Flavobacterium O O O O
sinopsychrotolerans O O O O
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
, O O O O
isolated O O O O
from O O O O
a O O O O
glacier O O O O
. O O O O
    
An O O O O
aerobic O O O O
, O O O O
Gram O O O O
- O O O O
negative O O O O
, O O O O
yellow O O O O
- O O O O
pigmented O O O O
bacterial O O O O
strain O O O O
, O O O O
designated O O O O
0533 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
, O O O O
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
frozen O O O O
soil O O O O
from O O O O
the O O O O
China O O O O
No O O O O
. O O O O
1 O O O O
glacier O O O O
. O O O O
    
Phylogenetic O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
strain O O O O
0533 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
was O O O O
a O O O O
member O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Flavobacterium O O O O
and O O O O
exhibited O O O O
97 O O O O
. O O O O
1 O O O O
- O O O O
98 O O O O
. O O O O
7 O O O O
% O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
sequence O O O O
similarity O O O O
with O O O O
its O O O O
nearest O O O O
phylogenetic O O O O
neighbours O O O O
. O O O O
    
Strain O O O O
0533 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
exhibited O O O O
phenotypic O O O O
and O O O O
chemotaxonomic O O O O
characteristics O O O O
common O O O O
to O O O O
the O O O O
genus O O O O
Flavobacterium O O O O
: O O O O
menaquinone O O O O
- O O O O
6 O O O O
( O O O O
MK O O O O
- O O O O
6 O O O O
) O O O O
was O O O O
the O O O O
predominant O O O O
quinone O O O O
and O O O O
iso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
15 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
, O O O O
C O O O O
( O O O O
17 O O O O
: O O O O
1 O O O O
) O O O O
omega6c O O O O
, O O O O
anteiso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
15 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
, O O O O
iso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
15 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
3 O O O O
- O O O O
OH O O O O
, O O O O
C O O O O
( O O O O
15 O O O O
: O O O O
1 O O O O
) O O O O
omega6c O O O O
, O O O O
iso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
16 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
3 O O O O
- O O O O
OH O O O O
, O O O O
summed O O O O
feature O O O O
3 O O O O
( O O O O
comprising O O O O
C O O O O
( O O O O
16 O O O O
: O O O O
1 O O O O
) O O O O
omega7c O O O O
and O O O O
/ O O O O
or O O O O
C O O O O
( O O O O
16 O O O O
: O O O O
1 O O O O
) O O O O
omega6c O O O O
) O O O O
, O O O O
iso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
15 O O O O
: O O O O
1 O O O O
) O O O O
G O O O O
and O O O O
iso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
17 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
3 O O O O
- O O O O
OH O O O O
were O O O O
the O O O O
major O O O O
fatty O O O O
acids O O O O
( O O O O
> O O O O
5 O O O O
% O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
DNA O O O O
G O O O O
+ O O O O
C O O O O
content O O O O
was O O O O
32 O O O O
. O O O O
5 O O O O
mol O O O O
% O O O O
. O O O O
    
On O O O O
the O O O O
basis O O O O
of O O O O
phenotypic O O O O
and O O O O
genotypic O O O O
data O O O O
, O O O O
a O O O O
novel O O O O
species O O O O
, O O O O
Flavobacterium O O O O
sinopsychrotolerans O O O O
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
, O O O O
is O O O O
proposed O O O O
. O O O O
    
The O O O O
type O O O O
strain O O O O
is O O O O
0533 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
( O O O O
= O O O O
CGMCC O O O O
1 O O O O
. O O O O
8704 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
JCM O O O O
16398 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Litoreibacter B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
albidus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gen O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
, O O O O
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
and O O O O
Litoreibacter B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
janthinus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
, O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
class O O O O
Alphaproteobacteria O O O O
isolated O O O O
from O O O O
the O O O O
seashore O O O O
. O O O O
    
Two O O O O
Gram O O O O
- O O O O
negative O O O O
, O O O O
strictly O O O O
aerobic O O O O
, O O O O
non O O O O
- O O O O
motile O O O O
bacteria O O O O
designated O O O O
strains O O O O
KMM B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
3851 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
and O O O O
KMM B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
3842 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
were O O O O
respectively O O O O
isolated O O O O
from O O O O
a O O O O
marine O O O O
snail O O O O
specimen O O O O
( O O O O
Umbonium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
costatum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
and O O O O
from O O O O
surrounding O O O O
sediments O O O O
collected O O O O
simultaneously O O O O
from O O O O
the O O O O
shore O O O O
of O O O O
the O O O O
Sea O O O O
of O O O O
Japan O O O O
. O O O O
    
Phylogenetic O O O O
analysis O O O O
based O O O O
on O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequences O O O O
showed O O O O
that O O O O
strains O O O O
KMM B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
3851 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
and O O O O
KMM B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
3842 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
were O O O O
affiliated O O O O
with O O O O
the O O O O
Roseobacter O O O O
lineage O O O O
of O O O O
the O O O O
class O O O O
Alphaproteobacteria O O O O
as O O O O
a O O O O
separate O O O O
phylogenetic O O O O
line O O O O
adjacent O O O O
to O O O O
the O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Thalassobacter O O O O
. O O O O
    
These O O O O
novel O O O O
isolates O O O O
shared O O O O
98 O O O O
. O O O O
5 O O O O
% O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
similarity O O O O
and O O O O
15 O O O O
% O O O O
DNA O O O O
- O O O O
DNA O O O O
relatedness O O O O
. O O O O
    
The O O O O
major O O O O
isoprenoid O O O O
quinone O O O O
of O O O O
both O O O O
strains O O O O
was O O O O
Q O O O O
- O O O O
10 O O O O
and O O O O
polar O O O O
lipids O O O O
consisted O O O O
of O O O O
phosphatidylcholine O O O O
, O O O O
phosphatidylethanolamine O O O O
, O O O O
phosphatidylglycerol O O O O
and O O O O
aminophospholipids O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
, O O O O
strain O O O O
KMM B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
3851 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
contained O O O O
two O O O O
unknown O O O O
lipids O O O O
, O O O O
whereas O O O O
strain O O O O
KMM B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
3842 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
contained O O O O
diphosphatidylglycerol O O O O
. O O O O
    
Fatty O O O O
acid O O O O
analysis O O O O
revealed O O O O
C O O O O
( O O O O
18 O O O O
: O O O O
1 O O O O
) O O O O
omega7c O O O O
and O O O O
C O O O O
( O O O O
16 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
as O O O O
major O O O O
components O O O O
and O O O O
small O O O O
amounts O O O O
of O O O O
C O O O O
( O O O O
18 O O O O
: O O O O
2 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
DNA O O O O
G O O O O
+ O O O O
C O O O O
contents O O O O
were O O O O
60 O O O O
. O O O O
4 O O O O
mol O O O O
% O O O O
( O O O O
KMM B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
3851 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
and O O O O
58 O O O O
. O O O O
5 O O O O
mol O O O O
% O O O O
( O O O O
KMM B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
3842 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Based O O O O
on O O O O
distinctive O O O O
phenotypic O O O O
characteristics O O O O
, O O O O
DNA O O O O
- O O O O
DNA O O O O
hybridization O O O O
data O O O O
and O O O O
phylogenetic O O O O
distance O O O O
, O O O O
strains O O O O
KMM B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
3851 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
and O O O O
KMM B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
3842 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
should O O O O
be O O O O
classified O O O O
as O O O O
representatives O O O O
of O O O O
two O O O O
novel O O O O
species O O O O
in O O O O
a O O O O
new O O O O
genus O O O O
, O O O O
Litoreibacter O O O O
gen O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
, O O O O
with O O O O
the O O O O
type O O O O
species O O O O
Litoreibacter B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
albidus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
    
( O O O O
type O O O O
strain O O O O
KMM B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
3851 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
NRIC O O O O
0773 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
JCM O O O O
16493 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
and O O O O
a O O O O
second O O O O
species O O O O
Litoreibacter B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
janthinus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
    
( O O O O
type O O O O
strain O O O O
KMM B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
3842 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
NRIC O O O O
0772 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
JCM O O O O
16492 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Methanobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
petrolearium O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Methanobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ferruginis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
mesophilic O O O O
methanogens O O O O
isolated O O O O
from O O O O
salty O O O O
environments O O O O
. O O O O
    
Two O O O O
methane O O O O
- O O O O
producing O O O O
archaea O O O O
, O O O O
designated O O O O
Mic5c12 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
and O O O O
Mic6c05 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
, O O O O
were O O O O
isolated O O O O
from O O O O
sludge O O O O
deposited O O O O
in O O O O
a O O O O
crude O O O O
oil O O O O
storage O O O O
tank O O O O
and O O O O
a O O O O
tubercle O O O O
on O O O O
the O O O O
interior O O O O
of O O O O
a O O O O
pipe O O O O
transporting O O O O
natural O O O O
gas O O O O
- O O O O
containing O O O O
brine O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
The O O O O
isolates O O O O
were O O O O
Gram O O O O
- O O O O
staining O O O O
- O O O O
variable O O O O
, O O O O
non O O O O
- O O O O
motile O O O O
rods O O O O
and O O O O
grew O O O O
only O O O O
on O O O O
H O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
/ O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Strain O O O O
Mic6c05 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
produced O O O O
methane O O O O
from O O O O
some O O O O
alcohols O O O O
without O O O O
showing O O O O
any O O O O
growth O O O O
; O O O O
strain O O O O
Mic5c12 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
did O O O O
not O O O O
utilize O O O O
alcohols O O O O
. O O O O
    
The O O O O
optimum O O O O
growth O O O O
conditions O O O O
for O O O O
strain O O O O
Mic5c12 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
were O O O O
35 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
, O O O O
pH O O O O
6 O O O O
. O O O O
5 O O O O
and O O O O
0 O O O O
- O O O O
0 O O O O
. O O O O
68 O O O O
M O O O O
NaCl O O O O
and O O O O
for O O O O
strain O O O O
Mic6c05 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
were O O O O
40 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
, O O O O
pH O O O O
6 O O O O
. O O O O
0 O O O O
- O O O O
7 O O O O
. O O O O
5 O O O O
and O O O O
0 O O O O
. O O O O
34 O O O O
M O O O O
NaCl O O O O
. O O O O
    
Strain O O O O
Mic5c12 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
was O O O O
halotolerant O O O O
and O O O O
strain O O O O
Mic6c05 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
was O O O O
halophilic O O O O
. O O O O
    
Comparative O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
analysis O O O O
revealed O O O O
that O O O O
strains O O O O
Mic5c12 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
and O O O O
Mic6c05 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
belonged O O O O
to O O O O
the O O O O
genus O O O O
Methanobacterium O O O O
and O O O O
their O O O O
closest O O O O
relative O O O O
was O O O O
Methanobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
subterraneum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
A8p O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
( O O O O
97 O O O O
. O O O O
3 O O O O
and O O O O
97 O O O O
. O O O O
9 O O O O
% O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
similarity O O O O
, O O O O
respectively O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
findings O O O O
from O O O O
the O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
analyses O O O O
were O O O O
supported O O O O
by O O O O
analysis O O O O
of O O O O
McrA O O O O
, O O O O
the O O O O
alpha O O O O
subunit O O O O
of O O O O
methyl O O O O
- O O O O
coenzyme O O O O
M O O O O
reductase O O O O
. O O O O
    
On O O O O
the O O O O
basis O O O O
of O O O O
phylogenetic O O O O
analyses O O O O
and O O O O
phenotypic O O O O
characteristics O O O O
, O O O O
two O O O O
novel O O O O
species O O O O
are O O O O
proposed O O O O
, O O O O
Methanobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
petrolearium O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Methanobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ferruginis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
with O O O O
type O O O O
strains O O O O
Mic5c12 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
( O O O O
= O O O O
NBRC O O O O
105198 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
DSM O O O O
22353 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
and O O O O
Mic6c05 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
( O O O O
= O O O O
NBRC O O O O
105197 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
DSM O O O O
21974 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
Jiangella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
muralis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
from O O O O
an O O O O
indoor O O O O
environment O O O O
. O O O O
    
A O O O O
Gram O O O O
- O O O O
stain O O O O
- O O O O
positive O O O O
, O O O O
non O O O O
- O O O O
spore O O O O
- O O O O
forming O O O O
actinobacterium O O O O
, O O O O
designated O O O O
15 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Je O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
017 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
wall O O O O
material O O O O
of O O O O
an O O O O
indoor O O O O
environment O O O O
. O O O O
    
The O O O O
isolate O O O O
formed O O O O
a O O O O
rudimentary O O O O
substrate O O O O
mycelium O O O O
that O O O O
fragmented O O O O
into O O O O
rod O O O O
- O O O O
shaped O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
On O O O O
the O O O O
basis O O O O
of O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
analysis O O O O
, O O O O
strain O O O O
15 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Je O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
017 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
shown O O O O
to O O O O
belong O O O O
to O O O O
the O O O O
genus O O O O
Jiangella O O O O
and O O O O
was O O O O
most O O O O
closely O O O O
related O O O O
to O O O O
Jiangella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
alba O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
YIM O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
61503 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
99 O O O O
. O O O O
7 O O O O
% O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
similarity O O O O
) O O O O
, O O O O
Jiangella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
alkaliphila O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
D8 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
87 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
99 O O O O
. O O O O
0 O O O O
% O O O O
) O O O O
and O O O O
Jiangella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
gansuensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
YIM O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
002 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
99 O O O O
. O O O O
0 O O O O
% O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
predominant O O O O
menaquinone O O O O
was O O O O
MK O O O O
- O O O O
9 O O O O
( O O O O
H O O O O
( O O O O
4 O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Whole O O O O
- O O O O
cell O O O O
hydrolysates O O O O
contained O O O O
ll O O O O
- O O O O
diaminopimelic O O O O
acid O O O O
as O O O O
the O O O O
diagnostic O O O O
diamino O O O O
acid O O O O
in O O O O
the O O O O
cell O O O O
wall O O O O
and O O O O
rhamnose O O O O
and O O O O
glucose O O O O
as O O O O
the O O O O
main O O O O
sugars O O O O
. O O O O
    
Mycolic O O O O
acids O O O O
were O O O O
absent O O O O
. O O O O
    
The O O O O
polar O O O O
lipid O O O O
profile O O O O
consisted O O O O
of O O O O
diphosphatidylglycerol O O O O
, O O O O
phosphatidylglycerol O O O O
, O O O O
phosphatidylinositol O O O O
, O O O O
phosphatidylinositol O O O O
mannoside O O O O
and O O O O
seven O O O O
unknown O O O O
phospholipids O O O O
. O O O O
    
The O O O O
fatty O O O O
acid O O O O
profile O O O O
contained O O O O
major O O O O
amounts O O O O
( O O O O
> O O O O
5 O O O O
% O O O O
) O O O O
of O O O O
anteiso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
15 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
, O O O O
iso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
16 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
, O O O O
iso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
15 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
, O O O O
iso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
17 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
, O O O O
anteiso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
17 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
and O O O O
C O O O O
( O O O O
17 O O O O
: O O O O
1 O O O O
) O O O O
omega8c O O O O
, O O O O
which O O O O
supported O O O O
the O O O O
affiliation O O O O
of O O O O
strain O O O O
15 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Je O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
017 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
to O O O O
the O O O O
genus O O O O
Jiangella O O O O
. O O O O
    
DNA O O O O
- O O O O
DNA O O O O
relatedness O O O O
and O O O O
physiological O O O O
and O O O O
biochemical O O O O
tests O O O O
allowed O O O O
the O O O O
differentiation O O O O
of O O O O
strain O O O O
15 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Je O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
017 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
from O O O O
the O O O O
type O O O O
strains O O O O
of O O O O
the O O O O
three O O O O
known O O O O
Jiangella O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Strain O O O O
15 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Je O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
017 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
represents O O O O
a O O O O
novel O O O O
Jiangella O O O O
species O O O O
, O O O O
for O O O O
which O O O O
we O O O O
propose O O O O
the O O O O
name O O O O
Jiangella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
muralis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
with O O O O
type O O O O
strain O O O O
15 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Je O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
017 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
= O O O O
DSM O O O O
45357 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
CCM O O O O
7680 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Surveys O O O O
of O O O O
non O O O O
- O O O O
ribosomal O O O O
peptide O O O O
and O O O O
polyketide O O O O
assembly O O O O
lines O O O O
in O O O O
fungi O O O O
and O O O O
prospects O O O O
for O O O O
their O O O O
analysis O O O O
in O O O O
vitro O O O O
and O O O O
in O O O O
vivo O O O O
. O O O O
    
With O O O O
many O O O O
bioactive O O O O
non O O O O
- O O O O
ribosomal O O O O
peptides O O O O
and O O O O
polyketides O O O O
produced O O O O
in O O O O
fungi O O O O
, O O O O
studies O O O O
of O O O O
their O O O O
biosyntheses O O O O
are O O O O
an O O O O
active O O O O
area O O O O
of O O O O
research O O O O
. O O O O
    
Practical O O O O
limitations O O O O
of O O O O
working O O O O
with O O O O
mega O O O O
- O O O O
dalton O O O O
synthetases O O O O
including O O O O
cell O O O O
lysis O O O O
and O O O O
protein O O O O
extraction O O O O
to O O O O
recombinant O O O O
gene O O O O
and O O O O
pathway O O O O
expression O O O O
has O O O O
slowed O O O O
understanding O O O O
of O O O O
many O O O O
secondary O O O O
metabolic O O O O
processes O O O O
relative O O O O
to O O O O
bacterial O O O O
counterparts O O O O
. O O O O
    
Recent O O O O
advances O O O O
in O O O O
accessing O O O O
fungal O O O O
biosynthetic O O O O
machinery O O O O
are O O O O
beginning O O O O
to O O O O
change O O O O
this O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
describe O O O O
the O O O O
successes O O O O
of O O O O
some O O O O
studies O O O O
of O O O O
thiotemplate O O O O
biosynthesis O O O O
in O O O O
fungal O O O O
systems O O O O
, O O O O
along O O O O
with O O O O
very O O O O
recent O O O O
advances O O O O
in O O O O
chemical O O O O
tagging O O O O
and O O O O
mass O O O O
spectrometric O O O O
strategies O O O O
to O O O O
selectively O O O O
study O O O O
biosynthetic O O O O
conveyer O O O O
belts O O O O
in O O O O
isolation O O O O
, O O O O
and O O O O
within O O O O
a O O O O
few O O O O
years O O O O
, O O O O
in O O O O
endogenous O O O O
fungal O O O O
proteomes O O O O
. O O O O
    
OsEDR1 O O O O
negatively O O O O
regulates O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bacterial O O O O
resistance O O O O
via O O O O
activation O O O O
of O O O O
ethylene O O O O
biosynthesis O O O O
. O O O O
    
Rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
OsEDR1 O O O O
is O O O O
a O O O O
sequence O O O O
ortholog O O O O
of O O O O
Arabidopsis O O O O
EDR1 O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
its O O O O
molecular O O O O
function O O O O
is O O O O
unknown O O O O
. O O O O
    
We O O O O
show O O O O
here O O O O
that O O O O
OsEDR1 O O O O
- O O O O
suppressing O O O O
/ O O O O
knockout O O O O
( O O O O
KO O O O O
) O O O O
plants O O O O
, O O O O
which O O O O
developed O O O O
spontaneous O O O O
lesions O O O O
on O O O O
the O O O O
leaves O O O O
, O O O O
have O O O O
enhanced O O O O
resistance O O O O
to O O O O
Xanthomonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
oryzae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pv O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
oryzae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Xoo B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
causing O O O O
bacterial O O O O
blight O O O O
disease O O O O
. O O O O
    
This O O O O
resistance O O O O
was O O O O
associated O O O O
with O O O O
increased O O O O
accumulation O O O O
of O O O O
salicylic O O O O
acid O O O O
( O O O O
SA O O O O
) O O O O
and O O O O
jasmonic O O O O
acid O O O O
( O O O O
JA O O O O
) O O O O
, O O O O
induced O O O O
expression O O O O
of O O O O
SA O O O O
- O O O O
and O O O O
JA O O O O
- O O O O
related O O O O
genes O O O O
and O O O O
suppressed O O O O
accumulation O O O O
of O O O O
1 O O O O
- O O O O
aminocyclopropane O O O O
- O O O O
1 O O O O
- O O O O
carboxylic O O O O
acid O O O O
( O O O O
ACC O O O O
) O O O O
, O O O O
the O O O O
direct O O O O
precursor O O O O
of O O O O
ethylene O O O O
, O O O O
and O O O O
expression O O O O
of O O O O
ethylene O O O O
- O O O O
related O O O O
genes O O O O
. O O O O
    
OsEDR1 O O O O
- O O O O
KO O O O O
plants O O O O
also O O O O
showed O O O O
suppressed O O O O
production O O O O
of O O O O
ethylene O O O O
. O O O O
    
Knockout O O O O
of O O O O
OsEDR1 O O O O
suppressed O O O O
the O O O O
ACC O O O O
synthase O O O O
( O O O O
ACS O O O O
) O O O O
gene O O O O
family O O O O
, O O O O
which O O O O
encodes O O O O
the O O O O
rate O O O O
- O O O O
limiting O O O O
enzymes O O O O
of O O O O
ethylene O O O O
biosynthesis O O O O
by O O O O
catalysing O O O O
the O O O O
formation O O O O
of O O O O
ACC O O O O
. O O O O
    
The O O O O
lesion O O O O
phenotype O O O O
and O O O O
enhanced O O O O
bacterial O O O O
resistance O O O O
of O O O O
the O O O O
OsEDR1 O O O O
- O O O O
KO O O O O
plants O O O O
was O O O O
partly O O O O
complemented O O O O
by O O O O
the O O O O
treatment O O O O
with O O O O
ACC O O O O
. O O O O
    
ACC O O O O
treatment O O O O
was O O O O
associated O O O O
with O O O O
decreased O O O O
SA O O O O
and O O O O
JA O O O O
biosynthesis O O O O
in O O O O
OsEDR1 O O O O
- O O O O
KO O O O O
plants O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
, O O O O
aminoethoxyvinylglycine O O O O
, O O O O
the O O O O
inhibitor O O O O
of O O O O
ethylene O O O O
biosynthesis O O O O
, O O O O
promoted O O O O
expression O O O O
of O O O O
SA O O O O
and O O O O
JA O O O O
synthesis O O O O
- O O O O
related O O O O
genes O O O O
in O O O O
OsEDR1 O O O O
- O O O O
KO O O O O
plants O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
ethylene O O O O
is O O O O
a O O O O
negative O O O O
signalling O O O O
molecule O O O O
in O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bacterial O O O O
resistance O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
Xoo B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
interaction O O O O
, O O O O
OsEDR1 O O O O
transcriptionally O O O O
promotes O O O O
the O O O O
synthesis O O O O
of O O O O
ethylene O O O O
that O O O O
, O O O O
in O O O O
turn O O O O
, O O O O
suppresses O O O O
SA O O O O
- O O O O
and O O O O
JA O O O O
- O O O O
associated O O O O
defence O O O O
signalling O O O O
. O O O O
    
Characterizing O O O O
demographic O O O O
variation O O O O
and O O O O
contributions O O O O
to O O O O
population O O O O
growth O O O O
rate O O O O
in O O O O
a O O O O
declining O O O O
population O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Understanding O O O O
how O O O O
demographic O O O O
variation O O O O
translates O O O O
into O O O O
variation O O O O
in O O O O
population O O O O
growth O O O O
rate O O O O
( O O O O
lambda O O O O
) O O O O
is O O O O
central O O O O
to O O O O
understanding O O O O
population O O O O
dynamics O O O O
. O O O O
    
Such O O O O
understanding O O O O
ideally O O O O
requires O O O O
knowledge O O O O
of O O O O
the O O O O
mean O O O O
, O O O O
variance O O O O
and O O O O
covariance O O O O
among O O O O
all O O O O
demographic O O O O
rates O O O O
, O O O O
allowing O O O O
the O O O O
potential O O O O
and O O O O
realized O O O O
contribution O O O O
of O O O O
each O O O O
rate O O O O
to O O O O
lambda O O O O
to O O O O
be O O O O
estimated O O O O
. O O O O
    
