
genes O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
SMu0835 O O O O
( O O O O
rcrR O O O O
) O O O O
encodes O O O O
a O O O O
MarR O O O O
family O O O O
transcriptional O O O O
regulator O O O O
. O O O O
    
Reverse O O O O
transcriptase O O O O
PCR O O O O
( O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
) O O O O
and O O O O
quantitative O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
analysis O O O O
showed O O O O
that O O O O
RcrR O O O O
functions O O O O
as O O O O
an O O O O
autogenous O O O O
negative O O O O
regulator O O O O
of O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
the O O O O
rcrRPQ O O O O
operon O O O O
. O O O O
    
A O O O O
mutant O O O O
in O O O O
which O O O O
a O O O O
polar O O O O
insertion O O O O
replaced O O O O
the O O O O
SMu836 O O O O
gene O O O O
( O O O O
Delta836polar O O O O
) O O O O
grew O O O O
more O O O O
slowly O O O O
and O O O O
had O O O O
final O O O O
yields O O O O
that O O O O
were O O O O
lower O O O O
than O O O O
those O O O O
of O O O O
the O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
strain O O O O
. O O O O
    
Likewise O O O O
, O O O O
the O O O O
Delta836polar O O O O
strain O O O O
had O O O O
an O O O O
impaired O O O O
capacity O O O O
to O O O O
form O O O O
biofilms O O O O
, O O O O
grew O O O O
poorly O O O O
at O O O O
pH O O O O
5 O O O O
. O O O O
5 O O O O
, O O O O
and O O O O
was O O O O
more O O O O
sensitive O O O O
to O O O O
oxidative O O O O
stressors O O O O
. O O O O
    
Optimal O O O O
expression O O O O
of O O O O
rcrPQ O O O O
required O O O O
RelP O O O O
and O O O O
vice O O O O
versa O O O O
. O O O O
    
Replacement O O O O
of O O O O
rcrR O O O O
with O O O O
a O O O O
nonpolar O O O O
antibiotic O O O O
resistance O O O O
marker O O O O
( O O O O
Delta835np O O O O
) O O O O
, O O O O
which O O O O
leads O O O O
to O O O O
overexpression O O O O
of O O O O
rcrPQ O O O O
, O O O O
yielded O O O O
a O O O O
strain O O O O
that O O O O
was O O O O
not O O O O
transformable O O O O
with O O O O
exogenous O O O O
DNA O O O O
. O O O O
    
Transcriptional O O O O
analysis O O O O
revealed O O O O
that O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
comYA O O O O
and O O O O
comX O O O O
was O O O O
dramatically O O O O
altered O O O O
in O O O O
the O O O O
Delta835np O O O O
and O O O O
Delta836polar O O O O
mutants O O O O
. O O O O
    
Collectively O O O O
, O O O O
the O O O O
data O O O O
support O O O O
the O O O O
suggestion O O O O
that O O O O
the O O O O
rcrRPQ O O O O
gene O O O O
products O O O O
play O O O O
a O O O O
critical O O O O
role O O O O
in O O O O
physiologic O O O O
homeostasis O O O O
and O O O O
stress O O O O
tolerance O O O O
by O O O O
linking O O O O
( O O O O
p O O O O
) O O O O
ppGpp O O O O
metabolism O O O O
, O O O O
acid O O O O
and O O O O
oxidative O O O O
stress O O O O
tolerance O O O O
, O O O O
and O O O O
genetic O O O O
competence O O O O
. O O O O
    
Mapping O O O O
functional O O O O
domains O O O O
of O O O O
colicin O O O O
M O O O O
. O O O O
    
Colicin O O O O
M O O O O
( O O O O
Cma O O O O
) O O O O
lyses O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cells O O O O
by O O O O
inhibiting O O O O
murein O O O O
biosynthesis O O O O
through O O O O
hydrolysis O O O O
of O O O O
the O O O O
phosphate O O O O
ester O O O O
between O O O O
C O O O O
( O O O O
55 O O O O
) O O O O
- O O O O
polyisoprenol O O O O
and O O O O
N O O O O
- O O O O
acetylmuramyl O O O O
( O O O O
MurNAc O O O O
) O O O O
- O O O O
pentapeptide O O O O
- O O O O
GlcNAc O O O O
in O O O O
the O O O O
periplasm O O O O
. O O O O
    
To O O O O
identify O O O O
Cma O O O O
functional O O O O
domains O O O O
, O O O O
we O O O O
isolated O O O O
54 O O O O
point O O O O
mutants O O O O
and O O O O
small O O O O
deletion O O O O
mutants O O O O
and O O O O
examined O O O O
their O O O O
cytotoxicity O O O O
levels O O O O
. O O O O
    
Activity O O O O
and O O O O
uptake O O O O
mutants O O O O
were O O O O
distinguished O O O O
by O O O O
osmotic O O O O
shock O O O O
, O O O O
which O O O O
transfers O O O O
Cma O O O O
into O O O O
the O O O O
periplasm O O O O
independent O O O O
of O O O O
the O O O O
specific O O O O
FhuA O O O O
receptor O O O O
and O O O O
the O O O O
Ton O O O O
system O O O O
. O O O O
    
Deletion O O O O
of O O O O
the O O O O
hydrophobic O O O O
helix O O O O
alpha1 O O O O
, O O O O
which O O O O
extends O O O O
from O O O O
the O O O O
compact O O O O
Cma O O O O
structure O O O O
, O O O O
abolished O O O O
interference O O O O
with O O O O
the O O O O
antibiotic O O O O
albomycin O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
transported O O O O
across O O O O
the O O O O
outer O O O O
membrane O O O O
by O O O O
the O O O O
same O O O O
system O O O O
as O O O O
Cma O O O O
, O O O O
thereby O O O O
identifying O O O O
alpha1 O O O O
as O O O O
the O O O O
Cma O O O O
site O O O O
that O O O O
binds O O O O
to O O O O
FhuA O O O O
. O O O O
    
Deletion O O O O
of O O O O
the O O O O
C O O O O
- O O O O
terminal O O O O
Lys O O O O
- O O O O
Arg O O O O
strongly O O O O
reduced O O O O
Cma O O O O
translocation O O O O
across O O O O
the O O O O
outer O O O O
membrane O O O O
after O O O O
binding O O O O
to O O O O
FhuA O O O O
. O O O O
    
Conversion O O O O
of O O O O
Asp226 O O O O
to O O O O
Glu O O O O
, O O O O
Asn O O O O
, O O O O
or O O O O
Ala O O O O
inactivated O O O O
Cma O O O O
. O O O O
    
Asp226 O O O O
is O O O O
exposed O O O O
at O O O O
the O O O O
Cma O O O O
surface O O O O
and O O O O
is O O O O
surrounded O O O O
by O O O O
Asp225 O O O O
, O O O O
Asp229 O O O O
, O O O O
His235 O O O O
, O O O O
Tyr228 O O O O
, O O O O
and O O O O
Arg236 O O O O
; O O O O
replacement O O O O
of O O O O
each O O O O
with O O O O
alanine O O O O
inactivated O O O O
Cma O O O O
. O O O O
    
We O O O O
propose O O O O
that O O O O
Asp226 O O O O
directly O O O O
participates O O O O
in O O O O
phosphate O O O O
ester O O O O
hydrolysis O O O O
and O O O O
that O O O O
the O O O O
surrounding O O O O
residues O O O O
contribute O O O O
to O O O O
the O O O O
active O O O O
site O O O O
. O O O O
    
These O O O O
residues O O O O
are O O O O
strongly O O O O
conserved O O O O
in O O O O
Cma O O O O
- O O O O
like O O O O
proteins O O O O
of O O O O
other O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Replacement O O O O
of O O O O
other O O O O
conserved O O O O
residues O O O O
with O O O O
alanine O O O O
inactivated O O O O
Cma O O O O
; O O O O
these O O O O
mutations O O O O
probably O O O O
altered O O O O
the O O O O
Cma O O O O
structure O O O O
, O O O O
as O O O O
particularly O O O O
apparent O O O O
for O O O O
mutants O O O O
in O O O O
the O O O O
unique O O O O
open O O O O
Beta O O O O
- O O O O
barrel O O O O
of O O O O
Cma O O O O
, O O O O
which O O O O
were O O O O
isolated O O O O
in O O O O
lower O O O O
yields O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
identify O O O O
regions O O O O
in O O O O
Cma O O O O
responsible O O O O
for O O O O
uptake O O O O
and O O O O
activity O O O O
and O O O O
support O O O O
the O O O O
concept O O O O
of O O O O
a O O O O
three O O O O
- O O O O
domain O O O O
arrangement O O O O
of O O O O
Cma O O O O
. O O O O
    
The O O O O
recombinase O O O O
IntA O O O O
is O O O O
required O O O O
for O O O O
excision O O O O
of O O O O
esp O O O O
- O O O O
containing O O O O
ICEEfm1 O O O O
in O O O O
Enterococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
faecium O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Comparative O O O O
genome O O O O
analysis O O O O
of O O O O
Enterococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
faecium O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
recently O O O O
revealed O O O O
that O O O O
a O O O O
genomic O O O O
island O O O O
containing O O O O
the O O O O
esp O O O O
gene O O O O
, O O O O
referred O O O O
to O O O O
as O O O O
the O O O O
esp O O O O
- O O O O
containing O O O O
pathogenicity O O O O
island O O O O
( O O O O
esp O O O O
PAI O O O O
) O O O O
, O O O O
can O O O O
be O O O O
transferred O O O O
by O O O O
conjugation O O O O
and O O O O
contains O O O O
a O O O O
partial O O O O
Tn916 O O O O
- O O O O
like O O O O
element O O O O
and O O O O
an O O O O
integrase O O O O
gene O O O O
, O O O O
intA O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
characterize O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
intA O O O O
in O O O O
the O O O O
excision O O O O
of O O O O
the O O O O
esp O O O O
PAI O O O O
. O O O O
    
An O O O O
intA O O O O
insertion O O O O
- O O O O
deletion O O O O
mutant O O O O
in O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
faecium O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
E1162 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
E1162DeltaintA B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
was O O O O
constructed O O O O
and O O O O
in O O O O
trans O O O O
complemented O O O O
with O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
intA O O O O
( O O O O
E1162DeltaintA B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
: O O O O
: O O O O
pEF30 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Circular O O O O
intermediates O O O O
( O O O O
CI O O O O
) O O O O
of O O O O
excised O O O O
esp O O O O
PAI O O O O
were O O O O
determined O O O O
using O O O O
inverse O O O O
PCR O O O O
analysis O O O O
on O O O O
purified O O O O
chromosomal O O O O
DNA O O O O
from O O O O
strains O O O O
E1162 O O O O
, O O O O
E1162Deltaesp O O O O
, O O O O
E1162DeltaintA O O O O
, O O O O
and O O O O
E1162DeltaintA O O O O
: O O O O
: O O O O
pEF30 O O O O
. O O O O
    
In O O O O
E1162 O O O O
and O O O O
E1162Deltaesp O O O O
, O O O O
CI O O O O
of O O O O
the O O O O
esp O O O O
PAI O O O O
were O O O O
detected O O O O
. O O O O
    
No O O O O
CI O O O O
were O O O O
detected O O O O
in O O O O
E1162DeltaintA O O O O
, O O O O
while O O O O
in O O O O
the O O O O
complemented O O O O
strain O O O O
E1162DeltaintA O O O O
: O O O O
: O O O O
pEF30 O O O O
CI O O O O
formation O O O O
was O O O O
restored O O O O
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
intA O O O O
is O O O O
essential O O O O
for O O O O
excision O O O O
and O O O O
subsequent O O O O
mobilization O O O O
of O O O O
the O O O O
esp O O O O
- O O O O
containing O O O O
genomic O O O O
island O O O O
in O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
faecium O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Based O O O O
on O O O O
the O O O O
fact O O O O
that O O O O
this O O O O
island O O O O
can O O O O
be O O O O
mobilized O O O O
and O O O O
is O O O O
self O O O O
- O O O O
transmissible O O O O
, O O O O
we O O O O
propose O O O O
to O O O O
change O O O O
the O O O O
name O O O O
of O O O O
the O O O O
esp O O O O
PAI O O O O
to O O O O
ICEEfm1 O O O O
. O O O O
    
Functional O O O O
and O O O O
phylogenetic O O O O
analysis O O O O
of O O O O
ureD O O O O
in O O O O
Shiga O O O O
toxin O O O O
- O O O O
producing O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Enterohemorrhagic O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
EHEC B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
is O O O O
a O O O O
food O O O O
- O O O O
borne O O O O
pathogen O O O O
that O O O O
can O O O O
cause O O O O
severe O O O O
health O O O O
complications O O O O
and O O O O
utilizes O O O O
a O O O O
much O O O O
lower O O O O
infectious O O O O
dose O O O O
than O O O O
other O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pathotypes O O O O
. O O O O
    
Despite O O O O
having O O O O
an O O O O
intact O O O O
ure O O O O
locus O O O O
, O O O O
ureDABCEFG O O O O
, O O O O
the O O O O
majority O O O O
of O O O O
EHEC B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
strains O O O O
are O O O O
phenotypically O O O O
urease O O O O
negative O O O O
under O O O O
tested O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
Urease O O O O
activity O O O O
potentially O O O O
assists O O O O
with O O O O
survival O O O O
fitness O O O O
by O O O O
enhancing O O O O
acid O O O O
tolerance O O O O
during O O O O
passage O O O O
through O O O O
the O O O O
stomach O O O O
or O O O O
by O O O O
aiding O O O O
with O O O O
colonization O O O O
in O O O O
either O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
or O O O O
animal O O O O
reservoirs O O O O
. O O O O
    
Previously O O O O
, O O O O
in O O O O
the O O O O
EHEC B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
O157 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
: O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H7 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Sakai O O O O
strain O O O O
, O O O O
a O O O O
point O O O O
mutation O O O O
in O O O O
ureD O O O O
, O O O O
encoding O O O O
a O O O O
urease O O O O
chaperone O O O O
protein O O O O
, O O O O
was O O O O
identified O O O O
, O O O O
resulting O O O O
in O O O O
a O O O O
substitution O O O O
of O O O O
an O O O O
amber O O O O
stop O O O O
codon O O O O
for O O O O
glutamine O O O O
. O O O O
    
This O O O O
single O O O O
nucleotide O O O O
polymorphism O O O O
( O O O O
SNP O O O O
) O O O O
is O O O O
observed O O O O
in O O O O
the O O O O
majority O O O O
of O O O O
EHEC B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
O157 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
: O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H7 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
isolates O O O O
and O O O O
correlates O O O O
with O O O O
a O O O O
negative O O O O
urease O O O O
phenotype O O O O
in O O O O
vitro O O O O
. O O O O
    
We O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
the O O O O
lack O O O O
of O O O O
urease O O O O
activity O O O O
in O O O O
vitro O O O O
is O O O O
not O O O O
solely O O O O
due O O O O
to O O O O
the O O O O
amber O O O O
codon O O O O
in O O O O
ureD O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
analysis O O O O
has O O O O
identified O O O O
two O O O O
additional O O O O
SNPs O O O O
in O O O O
ureD O O O O
affecting O O O O
amino O O O O
acid O O O O
positions O O O O
38 O O O O
and O O O O
205 O O O O
, O O O O
in O O O O
both O O O O
cases O O O O
determining O O O O
whether O O O O
the O O O O
encoded O O O O
amino O O O O
acid O O O O
is O O O O
leucine O O O O
or O O O O
proline O O O O
. O O O O
    
Phylogenetic O O O O
analysis O O O O
based O O O O
on O O O O
Ure O O O O
protein O O O O
sequences O O O O
from O O O O
a O O O O
variety O O O O
of O O O O
urease O O O O
- O O O O
encoding O O O O
bacteria O O O O
demonstrates O O O O
that O O O O
the O O O O
proline O O O O
at O O O O
position O O O O
38 O O O O
is O O O O
highly O O O O
conserved O O O O
among O O O O
Gram O O O O
- O O O O
negative O O O O
bacteria O O O O
. O O O O
    
Experiments O O O O
reveal O O O O
that O O O O
the O O O O
L38P O O O O
substitution O O O O
enhances O O O O
urease O O O O
enzyme O O O O
activity O O O O
; O O O O
however O O O O
, O O O O
the O O O O
L205P O O O O
substitution O O O O
does O O O O
not O O O O
. O O O O
    
Multilocus O O O O
sequence O O O O
typing O O O O
analysis O O O O
for O O O O
a O O O O
variety O O O O
of O O O O
Shiga O O O O
toxin O O O O
- O O O O
producing O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
isolates O O O O
combined O O O O
with O O O O
the O O O O
ureD O O O O
sequence O O O O
reveals O O O O
that O O O O
except O O O O
for O O O O
a O O O O
subset O O O O
of O O O O
the O O O O
O157 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
: O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H7 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strains O O O O
, O O O O
neither O O O O
the O O O O
in O O O O
vitro O O O O
urease O O O O
- O O O O
positive O O O O
phenotype O O O O
nor O O O O
the O O O O
ureD O O O O
sequence O O O O
is O O O O
phylogenetically O O O O
restricted O O O O
. O O O O
    
Genome O O O O
- O O O O
wide O O O O
identification O O O O
of O O O O
Mycobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tuberculosis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
exported O O O O
proteins O O O O
with O O O O
roles O O O O
in O O O O
intracellular O O O O
growth O O O O
. O O O O
    
The O O O O
exported O O O O
proteins O O O O
of O O O O
Mycobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tuberculosis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
that O O O O
are O O O O
localized O O O O
at O O O O
the O O O O
bacterial O O O O
cell O O O O
surface O O O O
or O O O O
secreted O O O O
into O O O O
the O O O O
environment O O O O
are O O O O
ideally O O O O
situated O O O O
to O O O O
interact O O O O
with O O O O
host O O O O
factors O O O O
and O O O O
to O O O O
function O O O O
in O O O O
virulence O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
constructed O O O O
a O O O O
novel O O O O
Beta O O O O
- O O O O
lactamase O O O O
reporter O O O O
transposon O O O O
and O O O O
used O O O O
it O O O O
directly O O O O
in O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tuberculosis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
for O O O O
genome O O O O
- O O O O
wide O O O O
identification O O O O
of O O O O
exported O O O O
proteins O O O O
. O O O O
    
From O O O O
177 O O O O
Beta O O O O
- O O O O
lactam O O O O
- O O O O
resistant O O O O
transposon O O O O
mutants O O O O
, O O O O
we O O O O
identified O O O O
111 O O O O
different O O O O
exported O O O O
proteins O O O O
. O O O O
    
The O O O O
majority O O O O
of O O O O
these O O O O
proteins O O O O
have O O O O
no O O O O
known O O O O
function O O O O
, O O O O
and O O O O
for O O O O
nearly O O O O
half O O O O
of O O O O
the O O O O
proteins O O O O
, O O O O
our O O O O
demonstration O O O O
that O O O O
they O O O O
are O O O O
exported O O O O
when O O O O
fused O O O O
to O O O O
a O O O O
Beta O O O O
- O O O O
lactamase O O O O
reporter O O O O
is O O O O
the O O O O
first O O O O
experimental O O O O
proof O O O O
of O O O O
their O O O O
extracytoplasmic O O O O
localization O O O O
. O O O O
    
The O O O O
transposon O O O O
mutants O O O O
in O O O O
our O O O O
banked O O O O
library O O O O
were O O O O
of O O O O
further O O O O
value O O O O
as O O O O
a O O O O
collection O O O O
of O O O O
mutants O O O O
lacking O O O O
individual O O O O
exported O O O O
proteins O O O O
. O O O O
    
By O O O O
individually O O O O
testing O O O O
each O O O O
of O O O O
111 O O O O
mutants O O O O
for O O O O
growth O O O O
in O O O O
macrophages O O O O
, O O O O
six O O O O
attenuated O O O O
mutants O O O O
with O O O O
insertions O O O O
in O O O O
mce1A O O O O
, O O O O
mce1B O O O O
, O O O O
mce2F O O O O
, O O O O
rv0199 O O O O
, O O O O
ctaC O O O O
, O O O O
and O O O O
lppX O O O O
were O O O O
identified O O O O
. O O O O
    
Given O O O O
that O O O O
much O O O O
of O O O O
the O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tuberculosis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
genome O O O O
encodes O O O O
proteins O O O O
of O O O O
unknown O O O O
function O O O O
, O O O O
our O O O O
library O O O O
of O O O O
mapped O O O O
transposon O O O O
mutants O O O O
is O O O O
a O O O O
valuable O O O O
resource O O O O
for O O O O
efforts O O O O
in O O O O
functional O O O O
genomics O O O O
. O O O O
    
This O O O O
work O O O O
also O O O O
demonstrates O O O O
the O O O O
power O O O O
of O O O O
a O O O O
Beta O O O O
- O O O O
lactamase O O O O
reporter O O O O
transposon O O O O
that O O O O
could O O O O
be O O O O
applied O O O O
similarly O O O O
to O O O O
other O O O O
bacterial O O O O
pathogens O O O O
. O O O O
    
Maternal O O O O
influence O O O O
on O O O O
philopatry O O O O
and O O O O
space O O O O
use O O O O
by O O O O
juvenile O O O O
brushtail O O O O
possums O O O O
( O O O O
Trichosurus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
vulpecula O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
causes O O O O
of O O O O
juvenile O O O O
sex O O O O
- O O O O
biased O O O O
philopatry O O O O
and O O O O
space O O O O
use O O O O
in O O O O
mammals O O O O
remain O O O O
poorly O O O O
understood O O O O
, O O O O
and O O O O
results O O O O
of O O O O
previous O O O O
research O O O O
have O O O O
been O O O O
conflicting O O O O
. O O O O
    
Experimental O O O O
interventions O O O O
and O O O O
manipulations O O O O
on O O O O
wild O O O O
populations O O O O
are O O O O
rare O O O O
, O O O O
but O O O O
can O O O O
play O O O O
an O O O O
important O O O O
role O O O O
in O O O O
establishing O O O O
the O O O O
factors O O O O
governing O O O O
offspring O O O O
space O O O O
use O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
experimentally O O O O
removed O O O O
mothers O O O O
of O O O O
independent O O O O
juvenile O O O O
brushtail O O O O
possums O O O O
from O O O O
the O O O O
maternal O O O O
home O O O O
range O O O O
and O O O O
examined O O O O
changes O O O O
in O O O O
offspring O O O O
space O O O O
use O O O O
with O O O O
global O O O O
positioning O O O O
system O O O O
collars O O O O
. O O O O
    
We O O O O
examined O O O O
the O O O O
influence O O O O
of O O O O
mother O O O O
absence O O O O
on O O O O
philopatric O O O O
behaviour O O O O
, O O O O
and O O O O
determined O O O O
whether O O O O
or O O O O
not O O O O
maternal O O O O
presence O O O O
affected O O O O
offspring O O O O
space O O O O
use O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
fitted O O O O
a O O O O
longitudinal O O O O
linear O O O O
mixed O O O O
effects O O O O
model O O O O
to O O O O
demonstrate O O O O
a O O O O
change O O O O
over O O O O
time O O O O
in O O O O
the O O O O
home O O O O
range O O O O
size O O O O
of O O O O
juveniles O O O O
following O O O O
experimental O O O O
treatment O O O O
by O O O O
the O O O O
removal O O O O
of O O O O
their O O O O
mothers O O O O
. O O O O
    
When O O O O
mothers O O O O
were O O O O
removed O O O O
from O O O O
the O O O O
natal O O O O
range O O O O
, O O O O
juveniles O O O O
occupied O O O O
significantly O O O O
larger O O O O
home O O O O
range O O O O
areas O O O O
, O O O O
with O O O O
average O O O O
increases O O O O
of O O O O
175 O O O O
% O O O O
in O O O O
95 O O O O
% O O O O
kernel O O O O
density O O O O
estimates O O O O
and O O O O
289 O O O O
% O O O O
in O O O O
minimum O O O O
convex O O O O
polygon O O O O
estimates O O O O
. O O O O
    
This O O O O
increase O O O O
occurred O O O O
within O O O O
the O O O O
first O O O O
month O O O O
following O O O O
mother O O O O
absence O O O O
and O O O O
was O O O O
independent O O O O
of O O O O
juvenile O O O O
sex O O O O
. O O O O
    
Home O O O O
ranges O O O O
of O O O O
control O O O O
juveniles O O O O
did O O O O
not O O O O
change O O O O
during O O O O
the O O O O
same O O O O
time O O O O
period O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Changes O O O O
in O O O O
the O O O O
spatial O O O O
structure O O O O
of O O O O
mammalian O O O O
populations O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
removal O O O O
of O O O O
individuals O O O O
have O O O O
important O O O O
implications O O O O
for O O O O
pest O O O O
management O O O O
. O O O O
    
The O O O O
impacts O O O O
of O O O O
management O O O O
strategies O O O O
which O O O O
target O O O O
particular O O O O
individuals O O O O
in O O O O
a O O O O
population O O O O
may O O O O
counteract O O O O
conservation O O O O
benefits O O O O
through O O O O
their O O O O
effect O O O O
on O O O O
the O O O O
space O O O O
use O O O O
of O O O O
survivors O O O O
. O O O O
    
Studies O O O O
involving O O O O
experimental O O O O
removals O O O O
provide O O O O
important O O O O
information O O O O
on O O O O
consequences O O O O
of O O O O
control O O O O
and O O O O
also O O O O
yield O O O O
insights O O O O
into O O O O
the O O O O
causes O O O O
of O O O O
mammalian O O O O
space O O O O
use O O O O
, O O O O
philopatric O O O O
behaviours O O O O
and O O O O
ultimately O O O O
dispersal O O O O
. O O O O
    
Competitive O O O O
interactions O O O O
shape O O O O
offspring O O O O
performance O O O O
in O O O O
relation O O O O
to O O O O
seasonal O O O O
timing O O O O
of O O O O
emergence O O O O
in O O O O
Atlantic B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
salmon O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Timing O O O O
of O O O O
birth O O O O
/ O O O O
hatching O O O O
may O O O O
have O O O O
strong O O O O
effects O O O O
on O O O O
offspring O O O O
fitness O O O O
. O O O O
    
Breeding O O O O
time O O O O
is O O O O
generally O O O O
considered O O O O
to O O O O
have O O O O
evolved O O O O
to O O O O
match O O O O
offspring O O O O
arrival O O O O
with O O O O
optimal O O O O
seasonal O O O O
environmental O O O O
conditions O O O O
, O O O O
though O O O O
this O O O O
is O O O O
rarely O O O O
tested O O O O
experimentally O O O O
and O O O O
factors O O O O
shaping O O O O
the O O O O
relations O O O O
between O O O O
timing O O O O
of O O O O
birth O O O O
and O O O O
reproductive O O O O
success O O O O
are O O O O
often O O O O
poorly O O O O
understood O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
By O O O O
manipulating O O O O
incubation O O O O
temperature O O O O
of O O O O
Atlantic B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
salmon O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
embryos O O O O
, O O O O
and O O O O
hence O O O O
controlling O O O O
for O O O O
maternal O O O O
and O O O O
genetic O O O O
effects O O O O
, O O O O
we O O O O
obtained O O O O
offspring O O O O
emerging O O O O
from O O O O
nests O O O O
prior O O O O
to O O O O
( O O O O
accelerated O O O O
) O O O O
, O O O O
during O O O O
and O O O O
after O O O O
( O O O O
decelerated O O O O
) O O O O
normal O O O O
emergence O O O O
times O O O O
, O O O O
and O O O O
accordingly O O O O
experienced O O O O
widely O O O O
different O O O O
seasonal O O O O
environmental O O O O
conditions O O O O
at O O O O
emergence O O O O
( O O O O
stream O O O O
temperature O O O O
range O O O O
4 O O O O
- O O O O
16 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
accelerated O O O O
group O O O O
emerged O O O O
at O O O O
temperatures O O O O
that O O O O
are O O O O
generally O O O O
considered O O O O
to O O O O
be O O O O
highly O O O O
sub O O O O
- O O O O
optimal O O O O
for O O O O
growth O O O O
and O O O O
likely O O O O
imposes O O O O
strong O O O O
constraints O O O O
on O O O O
feeding O O O O
and O O O O
activity O O O O
, O O O O
and O O O O
during O O O O
a O O O O
peak O O O O
in O O O O
water O O O O
discharge O O O O
which O O O O
is O O O O
expected O O O O
to O O O O
negatively O O O O
influence O O O O
habitat O O O O
availability O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
wild O O O O
, O O O O
overall O O O O
mortality O O O O
during O O O O
the O O O O
period O O O O
after O O O O
emergence O O O O
was O O O O
79 O O O O
% O O O O
, O O O O
and O O O O
was O O O O
significantly O O O O
affected O O O O
by O O O O
both O O O O
release O O O O
density O O O O
and O O O O
emergence O O O O
timing O O O O
. O O O O
    
Accelerated O O O O
offspring O O O O
, O O O O
which O O O O
emerged O O O O
earliest O O O O
and O O O O
experienced O O O O
the O O O O
harshest O O O O
environmental O O O O
conditions O O O O
, O O O O
had O O O O
both O O O O
highest O O O O
survival O O O O
and O O O O
largest O O O O
final O O O O
body O O O O
size O O O O
. O O O O
    
The O O O O
effect O O O O
was O O O O
particularly O O O O
strong O O O O
at O O O O
the O O O O
high O O O O
density O O O O
release O O O O
site O O O O
, O O O O
where O O O O
survival O O O O
of O O O O
accelerated O O O O
offspring O O O O
was O O O O
significantly O O O O
higher O O O O
than O O O O
both O O O O
the O O O O
normal O O O O
and O O O O
decelerated O O O O
groups O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
In O O O O
more O O O O
controlled O O O O
semi O O O O
- O O O O
natural O O O O
environments O O O O
, O O O O
all O O O O
developmental O O O O
groups O O O O
were O O O O
able O O O O
to O O O O
perform O O O O
well O O O O
, O O O O
but O O O O
accelerated O O O O
offspring O O O O
had O O O O
a O O O O
relatively O O O O
better O O O O
performance O O O O
than O O O O
the O O O O
later O O O O
emerging O O O O
offspring O O O O
when O O O O
density O O O O
was O O O O
high O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
the O O O O
relative O O O O
performance O O O O
of O O O O
the O O O O
different O O O O
groups O O O O
was O O O O
not O O O O
sensitive O O O O
to O O O O
water O O O O
discharge O O O O
regimes O O O O
( O O O O
temporally O O O O
stable O O O O
vs O O O O
. O O O O
fluctuating O O O O
) O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
the O O O O
performance O O O O
of O O O O
offspring O O O O
in O O O O
relation O O O O
to O O O O
seasonal O O O O
timing O O O O
of O O O O
emergence O O O O
is O O O O
highly O O O O
affected O O O O
by O O O O
competitive O O O O
interactions O O O O
in O O O O
Atlantic B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
salmon O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Although O O O O
a O O O O
match O O O O
between O O O O
phenology O O O O
and O O O O
optimal O O O O
seasonal O O O O
environmental O O O O
conditions O O O O
may O O O O
be O O O O
highly O O O O
important O O O O
for O O O O
organisms O O O O
depending O O O O
on O O O O
specific O O O O
resources O O O O
that O O O O
are O O O O
only O O O O
available O O O O
during O O O O
a O O O O
limited O O O O
period O O O O
of O O O O
the O O O O
season O O O O
, O O O O
such O O O O
resources O O O O
may O O O O
be O O O O
available O O O O
in O O O O
variable O O O O
amounts O O O O
year O O O O
around O O O O
for O O O O
many O O O O
organisms O O O O
. O O O O
    
For O O O O
these O O O O
, O O O O
offspring O O O O
success O O O O
may O O O O
to O O O O
a O O O O
larger O O O O
degree O O O O
be O O O O
shaped O O O O
by O O O O
the O O O O
timing O O O O
of O O O O
their O O O O
hatching O O O O
/ O O O O
birth O O O O
relative O O O O
to O O O O
each O O O O
other O O O O
, O O O O
and O O O O
particularly O O O O
so O O O O
under O O O O
high O O O O
population O O O O
densities O O O O
. O O O O
    
Disentangling O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
predator O O O O
hunting O O O O
mode O O O O
and O O O O
habitat O O O O
domain O O O O
on O O O O
the O O O O
top O O O O
- O O O O
down O O O O
control O O O O
of O O O O
insect O O O O
herbivores O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Polyphagous O O O O
predatory O O O O
invertebrates O O O O
play O O O O
a O O O O
key O O O O
role O O O O
in O O O O
the O O O O
top O O O O
- O O O O
down O O O O
control O O O O
of O O O O
insect O O O O
herbivores O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
predicting O O O O
predation O O O O
risk O O O O
for O O O O
herbivores O O O O
is O O O O
not O O O O
a O O O O
simple O O O O
function O O O O
of O O O O
predator O O O O
species O O O O
richness O O O O
. O O O O
    
Predation O O O O
risk O O O O
may O O O O
be O O O O
reduced O O O O
or O O O O
enhanced O O O O
depending O O O O
on O O O O
the O O O O
functional O O O O
characteristics O O O O
predator O O O O
species O O O O
. O O O O
    
We O O O O
predict O O O O
that O O O O
where O O O O
predator O O O O
species O O O O
spatially O O O O
overlap O O O O
this O O O O
will O O O O
reduce O O O O
predation O O O O
risk O O O O
for O O O O
herbivores O O O O
by O O O O
allowing O O O O
negative O O O O
inter O O O O
- O O O O
specific O O O O
interaction O O O O
between O O O O
predators O O O O
to O O O O
occur O O O O
. O O O O
    
Where O O O O
increased O O O O
predation O O O O
risk O O O O
occurs O O O O
, O O O O
we O O O O
also O O O O
predict O O O O
that O O O O
this O O O O
will O O O O
have O O O O
a O O O O
cascading O O O O
effect O O O O
through O O O O
the O O O O
food O O O O
chain O O O O
reducing O O O O
plant O O O O
growth O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
used O O O O
a O O O O
substitutive O O O O
replicated O O O O
block O O O O
design O O O O
to O O O O
identify O O O O
the O O O O
effect O O O O
of O O O O
similarity O O O O
and O O O O
dissimilarity O O O O
in O O O O
predator O O O O
hunting O O O O
mode O O O O
( O O O O
e O O O O
. O O O O
g O O O O
. O O O O
' O O O O
sit O O O O
and O O O O
wait O O O O
' O O O O
, O O O O
' O O O O
sit O O O O
and O O O O
pursue O O O O
' O O O O
, O O O O
and O O O O
' O O O O
active O O O O
' O O O O
) O O O O
and O O O O
habitat O O O O
domain O O O O
( O O O O
e O O O O
. O O O O
g O O O O
. O O O O
canopy O O O O
or O O O O
ground O O O O
) O O O O
on O O O O
the O O O O
top O O O O
- O O O O
down O O O O
control O O O O
of O O O O
planthoppers O O O O
in O O O O
grasslands O O O O
. O O O O
    
Predators O O O O
included O O O O
within O O O O
the O O O O
mesocosms O O O O
were O O O O
randomly O O O O
selected O O O O
from O O O O
a O O O O
pool O O O O
of O O O O
17 O O O O
local O O O O
species O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Predation O O O O
risk O O O O
was O O O O
reduced O O O O
where O O O O
predators O O O O
shared O O O O
the O O O O
same O O O O
habitat O O O O
domain O O O O
, O O O O
independent O O O O
of O O O O
whether O O O O
they O O O O
shared O O O O
hunting O O O O
modes O O O O
. O O O O
    
Where O O O O
predators O O O O
shared O O O O
the O O O O
same O O O O
habitat O O O O
domains O O O O
, O O O O
there O O O O
was O O O O
some O O O O
evidence O O O O
that O O O O
this O O O O
had O O O O
a O O O O
cascading O O O O
negative O O O O
effect O O O O
on O O O O
the O O O O
re O O O O
- O O O O
growth O O O O
of O O O O
grass O O O O
biomass O O O O
. O O O O
    
Where O O O O
predator O O O O
habitat O O O O
domains O O O O
did O O O O
not O O O O
overlap O O O O
, O O O O
there O O O O
were O O O O
substitutable O O O O
effects O O O O
on O O O O
predation O O O O
risk O O O O
to O O O O
planthoppers O O O O
. O O O O
    
Predation O O O O
risk O O O O
for O O O O
planthoppers O O O O
was O O O O
affected O O O O
by O O O O
taxonomic O O O O
identity O O O O
of O O O O
predator O O O O
species O O O O
, O O O O
i O O O O
. O O O O
e O O O O
. O O O O
whether O O O O
they O O O O
were O O O O
beetles O O O O
, O O O O
spiders O O O O
or O O O O
true O O O O
bugs O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
indicated O O O O
that O O O O
in O O O O
multi O O O O
- O O O O
predator O O O O
systems O O O O
, O O O O
the O O O O
risk O O O O
of O O O O
predation O O O O
is O O O O
typically O O O O
reduced O O O O
. O O O O
    
Consideration O O O O
of O O O O
functional O O O O
characteristics O O O O
of O O O O
individual O O O O
species O O O O
, O O O O
in O O O O
particular O O O O
aspects O O O O
of O O O O
habitat O O O O
domain O O O O
and O O O O
hunting O O O O
mode O O O O
, O O O O
are O O O O
crucial O O O O
in O O O O
predicting O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
multi O O O O
- O O O O
predator O O O O
systems O O O O
on O O O O
the O O O O
top O O O O
- O O O O
down O O O O
control O O O O
of O O O O
herbivores O O O O
. O O O O
    
Clinical O O O O
experience O O O O
and O O O O
laboratory O O O O
investigations O O O O
in O O O O
patients O O O O
with O O O O
anti O O O O
- O O O O
NMDAR O O O O
encephalitis O O O O
. O O O O
    
Since O O O O
its O O O O
discovery O O O O
in O O O O
2007 O O O O
, O O O O
the O O O O
encephalitis O O O O
associated O O O O
with O O O O
antibodies O O O O
against O O O O
the O O O O
N O O O O
- O O O O
methyl O O O O
- O O O O
D O O O O
- O O O O
aspartate O O O O
receptor O O O O
( O O O O
NMDAR O O O O
) O O O O
has O O O O
entered O O O O
the O O O O
mainstream O O O O
of O O O O
neurology O O O O
and O O O O
other O O O O
disciplines O O O O
. O O O O
    
Most O O O O
patients O O O O
with O O O O
anti O O O O
- O O O O
NMDAR O O O O
encephalitis O O O O
develop O O O O
a O O O O
multistage O O O O
illness O O O O
that O O O O
progresses O O O O
from O O O O
psychosis O O O O
, O O O O
memory O O O O
deficits O O O O
, O O O O
seizures O O O O
, O O O O
and O O O O
language O O O O
disintegration O O O O
into O O O O
a O O O O
state O O O O
of O O O O
unresponsiveness O O O O
with O O O O
catatonic O O O O
features O O O O
often O O O O
associated O O O O
with O O O O
abnormal O O O O
movements O O O O
, O O O O
and O O O O
autonomic O O O O
and O O O O
breathing O O O O
instability O O O O
. O O O O
    
The O O O O
disorder O O O O
predominantly O O O O
affects O O O O
children O O O O
and O O O O
young O O O O
adults O O O O
, O O O O
occurs O O O O
with O O O O
or O O O O
without O O O O
tumour O O O O
association O O O O
, O O O O
and O O O O
responds O O O O
to O O O O
treatment O O O O
but O O O O
can O O O O
relapse O O O O
. O O O O
    
The O O O O
presence O O O O
of O O O O
a O O O O
tumour O O O O
( O O O O
usually O O O O
an O O O O
ovarian O O O O
teratoma O O O O
) O O O O
is O O O O
dependent O O O O
on O O O O
age O O O O
, O O O O
sex O O O O
, O O O O
and O O O O
ethnicity O O O O
, O O O O
being O O O O
more O O O O
frequent O O O O
in O O O O
women O O O O
older O O O O
than O O O O
18 O O O O
years O O O O
, O O O O
and O O O O
slightly O O O O
more O O O O
predominant O O O O
in O O O O
black O O O O
women O O O O
than O O O O
it O O O O
is O O O O
in O O O O
white O O O O
women O O O O
. O O O O
    
Patients O O O O
treated O O O O
with O O O O
tumour O O O O
resection O O O O
and O O O O
immunotherapy O O O O
( O O O O
corticosteroids O O O O
, O O O O
intravenous O O O O
immunoglobulin O O O O
, O O O O
or O O O O
plasma O O O O
exchange O O O O
) O O O O
respond O O O O
faster O O O O
to O O O O
treatment O O O O
and O O O O
less O O O O
frequently O O O O
need O O O O
second O O O O
- O O O O
line O O O O
immunotherapy O O O O
( O O O O
cyclophosphamide O O O O
or O O O O
rituximab O O O O
, O O O O
or O O O O
both O O O O
) O O O O
than O O O O
do O O O O
patients O O O O
without O O O O
a O O O O
tumour O O O O
who O O O O
receive O O O O
similar O O O O
initial O O O O
immunotherapy O O O O
. O O O O
    
More O O O O
than O O O O
75 O O O O
% O O O O
of O O O O
all O O O O
patients O O O O
have O O O O
substantial O O O O
recovery O O O O
that O O O O
occurs O O O O
in O O O O
inverse O O O O
order O O O O
of O O O O
symptom O O O O
development O O O O
and O O O O
is O O O O
associated O O O O
with O O O O
a O O O O
decline O O O O
of O O O O
antibody O O O O
titres O O O O
. O O O O
    
Patients O O O O
' O O O O
antibodies O O O O
cause O O O O
a O O O O
titre O O O O
- O O O O
dependent O O O O
, O O O O
reversible O O O O
decrease O O O O
of O O O O
synaptic O O O O
NMDAR O O O O
by O O O O
a O O O O
mechanism O O O O
of O O O O
crosslinking O O O O
and O O O O
internalisation O O O O
. O O O O
    
On O O O O
the O O O O
basis O O O O
of O O O O
models O O O O
of O O O O
pharmacological O O O O
or O O O O
genetic O O O O
disruption O O O O
of O O O O
NMDAR O O O O
, O O O O
these O O O O
antibody O O O O
effects O O O O
reveal O O O O
a O O O O
probable O O O O
pathogenic O O O O
relation O O O O
between O O O O
the O O O O
depletion O O O O
of O O O O
receptors O O O O
and O O O O
the O O O O
clinical O O O O
features O O O O
of O O O O
anti O O O O
- O O O O
NMDAR O O O O
encephalitis O O O O
. O O O O
    
Acute O O O O
encephalopathy O O O O
with O O O O
inflammation O O O O
- O O O O
mediated O O O O
status O O O O
epilepticus O O O O
. O O O O
    
Fever O O O O
- O O O O
induced O O O O
refractory O O O O
epileptic O O O O
encephalopathy O O O O
in O O O O
school O O O O
- O O O O
aged O O O O
children O O O O
( O O O O
FIRES O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
idiopathic O O O O
hemiconvulsion O O O O
- O O O O
hemiplegia O O O O
syndrome O O O O
( O O O O
IHHS O O O O
) O O O O
are O O O O
both O O O O
triggered O O O O
by O O O O
fever O O O O
, O O O O
although O O O O
evidence O O O O
for O O O O
a O O O O
causal O O O O
microorganism O O O O
or O O O O
an O O O O
autoimmune O O O O
phenomenon O O O O
is O O O O
lacking O O O O
. O O O O
    
FIRES O O O O
begins O O O O
in O O O O
school O O O O
age O O O O
with O O O O
status O O O O
epilepticus O O O O
lasting O O O O
several O O O O
weeks O O O O
, O O O O
involves O O O O
perisylvian O O O O
areas O O O O
including O O O O
mesial O O O O
temporal O O O O
structures O O O O
, O O O O
and O O O O
is O O O O
followed O O O O
by O O O O
pharmacoresistant O O O O
epilepsy O O O O
with O O O O
major O O O O
cognitive O O O O
deterioration O O O O
. O O O O
    
IHHS O O O O
begins O O O O
in O O O O
infancy O O O O
with O O O O
unilateral O O O O
clonic O O O O
status O O O O
epilepticus O O O O
and O O O O
is O O O O
followed O O O O
by O O O O
hemiplegia O O O O
with O O O O
pharmacoresistant O O O O
epilepsy O O O O
. O O O O
    
The O O O O
aetiology O O O O
of O O O O
FIRES O O O O
and O O O O
IHHS O O O O
remains O O O O
unknown O O O O
, O O O O
although O O O O
clinical O O O O
features O O O O
and O O O O
experimental O O O O
models O O O O
point O O O O
to O O O O
a O O O O
likely O O O O
vicious O O O O
cycle O O O O
involving O O O O
inflammation O O O O
and O O O O
seizure O O O O
activity O O O O
that O O O O
depends O O O O
on O O O O
the O O O O
stage O O O O
of O O O O
brain O O O O
maturation O O O O
. O O O O
    
We O O O O
therefore O O O O
propose O O O O
to O O O O
group O O O O
these O O O O
conditions O O O O
under O O O O
the O O O O
concept O O O O
of O O O O
acute O O O O
encephalopathy O O O O
with O O O O
inflammation O O O O
- O O O O
mediated O O O O
status O O O O
epilepticus O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
to O O O O
preliminary O O O O
but O O O O
encouraging O O O O
clinical O O O O
observations O O O O
, O O O O
there O O O O
are O O O O
theoretical O O O O
reasons O O O O
to O O O O
consider O O O O
the O O O O
ketogenic O O O O
diet O O O O
as O O O O
an O O O O
early O O O O
means O O O O
to O O O O
control O O O O
both O O O O
seizures O O O O
and O O O O
inflammation O O O O
. O O O O
    
The O O O O
ribonucleotide O O O O
reductase O O O O
large O O O O
subunit O O O O
( O O O O
RRM1 O O O O
) O O O O
as O O O O
a O O O O
predictive O O O O
factor O O O O
in O O O O
patients O O O O
with O O O O
cancer O O O O
. O O O O
    
The O O O O
large O O O O
subunit O O O O
of O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ribonucleotide O O O O
reductase O O O O
, O O O O
RRM1 O O O O
, O O O O
is O O O O
involved O O O O
in O O O O
the O O O O
regulation O O O O
of O O O O
cell O O O O
proliferation O O O O
, O O O O
cell O O O O
migration O O O O
, O O O O
tumour O O O O
and O O O O
metastasis O O O O
development O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
synthesis O O O O
of O O O O
deoxyribonucleotides O O O O
for O O O O
DNA O O O O
synthesis O O O O
. O O O O
    
It O O O O
is O O O O
also O O O O
a O O O O
cellular O O O O
target O O O O
for O O O O
the O O O O
chemotherapeutic O O O O
agent O O O O
, O O O O
gemcitabine O O O O
. O O O O
    
RRM1 O O O O
has O O O O
been O O O O
studied O O O O
in O O O O
a O O O O
large O O O O
number O O O O
of O O O O
patients O O O O
with O O O O
different O O O O
types O O O O
of O O O O
cancer O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
non O O O O
- O O O O
small O O O O
- O O O O
cell O O O O
lung O O O O
cancer O O O O
, O O O O
pancreatic O O O O
cancer O O O O
, O O O O
breast O O O O
cancer O O O O
, O O O O
and O O O O
biliary O O O O
tract O O O O
cancer O O O O
, O O O O
to O O O O
establish O O O O
its O O O O
prognostic O O O O
or O O O O
predictive O O O O
value O O O O
when O O O O
patients O O O O
were O O O O
treated O O O O
with O O O O
gemcitabine O O O O
, O O O O
and O O O O
mRNA O O O O
expression O O O O
and O O O O
genetic O O O O
variants O O O O
as O O O O
determined O O O O
by O O O O
genotyping O O O O
have O O O O
in O O O O
some O O O O
cases O O O O
been O O O O
associated O O O O
with O O O O
clinical O O O O
outcome O O O O
of O O O O
patients O O O O
with O O O O
cancer O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
review O O O O
preclinical O O O O
and O O O O
clinical O O O O
studies O O O O
of O O O O
RRM1 O O O O
assessment O O O O
and O O O O
discuss O O O O
the O O O O
further O O O O
steps O O O O
in O O O O
the O O O O
development O O O O
of O O O O
this O O O O
clinically O O O O
pertinent O O O O
biomarker O O O O
. O O O O
    
KRAS O O O O
, O O O O
BRAF O O O O
, O O O O
PIK3CA O O O O
, O O O O
and O O O O
PTEN O O O O
mutations O O O O
: O O O O
implications O O O O
for O O O O
targeted O O O O
therapies O O O O
in O O O O
metastatic O O O O
colorectal O O O O
cancer O O O O
. O O O O
    
The O O O O
discovery O O O O
of O O O O
mutant O O O O
KRAS O O O O
as O O O O
a O O O O
predictor O O O O
of O O O O
resistance O O O O
to O O O O
epidermal O O O O
growth O O O O
- O O O O
factor O O O O
receptor O O O O
( O O O O
EGFR O O O O
) O O O O
monoclonal O O O O
antibodies O O O O
brought O O O O
a O O O O
major O O O O
change O O O O
in O O O O
the O O O O
treatment O O O O
of O O O O
metastatic O O O O
colorectal O O O O
cancer O O O O
. O O O O
    
This O O O O
seminal O O O O
finding O O O O
also O O O O
highlighted O O O O
our O O O O
sparse O O O O
knowledge O O O O
about O O O O
key O O O O
signalling O O O O
pathways O O O O
in O O O O
colorectal O O O O
tumours O O O O
. O O O O
    
Drugs O O O O
that O O O O
inhibit O O O O
oncogenic O O O O
alterations O O O O
such O O O O
as O O O O
phospho O O O O
- O O O O
MAP2K O O O O
( O O O O
also O O O O
called O O O O
MEK O O O O
) O O O O
, O O O O
phospho O O O O
- O O O O
AKT O O O O
, O O O O
and O O O O
mutant O O O O
B O O O O
- O O O O
RAF O O O O
seem O O O O
promising O O O O
as O O O O
single O O O O
treatment O O O O
or O O O O
when O O O O
given O O O O
with O O O O
EGFR O O O O
inhibitors O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
our O O O O
understanding O O O O
of O O O O
the O O O O
precise O O O O
role O O O O
these O O O O
potential O O O O
drug O O O O
targets O O O O
have O O O O
in O O O O
colorectal O O O O
tumours O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
oncogenic O O O O
dependence O O O O
that O O O O
tumours O O O O
might O O O O
have O O O O
on O O O O
these O O O O
components O O O O
, O O O O
has O O O O
not O O O O
progressed O O O O
at O O O O
the O O O O
same O O O O
rate O O O O
. O O O O
    
As O O O O
a O O O O
result O O O O
, O O O O
patient O O O O
selection O O O O
and O O O O
prediction O O O O
of O O O O
treatment O O O O
effects O O O O
remain O O O O
problematic O O O O
. O O O O
    
We O O O O
review O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
mutations O O O O
in O O O O
genes O O O O
other O O O O
than O O O O
KRAS O O O O
on O O O O
the O O O O
efficacy O O O O
of O O O O
anti O O O O
- O O O O
EGFR O O O O
therapy O O O O
, O O O O
and O O O O
discuss O O O O
strategies O O O O
to O O O O
target O O O O
these O O O O
oncogenic O O O O
alterations O O O O
alone O O O O
or O O O O
in O O O O
combination O O O O
with O O O O
receptor O O O O
tyrosine O O O O
- O O O O
kinase O O O O
inhibition O O O O
. O O O O
    
Conserved O O O O
function O O O O
of O O O O
the O O O O
Kruppel O O O O
gap O O O O
gene O O O O
in O O O O
the O O O O
blowfly O O O O
Lucilia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sericata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
despite O O O O
anterior O O O O
shift O O O O
of O O O O
expression O O O O
. O O O O
    
To O O O O
determine O O O O
whether O O O O
expression O O O O
patterns O O O O
of O O O O
segmentation O O O O
genes O O O O
found O O O O
in O O O O
Drosophila B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
melanogaster O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
can O O O O
be O O O O
scaled O O O O
to O O O O
pattern O O O O
larger O O O O
insects O O O O
, O O O O
we O O O O
studied O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
the O O O O
Kruppel O O O O
( O O O O
Kr O O O O
) O O O O
gene O O O O
in O O O O
the O O O O
blowfly O O O O
Lucilia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sericata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Compared O O O O
with O O O O
Drosophila B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
Kr O O O O
, O O O O
L B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sericata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Kr O O O O
showed O O O O
an O O O O
unexpected O O O O
10 O O O O
% O O O O
shift O O O O
of O O O O
expression O O O O
towards O O O O
the O O O O
anterior O O O O
pole O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
expression O O O O
domains O O O O
not O O O O
found O O O O
in O O O O
D B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
melanogaster O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
were O O O O
present O O O O
at O O O O
the O O O O
blastoderm O O O O
stage O O O O
of O O O O
L B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sericata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
To O O O O
compare O O O O
Kr O O O O
activity O O O O
and O O O O
function O O O O
, O O O O
we O O O O
employed O O O O
RNA O O O O
interference O O O O
- O O O O
mediated O O O O
gene O O O O
silencing O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
Kr O O O O
phenotypes O O O O
in O O O O
L B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sericata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
comparable O O O O
with O O O O
those O O O O
observed O O O O
in O O O O
D B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
melanogaster O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
demonstrating O O O O
that O O O O
L B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sericata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Kr O O O O
functions O O O O
as O O O O
a O O O O
gap O O O O
gene O O O O
as O O O O
it O O O O
does O O O O
in O O O O
Drosophila B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
show O O O O
that O O O O
, O O O O
despite O O O O
an O O O O
anterior O O O O
shift O O O O
in O O O O
expression O O O O
, O O O O
Kr O O O O
function O O O O
has O O O O
remained O O O O
conserved O O O O
during O O O O
the O O O O
evolution O O O O
of O O O O
the O O O O
blowflies O O O O
. O O O O
    
Antibiotics O O O O
and O O O O
UV O O O O
radiation O O O O
induce O O O O
competence O O O O
for O O O O
natural O O O O
transformation O O O O
in O O O O
Legionella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pneumophila O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Natural O O O O
transformation O O O O
by O O O O
competence O O O O
is O O O O
a O O O O
major O O O O
mechanism O O O O
of O O O O
horizontal O O O O
gene O O O O
transfer O O O O
in O O O O
bacteria O O O O
. O O O O
    
Competence O O O O
is O O O O
defined O O O O
as O O O O
the O O O O
genetically O O O O
programmed O O O O
physiological O O O O
state O O O O
that O O O O
enables O O O O
bacteria O O O O
to O O O O
actively O O O O
take O O O O
up O O O O
DNA O O O O
from O O O O
the O O O O
environment O O O O
. O O O O
    
The O O O O
conditions O O O O
that O O O O
signal O O O O
competence O O O O
development O O O O
are O O O O
multiple O O O O
and O O O O
elusive O O O O
, O O O O
complicating O O O O
the O O O O
understanding O O O O
of O O O O
its O O O O
evolutionary O O O O
significance O O O O
. O O O O
    
We O O O O
used O O O O
expression O O O O
of O O O O
the O O O O
competence O O O O
gene O O O O
comEA O O O O
as O O O O
a O O O O
reporter O O O O
of O O O O
competence O O O O
development O O O O
and O O O O
screened O O O O
several O O O O
hundred O O O O
molecules O O O O
for O O O O
their O O O O
ability O O O O
to O O O O
induce O O O O
competence O O O O
in O O O O
the O O O O
freshwater O O O O
living O O O O
pathogen O O O O
Legionella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pneumophila O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
that O O O O
comEA O O O O
expression O O O O
is O O O O
induced O O O O
by O O O O
chronic O O O O
exposure O O O O
to O O O O
genotoxic O O O O
molecules O O O O
such O O O O
as O O O O
mitomycin O O O O
C O O O O
and O O O O
antibiotics O O O O
of O O O O
the O O O O
fluoroquinolone O O O O
family O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
indicated O O O O
that O O O O
, O O O O
in O O O O
L B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pneumophila O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
competence O O O O
may O O O O
be O O O O
a O O O O
response O O O O
to O O O O
genotoxic O O O O
stress O O O O
. O O O O
    
Sunlight O O O O
- O O O O
emitted O O O O
UV O O O O
light O O O O
represents O O O O
a O O O O
major O O O O
source O O O O
of O O O O
genotoxic O O O O
stress O O O O
in O O O O
the O O O O
environment O O O O
and O O O O
we O O O O
found O O O O
that O O O O
exposure O O O O
to O O O O
UV O O O O
radiation O O O O
effectively O O O O
induces O O O O
competence O O O O
development O O O O
. O O O O
    
For O O O O
the O O O O
first O O O O
time O O O O
, O O O O
we O O O O
show O O O O
that O O O O
genetic O O O O
exchanges O O O O
by O O O O
natural O O O O
transformation O O O O
occur O O O O
within O O O O
an O O O O
UV O O O O
- O O O O
stressed O O O O
population O O O O
. O O O O
    
Genotoxic O O O O
stress O O O O
induces O O O O
the O O O O
RecA O O O O
- O O O O
dependent O O O O
SOS O O O O
response O O O O
in O O O O
many O O O O
bacteria O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
genetic O O O O
and O O O O
phenotypic O O O O
evidence O O O O
suggest O O O O
that O O O O
L B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pneumophila O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
lacks O O O O
a O O O O
prototypic O O O O
SOS O O O O
response O O O O
and O O O O
competence O O O O
development O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
genotoxic O O O O
stress O O O O
is O O O O
RecA O O O O
independent O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
strengthen O O O O
the O O O O
hypothesis O O O O
that O O O O
competence O O O O
may O O O O
have O O O O
evolved O O O O
as O O O O
a O O O O
DNA O O O O
damage O O O O
response O O O O
in O O O O
SOS O O O O
- O O O O
deficient O O O O
bacteria O O O O
. O O O O
    
This O O O O
parasexual O O O O
response O O O O
to O O O O
DNA O O O O
damage O O O O
may O O O O
have O O O O
enabled O O O O
L B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pneumophila O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
to O O O O
acquire O O O O
and O O O O
propagate O O O O
foreign O O O O
genes O O O O
, O O O O
contributing O O O O
to O O O O
the O O O O
emergence O O O O
of O O O O
this O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pathogen O O O O
. O O O O
    
Identification O O O O
of O O O O
missing O O O O
genes O O O O
and O O O O
enzymes O O O O
for O O O O
autotrophic O O O O
carbon O O O O
fixation O O O O
in O O O O
crenarchaeota O O O O
. O O O O
    
Two O O O O
autotrophic O O O O
carbon O O O O
fixation O O O O
cycles O O O O
have O O O O
been O O O O
identified O O O O
in O O O O
Crenarchaeota O O O O
. O O O O
    
The O O O O
dicarboxylate O O O O
/ O O O O
4 O O O O
- O O O O
hydroxybutyrate O O O O
cycle O O O O
functions O O O O
in O O O O
anaerobic O O O O
or O O O O
microaerobic O O O O
autotrophic O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
Thermoproteales O O O O
and O O O O
Desulfurococcales O O O O
. O O O O
    
The O O O O
3 O O O O
- O O O O
hydroxypropionate O O O O
/ O O O O
4 O O O O
- O O O O
hydroxybutyrate O O O O
cycle O O O O
occurs O O O O
in O O O O
aerobic O O O O
autotrophic O O O O
Sulfolobales O O O O
; O O O O
a O O O O
similar O O O O
cycle O O O O
may O O O O
operate O O O O
in O O O O
autotrophic O O O O
aerobic O O O O
marine O O O O
Crenarchaeota O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
cycles O O O O
form O O O O
succinyl O O O O
- O O O O
coenzyme O O O O
A O O O O
( O O O O
CoA O O O O
) O O O O
from O O O O
acetyl O O O O
- O O O O
CoA O O O O
and O O O O
two O O O O
molecules O O O O
of O O O O
inorganic O O O O
carbon O O O O
, O O O O
but O O O O
they O O O O
use O O O O
different O O O O
means O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
cycles O O O O
have O O O O
in O O O O
common O O O O
the O O O O
( O O O O
re O O O O
) O O O O
generation O O O O
of O O O O
acetyl O O O O
- O O O O
CoA O O O O
from O O O O
succinyl O O O O
- O O O O
CoA O O O O
via O O O O
identical O O O O
intermediates O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
identified O O O O
several O O O O
missing O O O O
enzymes O O O O
/ O O O O
genes O O O O
involved O O O O
in O O O O
the O O O O
seven O O O O
- O O O O
step O O O O
conversion O O O O
of O O O O
succinyl O O O O
- O O O O
CoA O O O O
to O O O O
two O O O O
molecules O O O O
of O O O O
acetyl O O O O
- O O O O
CoA O O O O
in O O O O
Thermoproteus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
neutrophilus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Thermoproteales O O O O
) O O O O
, O O O O
Ignicoccus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
hospitalis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Desulfurococcales O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
Metallosphaera B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sedula O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Sulfolobales O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
identified O O O O
enzymes O O O O
/ O O O O
genes O O O O
include O O O O
succinyl O O O O
- O O O O
CoA O O O O
reductase O O O O
, O O O O
succinic O O O O
semialdehyde O O O O
reductase O O O O
, O O O O
4 O O O O
- O O O O
hydroxybutyrate O O O O
- O O O O
CoA O O O O
ligase O O O O
, O O O O
bifunctional O O O O
crotonyl O O O O
- O O O O
CoA O O O O
hydratase O O O O
/ O O O O
( O O O O
S O O O O
) O O O O
- O O O O
3 O O O O
- O O O O
hydroxybutyryl O O O O
- O O O O
CoA O O O O
dehydrogenase O O O O
, O O O O
and O O O O
beta O O O O
- O O O O
ketothiolase O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
- O O O O
Hydroxybutyryl O O O O
- O O O O
CoA O O O O
dehydratase O O O O
, O O O O
which O O O O
catalyzes O O O O
a O O O O
mechanistically O O O O
intriguing O O O O
elimination O O O O
of O O O O
water O O O O
, O O O O
is O O O O
well O O O O
conserved O O O O
and O O O O
rightly O O O O
can O O O O
be O O O O
considered O O O O
the O O O O
key O O O O
enzyme O O O O
of O O O O
these O O O O
two O O O O
cycles O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
, O O O O
several O O O O
of O O O O
the O O O O
other O O O O
enzymes O O O O
evolved O O O O
from O O O O
quite O O O O
different O O O O
sources O O O O
, O O O O
making O O O O
functional O O O O
predictions O O O O
based O O O O
solely O O O O
on O O O O
genome O O O O
interpretation O O O O
difficult O O O O
, O O O O
if O O O O
not O O O O
questionable O O O O
. O O O O
    
Unexpected O O O O
coregulator O O O O
range O O O O
for O O O O
the O O O O
global O O O O
regulator O O O O
Lrp O O O O
of O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Proteus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mirabilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
Lrp O O O O
/ O O O O
AsnC O O O O
family O O O O
of O O O O
transcription O O O O
factors O O O O
links O O O O
gene O O O O
regulation O O O O
to O O O O
metabolism O O O O
in O O O O
bacteria O O O O
and O O O O
archaea O O O O
. O O O O
    
Members O O O O
of O O O O
this O O O O
family O O O O
, O O O O
collectively O O O O
, O O O O
respond O O O O
to O O O O
a O O O O
wide O O O O
range O O O O
of O O O O
amino O O O O
acids O O O O
as O O O O
coregulators O O O O
. O O O O
    
In O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Lrp O O O O
regulates O O O O
over O O O O
200 O O O O
genes O O O O
directly O O O O
and O O O O
is O O O O
well O O O O
known O O O O
to O O O O
respond O O O O
to O O O O
leucine O O O O
and O O O O
, O O O O
to O O O O
a O O O O
somewhat O O O O
lesser O O O O
extent O O O O
, O O O O
alanine O O O O
. O O O O
    
We O O O O
focused O O O O
on O O O O
Lrp O O O O
from O O O O
Proteus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mirabilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
orthologs O O O O
with O O O O
98 O O O O
% O O O O
identity O O O O
overall O O O O
and O O O O
identical O O O O
helix O O O O
- O O O O
turn O O O O
- O O O O
helix O O O O
motifs O O O O
, O O O O
for O O O O
which O O O O
a O O O O
previous O O O O
study O O O O
nevertheless O O O O
found O O O O
functional O O O O
differences O O O O
. O O O O
    
Sequence O O O O
differences O O O O
between O O O O
these O O O O
orthologs O O O O
, O O O O
within O O O O
and O O O O
adjacent O O O O
to O O O O
the O O O O
amino O O O O
acid O O O O
- O O O O
responsive O O O O
RAM O O O O
domain O O O O
, O O O O
led O O O O
us O O O O
to O O O O
test O O O O
for O O O O
differential O O O O
sensitivity O O O O
to O O O O
coregulatory O O O O
amino O O O O
acids O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
course O O O O
of O O O O
this O O O O
investigation O O O O
, O O O O
we O O O O
found O O O O
, O O O O
via O O O O
in O O O O
vivo O O O O
reporter O O O O
fusion O O O O
assays O O O O
and O O O O
in O O O O
vitro O O O O
electrophoretic O O O O
mobility O O O O
shift O O O O
experiments O O O O
, O O O O
that O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Lrp O O O O
itself O O O O
responded O O O O
to O O O O
a O O O O
broader O O O O
range O O O O
of O O O O
amino O O O O
acids O O O O
than O O O O
was O O O O
previously O O O O
appreciated O O O O
. O O O O
    
In O O O O
particular O O O O
, O O O O
for O O O O
both O O O O
the O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
mirabilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
orthologs O O O O
, O O O O
Lrp O O O O
responsiveness O O O O
to O O O O
methionine O O O O
was O O O O
similar O O O O
in O O O O
magnitude O O O O
to O O O O
that O O O O
to O O O O
leucine O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
Lrp O O O O
orthologs O O O O
are O O O O
also O O O O
fairly O O O O
sensitive O O O O
to O O O O
Ile O O O O
, O O O O
His O O O O
, O O O O
and O O O O
Thr O O O O
. O O O O
    
These O O O O
observations O O O O
suggest O O O O
that O O O O
Lrp O O O O
ties O O O O
gene O O O O
expression O O O O
in O O O O
the O O O O
Enterobacteriaceae O O O O
rather O O O O
extensively O O O O
to O O O O
physiological O O O O
status O O O O
, O O O O
as O O O O
reflected O O O O
in O O O O
amino O O O O
acid O O O O
pools O O O O
. O O O O
    
These O O O O
findings O O O O
also O O O O
have O O O O
substantial O O O O
implications O O O O
for O O O O
attempts O O O O
to O O O O
model O O O O
regulatory O O O O
architecture O O O O
from O O O O
transcriptome O O O O
measurements O O O O
or O O O O
to O O O O
infer O O O O
such O O O O
architecture O O O O
from O O O O
genome O O O O
sequences O O O O
, O O O O
and O O O O
they O O O O
suggest O O O O
that O O O O
even O O O O
well O O O O
- O O O O
studied O O O O
regulators O O O O
deserve O O O O
ongoing O O O O
exploration O O O O
. O O O O
    
Labeling O O O O
and O O O O
enzyme O O O O
studies O O O O
of O O O O
the O O O O
central O O O O
carbon O O O O
metabolism O O O O
in O O O O
Metallosphaera B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sedula O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Metallosphaera B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sedula O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Sulfolobales O O O O
, O O O O
Crenarchaeota O O O O
) O O O O
uses O O O O
the O O O O
3 O O O O
- O O O O
hydroxypropionate O O O O
/ O O O O
4 O O O O
- O O O O
hydroxybutyrate O O O O
cycle O O O O
for O O O O
autotrophic O O O O
carbon O O O O
fixation O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
pathway O O O O
, O O O O
acetyl O O O O
- O O O O
coenzyme O O O O
A O O O O
( O O O O
CoA O O O O
) O O O O
and O O O O
succinyl O O O O
- O O O O
CoA O O O O
are O O O O
the O O O O
only O O O O
intermediates O O O O
that O O O O
can O O O O
be O O O O
considered O O O O
common O O O O
to O O O O
the O O O O
central O O O O
carbon O O O O
metabolism O O O O
. O O O O
    
We O O O O
addressed O O O O
the O O O O
question O O O O
of O O O O
which O O O O
intermediate O O O O
of O O O O
the O O O O
cycle O O O O
most O O O O
biosynthetic O O O O
routes O O O O
branch O O O O
off O O O O
. O O O O
    
We O O O O
labeled O O O O
autotrophically O O O O
growing O O O O
cells O O O O
by O O O O
using O O O O
4 O O O O
- O O O O
hydroxy O O O O
[ O O O O
1 O O O O
- O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
4C O O O O
] O O O O
butyrate O O O O
and O O O O
[ O O O O
1 O O O O
, O O O O
4 O O O O
- O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
3C1 O O O O
] O O O O
succinate O O O O
, O O O O
respectively O O O O
, O O O O
as O O O O
precursors O O O O
for O O O O
biosynthesis O O O O
. O O O O
    
The O O O O
labeling O O O O
patterns O O O O
of O O O O
protein O O O O
- O O O O
derived O O O O
amino O O O O
acids O O O O
verified O O O O
the O O O O
operation O O O O
of O O O O
the O O O O
proposed O O O O
carbon O O O O
fixation O O O O
cycle O O O O
, O O O O
in O O O O
which O O O O
4 O O O O
- O O O O
hydroxybutyrate O O O O
is O O O O
converted O O O O
to O O O O
two O O O O
molecules O O O O
of O O O O
acetyl O O O O
- O O O O
CoA O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
also O O O O
showed O O O O
that O O O O
major O O O O
biosynthetic O O O O
flux O O O O
does O O O O
not O O O O
occur O O O O
via O O O O
acetyl O O O O
- O O O O
CoA O O O O
, O O O O
except O O O O
for O O O O
the O O O O
formation O O O O
of O O O O
building O O O O
blocks O O O O
that O O O O
are O O O O
directly O O O O
derived O O O O
from O O O O
acetyl O O O O
- O O O O
CoA O O O O
. O O O O
    
Notably O O O O
, O O O O
acetyl O O O O
- O O O O
CoA O O O O
is O O O O
not O O O O
assimilated O O O O
via O O O O
reductive O O O O
carboxylation O O O O
to O O O O
pyruvate O O O O
. O O O O
    
Rather O O O O
, O O O O
our O O O O
data O O O O
suggest O O O O
that O O O O
the O O O O
majority O O O O
of O O O O
anabolic O O O O
precursors O O O O
are O O O O
derived O O O O
from O O O O
succinyl O O O O
- O O O O
CoA O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
removed O O O O
from O O O O
the O O O O
cycle O O O O
via O O O O
oxidation O O O O
to O O O O
malate O O O O
and O O O O
oxaloacetate O O O O
. O O O O
    
These O O O O
C4intermediates O O O O
yield O O O O
pyruvate O O O O
and O O O O
phosphoenolpyruvate O O O O
( O O O O
PEP O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Enzyme O O O O
activities O O O O
that O O O O
are O O O O
required O O O O
for O O O O
forming O O O O
intermediates O O O O
from O O O O
succinyl O O O O
- O O O O
CoA O O O O
were O O O O
detected O O O O
, O O O O
including O O O O
enzymes O O O O
catalyzing O O O O
gluconeogenesis O O O O
from O O O O
PEP O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
completes O O O O
the O O O O
picture O O O O
of O O O O
the O O O O
central O O O O
carbon O O O O
metabolism O O O O
in O O O O
autotrophic O O O O
Sulfolobales O O O O
by O O O O
connecting O O O O
the O O O O
autotrophic O O O O
carbon O O O O
fixation O O O O
cycle O O O O
to O O O O
the O O O O
formation O O O O
of O O O O
central O O O O
carbon O O O O
precursor O O O O
metabolites O O O O
. O O O O
    
The O O O O
sensor O O O O
kinase O O O O
CbrA O O O O
is O O O O
a O O O O
global O O O O
regulator O O O O
that O O O O
modulates O O O O
metabolism O O O O
, O O O O
virulence O O O O
, O O O O
and O O O O
antibiotic O O O O
resistance O O O O
in O O O O
Pseudomonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aeruginosa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Pseudomonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aeruginosa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
an O O O O
opportunistic O O O O
pathogen O O O O
that O O O O
possesses O O O O
a O O O O
large O O O O
arsenal O O O O
of O O O O
virulence O O O O
factors O O O O
enabling O O O O
the O O O O
pathogen O O O O
to O O O O
cause O O O O
serious O O O O
infections O O O O
in O O O O
immunocompromised O O O O
patients O O O O
, O O O O
burn O O O O
victims O O O O
, O O O O
and O O O O
cystic O O O O
fibrosis O O O O
patients O O O O
. O O O O
    
CbrA O O O O
is O O O O
a O O O O
sensor O O O O
kinase O O O O
that O O O O
has O O O O
previously O O O O
been O O O O
implied O O O O
to O O O O
play O O O O
a O O O O
role O O O O
with O O O O
its O O O O
cognate O O O O
response O O O O
regulator O O O O
CbrB O O O O
in O O O O
the O O O O
metabolic O O O O
regulation O O O O
of O O O O
carbon O O O O
and O O O O
nitrogen O O O O
utilization O O O O
in O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
aeruginosa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Here O O O O
it O O O O
is O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
CbrA O O O O
and O O O O
CbrB O O O O
play O O O O
an O O O O
important O O O O
role O O O O
in O O O O
various O O O O
virulence O O O O
and O O O O
virulence O O O O
- O O O O
related O O O O
processes O O O O
of O O O O
the O O O O
bacteria O O O O
, O O O O
including O O O O
swarming O O O O
, O O O O
biofilm O O O O
formation O O O O
, O O O O
cytotoxicity O O O O
, O O O O
and O O O O
antibiotic O O O O
resistance O O O O
. O O O O
    
The O O O O
cbrA O O O O
deletion O O O O
mutant O O O O
was O O O O
completely O O O O
unable O O O O
to O O O O
swarm O O O O
while O O O O
exhibiting O O O O
an O O O O
increase O O O O
in O O O O
biofilm O O O O
formation O O O O
, O O O O
supporting O O O O
the O O O O
inverse O O O O
regulation O O O O
of O O O O
swarming O O O O
and O O O O
biofilm O O O O
formation O O O O
in O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
aeruginosa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
cbrA O O O O
mutant O O O O
also O O O O
exhibited O O O O
increased O O O O
cytotoxicity O O O O
to O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
lung O O O O
epithelial O O O O
cells O O O O
as O O O O
early O O O O
as O O O O
4 O O O O
and O O O O
6 O O O O
h O O O O
postinfection O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
the O O O O
cbrA O O O O
mutant O O O O
demonstrated O O O O
increased O O O O
resistance O O O O
toward O O O O
a O O O O
variety O O O O
of O O O O
clinically O O O O
important O O O O
antibiotics O O O O
, O O O O
including O O O O
polymyxin O O O O
B O O O O
, O O O O
ciprofloxacin O O O O
, O O O O
and O O O O
tobramycin O O O O
. O O O O
    
Microarray O O O O
analysis O O O O
revealed O O O O
that O O O O
under O O O O
swarming O O O O
conditions O O O O
, O O O O
CbrA O O O O
regulated O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
many O O O O
genes O O O O
, O O O O
including O O O O
phoPQ O O O O
, O O O O
pmrAB O O O O
, O O O O
arnBCADTEF O O O O
, O O O O
dnaK O O O O
, O O O O
and O O O O
pvdQ O O O O
, O O O O
consistent O O O O
with O O O O
the O O O O
antibiotic O O O O
resistance O O O O
and O O O O
swarming O O O O
impairment O O O O
phenotypes O O O O
of O O O O
the O O O O
cbrA O O O O
mutant O O O O
. O O O O
    
Phenotypic O O O O
and O O O O
real O O O O
- O O O O
time O O O O
quantitative O O O O
PCR O O O O
( O O O O
RT O O O O
- O O O O
qPCR O O O O
) O O O O
analyses O O O O
of O O O O
a O O O O
PA14 O O O O
cbrB O O O O
mutant O O O O
suggested O O O O
that O O O O
CbrA O O O O
may O O O O
be O O O O
modulating O O O O
swarming O O O O
, O O O O
biofilm O O O O
formation O O O O
, O O O O
and O O O O
cytotoxicity O O O O
via O O O O
CbrB O O O O
and O O O O
that O O O O
the O O O O
CrcZ O O O O
small O O O O
RNA O O O O
is O O O O
likely O O O O
downstream O O O O
of O O O O
this O O O O
two O O O O
- O O O O
component O O O O
regulator O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
as O O O O
CbrB O O O O
did O O O O
not O O O O
have O O O O
a O O O O
resistance O O O O
phenotype O O O O
, O O O O
CbrA O O O O
likely O O O O
modulates O O O O
antibiotic O O O O
resistance O O O O
in O O O O
a O O O O
manner O O O O
independent O O O O
of O O O O
CbrB O O O O
. O O O O
    
Characterization O O O O
of O O O O
a O O O O
polyketide O O O O
synthase O O O O
in O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
niger O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
whose O O O O
product O O O O
is O O O O
a O O O O
precursor O O O O
for O O O O
both O O O O
dihydroxynaphthalene O O O O
( O O O O
DHN O O O O
) O O O O
melanin O O O O
and O O O O
naphtho O O O O
- O O O O
gamma O O O O
- O O O O
pyrone O O O O
. O O O O
    
The O O O O
genome O O O O
sequencing O O O O
of O O O O
the O O O O
fungus O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
niger O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
uncovered O O O O
a O O O O
large O O O O
cache O O O O
of O O O O
genes O O O O
encoding O O O O
enzymes O O O O
thought O O O O
to O O O O
be O O O O
involved O O O O
in O O O O
the O O O O
production O O O O
of O O O O
secondary O O O O
metabolites O O O O
yet O O O O
to O O O O
be O O O O
identified O O O O
. O O O O
    
Identification O O O O
and O O O O
structural O O O O
characterization O O O O
of O O O O
many O O O O
of O O O O
these O O O O
predicted O O O O
secondary O O O O
metabolites O O O O
are O O O O
hampered O O O O
by O O O O
their O O O O
low O O O O
concentration O O O O
relative O O O O
to O O O O
the O O O O
known O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
niger O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
metabolites O O O O
such O O O O
as O O O O
the O O O O
naphtho O O O O
- O O O O
gamma O O O O
- O O O O
pyrone O O O O
family O O O O
of O O O O
polyketides O O O O
. O O O O
    
We O O O O
deleted O O O O
a O O O O
non O O O O
- O O O O
reducing O O O O
PKS O O O O
gene O O O O
in O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
niger O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ATCC O O O O
11414 O O O O
, O O O O
a O O O O
daughter O O O O
strain O O O O
of O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
niger O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ATCC O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1015 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
whose O O O O
genome O O O O
was O O O O
sequenced O O O O
by O O O O
the O O O O
DOE O O O O
Joint O O O O
Genome O O O O
Institute O O O O
. O O O O
    
This O O O O
PKS O O O O
encoding O O O O
gene O O O O
we O O O O
name O O O O
albA O O O O
is O O O O
a O O O O
predicted O O O O
ortholog O O O O
of O O O O
alb1 O O O O
from O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
which O O O O
is O O O O
responsible O O O O
for O O O O
production O O O O
of O O O O
the O O O O
naphtho O O O O
- O O O O
gamma O O O O
- O O O O
pyrone O O O O
precursor O O O O
for O O O O
the O O O O
1 O O O O
, O O O O
8 O O O O
- O O O O
dihydroxynaphthalene O O O O
( O O O O
DHN O O O O
) O O O O
melanin O O O O
/ O O O O
spore O O O O
pigment O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
show O O O O
that O O O O
the O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nigeralbA O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
PKS O O O O
is O O O O
responsible O O O O
for O O O O
both O O O O
the O O O O
production O O O O
of O O O O
the O O O O
spore O O O O
pigment O O O O
precursor O O O O
and O O O O
a O O O O
family O O O O
of O O O O
naphtho O O O O
- O O O O
gamma O O O O
- O O O O
pyrones O O O O
commonly O O O O
found O O O O
in O O O O
significant O O O O
quantity O O O O
in O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
niger O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
culture O O O O
extracts O O O O
. O O O O
    
The O O O O
generation O O O O
of O O O O
an O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
niger O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O O O O
devoid O O O O
of O O O O
naphtho O O O O
- O O O O
gamma O O O O
- O O O O
pyrones O O O O
will O O O O
greatly O O O O
facilitate O O O O
the O O O O
elucidation O O O O
of O O O O
cryptic O O O O
biosynthetic O O O O
pathways O O O O
in O O O O
this O O O O
organism O O O O
. O O O O
    
Drivers O O O O
of O O O O
age O O O O
- O O O O
specific O O O O
survival O O O O
in O O O O
a O O O O
long O O O O
- O O O O
lived O O O O
seabird O O O O
: O O O O
contributions O O O O
of O O O O
observed O O O O
and O O O O
hidden O O O O
sources O O O O
of O O O O
heterogeneity O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
assessed O O O O
the O O O O
relative O O O O
influence O O O O
of O O O O
variability O O O O
in O O O O
recruitment O O O O
age O O O O
, O O O O
dynamic O O O O
reproductive O O O O
investment O O O O
( O O O O
time O O O O
- O O O O
specific O O O O
reproductive O O O O
states O O O O
) O O O O
and O O O O
frailty O O O O
( O O O O
unobserved O O O O
differences O O O O
in O O O O
survival O O O O
abilities O O O O
across O O O O
individuals O O O O
) O O O O
on O O O O
survival O O O O
in O O O O
the O O O O
black B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
legged O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
kittiwake O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
we O O O O
examined O O O O
whether O O O O
observed O O O O
variability O O O O
in O O O O
survival O O O O
trajectories O O O O
was O O O O
best O O O O
explained O O O O
by O O O O
immediate O O O O
reproductive O O O O
investment O O O O
, O O O O
cumulative O O O O
investment O O O O
, O O O O
or O O O O
both O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Individuals O O O O
that O O O O
delayed O O O O
recruitment O O O O
( O O O O
> O O O O
= O O O O
age O O O O
7 O O O O
) O O O O
suffered O O O O
a O O O O
higher O O O O
mortality O O O O
risk O O O O
than O O O O
early O O O O
recruits O O O O
( O O O O
age O O O O
3 O O O O
) O O O O
, O O O O
especially O O O O
later O O O O
in O O O O
life O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
recruitment O O O O
age O O O O
may O O O O
be O O O O
an O O O O
indicator O O O O
of O O O O
individual O O O O
quality O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
recruitment O O O O
age O O O O
helped O O O O
explain O O O O
variation O O O O
in O O O O
survival O O O O
, O O O O
time O O O O
- O O O O
varying O O O O
reproductive O O O O
investment O O O O
had O O O O
a O O O O
more O O O O
substantial O O O O
influence O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
dichotomy O O O O
of O O O O
attempting O O O O
to O O O O
breed O O O O
or O O O O
not O O O O
explained O O O O
variability O O O O
in O O O O
survival O O O O
across O O O O
life O O O O
better O O O O
than O O O O
other O O O O
parameterizations O O O O
of O O O O
reproductive O O O O
states O O O O
such O O O O
as O O O O
clutch O O O O
size O O O O
, O O O O
brood O O O O
size O O O O
or O O O O
breeding O O O O
success O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
kittiwake O O O O
, O O O O
the O O O O
sinequanon O O O O
condition O O O O
to O O O O
initiate O O O O
reproduction O O O O
is O O O O
to O O O O
hold O O O O
a O O O O
nest O O O O
site O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
considered O O O O
a O O O O
very O O O O
competitive O O O O
activity O O O O
. O O O O
    
This O O O O
might O O O O
explain O O O O
why O O O O
attempting O O O O
to O O O O
breed O O O O
is O O O O
the O O O O
key O O O O
level O O O O
of O O O O
investment O O O O
that O O O O
affects O O O O
survival O O O O
, O O O O
independent O O O O
of O O O O
the O O O O
outcome O O O O
( O O O O
failure O O O O
or O O O O
success O O O O
) O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Interestingly O O O O
, O O O O
the O O O O
more O O O O
individuals O O O O
cumulate O O O O
reproductive O O O O
attempts O O O O
over O O O O
life O O O O
, O O O O
the O O O O
lower O O O O
their O O O O
mortality O O O O
risk O O O O
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
breeding O O O O
experience O O O O
may O O O O
be O O O O
a O O O O
good O O O O
indicator O O O O
of O O O O
parental O O O O
quality O O O O
as O O O O
well O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
, O O O O
attempting O O O O
to O O O O
breed O O O O
at O O O O
time O O O O
t O O O O
increased O O O O
the O O O O
risk O O O O
of O O O O
mortality O O O O
between O O O O
t O O O O
and O O O O
t O O O O
+ O O O O
1 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
thus O O O O
detected O O O O
an O O O O
immediate O O O O
trade O O O O
- O O O O
off O O O O
between O O O O
attempting O O O O
to O O O O
breed O O O O
and O O O O
survival O O O O
in O O O O
this O O O O
population O O O O
; O O O O
however O O O O
, O O O O
the O O O O
earlier O O O O
individuals O O O O
recruited O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
more O O O O
breeding O O O O
experience O O O O
they O O O O
accumulated O O O O
, O O O O
the O O O O
smaller O O O O
the O O O O
cost O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Lastly O O O O
, O O O O
unobserved O O O O
heterogeneity O O O O
across O O O O
individuals O O O O
improved O O O O
model O O O O
fit O O O O
more O O O O
( O O O O
1 O O O O
* O O O O
3 O O O O
times O O O O
) O O O O
than O O O O
fixed O O O O
and O O O O
dynamic O O O O
sources O O O O
of O O O O
observed O O O O
heterogeneity O O O O
in O O O O
reproductive O O O O
investment O O O O
, O O O O
demonstrating O O O O
that O O O O
it O O O O
is O O O O
critical O O O O
to O O O O
account O O O O
for O O O O
both O O O O
sources O O O O
of O O O O
individual O O O O
heterogeneity O O O O
when O O O O
studying O O O O
survival O O O O
trajectories O O O O
. O O O O
    
Only O O O O
after O O O O
simultaneously O O O O
accounting O O O O
for O O O O
both O O O O
sources O O O O
of O O O O
heterogeneity O O O O
were O O O O
we O O O O
able O O O O
to O O O O
detect O O O O
the O O O O
' O O O O
cost O O O O
' O O O O
of O O O O
immediate O O O O
reproductive O O O O
investment O O O O
on O O O O
survival O O O O
and O O O O
the O O O O
' O O O O
benefit O O O O
' O O O O
of O O O O
cumulative O O O O
breeding O O O O
attempts O O O O
( O O O O
experience O O O O
) O O O O
, O O O O
a O O O O
proxy O O O O
to O O O O
individual O O O O
quality O O O O
. O O O O
    
Developmental O O O O
plasticity O O O O
of O O O O
immune O O O O
defence O O O O
in O O O O
two O O O O
life O O O O
- O O O O
history O O O O
ecotypes O O O O
of O O O O
the O O O O
garter B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
snake O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Thamnophis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
elegans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O O O O
a O O O O
common O O O O
- O O O O
environment O O O O
experiment O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Ecoimmunological O O O O
theory O O O O
predicts O O O O
a O O O O
link O O O O
between O O O O
life O O O O
- O O O O
history O O O O
and O O O O
immune O O O O
- O O O O
defence O O O O
strategies O O O O
such O O O O
that O O O O
fast O O O O
- O O O O
living O O O O
organisms O O O O
should O O O O
rely O O O O
more O O O O
on O O O O
constitutive O O O O
innate O O O O
defences O O O O
compared O O O O
to O O O O
slow O O O O
- O O O O
living O O O O
organisms O O O O
. O O O O
    
An O O O O
untested O O O O
assumption O O O O
of O O O O
this O O O O
hypothesis O O O O
is O O O O
that O O O O
the O O O O
variation O O O O
in O O O O
immune O O O O
defence O O O O
associated O O O O
with O O O O
variation O O O O
in O O O O
life O O O O
history O O O O
has O O O O
a O O O O
genetic O O O O
basis O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Replicate O O O O
populations O O O O
of O O O O
two O O O O
life O O O O
- O O O O
history O O O O
ecotypes O O O O
of O O O O
the O O O O
garter B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
snake O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Thamnophis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
elegans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
provide O O O O
an O O O O
ideal O O O O
system O O O O
in O O O O
which O O O O
to O O O O
test O O O O
this O O O O
assumption O O O O
. O O O O
    
Free O O O O
- O O O O
ranging O O O O
snakes O O O O
of O O O O
the O O O O
fast O O O O
- O O O O
living O O O O
ecotype O O O O
, O O O O
which O O O O
reside O O O O
in O O O O
lakeshore O O O O
habitats O O O O
, O O O O
show O O O O
higher O O O O
levels O O O O
of O O O O
three O O O O
measures O O O O
of O O O O
constitutive O O O O
innate O O O O
immunity O O O O
than O O O O
those O O O O
of O O O O
the O O O O
slow O O O O
- O O O O
living O O O O
ecotype O O O O
, O O O O
which O O O O
inhabit O O O O
meadows O O O O
around O O O O
the O O O O
lake O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
this O O O O
pattern O O O O
is O O O O
consistent O O O O
with O O O O
the O O O O
ecoimmunological O O O O
pace O O O O
- O O O O
of O O O O
- O O O O
life O O O O
hypothesis O O O O
, O O O O
environmental O O O O
differences O O O O
between O O O O
the O O O O
lakeshore O O O O
and O O O O
meadow O O O O
habitats O O O O
could O O O O
also O O O O
explain O O O O
the O O O O
observed O O O O
differences O O O O
in O O O O
immune O O O O
defence O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
performed O O O O
a O O O O
common O O O O
- O O O O
environment O O O O
experiment O O O O
to O O O O
distinguish O O O O
between O O O O
these O O O O
alternatives O O O O
. O O O O
    
Snakes O O O O
born O O O O
and O O O O
raised O O O O
in O O O O
common O O O O
- O O O O
environment O O O O
conditions O O O O
reflected O O O O
the O O O O
immune O O O O
phenotype O O O O
of O O O O
their O O O O
native O O O O
habitats O O O O
when O O O O
sampled O O O O
at O O O O
4 O O O O
months O O O O
of O O O O
age O O O O
( O O O O
i O O O O
. O O O O
e O O O O
. O O O O
fast O O O O
- O O O O
living O O O O
lakeshore O O O O
snakes O O O O
showed O O O O
higher O O O O
levels O O O O
of O O O O
natural O O O O
antibodies O O O O
, O O O O
complement O O O O
activity O O O O
and O O O O
bactericidal O O O O
competence O O O O
than O O O O
slow O O O O
- O O O O
living O O O O
meadow O O O O
snakes O O O O
) O O O O
, O O O O
but O O O O
no O O O O
longer O O O O
showed O O O O
differences O O O O
when O O O O
19 O O O O
months O O O O
old O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
This O O O O
suggests O O O O
that O O O O
the O O O O
differences O O O O
in O O O O
innate O O O O
immunity O O O O
observed O O O O
between O O O O
the O O O O
two O O O O
ecotypes O O O O
have O O O O
an O O O O
important O O O O
- O O O O
and O O O O
likely O O O O
age O O O O
- O O O O
specific O O O O
- O O O O
environmental O O O O
influence O O O O
, O O O O
with O O O O
these O O O O
immune O O O O
components O O O O
showing O O O O
developmental O O O O
plasticity O O O O
. O O O O
    
A O O O O
genetic O O O O
effect O O O O
in O O O O
early O O O O
life O O O O
may O O O O
also O O O O
be O O O O
present O O O O
, O O O O
but O O O O
further O O O O
research O O O O
is O O O O
needed O O O O
to O O O O
confirm O O O O
this O O O O
possibility O O O O
and O O O O
therefore O O O O
provide O O O O
a O O O O
more O O O O
definitive O O O O
test O O O O
of O O O O
the O O O O
ecoimmunological O O O O
pace O O O O
- O O O O
of O O O O
- O O O O
life O O O O
hypothesis O O O O
in O O O O
this O O O O
system O O O O
. O O O O
    
Prey O O O O
, O O O O
predators O O O O
, O O O O
parasites O O O O
: O O O O
intraguild O O O O
predation O O O O
or O O O O
simpler O O O O
community O O O O
modules O O O O
in O O O O
disguise O O O O
? O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Competition O O O O
and O O O O
predation O O O O
are O O O O
at O O O O
the O O O O
heart O O O O
of O O O O
community O O O O
ecology O O O O
. O O O O
    
The O O O O
theoretical O O O O
concept O O O O
of O O O O
intraguild O O O O
predation O O O O
( O O O O
IGP O O O O
) O O O O
combines O O O O
these O O O O
key O O O O
interactions O O O O
in O O O O
a O O O O
single O O O O
community O O O O
module O O O O
. O O O O
    
Because O O O O
IGP O O O O
is O O O O
believed O O O O
to O O O O
be O O O O
ubiquitous O O O O
in O O O O
nature O O O O
, O O O O
it O O O O
has O O O O
been O O O O
subject O O O O
to O O O O
extensive O O O O
research O O O O
, O O O O
and O O O O
there O O O O
exists O O O O
a O O O O
well O O O O
- O O O O
developed O O O O
theoretical O O O O
framework O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
show O O O O
that O O O O
a O O O O
general O O O O
class O O O O
of O O O O
IGP O O O O
models O O O O
can O O O O
be O O O O
transformed O O O O
to O O O O
simpler O O O O
, O O O O
but O O O O
equivalent O O O O
community O O O O
structures O O O O
. O O O O
    
This O O O O
rather O O O O
unexpected O O O O
simplification O O O O
depends O O O O
critically O O O O
on O O O O
the O O O O
property O O O O
of O O O O
' O O O O
indiscriminate O O O O
predation O O O O
' O O O O
, O O O O
which O O O O
we O O O O
define O O O O
broadly O O O O
as O O O O
the O O O O
top O O O O
- O O O O
predator O O O O
not O O O O
distinguishing O O O O
between O O O O
its O O O O
two O O O O
different O O O O
prey O O O O
species O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
In O O O O
a O O O O
broader O O O O
context O O O O
, O O O O
the O O O O
great O O O O
importance O O O O
of O O O O
IGP O O O O
and O O O O
of O O O O
the O O O O
simplifying O O O O
transformation O O O O
we O O O O
report O O O O
here O O O O
is O O O O
enhanced O O O O
by O O O O
the O O O O
recent O O O O
insight O O O O
that O O O O
the O O O O
basic O O O O
IGP O O O O
structure O O O O
extends O O O O
naturally O O O O
to O O O O
host O O O O
- O O O O
parasitoid O O O O
and O O O O
host O O O O
- O O O O
pathogen O O O O
communities O O O O
. O O O O
    
We O O O O
show O O O O
that O O O O
parasites O O O O
infecting O O O O
prey O O O O
( O O O O
predators O O O O
) O O O O
tend O O O O
to O O O O
render O O O O
IGP O O O O
effectively O O O O
into O O O O
exploitative O O O O
competition O O O O
( O O O O
tritrophic O O O O
food O O O O
chain O O O O
, O O O O
respectively O O O O
) O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
equivalence O O O O
between O O O O
the O O O O
original O O O O
and O O O O
simplified O O O O
community O O O O
module O O O O
makes O O O O
it O O O O
possible O O O O
to O O O O
take O O O O
advantage O O O O
from O O O O
already O O O O
existing O O O O
insights O O O O
. O O O O
    
We O O O O
illustrate O O O O
this O O O O
by O O O O
means O O O O
of O O O O
an O O O O
eco O O O O
- O O O O
epidemiological O O O O
IGP O O O O
model O O O O
that O O O O
is O O O O
strikingly O O O O
similar O O O O
to O O O O
a O O O O
classical O O O O
exploitative O O O O
competition O O O O
model O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
change O O O O
of O O O O
perspective O O O O
on O O O O
certain O O O O
community O O O O
modules O O O O
may O O O O
contribute O O O O
to O O O O
a O O O O
better O O O O
understanding O O O O
of O O O O
food O O O O
web O O O O
dynamics O O O O
. O O O O
    
In O O O O
particular O O O O
, O O O O
it O O O O
may O O O O
help O O O O
explain O O O O
the O O O O
interactions O O O O
in O O O O
food O O O O
webs O O O O
that O O O O
include O O O O
parasites O O O O
. O O O O
    
Given O O O O
the O O O O
ubiquity O O O O
of O O O O
parasitism O O O O
, O O O O
food O O O O
webs O O O O
may O O O O
appear O O O O
in O O O O
a O O O O
different O O O O
light O O O O
when O O O O
they O O O O
are O O O O
transformed O O O O
to O O O O
their O O O O
simplified O O O O
analogue O O O O
. O O O O
    
Individual O O O O
differences O O O O
in O O O O
reproductive O O O O
costs O O O O
examined O O O O
using O O O O
multi O O O O
- O O O O
state O O O O
methods O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Trade O O O O
- O O O O
offs O O O O
among O O O O
life O O O O
- O O O O
history O O O O
traits O O O O
are O O O O
common O O O O
because O O O O
individuals O O O O
have O O O O
to O O O O
partition O O O O
limited O O O O
resources O O O O
between O O O O
multiple O O O O
traits O O O O
. O O O O
    
Reproductive O O O O
costs O O O O
are O O O O
generally O O O O
assumed O O O O
to O O O O
be O O O O
high O O O O
, O O O O
resulting O O O O
in O O O O
reduced O O O O
survival O O O O
and O O O O
fecundity O O O O
in O O O O
the O O O O
following O O O O
year O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
it O O O O
is O O O O
common O O O O
to O O O O
find O O O O
positive O O O O
rather O O O O
than O O O O
negative O O O O
correlations O O O O
between O O O O
life O O O O
- O O O O
history O O O O
traits O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
use O O O O
a O O O O
data O O O O
set O O O O
from O O O O
the O O O O
individual O O O O
- O O O O
based O O O O
study O O O O
of O O O O
red B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
deer O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
on O O O O
the O O O O
Isle O O O O
of O O O O
Rum O O O O
to O O O O
examine O O O O
how O O O O
these O O O O
costs O O O O
vary O O O O
between O O O O
individuals O O O O
and O O O O
at O O O O
different O O O O
ages O O O O
, O O O O
using O O O O
multi O O O O
- O O O O
state O O O O
mark O O O O
- O O O O
recapture O O O O
methodology O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Females O O O O
that O O O O
had O O O O
reproduced O O O O
frequently O O O O
in O O O O
the O O O O
past O O O O
incurred O O O O
lower O O O O
costs O O O O
of O O O O
reproduction O O O O
in O O O O
terms O O O O
of O O O O
survival O O O O
in O O O O
the O O O O
following O O O O
year O O O O
and O O O O
were O O O O
more O O O O
likely O O O O
to O O O O
reproduce O O O O
in O O O O
two O O O O
consecutive O O O O
years O O O O
. O O O O
    
Older O O O O
individuals O O O O
and O O O O
those O O O O
that O O O O
had O O O O
not O O O O
reproduced O O O O
frequently O O O O
exhibited O O O O
higher O O O O
costs O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
highlight O O O O
the O O O O
importance O O O O
of O O O O
considering O O O O
heterogeneity O O O O
and O O O O
individual O O O O
quality O O O O
when O O O O
examining O O O O
trade O O O O
- O O O O
offs O O O O
and O O O O
demonstrate O O O O
the O O O O
effectiveness O O O O
of O O O O
using O O O O
detailed O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
data O O O O
sets O O O O
to O O O O
explore O O O O
life O O O O
- O O O O
history O O O O
strategies O O O O
using O O O O
multi O O O O
- O O O O
state O O O O
mark O O O O
- O O O O
recapture O O O O
models O O O O
. O O O O
    
Functional O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
fungal O O O O
/ O O O O
plant O O O O
class O O O O
chitinase O O O O
family O O O O
in O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
A O O O O
quintuple O O O O
mutant O O O O
was O O O O
constructed O O O O
to O O O O
delete O O O O
the O O O O
entire O O O O
family O O O O
of O O O O
the O O O O
fungal O O O O
/ O O O O
plant O O O O
( O O O O
class O O O O
III O O O O
) O O O O
chitinases O O O O
of O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Only O O O O
a O O O O
limited O O O O
reduction O O O O
in O O O O
the O O O O
total O O O O
chitinolytic O O O O
activity O O O O
was O O O O
seen O O O O
for O O O O
the O O O O
different O O O O
chitinase O O O O
mutants O O O O
including O O O O
the O O O O
quintuple O O O O
mutant O O O O
. O O O O
    
In O O O O
spite O O O O
of O O O O
this O O O O
reduction O O O O
in O O O O
chitinolytic O O O O
activity O O O O
, O O O O
no O O O O
growth O O O O
or O O O O
germination O O O O
defects O O O O
were O O O O
observed O O O O
in O O O O
these O O O O
chitinase O O O O
mutants O O O O
. O O O O
    
This O O O O
result O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
the O O O O
fungal O O O O
/ O O O O
plant O O O O
chitinases O O O O
do O O O O
not O O O O
have O O O O
an O O O O
essential O O O O
role O O O O
in O O O O
the O O O O
morphogenesis O O O O
of O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
A O O O O
slight O O O O
diminution O O O O
of O O O O
the O O O O
growth O O O O
during O O O O
autolysis O O O O
was O O O O
seen O O O O
for O O O O
the O O O O
quintuple O O O O
mutant O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
class O O O O
III O O O O
chitinases O O O O
may O O O O
play O O O O
only O O O O
a O O O O
nutritional O O O O
role O O O O
during O O O O
this O O O O
phase O O O O
of O O O O
the O O O O
cycle O O O O
, O O O O
retarding O O O O
fungal O O O O
death O O O O
. O O O O
    
Early O O O O
- O O O O
onset O O O O
versus O O O O
late O O O O
- O O O O
onset O O O O
Alzheimer O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
: O O O O
the O O O O
case O O O O
of O O O O
the O O O O
missing O O O O
APOE O O O O
epsilo4 O O O O
allele O O O O
. O O O O
    
Some O O O O
patients O O O O
with O O O O
early O O O O
- O O O O
onset O O O O
Alzheimer O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
( O O O O
AD O O O O
) O O O O
present O O O O
with O O O O
a O O O O
distinct O O O O
phenotype O O O O
. O O O O
    
Typically O O O O
, O O O O
the O O O O
first O O O O
and O O O O
most O O O O
salient O O O O
characteristic O O O O
of O O O O
AD O O O O
is O O O O
episodic O O O O
memory O O O O
impairment O O O O
. O O O O
    
A O O O O
few O O O O
patients O O O O
, O O O O
however O O O O
, O O O O
present O O O O
with O O O O
focal O O O O
cortical O O O O
, O O O O
non O O O O
- O O O O
memory O O O O
symptoms O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
difficulties O O O O
with O O O O
language O O O O
, O O O O
visuospatial O O O O
, O O O O
or O O O O
executive O O O O
functions O O O O
. O O O O
    
These O O O O
presentations O O O O
are O O O O
associated O O O O
with O O O O
specific O O O O
patterns O O O O
of O O O O
atrophy O O O O
and O O O O
frequently O O O O
with O O O O
a O O O O
young O O O O
age O O O O
at O O O O
onset O O O O
. O O O O
    
Age O O O O
is O O O O
not O O O O
, O O O O
however O O O O
, O O O O
the O O O O
only O O O O
determinant O O O O
of O O O O
phenotype O O O O
; O O O O
underlying O O O O
factors O O O O
, O O O O
especially O O O O
genetic O O O O
factors O O O O
, O O O O
seem O O O O
also O O O O
to O O O O
affect O O O O
phenotype O O O O
and O O O O
predispose O O O O
patients O O O O
to O O O O
younger O O O O
or O O O O
older O O O O
age O O O O
at O O O O
onset O O O O
. O O O O
    
Importantly O O O O
, O O O O
patients O O O O
with O O O O
atypical O O O O
early O O O O
- O O O O
onset O O O O
disease O O O O
seldom O O O O
carry O O O O
the O O O O
APOE O O O O
epsilo4 O O O O
allele O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
the O O O O
most O O O O
important O O O O
risk O O O O
factor O O O O
for O O O O
lowering O O O O
the O O O O
age O O O O
of O O O O
onset O O O O
in O O O O
patients O O O O
with O O O O
AD O O O O
. O O O O
    
Additionally O O O O
, O O O O
theAPOE O O O O
epsilo4 O O O O
genotype O O O O
seems O O O O
to O O O O
predispose O O O O
patients O O O O
to O O O O
vulnerability O O O O
in O O O O
the O O O O
medial O O O O
temporal O O O O
areas O O O O
, O O O O
which O O O O
leads O O O O
to O O O O
memory O O O O
loss O O O O
. O O O O
    
Conversely O O O O
, O O O O
patients O O O O
negative O O O O
for O O O O
the O O O O
APOE O O O O
epsilo4 O O O O
allele O O O O
and O O O O
with O O O O
early O O O O
- O O O O
onset O O O O
AD O O O O
are O O O O
more O O O O
likely O O O O
to O O O O
be O O O O
predisposed O O O O
to O O O O
vulnerability O O O O
of O O O O
cerebral O O O O
networks O O O O
beyond O O O O
the O O O O
medial O O O O
temporal O O O O
lobes O O O O
. O O O O
    
Other O O O O
factors O O O O
are O O O O
probably O O O O
involved O O O O
in O O O O
determining O O O O
the O O O O
pattern O O O O
of O O O O
atrophy O O O O
, O O O O
but O O O O
these O O O O
are O O O O
currently O O O O
unknown O O O O
. O O O O
    
Breathing O O O O
some O O O O
air O O O O
into O O O O
the O O O O
single O O O O
- O O O O
species O O O O
vacuum O O O O
: O O O O
multi O O O O
- O O O O
species O O O O
responses O O O O
to O O O O
environmental O O O O
change O O O O
. O O O O
    
Studies O O O O
of O O O O
ecological O O O O
responses O O O O
to O O O O
climate O O O O
change O O O O
have O O O O
often O O O O
analysed O O O O
species O O O O
independently O O O O
of O O O O
each O O O O
other O O O O
, O O O O
yet O O O O
interactions O O O O
between O O O O
species O O O O
are O O O O
fundamental O O O O
aspects O O O O
of O O O O
ecology O O O O
. O O O O
    
Mutshinda O O O O
, O O O O
O O O O O
' O O O O
Hara O O O O
& O O O O
amp O O O O
; O O O O
Woiwod O O O O
( O O O O
2011 O O O O
) O O O O
used O O O O
light O O O O
- O O O O
trapping O O O O
data O O O O
for O O O O
Lepidoptera O O O O
( O O O O
moths O O O O
) O O O O
to O O O O
examine O O O O
population O O O O
responses O O O O
to O O O O
intraspecific O O O O
effects O O O O
and O O O O
effects O O O O
of O O O O
winter O O O O
rainfall O O O O
and O O O O
temperature O O O O
. O O O O
    
They O O O O
show O O O O
how O O O O
Bayesian O O O O
hierarchical O O O O
models O O O O
can O O O O
analyse O O O O
residual O O O O
correlations O O O O
among O O O O
species O O O O
' O O O O
responses O O O O
, O O O O
illustrating O O O O
an O O O O
approach O O O O
to O O O O
account O O O O
for O O O O
and O O O O
measure O O O O
dependencies O O O O
that O O O O
are O O O O
not O O O O
fully O O O O
explained O O O O
by O O O O
the O O O O
candidate O O O O
explanatory O O O O
variables O O O O
. O O O O
    
A O O O O
key O O O O
result O O O O
is O O O O
that O O O O
the O O O O
responses O O O O
of O O O O
the O O O O
different O O O O
moth O O O O
species O O O O
did O O O O
not O O O O
appear O O O O
to O O O O
have O O O O
strong O O O O
residual O O O O
correlation O O O O
( O O O O
Mutshinda O O O O
, O O O O
O O O O O
' O O O O
Hara O O O O
& O O O O
amp O O O O
; O O O O
Woiwod O O O O
2011 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
These O O O O
analyses O O O O
provide O O O O
an O O O O
approach O O O O
for O O O O
synthesising O O O O
across O O O O
species O O O O
and O O O O
can O O O O
better O O O O
inform O O O O
ecological O O O O
responses O O O O
to O O O O
environmental O O O O
change O O O O
. O O O O
    
Functional O O O O
analysis O O O O
of O O O O
a O O O O
mitochondrial O O O O
phosphopantetheinyl O O O O
transferase O O O O
( O O O O
PPTase O O O O
) O O O O
gene O O O O
pptB O O O O
in O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
mitochondrial O O O O
phosphopantetheinyl O O O O
transferase O O O O
gene O O O O
pptB O O O O
of O O O O
the O O O O
opportunistic O O O O
pathogen O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
has O O O O
been O O O O
identified O O O O
and O O O O
characterised O O O O
. O O O O
    
Unlike O O O O
pptA O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
required O O O O
for O O O O
lysine O O O O
biosynthesis O O O O
, O O O O
secondary O O O O
metabolism O O O O
, O O O O
and O O O O
iron O O O O
assimilation O O O O
, O O O O
pptB O O O O
is O O O O
essential O O O O
for O O O O
viability O O O O
. O O O O
    
PptB O O O O
is O O O O
located O O O O
in O O O O
the O O O O
mitochondria O O O O
. O O O O
    
In O O O O
vitro O O O O
expression O O O O
of O O O O
pptA O O O O
and O O O O
pptB O O O O
has O O O O
shown O O O O
that O O O O
PptB O O O O
is O O O O
specific O O O O
for O O O O
the O O O O
mitochondrial O O O O
acyl O O O O
carrier O O O O
protein O O O O
AcpA O O O O
. O O O O
    
Borderline O O O O
personality O O O O
disorder O O O O
. O O O O
    
Recent O O O O
research O O O O
findings O O O O
have O O O O
contributed O O O O
to O O O O
an O O O O
improved O O O O
understanding O O O O
and O O O O
treatment O O O O
of O O O O
borderline O O O O
personality O O O O
disorder O O O O
. O O O O
    
This O O O O
disorder O O O O
is O O O O
characterised O O O O
by O O O O
severe O O O O
functional O O O O
impairments O O O O
, O O O O
a O O O O
high O O O O
risk O O O O
of O O O O
suicide O O O O
, O O O O
a O O O O
negative O O O O
effect O O O O
on O O O O
the O O O O
course O O O O
of O O O O
depressive O O O O
disorders O O O O
, O O O O
extensive O O O O
use O O O O
of O O O O
treatment O O O O
, O O O O
and O O O O
high O O O O
costs O O O O
to O O O O
society O O O O
. O O O O
    
The O O O O
course O O O O
of O O O O
this O O O O
disorder O O O O
is O O O O
less O O O O
stable O O O O
than O O O O
expected O O O O
for O O O O
personality O O O O
disorders O O O O
. O O O O
    
The O O O O
causes O O O O
are O O O O
not O O O O
yet O O O O
clear O O O O
, O O O O
but O O O O
genetic O O O O
factors O O O O
and O O O O
adverse O O O O
life O O O O
events O O O O
seem O O O O
to O O O O
interact O O O O
to O O O O
lead O O O O
to O O O O
the O O O O
disorder O O O O
. O O O O
    
Neurobiological O O O O
research O O O O
suggests O O O O
that O O O O
abnormalities O O O O
in O O O O
the O O O O
frontolimbic O O O O
networks O O O O
are O O O O
associated O O O O
with O O O O
many O O O O
of O O O O
the O O O O
symptoms O O O O
. O O O O
    
Data O O O O
for O O O O
the O O O O
effectiveness O O O O
of O O O O
pharmacotherapy O O O O
vary O O O O
and O O O O
evidence O O O O
is O O O O
not O O O O
yet O O O O
robust O O O O
. O O O O
    
Specific O O O O
forms O O O O
of O O O O
psychotherapy O O O O
seem O O O O
to O O O O
be O O O O
beneficial O O O O
for O O O O
at O O O O
least O O O O
some O O O O
of O O O O
the O O O O
problems O O O O
frequently O O O O
reported O O O O
in O O O O
patients O O O O
with O O O O
borderline O O O O
personality O O O O
disorder O O O O
. O O O O
    
At O O O O
present O O O O
, O O O O
there O O O O
is O O O O
no O O O O
evidence O O O O
to O O O O
suggest O O O O
that O O O O
one O O O O
specific O O O O
form O O O O
of O O O O
psychotherapy O O O O
is O O O O
more O O O O
effective O O O O
than O O O O
another O O O O
. O O O O
    
Further O O O O
research O O O O
is O O O O
needed O O O O
on O O O O
the O O O O
diagnosis O O O O
, O O O O
neurobiology O O O O
, O O O O
and O O O O
treatment O O O O
of O O O O
borderline O O O O
personality O O O O
disorder O O O O
. O O O O
    
Spatio O O O O
- O O O O
temporal O O O O
variation O O O O
in O O O O
territory O O O O
quality O O O O
and O O O O
oxidative O O O O
status O O O O
: O O O O
a O O O O
natural O O O O
experiment O O O O
in O O O O
the O O O O
Seychelles B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
warbler O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Acrocephalus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sechellensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Fluctuations O O O O
in O O O O
the O O O O
quality O O O O
of O O O O
the O O O O
habitat O O O O
in O O O O
which O O O O
an O O O O
animal O O O O
lives O O O O
can O O O O
have O O O O
major O O O O
consequences O O O O
for O O O O
its O O O O
behaviour O O O O
and O O O O
physiological O O O O
state O O O O
. O O O O
    
In O O O O
poor O O O O
- O O O O
quality O O O O
habitat O O O O
with O O O O
low O O O O
food O O O O
availability O O O O
, O O O O
metabolically O O O O
intensive O O O O
foraging O O O O
activity O O O O
is O O O O
likely O O O O
to O O O O
result O O O O
in O O O O
increased O O O O
generation O O O O
of O O O O
reactive O O O O
oxygen O O O O
species O O O O
, O O O O
while O O O O
scarcity O O O O
of O O O O
food O O O O
can O O O O
lead O O O O
to O O O O
a O O O O
weakening O O O O
of O O O O
exogenously O O O O
derived O O O O
antioxidant O O O O
defences O O O O
. O O O O
    
The O O O O
consequent O O O O
oxidant O O O O
/ O O O O
antioxidant O O O O
imbalance O O O O
may O O O O
lead O O O O
to O O O O
elevated O O O O
oxidative O O O O
stress O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
the O O O O
link O O O O
between O O O O
food O O O O
availability O O O O
and O O O O
oxidative O O O O
stress O O O O
has O O O O
been O O O O
studied O O O O
in O O O O
the O O O O
laboratory O O O O
, O O O O
very O O O O
little O O O O
is O O O O
known O O O O
about O O O O
this O O O O
relationship O O O O
in O O O O
the O O O O
wild O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
investigate O O O O
the O O O O
association O O O O
between O O O O
territory O O O O
quality O O O O
( O O O O
measured O O O O
through O O O O
food O O O O
availability O O O O
) O O O O
and O O O O
oxidative O O O O
stress O O O O
in O O O O
the O O O O
Seychelles B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
warbler O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Acrocephalus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sechellensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Seychelles B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
warblers O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
are O O O O
insectivorous O O O O
birds O O O O
that O O O O
inhabit O O O O
a O O O O
fixed O O O O
feeding O O O O
territory O O O O
year O O O O
round O O O O
. O O O O
    
Individuals O O O O
experience O O O O
profound O O O O
and O O O O
rapid O O O O
local O O O O
fluctuations O O O O
in O O O O
territory O O O O
quality O O O O
within O O O O
these O O O O
territories O O O O
, O O O O
owing O O O O
to O O O O
changing O O O O
patterns O O O O
of O O O O
vegetation O O O O
defoliation O O O O
resulting O O O O
from O O O O
seasonal O O O O
changes O O O O
in O O O O
prevailing O O O O
wind O O O O
direction O O O O
and O O O O
wind O O O O
- O O O O
borne O O O O
salt O O O O
spray O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
As O O O O
expected O O O O
, O O O O
oxidant O O O O
generation O O O O
( O O O O
measured O O O O
as O O O O
reactive O O O O
oxygen O O O O
metabolites O O O O
; O O O O
ROMs O O O O
) O O O O
was O O O O
higher O O O O
when O O O O
territory O O O O
quality O O O O
was O O O O
low O O O O
, O O O O
but O O O O
there O O O O
was O O O O
no O O O O
correlation O O O O
between O O O O
territory O O O O
quality O O O O
and O O O O
antioxidant O O O O
capacity O O O O
( O O O O
OXY O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
negative O O O O
correlation O O O O
between O O O O
territory O O O O
quality O O O O
and O O O O
ROMs O O O O
was O O O O
significant O O O O
between O O O O
individuals O O O O
and O O O O
approached O O O O
significance O O O O
within O O O O
individuals O O O O
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
the O O O O
pattern O O O O
resulted O O O O
from O O O O
individual O O O O
responses O O O O
to O O O O
environmental O O O O
variation O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
ROMs O O O O
and O O O O
OXY O O O O
levels O O O O
within O O O O
individuals O O O O
were O O O O
positively O O O O
correlated O O O O
, O O O O
but O O O O
the O O O O
relationship O O O O
between O O O O
territory O O O O
quality O O O O
and O O O O
ROMs O O O O
persisted O O O O
after O O O O
including O O O O
OXY O O O O
as O O O O
a O O O O
covariate O O O O
, O O O O
implying O O O O
that O O O O
oxidative O O O O
stress O O O O
occurs O O O O
in O O O O
low O O O O
territory O O O O
quality O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
indicate O O O O
that O O O O
the O O O O
oxidative O O O O
stress O O O O
balance O O O O
of O O O O
an O O O O
individual O O O O
is O O O O
sensitive O O O O
to O O O O
relatively O O O O
short O O O O
- O O O O
term O O O O
changes O O O O
in O O O O
territory O O O O
quality O O O O
, O O O O
which O O O O
may O O O O
have O O O O
consequences O O O O
for O O O O
the O O O O
birds O O O O
' O O O O
fitness O O O O
. O O O O
    