Such O O O O
studies O O O O
require O O O O
integrated O O O O
monitoring O O O O
of O O O O
all O O O O
demographic O O O O
rates O O O O
across O O O O
multiple O O O O
years O O O O
and O O O O
are O O O O
consequently O O O O
rare O O O O
, O O O O
particularly O O O O
in O O O O
declining O O O O
populations O O O O
and O O O O
for O O O O
species O O O O
with O O O O
less O O O O
tractable O O O O
life O O O O
histories O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
used O O O O
12 O O O O
years O O O O
of O O O O
comprehensive O O O O
demographic O O O O
data O O O O
from O O O O
a O O O O
declining O O O O
ring B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ouzel O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Turdus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
torquatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
population O O O O
to O O O O
estimate O O O O
the O O O O
mean O O O O
, O O O O
variance O O O O
and O O O O
covariance O O O O
in O O O O
all O O O O
major O O O O
demographic O O O O
rates O O O O
and O O O O
estimate O O O O
potential O O O O
and O O O O
realized O O O O
demographic O O O O
contributions O O O O
to O O O O
lambda O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Population O O O O
size O O O O
decreased O O O O
from O O O O
39 O O O O
to O O O O
13 O O O O
breeding O O O O
pairs O O O O
( O O O O
- O O O O
67 O O O O
% O O O O
) O O O O
and O O O O
mean O O O O
lambda O O O O
was O O O O
0 O O O O
* O O O O
91 O O O O
during O O O O
1998 O O O O
- O O O O
2009 O O O O
. O O O O
    
This O O O O
decrease O O O O
did O O O O
not O O O O
reflect O O O O
a O O O O
substantial O O O O
concurrent O O O O
decrease O O O O
in O O O O
any O O O O
single O O O O
key O O O O
demographic O O O O
rate O O O O
, O O O O
but O O O O
reflected O O O O
varying O O O O
combinations O O O O
of O O O O
demographic O O O O
rates O O O O
that O O O O
consistently O O O O
produced O O O O
lambda O O O O
& O O O O
lt O O O O
; O O O O
1 O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Basic O O O O
prospective O O O O
elasticity O O O O
analysis O O O O
indicated O O O O
that O O O O
lambda O O O O
was O O O O
most O O O O
sensitive O O O O
to O O O O
adult O O O O
survival O O O O
, O O O O
closely O O O O
followed O O O O
by O O O O
early O O O O
season O O O O
reproductive O O O O
success O O O O
and O O O O
early O O O O
brood O O O O
first O O O O
- O O O O
year O O O O
survival O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
, O O O O
integrated O O O O
elasticity O O O O
analysis O O O O
, O O O O
accounting O O O O
for O O O O
estimated O O O O
demographic O O O O
covariance O O O O
, O O O O
indicated O O O O
that O O O O
lambda O O O O
was O O O O
most O O O O
sensitive O O O O
to O O O O
early O O O O
brood O O O O
first O O O O
- O O O O
year O O O O
survival O O O O
, O O O O
closely O O O O
followed O O O O
by O O O O
re O O O O
- O O O O
nesting O O O O
rate O O O O
, O O O O
early O O O O
season O O O O
reproductive O O O O
success O O O O
, O O O O
late O O O O
- O O O O
brood O O O O
first O O O O
- O O O O
year O O O O
survival O O O O
and O O O O
adult O O O O
survival O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Retrospective O O O O
decomposition O O O O
of O O O O
variance O O O O
suggested O O O O
that O O O O
first O O O O
- O O O O
year O O O O
survival O O O O
contributed O O O O
most O O O O
to O O O O
observed O O O O
variation O O O O
in O O O O
lambda O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
demographic O O O O
comparison O O O O
with O O O O
other O O O O
related O O O O
species O O O O
suggested O O O O
that O O O O
adult O O O O
survival O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
reproductive O O O O
success O O O O
or O O O O
post O O O O
- O O O O
fledging O O O O
survival O O O O
, O O O O
averaged O O O O
lower O O O O
than O O O O
expected O O O O
throughout O O O O
the O O O O
12 O O O O
- O O O O
year O O O O
study O O O O
. O O O O
    
7 O O O O
. O O O O
    
These O O O O
data O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
multiple O O O O
approaches O O O O
, O O O O
including O O O O
comprehensive O O O O
demographic O O O O
and O O O O
comparative O O O O
analyses O O O O
and O O O O
due O O O O
consideration O O O O
of O O O O
conflicting O O O O
answers O O O O
, O O O O
may O O O O
be O O O O
necessary O O O O
to O O O O
accurately O O O O
diagnose O O O O
the O O O O
demographic O O O O
basis O O O O
of O O O O
population O O O O
change O O O O
. O O O O
    
Hydraulic O O O O
constraints O O O O
limit O O O O
height O O O O
growth O O O O
in O O O O
trees O O O O
at O O O O
high O O O O
altitude O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Low O O O O
temperatures O O O O
limit O O O O
the O O O O
fixation O O O O
of O O O O
photosynthates O O O O
and O O O O
xylogenesis O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
hypothesized O O O O
that O O O O
reduced O O O O
longitudinal O O O O
growth O O O O
in O O O O
trees O O O O
at O O O O
high O O O O
altitude O O O O
is O O O O
related O O O O
to O O O O
the O O O O
lower O O O O
hydraulic O O O O
efficiency O O O O
of O O O O
the O O O O
transport O O O O
system O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Apical O O O O
buds O O O O
of O O O O
Norway B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
spruce O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Picea B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
abies O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
trees O O O O
at O O O O
high O O O O
and O O O O
low O O O O
elevation O O O O
were O O O O
heated O O O O
during O O O O
2006 O O O O
and O O O O
2007 O O O O
. O O O O
    
At O O O O
the O O O O
end O O O O
of O O O O
the O O O O
experiment O O O O
, O O O O
trees O O O O
were O O O O
felled O O O O
. O O O O
    
Longitudinal O O O O
increments O O O O
and O O O O
tracheid O O O O
lumen O O O O
areas O O O O
were O O O O
measured O O O O
along O O O O
the O O O O
stem O O O O
. O O O O
    
Apical O O O O
hydraulic O O O O
conductivity O O O O
( O O O O
k O O O O
) O O O O
was O O O O
estimated O O O O
from O O O O
anatomical O O O O
data O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Before O O O O
heating O O O O
, O O O O
high O O O O
- O O O O
altitude O O O O
trees O O O O
showed O O O O
fewer O O O O
( O O O O
P O O O O
= O O O O
0 O O O O
. O O O O
002 O O O O
) O O O O
and O O O O
smaller O O O O
( O O O O
P O O O O
= O O O O
0 O O O O
. O O O O
008 O O O O
) O O O O
apical O O O O
conduits O O O O
, O O O O
and O O O O
therefore O O O O
reduced O O O O
k O O O O
( O O O O
P O O O O
= O O O O
0 O O O O
. O O O O
016 O O O O
) O O O O
and O O O O
stem O O O O
elongation O O O O
( O O O O
P O O O O
& O O O O
lt O O O O
; O O O O
0 O O O O
. O O O O
0001 O O O O
) O O O O
, O O O O
in O O O O
comparison O O O O
with O O O O
trees O O O O
at O O O O
low O O O O
elevation O O O O
. O O O O
    
After O O O O
2 O O O O
yr O O O O
of O O O O
heating O O O O
, O O O O
k O O O O
increased O O O O
at O O O O
both O O O O
high O O O O
( O O O O
P O O O O
= O O O O
0 O O O O
. O O O O
014 O O O O
) O O O O
and O O O O
low O O O O
( O O O O
P O O O O
= O O O O
0 O O O O
. O O O O
047 O O O O
) O O O O
elevation O O O O
. O O O O
    
Only O O O O
high O O O O
- O O O O
altitude O O O O
trees O O O O
showed O O O O
increased O O O O
stem O O O O
elongation O O O O
, O O O O
which O O O O
reached O O O O
the O O O O
same O O O O
magnitude O O O O
as O O O O
that O O O O
of O O O O
controls O O O O
at O O O O
low O O O O
elevation O O O O
( O O O O
P O O O O
= O O O O
0 O O O O
. O O O O
735 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Heating O O O O
around O O O O
the O O O O
apical O O O O
shoots O O O O
did O O O O
not O O O O
appear O O O O
to O O O O
induce O O O O
significant O O O O
changes O O O O
in O O O O
conduit O O O O
dimension O O O O
along O O O O
the O O O O
rest O O O O
of O O O O
the O O O O
stem O O O O
. O O O O
    
* O O O O
The O O O O
total O O O O
number O O O O
and O O O O
size O O O O
of O O O O
xylem O O O O
elements O O O O
at O O O O
the O O O O
stem O O O O
apex O O O O
are O O O O
strongly O O O O
constrained O O O O
by O O O O
low O O O O
temperatures O O O O
. O O O O
    
Trees O O O O
at O O O O
high O O O O
altitude O O O O
are O O O O
therefore O O O O
prevented O O O O
from O O O O
building O O O O
up O O O O
an O O O O
efficient O O O O
transport O O O O
system O O O O
, O O O O
and O O O O
their O O O O
reduced O O O O
longitudinal O O O O
growth O O O O
reflects O O O O
strong O O O O
hydraulic O O O O
limitations O O O O
. O O O O
    
Physiological O O O O
performance O O O O
of O O O O
an O O O O
Alaskan O O O O
shrub O O O O
( O O O O
Alnus O O O O
fruticosa O O O O
) O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
disease O O O O
( O O O O
Valsa O O O O
melanodiscus O O O O
) O O O O
and O O O O
water O O O O
stress O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Following O O O O
the O O O O
decades O O O O
- O O O O
long O O O O
warming O O O O
and O O O O
drying O O O O
trend O O O O
in O O O O
Alaska O O O O
, O O O O
there O O O O
is O O O O
mounting O O O O
evidence O O O O
that O O O O
temperature O O O O
- O O O O
induced O O O O
drought O O O O
stress O O O O
is O O O O
associated O O O O
with O O O O
disease O O O O
outbreaks O O O O
in O O O O
the O O O O
boreal O O O O
forest O O O O
. O O O O
    
Recent O O O O
evidence O O O O
of O O O O
this O O O O
trend O O O O
is O O O O
an O O O O
outbreak O O O O
of O O O O
Cytospora O O O O
canker O O O O
disease O O O O
( O O O O
fungal O O O O
pathogen O O O O
Valsa O O O O
melanodiscus O O O O
( O O O O
anamorph O O O O
= O O O O
Cytospora O O O O
umbrina O O O O
) O O O O
) O O O O
on O O O O
Alnus O O O O
species O O O O
. O O O O
    
* O O O O
For O O O O
Alnus O O O O
fruticosa O O O O
, O O O O
we O O O O
examined O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
water O O O O
stress O O O O
on O O O O
disease O O O O
predisposition O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
disease O O O O
and O O O O
water O O O O
stress O O O O
on O O O O
host O O O O
physiology O O O O
. O O O O
    
In O O O O
two O O O O
trials O O O O
, O O O O
we O O O O
conducted O O O O
a O O O O
full O O O O
- O O O O
factorial O O O O
experiment O O O O
that O O O O
crossed O O O O
two O O O O
levels O O O O
of O O O O
water O O O O
stress O O O O
with O O O O
three O O O O
types O O O O
of O O O O
inoculum O O O O
( O O O O
two O O O O
isolates O O O O
of O O O O
V O O O O
. O O O O
melanodiscus O O O O
, O O O O
one O O O O
control O O O O
isolate O O O O
) O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Water O O O O
stress O O O O
was O O O O
not O O O O
required O O O O
for O O O O
disease O O O O
predisposition O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
water O O O O
stress O O O O
and O O O O
disease O O O O
on O O O O
host O O O O
physiology O O O O
were O O O O
greatest O O O O
near O O O O
the O O O O
peak O O O O
phenological O O O O
stage O O O O
of O O O O
the O O O O
host O O O O
and O O O O
during O O O O
hot O O O O
, O O O O
dry O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
During O O O O
this O O O O
time O O O O
, O O O O
water O O O O
stress O O O O
and O O O O
disease O O O O
reduced O O O O
light O O O O
- O O O O
saturated O O O O
photosynthesis O O O O
( O O O O
- O O O O
30 O O O O
% O O O O
) O O O O
, O O O O
light O O O O
saturation O O O O
point O O O O
( O O O O
- O O O O
60 O O O O
% O O O O
) O O O O
and O O O O
stomatal O O O O
conductance O O O O
( O O O O
- O O O O
40 O O O O
% O O O O
) O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Our O O O O
results O O O O
depended O O O O
on O O O O
the O O O O
timing O O O O
of O O O O
water O O O O
stress O O O O
and O O O O
disease O O O O
in O O O O
relation O O O O
to O O O O
host O O O O
phenology O O O O
and O O O O
the O O O O
environment O O O O
. O O O O
    
These O O O O
factors O O O O
should O O O O
not O O O O
be O O O O
overlooked O O O O
in O O O O
attempts O O O O
to O O O O
generalize O O O O
predictions O O O O
about O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
temperature O O O O
- O O O O
induced O O O O
drought O O O O
stress O O O O
in O O O O
this O O O O
pathosystem O O O O
. O O O O
    
The O O O O
novel O O O O
marine O O O O
gliding O O O O
zooflagellate O O O O
genus O O O O
Mantamonas O O O O
( O O O O
Mantamonadida O O O O
ord O O O O
. O O O O
n O O O O
. O O O O
: O O O O
Apusozoa O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Mantamonas O O O O
is O O O O
a O O O O
novel O O O O
genus O O O O
of O O O O
marine O O O O
gliding O O O O
zooflagellates O O O O
probably O O O O
related O O O O
to O O O O
apusomonad O O O O
and O O O O
planomonad O O O O
Apusozoa O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
phase O O O O
and O O O O
differential O O O O
interference O O O O
contrast O O O O
microscopy O O O O
we O O O O
describe O O O O
the O O O O
type O O O O
species O O O O
Mantamonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
plastica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
n O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
from O O O O
coastal O O O O
sediment O O O O
in O O O O
Cumbria O O O O
, O O O O
England O O O O
. O O O O
    
Cells O O O O
are O O O O
- O O O O
5mum O O O O
long O O O O
, O O O O
- O O O O
5mum O O O O
wide O O O O
, O O O O
asymmetric O O O O
, O O O O
flattened O O O O
, O O O O
biciliate O O O O
, O O O O
and O O O O
somewhat O O O O
plastic O O O O
. O O O O
    
The O O O O
posterior O O O O
cilium O O O O
, O O O O
on O O O O
which O O O O
they O O O O
glide O O O O
smoothly O O O O
over O O O O
the O O O O
substratum O O O O
, O O O O
is O O O O
long O O O O
and O O O O
highly O O O O
acronematic O O O O
. O O O O
    
The O O O O
much O O O O
thinner O O O O
, O O O O
shorter O O O O
, O O O O
and O O O O
almost O O O O
immobile O O O O
anterior O O O O
cilium O O O O
points O O O O
forward O O O O
to O O O O
the O O O O
cell O O O O
' O O O O
s O O O O
left O O O O
. O O O O
    
These O O O O
morphological O O O O
and O O O O
behavioural O O O O
traits O O O O
suggest O O O O
that O O O O
Mantamonas O O O O
is O O O O
a O O O O
member O O O O
of O O O O
the O O O O
protozoan O O O O
phylum O O O O
Apusozoa O O O O
. O O O O
    
Analyses O O O O
of O O O O
18S O O O O
and O O O O
28S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequences O O O O
of O O O O
Mantamonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
plastica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
a O O O O
second O O O O
genetically O O O O
very O O O O
different O O O O
marine O O O O
species O O O O
from O O O O
coastal O O O O
sediment O O O O
in O O O O
Tanzania O O O O
show O O O O
Mantamonas O O O O
as O O O O
a O O O O
robustly O O O O
monophyletic O O O O
clade O O O O
, O O O O
that O O O O
is O O O O
very O O O O
divergent O O O O
from O O O O
all O O O O
other O O O O
eukaryotes O O O O
. O O O O
    
18S O O O O
rRNA O O O O
trees O O O O
mostly O O O O
place O O O O
Mantamonas O O O O
within O O O O
unikonts O O O O
( O O O O
opisthokonts O O O O
, O O O O
Apusozoa O O O O
, O O O O
and O O O O
Amoebozoa O O O O
) O O O O
but O O O O
its O O O O
precise O O O O
position O O O O
varies O O O O
with O O O O
phylogenetic O O O O
algorithm O O O O
and O O O O
/ O O O O
or O O O O
taxon O O O O
and O O O O
nucleotide O O O O
position O O O O
sampling O O O O
; O O O O
it O O O O
may O O O O
group O O O O
equally O O O O
weakly O O O O
as O O O O
sister O O O O
to O O O O
Planomonadida O O O O
, O O O O
Apusomonadida O O O O
or O O O O
Breviata O O O O
. O O O O
    
On O O O O
28S O O O O
rRNA O O O O
and O O O O
joint O O O O
18 O O O O
/ O O O O
28S O O O O
rRNA O O O O
phylogenies O O O O
( O O O O
including O O O O
11 O O O O
other O O O O
newly O O O O
obtained O O O O
apusozoan O O O O
/ O O O O
amoebozoan O O O O
28S O O O O
rRNA O O O O
sequences O O O O
) O O O O
it O O O O
consistently O O O O
strongly O O O O
groups O O O O
with O O O O
Apusomonadida O O O O
( O O O O
Apusozoa O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Scaling O O O O
of O O O O
swim O O O O
speed O O O O
in O O O O
breath O O O O
- O O O O
hold O O O O
divers O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Breath O O O O
- O O O O
hold O O O O
divers O O O O
are O O O O
widely O O O O
assumed O O O O
to O O O O
descend O O O O
and O O O O
ascend O O O O
at O O O O
the O O O O
speed O O O O
that O O O O
minimizes O O O O
energy O O O O
expenditure O O O O
per O O O O
distance O O O O
travelled O O O O
( O O O O
the O O O O
cost O O O O
of O O O O
transport O O O O
( O O O O
COT O O O O
) O O O O
) O O O O
to O O O O
maximize O O O O
foraging O O O O
duration O O O O
at O O O O
depth O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
measuring O O O O
COT O O O O
with O O O O
captive O O O O
animals O O O O
is O O O O
difficult O O O O
, O O O O
and O O O O
empirical O O O O
support O O O O
for O O O O
this O O O O
hypothesis O O O O
is O O O O
sparse O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
examined O O O O
the O O O O
scaling O O O O
relationship O O O O
of O O O O
swim O O O O
speed O O O O
in O O O O
free O O O O
- O O O O
ranging O O O O
diving O O O O
birds O O O O
, O O O O
mammals O O O O
and O O O O
turtles O O O O
( O O O O
37 O O O O
species O O O O
; O O O O
mass O O O O
range O O O O
, O O O O
0 O O O O
* O O O O
5 O O O O
- O O O O
90 O O O O
, O O O O
000 O O O O
kg O O O O
) O O O O
with O O O O
phylogenetically O O O O
informed O O O O
statistical O O O O
methods O O O O
and O O O O
derived O O O O
the O O O O
theoretical O O O O
prediction O O O O
for O O O O
the O O O O
allometric O O O O
exponent O O O O
under O O O O
the O O O O
COT O O O O
hypothesis O O O O
by O O O O
constructing O O O O
a O O O O
biomechanical O O O O
model O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Swim O O O O
speed O O O O
significantly O O O O
increased O O O O
with O O O O
mass O O O O
, O O O O
despite O O O O
considerable O O O O
variations O O O O
around O O O O
the O O O O
scaling O O O O
line O O O O
. O O O O
    
The O O O O
allometric O O O O
exponent O O O O
( O O O O
0 O O O O
* O O O O
09 O O O O
) O O O O
was O O O O
statistically O O O O
consistent O O O O
with O O O O
the O O O O
theoretical O O O O
prediction O O O O
( O O O O
0 O O O O
* O O O O
05 O O O O
) O O O O
of O O O O
the O O O O
COT O O O O
hypothesis O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
finding O O O O
suggests O O O O
a O O O O
previously O O O O
unrecognized O O O O
advantage O O O O
of O O O O
size O O O O
in O O O O
divers O O O O
: O O O O
larger O O O O
animals O O O O
swim O O O O
faster O O O O
and O O O O
thus O O O O
could O O O O
travel O O O O
longer O O O O
distance O O O O
, O O O O
search O O O O
larger O O O O
volume O O O O
of O O O O
water O O O O
for O O O O
prey O O O O
and O O O O
exploit O O O O
a O O O O
greater O O O O
range O O O O
of O O O O
depths O O O O
during O O O O
a O O O O
given O O O O
dive O O O O
duration O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
as O O O O
predicted O O O O
from O O O O
the O O O O
model O O O O
, O O O O
endotherms O O O O
( O O O O
birds O O O O
and O O O O
mammals O O O O
) O O O O
swam O O O O
faster O O O O
than O O O O
ectotherms O O O O
( O O O O
turtles O O O O
) O O O O
for O O O O
their O O O O
size O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
metabolic O O O O
power O O O O
production O O O O
limits O O O O
swim O O O O
speed O O O O
. O O O O
    
Among O O O O
endotherms O O O O
, O O O O
birds O O O O
swam O O O O
faster O O O O
than O O O O
mammals O O O O
, O O O O
which O O O O
cannot O O O O
be O O O O
explained O O O O
by O O O O
the O O O O
model O O O O
. O O O O
    
Reynolds O O O O
numbers O O O O
of O O O O
small O O O O
birds O O O O
( O O O O
& O O O O
lt O O O O
; O O O O
2 O O O O
kg O O O O
) O O O O
were O O O O
close O O O O
to O O O O
the O O O O
lower O O O O
limit O O O O
of O O O O
turbulent O O O O
flow O O O O
( O O O O
- O O O O
3 O O O O
x O O O O
10 O O O O
( O O O O
5 O O O O
) O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
they O O O O
swam O O O O
fast O O O O
possibly O O O O
to O O O O
avoid O O O O
the O O O O
increased O O O O
drag O O O O
associated O O O O
with O O O O
flow O O O O
transition O O O O
. O O O O
    
Stable O O O O
isotope O O O O
labelling O O O O
and O O O O
zinc O O O O
distribution O O O O
in O O O O
grains O O O O
studied O O O O
by O O O O
laser O O O O
ablation O O O O
ICP O O O O
- O O O O
MS O O O O
in O O O O
an O O O O
ear O O O O
culture O O O O
system O O O O
reveals O O O O
zinc O O O O
transport O O O O
barriers O O O O
during O O O O
grain O O O O
filling O O O O
in O O O O
wheat B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Zinc O O O O
( O O O O
Zn O O O O
) O O O O
deficiency O O O O
has O O O O
been O O O O
recognized O O O O
as O O O O
a O O O O
potential O O O O
risk O O O O
for O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
health O O O O
in O O O O
many O O O O
developing O O O O
regions O O O O
where O O O O
staple O O O O
food O O O O
with O O O O
low O O O O
micronutrient O O O O
density O O O O
represents O O O O
a O O O O
major O O O O
proportion O O O O
of O O O O
the O O O O
diet O O O O
. O O O O
    
The O O O O
success O O O O
of O O O O
strategies O O O O
to O O O O
increase O O O O
Zn O O O O
content O O O O
in O O O O
the O O O O
edible O O O O
part O O O O
of O O O O
crops O O O O
requires O O O O
better O O O O
understanding O O O O
of O O O O
Zn O O O O
transport O O O O
to O O O O
, O O O O
and O O O O
distribution O O O O
within O O O O
, O O O O
the O O O O
grains O O O O
. O O O O
    
The O O O O
transfer O O O O
of O O O O
Zn O O O O
from O O O O
the O O O O
growth O O O O
medium O O O O
to O O O O
wheat B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
Triticum B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aestivum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
grains O O O O
in O O O O
an O O O O
ear O O O O
culture O O O O
system O O O O
was O O O O
investigated O O O O
by O O O O
using O O O O
the O O O O
stable O O O O
Zn O O O O
isotope O O O O
( O O O O
70 O O O O
) O O O O
Zn O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
spatial O O O O
distribution O O O O
of O O O O
Zn O O O O
within O O O O
the O O O O
grains O O O O
was O O O O
studied O O O O
by O O O O
laser O O O O
ablation O O O O
- O O O O
inductively O O O O
coupled O O O O
plasma O O O O
- O O O O
mass O O O O
spectrometry O O O O
( O O O O
LA O O O O
- O O O O
ICP O O O O
- O O O O
MS O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Zinc O O O O
was O O O O
readily O O O O
transported O O O O
in O O O O
the O O O O
stem O O O O
up O O O O
to O O O O
the O O O O
rachis O O O O
. O O O O
    
More O O O O
Zn O O O O
accumulated O O O O
in O O O O
the O O O O
stem O O O O
when O O O O
higher O O O O
amounts O O O O
of O O O O
Zn O O O O
were O O O O
supplied O O O O
to O O O O
the O O O O
medium O O O O
. O O O O
    
Once O O O O
Zn O O O O
was O O O O
transported O O O O
into O O O O
the O O O O
grain O O O O
, O O O O
Zn O O O O
accumulated O O O O
particularly O O O O
in O O O O
the O O O O
crease O O O O
vascular O O O O
tissue O O O O
. O O O O
    
The O O O O
gradient O O O O
of O O O O
( O O O O
70 O O O O
) O O O O
Zn O O O O
concentration O O O O
between O O O O
crease O O O O
vascular O O O O
tissue O O O O
, O O O O
aleurone O O O O
layer O O O O
and O O O O
endosperm O O O O
demonstrates O O O O
that O O O O
Zn O O O O
is O O O O
distributed O O O O
within O O O O
grain O O O O
through O O O O
the O O O O
crease O O O O
phloem O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
two O O O O
barriers O O O O
of O O O O
Zn O O O O
transport O O O O
into O O O O
wheat B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
grains O O O O
may O O O O
exist O O O O
: O O O O
between O O O O
the O O O O
stem O O O O
tissue O O O O
rachis O O O O
and O O O O
the O O O O
grain O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
maternal O O O O
and O O O O
filial O O O O
tissues O O O O
in O O O O
the O O O O
grain O O O O
. O O O O
    
Differential O O O O
expression O O O O
of O O O O
odorant O O O O
receptor O O O O
genes O O O O
involved O O O O
in O O O O
the O O O O
sexual O O O O
isolation O O O O
of O O O O
two O O O O
Heliothis O O O O
moths O O O O
. O O O O
    
Moth O O O O
sexual O O O O
communication O O O O
systems O O O O
are O O O O
highly O O O O
diverse O O O O
, O O O O
but O O O O
the O O O O
mechanisms O O O O
underlying O O O O
their O O O O
evolutionary O O O O
diversification O O O O
remain O O O O
unclear O O O O
. O O O O
    
Recently O O O O
, O O O O
genes O O O O
coding O O O O
for O O O O
odorant O O O O
receptors O O O O
( O O O O
ORs O O O O
) O O O O
OR6 O O O O
, O O O O
OR14 O O O O
, O O O O
OR15 O O O O
and O O O O
OR16 O O O O
have O O O O
been O O O O
genetically O O O O
associated O O O O
with O O O O
species O O O O
- O O O O
specific O O O O
male O O O O
response O O O O
to O O O O
female O O O O
pheromone O O O O
blends O O O O
in O O O O
Heliothis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virescens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Hv B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
and O O O O
Heliothis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
subflexa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Hs B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
. O O O O
    
Quantitative O O O O
real O O O O
- O O O O
time O O O O
PCR O O O O
analysis O O O O
indicates O O O O
that O O O O
expression O O O O
of O O O O
HvOR6 O O O O
, O O O O
HsOR6 O O O O
, O O O O
HvOR14 O O O O
, O O O O
HsOR14 O O O O
, O O O O
HvOR15 O O O O
and O O O O
HsOR15 O O O O
is O O O O
male O O O O
biased O O O O
, O O O O
which O O O O
supports O O O O
the O O O O
hypothesis O O O O
that O O O O
they O O O O
have O O O O
a O O O O
role O O O O
in O O O O
mediating O O O O
female O O O O
sex O O O O
pheromone O O O O
detection O O O O
. O O O O
    
The O O O O
genes O O O O
HvOR14 O O O O
, O O O O
HvOR15 O O O O
and O O O O
HvOR16 O O O O
are O O O O
expressed O O O O
at O O O O
higher O O O O
levels O O O O
than O O O O
their O O O O
corresponding O O O O
orthologues O O O O
HsOR14 O O O O
, O O O O
HsOR15 O O O O
and O O O O
HsOR16 O O O O
in O O O O
male O O O O
antennae O O O O
, O O O O
while O O O O
HvOR6 O O O O
and O O O O
HsOR6 O O O O
transcripts O O O O
are O O O O
equally O O O O
abundant O O O O
in O O O O
male O O O O
antennae O O O O
. O O O O
    
The O O O O
lack O O O O
of O O O O
higher O O O O
expression O O O O
of O O O O
any O O O O
of O O O O
the O O O O
receptor O O O O
genes O O O O
in O O O O
H B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
subflexa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
antennae O O O O
suggests O O O O
that O O O O
interspecific O O O O
sequence O O O O
differences O O O O
, O O O O
rather O O O O
than O O O O
gene O O O O
regulation O O O O
differences O O O O
, O O O O
underly O O O O
the O O O O
species O O O O
- O O O O
specific O O O O
male O O O O
response O O O O
to O O O O
pheromone O O O O
components O O O O
. O O O O
    
Cryptogein O O O O
, O O O O
a O O O O
fungal O O O O
elicitor O O O O
, O O O O
remodels O O O O
the O O O O
phenylpropanoid O O O O
metabolism O O O O
of O O O O
tobacco B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cell O O O O
suspension O O O O
cultures O O O O
in O O O O
a O O O O
calcium O O O O
- O O O O
dependent O O O O
manner O O O O
. O O O O
    
Plant O O O O
cells O O O O
use O O O O
calcium O O O O
- O O O O
based O O O O
signalling O O O O
pathways O O O O
to O O O O
transduce O O O O
biotic O O O O
and O O O O
/ O O O O
or O O O O
abiotic O O O O
stimuli O O O O
into O O O O
adaptive O O O O
responses O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
little O O O O
is O O O O
known O O O O
about O O O O
the O O O O
coupling O O O O
between O O O O
calcium O O O O
signalling O O O O
, O O O O
transcriptional O O O O
regulation O O O O
and O O O O
the O O O O
downstream O O O O
biochemical O O O O
processes O O O O
. O O O O
    
To O O O O
understand O O O O
these O O O O
relationships O O O O
better O O O O
, O O O O
we O O O O
challenged O O O O
tobacco B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
BY O O O O
- O O O O
2 O O O O
cells O O O O
with O O O O
cryptogein O O O O
and O O O O
evaluated O O O O
how O O O O
calcium O O O O
transients O O O O
( O O O O
monitored O O O O
through O O O O
the O O O O
calcium O O O O
sensor O O O O
aequorin O O O O
) O O O O
impact O O O O
( O O O O
1 O O O O
) O O O O
transcript O O O O
levels O O O O
of O O O O
phenylpropanoid O O O O
genes O O O O
( O O O O
assessed O O O O
by O O O O
RT O O O O
- O O O O
qPCR O O O O
) O O O O
; O O O O
and O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
derived O O O O
- O O O O
phenolic O O O O
compounds O O O O
( O O O O
analysed O O O O
by O O O O
mass O O O O
spectrometry O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Most O O O O
genes O O O O
of O O O O
the O O O O
phenylpropanoid O O O O
pathway O O O O
were O O O O
up O O O O
- O O O O
regulated O O O O
by O O O O
cryptogein O O O O
and O O O O
cell O O O O
wall O O O O
- O O O O
bound O O O O
phenolic O O O O
compounds O O O O
accumulated O O O O
( O O O O
mainly O O O O
5 O O O O
- O O O O
hydroxyferulic O O O O
acid O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
accumulation O O O O
of O O O O
both O O O O
transcripts O O O O
and O O O O
phenolics O O O O
was O O O O
calcium O O O O
- O O O O
dependent O O O O
. O O O O
    
The O O O O
transcriptional O O O O
regulation O O O O
of O O O O
phenylpropanoid O O O O
genes O O O O
was O O O O
correlated O O O O
in O O O O
a O O O O
non O O O O
- O O O O
linear O O O O
manner O O O O
with O O O O
stimulus O O O O
intensity O O O O
and O O O O
with O O O O
components O O O O
of O O O O
the O O O O
cryptogein O O O O
- O O O O
induced O O O O
calcium O O O O
signature O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
, O O O O
calmodulin O O O O
inhibitors O O O O
increased O O O O
the O O O O
sensitivity O O O O
of O O O O
cells O O O O
to O O O O
low O O O O
concentrations O O O O
of O O O O
cryptogein O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
led O O O O
us O O O O
to O O O O
propose O O O O
a O O O O
model O O O O
of O O O O
coupling O O O O
between O O O O
the O O O O
cryptogein O O O O
signal O O O O
, O O O O
calcium O O O O
signalling O O O O
and O O O O
the O O O O
transcriptional O O O O
response O O O O
, O O O O
exerting O O O O
control O O O O
of O O O O
transcription O O O O
through O O O O
the O O O O
coordinated O O O O
action O O O O
of O O O O
two O O O O
decoding O O O O
modules O O O O
exerting O O O O
opposite O O O O
effects O O O O
. O O O O
    
Rapid O O O O
detection O O O O
of O O O O
drug O O O O
- O O O O
resistant O O O O
mutations O O O O
in O O O O
hepatitis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
B O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
by O O O O
the O O O O
PCR O O O O
- O O O O
Invader O O O O
assay O O O O
. O O O O
    
Early O O O O
detection O O O O
of O O O O
resistant O O O O
mutations O O O O
of O O O O
hepatitis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
B O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
HBV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
is O O O O
important O O O O
for O O O O
patients O O O O
on O O O O
nucleos O O O O
( O O O O
t O O O O
) O O O O
ide O O O O
analog O O O O
therapy O O O O
. O O O O
    
An O O O O
assay O O O O
based O O O O
on O O O O
the O O O O
PCR O O O O
- O O O O
Invader O O O O
technology O O O O
was O O O O
developed O O O O
to O O O O
detect O O O O
resistant O O O O
mutations O O O O
with O O O O
high O O O O
sensitivity O O O O
. O O O O
    
The O O O O
assay O O O O
specifically O O O O
detects O O O O
mutations O O O O
at O O O O
codons O O O O
180 O O O O
, O O O O
181 O O O O
, O O O O
184 O O O O
, O O O O
202 O O O O
, O O O O
204 O O O O
, O O O O
and O O O O
250 O O O O
of O O O O
the O O O O
HBV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
polymerase O O O O
reverse O O O O
transcriptase O O O O
domain O O O O
. O O O O
    
These O O O O
mutations O O O O
result O O O O
in O O O O
resistance O O O O
to O O O O
lamivudine O O O O
and O O O O
entecavir O O O O
. O O O O
    
In O O O O
mixtures O O O O
of O O O O
plasmids O O O O
containing O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
and O O O O
resistant O O O O
mutants O O O O
, O O O O
fold O O O O
- O O O O
over O O O O
- O O O O
zero O O O O
values O O O O
for O O O O
resistant O O O O
mutations O O O O
were O O O O
detected O O O O
in O O O O
2 O O O O
% O O O O
of O O O O
the O O O O
total O O O O
. O O O O
    
Seventy O O O O
- O O O O
five O O O O
serum O O O O
samples O O O O
from O O O O
patients O O O O
, O O O O
whose O O O O
treatment O O O O
had O O O O
been O O O O
switched O O O O
from O O O O
lamivudine O O O O
to O O O O
entecavir O O O O
, O O O O
were O O O O
examined O O O O
by O O O O
the O O O O
PCR O O O O
- O O O O
Invader O O O O
assay O O O O
and O O O O
direct O O O O
sequencing O O O O
. O O O O
    
The O O O O
PCR O O O O
- O O O O
Invader O O O O
assay O O O O
detected O O O O
all O O O O
resistant O O O O
mutations O O O O
that O O O O
were O O O O
detected O O O O
by O O O O
direct O O O O
sequencing O O O O
and O O O O
even O O O O
detected O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
mutants O O O O
that O O O O
direct O O O O
sequencing O O O O
could O O O O
not O O O O
. O O O O
    
Cloning O O O O
sequencing O O O O
confirmed O O O O
those O O O O
mutations O O O O
found O O O O
by O O O O
the O O O O
PCR O O O O
- O O O O
Invader O O O O
assay O O O O
and O O O O
not O O O O
by O O O O
direct O O O O
sequencing O O O O
. O O O O
    
The O O O O
PCR O O O O
- O O O O
Invader O O O O
assay O O O O
is O O O O
a O O O O
useful O O O O
tool O O O O
for O O O O
the O O O O
early O O O O
detection O O O O
of O O O O
drug O O O O
- O O O O
resistant O O O O
mutations O O O O
. O O O O
    
Separating O O O O
parental O O O O
environment O O O O
from O O O O
seed O O O O
size O O O O
effects O O O O
on O O O O
next O O O O
generation O O O O
growth O O O O
and O O O O
development O O O O
in O O O O
Arabidopsis O O O O
. O O O O
    
Plant O O O O
growth O O O O
and O O O O
development O O O O
is O O O O
profoundly O O O O
influenced O O O O
by O O O O
environmental O O O O
conditions O O O O
that O O O O
laboratory O O O O
experimentation O O O O
typically O O O O
attempts O O O O
to O O O O
control O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
growth O O O O
conditions O O O O
are O O O O
not O O O O
uniform O O O O
between O O O O
or O O O O
even O O O O
within O O O O
laboratories O O O O
and O O O O
the O O O O
extent O O O O
to O O O O
which O O O O
these O O O O
differences O O O O
influence O O O O
plant O O O O
growth O O O O
and O O O O
development O O O O
is O O O O
unknown O O O O
. O O O O
    
Experiments O O O O
with O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
Arabidopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
thaliana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
were O O O O
designed O O O O
to O O O O
quantify O O O O
the O O O O
influences O O O O
of O O O O
parental O O O O
environment O O O O
and O O O O
seed O O O O
size O O O O
on O O O O
growth O O O O
and O O O O
development O O O O
in O O O O
the O O O O
next O O O O
generation O O O O
. O O O O
    
A O O O O
single O O O O
lot O O O O
of O O O O
seed O O O O
was O O O O
planted O O O O
in O O O O
six O O O O
environmental O O O O
chambers O O O O
and O O O O
grown O O O O
to O O O O
maturity O O O O
. O O O O
    
The O O O O
seed O O O O
produced O O O O
was O O O O
mechanically O O O O
sieved O O O O
into O O O O
small O O O O
and O O O O
large O O O O
size O O O O
classes O O O O
then O O O O
grown O O O O
in O O O O
a O O O O
common O O O O
environment O O O O
and O O O O
subjected O O O O
to O O O O
a O O O O
set O O O O
of O O O O
assays O O O O
spanning O O O O
the O O O O
life O O O O
cycle O O O O
. O O O O
    
Analysis O O O O
of O O O O
variance O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
seed O O O O
size O O O O
effects O O O O
were O O O O
particularly O O O O
significant O O O O
early O O O O
in O O O O
development O O O O
, O O O O
affecting O O O O
primary O O O O
root O O O O
growth O O O O
and O O O O
gravitropism O O O O
, O O O O
but O O O O
also O O O O
flowering O O O O
time O O O O
. O O O O
    
Parental O O O O
environment O O O O
affected O O O O
progeny O O O O
germination O O O O
time O O O O
, O O O O
flowering O O O O
and O O O O
weight O O O O
of O O O O
seed O O O O
the O O O O
progeny O O O O
produced O O O O
. O O O O
    
In O O O O
some O O O O
cases O O O O
, O O O O
the O O O O
parental O O O O
environment O O O O
affected O O O O
the O O O O
magnitude O O O O
of O O O O
( O O O O
interacted O O O O
with O O O O
) O O O O
the O O O O
observed O O O O
seed O O O O
size O O O O
effects O O O O
. O O O O
    
These O O O O
data O O O O
indicate O O O O
that O O O O
life O O O O
history O O O O
circumstances O O O O
of O O O O
the O O O O
parental O O O O
generation O O O O
can O O O O
affect O O O O
growth O O O O
and O O O O
development O O O O
throughout O O O O
the O O O O
life O O O O
cycle O O O O
of O O O O
the O O O O
next O O O O
generation O O O O
to O O O O
an O O O O
extent O O O O
that O O O O
should O O O O
be O O O O
considered O O O O
when O O O O
performing O O O O
genetic O O O O
studies O O O O
. O O O O
    
The O O O O
first O O O O
vitellogenin O O O O
receptor O O O O
from O O O O
a O O O O
Lepidopteran O O O O
insect O O O O
: O O O O
molecular O O O O
characterization O O O O
, O O O O
expression O O O O
patterns O O O O
and O O O O
RNA O O O O
interference O O O O
analysis O O O O
. O O O O
    
The O O O O
vitellogenin O O O O
receptor O O O O
( O O O O
VgR O O O O
) O O O O
belongs O O O O
to O O O O
the O O O O
low O O O O
- O O O O
density O O O O
lipoprotein O O O O
receptor O O O O
( O O O O
LDLR O O O O
) O O O O
superfamily O O O O
, O O O O
and O O O O
is O O O O
an O O O O
important O O O O
carrier O O O O
for O O O O
the O O O O
uptake O O O O
of O O O O
vitellogenin O O O O
( O O O O
Vg O O O O
) O O O O
into O O O O
developing O O O O
oocytes O O O O
of O O O O
all O O O O
oviparous O O O O
species O O O O
. O O O O
    
The O O O O
first O O O O
full O O O O
- O O O O
length O O O O
message O O O O
for O O O O
a O O O O
VgR O O O O
from O O O O
a O O O O
Lepidopteran O O O O
insect O O O O
was O O O O
cloned O O O O
and O O O O
sequenced O O O O
from O O O O
the O O O O
ovary O O O O
of O O O O
Spodoptera B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
litura O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Fabricius O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
GenBank O O O O
accession O O O O
no O O O O
. O O O O
GU983858 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
coding O O O O
region O O O O
consisted O O O O
of O O O O
5370 O O O O
bp O O O O
flanked O O O O
by O O O O
a O O O O
49 O O O O
bp O O O O
5 O O O O
' O O O O
- O O O O
untranslated O O O O
region O O O O
( O O O O
UTR O O O O
) O O O O
and O O O O
a O O O O
177 O O O O
bp O O O O
3 O O O O
' O O O O
- O O O O
UTR O O O O
, O O O O
which O O O O
encoded O O O O
a O O O O
1798 O O O O
- O O O O
residue O O O O
protein O O O O
with O O O O
a O O O O
predicted O O O O
molecular O O O O
weight O O O O
( O O O O
MW O O O O
) O O O O
of O O O O
201 O O O O
. O O O O
69 O O O O
kDa O O O O
. O O O O
    
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
litura O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
VgR O O O O
( O O O O
SlVgR O O O O
) O O O O
comprised O O O O
two O O O O
ligand O O O O
binding O O O O
sites O O O O
with O O O O
four O O O O
LDLR O O O O
class O O O O
A O O O O
repeats O O O O
in O O O O
the O O O O
first O O O O
domain O O O O
and O O O O
seven O O O O
in O O O O
the O O O O
second O O O O
domain O O O O
, O O O O
an O O O O
epidermal O O O O
growth O O O O
factor O O O O
- O O O O
like O O O O
domain O O O O
containing O O O O
an O O O O
LDLR O O O O
class O O O O
B O O O O
repeat O O O O
and O O O O
a O O O O
YWXD O O O O
motif O O O O
, O O O O
a O O O O
transmembrane O O O O
domain O O O O
and O O O O
a O O O O
cytoplasmic O O O O
domain O O O O
. O O O O
    
A O O O O
phylogenetic O O O O
relationship O O O O
placed O O O O
SlVgR O O O O
as O O O O
a O O O O
separate O O O O
group O O O O
from O O O O
the O O O O
other O O O O
insects O O O O
. O O O O
    
SlVgR O O O O
messenger O O O O
RNA O O O O
( O O O O
mRNA O O O O
) O O O O
was O O O O
specifically O O O O
expressed O O O O
in O O O O
the O O O O
ovarian O O O O
tissues O O O O
. O O O O
    
The O O O O
developmental O O O O
expression O O O O
patterns O O O O
showed O O O O
that O O O O
VgR O O O O
mRNA O O O O
was O O O O
first O O O O
transcribed O O O O
in O O O O
6 O O O O
( O O O O
th O O O O
) O O O O
day O O O O
female O O O O
pupae O O O O
and O O O O
the O O O O
maximum O O O O
level O O O O
of O O O O
VgR O O O O
mRNA O O O O
appeared O O O O
in O O O O
36 O O O O
- O O O O
h O O O O
- O O O O
old O O O O
adults O O O O
. O O O O
    
Immunoblot O O O O
analysis O O O O
detected O O O O
an O O O O
ovary O O O O
- O O O O
specific O O O O
VgR O O O O
protein O O O O
with O O O O
a O O O O
MW O O O O
of O O O O
- O O O O
200 O O O O
kDa O O O O
, O O O O
whose O O O O
development O O O O
profiles O O O O
were O O O O
consistent O O O O
with O O O O
VgR O O O O
mRNA O O O O
expression O O O O
patterns O O O O
. O O O O
    
RNA O O O O
inteference O O O O
( O O O O
RNAi O O O O
) O O O O
specifically O O O O
disrupted O O O O
the O O O O
VgR O O O O
gene O O O O
by O O O O
injection O O O O
of O O O O
3 O O O O
or O O O O
5 O O O O
mug O O O O
VgR O O O O
double O O O O
- O O O O
stranded O O O O
RNA O O O O
per O O O O
insect O O O O
in O O O O
4 O O O O
( O O O O
th O O O O
) O O O O
or O O O O
6 O O O O
( O O O O
th O O O O
) O O O O
day O O O O
pupae O O O O
. O O O O
    
RNAi O O O O
of O O O O
SlVgR O O O O
led O O O O
to O O O O
a O O O O
phenotype O O O O
characterized O O O O
by O O O O
high O O O O
Vg O O O O
accumulation O O O O
in O O O O
the O O O O
haemolymph O O O O
, O O O O
low O O O O
Vg O O O O
deposition O O O O
in O O O O
the O O O O
ovary O O O O
and O O O O
the O O O O
failure O O O O
of O O O O
insect O O O O
spawning O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
mean O O O O
that O O O O
VgR O O O O
is O O O O
critical O O O O
for O O O O
binding O O O O
Vg O O O O
and O O O O
transporting O O O O
it O O O O
into O O O O
the O O O O
oocytes O O O O
of O O O O
the O O O O
insect O O O O
ovary O O O O
, O O O O
thus O O O O
playing O O O O
an O O O O
important O O O O
role O O O O
in O O O O
insect O O O O
reproduction O O O O
. O O O O
    
Simian B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
immunodeficiency O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
from O O O O
the O O O O
sooty B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mangabey O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
rhesus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
macaque O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
modified O O O O
with O O O O
O O O O O
- O O O O
linked O O O O
carbohydrate O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
stretches O O O O
of O O O O
serine O O O O
and O O O O
threonine O O O O
are O O O O
sometimes O O O O
sites O O O O
for O O O O
O O O O O
- O O O O
linked O O O O
carbohydrate O O O O
attachment O O O O
, O O O O
specific O O O O
sequence O O O O
and O O O O
structural O O O O
determinants O O O O
for O O O O
O O O O O
- O O O O
linked O O O O
attachment O O O O
remain O O O O
ill O O O O
defined O O O O
. O O O O
    