Ice O O O O
- O O O O
cover O O O O
effects O O O O
on O O O O
competitive O O O O
interactions O O O O
between O O O O
two O O O O
fish O O O O
species O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Variations O O O O
in O O O O
the O O O O
strength O O O O
of O O O O
ecological O O O O
interactions O O O O
between O O O O
seasons O O O O
have O O O O
received O O O O
little O O O O
attention O O O O
, O O O O
despite O O O O
an O O O O
increased O O O O
focus O O O O
on O O O O
climate O O O O
alterations O O O O
on O O O O
ecosystems O O O O
. O O O O
    
Particularly O O O O
, O O O O
the O O O O
winter O O O O
situation O O O O
is O O O O
often O O O O
neglected O O O O
when O O O O
studying O O O O
competitive O O O O
interactions O O O O
. O O O O
    
In O O O O
northern O O O O
temperate O O O O
freshwaters O O O O
, O O O O
winter O O O O
implies O O O O
low O O O O
temperatures O O O O
and O O O O
reduced O O O O
food O O O O
availability O O O O
, O O O O
but O O O O
also O O O O
strong O O O O
reduction O O O O
in O O O O
ambient O O O O
light O O O O
because O O O O
of O O O O
ice O O O O
and O O O O
snow O O O O
cover O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
study O O O O
how O O O O
brown B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trout O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
[ O O O O
Salmo B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trutta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
L O O O O
. O O O O
) O O O O
] O O O O
respond O O O O
to O O O O
variations O O O O
in O O O O
ice O O O O
- O O O O
cover O O O O
duration O O O O
and O O O O
competition O O O O
with O O O O
Arctic B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
charr O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
[ O O O O
Salvelinus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
alpinus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
L O O O O
. O O O O
) O O O O
] O O O O
, O O O O
by O O O O
linking O O O O
laboratory O O O O
- O O O O
derived O O O O
physiological O O O O
performance O O O O
and O O O O
field O O O O
data O O O O
on O O O O
variation O O O O
in O O O O
abundance O O O O
among O O O O
and O O O O
within O O O O
natural O O O O
brown B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trout O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
populations O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
Arctic B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
charr O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
brown B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trout O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
reduced O O O O
resting O O O O
metabolic O O O O
rate O O O O
under O O O O
simulated O O O O
ice O O O O
- O O O O
cover O O O O
( O O O O
darkness O O O O
) O O O O
in O O O O
the O O O O
laboratory O O O O
, O O O O
compared O O O O
to O O O O
no O O O O
ice O O O O
( O O O O
6 O O O O
- O O O O
h O O O O
daylight O O O O
) O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
in O O O O
contrast O O O O
to O O O O
brown B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trout O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Arctic B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
charr O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
able O O O O
to O O O O
obtain O O O O
positive O O O O
growth O O O O
rate O O O O
in O O O O
darkness O O O O
and O O O O
had O O O O
higher O O O O
food O O O O
intake O O O O
in O O O O
tank O O O O
experiments O O O O
than O O O O
brown B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trout O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Arctic B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
charr O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
also O O O O
performed O O O O
better O O O O
( O O O O
lower O O O O
energy O O O O
loss O O O O
) O O O O
under O O O O
simulated O O O O
ice O O O O
- O O O O
cover O O O O
in O O O O
a O O O O
semi O O O O
- O O O O
natural O O O O
environment O O O O
with O O O O
natural O O O O
food O O O O
supply O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
When O O O O
comparing O O O O
brown B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trout O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
biomass O O O O
across O O O O
190 O O O O
Norwegian O O O O
lakes O O O O
along O O O O
a O O O O
climate O O O O
gradient O O O O
, O O O O
longer O O O O
ice O O O O
- O O O O
covered O O O O
duration O O O O
decreased O O O O
the O O O O
biomass O O O O
only O O O O
in O O O O
lakes O O O O
where O O O O
brown B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trout O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
lived O O O O
together O O O O
with O O O O
Arctic B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
charr O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
We O O O O
were O O O O
not O O O O
able O O O O
to O O O O
detect O O O O
any O O O O
effect O O O O
of O O O O
ice O O O O
- O O O O
cover O O O O
on O O O O
brown B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trout O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
biomass O O O O
in O O O O
lakes O O O O
where O O O O
brown B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trout O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
the O O O O
only O O O O
fish O O O O
species O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Similarly O O O O
, O O O O
a O O O O
25 O O O O
- O O O O
year O O O O
time O O O O
series O O O O
from O O O O
a O O O O
lake O O O O
with O O O O
both O O O O
brown B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trout O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Arctic B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
charr O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
showed O O O O
that O O O O
brown B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trout O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
population O O O O
growth O O O O
rate O O O O
depended O O O O
on O O O O
the O O O O
interaction O O O O
between O O O O
ice O O O O
breakup O O O O
date O O O O
and O O O O
Arctic B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
charr O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
abundance O O O O
. O O O O
    
High O O O O
charr B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
abundance O O O O
was O O O O
correlated O O O O
with O O O O
low O O O O
trout O O O O
population O O O O
growth O O O O
rate O O O O
only O O O O
in O O O O
combination O O O O
with O O O O
long O O O O
winters O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
In O O O O
conclusion O O O O
, O O O O
the O O O O
two O O O O
species O O O O
differed O O O O
in O O O O
performance O O O O
under O O O O
ice O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
observed O O O O
outcome O O O O
of O O O O
competition O O O O
in O O O O
natural O O O O
populations O O O O
was O O O O
strongly O O O O
dependent O O O O
on O O O O
duration O O O O
of O O O O
the O O O O
ice O O O O
- O O O O
covered O O O O
period O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
study O O O O
shows O O O O
that O O O O
changes O O O O
in O O O O
ice O O O O
phenology O O O O
may O O O O
alter O O O O
species O O O O
interactions O O O O
in O O O O
Northern O O O O
aquatic O O O O
systems O O O O
. O O O O
    
Increased O O O O
knowledge O O O O
of O O O O
how O O O O
adaptations O O O O
to O O O O
winter O O O O
conditions O O O O
differ O O O O
among O O O O
coexisting O O O O
species O O O O
is O O O O
therefore O O O O
vital O O O O
for O O O O
our O O O O
understanding O O O O
of O O O O
ecological O O O O
impacts O O O O
of O O O O
climate O O O O
change O O O O
. O O O O
    
Predicting O O O O
the O O O O
post O O O O
- O O O O
fire O O O O
responses O O O O
of O O O O
animal O O O O
assemblages O O O O
: O O O O
testing O O O O
a O O O O
trait O O O O
- O O O O
based O O O O
approach O O O O
using O O O O
spiders O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Developing O O O O
a O O O O
predictive O O O O
understanding O O O O
of O O O O
how O O O O
species O O O O
assemblages O O O O
respond O O O O
to O O O O
fire O O O O
is O O O O
a O O O O
key O O O O
conservation O O O O
goal O O O O
. O O O O
    
In O O O O
moving O O O O
from O O O O
solely O O O O
describing O O O O
patterns O O O O
following O O O O
fire O O O O
to O O O O
predicting O O O O
changes O O O O
, O O O O
plant O O O O
ecologists O O O O
have O O O O
successfully O O O O
elucidated O O O O
generalizations O O O O
based O O O O
on O O O O
functional O O O O
traits O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
species O O O O
traits O O O O
might O O O O
also O O O O
allow O O O O
better O O O O
predictions O O O O
for O O O O
fauna O O O O
, O O O O
but O O O O
there O O O O
are O O O O
few O O O O
empirical O O O O
tests O O O O
of O O O O
this O O O O
approach O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
examined O O O O
whether O O O O
species O O O O
traits O O O O
changed O O O O
with O O O O
post O O O O
- O O O O
fire O O O O
age O O O O
for O O O O
spiders O O O O
in O O O O
27 O O O O
sites O O O O
, O O O O
representing O O O O
a O O O O
chronosequence O O O O
of O O O O
0 O O O O
- O O O O
20 O O O O
years O O O O
post O O O O
- O O O O
fire O O O O
. O O O O
    
We O O O O
predicted O O O O
a O O O O
priori O O O O
whether O O O O
spiders O O O O
with O O O O
ten O O O O
traits O O O O
associated O O O O
with O O O O
survival O O O O
, O O O O
dispersal O O O O
, O O O O
reproduction O O O O
, O O O O
resource O O O O
- O O O O
utilization O O O O
and O O O O
microhabitat O O O O
occupation O O O O
would O O O O
increase O O O O
or O O O O
decrease O O O O
with O O O O
post O O O O
- O O O O
fire O O O O
age O O O O
. O O O O
    
We O O O O
then O O O O
tested O O O O
these O O O O
predictions O O O O
using O O O O
a O O O O
direct O O O O
( O O O O
fourth O O O O
- O O O O
corner O O O O
on O O O O
individual O O O O
traits O O O O
and O O O O
composite O O O O
traits O O O O
) O O O O
and O O O O
an O O O O
indirect O O O O
( O O O O
emergent O O O O
groups O O O O
) O O O O
approach O O O O
, O O O O
comparing O O O O
the O O O O
benefits O O O O
of O O O O
each O O O O
and O O O O
also O O O O
examining O O O O
the O O O O
degree O O O O
to O O O O
which O O O O
traits O O O O
were O O O O
intercorrelated O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
For O O O O
the O O O O
seven O O O O
individual O O O O
traits O O O O
that O O O O
were O O O O
significant O O O O
, O O O O
three O O O O
followed O O O O
predictions O O O O
( O O O O
body O O O O
size O O O O
, O O O O
abundance O O O O
of O O O O
burrow O O O O
ambushers O O O O
and O O O O
burrowers O O O O
was O O O O
greater O O O O
in O O O O
recently O O O O
burnt O O O O
sites O O O O
) O O O O
; O O O O
two O O O O
were O O O O
opposite O O O O
( O O O O
species O O O O
with O O O O
heavy O O O O
sclerotisation O O O O
of O O O O
the O O O O
cephalothorax O O O O
and O O O O
longer O O O O
time O O O O
to O O O O
maturity O O O O
were O O O O
in O O O O
greater O O O O
abundance O O O O
in O O O O
long O O O O
unburnt O O O O
and O O O O
recently O O O O
burnt O O O O
sites O O O O
respectively O O O O
) O O O O
; O O O O
and O O O O
two O O O O
displayed O O O O
response O O O O
patterns O O O O
more O O O O
complex O O O O
than O O O O
predicted O O O O
( O O O O
abdominal O O O O
scutes O O O O
displayed O O O O
a O O O O
U O O O O
- O O O O
shaped O O O O
response O O O O
and O O O O
dispersal O O O O
ability O O O O
a O O O O
hump O O O O
shaped O O O O
curve O O O O
) O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
within O O O O
a O O O O
given O O O O
trait O O O O
, O O O O
there O O O O
were O O O O
few O O O O
significant O O O O
differences O O O O
among O O O O
post O O O O
- O O O O
fire O O O O
ages O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Several O O O O
traits O O O O
were O O O O
intercorrelated O O O O
and O O O O
scores O O O O
based O O O O
on O O O O
composite O O O O
traits O O O O
used O O O O
in O O O O
a O O O O
fourth O O O O
- O O O O
corner O O O O
analysis O O O O
found O O O O
significant O O O O
patterns O O O O
, O O O O
but O O O O
slightly O O O O
different O O O O
to O O O O
those O O O O
using O O O O
individual O O O O
traits O O O O
. O O O O
    
Changes O O O O
in O O O O
abundance O O O O
with O O O O
post O O O O
- O O O O
fire O O O O
age O O O O
were O O O O
significant O O O O
for O O O O
three O O O O
of O O O O
the O O O O
five O O O O
emergent O O O O
groups O O O O
. O O O O
    
The O O O O
fourth O O O O
- O O O O
corner O O O O
analysis O O O O
yielded O O O O
more O O O O
detailed O O O O
results O O O O
, O O O O
but O O O O
overall O O O O
we O O O O
consider O O O O
the O O O O
two O O O O
approaches O O O O
complementary O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
While O O O O
we O O O O
found O O O O
significant O O O O
differences O O O O
in O O O O
traits O O O O
with O O O O
post O O O O
- O O O O
fire O O O O
age O O O O
, O O O O
our O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
a O O O O
trait O O O O
- O O O O
based O O O O
approach O O O O
may O O O O
not O O O O
increase O O O O
predictive O O O O
power O O O O
, O O O O
at O O O O
least O O O O
for O O O O
the O O O O
assemblages O O O O
of O O O O
spiders O O O O
we O O O O
studied O O O O
. O O O O
    
That O O O O
said O O O O
, O O O O
there O O O O
are O O O O
many O O O O
refinements O O O O
to O O O O
faunal O O O O
traits O O O O
that O O O O
could O O O O
increase O O O O
predictive O O O O
power O O O O
. O O O O
    
Analysis O O O O
of O O O O
expressed O O O O
sequence O O O O
tags O O O O
from O O O O
Maize B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mosaic O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
rhabdovirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O O O O
infected O O O O
gut O O O O
tissues O O O O
of O O O O
Peregrinus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
maidis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
reveals O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
key O O O O
components O O O O
of O O O O
insect O O O O
innate O O O O
immunity O O O O
. O O O O
    
The O O O O
corn B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
planthopper O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Peregrinus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
maidis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
causes O O O O
direct O O O O
feeding O O O O
damage O O O O
to O O O O
plants O O O O
and O O O O
transmits O O O O
Maize B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mosaic O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
rhabdovirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
MMV O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
a O O O O
persistent O O O O
- O O O O
propagative O O O O
manner O O O O
. O O O O
    
MMV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
must O O O O
cross O O O O
several O O O O
insect O O O O
tissue O O O O
layers O O O O
for O O O O
successful O O O O
transmission O O O O
to O O O O
occur O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
gut O O O O
serves O O O O
as O O O O
an O O O O
important O O O O
barrier O O O O
for O O O O
rhabdovirus O O O O
transmission O O O O
. O O O O
    
In O O O O
order O O O O
to O O O O
facilitate O O O O
the O O O O
identification O O O O
of O O O O
proteins O O O O
that O O O O
may O O O O
interact O O O O
with O O O O
MMV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
either O O O O
by O O O O
facilitating O O O O
acquisition O O O O
or O O O O
responding O O O O
to O O O O
virus O O O O
infection O O O O
, O O O O
we O O O O
generated O O O O
and O O O O
analysed O O O O
the O O O O
gut O O O O
transcriptome O O O O
of O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
maidis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
From O O O O
two O O O O
normalized O O O O
cDNA O O O O
libraries O O O O
, O O O O
we O O O O
generated O O O O
a O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
maidis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gut O O O O
transcriptome O O O O
composed O O O O
of O O O O
20 O O O O
, O O O O
771 O O O O
expressed O O O O
sequence O O O O
tags O O O O
( O O O O
ESTs O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Assembly O O O O
of O O O O
the O O O O
sequences O O O O
yielded O O O O
1860 O O O O
contigs O O O O
and O O O O
14 O O O O
, O O O O
032 O O O O
singletons O O O O
, O O O O
and O O O O
biological O O O O
roles O O O O
were O O O O
assigned O O O O
to O O O O
5793 O O O O
( O O O O
36 O O O O
% O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Comparison O O O O
of O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
maidis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ESTs O O O O
with O O O O
other O O O O
insect O O O O
amino O O O O
acid O O O O
sequences O O O O
revealed O O O O
that O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
maidis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
shares O O O O
greatest O O O O
sequence O O O O
similarity O O O O
with O O O O
another O O O O
hemipteran O O O O
, O O O O
the O O O O
brown B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
planthopper O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Nilaparvata B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
lugens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
We O O O O
identified O O O O
202 O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
maidis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
transcripts O O O O
with O O O O
putative O O O O
homology O O O O
to O O O O
proteins O O O O
associated O O O O
with O O O O
insect O O O O
innate O O O O
immunity O O O O
, O O O O
including O O O O
those O O O O
implicated O O O O
in O O O O
the O O O O
Toll O O O O
, O O O O
Imd O O O O
, O O O O
JAK O O O O
/ O O O O
STAT O O O O
, O O O O
Jnk O O O O
and O O O O
the O O O O
small O O O O
- O O O O
interfering O O O O
RNA O O O O
- O O O O
mediated O O O O
pathways O O O O
. O O O O
    
Sequence O O O O
comparisons O O O O
between O O O O
our O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
maidis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gut O O O O
EST O O O O
collection O O O O
and O O O O
the O O O O
currently O O O O
available O O O O
National O O O O
Center O O O O
for O O O O
Biotechnology O O O O
Information O O O O
EST O O O O
database O O O O
collection O O O O
for O O O O
Ni B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
lugens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
revealed O O O O
that O O O O
a O O O O
pathogen O O O O
recognition O O O O
receptor O O O O
in O O O O
the O O O O
Imd O O O O
pathway O O O O
, O O O O
peptidoglycan O O O O
recognition O O O O
protein O O O O
- O O O O
long O O O O
class O O O O
( O O O O
PGRP O O O O
- O O O O
LC O O O O
) O O O O
, O O O O
is O O O O
present O O O O
in O O O O
these O O O O
two O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
family O O O O
Delphacidae O O O O
; O O O O
however O O O O
, O O O O
these O O O O
recognition O O O O
receptors O O O O
are O O O O
lacking O O O O
in O O O O
the O O O O
model O O O O
hemipteran O O O O
Acyrthosiphon B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pisum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
, O O O O
we O O O O
identified O O O O
sequences O O O O
in O O O O
the O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
maidis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gut O O O O
transcriptome O O O O
that O O O O
share O O O O
significant O O O O
amino O O O O
acid O O O O
sequence O O O O
similarities O O O O
with O O O O
the O O O O
rhabdovirus O O O O
receptor O O O O
molecule O O O O
, O O O O
acetylcholine O O O O
receptor O O O O
( O O O O
AChR O O O O
) O O O O
, O O O O
found O O O O
in O O O O
other O O O O
hosts O O O O
. O O O O
    
This O O O O
EST O O O O
analysis O O O O
sheds O O O O
new O O O O
light O O O O
on O O O O
immune O O O O
response O O O O
pathways O O O O
in O O O O
hemipteran O O O O
guts O O O O
that O O O O
will O O O O
be O O O O
useful O O O O
for O O O O
further O O O O
dissecting O O O O
innate O O O O
defence O O O O
response O O O O
pathways O O O O
to O O O O
rhabdovirus O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
Genetic O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
xenobiotic O O O O
resistance O O O O
- O O O O
associated O O O O
ABC O O O O
gene O O O O
subfamilies O O O O
of O O O O
the O O O O
Lepidoptera O O O O
. O O O O
    
Some O O O O
ATP O O O O
- O O O O
binding O O O O
cassette O O O O
( O O O O
ABC O O O O
) O O O O
transporters O O O O
of O O O O
subfamilies O O O O
B O O O O
, O O O O
C O O O O
and O O O O
G O O O O
confer O O O O
resistance O O O O
to O O O O
xenobiotics O O O O
including O O O O
insecticides O O O O
. O O O O
    
We O O O O
identified O O O O
genes O O O O
of O O O O
these O O O O
subfamilies O O O O
expressed O O O O
by O O O O
the O O O O
lepidopterans O O O O
Trichoplusia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ni O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Bombyx B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mori O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
mori O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
genome O O O O
includes O O O O
eight O O O O
, O O O O
six O O O O
and O O O O
13 O O O O
ABC O O O O
- O O O O
B O O O O
, O O O O
- O O O O
C O O O O
and O O O O
- O O O O
G O O O O
genes O O O O
, O O O O
respectively O O O O
, O O O O
which O O O O
encode O O O O
P O O O O
- O O O O
glycoprotein O O O O
, O O O O
multidrug O O O O
resistance O O O O
protein O O O O
, O O O O
MRP O O O O
, O O O O
and O O O O
breast O O O O
cancer O O O O
resistance O O O O
protein O O O O
, O O O O
BCRP O O O O
, O O O O
homologues O O O O
. O O O O
    
Among O O O O
the O O O O
ABC O O O O
- O O O O
C O O O O
and O O O O
- O O O O
G O O O O
subfamilies O O O O
, O O O O
gene O O O O
duplication O O O O
contributes O O O O
to O O O O
protein O O O O
diversity O O O O
. O O O O
    
We O O O O
have O O O O
identified O O O O
three O O O O
ABC O O O O
- O O O O
B O O O O
and O O O O
two O O O O
ABC O O O O
- O O O O
C O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ni O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
genes O O O O
. O O O O
    
Analyses O O O O
of O O O O
the O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ni O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
MRP O O O O
( O O O O
TrnMRP O O O O
) O O O O
revealed O O O O
unique O O O O
features O O O O
, O O O O
including O O O O
the O O O O
potential O O O O
for O O O O
TrnMRP4 O O O O
hyperglycosylation O O O O
and O O O O
the O O O O
alternative O O O O
splicing O O O O
of O O O O
TrnMRP1 O O O O
. O O O O
    
Taken O O O O
together O O O O
, O O O O
these O O O O
attributes O O O O
of O O O O
moth O O O O
multidrug O O O O
resistance O O O O
- O O O O
associated O O O O
ABCs O O O O
may O O O O
confer O O O O
distinct O O O O
functional O O O O
capacities O O O O
to O O O O
xenobiotic O O O O
efflux O O O O
. O O O O
    
Effects O O O O
of O O O O
Wolbachia O O O O
on O O O O
mtDNA O O O O
variation O O O O
and O O O O
evolution O O O O
in O O O O
natural O O O O
populations O O O O
of O O O O
Tetranychus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
urticae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Koch O O O O
. O O O O
    
We O O O O
investigated O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
Wolbachia O O O O
infection O O O O
on O O O O
mtDNA O O O O
variation O O O O
in O O O O
spider O O O O
mites O O O O
by O O O O
sequencing O O O O
a O O O O
portion O O O O
of O O O O
the O O O O
mitochondrial O O O O
cytochrome O O O O
oxidase O O O O
I O O O O
( O O O O
COI O O O O
) O O O O
gene O O O O
from O O O O
198 O O O O
individuals O O O O
of O O O O
known O O O O
infection O O O O
status O O O O
. O O O O
    
Four O O O O
Wolbachia O O O O
strains O O O O
were O O O O
described O O O O
in O O O O
the O O O O
current O O O O
study O O O O
, O O O O
namely O O O O
wUrtOri1 O O O O
, O O O O
wUrtOri2 O O O O
, O O O O
wUrtOri3 O O O O
and O O O O
wUrtCon1 O O O O
. O O O O
    
As O O O O
predicted O O O O
, O O O O
the O O O O
haplotype O O O O
and O O O O
nucleotide O O O O
diversity O O O O
were O O O O
lower O O O O
in O O O O
infected O O O O
individuals O O O O
than O O O O
in O O O O
uninfected O O O O
individuals O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
these O O O O
mtDNA O O O O
haplotype O O O O
data O O O O
are O O O O
not O O O O
entirely O O O O
concordant O O O O
with O O O O
the O O O O
surface O O O O
protein O O O O
of O O O O
wolbachia O O O O
( O O O O
wsp O O O O
) O O O O
sequence O O O O
data O O O O
and O O O O
both O O O O
infected O O O O
and O O O O
uninfected O O O O
individuals O O O O
were O O O O
found O O O O
of O O O O
the O O O O
same O O O O
haplotype O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
values O O O O
of O O O O
Tajima O O O O
' O O O O
s O O O O
D O O O O
and O O O O
Fu O O O O
& O O O O
amp O O O O
; O O O O
Li O O O O
' O O O O
s O O O O
F O O O O
were O O O O
consistently O O O O
less O O O O
than O O O O
zero O O O O
for O O O O
most O O O O
infected O O O O
groups O O O O
, O O O O
McDonald O O O O
- O O O O
Kreitman O O O O
tests O O O O
suggested O O O O
that O O O O
the O O O O
patterns O O O O
of O O O O
variation O O O O
were O O O O
different O O O O
from O O O O
those O O O O
expected O O O O
under O O O O
neutrality O O O O
in O O O O
only O O O O
the O O O O
uninfected O O O O
group O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
the O O O O
neutrality O O O O
tests O O O O
do O O O O
not O O O O
show O O O O
a O O O O
clear O O O O
effect O O O O
of O O O O
Wolbachia O O O O
infection O O O O
on O O O O
patterns O O O O
of O O O O
mtDNA O O O O
variation O O O O
and O O O O
substitution O O O O
in O O O O
spider O O O O
mites O O O O
. O O O O
    
Decompression O O O O
illness O O O O
. O O O O
    
Decompression O O O O
illness O O O O
is O O O O
caused O O O O
by O O O O
intravascular O O O O
or O O O O
extravascular O O O O
bubbles O O O O
that O O O O
are O O O O
formed O O O O
as O O O O
a O O O O
result O O O O
of O O O O
reduction O O O O
in O O O O
environmental O O O O
pressure O O O O
( O O O O
decompression O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
term O O O O
covers O O O O
both O O O O
arterial O O O O
gas O O O O
embolism O O O O
, O O O O
in O O O O
which O O O O
alveolar O O O O
gas O O O O
or O O O O
venous O O O O
gas O O O O
emboli O O O O
( O O O O
via O O O O
cardiac O O O O
shunts O O O O
or O O O O
via O O O O
pulmonary O O O O
vessels O O O O
) O O O O
are O O O O
introduced O O O O
into O O O O
the O O O O
arterial O O O O
circulation O O O O
, O O O O
and O O O O
decompression O O O O
sickness O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
caused O O O O
by O O O O
in O O O O
- O O O O
situ O O O O
bubble O O O O
formation O O O O
from O O O O
dissolved O O O O
inert O O O O
gas O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
syndromes O O O O
can O O O O
occur O O O O
in O O O O
divers O O O O
, O O O O
compressed O O O O
air O O O O
workers O O O O
, O O O O
aviators O O O O
, O O O O
and O O O O
astronauts O O O O
, O O O O
but O O O O
arterial O O O O
gas O O O O
embolism O O O O
also O O O O
arises O O O O
from O O O O
iatrogenic O O O O
causes O O O O
unrelated O O O O
to O O O O
decompression O O O O
. O O O O
    
Risk O O O O
of O O O O
decompression O O O O
illness O O O O
is O O O O
affected O O O O
by O O O O
immersion O O O O
, O O O O
exercise O O O O
, O O O O
and O O O O
heat O O O O
or O O O O
cold O O O O
. O O O O
    
Manifestations O O O O
range O O O O
from O O O O
itching O O O O
and O O O O
minor O O O O
pain O O O O
to O O O O
neurological O O O O
symptoms O O O O
, O O O O
cardiac O O O O
collapse O O O O
, O O O O
and O O O O
death O O O O
. O O O O
    
First O O O O
- O O O O
aid O O O O
treatment O O O O
is O O O O
100 O O O O
% O O O O
oxygen O O O O
and O O O O
definitive O O O O
treatment O O O O
is O O O O
recompression O O O O
to O O O O
increased O O O O
pressure O O O O
, O O O O
breathing O O O O
100 O O O O
% O O O O
oxygen O O O O
. O O O O
    
Adjunctive O O O O
treatment O O O O
, O O O O
including O O O O
fluid O O O O
administration O O O O
and O O O O
prophylaxis O O O O
against O O O O
venous O O O O
thromboembolism O O O O
in O O O O
paralysed O O O O
patients O O O O
, O O O O
is O O O O
also O O O O
recommended O O O O
. O O O O
    
Treatment O O O O
is O O O O
, O O O O
in O O O O
most O O O O
cases O O O O
, O O O O
effective O O O O
although O O O O
residual O O O O
deficits O O O O
can O O O O
remain O O O O
in O O O O
serious O O O O
cases O O O O
, O O O O
even O O O O
after O O O O
several O O O O
recompressions O O O O
. O O O O
    
The O O O O
genetic O O O O
basis O O O O
for O O O O
3 O O O O
- O O O O
ADON O O O O
and O O O O
15 O O O O
- O O O O
ADON O O O O
trichothecene O O O O
chemotypes O O O O
in O O O O
Fusarium O O O O
. O O O O
    
Certain O O O O
Fusarium O O O O
species O O O O
cause O O O O
head O O O O
blight O O O O
of O O O O
wheat B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
other O O O O
small O O O O
grains O O O O
worldwide O O O O
and O O O O
produce O O O O
trichothecene O O O O
mycotoxins O O O O
. O O O O
    
These O O O O
mycotoxins O O O O
can O O O O
induce O O O O
toxicoses O O O O
in O O O O
animals O O O O
and O O O O
humans B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
can O O O O
contribute O O O O
to O O O O
the O O O O
ability O O O O
of O O O O
some O O O O
fusaria O O O O
to O O O O
cause O O O O
plant O O O O
disease O O O O
. O O O O
    
Production O O O O
of O O O O
the O O O O
trichothecene O O O O
3 O O O O
- O O O O
acetyldeoxynivalenol O O O O
( O O O O
3 O O O O
- O O O O
ADON O O O O
) O O O O
versus O O O O
15 O O O O
- O O O O
acetyldeoxynivalenol O O O O
( O O O O
15 O O O O
- O O O O
ADON O O O O
) O O O O
is O O O O
an O O O O
important O O O O
phenotypic O O O O
difference O O O O
within O O O O
and O O O O
among O O O O
some O O O O
Fusarium O O O O
species O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
until O O O O
now O O O O
, O O O O
the O O O O
genetic O O O O
basis O O O O
for O O O O
this O O O O
difference O O O O
in O O O O
chemotype O O O O
has O O O O
not O O O O
been O O O O
identified O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
identified O O O O
consistent O O O O
DNA O O O O
sequence O O O O
differences O O O O
in O O O O
the O O O O
coding O O O O
region O O O O
of O O O O
the O O O O
trichothecene O O O O
biosynthetic O O O O
gene O O O O
TRI8 O O O O
in O O O O
3 O O O O
- O O O O
ADON O O O O
and O O O O
15 O O O O
- O O O O
ADON O O O O
strains O O O O
. O O O O
    
Functional O O O O
analyses O O O O
of O O O O
the O O O O
TRI8 O O O O
enzyme O O O O
( O O O O
Tri8 O O O O
) O O O O
in O O O O
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
graminearum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
the O O O O
predominant O O O O
cause O O O O
of O O O O
wheat O O O O
head O O O O
blight O O O O
in O O O O
North O O O O
America O O O O
and O O O O
Europe O O O O
, O O O O
revealed O O O O
that O O O O
Tri8 O O O O
from O O O O
3 O O O O
- O O O O
ADON O O O O
strains O O O O
catalyzes O O O O
deacetylation O O O O
of O O O O
the O O O O
trichothecene O O O O
biosynthetic O O O O
intermediate O O O O
3 O O O O
, O O O O
15 O O O O
- O O O O
diacetyldeoxynivalenol O O O O
at O O O O
carbon O O O O
15 O O O O
to O O O O
yield O O O O
3 O O O O
- O O O O
ADON O O O O
, O O O O
whereas O O O O
Tri8 O O O O
from O O O O
15 O O O O
- O O O O
ADON O O O O
strains O O O O
catalyzes O O O O
deacetylation O O O O
of O O O O
3 O O O O
, O O O O
15 O O O O
- O O O O
diacetyldeoxynivalenol O O O O
at O O O O
carbon O O O O
3 O O O O
to O O O O
yield O O O O
15 O O O O
- O O O O
ADON O O O O
. O O O O
    
Fusarium O O O O
strains O O O O
that O O O O
produce O O O O
the O O O O
trichothecene O O O O
nivalenol O O O O
have O O O O
a O O O O
Tri8 O O O O
that O O O O
functions O O O O
like O O O O
that O O O O
in O O O O
15 O O O O
- O O O O
ADON O O O O
strains O O O O
. O O O O
    
TRI3 O O O O
, O O O O
which O O O O
encodes O O O O
a O O O O
trichothecene O O O O
carbon O O O O
15 O O O O
acetyltransferase O O O O
, O O O O
was O O O O
found O O O O
to O O O O
be O O O O
functional O O O O
in O O O O
all O O O O
three O O O O
chemotypes O O O O
. O O O O
    
Together O O O O
, O O O O
our O O O O
data O O O O
indicate O O O O
that O O O O
differential O O O O
activity O O O O
of O O O O
Tri8 O O O O
determines O O O O
the O O O O
3 O O O O
- O O O O
ADON O O O O
and O O O O
15 O O O O
- O O O O
ADON O O O O
chemotypes O O O O
in O O O O
Fusarium O O O O
. O O O O
    
Influence O O O O
of O O O O
proximity O O O O
to O O O O
a O O O O
geographical O O O O
range O O O O
limit O O O O
on O O O O
the O O O O
physiology O O O O
of O O O O
a O O O O
tropical O O O O
bird O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Species O O O O
' O O O O
geographical O O O O
ranges O O O O
can O O O O
be O O O O
limited O O O O
by O O O O
a O O O O
variety O O O O
of O O O O
biotic O O O O
and O O O O
abiotic O O O O
factors O O O O
. O O O O
    
Physiological O O O O
challenge O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
unsuitable O O O O
environmental O O O O
conditions O O O O
can O O O O
establish O O O O
limits O O O O
to O O O O
geographical O O O O
ranges O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
studied O O O O
the O O O O
physiology O O O O
of O O O O
Song B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
Wrens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Cyphorhinus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
phaeocephalus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
across O O O O
their O O O O
geographical O O O O
range O O O O
on O O O O
the O O O O
isthmus O O O O
of O O O O
Panama O O O O
, O O O O
an O O O O
area O O O O
characterized O O O O
by O O O O
a O O O O
strong O O O O
rainfall O O O O
gradient O O O O
. O O O O
    
Wrens O O O O
are O O O O
common O O O O
on O O O O
the O O O O
Caribbean O O O O
slope O O O O
of O O O O
the O O O O
isthmus O O O O
where O O O O
annual O O O O
rainfall O O O O
is O O O O
greatest O O O O
, O O O O
but O O O O
wren O O O O
abundance O O O O
declines O O O O
towards O O O O
the O O O O
south O O O O
as O O O O
annual O O O O
rainfall O O O O
declines O O O O
. O O O O
    
Song B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
Wrens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
are O O O O
completely O O O O
absent O O O O
from O O O O
the O O O O
driest O O O O
third O O O O
of O O O O
the O O O O
isthmus O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
searched O O O O
for O O O O
the O O O O
existence O O O O
of O O O O
a O O O O
physiologically O O O O
induced O O O O
distribution O O O O
limit O O O O
by O O O O
measuring O O O O
body O O O O
condition O O O O
( O O O O
an O O O O
integrative O O O O
measure O O O O
of O O O O
energy O O O O
balance O O O O
) O O O O
, O O O O
hematocrit O O O O
( O O O O
% O O O O
packed O O O O
red O O O O
blood O O O O
cells O O O O
in O O O O
a O O O O
given O O O O
blood O O O O
sample O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
corticosterone O O O O
levels O O O O
( O O O O
CORT O O O O
, O O O O
a O O O O
steroid O O O O
hormone O O O O
that O O O O
regulates O O O O
the O O O O
availability O O O O
of O O O O
energy O O O O
and O O O O
the O O O O
endocrine O O O O
stress O O O O
response O O O O
) O O O O
in O O O O
males O O O O
and O O O O
females O O O O
. O O O O
    
We O O O O
caught O O O O
birds O O O O
by O O O O
luring O O O O
them O O O O
into O O O O
nets O O O O
when O O O O
they O O O O
responded O O O O
to O O O O
playback O O O O
of O O O O
conspecific O O O O
song O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Wrens O O O O
living O O O O
in O O O O
drier O O O O
habitat O O O O
near O O O O
the O O O O
geographical O O O O
range O O O O
edge O O O O
were O O O O
significantly O O O O
more O O O O
likely O O O O
to O O O O
have O O O O
abnormally O O O O
low O O O O
hematocrit O O O O
scores O O O O
. O O O O
    
Baseline O O O O
CORT O O O O
levels O O O O
were O O O O
negatively O O O O
associated O O O O
with O O O O
rainfall O O O O
in O O O O
one O O O O
of O O O O
our O O O O
three O O O O
best O O O O
- O O O O
fit O O O O
path O O O O
models O O O O
, O O O O
indicating O O O O
potential O O O O
energetic O O O O
challenge O O O O
in O O O O
some O O O O
individuals O O O O
. O O O O
    
Maximum O O O O
CORT O O O O
levels O O O O
during O O O O
a O O O O
60 O O O O
- O O O O
min O O O O
period O O O O
of O O O O
restraint O O O O
correlated O O O O
significantly O O O O
only O O O O
with O O O O
sex O O O O
, O O O O
being O O O O
higher O O O O
in O O O O
females O O O O
. O O O O
    
Birds O O O O
with O O O O
the O O O O
poorest O O O O
body O O O O
condition O O O O
lived O O O O
at O O O O
the O O O O
dry O O O O
end O O O O
of O O O O
the O O O O
gradient O O O O
. O O O O
    
Birds O O O O
on O O O O
the O O O O
wet O O O O
end O O O O
of O O O O
the O O O O
gradient O O O O
responded O O O O
fastest O O O O
to O O O O
conspecific O O O O
song O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Environmental O O O O
conditions O O O O
vary O O O O
across O O O O
geographical O O O O
ranges O O O O
and O O O O
may O O O O
influence O O O O
the O O O O
physiological O O O O
conditions O O O O
of O O O O
organisms O O O O
, O O O O
thereby O O O O
enforcing O O O O
limits O O O O
to O O O O
species O O O O
' O O O O
distributions O O O O
. O O O O
    
Highly O O O O
specialized O O O O
species O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
birds O O O O
of O O O O
the O O O O
rain O O O O
forest O O O O
understory O O O O
, O O O O
may O O O O
be O O O O
especially O O O O
susceptible O O O O
to O O O O
environmental O O O O
variation O O O O
associated O O O O
with O O O O
changing O O O O
climatic O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
New O O O O
insights O O O O
into O O O O
the O O O O
mechanism O O O O
of O O O O
light O O O O
modulated O O O O
signaling O O O O
by O O O O
heterotrimeric O O O O
G O O O O
- O O O O
proteins O O O O
: O O O O
ENVOY O O O O
acts O O O O
on O O O O
gna1 O O O O
and O O O O
gna3 O O O O
and O O O O
adjusts O O O O
cAMP O O O O
levels O O O O
in O O O O
Trichoderma B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
reesei O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Hypocrea B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
jecorina O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
. O O O O
    
Sensing O O O O
of O O O O
environmental O O O O
signals O O O O
is O O O O
often O O O O
mediated O O O O
by O O O O
G O O O O
- O O O O
protein O O O O
coupled O O O O
receptors O O O O
and O O O O
their O O O O
cognate O O O O
heterotrimeric O O O O
G O O O O
- O O O O
proteins O O O O
. O O O O
    
In O O O O
Trichoderma B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
reesei O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Hypocrea B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
jecorina O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
the O O O O
signals O O O O
transmitted O O O O
via O O O O
the O O O O
G O O O O
- O O O O
protein O O O O
alpha O O O O
subunits O O O O
GNA1 O O O O
and O O O O
GNA3 O O O O
cause O O O O
considerable O O O O
modulation O O O O
of O O O O
cellulase O O O O
transcript O O O O
levels O O O O
and O O O O
the O O O O
extent O O O O
of O O O O
this O O O O
adjustment O O O O
is O O O O
dependent O O O O
on O O O O
the O O O O
light O O O O
status O O O O
. O O O O
    
We O O O O
therefore O O O O
intended O O O O
to O O O O
elucidate O O O O
the O O O O
underlying O O O O
mechanism O O O O
connecting O O O O
light O O O O
response O O O O
and O O O O
heterotrimeric O O O O
G O O O O
- O O O O
protein O O O O
signaling O O O O
. O O O O
    
Analysis O O O O
of O O O O
double O O O O
mutant O O O O
strains O O O O
showed O O O O
that O O O O
constitutive O O O O
activation O O O O
of O O O O
GNA1 O O O O
or O O O O
GNA3 O O O O
in O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
the O O O O
PAS O O O O
/ O O O O
LOV O O O O
domain O O O O
protein O O O O
ENVOY O O O O
( O O O O
ENV1 O O O O
) O O O O
leads O O O O
to O O O O
the O O O O
phenotype O O O O
of O O O O
constitutive O O O O
G O O O O
- O O O O
alpha O O O O
activation O O O O
in O O O O
darkness O O O O
. O O O O
    
In O O O O
light O O O O
, O O O O
however O O O O
the O O O O
deletion O O O O
- O O O O
phenotype O O O O
of O O O O
Deltaenv1 O O O O
was O O O O
observed O O O O
with O O O O
respect O O O O
to O O O O
growth O O O O
, O O O O
conidiation O O O O
and O O O O
cellulase O O O O
gene O O O O
transcription O O O O
. O O O O
    
Additionally O O O O
deletion O O O O
of O O O O
env1 O O O O
causes O O O O
decreased O O O O
intracellular O O O O
cAMP O O O O
accumulation O O O O
, O O O O
even O O O O
upon O O O O
constitutive O O O O
activation O O O O
of O O O O
GNA1 O O O O
or O O O O
GNA3 O O O O
. O O O O
    
While O O O O
supplementation O O O O
of O O O O
cAMP O O O O
caused O O O O
an O O O O
even O O O O
more O O O O
severe O O O O
growth O O O O
phenotype O O O O
of O O O O
all O O O O
strains O O O O
lacking O O O O
env1 O O O O
in O O O O
light O O O O
, O O O O
addition O O O O
of O O O O
the O O O O
phosphodiesterase O O O O
inhibitor O O O O
caffeine O O O O
rescued O O O O
the O O O O
growth O O O O
phenotype O O O O
of O O O O
these O O O O
strains O O O O
. O O O O
    
ENV1 O O O O
is O O O O
consequently O O O O
suggested O O O O
to O O O O
connect O O O O
the O O O O
light O O O O
response O O O O
pathway O O O O
with O O O O
nutrient O O O O
signaling O O O O
by O O O O
the O O O O
heterotrimeric O O O O
G O O O O
- O O O O
protein O O O O
cascade O O O O
by O O O O
adjusting O O O O
transcript O O O O
levels O O O O
of O O O O
gna1 O O O O
and O O O O
gna3 O O O O
and O O O O
action O O O O
on O O O O
cAMP O O O O
levels O O O O
- O O O O
presumably O O O O
through O O O O
inhibition O O O O
of O O O O
a O O O O
phosphodiesterase O O O O
. O O O O
    
Chronic O O O O
diseases O O O O
and O O O O
injuries O O O O
in O O O O
India O O O O
. O O O O
    
Chronic O O O O
diseases O O O O
( O O O O
eg O O O O
, O O O O
cardiovascular O O O O
diseases O O O O
, O O O O
mental O O O O
health O O O O
disorders O O O O
, O O O O
diabetes O O O O
, O O O O
and O O O O
cancer O O O O
) O O O O
and O O O O
injuries O O O O
are O O O O
the O O O O
leading O O O O
causes O O O O
of O O O O
death O O O O
and O O O O
disability O O O O
in O O O O
India O O O O
, O O O O
and O O O O
we O O O O
project O O O O
pronounced O O O O
increases O O O O
in O O O O
their O O O O
contribution O O O O
to O O O O
the O O O O
burden O O O O
of O O O O
disease O O O O
during O O O O
the O O O O
next O O O O
25 O O O O
years O O O O
. O O O O
    
Most O O O O
chronic O O O O
diseases O O O O
are O O O O
equally O O O O
prevalent O O O O
in O O O O
poor O O O O
and O O O O
rural O O O O
populations O O O O
and O O O O
often O O O O
occur O O O O
together O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
a O O O O
wide O O O O
range O O O O
of O O O O
cost O O O O
- O O O O
effective O O O O
primary O O O O
and O O O O
secondary O O O O
prevention O O O O
strategies O O O O
are O O O O
available O O O O
, O O O O
their O O O O
coverage O O O O
is O O O O
generally O O O O
low O O O O
, O O O O
especially O O O O
in O O O O
poor O O O O
and O O O O
rural O O O O
populations O O O O
. O O O O
    
Much O O O O
of O O O O
the O O O O
care O O O O
for O O O O
chronic O O O O
diseases O O O O
and O O O O
injuries O O O O
is O O O O
provided O O O O
in O O O O
the O O O O
private O O O O
sector O O O O
and O O O O
can O O O O
be O O O O
very O O O O
expensive O O O O
. O O O O
    
Sufficient O O O O
evidence O O O O
exists O O O O
to O O O O
warrant O O O O
immediate O O O O
action O O O O
to O O O O
scale O O O O
up O O O O
interventions O O O O
for O O O O
chronic O O O O
diseases O O O O
and O O O O
injuries O O O O
through O O O O
private O O O O
and O O O O
public O O O O
sectors O O O O
; O O O O
improved O O O O
public O O O O
health O O O O
and O O O O
primary O O O O
health O O O O
- O O O O
care O O O O
systems O O O O
are O O O O
essential O O O O
for O O O O
the O O O O
implementation O O O O
of O O O O
cost O O O O
- O O O O
effective O O O O
interventions O O O O
. O O O O
    
We O O O O
strongly O O O O
advocate O O O O
the O O O O
need O O O O
to O O O O
strengthen O O O O
social O O O O
and O O O O
policy O O O O
frameworks O O O O
to O O O O
enable O O O O
the O O O O
implementation O O O O
of O O O O
interventions O O O O
such O O O O
as O O O O
taxation O O O O
on O O O O
bidis O O O O
( O O O O
small O O O O
hand O O O O
- O O O O
rolled O O O O
cigarettes O O O O
) O O O O
, O O O O
smokeless O O O O
tobacco B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
and O O O O
locally O O O O
brewed O O O O
alcohols O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
advocate O O O O
the O O O O
integration O O O O
of O O O O
national O O O O
programmes O O O O
for O O O O
various O O O O
chronic O O O O
diseases O O O O
and O O O O
injuries O O O O
with O O O O
one O O O O
another O O O O
and O O O O
with O O O O
national O O O O
health O O O O
agendas O O O O
. O O O O
    
India O O O O
has O O O O
already O O O O
passed O O O O
the O O O O
early O O O O
stages O O O O
of O O O O
a O O O O
chronic O O O O
disease O O O O
and O O O O
injury O O O O
epidemic O O O O
; O O O O
in O O O O
view O O O O
of O O O O
the O O O O
implications O O O O
for O O O O
future O O O O
disease O O O O
burden O O O O
and O O O O
the O O O O
demographic O O O O
transition O O O O
that O O O O
is O O O O
in O O O O
progress O O O O
in O O O O
India O O O O
, O O O O
the O O O O
rate O O O O
at O O O O
which O O O O
effective O O O O
prevention O O O O
and O O O O
control O O O O
is O O O O
implemented O O O O
should O O O O
be O O O O
substantially O O O O
increased O O O O
. O O O O
    
The O O O O
emerging O O O O
agenda O O O O
of O O O O
chronic O O O O
diseases O O O O
and O O O O
injuries O O O O
should O O O O
be O O O O
a O O O O
political O O O O
priority O O O O
and O O O O
central O O O O
to O O O O
national O O O O
consciousness O O O O
, O O O O
if O O O O
universal O O O O
health O O O O
care O O O O
is O O O O
to O O O O
be O O O O
achieved O O O O
. O O O O
    
Health O O O O
care O O O O
and O O O O
equity O O O O
in O O O O
India O O O O
. O O O O
    
In O O O O
India O O O O
, O O O O
despite O O O O
improvements O O O O
in O O O O
access O O O O
to O O O O
health O O O O
care O O O O
, O O O O
inequalities O O O O
are O O O O
related O O O O
to O O O O
socioeconomic O O O O
status O O O O
, O O O O
geography O O O O
, O O O O
and O O O O
gender O O O O
, O O O O
and O O O O
are O O O O
compounded O O O O
by O O O O
high O O O O
out O O O O
- O O O O
of O O O O
- O O O O
pocket O O O O
expenditures O O O O
, O O O O
with O O O O
more O O O O
than O O O O
three O O O O
- O O O O
quarters O O O O
of O O O O
the O O O O
increasing O O O O
financial O O O O
burden O O O O
of O O O O
health O O O O
care O O O O
being O O O O
met O O O O
by O O O O
households O O O O
. O O O O
    
Health O O O O
- O O O O
care O O O O
expenditures O O O O
exacerbate O O O O
poverty O O O O
, O O O O
with O O O O
about O O O O
39 O O O O
million O O O O
additional O O O O
people O O O O
falling O O O O
into O O O O
poverty O O O O
every O O O O
year O O O O
as O O O O
a O O O O
result O O O O
of O O O O
such O O O O
expenditures O O O O
. O O O O
    
We O O O O
identify O O O O
key O O O O
challenges O O O O
for O O O O
the O O O O
achievement O O O O
of O O O O
equity O O O O
in O O O O
service O O O O
provision O O O O
, O O O O
and O O O O
equity O O O O
in O O O O
financing O O O O
and O O O O
financial O O O O
risk O O O O
protection O O O O
in O O O O
India O O O O
. O O O O
    
These O O O O
challenges O O O O
include O O O O
an O O O O
imbalance O O O O
in O O O O
resource O O O O
allocation O O O O
, O O O O
inadequate O O O O
physical O O O O
access O O O O
to O O O O
high O O O O
- O O O O
quality O O O O
health O O O O
services O O O O
and O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
resources O O O O
for O O O O
health O O O O
, O O O O
high O O O O
out O O O O
- O O O O
of O O O O
- O O O O
pocket O O O O
health O O O O
expenditures O O O O
, O O O O
inflation O O O O
in O O O O
health O O O O
spending O O O O
, O O O O
and O O O O
behavioural O O O O
factors O O O O
that O O O O
affect O O O O
the O O O O
demand O O O O
for O O O O
appropriate O O O O
health O O O O
care O O O O
. O O O O
    
Use O O O O
of O O O O
equity O O O O
metrics O O O O
in O O O O
monitoring O O O O
, O O O O
assessment O O O O
, O O O O
and O O O O
strategic O O O O
planning O O O O
; O O O O
investment O O O O
in O O O O
development O O O O
of O O O O
a O O O O
rigorous O O O O
knowledge O O O O
base O O O O
of O O O O
health O O O O
- O O O O
systems O O O O
research O O O O
; O O O O
development O O O O
of O O O O
a O O O O
refined O O O O
equity O O O O
- O O O O
focused O O O O
process O O O O
of O O O O
deliberative O O O O
decision O O O O
making O O O O
in O O O O
health O O O O
reform O O O O
; O O O O
and O O O O
redefinition O O O O
of O O O O
the O O O O
specific O O O O
responsibilities O O O O
and O O O O
accountabilities O O O O
of O O O O
key O O O O
actors O O O O
are O O O O
needed O O O O
to O O O O
try O O O O
to O O O O
achieve O O O O
equity O O O O
in O O O O
health O O O O
care O O O O
in O O O O
India O O O O
. O O O O
    
The O O O O
implementation O O O O
of O O O O
these O O O O
principles O O O O
with O O O O
strengthened O O O O
public O O O O
health O O O O
and O O O O
primary O O O O
- O O O O
care O O O O
services O O O O
will O O O O
help O O O O
to O O O O
ensure O O O O
a O O O O
more O O O O
equitable O O O O
health O O O O
care O O O O
for O O O O
India O O O O
' O O O O
s O O O O
population O O O O
. O O O O
    
Reproductive O O O O
health O O O O
, O O O O
and O O O O
child O O O O
health O O O O
and O O O O
nutrition O O O O
in O O O O
India O O O O
: O O O O
meeting O O O O
the O O O O
challenge O O O O
. O O O O
    
India O O O O
, O O O O
with O O O O
a O O O O
population O O O O
of O O O O
more O O O O
than O O O O
1 O O O O
billion O O O O
people O O O O
, O O O O
has O O O O
many O O O O
challenges O O O O
in O O O O
improving O O O O
the O O O O
health O O O O
and O O O O
nutrition O O O O
of O O O O
its O O O O
citizens O O O O
. O O O O
    
Steady O O O O
declines O O O O
have O O O O
been O O O O
noted O O O O
in O O O O
fertility O O O O
, O O O O
maternal O O O O
, O O O O
infant O O O O
and O O O O
child O O O O
mortalities O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
prevalence O O O O
of O O O O
severe O O O O
manifestations O O O O
of O O O O
nutritional O O O O
deficiencies O O O O
, O O O O
but O O O O
the O O O O
pace O O O O
has O O O O
been O O O O
slow O O O O
and O O O O
falls O O O O
short O O O O
of O O O O
national O O O O
and O O O O
Millennium O O O O
Development O O O O
Goal O O O O
targets O O O O
. O O O O
    
The O O O O
likely O O O O
explanations O O O O
include O O O O
social O O O O
inequities O O O O
, O O O O
disparities O O O O
in O O O O
health O O O O
systems O O O O
between O O O O
and O O O O
within O O O O
states O O O O
, O O O O
and O O O O
consequences O O O O
of O O O O
urbanisation O O O O
and O O O O
demographic O O O O
transition O O O O
. O O O O
    
In O O O O
2005 O O O O
, O O O O
India O O O O
embarked O O O O
on O O O O
the O O O O
National O O O O
Rural O O O O
Health O O O O
Mission O O O O
, O O O O
an O O O O
extraordinary O O O O
effort O O O O
to O O O O
strengthen O O O O
the O O O O
health O O O O
systems O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
coverage O O O O
of O O O O
priority O O O O
interventions O O O O
remains O O O O
insufficient O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
content O O O O
and O O O O
quality O O O O
of O O O O
existing O O O O
interventions O O O O
are O O O O
suboptimum O O O O
. O O O O
    
Substantial O O O O
unmet O O O O
need O O O O
for O O O O
contraception O O O O
remains O O O O
, O O O O
adolescent O O O O
pregnancies O O O O
are O O O O
common O O O O
, O O O O
and O O O O
access O O O O
to O O O O
safe O O O O
abortion O O O O
is O O O O
inadequate O O O O
. O O O O
    
Increases O O O O
in O O O O
the O O O O
numbers O O O O
of O O O O
deliveries O O O O
in O O O O
institutions O O O O
have O O O O
not O O O O
been O O O O
matched O O O O
by O O O O
improvements O O O O
in O O O O
the O O O O
quality O O O O
of O O O O
intrapartum O O O O
and O O O O
neonatal O O O O
care O O O O
. O O O O
    
Infants O O O O
and O O O O
young O O O O
children O O O O
do O O O O
not O O O O
get O O O O
the O O O O
health O O O O
care O O O O
they O O O O
need O O O O
; O O O O
access O O O O
to O O O O
effective O O O O
treatment O O O O
for O O O O
neonatal O O O O
illness O O O O
, O O O O
diarrhoea O O O O
, O O O O
and O O O O
pneumonia O O O O
shows O O O O
little O O O O
improvement O O O O
; O O O O
and O O O O
the O O O O
coverage O O O O
of O O O O
nutrition O O O O
programmes O O O O
is O O O O
inadequate O O O O
. O O O O
    
Absence O O O O
of O O O O
well O O O O
functioning O O O O
health O O O O
systems O O O O
is O O O O
indicated O O O O
by O O O O
the O O O O
inadequacies O O O O
related O O O O
to O O O O
planning O O O O
, O O O O
financing O O O O
, O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
resources O O O O
, O O O O
infrastructure O O O O
, O O O O
supply O O O O
systems O O O O
, O O O O
governance O O O O
, O O O O
information O O O O
, O O O O
and O O O O
monitoring O O O O
. O O O O
    
We O O O O
provide O O O O
a O O O O
case O O O O
for O O O O
transformation O O O O
of O O O O
health O O O O
systems O O O O
through O O O O
effective O O O O
stewardship O O O O
, O O O O
decentralised O O O O
planning O O O O
in O O O O
districts O O O O
, O O O O
a O O O O
reasoned O O O O
approach O O O O
to O O O O
financing O O O O
that O O O O
affects O O O O
demand O O O O
for O O O O
health O O O O
care O O O O
, O O O O
a O O O O
campaign O O O O
to O O O O
create O O O O
awareness O O O O
and O O O O
change O O O O
health O O O O
and O O O O
nutrition O O O O
behaviour O O O O
, O O O O
and O O O O
revision O O O O
of O O O O
programmes O O O O
for O O O O
child O O O O
nutrition O O O O
on O O O O
the O O O O
basis O O O O
of O O O O
evidence O O O O
. O O O O
    
This O O O O
agenda O O O O
needs O O O O
political O O O O
commitment O O O O
of O O O O
the O O O O
highest O O O O
order O O O O
and O O O O
the O O O O
development O O O O
of O O O O
a O O O O
people O O O O
' O O O O
s O O O O
movement O O O O
. O O O O
    
Human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
resources O O O O
for O O O O
health O O O O
in O O O O
India O O O O
. O O O O
    
India O O O O
has O O O O
a O O O O
severe O O O O
shortage O O O O
of O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
resources O O O O
for O O O O
health O O O O
. O O O O
    
It O O O O
has O O O O
a O O O O
shortage O O O O
of O O O O
qualified O O O O
health O O O O
workers O O O O
and O O O O
the O O O O
workforce O O O O
is O O O O
concentrated O O O O
in O O O O
urban O O O O
areas O O O O
. O O O O
    
Bringing O O O O
qualified O O O O
health O O O O
workers O O O O
to O O O O
rural O O O O
, O O O O
remote O O O O
, O O O O
and O O O O
underserved O O O O
areas O O O O
is O O O O
very O O O O
challenging O O O O
. O O O O
    
Many O O O O
Indians O O O O
, O O O O
especially O O O O
those O O O O
living O O O O
in O O O O
rural O O O O
areas O O O O
, O O O O
receive O O O O
care O O O O
from O O O O
unqualified O O O O
providers O O O O
. O O O O
    
The O O O O
migration O O O O
of O O O O
qualified O O O O
allopathic O O O O
doctors O O O O
and O O O O
nurses O O O O
is O O O O
substantial O O O O
and O O O O
further O O O O
strains O O O O
the O O O O
system O O O O
. O O O O
    
Nurses O O O O
do O O O O
not O O O O
have O O O O
much O O O O
authority O O O O
or O O O O
say O O O O
within O O O O
the O O O O
health O O O O
system O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
resources O O O O
to O O O O
train O O O O
them O O O O
are O O O O
still O O O O
inadequate O O O O
. O O O O
    
Little O O O O
attention O O O O
is O O O O
paid O O O O
during O O O O
medical O O O O
education O O O O
to O O O O
the O O O O
medical O O O O
and O O O O
public O O O O
health O O O O
needs O O O O
of O O O O
the O O O O
population O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
rapid O O O O
privatisation O O O O
of O O O O
medical O O O O
and O O O O
nursing O O O O
education O O O O
has O O O O
implications O O O O
for O O O O
its O O O O
quality O O O O
and O O O O
governance O O O O
. O O O O
    
Such O O O O
issues O O O O
are O O O O
a O O O O
result O O O O
of O O O O
underinvestment O O O O
in O O O O
and O O O O
poor O O O O
governance O O O O
of O O O O
the O O O O
health O O O O
sector O O O O
- O O O O
- O O O O
two O O O O
issues O O O O
that O O O O
the O O O O
government O O O O
urgently O O O O
needs O O O O
to O O O O
address O O O O
. O O O O
    
A O O O O
comprehensive O O O O
national O O O O
policy O O O O
for O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
resources O O O O
is O O O O
needed O O O O
to O O O O
achieve O O O O
universal O O O O
health O O O O
care O O O O
in O O O O
India O O O O
. O O O O
    
The O O O O
public O O O O
sector O O O O
will O O O O
need O O O O
to O O O O
redesign O O O O
appropriate O O O O
packages O O O O
of O O O O
monetary O O O O
and O O O O
non O O O O
- O O O O
monetary O O O O
incentives O O O O
to O O O O
encourage O O O O
qualified O O O O
health O O O O
workers O O O O
to O O O O
work O O O O
in O O O O
rural O O O O
and O O O O
remote O O O O
areas O O O O
. O O O O
    
Such O O O O
a O O O O
policy O O O O
might O O O O
also O O O O
encourage O O O O
task O O O O
- O O O O
shifting O O O O
and O O O O
mainstreaming O O O O
doctors O O O O
and O O O O
practitioners O O O O
who O O O O
practice O O O O
traditional O O O O
Indian O O O O
medicine O O O O
( O O O O
ayurveda O O O O
, O O O O
yoga O O O O
and O O O O
naturopathy O O O O
, O O O O
unani O O O O
, O O O O
and O O O O
siddha O O O O
) O O O O
and O O O O
homoeopathy O O O O
to O O O O
work O O O O
in O O O O
these O O O O
areas O O O O
while O O O O
adopting O O O O
other O O O O
innovative O O O O
ways O O O O
of O O O O
augmenting O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
resources O O O O
for O O O O
health O O O O
. O O O O
    
At O O O O
the O O O O
same O O O O
time O O O O
, O O O O
additional O O O O
investments O O O O
will O O O O
be O O O O
needed O O O O
to O O O O
improve O O O O
the O O O O
relevance O O O O
, O O O O
quantity O O O O
, O O O O
and O O O O
quality O O O O
of O O O O
nursing O O O O
, O O O O
medical O O O O
, O O O O
and O O O O
public O O O O
health O O O O
education O O O O
in O O O O
the O O O O
country O O O O
. O O O O
    
Emerging O O O O
diversity O O O O
within O O O O
chrysophytes O O O O
, O O O O
choanoflagellates O O O O
and O O O O
bicosoecids O O O O
based O O O O
on O O O O
molecular O O O O
surveys O O O O
. O O O O
    
In O O O O
recent O O O O
years O O O O
, O O O O
a O O O O
substantial O O O O
amount O O O O
of O O O O
data O O O O
on O O O O
aquatic O O O O
protists O O O O
has O O O O
been O O O O
obtained O O O O
from O O O O
culture O O O O
- O O O O
independent O O O O
molecular O O O O
approaches O O O O
, O O O O
unveiling O O O O
a O O O O
large O O O O
diversity O O O O
and O O O O
the O O O O
existence O O O O
of O O O O
new O O O O
lineages O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
sequences O O O O
affiliated O O O O
with O O O O
minor O O O O
groups O O O O
( O O O O
in O O O O
terms O O O O
of O O O O
clonal O O O O
abundance O O O O
) O O O O
have O O O O
often O O O O
been O O O O
under O O O O
- O O O O
analyzed O O O O
, O O O O
and O O O O
this O O O O
hides O O O O
a O O O O
potentially O O O O
relevant O O O O
source O O O O
of O O O O
phylogenetic O O O O
information O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
have O O O O
searched O O O O
public O O O O
databases O O O O
for O O O O
18S O O O O
rDNA O O O O
sequences O O O O
of O O O O
chrysophytes O O O O
, O O O O
choanoflagellates O O O O
and O O O O
bicosoecids O O O O
retrieved O O O O
from O O O O
molecular O O O O
surveys O O O O
of O O O O
protists O O O O
. O O O O
    
These O O O O
three O O O O
groups O O O O
are O O O O
often O O O O
considered O O O O
to O O O O
account O O O O
for O O O O
most O O O O
of O O O O
the O O O O
heterotrophic O O O O
flagellates O O O O
, O O O O
an O O O O
important O O O O
functional O O O O
component O O O O
in O O O O
microbial O O O O
food O O O O
webs O O O O
. O O O O
    
They O O O O
represented O O O O
a O O O O
significant O O O O
fraction O O O O
of O O O O
clones O O O O
in O O O O
freshwater O O O O
studies O O O O
, O O O O
whereas O O O O
their O O O O
relative O O O O
clonal O O O O
abundance O O O O
was O O O O
low O O O O
in O O O O
marine O O O O
studies O O O O
. O O O O
    
The O O O O
novelty O O O O
displayed O O O O
by O O O O
this O O O O
dataset O O O O
was O O O O
notable O O O O
. O O O O
    
Most O O O O
environmental O O O O
sequences O O O O
were O O O O
distant O O O O
to O O O O
sequences O O O O
of O O O O
cultured O O O O
organisms O O O O
, O O O O
indicating O O O O
a O O O O
significant O O O O
bias O O O O
in O O O O
the O O O O
representation O O O O
of O O O O
taxa O O O O
in O O O O
culture O O O O
. O O O O
    
Moreover O O O O
, O O O O
they O O O O
were O O O O
often O O O O
distant O O O O
to O O O O
sequences O O O O
from O O O O
other O O O O
molecular O O O O
surveys O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
an O O O O
insufficient O O O O
sequencing O O O O
effort O O O O
to O O O O
characterize O O O O
the O O O O
in O O O O
situ O O O O
diversity O O O O
of O O O O
these O O O O
groups O O O O
. O O O O
    
Phylogenetic O O O O
trees O O O O
with O O O O
complete O O O O
sequences O O O O
present O O O O
the O O O O
most O O O O
accurate O O O O
representation O O O O
of O O O O
the O O O O
diversity O O O O
of O O O O
these O O O O
groups O O O O
, O O O O
with O O O O
the O O O O
emergence O O O O
of O O O O
several O O O O
new O O O O
clades O O O O
formed O O O O
exclusively O O O O
by O O O O
environmental O O O O
sequences O O O O
. O O O O
    
Exhaustive O O O O
data O O O O
mining O O O O
in O O O O
sequence O O O O
databases O O O O
allowed O O O O
the O O O O
identification O O O O
of O O O O
new O O O O
diversity O O O O
hidden O O O O
inside O O O O
chrysophytes O O O O
, O O O O
choanoflagellates O O O O
and O O O O
bicosoecids O O O O
. O O O O
    
Gene O O O O
expression O O O O
analysis O O O O
of O O O O
wounding O O O O
- O O O O
induced O O O O
root O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
shoot O O O O
communication O O O O
in O O O O
Arabidopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
thaliana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Root O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
shoot O O O O
communication O O O O
plays O O O O
an O O O O
important O O O O
role O O O O
in O O O O
the O O O O
adaptation O O O O
to O O O O
environmental O O O O
stress O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
established O O O O
a O O O O
model O O O O
system O O O O
for O O O O
root O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
shoot O O O O
signalling O O O O
to O O O O
observe O O O O
global O O O O
gene O O O O
expression O O O O
in O O O O
Arabidopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
thaliana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
roots O O O O
of O O O O
Arabidopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
seedlings O O O O
were O O O O
wounded O O O O
and O O O O
the O O O O
expression O O O O
in O O O O
the O O O O
shoots O O O O
of O O O O
68 O O O O
and O O O O
5 O O O O
genes O O O O
was O O O O
up O O O O
- O O O O
regulated O O O O
threefold O O O O
at O O O O
30 O O O O
min O O O O
and O O O O
6 O O O O
h O O O O
post O O O O
- O O O O
injury O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
These O O O O
genes O O O O
were O O O O
designated O O O O
early O O O O
and O O O O
late O O O O
Root O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
Shoot O O O O
responsive O O O O
( O O O O
RtS O O O O
) O O O O
genes O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
Many O O O O
of O O O O
the O O O O
early O O O O
RtS O O O O
genes O O O O
were O O O O
found O O O O
to O O O O
encode O O O O
transcription O O O O
factors O O O O
such O O O O
as O O O O
AtERFs O O O O
, O O O O
whereas O O O O
others O O O O
were O O O O
associated O O O O
with O O O O
jasmonic O O O O
acid O O O O
( O O O O
JA O O O O
) O O O O
and O O O O
ethylene O O O O
( O O O O
ET O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Some O O O O
of O O O O
the O O O O
late O O O O
RtS O O O O
genes O O O O
were O O O O
shown O O O O
to O O O O
be O O O O
regulated O O O O
by O O O O
12 O O O O
- O O O O
oxo O O O O
- O O O O
phytodienoic O O O O
acid O O O O
( O O O O
OPDA O O O O
) O O O O
. O O O O
    
In O O O O
fact O O O O
, O O O O
elevated O O O O
levels O O O O
of O O O O
JA O O O O
and O O O O
OPDA O O O O
were O O O O
detected O O O O
in O O O O
the O O O O
shoots O O O O
of O O O O
seedlings O O O O
30 O O O O
min O O O O
and O O O O
6 O O O O
h O O O O
, O O O O
respectively O O O O
, O O O O
after O O O O
wounding O O O O
of O O O O
the O O O O
roots O O O O
. O O O O
    
A O O O O
mutant O O O O
analysis O O O O
revealed O O O O
that O O O O
JA O O O O
and O O O O
ET O O O O
are O O O O
involved O O O O
in O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
the O O O O
early O O O O
RtS O O O O
genes O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
root O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
shoot O O O O
communication O O O O
for O O O O
many O O O O
RtS O O O O
genes O O O O
is O O O O
associated O O O O
with O O O O
the O O O O
systemic O O O O
production O O O O
of O O O O
JA O O O O
, O O O O
OPDA O O O O
and O O O O
possibly O O O O
ET O O O O
. O O O O
    
Effects O O O O
of O O O O
the O O O O
hydraulic O O O O
coupling O O O O
between O O O O
xylem O O O O
and O O O O
phloem O O O O
on O O O O
diurnal O O O O
phloem O O O O
diameter O O O O
variation O O O O
. O O O O
    
Measurements O O O O
of O O O O
diurnal O O O O
diameter O O O O
variations O O O O
of O O O O
the O O O O
xylem O O O O
and O O O O
phloem O O O O
are O O O O
a O O O O
promising O O O O
tool O O O O
for O O O O
studying O O O O
plant O O O O
hydraulics O O O O
and O O O O
xylem O O O O
- O O O O
phloem O O O O
interactions O O O O
in O O O O
field O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
both O O O O
the O O O O
theoretical O O O O
framework O O O O
and O O O O
the O O O O
experimental O O O O
verification O O O O
needed O O O O
to O O O O
interpret O O O O
phloem O O O O
diameter O O O O
data O O O O
are O O O O
incomplete O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
analytically O O O O
evaluate O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
changing O O O O
the O O O O
radial O O O O
conductance O O O O
between O O O O
the O O O O
xylem O O O O
and O O O O
the O O O O
phloem O O O O
on O O O O
phloem O O O O
diameter O O O O
variations O O O O
and O O O O
test O O O O
the O O O O
theory O O O O
using O O O O
simple O O O O
manipulation O O O O
experiments O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
show O O O O
that O O O O
phloem O O O O
diameter O O O O
variations O O O O
are O O O O
mainly O O O O
caused O O O O
by O O O O
changes O O O O
in O O O O
the O O O O
radial O O O O
flow O O O O
rate O O O O
of O O O O
water O O O O
between O O O O
the O O O O
xylem O O O O
and O O O O
the O O O O
phloem O O O O
. O O O O
    
Reducing O O O O
the O O O O
hydraulic O O O O
conductance O O O O
between O O O O
these O O O O
tissues O O O O
decreases O O O O
the O O O O
amplitude O O O O
of O O O O
phloem O O O O
diameter O O O O
variation O O O O
and O O O O
increases O O O O
the O O O O
time O O O O
lag O O O O
between O O O O
xylem O O O O
and O O O O
phloem O O O O
diameter O O O O
variation O O O O
in O O O O
a O O O O
predictable O O O O
manner O O O O
. O O O O
    
Variation O O O O
in O O O O
the O O O O
amplitude O O O O
and O O O O
timing O O O O
of O O O O
diameter O O O O
variations O O O O
that O O O O
cannot O O O O
be O O O O
explained O O O O
by O O O O
changes O O O O
in O O O O
the O O O O
hydraulic O O O O
conductance O O O O
, O O O O
could O O O O
be O O O O
related O O O O
to O O O O
changes O O O O
in O O O O
the O O O O
osmotic O O O O
concentration O O O O
in O O O O
the O O O O
phloem O O O O
. O O O O
    
Light O O O O
exerts O O O O
multiple O O O O
levels O O O O
of O O O O
influence O O O O
on O O O O
the O O O O
Arabidopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
wound O O O O
response O O O O
. O O O O
    
Light O O O O
plays O O O O
important O O O O
roles O O O O
in O O O O
modulating O O O O
plant O O O O
responses O O O O
to O O O O
attack O O O O
by O O O O
pests O O O O
and O O O O
pathogens O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
test O O O O
the O O O O
hypothesis O O O O
that O O O O
darkness O O O O
modifies O O O O
the O O O O
response O O O O
to O O O O
wounding O O O O
, O O O O
and O O O O
examine O O O O
possible O O O O
mechanisms O O O O
for O O O O
such O O O O
an O O O O
effect O O O O
. O O O O
    
We O O O O
investigated O O O O
changes O O O O
in O O O O
the O O O O
Arabidopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
transcriptome O O O O
following O O O O
a O O O O
light O O O O
- O O O O
dark O O O O
transition O O O O
and O O O O
the O O O O
response O O O O
to O O O O
wounding O O O O
either O O O O
in O O O O
the O O O O
light O O O O
or O O O O
in O O O O
the O O O O
dark O O O O
. O O O O
    
The O O O O
transcriptional O O O O
response O O O O
to O O O O
the O O O O
light O O O O
- O O O O
dark O O O O
transition O O O O
strongly O O O O
resembles O O O O
responses O O O O
associated O O O O
with O O O O
carbon O O O O
depletion O O O O
. O O O O
    
The O O O O
dark O O O O
shift O O O O
and O O O O
wound O O O O
responses O O O O
acted O O O O
largely O O O O
independently O O O O
, O O O O
but O O O O
more O O O O
complex O O O O
interactions O O O O
were O O O O
identified O O O O
at O O O O
a O O O O
number O O O O
of O O O O
levels O O O O
. O O O O
    
Darkness O O O O
attenuates O O O O
the O O O O
overall O O O O
transcriptional O O O O
response O O O O
to O O O O
wounding O O O O
, O O O O
and O O O O
we O O O O
identified O O O O
genes O O O O
and O O O O
physiological O O O O
processes O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
anthocyanin O O O O
accumulation O O O O
, O O O O
that O O O O
exhibit O O O O
light O O O O
- O O O O
dependent O O O O
wound O O O O
responses O O O O
. O O O O
    
Transcriptional O O O O
activation O O O O
of O O O O
light O O O O
- O O O O
dependent O O O O
wound O O O O
- O O O O
induced O O O O
genes O O O O
requires O O O O
a O O O O
chloroplast O O O O
- O O O O
derived O O O O
signal O O O O
originating O O O O
from O O O O
photosynthetic O O O O
electron O O O O
transport O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
present O O O O
evidence O O O O
of O O O O
a O O O O
role O O O O
for O O O O
the O O O O
circadian O O O O
clock O O O O
in O O O O
modifying O O O O
wound O O O O
responses O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
show O O O O
that O O O O
darkness O O O O
impacts O O O O
on O O O O
the O O O O
wound O O O O
response O O O O
at O O O O
a O O O O
number O O O O
of O O O O
levels O O O O
, O O O O
which O O O O
may O O O O
imply O O O O
differences O O O O
in O O O O
induced O O O O
herbivore O O O O
defences O O O O
during O O O O
the O O O O
day O O O O
and O O O O
night O O O O
. O O O O
    
The O O O O
effect O O O O
of O O O O
competition O O O O
from O O O O
neighbours O O O O
on O O O O
stomatal O O O O
conductance O O O O
in O O O O
lettuce B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
tomato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
plants O O O O
. O O O O
    
Competition O O O O
decreased O O O O
transpiration O O O O
from O O O O
young O O O O
lettuce B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
plants O O O O
after O O O O
2 O O O O
days O O O O
, O O O O
before O O O O
any O O O O
reductions O O O O
in O O O O
leaf O O O O
area O O O O
became O O O O
apparent O O O O
, O O O O
and O O O O
stomatal O O O O
conductance O O O O
( O O O O
g O O O O
( O O O O
s O O O O
) O O O O
) O O O O
of O O O O
lettuce B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
tomato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
plants O O O O
was O O O O
also O O O O
reduced O O O O
. O O O O
    
Stomatal O O O O
closure O O O O
was O O O O
not O O O O
due O O O O
to O O O O
hydraulic O O O O
signals O O O O
or O O O O
competition O O O O
for O O O O
nutrients O O O O
, O O O O
as O O O O
soil O O O O
water O O O O
content O O O O
, O O O O
leaf O O O O
water O O O O
status O O O O
and O O O O
leaf O O O O
nitrate O O O O
concentrations O O O O
were O O O O
unaffected O O O O
by O O O O
neighbours O O O O
. O O O O
    
Competition O O O O
- O O O O
induced O O O O
stomatal O O O O
closure O O O O
was O O O O
absent O O O O
in O O O O
an O O O O
abscisic O O O O
acid O O O O
( O O O O
ABA O O O O
) O O O O
- O O O O
deficient O O O O
tomato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mutant O O O O
, O O O O
flacca O O O O
, O O O O
indicating O O O O
a O O O O
fundamental O O O O
involvement O O O O
of O O O O
ABA O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
tomato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
xylem O O O O
sap O O O O
ABA O O O O
concentrations O O O O
were O O O O
unaffected O O O O
by O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
neighbours O O O O
, O O O O
ABA O O O O
/ O O O O
pH O O O O
- O O O O
based O O O O
stomatal O O O O
modulation O O O O
is O O O O
still O O O O
likely O O O O
to O O O O
underlie O O O O
the O O O O
response O O O O
to O O O O
competition O O O O
, O O O O
as O O O O
soil O O O O
and O O O O
xylem O O O O
sap O O O O
alkalization O O O O
was O O O O
observed O O O O
in O O O O
competing O O O O
plants O O O O
. O O O O
    
Competition O O O O
also O O O O
modulated O O O O
leaf O O O O
ethylene O O O O
production O O O O
, O O O O
and O O O O
treatment O O O O
of O O O O
lettuce B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
plants O O O O
with O O O O
an O O O O
ethylene O O O O
perception O O O O
inhibitor O O O O
( O O O O
1 O O O O
- O O O O
methylcyclopropene O O O O
) O O O O
diminished O O O O
the O O O O
difference O O O O
in O O O O
g O O O O
( O O O O
s O O O O
) O O O O
between O O O O
single O O O O
and O O O O
competing O O O O
plants O O O O
grown O O O O
in O O O O
a O O O O
controlled O O O O
environment O O O O
room O O O O
, O O O O
but O O O O
increased O O O O
it O O O O
in O O O O
plants O O O O
grown O O O O
in O O O O
the O O O O
greenhouse O O O O
: O O O O
ethylene O O O O
altered O O O O
the O O O O
extent O O O O
of O O O O
the O O O O
stomatal O O O O
response O O O O
to O O O O
competition O O O O
. O O O O
    
Effects O O O O
of O O O O
competition O O O O
on O O O O
g O O O O
( O O O O
s O O O O
) O O O O
are O O O O
discussed O O O O
in O O O O
terms O O O O
of O O O O
the O O O O
detection O O O O
of O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
neighbours O O O O
: O O O O
increases O O O O
in O O O O
g O O O O
( O O O O
s O O O O
) O O O O
and O O O O
carbon O O O O
fixation O O O O
may O O O O
allow O O O O
faster O O O O
initial O O O O
space O O O O
occupancy O O O O
within O O O O
an O O O O
emerging O O O O
community O O O O
/ O O O O
crop O O O O
. O O O O
    
The O O O O
role O O O O
of O O O O
class O O O O
A1 O O O O
heat O O O O
shock O O O O
factors O O O O
( O O O O
HSFA1s O O O O
) O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
heat O O O O
and O O O O
other O O O O
stresses O O O O
in O O O O
Arabidopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
In O O O O
Arabidopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
there O O O O
are O O O O
four O O O O
homologs O O O O
of O O O O
class O O O O
A1 O O O O
heat O O O O
shock O O O O
factor O O O O
( O O O O
HSFA1 O O O O
) O O O O
genes O O O O
, O O O O
which O O O O
likely O O O O
encode O O O O
the O O O O
master O O O O
regulators O O O O
of O O O O
heat O O O O
shock O O O O
response O O O O
( O O O O
HSR O O O O
) O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
previous O O O O
studies O O O O
with O O O O
double O O O O
knockout O O O O
( O O O O
KO O O O O
) O O O O
mutants O O O O
were O O O O
unable O O O O
to O O O O
confirm O O O O
this O O O O
point O O O O
probably O O O O
due O O O O
to O O O O
functional O O O O
redundancy O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
generated O O O O
a O O O O
quadruple O O O O
KO O O O O
( O O O O
QK O O O O
) O O O O
and O O O O
four O O O O
triple O O O O
KO O O O O
mutants O O O O
to O O O O
dissect O O O O
their O O O O
functions O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
data O O O O
show O O O O
that O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
HSFA1 O O O O
group O O O O
not O O O O
only O O O O
play O O O O
a O O O O
pivotal O O O O
role O O O O
in O O O O
HSR O O O O
but O O O O
also O O O O
are O O O O
involved O O O O
in O O O O
growth O O O O
and O O O O
development O O O O
. O O O O
    
Alterations O O O O
in O O O O
morphology O O O O
and O O O O
retardation O O O O
in O O O O
growth O O O O
were O O O O
observed O O O O
in O O O O
the O O O O
quadruple O O O O
but O O O O
not O O O O
in O O O O
triple O O O O
KO O O O O
mutants O O O O
. O O O O
    
The O O O O
basal O O O O
and O O O O
acquired O O O O
thermotolerance O O O O
capacity O O O O
was O O O O
dramatically O O O O
decreased O O O O
in O O O O
the O O O O
QK O O O O
mutant O O O O
but O O O O
varied O O O O
in O O O O
triple O O O O
KO O O O O
mutants O O O O
at O O O O
different O O O O
developmental O O O O
stages O O O O
. O O O O
    
The O O O O
transcriptomics O O O O
profiles O O O O
suggested O O O O
that O O O O
more O O O O
than O O O O
65 O O O O
% O O O O
of O O O O
the O O O O
heat O O O O
stress O O O O
( O O O O
HS O O O O
) O O O O
- O O O O
up O O O O
- O O O O
regulated O O O O
genes O O O O
were O O O O
HSFA1 O O O O
dependent O O O O
. O O O O
    
HSFA1s O O O O
were O O O O
also O O O O
involved O O O O
in O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
several O O O O
HS O O O O
genes O O O O
induced O O O O
by O O O O
H O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
O O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
, O O O O
salt O O O O
and O O O O
mannitol O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
consistent O O O O
with O O O O
the O O O O
increased O O O O
sensitive O O O O
phenotype O O O O
of O O O O
the O O O O
QK O O O O
mutant O O O O
to O O O O
the O O O O
stress O O O O
factors O O O O
. O O O O
    
In O O O O
conclusion O O O O
, O O O O
the O O O O
Arabidopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
HSFA1s O O O O
function O O O O
as O O O O
the O O O O
master O O O O
regulators O O O O
of O O O O
HSR O O O O
and O O O O
participate O O O O
as O O O O
important O O O O
components O O O O
in O O O O
other O O O O
abiotic O O O O
stress O O O O
responses O O O O
as O O O O
well O O O O
. O O O O
    
Predicting O O O O
the O O O O
optimal O O O O
prey O O O O
group O O O O
size O O O O
from O O O O
predator O O O O
hunting O O O O
behaviour O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
How O O O O
group O O O O
size O O O O
affects O O O O
predator O O O O
attack O O O O
and O O O O
success O O O O
rate O O O O
, O O O O
and O O O O
so O O O O
prey O O O O
vulnerability O O O O
, O O O O
is O O O O
important O O O O
in O O O O
determining O O O O
the O O O O
nonlethal O O O O
consequences O O O O
of O O O O
predation O O O O
risk O O O O
on O O O O
animal O O O O
populations O O O O
and O O O O
communities O O O O
. O O O O
    
Theory O O O O
predicts O O O O
that O O O O
both O O O O
predator O O O O
attack O O O O
success O O O O
rate O O O O
and O O O O
the O O O O
dilution O O O O
effect O O O O
decline O O O O
exponentially O O O O
with O O O O
group O O O O
size O O O O
and O O O O
that O O O O
selection O O O O
generates O O O O
optimal O O O O
group O O O O
sizes O O O O
at O O O O
a O O O O
' O O O O
risk O O O O
threshold O O O O
' O O O O
above O O O O
which O O O O
antipredation O O O O
benefits O O O O
are O O O O
outweighed O O O O
by O O O O
costs O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
those O O O O
owing O O O O
to O O O O
higher O O O O
attack O O O O
rates O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
examined O O O O
whether O O O O
flock O O O O
size O O O O
risk O O O O
thresholds O O O O
for O O O O
attack O O O O
rate O O O O
, O O O O
success O O O O
rate O O O O
or O O O O
dilution O O O O
differed O O O O
, O O O O
and O O O O
therefore O O O O
whether O O O O
the O O O O
strength O O O O
of O O O O
selection O O O O
for O O O O
group O O O O
size O O O O
differed O O O O
for O O O O
these O O O O
three O O O O
factors O O O O
, O O O O
using O O O O
a O O O O
system O O O O
of O O O O
redshank B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
Tringa B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
totanus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
flocks O O O O
being O O O O
hunted O O O O
by O O O O
Eurasian B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sparrowhawks O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Accipiter B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nisus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
asked O O O O
which O O O O
of O O O O
the O O O O
three O O O O
thresholds O O O O
, O O O O
on O O O O
their O O O O
own O O O O
or O O O O
in O O O O
combination O O O O
, O O O O
predicted O O O O
the O O O O
most O O O O
commonly O O O O
observed O O O O
group O O O O
size O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Mean O O O O
redshank B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
flock O O O O
size O O O O
increased O O O O
with O O O O
a O O O O
very O O O O
gradual O O O O
quadratic O O O O
function O O O O
( O O O O
i O O O O
. O O O O
e O O O O
. O O O O
approximately O O O O
linearly O O O O
) O O O O
with O O O O
population O O O O
size O O O O
, O O O O
although O O O O
at O O O O
a O O O O
rate O O O O
half O O O O
that O O O O
possible O O O O
; O O O O
when O O O O
population O O O O
size O O O O
was O O O O
not O O O O
limiting O O O O
, O O O O
individuals O O O O
almost O O O O
always O O O O
avoided O O O O
flocks O O O O
of O O O O
less O O O O
than O O O O
30 O O O O
and O O O O
birds O O O O
were O O O O
frequently O O O O
in O O O O
flocks O O O O
up O O O O
to O O O O
at O O O O
least O O O O
80 O O O O
. O O O O
    
Sparrowhawk B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
attack O O O O
rate O O O O
showed O O O O
a O O O O
quadratic O O O O
relationship O O O O
with O O O O
flock O O O O
size O O O O
and O O O O
peaked O O O O
at O O O O
55 O O O O
redshanks B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Sparrowhawk B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
attack O O O O
success O O O O
rate O O O O
, O O O O
however O O O O
, O O O O
declined O O O O
exponentially O O O O
, O O O O
becoming O O O O
less O O O O
steep O O O O
at O O O O
flock O O O O
sizes O O O O
of O O O O
about O O O O
40 O O O O
and O O O O
remaining O O O O
uniformly O O O O
low O O O O
( O O O O
a O O O O
95 O O O O
% O O O O
decrease O O O O
) O O O O
by O O O O
70 O O O O
. O O O O
    
Combined O O O O
with O O O O
dilution O O O O
, O O O O
individual O O O O
risk O O O O
of O O O O
death O O O O
per O O O O
attack O O O O
decreased O O O O
by O O O O
95 O O O O
% O O O O
when O O O O
group O O O O
size O O O O
reached O O O O
30 O O O O
( O O O O
20 O O O O
for O O O O
the O O O O
dilution O O O O
effect O O O O
alone O O O O
) O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Redshanks B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
most O O O O
commonly O O O O
formed O O O O
group O O O O
sizes O O O O
that O O O O
gained O O O O
the O O O O
maximum O O O O
individual O O O O
predation O O O O
risk O O O O
reduction O O O O
. O O O O
    
They O O O O
also O O O O
commonly O O O O
formed O O O O
group O O O O
sizes O O O O
far O O O O
above O O O O
any O O O O
further O O O O
substantial O O O O
advantages O O O O
from O O O O
the O O O O
dilution O O O O
effect O O O O
or O O O O
from O O O O
reducing O O O O
attack O O O O
rate O O O O
, O O O O
but O O O O
that O O O O
continued O O O O
to O O O O
reduce O O O O
predation O O O O
risk O O O O
by O O O O
lowering O O O O
attack O O O O
success O O O O
rate O O O O
. O O O O
    
Individuals O O O O
did O O O O
not O O O O
always O O O O
form O O O O
the O O O O
largest O O O O
groups O O O O
possible O O O O
which O O O O
we O O O O
suggest O O O O
is O O O O
because O O O O
individual O O O O
variation O O O O
in O O O O
risk O O O O
- O O O O
taking O O O O
subdivides O O O O
the O O O O
population O O O O
. O O O O
    
This O O O O
places O O O O
a O O O O
constraint O O O O
on O O O O
the O O O O
ability O O O O
of O O O O
individuals O O O O
to O O O O
compensate O O O O
for O O O O
predation O O O O
risk O O O O
and O O O O
will O O O O
have O O O O
a O O O O
variety O O O O
of O O O O
important O O O O
effects O O O O
on O O O O
animal O O O O
populations O O O O
. O O O O
    
Ecosystem O O O O
engineering O O O O
and O O O O
predation O O O O
: O O O O
the O O O O
multi O O O O
- O O O O
trophic O O O O
impact O O O O
of O O O O
two O O O O
ant O O O O
species O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Ants O O O O
are O O O O
ubiquitous O O O O
ecosystem O O O O
engineers O O O O
and O O O O
generalist O O O O
predators O O O O
and O O O O
are O O O O
able O O O O
to O O O O
affect O O O O
ecological O O O O
communities O O O O
via O O O O
both O O O O
pathways O O O O
. O O O O
    
They O O O O
are O O O O
likely O O O O
to O O O O
influence O O O O
any O O O O
other O O O O
terrestrial O O O O
arthropod O O O O
group O O O O
either O O O O
directly O O O O
or O O O O
indirectly O O O O
caused O O O O
by O O O O
their O O O O
high O O O O
abundance O O O O
and O O O O
territoriality O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
studied O O O O
the O O O O
impact O O O O
of O O O O
two O O O O
ant O O O O
species O O O O
common O O O O
in O O O O
Central O O O O
Europe O O O O
, O O O O
Myrmica B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
rubra O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Lasius B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
niger O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
on O O O O
an O O O O
arthropod O O O O
community O O O O
. O O O O
    
Colony O O O O
presence O O O O
and O O O O
density O O O O
of O O O O
these O O O O
two O O O O
ant O O O O
species O O O O
were O O O O
manipulated O O O O
in O O O O
a O O O O
field O O O O
experiment O O O O
from O O O O
the O O O O
start O O O O
of O O O O
ant O O O O
activity O O O O
in O O O O
spring O O O O
to O O O O
late O O O O
summer O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
experiment O O O O
revealed O O O O
a O O O O
positive O O O O
influence O O O O
of O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
one O O O O
ant O O O O
colony O O O O
on O O O O
densities O O O O
of O O O O
decomposers O O O O
, O O O O
herbivores O O O O
and O O O O
parasitoids O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
in O O O O
the O O O O
case O O O O
of O O O O
herbivores O O O O
and O O O O
parasitoids O O O O
, O O O O
this O O O O
effect O O O O
was O O O O
reversed O O O O
in O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
two O O O O
colonies O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Generally O O O O
, O O O O
effects O O O O
of O O O O
the O O O O
two O O O O
ant O O O O
species O O O O
were O O O O
similar O O O O
with O O O O
the O O O O
exception O O O O
of O O O O
their O O O O
effect O O O O
on O O O O
Braconidae O O O O
parasitoid O O O O
densities O O O O
that O O O O
responded O O O O
positively O O O O
to O O O O
one O O O O
colony O O O O
of O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
rubra O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
but O O O O
not O O O O
of O O O O
L B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
niger O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Spider O O O O
density O O O O
was O O O O
not O O O O
affected O O O O
by O O O O
ant O O O O
colony O O O O
manipulation O O O O
, O O O O
but O O O O
species O O O O
richness O O O O
of O O O O
spiders O O O O
responded O O O O
positively O O O O
to O O O O
ant O O O O
presence O O O O
. O O O O
    
This O O O O
effect O O O O
was O O O O
independent O O O O
of O O O O
ant O O O O
colony O O O O
density O O O O
, O O O O
but O O O O
where O O O O
two O O O O
colonies O O O O
were O O O O
present O O O O
, O O O O
spider O O O O
richness O O O O
was O O O O
significantly O O O O
greater O O O O
in O O O O
plots O O O O
with O O O O
two O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
rubra O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
colonies O O O O
than O O O O
in O O O O
plots O O O O
with O O O O
one O O O O
colony O O O O
of O O O O
each O O O O
ant O O O O
species O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
To O O O O
test O O O O
whether O O O O
the O O O O
positive O O O O
ecosystem O O O O
engineering O O O O
effects O O O O
were O O O O
purely O O O O
caused O O O O
by O O O O
modified O O O O
properties O O O O
of O O O O
the O O O O
soil O O O O
, O O O O
we O O O O
added O O O O
in O O O O
an O O O O
additional O O O O
experiment O O O O
( O O O O
i O O O O
) O O O O
the O O O O
soil O O O O
from O O O O
ant O O O O
nests O O O O
( O O O O
without O O O O
ants O O O O
) O O O O
or O O O O
( O O O O
ii O O O O
) O O O O
unmodified O O O O
soil O O O O
or O O O O
( O O O O
iii O O O O
) O O O O
ant O O O O
nests O O O O
( O O O O
including O O O O
ants O O O O
) O O O O
to O O O O
experimental O O O O
plots O O O O
. O O O O
    
Ant O O O O
nest O O O O
soil O O O O
on O O O O
its O O O O
own O O O O
did O O O O
not O O O O
have O O O O
a O O O O
significant O O O O
impact O O O O
on O O O O
densities O O O O
of O O O O
decomposers O O O O
, O O O O
herbivores O O O O
or O O O O
predators O O O O
, O O O O
which O O O O
were O O O O
significantly O O O O
, O O O O
and O O O O
positively O O O O
, O O O O
affected O O O O
by O O O O
the O O O O
addition O O O O
of O O O O
an O O O O
intact O O O O
nest O O O O
. O O O O
    
7 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
suggest O O O O
an O O O O
important O O O O
role O O O O
of O O O O
both O O O O
ant O O O O
species O O O O
in O O O O
the O O O O
grassland O O O O
food O O O O
web O O O O
, O O O O
strongly O O O O
affecting O O O O
the O O O O
densities O O O O
of O O O O
decomposers O O O O
, O O O O
herbivores O O O O
and O O O O
higher O O O O
trophic O O O O
levels O O O O
. O O O O
    
We O O O O
discuss O O O O
how O O O O
the O O O O
relative O O O O
impact O O O O
via O O O O
bottom O O O O
- O O O O
up O O O O
and O O O O
top O O O O
- O O O O
down O O O O
effects O O O O
of O O O O
ants O O O O
depends O O O O
on O O O O
nest O O O O
density O O O O
, O O O O
with O O O O
a O O O O
relatively O O O O
greater O O O O
top O O O O
- O O O O
down O O O O
predatory O O O O
impact O O O O
at O O O O
higher O O O O
densities O O O O
. O O O O
    
Constraints O O O O
on O O O O
host O O O O
choice O O O O
: O O O O
why O O O O
do O O O O
parasitic O O O O
birds O O O O
rarely O O O O
exploit O O O O
some O O O O
common O O O O
potential O O O O
hosts O O O O
? O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Why O O O O
are O O O O
some O O O O
common O O O O
and O O O O
apparently O O O O
suitable O O O O
resources O O O O
avoided O O O O
by O O O O
potential O O O O
users O O O O
? O O O O
    
This O O O O
interesting O O O O
ecological O O O O
and O O O O
evolutionary O O O O
conundrum O O O O
is O O O O
vividly O O O O
illustrated O O O O
by O O O O
obligate O O O O
brood O O O O
parasites O O O O
. O O O O
    
Parasitic O O O O
birds O O O O
lay O O O O
their O O O O
eggs O O O O
into O O O O
nests O O O O
of O O O O
a O O O O
wide O O O O
range O O O O
of O O O O
host O O O O
species O O O O
, O O O O
including O O O O
many O O O O
rare O O O O
ones O O O O
, O O O O
but O O O O
do O O O O
not O O O O
parasitize O O O O
some O O O O
commonly O O O O
co O O O O
- O O O O
occurring O O O O
potential O O O O
hosts O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Attempts O O O O
to O O O O
explain O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
parasitism O O O O
in O O O O
common O O O O
potential O O O O
hosts O O O O
are O O O O
limited O O O O
and O O O O
typically O O O O
focused O O O O
on O O O O
single O O O O
- O O O O
factor O O O O
explanations O O O O
while O O O O
ignoring O O O O
other O O O O
potential O O O O
factors O O O O
. O O O O
    
We O O O O
tested O O O O
why O O O O
thrushes O O O O
Turdus O O O O
spp O O O O
. O O O O
are O O O O
extremely O O O O
rarely O O O O
parasitized O O O O
by O O O O
common B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cuckoos O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Cuculus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
canorus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
despite O O O O
breeding O O O O
commonly O O O O
in O O O O
sympatry O O O O
and O O O O
building O O O O
the O O O O
most O O O O
conspicuous O O O O
nests O O O O
among O O O O
forest O O O O
- O O O O
breeding O O O O
passerines O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
No O O O O
single O O O O
examined O O O O
factor O O O O
explained O O O O
cuckoo B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
avoidance O O O O
of O O O O
thrushes O O O O
. O O O O
    
Life O O O O
- O O O O
history O O O O
traits O O O O
of O O O O
all O O O O
six O O O O
European O O O O
thrush O O O O
species O O O O
and O O O O
the O O O O
10 O O O O
most O O O O
frequently O O O O
used O O O O
cuckoo B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
hosts O O O O
in O O O O
Europe O O O O
were O O O O
similar O O O O
except O O O O
body O O O O
/ O O O O
egg O O O O
size O O O O
, O O O O
nest O O O O
design O O O O
and O O O O
nestling O O O O
diet O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Experiments O O O O
( O O O O
n O O O O
= O O O O
1211 O O O O
) O O O O
in O O O O
several O O O O
populations O O O O
across O O O O
Europe O O O O
showed O O O O
that O O O O
host O O O O
defences O O O O
at O O O O
egg O O O O
- O O O O
laying O O O O
and O O O O
incubation O O O O
stages O O O O
did O O O O
not O O O O
account O O O O
for O O O O
the O O O O
lack O O O O
of O O O O
cuckoo B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
parasitism O O O O
in O O O O
thrushes O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
cross O O O O
- O O O O
fostering O O O O
experiments O O O O
disclosed O O O O
that O O O O
various O O O O
factors O O O O
during O O O O
the O O O O
nestling O O O O
period O O O O
prevent O O O O
cuckoos B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
from O O O O
successfully O O O O
parasitizing O O O O
thrushes O O O O
. O O O O
    
Specifically O O O O
, O O O O
in O O O O
some O O O O
thrush O O O O
species O O O O
, O O O O
the O O O O
nest O O O O
cup O O O O
design O O O O
forced O O O O
cuckoo B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
chicks O O O O
to O O O O
compete O O O O
with O O O O
host O O O O
chicks O O O O
with O O O O
fatal O O O O
consequences O O O O
for O O O O
the O O O O
parasite O O O O
. O O O O
    
Other O O O O
species O O O O
were O O O O
reluctant O O O O
to O O O O
care O O O O
even O O O O
for O O O O
lone O O O O
cuckoo B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
chicks O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Importantly O O O O
, O O O O
in O O O O
an O O O O
apparently O O O O
phylogenetically O O O O
homogenous O O O O
group O O O O
of O O O O
hosts O O O O
, O O O O
there O O O O
were O O O O
interspecific O O O O
differences O O O O
in O O O O
factors O O O O
responsible O O O O
for O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
cuckoo B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
parasitism O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
highlights O O O O
the O O O O
importance O O O O
of O O O O
considering O O O O
multiple O O O O
potential O O O O
factors O O O O
and O O O O
their O O O O
interactions O O O O
for O O O O
understanding O O O O
absence O O O O
of O O O O
parasitism O O O O
in O O O O
potential O O O O
hosts O O O O
of O O O O
parasitic O O O O
birds O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
present O O O O
study O O O O
, O O O O
comparative O O O O
and O O O O
experimental O O O O
procedures O O O O
are O O O O
integrated O O O O
, O O O O
which O O O O
represent O O O O
a O O O O
novel O O O O
approach O O O O
that O O O O
should O O O O
prove O O O O
useful O O O O
for O O O O
the O O O O
understanding O O O O
of O O O O
interspecific O O O O
ecological O O O O
relationships O O O O
in O O O O
general O O O O
. O O O O
    
Neurological O O O O
complications O O O O
of O O O O
acute O O O O
ischaemic O O O O
stroke O O O O
. O O O O
    
Complications O O O O
after O O O O
ischaemic O O O O
stroke O O O O
, O O O O
including O O O O
both O O O O
neurological O O O O
and O O O O
medical O O O O
complications O O O O
, O O O O
are O O O O
a O O O O
major O O O O
cause O O O O
of O O O O
morbidity O O O O
and O O O O
mortality O O O O
. O O O O
    
Neurological O O O O
complications O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
brain O O O O
oedema O O O O
or O O O O
haemorrhagic O O O O
transformation O O O O
, O O O O
occur O O O O
earlier O O O O
than O O O O
do O O O O
medical O O O O
complications O O O O
and O O O O
can O O O O
affect O O O O
outcomes O O O O
with O O O O
potential O O O O
serious O O O O
short O O O O
- O O O O
term O O O O
and O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
consequences O O O O
. O O O O
    
Some O O O O
of O O O O
these O O O O
complications O O O O
could O O O O
be O O O O
prevented O O O O
or O O O O
, O O O O
when O O O O
this O O O O
is O O O O
not O O O O
possible O O O O
, O O O O
early O O O O
detection O O O O
and O O O O
proper O O O O
management O O O O
could O O O O
be O O O O
effective O O O O
in O O O O
reducing O O O O
the O O O O
adverse O O O O
effects O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
there O O O O
is O O O O
little O O O O
evidence O O O O
- O O O O
based O O O O
data O O O O
to O O O O
guide O O O O
the O O O O
management O O O O
of O O O O
these O O O O
neurological O O O O
complications O O O O
. O O O O
    
There O O O O
is O O O O
a O O O O
clear O O O O
need O O O O
for O O O O
improved O O O O
surveillance O O O O
and O O O O
specific O O O O
interventions O O O O
for O O O O
the O O O O
prevention O O O O
, O O O O
early O O O O
diagnosis O O O O
, O O O O
and O O O O
proper O O O O
management O O O O
of O O O O
neurological O O O O
complications O O O O
during O O O O
the O O O O
acute O O O O
phase O O O O
of O O O O
stroke O O O O
to O O O O
reduce O O O O
stroke O O O O
morbidity O O O O
and O O O O
mortality O O O O
. O O O O
    
The O O O O
decoupling O O O O
of O O O O
abundance O O O O
and O O O O
species O O O O
richness O O O O
in O O O O
lizard O O O O
communities O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Patterns O O O O
of O O O O
species O O O O
richness O O O O
often O O O O
correlate O O O O
strongly O O O O
with O O O O
measures O O O O
of O O O O
energy O O O O
. O O O O
    
The O O O O
more O O O O
individuals O O O O
hypothesis O O O O
( O O O O
MIH O O O O
) O O O O
proposes O O O O
that O O O O
this O O O O
relationship O O O O
is O O O O
facilitated O O O O
by O O O O
greater O O O O
resources O O O O
supporting O O O O
larger O O O O
populations O O O O
, O O O O
which O O O O
are O O O O
less O O O O
likely O O O O
to O O O O
become O O O O
extinct O O O O
. O O O O
    
Hence O O O O
, O O O O
the O O O O
MIH O O O O
predicts O O O O
that O O O O
community O O O O
abundance O O O O
and O O O O
species O O O O
richness O O O O
will O O O O
be O O O O
positively O O O O
related O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Recently O O O O
, O O O O
Buckley O O O O
& O O O O
amp O O O O
; O O O O
Jetz O O O O
( O O O O
2010 O O O O
, O O O O
Journal O O O O
of O O O O
Animal O O O O
Ecology O O O O
, O O O O
79 O O O O
, O O O O
358 O O O O
- O O O O
365 O O O O
) O O O O
documented O O O O
a O O O O
decoupling O O O O
of O O O O
community O O O O
abundance O O O O
and O O O O
species O O O O
richness O O O O
in O O O O
lizard O O O O
communities O O O O
in O O O O
south O O O O
- O O O O
west O O O O
United O O O O
States O O O O
, O O O O
such O O O O
that O O O O
richer O O O O
communities O O O O
did O O O O
not O O O O
contain O O O O
more O O O O
individuals O O O O
. O O O O
    
They O O O O
predicted O O O O
, O O O O
as O O O O
a O O O O
consequence O O O O
of O O O O
the O O O O
mechanisms O O O O
driving O O O O
the O O O O
decoupling O O O O
, O O O O
a O O O O
more O O O O
even O O O O
distribution O O O O
of O O O O
species O O O O
abundances O O O O
in O O O O
species O O O O
- O O O O
rich O O O O
communities O O O O
, O O O O
evidenced O O O O
by O O O O
a O O O O
positive O O O O
relationship O O O O
between O O O O
species O O O O
evenness O O O O
and O O O O
species O O O O
richness O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
a O O O O
similar O O O O
decoupling O O O O
of O O O O
the O O O O
relationship O O O O
between O O O O
abundance O O O O
and O O O O
species O O O O
richness O O O O
for O O O O
lizard O O O O
communities O O O O
in O O O O
semi O O O O
- O O O O
arid O O O O
south O O O O
- O O O O
eastern O O O O
Australia O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
we O O O O
note O O O O
that O O O O
a O O O O
positive O O O O
relationship O O O O
between O O O O
evenness O O O O
and O O O O
richness O O O O
is O O O O
expected O O O O
because O O O O
of O O O O
the O O O O
nature O O O O
of O O O O
the O O O O
indices O O O O
used O O O O
. O O O O
    
We O O O O
illustrate O O O O
this O O O O
mathematically O O O O
and O O O O
empirically O O O O
using O O O O
data O O O O
from O O O O
both O O O O
sets O O O O
of O O O O
lizard O O O O
communities O O O O
. O O O O
    
When O O O O
we O O O O
used O O O O
a O O O O
measure O O O O
of O O O O
evenness O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
robust O O O O
to O O O O
species O O O O
richness O O O O
, O O O O
there O O O O
was O O O O
no O O O O
relationship O O O O
between O O O O
evenness O O O O
and O O O O
richness O O O O
in O O O O
either O O O O
data O O O O
set O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
For O O O O
lizard O O O O
communities O O O O
in O O O O
both O O O O
Australia O O O O
and O O O O
the O O O O
United O O O O
States O O O O
, O O O O
species O O O O
dominance O O O O
decreased O O O O
as O O O O
species O O O O
richness O O O O
increased O O O O
. O O O O
    
Further O O O O
, O O O O
with O O O O
the O O O O
iterative O O O O
removal O O O O
of O O O O
the O O O O
first O O O O
, O O O O
second O O O O
and O O O O
third O O O O
most O O O O
dominant O O O O
species O O O O
from O O O O
each O O O O
community O O O O
, O O O O
the O O O O
relationship O O O O
between O O O O
abundance O O O O
and O O O O
species O O O O
richness O O O O
became O O O O
increasingly O O O O
more O O O O
positive O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
data O O O O
support O O O O
the O O O O
contention O O O O
that O O O O
species O O O O
richness O O O O
in O O O O
lizard O O O O
communities O O O O
is O O O O
not O O O O
directly O O O O
related O O O O
to O O O O
the O O O O
number O O O O
of O O O O
individuals O O O O
an O O O O
environment O O O O
can O O O O
support O O O O
. O O O O
    
We O O O O
propose O O O O
an O O O O
alternative O O O O
hypothesis O O O O
regarding O O O O
how O O O O
the O O O O
decoupling O O O O
of O O O O
abundance O O O O
and O O O O
richness O O O O
is O O O O
accommodated O O O O
; O O O O
namely O O O O
, O O O O
an O O O O
inverse O O O O
relationship O O O O
between O O O O
species O O O O
dominance O O O O
and O O O O
species O O O O
richness O O O O
, O O O O
possibly O O O O
because O O O O
of O O O O
ecological O O O O
release O O O O
. O O O O
    
Food O O O O
chain O O O O
length O O O O
and O O O O
omnivory O O O O
determine O O O O
the O O O O
stability O O O O
of O O O O
a O O O O
marine O O O O
subtidal O O O O
food O O O O
web O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
a O O O O
subtidal O O O O
marine O O O O
food O O O O
web O O O O
as O O O O
a O O O O
model O O O O
system O O O O
, O O O O
we O O O O
examined O O O O
how O O O O
food O O O O
chain O O O O
length O O O O
( O O O O
predators O O O O
present O O O O
or O O O O
absent O O O O
) O O O O
and O O O O
the O O O O
prevalence O O O O
of O O O O
omnivory O O O O
influenced O O O O
temporal O O O O
stability O O O O
( O O O O
and O O O O
its O O O O
components O O O O
) O O O O
of O O O O
herbivores O O O O
and O O O O
plants O O O O
. O O O O
    
We O O O O
held O O O O
the O O O O
density O O O O
of O O O O
top O O O O
predators O O O O
constant O O O O
but O O O O
manipulated O O O O
their O O O O
identity O O O O
to O O O O
generate O O O O
a O O O O
gradient O O O O
in O O O O
omnivory O O O O
prevalence O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
measured O O O O
temporal O O O O
stability O O O O
as O O O O
the O O O O
inverse O O O O
of O O O O
the O O O O
coefficient O O O O
of O O O O
variation O O O O
of O O O O
abundance O O O O
over O O O O
time O O O O
. O O O O
    
Predators O O O O
and O O O O
omnivory O O O O
could O O O O
influence O O O O
temporal O O O O
stability O O O O
through O O O O
effects O O O O
on O O O O
abundance O O O O
( O O O O
the O O O O
' O O O O
abundance O O O O
' O O O O
effect O O O O
) O O O O
, O O O O
summed O O O O
variance O O O O
across O O O O
taxa O O O O
( O O O O
the O O O O
' O O O O
portfolio O O O O
effect O O O O
' O O O O
) O O O O
or O O O O
summed O O O O
covariances O O O O
among O O O O
taxa O O O O
( O O O O
the O O O O
' O O O O
covariance O O O O
effect O O O O
' O O O O
) O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
that O O O O
increasing O O O O
food O O O O
chain O O O O
length O O O O
by O O O O
predator O O O O
addition O O O O
destabilized O O O O
aggregate O O O O
herbivore O O O O
abundance O O O O
through O O O O
their O O O O
cascading O O O O
effects O O O O
on O O O O
abundances O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
predators O O O O
destabilized O O O O
herbivores O O O O
through O O O O
the O O O O
overyielding O O O O
effect O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
found O O O O
that O O O O
the O O O O
stability O O O O
of O O O O
herbivore O O O O
abundance O O O O
and O O O O
microalgae O O O O
declined O O O O
with O O O O
increasing O O O O
prevalence O O O O
of O O O O
omnivory O O O O
among O O O O
top O O O O
predators O O O O
. O O O O
    
Aggregate O O O O
macroalgae O O O O
was O O O O
not O O O O
affected O O O O
, O O O O
but O O O O
the O O O O
stability O O O O
of O O O O
one O O O O
algal O O O O
taxon O O O O
increased O O O O
with O O O O
the O O O O
prevalence O O O O
of O O O O
omnivory O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
herbivores O O O O
are O O O O
more O O O O
sensitive O O O O
than O O O O
plants O O O O
to O O O O
changes O O O O
in O O O O
food O O O O
web O O O O
structure O O O O
because O O O O
of O O O O
predator O O O O
additions O O O O
by O O O O
invasion O O O O
or O O O O
deletions O O O O
such O O O O
as O O O O
might O O O O
occur O O O O
via O O O O
harvesting O O O O
and O O O O
habitat O O O O
loss O O O O
. O O O O
    
Are O O O O
numbers O O O O
enough O O O O
? O O O O
    
Colonizer O O O O
phenotype O O O O
and O O O O
abundance O O O O
interact O O O O
to O O O O
affect O O O O
population O O O O
dynamics O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Ecologists O O O O
have O O O O
long O O O O
recognized O O O O
that O O O O
the O O O O
number O O O O
of O O O O
colonizers O O O O
entering O O O O
a O O O O
population O O O O
can O O O O
be O O O O
a O O O O
major O O O O
driver O O O O
of O O O O
population O O O O
dynamics O O O O
, O O O O
but O O O O
still O O O O
struggle O O O O
to O O O O
explain O O O O
why O O O O
the O O O O
importance O O O O
of O O O O
colonizer O O O O
supply O O O O
varies O O O O
so O O O O
dramatically O O O O
. O O O O
    
While O O O O
there O O O O
are O O O O
indications O O O O
that O O O O
differences O O O O
in O O O O
the O O O O
phenotype O O O O
among O O O O
dispersing O O O O
individuals O O O O
could O O O O
also O O O O
be O O O O
important O O O O
to O O O O
populations O O O O
, O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
phenotypic O O O O
variation O O O O
relative O O O O
to O O O O
the O O O O
number O O O O
of O O O O
individuals O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
extent O O O O
to O O O O
which O O O O
they O O O O
interact O O O O
, O O O O
remains O O O O
unknown O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
simultaneously O O O O
manipulated O O O O
the O O O O
phenotype O O O O
( O O O O
dispersal O O O O
duration O O O O
) O O O O
and O O O O
abundance O O O O
of O O O O
settlers O O O O
of O O O O
a O O O O
marine O O O O
bryozoan O O O O
and O O O O
measured O O O O
subsequent O O O O
population O O O O
structure O O O O
in O O O O
the O O O O
field O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Increases O O O O
in O O O O
the O O O O
number O O O O
of O O O O
colonizing O O O O
individuals O O O O
increased O O O O
the O O O O
subsequent O O O O
recruitment O O O O
and O O O O
biomass O O O O
of O O O O
populations O O O O
, O O O O
regardless O O O O
of O O O O
colonizer O O O O
phenotype O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
relationship O O O O
between O O O O
colonizer O O O O
abundance O O O O
and O O O O
the O O O O
subsequent O O O O
reproductive O O O O
yield O O O O
of O O O O
the O O O O
population O O O O
was O O O O
strongly O O O O
reduced O O O O
in O O O O
populations O O O O
containing O O O O
individuals O O O O
that O O O O
had O O O O
long O O O O
dispersal O O O O
durations O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
interactive O O O O
effects O O O O
of O O O O
colonizer O O O O
phenotype O O O O
and O O O O
abundance O O O O
on O O O O
the O O O O
reproductive O O O O
yield O O O O
of O O O O
populations O O O O
occurred O O O O
because O O O O
longer O O O O
dispersal O O O O
durations O O O O
decreased O O O O
the O O O O
proportion O O O O
of O O O O
individuals O O O O
that O O O O
reproduced O O O O
. O O O O
    
In O O O O
fact O O O O
, O O O O
populations O O O O
established O O O O
from O O O O
a O O O O
few O O O O
individuals O O O O
with O O O O
short O O O O
dispersal O O O O
durations O O O O
had O O O O
similar O O O O
reproductive O O O O
yield O O O O
to O O O O
populations O O O O
c O O O O
. O O O O
    
30 O O O O
times O O O O
larger O O O O
established O O O O
from O O O O
individuals O O O O
with O O O O
long O O O O
dispersal O O O O
durations O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Interactions O O O O
between O O O O
colonizer O O O O
phenotype O O O O
and O O O O
abundance O O O O
have O O O O
important O O O O
implications O O O O
for O O O O
predicting O O O O
population O O O O
dynamics O O O O
beyond O O O O
those O O O O
previously O O O O
provided O O O O
by O O O O
numerical O O O O
abundance O O O O
or O O O O
recruit O O O O
phenotype O O O O
alone O O O O
. O O O O
    
A O O O O
bicistronic O O O O
, O O O O
Ubiquitin O O O O
- O O O O
10 O O O O
promoter O O O O
- O O O O
based O O O O
vector O O O O
cassette O O O O
for O O O O
transient O O O O
transformation O O O O
and O O O O
functional O O O O
analysis O O O O
of O O O O
membrane O O O O
transport O O O O
demonstrates O O O O
the O O O O
utility O O O O
of O O O O
quantitative O O O O
voltage O O O O
clamp O O O O
studies O O O O
on O O O O
intact O O O O
Arabidopsis O O O O
root O O O O
epidermis O O O O
. O O O O
    