The O O O O
gp120 O O O O
envelope O O O O
protein O O O O
of O O O O
SIVmac239 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
contains O O O O
a O O O O
serine O O O O
- O O O O
threonine O O O O
- O O O O
rich O O O O
stretch O O O O
of O O O O
amino O O O O
acids O O O O
at O O O O
positions O O O O
128 O O O O
to O O O O
139 O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
show O O O O
that O O O O
lectin O O O O
protein O O O O
from O O O O
jackfruit B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
seed O O O O
( O O O O
jacalin O O O O
) O O O O
, O O O O
which O O O O
binds O O O O
to O O O O
non O O O O
- O O O O
and O O O O
monosialylated O O O O
core O O O O
1 O O O O
O O O O O
- O O O O
linked O O O O
carbohydrate O O O O
, O O O O
potently O O O O
inhibited O O O O
the O O O O
replication O O O O
of O O O O
SIVmac239 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Selection O O O O
of O O O O
a O O O O
jacalin O O O O
- O O O O
resistant O O O O
SIVmac239 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
variant O O O O
population O O O O
resulted O O O O
in O O O O
virus O O O O
with O O O O
specific O O O O
substitutions O O O O
within O O O O
amino O O O O
acids O O O O
128 O O O O
to O O O O
139 O O O O
. O O O O
    
Cloned O O O O
simian B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
immunodeficiency O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
SIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
variants O O O O
with O O O O
substitutions O O O O
in O O O O
the O O O O
128 O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
139 O O O O
region O O O O
had O O O O
infectivities O O O O
equivalent O O O O
to O O O O
, O O O O
or O O O O
within O O O O
1 O O O O
log O O O O
unit O O O O
of O O O O
, O O O O
that O O O O
of O O O O
SIVmac239 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
were O O O O
resistant O O O O
to O O O O
the O O O O
inhibitory O O O O
effects O O O O
of O O O O
jacalin O O O O
. O O O O
    
Characterization O O O O
of O O O O
the O O O O
SIVmac239 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
gp120 O O O O
O O O O O
- O O O O
linked O O O O
glycome O O O O
showed O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
core O O O O
1 O O O O
and O O O O
core O O O O
2 O O O O
O O O O O
- O O O O
linked O O O O
carbohydrate O O O O
; O O O O
a O O O O
128 O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
139 O O O O
- O O O O
substituted O O O O
variant O O O O
gp120 O O O O
from O O O O
jacalin O O O O
- O O O O
resistant O O O O
SIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
lacked O O O O
O O O O O
- O O O O
linked O O O O
carbohydrate O O O O
. O O O O
    
Unlike O O O O
that O O O O
of O O O O
SIVmac239 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
the O O O O
replication O O O O
of O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
NL4 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
3 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
resistant O O O O
to O O O O
inhibition O O O O
by O O O O
jacalin O O O O
. O O O O
    
Purified O O O O
gp120s O O O O
from O O O O
four O O O O
SIVmac B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
SIVsm B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
strains O O O O
bound O O O O
jacalin O O O O
strongly O O O O
in O O O O
an O O O O
enzyme O O O O
- O O O O
linked O O O O
immunosorbent O O O O
assay O O O O
, O O O O
while O O O O
nine O O O O
different O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gp120s O O O O
, O O O O
two O O O O
SIVcpz B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
gp120s O O O O
, O O O O
and O O O O
128 O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
139 O O O O
- O O O O
substituted O O O O
SIVmac239 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
gp120 O O O O
did O O O O
not O O O O
bind O O O O
jacalin O O O O
. O O O O
    
The O O O O
ability O O O O
or O O O O
inability O O O O
to O O O O
bind O O O O
jacalin O O O O
thus O O O O
correlated O O O O
with O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
the O O O O
serine O O O O
- O O O O
threonine O O O O
- O O O O
rich O O O O
stretch O O O O
in O O O O
the O O O O
SIVmac B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
SIVsm B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
gp120s O O O O
and O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
such O O O O
stretches O O O O
in O O O O
the O O O O
SIVcpz B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gp120s O O O O
. O O O O
    
Consistent O O O O
with O O O O
sequence O O O O
predictions O O O O
, O O O O
two O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
2 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gp120s O O O O
bound O O O O
jacalin O O O O
, O O O O
while O O O O
one O O O O
did O O O O
not O O O O
. O O O O
    
These O O O O
data O O O O
demonstrate O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
non O O O O
- O O O O
and O O O O
monosialylated O O O O
core O O O O
1 O O O O
O O O O O
- O O O O
linked O O O O
carbohydrate O O O O
on O O O O
the O O O O
gp120s O O O O
of O O O O
SIVmac B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
SIVsm B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
the O O O O
lack O O O O
of O O O O
these O O O O
modifications O O O O
on O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
SIVcpz B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
gp120s O O O O
. O O O O
    
Varicella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
zoster O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
glycoprotein O O O O
E O O O O
is O O O O
a O O O O
critical O O O O
determinant O O O O
of O O O O
virulence O O O O
in O O O O
the O O O O
SCID O O O O
mouse O O O O
- O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
model O O O O
of O O O O
neuropathogenesis O O O O
. O O O O
    
Varicella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
zoster O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
VZV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
is O O O O
a O O O O
neurotropic O O O O
alphaherpesvirus O O O O
. O O O O
    
VZV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infection O O O O
of O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
dorsal O O O O
root O O O O
ganglion O O O O
( O O O O
DRG O O O O
) O O O O
xenografts O O O O
in O O O O
immunodeficient O O O O
mice O O O O
models O O O O
the O O O O
infection O O O O
of O O O O
sensory O O O O
ganglia O O O O
. O O O O
    
We O O O O
examined O O O O
DRG O O O O
infection O O O O
with O O O O
recombinant O O O O
VZV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
recombinant O O O O
Oka O O O O
[ O O O O
rOka O O O O
] O O O O
) O O O O
and O O O O
the O O O O
following O O O O
gE O O O O
mutants O O O O
: O O O O
gEDelta27 O O O O
- O O O O
90 O O O O
, O O O O
gEDeltaCys O O O O
, O O O O
gE O O O O
- O O O O
AYRV O O O O
, O O O O
and O O O O
gE O O O O
- O O O O
SSTT O O O O
. O O O O
    
gEDelta27 O O O O
- O O O O
90 O O O O
, O O O O
which O O O O
lacks O O O O
the O O O O
gE O O O O
domain O O O O
that O O O O
interacts O O O O
with O O O O
a O O O O
putative O O O O
receptor O O O O
insulin O O O O
- O O O O
degrading O O O O
enzyme O O O O
( O O O O
IDE O O O O
) O O O O
, O O O O
replicated O O O O
as O O O O
extensively O O O O
as O O O O
rOka O O O O
, O O O O
producing O O O O
infectious O O O O
virions O O O O
and O O O O
significant O O O O
cytopathic O O O O
effects O O O O
within O O O O
14 O O O O
days O O O O
of O O O O
inoculation O O O O
. O O O O
    
Since O O O O
neural O O O O
cells O O O O
express O O O O
IDE O O O O
, O O O O
the O O O O
gE O O O O
/ O O O O
IDE O O O O
interaction O O O O
was O O O O
dispensable O O O O
for O O O O
VZV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
neurotropism O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
, O O O O
gEDeltaCys O O O O
, O O O O
which O O O O
lacks O O O O
gE O O O O
/ O O O O
gI O O O O
heterodimer O O O O
formation O O O O
, O O O O
was O O O O
significantly O O O O
impaired O O O O
at O O O O
early O O O O
times O O O O
postinfection O O O O
; O O O O
viral O O O O
genome O O O O
copy O O O O
numbers O O O O
increased O O O O
slowly O O O O
, O O O O
and O O O O
infectious O O O O
virus O O O O
production O O O O
was O O O O
not O O O O
detected O O O O
until O O O O
day O O O O
28 O O O O
. O O O O
    
Delayed O O O O
replication O O O O
was O O O O
associated O O O O
with O O O O
impaired O O O O
cell O O O O
- O O O O
cell O O O O
spread O O O O
in O O O O
ganglia O O O O
, O O O O
similar O O O O
to O O O O
the O O O O
phenotype O O O O
of O O O O
a O O O O
gI O O O O
deletion O O O O
mutant O O O O
( O O O O
rOkaDeltagI O O O O
) O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
at O O O O
later O O O O
time O O O O
points O O O O
, O O O O
infection O O O O
of O O O O
satellite O O O O
cells O O O O
and O O O O
other O O O O
supportive O O O O
nonneuronal O O O O
cells O O O O
resulted O O O O
in O O O O
extensive O O O O
DRG O O O O
tissue O O O O
damage O O O O
and O O O O
cell O O O O
loss O O O O
such O O O O
that O O O O
cytopathic O O O O
changes O O O O
observed O O O O
at O O O O
day O O O O
70 O O O O
were O O O O
more O O O O
severe O O O O
than O O O O
those O O O O
for O O O O
rOka O O O O
- O O O O
infected O O O O
DRG O O O O
. O O O O
    
The O O O O
replication O O O O
of O O O O
gE O O O O
- O O O O
AYRV O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
impaired O O O O
for O O O O
trans O O O O
- O O O O
Golgi O O O O
network O O O O
( O O O O
TGN O O O O
) O O O O
localization O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
replication O O O O
of O O O O
gE O O O O
- O O O O
SSTT O O O O
, O O O O
which O O O O
contains O O O O
mutations O O O O
in O O O O
an O O O O
acidic O O O O
cluster O O O O
, O O O O
were O O O O
equivalent O O O O
to O O O O
that O O O O
of O O O O
rOka O O O O
, O O O O
causing O O O O
significant O O O O
cytopathic O O O O
effects O O O O
and O O O O
infectious O O O O
virus O O O O
production O O O O
by O O O O
day O O O O
14 O O O O
; O O O O
genome O O O O
copy O O O O
numbers O O O O
were O O O O
equivalent O O O O
to O O O O
those O O O O
of O O O O
rOka O O O O
. O O O O
    
These O O O O
experiments O O O O
suggest O O O O
that O O O O
the O O O O
gE O O O O
interaction O O O O
with O O O O
cellular O O O O
IDE O O O O
, O O O O
gE O O O O
targeting O O O O
to O O O O
TGN O O O O
sites O O O O
of O O O O
virion O O O O
envelopment O O O O
, O O O O
and O O O O
phosphorylation O O O O
at O O O O
SSTT O O O O
are O O O O
dispensable O O O O
for O O O O
VZV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
DRG O O O O
infection O O O O
, O O O O
whereas O O O O
the O O O O
gE O O O O
/ O O O O
gI O O O O
interaction O O O O
is O O O O
critical O O O O
for O O O O
VZV O O O O
neurovirulence O O O O
. O O O O
    
Antiviral O O O O
effects O O O O
of O O O O
a O O O O
transgenic O O O O
RNA O O O O
- O O O O
dependent O O O O
RNA O O O O
polymerase O O O O
. O O O O
    
Transgenic O O O O
expression O O O O
of O O O O
the O O O O
RNA O O O O
- O O O O
dependent O O O O
RNA O O O O
polymerase O O O O
3D O O O O
( O O O O
pol O O O O
) O O O O
inhibited O O O O
infection O O O O
of O O O O
Theiler B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
' O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
s O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
murine O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
encephalitis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
TMEV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
, O O O O
a O O O O
picornavirus O O O O
from O O O O
which O O O O
it O O O O
was O O O O
derived O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
infected O O O O
3D O O O O
( O O O O
pol O O O O
) O O O O
transgenic O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
with O O O O
another O O O O
picornavirus O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
an O O O O
alphaherpesvirus O O O O
and O O O O
a O O O O
rhabdovirus O O O O
. O O O O
    
3D O O O O
( O O O O
pol O O O O
) O O O O
transgenic O O O O
FVB O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
had O O O O
significantly O O O O
lower O O O O
viral O O O O
loads O O O O
and O O O O
survived O O O O
longer O O O O
after O O O O
infection O O O O
with O O O O
all O O O O
three O O O O
types O O O O
of O O O O
viruses O O O O
than O O O O
nontransgenic O O O O
FVB O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Viral O O O O
inhibition O O O O
among O O O O
three O O O O
different O O O O
types O O O O
of O O O O
virus O O O O
by O O O O
transgenic O O O O
3D O O O O
( O O O O
pol O O O O
) O O O O
suggests O O O O
that O O O O
the O O O O
mechanism O O O O
of O O O O
action O O O O
is O O O O
not O O O O
the O O O O
direct O O O O
interference O O O O
with O O O O
picornaviral O O O O
3D O O O O
( O O O O
pol O O O O
) O O O O
but O O O O
instead O O O O
may O O O O
be O O O O
the O O O O
changing O O O O
of O O O O
host O O O O
cells O O O O
to O O O O
an O O O O
antiviral O O O O
state O O O O
before O O O O
or O O O O
after O O O O
viral O O O O
infection O O O O
occurs O O O O
, O O O O
as O O O O
basal O O O O
interferon O O O O
levels O O O O
were O O O O
higher O O O O
in O O O O
3D O O O O
( O O O O
pol O O O O
) O O O O
transgenic O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
before O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
Further O O O O
study O O O O
of O O O O
this O O O O
mechanism O O O O
may O O O O
open O O O O
new O O O O
possibilities O O O O
for O O O O
future O O O O
antiviral O O O O
therapy O O O O
. O O O O
    
Parasitoid O O O O
developmental O O O O
mortality O O O O
in O O O O
the O O O O
field O O O O
: O O O O
patterns O O O O
, O O O O
causes O O O O
and O O O O
consequences O O O O
for O O O O
sex O O O O
ratio O O O O
and O O O O
virginity O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Sex O O O O
ratio O O O O
theory O O O O
predicts O O O O
that O O O O
developmental O O O O
mortality O O O O
can O O O O
affect O O O O
sex O O O O
ratio O O O O
optima O O O O
under O O O O
Local O O O O
Mate O O O O
Competition O O O O
and O O O O
also O O O O
lead O O O O
to O O O O
' O O O O
virgin O O O O
' O O O O
broods O O O O
containing O O O O
only O O O O
females O O O O
with O O O O
no O O O O
sibling O O O O
- O O O O
mating O O O O
opportunities O O O O
on O O O O
maturity O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Estimates O O O O
of O O O O
developmental O O O O
mortality O O O O
and O O O O
its O O O O
sex O O O O
ratio O O O O
effects O O O O
have O O O O
been O O O O
laboratory O O O O
based O O O O
, O O O O
and O O O O
both O O O O
models O O O O
and O O O O
laboratory O O O O
studies O O O O
have O O O O
treated O O O O
mortality O O O O
as O O O O
a O O O O
phenomenon O O O O
without O O O O
identifying O O O O
its O O O O
biological O O O O
causes O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
contribute O O O O
a O O O O
large O O O O
set O O O O
of O O O O
field O O O O
data O O O O
on O O O O
Metaphycus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
luteolus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Timberlake O O O O
( O O O O
Hymenoptera O O O O
: O O O O
Encyrtidae O O O O
) O O O O
, O O O O
an O O O O
endoparasitoid O O O O
of O O O O
soft O O O O
scale O O O O
insects O O O O
( O O O O
Hemiptera O O O O
: O O O O
Coccidae O O O O
) O O O O
, O O O O
which O O O O
has O O O O
sex O O O O
allocation O O O O
conditional O O O O
on O O O O
host O O O O
quality O O O O
and O O O O
female O O O O
- O O O O
biased O O O O
brood O O O O
sex O O O O
ratios O O O O
. O O O O
    
Developmental O O O O
mortality O O O O
within O O O O
broods O O O O
can O O O O
be O O O O
both O O O O
assessed O O O O
and O O O O
attributed O O O O
to O O O O
distinct O O O O
causes O O O O
, O O O O
including O O O O
encapsulation O O O O
by O O O O
the O O O O
host O O O O
and O O O O
larval O O O O
- O O O O
larval O O O O
competition O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Thirty O O O O
per O O O O
cent O O O O
of O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
luteolus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
offspring O O O O
die O O O O
during O O O O
development O O O O
with O O O O
65 O O O O
% O O O O
of O O O O
this O O O O
mortality O O O O
because O O O O
of O O O O
encapsulation O O O O
and O O O O
28 O O O O
% O O O O
because O O O O
of O O O O
larval O O O O
competition O O O O
. O O O O
    
The O O O O
distributions O O O O
of O O O O
mortality O O O O
overall O O O O
and O O O O
for O O O O
each O O O O
cause O O O O
of O O O O
mortality O O O O
separately O O O O
were O O O O
overdispersed O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
probability O O O O
of O O O O
an O O O O
individual O O O O
being O O O O
encapsulated O O O O
increased O O O O
with O O O O
clutch O O O O
size O O O O
, O O O O
while O O O O
the O O O O
probability O O O O
of O O O O
being O O O O
killed O O O O
by O O O O
a O O O O
brood O O O O
mate O O O O
declined O O O O
with O O O O
increasing O O O O
clutch O O O O
size O O O O
and O O O O
with O O O O
increasing O O O O
per O O O O
capita O O O O
availability O O O O
of O O O O
resources O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
sexual O O O O
compositions O O O O
of O O O O
broods O O O O
at O O O O
emergence O O O O
were O O O O
influenced O O O O
by O O O O
both O O O O
the O O O O
degree O O O O
and O O O O
the O O O O
type O O O O
of O O O O
mortality O O O O
operating O O O O
. O O O O
    
At O O O O
higher O O O O
levels O O O O
of O O O O
mortality O O O O
, O O O O
single O O O O
sex O O O O
broods O O O O
were O O O O
more O O O O
common O O O O
and O O O O
sex O O O O
ratios O O O O
were O O O O
less O O O O
precise O O O O
. O O O O
    
Overall O O O O
, O O O O
virginity O O O O
was O O O O
more O O O O
prevalent O O O O
than O O O O
predicted O O O O
and O O O O
was O O O O
more O O O O
greatly O O O O
affected O O O O
by O O O O
the O O O O
occurrence O O O O
of O O O O
competition O O O O
than O O O O
by O O O O
other O O O O
sources O O O O
of O O O O
mortality O O O O
, O O O O
almost O O O O
certainly O O O O
because O O O O
competition O O O O
tended O O O O
to O O O O
eliminate O O O O
males O O O O
. O O O O
    
7 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
reproductive O O O O
and O O O O
developmental O O O O
biology O O O O
of O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
luteolus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
appears O O O O
to O O O O
be O O O O
influenced O O O O
by O O O O
a O O O O
complex O O O O
interplay O O O O
of O O O O
maternal O O O O
clutch O O O O
size O O O O
and O O O O
sex O O O O
allocation O O O O
strategies O O O O
, O O O O
offspring O O O O
- O O O O
offspring O O O O
developmental O O O O
interactions O O O O
, O O O O
host O O O O
defence O O O O
mechanisms O O O O
and O O O O
postemergence O O O O
mating O O O O
behaviour O O O O
. O O O O
    
Despite O O O O
the O O O O
great O O O O
sophistication O O O O
of O O O O
sex O O O O
ratio O O O O
theory O O O O
, O O O O
it O O O O
has O O O O
not O O O O
yet O O O O
evolved O O O O
to O O O O
the O O O O
point O O O O
where O O O O
it O O O O
is O O O O
capable O O O O
of O O O O
considering O O O O
all O O O O
of O O O O
these O O O O
influences O O O O
simultaneously O O O O
. O O O O
    
The O O O O
degree O O O O
of O O O O
mycoheterotrophic O O O O
carbon O O O O
gain O O O O
in O O O O
green O O O O
, O O O O
variegated O O O O
and O O O O
vegetative O O O O
albino O O O O
individuals O O O O
of O O O O
Cephalanthera B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
damasonium O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
related O O O O
to O O O O
leaf O O O O
chlorophyll O O O O
concentrations O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Achlorophyllous O O O O
variants O O O O
of O O O O
some O O O O
forest O O O O
orchids O O O O
are O O O O
known O O O O
to O O O O
reach O O O O
almost O O O O
the O O O O
same O O O O
size O O O O
as O O O O
their O O O O
green O O O O
forms O O O O
. O O O O
    
These O O O O
vegetative O O O O
albino O O O O
forms O O O O
cover O O O O
their O O O O
entire O O O O
carbon O O O O
( O O O O
C O O O O
) O O O O
demand O O O O
through O O O O
fungi O O O O
that O O O O
simultaneously O O O O
form O O O O
ectomycorrhizae O O O O
with O O O O
trees O O O O
, O O O O
while O O O O
green O O O O
variants O O O O
partially O O O O
draw O O O O
on O O O O
C O O O O
from O O O O
photosynthesis O O O O
and O O O O
C O O O O
from O O O O
fungal O O O O
hosts O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
investigate O O O O
whether O O O O
the O O O O
amount O O O O
of O O O O
C O O O O
derived O O O O
from O O O O
either O O O O
source O O O O
is O O O O
proportional O O O O
to O O O O
leaf O O O O
chlorophyll O O O O
concentration O O O O
. O O O O
    
The O O O O
discovery O O O O
of O O O O
two O O O O
Cephalanthera B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
damasonium O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
populations O O O O
with O O O O
variegated O O O O
leaves O O O O
enabled O O O O
a O O O O
continuous O O O O
bridging O O O O
of O O O O
leaf O O O O
chlorophyll O O O O
concentrations O O O O
between O O O O
green O O O O
and O O O O
albino O O O O
forms O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Leaves O O O O
of O O O O
27 O O O O
green O O O O
, O O O O
variegated O O O O
and O O O O
albino O O O O
individuals O O O O
of O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
damasonium O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
were O O O O
compared O O O O
for O O O O
chlorophyll O O O O
concentrations O O O O
, O O O O
C O O O O
sources O O O O
( O O O O
as O O O O
characterized O O O O
by O O O O
( O O O O
13 O O O O
) O O O O
C O O O O
abundances O O O O
) O O O O
and O O O O
total O O O O
C O O O O
and O O O O
nitrogen O O O O
( O O O O
N O O O O
) O O O O
concentrations O O O O
. O O O O
    
* O O O O
We O O O O
found O O O O
a O O O O
linear O O O O
relationship O O O O
between O O O O
leaf O O O O
chlorophyll O O O O
concentrations O O O O
and O O O O
the O O O O
proportional O O O O
reliance O O O O
on O O O O
fungi O O O O
as O O O O
a O O O O
C O O O O
source O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
we O O O O
show O O O O
that O O O O
the O O O O
shift O O O O
in O O O O
C O O O O
gain O O O O
through O O O O
mycoheterotrophic O O O O
means O O O O
significantly O O O O
changes O O O O
leaf O O O O
total O O O O
C O O O O
and O O O O
N O O O O
concentrations O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Our O O O O
results O O O O
document O O O O
that O O O O
partial O O O O
mycoheterotrophy O O O O
in O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
damasonium O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
not O O O O
a O O O O
static O O O O
nutritional O O O O
mode O O O O
but O O O O
a O O O O
flexible O O O O
mechanism O O O O
related O O O O
inter O O O O
alia O O O O
to O O O O
leaf O O O O
chlorophyll O O O O
concentrations O O O O
. O O O O
    
The O O O O
change O O O O
in O O O O
proportional O O O O
reliance O O O O
on O O O O
fungi O O O O
as O O O O
a O O O O
C O O O O
source O O O O
affects O O O O
leaf O O O O
chemical O O O O
composition O O O O
. O O O O
    
Assembly O O O O
of O O O O
the O O O O
type O O O O
II O O O O
secretion O O O O
system O O O O
: O O O O
identification O O O O
of O O O O
ExeA O O O O
residues O O O O
critical O O O O
for O O O O
peptidoglycan O O O O
binding O O O O
and O O O O
secretin O O O O
multimerization O O O O
. O O O O
    
Aeromonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
hydrophila O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
secretes O O O O
a O O O O
number O O O O
of O O O O
protein O O O O
toxins O O O O
across O O O O
the O O O O
outer O O O O
membrane O O O O
via O O O O
the O O O O
type O O O O
II O O O O
secretion O O O O
system O O O O
( O O O O
T2SS O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Assembly O O O O
of O O O O
the O O O O
secretion O O O O
channel O O O O
ExeD O O O O
secretin O O O O
into O O O O
the O O O O
outer O O O O
membrane O O O O
is O O O O
dependent O O O O
on O O O O
the O O O O
peptidoglycan O O O O
binding O O O O
domain O O O O
of O O O O
ExeA O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
the O O O O
peptidoglycan O O O O
binding O O O O
domain O O O O
PF01471 O O O O
family O O O O
members O O O O
were O O O O
divided O O O O
into O O O O
a O O O O
prokaryotic O O O O
group O O O O
and O O O O
a O O O O
eukaryotic O O O O
group O O O O
. O O O O
    
By O O O O
comparison O O O O
of O O O O
their O O O O
sequence O O O O
conservation O O O O
profiles O O O O
and O O O O
their O O O O
representative O O O O
crystal O O O O
structures O O O O
, O O O O
we O O O O
found O O O O
the O O O O
prokaryotic O O O O
members O O O O
to O O O O
have O O O O
a O O O O
highly O O O O
conserved O O O O
pocket O O O O
( O O O O
s O O O O
) O O O O
that O O O O
is O O O O
not O O O O
present O O O O
in O O O O
the O O O O
eukaryotic O O O O
members O O O O
. O O O O
    
Substitution O O O O
mutations O O O O
of O O O O
nine O O O O
amino O O O O
acids O O O O
of O O O O
the O O O O
pocket O O O O
were O O O O
constructed O O O O
in O O O O
ExeA O O O O
. O O O O
    
Five O O O O
of O O O O
the O O O O
substitution O O O O
derivatives O O O O
showed O O O O
greatly O O O O
decreased O O O O
lipase O O O O
secretion O O O O
, O O O O
accompanied O O O O
by O O O O
defects O O O O
in O O O O
secretin O O O O
assembly O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
, O O O O
using O O O O
in O O O O
vivo O O O O
cross O O O O
- O O O O
linking O O O O
and O O O O
in O O O O
vitro O O O O
cosedimentation O O O O
assays O O O O
, O O O O
we O O O O
showed O O O O
that O O O O
these O O O O
mutations O O O O
decreased O O O O
ExeA O O O O
- O O O O
peptidoglycan O O O O
interactions O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
the O O O O
highly O O O O
conserved O O O O
pocket O O O O
in O O O O
ExeA O O O O
is O O O O
the O O O O
binding O O O O
site O O O O
for O O O O
its O O O O
peptidoglycan O O O O
ligand O O O O
and O O O O
identify O O O O
residues O O O O
critical O O O O
for O O O O
this O O O O
binding O O O O
. O O O O
    
Translational O O O O
control O O O O
of O O O O
the O O O O
abundance O O O O
of O O O O
cytoplasmic O O O O
poly O O O O
( O O O O
A O O O O
) O O O O
binding O O O O
protein O O O O
in O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cytomegalovirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O O O O
infected O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Irrespective O O O O
of O O O O
their O O O O
effects O O O O
on O O O O
ongoing O O O O
host O O O O
protein O O O O
synthesis O O O O
, O O O O
productive O O O O
replication O O O O
of O O O O
the O O O O
representative O O O O
alphaherpesvirus O O O O
herpes B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
simplex O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
type O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
the O O O O
representative O O O O
gammaherpesvirus O O O O
Kaposi B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
' O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
s O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sarcoma O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
herpesvirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
the O O O O
representative O O O O
betaherpesvirus O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cytomegalovirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
[ O O O O
HCMV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
] O O O O
stimulates O O O O
the O O O O
assembly O O O O
of O O O O
the O O O O
multisubunit O O O O
, O O O O
cap O O O O
- O O O O
binding O O O O
translation O O O O
factor O O O O
eIF4F O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
only O O O O
HCMV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
replication O O O O
is O O O O
associated O O O O
with O O O O
an O O O O
increased O O O O
abundance O O O O
of O O O O
eIF4F O O O O
core O O O O
components O O O O
( O O O O
eIF4E O O O O
, O O O O
eIF4G O O O O
, O O O O
eIF4A O O O O
) O O O O
and O O O O
the O O O O
eIF4F O O O O
- O O O O
associated O O O O
factor O O O O
poly O O O O
( O O O O
A O O O O
) O O O O
binding O O O O
protein O O O O
( O O O O
PABP O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
the O O O O
increase O O O O
in O O O O
translation O O O O
factor O O O O
concentration O O O O
was O O O O
readily O O O O
detected O O O O
in O O O O
an O O O O
asynchronous O O O O
population O O O O
of O O O O
HCMV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
infected O O O O
primary O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fibroblasts O O O O
, O O O O
abolished O O O O
by O O O O
prior O O O O
UV O O O O
inactivation O O O O
of O O O O
virus O O O O
, O O O O
and O O O O
genetically O O O O
dependent O O O O
upon O O O O
viral O O O O
immediate O O O O
- O O O O
early O O O O
genes O O O O
. O O O O
    
Strikingly O O O O
, O O O O
while O O O O
increased O O O O
mRNA O O O O
steady O O O O
- O O O O
state O O O O
levels O O O O
accompanied O O O O
the O O O O
rise O O O O
in O O O O
eIF4E O O O O
and O O O O
eIF4G O O O O
protein O O O O
levels O O O O
, O O O O
the O O O O
overall O O O O
abundance O O O O
of O O O O
PABP O O O O
mRNA O O O O
, O O O O
together O O O O
with O O O O
the O O O O
half O O O O
- O O O O
life O O O O
of O O O O
the O O O O
polypeptide O O O O
it O O O O
encodes O O O O
, O O O O
remained O O O O
relatively O O O O
unchanged O O O O
by O O O O
HCMV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infection O O O O
. O O O O
    
Instead O O O O
, O O O O
HCMV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
induced O O O O
PABP O O O O
accumulation O O O O
resulted O O O O
from O O O O
new O O O O
protein O O O O
synthesis O O O O
and O O O O
was O O O O
sensitive O O O O
to O O O O
the O O O O
mTORC1 O O O O
- O O O O
selective O O O O
inhibitor O O O O
rapamycin O O O O
, O O O O
which O O O O
interferes O O O O
with O O O O
phosphorylation O O O O
of O O O O
the O O O O
mTORC1 O O O O
substrate O O O O
p70 O O O O
S6K O O O O
and O O O O
the O O O O
translational O O O O
repressor O O O O
4E O O O O
- O O O O
BP1 O O O O
. O O O O
    
While O O O O
virus O O O O
- O O O O
induced O O O O
PABP O O O O
accumulation O O O O
did O O O O
not O O O O
require O O O O
p70 O O O O
S6K O O O O
, O O O O
it O O O O
was O O O O
inhibited O O O O
by O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
a O O O O
dominant O O O O
- O O O O
acting O O O O
4E O O O O
- O O O O
BP1 O O O O
variant O O O O
unable O O O O
to O O O O
be O O O O
inactivated O O O O
by O O O O
mTORC1 O O O O
. O O O O
    
Finally O O O O
, O O O O
unlike O O O O
the O O O O
situation O O O O
in O O O O
alpha O O O O
- O O O O
or O O O O
gammaherpesvirus O O O O
- O O O O
infected O O O O
cells O O O O
, O O O O
where O O O O
PABP O O O O
is O O O O
redistributed O O O O
to O O O O
nuclei O O O O
, O O O O
PABP O O O O
accumulated O O O O
in O O O O
the O O O O
cytoplasm O O O O
of O O O O
HCMV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
infected O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
cytoplasmic O O O O
PABP O O O O
accumulation O O O O
is O O O O
translationally O O O O
controlled O O O O
in O O O O
HCMV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
infected O O O O
cells O O O O
via O O O O
a O O O O
mechanism O O O O
requiring O O O O
mTORC1 O O O O
- O O O O
mediated O O O O
inhibition O O O O
of O O O O
the O O O O
cellular O O O O
4E O O O O
- O O O O
BP1 O O O O
translational O O O O
repressor O O O O
. O O O O
    
A O O O O
new O O O O
model O O O O
of O O O O
Epstein B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Barr O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
infection O O O O
reveals O O O O
an O O O O
important O O O O
role O O O O
for O O O O
earlylytic O O O O
viral O O O O
protein O O O O
expression O O O O
in O O O O
the O O O O
development O O O O
of O O O O
lymphomas O O O O
. O O O O
    
Epstein B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Barr O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
EBV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
infects O O O O
cells O O O O
in O O O O
latent O O O O
or O O O O
lytic O O O O
forms O O O O
, O O O O
but O O O O
the O O O O
roleof O O O O
lytic O O O O
infection O O O O
in O O O O
EBV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
induced O O O O
lymphomas O O O O
is O O O O
unclear O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
have O O O O
used O O O O
anew O O O O
humanized O O O O
mouse B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
model O O O O
, O O O O
in O O O O
which O O O O
both O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fetal O O O O
CD34 O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
hematopoietic O O O O
stemcells O O O O
and O O O O
thymus O O O O
/ O O O O
liver O O O O
tissue O O O O
are O O O O
transplanted O O O O
, O O O O
to O O O O
compare O O O O
EBV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pathogenesis O O O O
andlymphoma O O O O
formation O O O O
following O O O O
infection O O O O
with O O O O
a O O O O
lytic O O O O
replication O O O O
- O O O O
defectiveBZLF1 O O O O
- O O O O
deleted O O O O
( O O O O
Z O O O O
- O O O O
KO O O O O
) O O O O
virus O O O O
or O O O O
a O O O O
lytically O O O O
active O O O O
BZLF1 O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
control O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
thecontrol O O O O
and O O O O
Z O O O O
- O O O O
KO O O O O
viruses O O O O
established O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
viral O O O O
latency O O O O
in O O O O
all O O O O
infectedanimals O O O O
. O O O O
    
The O O O O
infection O O O O
appeared O O O O
well O O O O
controlled O O O O
in O O O O
some O O O O
animals O O O O
, O O O O
but O O O O
otherseventually O O O O
developed O O O O
CD20 O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
diffuse O O O O
large O O O O
B O O O O
cell O O O O
lymphomas O O O O
( O O O O
DLBCL O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Animalsinfected O O O O
with O O O O
the O O O O
control O O O O
virus O O O O
developed O O O O
tumors O O O O
more O O O O
frequently O O O O
than O O O O
Z O O O O
- O O O O
KOvirus O O O O
- O O O O
infected O O O O
animals O O O O
. O O O O
    
Specific O O O O
immune O O O O
responses O O O O
against O O O O
EBV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
infected O O O O
B O O O O
cellswere O O O O
generated O O O O
in O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infected O O O O
with O O O O
either O O O O
the O O O O
control O O O O
virus O O O O
or O O O O
the O O O O
Z O O O O
- O O O O
KOvirus O O O O
. O O O O
    
In O O O O
both O O O O
cases O O O O
, O O O O
forms O O O O
of O O O O
viral O O O O
latency O O O O
( O O O O
type O O O O
I O O O O
and O O O O
type O O O O
IIB O O O O
) O O O O
wereobserved O O O O
that O O O O
are O O O O
less O O O O
immunogenic O O O O
than O O O O
the O O O O
highly O O O O
transforming O O O O
form O O O O
( O O O O
type O O O O
III O O O O
) O O O O
commonly O O O O
found O O O O
in O O O O
tumors O O O O
of O O O O
immunocompromised O O O O
hosts O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
immunepressure O O O O
contributed O O O O
to O O O O
the O O O O
outcome O O O O
of O O O O
the O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
point O O O O
to O O O O
animportant O O O O
role O O O O
for O O O O
lytic O O O O
EBV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infection O O O O
in O O O O
the O O O O
development O O O O
of O O O O
B O O O O
cell O O O O
lymphomasin O O O O
the O O O O
context O O O O
of O O O O
an O O O O
active O O O O
host O O O O
immune O O O O
response O O O O
. O O O O
    
Serine O O O O
- O O O O
threonine O O O O
ubiquitination O O O O
mediates O O O O
downregulation O O O O
of O O O O
BST O O O O
- O O O O
2 O O O O
/ O O O O
tetherin O O O O
and O O O O
relief O O O O
of O O O O
restricted O O O O
virion O O O O
release O O O O
by O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Vpu O O O O
. O O O O
    
The O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
protein O O O O
Vpu O O O O
counteracts O O O O
the O O O O
antiviral O O O O
activity O O O O
of O O O O
the O O O O
innate O O O O
restriction O O O O
factor O O O O
BST O O O O
- O O O O
2 O O O O
/ O O O O
tetherin O O O O
by O O O O
a O O O O
mechanism O O O O
that O O O O
partly O O O O
depends O O O O
on O O O O
its O O O O
interaction O O O O
with O O O O
Beta O O O O
- O O O O
TrCP O O O O
, O O O O
a O O O O
substrate O O O O
adaptor O O O O
for O O O O
an O O O O
SCF O O O O
( O O O O
Skp O O O O
- O O O O
Cullin O O O O
1 O O O O
- O O O O
F O O O O
box O O O O
) O O O O
E3 O O O O
ubiquitin O O O O
ligase O O O O
complex O O O O
. O O O O
    
This O O O O
suggests O O O O
that O O O O
Vpu O O O O
stimulates O O O O
the O O O O
ubiquitination O O O O
of O O O O
BST O O O O
- O O O O
2 O O O O
and O O O O
that O O O O
this O O O O
underlies O O O O
the O O O O
relief O O O O
of O O O O
restriction O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
show O O O O
that O O O O
Vpu O O O O
stimulates O O O O
ubiquitination O O O O
of O O O O
BST O O O O
- O O O O
2 O O O O
. O O O O
    
Mutation O O O O
of O O O O
all O O O O
potential O O O O
ubiquitination O O O O
sites O O O O
in O O O O
the O O O O
cytoplasmic O O O O
domain O O O O
of O O O O
BST O O O O
- O O O O
2 O O O O
, O O O O
including O O O O
lysines O O O O
, O O O O
cysteines O O O O
, O O O O
serines O O O O
, O O O O
and O O O O
threonines O O O O
, O O O O
abrogates O O O O
Vpu O O O O
- O O O O
mediated O O O O
ubiquitination O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
a O O O O
serine O O O O
- O O O O
threonine O O O O
- O O O O
serine O O O O
sequence O O O O
specifically O O O O
mediates O O O O
the O O O O
downregulation O O O O
of O O O O
BST O O O O
- O O O O
2 O O O O
from O O O O
the O O O O
cell O O O O
surface O O O O
and O O O O
the O O O O
optimal O O O O
relief O O O O
of O O O O
restricted O O O O
virion O O O O
release O O O O
. O O O O
    
Serine O O O O
- O O O O
threonine O O O O
ubiquitination O O O O
of O O O O
BST O O O O
- O O O O
2 O O O O
is O O O O
likely O O O O
part O O O O
of O O O O
the O O O O
mechanism O O O O
by O O O O
which O O O O
Vpu O O O O
counteracts O O O O
innate O O O O
defenses O O O O
. O O O O
    
R5 O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
env O O O O
and O O O O
vesicular B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
stomatitis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
G O O O O
protein O O O O
cooperate O O O O
to O O O O
mediate O O O O
fusion O O O O
to O O O O
naive O O O O
CD4 O O O O
+ O O O O
T O O O O
Cells O O O O
. O O O O
    
Naive O O O O
CD4 O O O O
( O O O O
4 O O O O
) O O O O
T O O O O
cells O O O O
are O O O O
resistant O O O O
to O O O O
both O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
R5 O O O O
env O O O O
and O O O O
vesicular B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
stomatitis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
G O O O O
protein O O O O
( O O O O
VSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
G O O O O
) O O O O
- O O O O
mediated O O O O
fusion O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
viral B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
particles O O O O
carrying O O O O
both O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
R5 O O O O
env O O O O
and O O O O
VSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
G O O O O
infect O O O O
naive O O O O
cells O O O O
by O O O O
an O O O O
unexplained O O O O
mechanism O O O O
. O O O O
    
We O O O O
show O O O O
that O O O O
VSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
G O O O O
- O O O O
pseudotyped O O O O
virus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cannot O O O O
fuse O O O O
to O O O O
unstimulated O O O O
cells O O O O
because O O O O
the O O O O
viral B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
particles O O O O
cannot O O O O
be O O O O
endocytosed O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
virions O O O O
carrying O O O O
both O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
R5 O O O O
env O O O O
and O O O O
VSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
G O O O O
can O O O O
fuse O O O O
because O O O O
CD4 O O O O
binding O O O O
allows O O O O
viral B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
uptake O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
findings O O O O
reveal O O O O
a O O O O
unique O O O O
mechanism O O O O
by O O O O
which O O O O
R5 O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
env O O O O
and O O O O
VSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
G O O O O
cooperate O O O O
to O O O O
allow O O O O
entry O O O O
to O O O O
naive O O O O
CD4 O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
T O O O O
cells O O O O
, O O O O
providing O O O O
a O O O O
tool O O O O
to O O O O
target O O O O
naive O O O O
CD4 O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
T O O O O
cells O O O O
with O O O O
R5 O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
to O O O O
study O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coreceptor O O O O
signaling O O O O
and O O O O
latency O O O O
. O O O O
    
A O O O O
recombinant O O O O
measles B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
unable O O O O
to O O O O
antagonize O O O O
STAT1 O O O O
function O O O O
cannot O O O O
control O O O O
inflammation O O O O
and O O O O
is O O O O
attenuated O O O O
in O O O O
rhesus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
monkeys O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Measles O O O O
remains O O O O
a O O O O
leading O O O O
cause O O O O
of O O O O
death O O O O
worldwide O O O O
among O O O O
children O O O O
because O O O O
it O O O O
suppresses O O O O
immune O O O O
function O O O O
. O O O O
    
The O O O O
measles B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
MV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
P O O O O
gene O O O O
encodes O O O O
three O O O O
proteins O O O O
( O O O O
P O O O O
, O O O O
V O O O O
, O O O O
and O O O O
C O O O O
) O O O O
that O O O O
interfere O O O O
with O O O O
innate O O O O
immunity O O O O
, O O O O
controlling O O O O
STAT1 O O O O
, O O O O
STAT2 O O O O
, O O O O
mda5 O O O O
, O O O O
and O O O O
perhaps O O O O
other O O O O
key O O O O
regulators O O O O
of O O O O
immune O O O O
function O O O O
. O O O O
    
We O O O O
identified O O O O
here O O O O
three O O O O
residues O O O O
in O O O O
the O O O O
shared O O O O
domain O O O O
of O O O O
the O O O O
P O O O O
and O O O O
V O O O O
proteins O O O O
- O O O O
tyrosine O O O O
110 O O O O
, O O O O
valine O O O O
112 O O O O
, O O O O
and O O O O
histidine O O O O
115 O O O O
- O O O O
that O O O O
function O O O O
to O O O O
retain O O O O
STAT1 O O O O
in O O O O
the O O O O
cytoplasm O O O O
and O O O O
inhibit O O O O
interferon O O O O
transcription O O O O
. O O O O
    
This O O O O
information O O O O
was O O O O
used O O O O
to O O O O
generate O O O O
a O O O O
recombinant O O O O
measles B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
unable O O O O
to O O O O
antagonize O O O O
STAT1 O O O O
function O O O O
( O O O O
STAT1 O O O O
- O O O O
blind O O O O
MV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
differing O O O O
only O O O O
in O O O O
these O O O O
three O O O O
residues O O O O
from O O O O
a O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
strain O O O O
of O O O O
well O O O O
- O O O O
defined O O O O
virulence O O O O
. O O O O
    
This O O O O
virus O O O O
was O O O O
used O O O O
to O O O O
assess O O O O
the O O O O
relevance O O O O
of O O O O
P O O O O
and O O O O
V O O O O
interactions O O O O
with O O O O
STAT1 O O O O
for O O O O
virulence O O O O
in O O O O
primates O O O O
. O O O O
    
When O O O O
a O O O O
group O O O O
of O O O O
six O O O O
rhesus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
monkeys O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Macaca B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mulatta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
was O O O O
inoculated O O O O
intranasally O O O O
with O O O O
STAT1 O O O O
- O O O O
blind O O O O
MV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
viremia O O O O
was O O O O
short O O O O
- O O O O
lived O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
skin O O O O
rash O O O O
and O O O O
other O O O O
clinical O O O O
signs O O O O
observed O O O O
with O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
MV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
were O O O O
absent O O O O
. O O O O
    
The O O O O
STAT1 O O O O
- O O O O
blind O O O O
virus O O O O
less O O O O
efficiently O O O O
controlled O O O O
the O O O O
inflammatory O O O O
response O O O O
, O O O O
as O O O O
measured O O O O
by O O O O
enhanced O O O O
transcription O O O O
of O O O O
interleukin O O O O
- O O O O
6 O O O O
and O O O O
tumor O O O O
necrosis O O O O
factor O O O O
alpha O O O O
in O O O O
peripheral O O O O
blood O O O O
mononuclear O O O O
cells O O O O
from O O O O
infected O O O O
hosts O O O O
. O O O O
    
Importantly O O O O
, O O O O
neutralizing O O O O
antibody O O O O
titers O O O O
and O O O O
MV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
specific O O O O
T O O O O
- O O O O
cell O O O O
responses O O O O
were O O O O
equivalent O O O O
in O O O O
hosts O O O O
infected O O O O
with O O O O
either O O O O
virus O O O O
. O O O O
    
These O O O O
findings O O O O
indicate O O O O
that O O O O
efficient O O O O
MV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
interactions O O O O
with O O O O
STAT1 O O O O
are O O O O
required O O O O
to O O O O
sustain O O O O
virulence O O O O
in O O O O
a O O O O
natural O O O O
host O O O O
by O O O O
controlling O O O O
the O O O O
inflammatory O O O O
response O O O O
against O O O O
the O O O O
virus O O O O
. O O O O
    
They O O O O
also O O O O
suggest O O O O
that O O O O
selectively O O O O
STAT1 O O O O
- O O O O
blind O O O O
MV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
may O O O O
have O O O O
utility O O O O
as O O O O
vectors O O O O
for O O O O
targeted O O O O
oncolysis O O O O
and O O O O
vaccination O O O O
. O O O O
    
RNA O O O O
aptamers O O O O
directed O O O O
to O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
immunodeficiency O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
type O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Gag O O O O
polyprotein O O O O
bind O O O O
to O O O O
the O O O O
matrix O O O O
and O O O O
nucleocapsid O O O O
domains O O O O
and O O O O
inhibit O O O O
virus O O O O
production O O O O
. O O O O
    
Gag O O O O
orchestrates O O O O
the O O O O
assembly O O O O
and O O O O
release O O O O
of O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
immunodeficiency O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
type O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
particles O O O O
. O O O O
    
We O O O O
explored O O O O
here O O O O
the O O O O
potential O O O O
of O O O O
anti O O O O
- O O O O
Gag O O O O
RNA O O O O
aptamers O O O O
to O O O O
inhibit O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
replication O O O O
. O O O O
    
In O O O O
vitro O O O O
, O O O O
RNA O O O O
aptamers O O O O
raised O O O O
against O O O O
an O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Gag O O O O
protein O O O O
, O O O O
lacking O O O O
the O O O O
N O O O O
- O O O O
terminal O O O O
myristate O O O O
and O O O O
the O O O O
C O O O O
- O O O O
terminal O O O O
p6 O O O O
( O O O O
DP6 O O O O
- O O O O
Gag O O O O
) O O O O
, O O O O
could O O O O
bind O O O O
to O O O O
matrix O O O O
protein O O O O
( O O O O
MA O O O O
) O O O O
, O O O O
nucleocapsid O O O O
protein O O O O
( O O O O
NC O O O O
) O O O O
, O O O O
or O O O O
entire O O O O
DP6 O O O O
- O O O O
Gag O O O O
protein O O O O
. O O O O
    