To O O O O
date O O O O
the O O O O
use O O O O
of O O O O
fluorescent O O O O
reporter O O O O
constructs O O O O
in O O O O
analysing O O O O
membrane O O O O
transport O O O O
has O O O O
been O O O O
limited O O O O
primarily O O O O
to O O O O
cell O O O O
lines O O O O
expressing O O O O
stably O O O O
either O O O O
the O O O O
tagged O O O O
transporter O O O O
protein O O O O
( O O O O
s O O O O
) O O O O
or O O O O
markers O O O O
to O O O O
identify O O O O
lineages O O O O
of O O O O
interest O O O O
. O O O O
    
Strategies O O O O
for O O O O
transient O O O O
expression O O O O
have O O O O
yet O O O O
to O O O O
be O O O O
exploited O O O O
in O O O O
transport O O O O
analysis O O O O
, O O O O
despite O O O O
their O O O O
wide O O O O
application O O O O
in O O O O
cellular O O O O
imaging O O O O
studies O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
describe O O O O
a O O O O
Gateway O O O O
- O O O O
compatible O O O O
, O O O O
bicistronic O O O O
vector O O O O
, O O O O
incorporating O O O O
the O O O O
constitutive O O O O
Ubiqutin O O O O
- O O O O
10 O O O O
gene O O O O
promoter O O O O
of O O O O
Arabidopsis O O O O
that O O O O
gives O O O O
prolonged O O O O
expression O O O O
after O O O O
transient O O O O
transformation O O O O
and O O O O
enables O O O O
fluorescence O O O O
marking O O O O
of O O O O
cells O O O O
without O O O O
a O O O O
fusion O O O O
construct O O O O
. O O O O
    
We O O O O
show O O O O
that O O O O
Arabidopsis O O O O
root O O O O
epidermal O O O O
cells O O O O
are O O O O
readily O O O O
transformed O O O O
by O O O O
co O O O O
- O O O O
cultivation O O O O
with O O O O
Agrobacterium O O O O
and O O O O
are O O O O
tractable O O O O
for O O O O
quantitative O O O O
electrophysiological O O O O
analysis O O O O
. O O O O
    
As O O O O
a O O O O
proof O O O O
of O O O O
principle O O O O
, O O O O
we O O O O
transiently O O O O
transformed O O O O
Arabidopsis O O O O
with O O O O
the O O O O
bicistronic O O O O
vector O O O O
carrying O O O O
GFP O O O O
as O O O O
the O O O O
fluorescent O O O O
marker O O O O
and O O O O
, O O O O
separately O O O O
, O O O O
the O O O O
integral O O O O
plasma O O O O
membrane O O O O
protein O O O O
SYP121 O O O O
essential O O O O
for O O O O
the O O O O
inward O O O O
K O O O O
+ O O O O
channel O O O O
current O O O O
. O O O O
    
We O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
transient O O O O
expression O O O O
of O O O O
SYP121 O O O O
in O O O O
syp121 O O O O
mutant O O O O
plants O O O O
is O O O O
sufficient O O O O
to O O O O
rescue O O O O
the O O O O
K O O O O
+ O O O O
current O O O O
in O O O O
vivo O O O O
. O O O O
    
The O O O O
combination O O O O
of O O O O
transient O O O O
expression O O O O
and O O O O
use O O O O
of O O O O
the O O O O
bicistronic O O O O
vector O O O O
promises O O O O
significant O O O O
advantages O O O O
for O O O O
studies O O O O
of O O O O
membrane O O O O
transport O O O O
and O O O O
nutrient O O O O
acquisition O O O O
in O O O O
roots O O O O
. O O O O
    
Treatment O O O O
of O O O O
patients O O O O
with O O O O
essential O O O O
tremor O O O O
. O O O O
    
Essential O O O O
tremor O O O O
is O O O O
a O O O O
common O O O O
movement O O O O
disorder O O O O
. O O O O
    
Tremor O O O O
severity O O O O
and O O O O
handicap O O O O
vary O O O O
widely O O O O
, O O O O
but O O O O
most O O O O
patients O O O O
with O O O O
essential O O O O
tremor O O O O
do O O O O
not O O O O
receive O O O O
a O O O O
diagnosis O O O O
and O O O O
hence O O O O
are O O O O
never O O O O
treated O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
many O O O O
patients O O O O
abandon O O O O
treatment O O O O
because O O O O
of O O O O
side O O O O
- O O O O
effects O O O O
or O O O O
poor O O O O
efficacy O O O O
. O O O O
    
A O O O O
newly O O O O
developed O O O O
algorithm O O O O
, O O O O
based O O O O
on O O O O
the O O O O
logarithmic O O O O
relation O O O O
between O O O O
tremor O O O O
amplitude O O O O
and O O O O
clinical O O O O
tremor O O O O
ratings O O O O
, O O O O
can O O O O
be O O O O
used O O O O
to O O O O
compare O O O O
the O O O O
magnitude O O O O
of O O O O
effect O O O O
of O O O O
available O O O O
treatments O O O O
. O O O O
    
Drugs O O O O
with O O O O
established O O O O
efficacy O O O O
( O O O O
propranolol O O O O
and O O O O
primidone O O O O
) O O O O
produce O O O O
a O O O O
mean O O O O
tremor O O O O
reduction O O O O
of O O O O
about O O O O
50 O O O O
% O O O O
. O O O O
    
Deep O O O O
brain O O O O
stimulation O O O O
( O O O O
DBS O O O O
) O O O O
in O O O O
the O O O O
thalamic O O O O
nucleus O O O O
ventrointermedius O O O O
or O O O O
neighbouring O O O O
subthalamic O O O O
structures O O O O
reduces O O O O
tremor O O O O
by O O O O
about O O O O
90 O O O O
% O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
no O O O O
controlled O O O O
trials O O O O
of O O O O
DBS O O O O
have O O O O
been O O O O
done O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
best O O O O
target O O O O
is O O O O
still O O O O
uncertain O O O O
. O O O O
    
Better O O O O
drugs O O O O
are O O O O
needed O O O O
, O O O O
and O O O O
controlled O O O O
trials O O O O
are O O O O
required O O O O
to O O O O
determine O O O O
the O O O O
safety O O O O
and O O O O
efficacy O O O O
of O O O O
DBS O O O O
in O O O O
the O O O O
nucleus O O O O
ventrointermedius O O O O
and O O O O
neighbouring O O O O
subthalamic O O O O
structures O O O O
. O O O O
    
Mechanisms O O O O
of O O O O
epileptogenesis O O O O
and O O O O
potential O O O O
treatment O O O O
targets O O O O
. O O O O
    
Prevention O O O O
of O O O O
epileptogenesis O O O O
after O O O O
brain O O O O
trauma O O O O
is O O O O
an O O O O
unmet O O O O
medical O O O O
challenge O O O O
. O O O O
    
Recent O O O O
molecular O O O O
profiling O O O O
studies O O O O
have O O O O
provided O O O O
an O O O O
insight O O O O
into O O O O
molecular O O O O
changes O O O O
that O O O O
contribute O O O O
to O O O O
formation O O O O
of O O O O
ictogenic O O O O
neuronal O O O O
networks O O O O
, O O O O
including O O O O
genes O O O O
regulating O O O O
synaptic O O O O
or O O O O
neuronal O O O O
plasticity O O O O
, O O O O
cell O O O O
death O O O O
, O O O O
proliferation O O O O
, O O O O
and O O O O
inflammatory O O O O
or O O O O
immune O O O O
responses O O O O
. O O O O
    
These O O O O
mechanisms O O O O
have O O O O
been O O O O
targeted O O O O
to O O O O
prevent O O O O
epileptogenesis O O O O
in O O O O
animal O O O O
models O O O O
. O O O O
    
Favourable O O O O
effects O O O O
have O O O O
been O O O O
obtained O O O O
using O O O O
immunosuppressants O O O O
, O O O O
antibodies O O O O
blocking O O O O
adhesion O O O O
of O O O O
leucocytes O O O O
to O O O O
endothelial O O O O
cells O O O O
, O O O O
gene O O O O
therapy O O O O
driving O O O O
expression O O O O
of O O O O
neurotrophic O O O O
factors O O O O
, O O O O
pharmacological O O O O
neurostimulation O O O O
, O O O O
or O O O O
even O O O O
with O O O O
conventional O O O O
antiepileptic O O O O
drugs O O O O
by O O O O
administering O O O O
them O O O O
before O O O O
the O O O O
appearance O O O O
of O O O O
genetic O O O O
epilepsy O O O O
. O O O O
    
Further O O O O
studies O O O O
are O O O O
needed O O O O
to O O O O
clarify O O O O
the O O O O
optimum O O O O
time O O O O
window O O O O
and O O O O
aetiological O O O O
specificity O O O O
of O O O O
treatments O O O O
. O O O O
    
Questions O O O O
related O O O O
to O O O O
adverse O O O O
events O O O O
also O O O O
need O O O O
further O O O O
consideration O O O O
. O O O O
    
Encouragingly O O O O
, O O O O
the O O O O
recent O O O O
experimental O O O O
studies O O O O
emphasise O O O O
that O O O O
the O O O O
complicated O O O O
process O O O O
of O O O O
epileptogenesis O O O O
can O O O O
be O O O O
favourably O O O O
modified O O O O
, O O O O
and O O O O
that O O O O
antiepileptogenesis O O O O
as O O O O
a O O O O
treatment O O O O
indication O O O O
might O O O O
not O O O O
be O O O O
an O O O O
impossible O O O O
mission O O O O
. O O O O
    
Pterin O O O O
- O O O O
based O O O O
ornamental O O O O
coloration O O O O
predicts O O O O
yolk O O O O
antioxidant O O O O
levels O O O O
in O O O O
female O O O O
striped B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
plateau O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
lizards O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Sceloporus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virgatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Maternal O O O O
investment O O O O
in O O O O
egg O O O O
quality O O O O
can O O O O
have O O O O
important O O O O
consequences O O O O
for O O O O
offspring O O O O
fitness O O O O
. O O O O
    
For O O O O
example O O O O
, O O O O
yolk O O O O
antioxidants O O O O
can O O O O
affect O O O O
embryonic O O O O
development O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
juvenile O O O O
and O O O O
adult O O O O
phenotype O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
females O O O O
may O O O O
be O O O O
selected O O O O
to O O O O
advertise O O O O
their O O O O
yolk O O O O
antioxidant O O O O
deposition O O O O
to O O O O
discriminatory O O O O
males O O O O
via O O O O
ornamental O O O O
signals O O O O
, O O O O
perhaps O O O O
depending O O O O
on O O O O
the O O O O
reproductive O O O O
costs O O O O
associated O O O O
with O O O O
signal O O O O
production O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Female O O O O
striped B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
plateau O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
lizards O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Sceloporus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virgatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
develop O O O O
pterin O O O O
- O O O O
based O O O O
orange O O O O
colour O O O O
patches O O O O
during O O O O
the O O O O
reproductive O O O O
season O O O O
that O O O O
influence O O O O
male O O O O
behaviour O O O O
and O O O O
that O O O O
are O O O O
positively O O O O
associated O O O O
with O O O O
the O O O O
phenotypic O O O O
quality O O O O
of O O O O
the O O O O
female O O O O
and O O O O
her O O O O
offspring O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
assessed O O O O
one O O O O
potential O O O O
developmental O O O O
mechanism O O O O
underlying O O O O
the O O O O
relationship O O O O
between O O O O
offspring O O O O
quality O O O O
and O O O O
female O O O O
ornamentation O O O O
in O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virgatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
by O O O O
examining O O O O
the O O O O
relationship O O O O
between O O O O
ornament O O O O
expression O O O O
and O O O O
yolk O O O O
antioxidant O O O O
levels O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
As O O O O
expected O O O O
, O O O O
concentrations O O O O
of O O O O
the O O O O
yolk O O O O
antioxidants O O O O
vitamin O O O O
A O O O O
, O O O O
vitamin O O O O
E O O O O
and O O O O
carotenoids O O O O
( O O O O
lutein O O O O
and O O O O
zeaxanthin O O O O
) O O O O
were O O O O
strongly O O O O
positively O O O O
intercorrelated O O O O
. O O O O
    
Eggs O O O O
from O O O O
larger O O O O
clutches O O O O
had O O O O
fewer O O O O
antioxidants O O O O
than O O O O
eggs O O O O
from O O O O
smaller O O O O
clutches O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
females O O O O
may O O O O
be O O O O
limited O O O O
in O O O O
antioxidant O O O O
availability O O O O
or O O O O
use O O O O
. O O O O
    
Fertilized O O O O
and O O O O
unfertilized O O O O
eggs O O O O
did O O O O
not O O O O
differ O O O O
in O O O O
yolk O O O O
antioxidant O O O O
levels O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
size O O O O
of O O O O
a O O O O
female O O O O
' O O O O
s O O O O
ornament O O O O
was O O O O
positively O O O O
related O O O O
to O O O O
both O O O O
the O O O O
concentration O O O O
and O O O O
total O O O O
amount O O O O
of O O O O
yolk O O O O
antioxidants O O O O
, O O O O
and O O O O
ornament O O O O
colour O O O O
was O O O O
positively O O O O
related O O O O
to O O O O
yolk O O O O
antioxidant O O O O
concentration O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
in O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virgatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
female O O O O
ornaments O O O O
may O O O O
advertise O O O O
egg O O O O
quality O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
, O O O O
these O O O O
data O O O O
suggest O O O O
that O O O O
more O O O O
ornamented O O O O
females O O O O
may O O O O
produce O O O O
higher O O O O
- O O O O
quality O O O O
offspring O O O O
, O O O O
in O O O O
part O O O O
because O O O O
their O O O O
eggs O O O O
contain O O O O
more O O O O
antioxidants O O O O
. O O O O
    
As O O O O
the O O O O
colour O O O O
ornament O O O O
of O O O O
interest O O O O
is O O O O
derived O O O O
from O O O O
pterins O O O O
, O O O O
not O O O O
carotenoids O O O O
, O O O O
direct O O O O
resource O O O O
trade O O O O
- O O O O
offs O O O O
between O O O O
ornaments O O O O
and O O O O
eggs O O O O
may O O O O
be O O O O
eliminated O O O O
, O O O O
reducing O O O O
reproductive O O O O
costs O O O O
associated O O O O
with O O O O
signalling O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
This O O O O
is O O O O
the O O O O
first O O O O
example O O O O
of O O O O
a O O O O
positive O O O O
relationship O O O O
between O O O O
female O O O O
ornamentation O O O O
and O O O O
yolk O O O O
antioxidants O O O O
in O O O O
reptiles O O O O
and O O O O
may O O O O
indicate O O O O
the O O O O
general O O O O
importance O O O O
of O O O O
these O O O O
patterns O O O O
in O O O O
oviparous O O O O
vertebrates O O O O
. O O O O
    
Human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
resources O O O O
for O O O O
health O O O O
in O O O O
southeast O O O O
Asia O O O O
: O O O O
shortages O O O O
, O O O O
distributional O O O O
challenges O O O O
, O O O O
and O O O O
international O O O O
trade O O O O
in O O O O
health O O O O
services O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
paper O O O O
, O O O O
we O O O O
address O O O O
the O O O O
issues O O O O
of O O O O
shortage O O O O
and O O O O
maldistribution O O O O
of O O O O
health O O O O
personnel O O O O
in O O O O
southeast O O O O
Asia O O O O
in O O O O
the O O O O
context O O O O
of O O O O
the O O O O
international O O O O
trade O O O O
in O O O O
health O O O O
services O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
there O O O O
is O O O O
no O O O O
shortage O O O O
of O O O O
health O O O O
workers O O O O
in O O O O
the O O O O
region O O O O
overall O O O O
, O O O O
when O O O O
analysed O O O O
separately O O O O
, O O O O
five O O O O
low O O O O
- O O O O
income O O O O
countries O O O O
have O O O O
some O O O O
deficit O O O O
. O O O O
    
All O O O O
countries O O O O
in O O O O
southeast O O O O
Asia O O O O
face O O O O
problems O O O O
of O O O O
maldistribution O O O O
of O O O O
health O O O O
workers O O O O
, O O O O
and O O O O
rural O O O O
areas O O O O
are O O O O
often O O O O
understaffed O O O O
. O O O O
    
Despite O O O O
a O O O O
high O O O O
capacity O O O O
for O O O O
medical O O O O
and O O O O
nursing O O O O
training O O O O
in O O O O
both O O O O
public O O O O
and O O O O
private O O O O
facilities O O O O
, O O O O
there O O O O
is O O O O
weak O O O O
coordination O O O O
between O O O O
production O O O O
of O O O O
health O O O O
workers O O O O
and O O O O
capacity O O O O
for O O O O
employment O O O O
. O O O O
    
Regional O O O O
experiences O O O O
and O O O O
policy O O O O
responses O O O O
to O O O O
address O O O O
these O O O O
challenges O O O O
can O O O O
be O O O O
used O O O O
to O O O O
inform O O O O
future O O O O
policy O O O O
in O O O O
the O O O O
region O O O O
and O O O O
elsewhere O O O O
. O O O O
    
A O O O O
distinctive O O O O
feature O O O O
of O O O O
southeast O O O O
Asia O O O O
is O O O O
its O O O O
engagement O O O O
in O O O O
international O O O O
trade O O O O
in O O O O
health O O O O
services O O O O
. O O O O
    
Singapore O O O O
and O O O O
Malaysia O O O O
import O O O O
health O O O O
workers O O O O
to O O O O
meet O O O O
domestic O O O O
demand O O O O
and O O O O
to O O O O
provide O O O O
services O O O O
to O O O O
international O O O O
patients O O O O
. O O O O
    
Thailand O O O O
attracts O O O O
many O O O O
foreign O O O O
patients O O O O
for O O O O
health O O O O
services O O O O
. O O O O
    
This O O O O
situation O O O O
has O O O O
resulted O O O O
in O O O O
the O O O O
so O O O O
- O O O O
called O O O O
brain O O O O
drain O O O O
of O O O O
highly O O O O
specialised O O O O
staff O O O O
from O O O O
public O O O O
medical O O O O
schools O O O O
to O O O O
the O O O O
private O O O O
hospitals O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Philippines O O O O
and O O O O
Indonesia O O O O
are O O O O
the O O O O
main O O O O
exporters O O O O
of O O O O
doctors O O O O
and O O O O
nurses O O O O
in O O O O
the O O O O
region O O O O
. O O O O
    
Agreements O O O O
about O O O O
mutual O O O O
recognition O O O O
of O O O O
professional O O O O
qualifications O O O O
for O O O O
three O O O O
groups O O O O
of O O O O
health O O O O
workers O O O O
under O O O O
the O O O O
Association O O O O
of O O O O
Southeast O O O O
Asian O O O O
Nations O O O O
Framework O O O O
Agreement O O O O
on O O O O
Services O O O O
could O O O O
result O O O O
in O O O O
increased O O O O
movement O O O O
within O O O O
the O O O O
region O O O O
in O O O O
the O O O O
future O O O O
. O O O O
    
To O O O O
ensure O O O O
that O O O O
vital O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
resources O O O O
for O O O O
health O O O O
are O O O O
available O O O O
to O O O O
meet O O O O
the O O O O
needs O O O O
of O O O O
the O O O O
populations O O O O
that O O O O
they O O O O
serve O O O O
, O O O O
migration O O O O
management O O O O
and O O O O
retention O O O O
strategies O O O O
need O O O O
to O O O O
be O O O O
integrated O O O O
into O O O O
ongoing O O O O
efforts O O O O
to O O O O
strengthen O O O O
health O O O O
systems O O O O
in O O O O
southeast O O O O
Asia O O O O
. O O O O
    
There O O O O
is O O O O
also O O O O
a O O O O
need O O O O
for O O O O
improved O O O O
dialogue O O O O
between O O O O
the O O O O
health O O O O
and O O O O
trade O O O O
sectors O O O O
on O O O O
how O O O O
to O O O O
balance O O O O
economic O O O O
opportunities O O O O
associated O O O O
with O O O O
trade O O O O
in O O O O
health O O O O
services O O O O
with O O O O
domestic O O O O
health O O O O
needs O O O O
and O O O O
equity O O O O
issues O O O O
. O O O O
    
Emerging O O O O
infectious O O O O
diseases O O O O
in O O O O
southeast O O O O
Asia O O O O
: O O O O
regional O O O O
challenges O O O O
to O O O O
control O O O O
. O O O O
    
Southeast O O O O
Asia O O O O
is O O O O
a O O O O
hotspot O O O O
for O O O O
emerging O O O O
infectious O O O O
diseases O O O O
, O O O O
including O O O O
those O O O O
with O O O O
pandemic O O O O
potential O O O O
. O O O O
    
Emerging O O O O
infectious O O O O
diseases O O O O
have O O O O
exacted O O O O
heavy O O O O
public O O O O
health O O O O
and O O O O
economic O O O O
tolls O O O O
. O O O O
    
Severe O O O O
acute O O O O
respiratory O O O O
syndrome O O O O
rapidly O O O O
decimated O O O O
the O O O O
region O O O O
' O O O O
s O O O O
tourist O O O O
industry O O O O
. O O O O
    
Influenza O O O O
A O O O O
H5N1 O O O O
has O O O O
had O O O O
a O O O O
profound O O O O
effect O O O O
on O O O O
the O O O O
poultry O O O O
industry O O O O
. O O O O
    
The O O O O
reasons O O O O
why O O O O
southeast O O O O
Asia O O O O
is O O O O
at O O O O
risk O O O O
from O O O O
emerging O O O O
infectious O O O O
diseases O O O O
are O O O O
complex O O O O
. O O O O
    
The O O O O
region O O O O
is O O O O
home O O O O
to O O O O
dynamic O O O O
systems O O O O
in O O O O
which O O O O
biological O O O O
, O O O O
social O O O O
, O O O O
ecological O O O O
, O O O O
and O O O O
technological O O O O
processes O O O O
interconnect O O O O
in O O O O
ways O O O O
that O O O O
enable O O O O
microbes O O O O
to O O O O
exploit O O O O
new O O O O
ecological O O O O
niches O O O O
. O O O O
    
These O O O O
processes O O O O
include O O O O
population O O O O
growth O O O O
and O O O O
movement O O O O
, O O O O
urbanisation O O O O
, O O O O
changes O O O O
in O O O O
food O O O O
production O O O O
, O O O O
agriculture O O O O
and O O O O
land O O O O
use O O O O
, O O O O
water O O O O
and O O O O
sanitation O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
effect O O O O
of O O O O
health O O O O
systems O O O O
through O O O O
generation O O O O
of O O O O
drug O O O O
resistance O O O O
. O O O O
    
Southeast O O O O
Asia O O O O
is O O O O
home O O O O
to O O O O
about O O O O
600 O O O O
million O O O O
people O O O O
residing O O O O
in O O O O
countries O O O O
as O O O O
diverse O O O O
as O O O O
Singapore O O O O
, O O O O
a O O O O
city O O O O
state O O O O
with O O O O
a O O O O
gross O O O O
domestic O O O O
product O O O O
( O O O O
GDP O O O O
) O O O O
of O O O O
US O O O O
$ O O O O
37 O O O O
, O O O O
500 O O O O
per O O O O
head O O O O
, O O O O
and O O O O
Laos O O O O
, O O O O
until O O O O
recently O O O O
an O O O O
overwhelmingly O O O O
rural O O O O
economy O O O O
, O O O O
with O O O O
a O O O O
GDP O O O O
of O O O O
US O O O O
$ O O O O
890 O O O O
per O O O O
head O O O O
. O O O O
    
The O O O O
regional O O O O
challenges O O O O
in O O O O
control O O O O
of O O O O
emerging O O O O
infectious O O O O
diseases O O O O
are O O O O
formidable O O O O
and O O O O
range O O O O
from O O O O
influencing O O O O
the O O O O
factors O O O O
that O O O O
drive O O O O
disease O O O O
emergence O O O O
, O O O O
to O O O O
making O O O O
surveillance O O O O
systems O O O O
fit O O O O
for O O O O
purpose O O O O
, O O O O
and O O O O
ensuring O O O O
that O O O O
regional O O O O
governance O O O O
mechanisms O O O O
work O O O O
effectively O O O O
to O O O O
improve O O O O
control O O O O
interventions O O O O
. O O O O
    
Health O O O O
- O O O O
financing O O O O
reforms O O O O
in O O O O
southeast O O O O
Asia O O O O
: O O O O
challenges O O O O
in O O O O
achieving O O O O
universal O O O O
coverage O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
sixth O O O O
paper O O O O
of O O O O
the O O O O
Series O O O O
, O O O O
we O O O O
review O O O O
health O O O O
- O O O O
financing O O O O
reforms O O O O
in O O O O
seven O O O O
countries O O O O
in O O O O
southeast O O O O
Asia O O O O
that O O O O
have O O O O
sought O O O O
to O O O O
reduce O O O O
dependence O O O O
on O O O O
out O O O O
- O O O O
of O O O O
- O O O O
pocket O O O O
payments O O O O
, O O O O
increase O O O O
pooled O O O O
health O O O O
finance O O O O
, O O O O
and O O O O
expand O O O O
service O O O O
use O O O O
as O O O O
steps O O O O
towards O O O O
universal O O O O
coverage O O O O
. O O O O
    
Laos O O O O
and O O O O
Cambodia O O O O
, O O O O
both O O O O
resource O O O O
- O O O O
poor O O O O
countries O O O O
, O O O O
have O O O O
mostly O O O O
relied O O O O
on O O O O
donor O O O O
- O O O O
supported O O O O
health O O O O
equity O O O O
funds O O O O
to O O O O
reach O O O O
the O O O O
poor O O O O
, O O O O
and O O O O
reliable O O O O
funding O O O O
and O O O O
appropriate O O O O
identification O O O O
of O O O O
the O O O O
eligible O O O O
poor O O O O
are O O O O
two O O O O
major O O O O
challenges O O O O
for O O O O
nationwide O O O O
expansion O O O O
. O O O O
    
For O O O O
Thailand O O O O
, O O O O
the O O O O
Philippines O O O O
, O O O O
Indonesia O O O O
, O O O O
and O O O O
Vietnam O O O O
, O O O O
social O O O O
health O O O O
insurance O O O O
financed O O O O
by O O O O
payroll O O O O
tax O O O O
is O O O O
commonly O O O O
used O O O O
for O O O O
formal O O O O
sector O O O O
employees O O O O
( O O O O
excluding O O O O
Malaysia O O O O
) O O O O
, O O O O
with O O O O
varying O O O O
outcomes O O O O
in O O O O
terms O O O O
of O O O O
financial O O O O
protection O O O O
. O O O O
    
Alternative O O O O
payment O O O O
methods O O O O
have O O O O
different O O O O
implications O O O O
for O O O O
provider O O O O
behaviour O O O O
and O O O O
financial O O O O
protection O O O O
. O O O O
    
Two O O O O
alternative O O O O
approaches O O O O
for O O O O
financial O O O O
protection O O O O
of O O O O
the O O O O
non O O O O
- O O O O
poor O O O O
outside O O O O
the O O O O
formal O O O O
sector O O O O
have O O O O
emerged O O O O
- O O O O
contributory O O O O
arrangements O O O O
and O O O O
tax O O O O
- O O O O
financed O O O O
schemes O O O O
- O O O O
with O O O O
different O O O O
abilities O O O O
to O O O O
achieve O O O O
high O O O O
population O O O O
coverage O O O O
rapidly O O O O
. O O O O
    
Fiscal O O O O
space O O O O
and O O O O
mobilisation O O O O
of O O O O
payroll O O O O
contributions O O O O
are O O O O
both O O O O
important O O O O
in O O O O
accelerating O O O O
financial O O O O
protection O O O O
. O O O O
    
Expanding O O O O
coverage O O O O
of O O O O
good O O O O
- O O O O
quality O O O O
services O O O O
and O O O O
ensuring O O O O
adequate O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
resources O O O O
are O O O O
also O O O O
important O O O O
to O O O O
achieve O O O O
universal O O O O
coverage O O O O
. O O O O
    
As O O O O
health O O O O
- O O O O
financing O O O O
reform O O O O
is O O O O
complex O O O O
, O O O O
institutional O O O O
capacity O O O O
to O O O O
generate O O O O
evidence O O O O
and O O O O
inform O O O O
policy O O O O
is O O O O
essential O O O O
and O O O O
should O O O O
be O O O O
strengthened O O O O
. O O O O
    
Health O O O O
and O O O O
health O O O O
- O O O O
care O O O O
systems O O O O
in O O O O
southeast O O O O
Asia O O O O
: O O O O
diversity O O O O
and O O O O
transitions O O O O
. O O O O
    
Southeast O O O O
Asia O O O O
is O O O O
a O O O O
region O O O O
of O O O O
enormous O O O O
social O O O O
, O O O O
economic O O O O
, O O O O
and O O O O
political O O O O
diversity O O O O
, O O O O
both O O O O
across O O O O
and O O O O
within O O O O
countries O O O O
, O O O O
shaped O O O O
by O O O O
its O O O O
history O O O O
, O O O O
geography O O O O
, O O O O
and O O O O
position O O O O
as O O O O
a O O O O
major O O O O
crossroad O O O O
of O O O O
trade O O O O
and O O O O
the O O O O
movement O O O O
of O O O O
goods O O O O
and O O O O
services O O O O
. O O O O
    
These O O O O
factors O O O O
have O O O O
not O O O O
only O O O O
contributed O O O O
to O O O O
the O O O O
disparate O O O O
health O O O O
status O O O O
of O O O O
the O O O O
region O O O O
' O O O O
s O O O O
diverse O O O O
populations O O O O
, O O O O
but O O O O
also O O O O
to O O O O
the O O O O
diverse O O O O
nature O O O O
of O O O O
its O O O O
health O O O O
systems O O O O
, O O O O
which O O O O
are O O O O
at O O O O
varying O O O O
stages O O O O
of O O O O
evolution O O O O
. O O O O
    
Rapid O O O O
but O O O O
inequitable O O O O
socioeconomic O O O O
development O O O O
, O O O O
coupled O O O O
with O O O O
differing O O O O
rates O O O O
of O O O O
demographic O O O O
and O O O O
epidemiological O O O O
transitions O O O O
, O O O O
have O O O O
accentuated O O O O
health O O O O
disparities O O O O
and O O O O
posed O O O O
great O O O O
public O O O O
health O O O O
challenges O O O O
for O O O O
national O O O O
health O O O O
systems O O O O
, O O O O
particularly O O O O
the O O O O
control O O O O
of O O O O
emerging O O O O
infectious O O O O
diseases O O O O
and O O O O
the O O O O
rise O O O O
of O O O O
non O O O O
- O O O O
communicable O O O O
diseases O O O O
within O O O O
ageing O O O O
populations O O O O
. O O O O
    
While O O O O
novel O O O O
forms O O O O
of O O O O
health O O O O
care O O O O
are O O O O
evolving O O O O
in O O O O
the O O O O
region O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
corporatised O O O O
public O O O O
health O O O O
- O O O O
care O O O O
systems O O O O
( O O O O
government O O O O
owned O O O O
, O O O O
but O O O O
operating O O O O
according O O O O
to O O O O
corporate O O O O
principles O O O O
and O O O O
with O O O O
private O O O O
- O O O O
sector O O O O
participation O O O O
) O O O O
and O O O O
financing O O O O
mechanisms O O O O
to O O O O
achieve O O O O
universal O O O O
coverage O O O O
, O O O O
there O O O O
are O O O O
key O O O O
lessons O O O O
for O O O O
health O O O O
reforms O O O O
and O O O O
decentralisation O O O O
. O O O O
    
New O O O O
challenges O O O O
have O O O O
emerged O O O O
with O O O O
rising O O O O
trade O O O O
in O O O O
health O O O O
services O O O O
, O O O O
migration O O O O
of O O O O
the O O O O
health O O O O
workforce O O O O
, O O O O
and O O O O
medical O O O O
tourism O O O O
. O O O O
    
Juxtaposed O O O O
between O O O O
the O O O O
emerging O O O O
giant O O O O
economies O O O O
of O O O O
China O O O O
and O O O O
India O O O O
, O O O O
countries O O O O
of O O O O
the O O O O
region O O O O
are O O O O
attempting O O O O
to O O O O
forge O O O O
a O O O O
common O O O O
regional O O O O
identity O O O O
, O O O O
despite O O O O
their O O O O
diversity O O O O
, O O O O
to O O O O
seek O O O O
mutually O O O O
acceptable O O O O
and O O O O
effective O O O O
solutions O O O O
to O O O O
key O O O O
regional O O O O
health O O O O
challenges O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
first O O O O
paper O O O O
in O O O O
the O O O O
Lancet O O O O
Series O O O O
on O O O O
health O O O O
in O O O O
southeast O O O O
Asia O O O O
, O O O O
we O O O O
present O O O O
an O O O O
overview O O O O
of O O O O
key O O O O
demographic O O O O
and O O O O
epidemiological O O O O
changes O O O O
in O O O O
the O O O O
region O O O O
, O O O O
explore O O O O
challenges O O O O
facing O O O O
health O O O O
systems O O O O
, O O O O
and O O O O
draw O O O O
attention O O O O
to O O O O
the O O O O
potential O O O O
for O O O O
regional O O O O
collaboration O O O O
in O O O O
health O O O O
. O O O O
    
Field O O O O
tests O O O O
of O O O O
interspecific O O O O
competition O O O O
in O O O O
ant O O O O
assemblages O O O O
: O O O O
revisiting O O O O
the O O O O
dominant O O O O
red O O O O
wood O O O O
ants O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
There O O O O
has O O O O
been O O O O
considerable O O O O
debate O O O O
on O O O O
the O O O O
importance O O O O
of O O O O
competition O O O O
in O O O O
ecological O O O O
communities O O O O
, O O O O
but O O O O
its O O O O
importance O O O O
in O O O O
structuring O O O O
ant O O O O
assemblages O O O O
has O O O O
often O O O O
been O O O O
uncritically O O O O
accepted O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
briefly O O O O
review O O O O
field O O O O
experiments O O O O
examining O O O O
competition O O O O
in O O O O
ant O O O O
assemblages O O O O
and O O O O
use O O O O
a O O O O
removal O O O O
experiment O O O O
to O O O O
test O O O O
the O O O O
effect O O O O
of O O O O
the O O O O
classical O O O O
territorial O O O O
dominant O O O O
ant O O O O
, O O O O
Formica B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aquilonia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Ants O O O O
of O O O O
this O O O O
species O O O O
group O O O O
are O O O O
thought O O O O
to O O O O
structure O O O O
communities O O O O
through O O O O
a O O O O
dominance O O O O
hierarchy O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
First O O O O
, O O O O
we O O O O
used O O O O
pitfall O O O O
traps O O O O
to O O O O
compare O O O O
the O O O O
abundance O O O O
of O O O O
other O O O O
ants O O O O
in O O O O
replicated O O O O
sites O O O O
with O O O O
low O O O O
and O O O O
high O O O O
densities O O O O
of O O O O
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
aquilonia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
differences O O O O
in O O O O
community O O O O
composition O O O O
, O O O O
in O O O O
particular O O O O
, O O O O
Camponotus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
herculeanus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
more O O O O
common O O O O
in O O O O
low O O O O
- O O O O
density O O O O
sites O O O O
, O O O O
in O O O O
accordance O O O O
with O O O O
predictions O O O O
. O O O O
    
Differences O O O O
in O O O O
ant O O O O
assemblages O O O O
were O O O O
not O O O O
owing O O O O
to O O O O
differences O O O O
in O O O O
measured O O O O
habitat O O O O
variables O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
removed O O O O
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
aquilonia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
from O O O O
a O O O O
set O O O O
of O O O O
high O O O O
- O O O O
density O O O O
sites O O O O
, O O O O
using O O O O
physical O O O O
and O O O O
chemical O O O O
methods O O O O
, O O O O
and O O O O
repeated O O O O
these O O O O
procedures O O O O
at O O O O
procedural O O O O
control O O O O
sites O O O O
. O O O O
    
One O O O O
year O O O O
after O O O O
removal O O O O
, O O O O
abundances O O O O
of O O O O
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
aquilonia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
at O O O O
removal O O O O
sites O O O O
were O O O O
similar O O O O
to O O O O
those O O O O
at O O O O
low O O O O
- O O O O
density O O O O
sites O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
composition O O O O
of O O O O
other O O O O
species O O O O
did O O O O
not O O O O
change O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
aquilonia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
removal O O O O
. O O O O
    
Replication O O O O
rates O O O O
were O O O O
identical O O O O
in O O O O
the O O O O
mensurative O O O O
and O O O O
experimental O O O O
components O O O O
of O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
so O O O O
this O O O O
is O O O O
unlikely O O O O
to O O O O
be O O O O
owing O O O O
to O O O O
the O O O O
analysis O O O O
being O O O O
insufficiently O O O O
powerful O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
suggest O O O O
three O O O O
possibilities O O O O
for O O O O
the O O O O
lack O O O O
of O O O O
difference O O O O
. O O O O
    
First O O O O
, O O O O
the O O O O
study O O O O
may O O O O
have O O O O
been O O O O
too O O O O
short O O O O
term O O O O
or O O O O
small O O O O
scale O O O O
to O O O O
detect O O O O
differences O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
previous O O O O
studies O O O O
have O O O O
shown O O O O
effects O O O O
on O O O O
smaller O O O O
spatial O O O O
- O O O O
and O O O O
temporal O O O O
- O O O O
scales O O O O
. O O O O
    
Second O O O O
, O O O O
priority O O O O
effects O O O O
may O O O O
be O O O O
important O O O O
in O O O O
the O O O O
successful O O O O
colonisation O O O O
by O O O O
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
aquilonia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Thirdly O O O O
, O O O O
boreal O O O O
ant O O O O
assemblages O O O O
may O O O O
be O O O O
too O O O O
depauperate O O O O
for O O O O
redundancy O O O O
in O O O O
ecological O O O O
roles O O O O
and O O O O
for O O O O
competition O O O O
to O O O O
play O O O O
an O O O O
important O O O O
structuring O O O O
role O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
thus O O O O
recommend O O O O
that O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
large O O O O
- O O O O
scale O O O O
experiments O O O O
be O O O O
considered O O O O
essential O O O O
if O O O O
we O O O O
are O O O O
to O O O O
distinguish O O O O
between O O O O
competing O O O O
hypotheses O O O O
in O O O O
community O O O O
ecology O O O O
. O O O O
    
Effective O O O O
management O O O O
in O O O O
clusters O O O O
of O O O O
pneumococcal B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
disease O O O O
: O O O O
a O O O O
systematic O O O O
review O O O O
. O O O O
    
Outbreaks O O O O
of O O O O
serious O O O O
pneumococcal B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
disease O O O O
can O O O O
occur O O O O
with O O O O
high O O O O
attack O O O O
rates O O O O
in O O O O
certain O O O O
settings O O O O
. O O O O
    
We O O O O
systematically O O O O
reviewed O O O O
studies O O O O
of O O O O
interventions O O O O
implemented O O O O
in O O O O
pneumococcal B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
clusters O O O O
and O O O O
those O O O O
reporting O O O O
the O O O O
effect O O O O
of O O O O
antibiotics O O O O
on O O O O
carriage O O O O
reduction O O O O
to O O O O
assess O O O O
the O O O O
effectiveness O O O O
of O O O O
interventions O O O O
. O O O O
    
Evidence O O O O
was O O O O
graded O O O O
according O O O O
to O O O O
the O O O O
Scottish O O O O
Intercollegiate O O O O
Guidelines O O O O
Network O O O O
system O O O O
. O O O O
    
Of O O O O
28 O O O O
identified O O O O
cluster O O O O
reports O O O O
, O O O O
one O O O O
showed O O O O
that O O O O
administration O O O O
of O O O O
antibiotics O O O O
to O O O O
close O O O O
contacts O O O O
reduced O O O O
risk O O O O
of O O O O
pneumococcal B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
disease O O O O
. O O O O
    
In O O O O
three O O O O
of O O O O
four O O O O
clusters O O O O
where O O O O
rifampicin O O O O
chemoprophylaxis O O O O
was O O O O
used O O O O
and O O O O
in O O O O
four O O O O
of O O O O
five O O O O
clusters O O O O
where O O O O
penicillin O O O O
was O O O O
used O O O O
no O O O O
further O O O O
cases O O O O
were O O O O
seen O O O O
after O O O O
intervention O O O O
. O O O O
    
In O O O O
clusters O O O O
where O O O O
pneumococcal B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
polysaccharide O O O O
vaccine O O O O
was O O O O
used O O O O
, O O O O
subsequent O O O O
cases O O O O
occurred O O O O
, O O O O
all O O O O
within O O O O
around O O O O
2 O O O O
weeks O O O O
of O O O O
vaccination O O O O
, O O O O
which O O O O
suggests O O O O
delayed O O O O
benefit O O O O
with O O O O
this O O O O
approach O O O O
( O O O O
evidence O O O O
grade O O O O
D O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Use O O O O
of O O O O
infection O O O O
control O O O O
measures O O O O
alone O O O O
was O O O O
reported O O O O
in O O O O
eight O O O O
clusters O O O O
, O O O O
with O O O O
no O O O O
further O O O O
cases O O O O
being O O O O
reported O O O O
in O O O O
seven O O O O
( O O O O
grade O O O O
D O O O O
) O O O O
. O O O O
    
From O O O O
21 O O O O
selected O O O O
carriage O O O O
studies O O O O
, O O O O
large O O O O
carriage O O O O
reductions O O O O
were O O O O
observed O O O O
consistently O O O O
with O O O O
use O O O O
of O O O O
penicillin O O O O
and O O O O
azithromycin O O O O
, O O O O
with O O O O
median O O O O
values O O O O
being O O O O
90 O O O O
% O O O O
and O O O O
73 O O O O
% O O O O
, O O O O
respectively O O O O
( O O O O
grade O O O O
C O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
findings O O O O
were O O O O
presented O O O O
to O O O O
a O O O O
working O O O O
group O O O O
for O O O O
pneumococcal B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cluster O O O O
guidelines O O O O
and O O O O
used O O O O
to O O O O
develop O O O O
key O O O O
recommendations O O O O
on O O O O
the O O O O
management O O O O
of O O O O
clusters O O O O
that O O O O
supported O O O O
prompt O O O O
use O O O O
of O O O O
amoxicillin O O O O
or O O O O
azithromycin O O O O
chemoprophylaxis O O O O
, O O O O
pneumococcal B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
vaccination O O O O
for O O O O
close O O O O
contacts O O O O
, O O O O
and O O O O
implementation O O O O
of O O O O
infection O O O O
control O O O O
measures O O O O
. O O O O
    
Urbanisation O O O O
and O O O O
infectious O O O O
diseases O O O O
in O O O O
a O O O O
globalised O O O O
world O O O O
. O O O O
    
The O O O O
world O O O O
is O O O O
becoming O O O O
urban O O O O
. O O O O
    
The O O O O
UN O O O O
predicts O O O O
that O O O O
the O O O O
world O O O O
' O O O O
s O O O O
urban O O O O
population O O O O
will O O O O
almost O O O O
double O O O O
from O O O O
3 O O O O
* O O O O
3 O O O O
billion O O O O
in O O O O
2007 O O O O
to O O O O
6 O O O O
* O O O O
3 O O O O
billion O O O O
in O O O O
2050 O O O O
. O O O O
    
Most O O O O
of O O O O
this O O O O
increase O O O O
will O O O O
be O O O O
in O O O O
developing O O O O
countries O O O O
. O O O O
    
Exponential O O O O
urban O O O O
growth O O O O
is O O O O
having O O O O
a O O O O
profound O O O O
effect O O O O
on O O O O
global O O O O
health O O O O
. O O O O
    
Because O O O O
of O O O O
international O O O O
travel O O O O
and O O O O
migration O O O O
, O O O O
cities O O O O
are O O O O
becoming O O O O
important O O O O
hubs O O O O
for O O O O
the O O O O
transmission O O O O
of O O O O
infectious O O O O
diseases O O O O
, O O O O
as O O O O
shown O O O O
by O O O O
recent O O O O
pandemics O O O O
. O O O O
    
Physicians O O O O
in O O O O
urban O O O O
environments O O O O
in O O O O
developing O O O O
and O O O O
developed O O O O
countries O O O O
need O O O O
to O O O O
be O O O O
aware O O O O
of O O O O
the O O O O
changes O O O O
in O O O O
infectious O O O O
diseases O O O O
associated O O O O
with O O O O
urbanisation O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
health O O O O
should O O O O
be O O O O
a O O O O
major O O O O
consideration O O O O
in O O O O
town O O O O
planning O O O O
to O O O O
ensure O O O O
urbanisation O O O O
works O O O O
to O O O O
reduce O O O O
the O O O O
burden O O O O
of O O O O
infectious O O O O
diseases O O O O
in O O O O
the O O O O
future O O O O
. O O O O
    
Emerging O O O O
opportunistic O O O O
yeast O O O O
infections O O O O
. O O O O
    
A O O O O
growing O O O O
population O O O O
of O O O O
immunosuppressed O O O O
patients O O O O
has O O O O
resulted O O O O
in O O O O
increasingly O O O O
frequent O O O O
diagnoses O O O O
of O O O O
invasive O O O O
fungal O O O O
infections O O O O
, O O O O
including O O O O
those O O O O
caused O O O O
by O O O O
unusual O O O O
yeasts O O O O
. O O O O
    
The O O O O
incidence O O O O
of O O O O
non O O O O
- O O O O
albicans O O O O
species O O O O
of O O O O
Candida O O O O
is O O O O
increasing O O O O
compared O O O O
with O O O O
that O O O O
of O O O O
Candida B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
several O O O O
species O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
Candida B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
glabrata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Candida B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
krusei O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
may O O O O
be O O O O
resistant O O O O
to O O O O
azole O O O O
antifungal O O O O
therapy O O O O
. O O O O
    
Trichosporon O O O O
species O O O O
are O O O O
the O O O O
second O O O O
most O O O O
common O O O O
cause O O O O
of O O O O
fungaemia O O O O
in O O O O
patients O O O O
with O O O O
haematological O O O O
malignant O O O O
disease O O O O
and O O O O
are O O O O
characterised O O O O
by O O O O
resistance O O O O
to O O O O
amphotericin O O O O
and O O O O
echinocandins O O O O
and O O O O
poor O O O O
prognosis O O O O
. O O O O
    
Rhodotorula O O O O
species O O O O
belong O O O O
to O O O O
the O O O O
family O O O O
Cryptococcaceae O O O O
, O O O O
and O O O O
are O O O O
a O O O O
cause O O O O
of O O O O
catheter O O O O
- O O O O
related O O O O
fungaemia O O O O
, O O O O
sepsis O O O O
, O O O O
and O O O O
invasive O O O O
disease O O O O
in O O O O
severely O O O O
immunosuppressed O O O O
patients O O O O
. O O O O
    
An O O O O
increasing O O O O
number O O O O
of O O O O
sporadic O O O O
cases O O O O
of O O O O
invasive O O O O
fungal O O O O
infections O O O O
by O O O O
non O O O O
- O O O O
neoformans O O O O
cryptococci O O O O
have O O O O
been O O O O
reported O O O O
in O O O O
immunocompromised O O O O
hosts O O O O
, O O O O
especially O O O O
for O O O O
patients O O O O
with O O O O
advanced O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infection O O O O
or O O O O
cancer O O O O
who O O O O
are O O O O
undergoing O O O O
transplant O O O O
. O O O O
    
Other O O O O
uncommon O O O O
yeasts O O O O
that O O O O
can O O O O
cause O O O O
invasive O O O O
disease O O O O
in O O O O
severely O O O O
immunosuppressed O O O O
patients O O O O
include O O O O
Geotrichum O O O O
, O O O O
Hansenula O O O O
, O O O O
Malassezia O O O O
, O O O O
and O O O O
Saccharomyces O O O O
. O O O O
    
Host O O O O
immune O O O O
status O O O O
is O O O O
a O O O O
crucial O O O O
determinant O O O O
of O O O O
the O O O O
type O O O O
of O O O O
invasive O O O O
fungal O O O O
infection O O O O
a O O O O
patient O O O O
is O O O O
at O O O O
risk O O O O
for O O O O
. O O O O
    
Diagnosis O O O O
can O O O O
be O O O O
challenging O O O O
and O O O O
relies O O O O
heavily O O O O
on O O O O
traditional O O O O
cultures O O O O
of O O O O
blood O O O O
and O O O O
other O O O O
sterile O O O O
sites O O O O
, O O O O
although O O O O
serum O O O O
( O O O O
1 O O O O
, O O O O
3 O O O O
) O O O O
- O O O O
Beta O O O O
- O O O O
D O O O O
- O O O O
glucan O O O O
testing O O O O
might O O O O
have O O O O
an O O O O
adjunctive O O O O
role O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
rare O O O O
yeasts O O O O
are O O O O
emerging O O O O
as O O O O
opportunistic O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pathogens O O O O
, O O O O
diagnosis O O O O
remains O O O O
challenging O O O O
and O O O O
treatment O O O O
suboptimal O O O O
. O O O O
    
Protist O O O O
- O O O O
like O O O O
inclusions O O O O
in O O O O
amber O O O O
, O O O O
as O O O O
evidenced O O O O
by O O O O
Charentes O O O O
amber O O O O
. O O O O
    
The O O O O
mid O O O O
- O O O O
Cretaceous O O O O
amber O O O O
of O O O O
France O O O O
contains O O O O
thousands O O O O
of O O O O
protist O O O O
- O O O O
like O O O O
inclusions O O O O
similar O O O O
in O O O O
shape O O O O
to O O O O
some O O O O
ciliates O O O O
, O O O O
flagellates O O O O
and O O O O
amoebae O O O O
. O O O O
    
The O O O O
sheer O O O O
abundance O O O O
of O O O O
these O O O O
inclusions O O O O
and O O O O
their O O O O
size O O O O
variation O O O O
within O O O O
a O O O O
single O O O O
amber O O O O
piece O O O O
are O O O O
not O O O O
concordant O O O O
with O O O O
true O O O O
fossil O O O O
protists O O O O
. O O O O
    
French O O O O
amber O O O O
is O O O O
coniferous O O O O
in O O O O
origin O O O O
, O O O O
which O O O O
generally O O O O
does O O O O
not O O O O
preserve O O O O
well O O O O
protists O O O O
without O O O O
cell O O O O
walls O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
it O O O O
would O O O O
be O O O O
surprising O O O O
if O O O O
French O O O O
Cretaceous O O O O
amber O O O O
had O O O O
preserved O O O O
millions O O O O
of O O O O
protists O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
present O O O O
a O O O O
survey O O O O
of O O O O
the O O O O
protist O O O O
- O O O O
like O O O O
inclusions O O O O
from O O O O
French O O O O
amber O O O O
and O O O O
attempt O O O O
to O O O O
elucidate O O O O
their O O O O
origins O O O O
. O O O O
    
Diverse O O O O
Cretaceous O O O O
ambers O O O O
( O O O O
from O O O O
Spain O O O O
, O O O O
Germany O O O O
and O O O O
Lebanon O O O O
) O O O O
, O O O O
also O O O O
derived O O O O
from O O O O
conifer O O O O
resins O O O O
, O O O O
contain O O O O
thousands O O O O
of O O O O
protist O O O O
- O O O O
like O O O O
inclusions O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
, O O O O
Tertiary O O O O
ambers O O O O
and O O O O
modern O O O O
resins O O O O
are O O O O
poor O O O O
in O O O O
protist O O O O
- O O O O
like O O O O
fossils O O O O
. O O O O
    
This O O O O
suggests O O O O
these O O O O
inclusions O O O O
originated O O O O
from O O O O
early O O O O
Cretaceous O O O O
plant O O O O
resins O O O O
, O O O O
probably O O O O
secreted O O O O
with O O O O
the O O O O
resin O O O O
by O O O O
trees O O O O
that O O O O
did O O O O
not O O O O
survive O O O O
after O O O O
the O O O O
Cretaceous O O O O
( O O O O
such O O O O
as O O O O
the O O O O
Cheirolepidiaceae O O O O
) O O O O
. O O O O
    
A O O O O
review O O O O
of O O O O
the O O O O
recent O O O O
literature O O O O
on O O O O
amber O O O O
microfossils O O O O
indicates O O O O
several O O O O
protist O O O O
- O O O O
like O O O O
inclusions O O O O
that O O O O
are O O O O
unlikely O O O O
to O O O O
have O O O O
a O O O O
biological O O O O
origin O O O O
have O O O O
already O O O O
been O O O O
described O O O O
as O O O O
real O O O O
fossil O O O O
protists O O O O
. O O O O
    
This O O O O
is O O O O
problematic O O O O
in O O O O
that O O O O
it O O O O
will O O O O
bias O O O O
our O O O O
understanding O O O O
of O O O O
protist O O O O
evolution O O O O
. O O O O
    
Management O O O O
of O O O O
uncommon O O O O
chemotherapy O O O O
- O O O O
induced O O O O
emergencies O O O O
. O O O O
    
Chemotherapy O O O O
can O O O O
induce O O O O
various O O O O
clinical O O O O
emergencies O O O O
. O O O O
    
Prompt O O O O
recognition O O O O
and O O O O
management O O O O
of O O O O
these O O O O
adverse O O O O
events O O O O
are O O O O
important O O O O
for O O O O
avoiding O O O O
further O O O O
morbidity O O O O
and O O O O
mortality O O O O
. O O O O
    
Some O O O O
events O O O O
such O O O O
as O O O O
hypersensitivity O O O O
and O O O O
extravasation O O O O
are O O O O
quite O O O O
common O O O O
, O O O O
whereas O O O O
emergencies O O O O
such O O O O
as O O O O
neutropenic O O O O
typhlitis O O O O
, O O O O
pancreatitis O O O O
, O O O O
and O O O O
acute O O O O
haemolysis O O O O
are O O O O
very O O O O
rare O O O O
. O O O O
    
Little O O O O
information O O O O
exists O O O O
on O O O O
the O O O O
management O O O O
of O O O O
rare O O O O
chemotherapy O O O O
- O O O O
induced O O O O
emergencies O O O O
that O O O O
affect O O O O
fewer O O O O
than O O O O
1 O O O O
% O O O O
of O O O O
patients O O O O
. O O O O
    
We O O O O
review O O O O
these O O O O
uncommon O O O O
chemotherapy O O O O
- O O O O
induced O O O O
life O O O O
- O O O O
threatening O O O O
emergencies O O O O
, O O O O
their O O O O
pathogenesis O O O O
and O O O O
management O O O O
, O O O O
and O O O O
recommendations O O O O
for O O O O
rechallenge O O O O
with O O O O
the O O O O
offending O O O O
chemotherapy O O O O
. O O O O
    
New O O O O
driver O O O O
mutations O O O O
in O O O O
non O O O O
- O O O O
small O O O O
- O O O O
cell O O O O
lung O O O O
cancer O O O O
. O O O O
    
Treatment O O O O
decisions O O O O
for O O O O
patients O O O O
with O O O O
lung O O O O
cancer O O O O
have O O O O
historically O O O O
been O O O O
based O O O O
on O O O O
tumour O O O O
histology O O O O
. O O O O
    
Some O O O O
understanding O O O O
of O O O O
the O O O O
molecular O O O O
composition O O O O
of O O O O
tumours O O O O
has O O O O
led O O O O
to O O O O
the O O O O
development O O O O
of O O O O
targeted O O O O
agents O O O O
, O O O O
for O O O O
which O O O O
initial O O O O
findings O O O O
are O O O O
promising O O O O
. O O O O
    
Clearer O O O O
understanding O O O O
of O O O O
mutations O O O O
in O O O O
relevant O O O O
genes O O O O
and O O O O
their O O O O
effects O O O O
on O O O O
cancer O O O O
cell O O O O
proliferation O O O O
and O O O O
survival O O O O
, O O O O
is O O O O
, O O O O
therefore O O O O
, O O O O
of O O O O
substantial O O O O
interest O O O O
. O O O O
    
We O O O O
review O O O O
current O O O O
knowledge O O O O
about O O O O
molecular O O O O
subsets O O O O
in O O O O
non O O O O
- O O O O
small O O O O
- O O O O
cell O O O O
lung O O O O
cancer O O O O
that O O O O
have O O O O
been O O O O
identified O O O O
as O O O O
potentially O O O O
having O O O O
clinical O O O O
relevance O O O O
to O O O O
targeted O O O O
therapies O O O O
. O O O O
    
Since O O O O
mutations O O O O
in O O O O
EGFR O O O O
and O O O O
KRAS O O O O
have O O O O
been O O O O
extensively O O O O
reviewed O O O O
elsewhere O O O O
, O O O O
here O O O O
, O O O O
we O O O O
discuss O O O O
subsets O O O O
defined O O O O
by O O O O
so O O O O
- O O O O
called O O O O
driver O O O O
mutations O O O O
in O O O O
ALK O O O O
, O O O O
HER2 O O O O
( O O O O
also O O O O
known O O O O
as O O O O
ERBB2 O O O O
) O O O O
, O O O O
BRAF O O O O
, O O O O
PIK3CA O O O O
, O O O O
AKT1 O O O O
, O O O O
MAP2K1 O O O O
, O O O O
and O O O O
MET O O O O
. O O O O
    
The O O O O
adoption O O O O
of O O O O
treatment O O O O
tailored O O O O
according O O O O
to O O O O
the O O O O
genetic O O O O
make O O O O
- O O O O
up O O O O
of O O O O
individual O O O O
tumours O O O O
would O O O O
involve O O O O
a O O O O
paradigm O O O O
shift O O O O
, O O O O
but O O O O
might O O O O
lead O O O O
to O O O O
substantial O O O O
therapeutic O O O O
improvements O O O O
. O O O O
    
Thermal O O O O
performance O O O O
curves O O O O
of O O O O
Paramecium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
caudatum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
: O O O O
a O O O O
model O O O O
selection O O O O
approach O O O O
. O O O O
    
The O O O O
ongoing O O O O
climate O O O O
change O O O O
has O O O O
motivated O O O O
numerous O O O O
studies O O O O
investigating O O O O
the O O O O
temperature O O O O
response O O O O
of O O O O
various O O O O
organisms O O O O
, O O O O
especially O O O O
that O O O O
of O O O O
ectotherms O O O O
. O O O O
    
To O O O O
correctly O O O O
describe O O O O
the O O O O
thermal O O O O
performance O O O O
of O O O O
these O O O O
organisms O O O O
, O O O O
functions O O O O
are O O O O
needed O O O O
which O O O O
sufficiently O O O O
fit O O O O
to O O O O
the O O O O
complete O O O O
optimum O O O O
curve O O O O
. O O O O
    
Surprisingly O O O O
, O O O O
model O O O O
- O O O O
comparisons O O O O
for O O O O
the O O O O
temperature O O O O
- O O O O
dependence O O O O
of O O O O
population O O O O
growth O O O O
rates O O O O
of O O O O
an O O O O
important O O O O
ectothermic O O O O
group O O O O
, O O O O
the O O O O
protozoa O O O O
, O O O O
are O O O O
still O O O O
missing O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
temperature O O O O
reaction O O O O
norms O O O O
of O O O O
natural O O O O
isolates O O O O
of O O O O
the O O O O
freshwater O O O O
protist O O O O
Paramecium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
caudatum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
were O O O O
investigated O O O O
, O O O O
considering O O O O
nearly O O O O
the O O O O
entire O O O O
temperature O O O O
range O O O O
. O O O O
    
These O O O O
reaction O O O O
norms O O O O
were O O O O
used O O O O
to O O O O
estimate O O O O
thermal O O O O
performance O O O O
curves O O O O
by O O O O
applying O O O O
a O O O O
set O O O O
of O O O O
commonly O O O O
used O O O O
model O O O O
functions O O O O
. O O O O
    
An O O O O
information O O O O
theory O O O O
approach O O O O
was O O O O
used O O O O
to O O O O
compare O O O O
models O O O O
and O O O O
to O O O O
identify O O O O
the O O O O
best O O O O
ones O O O O
for O O O O
describing O O O O
these O O O O
data O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
indicate O O O O
that O O O O
the O O O O
models O O O O
which O O O O
can O O O O
describe O O O O
negative O O O O
growth O O O O
at O O O O
the O O O O
high O O O O
- O O O O
and O O O O
low O O O O
- O O O O
temperature O O O O
branch O O O O
of O O O O
an O O O O
optimum O O O O
curve O O O O
are O O O O
preferable O O O O
. O O O O
    
This O O O O
is O O O O
a O O O O
prerequisite O O O O
for O O O O
accurately O O O O
calculating O O O O
the O O O O
critical O O O O
upper O O O O
and O O O O
lower O O O O
thermal O O O O
limits O O O O
. O O O O
    
While O O O O
we O O O O
detected O O O O
a O O O O
temperature O O O O
optimum O O O O
of O O O O
around O O O O
29 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
for O O O O
all O O O O
investigated O O O O
clonal O O O O
strains O O O O
, O O O O
the O O O O
critical O O O O
thermal O O O O
limits O O O O
were O O O O
considerably O O O O
different O O O O
between O O O O
individual O O O O
clones O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
the O O O O
tropical O O O O
clone O O O O
showed O O O O
the O O O O
narrowest O O O O
thermal O O O O
tolerance O O O O
, O O O O
with O O O O
a O O O O
shift O O O O
of O O O O
its O O O O
critical O O O O
thermal O O O O
limits O O O O
to O O O O
higher O O O O
temperatures O O O O
. O O O O
    
The O O O O
molecular O O O O
and O O O O
genetic O O O O
basis O O O O
of O O O O
conidial O O O O
pigmentation O O O O
in O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
niger O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
A O O O O
characteristic O O O O
hallmark O O O O
of O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
niger O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
the O O O O
formation O O O O
of O O O O
black O O O O
conidiospores O O O O
. O O O O
    
We O O O O
have O O O O
identified O O O O
four O O O O
loci O O O O
involved O O O O
in O O O O
spore O O O O
pigmentation O O O O
of O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
niger O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
by O O O O
using O O O O
a O O O O
combined O O O O
genomic O O O O
and O O O O
classical O O O O
complementation O O O O
approach O O O O
. O O O O
    
First O O O O
, O O O O
we O O O O
characterized O O O O
a O O O O
newly O O O O
isolated O O O O
color O O O O
mutant O O O O
, O O O O
colA O O O O
, O O O O
which O O O O
lacked O O O O
pigmentation O O O O
resulting O O O O
in O O O O
white O O O O
or O O O O
colorless O O O O
conidia O O O O
. O O O O
    
Pigmentation O O O O
of O O O O
the O O O O
colA O O O O
mutant O O O O
was O O O O
restored O O O O
by O O O O
a O O O O
gene O O O O
( O O O O
An12g03950 O O O O
) O O O O
which O O O O
encodes O O O O
a O O O O
putative O O O O
4 O O O O
' O O O O
phosphopantetheinyl O O O O
transferase O O O O
protein O O O O
( O O O O
PptA O O O O
) O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
' O O O O
Phosphopantetheinyl O O O O
transferase O O O O
activity O O O O
is O O O O
required O O O O
for O O O O
the O O O O
activation O O O O
of O O O O
Polyketide O O O O
Synthases O O O O
( O O O O
PKSs O O O O
) O O O O
and O O O O
/ O O O O
or O O O O
Non O O O O
- O O O O
Ribosomal O O O O
Peptide O O O O
Synthases O O O O
( O O O O
NRPSs O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
loci O O O O
whose O O O O
mutation O O O O
resulted O O O O
in O O O O
fawn O O O O
, O O O O
olive O O O O
, O O O O
and O O O O
brown O O O O
color O O O O
phenotypes O O O O
were O O O O
identified O O O O
by O O O O
complementation O O O O
. O O O O
    
The O O O O
fawn O O O O
phenotype O O O O
was O O O O
complemented O O O O
by O O O O
a O O O O
PKS O O O O
protein O O O O
( O O O O
FwnA O O O O
, O O O O
An09g05730 O O O O
) O O O O
, O O O O
the O O O O
ovlA O O O O
mutant O O O O
by O O O O
An14g05350 O O O O
( O O O O
OlvA O O O O
) O O O O
and O O O O
the O O O O
brnA O O O O
mutant O O O O
by O O O O
An14g05370 O O O O
( O O O O
BrnA O O O O
) O O O O
, O O O O
the O O O O
respective O O O O
homologs O O O O
of O O O O
alb1 O O O O
/ O O O O
pksP O O O O
, O O O O
ayg1 O O O O
and O O O O
abr1 O O O O
in O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Targeted O O O O
disruption O O O O
of O O O O
the O O O O
pptA O O O O
, O O O O
fwnA O O O O
, O O O O
olvA O O O O
and O O O O
brnA O O O O
genes O O O O
confirmed O O O O
the O O O O
complementation O O O O
results O O O O
. O O O O
    
Disruption O O O O
of O O O O
the O O O O
pptA O O O O
gene O O O O
abolished O O O O
synthesis O O O O
of O O O O
all O O O O
polyketides O O O O
and O O O O
non O O O O
- O O O O
ribosomal O O O O
peptides O O O O
, O O O O
while O O O O
the O O O O
naphtho O O O O
- O O O O
gamma O O O O
- O O O O
pyrone O O O O
subclass O O O O
of O O O O
polyketides O O O O
were O O O O
specifically O O O O
dependent O O O O
on O O O O
fwnA O O O O
, O O O O
and O O O O
funalenone O O O O
on O O O O
fwnA O O O O
, O O O O
olvA O O O O
and O O O O
brnA O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
secondary O O O O
metabolite O O O O
profiling O O O O
of O O O O
the O O O O
color O O O O
mutants O O O O
revealed O O O O
a O O O O
close O O O O
relationship O O O O
between O O O O
polyketide O O O O
synthesis O O O O
and O O O O
conidial O O O O
pigmentation O O O O
in O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
niger O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Identification O O O O
and O O O O
characterization O O O O
of O O O O
putative O O O O
osmosensors O O O O
, O O O O
HwSho1A O O O O
and O O O O
HwSho1B O O O O
, O O O O
from O O O O
the O O O O
extremely O O O O
halotolerant O O O O
black O O O O
yeast O O O O
Hortaea B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
werneckii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
In O O O O
Saccharomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cerevisiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
the O O O O
Sho1 O O O O
protein O O O O
is O O O O
one O O O O
of O O O O
two O O O O
potential O O O O
osmosensors O O O O
that O O O O
can O O O O
activate O O O O
the O O O O
kinase O O O O
cascade O O O O
of O O O O
the O O O O
HOG O O O O
pathway O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
increased O O O O
extracellular O O O O
osmolarity O O O O
. O O O O
    
Two O O O O
novel O O O O
SHO1 O O O O
- O O O O
like O O O O
genes O O O O
, O O O O
HwSHO1A O O O O
and O O O O
HwSHO1B O O O O
, O O O O
have O O O O
been O O O O
cloned O O O O
from O O O O
the O O O O
saltern O O O O
- O O O O
inhabiting O O O O
, O O O O
extremely O O O O
halotolerant O O O O
black O O O O
yeast O O O O
Hortaea B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
werneckii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
HwSho1 O O O O
protein O O O O
isoforms O O O O
are O O O O
93 O O O O
. O O O O
8 O O O O
% O O O O
identical O O O O
in O O O O
their O O O O
amino O O O O
- O O O O
acid O O O O
sequences O O O O
, O O O O
and O O O O
have O O O O
a O O O O
conserved O O O O
SH3 O O O O
domain O O O O
. O O O O
    
When O O O O
the O O O O
HwSHO1 O O O O
genes O O O O
were O O O O
transferred O O O O
into O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cerevisae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cells O O O O
lacking O O O O
the O O O O
SHO1 O O O O
gene O O O O
, O O O O
both O O O O
of O O O O
the O O O O
HwSho1 O O O O
isoforms O O O O
fully O O O O
complemented O O O O
the O O O O
function O O O O
of O O O O
the O O O O
native O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cerevisiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Sho1 O O O O
protein O O O O
. O O O O
    
Through O O O O
microscopic O O O O
and O O O O
biochemical O O O O
validation O O O O
, O O O O
we O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
in O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cerevisiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
both O O O O
of O O O O
the O O O O
HwSho1 O O O O
proteins O O O O
have O O O O
characteristic O O O O
subcellular O O O O
localizations O O O O
similar O O O O
to O O O O
the O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cerevisiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Sho1 O O O O
protein O O O O
, O O O O
and O O O O
they O O O O
can O O O O
both O O O O
activate O O O O
the O O O O
HOG O O O O
pathway O O O O
under O O O O
conditions O O O O
of O O O O
osmotic O O O O
stress O O O O
. O O O O
    
To O O O O
a O O O O
lower O O O O
extent O O O O
, O O O O
crosstalk O O O O
to O O O O
the O O O O
mating O O O O
pathway O O O O
expressing O O O O
HwSho1 O O O O
proteins O O O O
is O O O O
conserved O O O O
in O O O O
the O O O O
PBS2 O O O O
deleted O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cerevisiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O O O O
. O O O O
    
These O O O O
data O O O O
show O O O O
that O O O O
the O O O O
HwSho1 O O O O
proteins O O O O
from O O O O
H B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
werneckii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
are O O O O
true O O O O
functional O O O O
homologs O O O O
of O O O O
the O O O O
Sho1 O O O O
protein O O O O
of O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cerevisiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Polymorphism O O O O
of O O O O
Paramecium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pentaurelia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Ciliophora O O O O
, O O O O
Oligohymenophorea O O O O
) O O O O
strains O O O O
revealed O O O O
by O O O O
rDNA O O O O
and O O O O
mtDNA O O O O
sequences O O O O
. O O O O
    
Paramecium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pentaurelia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
one O O O O
of O O O O
15 O O O O
known O O O O
sibling O O O O
species O O O O
of O O O O
the O O O O
Paramecium O O O O
aurelia O O O O
complex O O O O
. O O O O
    
It O O O O
is O O O O
recognized O O O O
as O O O O
a O O O O
species O O O O
showing O O O O
no O O O O
intra O O O O
- O O O O
specific O O O O
differentiation O O O O
on O O O O
the O O O O
basis O O O O
of O O O O
molecular O O O O
fingerprint O O O O
analyses O O O O
, O O O O
whereas O O O O
the O O O O
majority O O O O
of O O O O
other O O O O
species O O O O
are O O O O
polymorphic O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
aimed O O O O
at O O O O
assessing O O O O
genetic O O O O
polymorphism O O O O
within O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pentaurelia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
including O O O O
new O O O O
strains O O O O
recently O O O O
found O O O O
in O O O O
Poland O O O O
( O O O O
originating O O O O
from O O O O
two O O O O
water O O O O
bodies O O O O
, O O O O
different O O O O
years O O O O
, O O O O
seasons O O O O
, O O O O
and O O O O
clones O O O O
of O O O O
one O O O O
strain O O O O
) O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
strains O O O O
collected O O O O
from O O O O
distant O O O O
habitats O O O O
( O O O O
USA O O O O
, O O O O
Europe O O O O
, O O O O
Asia O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
strains O O O O
representing O O O O
other O O O O
species O O O O
of O O O O
the O O O O
complex O O O O
. O O O O
    
We O O O O
compared O O O O
two O O O O
DNA O O O O
fragments O O O O
: O O O O
partial O O O O
sequences O O O O
( O O O O
349 O O O O
bp O O O O
) O O O O
of O O O O
the O O O O
LSU O O O O
rDNA O O O O
and O O O O
partial O O O O
sequences O O O O
( O O O O
618 O O O O
bp O O O O
) O O O O
of O O O O
cytochrome O O O O
B O O O O
gene O O O O
. O O O O
    
A O O O O
correlation O O O O
between O O O O
the O O O O
geographical O O O O
origin O O O O
of O O O O
the O O O O
strains O O O O
and O O O O
the O O O O
genetic O O O O
characteristics O O O O
of O O O O
their O O O O
genotypes O O O O
was O O O O
not O O O O
observed O O O O
. O O O O
    
Different O O O O
genotypes O O O O
were O O O O
found O O O O
in O O O O
Kraksigmaw O O O O
in O O O O
two O O O O
types O O O O
of O O O O
water O O O O
bodies O O O O
( O O O O
Opatkowice O O O O
- O O O O
natural O O O O
pond O O O O
; O O O O
Jordan O O O O
' O O O O
s O O O O
Park O O O O
- O O O O
artificial O O O O
pond O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Haplotype O O O O
diversity O O O O
within O O O O
a O O O O
single O O O O
water O O O O
body O O O O
was O O O O
not O O O O
recorded O O O O
. O O O O
    
Likewise O O O O
, O O O O
seasonal O O O O
haplotype O O O O
differences O O O O
between O O O O
the O O O O
strains O O O O
within O O O O
the O O O O
artificial O O O O
water O O O O
body O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
differences O O O O
between O O O O
clones O O O O
originating O O O O
from O O O O
one O O O O
strain O O O O
, O O O O
were O O O O
not O O O O
detected O O O O
. O O O O
    
The O O O O
clustering O O O O
of O O O O
some O O O O
strains O O O O
belonging O O O O
to O O O O
different O O O O
species O O O O
was O O O O
observed O O O O
in O O O O
the O O O O
phylogenies O O O O
. O O O O
    
Determinants O O O O
of O O O O
reproductive O O O O
success O O O O
in O O O O
dominant O O O O
pairs O O O O
of O O O O
clownfish O O O O
: O O O O
a O O O O
boosted O O O O
regression O O O O
tree O O O O
analysis O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Central O O O O
questions O O O O
of O O O O
behavioural O O O O
and O O O O
evolutionary O O O O
ecology O O O O
are O O O O
what O O O O
factors O O O O
influence O O O O
the O O O O
reproductive O O O O
success O O O O
of O O O O
dominant O O O O
breeders O O O O
and O O O O
subordinate O O O O
nonbreeders O O O O
within O O O O
animal O O O O
societies O O O O
? O O O O
    
A O O O O
complete O O O O
understanding O O O O
of O O O O
any O O O O
society O O O O
requires O O O O
that O O O O
these O O O O
questions O O O O
be O O O O
answered O O O O
for O O O O
all O O O O
individuals O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
clown O O O O
anemonefish O O O O
, O O O O
Amphiprion B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
percula O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
forms O O O O
simple O O O O
societies O O O O
that O O O O
live O O O O
in O O O O
close O O O O
association O O O O
with O O O O
sea O O O O
anemones O O O O
, O O O O
Heteractis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
magnifica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
use O O O O
data O O O O
from O O O O
a O O O O
well O O O O
- O O O O
studied O O O O
population O O O O
of O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
percula O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
to O O O O
determine O O O O
the O O O O
major O O O O
predictors O O O O
of O O O O
reproductive O O O O
success O O O O
of O O O O
dominant O O O O
pairs O O O O
in O O O O
this O O O O
species O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
analyse O O O O
the O O O O
effect O O O O
of O O O O
multiple O O O O
predictors O O O O
on O O O O
four O O O O
components O O O O
of O O O O
reproductive O O O O
success O O O O
, O O O O
using O O O O
a O O O O
relatively O O O O
new O O O O
technique O O O O
from O O O O
the O O O O
field O O O O
of O O O O
statistical O O O O
learning O O O O
: O O O O
boosted O O O O
regression O O O O
trees O O O O
( O O O O
BRTs O O O O
) O O O O
. O O O O
    
BRTs O O O O
have O O O O
the O O O O
potential O O O O
to O O O O
model O O O O
complex O O O O
relationships O O O O
in O O O O
ways O O O O
that O O O O
give O O O O
powerful O O O O
insight O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
show O O O O
that O O O O
the O O O O
reproductive O O O O
success O O O O
of O O O O
dominant O O O O
pairs O O O O
is O O O O
unrelated O O O O
to O O O O
the O O O O
presence O O O O
, O O O O
number O O O O
or O O O O
phenotype O O O O
of O O O O
nonbreeders O O O O
. O O O O
    
This O O O O
is O O O O
consistent O O O O
with O O O O
the O O O O
observation O O O O
that O O O O
nonbreeders O O O O
do O O O O
not O O O O
help O O O O
or O O O O
hinder O O O O
breeders O O O O
in O O O O
any O O O O
way O O O O
, O O O O
confirming O O O O
and O O O O
extending O O O O
the O O O O
results O O O O
of O O O O
a O O O O
previous O O O O
study O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Primarily O O O O
, O O O O
reproductive O O O O
success O O O O
is O O O O
negatively O O O O
related O O O O
to O O O O
male O O O O
growth O O O O
and O O O O
positively O O O O
related O O O O
to O O O O
breeding O O O O
experience O O O O
. O O O O
    
It O O O O
is O O O O
likely O O O O
that O O O O
these O O O O
effects O O O O
are O O O O
interrelated O O O O
because O O O O
males O O O O
that O O O O
grow O O O O
a O O O O
lot O O O O
have O O O O
little O O O O
breeding O O O O
experience O O O O
. O O O O
    
These O O O O
effects O O O O
are O O O O
indicative O O O O
of O O O O
a O O O O
trade O O O O
- O O O O
off O O O O
between O O O O
male O O O O
growth O O O O
and O O O O
parental O O O O
investment O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
Secondarily O O O O
, O O O O
reproductive O O O O
success O O O O
is O O O O
positively O O O O
related O O O O
to O O O O
female O O O O
growth O O O O
and O O O O
size O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
population O O O O
, O O O O
female O O O O
size O O O O
is O O O O
positively O O O O
related O O O O
to O O O O
group O O O O
size O O O O
and O O O O
anemone O O O O
size O O O O
, O O O O
also O O O O
. O O O O
    
These O O O O
positive O O O O
correlations O O O O
among O O O O
traits O O O O
likely O O O O
are O O O O
caused O O O O
by O O O O
variation O O O O
in O O O O
site O O O O
quality O O O O
and O O O O
are O O O O
suggestive O O O O
of O O O O
a O O O O
silver O O O O
- O O O O
spoon O O O O
effect O O O O
. O O O O
    
7 O O O O
. O O O O
    
Noteworthily O O O O
, O O O O
whereas O O O O
reproductive O O O O
success O O O O
is O O O O
positively O O O O
related O O O O
to O O O O
female O O O O
size O O O O
, O O O O
it O O O O
is O O O O
unrelated O O O O
to O O O O
male O O O O
size O O O O
. O O O O
    
This O O O O
observation O O O O
provides O O O O
support O O O O
for O O O O
the O O O O
size O O O O
advantage O O O O
hypothesis O O O O
for O O O O
sex O O O O
change O O O O
: O O O O
both O O O O
individuals O O O O
maximize O O O O
their O O O O
reproductive O O O O
success O O O O
when O O O O
the O O O O
larger O O O O
individual O O O O
adopts O O O O
the O O O O
female O O O O
tactic O O O O
. O O O O
    
8 O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
provides O O O O
the O O O O
most O O O O
complete O O O O
picture O O O O
to O O O O
date O O O O
of O O O O
the O O O O
factors O O O O
that O O O O
predict O O O O
the O O O O
reproductive O O O O
success O O O O
of O O O O
dominant O O O O
pairs O O O O
of O O O O
clown O O O O
anemonefish O O O O
and O O O O
illustrates O O O O
the O O O O
utility O O O O
of O O O O
BRTs O O O O
for O O O O
analysis O O O O
of O O O O
complex O O O O
behavioural O O O O
and O O O O
evolutionary O O O O
ecology O O O O
data O O O O
. O O O O
    
Novel O O O O
cultured O O O O
protists O O O O
identify O O O O
deep O O O O
- O O O O
branching O O O O
environmental O O O O
DNA O O O O
clades O O O O
of O O O O
cercozoa O O O O
: O O O O
New O O O O
Genera O O O O
Tremula O O O O
, O O O O
Micrometopion O O O O
, O O O O
Minimassisteria O O O O
, O O O O
Nudifila O O O O
, O O O O
Peregrinia O O O O
. O O O O
    
We O O O O
describe O O O O
three O O O O
new O O O O
orders O O O O
of O O O O
filosan O O O O
Cercozoa O O O O
, O O O O
five O O O O
new O O O O
deep O O O O
- O O O O
branching O O O O
genera O O O O
, O O O O
eight O O O O
new O O O O
species O O O O
of O O O O
Thaumatomonas O O O O
, O O O O
Reckertia O O O O
, O O O O
Spongomonas O O O O
, O O O O
Rhogostoma O O O O
, O O O O
Agitata O O O O
, O O O O
Neoheteromita O O O O
and O O O O
Paracercomonas O O O O
, O O O O
sequence O O O O
their O O O O
18S O O O O
rDNA O O O O
, O O O O
and O O O O
construct O O O O
18S O O O O
rDNA O O O O
trees O O O O
for O O O O
148 O O O O
Cercozoa O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
phylogeny O O O O
indicates O O O O
that O O O O
Filosa O O O O
were O O O O
ancestrally O O O O
gliding O O O O
flagellates O O O O
; O O O O
non O O O O
- O O O O
flagellate O O O O
filose O O O O
amoebae O O O O
evolved O O O O
from O O O O
them O O O O
five O O O O
times O O O O
independently O O O O
. O O O O
    
The O O O O
new O O O O
genera O O O O
are O O O O
more O O O O
closely O O O O
related O O O O
to O O O O
environmental O O O O
DNA O O O O
sequences O O O O
than O O O O
cultured O O O O
organisms O O O O
. O O O O
    
Tremula B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
longifila O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
a O O O O
zooflagellate O O O O
glider O O O O
on O O O O
both O O O O
flagella O O O O
( O O O O
unlike O O O O
other O O O O
Cercozoa O O O O
) O O O O
, O O O O
is O O O O
the O O O O
most O O O O
divergent O O O O
filosan O O O O
( O O O O
Tremulida O O O O
ord O O O O
. O O O O
n O O O O
. O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Micrometopion B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nutans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
a O O O O
eukaryote O O O O
- O O O O
eating O O O O
gliding O O O O
zooflagellate O O O O
like O O O O
Metopion O O O O
and O O O O
Metromonas O O O O
. O O O O
    
Minimassisteria B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
diva O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
a O O O O
widespread O O O O
trimorphic O O O O
marine O O O O
amoeboflagellate O O O O
granofilosan O O O O
. O O O O
    
Peregrinia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
clavideferens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
a O O O O
non O O O O
- O O O O
testate O O O O
, O O O O
scale O O O O
- O O O O
bearing O O O O
, O O O O
filose O O O O
amoeba O O O O
, O O O O
branches O O O O
deeply O O O O
in O O O O
Thaumatomonadida O O O O
, O O O O
which O O O O
are O O O O
probably O O O O
sisters O O O O
to O O O O
Spongomonadida O O O O
. O O O O
    
Nudifila B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
producta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
a O O O O
filose O O O O
amoeboflagellate O O O O
related O O O O
to O O O O
Clautriavia O O O O
and O O O O
Marimonadida O O O O
( O O O O
ord O O O O
. O O O O
n O O O O
. O O O O
, O O O O
e O O O O
. O O O O
g O O O O
. O O O O
Pseudopirsonia O O O O
, O O O O
Auranticordis O O O O
) O O O O
. O O O O
    
We O O O O
substantially O O O O
revise O O O O
Imbricatea O O O O
, O O O O
now O O O O
including O O O O
Spongomonadida O O O O
, O O O O
and O O O O
Thecofilosea O O O O
to O O O O
include O O O O
Phaeodaria O O O O
. O O O O
    
Thecofilosea O O O O
and O O O O
Imbricatea O O O O
and O O O O
Thecofilosea O O O O
are O O O O
sisters O O O O
, O O O O
both O O O O
arguably O O O O
ancestrally O O O O
rigid O O O O
gliding O O O O
flagellates O O O O
with O O O O
ventral O O O O
pseudopod O O O O
- O O O O
emitting O O O O
grooves O O O O
. O O O O
    
Scale O O O O
- O O O O
free O O O O
Ovulinata B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
parva O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
sister O O O O
to O O O O
Paulinella O O O O
, O O O O
so O O O O
imbricate O O O O
silica O O O O
scales O O O O
can O O O O
be O O O O
lost O O O O
. O O O O
    
Internal O O O O
hollow O O O O
silica O O O O
skeletons O O O O
evolved O O O O
twice O O O O
in O O O O
Thecofilosea O O O O
( O O O O
Ebriida O O O O
, O O O O
Phaeodaria O O O O
) O O O O
or O O O O
were O O O O
multiply O O O O
lost O O O O
. O O O O
    
Protaspa O O O O
replaces O O O O
preoccupied O O O O
' O O O O
Protaspis O O O O
' O O O O
. O O O O
    
Amyotrophic O O O O
lateral O O O O
sclerosis O O O O
. O O O O
    
Amyotrophic O O O O
lateral O O O O
sclerosis O O O O
( O O O O
ALS O O O O
) O O O O
is O O O O
an O O O O
idiopathic O O O O
, O O O O
fatal O O O O
neurodegenerative O O O O
disease O O O O
of O O O O
the O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
motor O O O O
system O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
Seminar O O O O
, O O O O
we O O O O
summarise O O O O
current O O O O
concepts O O O O
about O O O O
the O O O O
origin O O O O
of O O O O
the O O O O
disease O O O O
, O O O O
what O O O O
predisposes O O O O
patients O O O O
to O O O O
develop O O O O
the O O O O
disorder O O O O
, O O O O
and O O O O
discuss O O O O
why O O O O
all O O O O
cases O O O O
of O O O O
ALS O O O O
are O O O O
not O O O O
the O O O O
same O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
150 O O O O
years O O O O
since O O O O
Charcot O O O O
originally O O O O
described O O O O
ALS O O O O
, O O O O
painfully O O O O
slow O O O O
progress O O O O
has O O O O
been O O O O
made O O O O
towards O O O O
answering O O O O
these O O O O
questions O O O O
. O O O O
    
We O O O O
focus O O O O
on O O O O
what O O O O
is O O O O
known O O O O
about O O O O
ALS O O O O
and O O O O
where O O O O
research O O O O
is O O O O
heading O O O O
- O O O O
from O O O O
the O O O O
small O O O O
steps O O O O
of O O O O
extending O O O O
longevity O O O O
, O O O O
improving O O O O
therapies O O O O
, O O O O
undertaking O O O O
clinical O O O O
trials O O O O
, O O O O
and O O O O
compiling O O O O
population O O O O
registries O O O O
to O O O O
the O O O O
overarching O O O O
goals O O O O
of O O O O
establishing O O O O
the O O O O
measures O O O O
that O O O O
guard O O O O
against O O O O
onset O O O O
and O O O O
finding O O O O
the O O O O
triggers O O O O
for O O O O
this O O O O
neurodegenerative O O O O
disorder O O O O
. O O O O
    
Tyrosine O O O O
phosphorylation O O O O
of O O O O
actin O O O O
during O O O O
microcyst O O O O
formation O O O O
and O O O O
germination O O O O
in O O O O
Polysphondylium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pallidum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
High O O O O
osmolarity O O O O
causes O O O O
amoebae O O O O
of O O O O
the O O O O
cellular O O O O
slime O O O O
mould O O O O
Polysphondylium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pallidum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
to O O O O
individually O O O O
encyst O O O O
, O O O O
forming O O O O
microcysts O O O O
. O O O O
    
During O O O O
microcyst O O O O
differentiation O O O O
, O O O O
actin O O O O
is O O O O
tyrosine O O O O
phosphorylated O O O O
. O O O O
    
Tyrosine O O O O
phosphorylation O O O O
of O O O O
actin O O O O
is O O O O
independent O O O O
of O O O O
encystment O O O O
conditions O O O O
and O O O O
occurs O O O O
during O O O O
the O O O O
final O O O O
stages O O O O
of O O O O
microcyst O O O O
formation O O O O
. O O O O
    
During O O O O
microcyst O O O O
germination O O O O
, O O O O
actin O O O O
undergoes O O O O
dephosphorylation O O O O
prior O O O O
to O O O O
amoebal O O O O
emergence O O O O
. O O O O
    
Renewed O O O O
phosphorylation O O O O
of O O O O
actin O O O O
in O O O O
germinating O O O O
microcysts O O O O
can O O O O
be O O O O
triggered O O O O
by O O O O
increasing O O O O
the O O O O
osmolarity O O O O
of O O O O
the O O O O
medium O O O O
which O O O O
inhibits O O O O
emergence O O O O
. O O O O
    
Immunofluorescence O O O O
reveals O O O O
that O O O O
actin O O O O
is O O O O
dispersed O O O O
throughout O O O O
the O O O O
cytoplasm O O O O
in O O O O
dormant O O O O
microcysts O O O O
. O O O O
    
Following O O O O
the O O O O
onset O O O O
of O O O O
germination O O O O
, O O O O
actin O O O O
is O O O O
observed O O O O
around O O O O
vesicles O O O O
where O O O O
it O O O O
co O O O O
- O O O O
localizes O O O O
with O O O O
phosphotyrosine O O O O
. O O O O
    
Prior O O O O
to O O O O
emergence O O O O
, O O O O
actin O O O O
localizes O O O O
to O O O O
patches O O O O
near O O O O
the O O O O
cell O O O O
surface O O O O
. O O O O
    
Increasing O O O O
osmolarity O O O O
disrupts O O O O
this O O O O
localization O O O O
and O O O O
causes O O O O
actin O O O O
to O O O O
redistribute O O O O
throughout O O O O
the O O O O
cytoplasm O O O O
, O O O O
a O O O O
situation O O O O
similar O O O O
to O O O O
that O O O O
observed O O O O
in O O O O
dormant O O O O
microcysts O O O O
. O O O O
    
The O O O O
tyrosine O O O O
phosphorylation O O O O
state O O O O
of O O O O
actin O O O O
does O O O O
not O O O O
appear O O O O
to O O O O
influence O O O O
the O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
viability O O O O
of O O O O
dormant O O O O
microcysts O O O O
. O O O O
    
Together O O O O
, O O O O
these O O O O
results O O O O
indicate O O O O
an O O O O
association O O O O
between O O O O
actin O O O O
tyrosine O O O O
phosphorylation O O O O
, O O O O
organization O O O O
of O O O O
the O O O O
actin O O O O
cytoskeleton O O O O
, O O O O
and O O O O
microcyst O O O O
dormancy O O O O
. O O O O
    
Mechanisms O O O O
of O O O O
unisexual O O O O
mating O O O O
in O O O O
Cryptococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
neoformans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Sex O O O O
serves O O O O
a O O O O
pivotal O O O O
role O O O O
in O O O O
genetic O O O O
exchange O O O O
and O O O O
it O O O O
contributes O O O O
to O O O O
the O O O O
fitness O O O O
and O O O O
genetic O O O O
diversity O O O O
for O O O O
eukaryotic O O O O
populations O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
the O O O O
importance O O O O
of O O O O
the O O O O
canonical O O O O
bisexual O O O O
mating O O O O
has O O O O
been O O O O
widely O O O O
accepted O O O O
, O O O O
the O O O O
significance O O O O
of O O O O
the O O O O
evolution O O O O
and O O O O
maintenance O O O O
of O O O O
unisexual O O O O
mating O O O O
observed O O O O
in O O O O
some O O O O
eukaryotes O O O O
is O O O O
unclear O O O O
. O O O O
    
The O O O O
recent O O O O
discovery O O O O
of O O O O
same O O O O
- O O O O
sex O O O O
mating O O O O
in O O O O
the O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fungal O O O O
pathogen O O O O
Cryptococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
neoformans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
the O O O O
revelation O O O O
of O O O O
its O O O O
impact O O O O
on O O O O
the O O O O
Cryptococcus O O O O
global O O O O
population O O O O
structure O O O O
provide O O O O
a O O O O
platform O O O O
to O O O O
elucidate O O O O
the O O O O
molecular O O O O
mechanisms O O O O
and O O O O
significance O O O O
of O O O O
unisexual O O O O
mating O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
review O O O O
the O O O O
evidence O O O O
of O O O O
unisexual O O O O
mating O O O O
in O O O O
Cryptococcus O O O O
and O O O O
provide O O O O
some O O O O
perspective O O O O
on O O O O
the O O O O
biological O O O O
significance O O O O
of O O O O
this O O O O
life O O O O
style O O O O
on O O O O
the O O O O
survival O O O O
of O O O O
this O O O O
important O O O O
fungal O O O O
pathogen O O O O
in O O O O
the O O O O
environment O O O O
and O O O O
in O O O O
animal O O O O
hosts O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
summarize O O O O
our O O O O
current O O O O
understanding O O O O
of O O O O
the O O O O
molecular O O O O
mechanisms O O O O
governing O O O O
this O O O O
unconventional O O O O
mode O O O O
of O O O O
reproduction O O O O
. O O O O
    
Patchy O O O O
bed O O O O
disturbance O O O O
and O O O O
fish O O O O
predation O O O O
independently O O O O
influence O O O O
the O O O O
distribution O O O O
of O O O O
stream O O O O
invertebrates O O O O
and O O O O
algae O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
identification O O O O
of O O O O
factors O O O O
determining O O O O
the O O O O
patchy O O O O
distribution O O O O
of O O O O
organisms O O O O
in O O O O
space O O O O
and O O O O
time O O O O
is O O O O
a O O O O
central O O O O
concern O O O O
of O O O O
ecology O O O O
. O O O O
    
Predation O O O O
and O O O O
abiotic O O O O
disturbance O O O O
are O O O O
both O O O O
well O O O O
- O O O O
known O O O O
drivers O O O O
of O O O O
this O O O O
patchiness O O O O
, O O O O
but O O O O
their O O O O
interplay O O O O
is O O O O
still O O O O
poorly O O O O
understood O O O O
, O O O O
especially O O O O
for O O O O
communities O O O O
dominated O O O O
by O O O O
mobile O O O O
organisms O O O O
in O O O O
frequently O O O O
disturbed O O O O
ecosystems O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
investigated O O O O
the O O O O
separate O O O O
and O O O O
interactive O O O O
influences O O O O
of O O O O
bed O O O O
disturbance O O O O
by O O O O
floods O O O O
and O O O O
predation O O O O
by O O O O
fish O O O O
on O O O O
the O O O O
benthic O O O O
community O O O O
in O O O O
a O O O O
flood O O O O
- O O O O
prone O O O O
stream O O O O
. O O O O
    
Electric O O O O
fields O O O O
excluded O O O O
fish O O O O
predators O O O O
from O O O O
half O O O O
of O O O O
48 O O O O
stream O O O O
bed O O O O
patches O O O O
( O O O O
area O O O O
0 O O O O
* O O O O
49 O O O O
m O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
) O O O O
with O O O O
contrasting O O O O
disturbance O O O O
treatments O O O O
. O O O O
    
Three O O O O
types O O O O
of O O O O
bed O O O O
disturbance O O O O
were O O O O
created O O O O
by O O O O
either O O O O
scouring O O O O
or O O O O
filling O O O O
patches O O O O
to O O O O
a O O O O
depth O O O O
of O O O O
15 O O O O
- O O O O
20 O O O O
cm O O O O
or O O O O
by O O O O
leaving O O O O
the O O O O
patches O O O O
undisturbed O O O O
, O O O O
thus O O O O
mimicking O O O O
the O O O O
mosaic O O O O
of O O O O
scour O O O O
and O O O O
fill O O O O
caused O O O O
by O O O O
a O O O O
moderate O O O O
flood O O O O
. O O O O
    
Benthic O O O O
invertebrates O O O O
and O O O O
algae O O O O
were O O O O
sampled O O O O
repeatedly O O O O
until O O O O
57 O O O O
days O O O O
after O O O O
the O O O O
disturbance O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Disturbance O O O O
influenced O O O O
all O O O O
ten O O O O
investigated O O O O
biological O O O O
response O O O O
variables O O O O
, O O O O
whereas O O O O
predation O O O O
affected O O O O
four O O O O
variables O O O O
. O O O O
    
Averaged O O O O
across O O O O
time O O O O
, O O O O
invertebrate O O O O
taxon O O O O
richness O O O O
and O O O O
total O O O O
abundance O O O O
were O O O O
highest O O O O
in O O O O
stable O O O O
patches O O O O
. O O O O
    
Algal O O O O
biomass O O O O
and O O O O
densities O O O O
of O O O O
five O O O O
of O O O O
the O O O O
seven O O O O
most O O O O
common O O O O
invertebrate O O O O
taxa O O O O
( O O O O
most O O O O
of O O O O
which O O O O
were O O O O
highly O O O O
mobile O O O O
) O O O O
were O O O O
higher O O O O
in O O O O
fill O O O O
than O O O O
in O O O O
scour O O O O
patches O O O O
, O O O O
whereas O O O O
two O O O O
taxa O O O O
were O O O O
more O O O O
abundant O O O O
in O O O O
scour O O O O
and O O O O
stable O O O O
than O O O O
in O O O O
fill O O O O
patches O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
two O O O O
common O O O O
invertebrate O O O O
grazers O O O O
were O O O O
more O O O O
abundant O O O O
and O O O O
algal O O O O
biomass O O O O
tended O O O O
to O O O O
be O O O O
reduced O O O O
in O O O O
fish O O O O
exclusion O O O O
patches O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
a O O O O
patch O O O O
- O O O O
scale O O O O
trophic O O O O
cascade O O O O
from O O O O
fish O O O O
to O O O O
algae O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
highlight O O O O
the O O O O
importance O O O O
of O O O O
patchy O O O O
physical O O O O
disturbance O O O O
for O O O O
the O O O O
microdistribution O O O O
of O O O O
mobile O O O O
stream O O O O
organisms O O O O
and O O O O
indicate O O O O
a O O O O
notable O O O O
, O O O O
but O O O O
less O O O O
prevalent O O O O
, O O O O
influence O O O O
of O O O O
fish O O O O
predation O O O O
at O O O O
the O O O O
patch O O O O
scale O O O O
in O O O O
this O O O O
frequently O O O O
disturbed O O O O
environment O O O O
. O O O O
    
Disturbance O O O O
and O O O O
predation O O O O
treatments O O O O
interacted O O O O
only O O O O
once O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
the O O O O
observed O O O O
predation O O O O
effects O O O O
were O O O O
largely O O O O
independent O O O O
of O O O O
local O O O O
bed O O O O
disturbance O O O O
patterns O O O O
. O O O O
    
Contrasting O O O O
cascade O O O O
effects O O O O
of O O O O
carnivores O O O O
on O O O O
plant O O O O
fitness O O O O
: O O O O
a O O O O
meta O O O O
- O O O O
analysis O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
carnivores O O O O
indirectly O O O O
improve O O O O
plant O O O O
fitness O O O O
by O O O O
decreasing O O O O
herbivory O O O O
, O O O O
they O O O O
may O O O O
also O O O O
decrease O O O O
plant O O O O
reproduction O O O O
by O O O O
disrupting O O O O
plant O O O O
- O O O O
pollinator O O O O
mutualism O O O O
. O O O O
    
The O O O O
overall O O O O
magnitude O O O O
of O O O O
the O O O O
resulting O O O O
net O O O O
effect O O O O
of O O O O
carnivores O O O O
on O O O O
plant O O O O
fitness O O O O
and O O O O
the O O O O
factors O O O O
responsible O O O O
for O O O O
the O O O O
variations O O O O
in O O O O
strength O O O O
and O O O O
direction O O O O
of O O O O
this O O O O
effect O O O O
have O O O O
not O O O O
been O O O O
explored O O O O
quantitatively O O O O
to O O O O
date O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
performed O O O O
a O O O O
meta O O O O
- O O O O
analysis O O O O
of O O O O
67 O O O O
studies O O O O
containing O O O O
163 O O O O
estimates O O O O
of O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
carnivores O O O O
on O O O O
plant O O O O
fitness O O O O
and O O O O
examined O O O O
the O O O O
relative O O O O
importance O O O O
of O O O O
several O O O O
potential O O O O
sources O O O O
of O O O O
variation O O O O
in O O O O
carnivore O O O O
effects O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Carnivores O O O O
significantly O O O O
increased O O O O
plant O O O O
fitness O O O O
via O O O O
suppression O O O O
of O O O O
herbivores O O O O
and O O O O
decreased O O O O
fitness O O O O
by O O O O
consuming O O O O
pollinators O O O O
. O O O O
    
The O O O O
overall O O O O
net O O O O
effect O O O O
of O O O O
carnivores O O O O
on O O O O
plant O O O O
fitness O O O O
was O O O O
positive O O O O
( O O O O
32 O O O O
% O O O O
increase O O O O
) O O O O
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
effects O O O O
via O O O O
herbivores O O O O
were O O O O
stronger O O O O
than O O O O
effects O O O O
via O O O O
pollinators O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Parasitoids O O O O
had O O O O
stronger O O O O
positive O O O O
effect O O O O
on O O O O
plant O O O O
fitness O O O O
than O O O O
predators O O O O
. O O O O
    
Active O O O O
hunters O O O O
increased O O O O
plant O O O O
fitness O O O O
, O O O O
whereas O O O O
stationary O O O O
predators O O O O
had O O O O
no O O O O
significant O O O O
effect O O O O
, O O O O
presumably O O O O
because O O O O
they O O O O
were O O O O
more O O O O
prone O O O O
to O O O O
disrupt O O O O
plant O O O O
- O O O O
pollinator O O O O
mutualism O O O O
. O O O O
    
Carnivores O O O O
with O O O O
broader O O O O
habitat O O O O
domain O O O O
had O O O O
negative O O O O
effects O O O O
on O O O O
plant O O O O
fitness O O O O
, O O O O
whereas O O O O
those O O O O
with O O O O
narrow O O O O
habitat O O O O
domain O O O O
had O O O O
positive O O O O
effects O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Predator O O O O
effects O O O O
were O O O O
positive O O O O
for O O O O
plants O O O O
which O O O O
offered O O O O
rewards O O O O
( O O O O
e O O O O
. O O O O
g O O O O
. O O O O
extrafloral O O O O
nectaries O O O O
) O O O O
and O O O O
negative O O O O
for O O O O
plants O O O O
which O O O O
lacked O O O O
any O O O O
attractors O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
adds O O O O
new O O O O
knowledge O O O O
on O O O O
the O O O O
factors O O O O
that O O O O
determine O O O O
the O O O O
strength O O O O
of O O O O
terrestrial O O O O
trophic O O O O
cascades O O O O
and O O O O
highlights O O O O
the O O O O
importance O O O O
of O O O O
considering O O O O
simultaneous O O O O
contrasting O O O O
interactions O O O O
in O O O O
the O O O O
same O O O O
study O O O O
system O O O O
. O O O O
    
Shrinking O O O O
by O O O O
numbers O O O O
: O O O O
landscape O O O O
context O O O O
affects O O O O
the O O O O
species O O O O
composition O O O O
but O O O O
not O O O O
the O O O O
quantitative O O O O
structure O O O O
of O O O O
local O O O O
food O O O O
webs O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
With O O O O
habitat O O O O
fragmentation O O O O
spreading O O O O
around O O O O
the O O O O
world O O O O
, O O O O
there O O O O
is O O O O
a O O O O
pressing O O O O
need O O O O
to O O O O
understand O O O O
its O O O O
impacts O O O O
on O O O O
local O O O O
food O O O O
webs O O O O
. O O O O
    
To O O O O
date O O O O
, O O O O
few O O O O
studies O O O O
have O O O O
examined O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
landscape O O O O
context O O O O
on O O O O
multiple O O O O
local O O O O
communities O O O O
in O O O O
a O O O O
quantitative O O O O
, O O O O
spatially O O O O
realistic O O O O
setting O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
To O O O O
examine O O O O
how O O O O
the O O O O
isolation O O O O
of O O O O
a O O O O
food O O O O
web O O O O
affects O O O O
its O O O O
structure O O O O
, O O O O
we O O O O
construct O O O O
local O O O O
food O O O O
webs O O O O
of O O O O
specialist O O O O
herbivores O O O O
and O O O O
their O O O O
natural O O O O
enemies O O O O
on O O O O
82 O O O O
individual O O O O
oaks B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
Quercus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
robur O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
growing O O O O
in O O O O
different O O O O
landscape O O O O
contexts O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Across O O O O
this O O O O
set O O O O
of O O O O
webs O O O O
, O O O O
we O O O O
find O O O O
that O O O O
communities O O O O
in O O O O
isolated O O O O
habitat O O O O
patches O O O O
not O O O O
only O O O O
contained O O O O
fewer O O O O
species O O O O
than O O O O
did O O O O
well O O O O
- O O O O
connected O O O O
ones O O O O
, O O O O
but O O O O
also O O O O
differed O O O O
in O O O O
species O O O O
composition O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Surprisingly O O O O
, O O O O
the O O O O
effects O O O O
observed O O O O
in O O O O
terms O O O O
of O O O O
species O O O O
composition O O O O
were O O O O
not O O O O
reflected O O O O
in O O O O
the O O O O
quantitative O O O O
interaction O O O O
structure O O O O
of O O O O
local O O O O
food O O O O
webs O O O O
: O O O O
landscape O O O O
context O O O O
had O O O O
no O O O O
detectable O O O O
effect O O O O
on O O O O
either O O O O
the O O O O
interaction O O O O
evenness O O O O
, O O O O
linkage O O O O
density O O O O
, O O O O
connectance O O O O
, O O O O
generality O O O O
or O O O O
vulnerability O O O O
of O O O O
local O O O O
webs O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
conclude O O O O
that O O O O
the O O O O
quantitative O O O O
structure O O O O
of O O O O
food O O O O
webs O O O O
may O O O O
be O O O O
stable O O O O
in O O O O
the O O O O
face O O O O
of O O O O
habitat O O O O
fragmentation O O O O
, O O O O
despite O O O O
clear O O O O
- O O O O
cut O O O O
impacts O O O O
on O O O O
individual O O O O
species O O O O
. O O O O
    
This O O O O
finding O O O O
offers O O O O
hope O O O O
- O O O O
inspiring O O O O
news O O O O
for O O O O
conservation O O O O
, O O O O
but O O O O
should O O O O
clearly O O O O
be O O O O
verified O O O O
by O O O O
empirical O O O O
studies O O O O
across O O O O
both O O O O
naturally O O O O
and O O O O
more O O O O
recently O O O O
fragmented O O O O
systems O O O O
. O O O O
    
Comparative O O O O
immunofluorescence O O O O
and O O O O
ultrastructural O O O O
analysis O O O O
of O O O O
microtubule O O O O
organization O O O O
in O O O O
Uronema O O O O
sp O O O O
. O O O O
, O O O O
Klebsormidium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
flaccidum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
K B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
subtilissimum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Stichococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bacillaris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
chloranthus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Chlorophyta O O O O
) O O O O
. O O O O
    
A O O O O
detailed O O O O
comparative O O O O
examination O O O O
of O O O O
microtubule O O O O
( O O O O
MT O O O O
) O O O O
organization O O O O
in O O O O
interphase O O O O
and O O O O
dividing O O O O
cells O O O O
of O O O O
Uronema O O O O
sp O O O O
. O O O O
, O O O O
Klebsormidium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
flaccidum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
K B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
subtilissimum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Stichococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bacillaris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
chloranthus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
made O O O O
using O O O O
tubulin O O O O
immunofluorescence O O O O
and O O O O
transmission O O O O
electron O O O O
microscopy O O O O
( O O O O
TEM O O O O
) O O O O
. O O O O
    
During O O O O
interphase O O O O
all O O O O
the O O O O
species O O O O
bear O O O O
a O O O O
well O O O O
- O O O O
organized O O O O
cortical O O O O
MT O O O O
system O O O O
, O O O O
consisting O O O O
of O O O O
parallel O O O O
bundles O O O O
with O O O O
different O O O O
orientations O O O O
. O O O O
    
In O O O O
Uronema O O O O
sp O O O O
. O O O O
the O O O O
cortical O O O O
MT O O O O
bundles O O O O
are O O O O
longitudinally O O O O
oriented O O O O
, O O O O
whereas O O O O
in O O O O
the O O O O
other O O O O
species O O O O
they O O O O
are O O O O
in O O O O
transverse O O O O
orientation O O O O
to O O O O
the O O O O
axis O O O O
of O O O O
the O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Considerable O O O O
differences O O O O
in O O O O
MT O O O O
organization O O O O
were O O O O
also O O O O
observed O O O O
during O O O O
stages O O O O
of O O O O
mitosis O O O O
, O O O O
mainly O O O O
preprophase O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
cytokinesis O O O O
. O O O O
    
In O O O O
Uronema O O O O
sp O O O O
. O O O O
, O O O O
a O O O O
particular O O O O
radial O O O O
MT O O O O
assembly O O O O
is O O O O
organized O O O O
during O O O O
preprophase O O O O
- O O O O
early O O O O
prophase O O O O
, O O O O
which O O O O
was O O O O
not O O O O
observed O O O O
in O O O O
the O O O O
other O O O O
species O O O O
. O O O O
    
In O O O O
Stichococcus O O O O
a O O O O
fine O O O O
MT O O O O
ring O O O O
surrounded O O O O
the O O O O
nucleus O O O O
during O O O O
preprophase O O O O
and O O O O
prophase O O O O
. O O O O
    
An O O O O
MT O O O O
ring O O O O
, O O O O
together O O O O
with O O O O
single O O O O
cytoplasmic O O O O
MTs O O O O
, O O O O
was O O O O
also O O O O
found O O O O
associated O O O O
with O O O O
the O O O O
developing O O O O
diaphragm O O O O
during O O O O
cytokinesis O O O O
in O O O O
Stichococcus O O O O
. O O O O
    
A O O O O
phycoplast O O O O
participates O O O O
in O O O O
cytokinesis O O O O
in O O O O
Uronema O O O O
sp O O O O
. O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
in O O O O
the O O O O
other O O O O
species O O O O
. O O O O
    
In O O O O
Uronema O O O O
sp O O O O
. O O O O
the O O O O
centrosome O O O O
functions O O O O
as O O O O
a O O O O
microtubule O O O O
organizing O O O O
center O O O O
( O O O O
MTOC O O O O
) O O O O
during O O O O
mitosis O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
during O O O O
interphase O O O O
and O O O O
cytokinesis O O O O
. O O O O
    
The O O O O
phylogenetic O O O O
significance O O O O
of O O O O
these O O O O
differences O O O O
is O O O O
discussed O O O O
in O O O O
combination O O O O
with O O O O
SSU O O O O
/ O O O O
ITS O O O O
sequencing O O O O
and O O O O
other O O O O
, O O O O
existing O O O O
molecular O O O O
data O O O O
. O O O O
    
Intentional O O O O
genetic O O O O
introgression O O O O
influences O O O O
survival O O O O
of O O O O
adults O O O O
and O O O O
subadults O O O O
in O O O O
a O O O O
small O O O O
, O O O O
inbred O O O O
felid O O O O
population O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Inbreeding O O O O
and O O O O
low O O O O
genetic O O O O
diversity O O O O
can O O O O
cause O O O O
reductions O O O O
in O O O O
individual O O O O
fitness O O O O
and O O O O
increase O O O O
extinction O O O O
risk O O O O
in O O O O
animal O O O O
populations O O O O
. O O O O
    
Intentional O O O O
introgression O O O O
, O O O O
achieved O O O O
by O O O O
releasing O O O O
genetically O O O O
diverse O O O O
individuals O O O O
into O O O O
inbred O O O O
populations O O O O
, O O O O
has O O O O
been O O O O
used O O O O
as O O O O
a O O O O
conservation O O O O
tool O O O O
to O O O O
improve O O O O
demographic O O O O
performance O O O O
in O O O O
endangered O O O O
populations O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
By O O O O
the O O O O
1980s O O O O
, O O O O
Florida B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
panthers O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Puma B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
concolor O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
coryi O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
had O O O O
been O O O O
reduced O O O O
to O O O O
a O O O O
small O O O O
, O O O O
inbred O O O O
population O O O O
that O O O O
appeared O O O O
to O O O O
be O O O O
on O O O O
the O O O O
brink O O O O
of O O O O
extinction O O O O
. O O O O
    
In O O O O
1995 O O O O
, O O O O
female O O O O
pumas O O O O
from O O O O
Texas O O O O
( O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
c O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
stanleyana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
were O O O O
released O O O O
in O O O O
occupied O O O O
panther O O O O
range O O O O
as O O O O
part O O O O
of O O O O
an O O O O
intentional O O O O
introgression O O O O
programme O O O O
to O O O O
restore O O O O
genetic O O O O
variability O O O O
and O O O O
improve O O O O
demographic O O O O
performance O O O O
of O O O O
panthers O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
used O O O O
25 O O O O
years O O O O
( O O O O
1981 O O O O
- O O O O
2006 O O O O
) O O O O
of O O O O
continuous O O O O
radiotelemetry O O O O
and O O O O
genetic O O O O
data O O O O
to O O O O
estimate O O O O
and O O O O
model O O O O
subadult O O O O
and O O O O
adult O O O O
panther O O O O
survival O O O O
and O O O O
cause O O O O
- O O O O
specific O O O O
mortality O O O O
to O O O O
provide O O O O
rigorous O O O O
sex O O O O
and O O O O
age O O O O
class O O O O
- O O O O
specific O O O O
survival O O O O
estimates O O O O
and O O O O
evaluate O O O O
the O O O O
effect O O O O
of O O O O
the O O O O
introgression O O O O
programme O O O O
on O O O O
these O O O O
parameters O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Genetic O O O O
ancestry O O O O
influenced O O O O
annual O O O O
survival O O O O
of O O O O
subadults O O O O
and O O O O
adults O O O O
after O O O O
introgression O O O O
, O O O O
as O O O O
F O O O O
( O O O O
1 O O O O
) O O O O
generation O O O O
admixed O O O O
panthers O O O O
( O O O O
= O O O O
0 O O O O
* O O O O
98 O O O O
) O O O O
survived O O O O
better O O O O
than O O O O
pre O O O O
- O O O O
introgression O O O O
type O O O O
panthers O O O O
( O O O O
= O O O O
0 O O O O
* O O O O
77 O O O O
) O O O O
and O O O O
other O O O O
admixed O O O O
individuals O O O O
( O O O O
= O O O O
0 O O O O
* O O O O
82 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
heterozygosity O O O O
was O O O O
higher O O O O
for O O O O
admixed O O O O
panthers O O O O
relative O O O O
to O O O O
pre O O O O
- O O O O
introgression O O O O
type O O O O
panthers O O O O
and O O O O
positively O O O O
influenced O O O O
survival O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
are O O O O
consistent O O O O
with O O O O
hybrid O O O O
vigour O O O O
; O O O O
however O O O O
, O O O O
extrinsic O O O O
factors O O O O
such O O O O
as O O O O
low O O O O
density O O O O
of O O O O
males O O O O
in O O O O
some O O O O
areas O O O O
of O O O O
panther O O O O
range O O O O
may O O O O
also O O O O
have O O O O
contributed O O O O
to O O O O
higher O O O O
survival O O O O
of O O O O
F O O O O
( O O O O
1 O O O O
) O O O O
panthers O O O O
. O O O O
    
Regardless O O O O
, O O O O
improved O O O O
survival O O O O
of O O O O
F O O O O
( O O O O
1 O O O O
) O O O O
subadults O O O O
and O O O O
adults O O O O
likely O O O O
contributed O O O O
to O O O O
the O O O O
numerical O O O O
increase O O O O
in O O O O
panthers O O O O
following O O O O
introgression O O O O
, O O O O
and O O O O
our O O O O
results O O O O
indicate O O O O
that O O O O
intentional O O O O
admixture O O O O
, O O O O
achieved O O O O
here O O O O
by O O O O
releasing O O O O
individuals O O O O
from O O O O
another O O O O
population O O O O
, O O O O
appears O O O O
to O O O O
have O O O O
been O O O O
successful O O O O
in O O O O
improving O O O O
demographic O O O O
performance O O O O
in O O O O
this O O O O
highly O O O O
endangered O O O O
population O O O O
. O O O O
    
Projectin O O O O
PEVK O O O O
domain O O O O
, O O O O
splicing O O O O
variants O O O O
and O O O O
domain O O O O
structure O O O O
in O O O O
basal O O O O
and O O O O
derived O O O O
insects O O O O
. O O O O
    
The O O O O
third O O O O
elastic O O O O
filament O O O O
of O O O O
striated O O O O
muscles O O O O
consists O O O O
of O O O O
giant O O O O
proteins O O O O
: O O O O
titin O O O O
( O O O O
in O O O O
vertebrates O O O O
) O O O O
and O O O O
kettin O O O O
/ O O O O
projectin O O O O
( O O O O
in O O O O
insects O O O O
) O O O O
. O O O O
    
In O O O O
all O O O O
three O O O O
proteins O O O O
, O O O O
elasticity O O O O
is O O O O
at O O O O
least O O O O
partly O O O O
associated O O O O
with O O O O
the O O O O
so O O O O
- O O O O
called O O O O
PEVK O O O O
domain O O O O
. O O O O
    
The O O O O
projectin O O O O
PEVK O O O O
domains O O O O
of O O O O
diverse O O O O
insects O O O O
are O O O O
highly O O O O
divergent O O O O
compared O O O O
with O O O O
an O O O O
otherwise O O O O
conserved O O O O
protein O O O O
organization O O O O
. O O O O
    
We O O O O
present O O O O
the O O O O
characterization O O O O
of O O O O
the O O O O
PEVK O O O O
domain O O O O
in O O O O
two O O O O
dragonflies O O O O
and O O O O
in O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
lice O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
A O O O O
conserved O O O O
segment O O O O
at O O O O
the O O O O
end O O O O
of O O O O
the O O O O
PEVK O O O O
, O O O O
the O O O O
NH O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
- O O O O
terminal O O O O
conserved O O O O
segment O O O O
- O O O O
1 O O O O
( O O O O
NTCS O O O O
- O O O O
1 O O O O
) O O O O
, O O O O
may O O O O
serve O O O O
as O O O O
an O O O O
anchor O O O O
point O O O O
for O O O O
projectin O O O O
to O O O O
either O O O O
myosin O O O O
or O O O O
actin O O O O
, O O O O
providing O O O O
a O O O O
mechanical O O O O
link O O O O
. O O O O
    