Upon O O O O
cotransfection O O O O
with O O O O
pNL4 O O O O
- O O O O
3 O O O O
. O O O O
Luc O O O O
molecular O O O O
clone O O O O
into O O O O
293T O O O O
cells O O O O
, O O O O
six O O O O
of O O O O
the O O O O
aptamers O O O O
caused O O O O
mild O O O O
inhibition O O O O
( O O O O
2 O O O O
- O O O O
to O O O O
3 O O O O
- O O O O
fold O O O O
) O O O O
in O O O O
the O O O O
extracellular O O O O
capsid O O O O
levels O O O O
, O O O O
and O O O O
one O O O O
aptamer O O O O
displayed O O O O
20 O O O O
- O O O O
fold O O O O
inhibition O O O O
. O O O O
    
The O O O O
reduction O O O O
was O O O O
not O O O O
due O O O O
to O O O O
a O O O O
release O O O O
defect O O O O
but O O O O
reflected O O O O
Gag O O O O
mRNA O O O O
levels O O O O
. O O O O
    
We O O O O
hypothesized O O O O
that O O O O
the O O O O
aptamers O O O O
influence O O O O
genomic O O O O
RNA O O O O
levels O O O O
via O O O O
perturbation O O O O
of O O O O
specific O O O O
Gag O O O O
- O O O O
genomic O O O O
RNA O O O O
interactions O O O O
. O O O O
    
Binding O O O O
studies O O O O
revealed O O O O
that O O O O
the O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
NC O O O O
- O O O O
binders O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
specifically O O O O
compete O O O O
with O O O O
the O O O O
packaging O O O O
signal O O O O
( O O O O
psi O O O O
) O O O O
of O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
for O O O O
binding O O O O
to O O O O
DP6 O O O O
- O O O O
Gag O O O O
. O O O O
    
Therefore O O O O
, O O O O
we O O O O
tested O O O O
the O O O O
ability O O O O
of O O O O
two O O O O
NC O O O O
- O O O O
binders O O O O
to O O O O
inhibit O O O O
viruses O O O O
containing O O O O
psi O O O O
- O O O O
region O O O O
deletions O O O O
( O O O O
DeltaSL1 O O O O
or O O O O
DeltaSL3 O O O O
) O O O O
and O O O O
found O O O O
that O O O O
the O O O O
NC O O O O
- O O O O
binders O O O O
were O O O O
no O O O O
longer O O O O
able O O O O
to O O O O
inhibit O O O O
Gag O O O O
synthesis O O O O
. O O O O
    
The O O O O
inability O O O O
of O O O O
these O O O O
aptamers O O O O
to O O O O
inhibit O O O O
psi O O O O
- O O O O
deleted O O O O
viruses O O O O
correlated O O O O
with O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
competition O O O O
with O O O O
the O O O O
corresponding O O O O
psi O O O O
transcripts O O O O
lacking O O O O
SL1 O O O O
or O O O O
SL3 O O O O
for O O O O
binding O O O O
DP6 O O O O
- O O O O
Gag O O O O
in O O O O
vitro O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
indicate O O O O
that O O O O
the O O O O
NC O O O O
- O O O O
binding O O O O
aptamers O O O O
disrupt O O O O
Gag O O O O
- O O O O
genomic O O O O
RNA O O O O
interaction O O O O
and O O O O
negatively O O O O
affect O O O O
genomic O O O O
RNA O O O O
transcription O O O O
, O O O O
processing O O O O
, O O O O
or O O O O
stability O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
reveal O O O O
an O O O O
essential O O O O
interaction O O O O
between O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Gag O O O O
and O O O O
the O O O O
psi O O O O
- O O O O
region O O O O
that O O O O
may O O O O
be O O O O
distinct O O O O
from O O O O
that O O O O
which O O O O
occurs O O O O
during O O O O
the O O O O
encapsidation O O O O
of O O O O
genomic O O O O
RNA O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
anti O O O O
- O O O O
Gag O O O O
aptamers O O O O
can O O O O
be O O O O
an O O O O
effective O O O O
tool O O O O
to O O O O
perturb O O O O
Gag O O O O
- O O O O
genomic O O O O
RNA O O O O
interactions O O O O
. O O O O
    
Energy O O O O
metabolism O O O O
in O O O O
amyotrophic O O O O
lateral O O O O
sclerosis O O O O
. O O O O
    
Amyotrophic O O O O
lateral O O O O
sclerosis O O O O
( O O O O
ALS O O O O
) O O O O
is O O O O
characterised O O O O
by O O O O
the O O O O
progressive O O O O
degeneration O O O O
of O O O O
upper O O O O
and O O O O
lower O O O O
motor O O O O
neurons O O O O
. O O O O
    
Besides O O O O
motor O O O O
neuron O O O O
degeneration O O O O
, O O O O
ALS O O O O
is O O O O
associated O O O O
with O O O O
several O O O O
defects O O O O
in O O O O
energy O O O O
metabolism O O O O
, O O O O
including O O O O
weight O O O O
loss O O O O
, O O O O
hypermetabolism O O O O
, O O O O
and O O O O
hyperlipidaemia O O O O
. O O O O
    
Most O O O O
of O O O O
these O O O O
abnormalities O O O O
correlate O O O O
with O O O O
duration O O O O
of O O O O
survival O O O O
, O O O O
and O O O O
available O O O O
clinical O O O O
evidence O O O O
supports O O O O
a O O O O
negative O O O O
contribution O O O O
of O O O O
defective O O O O
energy O O O O
metabolism O O O O
to O O O O
the O O O O
overall O O O O
pathogenic O O O O
process O O O O
. O O O O
    
Findings O O O O
from O O O O
animal O O O O
models O O O O
of O O O O
ALS O O O O
support O O O O
this O O O O
view O O O O
and O O O O
provide O O O O
insights O O O O
into O O O O
the O O O O
underlying O O O O
mechanisms O O O O
. O O O O
    
Altogether O O O O
, O O O O
these O O O O
results O O O O
have O O O O
clinical O O O O
consequences O O O O
for O O O O
the O O O O
management O O O O
of O O O O
defective O O O O
energy O O O O
metabolism O O O O
in O O O O
patients O O O O
with O O O O
ALS O O O O
and O O O O
pave O O O O
the O O O O
way O O O O
for O O O O
future O O O O
therapeutic O O O O
interventions O O O O
. O O O O
    
A O O O O
small O O O O
protein O O O O
required O O O O
for O O O O
the O O O O
switch O O O O
from O O O O
{ O O O O
sigma O O O O
} O O O O
F O O O O
to O O O O
{ O O O O
sigma O O O O
} O O O O
G O O O O
during O O O O
sporulation O O O O
in O O O O
Bacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
subtilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
A O O O O
cascade O O O O
of O O O O
alternative O O O O
sigma O O O O
factors O O O O
governs O O O O
the O O O O
program O O O O
of O O O O
developmental O O O O
gene O O O O
expression O O O O
during O O O O
sporulation O O O O
in O O O O
Bacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
subtilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Little O O O O
is O O O O
known O O O O
, O O O O
however O O O O
, O O O O
about O O O O
how O O O O
the O O O O
early O O O O
- O O O O
acting O O O O
sigma O O O O
factors O O O O
are O O O O
inactivated O O O O
and O O O O
replaced O O O O
by O O O O
the O O O O
later O O O O
- O O O O
acting O O O O
factors O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
identify O O O O
a O O O O
small O O O O
protein O O O O
, O O O O
Fin O O O O
( O O O O
formerly O O O O
known O O O O
as O O O O
YabK O O O O
) O O O O
, O O O O
that O O O O
is O O O O
required O O O O
for O O O O
efficient O O O O
switching O O O O
from O O O O
sigma O O O O
( O O O O
F O O O O
) O O O O
- O O O O
to O O O O
sigma O O O O
( O O O O
G O O O O
) O O O O
- O O O O
directed O O O O
gene O O O O
expression O O O O
in O O O O
the O O O O
forespore O O O O
compartment O O O O
of O O O O
the O O O O
developing O O O O
sporangium O O O O
. O O O O
    
The O O O O
fin O O O O
gene O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
conserved O O O O
among O O O O
Bacillus O O O O
species O O O O
and O O O O
species O O O O
of O O O O
related O O O O
genera O O O O
, O O O O
is O O O O
transcribed O O O O
in O O O O
the O O O O
forespore O O O O
under O O O O
the O O O O
control O O O O
of O O O O
both O O O O
sigma O O O O
( O O O O
F O O O O
) O O O O
and O O O O
sigma O O O O
( O O O O
G O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Cells O O O O
mutant O O O O
for O O O O
fin O O O O
are O O O O
unable O O O O
to O O O O
fully O O O O
deactivate O O O O
sigma O O O O
( O O O O
F O O O O
) O O O O
and O O O O
, O O O O
conversely O O O O
, O O O O
are O O O O
unable O O O O
to O O O O
fully O O O O
activate O O O O
sigma O O O O
( O O O O
G O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Consistent O O O O
with O O O O
their O O O O
deficiency O O O O
in O O O O
sigma O O O O
( O O O O
G O O O O
) O O O O
- O O O O
directed O O O O
gene O O O O
expression O O O O
, O O O O
fin O O O O
cells O O O O
are O O O O
arrested O O O O
in O O O O
large O O O O
numbers O O O O
following O O O O
the O O O O
engulfment O O O O
stage O O O O
of O O O O
sporulation O O O O
, O O O O
ultimately O O O O
forming O O O O
50 O O O O
- O O O O
fold O O O O
fewer O O O O
heat O O O O
- O O O O
resistant O O O O
spores O O O O
than O O O O
the O O O O
wild O O O O
type O O O O
. O O O O
    
Based O O O O
in O O O O
part O O O O
on O O O O
the O O O O
similarity O O O O
of O O O O
Fin O O O O
to O O O O
the O O O O
anti O O O O
- O O O O
sigma O O O O
( O O O O
G O O O O
) O O O O
factor O O O O
CsfB O O O O
( O O O O
also O O O O
called O O O O
Gin O O O O
) O O O O
, O O O O
we O O O O
speculate O O O O
that O O O O
Fin O O O O
is O O O O
an O O O O
anti O O O O
- O O O O
sigma O O O O
( O O O O
F O O O O
) O O O O
factor O O O O
which O O O O
, O O O O
by O O O O
disabling O O O O
sigma O O O O
( O O O O
F O O O O
) O O O O
, O O O O
promotes O O O O
the O O O O
switch O O O O
to O O O O
late O O O O
developmental O O O O
gene O O O O
expression O O O O
in O O O O
the O O O O
forespore O O O O
. O O O O
    
Activation O O O O
of O O O O
the O O O O
SoxR O O O O
regulon O O O O
in O O O O
Streptomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coelicolor O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
by O O O O
the O O O O
extracellular O O O O
form O O O O
of O O O O
the O O O O
pigmented O O O O
antibiotic O O O O
actinorhodin O O O O
. O O O O
    
The O O O O
redox O O O O
- O O O O
sensitive O O O O
transcription O O O O
factor O O O O
SoxR O O O O
in O O O O
enteric O O O O
bacteria O O O O
senses O O O O
and O O O O
regulates O O O O
the O O O O
cellular O O O O
response O O O O
to O O O O
superoxide O O O O
and O O O O
nitric O O O O
oxide O O O O
. O O O O
    
In O O O O
other O O O O
bacterial O O O O
groups O O O O
, O O O O
however O O O O
, O O O O
it O O O O
may O O O O
respond O O O O
to O O O O
redox O O O O
- O O O O
active O O O O
small O O O O
molecules O O O O
, O O O O
as O O O O
demonstrated O O O O
for O O O O
pyocyanin O O O O
sensing O O O O
in O O O O
pseudomonads O O O O
. O O O O
    
The O O O O
antibiotic O O O O
- O O O O
producing O O O O
soil O O O O
bacterium O O O O
Streptomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coelicolor O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
contains O O O O
a O O O O
gene O O O O
for O O O O
an O O O O
SoxR O O O O
homologue O O O O
( O O O O
SCO1697 O O O O
) O O O O
whose O O O O
DNA O O O O
recognition O O O O
helix O O O O
is O O O O
identical O O O O
to O O O O
that O O O O
of O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
SoxR O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
the O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
SoxR O O O O
binding O O O O
sequence O O O O
, O O O O
we O O O O
predicted O O O O
five O O O O
candidate O O O O
genes O O O O
of O O O O
the O O O O
SoxR O O O O
regulon O O O O
and O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
SoxR O O O O
binds O O O O
to O O O O
their O O O O
promoter O O O O
regions O O O O
and O O O O
activates O O O O
their O O O O
expression O O O O
concurrently O O O O
with O O O O
the O O O O
production O O O O
of O O O O
the O O O O
blue O O O O
antibiotic O O O O
actinorhodin O O O O
( O O O O
a O O O O
benzoisochromanequinone O O O O
) O O O O
. O O O O
    
These O O O O
genes O O O O
encode O O O O
a O O O O
probable O O O O
NADPH O O O O
- O O O O
dependent O O O O
flavin O O O O
reductase O O O O
( O O O O
SCO2478 O O O O
) O O O O
, O O O O
an O O O O
NADPH O O O O
- O O O O
dependent O O O O
quinone O O O O
reductase O O O O
( O O O O
SCO4266 O O O O
) O O O O
, O O O O
an O O O O
ABC O O O O
transporter O O O O
( O O O O
SCO7008 O O O O
) O O O O
, O O O O
a O O O O
monooxygenase O O O O
( O O O O
SCO1909 O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
a O O O O
hypothetical O O O O
protein O O O O
( O O O O
SCO1178 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Addition O O O O
of O O O O
actinorhodin O O O O
to O O O O
exponentially O O O O
growing O O O O
cells O O O O
activated O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
SoxR O O O O
target O O O O
genes O O O O
in O O O O
an O O O O
SoxR O O O O
- O O O O
dependent O O O O
manner O O O O
. O O O O
    
The O O O O
secreted O O O O
gamma O O O O
- O O O O
actinorhodin O O O O
was O O O O
over O O O O
10 O O O O
- O O O O
fold O O O O
more O O O O
effective O O O O
in O O O O
activation O O O O
than O O O O
the O O O O
intracellular O O O O
form O O O O
of O O O O
actinorhodin O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
SoxR O O O O
is O O O O
specified O O O O
to O O O O
respond O O O O
more O O O O
to O O O O
exogenous O O O O
signals O O O O
than O O O O
to O O O O
intracellular O O O O
metabolites O O O O
. O O O O
    
The O O O O
DeltasoxR O O O O
mutant O O O O
was O O O O
not O O O O
compromised O O O O
in O O O O
resistance O O O O
against O O O O
oxidants O O O O
but O O O O
was O O O O
slow O O O O
in O O O O
forming O O O O
aerial O O O O
mycelium O O O O
on O O O O
R2YE O O O O
medium O O O O
with O O O O
reduced O O O O
sporulation O O O O
, O O O O
and O O O O
its O O O O
production O O O O
of O O O O
actinorhodin O O O O
and O O O O
undecylprodigiosin O O O O
was O O O O
lowered O O O O
by O O O O
about O O O O
50 O O O O
% O O O O
and O O O O
30 O O O O
% O O O O
, O O O O
respectively O O O O
, O O O O
compared O O O O
to O O O O
that O O O O
of O O O O
the O O O O
wild O O O O
type O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
support O O O O
the O O O O
proposal O O O O
that O O O O
SoxR O O O O
senses O O O O
redox O O O O
- O O O O
active O O O O
molecules O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
actinorhodin O O O O
in O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
coelicolor O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
induces O O O O
a O O O O
protective O O O O
function O O O O
against O O O O
them O O O O
. O O O O
    
It O O O O
also O O O O
functions O O O O
to O O O O
ensure O O O O
that O O O O
cells O O O O
undergo O O O O
optimal O O O O
differentiation O O O O
and O O O O
secondary O O O O
metabolite O O O O
production O O O O
. O O O O
    
Ecological O O O O
trade O O O O
- O O O O
offs O O O O
between O O O O
jasmonic O O O O
acid O O O O
- O O O O
dependent O O O O
direct O O O O
and O O O O
indirect O O O O
plant O O O O
defences O O O O
in O O O O
tritrophic O O O O
interactions O O O O
. O O O O
    
Recent O O O O
studies O O O O
on O O O O
plants O O O O
genetically O O O O
modified O O O O
in O O O O
jasmonic O O O O
acid O O O O
( O O O O
JA O O O O
) O O O O
signalling O O O O
support O O O O
the O O O O
hypothesis O O O O
that O O O O
the O O O O
jasmonate O O O O
family O O O O
of O O O O
oxylipins O O O O
plays O O O O
an O O O O
important O O O O
role O O O O
in O O O O
mediating O O O O
direct O O O O
and O O O O
indirect O O O O
plant O O O O
defences O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
interaction O O O O
of O O O O
two O O O O
modes O O O O
of O O O O
defence O O O O
in O O O O
tritrophic O O O O
systems O O O O
is O O O O
largely O O O O
unknown O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
examined O O O O
the O O O O
preference O O O O
and O O O O
performance O O O O
of O O O O
a O O O O
herbivorous O O O O
leafminer B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
Liriomyza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
huidobrensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
and O O O O
its O O O O
parasitic O O O O
wasp B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
Opius B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
dissitus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
on O O O O
three O O O O
tomato B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
genotypes O O O O
: O O O O
a O O O O
wild B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
type O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
WT O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
plant O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
a O O O O
JA B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
biosynthesis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
spr2 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
mutant O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
a O O O O
JA B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
overexpression O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
35S O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
: O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
: O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
prosys O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
plant O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Their O O O O
proteinase O O O O
inhibitor O O O O
production O O O O
and O O O O
volatile O O O O
emission O O O O
were O O O O
used O O O O
as O O O O
direct O O O O
and O O O O
indirect O O O O
defence O O O O
factors O O O O
to O O O O
evaluate O O O O
the O O O O
responses O O O O
of O O O O
leafminers B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
parasitoids O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
show O O O O
that O O O O
although O O O O
spr2 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mutant O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
plants O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
are O O O O
compromised O O O O
in O O O O
direct O O O O
defence O O O O
against O O O O
the O O O O
larval O O O O
leafminers B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
in O O O O
attracting O O O O
parasitoids O O O O
, O O O O
they O O O O
are O O O O
less O O O O
attractive O O O O
to O O O O
adult O O O O
flies O O O O
compared O O O O
with O O O O
WT B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
plants O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Moreover O O O O
, O O O O
in O O O O
comparison O O O O
to O O O O
other O O O O
genotypes O O O O
, O O O O
the O O O O
35S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
: O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
: O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
prosys O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
plant O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
displays O O O O
greater O O O O
direct O O O O
and O O O O
constitutive O O O O
indirect O O O O
defences O O O O
, O O O O
but O O O O
reduced O O O O
success O O O O
of O O O O
parasitism O O O O
by O O O O
parasitoids O O O O
. O O O O
    
Taken O O O O
together O O O O
, O O O O
these O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
there O O O O
are O O O O
distinguished O O O O
ecological O O O O
trade O O O O
- O O O O
offs O O O O
between O O O O
JA O O O O
- O O O O
dependent O O O O
direct O O O O
and O O O O
indirect O O O O
defences O O O O
in O O O O
genetically O O O O
modified O O O O
plants O O O O
whose O O O O
fitness O O O O
should O O O O
be O O O O
assessed O O O O
in O O O O
tritrophic O O O O
systems O O O O
and O O O O
under O O O O
natural O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
The O O O O
absence O O O O
of O O O O
sex O O O O
- O O O O
biased O O O O
dispersal O O O O
in O O O O
the O O O O
cooperatively O O O O
breeding O O O O
grey B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
crowned O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
babbler O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Cooperatively O O O O
breeding O O O O
birds O O O O
are O O O O
thought O O O O
to O O O O
be O O O O
especially O O O O
vulnerable O O O O
to O O O O
habitat O O O O
fragmentation O O O O
, O O O O
in O O O O
part O O O O
because O O O O
dispersal O O O O
is O O O O
typically O O O O
restricted O O O O
for O O O O
one O O O O
sex O O O O
, O O O O
increasing O O O O
the O O O O
likelihood O O O O
of O O O O
inbreeding O O O O
. O O O O
    
Knowledge O O O O
of O O O O
dispersal O O O O
is O O O O
essential O O O O
to O O O O
conservation O O O O
efforts O O O O
, O O O O
but O O O O
is O O O O
often O O O O
hampered O O O O
by O O O O
our O O O O
inability O O O O
to O O O O
measure O O O O
its O O O O
frequency O O O O
and O O O O
distance O O O O
when O O O O
dispersal O O O O
is O O O O
infrequent O O O O
and O O O O
difficult O O O O
to O O O O
observe O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Disrupted O O O O
dispersal O O O O
is O O O O
a O O O O
purported O O O O
cause O O O O
of O O O O
decline O O O O
in O O O O
the O O O O
Australian O O O O
grey B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
crowned O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
babbler O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Pomatostomus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
temporalis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
sexes O O O O
of O O O O
offspring O O O O
delay O O O O
dispersal O O O O
for O O O O
up O O O O
to O O O O
several O O O O
years O O O O
to O O O O
help O O O O
parents O O O O
raise O O O O
subsequent O O O O
broods O O O O
, O O O O
yet O O O O
little O O O O
else O O O O
is O O O O
known O O O O
about O O O O
the O O O O
dispersal O O O O
of O O O O
this O O O O
cooperatively O O O O
breeding O O O O
woodland O O O O
bird O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
As O O O O
both O O O O
sexes O O O O
appear O O O O
to O O O O
help O O O O
, O O O O
but O O O O
only O O O O
male O O O O
helpers O O O O
boost O O O O
fledgling O O O O
production O O O O
, O O O O
we O O O O
hypothesized O O O O
that O O O O
males O O O O
would O O O O
be O O O O
the O O O O
more O O O O
philopatric O O O O
sex O O O O
in O O O O
this O O O O
species O O O O
, O O O O
and O O O O
that O O O O
female O O O O
grey B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
crowned O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
babblers O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
would O O O O
disperse O O O O
over O O O O
greater O O O O
distances O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
To O O O O
ensure O O O O
reliable O O O O
determination O O O O
of O O O O
sex O O O O
and O O O O
minimize O O O O
bias O O O O
towards O O O O
detecting O O O O
short O O O O
- O O O O
distance O O O O
dispersal O O O O
events O O O O
, O O O O
we O O O O
combined O O O O
molecular O O O O
- O O O O
based O O O O
sexing O O O O
and O O O O
analyses O O O O
of O O O O
population O O O O
genetic O O O O
structure O O O O
using O O O O
polymorphic O O O O
microsatellite O O O O
loci O O O O
with O O O O
observational O O O O
data O O O O
obtained O O O O
over O O O O
multiple O O O O
field O O O O
seasons O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Observations O O O O
of O O O O
banded O O O O
birds O O O O
showed O O O O
only O O O O
infrequent O O O O
fission O O O O
of O O O O
groups O O O O
or O O O O
short O O O O
- O O O O
distance O O O O
dispersal O O O O
( O O O O
mean O O O O
= O O O O
854 O O O O
m O O O O
) O O O O
, O O O O
but O O O O
no O O O O
apparent O O O O
sex O O O O
- O O O O
bias O O O O
in O O O O
these O O O O
patterns O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
There O O O O
was O O O O
significant O O O O
genetic O O O O
differentiation O O O O
between O O O O
social O O O O
groups O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
between O O O O
the O O O O
sexes O O O O
. O O O O
    
Spatial O O O O
genetic O O O O
autocorrelation O O O O
analysis O O O O
of O O O O
breeders O O O O
revealed O O O O
a O O O O
random O O O O
distribution O O O O
of O O O O
genotypes O O O O
across O O O O
the O O O O
study O O O O
area O O O O
for O O O O
both O O O O
sexes O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
contrary O O O O
to O O O O
expectations O O O O
, O O O O
we O O O O
found O O O O
no O O O O
genetic O O O O
evidence O O O O
for O O O O
restricted O O O O
dispersal O O O O
or O O O O
for O O O O
sex O O O O
- O O O O
biased O O O O
dispersal O O O O
over O O O O
the O O O O
85 O O O O
- O O O O
km O O O O
scale O O O O
of O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
effective O O O O
dispersal O O O O
occurs O O O O
over O O O O
greater O O O O
distances O O O O
and O O O O
more O O O O
frequently O O O O
than O O O O
recoveries O O O O
of O O O O
banded O O O O
birds O O O O
indicated O O O O
. O O O O
    