The O O O O
analysis O O O O
of O O O O
alternative O O O O
splicing O O O O
variants O O O O
identifies O O O O
the O O O O
shortest O O O O
PEVK O O O O
isoform O O O O
as O O O O
the O O O O
predominant O O O O
form O O O O
in O O O O
the O O O O
flight O O O O
muscles O O O O
of O O O O
several O O O O
insects O O O O
, O O O O
possibly O O O O
contributing O O O O
to O O O O
myofibrillar O O O O
stiffness O O O O
. O O O O
    
Paediatric O O O O
stroke O O O O
: O O O O
genetic O O O O
insights O O O O
into O O O O
disease O O O O
mechanisms O O O O
and O O O O
treatment O O O O
targets O O O O
. O O O O
    
In O O O O
children O O O O
, O O O O
stroke O O O O
is O O O O
as O O O O
common O O O O
as O O O O
brain O O O O
tumour O O O O
and O O O O
causes O O O O
substantial O O O O
mortality O O O O
and O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
morbidity O O O O
, O O O O
with O O O O
recurrence O O O O
in O O O O
up O O O O
to O O O O
20 O O O O
% O O O O
. O O O O
    
There O O O O
are O O O O
three O O O O
sets O O O O
of O O O O
international O O O O
clinical O O O O
guidelines O O O O
relating O O O O
to O O O O
childhood O O O O
stroke O O O O
; O O O O
however O O O O
, O O O O
acute O O O O
and O O O O
preventive O O O O
treatment O O O O
recommendations O O O O
are O O O O
based O O O O
on O O O O
interventions O O O O
effective O O O O
in O O O O
adults O O O O
, O O O O
rather O O O O
than O O O O
data O O O O
regarding O O O O
efficacy O O O O
in O O O O
children O O O O
. O O O O
    
A O O O O
wide O O O O
spectrum O O O O
of O O O O
risk O O O O
factors O O O O
underlies O O O O
childhood O O O O
stroke O O O O
, O O O O
and O O O O
these O O O O
risk O O O O
factors O O O O
vary O O O O
from O O O O
those O O O O
encountered O O O O
in O O O O
adults O O O O
. O O O O
    
Specific O O O O
disease O O O O
mechanisms O O O O
implicated O O O O
in O O O O
childhood O O O O
arterial O O O O
ischaemic O O O O
stroke O O O O
have O O O O
received O O O O
little O O O O
attention O O O O
, O O O O
but O O O O
an O O O O
increased O O O O
understanding O O O O
of O O O O
disease O O O O
pathogenesis O O O O
could O O O O
lead O O O O
to O O O O
novel O O O O
targeted O O O O
treatment O O O O
approaches O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
consider O O O O
insights O O O O
into O O O O
the O O O O
pathogenesis O O O O
of O O O O
childhood O O O O
arterial O O O O
ischaemic O O O O
stroke O O O O
and O O O O
cerebral O O O O
arteriopathy O O O O
, O O O O
provided O O O O
by O O O O
current O O O O
knowledge O O O O
of O O O O
Mendelian O O O O
diseases O O O O
that O O O O
are O O O O
associated O O O O
with O O O O
an O O O O
increased O O O O
risk O O O O
of O O O O
these O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
We O O O O
give O O O O
particular O O O O
attention O O O O
to O O O O
aspects O O O O
of O O O O
vascular O O O O
development O O O O
, O O O O
homoeostasis O O O O
, O O O O
and O O O O
response O O O O
to O O O O
environmental O O O O
effects O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
analysis O O O O
highlights O O O O
a O O O O
potential O O O O
role O O O O
for O O O O
interventions O O O O
already O O O O
licensed O O O O
for O O O O
pharmaceutical O O O O
use O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
new O O O O
therapeutic O O O O
targets O O O O
and O O O O
avenues O O O O
for O O O O
further O O O O
research O O O O
. O O O O
    
The O O O O
sirtuin O O O O
pathway O O O O
in O O O O
ageing O O O O
and O O O O
Alzheimer O O O O
disease O O O O
: O O O O
mechanistic O O O O
and O O O O
therapeutic O O O O
considerations O O O O
. O O O O
    
BACKGROUND O O O O
: O O O O
Advances O O O O
in O O O O
gerontology O O O O
have O O O O
yielded O O O O
crucial O O O O
insights O O O O
into O O O O
the O O O O
molecular O O O O
and O O O O
biochemical O O O O
aspects O O O O
of O O O O
the O O O O
ageing O O O O
process O O O O
. O O O O
    
The O O O O
sirtuin O O O O
pathway O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
most O O O O
notable O O O O
for O O O O
its O O O O
association O O O O
with O O O O
the O O O O
anti O O O O
- O O O O
ageing O O O O
effects O O O O
of O O O O
calorie O O O O
restriction O O O O
, O O O O
has O O O O
received O O O O
particular O O O O
attention O O O O
, O O O O
and O O O O
pharmacological O O O O
or O O O O
transgenic O O O O
upregulation O O O O
of O O O O
the O O O O
sirtuin O O O O
pathway O O O O
has O O O O
shown O O O O
promising O O O O
results O O O O
in O O O O
laboratory O O O O
models O O O O
of O O O O
ageing O O O O
. O O O O
    
Alzheimer O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
is O O O O
a O O O O
neurodegenerative O O O O
disease O O O O
that O O O O
is O O O O
imposing O O O O
an O O O O
increasing O O O O
burden O O O O
on O O O O
society O O O O
, O O O O
and O O O O
is O O O O
the O O O O
leading O O O O
cause O O O O
of O O O O
senile O O O O
dementia O O O O
worldwide O O O O
. O O O O
    
The O O O O
lack O O O O
of O O O O
therapies O O O O
for O O O O
Alzheimer O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
provides O O O O
a O O O O
strong O O O O
incentive O O O O
for O O O O
the O O O O
development O O O O
of O O O O
an O O O O
effective O O O O
treatment O O O O
strategy O O O O
and O O O O
, O O O O
interestingly O O O O
, O O O O
research O O O O
has O O O O
uncovered O O O O
a O O O O
mechanism O O O O
of O O O O
action O O O O
of O O O O
the O O O O
sirtuin O O O O
pathway O O O O
that O O O O
might O O O O
have O O O O
therapeutic O O O O
potential O O O O
for O O O O
Alzheimer O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
. O O O O
    
RECENT O O O O
DEVELOPMENTS O O O O
: O O O O
SIRT1 O O O O
, O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
seven O O O O
mammalian O O O O
proteins O O O O
of O O O O
the O O O O
sirtuin O O O O
family O O O O
of O O O O
NAD O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
- O O O O
dependent O O O O
deacetylases O O O O
, O O O O
has O O O O
recently O O O O
been O O O O
shown O O O O
to O O O O
attenuate O O O O
amyloidogenic O O O O
processing O O O O
of O O O O
amyloid O O O O
- O O O O
Beta O O O O
protein O O O O
precursor O O O O
( O O O O
APP O O O O
) O O O O
in O O O O
cell O O O O
culture O O O O
studies O O O O
in O O O O
vitro O O O O
and O O O O
in O O O O
transgenic O O O O
mouse B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
models O O O O
of O O O O
Alzheimer O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
. O O O O
    
Mechanistically O O O O
, O O O O
SIRT1 O O O O
increases O O O O
alpha O O O O
- O O O O
secretase O O O O
production O O O O
and O O O O
activity O O O O
through O O O O
activation O O O O
of O O O O
the O O O O
alpha O O O O
- O O O O
secretase O O O O
gene O O O O
ADAM10 O O O O
. O O O O
    
Because O O O O
alpha O O O O
- O O O O
secretase O O O O
is O O O O
the O O O O
enzyme O O O O
responsible O O O O
for O O O O
the O O O O
non O O O O
- O O O O
amyloidogenic O O O O
cleavage O O O O
of O O O O
APP O O O O
, O O O O
upregulation O O O O
of O O O O
alpha O O O O
- O O O O
secretase O O O O
shifts O O O O
APP O O O O
processing O O O O
to O O O O
reduce O O O O
the O O O O
pathological O O O O
accumulation O O O O
of O O O O
the O O O O
presumptive O O O O
toxic O O O O
ABeta O O O O
species O O O O
that O O O O
results O O O O
from O O O O
Beta O O O O
- O O O O
secretase O O O O
and O O O O
gamma O O O O
- O O O O
secretase O O O O
activity O O O O
. O O O O
    
Interestingly O O O O
, O O O O
the O O O O
spatial O O O O
patterns O O O O
of O O O O
ABeta O O O O
deposition O O O O
in O O O O
the O O O O
brain O O O O
might O O O O
correlate O O O O
with O O O O
increased O O O O
aerobic O O O O
glycolysis O O O O
in O O O O
those O O O O
regions O O O O
. O O O O
    
Because O O O O
aerobic O O O O
glycolysis O O O O
depletes O O O O
cellular O O O O
levels O O O O
of O O O O
NAD O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
( O O O O
through O O O O
a O O O O
decreased O O O O
NAD O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
/ O O O O
NADH O O O O
ratio O O O O
) O O O O
, O O O O
it O O O O
is O O O O
possible O O O O
that O O O O
a O O O O
corresponding O O O O
downregulation O O O O
of O O O O
the O O O O
NAD O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
- O O O O
dependent O O O O
sirtuin O O O O
pathway O O O O
contributes O O O O
to O O O O
the O O O O
amyloidogenic O O O O
processing O O O O
of O O O O
APP O O O O
. O O O O
    
WHERE O O O O
NEXT O O O O
? O O O O
: O O O O
The O O O O
specific O O O O
inhibition O O O O
of O O O O
ABeta O O O O
generation O O O O
by O O O O
SIRT1 O O O O
coupled O O O O
with O O O O
the O O O O
potential O O O O
link O O O O
between O O O O
aerobic O O O O
glycolysis O O O O
, O O O O
NAD O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
depletion O O O O
, O O O O
and O O O O
amyloidogenesis O O O O
through O O O O
the O O O O
sirtuin O O O O
pathway O O O O
has O O O O
translational O O O O
implications O O O O
. O O O O
    
On O O O O
the O O O O
one O O O O
hand O O O O
, O O O O
the O O O O
possible O O O O
underlying O O O O
role O O O O
of O O O O
the O O O O
sirtuin O O O O
pathway O O O O
in O O O O
Alzheimer O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
onset O O O O
and O O O O
development O O O O
might O O O O
increase O O O O
our O O O O
understanding O O O O
of O O O O
this O O O O
devastating O O O O
condition O O O O
. O O O O
    
On O O O O
the O O O O
other O O O O
hand O O O O
, O O O O
therapeutic O O O O
upregulation O O O O
of O O O O
SIRT1 O O O O
might O O O O
provide O O O O
opportunities O O O O
for O O O O
the O O O O
amelioration O O O O
of O O O O
Alzheimer O O O O
' O O O O
s O O O O
- O O O O
disease O O O O
- O O O O
type O O O O
neuropathology O O O O
through O O O O
inhibition O O O O
of O O O O
amyloidogenesis O O O O
. O O O O
    
Ultimately O O O O
, O O O O
further O O O O
analysis O O O O
into O O O O
both O O O O
aspects O O O O
is O O O O
necessary O O O O
if O O O O
any O O O O
progress O O O O
is O O O O
to O O O O
be O O O O
made O O O O
. O O O O
    
Ventricular O O O O
septal O O O O
defect O O O O
. O O O O
    
Ventricular O O O O
septal O O O O
defects O O O O
account O O O O
for O O O O
up O O O O
to O O O O
40 O O O O
% O O O O
of O O O O
all O O O O
congenital O O O O
cardiac O O O O
malformations O O O O
. O O O O
    
The O O O O
diagnosis O O O O
encompasses O O O O
a O O O O
broad O O O O
range O O O O
of O O O O
anomalies O O O O
, O O O O
including O O O O
isolated O O O O
defects O O O O
and O O O O
those O O O O
associated O O O O
with O O O O
other O O O O
congenital O O O O
cardiac O O O O
malformations O O O O
. O O O O
    
Presentation O O O O
, O O O O
symptoms O O O O
, O O O O
natural O O O O
history O O O O
, O O O O
and O O O O
management O O O O
of O O O O
ventricular O O O O
septal O O O O
defects O O O O
depend O O O O
on O O O O
size O O O O
and O O O O
anatomical O O O O
associations O O O O
of O O O O
the O O O O
anomaly O O O O
, O O O O
patient O O O O
' O O O O
s O O O O
age O O O O
, O O O O
and O O O O
local O O O O
diagnostic O O O O
and O O O O
interventional O O O O
expertise O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
Seminar O O O O
, O O O O
we O O O O
describe O O O O
the O O O O
anatomical O O O O
range O O O O
of O O O O
ventricular O O O O
septal O O O O
defects O O O O
and O O O O
discuss O O O O
present O O O O
management O O O O
of O O O O
these O O O O
malformations O O O O
. O O O O
    
Genetic O O O O
determinants O O O O
, O O O O
diagnostic O O O O
techniques O O O O
, O O O O
physiological O O O O
considerations O O O O
, O O O O
and O O O O
management O O O O
challenges O O O O
are O O O O
examined O O O O
in O O O O
detail O O O O
. O O O O
    
Unfortunately O O O O
, O O O O
in O O O O
many O O O O
circumstances O O O O
, O O O O
evidence O O O O
on O O O O
which O O O O
to O O O O
guide O O O O
optimum O O O O
management O O O O
is O O O O
scarce O O O O
. O O O O
    
We O O O O
present O O O O
some O O O O
longer O O O O
term O O O O
considerations O O O O
of O O O O
ventricular O O O O
septal O O O O
defects O O O O
in O O O O
adolescents O O O O
and O O O O
adults O O O O
, O O O O
with O O O O
particular O O O O
emphasis O O O O
on O O O O
patients O O O O
with O O O O
raised O O O O
pulmonary O O O O
vascular O O O O
resistance O O O O
and O O O O
Eisenmenger O O O O
' O O O O
s O O O O
syndrome O O O O
. O O O O
    
Interplay O O O O
between O O O O
the O O O O
parasite O O O O
Amoebophrya B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
    
( O O O O
Alveolata O O O O
) O O O O
and O O O O
the O O O O
cyst O O O O
formation O O O O
of O O O O
the O O O O
red O O O O
tide O O O O
dinoflagellate O O O O
Scrippsiella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trochoidea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Syndiniales O O O O
( O O O O
Alveolata O O O O
) O O O O
are O O O O
marine O O O O
parasites O O O O
of O O O O
a O O O O
wide O O O O
range O O O O
of O O O O
hosts O O O O
, O O O O
from O O O O
unicellular O O O O
organisms O O O O
to O O O O
Metazoa O O O O
. O O O O
    
Many O O O O
Syndiniales O O O O
obligatorily O O O O
kill O O O O
their O O O O
hosts O O O O
to O O O O
accomplish O O O O
their O O O O
life O O O O
cycle O O O O
. O O O O
    
This O O O O
is O O O O
the O O O O
case O O O O
for O O O O
Amoebophrya B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
spp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
infecting O O O O
dinoflagellates O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
several O O O O
dinoflagellate O O O O
species O O O O
known O O O O
to O O O O
be O O O O
infected O O O O
by O O O O
these O O O O
parasites O O O O
produce O O O O
diploid O O O O
resting O O O O
cysts O O O O
as O O O O
part O O O O
of O O O O
their O O O O
life O O O O
history O O O O
. O O O O
    
These O O O O
resting O O O O
cysts O O O O
may O O O O
survive O O O O
several O O O O
seasons O O O O
in O O O O
the O O O O
sediment O O O O
before O O O O
germinating O O O O
. O O O O
    
How O O O O
these O O O O
parasites O O O O
survive O O O O
during O O O O
the O O O O
dormancy O O O O
of O O O O
their O O O O
host O O O O
remained O O O O
an O O O O
open O O O O
question O O O O
. O O O O
    
We O O O O
successfully O O O O
established O O O O
infections O O O O
by O O O O
Amoebophrya B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
the O O O O
red O O O O
tide O O O O
dinoflagellate O O O O
Scrippsiella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trochoidea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
This O O O O
host O O O O
strain O O O O
was O O O O
homothallic O O O O
and O O O O
able O O O O
to O O O O
continuously O O O O
produce O O O O
typical O O O O
calcified O O O O
cysts O O O O
covered O O O O
by O O O O
calcareous O O O O
spines O O O O
. O O O O
    
Presence O O O O
of O O O O
the O O O O
parasite O O O O
significantly O O O O
speeded O O O O
up O O O O
the O O O O
host O O O O
cyst O O O O
production O O O O
, O O O O
and O O O O
cysts O O O O
produced O O O O
were O O O O
the O O O O
only O O O O
cells O O O O
to O O O O
resist O O O O
infections O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
some O O O O
of O O O O
them O O O O
were O O O O
clearly O O O O
infected O O O O
, O O O O
probably O O O O
earlier O O O O
in O O O O
their O O O O
formation O O O O
. O O O O
    
After O O O O
10 O O O O
months O O O O
, O O O O
cysts O O O O
produced O O O O
in O O O O
presence O O O O
of O O O O
the O O O O
parasite O O O O
were O O O O
able O O O O
to O O O O
germinate O O O O
and O O O O
new O O O O
infective O O O O
cycles O O O O
of O O O O
the O O O O
parasite O O O O
were O O O O
rapidly O O O O
observed O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
a O O O O
very O O O O
novel O O O O
relationship O O O O
for O O O O
protists O O O O
is O O O O
demonstrated O O O O
, O O O O
one O O O O
in O O O O
which O O O O
parasite O O O O
and O O O O
host O O O O
simultaneously O O O O
enter O O O O
dormancy O O O O
, O O O O
emerging O O O O
months O O O O
later O O O O
to O O O O
propagate O O O O
both O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Treatment O O O O
implications O O O O
of O O O O
the O O O O
emerging O O O O
molecular O O O O
classification O O O O
system O O O O
for O O O O
melanoma O O O O
. O O O O
    
Melanoma O O O O
is O O O O
an O O O O
aggressive O O O O
disease O O O O
with O O O O
few O O O O
standard O O O O
treatment O O O O
options O O O O
. O O O O
    
The O O O O
conventional O O O O
classification O O O O
system O O O O
for O O O O
this O O O O
disease O O O O
is O O O O
based O O O O
on O O O O
histological O O O O
growth O O O O
patterns O O O O
, O O O O
with O O O O
division O O O O
into O O O O
four O O O O
subtypes O O O O
: O O O O
superficial O O O O
spreading O O O O
, O O O O
lentigo O O O O
maligna O O O O
, O O O O
nodular O O O O
, O O O O
and O O O O
acral O O O O
lentiginous O O O O
. O O O O
    
Major O O O O
limitations O O O O
of O O O O
this O O O O
classification O O O O
system O O O O
are O O O O
absence O O O O
of O O O O
prognostic O O O O
importance O O O O
and O O O O
little O O O O
correlation O O O O
with O O O O
treatment O O O O
outcomes O O O O
. O O O O
    
Recent O O O O
preclinical O O O O
and O O O O
clinical O O O O
findings O O O O
support O O O O
the O O O O
notion O O O O
that O O O O
melanoma O O O O
is O O O O
not O O O O
one O O O O
malignant O O O O
disorder O O O O
but O O O O
rather O O O O
a O O O O
family O O O O
of O O O O
distinct O O O O
molecular O O O O
diseases O O O O
. O O O O
    
Incorporation O O O O
of O O O O
genetic O O O O
signatures O O O O
into O O O O
the O O O O
conventional O O O O
histopathological O O O O
classification O O O O
of O O O O
melanoma O O O O
has O O O O
great O O O O
implications O O O O
for O O O O
development O O O O
of O O O O
new O O O O
and O O O O
effective O O O O
treatments O O O O
. O O O O
    
Genes O O O O
of O O O O
the O O O O
mitogen O O O O
- O O O O
associated O O O O
protein O O O O
kinase O O O O
( O O O O
MAPK O O O O
) O O O O
pathway O O O O
harbour O O O O
alterations O O O O
sometimes O O O O
identified O O O O
in O O O O
people O O O O
with O O O O
melanoma O O O O
. O O O O
    
The O O O O
mutation O O O O
Val600Glu O O O O
in O O O O
the O O O O
BRAF O O O O
oncogene O O O O
( O O O O
designated O O O O
BRAF O O O O
( O O O O
V600E O O O O
) O O O O
) O O O O
has O O O O
been O O O O
associated O O O O
with O O O O
sensitivity O O O O
in O O O O
vitro O O O O
and O O O O
in O O O O
vivo O O O O
to O O O O
agents O O O O
that O O O O
inhibit O O O O
BRAF O O O O
( O O O O
V600E O O O O
) O O O O
or O O O O
MEK O O O O
( O O O O
a O O O O
kinase O O O O
in O O O O
the O O O O
MAPK O O O O
pathway O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Melanomas O O O O
arising O O O O
from O O O O
mucosal O O O O
, O O O O
acral O O O O
, O O O O
chronically O O O O
sun O O O O
- O O O O
damaged O O O O
surfaces O O O O
sometimes O O O O
have O O O O
oncogenic O O O O
mutations O O O O
in O O O O
KIT O O O O
, O O O O
against O O O O
which O O O O
several O O O O
inhibitors O O O O
have O O O O
shown O O O O
clinical O O O O
efficacy O O O O
. O O O O
    
Some O O O O
uveal O O O O
melanomas O O O O
have O O O O
activating O O O O
mutations O O O O
in O O O O
GNAQ O O O O
and O O O O
GNA11 O O O O
, O O O O
rendering O O O O
them O O O O
potentially O O O O
susceptible O O O O
to O O O O
MEK O O O O
inhibition O O O O
. O O O O
    
These O O O O
findings O O O O
suggest O O O O
that O O O O
prospective O O O O
genotyping O O O O
of O O O O
patients O O O O
with O O O O
melanoma O O O O
should O O O O
be O O O O
used O O O O
increasingly O O O O
as O O O O
we O O O O
work O O O O
to O O O O
develop O O O O
new O O O O
and O O O O
effective O O O O
treatments O O O O
for O O O O
this O O O O
disease O O O O
. O O O O
    
Ciliate O O O O
community O O O O
associated O O O O
with O O O O
aquatic O O O O
macrophyte O O O O
roots O O O O
: O O O O
effects O O O O
of O O O O
nutrient O O O O
enrichment O O O O
on O O O O
the O O O O
community O O O O
composition O O O O
and O O O O
species O O O O
richness O O O O
. O O O O
    
The O O O O
objective O O O O
of O O O O
this O O O O
study O O O O
was O O O O
to O O O O
identify O O O O
the O O O O
impact O O O O
of O O O O
nutrient O O O O
enrichment O O O O
on O O O O
the O O O O
diversity O O O O
of O O O O
the O O O O
ciliate O O O O
community O O O O
associated O O O O
with O O O O
the O O O O
roots O O O O
of O O O O
the O O O O
aquatic O O O O
macrophyte O O O O
Eichhornia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
crassipes O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
experiment O O O O
was O O O O
performed O O O O
in O O O O
the O O O O
Garsigmaas O O O O
Lake O O O O
, O O O O
located O O O O
in O O O O
the O O O O
Upper O O O O
Parana O O O O
River O O O O
floodplain O O O O
, O O O O
Brazil O O O O
. O O O O
    
We O O O O
conducted O O O O
two O O O O
treatments O O O O
( O O O O
fertilized O O O O
and O O O O
control O O O O
) O O O O
with O O O O
three O O O O
replicates O O O O
each O O O O
. O O O O
    
To O O O O
increase O O O O
the O O O O
initial O O O O
nutrient O O O O
concentrations O O O O
in O O O O
each O O O O
mesocosm O O O O
of O O O O
the O O O O
fertilized O O O O
treatment O O O O
, O O O O
we O O O O
added O O O O
1000 O O O O
mugL O O O O
( O O O O
- O O O O
1 O O O O
) O O O O
of O O O O
KNO O O O O
( O O O O
3 O O O O
) O O O O
and O O O O
200 O O O O
mugL O O O O
( O O O O
- O O O O
1 O O O O
) O O O O
of O O O O
KH O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
PO O O O O
( O O O O
4 O O O O
) O O O O
during O O O O
each O O O O
sampling O O O O
date O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
a O O O O
relative O O O O
high O O O O
number O O O O
of O O O O
ciliate O O O O
species O O O O
( O O O O
85 O O O O
species O O O O
) O O O O
and O O O O
a O O O O
predominance O O O O
of O O O O
hypotrichs O O O O
. O O O O
    
Among O O O O
the O O O O
recorded O O O O
species O O O O
, O O O O
about O O O O
25 O O O O
% O O O O
occurred O O O O
exclusively O O O O
in O O O O
the O O O O
fertilized O O O O
treatment O O O O
. O O O O
    
Moreover O O O O
, O O O O
detrended O O O O
correspondence O O O O
analysis O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
the O O O O
ciliate O O O O
community O O O O
associated O O O O
with O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
crassipes O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
roots O O O O
changed O O O O
significantly O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
the O O O O
nutrient O O O O
input O O O O
in O O O O
such O O O O
a O O O O
way O O O O
that O O O O
the O O O O
species O O O O
composition O O O O
of O O O O
the O O O O
fertilized O O O O
treatment O O O O
was O O O O
remarkably O O O O
different O O O O
from O O O O
that O O O O
of O O O O
the O O O O
control O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
to O O O O
our O O O O
expectations O O O O
, O O O O
species O O O O
richness O O O O
in O O O O
the O O O O
fertilized O O O O
treatment O O O O
was O O O O
significantly O O O O
higher O O O O
than O O O O
that O O O O
in O O O O
the O O O O
control O O O O
, O O O O
refuting O O O O
our O O O O
hypothesis O O O O
that O O O O
species O O O O
richness O O O O
decreases O O O O
under O O O O
eutrophic O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
International O O O O
Cognition O O O O
and O O O O
Cancer O O O O
Task O O O O
Force O O O O
recommendations O O O O
to O O O O
harmonise O O O O
studies O O O O
of O O O O
cognitive O O O O
function O O O O
in O O O O
patients O O O O
with O O O O
cancer O O O O
. O O O O
    
It O O O O
has O O O O
become O O O O
increasingly O O O O
apparent O O O O
that O O O O
cytotoxic O O O O
drugs O O O O
given O O O O
systemically O O O O
for O O O O
non O O O O
- O O O O
CNS O O O O
tumours O O O O
might O O O O
have O O O O
cognitive O O O O
side O O O O
- O O O O
effects O O O O
, O O O O
but O O O O
many O O O O
fundamental O O O O
questions O O O O
require O O O O
further O O O O
elucidation O O O O
, O O O O
and O O O O
large O O O O
samples O O O O
from O O O O
several O O O O
institutions O O O O
are O O O O
needed O O O O
. O O O O
    
Two O O O O
working O O O O
groups O O O O
brought O O O O
together O O O O
by O O O O
the O O O O
International O O O O
Cognition O O O O
and O O O O
Cancer O O O O
Task O O O O
Force O O O O
( O O O O
ICCTF O O O O
) O O O O
developed O O O O
recommendations O O O O
for O O O O
a O O O O
core O O O O
set O O O O
of O O O O
neuropsychological O O O O
tests O O O O
, O O O O
common O O O O
criterion O O O O
for O O O O
defining O O O O
cognitive O O O O
impairment O O O O
and O O O O
cognitive O O O O
changes O O O O
, O O O O
and O O O O
common O O O O
approaches O O O O
to O O O O
improve O O O O
the O O O O
homogeneity O O O O
of O O O O
study O O O O
methods O O O O
. O O O O
    
These O O O O
recommendations O O O O
will O O O O
improve O O O O
research O O O O
design O O O O
and O O O O
facilitate O O O O
study O O O O
combinations O O O O
, O O O O
between O O O O
- O O O O
study O O O O
comparisons O O O O
, O O O O
and O O O O
meta O O O O
- O O O O
analyses O O O O
, O O O O
which O O O O
will O O O O
allow O O O O
more O O O O
accurate O O O O
estimates O O O O
of O O O O
incidence O O O O
, O O O O
severity O O O O
, O O O O
individual O O O O
risk O O O O
factors O O O O
, O O O O
and O O O O
causes O O O O
of O O O O
cognitive O O O O
problems O O O O
associated O O O O
with O O O O
chemotherapy O O O O
for O O O O
non O O O O
- O O O O
CNS O O O O
tumours O O O O
. O O O O
    
Low O O O O
functional O O O O
richness O O O O
and O O O O
redundancy O O O O
of O O O O
a O O O O
predator O O O O
assemblage O O O O
in O O O O
native O O O O
forest O O O O
fragments O O O O
of O O O O
Chiloe O O O O
island O O O O
, O O O O
Chile O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Changes O O O O
in O O O O
land O O O O
use O O O O
and O O O O
habitat O O O O
fragmentation O O O O
are O O O O
major O O O O
drivers O O O O
of O O O O
global O O O O
change O O O O
, O O O O
and O O O O
studying O O O O
their O O O O
effects O O O O
on O O O O
biodiversity O O O O
constitutes O O O O
a O O O O
major O O O O
research O O O O
programme O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
biodiversity O O O O
is O O O O
a O O O O
multifaceted O O O O
concept O O O O
, O O O O
with O O O O
a O O O O
functional O O O O
component O O O O
linking O O O O
species O O O O
richness O O O O
to O O O O
ecosystem O O O O
function O O O O
. O O O O
    
Currently O O O O
, O O O O
the O O O O
interaction O O O O
between O O O O
functional O O O O
and O O O O
taxonomic O O O O
components O O O O
of O O O O
biodiversity O O O O
under O O O O
realistic O O O O
scenarios O O O O
of O O O O
habitat O O O O
degradation O O O O
is O O O O
poorly O O O O
understood O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
expected O O O O
functional O O O O
richness O O O O
( O O O O
FR O O O O
) O O O O
- O O O O
species O O O O
richness O O O O
relationship O O O O
( O O O O
FRSR O O O O
) O O O O
is O O O O
positive O O O O
, O O O O
and O O O O
attenuated O O O O
for O O O O
functional O O O O
redundancy O O O O
in O O O O
species O O O O
- O O O O
rich O O O O
assemblages O O O O
. O O O O
    
Further O O O O
, O O O O
environmental O O O O
filters O O O O
are O O O O
expected O O O O
to O O O O
flatten O O O O
that O O O O
association O O O O
by O O O O
sorting O O O O
species O O O O
with O O O O
similar O O O O
traits O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
analysing O O O O
FRSR O O O O
can O O O O
inform O O O O
about O O O O
the O O O O
response O O O O
of O O O O
biodiversity O O O O
to O O O O
environmental O O O O
gradients O O O O
and O O O O
habitat O O O O
fragmentation O O O O
, O O O O
and O O O O
its O O O O
expected O O O O
functional O O O O
consequences O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Top O O O O
predators O O O O
affect O O O O
ecosystem O O O O
functioning O O O O
through O O O O
prey O O O O
consumption O O O O
and O O O O
are O O O O
particularly O O O O
vulnerable O O O O
to O O O O
changes O O O O
in O O O O
land O O O O
use O O O O
and O O O O
habitat O O O O
fragmentation O O O O
, O O O O
being O O O O
good O O O O
indicators O O O O
of O O O O
ecosystem O O O O
health O O O O
and O O O O
suitable O O O O
models O O O O
for O O O O
assessing O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
habitat O O O O
fragmentation O O O O
on O O O O
their O O O O
FR O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
this O O O O
study O O O O
analyses O O O O
the O O O O
functional O O O O
redundancy O O O O
of O O O O
a O O O O
vertebrate O O O O
predator O O O O
assemblage O O O O
at O O O O
temperate O O O O
forest O O O O
fragments O O O O
in O O O O
a O O O O
rural O O O O
landscape O O O O
of O O O O
Chiloe O O O O
island O O O O
( O O O O
Chile O O O O
) O O O O
, O O O O
testing O O O O
the O O O O
existence O O O O
of O O O O
environmental O O O O
filters O O O O
by O O O O
contrasting O O O O
an O O O O
empirically O O O O
derived O O O O
FRSR O O O O
against O O O O
those O O O O
predicted O O O O
from O O O O
 O O O O
models O O O O
, O O O O
and O O O O
testing O O O O
the O O O O
association O O O O
between O O O O
biodiversity O O O O
components O O O O
and O O O O
the O O O O
structure O O O O
of O O O O
forest O O O O
fragments O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Overall O O O O
, O O O O
contrasts O O O O
against O O O O
 O O O O
models O O O O
indicate O O O O
that O O O O
regional O O O O
factors O O O O
determine O O O O
low O O O O
levels O O O O
of O O O O
FR O O O O
and O O O O
redundancy O O O O
for O O O O
the O O O O
vertebrate O O O O
predator O O O O
assemblage O O O O
studied O O O O
, O O O O
while O O O O
recorded O O O O
linear O O O O
FRSR O O O O
indicates O O O O
proportional O O O O
responses O O O O
of O O O O
the O O O O
two O O O O
biodiversity O O O O
components O O O O
to O O O O
the O O O O
structure O O O O
of O O O O
forest O O O O
fragments O O O O
. O O O O
    
Further O O O O
, O O O O
most O O O O
species O O O O
were O O O O
positively O O O O
associated O O O O
with O O O O
either O O O O
fragment O O O O
size O O O O
or O O O O
shape O O O O
complexity O O O O
, O O O O
which O O O O
are O O O O
highly O O O O
correlated O O O O
. O O O O
    
This O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
ecological O O O O
filters O O O O
at O O O O
the O O O O
single O O O O
- O O O O
fragment O O O O
scale O O O O
, O O O O
rendered O O O O
taxonomically O O O O
and O O O O
functionally O O O O
richer O O O O
predator O O O O
assemblages O O O O
at O O O O
large O O O O
complex O O O O
- O O O O
shaped O O O O
fragments O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
predict O O O O
strong O O O O
effects O O O O
of O O O O
deforestation O O O O
on O O O O
both O O O O
components O O O O
of O O O O
biodiversity O O O O
, O O O O
potentially O O O O
affecting O O O O
the O O O O
functioning O O O O
of O O O O
remnants O O O O
of O O O O
native O O O O
temperate O O O O
forest O O O O
ecosystems O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
the O O O O
present O O O O
study O O O O
assesses O O O O
general O O O O
responses O O O O
of O O O O
functional O O O O
and O O O O
taxonomic O O O O
components O O O O
of O O O O
biodiversity O O O O
to O O O O
a O O O O
specific O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
driven O O O O
process O O O O
. O O O O
    
Fluorescent O O O O
proteins O O O O
illuminate O O O O
the O O O O
structure O O O O
and O O O O
function O O O O
of O O O O
the O O O O
hyphal O O O O
tip O O O O
apparatus O O O O
. O O O O
    
Fungal O O O O
hyphae O O O O
show O O O O
extreme O O O O
polarized O O O O
growth O O O O
at O O O O
the O O O O
tip O O O O
. O O O O
    
Electron O O O O
microscope O O O O
studies O O O O
have O O O O
revealed O O O O
a O O O O
apical O O O O
body O O O O
called O O O O
the O O O O
Spitzenkorper O O O O
that O O O O
is O O O O
thought O O O O
to O O O O
drive O O O O
polarized O O O O
growth O O O O
. O O O O
    
Studies O O O O
of O O O O
polarized O O O O
growth O O O O
in O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cerevisiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
have O O O O
identified O O O O
the O O O O
protein O O O O
components O O O O
of O O O O
the O O O O
polarized O O O O
growth O O O O
machinery O O O O
, O O O O
that O O O O
are O O O O
conserved O O O O
in O O O O
other O O O O
fungi O O O O
. O O O O
    
Fusion O O O O
of O O O O
these O O O O
proteins O O O O
to O O O O
GFP O O O O
and O O O O
its O O O O
variants O O O O
has O O O O
for O O O O
the O O O O
first O O O O
time O O O O
allowed O O O O
the O O O O
localization O O O O
of O O O O
these O O O O
proteins O O O O
in O O O O
real O O O O
time O O O O
to O O O O
the O O O O
hyphal O O O O
tip O O O O
without O O O O
the O O O O
need O O O O
for O O O O
drastic O O O O
fixation O O O O
procedures O O O O
. O O O O
    
Such O O O O
studies O O O O
showed O O O O
that O O O O
vesicle O O O O
- O O O O
associated O O O O
proteins O O O O
localize O O O O
to O O O O
the O O O O
Spitzenkorper O O O O
and O O O O
identified O O O O
a O O O O
second O O O O
compartment O O O O
located O O O O
at O O O O
the O O O O
tip O O O O
surface O O O O
composed O O O O
of O O O O
exocyst O O O O
and O O O O
other O O O O
proteins O O O O
that O O O O
mediate O O O O
the O O O O
fusion O O O O
of O O O O
secretory O O O O
vesicles O O O O
with O O O O
the O O O O
plasma O O O O
membrane O O O O
. O O O O
    
One O O O O
step O O O O
construction O O O O
of O O O O
Agrobacterium O O O O
- O O O O
Recombination O O O O
- O O O O
ready O O O O
- O O O O
plasmids O O O O
( O O O O
OSCAR O O O O
) O O O O
, O O O O
an O O O O
efficient O O O O
and O O O O
robust O O O O
tool O O O O
for O O O O
ATMT O O O O
based O O O O
gene O O O O
deletion O O O O
construction O O O O
in O O O O
fungi O O O O
. O O O O
    
Increasing O O O O
availability O O O O
of O O O O
genomic O O O O
data O O O O
and O O O O
sophistication O O O O
of O O O O
analytical O O O O
methodology O O O O
in O O O O
fungi O O O O
has O O O O
elevated O O O O
the O O O O
need O O O O
for O O O O
functional O O O O
genomics O O O O
tools O O O O
in O O O O
these O O O O
organisms O O O O
. O O O O
    
Previously O O O O
we O O O O
reported O O O O
a O O O O
method O O O O
called O O O O
DelsGate O O O O
for O O O O
rapid O O O O
preparation O O O O
of O O O O
deletion O O O O
constructs O O O O
for O O O O
protoplast O O O O
- O O O O
mediated O O O O
fungal O O O O
transformation O O O O
systems O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
based O O O O
on O O O O
Gateway O O O O
( O O O O
R O O O O
) O O O O
technology O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
over O O O O
the O O O O
past O O O O
several O O O O
years O O O O
Agrobacteriumtumefaciens B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
mediated O O O O
transformation O O O O
( O O O O
ATMT O O O O
) O O O O
has O O O O
become O O O O
the O O O O
preferred O O O O
genetic O O O O
transformation O O O O
method O O O O
for O O O O
an O O O O
increasing O O O O
number O O O O
of O O O O
fungi O O O O
. O O O O
    
Therefore O O O O
, O O O O
we O O O O
developed O O O O
a O O O O
method O O O O
for O O O O
One O O O O
Step O O O O
Construction O O O O
of O O O O
Agrobacterium O O O O
- O O O O
Recombination O O O O
- O O O O
ready O O O O
- O O O O
plasmids O O O O
( O O O O
OSCAR O O O O
) O O O O
, O O O O
to O O O O
rapidly O O O O
create O O O O
deletion O O O O
constructs O O O O
for O O O O
ATMT O O O O
systems O O O O
. O O O O
    
The O O O O
OSCAR O O O O
methodology O O O O
involves O O O O
PCR O O O O
amplification O O O O
of O O O O
the O O O O
upstream O O O O
and O O O O
downstream O O O O
flanks O O O O
of O O O O
the O O O O
gene O O O O
of O O O O
interest O O O O
, O O O O
using O O O O
gene O O O O
specific O O O O
primers O O O O
each O O O O
with O O O O
a O O O O
5 O O O O
' O O O O
extension O O O O
containing O O O O
one O O O O
of O O O O
four O O O O
different O O O O
attB O O O O
recombination O O O O
sites O O O O
, O O O O
modified O O O O
from O O O O
the O O O O
Invitrogen O O O O
MultiSite O O O O
Gateway O O O O
( O O O O
R O O O O
) O O O O
system O O O O
. O O O O
    
Amplified O O O O
gene O O O O
flanks O O O O
are O O O O
then O O O O
mixed O O O O
with O O O O
specifically O O O O
designed O O O O
marker O O O O
and O O O O
binary O O O O
vectors O O O O
and O O O O
treated O O O O
with O O O O
BP O O O O
clonase O O O O
, O O O O
generating O O O O
the O O O O
deletion O O O O
construct O O O O
in O O O O
a O O O O
single O O O O
cloning O O O O
step O O O O
. O O O O
    
The O O O O
entire O O O O
process O O O O
of O O O O
deletion O O O O
construct O O O O
preparation O O O O
can O O O O
be O O O O
accomplished O O O O
in O O O O
just O O O O
2days O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
OSCAR O O O O
we O O O O
generated O O O O
eight O O O O
targeted O O O O
deletion O O O O
constructs O O O O
and O O O O
used O O O O
two O O O O
of O O O O
them O O O O
to O O O O
generate O O O O
deletion O O O O
mutants O O O O
in O O O O
Verticillium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
dahliae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
by O O O O
ATMT O O O O
. O O O O
    
In O O O O
summary O O O O
, O O O O
OSCAR O O O O
methodology O O O O
combines O O O O
PCR O O O O
and O O O O
Gateway O O O O
( O O O O
R O O O O
) O O O O
technology O O O O
to O O O O
rapidly O O O O
and O O O O
robustly O O O O
generate O O O O
precise O O O O
deletion O O O O
constructs O O O O
for O O O O
fungal O O O O
ATMT O O O O
and O O O O
homologous O O O O
gene O O O O
replacement O O O O
. O O O O
    
Scales O O O O
of O O O O
orientation O O O O
, O O O O
directed O O O O
walks O O O O
and O O O O
movement O O O O
path O O O O
structure O O O O
in O O O O
sharks O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Animal O O O O
search O O O O
patterns O O O O
reflect O O O O
sensory O O O O
perception O O O O
ranges O O O O
combined O O O O
with O O O O
memory O O O O
and O O O O
knowledge O O O O
of O O O O
the O O O O
surrounding O O O O
environment O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Random O O O O
walks O O O O
are O O O O
used O O O O
when O O O O
the O O O O
locations O O O O
of O O O O
resources O O O O
are O O O O
unknown O O O O
, O O O O
whereas O O O O
directed O O O O
walks O O O O
should O O O O
be O O O O
optimal O O O O
when O O O O
the O O O O
location O O O O
of O O O O
favourable O O O O
habitats O O O O
is O O O O
known O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
directed O O O O
walks O O O O
have O O O O
been O O O O
quantified O O O O
for O O O O
very O O O O
few O O O O
species O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
re O O O O
- O O O O
analysed O O O O
tracking O O O O
data O O O O
from O O O O
three O O O O
shark O O O O
species O O O O
to O O O O
determine O O O O
whether O O O O
they O O O O
were O O O O
using O O O O
directed O O O O
walks O O O O
, O O O O
and O O O O
if O O O O
so O O O O
, O O O O
over O O O O
which O O O O
spatial O O O O
scales O O O O
. O O O O
    
Fractal O O O O
analysis O O O O
was O O O O
used O O O O
to O O O O
quantify O O O O
how O O O O
movement O O O O
structure O O O O
varied O O O O
with O O O O
spatial O O O O
scale O O O O
and O O O O
determine O O O O
whether O O O O
the O O O O
sharks O O O O
were O O O O
using O O O O
patches O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Tiger O O O O
sharks O O O O
performed O O O O
directed O O O O
walks O O O O
at O O O O
large O O O O
spatial O O O O
scales O O O O
( O O O O
at O O O O
least O O O O
6 O O O O
- O O O O
8 O O O O
km O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Thresher O O O O
sharks O O O O
also O O O O
showed O O O O
directed O O O O
movement O O O O
( O O O O
at O O O O
scales O O O O
of O O O O
400 O O O O
- O O O O
1900 O O O O
m O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
adult O O O O
threshers B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
were O O O O
able O O O O
to O O O O
orient O O O O
at O O O O
greater O O O O
scales O O O O
than O O O O
juveniles O O O O
, O O O O
which O O O O
may O O O O
suggest O O O O
that O O O O
learning O O O O
improves O O O O
the O O O O
ability O O O O
to O O O O
perform O O O O
directed O O O O
walks O O O O
. O O O O
    
Blacktip B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
reef O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sharks O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
had O O O O
small O O O O
home O O O O
ranges O O O O
, O O O O
high O O O O
site O O O O
fidelity O O O O
and O O O O
showed O O O O
no O O O O
evidence O O O O
of O O O O
oriented O O O O
movements O O O O
at O O O O
large O O O O
scales O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
There O O O O
were O O O O
inter O O O O
- O O O O
and O O O O
intraspecific O O O O
differences O O O O
in O O O O
path O O O O
structure O O O O
and O O O O
patch O O O O
size O O O O
, O O O O
although O O O O
most O O O O
individuals O O O O
showed O O O O
scale O O O O
- O O O O
dependent O O O O
movements O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
some O O O O
individuals O O O O
of O O O O
each O O O O
species O O O O
performed O O O O
movements O O O O
similar O O O O
to O O O O
a O O O O
correlated O O O O
random O O O O
walk O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
Sharks O O O O
can O O O O
perform O O O O
directed O O O O
walks O O O O
over O O O O
large O O O O
spatial O O O O
scales O O O O
, O O O O
with O O O O
scales O O O O
of O O O O
movements O O O O
reflecting O O O O
site O O O O
fidelity O O O O
and O O O O
home O O O O
range O O O O
size O O O O
. O O O O
    
Understanding O O O O
when O O O O
and O O O O
where O O O O
directed O O O O
walks O O O O
occur O O O O
is O O O O
crucial O O O O
for O O O O
developing O O O O
more O O O O
accurate O O O O
population O O O O
- O O O O
level O O O O
dispersal O O O O
models O O O O
. O O O O
    
El O O O O
Nino O O O O
in O O O O
the O O O O
warm O O O O
tropics O O O O
: O O O O
local O O O O
sea O O O O
temperature O O O O
predicts O O O O
breeding O O O O
parameters O O O O
and O O O O
growth O O O O
of O O O O
blue B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
footed O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
boobies O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
There O O O O
is O O O O
increasing O O O O
interest O O O O
in O O O O
the O O O O
impacts O O O O
of O O O O
El O O O O
Nino O O O O
Southern O O O O
Oscillation O O O O
( O O O O
ENSO O O O O
) O O O O
on O O O O
reproduction O O O O
of O O O O
apical O O O O
predators O O O O
such O O O O
as O O O O
seabirds O O O O
and O O O O
marine O O O O
mammals O O O O
. O O O O
    
Long O O O O
- O O O O
term O O O O
studies O O O O
documenting O O O O
ENSO O O O O
effects O O O O
on O O O O
reproduction O O O O
of O O O O
seabirds O O O O
in O O O O
the O O O O
warm O O O O
tropics O O O O
are O O O O
scarce O O O O
, O O O O
and O O O O
differential O O O O
sensitivity O O O O
of O O O O
breeding O O O O
parameters O O O O
to O O O O
ENSO O O O O
has O O O O
rarely O O O O
been O O O O
explored O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Analysis O O O O
of O O O O
18 O O O O
years O O O O
of O O O O
breeding O O O O
data O O O O
from O O O O
a O O O O
colony O O O O
of O O O O
the O O O O
blue B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
footed O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
booby O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Sula B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nebouxii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Milne O O O O
- O O O O
Edwards O O O O
) O O O O
showed O O O O
a O O O O
delay O O O O
in O O O O
onset O O O O
of O O O O
breeding O O O O
when O O O O
the O O O O
global O O O O
Southern O O O O
Oscillation O O O O
Index O O O O
was O O O O
negative O O O O
; O O O O
each O O O O
unit O O O O
of O O O O
the O O O O
atmospheric O O O O
pressure O O O O
differential O O O O
( O O O O
hPa O O O O
) O O O O
across O O O O
the O O O O
Pacific O O O O
Ocean O O O O
meant O O O O
a O O O O
delay O O O O
of O O O O
7 O O O O
days O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
ENSO O O O O
conditions O O O O
also O O O O
produced O O O O
declines O O O O
in O O O O
breeding O O O O
participation O O O O
, O O O O
clutch O O O O
size O O O O
, O O O O
brood O O O O
size O O O O
, O O O O
hatching O O O O
success O O O O
and O O O O
fledging O O O O
success O O O O
, O O O O
especially O O O O
when O O O O
surface O O O O
waters O O O O
surrounding O O O O
the O O O O
colony O O O O
were O O O O
warmer O O O O
during O O O O
winter O O O O
and O O O O
spring O O O O
. O O O O
    
Each O O O O
additional O O O O
degree O O O O
( O O O O
^ O O O O
0C O O O O
) O O O O
of O O O O
water O O O O
temperature O O O O
produced O O O O
a O O O O
reduction O O O O
of O O O O
0 O O O O
. O O O O
45 O O O O
fledglings O O O O
per O O O O
nest O O O O
. O O O O
    
Different O O O O
breeding O O O O
parameters O O O O
were O O O O
sensitive O O O O
to O O O O
ENSO O O O O
indices O O O O
in O O O O
different O O O O
blocks O O O O
of O O O O
months O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Warming O O O O
of O O O O
local O O O O
waters O O O O
during O O O O
the O O O O
winter O O O O
was O O O O
associated O O O O
with O O O O
decline O O O O
in O O O O
ocean O O O O
productivity O O O O
in O O O O
the O O O O
current O O O O
year O O O O
and O O O O
the O O O O
following O O O O
year O O O O
, O O O O
consistent O O O O
with O O O O
ENSO O O O O
impacts O O O O
on O O O O
breeding O O O O
parameters O O O O
being O O O O
mediated O O O O
by O O O O
effects O O O O
on O O O O
local O O O O
productivity O O O O
and O O O O
prey O O O O
availability O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
there O O O O
was O O O O
no O O O O
evidence O O O O
of O O O O
lagged O O O O
effects O O O O
of O O O O
ENSO O O O O
on O O O O
any O O O O
breeding O O O O
parameter O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Comparison O O O O
of O O O O
5 O O O O
years O O O O
revealed O O O O
that O O O O
when O O O O
local O O O O
surface O O O O
waters O O O O
were O O O O
warm O O O O
, O O O O
chicks O O O O
grew O O O O
more O O O O
slowly O O O O
, O O O O
but O O O O
no O O O O
effects O O O O
of O O O O
ENSO O O O O
on O O O O
weight O O O O
and O O O O
size O O O O
of O O O O
eggs O O O O
were O O O O
evident O O O O
in O O O O
data O O O O
of O O O O
9 O O O O
and O O O O
7 O O O O
years O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
findings O O O O
extend O O O O
evidence O O O O
of O O O O
impacts O O O O
of O O O O
ENSO O O O O
on O O O O
seabird O O O O
reproduction O O O O
to O O O O
the O O O O
eastern O O O O
tropical O O O O
Pacific O O O O
and O O O O
indicate O O O O
that O O O O
several O O O O
breeding O O O O
parameters O O O O
of O O O O
blue B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
footed O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
boobies O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
but O O O O
not O O O O
egg O O O O
size O O O O
) O O O O
are O O O O
affected O O O O
in O O O O
the O O O O
short O O O O
term O O O O
by O O O O
ENSO O O O O
conditions O O O O
, O O O O
particularly O O O O
by O O O O
local O O O O
anomalies O O O O
in O O O O
sea O O O O
surface O O O O
temperature O O O O
associated O O O O
with O O O O
decline O O O O
in O O O O
ocean O O O O
productivity O O O O
. O O O O
    
Partial O O O O
diel O O O O
vertical O O O O
migrations O O O O
in O O O O
pelagic O O O O
fish O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Field O O O O
studies O O O O
on O O O O
diel O O O O
vertical O O O O
migration O O O O
( O O O O
DVM O O O O
) O O O O
usually O O O O
report O O O O
uniform O O O O
behaviour O O O O
with O O O O
population O O O O
- O O O O
wide O O O O
ascents O O O O
and O O O O
descents O O O O
during O O O O
crepuscular O O O O
periods O O O O
. O O O O
    
This O O O O
contrasts O O O O
partial O O O O
seasonal O O O O
migrations O O O O
of O O O O
many O O O O
animal O O O O
populations O O O O
, O O O O
where O O O O
individuals O O O O
choose O O O O
either O O O O
the O O O O
resident O O O O
or O O O O
the O O O O
migrant O O O O
strategy O O O O
depending O O O O
on O O O O
population O O O O
density O O O O
, O O O O
feeding O O O O
opportunity O O O O
and O O O O
predation O O O O
risk O O O O
in O O O O
the O O O O
resident O O O O
and O O O O
migrant O O O O
habitats O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
tested O O O O
whether O O O O
DVM O O O O
of O O O O
freshwater O O O O
zooplanktivorous O O O O
fish O O O O
( O O O O
Coregonus O O O O
spp O O O O
. O O O O
) O O O O
resembles O O O O
partial O O O O
migrations O O O O
. O O O O
    
Twenty O O O O
- O O O O
eight O O O O
hydroacoustic O O O O
surveys O O O O
were O O O O
performed O O O O
in O O O O
the O O O O
deep O O O O
Lake O O O O
Stechlin O O O O
( O O O O
Germany O O O O
) O O O O
between O O O O
2000 O O O O
and O O O O
2010 O O O O
, O O O O
with O O O O
samplings O O O O
encompassing O O O O
all O O O O
months O O O O
between O O O O
March O O O O
and O O O O
December O O O O
. O O O O
    
Zooplankton O O O O
samples O O O O
were O O O O
simultaneously O O O O
taken O O O O
in O O O O
epilimnetic O O O O
and O O O O
hypolimnetic O O O O
layers O O O O
. O O O O
    
Fish O O O O
obtained O O O O
from O O O O
depth O O O O
- O O O O
stratified O O O O
samplings O O O O
by O O O O
a O O O O
midwater O O O O
trawl O O O O
were O O O O
used O O O O
to O O O O
test O O O O
for O O O O
individual O O O O
differences O O O O
between O O O O
residents O O O O
and O O O O
migrants O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
show O O O O
for O O O O
the O O O O
first O O O O
time O O O O
that O O O O
DVMs O O O O
of O O O O
freshwater O O O O
fish O O O O
resemble O O O O
patterns O O O O
of O O O O
partial O O O O
migrations O O O O
often O O O O
found O O O O
in O O O O
seasonal O O O O
environments O O O O
. O O O O
    
Across O O O O
all O O O O
samplings O O O O
, O O O O
7 O O O O
- O O O O
33 O O O O
% O O O O
of O O O O
fish O O O O
did O O O O
not O O O O
ascend O O O O
at O O O O
dusk O O O O
, O O O O
but O O O O
exhibited O O O O
the O O O O
resident O O O O
strategy O O O O
. O O O O
    
The O O O O
proportion O O O O
or O O O O
residents O O O O
increased O O O O
at O O O O
low O O O O
zooplankton O O O O
feeding O O O O
rates O O O O
in O O O O
the O O O O
daytime O O O O
habitat O O O O
and O O O O
during O O O O
months O O O O
when O O O O
the O O O O
temperature O O O O
difference O O O O
between O O O O
daytime O O O O
and O O O O
night O O O O
- O O O O
time O O O O
habitats O O O O
was O O O O
minor O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Slightly O O O O
larger O O O O
size O O O O
and O O O O
higher O O O O
caloric O O O O
density O O O O
of O O O O
migrants O O O O
over O O O O
residents O O O O
in O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
coexisting O O O O
Coregonus O O O O
species O O O O
suggested O O O O
that O O O O
individual O O O O
differences O O O O
contributed O O O O
to O O O O
the O O O O
migration O O O O
strategy O O O O
performed O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
these O O O O
results O O O O
were O O O O
based O O O O
on O O O O
one O O O O
sample O O O O
only O O O O
, O O O O
and O O O O
extrapolation O O O O
to O O O O
the O O O O
entire O O O O
data O O O O
set O O O O
is O O O O
not O O O O
possible O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
are O O O O
indirect O O O O
evidence O O O O
that O O O O
the O O O O
balance O O O O
between O O O O
migrants O O O O
and O O O O
residents O O O O
may O O O O
primarily O O O O
depend O O O O
on O O O O
the O O O O
trade O O O O
- O O O O
off O O O O
between O O O O
feeding O O O O
gains O O O O
and O O O O
metabolic O O O O
and O O O O
predation O O O O
costs O O O O
of O O O O
migration O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
results O O O O
also O O O O
suggest O O O O
that O O O O
the O O O O
global O O O O
fitness O O O O
consequences O O O O
for O O O O
the O O O O
resident O O O O
and O O O O
migrant O O O O
strategies O O O O
may O O O O
not O O O O
be O O O O
identical O O O O
, O O O O
rendering O O O O
the O O O O
importance O O O O
of O O O O
individual O O O O
traits O O O O
in O O O O
the O O O O
' O O O O
decision O O O O
to O O O O
migrate O O O O
' O O O O
likely O O O O
. O O O O
    
Clinical O O O O
management O O O O
of O O O O
Staphylococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aureus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bacteraemia O O O O
. O O O O
    
Staphylococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aureus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bacteraemia O O O O
is O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
most O O O O
common O O O O
serious O O O O
bacterial O O O O
infections O O O O
worldwide O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
UK O O O O
alone O O O O
, O O O O
around O O O O
12 O O O O
, O O O O
500 O O O O
cases O O O O
each O O O O
year O O O O
are O O O O
reported O O O O
, O O O O
with O O O O
an O O O O
associated O O O O
mortality O O O O
of O O O O
about O O O O
30 O O O O
% O O O O
, O O O O
yet O O O O
the O O O O
evidence O O O O
guiding O O O O
optimum O O O O
management O O O O
is O O O O
poor O O O O
. O O O O
    
To O O O O
date O O O O
, O O O O
fewer O O O O
than O O O O
1500 O O O O
patients O O O O
with O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aureus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bacteraemia O O O O
have O O O O
been O O O O
recruited O O O O
to O O O O
16 O O O O
controlled O O O O
trials O O O O
of O O O O
antimicrobial O O O O
therapy O O O O
. O O O O
    
Consequently O O O O
, O O O O
clinical O O O O
practice O O O O
is O O O O
driven O O O O
by O O O O
the O O O O
results O O O O
of O O O O
observational O O O O
studies O O O O
and O O O O
anecdote O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
propose O O O O
and O O O O
review O O O O
ten O O O O
unanswered O O O O
clinical O O O O
questions O O O O
commonly O O O O
posed O O O O
by O O O O
those O O O O
managing O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aureus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bacteraemia O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
findings O O O O
define O O O O
the O O O O
major O O O O
areas O O O O
of O O O O
uncertainty O O O O
in O O O O
the O O O O
management O O O O
of O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aureus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bacteraemia O O O O
and O O O O
highlight O O O O
just O O O O
two O O O O
key O O O O
principles O O O O
. O O O O
    
First O O O O
, O O O O
all O O O O
infective O O O O
foci O O O O
must O O O O
be O O O O
identified O O O O
and O O O O
removed O O O O
as O O O O
soon O O O O
as O O O O
possible O O O O
. O O O O
    
Second O O O O
, O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
antimicrobial O O O O
therapy O O O O
is O O O O
required O O O O
for O O O O
those O O O O
with O O O O
persistent O O O O
bacteraemia O O O O
or O O O O
a O O O O
deep O O O O
, O O O O
irremovable O O O O
focus O O O O
. O O O O
    
Beyond O O O O
this O O O O
, O O O O
the O O O O
best O O O O
drugs O O O O
, O O O O
dose O O O O
, O O O O
mode O O O O
of O O O O
delivery O O O O
, O O O O
and O O O O
duration O O O O
of O O O O
therapy O O O O
are O O O O
uncertain O O O O
, O O O O
a O O O O
situation O O O O
compounded O O O O
by O O O O
emerging O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aureus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strains O O O O
that O O O O
are O O O O
resistant O O O O
to O O O O
old O O O O
and O O O O
new O O O O
antibiotics O O O O
. O O O O
    
We O O O O
discuss O O O O
the O O O O
consequences O O O O
on O O O O
clinical O O O O
practice O O O O
, O O O O
and O O O O
how O O O O
these O O O O
findings O O O O
define O O O O
the O O O O
agenda O O O O
for O O O O
future O O O O
clinical O O O O
research O O O O
. O O O O
    
Seasonal O O O O
influenza O O O O
epidemiology O O O O
in O O O O
sub O O O O
- O O O O
Saharan O O O O
Africa O O O O
: O O O O
a O O O O
systematic O O O O
review O O O O
. O O O O
    
Acute O O O O
respiratory O O O O
infection O O O O
( O O O O
ARI O O O O
) O O O O
is O O O O
a O O O O
leading O O O O
cause O O O O
of O O O O
mortality O O O O
worldwide O O O O
, O O O O
of O O O O
which O O O O
influenza O O O O
is O O O O
an O O O O
important O O O O
cause O O O O
that O O O O
can O O O O
be O O O O
prevented O O O O
with O O O O
vaccination O O O O
. O O O O
    
We O O O O
did O O O O
a O O O O
systematic O O O O
review O O O O
of O O O O
research O O O O
published O O O O
from O O O O
1980 O O O O
to O O O O
2009 O O O O
on O O O O
seasonal O O O O
influenza O O O O
epidemiology O O O O
in O O O O
sub O O O O
- O O O O
Saharan O O O O
Africa O O O O
to O O O O
identify O O O O
data O O O O
strengths O O O O
and O O O O
weaknesses O O O O
that O O O O
might O O O O
affect O O O O
policy O O O O
decisions O O O O
, O O O O
to O O O O
assess O O O O
the O O O O
state O O O O
of O O O O
knowledge O O O O
on O O O O
influenza O O O O
disease O O O O
burden O O O O
, O O O O
and O O O O
to O O O O
ascertain O O O O
unique O O O O
features O O O O
of O O O O
influenza O O O O
epidemiology O O O O
in O O O O
the O O O O
region O O O O
. O O O O
    
We O O O O
assessed O O O O
1203 O O O O
papers O O O O
, O O O O
reviewed O O O O
104 O O O O
, O O O O
and O O O O
included O O O O
49 O O O O
articles O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
- O O O O
25 O O O O
% O O O O
of O O O O
outpatient O O O O
ARI O O O O
visits O O O O
were O O O O
caused O O O O
by O O O O
influenza O O O O
( O O O O
11 O O O O
studies O O O O
; O O O O
mean O O O O
9 O O O O
* O O O O
5 O O O O
% O O O O
; O O O O
median O O O O
10 O O O O
% O O O O
) O O O O
, O O O O
whereas O O O O
0 O O O O
* O O O O
6 O O O O
- O O O O
15 O O O O
* O O O O
6 O O O O
% O O O O
of O O O O
children O O O O
admitted O O O O
to O O O O
hospital O O O O
for O O O O
ARI O O O O
had O O O O
influenza O O O O
identified O O O O
( O O O O
15 O O O O
studies O O O O
; O O O O
mean O O O O
6 O O O O
* O O O O
6 O O O O
% O O O O
; O O O O
median O O O O
6 O O O O
* O O O O
3 O O O O
% O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Influenza O O O O
was O O O O
highly O O O O
seasonal O O O O
in O O O O
southern O O O O
Africa O O O O
. O O O O
    
Other O O O O
data O O O O
were O O O O
often O O O O
absent O O O O
, O O O O
particularly O O O O
direct O O O O
measurement O O O O
of O O O O
influenza O O O O
incidence O O O O
rates O O O O
for O O O O
all O O O O
ages O O O O
, O O O O
within O O O O
different O O O O
patient O O O O
settings O O O O
( O O O O
outpatient O O O O
, O O O O
inpatient O O O O
, O O O O
community O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
for O O O O
all O O O O
countries O O O O
. O O O O
    
Data O O O O
from O O O O
sub O O O O
- O O O O
Saharan O O O O
Africa O O O O
are O O O O
insufficient O O O O
to O O O O
allow O O O O
most O O O O
countries O O O O
to O O O O
prioritise O O O O
strategies O O O O
for O O O O
influenza O O O O
prevention O O O O
and O O O O
control O O O O
. O O O O
    
Key O O O O
data O O O O
gaps O O O O
include O O O O
incidence O O O O
and O O O O
case O O O O
- O O O O
fatality O O O O
ratios O O O O
for O O O O
all O O O O
ages O O O O
, O O O O
the O O O O
contribution O O O O
of O O O O
influenza O O O O
towards O O O O
admission O O O O
of O O O O
adults O O O O
to O O O O
hospital O O O O
for O O O O
ARI O O O O
, O O O O
representative O O O O
seasonality O O O O
data O O O O
, O O O O
economic O O O O
burden O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
interaction O O O O
of O O O O
influenza O O O O
with O O O O
prevalent O O O O
disorders O O O O
in O O O O
Africa O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
malaria O O O O
, O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
and O O O O
malnutrition O O O O
. O O O O
    
Population O O O O
biological O O O O
principles O O O O
of O O O O
drug O O O O
- O O O O
resistance O O O O
evolution O O O O
in O O O O
infectious O O O O
diseases O O O O
. O O O O
    
The O O O O
emergence O O O O
of O O O O
resistant O O O O
pathogens O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
selection O O O O
pressure O O O O
by O O O O
drugs O O O O
and O O O O
their O O O O
possible O O O O
disappearance O O O O
when O O O O
drug O O O O
use O O O O
is O O O O
discontinued O O O O
are O O O O
evolutionary O O O O
processes O O O O
common O O O O
to O O O O
many O O O O
pathogens O O O O
. O O O O
    
Population O O O O
biological O O O O
models O O O O
have O O O O
been O O O O
used O O O O
to O O O O
study O O O O
the O O O O
dynamics O O O O
of O O O O
resistance O O O O
in O O O O
viruses O O O O
, O O O O
bacteria O O O O
, O O O O
and O O O O
eukaryotic O O O O
microparasites O O O O
both O O O O
at O O O O
the O O O O
level O O O O
of O O O O
the O O O O
individual O O O O
treated O O O O
host O O O O
and O O O O
of O O O O
the O O O O
treated O O O O
host O O O O
population O O O O
. O O O O
    
Despite O O O O
the O O O O
existence O O O O
of O O O O
generic O O O O
features O O O O
that O O O O
underlie O O O O
such O O O O
evolutionary O O O O
dynamics O O O O
, O O O O
different O O O O
conclusions O O O O
have O O O O
been O O O O
reached O O O O
about O O O O
the O O O O
key O O O O
factors O O O O
affecting O O O O
the O O O O
rate O O O O
of O O O O
resistance O O O O
evolution O O O O
and O O O O
how O O O O
to O O O O
best O O O O
use O O O O
drugs O O O O
to O O O O
minimise O O O O
the O O O O
risk O O O O
of O O O O
generating O O O O
high O O O O
levels O O O O
of O O O O
resistance O O O O
. O O O O
    
Improved O O O O
understanding O O O O
of O O O O
generic O O O O
versus O O O O
specific O O O O
population O O O O
biological O O O O
aspects O O O O
will O O O O
help O O O O
to O O O O
translate O O O O
results O O O O
between O O O O
different O O O O
studies O O O O
, O O O O
and O O O O
allow O O O O
development O O O O
of O O O O
a O O O O
more O O O O
rational O O O O
basis O O O O
for O O O O
sustainable O O O O
drug O O O O
use O O O O
than O O O O
exists O O O O
at O O O O
present O O O O
. O O O O
    
Guidelines O O O O
for O O O O
hospital O O O O
- O O O O
acquired O O O O
pneumonia O O O O
and O O O O
health O O O O
- O O O O
care O O O O
- O O O O
associated O O O O
pneumonia O O O O
: O O O O
a O O O O
vulnerability O O O O
, O O O O
a O O O O
pitfall O O O O
, O O O O
and O O O O
a O O O O
fatal O O O O
flaw O O O O
. O O O O
    
The O O O O
2005 O O O O
American O O O O
Thoracic O O O O
Society O O O O
and O O O O
Infectious O O O O
Disease O O O O
Society O O O O
of O O O O
America O O O O
' O O O O
s O O O O
guidelines O O O O
for O O O O
pneumonia O O O O
introduced O O O O
the O O O O
new O O O O
category O O O O
of O O O O
health O O O O
- O O O O
care O O O O
- O O O O
associated O O O O
pneumonia O O O O
, O O O O
which O O O O
increased O O O O
the O O O O
number O O O O
of O O O O
people O O O O
to O O O O
whom O O O O
the O O O O
guidelines O O O O
for O O O O
multidrug O O O O
- O O O O
resistant O O O O
pathogens O O O O
applied O O O O
. O O O O
    
Three O O O O
fundamental O O O O
issues O O O O
inherent O O O O
in O O O O
the O O O O
definition O O O O
of O O O O
hospital O O O O
- O O O O
acquired O O O O
pneumonia O O O O
and O O O O
health O O O O
- O O O O
care O O O O
- O O O O
associated O O O O
pneumonia O O O O
undermined O O O O
the O O O O
credibility O O O O
of O O O O
these O O O O
guidelines O O O O
and O O O O
the O O O O
applicability O O O O
of O O O O
their O O O O
recommendations O O O O
: O O O O
a O O O O
vulnerability O O O O
, O O O O
a O O O O
pitfall O O O O
, O O O O
and O O O O
a O O O O
fatal O O O O
flaw O O O O
. O O O O
    
The O O O O
vulnerability O O O O
is O O O O
the O O O O
extreme O O O O
heterogeneity O O O O
of O O O O
the O O O O
population O O O O
of O O O O
patients O O O O
. O O O O
    
The O O O O
fatal O O O O
flaw O O O O
is O O O O
the O O O O
failure O O O O
to O O O O
accurately O O O O
diagnose O O O O
hospital O O O O
- O O O O
acquired O O O O
pneumonia O O O O
and O O O O
ventilator O O O O
- O O O O
associated O O O O
pneumonia O O O O
; O O O O
inability O O O O
to O O O O
distinguish O O O O
colonisation O O O O
from O O O O
infection O O O O
in O O O O
respiratory O O O O
- O O O O
tract O O O O
cultures O O O O
renders O O O O
the O O O O
guidelines O O O O
inherently O O O O
unstable O O O O
. O O O O
    
The O O O O
pitfall O O O O
is O O O O
spiralling O O O O
empiricism O O O O
of O O O O
antibiotic O O O O
use O O O O
for O O O O
severely O O O O
ill O O O O
patients O O O O
in O O O O
whom O O O O
infection O O O O
might O O O O
not O O O O
be O O O O
present O O O O
. O O O O
    
A O O O O
vicious O O O O
circle O O O O
of O O O O
antibiotic O O O O
overuse O O O O
leading O O O O
to O O O O
emergence O O O O
of O O O O
resistant O O O O
microflora O O O O
can O O O O
become O O O O
established O O O O
, O O O O
leading O O O O
to O O O O
unnecessary O O O O
use O O O O
of O O O O
empirical O O O O
broad O O O O
- O O O O
spectrum O O O O
combination O O O O
antibiotics O O O O
and O O O O
increased O O O O
mortality O O O O
. O O O O
    
Controlled O O O O
studies O O O O
now O O O O
show O O O O
that O O O O
administration O O O O
of O O O O
broad O O O O
- O O O O
spectrum O O O O
combination O O O O
antibiotic O O O O
therapy O O O O
can O O O O
lead O O O O
to O O O O
increased O O O O
mortality O O O O
in O O O O
uninfected O O O O
patients O O O O
. O O O O
    
Proposed O O O O
solutions O O O O
include O O O O
the O O O O
use O O O O
of O O O O
individualised O O O O
assessment O O O O
of O O O O
patients O O O O
. O O O O
    
Health O O O O
- O O O O
care O O O O
- O O O O
associated O O O O
pneumonia O O O O
should O O O O
be O O O O
broken O O O O
down O O O O
into O O O O
several O O O O
distinct O O O O
subgroups O O O O
so O O O O
narrow O O O O
- O O O O
spectrum O O O O
antibiotic O O O O
therapy O O O O
can O O O O
be O O O O
used O O O O
. O O O O
    
Emphasis O O O O
should O O O O
be O O O O
placed O O O O
on O O O O
defining O O O O
the O O O O
microbial O O O O
cause O O O O
of O O O O
the O O O O
pneumonia O O O O
rather O O O O
than O O O O
reflex O O O O
administration O O O O
of O O O O
empirical O O O O
combination O O O O
therapy O O O O
. O O O O
    
Alzheimer O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
. O O O O
    
An O O O O
estimated O O O O
24 O O O O
million O O O O
people O O O O
worldwide O O O O
have O O O O
dementia O O O O
, O O O O
the O O O O
majority O O O O
of O O O O
whom O O O O
are O O O O
thought O O O O
to O O O O
have O O O O
Alzheimer O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
Alzheimer O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
represents O O O O
a O O O O
major O O O O
public O O O O
health O O O O
concern O O O O
and O O O O
has O O O O
been O O O O
identified O O O O
as O O O O
a O O O O
research O O O O
priority O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
there O O O O
are O O O O
licensed O O O O
treatments O O O O
that O O O O
can O O O O
alleviate O O O O
symptoms O O O O
of O O O O
Alzheimer O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
, O O O O
there O O O O
is O O O O
a O O O O
pressing O O O O
need O O O O
to O O O O
improve O O O O
our O O O O
understanding O O O O
of O O O O
pathogenesis O O O O
to O O O O
enable O O O O
development O O O O
of O O O O
disease O O O O
- O O O O
modifying O O O O
treatments O O O O
. O O O O
    
Methods O O O O
for O O O O
improving O O O O
diagnosis O O O O
are O O O O
also O O O O
moving O O O O
forward O O O O
, O O O O
but O O O O
a O O O O
better O O O O
consensus O O O O
is O O O O
needed O O O O
for O O O O
development O O O O
of O O O O
a O O O O
panel O O O O
of O O O O
biological O O O O
and O O O O
neuroimaging O O O O
biomarkers O O O O
that O O O O
support O O O O
clinical O O O O
diagnosis O O O O
. O O O O
    
There O O O O
is O O O O
now O O O O
strong O O O O
evidence O O O O
of O O O O
potential O O O O
risk O O O O
and O O O O
protective O O O O
factors O O O O
for O O O O
Alzheimer O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
, O O O O
dementia O O O O
, O O O O
and O O O O
cognitive O O O O
decline O O O O
, O O O O
but O O O O
further O O O O
work O O O O
is O O O O
needed O O O O
to O O O O
understand O O O O
these O O O O
better O O O O
and O O O O
to O O O O
establish O O O O
whether O O O O
interventions O O O O
can O O O O
substantially O O O O
lower O O O O
these O O O O
risks O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
Seminar O O O O
, O O O O
we O O O O
provide O O O O
an O O O O
overview O O O O
of O O O O
recent O O O O
evidence O O O O
regarding O O O O
the O O O O
epidemiology O O O O
, O O O O
pathogenesis O O O O
, O O O O
diagnosis O O O O
, O O O O
and O O O O
treatment O O O O
of O O O O
Alzheimer O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
, O O O O
and O O O O
discuss O O O O
potential O O O O
ways O O O O
to O O O O
reduce O O O O
the O O O O
risk O O O O
of O O O O
developing O O O O
the O O O O
disease O O O O
. O O O O
    
Serum O O O O
c O O O O
testing O O O O
in O O O O
patients O O O O
with O O O O
HER2 O O O O
- O O O O
positive O O O O
breast O O O O
cancer O O O O
: O O O O
the O O O O
death O O O O
knell O O O O
tolls O O O O
. O O O O
    
Determination O O O O
of O O O O
the O O O O
human O O O O
epidermal O O O O
growth O O O O
factor O O O O
receptor O O O O
2 O O O O
( O O O O
HER2 O O O O
; O O O O
also O O O O
known O O O O
as O O O O
ERBB2 O O O O
) O O O O
status O O O O
of O O O O
breast O O O O
tumours O O O O
is O O O O
emphasised O O O O
in O O O O
various O O O O
national O O O O
guidelines O O O O
as O O O O
a O O O O
necessary O O O O
step O O O O
for O O O O
the O O O O
diagnosis O O O O
of O O O O
breast O O O O
cancer O O O O
. O O O O
    
As O O O O
an O O O O
alternative O O O O
to O O O O
tissue O O O O
- O O O O
based O O O O
diagnostic O O O O
methods O O O O
, O O O O
there O O O O
has O O O O
been O O O O
substantial O O O O
interest O O O O
in O O O O
the O O O O
establishment O O O O
of O O O O
an O O O O
easily O O O O
accessible O O O O
serum O O O O
- O O O O
based O O O O
alternative O O O O
that O O O O
could O O O O
be O O O O
used O O O O
for O O O O
prognosis O O O O
and O O O O
diagnosis O O O O
. O O O O
    
Detection O O O O
of O O O O
serum O O O O
- O O O O
soluble O O O O
- O O O O
HER2 O O O O
extracellular O O O O
domain O O O O
( O O O O
ECD O O O O
) O O O O
and O O O O
establishment O O O O
of O O O O
its O O O O
potential O O O O
clinical O O O O
usefulness O O O O
has O O O O
created O O O O
much O O O O
debate O O O O
. O O O O
    
We O O O O
assessed O O O O
whether O O O O
identification O O O O
of O O O O
circulating O O O O
concentrations O O O O
of O O O O
HER2 O O O O
ECD O O O O
have O O O O
clinical O O O O
usefulness O O O O
for O O O O
management O O O O
of O O O O
patients O O O O
with O O O O
HER2 O O O O
- O O O O
positive O O O O
breast O O O O
cancer O O O O
. O O O O
    
We O O O O
examined O O O O
data O O O O
from O O O O
63 O O O O
studies O O O O
of O O O O
patients O O O O
with O O O O
breast O O O O
cancer O O O O
. O O O O
    
Prevalence O O O O
of O O O O
increased O O O O
concentrations O O O O
varied O O O O
greatly O O O O
between O O O O
studies O O O O
. O O O O
    
Some O O O O
studies O O O O
showed O O O O
significant O O O O
associations O O O O
between O O O O
raised O O O O
concentrations O O O O
and O O O O
poor O O O O
prognosis O O O O
, O O O O
poor O O O O
response O O O O
to O O O O
treatments O O O O
including O O O O
trastuzumab O O O O
, O O O O
or O O O O
tumour O O O O
characteristics O O O O
associated O O O O
with O O O O
aggressive O O O O
disease O O O O
, O O O O
whereas O O O O
others O O O O
did O O O O
not O O O O
. O O O O
    
Examination O O O O
of O O O O
existing O O O O
data O O O O
showed O O O O
that O O O O
concentrations O O O O
of O O O O
HER2 O O O O
ECD O O O O
are O O O O
not O O O O
consistently O O O O
related O O O O
to O O O O
patient O O O O
outcomes O O O O
; O O O O
therefore O O O O
, O O O O
there O O O O
is O O O O
insufficient O O O O
evidence O O O O
to O O O O
support O O O O
the O O O O
clinical O O O O
use O O O O
of O O O O
serum O O O O
HER2 O O O O
ECD O O O O
testing O O O O
. O O O O
    
Design O O O O
and O O O O
execution O O O O
of O O O O
future O O O O
large O O O O
- O O O O
scale O O O O
trials O O O O
to O O O O
investigate O O O O
the O O O O
clinical O O O O
use O O O O
of O O O O
HER2 O O O O
ECD O O O O
testing O O O O
, O O O O
in O O O O
view O O O O
of O O O O
the O O O O
progressive O O O O
non O O O O
- O O O O
supportive O O O O
evidence O O O O
, O O O O
is O O O O
not O O O O
recommended O O O O
. O O O O
    
Oncologists O O O O
should O O O O
continue O O O O
to O O O O
adhere O O O O
to O O O O
national O O O O
guidelines O O O O
for O O O O
determining O O O O
HER2 O O O O
status O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
oncologists O O O O
should O O O O
continue O O O O
to O O O O
use O O O O
clinical O O O O
parameters O O O O
when O O O O
making O O O O
decisions O O O O
about O O O O
initiation O O O O
, O O O O
continuation O O O O
, O O O O
and O O O O
discontinuation O O O O
of O O O O
HER2 O O O O
- O O O O
targeted O O O O
treatments O O O O
. O O O O
    
Breast O O O O
- O O O O
cancer O O O O
early O O O O
detection O O O O
in O O O O
low O O O O
- O O O O
income O O O O
and O O O O
middle O O O O
- O O O O
income O O O O
countries O O O O
: O O O O
do O O O O
what O O O O
you O O O O
can O O O O
versus O O O O
one O O O O
size O O O O
fits O O O O
all O O O O
. O O O O
    
In O O O O
general O O O O
, O O O O
rates O O O O
of O O O O
breast O O O O
cancer O O O O
are O O O O
lower O O O O
in O O O O
low O O O O
- O O O O
income O O O O
and O O O O
middle O O O O
- O O O O
income O O O O
countries O O O O
( O O O O
LMCs O O O O
) O O O O
than O O O O
they O O O O
are O O O O
in O O O O
more O O O O
industrialised O O O O
countries O O O O
of O O O O
North O O O O
America O O O O
and O O O O
Europe O O O O
. O O O O
    
This O O O O
lower O O O O
incidence O O O O
means O O O O
that O O O O
screening O O O O
programmes O O O O
aimed O O O O
at O O O O
early O O O O
detection O O O O
in O O O O
asymptomatic O O O O
women O O O O
would O O O O
have O O O O
a O O O O
lower O O O O
yield O O O O
- O O O O
- O O O O
ie O O O O
, O O O O
substantially O O O O
more O O O O
women O O O O
would O O O O
need O O O O
to O O O O
be O O O O
examined O O O O
to O O O O
find O O O O
a O O O O
true O O O O
case O O O O
of O O O O
breast O O O O
cancer O O O O
. O O O O
    
Because O O O O
the O O O O
average O O O O
age O O O O
of O O O O
breast O O O O
cancer O O O O
is O O O O
generally O O O O
younger O O O O
in O O O O
LMCs O O O O
, O O O O
it O O O O
has O O O O
been O O O O
suggested O O O O
that O O O O
breast O O O O
- O O O O
cancer O O O O
screening O O O O
programmes O O O O
begin O O O O
at O O O O
an O O O O
earlier O O O O
age O O O O
in O O O O
these O O O O
settings O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
younger O O O O
average O O O O
age O O O O
of O O O O
breast O O O O
cancer O O O O
is O O O O
mainly O O O O
driven O O O O
by O O O O
the O O O O
age O O O O
distribution O O O O
of O O O O
the O O O O
population O O O O
, O O O O
and O O O O
fewer O O O O
older O O O O
women O O O O
with O O O O
breast O O O O
cancer O O O O
, O O O O
rather O O O O
than O O O O
by O O O O
higher O O O O
age O O O O
- O O O O
specific O O O O
incidence O O O O
rates O O O O
in O O O O
younger O O O O
women O O O O
. O O O O
    
Resources O O O O
in O O O O
LMCs O O O O
might O O O O
be O O O O
better O O O O
used O O O O
to O O O O
raise O O O O
awareness O O O O
and O O O O
encourage O O O O
more O O O O
women O O O O
with O O O O
palpable O O O O
breast O O O O
lumps O O O O
to O O O O
seek O O O O
and O O O O
receive O O O O
treatment O O O O
in O O O O
a O O O O
timely O O O O
manner O O O O
. O O O O
    
Towards O O O O
a O O O O
conceptual O O O O
framework O O O O
to O O O O
support O O O O
one O O O O
- O O O O
health O O O O
research O O O O
for O O O O
policy O O O O
on O O O O
emerging O O O O
zoonoses O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
past O O O O
two O O O O
decades O O O O
there O O O O
has O O O O
been O O O O
a O O O O
growing O O O O
realisation O O O O
that O O O O
the O O O O
livestock O O O O
sector O O O O
was O O O O
in O O O O
a O O O O
process O O O O
of O O O O
change O O O O
, O O O O
resulting O O O O
from O O O O
an O O O O
expansion O O O O
of O O O O
intensive O O O O
animal O O O O
production O O O O
systems O O O O
and O O O O
trade O O O O
to O O O O
meet O O O O
a O O O O
globalised O O O O
world O O O O
' O O O O
s O O O O
increasing O O O O
demand O O O O
for O O O O
livestock O O O O
products O O O O
. O O O O
    
One O O O O
unintended O O O O
consequence O O O O
has O O O O
been O O O O
the O O O O
emergence O O O O
and O O O O
spread O O O O
of O O O O
transboundary O O O O
animal O O O O
diseases O O O O
and O O O O
, O O O O
more O O O O
specifically O O O O
, O O O O
the O O O O
resurgence O O O O
and O O O O
emergence O O O O
of O O O O
zoonotic O O O O
diseases O O O O
. O O O O
    
Concurrent O O O O
with O O O O
changes O O O O
in O O O O
the O O O O
livestock O O O O
sector O O O O
, O O O O
contact O O O O
with O O O O
wildlife O O O O
has O O O O
increased O O O O
. O O O O
    
This O O O O
development O O O O
has O O O O
increased O O O O
the O O O O
risk O O O O
of O O O O
transmission O O O O
of O O O O
infections O O O O
from O O O O
wildlife O O O O
to O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
beings O O O O
and O O O O
livestock O O O O
. O O O O
    
Two O O O O
overarching O O O O
questions O O O O
arise O O O O
with O O O O
respect O O O O
to O O O O
the O O O O
real O O O O
and O O O O
perceived O O O O
threat O O O O
from O O O O
emerging O O O O
infectious O O O O
diseases O O O O
: O O O O
why O O O O
are O O O O
these O O O O
problems O O O O
arising O O O O
with O O O O
increasing O O O O
frequency O O O O
, O O O O
and O O O O
how O O O O
should O O O O
we O O O O
manage O O O O
and O O O O
control O O O O
them O O O O
? O O O O
    
A O O O O
clear O O O O
conceptual O O O O
research O O O O
framework O O O O
can O O O O
provide O O O O
a O O O O
guide O O O O
to O O O O
ensure O O O O
a O O O O
research O O O O
strategy O O O O
that O O O O
coherently O O O O
links O O O O
to O O O O
the O O O O
overarching O O O O
goals O O O O
of O O O O
policy O O O O
makers O O O O
. O O O O
    
We O O O O
propose O O O O
such O O O O
a O O O O
new O O O O
framework O O O O
in O O O O
support O O O O
of O O O O
a O O O O
research O O O O
and O O O O
policy O O O O
- O O O O
generation O O O O
strategy O O O O
to O O O O
help O O O O
to O O O O
address O O O O
the O O O O
challenges O O O O
posed O O O O
by O O O O
emerging O O O O
zoonoses O O O O
. O O O O
    
Compartmentalization O O O O
of O O O O
a O O O O
glycolytic O O O O
enzyme O O O O
in O O O O
Diplonema O O O O
, O O O O
a O O O O
non O O O O
- O O O O
kinetoplastid O O O O
euglenozoan O O O O
. O O O O
    
Glycosomes O O O O
are O O O O
peroxisome O O O O
- O O O O
related O O O O
organelles O O O O
containing O O O O
glycolytic O O O O
enzymes O O O O
that O O O O
have O O O O
been O O O O
found O O O O
only O O O O
in O O O O
kinetoplastids O O O O
. O O O O
    
We O O O O
show O O O O
here O O O O
that O O O O
a O O O O
glycolytic O O O O
enzyme O O O O
is O O O O
compartmentalized O O O O
in O O O O
diplonemids O O O O
, O O O O
the O O O O
sister O O O O
group O O O O
of O O O O
kinetoplastids O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
that O O O O
, O O O O
similar O O O O
to O O O O
kinetoplastid O O O O
aldolases O O O O
, O O O O
the O O O O
fructose O O O O
1 O O O O
, O O O O
6 O O O O
- O O O O
bisphosphate O O O O
aldolase O O O O
of O O O O
Diplonema B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
papillatum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
possesses O O O O
a O O O O
type O O O O
2 O O O O
- O O O O
peroxisomal O O O O
targeting O O O O
signal O O O O
. O O O O
    
Western O O O O
blotting O O O O
showed O O O O
that O O O O
this O O O O
aldolase O O O O
was O O O O
present O O O O
predominantly O O O O
in O O O O
the O O O O
membrane O O O O
/ O O O O
organellar O O O O
fraction O O O O
. O O O O
    
Immunofluorescence O O O O
analysis O O O O
showed O O O O
that O O O O
this O O O O
aldolase O O O O
had O O O O
a O O O O
scattered O O O O
distribution O O O O
in O O O O
the O O O O
cytosol O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
its O O O O
compartmentalization O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
, O O O O
orotidine O O O O
- O O O O
5 O O O O
' O O O O
- O O O O
monophosphate O O O O
decarboxylase O O O O
, O O O O
a O O O O
non O O O O
- O O O O
glycolytic O O O O
glycosomal O O O O
enzyme O O O O
in O O O O
kinetoplastids O O O O
, O O O O
was O O O O
shown O O O O
to O O O O
be O O O O
a O O O O
cytosolic O O O O
enzyme O O O O
in O O O O
D B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
papillatum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Since O O O O
euglenoids O O O O
, O O O O
the O O O O
earliest O O O O
diverging O O O O
branch O O O O
of O O O O
Euglenozoa O O O O
, O O O O
do O O O O
not O O O O
possess O O O O
glycolytic O O O O
compartments O O O O
, O O O O
these O O O O
findings O O O O
suggest O O O O
that O O O O
the O O O O
routing O O O O
of O O O O
glycolytic O O O O
enzymes O O O O
into O O O O
peroxisomes O O O O
may O O O O
have O O O O
occurred O O O O
in O O O O
a O O O O
common O O O O
ancestor O O O O
of O O O O
diplonemids O O O O
and O O O O
kinetoplastids O O O O
, O O O O
followed O O O O
by O O O O
diversification O O O O
of O O O O
these O O O O
newly O O O O
established O O O O
organelles O O O O
in O O O O
each O O O O
of O O O O
these O O O O
euglenozoan O O O O
lineages O O O O
. O O O O
    
Responses O O O O
of O O O O
the O O O O
pea B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aphid O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
transcriptome O O O O
to O O O O
infection O O O O
by O O O O
facultative O O O O
symbionts O O O O
. O O O O
    
Serratia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
symbiotica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
a O O O O
facultative O O O O
symbiont O O O O
of O O O O
pea B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aphids O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Acyrthosiphon B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pisum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
that O O O O
provides O O O O
tolerance O O O O
to O O O O
heat O O O O
stress O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
the O O O O
phenotypic O O O O
effects O O O O
of O O O O
facultative O O O O
symbionts O O O O
upon O O O O
hosts O O O O
have O O O O
been O O O O
studied O O O O
in O O O O
some O O O O
detail O O O O
, O O O O
little O O O O
is O O O O
known O O O O
about O O O O
the O O O O
molecular O O O O
and O O O O
genomic O O O O
basis O O O O
of O O O O
these O O O O
interactions O O O O
. O O O O
    
Previous O O O O
studies O O O O
show O O O O
a O O O O
large O O O O
impact O O O O
of O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
symbiotica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
upon O O O O
the O O O O
aphid O O O O
metabolome O O O O
. O O O O
    
Whole O O O O
- O O O O
genome O O O O
transcriptional O O O O
profiling O O O O
and O O O O
next O O O O
- O O O O
generation O O O O
sequencing O O O O
demonstrated O O O O
expression O O O O
of O O O O
94 O O O O
% O O O O
of O O O O
RefSeq O O O O
genes O O O O
from O O O O
the O O O O
pea B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aphid O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
genome O O O O
, O O O O
providing O O O O
the O O O O
largest O O O O
dataset O O O O
to O O O O
date O O O O
on O O O O
aphid O O O O
gene O O O O
expression O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
only O O O O
28 O O O O
genes O O O O
showed O O O O
changes O O O O
in O O O O
expression O O O O
with O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
symbiotica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
infection O O O O
, O O O O
and O O O O
these O O O O
changes O O O O
were O O O O
of O O O O
small O O O O
magnitude O O O O
. O O O O
    
No O O O O
expression O O O O
differences O O O O
in O O O O
genes O O O O
involved O O O O
in O O O O
innate O O O O
immunity O O O O
in O O O O
other O O O O
insects O O O O
were O O O O
observed O O O O
. O O O O
    
Therefore O O O O
, O O O O
the O O O O
large O O O O
metabolic O O O O
impact O O O O
of O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
symbiotica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
most O O O O
likely O O O O
a O O O O
result O O O O
of O O O O
metabolism O O O O
of O O O O
the O O O O
symbiont O O O O
itself O O O O
, O O O O
or O O O O
of O O O O
post O O O O
- O O O O
transcriptional O O O O
modification O O O O
of O O O O
host O O O O
gene O O O O
expression O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
symbiotica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
has O O O O
a O O O O
major O O O O
influence O O O O
on O O O O
its O O O O
host O O O O
' O O O O
s O O O O
metabolome O O O O
and O O O O
resistance O O O O
to O O O O
heat O O O O
, O O O O
it O O O O
induces O O O O
little O O O O
change O O O O
in O O O O
gene O O O O
expression O O O O
in O O O O
its O O O O
host O O O O
. O O O O
    
Molecular O O O O
cloning O O O O
and O O O O
characterization O O O O
of O O O O
a O O O O
thioredoxin O O O O
peroxidase O O O O
gene O O O O
from O O O O
Apis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cerana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cerana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Thioredoxin O O O O
peroxidases O O O O
( O O O O
Tpxs O O O O
) O O O O
play O O O O
important O O O O
roles O O O O
in O O O O
protecting O O O O
organisms O O O O
against O O O O
the O O O O
toxicity O O O O
of O O O O
reactive O O O O
oxygen O O O O
species O O O O
( O O O O
ROS O O O O
) O O O O
and O O O O
regulating O O O O
intracellular O O O O
signal O O O O
transduction O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
present O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
cloned O O O O
the O O O O
full O O O O
cDNA O O O O
of O O O O
Tpx1 O O O O
encoding O O O O
a O O O O
195 O O O O
- O O O O
amino O O O O
acid O O O O
protein O O O O
from O O O O
Apis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cerana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cerana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Acc O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Based O O O O
on O O O O
the O O O O
genomic O O O O
DNA O O O O
sequence O O O O
, O O O O
a O O O O
1442 O O O O
- O O O O
bp O O O O
5 O O O O
' O O O O
- O O O O
flanking O O O O
region O O O O
was O O O O
obtained O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
putative O O O O
transcription O O O O
factor O O O O
binding O O O O
sites O O O O
were O O O O
predicted O O O O
. O O O O
    
Quantitative O O O O
PCR O O O O
analysis O O O O
showed O O O O
that O O O O
AccTpx1 O O O O
was O O O O
highly O O O O
expressed O O O O
in O O O O
thorax O O O O
and O O O O
that O O O O
the O O O O
AccTpx1 O O O O
transcript O O O O
reached O O O O
its O O O O
highest O O O O
level O O O O
in O O O O
two O O O O
- O O O O
week O O O O
- O O O O
old O O O O
adult O O O O
worker B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
honeybees O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Moreover O O O O
, O O O O
expression O O O O
of O O O O
the O O O O
AccTpx1 O O O O
transcript O O O O
was O O O O
increased O O O O
by O O O O
various O O O O
abiotic O O O O
stresses O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
ultraviolet O O O O
light O O O O
, O O O O
HgCl O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
insecticide O O O O
treatments O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
, O O O O
the O O O O
recombinant O O O O
AccTpx1 O O O O
protein O O O O
exhibited O O O O
antioxidant O O O O
activity O O O O
; O O O O
it O O O O
removed O O O O
hydrogen O O O O
peroxide O O O O
and O O O O
protected O O O O
DNA O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
AccTpx1 O O O O
plays O O O O
an O O O O
important O O O O
role O O O O
in O O O O
protecting O O O O
honeybees B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
from O O O O
oxidative O O O O
injury O O O O
and O O O O
may O O O O
act O O O O
in O O O O
extending O O O O
the O O O O
lifespan O O O O
of O O O O
them O O O O
. O O O O
    
Predation O O O O
and O O O O
patchiness O O O O
in O O O O
the O O O O
tropical O O O O
litter O O O O
: O O O O
do O O O O
swarm O O O O
- O O O O
raiding O O O O
army O O O O
ants O O O O
skim O O O O
the O O O O
cream O O O O
or O O O O
drain O O O O
the O O O O
bottle O O O O
? O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Swarm O O O O
- O O O O
raiding O O O O
army O O O O
ants O O O O
have O O O O
long O O O O
been O O O O
considered O O O O
as O O O O
episodic O O O O
, O O O O
catastrophic O O O O
agents O O O O
of O O O O
disturbance O O O O
in O O O O
the O O O O
tropical O O O O
litter O O O O
, O O O O
but O O O O
few O O O O
quantitative O O O O
data O O O O
exist O O O O
on O O O O
their O O O O
diets O O O O
, O O O O
preferences O O O O
, O O O O
and O O O O
, O O O O
critically O O O O
, O O O O
their O O O O
ability O O O O
to O O O O
deplete O O O O
prey O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
provide O O O O
such O O O O
data O O O O
for O O O O
two O O O O
common O O O O
species O O O O
of O O O O
swarm O O O O
raiders O O O O
broadly O O O O
sympatric O O O O
throughout O O O O
the O O O O
Neotropics O O O O
: O O O O
the O O O O
iconic O O O O
Eciton B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
burchellii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
the O O O O
more O O O O
secretive O O O O
, O O O O
less O O O O
studied O O O O
Labidus O O O O
praedator O O O O
. O O O O
    
In O O O O
Ecuador O O O O
, O O O O
Costa O O O O
Rica O O O O
, O O O O
Venezuela O O O O
and O O O O
Panama O O O O
, O O O O
patches O O O O
of O O O O
forest O O O O
floor O O O O
were O O O O
sampled O O O O
for O O O O
litter O O O O
invertebrates O O O O
immediately O O O O
before O O O O
and O O O O
after O O O O
army O O O O
ant O O O O
raids O O O O
. O O O O
    
These O O O O
invertebrates O O O O
have O O O O
been O O O O
shown O O O O
to O O O O
regulate O O O O
decomposition O O O O
and O O O O
vary O O O O
100 O O O O
- O O O O
fold O O O O
in O O O O
local O O O O
densities O O O O
across O O O O
the O O O O
forest O O O O
floor O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Contrary O O O O
to O O O O
Eciton O O O O
' O O O O
s O O O O
popular O O O O
image O O O O
, O O O O
only O O O O
Labidus O O O O
consistently O O O O
reduced O O O O
the O O O O
biomass O O O O
of O O O O
litter O O O O
invertebrates O O O O
and O O O O
only O O O O
then O O O O
by O O O O
an O O O O
average O O O O
of O O O O
25 O O O O
% O O O O
. O O O O
    
Eciton O O O O
' O O O O
s O O O O
impacts O O O O
were O O O O
concentrated O O O O
on O O O O
rich O O O O
patches O O O O
of O O O O
invertebrates O O O O
, O O O O
while O O O O
Labidus O O O O
prey O O O O
depletion O O O O
showed O O O O
no O O O O
such O O O O
density O O O O
dependence O O O O
. O O O O
    
Labidus O O O O
reduced O O O O
the O O O O
biomass O O O O
of O O O O
some O O O O
invertebrates O O O O
- O O O O
isopods O O O O
, O O O O
larviforms O O O O
and O O O O
coleoptera O O O O
- O O O O
by O O O O
up O O O O
to O O O O
75 O O O O
% O O O O
; O O O O
Eciton O O O O
showed O O O O
no O O O O
such O O O O
prey O O O O
preferences O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
Eciton O O O O
specializes O O O O
on O O O O
high O O O O
biomass O O O O
patches O O O O
, O O O O
while O O O O
Labidus O O O O
feeds O O O O
profitably O O O O
from O O O O
any O O O O
litter O O O O
patch O O O O
. O O O O
    
Combined O O O O
, O O O O
these O O O O
swarm O O O O
raiders O O O O
sum O O O O
to O O O O
be O O O O
chronic O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
catastrophic O O O O
, O O O O
predators O O O O
of O O O O
common O O O O
litter O O O O
invertebrates O O O O
of O O O O
the O O O O
brown O O O O
food O O O O
web O O O O
. O O O O
    
Community O O O O
- O O O O
wide O O O O
character O O O O
displacement O O O O
in O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
clines O O O O
: O O O O
a O O O O
test O O O O
of O O O O
Holarctic O O O O
weasel O O O O
guilds O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Competition O O O O
is O O O O
thought O O O O
to O O O O
be O O O O
a O O O O
major O O O O
influence O O O O
on O O O O
community O O O O
assembly O O O O
, O O O O
ecology O O O O
and O O O O
evolution O O O O
; O O O O
presence O O O O
of O O O O
competitors O O O O
may O O O O
cause O O O O
divergence O O O O
in O O O O
traits O O O O
related O O O O
to O O O O
resource O O O O
use O O O O
( O O O O
character O O O O
displacement O O O O
) O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Such O O O O
traits O O O O
, O O O O
however O O O O
, O O O O
often O O O O
vary O O O O
clinally O O O O
, O O O O
and O O O O
this O O O O
phenomenon O O O O
may O O O O
be O O O O
independent O O O O
of O O O O
the O O O O
presence O O O O
or O O O O
absence O O O O
of O O O O
competing O O O O
species O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
presence O O O O
of O O O O
such O O O O
clines O O O O
can O O O O
either O O O O
obscure O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
competition O O O O
, O O O O
or O O O O
create O O O O
an O O O O
impression O O O O
that O O O O
competition O O O O
is O O O O
operating O O O O
when O O O O
, O O O O
in O O O O
fact O O O O
, O O O O
it O O O O
is O O O O
not O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
corrected O O O O
for O O O O
clinal O O O O
variation O O O O
while O O O O
testing O O O O
for O O O O
character O O O O
displacement O O O O
in O O O O
two O O O O
well O O O O
- O O O O
studied O O O O
weasel O O O O
( O O O O
Mustela O O O O
) O O O O
guilds O O O O
, O O O O
in O O O O
the O O O O
Nearctic O O O O
and O O O O
the O O O O
west O O O O
Palaearctic O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Without O O O O
accounting O O O O
for O O O O
clines O O O O
, O O O O
our O O O O
results O O O O
agreed O O O O
with O O O O
previous O O O O
studies O O O O
suggesting O O O O
character O O O O
displacement O O O O
in O O O O
these O O O O
guilds O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
when O O O O
we O O O O
corrected O O O O
for O O O O
clines O O O O
, O O O O
predictions O O O O
of O O O O
competition O O O O
theory O O O O
were O O O O
not O O O O
met O O O O
- O O O O
and O O O O
often O O O O
we O O O O
obtained O O O O
evidence O O O O
for O O O O
character O O O O
convergence O O O O
in O O O O
sympatry O O O O
. O O O O
    
7 O O O O
. O O O O
    
This O O O O
may O O O O
suggest O O O O
that O O O O
the O O O O
nature O O O O
of O O O O
the O O O O
resource O O O O
base O O O O
may O O O O
be O O O O
more O O O O
important O O O O
than O O O O
interspecific O O O O
competition O O O O
in O O O O
shaping O O O O
morphology O O O O
and O O O O
size O O O O
in O O O O
these O O O O
carnivores O O O O
. O O O O
    
8 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
highlight O O O O
the O O O O
need O O O O
to O O O O
account O O O O
for O O O O
geographic O O O O
variation O O O O
when O O O O
studying O O O O
character O O O O
displacement O O O O
and O O O O
cast O O O O
some O O O O
doubt O O O O
on O O O O
prevailing O O O O
ideas O O O O
regarding O O O O
the O O O O
effect O O O O
of O O O O
competition O O O O
on O O O O
morphological O O O O
evolution O O O O
. O O O O
    
Agrobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tumefasciens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O O O O
mediated O O O O
transformation O O O O
of O O O O
the O O O O
aquatic O O O O
fungus O O O O
Blastocladiella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
emersonii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Agrobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tumefaciens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
widely O O O O
used O O O O
for O O O O
plant O O O O
DNA O O O O
transformation O O O O
and O O O O
more O O O O
recently O O O O
, O O O O
has O O O O
also O O O O
been O O O O
used O O O O
to O O O O
transform O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
filamentous O O O O
fungi O O O O
and O O O O
even O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cells O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
this O O O O
technique O O O O
, O O O O
we O O O O
developed O O O O
the O O O O
first O O O O
transformation O O O O
protocol O O O O
for O O O O
the O O O O
saprobic O O O O
aquatic O O O O
fungus O O O O
Blastocladiella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
emersonii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
a O O O O
Blastocladiomycete O O O O
localized O O O O
at O O O O
the O O O O
base O O O O
of O O O O
fungal O O O O
phylogenetic O O O O
tree O O O O
, O O O O
which O O O O
has O O O O
been O O O O
shown O O O O
as O O O O
a O O O O
promising O O O O
and O O O O
interesting O O O O
model O O O O
of O O O O
study O O O O
of O O O O
cellular O O O O
function O O O O
and O O O O
differentiation O O O O
. O O O O
    
We O O O O
constructed O O O O
binary O O O O
T O O O O
- O O O O
DNA O O O O
vectors O O O O
containing O O O O
hygromycin O O O O
phosphotransferase O O O O
( O O O O
hph O O O O
) O O O O
or O O O O
enhanced O O O O
green O O O O
fluorescent O O O O
protein O O O O
( O O O O
egfp O O O O
) O O O O
genes O O O O
, O O O O
under O O O O
the O O O O
control O O O O
of O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
trpC O O O O
promoter O O O O
and O O O O
terminator O O O O
sequences O O O O
. O O O O
    
24 O O O O
h O O O O
of O O O O
co O O O O
- O O O O
cultivation O O O O
in O O O O
induction O O O O
medium O O O O
( O O O O
IM O O O O
) O O O O
agar O O O O
plates O O O O
, O O O O
followed O O O O
by O O O O
transfer O O O O
to O O O O
PYG O O O O
- O O O O
agar O O O O
plates O O O O
containing O O O O
cefotaxim O O O O
to O O O O
kill O O O O
Agrobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tumefsciens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
hygromycin O O O O
to O O O O
select O O O O
transformants O O O O
, O O O O
resulted O O O O
in O O O O
growth O O O O
and O O O O
sporulation O O O O
of O O O O
resistant O O O O
transformants O O O O
. O O O O
    
Genomic O O O O
DNA O O O O
from O O O O
the O O O O
pool O O O O
o O O O O
resistant O O O O
zoospores O O O O
were O O O O
shown O O O O
to O O O O
contain O O O O
T O O O O
- O O O O
DNA O O O O
insertion O O O O
as O O O O
evidenced O O O O
by O O O O
PCR O O O O
amplification O O O O
of O O O O
hph O O O O
gene O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
a O O O O
similar O O O O
protocol O O O O
we O O O O
could O O O O
also O O O O
evidence O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
enhanced O O O O
green O O O O
fluorescent O O O O
protein O O O O
( O O O O
EGFP O O O O
) O O O O
in O O O O
zoospores O O O O
derived O O O O
from O O O O
transformed O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
This O O O O
protocol O O O O
can O O O O
also O O O O
open O O O O
new O O O O
perspectives O O O O
for O O O O
other O O O O
non O O O O
- O O O O
transformable O O O O
closely O O O O
related O O O O
fungi O O O O
, O O O O
like O O O O
the O O O O
Chytridiomycete O O O O
class O O O O
. O O O O
    
Chronic O O O O
pancreatitis O O O O
. O O O O
    
Chronic O O O O
pancreatitis O O O O
is O O O O
a O O O O
progressive O O O O
fibroinflammatory O O O O
disease O O O O
that O O O O
exists O O O O
in O O O O
large O O O O
- O O O O
duct O O O O
( O O O O
often O O O O
with O O O O
intraductal O O O O
calculi O O O O
) O O O O
or O O O O
small O O O O
- O O O O
duct O O O O
form O O O O
. O O O O
    
In O O O O
many O O O O
patients O O O O
this O O O O
disease O O O O
results O O O O
from O O O O
a O O O O
complex O O O O
mix O O O O
of O O O O
environmental O O O O
( O O O O
eg O O O O
, O O O O
alcohol O O O O
, O O O O
cigarettes O O O O
, O O O O
and O O O O
occupational O O O O
chemicals O O O O
) O O O O
and O O O O
genetic O O O O
factors O O O O
( O O O O
eg O O O O
, O O O O
mutation O O O O
in O O O O
a O O O O
trypsin O O O O
- O O O O
controlling O O O O
gene O O O O
or O O O O
the O O O O
cystic O O O O
fibrosis O O O O
transmembrane O O O O
conductance O O O O
regulator O O O O
) O O O O
; O O O O
a O O O O
few O O O O
patients O O O O
have O O O O
hereditary O O O O
or O O O O
autoimmune O O O O
disease O O O O
. O O O O
    
Pain O O O O
in O O O O
the O O O O
form O O O O
of O O O O
recurrent O O O O
attacks O O O O
of O O O O
pancreatitis O O O O
( O O O O
representing O O O O
paralysis O O O O
of O O O O
apical O O O O
exocytosis O O O O
in O O O O
acinar O O O O
cells O O O O
) O O O O
or O O O O
constant O O O O
and O O O O
disabling O O O O
pain O O O O
is O O O O
usually O O O O
the O O O O
main O O O O
symptom O O O O
. O O O O
    
Management O O O O
of O O O O
the O O O O
pain O O O O
is O O O O
mainly O O O O
empirical O O O O
, O O O O
involving O O O O
potent O O O O
analgesics O O O O
, O O O O
duct O O O O
drainage O O O O
by O O O O
endoscopic O O O O
or O O O O
surgical O O O O
means O O O O
, O O O O
and O O O O
partial O O O O
or O O O O
total O O O O
pancreatectomy O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
steroids O O O O
rapidly O O O O
reduce O O O O
symptoms O O O O
in O O O O
patients O O O O
with O O O O
autoimmune O O O O
pancreatitis O O O O
, O O O O
and O O O O
micronutrient O O O O
therapy O O O O
to O O O O
correct O O O O
electrophilic O O O O
stress O O O O
is O O O O
emerging O O O O
as O O O O
a O O O O
promising O O O O
treatment O O O O
in O O O O
the O O O O
other O O O O
patients O O O O
. O O O O
    
Steatorrhoea O O O O
, O O O O
diabetes O O O O
, O O O O
local O O O O
complications O O O O
, O O O O
and O O O O
psychosocial O O O O
issues O O O O
associated O O O O
with O O O O
the O O O O
disease O O O O
are O O O O
additional O O O O
therapeutic O O O O
challenges O O O O
. O O O O
    
Occurrence O O O O
of O O O O
the O O O O
lobose O O O O
testate O O O O
amoeba O O O O
Pseudonebela O O O O
africana O O O O
( O O O O
Amoebozoa O O O O
, O O O O
Arcellinida O O O O
) O O O O
in O O O O
the O O O O
Brazilian O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
cerrado O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
. O O O O
    
Flagship O O O O
species O O O O
are O O O O
defined O O O O
as O O O O
microbial O O O O
eukaryote O O O O
species O O O O
with O O O O
characteristic O O O O
morphologies O O O O
and O O O O
restricted O O O O
geographic O O O O
distributions O O O O
. O O O O
    
These O O O O
are O O O O
proposed O O O O
as O O O O
ideal O O O O
systems O O O O
to O O O O
elucidate O O O O
patterns O O O O
of O O O O
geographical O O O O
distribution O O O O
in O O O O
microbial O O O O
eukaryotes O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
present O O O O
new O O O O
records O O O O
of O O O O
the O O O O
putative O O O O
flagship O O O O
species O O O O
Pseudonebela O O O O
africana O O O O
, O O O O
a O O O O
lobose O O O O
testate O O O O
amoeba O O O O
( O O O O
Arcellinida O O O O
) O O O O
characterized O O O O
by O O O O
a O O O O
cross O O O O
or O O O O
clover O O O O
- O O O O
shaped O O O O
aperture O O O O
and O O O O
geographic O O O O
distribution O O O O
previously O O O O
believed O O O O
to O O O O
be O O O O
restricted O O O O
to O O O O
Africa O O O O
. O O O O
    
We O O O O
have O O O O
sampled O O O O
P O O O O
. O O O O
africana O O O O
from O O O O
5 O O O O
separate O O O O
ponds O O O O
in O O O O
the O O O O
Central O O O O
and O O O O
Southwest O O O O
Brazillian O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
cerrado O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
, O O O O
and O O O O
characterized O O O O
individuals O O O O
both O O O O
by O O O O
light O O O O
and O O O O
electron O O O O
microscopy O O O O
. O O O O
    
We O O O O
provide O O O O
a O O O O
brief O O O O
description O O O O
to O O O O
facilitate O O O O
further O O O O
studies O O O O
on O O O O
this O O O O
poorly O O O O
understood O O O O
taxon O O O O
, O O O O
and O O O O
show O O O O
that O O O O
light O O O O
microscopy O O O O
is O O O O
sufficient O O O O
for O O O O
identification O O O O
, O O O O
an O O O O
important O O O O
feature O O O O
for O O O O
ecological O O O O
and O O O O
biogeographical O O O O
studies O O O O
. O O O O
    
Comparing O O O O
isotopic O O O O
niche O O O O
widths O O O O
among O O O O
and O O O O
within O O O O
communities O O O O
: O O O O
SIBER O O O O
- O O O O
Stable O O O O
Isotope O O O O
Bayesian O O O O
Ellipses O O O O
in O O O O
R O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
use O O O O
of O O O O
stable O O O O
isotope O O O O
data O O O O
to O O O O
infer O O O O
characteristics O O O O
of O O O O
community O O O O
structure O O O O
and O O O O
niche O O O O
width O O O O
of O O O O
community O O O O
members O O O O
has O O O O
become O O O O
increasingly O O O O
common O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
these O O O O
developments O O O O
have O O O O
provided O O O O
ecologists O O O O
with O O O O
new O O O O
perspectives O O O O
, O O O O
their O O O O
full O O O O
impact O O O O
has O O O O
been O O O O
hampered O O O O
by O O O O
an O O O O
inability O O O O
to O O O O
statistically O O O O
compare O O O O
individual O O O O
communities O O O O
using O O O O
descriptive O O O O
metrics O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
solve O O O O
these O O O O
issues O O O O
by O O O O
reformulating O O O O
the O O O O
metrics O O O O
in O O O O
a O O O O
Bayesian O O O O
framework O O O O
. O O O O
    
This O O O O
reformulation O O O O
takes O O O O
account O O O O
of O O O O
uncertainty O O O O
in O O O O
the O O O O
sampled O O O O
data O O O O
and O O O O
naturally O O O O
incorporates O O O O
error O O O O
arising O O O O
from O O O O
the O O O O
sampling O O O O
process O O O O
, O O O O
propagating O O O O
it O O O O
through O O O O
to O O O O
the O O O O
derived O O O O
metrics O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
we O O O O
develop O O O O
novel O O O O
multivariate O O O O
ellipse O O O O
- O O O O
based O O O O
metrics O O O O
as O O O O
an O O O O
alternative O O O O
to O O O O
the O O O O
currently O O O O
employed O O O O
Convex O O O O
Hull O O O O
methods O O O O
when O O O O
applied O O O O
to O O O O
single O O O O
community O O O O
members O O O O
. O O O O
    
We O O O O
show O O O O
that O O O O
unlike O O O O
Convex O O O O
Hulls O O O O
, O O O O
the O O O O
ellipses O O O O
are O O O O
unbiased O O O O
with O O O O
respect O O O O
to O O O O
sample O O O O
size O O O O
, O O O O
and O O O O
their O O O O
estimation O O O O
via O O O O
Bayesian O O O O
inference O O O O
allows O O O O
robust O O O O
comparison O O O O
to O O O O
be O O O O
made O O O O
among O O O O
data O O O O
sets O O O O
comprising O O O O
different O O O O
sample O O O O
sizes O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
These O O O O
new O O O O
metrics O O O O
, O O O O
which O O O O
we O O O O
call O O O O
SIBER O O O O
( O O O O
Stable O O O O
Isotope O O O O
Bayesian O O O O
Ellipses O O O O
in O O O O
R O O O O
) O O O O
, O O O O
open O O O O
up O O O O
more O O O O
avenues O O O O
for O O O O
direct O O O O
comparison O O O O
of O O O O
isotopic O O O O
niches O O O O
across O O O O
communities O O O O
. O O O O
    
The O O O O
computational O O O O
code O O O O
to O O O O
calculate O O O O
the O O O O
new O O O O
metrics O O O O
is O O O O
implemented O O O O
in O O O O
the O O O O
free O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
download O O O O
package O O O O
Stable O O O O
Isotope O O O O
Analysis O O O O
for O O O O
the O O O O
R O O O O
statistical O O O O
environment O O O O
. O O O O
    
The O O O O
role O O O O
of O O O O
body O O O O
mass O O O O
in O O O O
diet O O O O
contiguity O O O O
and O O O O
food O O O O
- O O O O
web O O O O
structure O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
idea O O O O
that O O O O
species O O O O
occupy O O O O
distinct O O O O
niches O O O O
is O O O O
a O O O O
fundamental O O O O
concept O O O O
in O O O O
ecology O O O O
. O O O O
    
Classically O O O O
, O O O O
the O O O O
niche O O O O
was O O O O
described O O O O
as O O O O
an O O O O
n O O O O
- O O O O
dimensional O O O O
hypervolume O O O O
where O O O O
each O O O O
dimension O O O O
represents O O O O
a O O O O
biotic O O O O
or O O O O
abiotic O O O O
characteristic O O O O
. O O O O
    
More O O O O
recently O O O O
, O O O O
it O O O O
has O O O O
been O O O O
hypothesised O O O O
that O O O O
a O O O O
single O O O O
dimension O O O O
may O O O O
be O O O O
sufficient O O O O
to O O O O
explain O O O O
the O O O O
system O O O O
- O O O O
level O O O O
organization O O O O
of O O O O
trophic O O O O
interactions O O O O
observed O O O O
between O O O O
species O O O O
in O O O O
a O O O O
community O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
test O O O O
the O O O O
hypothesis O O O O
that O O O O
species O O O O
body O O O O
mass O O O O
is O O O O
that O O O O
single O O O O
dimension O O O O
. O O O O
    
Specifically O O O O
, O O O O
we O O O O
determine O O O O
how O O O O
the O O O O
intervality O O O O
of O O O O
food O O O O
webs O O O O
ordered O O O O
by O O O O
body O O O O
size O O O O
compares O O O O
to O O O O
that O O O O
of O O O O
randomly O O O O
ordered O O O O
food O O O O
webs O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
extend O O O O
this O O O O
analysis O O O O
beyond O O O O
the O O O O
community O O O O
level O O O O
to O O O O
the O O O O
effect O O O O
of O O O O
body O O O O
mass O O O O
in O O O O
explaining O O O O
the O O O O
diets O O O O
of O O O O
individual O O O O
species O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
conclude O O O O
that O O O O
body O O O O
mass O O O O
significantly O O O O
explains O O O O
the O O O O
ordering O O O O
of O O O O
species O O O O
and O O O O
the O O O O
contiguity O O O O
of O O O O
diets O O O O
in O O O O
empirical O O O O
communities O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
At O O O O
the O O O O
species O O O O
- O O O O
specific O O O O
level O O O O
, O O O O
we O O O O
find O O O O
that O O O O
the O O O O
degree O O O O
to O O O O
which O O O O
body O O O O
mass O O O O
is O O O O
a O O O O
significant O O O O
explanatory O O O O
variable O O O O
depends O O O O
strongly O O O O
on O O O O
the O O O O
phylogenetic O O O O
history O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
other O O O O
evolutionarily O O O O
conserved O O O O
traits O O O O
partly O O O O
account O O O O
for O O O O
species O O O O
' O O O O
roles O O O O
in O O O O
the O O O O
food O O O O
web O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
investigation O O O O
of O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
body O O O O
mass O O O O
in O O O O
food O O O O
webs O O O O
thus O O O O
helps O O O O
us O O O O
to O O O O
better O O O O
understand O O O O
the O O O O
important O O O O
features O O O O
of O O O O
community O O O O
food O O O O
- O O O O
web O O O O
structure O O O O
and O O O O
the O O O O
evolutionary O O O O
forces O O O O
that O O O O
have O O O O
led O O O O
us O O O O
to O O O O
the O O O O
communities O O O O
we O O O O
observe O O O O
. O O O O
    
Beyond O O O O
phytohaemagglutinin O O O O
: O O O O
assessing O O O O
vertebrate O O O O
immune O O O O
function O O O O
across O O O O
ecological O O O O
contexts O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Over O O O O
the O O O O
past O O O O
decade O O O O
, O O O O
there O O O O
has O O O O
been O O O O
a O O O O
substantial O O O O
increase O O O O
in O O O O
interest O O O O
in O O O O
the O O O O
immune O O O O
system O O O O
and O O O O
the O O O O
role O O O O
it O O O O
plays O O O O
in O O O O
the O O O O
regulation O O O O
of O O O O
disease O O O O
susceptibility O O O O
, O O O O
giving O O O O
rise O O O O
to O O O O
the O O O O
field O O O O
of O O O O
eco O O O O
- O O O O
immunology O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Eco O O O O
- O O O O
immunology O O O O
aims O O O O
to O O O O
understand O O O O
changes O O O O
in O O O O
host O O O O
immune O O O O
responses O O O O
in O O O O
the O O O O
broader O O O O
framework O O O O
of O O O O
an O O O O
organism O O O O
' O O O O
s O O O O
evolutionary O O O O
, O O O O
ecological O O O O
and O O O O
life O O O O
- O O O O
history O O O O
contexts O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
immune O O O O
system O O O O
, O O O O
however O O O O
, O O O O
is O O O O
complex O O O O
and O O O O
multifaceted O O O O
and O O O O
can O O O O
be O O O O
intimidating O O O O
for O O O O
the O O O O
nonimmunologist O O O O
interested O O O O
in O O O O
incorporating O O O O
immunological O O O O
questions O O O O
into O O O O
their O O O O
research O O O O
. O O O O
    
Which O O O O
immune O O O O
responses O O O O
should O O O O
one O O O O
measure O O O O
and O O O O
what O O O O
is O O O O
the O O O O
biological O O O O
significance O O O O
of O O O O
these O O O O
measures O O O O
? O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
focus O O O O
of O O O O
this O O O O
review O O O O
is O O O O
to O O O O
describe O O O O
a O O O O
wide O O O O
range O O O O
of O O O O
eco O O O O
- O O O O
immunology O O O O
techniques O O O O
, O O O O
from O O O O
the O O O O
simple O O O O
to O O O O
the O O O O
sophisticated O O O O
, O O O O
with O O O O
the O O O O
goal O O O O
of O O O O
providing O O O O
researchers O O O O
with O O O O
a O O O O
range O O O O
of O O O O
options O O O O
to O O O O
consider O O O O
incorporating O O O O
in O O O O
their O O O O
own O O O O
research O O O O
programs O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
These O O O O
techniques O O O O
were O O O O
chosen O O O O
because O O O O
they O O O O
provide O O O O
relatively O O O O
straightforward O O O O
, O O O O
biologically O O O O
meaningful O O O O
assessments O O O O
of O O O O
immune O O O O
function O O O O
, O O O O
many O O O O
of O O O O
which O O O O
can O O O O
be O O O O
performed O O O O
across O O O O
a O O O O
range O O O O
of O O O O
ecological O O O O
contexts O O O O
( O O O O
i O O O O
. O O O O
e O O O O
. O O O O
field O O O O
vs O O O O
. O O O O
laboratory O O O O
) O O O O
and O O O O
in O O O O
a O O O O
wide O O O O
range O O O O
of O O O O
vertebrate O O O O
animals O O O O
without O O O O
relying O O O O
on O O O O
species O O O O
- O O O O
specific O O O O
reagents O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
By O O O O
incorporating O O O O
assessments O O O O
of O O O O
immune O O O O
function O O O O
into O O O O
their O O O O
specific O O O O
research O O O O
questions O O O O
, O O O O
animal O O O O
ecologists O O O O
will O O O O
gain O O O O
a O O O O
more O O O O
comprehensive O O O O
understanding O O O O
of O O O O
organism O O O O
- O O O O
environment O O O O
interactions O O O O
. O O O O
    
Genome O O O O
- O O O O
wide O O O O
analysis O O O O
of O O O O
brain O O O O
transcriptional O O O O
changes O O O O
in O O O O
honey B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bee O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Apis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mellifera O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
L O O O O
. O O O O
) O O O O
queens O O O O
exposed O O O O
to O O O O
carbon O O O O
dioxide O O O O
and O O O O
physical O O O O
manipulation O O O O
. O O O O
    
Mating O O O O
is O O O O
a O O O O
complex O O O O
process O O O O
causing O O O O
many O O O O
behavioural O O O O
and O O O O
physiological O O O O
changes O O O O
, O O O O
but O O O O
the O O O O
factors O O O O
triggering O O O O
them O O O O
and O O O O
the O O O O
underlying O O O O
molecular O O O O
processes O O O O
are O O O O
not O O O O
well O O O O
characterized O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
present O O O O
study O O O O
we O O O O
examine O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
( O O O O
a O O O O
commonly O O O O
used O O O O
anaesthetic O O O O
in O O O O
instrumental O O O O
insemination O O O O
that O O O O
causes O O O O
changes O O O O
similar O O O O
to O O O O
those O O O O
occurring O O O O
after O O O O
mating O O O O
) O O O O
and O O O O
physical O O O O
manipulation O O O O
( O O O O
which O O O O
may O O O O
mimic O O O O
certain O O O O
aspects O O O O
of O O O O
copulation O O O O
) O O O O
on O O O O
the O O O O
behavioural O O O O
, O O O O
physiological O O O O
and O O O O
brain O O O O
transcriptional O O O O
changes O O O O
in O O O O
honey B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bee O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
queens O O O O
. O O O O
    
We O O O O
show O O O O
that O O O O
while O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
causes O O O O
cessation O O O O
of O O O O
mating O O O O
flights O O O O
and O O O O
ovary O O O O
activation O O O O
, O O O O
physical O O O O
manipulation O O O O
has O O O O
additional O O O O
effects O O O O
on O O O O
ovary O O O O
activation O O O O
and O O O O
brain O O O O
transcriptional O O O O
changes O O O O
. O O O O
    
Comparisons O O O O
with O O O O
previous O O O O
studies O O O O
of O O O O
honey B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bees O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
female O O O O
Drosophila B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
indicate O O O O
that O O O O
common O O O O
molecular O O O O
mechanisms O O O O
may O O O O
be O O O O
responsible O O O O
for O O O O
regulating O O O O
reproductive O O O O
changes O O O O
across O O O O
different O O O O
mating O O O O
regimes O O O O
and O O O O
insect O O O O
orders O O O O
. O O O O
    
Does O O O O
variation O O O O
in O O O O
movement O O O O
tactics O O O O
and O O O O
trophic O O O O
interactions O O O O
among O O O O
American B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
alligators O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
create O O O O
habitat O O O O
linkages O O O O
? O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Highly O O O O
mobile O O O O
top O O O O
predators O O O O
are O O O O
hypothesized O O O O
to O O O O
spatially O O O O
and O O O O
/ O O O O
or O O O O
temporally O O O O
link O O O O
disparate O O O O
habitats O O O O
through O O O O
the O O O O
combination O O O O
of O O O O
their O O O O
movement O O O O
and O O O O
feeding O O O O
patterns O O O O
, O O O O
but O O O O
recent O O O O
studies O O O O
suggest O O O O
that O O O O
individual O O O O
specialization O O O O
in O O O O
habitat O O O O
use O O O O
and O O O O
feeding O O O O
could O O O O
keep O O O O
habitats O O O O
compartmentalized O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
used O O O O
passive O O O O
acoustic O O O O
telemetry O O O O
and O O O O
stable O O O O
isotope O O O O
analysis O O O O
to O O O O
investigate O O O O
whether O O O O
specialization O O O O
in O O O O
movement O O O O
and O O O O
feeding O O O O
patterns O O O O
of O O O O
American B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
alligators O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Alligator B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mississippiensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
in O O O O
an O O O O
oligotrophic O O O O
subtropical O O O O
estuary O O O O
created O O O O
habitat O O O O
linkages O O O O
between O O O O
marine O O O O
and O O O O
estuarine O O O O
/ O O O O
freshwater O O O O
food O O O O
webs O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Individual O O O O
alligators O O O O
adopted O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
three O O O O
relatively O O O O
distinct O O O O
movement O O O O
tactics O O O O
that O O O O
were O O O O
linked O O O O
to O O O O
variation O O O O
in O O O O
diets O O O O
. O O O O
    
Fifty O O O O
- O O O O
six O O O O
per O O O O
cent O O O O
of O O O O
alligators O O O O
regularly O O O O
travelled O O O O
from O O O O
the O O O O
upstream O O O O
( O O O O
freshwater O O O O
/ O O O O
mid O O O O
- O O O O
estuary O O O O
) O O O O
areas O O O O
into O O O O
the O O O O
downstream O O O O
( O O O O
marine O O O O
- O O O O
influenced O O O O
) O O O O
areas O O O O
where O O O O
salinities O O O O
exceed O O O O
those O O O O
typically O O O O
tolerated O O O O
by O O O O
alligators O O O O
. O O O O
    
Thirty O O O O
- O O O O
one O O O O
per O O O O
cent O O O O
of O O O O
the O O O O
alligators O O O O
made O O O O
regular O O O O
trips O O O O
from O O O O
the O O O O
mid O O O O
- O O O O
estuarine O O O O
habitat O O O O
into O O O O
the O O O O
upstream O O O O
habitat O O O O
; O O O O
13 O O O O
% O O O O
remained O O O O
in O O O O
the O O O O
mid O O O O
- O O O O
estuary O O O O
zone O O O O
year O O O O
- O O O O
round O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Stable O O O O
isotopic O O O O
analysis O O O O
indicated O O O O
that O O O O
, O O O O
unlike O O O O
individuals O O O O
remaining O O O O
in O O O O
the O O O O
mid O O O O
- O O O O
estuary O O O O
and O O O O
upstream O O O O
zones O O O O
, O O O O
alligators O O O O
that O O O O
used O O O O
the O O O O
downstream O O O O
zone O O O O
fed O O O O
at O O O O
least O O O O
partially O O O O
from O O O O
marine O O O O
food O O O O
webs O O O O
and O O O O
likely O O O O
moved O O O O
to O O O O
access O O O O
higher O O O O
prey O O O O
abundance O O O O
at O O O O
the O O O O
expense O O O O
of O O O O
salt O O O O
stress O O O O
. O O O O
    
Therefore O O O O
, O O O O
' O O O O
commuting O O O O
' O O O O
alligators O O O O
may O O O O
link O O O O
marine O O O O
food O O O O
webs O O O O
with O O O O
those O O O O
of O O O O
the O O O O
estuary O O O O
and O O O O
marshes O O O O
in O O O O
the O O O O
coastal O O O O
Everglades O O O O
and O O O O
create O O O O
an O O O O
upstream O O O O
vector O O O O
for O O O O
allochthonous O O O O
nutrient O O O O
inputs O O O O
into O O O O
the O O O O
estuary O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
lends O O O O
further O O O O
support O O O O
to O O O O
the O O O O
hypothesis O O O O
that O O O O
large O O O O
- O O O O
bodied O O O O
highly O O O O
mobile O O O O
predators O O O O
faced O O O O
with O O O O
trade O O O O
- O O O O
offs O O O O
are O O O O
likely O O O O
to O O O O
exhibit O O O O
individual O O O O
specialization O O O O
leading O O O O
to O O O O
habitat O O O O
linkages O O O O
, O O O O
rather O O O O
than O O O O
compartmentalization O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
conditions O O O O
under O O O O
which O O O O
this O O O O
scenario O O O O
occurs O O O O
require O O O O
further O O O O
investigation O O O O
. O O O O
    
Relative O O O O
fitness O O O O
of O O O O
alternative O O O O
male O O O O
reproductive O O O O
tactics O O O O
in O O O O
a O O O O
mammal O O O O
varies O O O O
between O O O O
years O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
In O O O O
many O O O O
species O O O O
, O O O O
males O O O O
can O O O O
use O O O O
different O O O O
behavioural O O O O
tactics O O O O
to O O O O
achieve O O O O
fertilization O O O O
, O O O O
so O O O O
- O O O O
called O O O O
alternative O O O O
reproductive O O O O
tactics O O O O
( O O O O
ARTs O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Few O O O O
field O O O O
studies O O O O
have O O O O
measured O O O O
fitness O O O O
consequences O O O O
of O O O O
ARTs O O O O
under O O O O
varying O O O O
environmental O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
describe O O O O
fitness O O O O
consequences O O O O
of O O O O
three O O O O
phenotypically O O O O
plastic O O O O
ARTs O O O O
in O O O O
the O O O O
African B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
striped O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
mouse O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Rhabdomys B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pumilio O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
and O O O O
show O O O O
that O O O O
relative O O O O
fitness O O O O
of O O O O
ARTs O O O O
differs O O O O
between O O O O
years O O O O
. O O O O
    
Each O O O O
year O O O O
represents O O O O
a O O O O
different O O O O
generation O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
For O O O O
the O O O O
generation O O O O
living O O O O
under O O O O
high O O O O
population O O O O
density O O O O
, O O O O
tactics O O O O
differed O O O O
in O O O O
relative O O O O
fitness O O O O
in O O O O
accordance O O O O
with O O O O
the O O O O
theory O O O O
of O O O O
conditional O O O O
strategies O O O O
, O O O O
with O O O O
highly O O O O
successful O O O O
territorial O O O O
breeding O O O O
males O O O O
having O O O O
10 O O O O
times O O O O
higher O O O O
success O O O O
than O O O O
solitary O O O O
roaming O O O O
males O O O O
and O O O O
102 O O O O
times O O O O
higher O O O O
success O O O O
than O O O O
adult O O O O
natally O O O O
philopatric O O O O
males O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
For O O O O
the O O O O
generation O O O O
living O O O O
under O O O O
intermediate O O O O
population O O O O
density O O O O
, O O O O
the O O O O
territorial O O O O
breeding O O O O
and O O O O
roaming O O O O
tactics O O O O
yielded O O O O
similar O O O O
fitness O O O O
, O O O O
which O O O O
would O O O O
be O O O O
in O O O O
agreement O O O O
with O O O O
the O O O O
theory O O O O
of O O O O
mixed O O O O
strategies O O O O
. O O O O
    
No O O O O
philopatric O O O O
males O O O O
occurred O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
For O O O O
the O O O O
generation O O O O
living O O O O
under O O O O
low O O O O
population O O O O
density O O O O
, O O O O
roaming O O O O
was O O O O
the O O O O
only O O O O
tactic O O O O
used O O O O
and O O O O
some O O O O
roamers O O O O
had O O O O
very O O O O
high O O O O
fitness O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
main O O O O
prediction O O O O
of O O O O
status O O O O
- O O O O
dependent O O O O
selection O O O O
for O O O O
conditional O O O O
strategies O O O O
is O O O O
a O O O O
correlation O O O O
between O O O O
fitness O O O O
and O O O O
status O O O O
, O O O O
often O O O O
measured O O O O
as O O O O
body O O O O
mass O O O O
, O O O O
but O O O O
we O O O O
did O O O O
not O O O O
find O O O O
this O O O O
correlation O O O O
within O O O O
tactics O O O O
when O O O O
more O O O O
than O O O O
one O O O O
tactic O O O O
was O O O O
expressed O O O O
in O O O O
the O O O O
population O O O O
. O O O O
    
7 O O O O
. O O O O
    
Female O O O O
distribution O O O O
seems O O O O
to O O O O
have O O O O
an O O O O
effect O O O O
on O O O O
which O O O O
reproductive O O O O
tactics O O O O
male O O O O
chose O O O O
: O O O O
female O O O O
defence O O O O
polygyny O O O O
when O O O O
females O O O O
are O O O O
clumped O O O O
( O O O O
interference O O O O
competition O O O O
) O O O O
, O O O O
but O O O O
a O O O O
searching O O O O
tactic O O O O
when O O O O
females O O O O
are O O O O
dispersed O O O O
( O O O O
scramble O O O O
competition O O O O
) O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
to O O O O
predictions O O O O
arising O O O O
from O O O O
theory O O O O
on O O O O
scramble O O O O
competition O O O O
, O O O O
male O O O O
body O O O O
mass O O O O
was O O O O
important O O O O
in O O O O
determining O O O O
fitness O O O O
only O O O O
in O O O O
the O O O O
year O O O O
when O O O O
females O O O O
were O O O O
dispersed O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
in O O O O
other O O O O
years O O O O
. O O O O
    
8 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
indicate O O O O
that O O O O
the O O O O
differentiation O O O O
between O O O O
conditional O O O O
and O O O O
mixed O O O O
strategies O O O O
is O O O O
not O O O O
an O O O O
absolute O O O O
one O O O O
. O O O O
    
In O O O O
many O O O O
other O O O O
species O O O O
, O O O O
environmental O O O O
conditions O O O O
might O O O O
fluctuate O O O O
temporally O O O O
and O O O O
spatially O O O O
so O O O O
that O O O O
the O O O O
normally O O O O
suboptimal O O O O
tactic O O O O
yields O O O O
similar O O O O
fitness O O O O
to O O O O
the O O O O
( O O O O
usually O O O O
) O O O O
dominant O O O O
tactic O O O O
or O O O O
that O O O O
only O O O O
a O O O O
single O O O O
tactic O O O O
prevails O O O O
. O O O O
    
9 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
suggest O O O O
the O O O O
term O O O O
single O O O O
strategy O O O O
, O O O O
independent O O O O
of O O O O
current O O O O
fitness O O O O
consequences O O O O
, O O O O
for O O O O
systems O O O O
where O O O O
tactics O O O O
are O O O O
not O O O O
genetically O O O O
determined O O O O
, O O O O
in O O O O
contrast O O O O
to O O O O
genetically O O O O
determined O O O O
alternative O O O O
strategies O O O O
. O O O O
    
Predicting O O O O
diet O O O O
and O O O O
consumption O O O O
rate O O O O
differences O O O O
between O O O O
and O O O O
within O O O O
species O O O O
using O O O O
gut O O O O
ecomorphology O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Rapid O O O O
environmental O O O O
changes O O O O
and O O O O
pressing O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
needs O O O O
to O O O O
forecast O O O O
the O O O O
consequences O O O O
of O O O O
environmental O O O O
change O O O O
are O O O O
increasingly O O O O
driving O O O O
ecology O O O O
to O O O O
become O O O O
a O O O O
predictive O O O O
science O O O O
. O O O O
    
The O O O O
need O O O O
for O O O O
effective O O O O
prediction O O O O
requires O O O O
both O O O O
the O O O O
development O O O O
of O O O O
new O O O O
tools O O O O
and O O O O
the O O O O
refocusing O O O O
of O O O O
existing O O O O
tools O O O O
that O O O O
may O O O O
have O O O O
previously O O O O
been O O O O
used O O O O
primarily O O O O
for O O O O
purposes O O O O
other O O O O
than O O O O
prediction O O O O
. O O O O
    
One O O O O
such O O O O
tool O O O O
that O O O O
historically O O O O
has O O O O
been O O O O
more O O O O
descriptive O O O O
in O O O O
nature O O O O
is O O O O
ecomorphology O O O O
( O O O O
the O O O O
study O O O O
of O O O O
relationships O O O O
between O O O O
ecological O O O O
roles O O O O
and O O O O
morphological O O O O
adaptations O O O O
of O O O O
species O O O O
and O O O O
individuals O O O O
) O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
examine O O O O
relationships O O O O
between O O O O
diet O O O O
and O O O O
gut O O O O
morphology O O O O
for O O O O
15 O O O O
species O O O O
of O O O O
brachyuran O O O O
crabs O O O O
, O O O O
a O O O O
group O O O O
of O O O O
pervasive O O O O
and O O O O
highly O O O O
successful O O O O
consumers O O O O
for O O O O
which O O O O
trophic O O O O
predictions O O O O
would O O O O
be O O O O
highly O O O O
valuable O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
show O O O O
that O O O O
patterns O O O O
in O O O O
crab O O O O
stomach O O O O
volume O O O O
closely O O O O
match O O O O
some O O O O
predictions O O O O
of O O O O
metabolic O O O O
theory O O O O
and O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
individual O O O O
diet O O O O
differences O O O O
and O O O O
associated O O O O
morphological O O O O
variation O O O O
reflect O O O O
, O O O O
at O O O O
least O O O O
in O O O O
some O O O O
instances O O O O
, O O O O
individual O O O O
choice O O O O
or O O O O
diet O O O O
specialization O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
then O O O O
present O O O O
examples O O O O
of O O O O
how O O O O
stomach O O O O
volume O O O O
can O O O O
be O O O O
used O O O O
to O O O O
predict O O O O
both O O O O
the O O O O
per O O O O
cent O O O O
herbivory O O O O
of O O O O
brachyuran O O O O
crabs O O O O
and O O O O
the O O O O
relative O O O O
consumption O O O O
rates O O O O
of O O O O
individual O O O O
crabs O O O O
. O O O O
    
Completing O O O O
the O O O O
purine O O O O
utilisation O O O O
pathway O O O O
of O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
We O O O O
have O O O O
previously O O O O
identified O O O O
by O O O O
classical O O O O
genetics O O O O
and O O O O
biochemistry O O O O
, O O O O
all O O O O
the O O O O
genes O O O O
of O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
predicted O O O O
to O O O O
be O O O O
involved O O O O
in O O O O
purine O O O O
utilisation O O O O
, O O O O
together O O O O
with O O O O
cognate O O O O
regulatory O O O O
genes O O O O
and O O O O
one O O O O
gene O O O O
encoding O O O O
a O O O O
novel O O O O
xanthine O O O O
hydroxylation O O O O
activity O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
article O O O O
we O O O O
complete O O O O
the O O O O
description O O O O
of O O O O
the O O O O
purine O O O O
utilisation O O O O
pathway O O O O
with O O O O
the O O O O
identification O O O O
of O O O O
the O O O O
two O O O O
genes O O O O
( O O O O
uaX O O O O
and O O O O
uaW O O O O
) O O O O
encoding O O O O
the O O O O
enzymes O O O O
catalysing O O O O
the O O O O
conversion O O O O
of O O O O
the O O O O
product O O O O
of O O O O
urate O O O O
oxidation O O O O
by O O O O
urate O O O O
oxidase O O O O
, O O O O
5 O O O O
- O O O O
hydroxyisourate O O O O
, O O O O
to O O O O
optically O O O O
active O O O O
allantoin O O O O
. O O O O
    
The O O O O
identification O O O O
of O O O O
these O O O O
additional O O O O
genes O O O O
confirms O O O O
the O O O O
complete O O O O
absence O O O O
of O O O O
clustering O O O O
of O O O O
the O O O O
genes O O O O
involved O O O O
in O O O O
purine O O O O
utilisation O O O O
in O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
ultrastructure O O O O
of O O O O
Ancyromonas O O O O
, O O O O
a O O O O
eukaryote O O O O
without O O O O
supergroup O O O O
affinities O O O O
. O O O O
    
The O O O O
small O O O O
heterotrophic O O O O
flagellate O O O O
Ancyromonas O O O O
( O O O O
= O O O O
Planomonas O O O O
) O O O O
lacks O O O O
close O O O O
relatives O O O O
in O O O O
most O O O O
molecular O O O O
phylogenies O O O O
, O O O O
and O O O O
it O O O O
is O O O O
suspected O O O O
that O O O O
it O O O O
does O O O O
not O O O O
belong O O O O
to O O O O
any O O O O
of O O O O
the O O O O
recognized O O O O
eukaryote O O O O
' O O O O
supergroups O O O O
' O O O O
, O O O O
making O O O O
it O O O O
an O O O O
organism O O O O
of O O O O
great O O O O
evolutionary O O O O
interest O O O O
. O O O O
    
Proposed O O O O
relatives O O O O
include O O O O
apusomonads O O O O
and O O O O
excavates O O O O
, O O O O
but O O O O
limited O O O O
understanding O O O O
of O O O O
the O O O O
ancyromonad O O O O
cytoskeleton O O O O
has O O O O
precluded O O O O
identification O O O O
of O O O O
candidate O O O O
structural O O O O
homologies O O O O
. O O O O
    
We O O O O
present O O O O
a O O O O
detailed O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
ultrastructure O O O O
of O O O O
Ancyromonas O O O O
through O O O O
computer O O O O
- O O O O
based O O O O
reconstruction O O O O
of O O O O
serial O O O O
sections O O O O
. O O O O
    
We O O O O
confirm O O O O
or O O O O
extend O O O O
previous O O O O
observations O O O O
of O O O O
its O O O O
major O O O O
organelles O O O O
( O O O O
mitochondria O O O O
, O O O O
Golgi O O O O
body O O O O
, O O O O
extrusomes O O O O
, O O O O
etc O O O O
. O O O O
) O O O O
and O O O O
pellicle O O O O
, O O O O
and O O O O
distinguish O O O O
a O O O O
system O O O O
of O O O O
stacked O O O O
endomembranes O O O O
that O O O O
may O O O O
be O O O O
developmentally O O O O
connected O O O O
to O O O O
the O O O O
glycocalyx O O O O
. O O O O
    
Ancyromonas O O O O
has O O O O
two O O O O
basal O O O O
bodies O O O O
, O O O O
each O O O O
with O O O O
its O O O O
own O O O O
flagellar O O O O
pocket O O O O
. O O O O
    
The O O O O
anterior O O O O
basal O O O O
body O O O O
associates O O O O
with O O O O
two O O O O
microtubular O O O O
elements O O O O
: O O O O
a O O O O
doublet O O O O
root O O O O
that O O O O
runs O O O O
from O O O O
between O O O O
the O O O O
basal O O O O
bodies O O O O
to O O O O
support O O O O
the O O O O
cell O O O O
' O O O O
s O O O O
rostrum O O O O
, O O O O
and O O O O
a O O O O
short O O O O
singlet O O O O
root O O O O
. O O O O
    
The O O O O
posterior O O O O
basal O O O O
body O O O O
is O O O O
associated O O O O
with O O O O
two O O O O
multi O O O O
- O O O O
microtubular O O O O
structures O O O O
and O O O O
a O O O O
singlet O O O O
root O O O O
. O O O O
    
One O O O O
multi O O O O
- O O O O
microtubular O O O O
structure O O O O
, O O O O
L1 O O O O
, O O O O
is O O O O
a O O O O
conventional O O O O
microtubular O O O O
root O O O O
. O O O O
    
The O O O O
other O O O O
structure O O O O
appears O O O O
as O O O O
a O O O O
curved O O O O
ribbon O O O O
of O O O O
- O O O O
8 O O O O
microtubules O O O O
near O O O O
the O O O O
basal O O O O
body O O O O
, O O O O
but O O O O
then O O O O
flares O O O O
out O O O O
into O O O O
two O O O O
multi O O O O
- O O O O
microtubular O O O O
elements O O O O
, O O O O
L2 O O O O
and O O O O
L3 O O O O
, O O O O
plus O O O O
two O O O O
single O O O O
microtubules O O O O
. O O O O
    
The O O O O
posterior O O O O
singlet O O O O
root O O O O
originates O O O O
independently O O O O
near O O O O
this O O O O
second O O O O
complex O O O O
. O O O O
    
L1 O O O O
, O O O O
the O O O O
singlet O O O O
, O O O O
L2 O O O O
, O O O O
and O O O O
L3 O O O O
all O O O O
support O O O O
the O O O O
posterior O O O O
flagellar O O O O
pocket O O O O
and O O O O
channel O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
identified O O O O
several O O O O
groups O O O O
of O O O O
peripheral O O O O
microtubules O O O O
. O O O O
    
Possible O O O O
homologies O O O O
with O O O O
the O O O O
flagellar O O O O
apparatus O O O O
of O O O O
both O O O O
apusomonads O O O O
and O O O O
excavates O O O O
include O O O O
a O O O O
splitting O O O O
root O O O O
on O O O O
the O O O O
right O O O O
side O O O O
of O O O O
the O O O O
posterior O O O O
basal O O O O
body O O O O
and O O O O
a O O O O
singlet O O O O
root O O O O
, O O O O
both O O O O
supporting O O O O
a O O O O
longitudinal O O O O
channel O O O O
or O O O O
groove O O O O
associated O O O O
with O O O O
the O O O O
posterior O O O O
flagellum O O O O
. O O O O
    
The O O O O
anterior O O O O
flagellar O O O O
apparatus O O O O
in O O O O
each O O O O
includes O O O O
a O O O O
root O O O O
supporting O O O O
structures O O O O
to O O O O
the O O O O
left O O O O
of O O O O
the O O O O
anterior O O O O
flagellum O O O O
. O O O O
    
Given O O O O
the O O O O
probable O O O O
deep O O O O
divergences O O O O
of O O O O
Ancyromonas O O O O
, O O O O
apusomonads O O O O
and O O O O
excavates O O O O
within O O O O
eukaryotes O O O O
, O O O O
it O O O O
is O O O O
possible O O O O
that O O O O
the O O O O
eukaryotic O O O O
cenancestor O O O O
also O O O O
possessed O O O O
these O O O O
features O O O O
. O O O O
    
Phylogenetic O O O O
validation O O O O
of O O O O
the O O O O
genera O O O O
Angomonas O O O O
and O O O O
Strigomonas O O O O
of O O O O
trypanosomatids O O O O
harboring O O O O
bacterial O O O O
endosymbionts O O O O
with O O O O
the O O O O
description O O O O
of O O O O
new O O O O
species O O O O
of O O O O
trypanosomatids O O O O
and O O O O
of O O O O
proteobacterial O O O O
symbionts O O O O
. O O O O
    
We O O O O
comparatively O O O O
examined O O O O
the O O O O
nutritional O O O O
, O O O O
molecular O O O O
and O O O O
optical O O O O
and O O O O
electron O O O O
microscopical O O O O
characteristics O O O O
of O O O O
reference O O O O
species O O O O
and O O O O
new O O O O
isolates O O O O
of O O O O
trypanosomatids O O O O
harboring O O O O
bacterial O O O O
endosymbionts O O O O
. O O O O
    
Sequencing O O O O
of O O O O
the O O O O
V7V8 O O O O
region O O O O
of O O O O
the O O O O
small O O O O
subunit O O O O
of O O O O
the O O O O
ribosomal O O O O
RNA O O O O
( O O O O
SSU O O O O
rRNA O O O O
) O O O O
gene O O O O
distinguished O O O O
six O O O O
major O O O O
genotypes O O O O
among O O O O
the O O O O
13 O O O O
isolates O O O O
examined O O O O
. O O O O
    
The O O O O
entire O O O O
sequences O O O O
of O O O O
the O O O O
SSU O O O O
rRNA O O O O
and O O O O
glycosomal O O O O
glyceraldehyde O O O O
phosphate O O O O
dehydrogenase O O O O
( O O O O
gGAPDH O O O O
) O O O O
genes O O O O
were O O O O
obtained O O O O
for O O O O
phylogenetic O O O O
analyses O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
resulting O O O O
phylogenetic O O O O
trees O O O O
, O O O O
the O O O O
symbiont O O O O
- O O O O
harboring O O O O
species O O O O
clustered O O O O
as O O O O
a O O O O
major O O O O
clade O O O O
comprising O O O O
two O O O O
subclades O O O O
that O O O O
corresponded O O O O
to O O O O
the O O O O
proposed O O O O
genera O O O O
Angomonas O O O O
and O O O O
Strigomonas O O O O
. O O O O
    
The O O O O
genus O O O O
Angomonas O O O O
comprised O O O O
10 O O O O
flagellates O O O O
including O O O O
former O O O O
Crithidia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
deanei O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
desouzai O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
plus O O O O
a O O O O
new O O O O
species O O O O
. O O O O
    
The O O O O
genus O O O O
Strigomonas O O O O
included O O O O
former O O O O
Crithidia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
oncopelti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Blastocrithidia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
culicis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
plus O O O O
a O O O O
new O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Sequences O O O O
from O O O O
the O O O O
internal O O O O
transcribed O O O O
spacer O O O O
of O O O O
ribosomal O O O O
DNA O O O O
( O O O O
ITS O O O O
rDNA O O O O
) O O O O
and O O O O
size O O O O
polymorphism O O O O
of O O O O
kinetoplast O O O O
DNA O O O O
( O O O O
kDNA O O O O
) O O O O
minicircles O O O O
revealed O O O O
considerable O O O O
genetic O O O O
heterogeneity O O O O
within O O O O
the O O O O
genera O O O O
Angomonas O O O O
and O O O O
Strigomonas O O O O
. O O O O
    
Phylogenetic O O O O
analyses O O O O
based O O O O
on O O O O
16S O O O O
rDNA O O O O
and O O O O
ITS O O O O
rDNA O O O O
sequences O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
all O O O O
of O O O O
the O O O O
endosymbionts O O O O
belonged O O O O
to O O O O
the O O O O
Betaproteobacteria O O O O
and O O O O
revealed O O O O
three O O O O
new O O O O
species O O O O
. O O O O
    
The O O O O
congruence O O O O
of O O O O
the O O O O
phylogenetic O O O O
trees O O O O
of O O O O
trypanosomatids O O O O
and O O O O
their O O O O
symbionts O O O O
support O O O O
a O O O O
co O O O O
- O O O O
divergent O O O O
host O O O O
- O O O O
symbiont O O O O
evolutionary O O O O
history O O O O
. O O O O
    
Introduced O O O O
brown B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trout O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
alter O O O O
native O O O O
acanthocephalan O O O O
infections O O O O
in O O O O
native O O O O
fish O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Native O O O O
parasite O O O O
acquisition O O O O
provides O O O O
introduced O O O O
species O O O O
with O O O O
the O O O O
potential O O O O
to O O O O
modify O O O O
native O O O O
host O O O O
- O O O O
parasite O O O O
dynamics O O O O
by O O O O
acting O O O O
as O O O O
parasite O O O O
reservoirs O O O O
( O O O O
with O O O O
the O O O O
' O O O O
spillback O O O O
' O O O O
of O O O O
infection O O O O
increasing O O O O
the O O O O
parasite O O O O
burdens O O O O
of O O O O
native O O O O
hosts O O O O
) O O O O
or O O O O
sinks O O O O
( O O O O
with O O O O
the O O O O
' O O O O
dilution O O O O
' O O O O
of O O O O
infection O O O O
decreasing O O O O
the O O O O
parasite O O O O
burdens O O O O
of O O O O
native O O O O
hosts O O O O
) O O O O
of O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
In O O O O
New O O O O
Zealand O O O O
, O O O O
negative O O O O
correlations O O O O
between O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
introduced O O O O
brown B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trout O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Salmo B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trutta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
and O O O O
native O O O O
parasite O O O O
burdens O O O O
of O O O O
the O O O O
native O O O O
roundhead B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
galaxias O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Galaxias B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
anomalus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
have O O O O
been O O O O
observed O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
parasite O O O O
dilution O O O O
is O O O O
occurring O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
used O O O O
a O O O O
multiple O O O O
- O O O O
scale O O O O
approach O O O O
combining O O O O
field O O O O
observations O O O O
, O O O O
experimental O O O O
infections O O O O
and O O O O
dynamic O O O O
population O O O O
modelling O O O O
to O O O O
investigate O O O O
whether O O O O
native O O O O
Acanthocephalus O O O O
galaxii O O O O
acquisition O O O O
by O O O O
brown B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trout O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
alters O O O O
host O O O O
- O O O O
parasite O O O O
dynamics O O O O
in O O O O
native O O O O
roundhead B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
galaxias O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Field O O O O
observations O O O O
demonstrated O O O O
higher O O O O
infection O O O O
intensity O O O O
in O O O O
introduced O O O O
trout O O O O
than O O O O
in O O O O
native B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
galaxias O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
but O O O O
only O O O O
small O O O O
, O O O O
immature O O O O
A O O O O
. O O O O
galaxii O O O O
were O O O O
present O O O O
in O O O O
trout B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Experimental O O O O
infections O O O O
also O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
A O O O O
. O O O O
galaxii O O O O
does O O O O
not O O O O
mature O O O O
in O O O O
trout B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
although O O O O
parasite O O O O
establishment O O O O
and O O O O
initial O O O O
growth O O O O
were O O O O
similar O O O O
in O O O O
the O O O O
two O O O O
hosts O O O O
. O O O O
    
Taken O O O O
together O O O O
, O O O O
these O O O O
results O O O O
support O O O O
the O O O O
hypothesis O O O O
that O O O O
trout B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
may O O O O
serve O O O O
as O O O O
an O O O O
infection O O O O
sink O O O O
for O O O O
the O O O O
native O O O O
parasite O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
dynamic O O O O
population O O O O
modelling O O O O
predicts O O O O
that O O O O
A O O O O
. O O O O
galaxii O O O O
infections O O O O
in O O O O
native O O O O
galaxias B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
should O O O O
at O O O O
most O O O O
only O O O O
be O O O O
slightly O O O O
reduced O O O O
by O O O O
dilution O O O O
in O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
trout B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Rather O O O O
, O O O O
model O O O O
exploration O O O O
indicates O O O O
parasite O O O O
densities O O O O
in O O O O
galaxias B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
are O O O O
highly O O O O
sensitive O O O O
to O O O O
galaxias B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
predation O O O O
on O O O O
infected O O O O
amphipods O O O O
, O O O O
and O O O O
to O O O O
relative O O O O
abundances O O O O
of O O O O
galaxias B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
trout B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Hence O O O O
, O O O O
trout B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
presence O O O O
may O O O O
instead O O O O
reduce O O O O
parasite O O O O
burdens O O O O
in O O O O
galaxias B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
by O O O O
either O O O O
reducing O O O O
galaxias B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
density O O O O
or O O O O
by O O O O
altering O O O O
galaxias B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
foraging O O O O
behaviour O O O O
. O O O O
    
Fitness O O O O
effects O O O O
of O O O O
endemic O O O O
malaria O O O O
infections O O O O
in O O O O
a O O O O
wild O O O O
bird O O O O
population O O O O
: O O O O
the O O O O
importance O O O O
of O O O O
ecological O O O O
structure O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Parasites O O O O
can O O O O
have O O O O
important O O O O
effects O O O O
on O O O O
host O O O O
populations O O O O
influencing O O O O
either O O O O
fecundity O O O O
or O O O O
mortality O O O O
, O O O O
but O O O O
understanding O O O O
the O O O O
magnitude O O O O
of O O O O
these O O O O
effects O O O O
in O O O O
endemic O O O O
host O O O O
- O O O O
parasite O O O O
systems O O O O
is O O O O
challenging O O O O
and O O O O
requires O O O O
an O O O O
understanding O O O O
of O O O O
ecological O O O O
processes O O O O
affecting O O O O
both O O O O
host O O O O
and O O O O
parasite O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Avian O O O O
blood O O O O
parasites O O O O
( O O O O
Haemoproteus O O O O
and O O O O
Plasmodium O O O O
) O O O O
have O O O O
been O O O O
much O O O O
studied O O O O
, O O O O
but O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
these O O O O
parasites O O O O
on O O O O
hosts O O O O
in O O O O
areas O O O O
where O O O O
they O O O O
are O O O O
endemic O O O O
remains O O O O
poorly O O O O
known O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
used O O O O
a O O O O
multistate O O O O
modelling O O O O
framework O O O O
to O O O O
explore O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
chronic O O O O
infection O O O O
with O O O O
Plasmodium O O O O
on O O O O
survival O O O O
and O O O O
recapture O O O O
probability O O O O
in O O O O
a O O O O
large O O O O
data O O O O
set O O O O
of O O O O
breeding O O O O
blue B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tits O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
involving O O O O
3424 O O O O
individuals O O O O
and O O O O
3118 O O O O
infection O O O O
diagnoses O O O O
over O O O O
nine O O O O
years O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
reveal O O O O
strong O O O O
associations O O O O
between O O O O
chronic O O O O
malaria O O O O
infection O O O O
and O O O O
both O O O O
recapture O O O O
and O O O O
survival O O O O
, O O O O
effects O O O O
that O O O O
are O O O O
dependent O O O O
on O O O O
the O O O O
clade O O O O
of O O O O
parasite O O O O
, O O O O
on O O O O
host O O O O
traits O O O O
and O O O O
on O O O O
the O O O O
local O O O O
risk O O O O
of O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Infection O O O O
with O O O O
Plasmodium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
relictum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
associated O O O O
with O O O O
reduced O O O O
recapture O O O O
probability O O O O
and O O O O
increased O O O O
survival O O O O
, O O O O
compared O O O O
to O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
circumflexum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
these O O O O
parasites O O O O
have O O O O
differing O O O O
virulence O O O O
and O O O O
cause O O O O
different O O O O
types O O O O
of O O O O
selection O O O O
on O O O O
this O O O O
host O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
suggest O O O O
a O O O O
large O O O O
potential O O O O
survival O O O O
cost O O O O
of O O O O
acute O O O O
infections O O O O
revealed O O O O
by O O O O
modelling O O O O
host O O O O
survival O O O O
as O O O O
a O O O O
function O O O O
of O O O O
the O O O O
local O O O O
risk O O O O
of O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
7 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
analyses O O O O
suggest O O O O
not O O O O
only O O O O
that O O O O
endemic O O O O
avian O O O O
malaria O O O O
may O O O O
have O O O O
multiple O O O O
fitness O O O O
effects O O O O
on O O O O
their O O O O
hosts O O O O
and O O O O
that O O O O
these O O O O
effects O O O O
are O O O O
species O O O O
dependent O O O O
, O O O O
but O O O O
also O O O O
that O O O O
adding O O O O
ecological O O O O
structure O O O O
( O O O O
in O O O O
this O O O O
case O O O O
parasite O O O O
species O O O O
and O O O O
spatial O O O O
variation O O O O
in O O O O
disease O O O O
occurrence O O O O
) O O O O
to O O O O
analyses O O O O
of O O O O
host O O O O
- O O O O
parasite O O O O
interactions O O O O
is O O O O
an O O O O
important O O O O
step O O O O
in O O O O
understanding O O O O
the O O O O
ecology O O O O
and O O O O
evolution O O O O
of O O O O
these O O O O
systems O O O O
. O O O O
    
Host O O O O
phylogeography O O O O
and O O O O
beta O O O O
diversity O O O O
in O O O O
avian O O O O
haemosporidian O O O O
( O O O O
Plasmodiidae O O O O
) O O O O
assemblages O O O O
of O O O O
the O O O O
Lesser O O O O
Antilles O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
estimated O O O O
the O O O O
correlation O O O O
between O O O O
host O O O O
phylogeographical O O O O
structure O O O O
and O O O O
beta O O O O
diversity O O O O
of O O O O
avian O O O O
haemosporidian O O O O
assemblages O O O O
of O O O O
passerine O O O O
birds O O O O
to O O O O
determine O O O O
the O O O O
degree O O O O
to O O O O
which O O O O
parasite O O O O
communities O O O O
change O O O O
with O O O O
host O O O O
evolution O O O O
, O O O O
expressed O O O O
as O O O O
genetic O O O O
divergence O O O O
between O O O O
island O O O O
populations O O O O
, O O O O
and O O O O
we O O O O
investigated O O O O
whether O O O O
differences O O O O
among O O O O
islands O O O O
in O O O O
the O O O O
haemosporidia O O O O
of O O O O
a O O O O
particular O O O O
host O O O O
species O O O O
reflect O O O O
beta O O O O
diversity O O O O
in O O O O
the O O O O
entire O O O O
parasite O O O O
assemblage O O O O
, O O O O
beta O O O O
diversity O O O O
in O O O O
vectors O O O O
, O O O O
turnover O O O O
of O O O O
bird O O O O
species O O O O
and O O O O
/ O O O O
or O O O O
geographical O O O O
distance O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
used O O O O
Mantel O O O O
tests O O O O
to O O O O
assess O O O O
the O O O O
significance O O O O
of O O O O
partial O O O O
correlations O O O O
between O O O O
host O O O O
nucleotide O O O O
difference O O O O
( O O O O
based O O O O
on O O O O
cytochrome O O O O
b O O O O
) O O O O
and O O O O
haemosporidian O O O O
( O O O O
Haemoproteus O O O O
spp O O O O
. O O O O
and O O O O
Plasmodium O O O O
spp O O O O
. O O O O
) O O O O
mitochondrial O O O O
lineage O O O O
beta O O O O
diversity O O O O
within O O O O
a O O O O
given O O O O
host O O O O
species O O O O
and O O O O
between O O O O
Plasmodium O O O O
mitochondrial O O O O
lineage O O O O
beta O O O O
diversity O O O O
and O O O O
mosquito O O O O
and O O O O
bird O O O O
species O O O O
beta O O O O
diversity O O O O
( O O O O
or O O O O
turnover O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Three O O O O
abundant O O O O
and O O O O
widespread O O O O
host O O O O
species O O O O
( O O O O
Tiaris B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bicolor O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Coereba B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
flaveola O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Loxigilla B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
noctis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O O O O
barbadensis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
were O O O O
included O O O O
in O O O O
the O O O O
study O O O O
. O O O O
    
Haemosporidian O O O O
lineage O O O O
beta O O O O
diversity O O O O
among O O O O
nine O O O O
islands O O O O
was O O O O
assessed O O O O
using O O O O
the O O O O
Chao O O O O
- O O O O
Jaccard O O O O
, O O O O
Chao O O O O
- O O O O
Sorensen O O O O
and O O O O
Morisita O O O O
- O O O O
Horn O O O O
indices O O O O
of O O O O
community O O O O
similarity O O O O
. O O O O
    
Beta O O O O
diversity O O O O
indices O O O O
of O O O O
mosquito O O O O
species O O O O
and O O O O
turnover O O O O
of O O O O
bird O O O O
species O O O O
were O O O O
calculated O O O O
from O O O O
data O O O O
in O O O O
published O O O O
records O O O O
and O O O O
field O O O O
guides O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
In O O O O
Loxigilla O O O O
spp O O O O
. O O O O
, O O O O
we O O O O
found O O O O
a O O O O
positive O O O O
correlation O O O O
with O O O O
geographical O O O O
distance O O O O
and O O O O
an O O O O
unexpected O O O O
negative O O O O
correlation O O O O
between O O O O
haemosporidian O O O O
beta O O O O
diversity O O O O
and O O O O
host O O O O
genetic O O O O
distance O O O O
. O O O O
    
Tiaris B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bicolor O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
exhibited O O O O
a O O O O
significant O O O O
positive O O O O
correlation O O O O
between O O O O
haemosporidian O O O O
beta O O O O
diversity O O O O
and O O O O
beta O O O O
diversity O O O O
within O O O O
the O O O O
entire O O O O
parasite O O O O
assemblage O O O O
. O O O O
    
We O O O O
did O O O O
not O O O O
find O O O O
significant O O O O
correlations O O O O
between O O O O
parasite O O O O
beta O O O O
diversity O O O O
and O O O O
mosquito O O O O
beta O O O O
diversity O O O O
or O O O O
bird O O O O
species O O O O
turnover O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Host O O O O
phylogeographical O O O O
structure O O O O
does O O O O
not O O O O
appear O O O O
to O O O O
drive O O O O
within O O O O
- O O O O
host O O O O
beta O O O O
diversity O O O O
of O O O O
haemosporidian O O O O
lineages O O O O
. O O O O
    
Instead O O O O
, O O O O
the O O O O
array O O O O
of O O O O
parasites O O O O
on O O O O
one O O O O
host O O O O
can O O O O
reflect O O O O
the O O O O
haemosporidian O O O O
assemblage O O O O
on O O O O
other O O O O
hosts O O O O
. O O O O
    
Dermamoeba B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
algensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
n O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
    
( O O O O
Amoebozoa O O O O
, O O O O
Dermamoebidae O O O O
) O O O O
: O O O O
an O O O O
algivorous O O O O
lobose O O O O
amoeba O O O O
with O O O O
complex O O O O
cell O O O O
coat O O O O
and O O O O
unusual O O O O
feeding O O O O
mode O O O O
. O O O O
    
The O O O O
genus O O O O
Dermamoeba O O O O
unifies O O O O
oblong O O O O
, O O O O
flattened O O O O
amoebae O O O O
of O O O O
lingulate O O O O
morphotype O O O O
, O O O O
possessing O O O O
a O O O O
thick O O O O
multilayered O O O O
cell O O O O
coat O O O O
. O O O O
    
It O O O O
includes O O O O
two O O O O
species O O O O
, O O O O
D O O O O
. O O O O
granifera O O O O
and O O O O
D O O O O
. O O O O
minor O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
paper O O O O
we O O O O
describe O O O O
a O O O O
third O O O O
species O O O O
of O O O O
this O O O O
genus O O O O
, O O O O
D B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
algensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
n O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
    
This O O O O
species O O O O
is O O O O
algivorous O O O O
; O O O O
engulfing O O O O
a O O O O
large O O O O
algal O O O O
cell O O O O
, O O O O
it O O O O
destroys O O O O
part O O O O
of O O O O
the O O O O
cell O O O O
coat O O O O
liberating O O O O
the O O O O
plasma O O O O
membrane O O O O
, O O O O
which O O O O
forms O O O O
the O O O O
food O O O O
vacuole O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
the O O O O
glycocalyx O O O O
never O O O O
appears O O O O
inside O O O O
the O O O O
phagosome O O O O
. O O O O
    
This O O O O
observation O O O O
confirms O O O O
that O O O O
some O O O O
of O O O O
the O O O O
thick O O O O
- O O O O
coated O O O O
amoebae O O O O
may O O O O
use O O O O
this O O O O
way O O O O
to O O O O
avoid O O O O
energetically O O O O
costly O O O O
digestion O O O O
of O O O O
their O O O O
own O O O O
glycocalyx O O O O
. O O O O
    
Studies O O O O
of O O O O
the O O O O
physiology O O O O
of O O O O
this O O O O
organism O O O O
show O O O O
that O O O O
it O O O O
feeds O O O O
most O O O O
actively O O O O
at O O O O
a O O O O
temperature O O O O
of O O O O
22 O O O O
- O O O O
25 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
. O O O O
    
Below O O O O
and O O O O
above O O O O
this O O O O
temperature O O O O
the O O O O
feeding O O O O
intensity O O O O
drastically O O O O
decreases O O O O
. O O O O
    
The O O O O
new O O O O
species O O O O
can O O O O
survive O O O O
NaCl O O O O
concentrations O O O O
up O O O O
to O O O O
5 O O O O
% O O O O
, O O O O
which O O O O
roughly O O O O
corresponds O O O O
to O O O O
50 O O O O
ppt O O O O
salinity O O O O
. O O O O
    
Accordingly O O O O
, O O O O
D B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
algensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
has O O O O
a O O O O
wide O O O O
range O O O O
of O O O O
salinity O O O O
tolerance O O O O
. O O O O
    
European O O O O
guidelines O O O O
on O O O O
the O O O O
clinical O O O O
management O O O O
of O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tropism O O O O
testing O O O O
. O O O O
    
Viral O O O O
tropism O O O O
is O O O O
the O O O O
ability O O O O
of O O O O
viruses O O O O
to O O O O
enter O O O O
and O O O O
infect O O O O
specific O O O O
host O O O O
cells O O O O
and O O O O
is O O O O
based O O O O
on O O O O
the O O O O
ability O O O O
of O O O O
viruses O O O O
to O O O O
bind O O O O
to O O O O
receptors O O O O
on O O O O
those O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Testing O O O O
for O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tropism O O O O
is O O O O
recommended O O O O
before O O O O
prescribing O O O O
a O O O O
chemokine O O O O
receptor O O O O
blocker O O O O
. O O O O
    
In O O O O
most O O O O
European O O O O
countries O O O O
, O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tropism O O O O
is O O O O
identified O O O O
with O O O O
tropism O O O O
phenotype O O O O
testing O O O O
. O O O O
    
New O O O O
data O O O O
support O O O O
genotype O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
third O O O O
hypervariable O O O O
loop O O O O
( O O O O
V3 O O O O
) O O O O
for O O O O
the O O O O
identification O O O O
of O O O O
tropism O O O O
. O O O O
    
The O O O O
European O O O O
Consensus O O O O
Group O O O O
on O O O O
clinical O O O O
management O O O O
of O O O O
tropism O O O O
testing O O O O
was O O O O
established O O O O
to O O O O
make O O O O
recommendations O O O O
to O O O O
clinicians O O O O
and O O O O
clinical O O O O
virologists O O O O
. O O O O
    
The O O O O
panel O O O O
recommends O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
tropism O O O O
testing O O O O
for O O O O
the O O O O
following O O O O
groups O O O O
: O O O O
drug O O O O
- O O O O
naive O O O O
patients O O O O
in O O O O
whom O O O O
toxic O O O O
effects O O O O
are O O O O
anticipated O O O O
or O O O O
for O O O O
whom O O O O
few O O O O
treatment O O O O
options O O O O
are O O O O
available O O O O
; O O O O
patients O O O O
who O O O O
have O O O O
poor O O O O
tolerability O O O O
to O O O O
or O O O O
toxic O O O O
effects O O O O
from O O O O
current O O O O
treatment O O O O
or O O O O
who O O O O
have O O O O
CNS O O O O
pathology O O O O
; O O O O
and O O O O
patients O O O O
for O O O O
whom O O O O
therapy O O O O
has O O O O
failed O O O O
and O O O O
a O O O O
change O O O O
in O O O O
treatment O O O O
is O O O O
considered O O O O
. O O O O
    
In O O O O
general O O O O
, O O O O
an O O O O
enhanced O O O O
sensitivity O O O O
Trofile O O O O
assay O O O O
and O O O O
V3 O O O O
population O O O O
genotyping O O O O
are O O O O
the O O O O
recommended O O O O
methods O O O O
. O O O O
    
Genotypic O O O O
methods O O O O
are O O O O
anticipated O O O O
to O O O O
be O O O O
used O O O O
more O O O O
frequently O O O O
in O O O O
the O O O O
clinical O O O O
setting O O O O
because O O O O
of O O O O
their O O O O
greater O O O O
accessibility O O O O
, O O O O
lower O O O O
cost O O O O
, O O O O
and O O O O
faster O O O O
turnaround O O O O
time O O O O
than O O O O
other O O O O
methods O O O O
. O O O O
    
For O O O O
the O O O O
interpretation O O O O
of O O O O
V3 O O O O
loop O O O O
genotyping O O O O
, O O O O
clinically O O O O
validated O O O O
systems O O O O
should O O O O
be O O O O
used O O O O
when O O O O
possible O O O O
. O O O O
    
Laboratories O O O O
doing O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tropism O O O O
tests O O O O
should O O O O
have O O O O
adequate O O O O
quality O O O O
assurance O O O O
measures O O O O
. O O O O
    
Similarly O O O O
, O O O O
close O O O O
collaboration O O O O
between O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
clinicians O O O O
and O O O O
virologists O O O O
is O O O O
needed O O O O
to O O O O
ensure O O O O
adequate O O O O
diagnostic O O O O
and O O O O
treatment O O O O
decisions O O O O
. O O O O
    
Causal O O O O
involvement O O O O
of O O O O
mammalian O O O O
- O O O O
type O O O O
cryptochrome O O O O
in O O O O
the O O O O
circadian O O O O
cuticle O O O O
deposition O O O O
rhythm O O O O
in O O O O
the O O O O
bean B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bug O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Riptortus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pedestris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Mammalian O O O O
- O O O O
type O O O O
CRYPTOCHROME O O O O
( O O O O
CRY O O O O
- O O O O
m O O O O
) O O O O
is O O O O
considered O O O O
to O O O O
be O O O O
a O O O O
core O O O O
repressive O O O O
component O O O O
of O O O O
the O O O O
circadian O O O O
clock O O O O
in O O O O
various O O O O
insect O O O O
species O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
this O O O O
role O O O O
is O O O O
based O O O O
only O O O O
on O O O O
the O O O O
molecular O O O O
function O O O O
of O O O O
CRY O O O O
- O O O O
m O O O O
in O O O O
cultured O O O O
cells O O O O
and O O O O
it O O O O
therefore O O O O
remains O O O O
unknown O O O O
whether O O O O
CRY O O O O
- O O O O
m O O O O
is O O O O
indispensable O O O O
for O O O O
governing O O O O
physiological O O O O
rhythms O O O O
at O O O O
the O O O O
organismal O O O O
level O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
present O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
show O O O O
that O O O O
RNA O O O O
interference O O O O
( O O O O
RNAi O O O O
) O O O O
targeting O O O O
of O O O O
cry O O O O
- O O O O
m O O O O
in O O O O
the O O O O
bean B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bug O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Riptortus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pedestris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
disrupts O O O O
the O O O O
circadian O O O O
clock O O O O
governing O O O O
the O O O O
cuticle O O O O
deposition O O O O
rhythm O O O O
and O O O O
results O O O O
in O O O O
the O O O O
generation O O O O
of O O O O
a O O O O
single O O O O
cuticle O O O O
layer O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
period O O O O
expression O O O O
was O O O O
induced O O O O
in O O O O
cry O O O O
- O O O O
m O O O O
RNAi O O O O
insects O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
verified O O O O
that O O O O
CRY O O O O
- O O O O
m O O O O
functions O O O O
as O O O O
a O O O O
negative O O O O
regulator O O O O
in O O O O
the O O O O
circadian O O O O
clock O O O O
that O O O O
generates O O O O
physiological O O O O
rhythm O O O O
at O O O O
the O O O O
organismal O O O O
level O O O O
. O O O O
    
Induced O O O O
pluripotent O O O O
stem O O O O
cells O O O O
: O O O O
a O O O O
new O O O O
revolution O O O O
for O O O O
clinical O O O O
neurology O O O O
? O O O O
    
Why O O O O
specific O O O O
neuronal O O O O
populations O O O O
are O O O O
uniquely O O O O
susceptible O O O O
in O O O O
neurodegenerative O O O O
diseases O O O O
remains O O O O
a O O O O
mystery O O O O
. O O O O
    
Brain O O O O
tissue O O O O
samples O O O O
from O O O O
patients O O O O
are O O O O
rarely O O O O
available O O O O
for O O O O
testing O O O O
, O O O O
and O O O O
animal O O O O
models O O O O
frequently O O O O
do O O O O
not O O O O
recapitulate O O O O
all O O O O
features O O O O
of O O O O
a O O O O
specific O O O O
disorder O O O O
; O O O O
therefore O O O O
, O O O O
pathophysiological O O O O
investigations O O O O
are O O O O
difficult O O O O
. O O O O
    
An O O O O
exciting O O O O
new O O O O
avenue O O O O
for O O O O
neurological O O O O
research O O O O
and O O O O
drug O O O O
development O O O O
is O O O O
the O O O O
discovery O O O O
that O O O O
patients O O O O
' O O O O
somatic O O O O
cells O O O O
can O O O O
be O O O O
reprogrammed O O O O
to O O O O
a O O O O
pluripotent O O O O
state O O O O
; O O O O
these O O O O
cells O O O O
are O O O O
known O O O O
as O O O O
induced O O O O
pluripotent O O O O
stem O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Once O O O O
pluripotency O O O O
is O O O O
reinstated O O O O
, O O O O
cell O O O O
colonies O O O O
can O O O O
be O O O O
expanded O O O O
and O O O O
differentiated O O O O
into O O O O
specific O O O O
neural O O O O
populations O O O O
. O O O O
    
The O O O O
availability O O O O
of O O O O
these O O O O
cells O O O O
enables O O O O
the O O O O
monitoring O O O O
in O O O O
vitro O O O O
of O O O O
temporal O O O O
features O O O O
of O O O O
disease O O O O
initiation O O O O
and O O O O
progression O O O O
, O O O O
and O O O O
testing O O O O
of O O O O
new O O O O
drug O O O O
treatments O O O O
on O O O O
the O O O O
patient O O O O
' O O O O
s O O O O
own O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Hence O O O O
, O O O O
this O O O O
swiftly O O O O
growing O O O O
area O O O O
of O O O O
research O O O O
has O O O O
the O O O O
potential O O O O
to O O O O
contribute O O O O
greatly O O O O
to O O O O
our O O O O
understanding O O O O
of O O O O
the O O O O
pathophysiology O O O O
of O O O O
neurodegenerative O O O O
and O O O O
neurodevelopmental O O O O
diseases O O O O
. O O O O
    
Viral O O O O
pneumonia O O O O
. O O O O
    
About O O O O
200 O O O O
million O O O O
cases O O O O
of O O O O
viral O O O O
community O O O O
- O O O O
acquired O O O O
pneumonia O O O O
occur O O O O
every O O O O
year O O O O
- O O O O
100 O O O O
million O O O O
in O O O O
children O O O O
and O O O O
100 O O O O
million O O O O
in O O O O
adults O O O O
. O O O O
    
Molecular O O O O
diagnostic O O O O
tests O O O O
have O O O O
greatly O O O O
increased O O O O
our O O O O
understanding O O O O
of O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
viruses O O O O
in O O O O
pneumonia O O O O
, O O O O
and O O O O
findings O O O O
indicate O O O O
that O O O O
the O O O O
incidence O O O O
of O O O O
viral O O O O
pneumonia O O O O
has O O O O
been O O O O
underestimated O O O O
. O O O O
    
In O O O O
children O O O O
, O O O O
respiratory B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
syncytial O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
rhinovirus O O O O
, O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
metapneumovirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bocavirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
parainfluenza O O O O
viruses O O O O
are O O O O
the O O O O
agents O O O O
identified O O O O
most O O O O
frequently O O O O
in O O O O
both O O O O
developed O O O O
and O O O O
developing O O O O
countries O O O O
. O O O O
    
Dual O O O O
viral O O O O
infections O O O O
are O O O O
common O O O O
, O O O O
and O O O O
a O O O O
third O O O O
of O O O O
children O O O O
have O O O O
evidence O O O O
of O O O O
viral O O O O
- O O O O
bacterial O O O O
co O O O O
- O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
In O O O O
adults O O O O
, O O O O
viruses O O O O
are O O O O
the O O O O
putative O O O O
causative O O O O
agents O O O O
in O O O O
a O O O O
third O O O O
of O O O O
cases O O O O
of O O O O
community O O O O
- O O O O
acquired O O O O
pneumonia O O O O
, O O O O
in O O O O
particular O O O O
influenza O O O O
viruses O O O O
, O O O O
rhinoviruses O O O O
, O O O O
and O O O O
coronaviruses O O O O
. O O O O
    
Bacteria O O O O
continue O O O O
to O O O O
have O O O O
a O O O O
predominant O O O O
role O O O O
in O O O O
adults O O O O
with O O O O
pneumonia O O O O
. O O O O
    
Presence O O O O
of O O O O
viral O O O O
epidemics O O O O
in O O O O
the O O O O
community O O O O
, O O O O
patient O O O O
' O O O O
s O O O O
age O O O O
, O O O O
speed O O O O
of O O O O
onset O O O O
of O O O O
illness O O O O
, O O O O
symptoms O O O O
, O O O O
biomarkers O O O O
, O O O O
radiographic O O O O
changes O O O O
, O O O O
and O O O O
response O O O O
to O O O O
treatment O O O O
can O O O O
help O O O O
differentiate O O O O
viral O O O O
from O O O O
bacterial O O O O
pneumonia O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
no O O O O
clinical O O O O
algorithm O O O O
exists O O O O
that O O O O
will O O O O
distinguish O O O O
clearly O O O O
the O O O O
cause O O O O
of O O O O
pneumonia O O O O
. O O O O
    
No O O O O
clear O O O O
consensus O O O O
has O O O O
been O O O O
reached O O O O
about O O O O
whether O O O O
patients O O O O
with O O O O
obvious O O O O
viral O O O O
community O O O O
- O O O O
acquired O O O O
pneumonia O O O O
need O O O O
to O O O O
be O O O O
treated O O O O
with O O O O
antibiotics O O O O
. O O O O
    
Apart O O O O
from O O O O
neuraminidase O O O O
inhibitors O O O O
for O O O O
pneumonia O O O O
caused O O O O
by O O O O
influenza O O O O
viruses O O O O
, O O O O
there O O O O
is O O O O
no O O O O
clear O O O O
role O O O O
for O O O O
use O O O O
of O O O O
specific O O O O
antivirals O O O O
to O O O O
treat O O O O
viral O O O O
community O O O O
- O O O O
acquired O O O O
pneumonia O O O O
. O O O O
    
Influenza O O O O
vaccines O O O O
are O O O O
the O O O O
only O O O O
available O O O O
specific O O O O
preventive O O O O
measures O O O O
. O O O O
    
Further O O O O
studies O O O O
are O O O O
needed O O O O
to O O O O
better O O O O
understand O O O O
the O O O O
cause O O O O
and O O O O
pathogenesis O O O O
of O O O O
community O O O O
- O O O O
acquired O O O O
pneumonia O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
regional O O O O
differences O O O O
in O O O O
cause O O O O
of O O O O
pneumonia O O O O
should O O O O
be O O O O
investigated O O O O
, O O O O
in O O O O
particular O O O O
to O O O O
obtain O O O O
more O O O O
data O O O O
from O O O O
developing O O O O
countries O O O O
. O O O O
    
Preventive O O O O
therapy O O O O
for O O O O
breast O O O O
cancer O O O O
: O O O O
a O O O O
consensus O O O O
statement O O O O
. O O O O
    
In O O O O
March O O O O
, O O O O
2010 O O O O
, O O O O
a O O O O
group O O O O
of O O O O
breast O O O O
cancer O O O O
experts O O O O
met O O O O
to O O O O
develop O O O O
a O O O O
consensus O O O O
statement O O O O
on O O O O
breast O O O O
cancer O O O O
prevention O O O O
, O O O O
with O O O O
a O O O O
focus O O O O
on O O O O
medical O O O O
and O O O O
therapeutic O O O O
interventions O O O O
. O O O O
    
We O O O O
present O O O O
the O O O O
conclusions O O O O
in O O O O
this O O O O
Review O O O O
. O O O O
    
First O O O O
we O O O O
agreed O O O O
that O O O O
the O O O O
term O O O O
chemoprevention O O O O
is O O O O
inappropriate O O O O
and O O O O
suggested O O O O
that O O O O
the O O O O
term O O O O
preventive O O O O
therapy O O O O
better O O O O
represents O O O O
this O O O O
feature O O O O
of O O O O
management O O O O
. O O O O
    
Two O O O O
selective O O O O
oestrogen O O O O
- O O O O
receptor O O O O
modulators O O O O
- O O O O
- O O O O
tamoxifen O O O O
and O O O O
raloxifene O O O O
- O O O O
- O O O O
are O O O O
so O O O O
far O O O O
the O O O O
only O O O O
medical O O O O
options O O O O
approved O O O O
by O O O O
the O O O O
US O O O O
Food O O O O
and O O O O
Drug O O O O
Administration O O O O
for O O O O
preventive O O O O
therapy O O O O
. O O O O
    
Of O O O O
these O O O O
tamoxifen O O O O
has O O O O
greater O O O O
efficacy O O O O
and O O O O
can O O O O
be O O O O
used O O O O
in O O O O
premenopausal O O O O
women O O O O
, O O O O
but O O O O
raloxifene O O O O
has O O O O
fewer O O O O
side O O O O
- O O O O
effects O O O O
. O O O O
    
Two O O O O
newer O O O O
drugs O O O O
in O O O O
this O O O O
class O O O O
, O O O O
lasofoxifene O O O O
and O O O O
arzoxifene O O O O
, O O O O
also O O O O
show O O O O
efficacy O O O O
and O O O O
possibly O O O O
a O O O O
better O O O O
overall O O O O
risk O O O O
- O O O O
benefit O O O O
profile O O O O
, O O O O
but O O O O
need O O O O
further O O O O
assessment O O O O
. O O O O
    
Aromatase O O O O
inhibitors O O O O
might O O O O
be O O O O
more O O O O
efficacious O O O O
, O O O O
and O O O O
results O O O O
of O O O O
prevention O O O O
trials O O O O
are O O O O
eagerly O O O O
awaited O O O O
. O O O O
    
Newer O O O O
agents O O O O
, O O O O
notably O O O O
bisphosphonates O O O O
and O O O O
metformin O O O O
, O O O O
have O O O O
shown O O O O
promise O O O O
in O O O O
observational O O O O
studies O O O O
and O O O O
need O O O O
to O O O O
be O O O O
assessed O O O O
in O O O O
randomised O O O O
prevention O O O O
trials O O O O
. O O O O
    
Other O O O O
agents O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
aspirin O O O O
, O O O O
other O O O O
non O O O O
- O O O O
steroidal O O O O
anti O O O O
- O O O O
inflammatory O O O O
drugs O O O O
, O O O O
COX O O O O
- O O O O
2 O O O O
inhibitors O O O O
, O O O O
retinoids O O O O
, O O O O
rexinoids O O O O
, O O O O
and O O O O
dietary O O O O
components O O O O
have O O O O
limited O O O O
effects O O O O
or O O O O
are O O O O
in O O O O
the O O O O
early O O O O
phases O O O O
of O O O O
investigation O O O O
. O O O O
    
New O O O O
contralateral O O O O
tumours O O O O
in O O O O
women O O O O
with O O O O
breast O O O O
cancer O O O O
might O O O O
be O O O O
generally O O O O
useful O O O O
as O O O O
a O O O O
model O O O O
for O O O O
prevention O O O O
, O O O O
as O O O O
has O O O O
been O O O O
seen O O O O
for O O O O
tamoxifen O O O O
. O O O O
    
If O O O O
valid O O O O
such O O O O
a O O O O
model O O O O
would O O O O
facilitate O O O O
the O O O O
design O O O O
of O O O O
simpler O O O O
, O O O O
cheaper O O O O
, O O O O
and O O O O
better O O O O
- O O O O
focused O O O O
trials O O O O
for O O O O
assessing O O O O
new O O O O
agents O O O O
. O O O O
    
Structure O O O O
and O O O O
evolution O O O O
of O O O O
the O O O O
Fusarium O O O O
mating O O O O
type O O O O
locus O O O O
: O O O O
new O O O O
insights O O O O
from O O O O
the O O O O
Gibberellafujikuroi O O O O
complex O O O O
. O O O O
    
Mating O O O O
type O O O O
genes O O O O
are O O O O
central O O O O
to O O O O
sexual O O O O
reproduction O O O O
and O O O O
compatibility O O O O
in O O O O
Ascomycete O O O O
fungi O O O O
. O O O O
    
However O O O O
the O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
MAT O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
loci O O O O
experience O O O O
unique O O O O
evolutionary O O O O
pressures O O O O
that O O O O
can O O O O
result O O O O
in O O O O
rapid O O O O
divergence O O O O
and O O O O
enhanced O O O O
inter O O O O
- O O O O
specific O O O O
gene O O O O
- O O O O
flow O O O O
( O O O O
lateral O O O O
gene O O O O
transfer O O O O
) O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
molecular O O O O
evolution O O O O
of O O O O
MAT O O O O
loci O O O O
was O O O O
considered O O O O
using O O O O
the O O O O
genus O O O O
Fusarium O O O O
( O O O O
Teleomorph O O O O
: O O O O
Gibberella O O O O
) O O O O
as O O O O
a O O O O
model O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
MAT1 O O O O
- O O O O
1 O O O O
and O O O O
MAT1 O O O O
- O O O O
2 O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
idiomorphs O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
from O O O O
eleven O O O O
species O O O O
of O O O O
the O O O O
Gibberellafujikuroi O O O O
species O O O O
complex O O O O
were O O O O
sequenced O O O O
. O O O O
    
Molecular O O O O
evolution O O O O
of O O O O
the O O O O
MAT O O O O
loci O O O O
from O O O O
these O O O O
heterothallic O O O O
( O O O O
self O O O O
- O O O O
sterile O O O O
) O O O O
species O O O O
was O O O O
compared O O O O
with O O O O
that O O O O
of O O O O
the O O O O
MAT O O O O
loci O O O O
from O O O O
nine O O O O
homothallic O O O O
( O O O O
self O O O O
- O O O O
fertile O O O O
) O O O O
species O O O O
in O O O O
the O O O O
Fusariumgraminearum B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
species O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
complex O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Although O O O O
Fusarium O O O O
has O O O O
previously O O O O
been O O O O
thought O O O O
to O O O O
have O O O O
the O O O O
same O O O O
complement O O O O
of O O O O
four O O O O
MAT O O O O
genes O O O O
that O O O O
are O O O O
found O O O O
in O O O O
Neurospora O O O O
, O O O O
we O O O O
found O O O O
evidence O O O O
of O O O O
a O O O O
novel O O O O
gene O O O O
, O O O O
MAT1 O O O O
- O O O O
2 O O O O
- O O O O
3 O O O O
, O O O O
that O O O O
may O O O O
be O O O O
specific O O O O
to O O O O
the O O O O
Hypocreales O O O O
. O O O O
    
All O O O O
MAT O O O O
genes O O O O
share O O O O
a O O O O
similar O O O O
set O O O O
of O O O O
cis O O O O
- O O O O
regulatory O O O O
motifs O O O O
, O O O O
although O O O O
homothallic O O O O
species O O O O
might O O O O
have O O O O
recruited O O O O
novel O O O O
regulatory O O O O
elements O O O O
, O O O O
which O O O O
could O O O O
potentially O O O O
facilitate O O O O
alternate O O O O
expression O O O O
of O O O O
MAT1 O O O O
- O O O O
1 O O O O
- O O O O
1 O O O O
and O O O O
MAT1 O O O O
- O O O O
2 O O O O
- O O O O
1 O O O O
. O O O O
    
FusariumMAT O O O O
loci O O O O
displayed O O O O
evidence O O O O
consistent O O O O
with O O O O
historical O O O O
lateral O O O O
gene O O O O
- O O O O
flow O O O O
. O O O O
    
Most O O O O
notably O O O O
, O O O O
the O O O O
MAT1 O O O O
- O O O O
1 O O O O
idiomorph O O O O
of O O O O
Fusariumsacchari B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
appears O O O O
to O O O O
be O O O O
unrelated O O O O
to O O O O
those O O O O
of O O O O
other O O O O
species O O O O
in O O O O
the O O O O
G O O O O
. O O O O
fujikuroi O O O O
complex O O O O
. O O O O
    
In O O O O
general O O O O
, O O O O
FusariumMAT O O O O
genes O O O O
are O O O O
highly O O O O
divergent O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
positive O O O O
selection O O O O
and O O O O
relaxed O O O O
selective O O O O
constraint O O O O
could O O O O
account O O O O
for O O O O
this O O O O
phenomenon O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
extent O O O O
of O O O O
both O O O O
recombination O O O O
and O O O O
inter O O O O
- O O O O
specific O O O O
gene O O O O
- O O O O
flow O O O O
in O O O O
the O O O O
MAT O O O O
locus O O O O
also O O O O
appears O O O O
to O O O O
affect O O O O
the O O O O
rate O O O O
of O O O O
divergence O O O O
. O O O O
    
Mucormycosis O O O O
: O O O O
its O O O O
contemporary O O O O
face O O O O
and O O O O
management O O O O
strategies O O O O
. O O O O
    
Several O O O O
countries O O O O
have O O O O
seen O O O O
rising O O O O
frequencies O O O O
of O O O O
mucormycosis O O O O
among O O O O
patients O O O O
with O O O O
haematological O O O O
disorders O O O O
, O O O O
malignancies O O O O
, O O O O
or O O O O
diabetes O O O O
mellitus O O O O
, O O O O
and O O O O
among O O O O
transplant O O O O
recipients O O O O
. O O O O
    
Growing O O O O
numbers O O O O
of O O O O
immunocompromised O O O O
hosts O O O O
, O O O O
widespread O O O O
use O O O O
of O O O O
antifungal O O O O
agents O O O O
inactive O O O O
against O O O O
mucormycosis O O O O
, O O O O
or O O O O
other O O O O
unidentified O O O O
factors O O O O
, O O O O
could O O O O
be O O O O
contributing O O O O
to O O O O
this O O O O
situation O O O O
. O O O O
    
The O O O O
predominant O O O O
clinical O O O O
manifestations O O O O
of O O O O
mucormycosis O O O O
vary O O O O
from O O O O
host O O O O
to O O O O
host O O O O
. O O O O
    
Additionally O O O O
, O O O O
risk O O O O
factors O O O O
specific O O O O
to O O O O
different O O O O
subgroups O O O O
have O O O O
been O O O O
identified O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
leukaemia O O O O
, O O O O
allogeneic O O O O
haemopoietic O O O O
stem O O O O
- O O O O
cell O O O O
transplant O O O O
, O O O O
voriconazole O O O O
prophylaxis O O O O
, O O O O
diabetes O O O O
, O O O O
and O O O O
malnutrition O O O O
. O O O O
    
We O O O O
summarise O O O O
the O O O O
current O O O O
state O O O O
of O O O O
knowledge O O O O
of O O O O
characteristics O O O O
and O O O O
risk O O O O
factors O O O O
and O O O O
discuss O O O O
topical O O O O
developments O O O O
in O O O O
therapeutic O O O O
methods O O O O
and O O O O
strategies O O O O
in O O O O
the O O O O
management O O O O
of O O O O
mucormycosis O O O O
. O O O O
    
Hygiene O O O O
: O O O O
new O O O O
hopes O O O O
, O O O O
new O O O O
horizons O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
promotion O O O O
of O O O O
safe O O O O
hygiene O O O O
is O O O O
the O O O O
single O O O O
most O O O O
cost O O O O
- O O O O
effective O O O O
means O O O O
of O O O O
preventing O O O O
infectious O O O O
disease O O O O
, O O O O
investment O O O O
in O O O O
hygiene O O O O
is O O O O
low O O O O
both O O O O
in O O O O
the O O O O
health O O O O
and O O O O
in O O O O
the O O O O
water O O O O
and O O O O
sanitation O O O O
sectors O O O O
. O O O O
    
Evidence O O O O
shows O O O O
the O O O O
benefit O O O O
of O O O O
improved O O O O
hygiene O O O O
, O O O O
especially O O O O
for O O O O
improved O O O O
handwashing O O O O
and O O O O
safe O O O O
stool O O O O
disposal O O O O
. O O O O
    
A O O O O
growing O O O O
understanding O O O O
of O O O O
what O O O O
drives O O O O
hygiene O O O O
behaviour O O O O
and O O O O
creative O O O O
partnerships O O O O
are O O O O
providing O O O O
fresh O O O O
approaches O O O O
to O O O O
change O O O O
behaviour O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
some O O O O
important O O O O
gaps O O O O
in O O O O
our O O O O
knowledge O O O O
exist O O O O
. O O O O
    
For O O O O
example O O O O
, O O O O
almost O O O O
no O O O O
trials O O O O
of O O O O
the O O O O
effectiveness O O O O
of O O O O
interventions O O O O
to O O O O
improve O O O O
food O O O O
hygiene O O O O
in O O O O
developing O O O O
countries O O O O
are O O O O
available O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
need O O O O
to O O O O
figure O O O O
out O O O O
how O O O O
best O O O O
to O O O O
make O O O O
safe O O O O
hygiene O O O O
practices O O O O
matters O O O O
of O O O O
daily O O O O
routine O O O O
that O O O O
are O O O O
sustained O O O O
by O O O O
social O O O O
norms O O O O
on O O O O
a O O O O
mass O O O O
scale O O O O
. O O O O
    
Full O O O O
and O O O O
active O O O O
involvement O O O O
of O O O O
the O O O O
health O O O O
sector O O O O
in O O O O
getting O O O O
safe O O O O
hygiene O O O O
to O O O O
all O O O O
homes O O O O
, O O O O
schools O O O O
, O O O O
and O O O O
institutions O O O O
will O O O O
bring O O O O
major O O O O
gains O O O O
to O O O O
public O O O O
health O O O O
. O O O O
    
Visceral O O O O
leishmaniasis O O O O
: O O O O
elimination O O O O
with O O O O
existing O O O O
interventions O O O O
. O O O O
    
The O O O O
world O O O O
' O O O O
s O O O O
burden O O O O
of O O O O
infectious O O O O
diseases O O O O
can O O O O
be O O O O
substantially O O O O
reduced O O O O
by O O O O
more O O O O
- O O O O
effective O O O O
use O O O O
of O O O O
existing O O O O
interventions O O O O
. O O O O
    
Advances O O O O
in O O O O
case O O O O
detection O O O O
, O O O O
diagnosis O O O O
, O O O O
and O O O O
treatment O O O O
strategies O O O O
have O O O O
made O O O O
it O O O O
possible O O O O
to O O O O
consider O O O O
the O O O O
elimination O O O O
of O O O O
visceral O O O O
leishmaniasis O O O O
in O O O O
the O O O O
Indian O O O O
subcontinent O O O O
. O O O O
    
The O O O O
priority O O O O
must O O O O
now O O O O
be O O O O
to O O O O
effectively O O O O
implement O O O O
existing O O O O
interventions O O O O
at O O O O
the O O O O
community O O O O
level O O O O
by O O O O
actively O O O O
finding O O O O
cases O O O O
in O O O O
endemic O O O O
villages O O O O
and O O O O
treating O O O O
them O O O O
with O O O O
single O O O O
- O O O O
dose O O O O
liposomal O O O O
amphotericin O O O O
B O O O O
at O O O O
primary O O O O
- O O O O
health O O O O
- O O O O
care O O O O
centres O O O O
. O O O O
    
Once O O O O
the O O O O
elimination O O O O
target O O O O
of O O O O
one O O O O
case O O O O
per O O O O
10 O O O O
, O O O O
000 O O O O
population O O O O
has O O O O
been O O O O
reached O O O O
, O O O O
combination O O O O
therapies O O O O
involving O O O O
miltefosine O O O O
and O O O O
paromomycin O O O O
can O O O O
be O O O O
introduced O O O O
to O O O O
ensure O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
availability O O O O
of O O O O
several O O O O
drugs O O O O
for O O O O
visceral O O O O
leishmaniasis O O O O
and O O O O
to O O O O
protect O O O O
against O O O O
resistance O O O O
. O O O O
    
Glaucoma O O O O
. O O O O
    
Most O O O O
medical O O O O
practitioners O O O O
have O O O O
regular O O O O
contact O O O O
with O O O O
adults O O O O
who O O O O
have O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
two O O O O
forms O O O O
of O O O O
glaucoma O O O O
: O O O O
open O O O O
- O O O O
angle O O O O
glaucoma O O O O
or O O O O
angle O O O O
- O O O O
closure O O O O
glaucoma O O O O
. O O O O
    
Data O O O O
from O O O O
population O O O O
- O O O O
based O O O O
surveys O O O O
indicate O O O O
that O O O O
one O O O O
in O O O O
40 O O O O
adults O O O O
older O O O O
than O O O O
40 O O O O
years O O O O
has O O O O
glaucoma O O O O
with O O O O
loss O O O O
of O O O O
visual O O O O
function O O O O
, O O O O
which O O O O
equates O O O O
to O O O O
60 O O O O
million O O O O
people O O O O
worldwide O O O O
being O O O O
affected O O O O
and O O O O
8 O O O O
* O O O O
4 O O O O
million O O O O
being O O O O
bilaterally O O O O
blind O O O O
. O O O O
    
Even O O O O
in O O O O
developed O O O O
countries O O O O
, O O O O
half O O O O
of O O O O
glaucoma O O O O
cases O O O O
are O O O O
undiagnosed O O O O
. O O O O
    
Glaucoma O O O O
is O O O O
mostly O O O O
asymptomatic O O O O
until O O O O
late O O O O
in O O O O
the O O O O
disease O O O O
when O O O O
visual O O O O
problems O O O O
arise O O O O
. O O O O
    
Vision O O O O
loss O O O O
from O O O O
glaucoma O O O O
cannot O O O O
be O O O O
recovered O O O O
, O O O O
and O O O O
improved O O O O
case O O O O
- O O O O
detection O O O O
methods O O O O
for O O O O
glaucoma O O O O
are O O O O
needed O O O O
. O O O O
    
Glaucoma O O O O
is O O O O
commonly O O O O
treated O O O O
with O O O O
daily O O O O
eye O O O O
- O O O O
drop O O O O
drugs O O O O
, O O O O
but O O O O
adherence O O O O
to O O O O
treatment O O O O
is O O O O
often O O O O
unsatisfactory O O O O
. O O O O
    
As O O O O
a O O O O
usually O O O O
asymptomatic O O O O
and O O O O
chronic O O O O
disease O O O O
, O O O O
glaucoma O O O O
has O O O O
similar O O O O
treatment O O O O
challenges O O O O
to O O O O
chronic O O O O
systemic O O O O
diseases O O O O
. O O O O
    
Similarities O O O O
to O O O O
the O O O O
pathogenesis O O O O
of O O O O
common O O O O
CNS O O O O
diseases O O O O
mean O O O O
that O O O O
common O O O O
neuroprotective O O O O
strategies O O O O
might O O O O
exist O O O O
. O O O O
    
Successful O O O O
gene O O O O
therapy O O O O
, O O O O
which O O O O
has O O O O
been O O O O
used O O O O
for O O O O
other O O O O
eye O O O O
diseases O O O O
might O O O O
be O O O O
possible O O O O
for O O O O
the O O O O
treatment O O O O
of O O O O
glaucoma O O O O
in O O O O
the O O O O
future O O O O
. O O O O
    
Heating O O O O
up O O O O
relations O O O O
between O O O O
cold O O O O
fish O O O O
: O O O O
competition O O O O
modifies O O O O
responses O O O O
to O O O O
climate O O O O
change O O O O
. O O O O
    
Most O O O O
predictions O O O O
about O O O O
species O O O O
responses O O O O
to O O O O
climate O O O O
change O O O O
ignore O O O O
species O O O O
interactions O O O O
. O O O O
    
Helland O O O O
and O O O O
colleagues O O O O
( O O O O
2011 O O O O
) O O O O
test O O O O
whether O O O O
this O O O O
assumption O O O O
is O O O O
valid O O O O
by O O O O
evaluating O O O O
whether O O O O
ice O O O O
cover O O O O
affects O O O O
competition O O O O
between O O O O
brown B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trout O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
[ O O O O
Salmo B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trutta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
L O O O O
. O O O O
) O O O O
] O O O O
and O O O O
Arctic B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
charr O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
[ O O O O
Salvelinus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
alpines O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
L O O O O
. O O O O
) O O O O
] O O O O
. O O O O
    
They O O O O
show O O O O
that O O O O
increasing O O O O
ice O O O O
cover O O O O
correlates O O O O
with O O O O
lower O O O O
trout O O O O
biomass O O O O
when O O O O
Arctic B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
charr O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
co O O O O
- O O O O
occur O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
in O O O O
charr B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
' O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
s O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
absence O O O O
. O O O O
    
In O O O O
experiments O O O O
, O O O O
charr B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
grew O O O O
better O O O O
in O O O O
the O O O O
cold O O O O
, O O O O
dark O O O O
environments O O O O
that O O O O
typify O O O O
ice O O O O
- O O O O
covered O O O O
lakes O O O O
. O O O O
    
Decreasing O O O O
ice O O O O
cover O O O O
with O O O O
warmer O O O O
winters O O O O
could O O O O
mean O O O O
more O O O O
trout O O O O
and O O O O
fewer O O O O
charr B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
More O O O O
generally O O O O
, O O O O
their O O O O
results O O O O
provide O O O O
an O O O O
excellent O O O O
example O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
species O O O O
interactions O O O O
can O O O O
strongly O O O O
modify O O O O
responses O O O O
to O O O O
climate O O O O
change O O O O
. O O O O
    
An O O O O
empirical O O O O
link O O O O
between O O O O
the O O O O
spectral O O O O
colour O O O O
of O O O O
climate O O O O
and O O O O
the O O O O
spectral O O O O
colour O O O O
of O O O O
field O O O O
populations O O O O
in O O O O
the O O O O
context O O O O
of O O O O
climate O O O O
change O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
spectral O O O O
colour O O O O
of O O O O
population O O O O
dynamics O O O O
and O O O O
its O O O O
causes O O O O
have O O O O
attracted O O O O
much O O O O
interest O O O O
. O O O O
    
The O O O O
spectral O O O O
colour O O O O
of O O O O
a O O O O
time O O O O
series O O O O
can O O O O
be O O O O
determined O O O O
from O O O O
its O O O O
power O O O O
spectrum O O O O
, O O O O
which O O O O
shows O O O O
what O O O O
proportion O O O O
of O O O O
the O O O O
total O O O O
variance O O O O
in O O O O
the O O O O
time O O O O
series O O O O
occurs O O O O
at O O O O
each O O O O
frequency O O O O
. O O O O
    
A O O O O
time O O O O
series O O O O
with O O O O
a O O O O
red O O O O
spectrum O O O O
( O O O O
a O O O O
negative O O O O
spectral O O O O
exponent O O O O
) O O O O
is O O O O
dominated O O O O
by O O O O
low O O O O
- O O O O
frequency O O O O
oscillations O O O O
, O O O O
and O O O O
a O O O O
time O O O O
series O O O O
with O O O O
a O O O O
blue O O O O
spectrum O O O O
( O O O O
a O O O O
positive O O O O
spectral O O O O
exponent O O O O
) O O O O
is O O O O
dominated O O O O
by O O O O
high O O O O
- O O O O
frequency O O O O
oscillations O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
climate O O O O
variables O O O O
and O O O O
population O O O O
time O O O O
series O O O O
are O O O O
characterised O O O O
by O O O O
red O O O O
spectra O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
a O O O O
population O O O O
' O O O O
s O O O O
environment O O O O
might O O O O
be O O O O
partly O O O O
responsible O O O O
for O O O O
its O O O O
spectral O O O O
colour O O O O
. O O O O
    
Laboratory O O O O
experiments O O O O
and O O O O
models O O O O
have O O O O
been O O O O
used O O O O
to O O O O
investigate O O O O
this O O O O
potential O O O O
link O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
no O O O O
study O O O O
using O O O O
field O O O O
data O O O O
has O O O O
directly O O O O
tested O O O O
whether O O O O
populations O O O O
in O O O O
redder O O O O
environments O O O O
are O O O O
redder O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
uses O O O O
the O O O O
Global O O O O
Population O O O O
Dynamics O O O O
Database O O O O
together O O O O
with O O O O
climate O O O O
data O O O O
to O O O O
test O O O O
for O O O O
this O O O O
effect O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
that O O O O
the O O O O
spectral O O O O
exponent O O O O
of O O O O
mean O O O O
summer O O O O
temperatures O O O O
correlates O O O O
positively O O O O
and O O O O
significantly O O O O
with O O O O
population O O O O
spectral O O O O
exponent O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
found O O O O
that O O O O
over O O O O
the O O O O
last O O O O
century O O O O
, O O O O
temperature O O O O
climate O O O O
variables O O O O
on O O O O
most O O O O
continents O O O O
have O O O O
become O O O O
bluer O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
population O O O O
time O O O O
series O O O O
are O O O O
not O O O O
long O O O O
or O O O O
abundant O O O O
enough O O O O
to O O O O
judge O O O O
directly O O O O
whether O O O O
their O O O O
spectral O O O O
colours O O O O
are O O O O
changing O O O O
, O O O O
our O O O O
two O O O O
results O O O O
taken O O O O
together O O O O
suggest O O O O
that O O O O
population O O O O
spectral O O O O
colour O O O O
may O O O O
be O O O O
affected O O O O
by O O O O
the O O O O
changing O O O O
spectral O O O O
colour O O O O
of O O O O
climate O O O O
variables O O O O
. O O O O
    
Population O O O O
spectral O O O O
colour O O O O
has O O O O
been O O O O
linked O O O O
to O O O O
extinction O O O O
; O O O O
we O O O O
discuss O O O O
the O O O O
potential O O O O
implications O O O O
of O O O O
our O O O O
results O O O O
for O O O O
extinction O O O O
probability O O O O
. O O O O
    
Response O O O O
assessment O O O O
in O O O O
neuro O O O O
- O O O O
oncology O O O O
( O O O O
a O O O O
report O O O O
of O O O O
the O O O O
RANO O O O O
group O O O O
) O O O O
: O O O O
assessment O O O O
of O O O O
outcome O O O O
in O O O O
trials O O O O
of O O O O
diffuse O O O O
low O O O O
- O O O O
grade O O O O
gliomas O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
low O O O O
- O O O O
grade O O O O
gliomas O O O O
( O O O O
LGG O O O O
) O O O O
have O O O O
a O O O O
less O O O O
aggressive O O O O
course O O O O
than O O O O
do O O O O
high O O O O
- O O O O
grade O O O O
gliomas O O O O
, O O O O
the O O O O
outcome O O O O
of O O O O
these O O O O
tumours O O O O
is O O O O
ultimately O O O O
fatal O O O O
in O O O O
most O O O O
patients O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
the O O O O
tumour O O O O
and O O O O
its O O O O
treatment O O O O
can O O O O
cause O O O O
disabling O O O O
morbidity O O O O
, O O O O
particularly O O O O
of O O O O
cognitive O O O O
functions O O O O
. O O O O
    
Because O O O O
many O O O O
patients O O O O
present O O O O
with O O O O
seizures O O O O
only O O O O
, O O O O
with O O O O
no O O O O
other O O O O
signs O O O O
and O O O O
symptoms O O O O
, O O O O
maintenance O O O O
of O O O O
quality O O O O
of O O O O
life O O O O
and O O O O
function O O O O
constitutes O O O O
a O O O O
particular O O O O
challenge O O O O
in O O O O
LGG O O O O
. O O O O
    
The O O O O
slow O O O O
growth O O O O
pattern O O O O
of O O O O
most O O O O
LGG O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
rare O O O O
radiological O O O O
true O O O O
responses O O O O
despite O O O O
a O O O O
favourable O O O O
clinical O O O O
response O O O O
to O O O O
treatment O O O O
, O O O O
interferes O O O O
with O O O O
the O O O O
use O O O O
of O O O O
progression O O O O
- O O O O
free O O O O
survival O O O O
as O O O O
the O O O O
primary O O O O
endpoint O O O O
in O O O O
trials O O O O
. O O O O
    
Overall O O O O
survival O O O O
as O O O O
an O O O O
endpoint O O O O
brings O O O O
logistical O O O O
challenges O O O O
, O O O O
and O O O O
is O O O O
sensitive O O O O
to O O O O
other O O O O
non O O O O
- O O O O
investigational O O O O
salvage O O O O
therapies O O O O
. O O O O
    
Clinical O O O O
trials O O O O
for O O O O
LGG O O O O
need O O O O
to O O O O
consider O O O O
other O O O O
measures O O O O
of O O O O
patient O O O O
benefit O O O O
such O O O O
as O O O O
cognition O O O O
, O O O O
symptom O O O O
burden O O O O
, O O O O
and O O O O
seizure O O O O
activity O O O O
, O O O O
to O O O O
establish O O O O
whether O O O O
improved O O O O
survival O O O O
is O O O O
reflected O O O O
in O O O O
prolonged O O O O
wellbeing O O O O
. O O O O
    
This O O O O
Review O O O O
investigates O O O O
clinical O O O O
and O O O O
imaging O O O O
endpoints O O O O
in O O O O
trials O O O O
of O O O O
LGG O O O O
, O O O O
and O O O O
provides O O O O
response O O O O
assessment O O O O
in O O O O
neuro O O O O
- O O O O
oncology O O O O
( O O O O
RANO O O O O
) O O O O
criteria O O O O
for O O O O
non O O O O
- O O O O
enhancing O O O O
tumours O O O O
. O O O O
    
Additionally O O O O
, O O O O
other O O O O
measures O O O O
for O O O O
patients O O O O
with O O O O
brain O O O O
tumours O O O O
that O O O O
assess O O O O
outcome O O O O
are O O O O
described O O O O
. O O O O
    
Similar O O O O
considerations O O O O
are O O O O
relevant O O O O
for O O O O
trials O O O O
of O O O O
high O O O O
- O O O O
grade O O O O
gliomas O O O O
, O O O O
although O O O O
for O O O O
these O O O O
tumours O O O O
survival O O O O
is O O O O
shorter O O O O
and O O O O
survival O O O O
endpoints O O O O
generally O O O O
have O O O O
more O O O O
value O O O O
than O O O O
they O O O O
do O O O O
for O O O O
LGG O O O O
. O O O O
    
Baculovirus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cyclobutane O O O O
pyrimidine O O O O
dimer O O O O
photolyases O O O O
show O O O O
a O O O O
close O O O O
relationship O O O O
with O O O O
lepidopteran O O O O
host O O O O
homologues O O O O
. O O O O
    
Cyclobutane O O O O
pyrimidine O O O O
dimer O O O O
( O O O O
CPD O O O O
) O O O O
photolyases O O O O
repair O O O O
ultraviolet O O O O
( O O O O
UV O O O O
) O O O O
- O O O O
induced O O O O
DNA O O O O
damage O O O O
using O O O O
blue O O O O
light O O O O
. O O O O
    
To O O O O
get O O O O
insight O O O O
in O O O O
the O O O O
origin O O O O
of O O O O
baculovirus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
CPD O O O O
photolyase O O O O
( O O O O
phr O O O O
) O O O O
genes O O O O
, O O O O
homologues O O O O
in O O O O
the O O O O
lepidopteran O O O O
insects O O O O
Chrysodeixis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
chalcites O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Spodoptera B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
exigua O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Trichoplusia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ni O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
were O O O O
identified O O O O
and O O O O
characterized O O O O
. O O O O
    
Lepidopteran O O O O
and O O O O
baculovirus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
phr O O O O
genes O O O O
each O O O O
form O O O O
a O O O O
monophyletic O O O O
group O O O O
, O O O O
and O O O O
together O O O O
form O O O O
a O O O O
well O O O O
- O O O O
supported O O O O
clade O O O O
within O O O O
the O O O O
insect O O O O
photolyases O O O O
. O O O O
    
This O O O O
suggests O O O O
that O O O O
baculoviruses B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
obtained O O O O
their O O O O
phr O O O O
genes O O O O
from O O O O
an O O O O
ancestral O O O O
lepidopteran O O O O
insect O O O O
host O O O O
. O O O O
    
A O O O O
likely O O O O
evolutionary O O O O
scenario O O O O
is O O O O
that O O O O
a O O O O
granulovirus O O O O
, O O O O
Spodoptera B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
litura O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
GV O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
or O O O O
a O O O O
direct O O O O
ancestor O O O O
, O O O O
obtained O O O O
a O O O O
phr O O O O
gene O O O O
. O O O O
    
Subsequently O O O O
, O O O O
it O O O O
was O O O O
horizontally O O O O
transferred O O O O
from O O O O
this O O O O
granulovirus O O O O
to O O O O
several O O O O
group O O O O
II O O O O
nucleopolyhedroviruses O O O O
( O O O O
NPVs O O O O
) O O O O
, O O O O
including O O O O
those O O O O
that O O O O
infect O O O O
noctuids O O O O
of O O O O
the O O O O
Plusiinae O O O O
subfamily O O O O
. O O O O
    
The O O O O
importance O O O O
of O O O O
marine O O O O
vs O O O O
. O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
induced O O O O
subsidies O O O O
in O O O O
the O O O O
maintenance O O O O
of O O O O
an O O O O
expanding O O O O
mesocarnivore O O O O
in O O O O
the O O O O
arctic O O O O
tundra O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Most O O O O
studies O O O O
addressing O O O O
the O O O O
causes O O O O
of O O O O
the O O O O
recent O O O O
increases O O O O
and O O O O
expansions O O O O
of O O O O
mesopredators O O O O
in O O O O
many O O O O
ecosystems O O O O
have O O O O
focused O O O O
on O O O O
the O O O O
top O O O O
- O O O O
down O O O O
, O O O O
releasing O O O O
effect O O O O
of O O O O
extinctions O O O O
of O O O O
large O O O O
apex O O O O
predators O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
in O O O O
the O O O O
case O O O O
of O O O O
the O O O O
northward O O O O
expansion O O O O
of O O O O
the O O O O
red B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fox O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
into O O O O
the O O O O
arctic O O O O
tundra O O O O
, O O O O
a O O O O
bottom O O O O
- O O O O
up O O O O
effect O O O O
of O O O O
increased O O O O
resource O O O O
availability O O O O
has O O O O
been O O O O
proposed O O O O
, O O O O
an O O O O
effect O O O O
that O O O O
can O O O O
counteract O O O O
prey O O O O
shortage O O O O
in O O O O
the O O O O
low O O O O
phase O O O O
of O O O O
the O O O O
multi O O O O
- O O O O
annual O O O O
rodent O O O O
cycle O O O O
. O O O O
    
Resource O O O O
subsidies O O O O
both O O O O
with O O O O
marine O O O O
and O O O O
with O O O O
terrestrial O O O O
origins O O O O
could O O O O
potentially O O O O
be O O O O
involved O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
During O O O O
different O O O O
phases O O O O
of O O O O
a O O O O
multi O O O O
- O O O O
annual O O O O
rodent O O O O
cycle O O O O
, O O O O
we O O O O
investigated O O O O
the O O O O
seasonal O O O O
dynamics O O O O
and O O O O
spatial O O O O
pattern O O O O
of O O O O
resource O O O O
use O O O O
by O O O O
red B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
foxes O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
across O O O O
a O O O O
coast O O O O
to O O O O
inland O O O O
low O O O O
arctic O O O O
tundra O O O O
gradient O O O O
, O O O O
Varanger O O O O
Peninsula O O O O
, O O O O
Norway O O O O
. O O O O
    
We O O O O
employed O O O O
two O O O O
complementary O O O O
methods O O O O
of O O O O
diet O O O O
analyses O O O O
: O O O O
stomach O O O O
contents O O O O
and O O O O
stable O O O O
isotope O O O O
analysis O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
that O O O O
inland O O O O
red B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
foxes O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
primarily O O O O
subsisted O O O O
on O O O O
reindeer B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
carrions O O O O
during O O O O
the O O O O
low O O O O
phase O O O O
of O O O O
a O O O O
small O O O O
rodent O O O O
population O O O O
cycle O O O O
. O O O O
    
Lemmings O O O O
became O O O O
the O O O O
most O O O O
important O O O O
food O O O O
item O O O O
towards O O O O
the O O O O
peak O O O O
phase O O O O
of O O O O
the O O O O
rodent O O O O
cycle O O O O
, O O O O
despite O O O O
being O O O O
less O O O O
abundant O O O O
than O O O O
sympatric O O O O
voles B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Isotopic O O O O
signatures O O O O
of O O O O
tissue O O O O
from O O O O
both O O O O
predator O O O O
and O O O O
prey O O O O
also O O O O
revealed O O O O
that O O O O
red B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
foxes O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
near O O O O
the O O O O
coast O O O O
used O O O O
marine O O O O
- O O O O
derived O O O O
subsidies O O O O
in O O O O
the O O O O
winter O O O O
, O O O O
but O O O O
these O O O O
allochthonous O O O O
resources O O O O
did O O O O
not O O O O
spillover O O O O
to O O O O
adult O O O O
foxes O O O O
living O O O O
beyond O O O O
20 O O O O
- O O O O
25 O O O O
km O O O O
from O O O O
the O O O O
coast O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
more O O O O
needs O O O O
to O O O O
be O O O O
learned O O O O
about O O O O
the O O O O
link O O O O
between O O O O
increasing O O O O
primary O O O O
productivity O O O O
due O O O O
to O O O O
climatic O O O O
warming O O O O
and O O O O
trophic O O O O
dynamics O O O O
in O O O O
tundra O O O O
ecosystems O O O O
, O O O O
we O O O O
suggest O O O O
that O O O O
changes O O O O
in O O O O
reindeer B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
management O O O O
through O O O O
a O O O O
bottom O O O O
- O O O O
up O O O O
effect O O O O
, O O O O
at O O O O
least O O O O
regionally O O O O
, O O O O
may O O O O
have O O O O
paved O O O O
the O O O O
way O O O O
towards O O O O
the O O O O
establishment O O O O
of O O O O
a O O O O
new O O O O
mesopredator O O O O
in O O O O
the O O O O
tundra O O O O
biome O O O O
. O O O O
    
Mathematical O O O O
models O O O O
in O O O O
the O O O O
evaluation O O O O
of O O O O
health O O O O
programmes O O O O
. O O O O
    
Modelling O O O O
is O O O O
valuable O O O O
in O O O O
the O O O O
planning O O O O
and O O O O
evaluation O O O O
of O O O O
interventions O O O O
, O O O O
especially O O O O
when O O O O
a O O O O
controlled O O O O
trial O O O O
is O O O O
ethically O O O O
or O O O O
logistically O O O O
impossible O O O O
. O O O O
    
Models O O O O
are O O O O
often O O O O
used O O O O
to O O O O
calculate O O O O
the O O O O
expected O O O O
course O O O O
of O O O O
events O O O O
in O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
more O O O O
formal O O O O
assessments O O O O
. O O O O
    
They O O O O
are O O O O
also O O O O
used O O O O
to O O O O
derive O O O O
estimates O O O O
of O O O O
rare O O O O
or O O O O
future O O O O
events O O O O
from O O O O
recorded O O O O
intermediate O O O O
points O O O O
. O O O O
    
When O O O O
developing O O O O
models O O O O
, O O O O
decisions O O O O
are O O O O
needed O O O O
about O O O O
the O O O O
appropriate O O O O
level O O O O
of O O O O
complexity O O O O
to O O O O
be O O O O
represented O O O O
and O O O O
about O O O O
model O O O O
structure O O O O
and O O O O
assumptions O O O O
. O O O O
    
The O O O O
degree O O O O
of O O O O
rigor O O O O
in O O O O
model O O O O
development O O O O
and O O O O
assessment O O O O
can O O O O
vary O O O O
greatly O O O O
, O O O O
and O O O O
there O O O O
is O O O O
a O O O O
danger O O O O
that O O O O
existing O O O O
beliefs O O O O
inappropriately O O O O
influence O O O O
judgments O O O O
about O O O O
model O O O O
assumptions O O O O
and O O O O
results O O O O
. O O O O
    
Scale O O O O
and O O O O
state O O O O
dependence O O O O
of O O O O
the O O O O
relationship O O O O
between O O O O
personality O O O O
and O O O O
dispersal O O O O
in O O O O
a O O O O
great B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tit O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
population O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Dispersal O O O O
is O O O O
a O O O O
key O O O O
process O O O O
in O O O O
population O O O O
biology O O O O
and O O O O
ecology O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
the O O O O
general O O O O
ecological O O O O
conditions O O O O
that O O O O
lead O O O O
to O O O O
dispersal O O O O
have O O O O
been O O O O
well O O O O
studied O O O O
, O O O O
the O O O O
causes O O O O
of O O O O
individual O O O O
variation O O O O
in O O O O
dispersal O O O O
are O O O O
less O O O O
well O O O O
understood O O O O
. O O O O
    
A O O O O
number O O O O
of O O O O
recent O O O O
studies O O O O
suggest O O O O
that O O O O
heritable O O O O
temperament O O O O
- O O O O
or O O O O
personality O O O O
- O O O O
traits O O O O
are O O O O
correlated O O O O
with O O O O
dispersal O O O O
in O O O O
the O O O O
wild O O O O
but O O O O
the O O O O
extent O O O O
to O O O O
which O O O O
these O O O O
' O O O O
personality O O O O
- O O O O
dispersal O O O O
syndromes O O O O
' O O O O
are O O O O
general O O O O
, O O O O
how O O O O
they O O O O
depend O O O O
on O O O O
an O O O O
individual O O O O
' O O O O
s O O O O
state O O O O
and O O O O
on O O O O
spatial O O O O
scale O O O O
and O O O O
whether O O O O
they O O O O
are O O O O
temporally O O O O
stable O O O O
, O O O O
both O O O O
within O O O O
and O O O O
across O O O O
individuals O O O O
, O O O O
remains O O O O
unclear O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
examine O O O O
the O O O O
relationship O O O O
between O O O O
exploration O O O O
behaviour O O O O
- O O O O
an O O O O
axis O O O O
of O O O O
personality O O O O
that O O O O
appears O O O O
to O O O O
be O O O O
important O O O O
in O O O O
animals O O O O
generally O O O O
- O O O O
and O O O O
a O O O O
variety O O O O
of O O O O
dispersal O O O O
processes O O O O
over O O O O
6 O O O O
years O O O O
in O O O O
a O O O O
population O O O O
of O O O O
the O O O O
great B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tit O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Parus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
major O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Exploration O O O O
behaviour O O O O
was O O O O
higher O O O O
in O O O O
immigrant O O O O
than O O O O
in O O O O
locally O O O O
born O O O O
juveniles O O O O
, O O O O
but O O O O
the O O O O
difference O O O O
was O O O O
much O O O O
larger O O O O
for O O O O
individuals O O O O
with O O O O
a O O O O
small O O O O
body O O O O
mass O O O O
, O O O O
though O O O O
independent O O O O
of O O O O
sex O O O O
, O O O O
representing O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
first O O O O
examples O O O O
of O O O O
a O O O O
state O O O O
- O O O O
dependent O O O O
effect O O O O
in O O O O
a O O O O
personality O O O O
- O O O O
dispersal O O O O
syndrome O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Despite O O O O
a O O O O
temporal O O O O
trend O O O O
in O O O O
exploration O O O O
behaviour O O O O
at O O O O
the O O O O
population O O O O
level O O O O
, O O O O
the O O O O
difference O O O O
between O O O O
immigrants O O O O
and O O O O
locally O O O O
born O O O O
birds O O O O
remained O O O O
stable O O O O
over O O O O
time O O O O
, O O O O
both O O O O
across O O O O
and O O O O
within O O O O
individuals O O O O
. O O O O
    
This O O O O
suggests O O O O
that O O O O
the O O O O
personality O O O O
difference O O O O
between O O O O
immigrants O O O O
and O O O O
locally O O O O
born O O O O
birds O O O O
is O O O O
established O O O O
early O O O O
in O O O O
development O O O O
, O O O O
but O O O O
that O O O O
the O O O O
process O O O O
of O O O O
immigration O O O O
interacts O O O O
with O O O O
both O O O O
personality O O O O
and O O O O
state O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
that O O O O
the O O O O
number O O O O
of O O O O
immigrant O O O O
parents O O O O
a O O O O
locally O O O O
born O O O O
bird O O O O
had O O O O
did O O O O
not O O O O
influence O O O O
exploration O O O O
behaviour O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
either O O O O
the O O O O
difference O O O O
between O O O O
immigrants O O O O
and O O O O
residents O O O O
was O O O O
environmental O O O O
or O O O O
that O O O O
the O O O O
effect O O O O
is O O O O
overridden O O O O
by O O O O
local O O O O
environmental O O O O
sources O O O O
of O O O O
variation O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
to O O O O
previous O O O O
work O O O O
, O O O O
we O O O O
found O O O O
no O O O O
evidence O O O O
for O O O O
links O O O O
between O O O O
personality O O O O
and O O O O
natal O O O O
dispersal O O O O
distance O O O O
within O O O O
the O O O O
population O O O O
, O O O O
either O O O O
in O O O O
terms O O O O
of O O O O
an O O O O
individual O O O O
' O O O O
s O O O O
own O O O O
exploration O O O O
behaviour O O O O
or O O O O
that O O O O
of O O O O
its O O O O
parents O O O O
. O O O O
    
7 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
there O O O O
are O O O O
links O O O O
between O O O O
individual O O O O
differences O O O O
in O O O O
personality O O O O
and O O O O
dispersal O O O O
, O O O O
but O O O O
that O O O O
these O O O O
can O O O O
be O O O O
dependent O O O O
on O O O O
differences O O O O
in O O O O
state O O O O
among O O O O
individuals O O O O
and O O O O
on O O O O
the O O O O
scale O O O O
over O O O O
which O O O O
dispersal O O O O
is O O O O
measured O O O O
. O O O O
    
Future O O O O
work O O O O
should O O O O
aim O O O O
to O O O O
understand O O O O
the O O O O
differences O O O O
between O O O O
dispersal O O O O
within O O O O
and O O O O
between O O O O
populations O O O O
and O O O O
the O O O O
ways O O O O
in O O O O
which O O O O
personality O O O O
and O O O O
state O O O O
interact O O O O
to O O O O
determine O O O O
the O O O O
outcome O O O O
of O O O O
these O O O O
processes O O O O
. O O O O
    
A O O O O
role O O O O
for O O O O
endosomal O O O O
proteins O O O O
in O O O O
alphavirus O O O O
dissemination O O O O
in O O O O
mosquitoes O O O O
. O O O O
    
Little O O O O
is O O O O
known O O O O
about O O O O
endosomal O O O O
pathway O O O O
proteins O O O O
involved O O O O
in O O O O
arthropod O O O O
- O O O O
borne O O O O
virus O O O O
( O O O O
arbovirus O O O O
) O O O O
assembly O O O O
and O O O O
cell O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
cell O O O O
spread O O O O
in O O O O
vector O O O O
mosquitoes O O O O
. O O O O
    
UNC93A O O O O
and O O O O
synaptic O O O O
vesicle O O O O
- O O O O
2 O O O O
( O O O O
SV2 O O O O
) O O O O
proteins O O O O
are O O O O
involved O O O O
in O O O O
intracellular O O O O
transport O O O O
in O O O O
mammals O O O O
. O O O O
    
They O O O O
show O O O O
amino O O O O
acid O O O O
sequence O O O O
conservation O O O O
from O O O O
mosquitoes O O O O
to O O O O
humans B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
and O O O O
their O O O O
transcripts O O O O
are O O O O
highly O O O O
enriched O O O O
in O O O O
Aedes B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aegypti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
during O O O O
arbovirus O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
Transient O O O O
gene O O O O
silencing O O O O
of O O O O
SV2 O O O O
or O O O O
UNC93A O O O O
in O O O O
mosquitoes O O O O
infected O O O O
with O O O O
the O O O O
recombinant O O O O
alphavirus O O O O
Sindbis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
MRE16 O O O O
- O O O O
enhanced O O O O
green O O O O
fluorescent O O O O
protein O O O O
( O O O O
SINV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
; O O O O
family O O O O
Togaviridae O O O O
) O O O O
resulted O O O O
in O O O O
the O O O O
accumulation O O O O
of O O O O
viral O O O O
positive O O O O
- O O O O
and O O O O
negative O O O O
- O O O O
strand O O O O
RNA O O O O
, O O O O
congregation O O O O
of O O O O
virus O O O O
envelope O O O O
antigen O O O O
in O O O O
intracellular O O O O
networks O O O O
, O O O O
and O O O O
reduced O O O O
virus O O O O
dissemination O O O O
outside O O O O
of O O O O
the O O O O
midgut O O O O
. O O O O
    