7 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
conclude O O O O
that O O O O
while O O O O
constraints O O O O
on O O O O
independent O O O O
breeding O O O O
encourage O O O O
high O O O O
rates O O O O
of O O O O
philopatry O O O O
, O O O O
incest O O O O
avoidance O O O O
nonetheless O O O O
drives O O O O
high O O O O
rates O O O O
of O O O O
dispersal O O O O
by O O O O
both O O O O
sexes O O O O
. O O O O
    
In O O O O
fragmented O O O O
habitat O O O O
, O O O O
the O O O O
dispersal O O O O
dynamics O O O O
of O O O O
this O O O O
cooperatively O O O O
breeding O O O O
species O O O O
are O O O O
unlikely O O O O
to O O O O
render O O O O
them O O O O
particularly O O O O
vulnerable O O O O
to O O O O
genetic O O O O
consequences O O O O
such O O O O
as O O O O
inbreeding O O O O
, O O O O
but O O O O
may O O O O
lead O O O O
to O O O O
increased O O O O
group O O O O
dissolution O O O O
. O O O O
    
Dual O O O O
Delta O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
3C O O O O
/ O O O O
delta O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
8O O O O O
response O O O O
to O O O O
water O O O O
and O O O O
nitrogen O O O O
availability O O O O
and O O O O
its O O O O
relationship O O O O
with O O O O
yield O O O O
in O O O O
field O O O O
- O O O O
grown O O O O
durum B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
wheat O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
combined O O O O
use O O O O
of O O O O
stable O O O O
carbon O O O O
and O O O O
oxygen O O O O
isotopes O O O O
in O O O O
plant O O O O
matter O O O O
is O O O O
a O O O O
tool O O O O
of O O O O
growing O O O O
interest O O O O
in O O O O
cereal O O O O
crop O O O O
management O O O O
and O O O O
breeding O O O O
, O O O O
owing O O O O
to O O O O
its O O O O
relevance O O O O
for O O O O
assessing O O O O
the O O O O
photosynthetic O O O O
and O O O O
transpirative O O O O
performance O O O O
under O O O O
different O O O O
growing O O O O
conditions O O O O
including O O O O
water O O O O
and O O O O
N O O O O
regimes O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
this O O O O
method O O O O
has O O O O
not O O O O
been O O O O
applied O O O O
to O O O O
wheat B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
grown O O O O
under O O O O
real O O O O
field O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
plant O O O O
growth O O O O
, O O O O
grain O O O O
yield O O O O
( O O O O
GY O O O O
) O O O O
and O O O O
the O O O O
associated O O O O
agronomic O O O O
components O O O O
, O O O O
carbon O O O O
isotope O O O O
discrimination O O O O
( O O O O
Delta O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
3C O O O O
) O O O O
plus O O O O
oxygen O O O O
isotope O O O O
composition O O O O
( O O O O
delta O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
8O O O O O
) O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
leaf O O O O
and O O O O
canopy O O O O
gas O O O O
exchange O O O O
were O O O O
measured O O O O
in O O O O
field O O O O
- O O O O
grown O O O O
wheat B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
subjected O O O O
to O O O O
different O O O O
water O O O O
and O O O O
N O O O O
availabilities O O O O
. O O O O
    
Water O O O O
limitation O O O O
was O O O O
the O O O O
main O O O O
factor O O O O
affecting O O O O
yield O O O O
, O O O O
leaf O O O O
and O O O O
canopy O O O O
gas O O O O
exchange O O O O
and O O O O
Delta O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
3C O O O O
and O O O O
delta O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
8O O O O O
, O O O O
whereas O O O O
N O O O O
had O O O O
a O O O O
smaller O O O O
effect O O O O
on O O O O
such O O O O
traits O O O O
. O O O O
    
The O O O O
combination O O O O
of O O O O
Delta O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
3C O O O O
and O O O O
delta O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
8O O O O O
gave O O O O
a O O O O
clear O O O O
advantage O O O O
compared O O O O
with O O O O
gas O O O O
exchange O O O O
measurements O O O O
, O O O O
as O O O O
it O O O O
provides O O O O
information O O O O
on O O O O
the O O O O
instantaneous O O O O
and O O O O
the O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
plant O O O O
photosynthetic O O O O
and O O O O
transpirative O O O O
performance O O O O
and O O O O
are O O O O
less O O O O
labour O O O O
intensive O O O O
than O O O O
gas O O O O
exchange O O O O
measurements O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
, O O O O
the O O O O
combination O O O O
of O O O O
plant O O O O
Delta O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
3C O O O O
and O O O O
delta O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
8O O O O O
predicted O O O O
differences O O O O
in O O O O
GY O O O O
and O O O O
related O O O O
agronomical O O O O
parameters O O O O
, O O O O
providing O O O O
agronomists O O O O
and O O O O
breeders O O O O
with O O O O
integrative O O O O
traits O O O O
for O O O O
selecting O O O O
crop O O O O
management O O O O
practices O O O O
and O O O O
/ O O O O
or O O O O
genotypes O O O O
with O O O O
better O O O O
performance O O O O
under O O O O
water O O O O
- O O O O
limiting O O O O
and O O O O
N O O O O
- O O O O
limiting O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
Climate O O O O
, O O O O
history O O O O
and O O O O
neutrality O O O O
as O O O O
drivers O O O O
of O O O O
mammal O O O O
beta O O O O
diversity O O O O
in O O O O
Europe O O O O
: O O O O
insights O O O O
from O O O O
multiscale O O O O
deconstruction O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Environmental O O O O
sorting O O O O
, O O O O
historical O O O O
factors O O O O
and O O O O
neutral O O O O
dynamics O O O O
may O O O O
all O O O O
drive O O O O
beta O O O O
diversity O O O O
( O O O O
change O O O O
in O O O O
species O O O O
composition O O O O
across O O O O
space O O O O
) O O O O
, O O O O
but O O O O
their O O O O
relative O O O O
importance O O O O
remains O O O O
unresolved O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
case O O O O
of O O O O
European O O O O
mammals O O O O
, O O O O
key O O O O
potential O O O O
drivers O O O O
of O O O O
large O O O O
- O O O O
scale O O O O
beta O O O O
diversity O O O O
include O O O O
current O O O O
climate O O O O
, O O O O
neutral O O O O
dynamics O O O O
and O O O O
two O O O O
historical O O O O
factors O O O O
: O O O O
Pleistocene O O O O
glaciations O O O O
and O O O O
peninsular O O O O
dynamics O O O O
( O O O O
immigration O O O O
from O O O O
extra O O O O
- O O O O
regional O O O O
eastern O O O O
faunal O O O O
source O O O O
areas O O O O
and O O O O
inter O O O O
- O O O O
linked O O O O
relictual O O O O
survival O O O O
and O O O O
evolutionary O O O O
differentiation O O O O
in O O O O
isolated O O O O
areas O O O O
) O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
assessed O O O O
the O O O O
relative O O O O
importance O O O O
of O O O O
these O O O O
drivers O O O O
using O O O O
a O O O O
novel O O O O
analytical O O O O
framework O O O O
to O O O O
deconstruct O O O O
beta O O O O
diversity O O O O
of O O O O
non O O O O
- O O O O
volant O O O O
mammals O O O O
in O O O O
Europe O O O O
( O O O O
138 O O O O
species O O O O
) O O O O
into O O O O
its O O O O
turnover O O O O
( O O O O
change O O O O
in O O O O
species O O O O
composition O O O O
because O O O O
of O O O O
species O O O O
replacements O O O O
) O O O O
and O O O O
nestedness O O O O
components O O O O
( O O O O
change O O O O
in O O O O
species O O O O
composition O O O O
because O O O O
of O O O O
species O O O O
richness O O O O
differences O O O O
) O O O O
at O O O O
continental O O O O
and O O O O
regional O O O O
( O O O O
250 O O O O
, O O O O
000 O O O O
km O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
) O O O O
scales O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
continental O O O O
- O O O O
scale O O O O
mammal O O O O
beta O O O O
diversity O O O O
to O O O O
be O O O O
mainly O O O O
caused O O O O
by O O O O
spatial O O O O
turnover O O O O
( O O O O
99 O O O O
* O O O O
9 O O O O
% O O O O
) O O O O
, O O O O
with O O O O
only O O O O
a O O O O
small O O O O
contribution O O O O
( O O O O
0 O O O O
* O O O O
1 O O O O
% O O O O
) O O O O
from O O O O
nestedness O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Current O O O O
climate O O O O
emerged O O O O
as O O O O
an O O O O
important O O O O
driver O O O O
of O O O O
beta O O O O
diversity O O O O
, O O O O
given O O O O
the O O O O
strong O O O O
continental O O O O
- O O O O
scale O O O O
turnover O O O O
, O O O O
particularly O O O O
in O O O O
north O O O O
- O O O O
south O O O O
direction O O O O
, O O O O
i O O O O
. O O O O
e O O O O
. O O O O
, O O O O
in O O O O
line O O O O
with O O O O
the O O O O
latitudinal O O O O
climate O O O O
gradient O O O O
, O O O O
and O O O O
, O O O O
more O O O O
directly O O O O
, O O O O
the O O O O
strong O O O O
correlation O O O O
of O O O O
climate O O O O
with O O O O
spatial O O O O
turnover O O O O
at O O O O
both O O O O
continental O O O O
and O O O O
regional O O O O
scales O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
there O O O O
was O O O O
also O O O O
evidence O O O O
for O O O O
the O O O O
importance O O O O
of O O O O
non O O O O
- O O O O
climatic O O O O
drivers O O O O
. O O O O
    
Notably O O O O
, O O O O
the O O O O
compositional O O O O
variation O O O O
purely O O O O
accounted O O O O
for O O O O
by O O O O
space O O O O
was O O O O
greater O O O O
than O O O O
that O O O O
purely O O O O
accounted O O O O
for O O O O
by O O O O
environment O O O O
for O O O O
both O O O O
the O O O O
turnover O O O O
and O O O O
the O O O O
nestedness O O O O
component O O O O
of O O O O
beta O O O O
diversity O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
the O O O O
strong O O O O
longitudinal O O O O
turnover O O O O
within O O O O
Southern O O O O
Europe O O O O
is O O O O
in O O O O
accordance O O O O
with O O O O
the O O O O
region O O O O
' O O O O
s O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
climatic O O O O
stability O O O O
having O O O O
allowed O O O O
multiple O O O O
refugia O O O O
and O O O O
local O O O O
evolutionary O O O O
diversification O O O O
. O O O O
    
As O O O O
expected O O O O
from O O O O
peninsular O O O O
dynamics O O O O
, O O O O
there O O O O
was O O O O
increasing O O O O
dissimilarity O O O O
with O O O O
geographic O O O O
distance O O O O
in O O O O
an O O O O
east O O O O
- O O O O
west O O O O
direction O O O O
because O O O O
of O O O O
nestedness O O O O
, O O O O
but O O O O
only O O O O
in O O O O
Central O O O O
and O O O O
Northern O O O O
Europe O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
In O O O O
conclusion O O O O
, O O O O
European O O O O
mammal O O O O
beta O O O O
diversity O O O O
mainly O O O O
reflects O O O O
spatial O O O O
turnover O O O O
and O O O O
only O O O O
to O O O O
a O O O O
limited O O O O
extent O O O O
nestedness O O O O
and O O O O
is O O O O
driven O O O O
by O O O O
current O O O O
climate O O O O
in O O O O
combination O O O O
with O O O O
historical O O O O
- O O O O
and O O O O
perhaps O O O O
, O O O O
neutral O O O O
- O O O O
dynamics O O O O
. O O O O
    
These O O O O
findings O O O O
suggest O O O O
that O O O O
a O O O O
key O O O O
challenge O O O O
for O O O O
climate O O O O
- O O O O
change O O O O
predictive O O O O
studies O O O O
will O O O O
be O O O O
taking O O O O
the O O O O
influence O O O O
of O O O O
non O O O O
- O O O O
climatic O O O O
factors O O O O
into O O O O
account O O O O
. O O O O
    
Type O O O O
I O O O O
signal O O O O
peptidase O O O O
and O O O O
protein O O O O
secretion O O O O
in O O O O
Staphylococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
epidermidis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Bacterial O O O O
protein O O O O
secretion O O O O
is O O O O
a O O O O
highly O O O O
orchestrated O O O O
process O O O O
that O O O O
is O O O O
essential O O O O
for O O O O
infection O O O O
and O O O O
virulence O O O O
. O O O O
    
Despite O O O O
extensive O O O O
efforts O O O O
to O O O O
predict O O O O
or O O O O
experimentally O O O O
detect O O O O
proteins O O O O
that O O O O
are O O O O
secreted O O O O
, O O O O
the O O O O
characterization O O O O
of O O O O
the O O O O
bacterial O O O O
secretome O O O O
has O O O O
remained O O O O
challenging O O O O
. O O O O
    
A O O O O
central O O O O
event O O O O
in O O O O
protein O O O O
secretion O O O O
is O O O O
the O O O O
type O O O O
I O O O O
signal O O O O
peptidase O O O O
( O O O O
SPase O O O O
) O O O O
- O O O O
mediated O O O O
cleavage O O O O
of O O O O
the O O O O
N O O O O
- O O O O
terminal O O O O
signal O O O O
peptide O O O O
that O O O O
targets O O O O
a O O O O
protein O O O O
for O O O O
secretion O O O O
via O O O O
the O O O O
general O O O O
secretory O O O O
pathway O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
arylomycins O O O O
are O O O O
a O O O O
class O O O O
of O O O O
natural O O O O
products O O O O
that O O O O
inhibit O O O O
SPase O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
they O O O O
may O O O O
be O O O O
useful O O O O
chemical O O O O
biology O O O O
tools O O O O
for O O O O
characterizing O O O O
the O O O O
secretome O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
using O O O O
an O O O O
arylomycin O O O O
derivative O O O O
, O O O O
along O O O O
with O O O O
two O O O O
- O O O O
dimensional O O O O
gel O O O O
electrophoresis O O O O
and O O O O
liquid O O O O
chromatography O O O O
- O O O O
tandem O O O O
mass O O O O
spectrometry O O O O
( O O O O
LC O O O O
- O O O O
MS O O O O
/ O O O O
MS O O O O
) O O O O
, O O O O
we O O O O
identify O O O O
11 O O O O
proteins O O O O
whose O O O O
secretion O O O O
from O O O O
stationary O O O O
- O O O O
phase O O O O
Staphylococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
epidermidis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
dependent O O O O
on O O O O
SPase O O O O
activity O O O O
, O O O O
9 O O O O
of O O O O
which O O O O
are O O O O
predicted O O O O
to O O O O
be O O O O
translated O O O O
with O O O O
canonical O O O O
N O O O O
- O O O O
terminal O O O O
signal O O O O
peptides O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
, O O O O
we O O O O
find O O O O
that O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
extracellular O O O O
domains O O O O
of O O O O
lipoteichoic O O O O
acid O O O O
synthase O O O O
( O O O O
LtaS O O O O
) O O O O
and O O O O
the O O O O
Beta O O O O
- O O O O
lactam O O O O
response O O O O
sensor O O O O
BlaR1 O O O O
in O O O O
the O O O O
medium O O O O
is O O O O
dependent O O O O
on O O O O
SPase O O O O
activity O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
they O O O O
are O O O O
cleaved O O O O
at O O O O
noncanonical O O O O
sites O O O O
within O O O O
the O O O O
protein O O O O
. O O O O
    
In O O O O
all O O O O
, O O O O
the O O O O
data O O O O
define O O O O
the O O O O
proteins O O O O
whose O O O O
stationary O O O O
- O O O O
phase O O O O
secretion O O O O
depends O O O O
on O O O O
SPase O O O O
and O O O O
also O O O O
suggest O O O O
that O O O O
the O O O O
arylomycins O O O O
should O O O O
be O O O O
valuable O O O O
chemical O O O O
biology O O O O
tools O O O O
for O O O O
the O O O O
study O O O O
of O O O O
protein O O O O
secretion O O O O
in O O O O
a O O O O
wide O O O O
variety O O O O
of O O O O
different O O O O
bacteria O O O O
. O O O O
    
Aerobic O O O O
degradation O O O O
of O O O O
mercaptosuccinate O O O O
by O O O O
the O O O O
gram O O O O
- O O O O
negative O O O O
bacterium O O O O
Variovorax B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
paradoxus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O O O O
B4 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Gram O O O O
- O O O O
negative O O O O
bacterium O O O O
Variovorax B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
paradoxus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O O O O
B4 O O O O
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
soil O O O O
under O O O O
mesophilic O O O O
and O O O O
aerobic O O O O
conditions O O O O
to O O O O
elucidate O O O O
the O O O O
so O O O O
far O O O O
unknown O O O O
catabolism O O O O
of O O O O
mercaptosuccinate O O O O
( O O O O
MS O O O O
) O O O O
. O O O O
    
During O O O O
growth O O O O
with O O O O
MS O O O O
this O O O O
strain O O O O
released O O O O
significant O O O O
amounts O O O O
of O O O O
sulfate O O O O
into O O O O
the O O O O
medium O O O O
. O O O O
    
Tn5 O O O O
: O O O O
: O O O O
mob O O O O
- O O O O
induced O O O O
mutagenesis O O O O
was O O O O
successfully O O O O
employed O O O O
and O O O O
yielded O O O O
nine O O O O
independent O O O O
mutants O O O O
incapable O O O O
of O O O O
using O O O O
MS O O O O
as O O O O
a O O O O
carbon O O O O
source O O O O
. O O O O
    
In O O O O
six O O O O
of O O O O
these O O O O
mutants O O O O
, O O O O
Tn5 O O O O
: O O O O
: O O O O
mob O O O O
insertions O O O O
were O O O O
mapped O O O O
in O O O O
a O O O O
putative O O O O
gene O O O O
encoding O O O O
a O O O O
molybdenum O O O O
( O O O O
Mo O O O O
) O O O O
cofactor O O O O
biosynthesis O O O O
protein O O O O
( O O O O
moeA O O O O
) O O O O
. O O O O
    
In O O O O
two O O O O
further O O O O
mutants O O O O
the O O O O
Tn5 O O O O
: O O O O
: O O O O
mob O O O O
insertion O O O O
was O O O O
mapped O O O O
in O O O O
the O O O O
gene O O O O
coding O O O O
for O O O O
a O O O O
putative O O O O
molybdopterin O O O O
( O O O O
MPT O O O O
) O O O O
oxidoreductase O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
to O O O O
the O O O O
wild O O O O
type O O O O
, O O O O
these O O O O
eight O O O O
mutants O O O O
also O O O O
showed O O O O
no O O O O
growth O O O O
on O O O O
taurine O O O O
. O O O O
    
In O O O O
another O O O O
mutant O O O O
a O O O O
gene O O O O
putatively O O O O
encoding O O O O
a O O O O
3 O O O O
- O O O O
hydroxyacyl O O O O
- O O O O
coenzyme O O O O
A O O O O
dehydrogenase O O O O
( O O O O
paaH2 O O O O
) O O O O
was O O O O
disrupted O O O O
by O O O O
transposon O O O O
insertion O O O O
. O O O O
    
Upon O O O O
subcellular O O O O
fractionation O O O O
of O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
cells O O O O
cultivated O O O O
with O O O O
MS O O O O
as O O O O
sole O O O O
carbon O O O O
and O O O O
sulfur O O O O
source O O O O
, O O O O
MPT O O O O
oxidoreductase O O O O
activity O O O O
was O O O O
detected O O O O
in O O O O
only O O O O
the O O O O
cytoplasmic O O O O
fraction O O O O
. O O O O
    
Cells O O O O
grown O O O O
with O O O O
succinate O O O O
, O O O O
taurine O O O O
, O O O O
or O O O O
gluconate O O O O
as O O O O
a O O O O
sole O O O O
carbon O O O O
source O O O O
exhibited O O O O
no O O O O
activity O O O O
or O O O O
much O O O O
lower O O O O
activity O O O O
. O O O O
    
MPT O O O O
oxidoreductase O O O O
activity O O O O
in O O O O
the O O O O
cytoplasmic O O O O
fraction O O O O
of O O O O
the O O O O
Tn5 O O O O
: O O O O
: O O O O
mob O O O O
- O O O O
induced O O O O
mutant O O O O
Icr6 O O O O
was O O O O
3 O O O O
- O O O O
fold O O O O
lower O O O O
in O O O O
comparison O O O O
to O O O O
the O O O O
wild O O O O
type O O O O
. O O O O
    
Therefore O O O O
, O O O O
a O O O O
new O O O O
pathway O O O O
for O O O O
MS O O O O
catabolism O O O O
in O O O O
V B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
paradoxus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O O O O
B4 O O O O
is O O O O
proposed O O O O
: O O O O
( O O O O
i O O O O
) O O O O
MPT O O O O
oxidoreductase O O O O
catalyzes O O O O
the O O O O
conversion O O O O
of O O O O
MS O O O O
first O O O O
into O O O O
sulfinosuccinate O O O O
( O O O O
a O O O O
putative O O O O
organo O O O O
- O O O O
sulfur O O O O
compound O O O O
composed O O O O
of O O O O
succinate O O O O
and O O O O
a O O O O
sulfino O O O O
group O O O O
) O O O O
and O O O O
then O O O O
into O O O O
sulfosuccinate O O O O
by O O O O
successive O O O O
transfer O O O O
of O O O O
oxygen O O O O
atoms O O O O
, O O O O
( O O O O
ii O O O O
) O O O O
sulfosuccinate O O O O
is O O O O
cleaved O O O O
into O O O O
oxaloacetate O O O O
and O O O O
sulfite O O O O
, O O O O
and O O O O
( O O O O
iii O O O O
) O O O O
sulfite O O O O
is O O O O
oxidized O O O O
to O O O O
sulfate O O O O
. O O O O
    
African O O O O
2 O O O O
, O O O O
a O O O O
clonal O O O O
complex O O O O
of O O O O
Mycobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bovis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
epidemiologically O O O O
important O O O O
in O O O O
East O O O O
Africa O O O O
. O O O O
    
We O O O O
have O O O O
identified O O O O
a O O O O
clonal O O O O
complex O O O O
of O O O O
Mycobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bovis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
isolated O O O O
at O O O O
high O O O O
frequency O O O O
from O O O O
cattle B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
in O O O O
Uganda O O O O
, O O O O
Burundi O O O O
, O O O O
Tanzania O O O O
, O O O O
and O O O O
Ethiopia O O O O
. O O O O
    
We O O O O
have O O O O
named O O O O
this O O O O
related O O O O
group O O O O
of O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bovis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strains O O O O
the O O O O
African O O O O
2 O O O O
( O O O O
Af2 O O O O
) O O O O
clonal O O O O
complex O O O O
of O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bovis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Af2 O O O O
strains O O O O
are O O O O
defined O O O O
by O O O O
a O O O O
specific O O O O
chromosomal O O O O
deletion O O O O
( O O O O
RDAf2 O O O O
) O O O O
and O O O O
can O O O O
be O O O O
identified O O O O
by O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
spacers O O O O
3 O O O O
to O O O O
7 O O O O
in O O O O
their O O O O
spoligotype O O O O
patterns O O O O
. O O O O
    
Deletion O O O O
analysis O O O O
of O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bovis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
isolates O O O O
from O O O O
Algeria O O O O
, O O O O
Mali O O O O
, O O O O
Chad O O O O
, O O O O
Nigeria O O O O
, O O O O
Cameroon O O O O
, O O O O
South O O O O
Africa O O O O
, O O O O
and O O O O
Mozambique O O O O
did O O O O
not O O O O
identify O O O O
any O O O O
strains O O O O
of O O O O
the O O O O
Af2 O O O O
clonal O O O O
complex O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
this O O O O
clonal O O O O
complex O O O O
of O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bovis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
localized O O O O
in O O O O
East O O O O
Africa O O O O
. O O O O
    