Further O O O O
, O O O O
UNC93A O O O O
silencing O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
SV2 O O O O
silencing O O O O
, O O O O
resulted O O O O
in O O O O
a O O O O
10 O O O O
- O O O O
fold O O O O
reduction O O O O
in O O O O
viral O O O O
titres O O O O
at O O O O
4 O O O O
days O O O O
post O O O O
- O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
Together O O O O
, O O O O
these O O O O
data O O O O
support O O O O
a O O O O
role O O O O
for O O O O
UNC93A O O O O
and O O O O
SV2 O O O O
in O O O O
virus O O O O
assembly O O O O
or O O O O
budding O O O O
. O O O O
    
Cis O O O O
- O O O O
regulatory O O O O
elements O O O O
( O O O O
CREs O O O O
) O O O O
were O O O O
identified O O O O
at O O O O
the O O O O
5 O O O O
' O O O O
- O O O O
ends O O O O
of O O O O
genes O O O O
from O O O O
the O O O O
original O O O O
data O O O O
set O O O O
in O O O O
which O O O O
SV2 O O O O
and O O O O
UNC93A O O O O
were O O O O
identified O O O O
. O O O O
    
Common O O O O
CREs O O O O
at O O O O
the O O O O
5 O O O O
' O O O O
- O O O O
end O O O O
genomic O O O O
regions O O O O
of O O O O
a O O O O
subset O O O O
of O O O O
enriched O O O O
transcripts O O O O
support O O O O
the O O O O
hypothesis O O O O
that O O O O
UNC93A O O O O
transcription O O O O
may O O O O
be O O O O
co O O O O
- O O O O
regulated O O O O
with O O O O
that O O O O
of O O O O
other O O O O
ion O O O O
transport O O O O
and O O O O
endosomal O O O O
trafficking O O O O
proteins O O O O
. O O O O
    
Pyrethroid O O O O
resistance O O O O
in O O O O
Sitophilus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
zeamais O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
associated O O O O
with O O O O
a O O O O
mutation O O O O
( O O O O
T929I O O O O
) O O O O
in O O O O
the O O O O
voltage O O O O
- O O O O
gated O O O O
sodium O O O O
channel O O O O
. O O O O
    
The O O O O
maize B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
weevil O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Sitophilus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
zeamais O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
is O O O O
the O O O O
most O O O O
important O O O O
pest O O O O
affecting O O O O
stored O O O O
grain O O O O
in O O O O
Brazil O O O O
and O O O O
its O O O O
control O O O O
relies O O O O
heavily O O O O
on O O O O
the O O O O
use O O O O
of O O O O
insecticides O O O O
. O O O O
    
The O O O O
intensive O O O O
use O O O O
of O O O O
compounds O O O O
such O O O O
as O O O O
the O O O O
pyrethroids O O O O
has O O O O
led O O O O
to O O O O
the O O O O
emergence O O O O
of O O O O
resistance O O O O
, O O O O
and O O O O
previous O O O O
studies O O O O
have O O O O
suggested O O O O
that O O O O
resistance O O O O
to O O O O
both O O O O
pyrethroids O O O O
and O O O O
1 O O O O
, O O O O
1 O O O O
, O O O O
1 O O O O
- O O O O
trichloro O O O O
- O O O O
2 O O O O
, O O O O
2 O O O O
- O O O O
bis O O O O
( O O O O
p O O O O
- O O O O
chlorophenyl O O O O
) O O O O
ethane O O O O
( O O O O
DDT O O O O
) O O O O
may O O O O
result O O O O
from O O O O
reduced O O O O
sensitivity O O O O
of O O O O
the O O O O
insecticide O O O O
target O O O O
, O O O O
the O O O O
voltage O O O O
- O O O O
gated O O O O
sodium O O O O
channel O O O O
. O O O O
    
To O O O O
identify O O O O
the O O O O
molecular O O O O
mechanisms O O O O
underlying O O O O
pyrethroid O O O O
resistance O O O O
in O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
zeamais O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
the O O O O
domain O O O O
II O O O O
region O O O O
of O O O O
the O O O O
voltage O O O O
- O O O O
gated O O O O
sodium O O O O
channel O O O O
( O O O O
para O O O O
- O O O O
orthologue O O O O
) O O O O
gene O O O O
was O O O O
amplified O O O O
by O O O O
PCR O O O O
and O O O O
sequenced O O O O
from O O O O
susceptible O O O O
and O O O O
resistant O O O O
laboratory O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
zeamais O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strains O O O O
that O O O O
were O O O O
selected O O O O
with O O O O
a O O O O
discriminating O O O O
dose O O O O
of O O O O
DDT O O O O
. O O O O
    
A O O O O
single O O O O
point O O O O
mutation O O O O
, O O O O
T929I O O O O
, O O O O
was O O O O
found O O O O
in O O O O
the O O O O
para O O O O
gene O O O O
of O O O O
the O O O O
resistant O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
zeamais O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
populations O O O O
and O O O O
its O O O O
presence O O O O
in O O O O
individual O O O O
weevils O O O O
was O O O O
strongly O O O O
associated O O O O
with O O O O
survival O O O O
after O O O O
DDT O O O O
exposure O O O O
. O O O O
    
This O O O O
is O O O O
the O O O O
first O O O O
identification O O O O
of O O O O
a O O O O
target O O O O
- O O O O
site O O O O
resistance O O O O
mutation O O O O
in O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
zeamais O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
unusually O O O O
it O O O O
is O O O O
a O O O O
super O O O O
- O O O O
kdr O O O O
type O O O O
mutation O O O O
occurring O O O O
in O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
the O O O O
more O O O O
common O O O O
kdr O O O O
( O O O O
L1014F O O O O
) O O O O
substitution O O O O
. O O O O
    
A O O O O
high O O O O
- O O O O
throughput O O O O
assay O O O O
based O O O O
on O O O O
TaqMan O O O O
single O O O O
nucleotide O O O O
polymorphism O O O O
genotyping O O O O
was O O O O
developed O O O O
for O O O O
sensitive O O O O
detection O O O O
of O O O O
the O O O O
mutation O O O O
and O O O O
used O O O O
to O O O O
screen O O O O
field O O O O
- O O O O
collected O O O O
strains O O O O
of O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
zeamais O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
This O O O O
showed O O O O
that O O O O
the O O O O
mutation O O O O
is O O O O
present O O O O
at O O O O
low O O O O
frequency O O O O
in O O O O
field O O O O
populations O O O O
and O O O O
is O O O O
a O O O O
useful O O O O
tool O O O O
for O O O O
informing O O O O
control O O O O
strategies O O O O
. O O O O
    
Stillbirths O O O O
: O O O O
the O O O O
way O O O O
forward O O O O
in O O O O
high O O O O
- O O O O
income O O O O
countries O O O O
. O O O O
    
Stillbirth O O O O
rates O O O O
in O O O O
high O O O O
- O O O O
income O O O O
countries O O O O
declined O O O O
dramatically O O O O
from O O O O
about O O O O
1940 O O O O
, O O O O
but O O O O
this O O O O
decline O O O O
has O O O O
slowed O O O O
or O O O O
stalled O O O O
over O O O O
recent O O O O
times O O O O
. O O O O
    
The O O O O
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and O O O O
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high O O O O
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Large O O O O
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need O O O O
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be O O O O
addressed O O O O
by O O O O
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more O O O O
educational O O O O
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and O O O O
improving O O O O
living O O O O
conditions O O O O
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women O O O O
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Placental O O O O
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and O O O O
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preterm O O O O
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linked O O O O
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The O O O O
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unexplained O O O O
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Future O O O O
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, O O O O
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% O O O O
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rural O O O O
sub O O O O
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Africa O O O O
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south O O O O
Asia O O O O
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1 O O O O
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( O O O O
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to O O O O
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Most O O O O
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associated O O O O
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. O O O O
    
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35 O O O O
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and O O O O
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International O O O O
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simple O O O O
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new O O O O
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the O O O O
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Stillbirths O O O O
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the O O O O
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2020 O O O O
. O O O O
    
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, O O O O
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98 O O O O
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We O O O O
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related O O O O
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and O O O O
especially O O O O
research O O O O
aimed O O O O
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interested O O O O
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join O O O O
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Beliefs O O O O
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spirits O O O O
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babies O O O O
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Stillbirth O O O O
prevention O O O O
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key O O O O
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health O O O O
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which O O O O
this O O O O
Stillbirths O O O O
Series O O O O
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aims O O O O
to O O O O
contribute O O O O
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Dynamic O O O O
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stationary O O O O
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during O O O O
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in O O O O
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. O O O O
    
During O O O O
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when O O O O
nuclear O O O O
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occurs O O O O
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closely O O O O
related O O O O
to O O O O
their O O O O
localisations O O O O
in O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
The O O O O
first O O O O
of O O O O
these O O O O
stages O O O O
is O O O O
the O O O O
entrance O O O O
of O O O O
one O O O O
meiotic O O O O
product O O O O
into O O O O
the O O O O
paroral O O O O
region O O O O
. O O O O
    
This O O O O
nucleus O O O O
survives O O O O
, O O O O
while O O O O
the O O O O
remaining O O O O
three O O O O
outside O O O O
this O O O O
area O O O O
degenerate O O O O
. O O O O
    
The O O O O
second O O O O
stage O O O O
is O O O O
the O O O O
antero O O O O
- O O O O
posterior O O O O
localisation O O O O
of O O O O
eight O O O O
synkaryon O O O O
division O O O O
products O O O O
. O O O O
    
Four O O O O
posterior O O O O
nuclei O O O O
are O O O O
differentiated O O O O
into O O O O
macronuclear O O O O
anlagen O O O O
, O O O O
whereas O O O O
four O O O O
anterior O O O O
nuclei O O O O
remain O O O O
as O O O O
the O O O O
presumptive O O O O
micronuclei O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
experiment O O O O
, O O O O
the O O O O
process O O O O
of O O O O
the O O O O
third O O O O
prezygotic O O O O
division O O O O
of O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
caudatum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
studied O O O O
with O O O O
the O O O O
help O O O O
of O O O O
protargol O O O O
staining O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
a O O O O
third O O O O
nuclear O O O O
migration O O O O
was O O O O
discovered O O O O
. O O O O
    
By O O O O
two O O O O
spindle O O O O
turnings O O O O
and O O O O
two O O O O
spindle O O O O
elongations O O O O
, O O O O
stationary O O O O
pronuclei O O O O
were O O O O
positioned O O O O
near O O O O
migratory O O O O
pronuclei O O O O
. O O O O
    
This O O O O
positioning O O O O
of O O O O
stationary O O O O
pronuclei O O O O
could O O O O
shorten O O O O
the O O O O
distance O O O O
for O O O O
transferred O O O O
migratory O O O O
pronuclei O O O O
to O O O O
recognise O O O O
and O O O O
reach O O O O
the O O O O
stationary O O O O
pronuclei O O O O
. O O O O
    
This O O O O
fosters O O O O
the O O O O
synkaryon O O O O
formation O O O O
of O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
caudatum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Complete O O O O
sructure O O O O
of O O O O
nuclear O O O O
rDNA O O O O
of O O O O
the O O O O
obligate O O O O
plant O O O O
parasite O O O O
Plasmodiophora B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
brassicae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
: O O O O
intraspecific O O O O
polymorphisms O O O O
in O O O O
the O O O O
exon O O O O
and O O O O
group O O O O
I O O O O
intron O O O O
of O O O O
the O O O O
large O O O O
subunit O O O O
rDNA O O O O
. O O O O
    
Plasmodiophora B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
brassicae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
a O O O O
soil O O O O
- O O O O
borne O O O O
obligate O O O O
intracellular O O O O
parasite O O O O
in O O O O
the O O O O
phylum O O O O
Cercozoa O O O O
of O O O O
the O O O O
Rhizaria O O O O
that O O O O
causes O O O O
clubroot O O O O
disease O O O O
of O O O O
crucifer O O O O
crops O O O O
. O O O O
    
To O O O O
control O O O O
the O O O O
disease O O O O
, O O O O
understanding O O O O
the O O O O
distribution O O O O
and O O O O
infection O O O O
routes O O O O
of O O O O
the O O O O
pathogen O O O O
is O O O O
essential O O O O
, O O O O
and O O O O
thus O O O O
development O O O O
of O O O O
reliable O O O O
molecular O O O O
markers O O O O
to O O O O
discriminate O O O O
geographic O O O O
populations O O O O
is O O O O
required O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
the O O O O
nuclear O O O O
ribosomal O O O O
RNA O O O O
gene O O O O
( O O O O
rDNA O O O O
) O O O O
repeat O O O O
unit O O O O
of O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
brassicae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
determined O O O O
, O O O O
with O O O O
particular O O O O
emphasis O O O O
on O O O O
the O O O O
structure O O O O
of O O O O
large O O O O
subunit O O O O
( O O O O
LSU O O O O
) O O O O
rDNA O O O O
, O O O O
in O O O O
which O O O O
polymorphic O O O O
regions O O O O
were O O O O
expected O O O O
to O O O O
be O O O O
present O O O O
. O O O O
    
The O O O O
complete O O O O
rDNA O O O O
complex O O O O
was O O O O
9513bp O O O O
long O O O O
, O O O O
which O O O O
included O O O O
the O O O O
small O O O O
subunit O O O O
, O O O O
5 O O O O
. O O O O
8S O O O O
and O O O O
LSU O O O O
rDNAs O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
the O O O O
internal O O O O
transcribed O O O O
spacer O O O O
and O O O O
intergenic O O O O
spacer O O O O
regions O O O O
. O O O O
    
Among O O O O
eight O O O O
field O O O O
populations O O O O
collected O O O O
from O O O O
throughout O O O O
Honshu O O O O
Island O O O O
, O O O O
Japan O O O O
, O O O O
a O O O O
1 O O O O
. O O O O
1 O O O O
kbp O O O O
region O O O O
of O O O O
the O O O O
LSU O O O O
rDNA O O O O
, O O O O
including O O O O
the O O O O
divergent O O O O
8 O O O O
domain O O O O
, O O O O
exhibited O O O O
intraspecific O O O O
polymorphisms O O O O
that O O O O
reflected O O O O
geographic O O O O
isolation O O O O
of O O O O
the O O O O
populations O O O O
. O O O O
    
Two O O O O
new O O O O
group O O O O
I O O O O
introns O O O O
were O O O O
found O O O O
in O O O O
this O O O O
region O O O O
in O O O O
six O O O O
out O O O O
of O O O O
the O O O O
eight O O O O
populations O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
sequences O O O O
also O O O O
reflected O O O O
their O O O O
geographic O O O O
isolation O O O O
. O O O O
    
The O O O O
polymorphic O O O O
region O O O O
found O O O O
in O O O O
this O O O O
study O O O O
may O O O O
have O O O O
potential O O O O
for O O O O
the O O O O
development O O O O
of O O O O
molecular O O O O
markers O O O O
for O O O O
discrimination O O O O
of O O O O
field O O O O
populations O O O O
/ O O O O
isolates O O O O
of O O O O
this O O O O
organism O O O O
. O O O O
    
Taxonomy O O O O
and O O O O
phylogeny O O O O
of O O O O
a O O O O
new O O O O
kleptoplastidal O O O O
dinoflagellate O O O O
, O O O O
Gymnodinium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
myriopyrenoides O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
    
( O O O O
Gymnodiniales O O O O
, O O O O
Dinophyceae O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
its O O O O
cryptophyte O O O O
symbiont O O O O
. O O O O
    
A O O O O
new O O O O
kleptoplastidal O O O O
dinoflagellate O O O O
, O O O O
Gymnodinium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
myriopyrenoides O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
, O O O O
was O O O O
described O O O O
using O O O O
light O O O O
microscopy O O O O
, O O O O
electron O O O O
microscopy O O O O
and O O O O
phylogengetic O O O O
analysis O O O O
based O O O O
on O O O O
partial O O O O
LSU O O O O
rDNA O O O O
sequences O O O O
. O O O O
    
Cells O O O O
were O O O O
dorsiventrally O O O O
flattened O O O O
, O O O O
elongate O O O O
- O O O O
elliptical O O O O
in O O O O
ventral O O O O
view O O O O
. O O O O
    
There O O O O
was O O O O
no O O O O
displacement O O O O
of O O O O
the O O O O
cingulum O O O O
encircling O O O O
the O O O O
anterior O O O O
part O O O O
of O O O O
the O O O O
cell O O O O
. O O O O
    
The O O O O
cingulum O O O O
was O O O O
curved O O O O
posteriorly O O O O
at O O O O
the O O O O
terminal O O O O
junction O O O O
with O O O O
the O O O O
sulcus O O O O
. O O O O
    
The O O O O
sulcus O O O O
was O O O O
generally O O O O
narrow O O O O
but O O O O
expanded O O O O
in O O O O
the O O O O
posterior O O O O
end O O O O
. O O O O
    
The O O O O
epicone O O O O
possessed O O O O
an O O O O
apical O O O O
groove O O O O
made O O O O
of O O O O
one O O O O
and O O O O
one O O O O
- O O O O
half O O O O
counterclockwise O O O O
revolutions O O O O
. O O O O
    
Phylogenetic O O O O
analysis O O O O
based O O O O
on O O O O
LSU O O O O
rDNA O O O O
showed O O O O
that O O O O
the O O O O
sequence O O O O
of O O O O
G B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
myriopyrenoides O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
included O O O O
in O O O O
the O O O O
Gymnodiniales O O O O
sensu O O O O
stricto O O O O
clade O O O O
and O O O O
had O O O O
special O O O O
affinities O O O O
with O O O O
the O O O O
species O O O O
Amphidinium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
poecilochroum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Gymnodinium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
acidotum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
which O O O O
also O O O O
harbor O O O O
kleptochloroplasts O O O O
. O O O O
    
Phylogenetic O O O O
analysis O O O O
based O O O O
on O O O O
plastid O O O O
- O O O O
encoded O O O O
SSU O O O O
rDNA O O O O
and O O O O
ultrastructural O O O O
observations O O O O
suggested O O O O
that O O O O
the O O O O
symbionts O O O O
of O O O O
G B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
myriopyrenoides O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
were O O O O
cryptophytes O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Chroomonas O O O O
or O O O O
Hemiselmis O O O O
. O O O O
    
Organelles O O O O
including O O O O
the O O O O
nucleus O O O O
, O O O O
the O O O O
nucleomorph O O O O
, O O O O
mitochondria O O O O
, O O O O
Golgi O O O O
bodies O O O O
and O O O O
large O O O O
chloroplasts O O O O
remained O O O O
in O O O O
the O O O O
cytoplasm O O O O
of O O O O
the O O O O
symbionts O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
the O O O O
periplast O O O O
, O O O O
ejectosomes O O O O
or O O O O
flagellar O O O O
apparatus O O O O
. O O O O
    
The O O O O
symbiotic O O O O
level O O O O
of O O O O
G B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
myriopyrenoides O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
estimated O O O O
to O O O O
be O O O O
a O O O O
relatively O O O O
early O O O O
stage O O O O
in O O O O
the O O O O
unarmored O O O O
kleptoplastidal O O O O
dinoflagellates O O O O
. O O O O
    
No O O O O
paradox O O O O
, O O O O
no O O O O
progress O O O O
: O O O O
inverse O O O O
cancer O O O O
comorbidity O O O O
in O O O O
people O O O O
with O O O O
other O O O O
complex O O O O
diseases O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
past O O O O
5 O O O O
years O O O O
, O O O O
several O O O O
leading O O O O
groups O O O O
have O O O O
attempted O O O O
to O O O O
explain O O O O
why O O O O
individuals O O O O
with O O O O
Down O O O O
' O O O O
s O O O O
syndrome O O O O
have O O O O
a O O O O
reduced O O O O
risk O O O O
of O O O O
many O O O O
solid O O O O
tumours O O O O
and O O O O
an O O O O
increased O O O O
risk O O O O
of O O O O
leukaemia O O O O
and O O O O
testicular O O O O
cancer O O O O
. O O O O
    
Niels O O O O
Bohr O O O O
, O O O O
the O O O O
Danish O O O O
physicist O O O O
, O O O O
noted O O O O
that O O O O
a O O O O
paradox O O O O
could O O O O
initiate O O O O
progress O O O O
. O O O O
    
We O O O O
think O O O O
that O O O O
the O O O O
paradox O O O O
of O O O O
a O O O O
medical O O O O
disorder O O O O
protecting O O O O
against O O O O
cancer O O O O
could O O O O
be O O O O
formalised O O O O
in O O O O
a O O O O
new O O O O
model O O O O
of O O O O
inverse O O O O
cancer O O O O
morbidity O O O O
in O O O O
people O O O O
with O O O O
other O O O O
serious O O O O
diseases O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
Personal O O O O
View O O O O
, O O O O
we O O O O
review O O O O
evidence O O O O
from O O O O
epidemiological O O O O
and O O O O
clinical O O O O
studies O O O O
that O O O O
supports O O O O
a O O O O
consistently O O O O
lower O O O O
than O O O O
expected O O O O
occurrence O O O O
of O O O O
cancer O O O O
in O O O O
patients O O O O
with O O O O
Down O O O O
' O O O O
s O O O O
syndrome O O O O
, O O O O
Parkinson O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
, O O O O
schizophrenia O O O O
, O O O O
diabetes O O O O
, O O O O
Alzheimer O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
, O O O O
multiple O O O O
sclerosis O O O O
, O O O O
and O O O O
anorexia O O O O
nervosa O O O O
. O O O O
    
Intriguingly O O O O
, O O O O
most O O O O
comorbidities O O O O
are O O O O
neuropsychiatric O O O O
or O O O O
CNS O O O O
disorders O O O O
. O O O O
    
We O O O O
provide O O O O
a O O O O
brief O O O O
overview O O O O
of O O O O
evidence O O O O
indicating O O O O
genetic O O O O
and O O O O
molecular O O O O
connections O O O O
between O O O O
cancer O O O O
and O O O O
these O O O O
complex O O O O
diseases O O O O
. O O O O
    
Inverse O O O O
comorbidity O O O O
could O O O O
be O O O O
a O O O O
valuable O O O O
model O O O O
to O O O O
investigate O O O O
common O O O O
or O O O O
related O O O O
pathways O O O O
or O O O O
processes O O O O
and O O O O
test O O O O
new O O O O
therapies O O O O
, O O O O
but O O O O
, O O O O
most O O O O
importantly O O O O
, O O O O
to O O O O
understand O O O O
why O O O O
certain O O O O
people O O O O
are O O O O
protected O O O O
from O O O O
the O O O O
malignancy O O O O
. O O O O
    
Milestones O O O O
in O O O O
Candida B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gene O O O O
manipulation O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
United O O O O
States O O O O
, O O O O
candidemia O O O O
is O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
most O O O O
common O O O O
hospital O O O O
- O O O O
acquired O O O O
infections O O O O
and O O O O
is O O O O
estimated O O O O
to O O O O
cause O O O O
10 O O O O
, O O O O
000 O O O O
deaths O O O O
per O O O O
year O O O O
. O O O O
    
The O O O O
species O O O O
Candida B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
responsible O O O O
for O O O O
the O O O O
majority O O O O
of O O O O
these O O O O
cases O O O O
. O O O O
    
As O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
capable O O O O
of O O O O
developing O O O O
resistance O O O O
against O O O O
the O O O O
currently O O O O
available O O O O
drugs O O O O
, O O O O
understanding O O O O
the O O O O
molecular O O O O
basis O O O O
of O O O O
drug O O O O
resistance O O O O
, O O O O
finding O O O O
new O O O O
cellular O O O O
targets O O O O
, O O O O
and O O O O
further O O O O
understanding O O O O
the O O O O
overall O O O O
mechanism O O O O
of O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pathogenesis O O O O
are O O O O
important O O O O
goals O O O O
. O O O O
    
To O O O O
study O O O O
this O O O O
pathogen O O O O
it O O O O
is O O O O
advantageous O O O O
to O O O O
manipulate O O O O
its O O O O
genome O O O O
. O O O O
    
Numerous O O O O
strategies O O O O
of O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gene O O O O
manipulation O O O O
have O O O O
been O O O O
introduced O O O O
. O O O O
    
This O O O O
review O O O O
evaluates O O O O
a O O O O
majority O O O O
of O O O O
these O O O O
strategies O O O O
and O O O O
should O O O O
be O O O O
a O O O O
helpful O O O O
guide O O O O
for O O O O
researchers O O O O
to O O O O
identify O O O O
gene O O O O
targeting O O O O
strategies O O O O
to O O O O
suit O O O O
their O O O O
requirements O O O O
. O O O O
    
The O O O O
pharmacological O O O O
treatment O O O O
of O O O O
epilepsy O O O O
in O O O O
adults O O O O
. O O O O
    
Treatment O O O O
decisions O O O O
in O O O O
epilepsy O O O O
need O O O O
to O O O O
be O O O O
individualised O O O O
on O O O O
the O O O O
basis O O O O
of O O O O
careful O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
risk O O O O
- O O O O
benefit O O O O
ratio O O O O
of O O O O
each O O O O
available O O O O
option O O O O
. O O O O
    
Key O O O O
decision O O O O
steps O O O O
include O O O O
the O O O O
time O O O O
at O O O O
which O O O O
antiepileptic O O O O
drug O O O O
treatment O O O O
should O O O O
be O O O O
started O O O O
, O O O O
which O O O O
drug O O O O
should O O O O
be O O O O
chosen O O O O
for O O O O
first O O O O
- O O O O
line O O O O
therapy O O O O
, O O O O
and O O O O
which O O O O
strategy O O O O
is O O O O
most O O O O
appropriate O O O O
for O O O O
people O O O O
who O O O O
did O O O O
not O O O O
respond O O O O
to O O O O
the O O O O
initially O O O O
prescribed O O O O
drug O O O O
. O O O O
    
With O O O O
more O O O O
than O O O O
20 O O O O
antiepileptic O O O O
drugs O O O O
currently O O O O
available O O O O
to O O O O
treat O O O O
epilepsy O O O O
in O O O O
adults O O O O
, O O O O
opportunities O O O O
to O O O O
tailor O O O O
drug O O O O
therapy O O O O
have O O O O
never O O O O
been O O O O
greater O O O O
, O O O O
but O O O O
optimum O O O O
use O O O O
of O O O O
such O O O O
a O O O O
complex O O O O
armamentarium O O O O
is O O O O
a O O O O
challenge O O O O
even O O O O
for O O O O
the O O O O
epilepsy O O O O
specialist O O O O
. O O O O
    
Antiepileptic O O O O
drug O O O O
choice O O O O
is O O O O
primarily O O O O
based O O O O
on O O O O
evidence O O O O
of O O O O
efficacy O O O O
and O O O O
effectiveness O O O O
for O O O O
the O O O O
individual O O O O
' O O O O
s O O O O
seizure O O O O
type O O O O
, O O O O
but O O O O
other O O O O
patient O O O O
- O O O O
specific O O O O
factors O O O O
need O O O O
to O O O O
be O O O O
considered O O O O
, O O O O
including O O O O
age O O O O
, O O O O
sex O O O O
, O O O O
childbearing O O O O
potential O O O O
, O O O O
comorbidities O O O O
, O O O O
and O O O O
concomitant O O O O
medications O O O O
. O O O O
    
Stroke O O O O
and O O O O
the O O O O
immune O O O O
system O O O O
: O O O O
from O O O O
pathophysiology O O O O
to O O O O
new O O O O
therapeutic O O O O
strategies O O O O
. O O O O
    
Stroke O O O O
is O O O O
the O O O O
second O O O O
most O O O O
common O O O O
cause O O O O
of O O O O
death O O O O
worldwide O O O O
and O O O O
a O O O O
major O O O O
cause O O O O
of O O O O
acquired O O O O
disability O O O O
in O O O O
adults O O O O
. O O O O
    
Despite O O O O
tremendous O O O O
progress O O O O
in O O O O
understanding O O O O
the O O O O
pathophysiology O O O O
of O O O O
stroke O O O O
, O O O O
translation O O O O
of O O O O
this O O O O
knowledge O O O O
into O O O O
effective O O O O
therapies O O O O
has O O O O
largely O O O O
failed O O O O
, O O O O
with O O O O
the O O O O
exception O O O O
of O O O O
thrombolysis O O O O
, O O O O
which O O O O
only O O O O
benefits O O O O
a O O O O
small O O O O
proportion O O O O
of O O O O
patients O O O O
. O O O O
    
Systemic O O O O
and O O O O
local O O O O
immune O O O O
responses O O O O
have O O O O
important O O O O
roles O O O O
in O O O O
causing O O O O
stroke O O O O
and O O O O
are O O O O
implicated O O O O
in O O O O
the O O O O
primary O O O O
and O O O O
secondary O O O O
progression O O O O
of O O O O
ischaemic O O O O
lesions O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
in O O O O
repair O O O O
, O O O O
recovery O O O O
, O O O O
and O O O O
overall O O O O
outcome O O O O
after O O O O
a O O O O
stroke O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
potential O O O O
therapeutic O O O O
targets O O O O
in O O O O
the O O O O
immune O O O O
system O O O O
and O O O O
inflammatory O O O O
responses O O O O
have O O O O
not O O O O
been O O O O
well O O O O
characterised O O O O
. O O O O
    
Development O O O O
of O O O O
novel O O O O
and O O O O
effective O O O O
therapeutic O O O O
strategies O O O O
for O O O O
stroke O O O O
will O O O O
require O O O O
further O O O O
investigation O O O O
of O O O O
these O O O O
pathways O O O O
in O O O O
terms O O O O
of O O O O
their O O O O
temporal O O O O
profile O O O O
( O O O O
before O O O O
, O O O O
during O O O O
, O O O O
and O O O O
after O O O O
stroke O O O O
) O O O O
and O O O O
risk O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
benefit O O O O
therapeutic O O O O
ratio O O O O
of O O O O
modulating O O O O
them O O O O
. O O O O
    
Emerging O O O O
targets O O O O
and O O O O
treatments O O O O
in O O O O
amyotrophic O O O O
lateral O O O O
sclerosis O O O O
. O O O O
    
Amyotrophic O O O O
lateral O O O O
sclerosis O O O O
( O O O O
ALS O O O O
) O O O O
is O O O O
a O O O O
progressive O O O O
motor O O O O
neuron O O O O
disease O O O O
that O O O O
is O O O O
currently O O O O
untreatable O O O O
. O O O O
    
Many O O O O
compounds O O O O
have O O O O
been O O O O
tested O O O O
in O O O O
laboratory O O O O
- O O O O
based O O O O
models O O O O
and O O O O
in O O O O
patients O O O O
with O O O O
ALS O O O O
, O O O O
but O O O O
so O O O O
far O O O O
only O O O O
one O O O O
drug O O O O
, O O O O
riluzole O O O O
, O O O O
has O O O O
shown O O O O
efficacy O O O O
, O O O O
yet O O O O
it O O O O
only O O O O
slightly O O O O
slows O O O O
disease O O O O
progression O O O O
. O O O O
    
Several O O O O
new O O O O
insights O O O O
into O O O O
the O O O O
causes O O O O
of O O O O
motor O O O O
neuron O O O O
death O O O O
have O O O O
led O O O O
to O O O O
the O O O O
identification O O O O
of O O O O
some O O O O
important O O O O
novel O O O O
targets O O O O
for O O O O
intervention O O O O
. O O O O
    
At O O O O
no O O O O
time O O O O
have O O O O
studies O O O O
involved O O O O
such O O O O
a O O O O
wide O O O O
range O O O O
of O O O O
innovations O O O O
and O O O O
such O O O O
advanced O O O O
technologies O O O O
. O O O O
    
Many O O O O
promising O O O O
studies O O O O
are O O O O
underway O O O O
to O O O O
test O O O O
potential O O O O
targets O O O O
that O O O O
will O O O O
hopefully O O O O
translate O O O O
into O O O O
meaningful O O O O
therapeutics O O O O
for O O O O
patients O O O O
with O O O O
ALS O O O O
. O O O O
    
Hepatitis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
delta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Hepatitis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
delta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
HDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
is O O O O
a O O O O
small O O O O
, O O O O
defective O O O O
RNA O O O O
virus O O O O
that O O O O
can O O O O
infect O O O O
only O O O O
individuals O O O O
who O O O O
have O O O O
hepatitis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
B O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
HBV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
; O O O O
worldwide O O O O
more O O O O
than O O O O
15 O O O O
million O O O O
people O O O O
are O O O O
co O O O O
- O O O O
infected O O O O
. O O O O
    
There O O O O
are O O O O
eight O O O O
reported O O O O
genotypes O O O O
of O O O O
HDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
with O O O O
unexplained O O O O
variations O O O O
in O O O O
their O O O O
geographical O O O O
distribution O O O O
and O O O O
pathogenicity O O O O
. O O O O
    
The O O O O
hepatitis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
D O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virion O O O O
is O O O O
composed O O O O
of O O O O
a O O O O
coat O O O O
of O O O O
HBV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
envelope O O O O
proteins O O O O
surrounding O O O O
the O O O O
nucleocapsid O O O O
, O O O O
which O O O O
consists O O O O
of O O O O
a O O O O
single O O O O
- O O O O
stranded O O O O
, O O O O
circular O O O O
RNA O O O O
genome O O O O
complexed O O O O
with O O O O
delta O O O O
antigen O O O O
, O O O O
the O O O O
viral O O O O
protein O O O O
. O O O O
    
HDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
is O O O O
clinically O O O O
important O O O O
because O O O O
although O O O O
it O O O O
suppresses O O O O
HBV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
replication O O O O
, O O O O
it O O O O
causes O O O O
severe O O O O
liver O O O O
disease O O O O
with O O O O
rapid O O O O
progression O O O O
to O O O O
cirrhosis O O O O
and O O O O
hepatic O O O O
decompensation O O O O
. O O O O
    
The O O O O
range O O O O
of O O O O
clinical O O O O
presentation O O O O
is O O O O
wide O O O O
, O O O O
varying O O O O
from O O O O
mild O O O O
disease O O O O
to O O O O
fulminant O O O O
liver O O O O
failure O O O O
. O O O O
    
The O O O O
prevalence O O O O
of O O O O
HDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
is O O O O
declining O O O O
in O O O O
some O O O O
endemic O O O O
areas O O O O
but O O O O
increasing O O O O
in O O O O
northern O O O O
and O O O O
central O O O O
Europe O O O O
because O O O O
of O O O O
immigration O O O O
. O O O O
    
Treatment O O O O
of O O O O
HDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
is O O O O
with O O O O
pegylated O O O O
interferon O O O O
alfa O O O O
; O O O O
however O O O O
, O O O O
response O O O O
rates O O O O
are O O O O
poor O O O O
. O O O O
    
Increased O O O O
understanding O O O O
of O O O O
the O O O O
molecular O O O O
virology O O O O
of O O O O
HDV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
will O O O O
identify O O O O
novel O O O O
therapeutic O O O O
targets O O O O
for O O O O
this O O O O
most O O O O
severe O O O O
form O O O O
of O O O O
chronic O O O O
viral O O O O
hepatitis O O O O
. O O O O
    
Altering O O O O
sexual O O O O
reproductive O O O O
mode O O O O
by O O O O
interspecific O O O O
exchange O O O O
of O O O O
MAT O O O O
loci O O O O
. O O O O
    
Sexual O O O O
fungi O O O O
can O O O O
be O O O O
self O O O O
- O O O O
sterile O O O O
( O O O O
heterothallic O O O O
, O O O O
requiring O O O O
genetically O O O O
distinct O O O O
partners O O O O
) O O O O
or O O O O
self O O O O
- O O O O
fertile O O O O
( O O O O
homothallic O O O O
, O O O O
no O O O O
partner O O O O
required O O O O
) O O O O
. O O O O
    
In O O O O
most O O O O
ascomycetes O O O O
, O O O O
a O O O O
single O O O O
mating O O O O
type O O O O
locus O O O O
( O O O O
MAT O O O O
) O O O O
controls O O O O
the O O O O
ability O O O O
to O O O O
reproduce O O O O
sexually O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
genus O O O O
Cochliobolus O O O O
, O O O O
all O O O O
heterothallic O O O O
species O O O O
have O O O O
either O O O O
MAT1 O O O O
- O O O O
1 O O O O
or O O O O
MAT1 O O O O
- O O O O
2 O O O O
( O O O O
but O O O O
never O O O O
both O O O O
) O O O O
in O O O O
different O O O O
individuals O O O O
whereas O O O O
all O O O O
homothallic O O O O
species O O O O
carry O O O O
both O O O O
MAT1 O O O O
- O O O O
1 O O O O
and O O O O
MAT1 O O O O
- O O O O
2 O O O O
in O O O O
the O O O O
same O O O O
nucleus O O O O
of O O O O
an O O O O
individual O O O O
. O O O O
    
It O O O O
has O O O O
been O O O O
demonstrated O O O O
, O O O O
previously O O O O
, O O O O
that O O O O
a O O O O
MAT O O O O
gene O O O O
from O O O O
homothallic O O O O
Cochliobolus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
luttrellii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
can O O O O
confer O O O O
self O O O O
- O O O O
mating O O O O
ability O O O O
on O O O O
a O O O O
mat O O O O
- O O O O
deleted O O O O
strain O O O O
of O O O O
its O O O O
heterothallic O O O O
relative O O O O
, O O O O
Cochliobolus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
heterostrophus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
reciprocal O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
expressed O O O O
, O O O O
separately O O O O
, O O O O
the O O O O
heterothallic O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
heterostrophus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
MAT1 O O O O
- O O O O
1 O O O O
- O O O O
1 O O O O
and O O O O
MAT1 O O O O
- O O O O
2 O O O O
- O O O O
1 O O O O
genes O O O O
in O O O O
a O O O O
mat O O O O
- O O O O
deleted O O O O
homothallic O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
luttrellii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O O O O
and O O O O
asked O O O O
if O O O O
this O O O O
converts O O O O
homothallic O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
luttrellii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
to O O O O
heterothallism O O O O
. O O O O
    
We O O O O
report O O O O
that O O O O
: O O O O
( O O O O
1 O O O O
) O O O O
A O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
luttrellii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
transgenic O O O O
strain O O O O
carrying O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
heterostrophus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
MAT1 O O O O
- O O O O
1 O O O O
- O O O O
1 O O O O
and O O O O
a O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
luttrellii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
transgenic O O O O
strain O O O O
carrying O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
heterostrophus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
MAT1 O O O O
- O O O O
2 O O O O
- O O O O
1 O O O O
can O O O O
mate O O O O
in O O O O
a O O O O
heterothallic O O O O
manner O O O O
and O O O O
the O O O O
fertility O O O O
of O O O O
the O O O O
cross O O O O
is O O O O
similar O O O O
to O O O O
that O O O O
of O O O O
a O O O O
wild O O O O
type O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
luttrellii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
self O O O O
. O O O O
    
Full O O O O
tetrads O O O O
are O O O O
always O O O O
found O O O O
. O O O O
    
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
A O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
luttrellii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
transgenic O O O O
strain O O O O
carrying O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
heterostrophus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
MAT1 O O O O
- O O O O
1 O O O O
- O O O O
1 O O O O
can O O O O
mate O O O O
with O O O O
the O O O O
parental O O O O
wild O O O O
type O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
luttrellii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
MAT1 O O O O
- O O O O
1 O O O O
; O O O O
MAT1 O O O O
- O O O O
2 O O O O
strain O O O O
, O O O O
indicating O O O O
the O O O O
latter O O O O
is O O O O
able O O O O
to O O O O
outcross O O O O
, O O O O
a O O O O
result O O O O
which O O O O
was O O O O
expected O O O O
but O O O O
has O O O O
not O O O O
been O O O O
demonstrated O O O O
previously O O O O
. O O O O
    
( O O O O
3 O O O O
) O O O O
A O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
luttrellii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
transgenic O O O O
strain O O O O
carrying O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
heterostrophus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
MAT1 O O O O
- O O O O
2 O O O O
- O O O O
1 O O O O
cannot O O O O
mate O O O O
with O O O O
the O O O O
parental O O O O
wild O O O O
type O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
luttrellii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
MAT1 O O O O
- O O O O
1 O O O O
; O O O O
MAT1 O O O O
- O O O O
2 O O O O
strain O O O O
, O O O O
indicating O O O O
outcrossing O O O O
specificity O O O O
. O O O O
    
( O O O O
4 O O O O
) O O O O
Each O O O O
transgenic O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
luttrellii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O O O O
, O O O O
carrying O O O O
only O O O O
a O O O O
single O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
heterostrophus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
MAT O O O O
gene O O O O
, O O O O
is O O O O
able O O O O
to O O O O
self O O O O
, O O O O
although O O O O
all O O O O
pseudothecia O O O O
produced O O O O
are O O O O
smaller O O O O
than O O O O
those O O O O
of O O O O
wild O O O O
type O O O O
and O O O O
fertility O O O O
is O O O O
low O O O O
( O O O O
about O O O O
4 O O O O
- O O O O
15 O O O O
% O O O O
of O O O O
the O O O O
number O O O O
of O O O O
wild O O O O
type O O O O
asci O O O O
) O O O O
. O O O O
    
These O O O O
data O O O O
support O O O O
the O O O O
argument O O O O
that O O O O
in O O O O
Cochliobolus O O O O
spp O O O O
. O O O O
, O O O O
the O O O O
primary O O O O
determinant O O O O
of O O O O
reproductive O O O O
mode O O O O
is O O O O
MAT O O O O
itself O O O O
, O O O O
and O O O O
that O O O O
a O O O O
heterothallic O O O O
strain O O O O
can O O O O
be O O O O
made O O O O
homothallic O O O O
or O O O O
a O O O O
homothallic O O O O
strain O O O O
can O O O O
be O O O O
made O O O O
heterothallic O O O O
by O O O O
exchange O O O O
of O O O O
MAT O O O O
genes O O O O
. O O O O
    
The O O O O
selfing O O O O
ability O O O O
of O O O O
transgenic O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
luttrellii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strains O O O O
also O O O O
suggests O O O O
that O O O O
both O O O O
MAT1 O O O O
- O O O O
1 O O O O
- O O O O
1 O O O O
and O O O O
MAT1 O O O O
- O O O O
2 O O O O
- O O O O
1 O O O O
genes O O O O
of O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
heterostrophus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
carry O O O O
equivalent O O O O
transcription O O O O
regulatory O O O O
activities O O O O
, O O O O
each O O O O
capable O O O O
of O O O O
promoting O O O O
sexual O O O O
development O O O O
when O O O O
alone O O O O
, O O O O
in O O O O
a O O O O
suitable O O O O
genetic O O O O
background O O O O
. O O O O
    
Rate O O O O
of O O O O
egg O O O O
maturation O O O O
in O O O O
marine O O O O
turtles O O O O
exhibits O O O O
' O O O O
universal O O O O
temperature O O O O
dependence O O O O
' O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
metabolic O O O O
theory O O O O
of O O O O
ecology O O O O
( O O O O
MTE O O O O
) O O O O
predicts O O O O
that O O O O
, O O O O
after O O O O
correcting O O O O
for O O O O
body O O O O
mass O O O O
variation O O O O
among O O O O
organisms O O O O
, O O O O
the O O O O
rates O O O O
of O O O O
most O O O O
biological O O O O
processes O O O O
will O O O O
vary O O O O
as O O O O
a O O O O
universal O O O O
function O O O O
of O O O O
temperature O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
empirical O O O O
support O O O O
for O O O O
' O O O O
universal O O O O
temperature O O O O
dependence O O O O
' O O O O
( O O O O
UTD O O O O
) O O O O
is O O O O
currently O O O O
equivocal O O O O
and O O O O
based O O O O
on O O O O
studies O O O O
of O O O O
a O O O O
limited O O O O
number O O O O
of O O O O
traits O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
In O O O O
many O O O O
ectothermic O O O O
animals O O O O
, O O O O
the O O O O
rate O O O O
at O O O O
which O O O O
females O O O O
produce O O O O
mature O O O O
eggs O O O O
is O O O O
temperature O O O O
dependent O O O O
and O O O O
may O O O O
be O O O O
an O O O O
important O O O O
factor O O O O
in O O O O
determining O O O O
the O O O O
costs O O O O
of O O O O
reproduction O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
tested O O O O
whether O O O O
the O O O O
rate O O O O
of O O O O
egg O O O O
maturation O O O O
in O O O O
marine O O O O
turtles O O O O
varies O O O O
with O O O O
environmental O O O O
temperature O O O O
as O O O O
predicted O O O O
by O O O O
MTE O O O O
, O O O O
using O O O O
the O O O O
time O O O O
separating O O O O
successive O O O O
clutches O O O O
of O O O O
individual O O O O
females O O O O
to O O O O
estimate O O O O
the O O O O
rate O O O O
at O O O O
which O O O O
eggs O O O O
are O O O O
formed O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
assessed O O O O
the O O O O
phenotypic O O O O
contribution O O O O
to O O O O
this O O O O
rate O O O O
, O O O O
by O O O O
using O O O O
radio O O O O
telemetry O O O O
to O O O O
make O O O O
repeated O O O O
measurements O O O O
of O O O O
interclutch O O O O
intervals O O O O
for O O O O
individual O O O O
green B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
turtles O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Chelonia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mydas O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Rates O O O O
of O O O O
egg O O O O
maturation O O O O
increased O O O O
with O O O O
seasonally O O O O
increasing O O O O
water O O O O
temperatures O O O O
in O O O O
radio O O O O
- O O O O
tracked O O O O
green B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
turtles O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
but O O O O
were O O O O
not O O O O
repeatable O O O O
for O O O O
individual O O O O
females O O O O
, O O O O
and O O O O
did O O O O
not O O O O
vary O O O O
according O O O O
to O O O O
maternal O O O O
body O O O O
size O O O O
or O O O O
reproductive O O O O
investment O O O O
( O O O O
number O O O O
and O O O O
size O O O O
of O O O O
eggs O O O O
produced O O O O
) O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
a O O O O
collated O O O O
data O O O O
set O O O O
from O O O O
several O O O O
different O O O O
populations O O O O
and O O O O
species O O O O
of O O O O
marine O O O O
turtles O O O O
, O O O O
we O O O O
then O O O O
show O O O O
that O O O O
a O O O O
single O O O O
relationship O O O O
with O O O O
water O O O O
temperature O O O O
explains O O O O
most O O O O
of O O O O
the O O O O
variation O O O O
in O O O O
egg O O O O
maturation O O O O
rates O O O O
, O O O O
with O O O O
a O O O O
slope O O O O
that O O O O
is O O O O
statistically O O O O
indistinguishable O O O O
from O O O O
the O O O O
UTD O O O O
predicted O O O O
by O O O O
MTE O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
several O O O O
alternative O O O O
statistical O O O O
models O O O O
also O O O O
described O O O O
the O O O O
relationship O O O O
between O O O O
temperature O O O O
and O O O O
egg O O O O
maturation O O O O
rates O O O O
equally O O O O
parsimoniously O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
offer O O O O
novel O O O O
support O O O O
for O O O O
the O O O O
MTE O O O O
' O O O O
s O O O O
predicted O O O O
UTD O O O O
of O O O O
biological O O O O
rates O O O O
, O O O O
although O O O O
the O O O O
underlying O O O O
mechanisms O O O O
require O O O O
further O O O O
study O O O O
. O O O O
    
The O O O O
strong O O O O
temperature O O O O
dependence O O O O
of O O O O
egg O O O O
maturation O O O O
combined O O O O
with O O O O
the O O O O
apparently O O O O
weak O O O O
phenotypic O O O O
contribution O O O O
to O O O O
this O O O O
rate O O O O
has O O O O
interesting O O O O
behavioural O O O O
implications O O O O
in O O O O
ectothermic O O O O
animals O O O O
. O O O O
    
We O O O O
suggest O O O O
that O O O O
maternal O O O O
thermoregulatory O O O O
behaviour O O O O
in O O O O
marine O O O O
turtles O O O O
, O O O O
and O O O O
many O O O O
other O O O O
reptiles O O O O
, O O O O
is O O O O
consistent O O O O
with O O O O
a O O O O
strategy O O O O
of O O O O
adaptively O O O O
increasing O O O O
body O O O O
temperatures O O O O
to O O O O
accelerate O O O O
egg O O O O
maturation O O O O
. O O O O
    
Host O O O O
plant O O O O
effects O O O O
on O O O O
alkaline O O O O
phosphatase O O O O
activity O O O O
in O O O O
the O O O O
whiteflies O O O O
, O O O O
Bemisia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tabaci O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Biotype O O O O
B O O O O
and O O O O
Trialeurodes B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
vaporariorum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Bemisia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tabaci O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Gennadius O O O O
) O O O O
B O O O O
- O O O O
biotype O O O O
and O O O O
Trialeurodes B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
vaporariorum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Westwood O O O O
) O O O O
( O O O O
Hemiptera O O O O
: O O O O
Aleyrodidae O O O O
) O O O O
often O O O O
coexist O O O O
on O O O O
greenhouse O O O O
- O O O O
grown O O O O
vegetable O O O O
crops O O O O
in O O O O
northern O O O O
China O O O O
. O O O O
    
The O O O O
recent O O O O
spread O O O O
of O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tabaci O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
B O O O O
- O O O O
biotype O O O O
has O O O O
largely O O O O
replaced O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
vaporariorum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
B O O O O
- O O O O
biotype O O O O
now O O O O
overlaps O O O O
with O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
vaporariorum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
where O O O O
common O O O O
hosts O O O O
occur O O O O
in O O O O
most O O O O
invaded O O O O
areas O O O O
. O O O O
    
The O O O O
impact O O O O
of O O O O
the O O O O
B O O O O
- O O O O
biotype O O O O
on O O O O
the O O O O
agro O O O O
eco O O O O
system O O O O
appears O O O O
to O O O O
be O O O O
widespread O O O O
, O O O O
and O O O O
involves O O O O
the O O O O
ability O O O O
to O O O O
compete O O O O
with O O O O
and O O O O
perhaps O O O O
replace O O O O
other O O O O
phytophages O O O O
like O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
vaporariorum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
An O O O O
emerging O O O O
hypothesis O O O O
is O O O O
that O O O O
the O O O O
B O O O O
- O O O O
biotype O O O O
is O O O O
physiologically O O O O
superior O O O O
due O O O O
at O O O O
least O O O O
in O O O O
part O O O O
to O O O O
an O O O O
improved O O O O
ability O O O O
to O O O O
metabolically O O O O
utilize O O O O
the O O O O
alkaline O O O O
phosphatase O O O O
pathway O O O O
. O O O O
    
To O O O O
test O O O O
this O O O O
hypothesis O O O O
, O O O O
alkaline O O O O
phosphatase O O O O
activity O O O O
was O O O O
studied O O O O
in O O O O
the O O O O
B O O O O
- O O O O
biotype O O O O
and O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
vaporariorum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
after O O O O
feeding O O O O
on O O O O
a O O O O
number O O O O
of O O O O
different O O O O
hosts O O O O
for O O O O
a O O O O
range O O O O
of O O O O
durations O O O O
, O O O O
with O O O O
and O O O O
without O O O O
host O O O O
switching O O O O
. O O O O
    
Alkaline O O O O
phosphatase O O O O
activity O O O O
in O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
vaporariorum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
1 O O O O
. O O O O
45 O O O O
to O O O O
2 O O O O
. O O O O
53 O O O O
- O O O O
fold O O O O
higher O O O O
than O O O O
that O O O O
of O O O O
the O O O O
B O O O O
- O O O O
biotype O O O O
when O O O O
fed O O O O
on O O O O
tomato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
for O O O O
4 O O O O
and O O O O
24 O O O O
h O O O O
, O O O O
or O O O O
switched O O O O
from O O O O
tomato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
to O O O O
cotton B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
cabbage B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
for O O O O
the O O O O
same O O O O
durations O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
alkaline O O O O
phosphatase O O O O
activity O O O O
in O O O O
the O O O O
B O O O O
- O O O O
biotype O O O O
was O O O O
1 O O O O
. O O O O
40 O O O O
to O O O O
3 O O O O
. O O O O
35 O O O O
- O O O O
fold O O O O
higher O O O O
than O O O O
that O O O O
of O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
vaporariorum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
when O O O O
the O O O O
host O O O O
switching O O O O
time O O O O
was O O O O
- O O O O
72 O O O O
and O O O O
- O O O O
120 O O O O
h O O O O
on O O O O
the O O O O
same O O O O
plant O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
short O O O O
- O O O O
term O O O O
( O O O O
4 O O O O
h O O O O
) O O O O
and O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
( O O O O
72 O O O O
h O O O O
) O O O O
switching O O O O
of O O O O
plant O O O O
hosts O O O O
can O O O O
significantly O O O O
affect O O O O
the O O O O
alkaline O O O O
phosphatase O O O O
activity O O O O
in O O O O
the O O O O
two O O O O
species O O O O
. O O O O
    
After O O O O
- O O O O
120 O O O O
h O O O O
, O O O O
feeding O O O O
on O O O O
tomato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
cotton B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
alkaline O O O O
phosphatase O O O O
activity O O O O
in O O O O
the O O O O
B O O O O
- O O O O
biotype O O O O
was O O O O
significantly O O O O
higher O O O O
than O O O O
that O O O O
of O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
vaporariorum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
It O O O O
was O O O O
shown O O O O
that O O O O
alkaline O O O O
phosphatase O O O O
aids O O O O
the O O O O
species O O O O
feeding O O O O
on O O O O
different O O O O
plant O O O O
species O O O O
, O O O O
and O O O O
that O O O O
the O O O O
B O O O O
- O O O O
biotype O O O O
is O O O O
physiologically O O O O
superior O O O O
to O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
vaporariorum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
utilizing O O O O
the O O O O
enzyme O O O O
compared O O O O
to O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
vaporariorum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
over O O O O
longer O O O O
periods O O O O
of O O O O
feeding O O O O
. O O O O
    
Evidence O O O O
to O O O O
support O O O O
karyotypic O O O O
variation O O O O
of O O O O
the O O O O
mosquito O O O O
, O O O O
Anopheles B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
peditaeniatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
Thailand O O O O
. O O O O
    
Eight O O O O
isoline O O O O
colonies O O O O
of O O O O
Anopheles B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
peditaeniatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Leicester O O O O
( O O O O
Diptera O O O O
: O O O O
Culicidae O O O O
) O O O O
were O O O O
established O O O O
from O O O O
wild O O O O
- O O O O
caught O O O O
females O O O O
collected O O O O
from O O O O
buffalo B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
baited O O O O
traps O O O O
at O O O O
8 O O O O
localities O O O O
in O O O O
Thailand O O O O
. O O O O
    
They O O O O
showed O O O O
2 O O O O
types O O O O
of O O O O
X O O O O
( O O O O
X O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
, O O O O
X O O O O
( O O O O
3 O O O O
) O O O O
) O O O O
and O O O O
4 O O O O
types O O O O
of O O O O
Y O O O O
( O O O O
Y O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
, O O O O
Y O O O O
( O O O O
3 O O O O
) O O O O
, O O O O
Y O O O O
( O O O O
4 O O O O
) O O O O
, O O O O
Y O O O O
( O O O O
5 O O O O
) O O O O
) O O O O
chromosomes O O O O
based O O O O
on O O O O
the O O O O
number O O O O
and O O O O
amount O O O O
of O O O O
major O O O O
block O O O O
( O O O O
s O O O O
) O O O O
of O O O O
heterochromatin O O O O
present O O O O
in O O O O
the O O O O
heterochromatic O O O O
arm O O O O
, O O O O
and O O O O
were O O O O
tentatively O O O O
designated O O O O
as O O O O
Forms O O O O
B O O O O
( O O O O
X O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
, O O O O
X O O O O
( O O O O
3 O O O O
) O O O O
, O O O O
Y O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
) O O O O
, O O O O
C O O O O
( O O O O
X O O O O
( O O O O
3 O O O O
) O O O O
, O O O O
Y O O O O
( O O O O
3 O O O O
) O O O O
) O O O O
, O O O O
D O O O O
( O O O O
X O O O O
( O O O O
3 O O O O
) O O O O
, O O O O
Y O O O O
( O O O O
4 O O O O
) O O O O
) O O O O
and O O O O
E O O O O
( O O O O
X O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
, O O O O
X O O O O
( O O O O
3 O O O O
) O O O O
, O O O O
Y O O O O
( O O O O
5 O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Form O O O O
B O O O O
was O O O O
found O O O O
in O O O O
Nan O O O O
, O O O O
Ratchaburi O O O O
, O O O O
and O O O O
Chumphon O O O O
provinces O O O O
; O O O O
Form O O O O
C O O O O
was O O O O
obtained O O O O
in O O O O
Chon O O O O
Buri O O O O
province O O O O
; O O O O
Form O O O O
D O O O O
was O O O O
recovered O O O O
in O O O O
Kamphaeng O O O O
Phet O O O O
province O O O O
; O O O O
and O O O O
Form O O O O
E O O O O
was O O O O
acquired O O O O
in O O O O
Chiang O O O O
Mai O O O O
, O O O O
Udon O O O O
Thani O O O O
, O O O O
and O O O O
Ubon O O O O
Ratchathani O O O O
provinces O O O O
. O O O O
    
Crossing O O O O
studies O O O O
among O O O O
the O O O O
8 O O O O
isoline O O O O
colonies O O O O
, O O O O
which O O O O
were O O O O
representative O O O O
of O O O O
4 O O O O
karyotypic O O O O
forms O O O O
of O O O O
An B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
peditaeniatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
revealed O O O O
genetic O O O O
compatibility O O O O
in O O O O
providing O O O O
viable O O O O
progenies O O O O
and O O O O
synaptic O O O O
salivary O O O O
gland O O O O
polytene O O O O
chromosomes O O O O
through O O O O
F O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
- O O O O
generations O O O O
, O O O O
thus O O O O
suggesting O O O O
the O O O O
conspecific O O O O
nature O O O O
of O O O O
these O O O O
karyotypic O O O O
forms O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
were O O O O
supported O O O O
by O O O O
the O O O O
very O O O O
low O O O O
intraspecific O O O O
sequence O O O O
variations O O O O
( O O O O
0 O O O O
. O O O O
0 O O O O
- O O O O
1 O O O O
. O O O O
1 O O O O
% O O O O
) O O O O
of O O O O
the O O O O
nucleotide O O O O
sequences O O O O
in O O O O
ribosomal O O O O
DNA O O O O
( O O O O
ITS2 O O O O
) O O O O
and O O O O
mitochondrial O O O O
DNA O O O O
( O O O O
COI O O O O
and O O O O
COII O O O O
) O O O O
of O O O O
the O O O O
4 O O O O
forms O O O O
. O O O O
    
A O O O O
review O O O O
of O O O O
the O O O O
implications O O O O
of O O O O
heterozygosity O O O O
and O O O O
inbreeding O O O O
on O O O O
germplasm O O O O
biodiversity O O O O
and O O O O
its O O O O
conservation O O O O
in O O O O
the O O O O
silkworm B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
Bombyx B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mori O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Abstract O O O O
Silkworm B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
genebanks O O O O
assume O O O O
paramount O O O O
importance O O O O
as O O O O
the O O O O
reservoirs O O O O
of O O O O
biodiversity O O O O
and O O O O
source O O O O
of O O O O
alleles O O O O
that O O O O
can O O O O
be O O O O
easily O O O O
retrieved O O O O
for O O O O
genetic O O O O
enhancement O O O O
of O O O O
popular O O O O
breeds O O O O
. O O O O
    
More O O O O
than O O O O
4000 O O O O
Bombyx B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mori O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
L O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Lepidoptera O O O O
: O O O O
Bombycidae O O O O
) O O O O
strains O O O O
are O O O O
currently O O O O
available O O O O
and O O O O
these O O O O
strains O O O O
are O O O O
maintained O O O O
through O O O O
continuous O O O O
sibling O O O O
mating O O O O
. O O O O
    
This O O O O
repeated O O O O
sibling O O O O
mating O O O O
makes O O O O
the O O O O
populations O O O O
of O O O O
each O O O O
strain O O O O
more O O O O
homozygous O O O O
, O O O O
but O O O O
leads O O O O
to O O O O
loss O O O O
of O O O O
unique O O O O
and O O O O
valuable O O O O
genes O O O O
through O O O O
the O O O O
process O O O O
of O O O O
inbreeding O O O O
depression O O O O
. O O O O
    
Hence O O O O
, O O O O
it O O O O
is O O O O
essential O O O O
to O O O O
maintain O O O O
a O O O O
minimal O O O O
degree O O O O
of O O O O
heterozygosity O O O O
within O O O O
the O O O O
population O O O O
of O O O O
each O O O O
silkworm B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
strain O O O O
, O O O O
especially O O O O
in O O O O
the O O O O
traditional O O O O
geographic O O O O
strains O O O O
, O O O O
to O O O O
avoid O O O O
such O O O O
loss O O O O
. O O O O
    
As O O O O
a O O O O
result O O O O
, O O O O
accurate O O O O
estimation O O O O
of O O O O
genetic O O O O
diversity O O O O
is O O O O
becoming O O O O
more O O O O
important O O O O
in O O O O
silkworm B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
genetic O O O O
resources O O O O
conservation O O O O
. O O O O
    
Application O O O O
of O O O O
molecular O O O O
markers O O O O
help O O O O
estimate O O O O
genetic O O O O
diversity O O O O
much O O O O
more O O O O
accurately O O O O
than O O O O
that O O O O
of O O O O
morphological O O O O
traits O O O O
. O O O O
    
Since O O O O
a O O O O
minimal O O O O
amount O O O O
of O O O O
heterozygosity O O O O
in O O O O
each O O O O
silkworm B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
strain O O O O
is O O O O
essential O O O O
for O O O O
better O O O O
conservation O O O O
by O O O O
avoiding O O O O
inbreeding O O O O
depression O O O O
, O O O O
this O O O O
article O O O O
overviews O O O O
both O O O O
theoretical O O O O
and O O O O
practical O O O O
importance O O O O
of O O O O
heterozygosity O O O O
together O O O O
with O O O O
impacts O O O O
of O O O O
inbreeding O O O O
depression O O O O
and O O O O
the O O O O
merits O O O O
and O O O O
demerits O O O O
of O O O O
neutral O O O O
molecular O O O O
markers O O O O
for O O O O
measurements O O O O
of O O O O
both O O O O
heterozygosity O O O O
and O O O O
inbreeding O O O O
depression O O O O
in O O O O
the O O O O
silkworm B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
Bombyx B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mori O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Characterization O O O O
of O O O O
nonjunctional O O O O
hemichannels O O O O
in O O O O
caterpillar O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Recent O O O O
studies O O O O
have O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
hemichannels O O O O
, O O O O
which O O O O
form O O O O
gap O O O O
junctions O O O O
when O O O O
paired O O O O
from O O O O
apposing O O O O
cells O O O O
, O O O O
may O O O O
serve O O O O
additional O O O O
roles O O O O
when O O O O
unpaired O O O O
including O O O O
cell O O O O
adhesion O O O O
and O O O O
paracrine O O O O
communication O O O O
. O O O O
    
Hemichannels O O O O
in O O O O
mammals O O O O
are O O O O
formed O O O O
by O O O O
connexins O O O O
or O O O O
pannexins O O O O
, O O O O
while O O O O
in O O O O
insects O O O O
they O O O O
are O O O O
formed O O O O
by O O O O
pannexin O O O O
homologues O O O O
termed O O O O
innexins O O O O
. O O O O
    
The O O O O
formation O O O O
of O O O O
functional O O O O
gap O O O O
junctions O O O O
by O O O O
insect O O O O
innexins O O O O
has O O O O
been O O O O
established O O O O
, O O O O
although O O O O
their O O O O
ability O O O O
to O O O O
form O O O O
functional O O O O
nonjunctional O O O O
hemichannels O O O O
has O O O O
not O O O O
been O O O O
reported O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
the O O O O
characteristics O O O O
of O O O O
nonjunctional O O O O
hemichannels O O O O
were O O O O
examined O O O O
in O O O O
three O O O O
lepidopteran O O O O
cell O O O O
types O O O O
, O O O O
two O O O O
cell O O O O
lines O O O O
( O O O O
High O O O O
Five O O O O
and O O O O
Sf9 O O O O
) O O O O
and O O O O
explanted O O O O
hemocytes O O O O
from O O O O
Heliothis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virescens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Fabricius O O O O
) O O O O
( O O O O
Lepidoptera O O O O
: O O O O
Noctuidae O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Selective O O O O
fluorescent O O O O
dye O O O O
uptake O O O O
by O O O O
hemichannels O O O O
was O O O O
observed O O O O
in O O O O
a O O O O
significant O O O O
minority O O O O
of O O O O
cells O O O O
, O O O O
using O O O O
fluorescence O O O O
microscopy O O O O
and O O O O
flow O O O O
cytometry O O O O
. O O O O
    
Carbenoxelone O O O O
, O O O O
an O O O O
inhibitor O O O O
of O O O O
mammalian O O O O
junctions O O O O
, O O O O
disrupted O O O O
dye O O O O
uptake O O O O
, O O O O
while O O O O
flufenamic O O O O
acid O O O O
and O O O O
mefloquine O O O O
did O O O O
not O O O O
. O O O O
    
The O O O O
presence O O O O
of O O O O
Ca O O O O
( O O O O
2 O O O O
+ O O O O
) O O O O
and O O O O
Mg O O O O
( O O O O
2 O O O O
+ O O O O
) O O O O
in O O O O
the O O O O
media O O O O
increased O O O O
hemichannel O O O O
activity O O O O
. O O O O
    
Additionally O O O O
, O O O O
lipopolysaccharide O O O O
, O O O O
a O O O O
stimulator O O O O
of O O O O
immune O O O O
activity O O O O
in O O O O
lepidopterans O O O O
, O O O O
decreased O O O O
dye O O O O
uptake O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
demonstrate O O O O
for O O O O
the O O O O
first O O O O
time O O O O
the O O O O
activity O O O O
of O O O O
nonjunctional O O O O
hemichannels O O O O
in O O O O
insect O O O O
cells O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
pharmacological O O O O
tools O O O O
to O O O O
manipulate O O O O
them O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
will O O O O
facilitate O O O O
the O O O O
further O O O O
examination O O O O
of O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
innexins O O O O
and O O O O
nonjunctional O O O O
hemichannels O O O O
in O O O O
insect O O O O
cell O O O O
biology O O O O
, O O O O
including O O O O
paracrine O O O O
signaling O O O O
, O O O O
and O O O O
comparative O O O O
studies O O O O
of O O O O
mammalian O O O O
pannexins O O O O
and O O O O
insect O O O O
innexins O O O O
. O O O O
    
Post O O O O
- O O O O
egression O O O O
host O O O O
tissue O O O O
feeding O O O O
is O O O O
another O O O O
strategy O O O O
of O O O O
host O O O O
regulation O O O O
by O O O O
the O O O O
Koinobiont O O O O
wasp O O O O
, O O O O
Toxoneuron B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nigriceps O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Koinobiont O O O O
wasps O O O O
start O O O O
their O O O O
lives O O O O
as O O O O
hemolymph O O O O
feeders O O O O
inside O O O O
the O O O O
host O O O O
body O O O O
, O O O O
but O O O O
before O O O O
they O O O O
egress O O O O
from O O O O
the O O O O
host O O O O
many O O O O
become O O O O
tissue O O O O
predators O O O O
. O O O O
    
One O O O O
species O O O O
, O O O O
the O O O O
endoparasitoid O O O O
Toxoneuron B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nigriceps O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Viereck O O O O
( O O O O
Hymenoptera O O O O
: O O O O
Braconidae O O O O
) O O O O
, O O O O
exhibits O O O O
the O O O O
unusual O O O O
behavior O O O O
of O O O O
egressing O O O O
before O O O O
initiating O O O O
tissue O O O O
predation O O O O
. O O O O
    
After O O O O
egression O O O O
from O O O O
the O O O O
host O O O O
, O O O O
it O O O O
reinserts O O O O
its O O O O
head O O O O
into O O O O
the O O O O
host O O O O
body O O O O
to O O O O
begin O O O O
tissue O O O O
feeding O O O O
. O O O O
    
These O O O O
third O O O O
instar O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nigriceps O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
larvae O O O O
show O O O O
a O O O O
significant O O O O
increase O O O O
in O O O O
body O O O O
size O O O O
and O O O O
mass O O O O
after O O O O
post O O O O
- O O O O
egression O O O O
feeding O O O O
. O O O O
    
Through O O O O
this O O O O
project O O O O
the O O O O
importance O O O O
of O O O O
post O O O O
- O O O O
egression O O O O
feeding O O O O
in O O O O
the O O O O
development O O O O
of O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nigriceps O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
its O O O O
host O O O O
the O O O O
tobacco B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
budworm O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Heliothis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virescens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Fabricius O O O O
( O O O O
Lepidoptera O O O O
: O O O O
Noctuidae O O O O
) O O O O
, O O O O
has O O O O
been O O O O
evaluated O O O O
. O O O O
    
The O O O O
study O O O O
was O O O O
conducted O O O O
by O O O O
preventing O O O O
the O O O O
egressed O O O O
third O O O O
instar O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nigriceps O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
larvae O O O O
from O O O O
feeding O O O O
on O O O O
host O O O O
tissue O O O O
and O O O O
observing O O O O
whether O O O O
they O O O O
could O O O O
undergo O O O O
further O O O O
development O O O O
. O O O O
    
Though O O O O
some O O O O
of O O O O
the O O O O
larvae O O O O
that O O O O
were O O O O
prevented O O O O
from O O O O
post O O O O
- O O O O
egression O O O O
feeding O O O O
did O O O O
undergo O O O O
cocoon O O O O
formation O O O O
, O O O O
pupation O O O O
, O O O O
and O O O O
adult O O O O
emergence O O O O
they O O O O
were O O O O
inferior O O O O
in O O O O
terms O O O O
of O O O O
size O O O O
, O O O O
body O O O O
mass O O O O
, O O O O
and O O O O
survival O O O O
to O O O O
those O O O O
that O O O O
developed O O O O
from O O O O
larvae O O O O
allowed O O O O
to O O O O
feeding O O O O
after O O O O
egression O O O O
. O O O O
    
Hence O O O O
, O O O O
it O O O O
is O O O O
concluded O O O O
that O O O O
post O O O O
- O O O O
egression O O O O
host O O O O
tissue O O O O
feeding O O O O
is O O O O
essential O O O O
for O O O O
the O O O O
normal O O O O
development O O O O
of O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nigriceps O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
as O O O O
the O O O O
prevention O O O O
of O O O O
feeding O O O O
resulted O O O O
in O O O O
significantly O O O O
lighter O O O O
and O O O O
smaller O O O O
larvae O O O O
, O O O O
cocoons O O O O
, O O O O
and O O O O
adults O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
deformed O O O O
adults O O O O
and O O O O
reduced O O O O
adult O O O O
survival O O O O
. O O O O
    
Post O O O O
- O O O O
egression O O O O
feeding O O O O
as O O O O
a O O O O
host O O O O
regulatory O O O O
strategy O O O O
is O O O O
discussed O O O O
. O O O O
    
Evaluating O O O O
aggregation O O O O
membership O O O O
and O O O O
copulatory O O O O
success O O O O
in O O O O
the O O O O
stink B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bug O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Euschistus O O O O
conspersus O O O O
, O O O O
using O O O O
field O O O O
and O O O O
laboratory O O O O
experiments O O O O
. O O O O
    
The O O O O
aggregation O O O O
and O O O O
mating O O O O
behavior O O O O
of O O O O
the O O O O
stink B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bug O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Euschistus O O O O
conspersus O O O O
Uhler O O O O
( O O O O
Hemiptera O O O O
: O O O O
Pentatomidae O O O O
) O O O O
was O O O O
investigated O O O O
in O O O O
a O O O O
series O O O O
of O O O O
field O O O O
and O O O O
laboratory O O O O
experiments O O O O
. O O O O
    
Marking O O O O
of O O O O
E O O O O
. O O O O
conspersus O O O O
mating O O O O
in O O O O
aggregations O O O O
in O O O O
the O O O O
field O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
both O O O O
sexes O O O O
mate O O O O
multiple O O O O
times O O O O
within O O O O
aggregations O O O O
on O O O O
successive O O O O
nights O O O O
and O O O O
with O O O O
different O O O O
partners O O O O
, O O O O
although O O O O
= O O O O
20 O O O O
% O O O O
of O O O O
the O O O O
individuals O O O O
of O O O O
both O O O O
sexes O O O O
returned O O O O
to O O O O
aggregations O O O O
but O O O O
did O O O O
not O O O O
mate O O O O
. O O O O
    
Further O O O O
analysis O O O O
of O O O O
mating O O O O
patterns O O O O
in O O O O
caged O O O O
aggregations O O O O
revealed O O O O
that O O O O
heavy O O O O
males O O O O
and O O O O
light O O O O
females O O O O
mated O O O O
more O O O O
frequently O O O O
than O O O O
their O O O O
respective O O O O
counterparts O O O O
. O O O O
    
Data O O O O
are O O O O
interpreted O O O O
in O O O O
terms O O O O
of O O O O
elucidating O O O O
the O O O O
function O O O O
of O O O O
benefits O O O O
of O O O O
multiple O O O O
mating O O O O
within O O O O
aggregations O O O O
for O O O O
males O O O O
and O O O O
females O O O O
. O O O O
    
Occurrence O O O O
of O O O O
entomopathogenic O O O O
fungi O O O O
from O O O O
agricultural O O O O
and O O O O
natural O O O O
ecosystems O O O O
in O O O O
Saltillo O O O O
, O O O O
Mexico O O O O
, O O O O
and O O O O
their O O O O
virulence O O O O
towards O O O O
thrips O O O O
and O O O O
whiteflies O O O O
. O O O O
    
Entomopathogenic O O O O
fungi O O O O
were O O O O
collected O O O O
from O O O O
soil O O O O
in O O O O
four O O O O
adjacent O O O O
habitats O O O O
( O O O O
oak O O O O
forest O O O O
, O O O O
agricultural O O O O
soil O O O O
, O O O O
pine O O O O
reforestation O O O O
and O O O O
chaparral O O O O
habitat O O O O
) O O O O
in O O O O
Saltillo O O O O
, O O O O
Mexico O O O O
using O O O O
the O O O O
insect O O O O
bait O O O O
method O O O O
with O O O O
Tenebrio B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
molitor O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
L O O O O
. O O O O
) O O O O
( O O O O
Coleoptera O O O O
: O O O O
Tenebrionidae O O O O
) O O O O
larvae O O O O
as O O O O
bait O O O O
. O O O O
    
Overall O O O O
, O O O O
of O O O O
the O O O O
larvae O O O O
exposed O O O O
to O O O O
soil O O O O
, O O O O
171 O O O O
( O O O O
20 O O O O
% O O O O
) O O O O
hosted O O O O
Beauveria B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bassiana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Balsamo O O O O
) O O O O
Vuillemin O O O O
( O O O O
Hypocreales O O O O
: O O O O
Cordycipitaceae O O O O
) O O O O
, O O O O
25 O O O O
( O O O O
3 O O O O
% O O O O
) O O O O
hosted O O O O
Metarhizium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
anisopliae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Metschnikoff O O O O
) O O O O
Sorokin O O O O
( O O O O
Hypocreales O O O O
: O O O O
Clavicipitaceae O O O O
) O O O O
and O O O O
1 O O O O
( O O O O
0 O O O O
. O O O O
1 O O O O
% O O O O
) O O O O
hosted O O O O
lsaria B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
= O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Paecilomyces O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
    
( O O O O
Hypocreales O O O O
: O O O O
Cordycipitaceae O O O O
) O O O O
. O O O O
    
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bassiana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
significantly O O O O
more O O O O
frequent O O O O
on O O O O
larvae O O O O
exposed O O O O
to O O O O
oak O O O O
forest O O O O
soil O O O O
. O O O O
    
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
anisopliae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
significantly O O O O
more O O O O
frequent O O O O
on O O O O
larvae O O O O
exposed O O O O
to O O O O
agricultural O O O O
soil O O O O
. O O O O
    
From O O O O
the O O O O
infected O O O O
bait O O O O
insects O O O O
, O O O O
93 O O O O
isolates O O O O
of O O O O
B O O O O
. O O O O
bassiana O O O O
and O O O O
24 O O O O
isolates O O O O
of O O O O
M O O O O
. O O O O
anisopliae O O O O
were O O O O
obtained O O O O
. O O O O
    
Strains O O O O
were O O O O
tested O O O O
for O O O O
their O O O O
infectivity O O O O
against O O O O
Cuban B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
laurel O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
thrips O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Gynaikothrips O O O O
uzeli O O O O
Zimmerman O O O O
( O O O O
Thysanoptera O O O O
: O O O O
Phlaeothripidae O O O O
) O O O O
and O O O O
the O O O O
greenhouse B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
whitefly O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Trialeurodes B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
vaporariorum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Westwood O O O O
) O O O O
( O O O O
Hemiptera O O O O
: O O O O
Aleyrodidae O O O O
) O O O O
. O O O O
    
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bassiana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
isolates O O O O
caused O O O O
the O O O O
highest O O O O
mortality O O O O
on O O O O
thrips O O O O
( O O O O
some O O O O
causing O O O O
88 O O O O
% O O O O
mortality O O O O
after O O O O
6 O O O O
days O O O O
) O O O O
; O O O O
both O O O O
fungal O O O O
species O O O O
caused O O O O
similarly O O O O
high O O O O
mortality O O O O
levels O O O O
against O O O O
whiteflies O O O O
( O O O O
75 O O O O
% O O O O
) O O O O
after O O O O
6 O O O O
days O O O O
. O O O O
    
Large O O O O
amounts O O O O
of O O O O
germplasm O O O O
of O O O O
entomopathogenic O O O O
fungi O O O O
, O O O O
fundamentally O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bassiana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
anisopliae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
exist O O O O
in O O O O
the O O O O
habitats O O O O
sampled O O O O
; O O O O
pathogenicity O O O O
varied O O O O
among O O O O
strains O O O O
, O O O O
and O O O O
some O O O O
strains O O O O
possessed O O O O
significant O O O O
virulence O O O O
. O O O O
    
Soils O O O O
in O O O O
these O O O O
habitats O O O O
are O O O O
reservoirs O O O O
of O O O O
diverse O O O O
strains O O O O
with O O O O
potential O O O O
for O O O O
use O O O O
in O O O O
biocontrol O O O O
. O O O O
    
Lasting O O O O
effects O O O O
of O O O O
maternal O O O O
behaviour O O O O
on O O O O
the O O O O
distribution O O O O
of O O O O
a O O O O
dispersive O O O O
stream O O O O
insect O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Predicting O O O O
population O O O O
dynamics O O O O
at O O O O
large O O O O
spatial O O O O
scales O O O O
requires O O O O
integrating O O O O
information O O O O
about O O O O
spatial O O O O
distribution O O O O
patterns O O O O
, O O O O
inter O O O O
- O O O O
patch O O O O
movement O O O O
rates O O O O
and O O O O
within O O O O
- O O O O
patch O O O O
processes O O O O
. O O O O
    
Advective O O O O
dispersal O O O O
of O O O O
aquatic O O O O
species O O O O
by O O O O
water O O O O
movement O O O O
is O O O O
considered O O O O
paramount O O O O
to O O O O
understanding O O O O
their O O O O
population O O O O
dynamics O O O O
. O O O O
    
Rivers O O O O
are O O O O
model O O O O
advective O O O O
systems O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
larvae O O O O
of O O O O
baetid O O O O
mayflies O O O O
are O O O O
considered O O O O
quintessential O O O O
dispersers O O O O
. O O O O
    
Egg O O O O
laying O O O O
of O O O O
baetids O O O O
along O O O O
channels O O O O
is O O O O
patchy O O O O
and O O O O
reflects O O O O
the O O O O
distribution O O O O
of O O O O
oviposition O O O O
sites O O O O
, O O O O
but O O O O
larvae O O O O
are O O O O
assumed O O O O
to O O O O
drift O O O O
frequently O O O O
and O O O O
far O O O O
, O O O O
thereby O O O O
erasing O O O O
patterns O O O O
created O O O O
during O O O O
oviposition O O O O
. O O O O
    
Dispersal O O O O
kernels O O O O
are O O O O
often O O O O
overestimated O O O O
, O O O O
however O O O O
, O O O O
and O O O O
empirical O O O O
tests O O O O
of O O O O
such O O O O
assumptions O O O O
are O O O O
warranted O O O O
because O O O O
of O O O O
the O O O O
pivotal O O O O
role O O O O
distribution O O O O
patterns O O O O
can O O O O
have O O O O
on O O O O
populations O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
tested O O O O
empirically O O O O
whether O O O O
the O O O O
egg O O O O
distribution O O O O
patterns O O O O
arising O O O O
from O O O O
oviposition O O O O
behaviours O O O O
persisted O O O O
and O O O O
were O O O O
reflected O O O O
in O O O O
the O O O O
distribution O O O O
patterns O O O O
of O O O O
larval O O O O
Baetis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
rhodani O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
In O O O O
field O O O O
surveys O O O O
, O O O O
we O O O O
tested O O O O
for O O O O
associations O O O O
between O O O O
egg O O O O
mass O O O O
and O O O O
larval O O O O
densities O O O O
over O O O O
1 O O O O
km O O O O
lengths O O O O
of O O O O
four O O O O
streams O O O O
. O O O O
    
A O O O O
control O O O O
species O O O O
, O O O O
the O O O O
mayfly O O O O
Ephemerella O O O O
ignita O O O O
, O O O O
was O O O O
employed O O O O
to O O O O
test O O O O
for O O O O
covarying O O O O
environmental O O O O
factors O O O O
. O O O O
    
We O O O O
estimated O O O O
drift O O O O
rates O O O O
directly O O O O
to O O O O
test O O O O
whether O O O O
larvae O O O O
dispersed O O O O
between O O O O
riffles O O O O
( O O O O
patches O O O O
of O O O O
high O O O O
egg O O O O
mass O O O O
density O O O O
) O O O O
and O O O O
whether O O O O
drift O O O O
rates O O O O
were O O O O
density O O O O
- O O O O
dependent O O O O
or O O O O
density O O O O
- O O O O
related O O O O
- O O O O
expected O O O O
outcomes O O O O
if O O O O
drift O O O O
erases O O O O
patterns O O O O
established O O O O
by O O O O
maternal O O O O
behaviours O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Positive O O O O
associations O O O O
between O O O O
egg O O O O
masses O O O O
and O O O O
larval O O O O
benthic O O O O
densities O O O O
were O O O O
found O O O O
for O O O O
neonate O O O O
and O O O O
mid O O O O
- O O O O
stage O O O O
larvae O O O O
of O O O O
Baetis O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
the O O O O
control O O O O
species O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
persistence O O O O
of O O O O
the O O O O
patchy O O O O
distribution O O O O
patterns O O O O
established O O O O
at O O O O
oviposition O O O O
. O O O O
    
Drift O O O O
rates O O O O
were O O O O
high O O O O
, O O O O
and O O O O
riffles O O O O
were O O O O
net O O O O
exporters O O O O
of O O O O
neonate O O O O
and O O O O
mid O O O O
- O O O O
stage O O O O
larvae O O O O
, O O O O
but O O O O
drift O O O O
rates O O O O
were O O O O
unrelated O O O O
to O O O O
benthic O O O O
densities O O O O
and O O O O
few O O O O
drifters O O O O
reached O O O O
the O O O O
next O O O O
riffle O O O O
. O O O O
    
Riffles O O O O
were O O O O
sinks O O O O
for O O O O
large O O O O
larvae O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
ontogenetic O O O O
shifts O O O O
in O O O O
habitat O O O O
use O O O O
, O O O O
but O O O O
little O O O O
long O O O O
- O O O O
distance O O O O
dispersal O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Overall O O O O
, O O O O
the O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
most O O O O
neonate O O O O
and O O O O
mid O O O O
- O O O O
stage O O O O
larvae O O O O
of O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
rhodani O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
remain O O O O
close O O O O
to O O O O
the O O O O
natal O O O O
riffle O O O O
, O O O O
and O O O O
late O O O O
- O O O O
stage O O O O
larvae O O O O
disperse O O O O
shorter O O O O
distances O O O O
than O O O O
routinely O O O O
assumed O O O O
. O O O O
    
The O O O O
persistence O O O O
of O O O O
maternal O O O O
effects O O O O
on O O O O
distribution O O O O
patterns O O O O
well O O O O
into O O O O
juvenile O O O O
life O O O O
of O O O O
an O O O O
allegedly O O O O
iconic O O O O
disperser O O O O
suggests O O O O
that O O O O
traditional O O O O
models O O O O
of O O O O
how O O O O
dispersal O O O O
influences O O O O
the O O O O
population O O O O
dynamics O O O O
of O O O O
many O O O O
lotic O O O O
invertebrates O O O O
may O O O O
be O O O O
incorrect O O O O
. O O O O
    
Effects O O O O
of O O O O
individual O O O O
condition O O O O
and O O O O
habitat O O O O
quality O O O O
on O O O O
natal O O O O
dispersal O O O O
behaviour O O O O
in O O O O
a O O O O
small O O O O
rodent O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Individuals O O O O
should O O O O
benefit O O O O
from O O O O
settling O O O O
in O O O O
high O O O O
- O O O O
quality O O O O
habitats O O O O
, O O O O
but O O O O
dispersers O O O O
born O O O O
under O O O O
favourable O O O O
conditions O O O O
have O O O O
a O O O O
better O O O O
physical O O O O
condition O O O O
and O O O O
should O O O O
therefore O O O O
be O O O O
more O O O O
successful O O O O
at O O O O
settling O O O O
in O O O O
high O O O O
- O O O O
quality O O O O
habitats O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
tested O O O O
these O O O O
predictions O O O O
with O O O O
root B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
voles O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Microtus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
oeconomus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
by O O O O
a O O O O
manipulation O O O O
of O O O O
individual O O O O
condition O O O O
through O O O O
litter O O O O
- O O O O
size O O O O
enlargement O O O O
and O O O O
reduction O O O O
during O O O O
lactation O O O O
combined O O O O
with O O O O
a O O O O
manipulation O O O O
of O O O O
habitat O O O O
quality O O O O
through O O O O
degradation O O O O
of O O O O
the O O O O
vegetation O O O O
cover O O O O
. O O O O
    
We O O O O
accurately O O O O
monitored O O O O
movements O O O O
of O O O O
149 O O O O
juveniles O O O O
during O O O O
a O O O O
settlement O O O O
and O O O O
breeding O O O O
period O O O O
of O O O O
3 O O O O
months O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
litter O O O O
size O O O O
treatment O O O O
had O O O O
long O O O O
- O O O O
lasting O O O O
effects O O O O
on O O O O
body O O O O
size O O O O
, O O O O
life O O O O
- O O O O
history O O O O
traits O O O O
and O O O O
home O O O O
range O O O O
size O O O O
, O O O O
but O O O O
did O O O O
not O O O O
influence O O O O
dispersal O O O O
behaviour O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Different O O O O
stages O O O O
of O O O O
dispersal O O O O
were O O O O
influenced O O O O
by O O O O
habitat O O O O
quality O O O O
. O O O O
    
In O O O O
low O O O O
- O O O O
quality O O O O
patches O O O O
, O O O O
females O O O O
dispersed O O O O
earlier O O O O
, O O O O
spent O O O O
more O O O O
time O O O O
prospecting O O O O
their O O O O
environment O O O O
before O O O O
settling O O O O
, O O O O
and O O O O
settlers O O O O
had O O O O
a O O O O
smaller O O O O
adult O O O O
body O O O O
size O O O O
than O O O O
in O O O O
high O O O O
- O O O O
quality O O O O
patches O O O O
. O O O O
    
Preference O O O O
and O O O O
competition O O O O
for O O O O
high O O O O
- O O O O
quality O O O O
patches O O O O
is O O O O
likely O O O O
adaptive O O O O
as O O O O
it O O O O
increased O O O O
fitness O O O O
both O O O O
in O O O O
terms O O O O
of O O O O
survival O O O O
and O O O O
reproduction O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
no O O O O
interactive O O O O
effect O O O O
of O O O O
individual O O O O
condition O O O O
and O O O O
habitat O O O O
quality O O O O
on O O O O
natal O O O O
dispersal O O O O
and O O O O
habitat O O O O
selection O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
These O O O O
findings O O O O
suggest O O O O
that O O O O
immediate O O O O
conditions O O O O
are O O O O
more O O O O
important O O O O
determinants O O O O
of O O O O
dispersal O O O O
decisions O O O O
than O O O O
conditions O O O O
experienced O O O O
early O O O O
in O O O O
life O O O O
. O O O O
    
Nesting O O O O
biology O O O O
and O O O O
fungiculture O O O O
of O O O O
the O O O O
fungus O O O O
- O O O O
growing O O O O
ant O O O O
, O O O O
Mycetagroicus O O O O
cerradensis O O O O
: O O O O
new O O O O
light O O O O
on O O O O
the O O O O
origin O O O O
of O O O O
higher O O O O
attine O O O O
agriculture O O O O
. O O O O
    
The O O O O
genus O O O O
Mycetagroicus O O O O
is O O O O
perhaps O O O O
the O O O O
least O O O O
known O O O O
of O O O O
all O O O O
fungus O O O O
- O O O O
growing O O O O
ant O O O O
genera O O O O
, O O O O
having O O O O
been O O O O
first O O O O
described O O O O
in O O O O
2001 O O O O
from O O O O
museum O O O O
specimens O O O O
. O O O O
    
A O O O O
recent O O O O
molecular O O O O
phylogenetic O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
fungus O O O O
- O O O O
growing O O O O
ants O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
Mycetagroicus O O O O
is O O O O
the O O O O
sister O O O O
to O O O O
all O O O O
higher O O O O
attine O O O O
ants O O O O
( O O O O
Trachymyrmex O O O O
, O O O O
Sericomyrmex O O O O
, O O O O
Acromyrmex O O O O
, O O O O
Pseudoatta O O O O
, O O O O
and O O O O
Atta O O O O
) O O O O
, O O O O
making O O O O
it O O O O
of O O O O
extreme O O O O
importance O O O O
for O O O O
understanding O O O O
the O O O O
transition O O O O
between O O O O
lower O O O O
and O O O O
higher O O O O
attine O O O O
agriculture O O O O
. O O O O
    
Four O O O O
nests O O O O
of O O O O
Mycetagroicus O O O O
cerradensis O O O O
near O O O O
Uberlandia O O O O
, O O O O
Minas O O O O
Gerais O O O O
, O O O O
Brazil O O O O
were O O O O
excavated O O O O
, O O O O
and O O O O
fungus O O O O
chambers O O O O
for O O O O
one O O O O
were O O O O
located O O O O
at O O O O
a O O O O
depth O O O O
of O O O O
3 O O O O
. O O O O
5 O O O O
meters O O O O
. O O O O
    
Based O O O O
on O O O O
its O O O O
lack O O O O
of O O O O
gongylidia O O O O
( O O O O
hyphal O O O O
- O O O O
tip O O O O
swellings O O O O
typical O O O O
of O O O O
higher O O O O
attine O O O O
cultivars O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
a O O O O
phylogenetic O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
ITS O O O O
rDNA O O O O
gene O O O O
region O O O O
, O O O O
M O O O O
. O O O O
cerradensis O O O O
cultivates O O O O
a O O O O
lower O O O O
attine O O O O
fungus O O O O
in O O O O
Clade O O O O
2 O O O O
of O O O O
lower O O O O
attine O O O O
( O O O O
G3 O O O O
) O O O O
fungi O O O O
. O O O O
    
This O O O O
finding O O O O
refines O O O O
a O O O O
previous O O O O
estimate O O O O
for O O O O
the O O O O
origin O O O O
of O O O O
higher O O O O
attine O O O O
agriculture O O O O
, O O O O
an O O O O
event O O O O
that O O O O
can O O O O
now O O O O
be O O O O
dated O O O O
at O O O O
approximately O O O O
21 O O O O
- O O O O
25 O O O O
mya O O O O
in O O O O
the O O O O
ancestor O O O O
of O O O O
extant O O O O
species O O O O
of O O O O
Trachymyrmex O O O O
and O O O O
Sericomyrmex O O O O
. O O O O
    
The O O O O
role O O O O
of O O O O
body O O O O
size O O O O
and O O O O
shape O O O O
in O O O O
understanding O O O O
competitive O O O O
interactions O O O O
within O O O O
a O O O O
community O O O O
of O O O O
Neotropical O O O O
dung O O O O
beetles O O O O
. O O O O
    
Geometric O O O O
morphometrics O O O O
is O O O O
helpful O O O O
for O O O O
understanding O O O O
how O O O O
body O O O O
size O O O O
and O O O O
body O O O O
shape O O O O
influence O O O O
the O O O O
strength O O O O
of O O O O
inter O O O O
- O O O O
specific O O O O
competitive O O O O
interactions O O O O
in O O O O
a O O O O
community O O O O
. O O O O
    
Dung O O O O
beetles O O O O
, O O O O
characterized O O O O
by O O O O
their O O O O
use O O O O
of O O O O
decomposing O O O O
organic O O O O
material O O O O
, O O O O
provide O O O O
a O O O O
useful O O O O
model O O O O
for O O O O
understanding O O O O
the O O O O
structuring O O O O
of O O O O
ecological O O O O
communities O O O O
and O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
competition O O O O
based O O O O
on O O O O
their O O O O
size O O O O
and O O O O
morphology O O O O
. O O O O
    
The O O O O
relationship O O O O
between O O O O
body O O O O
size O O O O
and O O O O
shape O O O O
in O O O O
a O O O O
dung O O O O
beetle O O O O
community O O O O
from O O O O
the O O O O
Atlantic O O O O
Forest O O O O
in O O O O
Serra O O O O
do O O O O
Japi O O O O
, O O O O
Brazil O O O O
was O O O O
analyzed O O O O
for O O O O
39 O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Fifteen O O O O
anatomical O O O O
landmarks O O O O
on O O O O
three O O O O
- O O O O
dimensional O O O O
Cartesian O O O O
coordinates O O O O
were O O O O
used O O O O
to O O O O
describe O O O O
both O O O O
the O O O O
shape O O O O
and O O O O
the O O O O
size O O O O
of O O O O
the O O O O
body O O O O
of O O O O
each O O O O
species O O O O
on O O O O
the O O O O
basis O O O O
of O O O O
the O O O O
centroid O O O O
located O O O O
along O O O O
homologous O O O O
points O O O O
in O O O O
all O O O O
of O O O O
the O O O O
species O O O O
. O O O O
    
The O O O O
first O O O O
vector O O O O
of O O O O
a O O O O
principal O O O O
components O O O O
analysis O O O O
explained O O O O
38 O O O O
. O O O O
5 O O O O
% O O O O
of O O O O
the O O O O
morphological O O O O
variation O O O O
among O O O O
species O O O O
, O O O O
and O O O O
represents O O O O
a O O O O
gradient O O O O
of O O O O
body O O O O
shape O O O O
from O O O O
elongated O O O O
, O O O O
flattened O O O O
bodies O O O O
with O O O O
narrow O O O O
abdomen O O O O
to O O O O
rounded O O O O
or O O O O
convex O O O O
bodies O O O O
. O O O O
    
The O O O O
second O O O O
component O O O O
explained O O O O
17 O O O O
. O O O O
8 O O O O
% O O O O
of O O O O
the O O O O
remaining O O O O
variation O O O O
in O O O O
body O O O O
shape O O O O
, O O O O
which O O O O
goes O O O O
from O O O O
species O O O O
with O O O O
an O O O O
abdomen O O O O
that O O O O
is O O O O
larger O O O O
than O O O O
the O O O O
elytra O O O O
to O O O O
species O O O O
with O O O O
constricted O O O O
abdomens O O O O
and O O O O
large O O O O
elytra O O O O
. O O O O
    
The O O O O
relationship O O O O
between O O O O
body O O O O
size O O O O
and O O O O
shape O O O O
was O O O O
analyzed O O O O
separately O O O O
for O O O O
diurnal O O O O
and O O O O
nocturnal O O O O
species O O O O
. O O O O
    
In O O O O
both O O O O
guilds O O O O
not O O O O
only O O O O
were O O O O
there O O O O
differences O O O O
in O O O O
body O O O O
size O O O O
, O O O O
but O O O O
also O O O O
in O O O O
body O O O O
shape O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
a O O O O
reduction O O O O
in O O O O
their O O O O
level O O O O
of O O O O
competition O O O O
. O O O O
    
Analysis O O O O
of O O O O
genetic O O O O
variation O O O O
and O O O O
phylogeny O O O O
of O O O O
the O O O O
predatory B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bug O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Pilophorus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
typicus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
in O O O O
Japan O O O O
using O O O O
mitochondrial O O O O
gene O O O O
sequences O O O O
. O O O O
    
Pilophorus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
typicus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Distant O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Heteroptera O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
: O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Miridae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
a O O O O
predatory B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bug O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
occurring O O O O
in O O O O
East O O O O
, O O O O
Southeast O O O O
, O O O O
and O O O O
South O O O O
Asia O O O O
. O O O O
    
Because O O O O
the O O O O
active O O O O
stages O O O O
of O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
typicus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
prey O O O O
on O O O O
various O O O O
agricultural O O O O
pest O O O O
insects O O O O
and O O O O
mites O O O O
, O O O O
this O O O O
species O O O O
is O O O O
a O O O O
candidate O O O O
insect O O O O
as O O O O
an O O O O
indigenous O O O O
natural O O O O
enemy O O O O
for O O O O
use O O O O
in O O O O
biological O O O O
control O O O O
programs O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
mass O O O O
releasing O O O O
of O O O O
introduced O O O O
natural O O O O
enemies O O O O
into O O O O
agricultural O O O O
fields O O O O
may O O O O
incur O O O O
the O O O O
risk O O O O
of O O O O
affecting O O O O
the O O O O
genetic O O O O
integrity O O O O
of O O O O
species O O O O
through O O O O
hybridization O O O O
with O O O O
a O O O O
local O O O O
population O O O O
. O O O O
    
To O O O O
clarify O O O O
the O O O O
genetic O O O O
characteristics O O O O
of O O O O
the O O O O
Japanese O O O O
populations O O O O
of O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
typicus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
two O O O O
portions O O O O
of O O O O
the O O O O
mitochondrial O O O O
DNA O O O O
, O O O O
the O O O O
cytochrome O O O O
oxidase O O O O
subunit O O O O
I O O O O
( O O O O
COI O O O O
) O O O O
( O O O O
534 O O O O
bp O O O O
) O O O O
and O O O O
the O O O O
cytochrome O O O O
B O O O O
( O O O O
cytB O O O O
) O O O O
( O O O O
217 O O O O
bp O O O O
) O O O O
genes O O O O
, O O O O
were O O O O
sequenced O O O O
for O O O O
64 O O O O
individuals O O O O
collected O O O O
from O O O O
55 O O O O
localities O O O O
in O O O O
a O O O O
wide O O O O
range O O O O
of O O O O
Japan O O O O
. O O O O
    
Totals O O O O
of O O O O
18 O O O O
and O O O O
10 O O O O
haplotypes O O O O
were O O O O
identified O O O O
for O O O O
the O O O O
COI O O O O
and O O O O
cytB O O O O
sequences O O O O
, O O O O
respectively O O O O
( O O O O
25 O O O O
haplotypes O O O O
over O O O O
regions O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Phylogenetic O O O O
analysis O O O O
using O O O O
the O O O O
maximum O O O O
likelihood O O O O
method O O O O
revealed O O O O
the O O O O
existence O O O O
of O O O O
two O O O O
genetically O O O O
distinct O O O O
groups O O O O
in O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
typicus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
Japan O O O O
. O O O O
    
These O O O O
groups O O O O
were O O O O
distributed O O O O
in O O O O
different O O O O
geographic O O O O
ranges O O O O
: O O O O
one O O O O
occurred O O O O
mainly O O O O
from O O O O
the O O O O
Pacific O O O O
coastal O O O O
areas O O O O
of O O O O
the O O O O
Kii O O O O
Peninsula O O O O
, O O O O
the O O O O
Shikoku O O O O
Island O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
Ryukyu O O O O
Islands O O O O
; O O O O
whereas O O O O
the O O O O
other O O O O
occurred O O O O
from O O O O
the O O O O
northern O O O O
Kyushu O O O O
district O O O O
to O O O O
the O O O O
Kanto O O O O
and O O O O
Hokuriku O O O O
districts O O O O
of O O O O
mainland O O O O
Japan O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
both O O O O
haplotypes O O O O
were O O O O
found O O O O
in O O O O
a O O O O
single O O O O
locality O O O O
of O O O O
the O O O O
southern O O O O
coast O O O O
of O O O O
the O O O O
Shikoku O O O O
Island O O O O
. O O O O
    
COI O O O O
phylogeny O O O O
incorporating O O O O
other O O O O
Pilophorus O O O O
species O O O O
revealed O O O O
that O O O O
these O O O O
groups O O O O
were O O O O
only O O O O
recently O O O O
differentiated O O O O
. O O O O
    
Therefore O O O O
, O O O O
use O O O O
of O O O O
a O O O O
certain O O O O
population O O O O
of O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
typicus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
across O O O O
its O O O O
distribution O O O O
range O O O O
should O O O O
be O O O O
done O O O O
with O O O O
caution O O O O
because O O O O
genetic O O O O
hybridization O O O O
may O O O O
occur O O O O
. O O O O
    
Fire O O O O
ant O O O O
decapitating O O O O
fly O O O O
cooperative O O O O
release O O O O
programs O O O O
( O O O O
1994 O O O O
- O O O O
2008 O O O O
) O O O O
: O O O O
two O O O O
Pseudacteon O O O O
species O O O O
, O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tricuspis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
curvatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
rapidly O O O O
expand O O O O
across O O O O
imported O O O O
fire O O O O
ant O O O O
populations O O O O
in O O O O
the O O O O
southeastern O O O O
United O O O O
States O O O O
. O O O O
    
Natural O O O O
enemies O O O O
of O O O O
the O O O O
imported O O O O
fire O O O O
ants O O O O
, O O O O
Solenopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
invicta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Buren O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
richteri O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Forel O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Hymenoptera O O O O
: O O O O
Formicidae O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
their O O O O
hybrid O O O O
, O O O O
include O O O O
a O O O O
suite O O O O
of O O O O
more O O O O
than O O O O
20 O O O O
fire O O O O
ant O O O O
decapitating O O O O
phorid O O O O
flies O O O O
from O O O O
South O O O O
America O O O O
in O O O O
the O O O O
genus O O O O
Pseudacteon O O O O
. O O O O
    
Over O O O O
the O O O O
past O O O O
12 O O O O
years O O O O
, O O O O
many O O O O
researchers O O O O
and O O O O
associates O O O O
have O O O O
cooperated O O O O
in O O O O
introducing O O O O
several O O O O
species O O O O
as O O O O
classical O O O O
or O O O O
self O O O O
- O O O O
sustaining O O O O
biological O O O O
control O O O O
agents O O O O
in O O O O
the O O O O
United O O O O
States O O O O
. O O O O
    
As O O O O
a O O O O
result O O O O
, O O O O
two O O O O
species O O O O
of O O O O
flies O O O O
, O O O O
Pseudacteon B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tricuspis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Borgmeier O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
curvatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Borgmeier O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Diptera O O O O
: O O O O
Phoridae O O O O
) O O O O
, O O O O
are O O O O
well O O O O
established O O O O
across O O O O
large O O O O
areas O O O O
of O O O O
the O O O O
southeastern O O O O
United O O O O
States O O O O
. O O O O
    
Whereas O O O O
many O O O O
researchers O O O O
have O O O O
published O O O O
local O O O O
and O O O O
state O O O O
information O O O O
about O O O O
the O O O O
establishment O O O O
and O O O O
spread O O O O
of O O O O
these O O O O
flies O O O O
, O O O O
here O O O O
distribution O O O O
data O O O O
from O O O O
both O O O O
published O O O O
and O O O O
unpublished O O O O
sources O O O O
has O O O O
been O O O O
compiled O O O O
for O O O O
the O O O O
entire O O O O
United O O O O
States O O O O
with O O O O
the O O O O
goal O O O O
of O O O O
presenting O O O O
confirmed O O O O
and O O O O
probable O O O O
distributions O O O O
as O O O O
of O O O O
the O O O O
fall O O O O
of O O O O
2008 O O O O
. O O O O
    
Documented O O O O
rates O O O O
of O O O O
expansion O O O O
were O O O O
also O O O O
used O O O O
to O O O O
predict O O O O
the O O O O
distribution O O O O
of O O O O
these O O O O
flies O O O O
three O O O O
years O O O O
later O O O O
in O O O O
the O O O O
fall O O O O
of O O O O
2011 O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
fall O O O O
of O O O O
2008 O O O O
, O O O O
eleven O O O O
years O O O O
after O O O O
the O O O O
first O O O O
successful O O O O
release O O O O
, O O O O
we O O O O
estimate O O O O
that O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tricuspis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
covered O O O O
about O O O O
50 O O O O
% O O O O
of O O O O
the O O O O
fire O O O O
ant O O O O
quarantined O O O O
area O O O O
and O O O O
that O O O O
it O O O O
will O O O O
occur O O O O
in O O O O
almost O O O O
65 O O O O
% O O O O
of O O O O
the O O O O
quarantine O O O O
area O O O O
by O O O O
2011 O O O O
. O O O O
    
Complete O O O O
coverage O O O O
of O O O O
the O O O O
fire O O O O
ant O O O O
quarantined O O O O
area O O O O
will O O O O
be O O O O
delayed O O O O
or O O O O
limited O O O O
by O O O O
this O O O O
species O O O O
' O O O O
slow O O O O
rate O O O O
of O O O O
spread O O O O
and O O O O
frequent O O O O
failure O O O O
to O O O O
establish O O O O
in O O O O
more O O O O
northerly O O O O
portions O O O O
of O O O O
the O O O O
fire O O O O
ant O O O O
range O O O O
and O O O O
also O O O O
, O O O O
perhaps O O O O
, O O O O
by O O O O
its O O O O
preference O O O O
for O O O O
red B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
imported O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fire O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ants O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
invicta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
. O O O O
    
Eight O O O O
years O O O O
after O O O O
the O O O O
first O O O O
successful O O O O
release O O O O
of O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
curvatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
two O O O O
biotypes O O O O
of O O O O
this O O O O
species O O O O
( O O O O
one O O O O
biotype O O O O
occurring O O O O
predominantly O O O O
in O O O O
the O O O O
black B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
hybrid O O O O
imported O O O O
fire O O O O
ants O O O O
and O O O O
the O O O O
other O O O O
occurring O O O O
in O O O O
red B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
imported O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fire O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ants O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
covered O O O O
almost O O O O
60 O O O O
% O O O O
of O O O O
the O O O O
fire O O O O
ant O O O O
quarantined O O O O
area O O O O
. O O O O
    
We O O O O
estimate O O O O
these O O O O
two O O O O
biotypes O O O O
will O O O O
cover O O O O
almost O O O O
90 O O O O
% O O O O
of O O O O
the O O O O
quarantine O O O O
area O O O O
by O O O O
2011 O O O O
and O O O O
100 O O O O
% O O O O
by O O O O
2012 O O O O
or O O O O
2013 O O O O
. O O O O
    
Strategic O O O O
selection O O O O
of O O O O
several O O O O
distributional O O O O
gaps O O O O
for O O O O
future O O O O
releases O O O O
will O O O O
accelerate O O O O
complete O O O O
coverage O O O O
of O O O O
quarantine O O O O
areas O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
some O O O O
gaps O O O O
may O O O O
be O O O O
best O O O O
used O O O O
for O O O O
the O O O O
release O O O O
of O O O O
additional O O O O
species O O O O
of O O O O
decapitating O O O O
flies O O O O
because O O O O
establishment O O O O
rates O O O O
may O O O O
be O O O O
higher O O O O
in O O O O
areas O O O O
without O O O O
competing O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Factors O O O O
of O O O O
susceptibility O O O O
of O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
myiasis O O O O
caused O O O O
by O O O O
the O O O O
New B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
World O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
screw O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
worm O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Cochliomyia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
hominivorax O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
Sao O O O O
Gonsigmaalo O O O O
, O O O O
Rio O O O O
de O O O O
Janeiro O O O O
, O O O O
Brazil O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
was O O O O
carried O O O O
out O O O O
between O O O O
July O O O O
2007 O O O O
and O O O O
June O O O O
2008 O O O O
and O O O O
reports O O O O
on O O O O
the O O O O
occurrence O O O O
of O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
myiasis O O O O
caused O O O O
by O O O O
the O O O O
New O O O O
World O O O O
screwworm O O O O
, O O O O
Cochliomyia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
hominivorax O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Coquerel O O O O
) O O O O
( O O O O
Diptera O O O O
: O O O O
Calliphoridae O O O O
) O O O O
in O O O O
Sao O O O O
Gonsigmaalo O O O O
in O O O O
the O O O O
state O O O O
of O O O O
Rio O O O O
de O O O O
Janeiro O O O O
, O O O O
Brazil O O O O
. O O O O
    
Liquid O O O O
or O O O O
solid O O O O
vaseline O O O O
was O O O O
used O O O O
to O O O O
suffocate O O O O
the O O O O
larvae O O O O
, O O O O
which O O O O
were O O O O
then O O O O
preserved O O O O
in O O O O
70 O O O O
% O O O O
ethanol O O O O
and O O O O
sent O O O O
to O O O O
the O O O O
Instituto O O O O
Oswaldo O O O O
Cruz O O O O
for O O O O
identification O O O O
. O O O O
    
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
hominivorax O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
were O O O O
identified O O O O
in O O O O
all O O O O
22 O O O O
cases O O O O
of O O O O
myiasis O O O O
. O O O O
    
There O O O O
were O O O O
12 O O O O
male O O O O
and O O O O
10 O O O O
female O O O O
patients O O O O
with O O O O
ages O O O O
ranging O O O O
from O O O O
03 O O O O
to O O O O
71 O O O O
. O O O O
    
Ethnically O O O O
the O O O O
highest O O O O
incidence O O O O
was O O O O
among O O O O
black O O O O
people O O O O
, O O O O
with O O O O
17 O O O O
cases O O O O
. O O O O
    
Open O O O O
wounds O O O O
were O O O O
the O O O O
main O O O O
cause O O O O
of O O O O
the O O O O
parasitosis O O O O
, O O O O
whereas O O O O
poor O O O O
personal O O O O
hygiene O O O O
, O O O O
the O O O O
low O O O O
educational O O O O
level O O O O
, O O O O
alcoholism O O O O
, O O O O
bedridden O O O O
patients O O O O
, O O O O
and O O O O
physical O O O O
or O O O O
mental O O O O
disability O O O O
were O O O O
possibly O O O O
secondary O O O O
factors O O O O
; O O O O
in O O O O
addition O O O O
to O O O O
all O O O O
these O O O O
factors O O O O
the O O O O
income O O O O
of O O O O
the O O O O
patients O O O O
was O O O O
very O O O O
low O O O O
. O O O O
    
Assessment O O O O
of O O O O
attractiveness O O O O
of O O O O
cassava B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
as O O O O
a O O O O
roosting O O O O
plant O O O O
for O O O O
the O O O O
melon B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fly O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Bactrocera B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cucurbitae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
the O O O O
Oriental B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fruit O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fly O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
dorsalis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Application O O O O
of O O O O
bait O O O O
spray O O O O
to O O O O
crop O O O O
borders O O O O
is O O O O
a O O O O
standard O O O O
approach O O O O
for O O O O
suppression O O O O
of O O O O
melon B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fly O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Bactrocera B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cucurbitae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Coquillett O O O O
) O O O O
( O O O O
Diptera O O O O
: O O O O
Tephritidae O O O O
) O O O O
populations O O O O
and O O O O
may O O O O
also O O O O
be O O O O
of O O O O
value O O O O
for O O O O
suppression O O O O
of O O O O
oriental B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fruit O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fly O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
dorsalis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Hendel O O O O
) O O O O
populations O O O O
. O O O O
    
Establishment O O O O
of O O O O
preferred O O O O
roosting O O O O
hosts O O O O
as O O O O
crop O O O O
borders O O O O
may O O O O
help O O O O
to O O O O
improve O O O O
suppression O O O O
of O O O O
both O O O O
fruit O O O O
fly O O O O
species O O O O
by O O O O
providing O O O O
sites O O O O
for O O O O
bait O O O O
spray O O O O
applications O O O O
. O O O O
    
In O O O O
an O O O O
area O O O O
- O O O O
wide O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cucurbitae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
suppression O O O O
trial O O O O
, O O O O
the O O O O
question O O O O
was O O O O
raised O O O O
as O O O O
to O O O O
whether O O O O
cassava B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
Manihot B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
esculenta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Crantz O O O O
( O O O O
Euphorbiales O O O O
: O O O O
Euphorbiaceae O O O O
) O O O O
, O O O O
could O O O O
be O O O O
used O O O O
as O O O O
a O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cucurbitae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
roosting O O O O
host O O O O
. O O O O
    
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
esculenta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
of O O O O
interest O O O O
as O O O O
a O O O O
roosting O O O O
host O O O O
because O O O O
, O O O O
in O O O O
contrast O O O O
to O O O O
many O O O O
other O O O O
identified O O O O
preferred O O O O
roosting O O O O
hosts O O O O
, O O O O
it O O O O
would O O O O
also O O O O
be O O O O
a O O O O
crop O O O O
potentially O O O O
increasing O O O O
the O O O O
productivity O O O O
of O O O O
the O O O O
crop O O O O
production O O O O
system O O O O
overall O O O O
. O O O O
    
As O O O O
a O O O O
short O O O O
- O O O O
lived O O O O
and O O O O
shrubby O O O O
perennial O O O O
, O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
esculenta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
potentially O O O O
constitutes O O O O
a O O O O
crop O O O O
with O O O O
more O O O O
persistent O O O O
roosting O O O O
foliage O O O O
than O O O O
an O O O O
annual O O O O
crop O O O O
such O O O O
as O O O O
corn B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
Zea B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mays O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
L O O O O
. O O O O
    
( O O O O
Cyperales O O O O
: O O O O
Poaceae O O O O
) O O O O
, O O O O
that O O O O
has O O O O
often O O O O
been O O O O
planted O O O O
as O O O O
a O O O O
roosting O O O O
host O O O O
for O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cucurbitae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
control O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
protein O O O O
- O O O O
baited O O O O
traps O O O O
set O O O O
amidst O O O O
potted O O O O
plants O O O O
placed O O O O
adjacent O O O O
to O O O O
a O O O O
papaya B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
Carica B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
papaya O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
L O O O O
. O O O O
    
( O O O O
Violales O O O O
: O O O O
Caricaceae O O O O
) O O O O
orchard O O O O
known O O O O
to O O O O
have O O O O
established O O O O
populations O O O O
of O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cucurbitae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
dorsalis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
the O O O O
effectiveness O O O O
of O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
esculenta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
as O O O O
a O O O O
roosting O O O O
host O O O O
was O O O O
assessed O O O O
by O O O O
comparing O O O O
its O O O O
attractiveness O O O O
to O O O O
that O O O O
of O O O O
castor B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bean O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Ricinus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
communis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
L O O O O
( O O O O
Malpighiales O O O O
: O O O O
Euphorbiaceae O O O O
) O O O O
, O O O O
previously O O O O
identified O O O O
as O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
most O O O O
attractive O O O O
roosting O O O O
hosts O O O O
for O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cucurbitae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
to O O O O
corn B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
a O O O O
crop O O O O
which O O O O
has O O O O
been O O O O
planted O O O O
as O O O O
a O O O O
roosting O O O O
host O O O O
for O O O O
help O O O O
in O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cucurbitae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
control O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
showed O O O O
that O O O O
use O O O O
of O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
esculenta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
as O O O O
a O O O O
roosting O O O O
host O O O O
is O O O O
comparable O O O O
to O O O O
use O O O O
of O O O O
R B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
communis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
by O O O O
both O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cucurbitae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
dorsalis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
provide O O O O
encouragement O O O O
to O O O O
incorporate O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
esculenta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
on O O O O
a O O O O
farm O O O O
as O O O O
a O O O O
trap O O O O
crop O O O O
( O O O O
i O O O O
. O O O O
e O O O O
. O O O O
site O O O O
for O O O O
bait O O O O
spray O O O O
application O O O O
) O O O O
. O O O O
    
This O O O O
has O O O O
the O O O O
advantage O O O O
of O O O O
having O O O O
the O O O O
trap O O O O
crop O O O O
be O O O O
a O O O O
crop O O O O
on O O O O
its O O O O
own O O O O
( O O O O
as O O O O
opposed O O O O
to O O O O
castor B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bean O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
and O O O O
, O O O O
among O O O O
prospective O O O O
crops O O O O
that O O O O
could O O O O
be O O O O
used O O O O
as O O O O
a O O O O
trap O O O O
crop O O O O
, O O O O
has O O O O
foliage O O O O
more O O O O
persistent O O O O
than O O O O
an O O O O
annual O O O O
trap O O O O
crop O O O O
such O O O O
as O O O O
corn B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
A O O O O
comparison O O O O
of O O O O
the O O O O
pitfall O O O O
trap O O O O
, O O O O
Winkler O O O O
extractor O O O O
and O O O O
Berlese O O O O
funnel O O O O
for O O O O
sampling O O O O
ground O O O O
- O O O O
dwelling O O O O
arthropods O O O O
in O O O O
tropical O O O O
montane O O O O
cloud O O O O
forests O O O O
. O O O O
    
Little O O O O
is O O O O
known O O O O
about O O O O
the O O O O
ground O O O O
- O O O O
dwelling O O O O
arthropod O O O O
diversity O O O O
in O O O O
tropical O O O O
montane O O O O
cloud O O O O
forests O O O O
( O O O O
TMCF O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Due O O O O
to O O O O
unique O O O O
habitat O O O O
conditions O O O O
in O O O O
TMCFs O O O O
with O O O O
continuously O O O O
wet O O O O
substrates O O O O
and O O O O
a O O O O
waterlogged O O O O
forest O O O O
floor O O O O
along O O O O
with O O O O
the O O O O
innate O O O O
biases O O O O
of O O O O
the O O O O
pitfall O O O O
trap O O O O
, O O O O
Berlese O O O O
funnel O O O O
and O O O O
Winkler O O O O
extractor O O O O
are O O O O
certain O O O O
to O O O O
make O O O O
it O O O O
difficult O O O O
to O O O O
choose O O O O
the O O O O
most O O O O
appropriate O O O O
method O O O O
to O O O O
sample O O O O
the O O O O
ground O O O O
- O O O O
dwelling O O O O
arthropods O O O O
in O O O O
TMCFs O O O O
. O O O O
    
Among O O O O
the O O O O
three O O O O
methods O O O O
, O O O O
the O O O O
Winkler O O O O
extractor O O O O
was O O O O
the O O O O
most O O O O
efficient O O O O
method O O O O
for O O O O
quantitative O O O O
data O O O O
and O O O O
pitfall O O O O
trapping O O O O
for O O O O
qualitative O O O O
data O O O O
for O O O O
most O O O O
groups O O O O
. O O O O
    
Inclusion O O O O
of O O O O
floatation O O O O
method O O O O
as O O O O
a O O O O
complementary O O O O
method O O O O
along O O O O
with O O O O
the O O O O
Winkler O O O O
extractor O O O O
would O O O O
enable O O O O
a O O O O
comprehensive O O O O
quantitative O O O O
survey O O O O
of O O O O
ground O O O O
- O O O O
dwelling O O O O
arthropods O O O O
. O O O O
    
Pitfall O O O O
trapping O O O O
is O O O O
essential O O O O
for O O O O
both O O O O
quantitative O O O O
and O O O O
qualitative O O O O
sampling O O O O
of O O O O
Diplopoda O O O O
, O O O O
Opiliones O O O O
, O O O O
Orthoptera O O O O
, O O O O
and O O O O
Diptera O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Winkler O O O O
extractor O O O O
was O O O O
the O O O O
best O O O O
quantitative O O O O
method O O O O
for O O O O
Psocoptera O O O O
, O O O O
Araneae O O O O
, O O O O
Isopoda O O O O
, O O O O
and O O O O
Formicidae O O O O
; O O O O
and O O O O
the O O O O
Berlese O O O O
funnel O O O O
was O O O O
best O O O O
for O O O O
Collembola O O O O
and O O O O
Chilopoda O O O O
. O O O O
    
For O O O O
larval O O O O
forms O O O O
of O O O O
different O O O O
insect O O O O
orders O O O O
and O O O O
the O O O O
Acari O O O O
, O O O O
all O O O O
the O O O O
three O O O O
methods O O O O
were O O O O
equally O O O O
effective O O O O
. O O O O
    
The O O O O
organization O O O O
of O O O O
foraging O O O O
in O O O O
the O O O O
fire O O O O
ant O O O O
, O O O O
Solenopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
invicta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Although O O O O
natural O O O O
selection O O O O
in O O O O
ants O O O O
acts O O O O
most O O O O
strongly O O O O
at O O O O
the O O O O
colony O O O O
, O O O O
or O O O O
superorganismal O O O O
level O O O O
, O O O O
foraging O O O O
patterns O O O O
have O O O O
rarely O O O O
been O O O O
studied O O O O
at O O O O
that O O O O
level O O O O
, O O O O
focusing O O O O
instead O O O O
on O O O O
the O O O O
behavior O O O O
of O O O O
individual O O O O
foragers O O O O
or O O O O
groups O O O O
of O O O O
foragers O O O O
. O O O O
    
The O O O O
experiments O O O O
and O O O O
observations O O O O
in O O O O
this O O O O
paper O O O O
reveal O O O O
in O O O O
broad O O O O
strokes O O O O
how O O O O
colonies O O O O
of O O O O
the O O O O
fire O O O O
ant O O O O
, O O O O
Solenopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
invicta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Buren O O O O
( O O O O
Hymenoptera B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
: O O O O
Formicidae O O O O
) O O O O
, O O O O
allocate O O O O
their O O O O
available O O O O
labor O O O O
to O O O O
foraging O O O O
, O O O O
how O O O O
they O O O O
disperse O O O O
that O O O O
force O O O O
within O O O O
their O O O O
territory O O O O
, O O O O
and O O O O
how O O O O
this O O O O
force O O O O
changes O O O O
with O O O O
colony O O O O
size O O O O
, O O O O
season O O O O
and O O O O
worker O O O O
age O O O O
. O O O O
    
Territory O O O O
area O O O O
is O O O O
positively O O O O
related O O O O
to O O O O
colony O O O O
size O O O O
and O O O O
the O O O O
number O O O O
of O O O O
foragers O O O O
, O O O O
more O O O O
so O O O O
during O O O O
the O O O O
spring O O O O
than O O O O
fall O O O O
. O O O O
    
Changes O O O O
of O O O O
colony O O O O
size O O O O
and O O O O
territory O O O O
area O O O O
are O O O O
driven O O O O
by O O O O
seasonal O O O O
variation O O O O
of O O O O
sexual O O O O
and O O O O
worker O O O O
production O O O O
, O O O O
which O O O O
in O O O O
turn O O O O
drive O O O O
seasonal O O O O
variation O O O O
of O O O O
worker O O O O
age O O O O
- O O O O
distribution O O O O
. O O O O
    
During O O O O
spring O O O O
sexual O O O O
production O O O O
, O O O O
colonies O O O O
shrink O O O O
because O O O O
worker O O O O
production O O O O
falls O O O O
below O O O O
replacement O O O O
. O O O O
    
This O O O O
loss O O O O
is O O O O
proportional O O O O
to O O O O
colony O O O O
size O O O O
, O O O O
causing O O O O
forager O O O O
density O O O O
in O O O O
the O O O O
spring O O O O
to O O O O
be O O O O
negatively O O O O
related O O O O
to O O O O
colony O O O O
and O O O O
territory O O O O
size O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
fall O O O O
, O O O O
colonies O O O O
emphasize O O O O
worker O O O O
production O O O O
, O O O O
bringing O O O O
colony O O O O
size O O O O
back O O O O
up O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
because O O O O
smaller O O O O
colonies O O O O
curtailed O O O O
spring O O O O
worker O O O O
production O O O O
less O O O O
than O O O O
larger O O O O
ones O O O O
, O O O O
their O O O O
fall O O O O
forager O O O O
populations O O O O
are O O O O
proportionally O O O O
greater O O O O
, O O O O
causing O O O O
them O O O O
to O O O O
gain O O O O
territory O O O O
at O O O O
the O O O O
expense O O O O
of O O O O
large O O O O
colonies O O O O
. O O O O
    
Much O O O O
variation O O O O
of O O O O
territory O O O O
area O O O O
remains O O O O
unexplained O O O O
and O O O O
can O O O O
probably O O O O
be O O O O
attributed O O O O
to O O O O
pressure O O O O
from O O O O
neighboring O O O O
colonies O O O O
. O O O O
    
Boundaries O O O O
between O O O O
territories O O O O
are O O O O
characterized O O O O
by O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
no O O O O
ants O O O O
' O O O O
zones O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
mostly O O O O
devoid O O O O
of O O O O
fire O O O O
ants O O O O
. O O O O
    
The O O O O
forager O O O O
population O O O O
can O O O O
be O O O O
divided O O O O
into O O O O
a O O O O
younger O O O O
group O O O O
of O O O O
recruitable O O O O
workers O O O O
that O O O O
wait O O O O
for O O O O
scouts O O O O
to O O O O
activate O O O O
them O O O O
to O O O O
help O O O O
retrieve O O O O
large O O O O
food O O O O
finds O O O O
. O O O O
    
About O O O O
one O O O O
- O O O O
third O O O O
of O O O O
the O O O O
recruits O O O O
wait O O O O
near O O O O
openings O O O O
in O O O O
the O O O O
foraging O O O O
tunnels O O O O
that O O O O
underlie O O O O
the O O O O
entire O O O O
territory O O O O
, O O O O
while O O O O
two O O O O
- O O O O
thirds O O O O
wait O O O O
in O O O O
the O O O O
nest O O O O
. O O O O
    
Recruitment O O O O
to O O O O
food O O O O
is O O O O
initially O O O O
very O O O O
rapid O O O O
and O O O O
local O O O O
from O O O O
the O O O O
foraging O O O O
tunnels O O O O
, O O O O
while O O O O
sustained O O O O
recruitment O O O O
gradually O O O O
involves O O O O
the O O O O
recruits O O O O
waiting O O O O
in O O O O
the O O O O
nest O O O O
. O O O O
    
As O O O O
recruits O O O O
age O O O O
, O O O O
they O O O O
become O O O O
scouts O O O O
searching O O O O
for O O O O
food O O O O
on O O O O
the O O O O
surface O O O O
, O O O O
and O O O O
die O O O O
about O O O O
two O O O O
weeks O O O O
later O O O O
. O O O O
    
Foraging O O O O
tunnels O O O O
decrease O O O O
in O O O O
cross O O O O
- O O O O
sectional O O O O
area O O O O
with O O O O
distance O O O O
from O O O O
the O O O O
nest O O O O
, O O O O
in O O O O
keeping O O O O
with O O O O
the O O O O
gradual O O O O
bleeding O O O O
off O O O O
of O O O O
workers O O O O
to O O O O
the O O O O
surface O O O O
with O O O O
distance O O O O
. O O O O
    
Foragers O O O O
lack O O O O
route O O O O
- O O O O
faithfulness O O O O
, O O O O
and O O O O
having O O O O
been O O O O
marked O O O O
and O O O O
released O O O O
at O O O O
one O O O O
point O O O O
within O O O O
the O O O O
territory O O O O
, O O O O
they O O O O
can O O O O
be O O O O
recaptured O O O O
at O O O O
any O O O O
other O O O O
point O O O O
a O O O O
day O O O O
later O O O O
. O O O O
    
The O O O O
size O O O O
of O O O O
the O O O O
territory O O O O
actually O O O O
occupied O O O O
may O O O O
be O O O O
limited O O O O
during O O O O
dry O O O O
weather O O O O
, O O O O
resulting O O O O
in O O O O
very O O O O
large O O O O
no O O O O
- O O O O
ants O O O O
' O O O O
zones O O O O
. O O O O
    
Pollen O O O O
preference O O O O
for O O O O
Psychotria O O O O
sp O O O O
. O O O O
    
is O O O O
not O O O O
learned O O O O
in O O O O
the O O O O
passion O O O O
flower O O O O
butterfly O O O O
, O O O O
Heliconius B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
erato O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Heliconius O O O O
butterflies O O O O
are O O O O
known O O O O
to O O O O
maximize O O O O
fitness O O O O
by O O O O
feeding O O O O
on O O O O
pollen O O O O
from O O O O
Gurania O O O O
sp O O O O
. O O O O
and O O O O
Psiguria O O O O
sp O O O O
. O O O O
    
( O O O O
Cucurbitales O O O O
: O O O O
Curcurbitaceae O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
Psychotria O O O O
sp O O O O
. O O O O
    
( O O O O
Gentianales O O O O
: O O O O
Rubiaceae O O O O
) O O O O
. O O O O
    
This O O O O
specialization O O O O
involves O O O O
specific O O O O
physical O O O O
, O O O O
physiological O O O O
, O O O O
and O O O O
behavioral O O O O
adaptations O O O O
including O O O O
efficient O O O O
search O O O O
strategies O O O O
in O O O O
the O O O O
forest O O O O
to O O O O
locate O O O O
pollen O O O O
host O O O O
plants O O O O
, O O O O
pollen O O O O
removal O O O O
, O O O O
and O O O O
pollen O O O O
external O O O O
digestion O O O O
. O O O O
    
Reducing O O O O
pollen O O O O
host O O O O
plant O O O O
search O O O O
time O O O O
is O O O O
crucial O O O O
to O O O O
out O O O O
- O O O O
compete O O O O
other O O O O
flower O O O O
visitors O O O O
and O O O O
to O O O O
reduce O O O O
exposure O O O O
to O O O O
predators O O O O
. O O O O
    
One O O O O
way O O O O
in O O O O
which O O O O
this O O O O
can O O O O
be O O O O
achieved O O O O
is O O O O
by O O O O
using O O O O
chemical O O O O
cues O O O O
to O O O O
learn O O O O
from O O O O
experienced O O O O
foragers O O O O
in O O O O
roosting O O O O
aggregations O O O O
. O O O O
    
Similar O O O O
strategies O O O O
have O O O O
been O O O O
documented O O O O
in O O O O
bumblebees O O O O
, O O O O
where O O O O
inexperienced O O O O
individuals O O O O
learn O O O O
floral O O O O
odors O O O O
from O O O O
experienced O O O O
foragers O O O O
. O O O O
    
Behavioral O O O O
experiments O O O O
using O O O O
plants O O O O
preferred O O O O
by O O O O
Heliconius B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
erato O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
suggest O O O O
that O O O O
pollen O O O O
preference O O O O
in O O O O
H B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
erato O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
an O O O O
innate O O O O
trait O O O O
and O O O O
consequently O O O O
learning O O O O
of O O O O
chemical O O O O
cues O O O O
at O O O O
roosting O O O O
aggregations O O O O
is O O O O
unlikely O O O O
. O O O O
    
Description O O O O
of O O O O
the O O O O
immatures O O O O
of O O O O
the O O O O
ant O O O O
, O O O O
Myrmelachista O O O O
catharinae O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Neotropical O O O O
ant O O O O
genus O O O O
Myrmelachista O O O O
Roger O O O O
comprises O O O O
69 O O O O
described O O O O
species O O O O
and O O O O
subspecies O O O O
, O O O O
and O O O O
still O O O O
is O O O O
a O O O O
poorly O O O O
studied O O O O
group O O O O
. O O O O
    
Larvae O O O O
play O O O O
a O O O O
paramount O O O O
role O O O O
in O O O O
colony O O O O
nutrition O O O O
in O O O O
social O O O O
hymenopterans O O O O
and O O O O
bear O O O O
considerable O O O O
value O O O O
in O O O O
the O O O O
reconstruction O O O O
of O O O O
group O O O O
phylogenies O O O O
, O O O O
however O O O O
, O O O O
they O O O O
are O O O O
generally O O O O
neglected O O O O
. O O O O
    
Larvae O O O O
of O O O O
different O O O O
instars O O O O
of O O O O
Myrmelachista O O O O
catharinae O O O O
Mayr O O O O
( O O O O
Hymenoptera O O O O
: O O O O
Formicidae O O O O
) O O O O
are O O O O
herein O O O O
described O O O O
in O O O O
detail O O O O
by O O O O
light O O O O
and O O O O
scanning O O O O
electron O O O O
microscopy O O O O
. O O O O
    
The O O O O
number O O O O
of O O O O
larval O O O O
instars O O O O
was O O O O
estimated O O O O
as O O O O
three O O O O
based O O O O
on O O O O
the O O O O
frequency O O O O
distribution O O O O
of O O O O
maximum O O O O
head O O O O
capsule O O O O
widths O O O O
. O O O O
    
The O O O O
described O O O O
larvae O O O O
confirmed O O O O
some O O O O
traits O O O O
typical O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
: O O O O
general O O O O
shape O O O O
of O O O O
body O O O O
and O O O O
mandibles O O O O
, O O O O
general O O O O
aspect O O O O
and O O O O
distribution O O O O
of O O O O
body O O O O
hairs O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
number O O O O
of O O O O
sensilla O O O O
on O O O O
the O O O O
palps O O O O
and O O O O
galea O O O O
. O O O O
    
Differently O O O O
from O O O O
other O O O O
Myrmelachista O O O O
larvae O O O O
previously O O O O
described O O O O
, O O O O
M O O O O
. O O O O
catharinae O O O O
presented O O O O
two O O O O
distinct O O O O
kinds O O O O
of O O O O
second O O O O
instars O O O O
, O O O O
some O O O O
additional O O O O
types O O O O
of O O O O
body O O O O
hairs O O O O
, O O O O
different O O O O
number O O O O
of O O O O
antennal O O O O
sensilla O O O O
, O O O O
and O O O O
a O O O O
distinct O O O O
labrum O O O O
shape O O O O
. O O O O
    
M O O O O
. O O O O
catharinae O O O O
presented O O O O
ten O O O O
pairs O O O O
of O O O O
spiracles O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
the O O O O
first O O O O
record O O O O
for O O O O
this O O O O
genus O O O O
. O O O O
    
Morphological O O O O
redescriptions O O O O
of O O O O
four O O O O
marine O O O O
ciliates O O O O
( O O O O
Ciliophora O O O O
: O O O O
Cyrtophorida O O O O
: O O O O
Dysteriidae O O O O
) O O O O
from O O O O
Qingdao O O O O
, O O O O
China O O O O
. O O O O
    
The O O O O
morphology O O O O
and O O O O
infraciliature O O O O
of O O O O
four O O O O
marine O O O O
cyrtophorid O O O O
ciliates O O O O
isolated O O O O
from O O O O
Qingdao O O O O
, O O O O
China O O O O
, O O O O
were O O O O
investigated O O O O
. O O O O
    
Based O O O O
on O O O O
the O O O O
present O O O O
work O O O O
and O O O O
on O O O O
previous O O O O
data O O O O
, O O O O
improved O O O O
diagnoses O O O O
for O O O O
three O O O O
rarely O O O O
known O O O O
species O O O O
are O O O O
provided O O O O
: O O O O
( O O O O
1 O O O O
) O O O O
Mirodysteria O O O O
decora O O O O
; O O O O
small O O O O
- O O O O
sized O O O O
marine O O O O
Mirodysteria O O O O
about O O O O
35 O O O O
- O O O O
60 O O O O
x O O O O
25 O O O O
- O O O O
35 O O O O
mum O O O O
in O O O O
vivo O O O O
, O O O O
oval O O O O
in O O O O
outline O O O O
; O O O O
body O O O O
surface O O O O
with O O O O
two O O O O
or O O O O
three O O O O
conspicuous O O O O
dorsal O O O O
spines O O O O
and O O O O
one O O O O
caudal O O O O
spine O O O O
; O O O O
three O O O O
right O O O O
kineties O O O O
, O O O O
the O O O O
rightmost O O O O
one O O O O
extending O O O O
dorso O O O O
- O O O O
apically O O O O
; O O O O
left O O O O
frontal O O O O
kineties O O O O
reduced O O O O
, O O O O
each O O O O
consisting O O O O
of O O O O
three O O O O
basal O O O O
bodies O O O O
only O O O O
; O O O O
podite O O O O
subcaudally O O O O
positioned O O O O
; O O O O
two O O O O
ventrally O O O O
located O O O O
contractile O O O O
vacuoles O O O O
. O O O O
    
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
Dysteria O O O O
legumen O O O O
; O O O O
body O O O O
oval O O O O
with O O O O
two O O O O
longitudinal O O O O
grooves O O O O
on O O O O
different O O O O
plates O O O O
; O O O O
six O O O O
right O O O O
kineties O O O O
, O O O O
the O O O O
rightmost O O O O
two O O O O
of O O O O
which O O O O
extend O O O O
dorso O O O O
- O O O O
apically O O O O
; O O O O
two O O O O
left O O O O
frontal O O O O
kineties O O O O
and O O O O
two O O O O
ventrally O O O O
located O O O O
contractile O O O O
vacuoles O O O O
. O O O O
    
( O O O O
3 O O O O
) O O O O
Dysteria O O O O
proraefrons O O O O
; O O O O
body O O O O
about O O O O
60x35 O O O O
mum O O O O
in O O O O
vivo O O O O
; O O O O
six O O O O
right O O O O
kineties O O O O
, O O O O
the O O O O
two O O O O
rightmost O O O O
of O O O O
which O O O O
extend O O O O
dorso O O O O
- O O O O
apically O O O O
and O O O O
the O O O O
leftmost O O O O
one O O O O
is O O O O
considerably O O O O
shortened O O O O
; O O O O
three O O O O
left O O O O
frontal O O O O
kineties O O O O
; O O O O
two O O O O
ventrally O O O O
located O O O O
contractile O O O O
vacuoles O O O O
. O O O O
    
A O O O O
population O O O O
of O O O O
D B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
derouxi O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
with O O O O
eight O O O O
or O O O O
nine O O O O
right O O O O
kineties O O O O
is O O O O
also O O O O
briefly O O O O
described O O O O
. O O O O
    
The O O O O
current O O O O
investigation O O O O
further O O O O
demonstrates O O O O
high O O O O
diversity O O O O
and O O O O
cosmopolitan O O O O
distribution O O O O
of O O O O
this O O O O
highly O O O O
specialized O O O O
group O O O O
of O O O O
benthic O O O O
ciliates O O O O
. O O O O
    
Morphological O O O O
and O O O O
molecular O O O O
information O O O O
of O O O O
a O O O O
new O O O O
species O O O O
of O O O O
Geleia O O O O
( O O O O
Ciliophora O O O O
, O O O O
Karyorelictea O O O O
) O O O O
, O O O O
with O O O O
redescriptions O O O O
of O O O O
two O O O O
Kentrophoros O O O O
species O O O O
from O O O O
China O O O O
. O O O O
    
The O O O O
morphology O O O O
and O O O O
infraciliature O O O O
of O O O O
three O O O O
karyorelictean O O O O
ciliates O O O O
, O O O O
Geleia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sinica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
spec O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
two O O O O
poorly O O O O
known O O O O
Kentrophoros O O O O
species O O O O
, O O O O
K B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
flavus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
K B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gracilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
isolated O O O O
from O O O O
the O O O O
intertidal O O O O
zone O O O O
of O O O O
a O O O O
beach O O O O
at O O O O
Qingdao O O O O
, O O O O
China O O O O
, O O O O
were O O O O
investigated O O O O
. O O O O
    
Geleia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sinica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
spec O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
    
is O O O O
distinguished O O O O
from O O O O
its O O O O
congeners O O O O
by O O O O
the O O O O
following O O O O
combination O O O O
of O O O O
characters O O O O
: O O O O
body O O O O
medium O O O O
- O O O O
sized O O O O
and O O O O
slender O O O O
- O O O O
cylindrical O O O O
; O O O O
with O O O O
a O O O O
conspicuous O O O O
prebuccal O O O O
fossa O O O O
; O O O O
28 O O O O
- O O O O
34 O O O O
somatic O O O O
kineties O O O O
; O O O O
about O O O O
40 O O O O
short O O O O
adoral O O O O
polykineties O O O O
; O O O O
intrabuccal O O O O
kinety O O O O
composed O O O O
of O O O O
25 O O O O
- O O O O
34 O O O O
dikinetids O O O O
; O O O O
paroral O O O O
kineties O O O O
composed O O O O
of O O O O
closely O O O O
spaced O O O O
dikinetids O O O O
. O O O O
    
The O O O O
comparison O O O O
with O O O O
similar O O O O
congeners O O O O
clearly O O O O
supports O O O O
the O O O O
validity O O O O
of O O O O
this O O O O
new O O O O
species O O O O
based O O O O
on O O O O
morphological O O O O
and O O O O
small O O O O
subunit O O O O
( O O O O
SSU O O O O
) O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
data O O O O
. O O O O
    
In O O O O
light O O O O
of O O O O
these O O O O
new O O O O
data O O O O
the O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
well O O O O
- O O O O
known O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
morphotype O O O O
, O O O O
Geleia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
simplex O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Faure O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Fremiet O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1951 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
is O O O O
redefined O O O O
. O O O O
    
Two O O O O
Kentrophoros O O O O
species O O O O
are O O O O
redescribed O O O O
and O O O O
improved O O O O
diagnoses O O O O
are O O O O
supplied O O O O
. O O O O
    
Kentrophoros B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
flavus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Raikov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Kovaleva O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1968 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
mainly O O O O
characterized O O O O
by O O O O
having O O O O
about O O O O
33 O O O O
macronuclei O O O O
and O O O O
12 O O O O
micronuclei O O O O
forming O O O O
a O O O O
row O O O O
that O O O O
extends O O O O
along O O O O
the O O O O
cell O O O O
meridian O O O O
, O O O O
and O O O O
12 O O O O
- O O O O
19 O O O O
ciliary O O O O
rows O O O O
on O O O O
the O O O O
right O O O O
side O O O O
of O O O O
the O O O O
cell O O O O
. O O O O
    
Kentrophoros B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
gracilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Raikov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1963 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
characterized O O O O
by O O O O
having O O O O
about O O O O
14 O O O O
macronuclei O O O O
, O O O O
13 O O O O
micronuclei O O O O
and O O O O
10 O O O O
- O O O O
13 O O O O
kineties O O O O
on O O O O
the O O O O
right O O O O
side O O O O
of O O O O
the O O O O
cell O O O O
. O O O O
    
Morphological O O O O
description O O O O
of O O O O
three O O O O
marine O O O O
ciliates O O O O
( O O O O
Ciliophora O O O O
, O O O O
Scuticociliatia O O O O
) O O O O
, O O O O
with O O O O
establishment O O O O
of O O O O
a O O O O
new O O O O
genus O O O O
and O O O O
two O O O O
new O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Three O O O O
marine O O O O
scuticociliates O O O O
, O O O O
Falcicyclidium O O O O
fangi O O O O
nov O O O O
. O O O O
gen O O O O
. O O O O
, O O O O
nov O O O O
. O O O O
spec O O O O
. O O O O
, O O O O
Falcicyclidium O O O O
atractodes O O O O
nov O O O O
. O O O O
spec O O O O
. O O O O
, O O O O
and O O O O
Cristigera O O O O
media O O O O
Kahl O O O O
, O O O O
1928 O O O O
were O O O O
investigated O O O O
using O O O O
live O O O O
observation O O O O
and O O O O
silver O O O O
impregnation O O O O
methods O O O O
. O O O O
    
The O O O O
genus O O O O
Falcicyclidium O O O O
is O O O O
distinguished O O O O
by O O O O
the O O O O
combination O O O O
of O O O O
: O O O O
( O O O O
i O O O O
) O O O O
dorsoventrally O O O O
flattened O O O O
body O O O O
, O O O O
( O O O O
ii O O O O
) O O O O
hook O O O O
- O O O O
like O O O O
( O O O O
falciform O O O O
) O O O O
paroral O O O O
membrane O O O O
, O O O O
( O O O O
iii O O O O
) O O O O
anterior O O O O
end O O O O
of O O O O
paroral O O O O
membrane O O O O
posterior O O O O
to O O O O
anterior O O O O
end O O O O
of O O O O
membranelle O O O O
1 O O O O
, O O O O
and O O O O
( O O O O
iv O O O O
) O O O O
multiple O O O O
caudal O O O O
cilia O O O O
. O O O O
    
Falcicyclidium O O O O
fangi O O O O
nov O O O O
. O O O O
spec O O O O
. O O O O
, O O O O
the O O O O
type O O O O
of O O O O
the O O O O
new O O O O
genus O O O O
, O O O O
can O O O O
be O O O O
recognized O O O O
by O O O O
the O O O O
combination O O O O
of O O O O
its O O O O
large O O O O
size O O O O
, O O O O
extremely O O O O
dorsoventrally O O O O
flattened O O O O
( O O O O
3 O O O O
: O O O O
1 O O O O
) O O O O
body O O O O
, O O O O
consistently O O O O
10 O O O O
somatic O O O O
kineties O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
broad O O O O
, O O O O
elongate O O O O
buccal O O O O
area O O O O
occupying O O O O
60 O O O O
% O O O O
of O O O O
the O O O O
body O O O O
length O O O O
. O O O O
    
Falcicyclidium O O O O
atractodes O O O O
nov O O O O
. O O O O
spec O O O O
. O O O O
    
is O O O O
mainly O O O O
characterized O O O O
by O O O O
a O O O O
unique O O O O
spine O O O O
projecting O O O O
from O O O O
both O O O O
the O O O O
anterior O O O O
and O O O O
posterior O O O O
end O O O O
. O O O O
    
The O O O O
uncommon O O O O
form O O O O
, O O O O
Cristigera O O O O
media O O O O
is O O O O
redescribed O O O O
based O O O O
on O O O O
the O O O O
population O O O O
from O O O O
Qingdao O O O O
, O O O O
the O O O O
statistic O O O O
data O O O O
and O O O O
additional O O O O
features O O O O
, O O O O
especially O O O O
the O O O O
morphology O O O O
of O O O O
the O O O O
living O O O O
cells O O O O
, O O O O
are O O O O
documented O O O O
. O O O O
    
Influence O O O O
of O O O O
helix O O O O
12 O O O O
of O O O O
Ultraspiracle O O O O
on O O O O
Drosophila B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
melanogaster O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ecdysone O O O O
receptor O O O O
function O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
it O O O O
has O O O O
no O O O O
ligand O O O O
, O O O O
helix O O O O
12 O O O O
in O O O O
the O O O O
ligand O O O O
binding O O O O
domain O O O O
of O O O O
Ultraspiracle O O O O
( O O O O
USP O O O O
) O O O O
is O O O O
locked O O O O
in O O O O
an O O O O
antagonistic O O O O
position O O O O
. O O O O
    
To O O O O
investigate O O O O
whether O O O O
this O O O O
position O O O O
is O O O O
of O O O O
functional O O O O
importance O O O O
, O O O O
we O O O O
enhanced O O O O
the O O O O
flexibility O O O O
of O O O O
helix O O O O
12 O O O O
by O O O O
mutating O O O O
two O O O O
amino O O O O
acids O O O O
( O O O O
259 O O O O
, O O O O
located O O O O
in O O O O
L1 O O O O
- O O O O
3 O O O O
and O O O O
F491 O O O O
in O O O O
helix O O O O
12 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Mutated O O O O
USP O O O O
reduces O O O O
the O O O O
stability O O O O
of O O O O
USP O O O O
and O O O O
all O O O O
isoforms O O O O
of O O O O
the O O O O
ecdysone O O O O
receptor O O O O
( O O O O
EcR O O O O
) O O O O
and O O O O
impairs O O O O
nuclear O O O O
localization O O O O
and O O O O
DNA O O O O
binding O O O O
of O O O O
EcR O O O O
/ O O O O
USP O O O O
( O O O O
L259A O O O O
/ O O O O
F491 O O O O
/ O O O O
A O O O O
) O O O O
, O O O O
resulting O O O O
in O O O O
lower O O O O
levels O O O O
of O O O O
basal O O O O
transcriptional O O O O
activity O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
the O O O O
affinity O O O O
of O O O O
the O O O O
ligand O O O O
ponasterone O O O O
A O O O O
to O O O O
EcR O O O O
/ O O O O
USP O O O O
( O O O O
L259 O O O O
/ O O O O
F491 O O O O
) O O O O
is O O O O
moderately O O O O
diminished O O O O
, O O O O
hormone O O O O
- O O O O
induced O O O O
stimulation O O O O
of O O O O
transcriptional O O O O
activity O O O O
is O O O O
normal O O O O
. O O O O
    
Potentiation O O O O
of O O O O
the O O O O
ecdysone O O O O
response O O O O
by O O O O
juvenile O O O O
hormone O O O O
( O O O O
JH O O O O
) O O O O
is O O O O
selectively O O O O
increased O O O O
in O O O O
mutated O O O O
heterodimers O O O O
with O O O O
EcR O O O O
- O O O O
B1 O O O O
, O O O O
demonstrating O O O O
that O O O O
the O O O O
antagonistic O O O O
position O O O O
impairs O O O O
functional O O O O
interaction O O O O
of O O O O
the O O O O
EcR O O O O
complex O O O O
with O O O O
JHIII O O O O
. O O O O
    
Physiological O O O O
and O O O O
molecular O O O O
evidence O O O O
that O O O O
environmental O O O O
changes O O O O
elicit O O O O
morphological O O O O
interconversion O O O O
in O O O O
the O O O O
model O O O O
diatom O O O O
Phaeodactylum B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tricornutum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Over O O O O
the O O O O
last O O O O
decades O O O O
Phaeodactylum B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tricornutum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
has O O O O
become O O O O
a O O O O
model O O O O
to O O O O
study O O O O
diatom O O O O
biology O O O O
at O O O O
the O O O O
molecular O O O O
level O O O O
. O O O O
    
Cells O O O O
have O O O O
the O O O O
peculiarity O O O O
to O O O O
be O O O O
pleiomorphic O O O O
and O O O O
it O O O O
is O O O O
thought O O O O
that O O O O
this O O O O
character O O O O
is O O O O
triggered O O O O
by O O O O
culture O O O O
conditions O O O O
, O O O O
although O O O O
few O O O O
quantitative O O O O
studies O O O O
have O O O O
been O O O O
performed O O O O
and O O O O
nothing O O O O
is O O O O
known O O O O
at O O O O
the O O O O
molecular O O O O
level O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
aim O O O O
was O O O O
to O O O O
quantify O O O O
the O O O O
effect O O O O
of O O O O
growth O O O O
conditions O O O O
on O O O O
cell O O O O
morphology O O O O
of O O O O
different O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tricornutum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strains O O O O
by O O O O
quantitative O O O O
microscopy O O O O
, O O O O
cellular O O O O
imaging O O O O
, O O O O
and O O O O
non O O O O
- O O O O
targeted O O O O
transcriptomics O O O O
. O O O O
    
We O O O O
show O O O O
that O O O O
morphotype O O O O
changes O O O O
can O O O O
be O O O O
regulated O O O O
by O O O O
changing O O O O
culture O O O O
conditions O O O O
, O O O O
depending O O O O
on O O O O
the O O O O
strain O O O O
, O O O O
and O O O O
show O O O O
a O O O O
common O O O O
trend O O O O
of O O O O
increased O O O O
oval O O O O
cell O O O O
abundance O O O O
as O O O O
a O O O O
response O O O O
to O O O O
stress O O O O
. O O O O
    
Examination O O O O
of O O O O
expressed O O O O
sequence O O O O
tags O O O O
( O O O O
ESTs O O O O
) O O O O
from O O O O
triradiate O O O O
cells O O O O
infers O O O O
the O O O O
importance O O O O
of O O O O
osmoregulation O O O O
in O O O O
the O O O O
maintenance O O O O
of O O O O
this O O O O
morphotype O O O O
, O O O O
whereas O O O O
ESTs O O O O
derived O O O O
from O O O O
oval O O O O
cells O O O O
grown O O O O
in O O O O
hyposaline O O O O
and O O O O
low O O O O
temperature O O O O
conditions O O O O
show O O O O
a O O O O
predominance O O O O
of O O O O
genes O O O O
encoding O O O O
typical O O O O
components O O O O
of O O O O
stress O O O O
pathways O O O O
, O O O O
especially O O O O
in O O O O
signaling O O O O
, O O O O
cell O O O O
homeostasis O O O O
and O O O O
lipid O O O O
metabolism O O O O
. O O O O
    
This O O O O
work O O O O
contributes O O O O
to O O O O
better O O O O
understand O O O O
the O O O O
importance O O O O
of O O O O
the O O O O
unique O O O O
capability O O O O
of O O O O
morphotype O O O O
conversion O O O O
in O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tricornutum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
its O O O O
relevance O O O O
in O O O O
acclimation O O O O
to O O O O
changing O O O O
environmental O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
Phr1p O O O O
, O O O O
a O O O O
glycosylphosphatidylinsitol O O O O
- O O O O
anchored O O O O
Beta O O O O
( O O O O
1 O O O O
, O O O O
3 O O O O
) O O O O
- O O O O
glucanosyltransferase O O O O
critical O O O O
for O O O O
hyphal O O O O
wall O O O O
formation O O O O
, O O O O
localizes O O O O
to O O O O
the O O O O
apical O O O O
growth O O O O
sites O O O O
and O O O O
septa O O O O
in O O O O
Candida B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Cell O O O O
wall O O O O
biogenesis O O O O
is O O O O
a O O O O
dynamic O O O O
process O O O O
relying O O O O
on O O O O
the O O O O
coordinated O O O O
activity O O O O
of O O O O
several O O O O
extracellular O O O O
enzymes O O O O
. O O O O
    
PHR1 O O O O
is O O O O
a O O O O
pH O O O O
- O O O O
regulated O O O O
gene O O O O
of O O O O
Candida B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
encoding O O O O
a O O O O
glycosylphosphatidylinositol O O O O
- O O O O
anchored O O O O
Beta O O O O
( O O O O
1 O O O O
, O O O O
3 O O O O
) O O O O
- O O O O
glucanosyltransferase O O O O
of O O O O
family O O O O
GH72 O O O O
which O O O O
acts O O O O
as O O O O
a O O O O
cell O O O O
wall O O O O
remodelling O O O O
enzyme O O O O
and O O O O
is O O O O
crucial O O O O
for O O O O
morphogenesis O O O O
and O O O O
virulence O O O O
. O O O O
    
In O O O O
order O O O O
to O O O O
explore O O O O
the O O O O
function O O O O
of O O O O
Phr1p O O O O
, O O O O
we O O O O
obtained O O O O
a O O O O
green O O O O
fluorescent O O O O
protein O O O O
( O O O O
GFP O O O O
) O O O O
fusion O O O O
to O O O O
determine O O O O
its O O O O
localization O O O O
. O O O O
    
During O O O O
induction O O O O
of O O O O
vegetative O O O O
growth O O O O
, O O O O
Phr1p O O O O
- O O O O
GFP O O O O
was O O O O
concentrated O O O O
in O O O O
the O O O O
plasma O O O O
membrane O O O O
of O O O O
the O O O O
growing O O O O
bud O O O O
, O O O O
in O O O O
the O O O O
mother O O O O
- O O O O
bud O O O O
neck O O O O
, O O O O
and O O O O
in O O O O
the O O O O
septum O O O O
. O O O O
    
Phr1p O O O O
- O O O O
GFP O O O O
was O O O O
recovered O O O O
in O O O O
the O O O O
detergent O O O O
- O O O O
resistant O O O O
membranes O O O O
indicating O O O O
its O O O O
association O O O O
with O O O O
the O O O O
lipid O O O O
rafts O O O O
as O O O O
the O O O O
wild O O O O
type O O O O
Phr1p O O O O
. O O O O
    
Upon O O O O
induction O O O O
of O O O O
hyphal O O O O
growth O O O O
, O O O O
Phr1p O O O O
- O O O O
GFP O O O O
highly O O O O
concentrated O O O O
at O O O O
the O O O O
apex O O O O
of O O O O
the O O O O
germ O O O O
tubes O O O O
and O O O O
progressively O O O O
distributed O O O O
along O O O O
the O O O O
lateral O O O O
sides O O O O
of O O O O
the O O O O
hyphae O O O O
. O O O O
    
Phr1p O O O O
- O O O O
GFP O O O O
also O O O O
labelled O O O O
the O O O O
hyphal O O O O
septa O O O O
, O O O O
where O O O O
it O O O O
colocalized O O O O
with O O O O
chitin O O O O
. O O O O
    
Localization O O O O
to O O O O
the O O O O
hyphal O O O O
septa O O O O
was O O O O
perturbed O O O O
in O O O O
nocodazole O O O O
- O O O O
treated O O O O
cells O O O O
, O O O O
whereas O O O O
inhibition O O O O
of O O O O
actin O O O O
polymerization O O O O
hindered O O O O
the O O O O
apical O O O O
localization O O O O
. O O O O
    
Electron O O O O
Microscopy O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
hyphal O O O O
wall O O O O
ultrastructure O O O O
of O O O O
a O O O O
PHR1 O O O O
 O O O O
mutant O O O O
showed O O O O
loss O O O O
of O O O O
compactness O O O O
and O O O O
irregular O O O O
organization O O O O
of O O O O
the O O O O
surface O O O O
layer O O O O
. O O O O
    
These O O O O
observations O O O O
indicate O O O O
that O O O O
Phr1p O O O O
plays O O O O
a O O O O
crucial O O O O
role O O O O
in O O O O
hyphal O O O O
wall O O O O
formation O O O O
, O O O O
a O O O O
highly O O O O
regulated O O O O
process O O O O
on O O O O
which O O O O
morphogenesis O O O O
and O O O O
virulence O O O O
rely O O O O
. O O O O
    
Dynamics O O O O
in O O O O
space O O O O
and O O O O
time O O O O
of O O O O
four O O O O
testate O O O O
amoebae O O O O
( O O O O
Difflugia O O O O
spp O O O O
. O O O O
) O O O O
co O O O O
- O O O O
existing O O O O
in O O O O
the O O O O
zooplankton O O O O
of O O O O
a O O O O
reservoir O O O O
in O O O O
southern O O O O
China O O O O
. O O O O
    
We O O O O
studied O O O O
a O O O O
long O O O O
time O O O O
series O O O O
of O O O O
the O O O O
dynamics O O O O
in O O O O
space O O O O
and O O O O
time O O O O
of O O O O
four O O O O
species O O O O
of O O O O
Difflugia O O O O
( O O O O
thecamoebae O O O O
) O O O O
that O O O O
co O O O O
- O O O O
exist O O O O
in O O O O
the O O O O
pelagic O O O O
plankton O O O O
of O O O O
Liuxihe O O O O
Reservoir O O O O
, O O O O
an O O O O
oligo O O O O
- O O O O
mesotrophic O O O O
impoundment O O O O
in O O O O
southern O O O O
China O O O O
, O O O O
during O O O O
8 O O O O
- O O O O
9 O O O O
months O O O O
( O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
summer O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
form O O O O
March O O O O
to O O O O
November O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
retreat O O O O
to O O O O
the O O O O
benthos O O O O
during O O O O
the O O O O
rest O O O O
of O O O O
the O O O O
year O O O O
( O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
winter O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
) O O O O
. O O O O
    
We O O O O
discuss O O O O
the O O O O
reasons O O O O
for O O O O
the O O O O
winter O O O O
retreat O O O O
, O O O O
and O O O O
suggest O O O O
that O O O O
predator O O O O
evasion O O O O
may O O O O
be O O O O
involved O O O O
, O O O O
although O O O O
temperature O O O O
- O O O O
linked O O O O
physiological O O O O
effects O O O O
( O O O O
like O O O O
the O O O O
rate O O O O
of O O O O
gas O O O O
bubble O O O O
production O O O O
) O O O O
appear O O O O
more O O O O
probable O O O O
. O O O O
    
Clear O O O O
diel O O O O
vertical O O O O
migration O O O O
of O O O O
Difflugia O O O O
was O O O O
not O O O O
observed O O O O
, O O O O
but O O O O
patchiness O O O O
was O O O O
common O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
no O O O O
evident O O O O
lake O O O O
edge O O O O
- O O O O
effects O O O O
in O O O O
the O O O O
spatial O O O O
pattern O O O O
either O O O O
, O O O O
but O O O O
the O O O O
abundances O O O O
were O O O O
strongly O O O O
influenced O O O O
by O O O O
trophic O O O O
conditions O O O O
and O O O O
increased O O O O
by O O O O
up O O O O
to O O O O
one O O O O
order O O O O
of O O O O
magnitude O O O O
in O O O O
the O O O O
upstream O O O O
, O O O O
eutrophic O O O O
sections O O O O
of O O O O
the O O O O
reservoir O O O O
. O O O O
    
Pathways O O O O
to O O O O
immunity O O O O
: O O O O
temporal O O O O
dynamics O O O O
of O O O O
the O O O O
bumblebee O O O O
( O O O O
Bombus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
terrestris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
immune O O O O
response O O O O
against O O O O
a O O O O
trypanosomal O O O O
gut O O O O
parasite O O O O
. O O O O
    
Immune O O O O
response O O O O
dynamics O O O O
in O O O O
insects O O O O
from O O O O
natural O O O O
host O O O O
- O O O O
parasite O O O O
associations O O O O
are O O O O
poorly O O O O
understood O O O O
, O O O O
despite O O O O
accumulating O O O O
evidence O O O O
of O O O O
ecological O O O O
immune O O O O
phenomena O O O O
in O O O O
these O O O O
systems O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
a O O O O
gene O O O O
discovery O O O O
approach O O O O
, O O O O
we O O O O
have O O O O
identified O O O O
genes O O O O
relating O O O O
to O O O O
signalling O O O O
, O O O O
enzymatic O O O O
processes O O O O
and O O O O
respiration O O O O
that O O O O
were O O O O
up O O O O
- O O O O
regulated O O O O
in O O O O
the O O O O
bumblebee O O O O
, O O O O
Bombus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
terrestris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
during O O O O
infection O O O O
with O O O O
the O O O O
trypanosomatid O O O O
parasite O O O O
, O O O O
Crithidia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bombi O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
, O O O O
we O O O O
have O O O O
mapped O O O O
dynamic O O O O
changes O O O O
in O O O O
the O O O O
temporal O O O O
expression O O O O
of O O O O
these O O O O
genes O O O O
and O O O O
three O O O O
candidate O O O O
antimicrobial O O O O
peptide O O O O
( O O O O
AMP O O O O
) O O O O
immune O O O O
genes O O O O
, O O O O
Abaecin O O O O
, O O O O
Defensin O O O O
and O O O O
Hymenoptaecin O O O O
, O O O O
from O O O O
1 O O O O
to O O O O
24 O O O O
h O O O O
after O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bombi O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
infection O O O O
. O O O O
    
We O O O O
show O O O O
that O O O O
dynamic O O O O
changes O O O O
in O O O O
expression O O O O
occur O O O O
for O O O O
individual O O O O
genes O O O O
at O O O O
distinct O O O O
phases O O O O
of O O O O
the O O O O
immune O O O O
response O O O O
to O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bombi O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
that O O O O
correspond O O O O
to O O O O
early O O O O
, O O O O
intermediate O O O O
and O O O O
late O O O O
stages O O O O
of O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
Carnivorous O O O O
planktonic O O O O
Difflugia O O O O
( O O O O
Protista O O O O
, O O O O
Amoebina O O O O
Testacea O O O O
) O O O O
and O O O O
their O O O O
predators O O O O
. O O O O
    
Four O O O O
planktonic O O O O
species O O O O
of O O O O
Difflugia O O O O
co O O O O
- O O O O
occurring O O O O
in O O O O
a O O O O
south O O O O
Chinese O O O O
reservoir O O O O
were O O O O
found O O O O
to O O O O
be O O O O
carnivorous O O O O
, O O O O
but O O O O
the O O O O
diet O O O O
was O O O O
widest O O O O
in O O O O
the O O O O
largest O O O O
species O O O O
( O O O O
D O O O O
. O O O O
tuberspinifera O O O O
) O O O O
and O O O O
narrowest O O O O
in O O O O
the O O O O
smallest O O O O
( O O O O
D O O O O
. O O O O
hydrostatica O O O O
) O O O O
. O O O O
    
It O O O O
included O O O O
rotifers O O O O
, O O O O
ciliates O O O O
, O O O O
dinoflagellates O O O O
, O O O O
floating O O O O
eggs O O O O
, O O O O
and O O O O
small O O O O
particles O O O O
associated O O O O
with O O O O
organic O O O O
debris O O O O
. O O O O
    
Scavenging O O O O
and O O O O
cannibalism O O O O
were O O O O
also O O O O
observed O O O O
. O O O O
    
Species O O O O
with O O O O
a O O O O
collared O O O O
test O O O O
( O O O O
D O O O O
. O O O O
biwae O O O O
, O O O O
D O O O O
. O O O O
mulanensis O O O O
) O O O O
showed O O O O
a O O O O
form O O O O
of O O O O
suction O O O O
- O O O O
feeding O O O O
, O O O O
while O O O O
species O O O O
with O O O O
teeth O O O O
on O O O O
the O O O O
pseudostome O O O O
used O O O O
these O O O O
, O O O O
together O O O O
with O O O O
their O O O O
pseudopods O O O O
, O O O O
as O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
inverted O O O O
crown O O O O
corks O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
, O O O O
providing O O O O
leverage O O O O
for O O O O
opening O O O O
the O O O O
lorica O O O O
of O O O O
their O O O O
( O O O O
rotifer O O O O
) O O O O
prey O O O O
. O O O O
    
Predators O O O O
of O O O O
Difflugia O O O O
included O O O O
cyclopoid O O O O
copepods O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
, O O O O
the O O O O
rotifers O O O O
Asplanchna O O O O
priodonta O O O O
, O O O O
Ploesoma B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
hudsoni O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
, O O O O
occasionally O O O O
, O O O O
big O O O O
ciliates O O O O
( O O O O
Stentor O O O O
sp O O O O
. O O O O
) O O O O
all O O O O
ingested O O O O
their O O O O
prey O O O O
as O O O O
a O O O O
whole O O O O
. O O O O
    
Ca O O O O
( O O O O
2 O O O O
+ O O O O
) O O O O
- O O O O
dependent O O O O
in O O O O
vivo O O O O
protein O O O O
phosphorylation O O O O
and O O O O
encystment O O O O
induction O O O O
in O O O O
the O O O O
ciliated O O O O
protozoan O O O O
Colpoda B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cucullus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Encystment O O O O
induction O O O O
of O O O O
Colpoda B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cucullus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
promoted O O O O
by O O O O
an O O O O
increase O O O O
in O O O O
external O O O O
Ca O O O O
( O O O O
2 O O O O
+ O O O O
) O O O O
and O O O O
overpopulation O O O O
of O O O O
Colpoda O O O O
vegetative O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
phos O O O O
- O O O O
tag O O O O
detection O O O O
assays O O O O
, O O O O
the O O O O
present O O O O
study O O O O
revealed O O O O
that O O O O
the O O O O
in O O O O
vivo O O O O
phosphorylation O O O O
level O O O O
in O O O O
several O O O O
proteins O O O O
[ O O O O
33 O O O O
kDa O O O O
, O O O O
37 O O O O
kDa O O O O
, O O O O
37 O O O O
. O O O O
5 O O O O
kDa O O O O
, O O O O
43 O O O O
kDa O O O O
, O O O O
47 O O O O
kDa O O O O
, O O O O
49 O O O O
kDa O O O O
, O O O O
etc O O O O
. O O O O
] O O O O
was O O O O
raised O O O O
when O O O O
the O O O O
vegetative O O O O
cells O O O O
were O O O O
stimulated O O O O
by O O O O
overpopulation O O O O
to O O O O
encyst O O O O
in O O O O
a O O O O
medium O O O O
containing O O O O
0 O O O O
. O O O O
1 O O O O
mM O O O O
Ca O O O O
( O O O O
2 O O O O
+ O O O O
) O O O O
or O O O O
without O O O O
the O O O O
addition O O O O
of O O O O
Ca O O O O
( O O O O
2 O O O O
+ O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
overpopulation O O O O
- O O O O
mediated O O O O
encystment O O O O
induction O O O O
and O O O O
protein O O O O
phosphorylation O O O O
were O O O O
suppressed O O O O
by O O O O
the O O O O
addition O O O O
of O O O O
EGTA O O O O
. O O O O
    
Ca O O O O
( O O O O
2 O O O O
+ O O O O
) O O O O
/ O O O O
overpopulation O O O O
- O O O O
stimulated O O O O
encystment O O O O
induction O O O O
and O O O O
protein O O O O
phosphorylation O O O O
were O O O O
also O O O O
suppressed O O O O
by O O O O
the O O O O
addition O O O O
of O O O O
BAPTA O O O O
- O O O O
AM O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
the O O O O
Ca O O O O
( O O O O
2 O O O O
+ O O O O
) O O O O
inflow O O O O
promoted O O O O
by O O O O
cell O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
cell O O O O
stimulation O O O O
due O O O O
to O O O O
overpopulation O O O O
may O O O O
activate O O O O
signaling O O O O
pathways O O O O
involving O O O O
protein O O O O
phosphorylation O O O O
and O O O O
encystment O O O O
induction O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
cAMP O O O O
- O O O O
AM O O O O
, O O O O
the O O O O
phosphorylation O O O O
levels O O O O
of O O O O
33 O O O O
kDa O O O O
, O O O O
37 O O O O
kDa O O O O
, O O O O
37 O O O O
. O O O O
5 O O O O
kDa O O O O
, O O O O
43 O O O O
kDa O O O O
, O O O O
47 O O O O
kDa O O O O
and O O O O
49 O O O O
kDa O O O O
proteins O O O O
were O O O O
enhanced O O O O
, O O O O
and O O O O
encystment O O O O
induction O O O O
was O O O O
promoted O O O O
. O O O O
    
Enzyme O O O O
immunoassays O O O O
( O O O O
EIAs O O O O
) O O O O
showed O O O O
that O O O O
intracellular O O O O
cAMP O O O O
concentration O O O O
was O O O O
raised O O O O
prior O O O O
to O O O O
encystment O O O O
when O O O O
the O O O O
cells O O O O
were O O O O
stimulated O O O O
by O O O O
overpopulation O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
cAMP O O O O
/ O O O O
PKA O O O O
- O O O O
dependent O O O O
protein O O O O
phosphorylation O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
an O O O O
event O O O O
on O O O O
Ca O O O O
( O O O O
2 O O O O
+ O O O O
) O O O O
- O O O O
triggered O O O O
signaling O O O O
pathways O O O O
, O O O O
may O O O O
be O O O O
involved O O O O
in O O O O
encystment O O O O
induction O O O O
. O O O O
    
Intestinal O O O O
ciliate O O O O
composition O O O O
found O O O O
in O O O O
the O O O O
feces O O O O
of O O O O
the O O O O
Turk B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
rahvan O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
horse O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Equus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
caballus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Linnaeus O O O O
1758 O O O O
. O O O O
    
Species O O O O
composition O O O O
and O O O O
distribution O O O O
of O O O O
large O O O O
intestinal O O O O
ciliates O O O O
were O O O O
investigated O O O O
in O O O O
the O O O O
feces O O O O
from O O O O
15 O O O O
Turk B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
rahvan O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
horses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
living O O O O
in O O O O
the O O O O
vicinity O O O O
of O O O O
Izmir O O O O
, O O O O
Turkey O O O O
. O O O O
    
Twenty O O O O
- O O O O
two O O O O
ciliate O O O O
genera O O O O
consisting O O O O
of O O O O
36 O O O O
species O O O O
were O O O O
identified O O O O
. O O O O
    
This O O O O
is O O O O
the O O O O
first O O O O
report O O O O
on O O O O
intestinal O O O O
ciliates O O O O
in O O O O
Turk B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
rahvan O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
horses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
no O O O O
previously O O O O
unknown O O O O
species O O O O
were O O O O
observed O O O O
. O O O O
    
The O O O O
mean O O O O
number O O O O
of O O O O
ciliates O O O O
was O O O O
14 O O O O
. O O O O
2 O O O O
+ O O O O
/ O O O O
- O O O O
13 O O O O
. O O O O
9x10 O O O O
( O O O O
4 O O O O
) O O O O
cells O O O O
ml O O O O
( O O O O
- O O O O
1 O O O O
) O O O O
of O O O O
feces O O O O
and O O O O
the O O O O
mean O O O O
number O O O O
of O O O O
ciliate O O O O
species O O O O
per O O O O
host O O O O
was O O O O
9 O O O O
. O O O O
9 O O O O
+ O O O O
/ O O O O
- O O O O
7 O O O O
. O O O O
1 O O O O
. O O O O
    
No O O O O
ciliates O O O O
were O O O O
observed O O O O
in O O O O
2 O O O O
horses B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Bundleia O O O O
and O O O O
Blepharocorys O O O O
were O O O O
considered O O O O
to O O O O
be O O O O
the O O O O
major O O O O
genera O O O O
since O O O O
these O O O O
ciliates O O O O
were O O O O
constantly O O O O
found O O O O
in O O O O
high O O O O
proportions O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
, O O O O
Paraisotricha O O O O
, O O O O
Didesmis O O O O
and O O O O
Gassovskiella O O O O
were O O O O
only O O O O
observed O O O O
at O O O O
low O O O O
frequencies O O O O
. O O O O
    
The O O O O
ciliates O O O O
found O O O O
in O O O O
this O O O O
survey O O O O
had O O O O
almost O O O O
the O O O O
same O O O O
characteristics O O O O
as O O O O
those O O O O
described O O O O
in O O O O
previous O O O O
reports O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
there O O O O
was O O O O
no O O O O
significant O O O O
geographic O O O O
variation O O O O
in O O O O
the O O O O
intestinal O O O O
ciliate O O O O
fauna O O O O
of O O O O
equids O O O O
. O O O O
    
Morphological O O O O
and O O O O
molecular O O O O
phylogeny O O O O
of O O O O
dileptid O O O O
and O O O O
tracheliid O O O O
ciliates O O O O
: O O O O
Resolution O O O O
at O O O O
the O O O O
base O O O O
of O O O O
the O O O O
class O O O O
Litostomatea O O O O
( O O O O
Ciliophora O O O O
, O O O O
Rhynchostomatia O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Dileptid O O O O
and O O O O
tracheliid O O O O
ciliates O O O O
have O O O O
been O O O O
traditionally O O O O
classified O O O O
within O O O O
the O O O O
subclass O O O O
Haptoria O O O O
of O O O O
the O O O O
class O O O O
Litostomatea O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
their O O O O
phylogenetic O O O O
position O O O O
among O O O O
haptorians O O O O
has O O O O
been O O O O
controversial O O O O
and O O O O
indicated O O O O
that O O O O
they O O O O
may O O O O
play O O O O
a O O O O
key O O O O
role O O O O
in O O O O
understanding O O O O
litostomatean O O O O
evolution O O O O
. O O O O
    
In O O O O
order O O O O
to O O O O
reconstruct O O O O
the O O O O
evolutionary O O O O
history O O O O
of O O O O
dileptids O O O O
and O O O O
tracheliids O O O O
, O O O O
and O O O O
to O O O O
unravel O O O O
their O O O O
affinity O O O O
to O O O O
other O O O O
haptorians O O O O
, O O O O
we O O O O
have O O O O
used O O O O
a O O O O
cladistic O O O O
approach O O O O
based O O O O
on O O O O
morphological O O O O
evidence O O O O
and O O O O
a O O O O
phylogenetic O O O O
approach O O O O
based O O O O
on O O O O
18S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequences O O O O
, O O O O
including O O O O
eight O O O O
new O O O O
ones O O O O
. O O O O
    
The O O O O
molecular O O O O
trees O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
dileptids O O O O
and O O O O
tracheliids O O O O
represent O O O O
a O O O O
separate O O O O
subclass O O O O
, O O O O
Rhynchostomatia O O O O
, O O O O
that O O O O
is O O O O
sister O O O O
to O O O O
the O O O O
subclasses O O O O
Haptoria O O O O
and O O O O
Trichostomatia O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Rhynchostomatia O O O O
are O O O O
characterized O O O O
by O O O O
a O O O O
ventrally O O O O
located O O O O
oral O O O O
opening O O O O
at O O O O
the O O O O
base O O O O
of O O O O
a O O O O
proboscis O O O O
that O O O O
carries O O O O
a O O O O
complex O O O O
oral O O O O
ciliature O O O O
. O O O O
    
We O O O O
have O O O O
recognized O O O O
two O O O O
orders O O O O
within O O O O
Rhynchostomatia O O O O
. O O O O
    
The O O O O
new O O O O
order O O O O
Tracheliida O O O O
is O O O O
monotypic O O O O
, O O O O
while O O O O
the O O O O
order O O O O
Dileptida O O O O
comprises O O O O
two O O O O
families O O O O
: O O O O
the O O O O
new O O O O
, O O O O
typically O O O O
bimacronucleate O O O O
family O O O O
Dimacrocaryonidae O O O O
and O O O O
the O O O O
multimacronucleate O O O O
family O O O O
Dileptidae O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Haptoria O O O O
evolved O O O O
from O O O O
the O O O O
last O O O O
common O O O O
ancestor O O O O
of O O O O
the O O O O
Litostomatea O O O O
by O O O O
polarization O O O O
of O O O O
the O O O O
body O O O O
, O O O O
the O O O O
oral O O O O
opening O O O O
locating O O O O
more O O O O
or O O O O
less O O O O
apically O O O O
and O O O O
the O O O O
oral O O O O
ciliature O O O O
simplifying O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Trichostomatia O O O O
originated O O O O
from O O O O
a O O O O
microaerophylic O O O O
haptorian O O O O
by O O O O
further O O O O
simplification O O O O
of O O O O
the O O O O
oral O O O O
ciliature O O O O
, O O O O
possibly O O O O
due O O O O
to O O O O
an O O O O
endosymbiotic O O O O
lifestyle O O O O
. O O O O
    
Compatible O O O O
interaction O O O O
with O O O O
its O O O O
rice O O O O
host O O O O
leads O O O O
to O O O O
enhanced O O O O
expression O O O O
of O O O O
the O O O O
gamma O O O O
subunit O O O O
of O O O O
oligosaccharyl O O O O
transferase O O O O
in O O O O
the O O O O
Asian B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
rice O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gall O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
midge O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Orseolia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
oryzae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
Asian B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
rice O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gall O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
midge O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Orseolia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
oryzae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
is O O O O
a O O O O
fast O O O O
evolving O O O O
, O O O O
damaging O O O O
pest O O O O
of O O O O
rice O O O O
. O O O O
    
Understanding O O O O
the O O O O
underlying O O O O
molecular O O O O
mechanism O O O O
of O O O O
interaction O O O O
between O O O O
the O O O O
gall O O O O
midge O O O O
and O O O O
rice O O O O
will O O O O
help O O O O
in O O O O
devising O O O O
strategies O O O O
to O O O O
control O O O O
and O O O O
manage O O O O
the O O O O
pest O O O O
. O O O O
    
The O O O O
present O O O O
study O O O O
aims O O O O
to O O O O
identify O O O O
rice O O O O
- O O O O
responsive O O O O
genes O O O O
in O O O O
the O O O O
gall O O O O
midge O O O O
that O O O O
aid O O O O
pest O O O O
survival O O O O
. O O O O
    
The O O O O
abundance O O O O
of O O O O
transcripts O O O O
coding O O O O
for O O O O
enzymes O O O O
related O O O O
to O O O O
glycosylation O O O O
, O O O O
in O O O O
a O O O O
cDNA O O O O
library O O O O
prepared O O O O
from O O O O
maggots O O O O
of O O O O
the O O O O
rice O O O O
gall O O O O
midge O O O O
feeding O O O O
on O O O O
susceptible O O O O
hosts O O O O
, O O O O
indicated O O O O
their O O O O
probable O O O O
involvement O O O O
in O O O O
the O O O O
gall O O O O
midge O O O O
- O O O O
rice O O O O
interaction O O O O
. O O O O
    
Hence O O O O
, O O O O
a O O O O
full O O O O
- O O O O
length O O O O
transcript O O O O
for O O O O
a O O O O
gamma O O O O
subunit O O O O
of O O O O
the O O O O
oligosaccharyl O O O O
transferase O O O O
gene O O O O
( O O O O
OoOST O O O O
) O O O O
from O O O O
the O O O O
gall O O O O
midge O O O O
was O O O O
cloned O O O O
and O O O O
characterized O O O O
. O O O O
    
It O O O O
has O O O O
72 O O O O
% O O O O
similarity O O O O
to O O O O
its O O O O
orthologue O O O O
cloned O O O O
from O O O O
Aedes B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aegypti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Tissue O O O O
- O O O O
specific O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
OoOST O O O O
revealed O O O O
an O O O O
increase O O O O
( O O O O
& O O O O
gt O O O O
; O O O O
sevenfold O O O O
) O O O O
in O O O O
the O O O O
transcripts O O O O
of O O O O
the O O O O
gene O O O O
in O O O O
the O O O O
salivary O O O O
glands O O O O
of O O O O
maggots O O O O
in O O O O
susceptible O O O O
plants O O O O
when O O O O
compared O O O O
with O O O O
the O O O O
transcript O O O O
level O O O O
in O O O O
the O O O O
salivary O O O O
glands O O O O
of O O O O
maggots O O O O
feeding O O O O
on O O O O
resistant O O O O
hosts O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
quantitative O O O O
PCR O O O O
, O O O O
performed O O O O
on O O O O
different O O O O
developmental O O O O
stages O O O O
of O O O O
the O O O O
maggots O O O O
in O O O O
two O O O O
susceptible O O O O
and O O O O
two O O O O
resistant O O O O
hosts O O O O
, O O O O
we O O O O
observed O O O O
similar O O O O
expression O O O O
patterns O O O O
( O O O O
i O O O O
. O O O O
e O O O O
. O O O O
overexpression O O O O
in O O O O
the O O O O
compatible O O O O
interaction O O O O
) O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
indicate O O O O
the O O O O
involvement O O O O
of O O O O
OoOST O O O O
in O O O O
maggot O O O O
survival O O O O
and O O O O
establishment O O O O
in O O O O
the O O O O
susceptible O O O O
host O O O O
. O O O O
    
In O O O O
order O O O O
to O O O O
identify O O O O
polymorphism O O O O
in O O O O
the O O O O
gene O O O O
, O O O O
OoOST O O O O
was O O O O
cloned O O O O
from O O O O
three O O O O
gall O O O O
midge O O O O
biotypes O O O O
GMB1 O O O O
, O O O O
GMB4 O O O O
and O O O O
GMB4M O O O O
. O O O O
    
Transcript O O O O
analysis O O O O
and O O O O
comparative O O O O
evaluation O O O O
of O O O O
shaker O O O O
and O O O O
slowmo O O O O
gene O O O O
homologues O O O O
from O O O O
the O O O O
European B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
corn O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
borer O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Ostrinia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nubilalis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
movement O O O O
and O O O O
dispersal O O O O
of O O O O
larval O O O O
Lepidoptera O O O O
impact O O O O
their O O O O
survival O O O O
and O O O O
distribution O O O O
within O O O O
the O O O O
natural O O O O
landscape O O O O
. O O O O
    
Homologues O O O O
of O O O O
the O O O O
Drosophila O O O O
behaviour O O O O
- O O O O
linked O O O O
genes O O O O
shaker O O O O
( O O O O
shkr O O O O
) O O O O
and O O O O
slowmo O O O O
( O O O O
slmo O O O O
) O O O O
were O O O O
identified O O O O
from O O O O
Ostrinia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nubilalis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Lepidoptera O O O O
: O O O O
Crambidae O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Onshkr O O O O
was O O O O
isolated O O O O
as O O O O
a O O O O
1610 O O O O
- O O O O
nucleotide O O O O
( O O O O
nt O O O O
) O O O O
constitutively O O O O
expressed O O O O
transcript O O O O
encoding O O O O
a O O O O
membrane O O O O
- O O O O
localized O O O O
469 O O O O
- O O O O
amino O O O O
- O O O O
acid O O O O
( O O O O
aa O O O O
) O O O O
protein O O O O
with O O O O
a O O O O
conserved O O O O
tetramerization O O O O
domain O O O O
and O O O O
the O O O O
six O O O O
- O O O O
domain O O O O
architecture O O O O
necessary O O O O
for O O O O
the O O O O
molecule O O O O
to O O O O
fold O O O O
into O O O O
an O O O O
active O O O O
K O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
channel O O O O
. O O O O
    
Three O O O O
expressed O O O O
splice O O O O
variants O O O O
of O O O O
682 O O O O
, O O O O
970 O O O O
and O O O O
1604 O O O O
nt O O O O
were O O O O
identified O O O O
for O O O O
the O O O O
Onslmo O O O O
gene O O O O
, O O O O
and O O O O
encode O O O O
predicted O O O O
141 O O O O
and O O O O
228 O O O O
aa O O O O
proteins O O O O
with O O O O
a O O O O
conserved O O O O
protein O O O O
of O O O O
relevant O O O O
evolutionary O O O O
and O O O O
lymphoid O O O O
interest O O O O
( O O O O
PRELI O O O O
) O O O O
domain O O O O
that O O O O
may O O O O
function O O O O
in O O O O
mitochondrial O O O O
protein O O O O
sorting O O O O
and O O O O
perinuclear O O O O
protein O O O O
localization O O O O
. O O O O
    
Onshkr O O O O
and O O O O
Onslmo O O O O
protein O O O O
sequences O O O O
aligned O O O O
within O O O O
monophyletic O O O O
lepidopteran O O O O
groups O O O O
. O O O O
    
Identification O O O O
of O O O O
predicted O O O O
seminal O O O O
fluid O O O O
proteins O O O O
in O O O O
Tribolium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
castaneum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
In O O O O
several O O O O
insect O O O O
species O O O O
, O O O O
seminal O O O O
fluid O O O O
proteins O O O O
( O O O O
SFPs O O O O
) O O O O
have O O O O
been O O O O
demonstrated O O O O
to O O O O
be O O O O
key O O O O
regulators O O O O
of O O O O
male O O O O
and O O O O
female O O O O
fitness O O O O
through O O O O
their O O O O
ability O O O O
to O O O O
alter O O O O
female O O O O
physiology O O O O
and O O O O
behaviour O O O O
. O O O O
    
Tribolium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
castaneum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
an O O O O
economically O O O O
important O O O O
pest O O O O
species O O O O
and O O O O
a O O O O
model O O O O
system O O O O
for O O O O
sexual O O O O
selection O O O O
research O O O O
, O O O O
but O O O O
little O O O O
is O O O O
known O O O O
about O O O O
SFPs O O O O
in O O O O
this O O O O
insect O O O O
. O O O O
    
To O O O O
create O O O O
a O O O O
foundation O O O O
for O O O O
the O O O O
study O O O O
of O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
castaneum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
SFPs O O O O
, O O O O
we O O O O
used O O O O
mass O O O O
spectrometry O O O O
to O O O O
identify O O O O
putative O O O O
SFPs O O O O
by O O O O
comparing O O O O
proteins O O O O
detected O O O O
in O O O O
the O O O O
male O O O O
reproductive O O O O
glands O O O O
with O O O O
those O O O O
found O O O O
in O O O O
the O O O O
reproductive O O O O
tracts O O O O
of O O O O
virgin O O O O
and O O O O
mated O O O O
females O O O O
. O O O O
    
Fourteen O O O O
putative O O O O
SFPs O O O O
, O O O O
thirteen O O O O
with O O O O
male O O O O
biased O O O O
expression O O O O
, O O O O
were O O O O
identified O O O O
through O O O O
this O O O O
approach O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
used O O O O
reverse O O O O
transcription O O O O
PCR O O O O
( O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
) O O O O
to O O O O
examine O O O O
expression O O O O
levels O O O O
across O O O O
different O O O O
tissue O O O O
types O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
strongly O O O O
male O O O O
- O O O O
biased O O O O
expression O O O O
in O O O O
13 O O O O
genes O O O O
, O O O O
nine O O O O
of O O O O
which O O O O
were O O O O
expressed O O O O
only O O O O
in O O O O
male O O O O
accessory O O O O
gland O O O O
tissue O O O O
. O O O O
    
This O O O O
represents O O O O
the O O O O
first O O O O
proteomic O O O O
- O O O O
based O O O O
method O O O O
of O O O O
identifying O O O O
putative O O O O
SFPs O O O O
in O O O O
any O O O O
coleopteran O O O O
species O O O O
, O O O O
and O O O O
is O O O O
the O O O O
first O O O O
study O O O O
in O O O O
this O O O O
species O O O O
to O O O O
identify O O O O
putative O O O O
SFPs O O O O
that O O O O
are O O O O
likely O O O O
transferred O O O O
to O O O O
the O O O O
female O O O O
. O O O O
    
This O O O O
work O O O O
could O O O O
lead O O O O
to O O O O
functional O O O O
analyses O O O O
of O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
SFPs O O O O
in O O O O
sexual O O O O
selection O O O O
, O O O O
sexual O O O O
conflict O O O O
and O O O O
potential O O O O
control O O O O
of O O O O
a O O O O
pest O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Comparison O O O O
of O O O O
transgene O O O O
expression O O O O
in O O O O
Aedes B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aegypti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
generated O O O O
by O O O O
mariner O O O O
Mos1 O O O O
transposition O O O O
and O O O O
PhiC31 O O O O
site O O O O
- O O O O
directed O O O O
recombination O O O O
. O O O O
    
Transgenic O O O O
mosquitoes O O O O
generated O O O O
by O O O O
transposable O O O O
elements O O O O
( O O O O
TEs O O O O
) O O O O
often O O O O
poorly O O O O
express O O O O
transgenes O O O O
owing O O O O
to O O O O
position O O O O
effects O O O O
. O O O O
    
To O O O O
avoid O O O O
these O O O O
effects O O O O
, O O O O
the O O O O
PhiC31 O O O O
site O O O O
- O O O O
directed O O O O
recombination O O O O
system O O O O
was O O O O
used O O O O
to O O O O
insert O O O O
transgenes O O O O
into O O O O
a O O O O
locus O O O O
favourable O O O O
for O O O O
gene O O O O
expression O O O O
in O O O O
Aedes B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aegypti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
We O O O O
describe O O O O
phenotypes O O O O
of O O O O
mariner O O O O
Mos1 O O O O
TE O O O O
and O O O O
PhiC31 O O O O
transgenic O O O O
mosquitoes O O O O
expressing O O O O
the O O O O
enhanced O O O O
green O O O O
fluorescent O O O O
protein O O O O
( O O O O
EGFP O O O O
) O O O O
reporter O O O O
in O O O O
midguts O O O O
of O O O O
blood O O O O
- O O O O
fed O O O O
females O O O O
. O O O O
    
Mosquitoes O O O O
of O O O O
nine O O O O
TE O O O O
- O O O O
generated O O O O
lines O O O O
[ O O O O
estimated O O O O
transformation O O O O
frequency O O O O
( O O O O
TF O O O O
) O O O O
: O O O O
9 O O O O
. O O O O
3 O O O O
% O O O O
] O O O O
clearly O O O O
expressed O O O O
the O O O O
eye O O O O
- O O O O
specific O O O O
selection O O O O
marker O O O O
but O O O O
only O O O O
2 O O O O
/ O O O O
9 O O O O
lines O O O O
robustly O O O O
expressed O O O O
the O O O O
EGFP O O O O
reporter O O O O
. O O O O
    
The O O O O
piggyBac O O O O
TE O O O O
- O O O O
generated O O O O
PhiC31 O O O O
docking O O O O
strain O O O O
, O O O O
attP26 O O O O
, O O O O
supported O O O O
recombination O O O O
with O O O O
attB O O O O
site O O O O
containing O O O O
donors O O O O
at O O O O
an O O O O
estimated O O O O
TF O O O O
of O O O O
1 O O O O
. O O O O
7 O O O O
- O O O O
4 O O O O
. O O O O
9 O O O O
% O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
a O O O O
codon O O O O
- O O O O
optimized O O O O
PhiC31 O O O O
integrase O O O O
mutant O O O O
instead O O O O
of O O O O
the O O O O
' O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
' O O O O
enzyme O O O O
did O O O O
not O O O O
affect O O O O
TF O O O O
. O O O O
    
Site O O O O
- O O O O
directed O O O O
recombination O O O O
of O O O O
line O O O O
attP26 O O O O
with O O O O
an O O O O
attB O O O O
- O O O O
containing O O O O
donor O O O O
expressing O O O O
EGFP O O O O
from O O O O
the O O O O
Ae B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
aegypti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
carboxypeptidase O O O O
promoter O O O O
produced O O O O
one O O O O
transgenic O O O O
line O O O O
with O O O O
blood O O O O
- O O O O
fed O O O O
females O O O O
expressing O O O O
the O O O O
reporter O O O O
in O O O O
midgut O O O O
tissue O O O O
. O O O O
    
Docking O O O O
strain O O O O
attP26 O O O O
also O O O O
supported O O O O
robust O O O O
expression O O O O
of O O O O
Flock B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
House O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
B2 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
from O O O O
the O O O O
Ae B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
aegypti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
polyubiquitin O O O O
promoter O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
data O O O O
confirm O O O O
that O O O O
eye O O O O
- O O O O
specific O O O O
selection O O O O
marker O O O O
expression O O O O
alone O O O O
is O O O O
not O O O O
a O O O O
reliable O O O O
indicator O O O O
for O O O O
robust O O O O
gene O O O O
- O O O O
of O O O O
- O O O O
interest O O O O
expression O O O O
in O O O O
Ae B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
aegypti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
that O O O O
the O O O O
PhiC31 O O O O
system O O O O
can O O O O
ensure O O O O
predictable O O O O
transgene O O O O
expression O O O O
in O O O O
this O O O O
mosquito O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Optimization O O O O
of O O O O
the O O O O
Gal4 O O O O
- O O O O
UAS O O O O
system O O O O
in O O O O
an O O O O
Anopheles B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
gambiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cell O O O O
line O O O O
. O O O O
    
The O O O O
development O O O O
of O O O O
the O O O O
bipartite O O O O
Gal4 O O O O
- O O O O
UAS O O O O
system O O O O
in O O O O
Anopheles B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
gambiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
would O O O O
improve O O O O
the O O O O
functional O O O O
characterization O O O O
of O O O O
genes O O O O
in O O O O
this O O O O
important O O O O
malaria O O O O
vector O O O O
. O O O O
    
Towards O O O O
this O O O O
aim O O O O
, O O O O
we O O O O
used O O O O
Gal4 O O O O
driver O O O O
plasmids O O O O
to O O O O
successfully O O O O
activate O O O O
expression O O O O
of O O O O
the O O O O
reporter O O O O
gene O O O O
, O O O O
luciferase O O O O
, O O O O
from O O O O
UAS O O O O
responder O O O O
plasmids O O O O
when O O O O
cotransfected O O O O
into O O O O
an O O O O
An B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gambiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cell O O O O
line O O O O
. O O O O
    
To O O O O
optimize O O O O
Gal4 O O O O
- O O O O
regulated O O O O
gene O O O O
expression O O O O
in O O O O
mosquitoes O O O O
, O O O O
we O O O O
compared O O O O
the O O O O
efficiency O O O O
of O O O O
a O O O O
series O O O O
of O O O O
alternative O O O O
Gal4 O O O O
transactivators O O O O
to O O O O
drive O O O O
reporter O O O O
gene O O O O
expression O O O O
from O O O O
responder O O O O
plasmids O O O O
incorporating O O O O
different O O O O
numbers O O O O
of O O O O
tandemly O O O O
arrayed O O O O
Gal4 O O O O
binding O O O O
sites O O O O
or O O O O
upstream O O O O
activation O O O O
sequences O O O O
( O O O O
UAS O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
indicated O O O O
that O O O O
the O O O O
native O O O O
Gal4 O O O O
is O O O O
only O O O O
weakly O O O O
active O O O O
in O O O O
these O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Modified O O O O
forms O O O O
of O O O O
Gal4 O O O O
, O O O O
including O O O O
those O O O O
carrying O O O O
minimal O O O O
VP16 O O O O
activation O O O O
domains O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
a O O O O
deleted O O O O
form O O O O
of O O O O
Gal4 O O O O
, O O O O
give O O O O
up O O O O
to O O O O
20 O O O O
- O O O O
fold O O O O
greater O O O O
activity O O O O
than O O O O
the O O O O
native O O O O
protein O O O O
, O O O O
when O O O O
used O O O O
in O O O O
conjunction O O O O
with O O O O
a O O O O
responder O O O O
plasmid O O O O
having O O O O
14 O O O O
UAS O O O O
repeats O O O O
. O O O O
    
The O O O O
identification O O O O
of O O O O
Gal4 O O O O
- O O O O
UAS O O O O
vectors O O O O
that O O O O
are O O O O
efficiently O O O O
expressed O O O O
in O O O O
a O O O O
mosquito O O O O
cell O O O O
line O O O O
should O O O O
facilitate O O O O
the O O O O
transfer O O O O
of O O O O
this O O O O
versatile O O O O
expression O O O O
system O O O O
to O O O O
An B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gambiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
potentially O O O O
to O O O O
other O O O O
insects O O O O
of O O O O
medical O O O O
importance O O O O
. O O O O
    
Host O O O O
translational O O O O
control O O O O
of O O O O
a O O O O
polydnavirus O O O O
, O O O O
Cotesia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
plutellae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bracovirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
by O O O O
sequestering O O O O
host O O O O
eIF4A O O O O
to O O O O
prevent O O O O
formation O O O O
of O O O O
a O O O O
translation O O O O
initiation O O O O
complex O O O O
. O O O O
    
Host O O O O
translational O O O O
control O O O O
is O O O O
a O O O O
viral O O O O
strategy O O O O
to O O O O
exploit O O O O
host O O O O
cellular O O O O
resources O O O O
. O O O O
    
Parasitization O O O O
by O O O O
some O O O O
endoparasitoids O O O O
containing O O O O
polydnaviruses O O O O
inhibits O O O O
the O O O O
synthesis O O O O
of O O O O
specific O O O O
host O O O O
proteins O O O O
at O O O O
post O O O O
- O O O O
transcriptional O O O O
level O O O O
. O O O O
    
Two O O O O
host O O O O
translation O O O O
inhibitory O O O O
factors O O O O
( O O O O
HTIFs O O O O
) O O O O
have O O O O
been O O O O
proposed O O O O
in O O O O
Cotesia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
plutellae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bracovirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
CpBV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
. O O O O
    
Parasitization O O O O
by O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
plutellae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
inhibited O O O O
storage O O O O
protein O O O O
1 O O O O
( O O O O
SP1 O O O O
) O O O O
synthesis O O O O
of O O O O
Plutella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
xylostella O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
at O O O O
post O O O O
- O O O O
transcriptional O O O O
level O O O O
. O O O O
    
One O O O O
HTIF O O O O
, O O O O
CpBV15Beta O O O O
, O O O O
inhibited O O O O
the O O O O
translation O O O O
of O O O O
SP1 O O O O
mRNA O O O O
in O O O O
an O O O O
in O O O O
vitro O O O O
translation O O O O
assay O O O O
using O O O O
rabbit B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
reticulocyte O O O O
lysate O O O O
, O O O O
but O O O O
did O O O O
not O O O O
inhibit O O O O
its O O O O
own O O O O
mRNA O O O O
. O O O O
    
To O O O O
further O O O O
analyse O O O O
the O O O O
discrimination O O O O
of O O O O
target O O O O
and O O O O
nontarget O O O O
mRNAs O O O O
of O O O O
the O O O O
inhibitory O O O O
effect O O O O
of O O O O
HTIF O O O O
, O O O O
5 O O O O
' O O O O
untranslated O O O O
regions O O O O
( O O O O
UTRs O O O O
) O O O O
of O O O O
SP1 O O O O
and O O O O
CpBV15Beta O O O O
mRNA O O O O
were O O O O
reciprocally O O O O
exchanged O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
HTIFs O O O O
, O O O O
the O O O O
chimeric O O O O
CpBV15Beta O O O O
mRNA O O O O
that O O O O
contained O O O O
SP1 O O O O
5 O O O O
' O O O O
UTR O O O O
was O O O O
not O O O O
translated O O O O
, O O O O
whereas O O O O
the O O O O
chimeric O O O O
SP1 O O O O
mRNA O O O O
that O O O O
contained O O O O
CpBV15Beta O O O O
5 O O O O
' O O O O
UTR O O O O
was O O O O
translated O O O O
. O O O O
    
There O O O O
was O O O O
a O O O O
difference O O O O
in O O O O
the O O O O
5 O O O O
' O O O O
UTR O O O O
secondary O O O O
structures O O O O
between O O O O
target O O O O
( O O O O
SP1 O O O O
) O O O O
and O O O O
nontarget O O O O
( O O O O
CpBV15alpha O O O O
and O O O O
CpBV15Beta O O O O
) O O O O
mRNAs O O O O
in O O O O
terms O O O O
of O O O O
thermal O O O O
stability O O O O
. O O O O
    
Different O O O O
mutant O O O O
5 O O O O
' O O O O
UTRs O O O O
of O O O O
SP1 O O O O
mRNA O O O O
were O O O O
prepared O O O O
by O O O O
point O O O O
mutations O O O O
to O O O O
modify O O O O
their O O O O
secondary O O O O
structures O O O O
. O O O O
    
The O O O O
constructs O O O O
containing O O O O
5 O O O O
' O O O O
UTRs O O O O
of O O O O
high O O O O
thermal O O O O
stability O O O O
in O O O O
their O O O O
secondary O O O O
structures O O O O
were O O O O
inhibited O O O O
by O O O O
HTIF O O O O
, O O O O
but O O O O
those O O O O
of O O O O
low O O O O
thermal O O O O
stability O O O O
were O O O O
not O O O O
. O O O O
    
Immunoprecipitation O O O O
with O O O O
CpBV15Beta O O O O
antibody O O O O
coprecipitated O O O O
eIF4A O O O O
, O O O O
which O O O O
would O O O O
be O O O O
required O O O O
for O O O O
unwinding O O O O
the O O O O
secondary O O O O
structure O O O O
of O O O O
the O O O O
5 O O O O
' O O O O
UTR O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
indicate O O O O
that O O O O
the O O O O
viral O O O O
HTIF O O O O
discriminates O O O O
between O O O O
host O O O O
mRNAs O O O O
according O O O O
to O O O O
their O O O O
dependency O O O O
on O O O O
eIF4A O O O O
to O O O O
form O O O O
a O O O O
functional O O O O
initiation O O O O
complex O O O O
for O O O O
translation O O O O
. O O O O
    
Identification O O O O
and O O O O
expression O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
genes O O O O
involved O O O O
in O O O O
serotonin O O O O
biosynthesis O O O O
and O O O O
transduction O O O O
in O O O O
the O O O O
field O O O O
cricket O O O O
Gryllus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bimaculatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Serotonin O O O O
( O O O O
5 O O O O
- O O O O
HT O O O O
) O O O O
modulates O O O O
various O O O O
aspects O O O O
of O O O O
behaviours O O O O
such O O O O
as O O O O
aggressive O O O O
behaviour O O O O
and O O O O
circadian O O O O
behaviour O O O O
in O O O O
the O O O O
cricket O O O O
. O O O O
    
To O O O O
elucidate O O O O
the O O O O
molecular O O O O
basis O O O O
of O O O O
the O O O O
cricket O O O O
5 O O O O
- O O O O
HT O O O O
system O O O O
, O O O O
we O O O O
identified O O O O
5 O O O O
- O O O O
HT O O O O
- O O O O
related O O O O
genes O O O O
in O O O O
the O O O O
field O O O O
cricket O O O O
Gryllus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bimaculatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
DeGeer O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Complementary O O O O
DNA O O O O
of O O O O
tryptophan O O O O
hydroxylase O O O O
and O O O O
phenylalanine O O O O
- O O O O
tryptophan O O O O
hydroxylase O O O O
, O O O O
which O O O O
convert O O O O
tryptophan O O O O
into O O O O
5 O O O O
- O O O O
hydroxy O O O O
- O O O O
L O O O O
- O O O O
tryptophan O O O O
( O O O O
5 O O O O
- O O O O
HTP O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
that O O O O
of O O O O
aromatic O O O O
L O O O O
- O O O O
amino O O O O
acid O O O O
decarboxylase O O O O
, O O O O
which O O O O
converts O O O O
5 O O O O
- O O O O
HTP O O O O
into O O O O
5 O O O O
- O O O O
HT O O O O
, O O O O
were O O O O
isolated O O O O
from O O O O
a O O O O
cricket O O O O
brain O O O O
cDNA O O O O
library O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
, O O O O
four O O O O
5 O O O O
- O O O O
HT O O O O
receptor O O O O
genes O O O O
( O O O O
5 O O O O
- O O O O
HT O O O O
( O O O O
1A O O O O
) O O O O
, O O O O
5 O O O O
- O O O O
HT O O O O
( O O O O
1B O O O O
) O O O O
, O O O O
5 O O O O
- O O O O
HT O O O O
( O O O O
2alpha O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
5 O O O O
- O O O O
HT O O O O
( O O O O
7 O O O O
) O O O O
) O O O O
were O O O O
identified O O O O
. O O O O
    
Expression O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
tryptophan O O O O
hydroxylase O O O O
gene O O O O
TRH O O O O
and O O O O
phenylalanine O O O O
- O O O O
tryptophan O O O O
hydroxylase O O O O
gene O O O O
TPH O O O O
, O O O O
which O O O O
are O O O O
selectively O O O O
involved O O O O
in O O O O
neuronal O O O O
and O O O O
peripheral O O O O
5 O O O O
- O O O O
HT O O O O
synthesis O O O O
in O O O O
Drosophila O O O O
, O O O O
suggested O O O O
that O O O O
two O O O O
5 O O O O
- O O O O
HT O O O O
synthesis O O O O
pathways O O O O
co O O O O
- O O O O
exist O O O O
in O O O O
the O O O O
cricket O O O O
neuronal O O O O
tissues O O O O
. O O O O
    
The O O O O
four O O O O
5 O O O O
- O O O O
HT O O O O
receptor O O O O
genes O O O O
were O O O O
expressed O O O O
in O O O O
various O O O O
tissues O O O O
at O O O O
differential O O O O
expression O O O O
levels O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
the O O O O
5 O O O O
- O O O O
HT O O O O
system O O O O
is O O O O
widely O O O O
distributed O O O O
in O O O O
the O O O O
cricket O O O O
. O O O O
    
The O O O O
influence O O O O
of O O O O
fundamental O O O O
design O O O O
parameters O O O O
on O O O O
ciliates O O O O
community O O O O
structure O O O O
in O O O O
Irish O O O O
activated O O O O
sludge O O O O
systems O O O O
. O O O O
    
The O O O O
protozoan O O O O
community O O O O
in O O O O
eleven O O O O
activated O O O O
sludge O O O O
wastewater O O O O
treatment O O O O
plants O O O O
( O O O O
WWTPs O O O O
) O O O O
in O O O O
the O O O O
greater O O O O
Dublin O O O O
area O O O O
has O O O O
been O O O O
investigated O O O O
and O O O O
correlated O O O O
with O O O O
key O O O O
physio O O O O
- O O O O
chemical O O O O
operational O O O O
and O O O O
effluent O O O O
quality O O O O
parameters O O O O
. O O O O
    
The O O O O
plants O O O O
represented O O O O
various O O O O
designs O O O O
, O O O O
including O O O O
conventional O O O O
and O O O O
biological O O O O
nutrient O O O O
removal O O O O
( O O O O
BNR O O O O
) O O O O
systems O O O O
. O O O O
    
The O O O O
aim O O O O
of O O O O
the O O O O
study O O O O
was O O O O
to O O O O
identify O O O O
differences O O O O
in O O O O
ciliate O O O O
community O O O O
due O O O O
to O O O O
key O O O O
design O O O O
parameters O O O O
including O O O O
anoxic O O O O
/ O O O O
anaerobic O O O O
stages O O O O
and O O O O
to O O O O
identify O O O O
suitable O O O O
bioindicator O O O O
species O O O O
for O O O O
performance O O O O
evaluation O O O O
. O O O O
    
BNR O O O O
systems O O O O
supported O O O O
significantly O O O O
different O O O O
protozoan O O O O
communities O O O O
compared O O O O
to O O O O
conventional O O O O
systems O O O O
. O O O O
    
Total O O O O
protozoan O O O O
abundance O O O O
was O O O O
reduced O O O O
in O O O O
plants O O O O
with O O O O
incorporated O O O O
anoxic O O O O
and O O O O
anaerobic O O O O
stages O O O O
, O O O O
whereas O O O O
species O O O O
diversity O O O O
was O O O O
either O O O O
unaffected O O O O
or O O O O
increased O O O O
. O O O O
    
Plagiocampa O O O O
rouxi O O O O
and O O O O
Holophrya O O O O
discolor O O O O
were O O O O
tolerant O O O O
to O O O O
anoxic O O O O
/ O O O O
anaerobic O O O O
conditions O O O O
and O O O O
associated O O O O
with O O O O
high O O O O
denitrification O O O O
. O O O O
    
Apart O O O O
from O O O O
process O O O O
design O O O O
, O O O O
influent O O O O
wastewater O O O O
characteristics O O O O
affect O O O O
protozoan O O O O
community O O O O
structure O O O O
. O O O O
    
Aspidisca O O O O
cicada O O O O
was O O O O
associated O O O O
with O O O O
low O O O O
dissolved O O O O
oxygen O O O O
and O O O O
low O O O O
nitrate O O O O
concentrations O O O O
, O O O O
while O O O O
Trochilia O O O O
minuta O O O O
was O O O O
indicative O O O O
of O O O O
good O O O O
nitrifying O O O O
conditions O O O O
and O O O O
good O O O O
sludge O O O O
settleability O O O O
. O O O O
    
Trithigmostoma O O O O
cucullulus O O O O
was O O O O
sensitive O O O O
to O O O O
ammonia O O O O
and O O O O
phosphate O O O O
and O O O O
could O O O O
be O O O O
useful O O O O
as O O O O
an O O O O
indicator O O O O
of O O O O
high O O O O
effluent O O O O
quality O O O O
. O O O O
    
The O O O O
association O O O O
rating O O O O
assessment O O O O
procedure O O O O
of O O O O
Curds O O O O
and O O O O
Cockburn O O O O
failed O O O O
to O O O O
predict O O O O
final O O O O
effluent O O O O
biological O O O O
oxygen O O O O
demand O O O O
( O O O O
BOD O O O O
( O O O O
5 O O O O
) O O O O
) O O O O
indicating O O O O
the O O O O
method O O O O
might O O O O
not O O O O
be O O O O
applicable O O O O
to O O O O
treatment O O O O
systems O O O O
of O O O O
different O O O O
designs O O O O
. O O O O
    
Identification O O O O
and O O O O
characterization O O O O
of O O O O
the O O O O
cysteine O O O O
protease O O O O
inhibitor O O O O
gene O O O O
MdCPI O O O O
from O O O O
Musca B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
domestica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Cysteine O O O O
proteinase O O O O
inhibitors O O O O
( O O O O
CPIs O O O O
) O O O O
are O O O O
involved O O O O
in O O O O
many O O O O
vital O O O O
cellular O O O O
processes O O O O
such O O O O
as O O O O
signalling O O O O
pathways O O O O
, O O O O
apoptosis O O O O
, O O O O
immune O O O O
response O O O O
and O O O O
development O O O O
; O O O O
however O O O O
, O O O O
no O O O O
CPIs O O O O
have O O O O
yet O O O O
been O O O O
reported O O O O
from O O O O
the O O O O
housefly B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
Musca B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
domestica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
report O O O O
the O O O O
isolation O O O O
and O O O O
characterization O O O O
of O O O O
a O O O O
housefly B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
CPI O O O O
gene O O O O
designated O O O O
MdCPI O O O O
. O O O O
    
The O O O O
gene O O O O
contains O O O O
an O O O O
open O O O O
reading O O O O
frame O O O O
of O O O O
357 O O O O
bp O O O O
encoding O O O O
a O O O O
protein O O O O
of O O O O
118 O O O O
amino O O O O
acid O O O O
residues O O O O
with O O O O
a O O O O
putative O O O O
signal O O O O
peptide O O O O
of O O O O
17 O O O O
amino O O O O
acid O O O O
residues O O O O
. O O O O
    
Protein O O O O
alignment O O O O
demonstrated O O O O
a O O O O
high O O O O
homology O O O O
to O O O O
that O O O O
of O O O O
Sarcophaga B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
crassipalpis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
identity O O O O
= O O O O
51 O O O O
% O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Phylogenetic O O O O
analysis O O O O
suggested O O O O
that O O O O
all O O O O
CPIs O O O O
from O O O O
dipterans O O O O
, O O O O
including O O O O
the O O O O
housefly B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
belong O O O O
to O O O O
the O O O O
I25A O O O O
family O O O O
and O O O O
may O O O O
be O O O O
descended O O O O
from O O O O
a O O O O
single O O O O
common O O O O
ancestor O O O O
. O O O O
    
The O O O O
gene O O O O
was O O O O
expressed O O O O
in O O O O
and O O O O
purified O O O O
from O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Biochemical O O O O
studies O O O O
showed O O O O
that O O O O
MdCPI O O O O
exerts O O O O
an O O O O
inhibiting O O O O
function O O O O
on O O O O
papain O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
a O O O O
classical O O O O
assay O O O O
to O O O O
confirm O O O O
CPIs O O O O
. O O O O
    
Real O O O O
- O O O O
time O O O O
quantitative O O O O
PCR O O O O
and O O O O
immunolocalization O O O O
analysis O O O O
revealed O O O O
that O O O O
MdCPI O O O O
is O O O O
specifically O O O O
expressed O O O O
in O O O O
haemocytes O O O O
and O O O O
fat O O O O
bodies O O O O
. O O O O
    
It O O O O
is O O O O
highly O O O O
down O O O O
- O O O O
regulated O O O O
in O O O O
larvae O O O O
and O O O O
markedly O O O O
up O O O O
- O O O O
regulated O O O O
in O O O O
the O O O O
pupal O O O O
stage O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
it O O O O
may O O O O
be O O O O
related O O O O
to O O O O
development O O O O
. O O O O
    
Functions O O O O
of O O O O
the O O O O
mitotic O O O O
B O O O O
- O O O O
type O O O O
cyclins O O O O
CLB1 O O O O
, O O O O
CLB2 O O O O
, O O O O
and O O O O
CLB3 O O O O
at O O O O
mitotic O O O O
exit O O O O
antagonized O O O O
by O O O O
the O O O O
CDC14 O O O O
phosphatase O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
budding O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
Saccharomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cerevisiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
cell O O O O
cycle O O O O
progression O O O O
and O O O O
cytokinesis O O O O
at O O O O
mitotic O O O O
exit O O O O
are O O O O
proposed O O O O
to O O O O
be O O O O
linked O O O O
by O O O O
CDC14 O O O O
phosphatase O O O O
antagonizing O O O O
the O O O O
function O O O O
of O O O O
mitotic O O O O
B O O O O
- O O O O
type O O O O
cyclin O O O O
( O O O O
CLBs O O O O
) O O O O
. O O O O
    
We O O O O
have O O O O
isolated O O O O
a O O O O
temperature O O O O
- O O O O
sensitive O O O O
mutant O O O O
, O O O O
cdc14 O O O O
( O O O O
A280V O O O O
) O O O O
, O O O O
with O O O O
a O O O O
mutation O O O O
in O O O O
the O O O O
conserved O O O O
phosphatase O O O O
domain O O O O
. O O O O
    
Prolonged O O O O
arrest O O O O
in O O O O
the O O O O
cdc14 O O O O
( O O O O
A280V O O O O
) O O O O
mutant O O O O
partially O O O O
uncoupled O O O O
cell O O O O
cycle O O O O
progression O O O O
from O O O O
the O O O O
completion O O O O
of O O O O
cytokinesis O O O O
as O O O O
measured O O O O
by O O O O
bud O O O O
re O O O O
- O O O O
emergence O O O O
, O O O O
in O O O O
the O O O O
form O O O O
of O O O O
elongated O O O O
apical O O O O
projections O O O O
, O O O O
and O O O O
DNA O O O O
re O O O O
- O O O O
replication O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
to O O O O
previous O O O O
mitotic O O O O
exit O O O O
mutants O O O O
, O O O O
cdc14 O O O O
( O O O O
A280V O O O O
) O O O O
mutants O O O O
displayed O O O O
a O O O O
strong O O O O
bias O O O O
for O O O O
the O O O O
first O O O O
apical O O O O
projection O O O O
to O O O O
form O O O O
in O O O O
the O O O O
mother O O O O
cell O O O O
body O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
cdc14 O O O O
( O O O O
A280V O O O O
) O O O O
mutant O O O O
phenotypes O O O O
, O O O O
the O O O O
functions O O O O
of O O O O
the O O O O
B O O O O
- O O O O
type O O O O
cyclins O O O O
at O O O O
mitotic O O O O
exit O O O O
were O O O O
investigated O O O O
. O O O O
    
The O O O O
preference O O O O
in O O O O
mother O O O O
- O O O O
daughter O O O O
apical O O O O
projection O O O O
formation O O O O
was O O O O
observed O O O O
to O O O O
be O O O O
independent O O O O
of O O O O
any O O O O
individual O O O O
CLB O O O O
function O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
cdc14 O O O O
( O O O O
A280V O O O O
) O O O O
clb1Delta O O O O
cells O O O O
displayed O O O O
a O O O O
pronounced O O O O
increase O O O O
in O O O O
apical O O O O
projections O O O O
, O O O O
while O O O O
cdc14 O O O O
( O O O O
A280V O O O O
) O O O O
clb3Delta O O O O
cells O O O O
were O O O O
observed O O O O
to O O O O
form O O O O
round O O O O
cellular O O O O
chains O O O O
. O O O O
    
While O O O O
cdc14 O O O O
( O O O O
A280V O O O O
) O O O O
cells O O O O
arrested O O O O
at O O O O
mitotic O O O O
exit O O O O
, O O O O
both O O O O
cdc14 O O O O
( O O O O
A280V O O O O
) O O O O
clb1Delta O O O O
and O O O O
cdc14 O O O O
( O O O O
A280V O O O O
) O O O O
clb3Delta O O O O
cells O O O O
completed O O O O
cytokinesis O O O O
, O O O O
but O O O O
failed O O O O
cell O O O O
separation O O O O
. O O O O
    
cdc14 O O O O
( O O O O
A280V O O O O
) O O O O
clb2Delta O O O O
cells O O O O
displayed O O O O
a O O O O
defect O O O O
in O O O O
actin O O O O
ring O O O O
assembly O O O O
. O O O O
    
These O O O O
observations O O O O
differentiate O O O O
the O O O O
functions O O O O
of O O O O
CLB1 O O O O
, O O O O
CLB2 O O O O
, O O O O
and O O O O
CLB3 O O O O
at O O O O
mitotic O O O O
exit O O O O
, O O O O
and O O O O
are O O O O
consistent O O O O
with O O O O
the O O O O
hypothesis O O O O
that O O O O
CLB O O O O
activities O O O O
are O O O O
antagonized O O O O
by O O O O
the O O O O
CDC14 O O O O
phosphatase O O O O
in O O O O
order O O O O
to O O O O
couple O O O O
cell O O O O
cycle O O O O
progression O O O O
with O O O O
cytokinesis O O O O
at O O O O
mitotic O O O O
exit O O O O
. O O O O
    
Insect O O O O
insulin O O O O
receptors O O O O
: O O O O
insights O O O O
from O O O O
sequence O O O O
and O O O O
caste O O O O
expression O O O O
analyses O O O O
of O O O O
two O O O O
cloned O O O O
hymenopteran O O O O
insulin O O O O
receptor O O O O
cDNAs O O O O
from O O O O
the O O O O
fire B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ant O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
insulin O O O O
and O O O O
insulin O O O O
- O O O O
like O O O O
growth O O O O
factor O O O O
( O O O O
IGF O O O O
) O O O O
signalling O O O O
( O O O O
IIS O O O O
) O O O O
pathway O O O O
in O O O O
the O O O O
honey B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bee O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Apis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mellifera O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
is O O O O
linked O O O O
to O O O O
reproductive O O O O
division O O O O
of O O O O
labour O O O O
and O O O O
foraging O O O O
behaviour O O O O
. O O O O
    
Two O O O O
insulin O O O O
receptor O O O O
genes O O O O
are O O O O
present O O O O
in O O O O
the O O O O
released O O O O
genomes O O O O
of O O O O
other O O O O
social O O O O
hymenopterans O O O O
. O O O O
    
Limited O O O O
information O O O O
is O O O O
available O O O O
on O O O O
the O O O O
IIS O O O O
pathway O O O O
role O O O O
in O O O O
ants O O O O
. O O O O
    
The O O O O
predicted O O O O
insulin O O O O
receptor O O O O
sequences O O O O
from O O O O
the O O O O
recently O O O O
released O O O O
draft O O O O
genome O O O O
of O O O O
the O O O O
fire B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ant O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Solenopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
invicta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Hymenoptera O O O O
: O O O O
Formicidae O O O O
) O O O O
are O O O O
incomplete O O O O
and O O O O
biologically O O O O
significant O O O O
data O O O O
are O O O O
also O O O O
lacking O O O O
. O O O O
    
To O O O O
elucidate O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
the O O O O
IIS O O O O
pathway O O O O
in O O O O
the O O O O
fire O O O O
ant O O O O
, O O O O
two O O O O
putative O O O O
insulin O O O O
receptors O O O O
( O O O O
SiInR O O O O
- O O O O
1 O O O O
and O O O O
SiInR O O O O
- O O O O
2 O O O O
) O O O O
were O O O O
cloned O O O O
; O O O O
the O O O O
first O O O O
InR O O O O
cDNAs O O O O
cloned O O O O
from O O O O
social O O O O
insects O O O O
. O O O O
    
Analyses O O O O
of O O O O
putative O O O O
post O O O O
- O O O O
translational O O O O
modification O O O O
sites O O O O
in O O O O
SiInRs O O O O
revealed O O O O
the O O O O
potential O O O O
for O O O O
differential O O O O
regulation O O O O
. O O O O
    
We O O O O
investigated O O O O
the O O O O
transcriptional O O O O
expression O O O O
of O O O O
both O O O O
receptors O O O O
at O O O O
different O O O O
developmental O O O O
stages O O O O
, O O O O
castes O O O O
and O O O O
queen O O O O
tissues O O O O
. O O O O
    
In O O O O
last O O O O
instar O O O O
larvae O O O O
and O O O O
pharate O O O O
pupae O O O O
of O O O O
workers O O O O
and O O O O
reproductive O O O O
, O O O O
transcriptional O O O O
abundance O O O O
of O O O O
both O O O O
receptors O O O O
was O O O O
negatively O O O O
correlated O O O O
with O O O O
body O O O O
size O O O O
and O O O O
nutritional O O O O
status O O O O
. O O O O
    
The O O O O
expression O O O O
level O O O O
of O O O O
both O O O O
receptors O O O O
in O O O O
different O O O O
queen O O O O
tissues O O O O
appears O O O O
to O O O O
correlate O O O O
with O O O O
requirements O O O O
for O O O O
queen O O O O
reproductive O O O O
physiology O O O O
and O O O O
behaviours O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
contributes O O O O
new O O O O
information O O O O
to O O O O
the O O O O
understanding O O O O
of O O O O
social O O O O
insects O O O O
because O O O O
in O O O O
fire B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ants O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
juvenile O O O O
hormone O O O O
acts O O O O
as O O O O
a O O O O
gonadotropin O O O O
and O O O O
workers O O O O
are O O O O
fully O O O O
sterile O O O O
, O O O O
contrary O O O O
to O O O O
honey B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bees O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
transcriptional O O O O
response O O O O
of O O O O
Saccharomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cerevisiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
to O O O O
proapoptotic O O O O
concentrations O O O O
of O O O O
Pichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
membranifaciens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
killer O O O O
toxin O O O O
. O O O O
    
PMKT O O O O
( O O O O
Pichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
membranifaciens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
killer O O O O
toxin O O O O
) O O O O
reportedly O O O O
has O O O O
antimicrobial O O O O
activity O O O O
against O O O O
yeasts B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
filamentous O O O O
fungi O O O O
. O O O O
    
In O O O O
previous O O O O
research O O O O
we O O O O
posited O O O O
that O O O O
high O O O O
PMKT O O O O
concentrations O O O O
pose O O O O
a O O O O
serious O O O O
challenge O O O O
for O O O O
cell O O O O
survival O O O O
by O O O O
disrupting O O O O
plasma O O O O
membrane O O O O
electrochemical O O O O
gradients O O O O
, O O O O
inducing O O O O
a O O O O
transcriptional O O O O
response O O O O
similar O O O O
to O O O O
that O O O O
of O O O O
certain O O O O
stimuli O O O O
such O O O O
as O O O O
hyperosmotic O O O O
shock O O O O
. O O O O
    
This O O O O
response O O O O
was O O O O
related O O O O
to O O O O
the O O O O
HOG O O O O
- O O O O
pathway O O O O
with O O O O
Hog1p O O O O
phosphorylation O O O O
and O O O O
a O O O O
transitional O O O O
increase O O O O
in O O O O
intracellular O O O O
glycerol O O O O
accumulation O O O O
. O O O O
    
Such O O O O
a O O O O
response O O O O
was O O O O
consistent O O O O
with O O O O
the O O O O
notion O O O O
that O O O O
the O O O O
effect O O O O
induced O O O O
by O O O O
high O O O O
PMKT O O O O
concentrations O O O O
lies O O O O
in O O O O
an O O O O
alteration O O O O
to O O O O
the O O O O
ionic O O O O
homeostasis O O O O
of O O O O
the O O O O
sensitive O O O O
cell O O O O
. O O O O
    
By O O O O
contrast O O O O
, O O O O
the O O O O
evidence O O O O
presented O O O O
here O O O O
shows O O O O
that O O O O
low O O O O
PMKT O O O O
doses O O O O
lead O O O O
to O O O O
a O O O O
cell O O O O
death O O O O
process O O O O
in O O O O
Saccharomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cerevisiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
accompanied O O O O
by O O O O
cytological O O O O
and O O O O
biochemical O O O O
indicators O O O O
of O O O O
apoptotic O O O O
programmed O O O O
cell O O O O
death O O O O
, O O O O
namely O O O O
, O O O O
the O O O O
production O O O O
of O O O O
reactive O O O O
oxygen O O O O
species O O O O
, O O O O
DNA O O O O
strand O O O O
breaks O O O O
, O O O O
metacaspase O O O O
activation O O O O
and O O O O
cytochrome O O O O
c O O O O
release O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
dying O O O O
cells O O O O
progressed O O O O
from O O O O
an O O O O
apoptotic O O O O
state O O O O
to O O O O
a O O O O
secondary O O O O
necrotic O O O O
state O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
rate O O O O
at O O O O
which O O O O
this O O O O
change O O O O
occurred O O O O
was O O O O
proportional O O O O
to O O O O
the O O O O
intensity O O O O
of O O O O
the O O O O
stimulus O O O O
. O O O O
    
We O O O O
have O O O O
explored O O O O
the O O O O
global O O O O
gene O O O O
expression O O O O
response O O O O
of O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cerevisiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
during O O O O
that O O O O
stimulus O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
obtained O O O O
from O O O O
DNA O O O O
microarrays O O O O
indicate O O O O
that O O O O
genes O O O O
related O O O O
with O O O O
an O O O O
oxidative O O O O
stress O O O O
response O O O O
were O O O O
induced O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
proapoptotic O O O O
concentrations O O O O
of O O O O
PMKT O O O O
, O O O O
showing O O O O
that O O O O
the O O O O
coordinated O O O O
transcriptional O O O O
response O O O O
is O O O O
not O O O O
coincident O O O O
with O O O O
that O O O O
obtained O O O O
when O O O O
ionophoric O O O O
concentrations O O O O
of O O O O
PMKT O O O O
are O O O O
used O O O O
. O O O O
    
By O O O O
contrast O O O O
, O O O O
cwp2Delta O O O O
mutants O O O O
showed O O O O
no O O O O
signs O O O O
of O O O O
apoptosis O O O O
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
the O O O O
initial O O O O
steps O O O O
of O O O O
the O O O O
killer O O O O
mechanism O O O O
coincide O O O O
when O O O O
proapoptotic O O O O
( O O O O
low O O O O
) O O O O
or O O O O
ionophoric O O O O
( O O O O
high O O O O
) O O O O
PMKT O O O O
concentrations O O O O
are O O O O
used O O O O
. O O O O
    
Additionally O O O O
, O O O O
low O O O O
dosages O O O O
of O O O O
PMKT O O O O
promoted O O O O
Hog1p O O O O
phosphorylation O O O O
and O O O O
glycerol O O O O
accumulation O O O O
. O O O O
    
Limitation O O O O
of O O O O
Sludge O O O O
Biotic O O O O
Index O O O O
application O O O O
for O O O O
control O O O O
of O O O O
a O O O O
wastewater O O O O
treatment O O O O
plant O O O O
working O O O O
with O O O O
shock O O O O
organic O O O O
and O O O O
ammonium O O O O
loadings O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
aimed O O O O
to O O O O
determine O O O O
the O O O O
relationship O O O O
between O O O O
activated O O O O
sludge O O O O
microfauna O O O O
, O O O O
the O O O O
sludge O O O O
biotic O O O O
index O O O O
( O O O O
SBI O O O O
) O O O O
and O O O O
the O O O O
effluent O O O O
quality O O O O
of O O O O
a O O O O
full O O O O
- O O O O
scale O O O O
municipal O O O O
wastewater O O O O
treatment O O O O
plant O O O O
( O O O O
WWTP O O O O
) O O O O
working O O O O
with O O O O
shock O O O O
organic O O O O
and O O O O
ammonium O O O O
loadings O O O O
caused O O O O
by O O O O
periodic O O O O
wastewater O O O O
delivery O O O O
from O O O O
septic O O O O
tanks O O O O
. O O O O
    
Irrespective O O O O
of O O O O
high O O O O
/ O O O O
low O O O O
effluent O O O O
quality O O O O
in O O O O
terms O O O O
of O O O O
COD O O O O
, O O O O
BOD O O O O
( O O O O
5 O O O O
) O O O O
, O O O O
ammonium O O O O
and O O O O
suspended O O O O
solids O O O O
, O O O O
high O O O O
SBI O O O O
values O O O O
( O O O O
8 O O O O
- O O O O
10 O O O O
) O O O O
, O O O O
which O O O O
correspond O O O O
to O O O O
the O O O O
first O O O O
quality O O O O
class O O O O
of O O O O
sludge O O O O
, O O O O
were O O O O
observed O O O O
. O O O O
    
High O O O O
SBI O O O O
values O O O O
were O O O O
connected O O O O
with O O O O
abundant O O O O
taxonomic O O O O
composition O O O O
and O O O O
the O O O O
domination O O O O
of O O O O
crawling O O O O
ciliates O O O O
with O O O O
shelled O O O O
amoebae O O O O
and O O O O
attached O O O O
ciliates O O O O
. O O O O
    
High O O O O
SBI O O O O
values O O O O
, O O O O
even O O O O
at O O O O
a O O O O
low O O O O
effluent O O O O
quality O O O O
, O O O O
limit O O O O
the O O O O
usefulness O O O O
of O O O O
the O O O O
index O O O O
for O O O O
monitoring O O O O
the O O O O
status O O O O
of O O O O
an O O O O
activated O O O O
sludge O O O O
system O O O O
and O O O O
the O O O O
effluent O O O O
quality O O O O
in O O O O
municipal O O O O
WWTP O O O O
- O O O O
treated O O O O
wastewater O O O O
from O O O O
septic O O O O
tanks O O O O
. O O O O
    
It O O O O
was O O O O
shown O O O O
that O O O O
a O O O O
more O O O O
sensitive O O O O
indicator O O O O
of O O O O
effluent O O O O
quality O O O O
was O O O O
a O O O O
change O O O O
in O O O O
the O O O O
abundance O O O O
of O O O O
attached O O O O
ciliates O O O O
with O O O O
a O O O O
narrow O O O O
peristome O O O O
( O O O O
Vorticella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infusionum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Opercularia O O O O
coarctata O O O O
) O O O O
, O O O O
small O O O O
flagellates O O O O
and O O O O
crawling O O O O
ciliates O O O O
( O O O O
Acineria O O O O
uncinata O O O O
) O O O O
feeding O O O O
on O O O O
flagellates O O O O
. O O O O
    
Microtubule O O O O
dynamics O O O O
in O O O O
mitosis O O O O
in O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Mitosis O O O O
in O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
very O O O O
rapid O O O O
, O O O O
requiring O O O O
less O O O O
than O O O O
5 O O O O
min O O O O
at O O O O
37 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
in O O O O
germlings O O O O
( O O O O
Bergen O O O O
and O O O O
Morris O O O O
, O O O O
1983 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
time O O O O
the O O O O
cytoplasmic O O O O
microtubules O O O O
( O O O O
MTs O O O O
) O O O O
must O O O O
disassemble O O O O
, O O O O
the O O O O
mitotic O O O O
spindle O O O O
assemble O O O O
, O O O O
function O O O O
and O O O O
disassemble O O O O
, O O O O
and O O O O
cytoplasmic O O O O
MTs O O O O
reassemble O O O O
. O O O O
    
It O O O O
follows O O O O
that O O O O
cytoplasmic O O O O
MTs O O O O
must O O O O
be O O O O
extremely O O O O
dynamic O O O O
in O O O O
this O O O O
period O O O O
and O O O O
we O O O O
were O O O O
interested O O O O
, O O O O
in O O O O
particular O O O O
, O O O O
in O O O O
examining O O O O
the O O O O
processes O O O O
of O O O O
MT O O O O
disassembly O O O O
in O O O O
prophase O O O O
and O O O O
reassembly O O O O
in O O O O
anaphase O O O O
and O O O O
telophase O O O O
. O O O O
    
We O O O O
observed O O O O
a O O O O
diploid O O O O
strain O O O O
that O O O O
expressed O O O O
GFP O O O O
- O O O O
alpha O O O O
- O O O O
tubulin O O O O
. O O O O
    
We O O O O
used O O O O
a O O O O
spinning O O O O
disk O O O O
confocal O O O O
microscope O O O O
that O O O O
allowed O O O O
rapid O O O O
image O O O O
capture O O O O
, O O O O
which O O O O
proved O O O O
necessary O O O O
because O O O O
microtubule O O O O
dynamics O O O O
were O O O O
extremely O O O O
rapid O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
, O O O O
for O O O O
the O O O O
first O O O O
time O O O O
, O O O O
that O O O O
microtubule O O O O
severing O O O O
occurs O O O O
in O O O O
prophase O O O O
in O O O O
a O O O O
filamentous O O O O
fungus O O O O
and O O O O
that O O O O
catastrophe O O O O
rather O O O O
than O O O O
nucleation O O O O
limits O O O O
astral O O O O
microtubule O O O O
growth O O O O
. O O O O
    
Fluorescent O O O O
protein O O O O
fusions O O O O
in O O O O
Candida B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
guilliermondii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Candida B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
guilliermondii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
an O O O O
emerging O O O O
fungal O O O O
agent O O O O
of O O O O
candidiasis O O O O
often O O O O
associated O O O O
with O O O O
oncology O O O O
patients O O O O
. O O O O
    
This O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
also O O O O
remains O O O O
a O O O O
promising O O O O
biotechnological O O O O
model O O O O
for O O O O
the O O O O
industrial O O O O
production O O O O
of O O O O
value O O O O
- O O O O
added O O O O
metabolites O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
present O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
developed O O O O
a O O O O
recipient O O O O
strain O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
a O O O O
set O O O O
of O O O O
plasmids O O O O
for O O O O
construction O O O O
of O O O O
fluorescent O O O O
protein O O O O
( O O O O
FP O O O O
) O O O O
fusions O O O O
in O O O O
this O O O O
species O O O O
. O O O O
    
We O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
guilliermondii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
phosphoglycerate O O O O
kinase O O O O
transcription O O O O
- O O O O
regulating O O O O
sequences O O O O
allow O O O O
a O O O O
constitutive O O O O
expression O O O O
of O O O O
codon O O O O
- O O O O
optimized O O O O
green O O O O
, O O O O
cyan O O O O
, O O O O
yellow O O O O
and O O O O
mCherry O O O O
FP O O O O
genes O O O O
in O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
guilliermondii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cells O O O O
and O O O O
the O O O O
fluorescence O O O O
signal O O O O
could O O O O
be O O O O
directly O O O O
observed O O O O
at O O O O
the O O O O
colony O O O O
and O O O O
blastospore O O O O
level O O O O
by O O O O
epifluorescence O O O O
microcopy O O O O
. O O O O
    
To O O O O
illustrate O O O O
differential O O O O
targeting O O O O
of O O O O
the O O O O
FPs O O O O
into O O O O
specified O O O O
cellular O O O O
compartments O O O O
, O O O O
we O O O O
studied O O O O
and O O O O
validated O O O O
the O O O O
expected O O O O
subcellular O O O O
localization O O O O
of O O O O
various O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
guilliermondii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
predicted O O O O
proteins O O O O
fused O O O O
to O O O O
FPs O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
co O O O O
- O O O O
expression O O O O
experiments O O O O
of O O O O
various O O O O
couples O O O O
of O O O O
FP O O O O
- O O O O
tagged O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
guilliermondii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
predicted O O O O
proteins O O O O
in O O O O
the O O O O
same O O O O
cell O O O O
showed O O O O
that O O O O
the O O O O
fluorescence O O O O
of O O O O
each O O O O
FP O O O O
could O O O O
be O O O O
detected O O O O
independently O O O O
, O O O O
providing O O O O
firm O O O O
evidences O O O O
that O O O O
YFP O O O O
/ O O O O
CFP O O O O
and O O O O
GFP O O O O
/ O O O O
mCherry O O O O
pairs O O O O
can O O O O
be O O O O
used O O O O
for O O O O
dual O O O O
labeling O O O O
in O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
guilliermondii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cells O O O O
. O O O O
    
This O O O O
technical O O O O
advance O O O O
will O O O O
facilitate O O O O
future O O O O
studies O O O O
of O O O O
protein O O O O
co O O O O
- O O O O
expression O O O O
and O O O O
co O O O O
- O O O O
localization O O O O
in O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
guilliermondii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
will O O O O
give O O O O
precious O O O O
help O O O O
for O O O O
elucidating O O O O
new O O O O
molecular O O O O
events O O O O
supporting O O O O
pathogenicity O O O O
, O O O O
antifungal O O O O
resistance O O O O
and O O O O
for O O O O
exploring O O O O
the O O O O
potential O O O O
of O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
metabolic O O O O
engineering O O O O
. O O O O
    
Insertion O O O O
of O O O O
an O O O O
intact O O O O
CR1 O O O O
retrotransposon O O O O
in O O O O
a O O O O
cadherin O O O O
gene O O O O
linked O O O O
with O O O O
Bt O O O O
resistance O O O O
in O O O O
the O O O O
pink B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bollworm O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Pectinophora B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
gossypiella O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Three O O O O
mutations O O O O
in O O O O
the O O O O
Pectinophora B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
gossypiella O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cadherin O O O O
gene O O O O
PgCad1 O O O O
are O O O O
linked O O O O
with O O O O
resistance O O O O
to O O O O
Bacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
thuringiensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Bt B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
toxin O O O O
Cry1Ac O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
show O O O O
that O O O O
the O O O O
r3 O O O O
mutation O O O O
entails O O O O
recent O O O O
insertion O O O O
into O O O O
PgCad1 O O O O
of O O O O
an O O O O
active O O O O
chicken B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
repeat O O O O
( O O O O
CR1 O O O O
) O O O O
retrotransposon O O O O
, O O O O
designated O O O O
CR1 O O O O
- O O O O
1 O O O O
_ O O O O
Pg O O O O
. O O O O
    
Unlike O O O O
most O O O O
other O O O O
CR1 O O O O
elements O O O O
, O O O O
CR1 O O O O
- O O O O
1 O O O O
_ O O O O
Pg O O O O
is O O O O
intact O O O O
, O O O O
transcribed O O O O
by O O O O
a O O O O
flanking O O O O
promoter O O O O
, O O O O
contains O O O O
target O O O O
site O O O O
duplications O O O O
and O O O O
has O O O O
a O O O O
relatively O O O O
low O O O O
number O O O O
of O O O O
copies O O O O
. O O O O
    
Examination O O O O
of O O O O
transcripts O O O O
from O O O O
the O O O O
PgCad1 O O O O
locus O O O O
revealed O O O O
that O O O O
CR1 O O O O
- O O O O
1 O O O O
_ O O O O
Pg O O O O
disrupts O O O O
both O O O O
the O O O O
cadherin O O O O
protein O O O O
and O O O O
a O O O O
long O O O O
noncoding O O O O
RNA O O O O
of O O O O
unknown O O O O
function O O O O
. O O O O
    
Together O O O O
with O O O O
previously O O O O
reported O O O O
data O O O O
, O O O O
these O O O O
findings O O O O
show O O O O
that O O O O
transposable O O O O
elements O O O O
disrupt O O O O
eight O O O O
of O O O O
12 O O O O
cadherin O O O O
alleles O O O O
linked O O O O
with O O O O
resistance O O O O
to O O O O
Cry1Ac O O O O
in O O O O
three O O O O
lepidopteran O O O O
species O O O O
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
the O O O O
cadherin O O O O
locus O O O O
is O O O O
a O O O O
common O O O O
target O O O O
for O O O O
disruption O O O O
by O O O O
transposable O O O O
elements O O O O
. O O O O
    
Application O O O O
of O O O O
the O O O O
systematic O O O O
"""" O O O O
DAmP O O O O
"""" O O O O
approach O O O O
to O O O O
create O O O O
a O O O O
partially O O O O
defective O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
mutant O O O O
. O O O O
    
An O O O O
understanding O O O O
of O O O O
gene O O O O
function O O O O
often O O O O
relies O O O O
upon O O O O
creating O O O O
multiple O O O O
kinds O O O O
of O O O O
alleles O O O O
. O O O O
    
Functional O O O O
analysis O O O O
in O O O O
Candida B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
a O O O O
major O O O O
fungal O O O O
pathogen O O O O
, O O O O
has O O O O
generally O O O O
included O O O O
characterization O O O O
of O O O O
mutant O O O O
strains O O O O
with O O O O
insertion O O O O
or O O O O
deletion O O O O
alleles O O O O
and O O O O
over O O O O
- O O O O
expression O O O O
alleles O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
use O O O O
in O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
another O O O O
type O O O O
of O O O O
allele O O O O
that O O O O
has O O O O
been O O O O
employed O O O O
effectively O O O O
in O O O O
the O O O O
model O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
Saccharomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cerevisiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
a O O O O
"""" O O O O
Decreased O O O O
Abundance O O O O
by O O O O
mRNA O O O O
Perturbation O O O O
"""" O O O O
( O O O O
DAmP O O O O
) O O O O
allele O O O O
( O O O O
Yan O O O O
et O O O O
al O O O O
. O O O O
, O O O O
2008 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
DAmP O O O O
alleles O O O O
are O O O O
created O O O O
systematically O O O O
through O O O O
replacement O O O O
of O O O O
30 O O O O
noncoding O O O O
regions O O O O
with O O O O
nonfunctional O O O O
heterologous O O O O
sequences O O O O
, O O O O
and O O O O
thus O O O O
are O O O O
broadly O O O O
applicable O O O O
. O O O O
    
We O O O O
used O O O O
a O O O O
DAmP O O O O
allele O O O O
to O O O O
probe O O O O
the O O O O
function O O O O
of O O O O
Sun41 O O O O
, O O O O
a O O O O
surface O O O O
protein O O O O
with O O O O
roles O O O O
in O O O O
cell O O O O
wall O O O O
integrity O O O O
, O O O O
cell O O O O
- O O O O
cell O O O O
adherence O O O O
, O O O O
hyphal O O O O
formation O O O O
, O O O O
and O O O O
biofilm O O O O
formation O O O O
that O O O O
has O O O O
been O O O O
suggested O O O O
as O O O O
a O O O O
possible O O O O
therapeutic O O O O
target O O O O
( O O O O
Firon O O O O
et O O O O
al O O O O
. O O O O
, O O O O
2007 O O O O
; O O O O
Hiller O O O O
et O O O O
al O O O O
. O O O O
, O O O O
2007 O O O O
; O O O O
Norice O O O O
et O O O O
al O O O O
. O O O O
, O O O O
2007 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
A O O O O
SUN41 O O O O
- O O O O
DAmP O O O O
allele O O O O
results O O O O
in O O O O
approximately O O O O
10 O O O O
- O O O O
fold O O O O
reduced O O O O
levels O O O O
of O O O O
SUN41 O O O O
RNA O O O O
, O O O O
and O O O O
yields O O O O
intermediate O O O O
phenotypes O O O O
in O O O O
most O O O O
assays O O O O
. O O O O
    
We O O O O
report O O O O
that O O O O
a O O O O
sun41Delta O O O O
/ O O O O
Delta O O O O
mutant O O O O
is O O O O
defective O O O O
in O O O O
biofilm O O O O
formation O O O O
in O O O O
vivo O O O O
, O O O O
and O O O O
that O O O O
the O O O O
SUN41 O O O O
- O O O O
DAmP O O O O
allele O O O O
complements O O O O
that O O O O
defect O O O O
. O O O O
    
This O O O O
finding O O O O
argues O O O O
that O O O O
Sun41 O O O O
may O O O O
not O O O O
be O O O O
an O O O O
ideal O O O O
therapeutic O O O O
target O O O O
for O O O O
biofilm O O O O
inhibition O O O O
, O O O O
since O O O O
a O O O O
90 O O O O
% O O O O
decrease O O O O
in O O O O
activity O O O O
has O O O O
little O O O O
effect O O O O
on O O O O
biofilm O O O O
formation O O O O
in O O O O
vivo O O O O
. O O O O
    
We O O O O
anticipate O O O O
that O O O O
DAmP O O O O
alleles O O O O
of O O O O
C O O O O
. O O O O
albicans O O O O
genes O O O O
will O O O O
be O O O O
informative O O O O
for O O O O
analysis O O O O
of O O O O
other O O O O
prospective O O O O
drug O O O O
targets O O O O
, O O O O
including O O O O
essential O O O O
genes O O O O
. O O O O
    
The O O O O
metalloreductase O O O O
FreB O O O O
is O O O O
involved O O O O
in O O O O
adaptation O O O O
of O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
to O O O O
iron O O O O
starvation O O O O
. O O O O
    
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
employs O O O O
two O O O O
high O O O O
affinity O O O O
iron O O O O
uptake O O O O
mechanisms O O O O
, O O O O
siderophore O O O O
mediated O O O O
iron O O O O
uptake O O O O
and O O O O
reductive O O O O
iron O O O O
assimilation O O O O
( O O O O
RIA O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
genome O O O O
encodes O O O O
15 O O O O
putative O O O O
metalloreductases O O O O
( O O O O
MR O O O O
) O O O O
but O O O O
the O O O O
ferrireductasesinvolved O O O O
in O O O O
RIA O O O O
remained O O O O
elusive O O O O
so O O O O
far O O O O
. O O O O
    
Expression O O O O
of O O O O
the O O O O
MR O O O O
FreB O O O O
was O O O O
found O O O O
to O O O O
be O O O O
transcriptionally O O O O
repressed O O O O
by O O O O
iron O O O O
via O O O O
SreA O O O O
, O O O O
a O O O O
repressor O O O O
of O O O O
iron O O O O
acquisition O O O O
during O O O O
iron O O O O
sufficiency O O O O
, O O O O
indicating O O O O
a O O O O
role O O O O
in O O O O
iron O O O O
metabolism O O O O
. O O O O
    
FreB O O O O
- O O O O
inactivation O O O O
by O O O O
gene O O O O
deletion O O O O
was O O O O
phenotypically O O O O
largely O O O O
inconspicuous O O O O
unless O O O O
combined O O O O
with O O O O
inactivation O O O O
of O O O O
the O O O O
siderophore O O O O
system O O O O
, O O O O
which O O O O
then O O O O
decreased O O O O
growth O O O O
rate O O O O
, O O O O
surface O O O O
ferrireductase O O O O
activity O O O O
and O O O O
oxidative O O O O
stress O O O O
resistance O O O O
during O O O O
iron O O O O
starvation O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
also O O O O
revealed O O O O
that O O O O
loss O O O O
of O O O O
copper O O O O
- O O O O
independent O O O O
siderophore O O O O
- O O O O
mediated O O O O
iron O O O O
uptake O O O O
increases O O O O
sensitivity O O O O
of O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
to O O O O
copper O O O O
starvation O O O O
due O O O O
to O O O O
copper O O O O
- O O O O
dependence O O O O
of O O O O
RIA O O O O
. O O O O
    
Expression O O O O
and O O O O
functional O O O O
characterisation O O O O
of O O O O
TNC O O O O
, O O O O
a O O O O
high O O O O
- O O O O
affinity O O O O
nickel O O O O
transporter O O O O
from O O O O
Neurospora B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
crassa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Our O O O O
previous O O O O
in O O O O
silico O O O O
studies O O O O
identified O O O O
a O O O O
high O O O O
- O O O O
affinity O O O O
nickel O O O O
transporter O O O O
, O O O O
TNC O O O O
, O O O O
from O O O O
the O O O O
metal O O O O
transportome O O O O
of O O O O
Neurospora B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
crassa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
A O O O O
knockout O O O O
mutant O O O O
of O O O O
the O O O O
tnc O O O O
gene O O O O
in O O O O
N B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
crassa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
failed O O O O
to O O O O
transport O O O O
nickel O O O O
, O O O O
showed O O O O
phenotypic O O O O
growth O O O O
defects O O O O
and O O O O
diminished O O O O
urease O O O O
activity O O O O
under O O O O
physiological O O O O
levels O O O O
of O O O O
nickel O O O O
. O O O O
    
Transport O O O O
assays O O O O
conducted O O O O
in O O O O
wild O O O O
type O O O O
and O O O O
knockout O O O O
mutant O O O O
strains O O O O
showed O O O O
that O O O O
TNC O O O O
transports O O O O
nickel O O O O
withhigh O O O O
affinity O O O O
but O O O O
exhibits O O O O
selectivity O O O O
for O O O O
other O O O O
transition O O O O
metal O O O O
ions O O O O
like O O O O
cobalt O O O O
. O O O O
    
Heterologous O O O O
complementation O O O O
of O O O O
Schizosaccharomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pombe O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nickel O O O O
uptake O O O O
mutant O O O O
by O O O O
TNC O O O O
further O O O O
substantiates O O O O
its O O O O
nickel O O O O
transport O O O O
function O O O O
. O O O O
    
Transcriptional O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
nickel O O O O
transporter O O O O
encoding O O O O
gene O O O O
, O O O O
tnc O O O O
in O O O O
N B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
crassa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
by O O O O
qRT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
showed O O O O
its O O O O
constitutive O O O O
expression O O O O
in O O O O
various O O O O
phases O O O O
of O O O O
its O O O O
life O O O O
cycle O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
levels O O O O
of O O O O
the O O O O
corresponding O O O O
protein O O O O
TNC O O O O
were O O O O
down O O O O
- O O O O
regulated O O O O
only O O O O
by O O O O
increasing O O O O
the O O O O
nickel O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
cobalt O O O O
concentration O O O O
in O O O O
the O O O O
media O O O O
. O O O O
    
Immunolocalisation O O O O
data O O O O
suggested O O O O
that O O O O
TNC O O O O
is O O O O
distributed O O O O
in O O O O
the O O O O
plasma O O O O
membrane O O O O
of O O O O
N B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
crassa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
the O O O O
present O O O O
study O O O O
establishes O O O O
TNC O O O O
as O O O O
a O O O O
functional O O O O
plasma O O O O
membrane O O O O
nickel O O O O
transporter O O O O
necessary O O O O
for O O O O
physiological O O O O
acquisition O O O O
of O O O O
nickel O O O O
in O O O O
the O O O O
multicellular O O O O
fungi O O O O
N B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
crassa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
effects O O O O
of O O O O
dsRNA O O O O
mycoviruses O O O O
on O O O O
growth O O O O
and O O O O
murine O O O O
virulence O O O O
of O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Some O O O O
isolates O O O O
of O O O O
the O O O O
opportunistic O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pathogenic O O O O
fungus O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
are O O O O
known O O O O
to O O O O
be O O O O
infected O O O O
with O O O O
mycoviruses O O O O
. O O O O
    
The O O O O
dsRNA O O O O
genomes O O O O
of O O O O
two O O O O
of O O O O
these O O O O
mycoviruses O O O O
, O O O O
which O O O O
include O O O O
a O O O O
chrysovirus O O O O
and O O O O
a O O O O
partitivirus O O O O
, O O O O
have O O O O
been O O O O
completely O O O O
sequenced O O O O
and O O O O
an O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
assay O O O O
for O O O O
the O O O O
viruses O O O O
has O O O O
been O O O O
developed O O O O
. O O O O
    
Through O O O O
curing O O O O
virus O O O O
- O O O O
infected O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
isolates O O O O
by O O O O
cycloheximide O O O O
treatment O O O O
and O O O O
transfecting O O O O
virus O O O O
- O O O O
free O O O O
isolates O O O O
with O O O O
purified O O O O
virus O O O O
, O O O O
as O O O O
checked O O O O
by O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
, O O O O
isogenic O O O O
virus O O O O
- O O O O
free O O O O
and O O O O
virus O O O O
- O O O O
infected O O O O
lines O O O O
of O O O O
the O O O O
fungus O O O O
were O O O O
generated O O O O
whose O O O O
phenotypes O O O O
and O O O O
growth O O O O
have O O O O
been O O O O
directly O O O O
compared O O O O
. O O O O
    
Mycovirus O O O O
infection O O O O
of O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
with O O O O
either O O O O
the O O O O
chrysovirus O O O O
or O O O O
the O O O O
partitivirus O O O O
resulted O O O O
in O O O O
significant O O O O
aberrant O O O O
phenotypic O O O O
alterations O O O O
and O O O O
attenuation O O O O
of O O O O
growth O O O O
of O O O O
the O O O O
fungus O O O O
but O O O O
had O O O O
no O O O O
effect O O O O
on O O O O
susceptibility O O O O
to O O O O
common O O O O
antifungals O O O O
. O O O O
    
Chrysovirus O O O O
infection O O O O
of O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
caused O O O O
no O O O O
significant O O O O
alterations O O O O
to O O O O
murine O O O O
pathogenicity O O O O
. O O O O
    
Gene O O O O
expression O O O O
associated O O O O
with O O O O
vegetative O O O O
incompatibility O O O O
in O O O O
Amylostereum B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
areolatum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
In O O O O
filamentous O O O O
fungi O O O O
, O O O O
vegetative O O O O
compatibility O O O O
among O O O O
individuals O O O O
of O O O O
the O O O O
same O O O O
species O O O O
is O O O O
determined O O O O
by O O O O
the O O O O
genes O O O O
encoded O O O O
at O O O O
the O O O O
heterokaryon O O O O
incompatibility O O O O
( O O O O
het O O O O
) O O O O
loci O O O O
. O O O O
    
The O O O O
hyphae O O O O
of O O O O
genetically O O O O
similar O O O O
individuals O O O O
that O O O O
share O O O O
the O O O O
same O O O O
allelic O O O O
specificities O O O O
at O O O O
their O O O O
het O O O O
loci O O O O
are O O O O
able O O O O
to O O O O
fuse O O O O
and O O O O
intermingle O O O O
, O O O O
while O O O O
different O O O O
allelic O O O O
specificities O O O O
at O O O O
the O O O O
het O O O O
loci O O O O
result O O O O
in O O O O
cell O O O O
death O O O O
of O O O O
the O O O O
interacting O O O O
hyphae O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
suppression O O O O
subtractive O O O O
hybridization O O O O
( O O O O
SSH O O O O
) O O O O
followed O O O O
by O O O O
pyrosequencing O O O O
and O O O O
quantitative O O O O
reverse O O O O
transcription O O O O
PCR O O O O
were O O O O
used O O O O
to O O O O
identify O O O O
genes O O O O
that O O O O
are O O O O
selectively O O O O
expressed O O O O
when O O O O
vegetatively O O O O
incompatible O O O O
individuals O O O O
of O O O O
Amylostereum B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
areolatum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
interact O O O O
. O O O O
    
The O O O O
SSH O O O O
library O O O O
contained O O O O
genes O O O O
associated O O O O
with O O O O
various O O O O
cellular O O O O
processes O O O O
, O O O O
including O O O O
cell O O O O
- O O O O
cell O O O O
adhesion O O O O
, O O O O
stress O O O O
and O O O O
defence O O O O
responses O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
cell O O O O
death O O O O
. O O O O
    
Some O O O O
of O O O O
the O O O O
transcripts O O O O
encoded O O O O
proteins O O O O
that O O O O
were O O O O
previously O O O O
implicated O O O O
in O O O O
the O O O O
stress O O O O
and O O O O
defence O O O O
responses O O O O
associated O O O O
with O O O O
vegetative O O O O
incompatibility O O O O
. O O O O
    
Other O O O O
transcripts O O O O
encoded O O O O
proteins O O O O
known O O O O
to O O O O
be O O O O
associated O O O O
with O O O O
programmed O O O O
cell O O O O
death O O O O
, O O O O
but O O O O
have O O O O
not O O O O
previously O O O O
been O O O O
linked O O O O
with O O O O
vegetative O O O O
incompatibility O O O O
. O O O O
    
Results O O O O
of O O O O
this O O O O
study O O O O
have O O O O
considerably O O O O
increased O O O O
our O O O O
knowledge O O O O
of O O O O
the O O O O
processes O O O O
underlying O O O O
vegetative O O O O
incompatibility O O O O
in O O O O
Basidiomycetes O O O O
in O O O O
general O O O O
and O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
areolatum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
particular O O O O
. O O O O
    
Brief O O O O
exposures O O O O
of O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
body O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
lice O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
to O O O O
sublethal O O O O
amounts O O O O
of O O O O
ivermectin O O O O
over O O O O
- O O O O
transcribes O O O O
detoxification O O O O
genes O O O O
involved O O O O
in O O O O
tolerance O O O O
. O O O O
    
Transcriptional O O O O
profiling O O O O
results O O O O
, O O O O
using O O O O
our O O O O
non O O O O
- O O O O
invasive O O O O
induction O O O O
assay O O O O
{ O O O O
short O O O O
exposure O O O O
intervals O O O O
( O O O O
2 O O O O
- O O O O
5 O O O O
h O O O O
) O O O O
to O O O O
sublethal O O O O
amounts O O O O
of O O O O
insecticides O O O O
[ O O O O
& O O O O
lt O O O O
; O O O O
lethal O O O O
concentration O O O O
3 O O O O
% O O O O
( O O O O
LC O O O O
( O O O O
3 O O O O
) O O O O
) O O O O
at O O O O
24 O O O O
h O O O O
] O O O O
administered O O O O
by O O O O
stress O O O O
- O O O O
reducing O O O O
means O O O O
( O O O O
contact O O O O
vs O O O O
. O O O O
immersion O O O O
screen O O O O
) O O O O
and O O O O
with O O O O
induction O O O O
assessed O O O O
in O O O O
a O O O O
time O O O O
frame O O O O
when O O O O
tolerance O O O O
is O O O O
still O O O O
present O O O O
[ O O O O
~ O O O O
lethal O O O O
concentration O O O O
90 O O O O
% O O O O
( O O O O
LC O O O O
( O O O O
90 O O O O
) O O O O
) O O O O
in O O O O
2 O O O O
- O O O O
4 O O O O
h O O O O
] O O O O
} O O O O
, O O O O
showed O O O O
that O O O O
ivermectin O O O O
- O O O O
induced O O O O
detoxification O O O O
genes O O O O
from O O O O
body B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
lice O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
are O O O O
identified O O O O
by O O O O
quantitative O O O O
real O O O O
- O O O O
time O O O O
PCR O O O O
analyses O O O O
. O O O O
    
Of O O O O
the O O O O
cytochrome O O O O
P450 O O O O
monooxygenase O O O O
and O O O O
ATP O O O O
binding O O O O
cassette O O O O
transporter O O O O
genes O O O O
induced O O O O
by O O O O
ivermectin O O O O
, O O O O
CYP6CJ1 O O O O
, O O O O
CYP9AG1 O O O O
, O O O O
CYP9AG2 O O O O
and O O O O
PhABCC4 O O O O
were O O O O
respectively O O O O
most O O O O
significantly O O O O
over O O O O
- O O O O
expressed O O O O
, O O O O
had O O O O
high O O O O
basal O O O O
expression O O O O
levels O O O O
and O O O O
were O O O O
most O O O O
closely O O O O
related O O O O
to O O O O
genes O O O O
from O O O O
other O O O O
organisms O O O O
that O O O O
metabolized O O O O
insecticides O O O O
, O O O O
including O O O O
ivermectin O O O O
. O O O O
    
Injection O O O O
of O O O O
double O O O O
- O O O O
stranded O O O O
RNAs O O O O
( O O O O
dsRNAs O O O O
) O O O O
against O O O O
either O O O O
CYP9AG2 O O O O
or O O O O
PhABCC4 O O O O
into O O O O
non O O O O
- O O O O
induced O O O O
female O O O O
lice O O O O
reduced O O O O
their O O O O
respective O O O O
transcript O O O O
level O O O O
and O O O O
resulted O O O O
in O O O O
increased O O O O
sensitivity O O O O
to O O O O
ivermectin O O O O
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
these O O O O
two O O O O
genes O O O O
are O O O O
involved O O O O
in O O O O
the O O O O
xenobiotic O O O O
metabolism O O O O
of O O O O
ivermectin O O O O
and O O O O
in O O O O
the O O O O
production O O O O
of O O O O
tolerance O O O O
. O O O O
    
Influence O O O O
of O O O O
hormone O O O O
response O O O O
elements O O O O
( O O O O
HREs O O O O
) O O O O
on O O O O
ecdysteroid O O O O
receptor O O O O
concentration O O O O
. O O O O
    
Transcriptional O O O O
activity O O O O
of O O O O
nuclear O O O O
receptors O O O O
is O O O O
the O O O O
result O O O O
of O O O O
transactivation O O O O
capability O O O O
and O O O O
receptor O O O O
protein O O O O
concentration O O O O
. O O O O
    
The O O O O
concentration O O O O
of O O O O
ecdysteroid O O O O
receptor O O O O
( O O O O
EcR O O O O
) O O O O
constitutively O O O O
expressed O O O O
in O O O O
vertebrate O O O O
cells O O O O
varies O O O O
depending O O O O
on O O O O
the O O O O
isoforms O O O O
. O O O O
    
Besides O O O O
ligand O O O O
binding O O O O
and O O O O
heterodimerization O O O O
with O O O O
ultraspiracle O O O O
( O O O O
USP O O O O
) O O O O
, O O O O
which O O O O
stabilizes O O O O
receptor O O O O
protein O O O O
concentration O O O O
, O O O O
degradation O O O O
is O O O O
regulated O O O O
by O O O O
interaction O O O O
of O O O O
the O O O O
receptor O O O O
complex O O O O
with O O O O
different O O O O
ecdysteroid O O O O
response O O O O
elements O O O O
( O O O O
EcREs O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Coexpression O O O O
of O O O O
EcREs O O O O
significantly O O O O
reduces O O O O
ecdysteroid O O O O
receptor O O O O
concentration O O O O
depending O O O O
on O O O O
the O O O O
type O O O O
of O O O O
EcRE O O O O
. O O O O
    
Transcriptional O O O O
activity O O O O
and O O O O
interaction O O O O
with O O O O
hormone O O O O
response O O O O
elements O O O O
( O O O O
HREs O O O O
) O O O O
as O O O O
determined O O O O
by O O O O
Electrophoretic O O O O
Mobility O O O O
Shift O O O O
Assay O O O O
( O O O O
EMSA O O O O
) O O O O
are O O O O
often O O O O
inversely O O O O
related O O O O
to O O O O
receptor O O O O
protein O O O O
concentration O O O O
. O O O O
    
The O O O O
complex O O O O
regulation O O O O
of O O O O
receptor O O O O
protein O O O O
concentration O O O O
offers O O O O
an O O O O
additional O O O O
opportunity O O O O
to O O O O
regulate O O O O
transcriptional O O O O
activity O O O O
in O O O O
an O O O O
isoform O O O O
- O O O O
and O O O O
target O O O O
cell O O O O
- O O O O
specific O O O O
manner O O O O
and O O O O
allows O O O O
the O O O O
temporal O O O O
limitation O O O O
of O O O O
hormone O O O O
action O O O O
. O O O O
    
Galleria B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mellonella O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
as O O O O
model O O O O
host O O O O
for O O O O
the O O O O
trans O O O O
- O O O O
kingdom O O O O
pathogen O O O O
Fusarium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
oxysporum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Fusarium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
oxysporum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
the O O O O
causal O O O O
agent O O O O
of O O O O
vascular O O O O
wilt O O O O
disease O O O O
, O O O O
affects O O O O
a O O O O
wide O O O O
range O O O O
of O O O O
plant O O O O
species O O O O
and O O O O
can O O O O
produce O O O O
disseminated O O O O
infections O O O O
in O O O O
humans B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
oxysporum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
f O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
lycopersici O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
isolate O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
FGSC O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
9935 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
causes O O O O
disease O O O O
both O O O O
on O O O O
tomato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
plants O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
immunodepressed O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
making O O O O
it O O O O
an O O O O
ideal O O O O
model O O O O
for O O O O
the O O O O
comparative O O O O
analysis O O O O
of O O O O
fungal O O O O
virulence O O O O
on O O O O
plant O O O O
and O O O O
animal O O O O
hosts O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
tested O O O O
the O O O O
ability O O O O
of O O O O
FGSC B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
9935 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
to O O O O
cause O O O O
disease O O O O
in O O O O
the O O O O
greater B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
wax O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
moth O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Galleria B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mellonella O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
an O O O O
invertebrate O O O O
model O O O O
host O O O O
that O O O O
is O O O O
widely O O O O
used O O O O
for O O O O
the O O O O
study O O O O
of O O O O
microbial O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pathogens O O O O
. O O O O
    
Injection O O O O
of O O O O
living O O O O
but O O O O
not O O O O
of O O O O
heat O O O O
- O O O O
killed O O O O
microconidia O O O O
into O O O O
the O O O O
hemocoel O O O O
of O O O O
G B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
mellonella O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
larvae O O O O
resulted O O O O
in O O O O
dose O O O O
- O O O O
dependent O O O O
killing O O O O
both O O O O
at O O O O
30 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
and O O O O
at O O O O
37 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
. O O O O
    
Fluorescence O O O O
microscopy O O O O
of O O O O
larvae O O O O
inoculated O O O O
with O O O O
a O O O O
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
oxysporum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
transformant O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
expressing O O O O
GFP O O O O
revealed O O O O
hyphal O O O O
proliferation O O O O
within O O O O
the O O O O
hemocoel O O O O
, O O O O
interaction O O O O
with O O O O
G B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
mellonella O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
hemocytes O O O O
, O O O O
and O O O O
colonization O O O O
of O O O O
the O O O O
killed O O O O
insects O O O O
by O O O O
the O O O O
fungus O O O O
. O O O O
    
Fungal O O O O
gene O O O O
knockout O O O O
mutants O O O O
previously O O O O
tested O O O O
in O O O O
the O O O O
tomato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
immunodepressed O O O O
mouse B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
systems O O O O
displayed O O O O
a O O O O
good O O O O
correlation O O O O
in O O O O
virulence O O O O
between O O O O
the O O O O
Galleria O O O O
and O O O O
the O O O O
mouse B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
model O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
Galleria O O O O
represents O O O O
a O O O O
useful O O O O
non O O O O
- O O O O
vertebrate O O O O
infection O O O O
model O O O O
for O O O O
studying O O O O
virulence O O O O
mechanisms O O O O
of O O O O
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
oxysporum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
on O O O O
animal O O O O
hosts O O O O
. O O O O
    
The O O O O
structure O O O O
- O O O O
function O O O O
relationship O O O O
of O O O O
the O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fumigatuscyp51A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
L98H O O O O
conversion O O O O
by O O O O
site O O O O
- O O O O
directed O O O O
mutagenesis O O O O
: O O O O
the O O O O
mechanism O O O O
of O O O O
L98H O O O O
azole O O O O
resistance O O O O
. O O O O
    
Since O O O O
1998 O O O O
, O O O O
the O O O O
rapid O O O O
emergence O O O O
of O O O O
multi O O O O
- O O O O
azole O O O O
- O O O O
resistance O O O O
( O O O O
MAR O O O O
) O O O O
was O O O O
observed O O O O
in O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
the O O O O
Netherlands O O O O
. O O O O
    
Two O O O O
dominant O O O O
mutations O O O O
were O O O O
found O O O O
in O O O O
the O O O O
cyp51A O O O O
gene O O O O
, O O O O
a O O O O
34bp O O O O
tandem O O O O
repeat O O O O
( O O O O
TR O O O O
) O O O O
in O O O O
the O O O O
promoter O O O O
region O O O O
combined O O O O
with O O O O
a O O O O
leucine O O O O
to O O O O
histidine O O O O
substitution O O O O
at O O O O
codon O O O O
98 O O O O
( O O O O
L98H O O O O
) O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
show O O O O
that O O O O
molecular O O O O
dynamics O O O O
simulations O O O O
combined O O O O
with O O O O
site O O O O
- O O O O
directed O O O O
mutagenesis O O O O
of O O O O
amino O O O O
acid O O O O
substitutions O O O O
in O O O O
the O O O O
cyp51A O O O O
gene O O O O
, O O O O
correlate O O O O
to O O O O
the O O O O
structure O O O O
- O O O O
function O O O O
relationship O O O O
of O O O O
the O O O O
L98H O O O O
substitution O O O O
conferring O O O O
to O O O O
MAR O O O O
in O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Because O O O O
of O O O O
a O O O O
L98H O O O O
directed O O O O
change O O O O
in O O O O
the O O O O
flexibility O O O O
of O O O O
the O O O O
loops O O O O
, O O O O
that O O O O
comprise O O O O
a O O O O
gate O O O O
- O O O O
like O O O O
structure O O O O
in O O O O
the O O O O
protein O O O O
, O O O O
the O O O O
capacity O O O O
of O O O O
the O O O O
two O O O O
ligand O O O O
entry O O O O
channels O O O O
is O O O O
modified O O O O
by O O O O
narrowing O O O O
the O O O O
diameter O O O O
and O O O O
thereby O O O O
binding O O O O
of O O O O
azoles O O O O
is O O O O
obstructed O O O O
. O O O O
    
Moreover O O O O
, O O O O
the O O O O
L98H O O O O
induced O O O O
relocation O O O O
of O O O O
tyrosine O O O O
121 O O O O
and O O O O
tyrosine O O O O
107 O O O O
seems O O O O
to O O O O
be O O O O
related O O O O
to O O O O
the O O O O
MAR O O O O
phenotype O O O O
, O O O O
without O O O O
affecting O O O O
the O O O O
biological O O O O
activity O O O O
of O O O O
the O O O O
CYP51A O O O O
protein O O O O
. O O O O
    
Site O O O O
- O O O O
directed O O O O
mutagenesis O O O O
showed O O O O
that O O O O
both O O O O
the O O O O
34bp O O O O
TR O O O O
and O O O O
the O O O O
L98H O O O O
mutation O O O O
are O O O O
required O O O O
to O O O O
obtain O O O O
the O O O O
MAR O O O O
phenotype O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
the O O O O
amino O O O O
acid O O O O
leucine O O O O
in O O O O
codon O O O O
98 O O O O
in O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
highly O O O O
conserved O O O O
and O O O O
important O O O O
for O O O O
maintaining O O O O
the O O O O
structure O O O O
of O O O O
the O O O O
CYP51A O O O O
protein O O O O
that O O O O
is O O O O
essential O O O O
for O O O O
azole O O O O
docking O O O O
. O O O O
    
Overexpression O O O O
of O O O O
a O O O O
cytochrome O O O O
P450 O O O O
monooxygenase O O O O
, O O O O
CYP6ER1 O O O O
, O O O O
is O O O O
associated O O O O
with O O O O
resistance O O O O
to O O O O
imidacloprid O O O O
in O O O O
the O O O O
brown B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
planthopper O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Nilaparvata B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
lugens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
brown B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
planthopper O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Nilaparvata B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
lugens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
is O O O O
an O O O O
economically O O O O
significant O O O O
pest O O O O
of O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
throughout O O O O
Asia O O O O
and O O O O
has O O O O
evolved O O O O
resistance O O O O
to O O O O
many O O O O
insecticides O O O O
including O O O O
the O O O O
neonicotinoid O O O O
imidacloprid O O O O
. O O O O
    
The O O O O
resistance O O O O
of O O O O
field O O O O
populations O O O O
of O O O O
N B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
lugens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
to O O O O
imidacloprid O O O O
has O O O O
been O O O O
attributed O O O O
to O O O O
enhanced O O O O
detoxification O O O O
by O O O O
cytochrome O O O O
P450 O O O O
monooxygenases O O O O
( O O O O
P450s O O O O
) O O O O
, O O O O
although O O O O
, O O O O
to O O O O
date O O O O
, O O O O
the O O O O
causative O O O O
P450 O O O O
( O O O O
s O O O O
) O O O O
has O O O O
( O O O O
have O O O O
) O O O O
not O O O O
been O O O O
identified O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
present O O O O
study O O O O
, O O O O
biochemical O O O O
assays O O O O
using O O O O
the O O O O
model O O O O
substrate O O O O
7 O O O O
- O O O O
ethoxycoumarin O O O O
showed O O O O
enhanced O O O O
P450 O O O O
activity O O O O
in O O O O
several O O O O
resistant O O O O
N B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
lugens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
field O O O O
strains O O O O
when O O O O
compared O O O O
with O O O O
a O O O O
susceptible O O O O
reference O O O O
strain O O O O
. O O O O
    
Thirty O O O O
three O O O O
cDNA O O O O
sequences O O O O
encoding O O O O
tentative O O O O
unique O O O O
P450s O O O O
were O O O O
identified O O O O
from O O O O
two O O O O
recent O O O O
sequencing O O O O
projects O O O O
and O O O O
by O O O O
degenerate O O O O
PCR O O O O
. O O O O
    
The O O O O
mRNA O O O O
expression O O O O
level O O O O
of O O O O
32 O O O O
of O O O O
these O O O O
was O O O O
examined O O O O
in O O O O
susceptible O O O O
, O O O O
moderately O O O O
resistant O O O O
and O O O O
highly O O O O
resistant O O O O
N B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
lugens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strains O O O O
using O O O O
quantitative O O O O
real O O O O
- O O O O
time O O O O
PCR O O O O
. O O O O
    
A O O O O
single O O O O
P450 O O O O
gene O O O O
( O O O O
CYP6ER1 O O O O
) O O O O
was O O O O
highly O O O O
overexpressed O O O O
in O O O O
all O O O O
resistant O O O O
strains O O O O
( O O O O
up O O O O
to O O O O
40 O O O O
- O O O O
fold O O O O
) O O O O
and O O O O
the O O O O
level O O O O
of O O O O
expression O O O O
observed O O O O
in O O O O
the O O O O
different O O O O
N B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
lugens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strains O O O O
was O O O O
significantly O O O O
correlated O O O O
with O O O O
the O O O O
resistance O O O O
phenotype O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
provide O O O O
strong O O O O
evidence O O O O
for O O O O
a O O O O
role O O O O
of O O O O
CYP6ER1 O O O O
in O O O O
the O O O O
resistance O O O O
of O O O O
N B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
lugens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
to O O O O
imidacloprid O O O O
. O O O O
    
Differential O O O O
PbP27 O O O O
expression O O O O
in O O O O
the O O O O
yeast O O O O
and O O O O
mycelial O O O O
forms O O O O
of O O O O
the O O O O
Paracoccidioides B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
brasiliensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
species O O O O
complex O O O O
. O O O O
    
p27 O O O O
is O O O O
an O O O O
antigenic O O O O
protein O O O O
produced O O O O
by O O O O
Paracoccidioides B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
brasiliensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
the O O O O
etiologic O O O O
agent O O O O
of O O O O
paracoccidioidomycosis O O O O
( O O O O
PCM O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Despite O O O O
its O O O O
unknown O O O O
function O O O O
, O O O O
it O O O O
has O O O O
been O O O O
suggested O O O O
as O O O O
a O O O O
putative O O O O
virulence O O O O
factor O O O O
, O O O O
proposed O O O O
as O O O O
a O O O O
suitable O O O O
target O O O O
for O O O O
the O O O O
design O O O O
of O O O O
diagnostic O O O O
tools O O O O
and O O O O
vaccines O O O O
, O O O O
and O O O O
considered O O O O
as O O O O
an O O O O
enhancer O O O O
in O O O O
antifungal O O O O
treatment O O O O
of O O O O
PCM O O O O
. O O O O
    
We O O O O
evaluated O O O O
sequence O O O O
polymorphisms O O O O
of O O O O
PbP27 O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
among O O O O
isolates O O O O
, O O O O
finding O O O O
some O O O O
polymorphisms O O O O
associated O O O O
with O O O O
the O O O O
isolates O O O O
' O O O O
phylogenetic O O O O
origin O O O O
. O O O O
    
In O O O O
order O O O O
to O O O O
determine O O O O
if O O O O
there O O O O
was O O O O
a O O O O
differential O O O O
expression O O O O
pattern O O O O
between O O O O
morphological O O O O
states O O O O
and O O O O
among O O O O
isolates O O O O
, O O O O
we O O O O
also O O O O
evaluated O O O O
PbP27 O O O O
expression O O O O
, O O O O
at O O O O
transcriptional O O O O
and O O O O
translational O O O O
levels O O O O
, O O O O
in O O O O
mycelia O O O O
and O O O O
yeast O O O O
cultures O O O O
in O O O O
14 O O O O
isolates O O O O
belonging O O O O
to O O O O
the O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
brasiliensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
species O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
complex O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
S1 O O O O
, O O O O
PS2 O O O O
, O O O O
PS3 O O O O
, O O O O
and O O O O
"""" O O O O
Pb01 O O O O
- O O O O
like O O O O
"""" O O O O
, O O O O
proposed O O O O
to O O O O
be O O O O
named O O O O
Paracoccidioides B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
lutzii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
by O O O O
two O O O O
techniques O O O O
, O O O O
real O O O O
time O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
( O O O O
RT O O O O
- O O O O
qPCR O O O O
) O O O O
and O O O O
protein O O O O
dot O O O O
blot O O O O
. O O O O
    
For O O O O
the O O O O
latter O O O O
, O O O O
four O O O O
protein O O O O
extracts O O O O
from O O O O
different O O O O
cell O O O O
localizations O O O O
( O O O O
SDS O O O O
or O O O O
Beta O O O O
- O O O O
mercaptoethanol O O O O
, O O O O
cytoplasmic O O O O
and O O O O
extracellular O O O O
proteins O O O O
) O O O O
were O O O O
analyzed O O O O
for O O O O
each O O O O
isolate O O O O
. O O O O
    
p27 O O O O
was O O O O
present O O O O
in O O O O
the O O O O
four O O O O
extracts O O O O
evaluated O O O O
, O O O O
mainly O O O O
in O O O O
the O O O O
SDS O O O O
extract O O O O
, O O O O
corresponding O O O O
to O O O O
an O O O O
extract O O O O
containing O O O O
proteins O O O O
loosely O O O O
attached O O O O
to O O O O
the O O O O
cell O O O O
wall O O O O
. O O O O
    
This O O O O
information O O O O
correlates O O O O
with O O O O
immunohistochemical O O O O
analysis O O O O
, O O O O
where O O O O
positive O O O O
staining O O O O
of O O O O
the O O O O
yeasts O O O O
' O O O O
cell O O O O
wall O O O O
was O O O O
observed O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
that O O O O
p27 O O O O
was O O O O
present O O O O
in O O O O
all O O O O
isolates O O O O
, O O O O
mainly O O O O
in O O O O
the O O O O
yeast O O O O
form O O O O
. O O O O
    
This O O O O
pattern O O O O
was O O O O
corroborated O O O O
by O O O O
RT O O O O
- O O O O
qPCR O O O O
results O O O O
, O O O O
with O O O O
higher O O O O
expression O O O O
levels O O O O
found O O O O
in O O O O
the O O O O
yeast O O O O
form O O O O
for O O O O
most O O O O
of O O O O
the O O O O
isolates O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
provide O O O O
new O O O O
insights O O O O
into O O O O
the O O O O
expression O O O O
patterns O O O O
of O O O O
this O O O O
protein O O O O
, O O O O
and O O O O
further O O O O
characterize O O O O
it O O O O
in O O O O
view O O O O
of O O O O
potential O O O O
uses O O O O
as O O O O
a O O O O
diagnostic O O O O
and O O O O
/ O O O O
or O O O O
therapeutic O O O O
tool O O O O
. O O O O
    
Involvement O O O O
of O O O O
a O O O O
helix O O O O
- O O O O
loop O O O O
- O O O O
helix O O O O
transcription O O O O
factor O O O O
CHC O O O O
- O O O O
1 O O O O
in O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
- O O O O
mediated O O O O
conidiation O O O O
suppression O O O O
in O O O O
Neurospora B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
crassa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
morphological O O O O
switch O O O O
from O O O O
vegetative O O O O
growth O O O O
to O O O O
conidiation O O O O
in O O O O
filamentous O O O O
fungi O O O O
is O O O O
highly O O O O
regulated O O O O
, O O O O
but O O O O
the O O O O
understanding O O O O
of O O O O
the O O O O
regulatory O O O O
mechanisms O O O O
is O O O O
limited O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
by O O O O
screening O O O O
a O O O O
set O O O O
of O O O O
knock O O O O
- O O O O
out O O O O
mutants O O O O
corresponding O O O O
to O O O O
103 O O O O
transcription O O O O
factor O O O O
encoding O O O O
genes O O O O
in O O O O
Neurospora B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
crassa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
a O O O O
mutant O O O O
was O O O O
found O O O O
to O O O O
produce O O O O
abundant O O O O
conidia O O O O
in O O O O
race O O O O
tubes O O O O
in O O O O
which O O O O
conidiation O O O O
in O O O O
the O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
strain O O O O
was O O O O
suppressed O O O O
. O O O O
    
The O O O O
corresponding O O O O
gene O O O O
NCU00749 O O O O
encodes O O O O
a O O O O
protein O O O O
containing O O O O
a O O O O
helix O O O O
- O O O O
loop O O O O
- O O O O
helix O O O O
DNA O O O O
binding O O O O
region O O O O
. O O O O
    
Unlike O O O O
enhanced O O O O
conidiation O O O O
in O O O O
ras O O O O
- O O O O
1 O O O O
and O O O O
sod O O O O
- O O O O
1 O O O O
mutants O O O O
, O O O O
which O O O O
was O O O O
completely O O O O
suppressed O O O O
by O O O O
antioxidant O O O O
N O O O O
- O O O O
acetyl O O O O
cysteine O O O O
, O O O O
enhanced O O O O
conidiation O O O O
in O O O O
the O O O O
NCU00749 O O O O
mutant O O O O
was O O O O
only O O O O
slightly O O O O
affected O O O O
by O O O O
N O O O O
- O O O O
acetyl O O O O
cysteine O O O O
. O O O O
    
When O O O O
grown O O O O
on O O O O
slants O O O O
, O O O O
the O O O O
NCU00749 O O O O
deletion O O O O
mutant O O O O
exhibited O O O O
earlier O O O O
conidial O O O O
formation O O O O
than O O O O
the O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
strain O O O O
, O O O O
and O O O O
this O O O O
was O O O O
more O O O O
evident O O O O
at O O O O
a O O O O
higher O O O O
( O O O O
5 O O O O
% O O O O
) O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
concentration O O O O
. O O O O
    
Therefore O O O O
, O O O O
we O O O O
named O O O O
NCU00749 O O O O
as O O O O
conidiation O O O O
at O O O O
high O O O O
carbon O O O O
dioxide O O O O
- O O O O
1 O O O O
( O O O O
chc O O O O
- O O O O
1 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Genes O O O O
that O O O O
are O O O O
highly O O O O
expressed O O O O
during O O O O
conidial O O O O
development O O O O
, O O O O
eas O O O O
, O O O O
con O O O O
- O O O O
6 O O O O
, O O O O
con O O O O
- O O O O
8 O O O O
and O O O O
con O O O O
- O O O O
10 O O O O
, O O O O
were O O O O
transcribed O O O O
at O O O O
a O O O O
higher O O O O
rate O O O O
in O O O O
the O O O O
chc O O O O
- O O O O
1 O O O O
deletion O O O O
mutant O O O O
than O O O O
the O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
strain O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
conidiation O O O O
induction O O O O
. O O O O
    
To O O O O
determine O O O O
the O O O O
mechanisms O O O O
by O O O O
which O O O O
CHC O O O O
- O O O O
1 O O O O
regulates O O O O
conidiation O O O O
, O O O O
we O O O O
conducted O O O O
a O O O O
RNA O O O O
sequencing O O O O
analysis O O O O
and O O O O
found O O O O
that O O O O
404 O O O O
genes O O O O
exhibited O O O O
> O O O O
= O O O O
2 O O O O
fold O O O O
changes O O O O
in O O O O
transcription O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
chc O O O O
- O O O O
1 O O O O
deletion O O O O
. O O O O
    
Among O O O O
them O O O O
, O O O O
fluffy O O O O
and O O O O
ada O O O O
- O O O O
6 O O O O
, O O O O
two O O O O
transcription O O O O
factor O O O O
genes O O O O
that O O O O
positively O O O O
regulate O O O O
conidiation O O O O
in O O O O
N B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
crassa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
rca O O O O
- O O O O
1 O O O O
, O O O O
whose O O O O
homolog O O O O
flbD O O O O
in O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
essential O O O O
for O O O O
conidiation O O O O
, O O O O
were O O O O
upregulated O O O O
in O O O O
the O O O O
chc O O O O
- O O O O
1 O O O O
deletion O O O O
mutant O O O O
. O O O O
    
Results O O O O
of O O O O
RNA O O O O
sequencing O O O O
also O O O O
suggest O O O O
that O O O O
signal O O O O
transduction O O O O
via O O O O
the O O O O
cAMP O O O O
and O O O O
the O O O O
MAK O O O O
- O O O O
2 O O O O
mediated O O O O
signal O O O O
pathways O O O O
, O O O O
and O O O O
ROS O O O O
generation O O O O
and O O O O
removal O O O O
, O O O O
mechanisms O O O O
known O O O O
to O O O O
regulate O O O O
conidiation O O O O
, O O O O
are O O O O
not O O O O
involved O O O O
in O O O O
chc O O O O
- O O O O
1 O O O O
mediated O O O O
control O O O O
of O O O O
conidiation O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
, O O O O
chc O O O O
- O O O O
1 O O O O
also O O O O
influences O O O O
expression O O O O
of O O O O
genes O O O O
involved O O O O
in O O O O
other O O O O
important O O O O
biological O O O O
processes O O O O
besides O O O O
conidiation O O O O
such O O O O
as O O O O
carbon O O O O
metabolism O O O O
, O O O O
sphingolipid O O O O
synthesis O O O O
, O O O O
cell O O O O
wall O O O O
synthesis O O O O
, O O O O
and O O O O
calcium O O O O
signaling O O O O
. O O O O
    
Identification O O O O
and O O O O
characterization O O O O
of O O O O
a O O O O
putative O O O O
basic O O O O
helix O O O O
- O O O O
loop O O O O
- O O O O
helix O O O O
transcription O O O O
factor O O O O
involved O O O O
in O O O O
the O O O O
early O O O O
stage O O O O
of O O O O
conidiophore O O O O
development O O O O
in O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
oryzae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
helix O O O O
- O O O O
loop O O O O
- O O O O
helix O O O O
( O O O O
HLH O O O O
) O O O O
family O O O O
of O O O O
transcriptional O O O O
factors O O O O
is O O O O
a O O O O
key O O O O
player O O O O
in O O O O
a O O O O
wide O O O O
range O O O O
of O O O O
developmental O O O O
processes O O O O
. O O O O
    
HLH O O O O
proteins O O O O
form O O O O
homo O O O O
- O O O O
and O O O O
/ O O O O
or O O O O
heterodimers O O O O
with O O O O
other O O O O
HLH O O O O
proteins O O O O
and O O O O
bind O O O O
to O O O O
E O O O O
- O O O O
box O O O O
motifs O O O O
. O O O O
    
The O O O O
regulation O O O O
and O O O O
functions O O O O
of O O O O
these O O O O
proteins O O O O
can O O O O
be O O O O
complex O O O O
due O O O O
to O O O O
their O O O O
bifunctional O O O O
roles O O O O
as O O O O
activators O O O O
and O O O O
repressors O O O O
of O O O O
gene O O O O
transcription O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
isolated O O O O
and O O O O
characterized O O O O
a O O O O
novel O O O O
predicted O O O O
bHLH O O O O
protein O O O O
- O O O O
encoding O O O O
gene O O O O
, O O O O
AO090023000902 O O O O
, O O O O
designated O O O O
ecdR O O O O
( O O O O
early O O O O
conidiophore O O O O
development O O O O
regulator O O O O
) O O O O
, O O O O
in O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
oryzae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
ecdR O O O O
gene O O O O
disruptant O O O O
produced O O O O
very O O O O
few O O O O
conidia O O O O
. O O O O
    
Conversely O O O O
, O O O O
the O O O O
overexpression O O O O
of O O O O
ecdR O O O O
resulted O O O O
in O O O O
the O O O O
formation O O O O
of O O O O
a O O O O
large O O O O
number O O O O
of O O O O
conidia O O O O
at O O O O
an O O O O
early O O O O
stage O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
the O O O O
EcdR O O O O
protein O O O O
is O O O O
required O O O O
for O O O O
early O O O O
asexual O O O O
development O O O O
. O O O O
    
Additionally O O O O
, O O O O
when O O O O
serially O O O O
diluted O O O O
conidia O O O O
were O O O O
spread O O O O
- O O O O
cultivated O O O O
onto O O O O
malt O O O O
agar O O O O
medium O O O O
, O O O O
we O O O O
found O O O O
that O O O O
conidial O O O O
number O O O O
of O O O O
the O O O O
control O O O O
strain O O O O
depended O O O O
on O O O O
the O O O O
cultivated O O O O
conidium O O O O
density O O O O
, O O O O
while O O O O
the O O O O
ecdR O O O O
- O O O O
overexpressing O O O O
strain O O O O
showed O O O O
no O O O O
significant O O O O
change O O O O
in O O O O
conidiation O O O O
. O O O O
    
These O O O O
phenotypes O O O O
of O O O O
ecdR O O O O
- O O O O
disruptant O O O O
and O O O O
ecdR O O O O
- O O O O
overexpressing O O O O
strains O O O O
are O O O O
partially O O O O
similar O O O O
to O O O O
those O O O O
of O O O O
the O O O O
sclR O O O O
- O O O O
overexpressing O O O O
strain O O O O
and O O O O
sclR O O O O
- O O O O
disruptant O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
Yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
two O O O O
- O O O O
hybrid O O O O
assays O O O O
and O O O O
sclR O O O O
, O O O O
ecdR O O O O
- O O O O
double O O O O
deletion O O O O
experiment O O O O
indicated O O O O
that O O O O
EcdR O O O O
plays O O O O
a O O O O
major O O O O
role O O O O
in O O O O
conidiation O O O O
, O O O O
and O O O O
SclR O O O O
represses O O O O
this O O O O
function O O O O
by O O O O
competitively O O O O
interacting O O O O
with O O O O
EcdR O O O O
in O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
oryzae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Meiotic O O O O
silencing O O O O
by O O O O
unpaired O O O O
DNA O O O O
is O O O O
expressed O O O O
more O O O O
strongly O O O O
in O O O O
the O O O O
early O O O O
than O O O O
the O O O O
late O O O O
perithecia O O O O
of O O O O
crosses O O O O
involving O O O O
most O O O O
wild O O O O
- O O O O
isolated O O O O
Neurospora B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
crassa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strains O O O O
and O O O O
in O O O O
self O O O O
- O O O O
crosses O O O O
of O O O O
N B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tetrasperma O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Meiotic O O O O
silencing O O O O
by O O O O
unpaired O O O O
DNA O O O O
is O O O O
a O O O O
presumed O O O O
RNAi O O O O
- O O O O
mediated O O O O
elimination O O O O
of O O O O
the O O O O
transcripts O O O O
of O O O O
any O O O O
gene O O O O
that O O O O
is O O O O
not O O O O
properly O O O O
paired O O O O
with O O O O
a O O O O
homolog O O O O
in O O O O
meiosis O O O O
. O O O O
    
Eighty O O O O
wild O O O O
- O O O O
isolated O O O O
strains O O O O
of O O O O
Neurospora B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
crassa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
were O O O O
classified O O O O
into O O O O
three O O O O
types O O O O
based O O O O
on O O O O
the O O O O
apparent O O O O
strength O O O O
of O O O O
meiotic O O O O
silencing O O O O
of O O O O
the O O O O
bml O O O O
( O O O O
Beta O O O O
- O O O O
tubulin O O O O
) O O O O
and O O O O
mei O O O O
- O O O O
3 O O O O
genes O O O O
in O O O O
crosses O O O O
with O O O O
the O O O O
: O O O O
: O O O O
Bml O O O O
( O O O O
r O O O O
) O O O O
and O O O O
: O O O O
: O O O O
mei O O O O
- O O O O
3 O O O O
tester O O O O
strains O O O O
. O O O O
    
"""" O O O O
OR O O O O
"""" O O O O
and O O O O
"""" O O O O
Sad O O O O
"""" O O O O
type O O O O
wild O O O O
- O O O O
isolates O O O O
, O O O O
respectively O O O O
, O O O O
did O O O O
or O O O O
did O O O O
not O O O O
silence O O O O
both O O O O
the O O O O
genes O O O O
, O O O O
whereas O O O O
the O O O O
"""" O O O O
Esm O O O O
"""" O O O O
type O O O O
( O O O O
68 O O O O
strains O O O O
) O O O O
silenced O O O O
bml O O O O
but O O O O
not O O O O
mei O O O O
- O O O O
3 O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
an O O O O
intermediate O O O O
strength O O O O
of O O O O
silencing O O O O
. O O O O
    
Many O O O O
wild O O O O
strains O O O O
, O O O O
especially O O O O
of O O O O
the O O O O
Esm O O O O
type O O O O
, O O O O
gave O O O O
fertile O O O O
crosses O O O O
with O O O O
strains O O O O
bearing O O O O
the O O O O
148kbp O O O O
chromosome O O O O
segment O O O O
duplication O O O O
Dp O O O O
( O O O O
EB4 O O O O
) O O O O
but O O O O
their O O O O
crosses O O O O
with O O O O
the O O O O
405kbp O O O O
Dp O O O O
( O O O O
IBj5 O O O O
) O O O O
were O O O O
barren O O O O
. O O O O
    
Larger O O O O
Dps O O O O
might O O O O
include O O O O
more O O O O
genes O O O O
whose O O O O
sensitivity O O O O
to O O O O
silencing O O O O
is O O O O
comparable O O O O
with O O O O
that O O O O
of O O O O
bml O O O O
, O O O O
consequently O O O O
their O O O O
crosses O O O O
with O O O O
the O O O O
OR O O O O
and O O O O
Esm O O O O
type O O O O
strains O O O O
would O O O O
be O O O O
about O O O O
equally O O O O
barren O O O O
, O O O O
whereas O O O O
small O O O O
Dps O O O O
, O O O O
with O O O O
presumably O O O O
few O O O O
or O O O O
no O O O O
bml O O O O
- O O O O
like O O O O
genes O O O O
suffer O O O O
little O O O O
gene O O O O
silencing O O O O
in O O O O
crosses O O O O
with O O O O
Esm O O O O
and O O O O
Sad O O O O
strains O O O O
and O O O O
thus O O O O
remain O O O O
fertile O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
lollipop O O O O
- O O O O
shaped O O O O
asci O O O O
as O O O O
indicators O O O O
of O O O O
silencing O O O O
in O O O O
crosses O O O O
of O O O O
the O O O O
: O O O O
: O O O O
act O O O O
tester O O O O
with O O O O
Esm O O O O
type O O O O
strains O O O O
, O O O O
and O O O O
white O O O O
- O O O O
spored O O O O
asci O O O O
in O O O O
Neurospora B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tetrasperma O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
self O O O O
- O O O O
crosses O O O O
heterozygous O O O O
for O O O O
an O O O O
ectopic O O O O
insertion O O O O
of O O O O
the O O O O
asm O O O O
- O O O O
1 O O O O
gene O O O O
, O O O O
we O O O O
found O O O O
that O O O O
meiotic O O O O
silencing O O O O
was O O O O
expressed O O O O
more O O O O
strongly O O O O
in O O O O
the O O O O
early O O O O
but O O O O
not O O O O
in O O O O
the O O O O
late O O O O
perithecia O O O O
of O O O O
these O O O O
crosses O O O O
. O O O O
    
Accumulation O O O O
of O O O O
P O O O O
- O O O O
bodies O O O O
in O O O O
Candida B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
under O O O O
different O O O O
stress O O O O
and O O O O
filamentous O O O O
growth O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
Candida B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
an O O O O
opportunistic O O O O
fungal O O O O
pathogen O O O O
that O O O O
grows O O O O
as O O O O
budding O O O O
yeast O O O O
, O O O O
pseudohyphal O O O O
, O O O O
and O O O O
hyphal O O O O
forms O O O O
. O O O O
    
In O O O O
response O O O O
to O O O O
external O O O O
signals O O O O
, O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
switches O O O O
rapidly O O O O
among O O O O
these O O O O
forms O O O O
. O O O O
    
mRNA O O O O
- O O O O
containing O O O O
cytoplasmic O O O O
granules O O O O
, O O O O
termed O O O O
processing O O O O
bodies O O O O
( O O O O
P O O O O
- O O O O
bodies O O O O
) O O O O
, O O O O
have O O O O
been O O O O
reported O O O O
to O O O O
accumulate O O O O
under O O O O
various O O O O
environmental O O O O
stress O O O O
conditions O O O O
in O O O O
diverse O O O O
species O O O O
from O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
to O O O O
mammals O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
provide O O O O
the O O O O
first O O O O
microscopic O O O O
and O O O O
genetic O O O O
characterization O O O O
of O O O O
P O O O O
- O O O O
bodies O O O O
in O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
core O O O O
components O O O O
of O O O O
P O O O O
- O O O O
bodies O O O O
, O O O O
including O O O O
the O O O O
decapping O O O O
machinery O O O O
( O O O O
Dcp2 O O O O
and O O O O
Dhh1 O O O O
) O O O O
, O O O O
5 O O O O
' O O O O
- O O O O
3 O O O O
' O O O O
exoribonuclease O O O O
( O O O O
Kem1 O O O O
/ O O O O
Xrn1 O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
P O O O O
- O O O O
body O O O O
scaffolding O O O O
protein O O O O
( O O O O
Edc3 O O O O
) O O O O
, O O O O
were O O O O
identified O O O O
and O O O O
their O O O O
localizations O O O O
with O O O O
respect O O O O
to O O O O
P O O O O
- O O O O
bodies O O O O
were O O O O
demonstrated O O O O
. O O O O
    
Various O O O O
growth O O O O
conditions O O O O
, O O O O
including O O O O
glucose O O O O
deprivation O O O O
, O O O O
hyperosmotic O O O O
stress O O O O
, O O O O
and O O O O
heat O O O O
stress O O O O
, O O O O
stimulated O O O O
the O O O O
accumulation O O O O
of O O O O
P O O O O
- O O O O
bodies O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
, O O O O
we O O O O
observed O O O O
P O O O O
- O O O O
body O O O O
aggregation O O O O
during O O O O
hyphal O O O O
development O O O O
. O O O O
    
The O O O O
deletion O O O O
mutant O O O O
strain O O O O
edc3 O O O O
/ O O O O
edc3 O O O O
had O O O O
a O O O O
defect O O O O
in O O O O
filamentation O O O O
and O O O O
exhibited O O O O
a O O O O
dramatic O O O O
reduction O O O O
in O O O O
the O O O O
number O O O O
of O O O O
P O O O O
- O O O O
bodies O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
Edc3 O O O O
plays O O O O
an O O O O
essential O O O O
role O O O O
in O O O O
the O O O O
assembly O O O O
and O O O O
maintenance O O O O
of O O O O
P O O O O
- O O O O
bodies O O O O
in O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
that O O O O
the O O O O
switch O O O O
to O O O O
filamentous O O O O
growth O O O O
appears O O O O
to O O O O
accompany O O O O
P O O O O
- O O O O
body O O O O
accumulation O O O O
. O O O O
    
A O O O O
heme O O O O
peroxidase O O O O
of O O O O
the O O O O
ascomyceteous O O O O
lichen O O O O
Leptogium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
saturninum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
oxidizes O O O O
high O O O O
- O O O O
redox O O O O
potential O O O O
substrates O O O O
. O O O O
    
Lichens O O O O
belonging O O O O
to O O O O
the O O O O
order O O O O
Peltigerales O O O O
display O O O O
strong O O O O
activity O O O O
of O O O O
multi O O O O
- O O O O
copper O O O O
oxidases O O O O
( O O O O
e O O O O
. O O O O
g O O O O
. O O O O
tyrosinase O O O O
) O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
heme O O O O
- O O O O
containing O O O O
peroxidases O O O O
. O O O O
    
The O O O O
lichen O O O O
peroxidase O O O O
was O O O O
purified O O O O
to O O O O
homogeneity O O O O
from O O O O
the O O O O
thallus O O O O
of O O O O
Leptogium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
saturninum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
LsaPOX O O O O
) O O O O
by O O O O
fast O O O O
protein O O O O
liquid O O O O
chromatography O O O O
and O O O O
then O O O O
partially O O O O
characterized O O O O
. O O O O
    
The O O O O
oligomeric O O O O
protein O O O O
occurs O O O O
as O O O O
both O O O O
79kDa O O O O
dimeric O O O O
and O O O O
42kDa O O O O
monomeric O O O O
forms O O O O
, O O O O
and O O O O
displayed O O O O
broad O O O O
substrate O O O O
specificity O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
to O O O O
an O O O O
ability O O O O
to O O O O
oxidize O O O O
classic O O O O
peroxidase O O O O
substrates O O O O
( O O O O
e O O O O
. O O O O
g O O O O
. O O O O
2 O O O O
, O O O O
6 O O O O
- O O O O
dimethoxyphenol O O O O
) O O O O
, O O O O
the O O O O
enzyme O O O O
could O O O O
convert O O O O
recalcitrant O O O O
compounds O O O O
such O O O O
as O O O O
synthetic O O O O
dyes O O O O
( O O O O
e O O O O
. O O O O
g O O O O
. O O O O
Azure O O O O
B O O O O
and O O O O
Reactive O O O O
Blue O O O O
5 O O O O
) O O O O
, O O O O
4 O O O O
- O O O O
nitrophenol O O O O
and O O O O
non O O O O
- O O O O
phenolic O O O O
methoxylated O O O O
aromatics O O O O
( O O O O
e O O O O
. O O O O
g O O O O
. O O O O
veratryl O O O O
alcohol O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Comparing O O O O
LsaPOX O O O O
with O O O O
a O O O O
basidiomycete O O O O
dye O O O O
- O O O O
decolorizing O O O O
( O O O O
DyP O O O O
) O O O O
- O O O O
type O O O O
peroxidase O O O O
from O O O O
Auricularia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
auricula O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
judae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
showed O O O O
that O O O O
the O O O O
lichen O O O O
enzyme O O O O
has O O O O
a O O O O
high O O O O
- O O O O
redox O O O O
potential O O O O
, O O O O
with O O O O
oxidation O O O O
capabilities O O O O
ranging O O O O
between O O O O
those O O O O
of O O O O
known O O O O
plant O O O O
and O O O O
fungal O O O O
peroxidases O O O O
. O O O O
    
Internal O O O O
peptide O O O O
fragments O O O O
show O O O O
homology O O O O
( O O O O
up O O O O
to O O O O
60 O O O O
% O O O O
) O O O O
with O O O O
putative O O O O
proteins O O O O
from O O O O
free O O O O
- O O O O
living O O O O
ascomycetes O O O O
( O O O O
e O O O O
. O O O O
g O O O O
. O O O O
Penicillium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
marneffei O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Neosartorya B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fischeri O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
to O O O O
sequences O O O O
of O O O O
algal O O O O
or O O O O
cyanobacterial O O O O
peptides O O O O
or O O O O
to O O O O
known O O O O
fungal O O O O
, O O O O
bacterial O O O O
or O O O O
plant O O O O
peroxidases O O O O
. O O O O
    
LsaPOX O O O O
is O O O O
the O O O O
first O O O O
heme O O O O
peroxidase O O O O
purified O O O O
from O O O O
an O O O O
ascomyceteous O O O O
lichen O O O O
that O O O O
may O O O O
help O O O O
the O O O O
organism O O O O
to O O O O
successfully O O O O
exploit O O O O
the O O O O
extreme O O O O
micro O O O O
- O O O O
environments O O O O
in O O O O
which O O O O
they O O O O
often O O O O
grow O O O O
. O O O O
    
Cannibalism O O O O
and O O O O
intraguild O O O O
predation O O O O
of O O O O
eggs O O O O
within O O O O
a O O O O
diverse O O O O
predator O O O O
assemblage O O O O
. O O O O
    
Greater O O O O
biodiversity O O O O
among O O O O
aphid O O O O
predators O O O O
sometimes O O O O
leads O O O O
to O O O O
greater O O O O
predator O O O O
reproductive O O O O
success O O O O
. O O O O
    
This O O O O
could O O O O
occur O O O O
if O O O O
cannibalism O O O O
of O O O O
predator O O O O
eggs O O O O
is O O O O
consistently O O O O
stronger O O O O
than O O O O
intraguild O O O O
predation O O O O
, O O O O
such O O O O
that O O O O
diversity O O O O
dilutes O O O O
cannibalism O O O O
risk O O O O
when O O O O
total O O O O
predator O O O O
densities O O O O
remain O O O O
constant O O O O
across O O O O
diversity O O O O
levels O O O O
. O O O O
    
We O O O O
compared O O O O
the O O O O
frequency O O O O
of O O O O
cannibalism O O O O
versus O O O O
intraguild O O O O
predation O O O O
by O O O O
adult O O O O
predators O O O O
of O O O O
four O O O O
species O O O O
[ O O O O
the O O O O
lady O O O O
beetles O O O O
Coccinella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
septempunctata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
L O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Hippodamia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
convergens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Guerin O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Meneville O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
the O O O O
predatory O O O O
bugs O O O O
Geocoris B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bullatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Say O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Nabis O O O O
alternatus O O O O
Parshley O O O O
] O O O O
on O O O O
the O O O O
eggs O O O O
of O O O O
three O O O O
predator O O O O
species O O O O
( O O O O
all O O O O
of O O O O
these O O O O
predators O O O O
but O O O O
Nabis O O O O
) O O O O
. O O O O
    
For O O O O
both O O O O
coccinellid O O O O
species O O O O
, O O O O
egg O O O O
predation O O O O
averaged O O O O
across O O O O
all O O O O
intraguild O O O O
predators O O O O
was O O O O
less O O O O
frequent O O O O
than O O O O
cannibalism O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
, O O O O
Geocoris B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
eggs O O O O
were O O O O
generally O O O O
more O O O O
likely O O O O
to O O O O
be O O O O
consumed O O O O
by O O O O
intraguild O O O O
predators O O O O
than O O O O
by O O O O
conspecifics O O O O
. O O O O
    
Closer O O O O
inspection O O O O
of O O O O
the O O O O
data O O O O
revealed O O O O
that O O O O
Geocoris B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
consistently O O O O
consumed O O O O
fewer O O O O
eggs O O O O
than O O O O
the O O O O
other O O O O
species O O O O
, O O O O
regardless O O O O
of O O O O
egg O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Indeed O O O O
, O O O O
for O O O O
lady O O O O
beetle O O O O
eggs O O O O
it O O O O
was O O O O
relatively O O O O
infrequent O O O O
egg O O O O
predation O O O O
by O O O O
Geocoris B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
that O O O O
brought O O O O
down O O O O
the O O O O
average O O O O
across O O O O
all O O O O
heterospecific O O O O
predators O O O O
, O O O O
masking O O O O
the O O O O
fact O O O O
that O O O O
adults O O O O
of O O O O
the O O O O
two O O O O
lady O O O O
beetles O O O O
were O O O O
no O O O O
more O O O O
likely O O O O
to O O O O
act O O O O
as O O O O
egg O O O O
cannibals O O O O
than O O O O
as O O O O
intraguild O O O O
predators O O O O
. O O O O
    
Nabis O O O O
ate O O O O
eggs O O O O
of O O O O
the O O O O
two O O O O
beetles O O O O
at O O O O
approximately O O O O
equal O O O O
rates O O O O
, O O O O
but O O O O
rarely O O O O
ate O O O O
Geocoris B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
eggs O O O O
. O O O O
    
Female O O O O
predators O O O O
generally O O O O
consumed O O O O
more O O O O
eggs O O O O
than O O O O
did O O O O
males O O O O
, O O O O
but O O O O
this O O O O
did O O O O
not O O O O
alter O O O O
any O O O O
of O O O O
the O O O O
patterns O O O O
described O O O O
above O O O O
. O O O O
    
Altogether O O O O
, O O O O
our O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
species O O O O
- O O O O
specific O O O O
differences O O O O
in O O O O
egg O O O O
predation O O O O
rates O O O O
determined O O O O
the O O O O
relative O O O O
intensity O O O O
of O O O O
egg O O O O
intraguild O O O O
- O O O O
predation O O O O
versus O O O O
cannibalism O O O O
, O O O O
rather O O O O
than O O O O
any O O O O
more O O O O
general O O O O
trend O O O O
for O O O O
egg O O O O
cannibalism O O O O
to O O O O
always O O O O
exceed O O O O
intraguild O O O O
predation O O O O
. O O O O
    
Sunflower O O O O
stem O O O O
weevil O O O O
and O O O O
its O O O O
larval O O O O
parasitoids O O O O
in O O O O
native O O O O
sunflowers O O O O
: O O O O
is O O O O
parasitoid O O O O
abundance O O O O
and O O O O
diversity O O O O
greater O O O O
in O O O O
the O O O O
u O O O O
. O O O O
s O O O O
. O O O O
    
Southwest O O O O
? O O O O
    
Classical O O O O
biological O O O O
control O O O O
programs O O O O
often O O O O
target O O O O
a O O O O
pest O O O O
' O O O O
s O O O O
region O O O O
of O O O O
origin O O O O
as O O O O
a O O O O
likely O O O O
source O O O O
for O O O O
new O O O O
biological O O O O
control O O O O
agents O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
use O O O O
this O O O O
approach O O O O
to O O O O
search O O O O
for O O O O
biological O O O O
control O O O O
agents O O O O
of O O O O
the O O O O
sunflower O O O O
stem O O O O
weevil O O O O
( O O O O
Cylindrocopturus O O O O
adspersus O O O O
LeConte O O O O
) O O O O
, O O O O
an O O O O
economically O O O O
important O O O O
pest O O O O
of O O O O
commercial O O O O
sunflower O O O O
. O O O O
    
We O O O O
conducted O O O O
surveys O O O O
of O O O O
weevil O O O O
natural O O O O
enemy O O O O
diversity O O O O
and O O O O
abundance O O O O
across O O O O
a O O O O
transect O O O O
running O O O O
from O O O O
the O O O O
northern O O O O
Great O O O O
Plains O O O O
to O O O O
the O O O O
southwestern O O O O
U O O O O
. O O O O
S O O O O
. O O O O
    
( O O O O
the O O O O
presumed O O O O
area O O O O
of O O O O
endemism O O O O
of O O O O
annual O O O O
sunflower O O O O
species O O O O
in O O O O
the O O O O
genus O O O O
Helianthus O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Accordingly O O O O
, O O O O
natural O O O O
enemy O O O O
diversity O O O O
and O O O O
abundance O O O O
were O O O O
expected O O O O
to O O O O
be O O O O
greater O O O O
in O O O O
the O O O O
southwestern O O O O
U O O O O
. O O O O
S O O O O
. O O O O
    
C O O O O
. O O O O
adspersus O O O O
and O O O O
their O O O O
larval O O O O
parasitoids O O O O
were O O O O
collected O O O O
from O O O O
stems O O O O
of O O O O
four O O O O
native O O O O
sunflower O O O O
species O O O O
( O O O O
Helianthus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
annuus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
H B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nuttallii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
H B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pauciflorus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
H B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
petiolaris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
from O O O O
147 O O O O
sites O O O O
across O O O O
eight O O O O
states O O O O
. O O O O
    
Native O O O O
H B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
annuus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
constituted O O O O
the O O O O
majority O O O O
of O O O O
the O O O O
sunflower O O O O
populations O O O O
. O O O O
    
Mean O O O O
weevil O O O O
densities O O O O
were O O O O
significantly O O O O
higher O O O O
in O O O O
sunflower O O O O
stalks O O O O
that O O O O
were O O O O
larger O O O O
in O O O O
diameter O O O O
. O O O O
    
Mean O O O O
weevil O O O O
densities O O O O
within O O O O
sites O O O O
did O O O O
not O O O O
differ O O O O
across O O O O
the O O O O
range O O O O
of O O O O
longitudes O O O O
and O O O O
latitudes O O O O
sampled O O O O
. O O O O
    
After O O O O
accounting O O O O
for O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
stalk O O O O
diameter O O O O
and O O O O
location O O O O
, O O O O
weevil O O O O
densities O O O O
did O O O O
not O O O O
differ O O O O
among O O O O
the O O O O
four O O O O
sunflower O O O O
species O O O O
nor O O O O
did O O O O
they O O O O
differ O O O O
as O O O O
a O O O O
function O O O O
of O O O O
elevation O O O O
. O O O O
    
C O O O O
. O O O O
adspersus O O O O
in O O O O
H B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
annuus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
H B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
petiolaris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
were O O O O
attacked O O O O
by O O O O
seven O O O O
species O O O O
of O O O O
parasitoids O O O O
. O O O O
    
No O O O O
parasitoids O O O O
were O O O O
found O O O O
attacking O O O O
C O O O O
. O O O O
adspersus O O O O
in O O O O
H B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nuttallii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
or O O O O
H B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pauciflorus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
stalks O O O O
. O O O O
    
C O O O O
. O O O O
adspersus O O O O
were O O O O
twice O O O O
as O O O O
likely O O O O
to O O O O
be O O O O
attacked O O O O
by O O O O
a O O O O
parasitoid O O O O
when O O O O
feeding O O O O
on O O O O
H B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
petiolaris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
than O O O O
H B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
annuus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
the O O O O
likelihood O O O O
that O O O O
C O O O O
. O O O O
adspersus O O O O
would O O O O
be O O O O
parasitized O O O O
decreased O O O O
with O O O O
increasing O O O O
elevation O O O O
and O O O O
increasing O O O O
stem O O O O
diameters O O O O
. O O O O
    
All O O O O
parasitoid O O O O
species O O O O
have O O O O
been O O O O
previously O O O O
reported O O O O
attacking O O O O
C O O O O
. O O O O
adspersus O O O O
larvae O O O O
in O O O O
cultivated O O O O
sunflower O O O O
. O O O O
    
Species O O O O
richness O O O O
was O O O O
less O O O O
diverse O O O O
in O O O O
these O O O O
collections O O O O
than O O O O
from O O O O
previous O O O O
studies O O O O
of O O O O
cultivated O O O O
sunflower O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
findings O O O O
suggest O O O O
that O O O O
the O O O O
species O O O O
of O O O O
larval O O O O
parasitoids O O O O
attacking O O O O
C O O O O
. O O O O
adspersus O O O O
in O O O O
native O O O O
sunflowers O O O O
have O O O O
successfully O O O O
made O O O O
the O O O O
transition O O O O
to O O O O
cultivated O O O O
sunflower O O O O
. O O O O
    
Interactions O O O O
Between O O O O
Extrafloral O O O O
Nectaries O O O O
, O O O O
Ants O O O O
( O O O O
Hymenoptera O O O O
: O O O O
Formicidae O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
Other O O O O
Natural O O O O
Enemies O O O O
Affect O O O O
Biological O O O O
Control O O O O
of O O O O
Grapholita B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
molesta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Lepidoptera O O O O
: O O O O
Tortricidae O O O O
) O O O O
on O O O O
Peach B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
Rosales O O O O
: O O O O
Rosaceae O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Extrafloral O O O O
nectaries O O O O
( O O O O
EFNs O O O O
) O O O O
are O O O O
reported O O O O
to O O O O
benefit O O O O
some O O O O
plants O O O O
when O O O O
ants O O O O
( O O O O
Hymenoptera O O O O
: O O O O
Formicidae O O O O
) O O O O
use O O O O
their O O O O
secretions O O O O
and O O O O
fend O O O O
off O O O O
herbivores O O O O
, O O O O
but O O O O
in O O O O
some O O O O
cases O O O O
resulting O O O O
competitive O O O O
interactions O O O O
may O O O O
reduce O O O O
biological O O O O
control O O O O
of O O O O
specific O O O O
herbivores O O O O
. O O O O
    
This O O O O
research O O O O
examined O O O O
the O O O O
interactions O O O O
between O O O O
ants O O O O
and O O O O
other O O O O
natural O O O O
enemies O O O O
associated O O O O
with O O O O
the O O O O
EFNs O O O O
of O O O O
peach B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
[ O O O O
Prunus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
persica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
L O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Batcsh O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
] O O O O
and O O O O
the O O O O
implications O O O O
for O O O O
biological O O O O
control O O O O
of O O O O
a O O O O
key O O O O
pest O O O O
, O O O O
the O O O O
oriental B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fruit O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
moth O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
[ O O O O
Grapholita B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
molesta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Busck O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
] O O O O
. O O O O
    
Studies O O O O
using O O O O
sentinel O O O O
G B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
molesta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
placed O O O O
on O O O O
peach B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trees O O O O
( O O O O
' O O O O
Lovell O O O O
' O O O O
cultivar O O O O
) O O O O
with O O O O
EFNs O O O O
present O O O O
and O O O O
absent O O O O
revealed O O O O
that O O O O
several O O O O
natural O O O O
enemy O O O O
groups O O O O
associated O O O O
with O O O O
the O O O O
EFNs O O O O
contribute O O O O
to O O O O
reductions O O O O
in O O O O
G B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
molesta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
eggs O O O O
, O O O O
larvae O O O O
, O O O O
and O O O O
pupae O O O O
in O O O O
peach O O O O
orchards O O O O
. O O O O
    
Ants O O O O
on O O O O
trees O O O O
with O O O O
EFNs O O O O
antagonized O O O O
the O O O O
G O O O O
. O O O O
molesta O O O O
egg O O O O
parasitoid O O O O
Trichogramma B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
minutum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Riley O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
but O O O O
the O O O O
ants O O O O
were O O O O
crucial O O O O
in O O O O
reducing O O O O
G B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
molesta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
both O O O O
the O O O O
larval O O O O
and O O O O
pupal O O O O
stages O O O O
. O O O O
    
Overall O O O O
, O O O O
individual O O O O
trees O O O O
with O O O O
EFNs O O O O
experienced O O O O
higher O O O O
ant O O O O
and O O O O
other O O O O
( O O O O
nonant O O O O
) O O O O
natural O O O O
enemy O O O O
densities O O O O
and O O O O
subsequent O O O O
pest O O O O
reductions O O O O
, O O O O
as O O O O
compared O O O O
with O O O O
trees O O O O
without O O O O
EFNs O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
implications O O O O
of O O O O
EFN O O O O
- O O O O
natural O O O O
enemy O O O O
- O O O O
pest O O O O
interactions O O O O
to O O O O
orchard O O O O
- O O O O
level O O O O
biological O O O O
control O O O O
will O O O O
likely O O O O
depend O O O O
on O O O O
local O O O O
G B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
molesta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
population O O O O
dynamics O O O O
. O O O O
    
Laboratory O O O O
and O O O O
Field O O O O
Evaluation O O O O
of O O O O
Formulated O O O O
Bacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
thuringiensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
var O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
israelensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
as O O O O
a O O O O
Feed O O O O
Additive O O O O
and O O O O
Using O O O O
Topical O O O O
Applications O O O O
for O O O O
Control O O O O
of O O O O
Musca B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
domestica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Diptera O O O O
: O O O O
Muscidae O O O O
) O O O O
Larvae O O O O
in O O O O
Caged O O O O
- O O O O
Poultry O O O O
Manure O O O O
. O O O O
    
Infestations O O O O
of O O O O
house B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
flies O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Musca B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
domestica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
L O O O O
. O O O O
, O O O O
are O O O O
a O O O O
continual O O O O
problem O O O O
around O O O O
poultry O O O O
establishments O O O O
. O O O O
    
Acute O O O O
toxicity O O O O
of O O O O
two O O O O
commercial O O O O
Bacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
thuringiensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
variety O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
israelensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Bti B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
formulations O O O O
( O O O O
water O O O O
- O O O O
dispersible O O O O
granules O O O O
and O O O O
bran O O O O
formulation O O O O
) O O O O
was O O O O
evaluated O O O O
against O O O O
larvae O O O O
in O O O O
the O O O O
laboratory O O O O
and O O O O
against O O O O
natural O O O O
populations O O O O
of O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
domestica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
larvae O O O O
in O O O O
the O O O O
field O O O O
applied O O O O
in O O O O
feed O O O O
to O O O O
chickens B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
as O O O O
topical O O O O
applications O O O O
in O O O O
the O O O O
poultry O O O O
houses O O O O
. O O O O
    
Bioassay O O O O
data O O O O
showed O O O O
that O O O O
susceptibility O O O O
of O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
domestica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
larvae O O O O
increased O O O O
to O O O O
a O O O O
given O O O O
concentration O O O O
of O O O O
Bti B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
as O O O O
the O O O O
duration O O O O
of O O O O
exposure O O O O
increased O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
laboratory O O O O
studies O O O O
, O O O O
the O O O O
LC O O O O
( O O O O
50 O O O O
) O O O O
values O O O O
of O O O O
Bti B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
for O O O O
the O O O O
larvae O O O O
ranged O O O O
between O O O O
65 O O O O
and O O O O
77 O O O O
. O O O O
4 O O O O
mug O O O O
/ O O O O
ml O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
field O O O O
, O O O O
a O O O O
concentration O O O O
of O O O O
10 O O O O
g O O O O
Bti B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
/ O O O O
kg O O O O
of O O O O
feed O O O O
resulted O O O O
in O O O O
90 O O O O
% O O O O
reduction O O O O
of O O O O
larvae O O O O
at O O O O
4 O O O O
wk O O O O
after O O O O
treatment O O O O
. O O O O
    
A O O O O
higher O O O O
concentration O O O O
( O O O O
2 O O O O
g O O O O
/ O O O O
liter O O O O
) O O O O
of O O O O
Bti B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
in O O O O
spray O O O O
applications O O O O
was O O O O
not O O O O
significantly O O O O
more O O O O
effective O O O O
than O O O O
the O O O O
lower O O O O
concentration O O O O
of O O O O
1 O O O O
g O O O O
/ O O O O
liter O O O O
. O O O O
    
Adding O O O O
Bti B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
to O O O O
chicken B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
feed O O O O
is O O O O
potentially O O O O
an O O O O
efficient O O O O
measure O O O O
for O O O O
the O O O O
management O O O O
and O O O O
control O O O O
of O O O O
house B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
flies O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
caged O O O O
- O O O O
poultry O O O O
facilities O O O O
. O O O O
    
Short O O O O
- O O O O
Term O O O O
Population O O O O
Redistribution O O O O
of O O O O
Pseudacteon B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tricuspis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Diptera O O O O
: O O O O
Phoridae O O O O
) O O O O
From O O O O
Point O O O O
Source O O O O
Releases O O O O
. O O O O
    
There O O O O
is O O O O
a O O O O
need O O O O
for O O O O
quantitative O O O O
data O O O O
on O O O O
patterns O O O O
and O O O O
rates O O O O
of O O O O
movement O O O O
of O O O O
organisms O O O O
to O O O O
understand O O O O
their O O O O
movement O O O O
behavior O O O O
and O O O O
predict O O O O
their O O O O
rates O O O O
of O O O O
spread O O O O
. O O O O
    
Opportunities O O O O
for O O O O
studying O O O O
movement O O O O
of O O O O
biological O O O O
control O O O O
agents O O O O
are O O O O
presented O O O O
during O O O O
release O O O O
programs O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
despite O O O O
these O O O O
opportunities O O O O
, O O O O
patterns O O O O
and O O O O
range O O O O
of O O O O
dispersal O O O O
are O O O O
often O O O O
not O O O O
considered O O O O
. O O O O
    
For O O O O
example O O O O
, O O O O
information O O O O
about O O O O
effects O O O O
of O O O O
wind O O O O
on O O O O
dispersal O O O O
patterns O O O O
and O O O O
heterogeneities O O O O
in O O O O
rates O O O O
of O O O O
movement O O O O
is O O O O
critical O O O O
to O O O O
predicting O O O O
future O O O O
range O O O O
expansion O O O O
of O O O O
biological O O O O
control O O O O
agents O O O O
and O O O O
determining O O O O
proximity O O O O
of O O O O
multiple O O O O
releases O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
the O O O O
pattern O O O O
and O O O O
range O O O O
of O O O O
movement O O O O
of O O O O
a O O O O
fire O O O O
ant O O O O
parasitoid O O O O
, O O O O
Pseudacteon B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tricuspis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Borgmeier O O O O
, O O O O
was O O O O
investigated O O O O
by O O O O
performing O O O O
a O O O O
series O O O O
of O O O O
mass O O O O
- O O O O
release O O O O
- O O O O
resighting O O O O
experiments O O O O
. O O O O
    
Flies O O O O
were O O O O
released O O O O
at O O O O
a O O O O
central O O O O
location O O O O
surrounded O O O O
by O O O O
radial O O O O
transects O O O O
containing O O O O
trays O O O O
of O O O O
host O O O O
ants O O O O
at O O O O
variable O O O O
distances O O O O
along O O O O
four O O O O
axes O O O O
. O O O O
    
Resighted O O O O
flies O O O O
were O O O O
censused O O O O
at O O O O
these O O O O
trays O O O O
at O O O O
30 O O O O
min O O O O
intervals O O O O
, O O O O
up O O O O
to O O O O
2 O O O O
h O O O O
postrelease O O O O
. O O O O
    
The O O O O
dispersal O O O O
pattern O O O O
of O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tricuspis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
the O O O O
short O O O O
term O O O O
was O O O O
consistent O O O O
with O O O O
a O O O O
simple O O O O
diffusion O O O O
model O O O O
. O O O O
    
On O O O O
average O O O O
, O O O O
50 O O O O
% O O O O
of O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tricuspis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
dispersed O O O O
= O O O O
< O O O O
10 O O O O
m O O O O
, O O O O
and O O O O
95 O O O O
% O O O O
dispersed O O O O
= O O O O
< O O O O
29 O O O O
m O O O O
. O O O O
    
Diffusion O O O O
rates O O O O
were O O O O
variable O O O O
, O O O O
depending O O O O
on O O O O
release O O O O
densities O O O O
, O O O O
but O O O O
tended O O O O
to O O O O
decline O O O O
over O O O O
time O O O O
after O O O O
release O O O O
. O O O O
    
Drift O O O O
of O O O O
dispersing O O O O
flies O O O O
was O O O O
detected O O O O
in O O O O
several O O O O
trials O O O O
, O O O O
and O O O O
was O O O O
attributed O O O O
to O O O O
prevailing O O O O
wind O O O O
dynamics O O O O
. O O O O
    
Data O O O O
from O O O O
this O O O O
assessment O O O O
of O O O O
the O O O O
short O O O O
term O O O O
redistribution O O O O
pattern O O O O
of O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tricuspis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
could O O O O
be O O O O
useful O O O O
in O O O O
determining O O O O
proximity O O O O
of O O O O
releases O O O O
of O O O O
this O O O O
, O O O O
and O O O O
other O O O O
fire O O O O
ant O O O O
parasitoids O O O O
. O O O O
    
Age O O O O
and O O O O
Sex O O O O
Related O O O O
Responsiveness O O O O
of O O O O
Tribolium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
castaneum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Coleoptera O O O O
: O O O O
Tenebrionidae O O O O
) O O O O
in O O O O
Novel O O O O
Behavioral O O O O
Bioassays O O O O
. O O O O
    
The O O O O
hardiness O O O O
and O O O O
mobile O O O O
nature O O O O
of O O O O
Tribolium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
castaneum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Herbst O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
make O O O O
them O O O O
easy O O O O
to O O O O
work O O O O
with O O O O
but O O O O
are O O O O
the O O O O
same O O O O
factors O O O O
that O O O O
make O O O O
their O O O O
responses O O O O
to O O O O
behavior O O O O
- O O O O
modifying O O O O
chemical O O O O
stimuli O O O O
difficult O O O O
to O O O O
evaluate O O O O
. O O O O
    
To O O O O
overcome O O O O
these O O O O
difficulties O O O O
two O O O O
bioassays O O O O
were O O O O
developed O O O O
: O O O O
a O O O O
two O O O O
- O O O O
choice O O O O
test O O O O
with O O O O
airflow O O O O
and O O O O
a O O O O
diffusion O O O O
- O O O O
based O O O O
test O O O O
to O O O O
evaluate O O O O
responses O O O O
to O O O O
chemical O O O O
stimuli O O O O
. O O O O
    
The O O O O
two O O O O
- O O O O
choice O O O O
assay O O O O
is O O O O
excellent O O O O
for O O O O
rapidly O O O O
comparing O O O O
two O O O O
stimuli O O O O
or O O O O
examining O O O O
the O O O O
response O O O O
to O O O O
one O O O O
stimulus O O O O
against O O O O
a O O O O
control O O O O
. O O O O
    
The O O O O
diffusion O O O O
assay O O O O
determines O O O O
differences O O O O
in O O O O
orientation O O O O
behavior O O O O
to O O O O
multiple O O O O
simultaneous O O O O
stimuli O O O O
and O O O O
can O O O O
examine O O O O
other O O O O
behaviors O O O O
during O O O O
exposure O O O O
. O O O O
    
Preparation O O O O
of O O O O
individuals O O O O
for O O O O
bioassay O O O O
is O O O O
also O O O O
important O O O O
, O O O O
because O O O O
disturbance O O O O
increases O O O O
the O O O O
activity O O O O
level O O O O
of O O O O
individual O O O O
beetles O O O O
beyond O O O O
the O O O O
duration O O O O
of O O O O
the O O O O
disturbance O O O O
. O O O O
    
The O O O O
age O O O O
and O O O O
the O O O O
sex O O O O
of O O O O
beetles O O O O
affect O O O O
responsiveness O O O O
to O O O O
chemical O O O O
cues O O O O
. O O O O
    
These O O O O
bioassays O O O O
and O O O O
a O O O O
better O O O O
understanding O O O O
of O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
castaneum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
' O O O O
s O O O O
activity O O O O
have O O O O
revealed O O O O
approaches O O O O
for O O O O
evaluating O O O O
its O O O O
responsiveness O O O O
to O O O O
behavior O O O O
- O O O O
modifying O O O O
chemicals O O O O
. O O O O
    
Evaluation O O O O
of O O O O
tag O O O O
entanglement O O O O
as O O O O
a O O O O
factor O O O O
in O O O O
harmonic O O O O
radar O O O O
studies O O O O
of O O O O
insect O O O O
dispersal O O O O
. O O O O
    
The O O O O
observation O O O O
of O O O O
insects O O O O
and O O O O
other O O O O
small O O O O
organisms O O O O
entangled O O O O
in O O O O
the O O O O
habitat O O O O
after O O O O
the O O O O
addition O O O O
of O O O O
vertical O O O O
or O O O O
trailing O O O O
electronic O O O O
tags O O O O
to O O O O
their O O O O
body O O O O
has O O O O
generated O O O O
concerns O O O O
on O O O O
the O O O O
suitability O O O O
of O O O O
harmonic O O O O
radars O O O O
to O O O O
track O O O O
the O O O O
dispersal O O O O
of O O O O
insects O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
compared O O O O
the O O O O
walking O O O O
behavior O O O O
of O O O O
adult O O O O
Colorado B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
potato O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
beetle O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Leptinotarsa B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
decemlineata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Say O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Chrysomelidae O O O O
) O O O O
, O O O O
plum B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
curculio O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Conotrachelus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nenuphar O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Herbst O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Curculionidae O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
western B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
corn O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
rootworm O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Diabrotica B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virgifera O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virgifera O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
LeConte O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Chrysomelidae O O O O
) O O O O
with O O O O
and O O O O
without O O O O
vertical O O O O
and O O O O
or O O O O
trailing O O O O
tags O O O O
in O O O O
field O O O O
plots O O O O
or O O O O
arenas O O O O
. O O O O
    
The O O O O
frequency O O O O
of O O O O
the O O O O
larger O O O O
Colorado B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
potato O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
beetles O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
crossing O O O O
bare O O O O
ground O O O O
or O O O O
grassy O O O O
plots O O O O
was O O O O
unaffected O O O O
by O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
an O O O O
8 O O O O
cm O O O O
trailing O O O O
harmonic O O O O
radar O O O O
tag O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
plum B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
curculios O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
western B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
corn O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
rootworms O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
were O O O O
either O O O O
unable O O O O
to O O O O
walk O O O O
with O O O O
a O O O O
4 O O O O
cm O O O O
trailing O O O O
tag O O O O
( O O O O
plum B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
curculio O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
or O O O O
displayed O O O O
a O O O O
reduced O O O O
ability O O O O
to O O O O
successfully O O O O
cross O O O O
a O O O O
bare O O O O
ground O O O O
arena O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
revealed O O O O
the O O O O
significant O O O O
impact O O O O
of O O O O
vegetation O O O O
on O O O O
successful O O O O
insect O O O O
dispersal O O O O
, O O O O
whether O O O O
tagged O O O O
or O O O O
not O O O O
. O O O O
    
The O O O O
vertical O O O O
movement O O O O
of O O O O
these O O O O
insects O O O O
on O O O O
stems O O O O
, O O O O
stalks O O O O
, O O O O
and O O O O
tubes O O O O
was O O O O
also O O O O
unaffected O O O O
by O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
vertical O O O O
tags O O O O
. O O O O
    
Trailing O O O O
tags O O O O
had O O O O
a O O O O
significant O O O O
negative O O O O
effect O O O O
on O O O O
the O O O O
vertical O O O O
movement O O O O
of O O O O
the O O O O
western B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
corn O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
rootworm O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Results O O O O
show O O O O
that O O O O
harmonic O O O O
radar O O O O
technology O O O O
is O O O O
a O O O O
suitable O O O O
method O O O O
for O O O O
studying O O O O
the O O O O
walking O O O O
paths O O O O
of O O O O
the O O O O
three O O O O
insects O O O O
with O O O O
appropriate O O O O
tag O O O O
type O O O O
and O O O O
size O O O O
. O O O O
    
The O O O O
nuisance O O O O
factor O O O O
generated O O O O
by O O O O
appropriately O O O O
sized O O O O
tags O O O O
was O O O O
small O O O O
relative O O O O
to O O O O
that O O O O
of O O O O
vegetation O O O O
. O O O O
    
Influence O O O O
of O O O O
Sticky O O O O
Trap O O O O
Color O O O O
and O O O O
Height O O O O
Above O O O O
Ground O O O O
on O O O O
Capture O O O O
of O O O O
Alate O O O O
Elatobium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
abietinum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Hemiptera O O O O
: O O O O
Aphididae O O O O
) O O O O
in O O O O
Sitka O O O O
Spruce O O O O
Plantations O O O O
. O O O O
    
A O O O O
series O O O O
of O O O O
field O O O O
trials O O O O
were O O O O
used O O O O
to O O O O
assess O O O O
the O O O O
practicality O O O O
of O O O O
using O O O O
sticky O O O O
traps O O O O
to O O O O
monitor O O O O
populations O O O O
of O O O O
green O O O O
spruce O O O O
aphid O O O O
, O O O O
Elatobium O O O O
abietinum O O O O
( O O O O
Walker O O O O
) O O O O
, O O O O
in O O O O
plantations O O O O
of O O O O
Sitka B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
spruce O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
highest O O O O
numbers O O O O
of O O O O
alate O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
abietinum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
were O O O O
caught O O O O
on O O O O
sticky O O O O
traps O O O O
placed O O O O
in O O O O
the O O O O
upper O O O O
third O O O O
of O O O O
the O O O O
live O O O O
canopy O O O O
at O O O O
9 O O O O
- O O O O
17 O O O O
m O O O O
above O O O O
the O O O O
ground O O O O
, O O O O
whereas O O O O
low O O O O
numbers O O O O
of O O O O
aphids O O O O
were O O O O
caught O O O O
just O O O O
below O O O O
the O O O O
live O O O O
canopy O O O O
or O O O O
at O O O O
2 O O O O
m O O O O
above O O O O
the O O O O
ground O O O O
. O O O O
    
Trials O O O O
in O O O O
2005 O O O O
with O O O O
sticky O O O O
traps O O O O
of O O O O
different O O O O
colors O O O O
showed O O O O
that O O O O
significantly O O O O
more O O O O
alate O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
abietinum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
were O O O O
caught O O O O
on O O O O
yellow O O O O
, O O O O
red O O O O
, O O O O
and O O O O
green O O O O
sticky O O O O
traps O O O O
than O O O O
on O O O O
white O O O O
, O O O O
blue O O O O
, O O O O
and O O O O
black O O O O
traps O O O O
. O O O O
    
A O O O O
repeat O O O O
trial O O O O
in O O O O
2007 O O O O
resulted O O O O
in O O O O
significantly O O O O
more O O O O
alate O O O O
aphids O O O O
being O O O O
caught O O O O
on O O O O
red O O O O
sticky O O O O
traps O O O O
than O O O O
on O O O O
traps O O O O
of O O O O
any O O O O
other O O O O
color O O O O
except O O O O
for O O O O
green O O O O
. O O O O
    
Attraction O O O O
to O O O O
red O O O O
is O O O O
unusual O O O O
among O O O O
aphids O O O O
, O O O O
as O O O O
aphids O O O O
are O O O O
thought O O O O
not O O O O
to O O O O
possess O O O O
a O O O O
red O O O O
- O O O O
sensitive O O O O
photoreceptor O O O O
. O O O O
    
The O O O O
attraction O O O O
of O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
abietinum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
to O O O O
red O O O O
- O O O O
colored O O O O
sticky O O O O
traps O O O O
suggests O O O O
that O O O O
conifer O O O O
- O O O O
feeding O O O O
aphids O O O O
might O O O O
have O O O O
a O O O O
fundamentally O O O O
different O O O O
color O O O O
response O O O O
compared O O O O
with O O O O
aphids O O O O
that O O O O
live O O O O
on O O O O
cereals O O O O
, O O O O
grasses O O O O
, O O O O
or O O O O
herbaceous O O O O
plants O O O O
. O O O O
    
Alternatively O O O O
, O O O O
the O O O O
attraction O O O O
to O O O O
red O O O O
might O O O O
be O O O O
a O O O O
physiological O O O O
artifact O O O O
related O O O O
to O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
red O O O O
- O O O O
screening O O O O
pigments O O O O
in O O O O
the O O O O
aphid O O O O
' O O O O
s O O O O
compound O O O O
eye O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Role O O O O
of O O O O
Frass O O O O
and O O O O
Cocoon O O O O
Volatiles O O O O
in O O O O
Host O O O O
Location O O O O
by O O O O
Monodontomerus O O O O
aeneus O O O O
, O O O O
a O O O O
Parasitoid O O O O
of O O O O
Megachilid O O O O
Solitary O O O O
Bees O O O O
. O O O O
    
Monodontomerus O O O O
aeneus O O O O
( O O O O
Fonscolombe O O O O
) O O O O
is O O O O
a O O O O
parasitic O O O O
wasp O O O O
that O O O O
oviposits O O O O
on O O O O
the O O O O
prepupae O O O O
and O O O O
pupae O O O O
of O O O O
Osmia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cornuta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Latreille O O O O
) O O O O
and O O O O
other O O O O
solitary O O O O
bee O O O O
species O O O O
. O O O O
    
A O O O O
two O O O O
- O O O O
armed O O O O
olfactometer O O O O
was O O O O
used O O O O
to O O O O
test O O O O
the O O O O
olfactory O O O O
attractiveness O O O O
of O O O O
O B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cornuta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
prepupae O O O O
, O O O O
cocoon O O O O
, O O O O
and O O O O
larval O O O O
frass O O O O
to O O O O
female O O O O
M O O O O
. O O O O
aeneus O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
cocoon O O O O
and O O O O
frass O O O O
attracted O O O O
the O O O O
female O O O O
parasitoids O O O O
, O O O O
but O O O O
frass O O O O
alone O O O O
was O O O O
more O O O O
attractive O O O O
than O O O O
the O O O O
cocoon O O O O
and O O O O
the O O O O
cocoon O O O O
with O O O O
frass O O O O
was O O O O
more O O O O
attractive O O O O
than O O O O
frass O O O O
alone O O O O
. O O O O
    
Female O O O O
parasitoids O O O O
were O O O O
not O O O O
attracted O O O O
by O O O O
the O O O O
host O O O O
prepupa O O O O
. O O O O
    
M33 O O O O
( O O O O
methanol O O O O
) O O O O
was O O O O
the O O O O
organic O O O O
volatile O O O O
most O O O O
emitted O O O O
by O O O O
cocoons O O O O
and O O O O
m61 O O O O
( O O O O
acetic O O O O
acid O O O O
) O O O O
was O O O O
the O O O O
compound O O O O
most O O O O
emitted O O O O
by O O O O
frass O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
cocoons O O O O
showed O O O O
higher O O O O
emission O O O O
for O O O O
almost O O O O
all O O O O
compounds O O O O
, O O O O
including O O O O
m61 O O O O
( O O O O
acetic O O O O
acid O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
acetic O O O O
acid O O O O
alone O O O O
attracted O O O O
M O O O O
. O O O O
aeneus O O O O
, O O O O
a O O O O
complex O O O O
volatile O O O O
signal O O O O
is O O O O
probably O O O O
involved O O O O
in O O O O
the O O O O
attraction O O O O
process O O O O
because O O O O
the O O O O
ratio O O O O
of O O O O
acetic O O O O
acid O O O O
and O O O O
acetaldehyde O O O O
characteristic O O O O
of O O O O
the O O O O
frass O O O O
was O O O O
more O O O O
attractive O O O O
than O O O O
other O O O O
ratios O O O O
. O O O O
    
Rapid O O O O
Cold O O O O
Hardening O O O O
and O O O O
Expression O O O O
of O O O O
Heat O O O O
Shock O O O O
Protein O O O O
Genes O O O O
in O O O O
the O O O O
B O O O O
- O O O O
Biotype O O O O
Bemisia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tabaci O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
This O O O O
paper O O O O
describes O O O O
the O O O O
rapid O O O O
cold O O O O
hardening O O O O
processes O O O O
of O O O O
the O O O O
sweetpotato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
whitefly O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Bemisia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tabaci O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Gennadius O O O O
) O O O O
. O O O O
    
It O O O O
was O O O O
found O O O O
that O O O O
all O O O O
developmental O O O O
stages O O O O
of O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tabaci O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
have O O O O
the O O O O
capacity O O O O
of O O O O
rapid O O O O
cold O O O O
hardening O O O O
and O O O O
the O O O O
length O O O O
of O O O O
time O O O O
required O O O O
to O O O O
induce O O O O
maximal O O O O
cold O O O O
hardiness O O O O
at O O O O
0 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
varies O O O O
with O O O O
stage O O O O
. O O O O
    
There O O O O
was O O O O
only O O O O
18 O O O O
. O O O O
3 O O O O
% O O O O
survival O O O O
when O O O O
adult O O O O
whiteflies O O O O
were O O O O
transferred O O O O
directly O O O O
from O O O O
26 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
to O O O O
- O O O O
8 O O O O
. O O O O
5 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
for O O O O
2 O O O O
h O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
exposure O O O O
to O O O O
0 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
for O O O O
1 O O O O
h O O O O
before O O O O
transfer O O O O
to O O O O
- O O O O
8 O O O O
. O O O O
5 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
increased O O O O
the O O O O
survival O O O O
to O O O O
81 O O O O
. O O O O
2 O O O O
% O O O O
. O O O O
    
The O O O O
whiteflies O O O O
show O O O O
"""" O O O O
prefreeze O O O O
"""" O O O O
mortality O O O O
when O O O O
they O O O O
were O O O O
exposed O O O O
to O O O O
temperatures O O O O
above O O O O
the O O O O
supercooling O O O O
point O O O O
( O O O O
SCP O O O O
) O O O O
, O O O O
although O O O O
the O O O O
range O O O O
of O O O O
SCP O O O O
of O O O O
whiteflies O O O O
is O O O O
- O O O O
26 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
to O O O O
- O O O O
29 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
. O O O O
    
The O O O O
rapid O O O O
cold O O O O
hardening O O O O
had O O O O
no O O O O
effect O O O O
on O O O O
SCP O O O O
and O O O O
reduced O O O O
the O O O O
lower O O O O
lethal O O O O
temperature O O O O
of O O O O
adults O O O O
from O O O O
- O O O O
9 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
to O O O O
- O O O O
11 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
. O O O O
    
Rapid O O O O
cold O O O O
- O O O O
hardened O O O O
adults O O O O
had O O O O
a O O O O
similar O O O O
lifespan O O O O
as O O O O
the O O O O
control O O O O
group O O O O
but O O O O
deposited O O O O
fewer O O O O
eggs O O O O
than O O O O
nonhardened O O O O
individuals O O O O
. O O O O
    
The O O O O
expression O O O O
profiles O O O O
during O O O O
cold O O O O
hardening O O O O
and O O O O
recovery O O O O
from O O O O
this O O O O
process O O O O
revealed O O O O
that O O O O
HSP90 O O O O
did O O O O
not O O O O
respond O O O O
to O O O O
cold O O O O
stress O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
HSP70 O O O O
and O O O O
HSP20 O O O O
were O O O O
significantly O O O O
induced O O O O
by O O O O
cold O O O O
with O O O O
different O O O O
temporal O O O O
expression O O O O
patterns O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
the O O O O
rapid O O O O
cold O O O O
hardening O O O O
response O O O O
is O O O O
possibly O O O O
advantageous O O O O
to O O O O
whiteflies O O O O
that O O O O
are O O O O
often O O O O
exposed O O O O
to O O O O
drastic O O O O
temperature O O O O
fluctuations O O O O
in O O O O
spring O O O O
or O O O O
autumn O O O O
in O O O O
northern O O O O
China O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
HSP70 O O O O
and O O O O
HSP20 O O O O
may O O O O
be O O O O
associated O O O O
with O O O O
the O O O O
cold O O O O
tolerance O O O O
of O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tabaci O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Interspecific O O O O
Interactions O O O O
Between O O O O
Bemisia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tabaci O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Biotype O O O O
B O O O O
and O O O O
Trialeurodes B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
vaporariorum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Hemiptera O O O O
: O O O O
Aleyrodidae O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Bemisia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tabaci O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Gennadius O O O O
) O O O O
biotype O O O O
B O O O O
and O O O O
Trialeurodes B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
vaporariorum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Westwood O O O O
) O O O O
are O O O O
invasive O O O O
whitefly O O O O
species O O O O
that O O O O
often O O O O
co O O O O
- O O O O
occur O O O O
on O O O O
greenhouse O O O O
- O O O O
grown O O O O
vegetables O O O O
in O O O O
northern O O O O
China O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tabaci O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
biotype O O O O
B O O O O
has O O O O
been O O O O
present O O O O
in O O O O
China O O O O
for O O O O
a O O O O
relatively O O O O
short O O O O
period O O O O
of O O O O
time O O O O
, O O O O
it O O O O
has O O O O
become O O O O
dominant O O O O
over O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
vaporariorum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
We O O O O
studied O O O O
the O O O O
interspecific O O O O
competitive O O O O
interactions O O O O
between O O O O
the O O O O
two O O O O
species O O O O
in O O O O
single O O O O
or O O O O
mixed O O O O
cultures O O O O
at O O O O
24 O O O O
+ O O O O
/ O O O O
- O O O O
1 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
, O O O O
40 O O O O
+ O O O O
/ O O O O
- O O O O
5 O O O O
% O O O O
RH O O O O
, O O O O
and O O O O
L14 O O O O
: O O O O
D10 O O O O
h O O O O
photoperiod O O O O
. O O O O
    
Female O O O O
longevity O O O O
on O O O O
tomato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
was O O O O
not O O O O
significantly O O O O
different O O O O
between O O O O
species O O O O
, O O O O
but O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tabaci O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
reproduced O O O O
4 O O O O
. O O O O
3 O O O O
to O O O O
4 O O O O
. O O O O
9 O O O O
fold O O O O
more O O O O
progeny O O O O
. O O O O
    
The O O O O
ratio O O O O
of O O O O
female O O O O
to O O O O
male O O O O
progeny O O O O
in O O O O
both O O O O
instances O O O O
was O O O O
greater O O O O
for O O O O
B O O O O
. O O O O
tabaci O O O O
. O O O O
    
When O O O O
cultured O O O O
on O O O O
tomato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
cotton B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
and O O O O
tobacco B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tabaci O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
developed O O O O
0 O O O O
. O O O O
8 O O O O
, O O O O
3 O O O O
. O O O O
3 O O O O
, O O O O
and O O O O
4 O O O O
. O O O O
7 O O O O
d O O O O
earlier O O O O
in O O O O
single O O O O
culture O O O O
, O O O O
and O O O O
1 O O O O
. O O O O
8 O O O O
, O O O O
3 O O O O
. O O O O
9 O O O O
, O O O O
and O O O O
4 O O O O
. O O O O
3 O O O O
d O O O O
earlier O O O O
in O O O O
mixed O O O O
culture O O O O
. O O O O
    
B O O O O
. O O O O
tabaci O O O O
displaced O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
vaporariorum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
four O O O O
, O O O O
five O O O O
and O O O O
six O O O O
generations O O O O
when O O O O
the O O O O
initial O O O O
ratios O O O O
of O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tabaci O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
to O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
vaporariorum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
were O O O O
15 O O O O
: O O O O
15 O O O O
, O O O O
20 O O O O
: O O O O
10 O O O O
, O O O O
or O O O O
10 O O O O
: O O O O
20 O O O O
on O O O O
tomato O O O O
. O O O O
    
Populations O O O O
of O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tabaci O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
were O O O O
2 O O O O
. O O O O
3 O O O O
fold O O O O
higher O O O O
than O O O O
that O O O O
of O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
vaporariorum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
on O O O O
tomato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
plants O O O O
for O O O O
seven O O O O
consecutive O O O O
generations O O O O
in O O O O
single O O O O
culture O O O O
. O O O O
    
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tabaci O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
performed O O O O
better O O O O
in O O O O
development O O O O
, O O O O
survival O O O O
, O O O O
fecundity O O O O
, O O O O
and O O O O
female O O O O
ratio O O O O
. O O O O
    
We O O O O
conclude O O O O
that O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tabaci O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
could O O O O
displace O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
vaporariorum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
as O O O O
short O O O O
as O O O O
four O O O O
generations O O O O
in O O O O
a O O O O
controlled O O O O
greenhouse O O O O
environment O O O O
when O O O O
they O O O O
start O O O O
at O O O O
equal O O O O
proportions O O O O
. O O O O
    
Warmer O O O O
greenhouse O O O O
conditions O O O O
and O O O O
an O O O O
increase O O O O
in O O O O
total O O O O
greenhouse O O O O
area O O O O
could O O O O
be O O O O
contributing O O O O
factors O O O O
in O O O O
the O O O O
recent O O O O
dominance O O O O
of O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tabaci O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