The O O O O
specific O O O O
spoligotype O O O O
pattern O O O O
of O O O O
the O O O O
Af2 O O O O
clonal O O O O
complex O O O O
was O O O O
rarely O O O O
identified O O O O
among O O O O
isolates O O O O
from O O O O
outside O O O O
Africa O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
few O O O O
isolates O O O O
that O O O O
were O O O O
found O O O O
and O O O O
tested O O O O
were O O O O
intact O O O O
at O O O O
the O O O O
RDAf2 O O O O
locus O O O O
. O O O O
    
We O O O O
conclude O O O O
that O O O O
the O O O O
Af2 O O O O
clonal O O O O
complex O O O O
is O O O O
localized O O O O
to O O O O
cattle B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
in O O O O
East O O O O
Africa O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
that O O O O
strains O O O O
of O O O O
the O O O O
Af2 O O O O
clonal O O O O
complex O O O O
of O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bovis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
have O O O O
, O O O O
in O O O O
general O O O O
, O O O O
four O O O O
or O O O O
more O O O O
copies O O O O
of O O O O
the O O O O
insertion O O O O
sequence O O O O
IS6110 O O O O
, O O O O
in O O O O
contrast O O O O
to O O O O
the O O O O
majority O O O O
of O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bovis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strains O O O O
isolated O O O O
from O O O O
cattle B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
which O O O O
are O O O O
thought O O O O
to O O O O
carry O O O O
only O O O O
one O O O O
or O O O O
a O O O O
few O O O O
copies O O O O
. O O O O
    
Isolation O O O O
and O O O O
characterization O O O O
of O O O O
P1 O O O O
adhesin O O O O
, O O O O
a O O O O
leg O O O O
protein O O O O
of O O O O
the O O O O
gliding O O O O
bacterium O O O O
Mycoplasma B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pneumoniae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Mycoplasma B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pneumoniae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
a O O O O
pathogen O O O O
causing O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pneumonia O O O O
, O O O O
binds O O O O
to O O O O
solid O O O O
surfaces O O O O
at O O O O
its O O O O
membrane O O O O
protrusion O O O O
and O O O O
glides O O O O
by O O O O
a O O O O
unique O O O O
mechanism O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
P1 O O O O
adhesin O O O O
, O O O O
which O O O O
functions O O O O
as O O O O
a O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
leg O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
in O O O O
gliding O O O O
, O O O O
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
mycoplasma B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
culture O O O O
and O O O O
characterized O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
gel O O O O
filtration O O O O
, O O O O
blue O O O O
- O O O O
native O O O O
polyacrylamide O O O O
gel O O O O
electrophoresis O O O O
( O O O O
BN O O O O
- O O O O
PAGE O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
chemical O O O O
cross O O O O
- O O O O
linking O O O O
, O O O O
the O O O O
isolated O O O O
P1 O O O O
adhesin O O O O
was O O O O
shown O O O O
to O O O O
form O O O O
a O O O O
complex O O O O
with O O O O
an O O O O
accessory O O O O
protein O O O O
named O O O O
P90 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
complex O O O O
included O O O O
two O O O O
molecules O O O O
each O O O O
of O O O O
P1 O O O O
adhesin O O O O
and O O O O
P90 O O O O
( O O O O
protein O O O O
B O O O O
) O O O O
, O O O O
had O O O O
a O O O O
molecular O O O O
mass O O O O
of O O O O
about O O O O
480 O O O O
kDa O O O O
, O O O O
and O O O O
was O O O O
observed O O O O
by O O O O
electron O O O O
microscopy O O O O
to O O O O
form O O O O
20 O O O O
- O O O O
nm O O O O
- O O O O
diameter O O O O
spheres O O O O
. O O O O
    
Partial O O O O
digestion O O O O
of O O O O
isolated O O O O
P1 O O O O
adhesin O O O O
by O O O O
trypsin O O O O
showed O O O O
that O O O O
the O O O O
P1 O O O O
adhesin O O O O
molecule O O O O
can O O O O
be O O O O
divided O O O O
into O O O O
three O O O O
domains O O O O
, O O O O
consistent O O O O
with O O O O
the O O O O
results O O O O
from O O O O
trypsin O O O O
treatment O O O O
of O O O O
the O O O O
cell O O O O
surface O O O O
. O O O O
    
Sequence O O O O
analysis O O O O
of O O O O
P1 O O O O
adhesin O O O O
and O O O O
its O O O O
orthologs O O O O
showed O O O O
that O O O O
domain O O O O
I O O O O
is O O O O
well O O O O
conserved O O O O
and O O O O
that O O O O
a O O O O
transmembrane O O O O
segment O O O O
exists O O O O
near O O O O
the O O O O
link O O O O
between O O O O
domains O O O O
II O O O O
and O O O O
III O O O O
. O O O O
    
The O O O O
peptidoglycan O O O O
- O O O O
binding O O O O
protein O O O O
FimV O O O O
promotes O O O O
assembly O O O O
of O O O O
the O O O O
Pseudomonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aeruginosa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
type O O O O
IV O O O O
pilus O O O O
secretin O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Pseudomonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aeruginosa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
inner O O O O
membrane O O O O
protein O O O O
FimV O O O O
is O O O O
among O O O O
several O O O O
proteins O O O O
of O O O O
unknown O O O O
function O O O O
required O O O O
for O O O O
type O O O O
IV O O O O
pilus O O O O
- O O O O
mediated O O O O
twitching O O O O
motility O O O O
, O O O O
arising O O O O
from O O O O
extension O O O O
and O O O O
retraction O O O O
of O O O O
pili O O O O
from O O O O
their O O O O
site O O O O
of O O O O
assembly O O O O
in O O O O
the O O O O
inner O O O O
membrane O O O O
. O O O O
    
The O O O O
pili O O O O
transit O O O O
the O O O O
periplasm O O O O
and O O O O
peptidoglycan O O O O
( O O O O
PG O O O O
) O O O O
layer O O O O
, O O O O
ultimately O O O O
exiting O O O O
the O O O O
cell O O O O
through O O O O
the O O O O
PilQ O O O O
secretin O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
fimV O O O O
mutants O O O O
are O O O O
nonmotile O O O O
, O O O O
they O O O O
are O O O O
susceptible O O O O
to O O O O
killing O O O O
by O O O O
pilus O O O O
- O O O O
specific O O O O
bacteriophage B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
a O O O O
hallmark O O O O
of O O O O
retractable O O O O
surface O O O O
pili O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
show O O O O
that O O O O
levels O O O O
of O O O O
recoverable O O O O
surface O O O O
pili O O O O
were O O O O
markedly O O O O
decreased O O O O
in O O O O
fimV O O O O
pilT O O O O
retraction O O O O
- O O O O
deficient O O O O
mutants O O O O
compared O O O O
with O O O O
levels O O O O
in O O O O
the O O O O
pilT O O O O
control O O O O
, O O O O
demonstrating O O O O
that O O O O
FimV O O O O
acts O O O O
at O O O O
the O O O O
level O O O O
of O O O O
pilus O O O O
assembly O O O O
. O O O O
    
Levels O O O O
of O O O O
inner O O O O
membrane O O O O
assembly O O O O
subcomplex O O O O
proteins O O O O
PilM O O O O
/ O O O O
N O O O O
/ O O O O
O O O O O
/ O O O O
P O O O O
were O O O O
decreased O O O O
in O O O O
fimV O O O O
mutants O O O O
, O O O O
but O O O O
supplementation O O O O
of O O O O
these O O O O
components O O O O
in O O O O
trans O O O O
did O O O O
not O O O O
restore O O O O
pilus O O O O
assembly O O O O
or O O O O
motility O O O O
. O O O O
    
Loss O O O O
of O O O O
FimV O O O O
dramatically O O O O
reduced O O O O
the O O O O
levels O O O O
of O O O O
the O O O O
PilQ O O O O
secretin O O O O
multimer O O O O
through O O O O
which O O O O
pili O O O O
exit O O O O
the O O O O
cell O O O O
, O O O O
in O O O O
part O O O O
due O O O O
to O O O O
decreased O O O O
levels O O O O
of O O O O
PilQ O O O O
monomers O O O O
, O O O O
while O O O O
PilF O O O O
pilotin O O O O
levels O O O O
were O O O O
unchanged O O O O
. O O O O
    
Expression O O O O
of O O O O
pilQ O O O O
in O O O O
trans O O O O
in O O O O
the O O O O
wild O O O O
type O O O O
or O O O O
fimV O O O O
mutants O O O O
increased O O O O
total O O O O
PilQ O O O O
monomer O O O O
levels O O O O
but O O O O
did O O O O
not O O O O
alter O O O O
secretin O O O O
multimer O O O O
levels O O O O
or O O O O
motility O O O O
. O O O O
    
PG O O O O
pulldown O O O O
assays O O O O
showed O O O O
that O O O O
the O O O O
N O O O O
terminus O O O O
of O O O O
FimV O O O O
bound O O O O
PG O O O O
in O O O O
a O O O O
LysM O O O O
motif O O O O
- O O O O
dependent O O O O
manner O O O O
, O O O O
and O O O O
a O O O O
mutant O O O O
with O O O O
an O O O O
in O O O O
- O O O O
frame O O O O
chromosomal O O O O
deletion O O O O
of O O O O
the O O O O
LysM O O O O
motif O O O O
had O O O O
reduced O O O O
motility O O O O
, O O O O
secretin O O O O
levels O O O O
, O O O O
and O O O O
surface O O O O
piliation O O O O
. O O O O
    
Together O O O O
, O O O O
our O O O O
data O O O O
show O O O O
that O O O O
FimV O O O O
' O O O O
s O O O O
role O O O O
in O O O O
pilus O O O O
assembly O O O O
is O O O O
to O O O O
promote O O O O
secretin O O O O
formation O O O O
and O O O O
that O O O O
this O O O O
function O O O O
depends O O O O
upon O O O O
its O O O O
PG O O O O
- O O O O
binding O O O O
domain O O O O
. O O O O
    
Three O O O O
motAB O O O O
stator O O O O
gene O O O O
products O O O O
in O O O O
Bdellovibrio B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bacteriovorus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
contribute O O O O
to O O O O
motility O O O O
of O O O O
a O O O O
single O O O O
flagellum O O O O
during O O O O
predatory O O O O
and O O O O
prey O O O O
- O O O O
independent O O O O
growth O O O O
. O O O O
    
The O O O O
predatory O O O O
bacterium O O O O
Bdellovibrio B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bacteriovorus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
uses O O O O
flagellar O O O O
motility O O O O
to O O O O
locate O O O O
regions O O O O
rich O O O O
in O O O O
Gram O O O O
- O O O O
negative O O O O
prey O O O O
bacteria O O O O
, O O O O
colliding O O O O
and O O O O
attaching O O O O
to O O O O
prey O O O O
and O O O O
then O O O O
ceasing O O O O
flagellar O O O O
motility O O O O
. O O O O
    
Prey O O O O
are O O O O
then O O O O
invaded O O O O
to O O O O
form O O O O
a O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
bdelloplast O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
in O O O O
a O O O O
type O O O O
IV O O O O
pilus O O O O
- O O O O
dependent O O O O
process O O O O
, O O O O
and O O O O
prey O O O O
contents O O O O
are O O O O
digested O O O O
, O O O O
allowing O O O O
Bdellovibrio B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
growth O O O O
and O O O O
septation O O O O
. O O O O
    
After O O O O
septation O O O O
, O O O O
Bdellovibrio B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
flagellar O O O O
motility O O O O
resumes O O O O
inside O O O O
the O O O O
prey O O O O
bdelloplast O O O O
prior O O O O
to O O O O
its O O O O
lysis O O O O
and O O O O
escape O O O O
of O O O O
Bdellovibrio B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
progeny O O O O
. O O O O
    
Bdellovibrio B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
can O O O O
also O O O O
grow O O O O
slowly O O O O
outside O O O O
prey O O O O
as O O O O
long O O O O
flagellate O O O O
host O O O O
- O O O O
independent O O O O
( O O O O
HI O O O O
) O O O O
cells O O O O
, O O O O
cultured O O O O
on O O O O
peptone O O O O
- O O O O
rich O O O O
media O O O O
. O O O O
    
The O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bacteriovorus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
HD100 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
genome O O O O
encodes O O O O
three O O O O
pairs O O O O
of O O O O
MotAB O O O O
flagellar O O O O
motor O O O O
proteins O O O O
, O O O O
each O O O O
of O O O O
which O O O O
could O O O O
potentially O O O O
form O O O O
an O O O O
inner O O O O
membrane O O O O
ion O O O O
channel O O O O
, O O O O
interact O O O O
with O O O O
the O O O O
FliG O O O O
flagellar O O O O
rotor O O O O
ring O O O O
, O O O O
and O O O O
produce O O O O
flagellar O O O O
rotation O O O O
. O O O O
    
In O O O O
2004 O O O O
, O O O O
Flannagan O O O O
and O O O O
coworkers O O O O
( O O O O
R O O O O
. O O O O
S O O O O
. O O O O
Flannagan O O O O
, O O O O
M O O O O
. O O O O
A O O O O
. O O O O
Valvano O O O O
, O O O O
and O O O O
S O O O O
. O O O O
F O O O O
. O O O O
Koval O O O O
, O O O O
Microbiology O O O O
150 O O O O
: O O O O
649 O O O O
- O O O O
656 O O O O
, O O O O
2004 O O O O
) O O O O
used O O O O
antisense O O O O
RNA O O O O
and O O O O
green O O O O
fluorescent O O O O
protein O O O O
( O O O O
GFP O O O O
) O O O O
expression O O O O
to O O O O
downregulate O O O O
a O O O O
single O O O O
Bdellovibrio B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
motA O O O O
gene O O O O
and O O O O
reported O O O O
slowed O O O O
release O O O O
from O O O O
the O O O O
bdelloplast O O O O
and O O O O
altered O O O O
motility O O O O
of O O O O
the O O O O
progeny O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
inactivated O O O O
each O O O O
pair O O O O
of O O O O
motAB O O O O
genes O O O O
and O O O O
found O O O O
that O O O O
each O O O O
pair O O O O
contributes O O O O
to O O O O
motility O O O O
, O O O O
both O O O O
predatorily O O O O
, O O O O
inside O O O O
the O O O O
bdelloplast O O O O
and O O O O
during O O O O
HI O O O O
growth O O O O
; O O O O
however O O O O
, O O O O
each O O O O
pair O O O O
was O O O O
dispensable O O O O
, O O O O
and O O O O
deletion O O O O
of O O O O
no O O O O
pair O O O O
abolished O O O O
motility O O O O
totally O O O O
. O O O O
    
Driving O O O O
- O O O O
ion O O O O
studies O O O O
with O O O O
phenamil O O O O
, O O O O
carbonyl O O O O
cyanide O O O O
m O O O O
- O O O O
chlorophenylhydrazone O O O O
( O O O O
CCCP O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
different O O O O
pH O O O O
and O O O O
sodium O O O O
conditions O O O O
indicated O O O O
that O O O O
all O O O O
Mot O O O O
pairs O O O O
are O O O O
proton O O O O
driven O O O O
, O O O O
although O O O O
the O O O O
sequence O O O O
similarities O O O O
of O O O O
each O O O O
Mot O O O O
pair O O O O
suggests O O O O
that O O O O
some O O O O
may O O O O
originate O O O O
from O O O O
halophilic O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
Bdellovibrio B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
is O O O O
a O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
dedicated O O O O
motorist O O O O
, O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
retaining O O O O
and O O O O
expressing O O O O
three O O O O
pairs O O O O
of O O O O
mot O O O O
genes O O O O
. O O O O
    
FAD O O O O
binding O O O O
by O O O O
ApbE O O O O
protein O O O O
from O O O O
Salmonella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
enterica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
: O O O O
a O O O O
new O O O O
class O O O O
of O O O O
FAD O O O O
- O O O O
binding O O O O
proteins O O O O
. O O O O
    
The O O O O
periplasmic O O O O
protein O O O O
ApbE O O O O
was O O O O
identified O O O O
through O O O O
the O O O O
analysis O O O O
of O O O O
several O O O O
mutants O O O O
defective O O O O
in O O O O
thiamine O O O O
biosynthesis O O O O
and O O O O
was O O O O
implicated O O O O
as O O O O
having O O O O
a O O O O
role O O O O
in O O O O
iron O O O O
- O O O O
sulfur O O O O
cluster O O O O
biosynthesis O O O O
or O O O O
repair O O O O
. O O O O
    
While O O O O
mutations O O O O
in O O O O
apbE O O O O
cause O O O O
decreased O O O O
activity O O O O
of O O O O
several O O O O
iron O O O O
- O O O O
sulfur O O O O
enzymes O O O O
in O O O O
vivo O O O O
, O O O O
the O O O O
specific O O O O
role O O O O
of O O O O
ApbE O O O O
remains O O O O
unknown O O O O
. O O O O
    
Members O O O O
of O O O O
the O O O O
AbpE O O O O
family O O O O
include O O O O
NosX O O O O
and O O O O
RnfF O O O O
, O O O O
which O O O O
have O O O O
been O O O O
implicated O O O O
in O O O O
oxidation O O O O
- O O O O
reduction O O O O
associated O O O O
with O O O O
nitrous O O O O
oxide O O O O
and O O O O
nitrogen O O O O
metabolism O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
work O O O O
, O O O O
we O O O O
show O O O O
that O O O O
ApbE O O O O
binds O O O O
one O O O O
FAD O O O O
molecule O O O O
per O O O O
monomeric O O O O
unit O O O O
. O O O O
    
The O O O O
structure O O O O
of O O O O
ApbE O O O O
in O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
bound O O O O
FAD O O O O
reveals O O O O
a O O O O
new O O O O
FAD O O O O
- O O O O
binding O O O O
motif O O O O
. O O O O
    
Protein O O O O
variants O O O O
that O O O O
are O O O O
nonfunctional O O O O
in O O O O
vivo O O O O
were O O O O
generated O O O O
by O O O O
random O O O O
and O O O O
targeted O O O O
mutagenesis O O O O
. O O O O
    
Each O O O O
variant O O O O
was O O O O
substituted O O O O
in O O O O
the O O O O
environment O O O O
of O O O O
the O O O O
FAD O O O O
and O O O O
analyzed O O O O
for O O O O
FAD O O O O
binding O O O O
after O O O O
reconstitution O O O O
. O O O O
    
The O O O O
variant O O O O
that O O O O
altered O O O O
a O O O O
key O O O O
tyrosine O O O O
residue O O O O
involved O O O O
in O O O O
FAD O O O O
binding O O O O
prevented O O O O
reconstitution O O O O
of O O O O
the O O O O
protein O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Serengeti O O O O
food O O O O
web O O O O
: O O O O
empirical O O O O
quantification O O O O
and O O O O
analysis O O O O
of O O O O
topological O O O O
changes O O O O
under O O O O
increasing O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
impact O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
To O O O O
address O O O O
effects O O O O
of O O O O
land O O O O
use O O O O
and O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
overexploitation O O O O
on O O O O
wildlife O O O O
populations O O O O
, O O O O
it O O O O
is O O O O
essential O O O O
to O O O O
better O O O O
understand O O O O
how O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
activities O O O O
have O O O O
changed O O O O
species O O O O
composition O O O O
, O O O O
diversity O O O O
and O O O O
functioning O O O O
. O O O O
    
Theoretical O O O O
studies O O O O
modelled O O O O
how O O O O
network O O O O
properties O O O O
change O O O O
under O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
induced O O O O
, O O O O
non O O O O
- O O O O
random O O O O
species O O O O
loss O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
we O O O O
lack O O O O
data O O O O
on O O O O
realistic O O O O
species O O O O
- O O O O
loss O O O O
sequences O O O O
in O O O O
threatened O O O O
, O O O O
real O O O O
- O O O O
world O O O O
food O O O O
webs O O O O
to O O O O
parameterize O O O O
these O O O O
models O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
present O O O O
a O O O O
first O O O O
size O O O O
- O O O O
structured O O O O
topological O O O O
food O O O O
web O O O O
of O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
most O O O O
pristine O O O O
terrestrial O O O O
ecosystems O O O O
in O O O O
the O O O O
world O O O O
, O O O O
the O O O O
Serengeti O O O O
ecosystem O O O O
( O O O O
Tanzania O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
food O O O O
web O O O O
consists O O O O
of O O O O
95 O O O O
grouped O O O O
nodes O O O O
and O O O O
includes O O O O
both O O O O
invertebrates O O O O
and O O O O
vertebrates O O O O
ranging O O O O
from O O O O
body O O O O
masses O O O O
between O O O O
10 O O O O
( O O O O
- O O O O
7 O O O O
) O O O O
and O O O O
10 O O O O
( O O O O
4 O O O O
) O O O O
kg O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
study O O O O
the O O O O
topological O O O O
changes O O O O
in O O O O
this O O O O
food O O O O
web O O O O
that O O O O
result O O O O
from O O O O
the O O O O
simulated O O O O
IUCN O O O O
- O O O O
based O O O O
species O O O O
- O O O O
loss O O O O
sequence O O O O
representing O O O O
current O O O O
species O O O O
vulnerability O O O O
to O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
disturbances O O O O
in O O O O
and O O O O
around O O O O
this O O O O
savanna O O O O
ecosystem O O O O
. O O O O
    
We O O O O
then O O O O
compare O O O O
this O O O O
realistic O O O O
extinction O O O O
scenario O O O O
with O O O O
other O O O O
extinction O O O O
sequences O O O O
based O O O O
on O O O O
body O O O O
size O O O O
and O O O O
connectance O O O O
and O O O O
perform O O O O
an O O O O
analysis O O O O
of O O O O
robustness O O O O
of O O O O
this O O O O
savanna O O O O
food O O O O
web O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
real O O O O
- O O O O
world O O O O
species O O O O
loss O O O O
in O O O O
this O O O O
case O O O O
starts O O O O
with O O O O
the O O O O
biggest O O O O
( O O O O
mega O O O O
) O O O O
herbivores O O O O
and O O O O
top O O O O
predators O O O O
, O O O O
causing O O O O
higher O O O O
predator O O O O
- O O O O
prey O O O O
mass O O O O
ratios O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
unlike O O O O
theoretically O O O O
modelled O O O O
linear O O O O
species O O O O
deletion O O O O
sequences O O O O
, O O O O
this O O O O
causes O O O O
poor O O O O
- O O O O
connected O O O O
species O O O O
to O O O O
be O O O O
lost O O O O
first O O O O
, O O O O
while O O O O
more O O O O
highly O O O O
connected O O O O
species O O O O
become O O O O
lost O O O O
as O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
impact O O O O
progresses O O O O
. O O O O
    
This O O O O
food O O O O
web O O O O
shows O O O O
high O O O O
robustness O O O O
to O O O O
decreasing O O O O
body O O O O
size O O O O
and O O O O
increasing O O O O
connectance O O O O
deletion O O O O
sequences O O O O
compared O O O O
with O O O O
a O O O O
high O O O O
sensitivity O O O O
to O O O O
the O O O O
decreasing O O O O
connectance O O O O
deletion O O O O
scenario O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
based O O O O
on O O O O
the O O O O
current O O O O
knowledge O O O O
of O O O O
the O O O O
Serengeti O O O O
ecosystem O O O O
, O O O O
we O O O O
discuss O O O O
how O O O O
the O O O O
focus O O O O
on O O O O
food O O O O
web O O O O
topology O O O O
alone O O O O
, O O O O
disregarding O O O O
nontrophic O O O O
interactions O O O O
, O O O O
may O O O O
lead O O O O
to O O O O
an O O O O
underestimation O O O O
of O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
impacts O O O O
on O O O O
wildlife O O O O
communities O O O O
, O O O O
with O O O O
the O O O O
number O O O O
of O O O O
trophic O O O O
links O O O O
affected O O O O
by O O O O
a O O O O
factor O O O O
of O O O O
two O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
underlines O O O O
the O O O O
importance O O O O
of O O O O
integrative O O O O
efforts O O O O
between O O O O
the O O O O
development O O O O
of O O O O
food O O O O
web O O O O
theory O O O O
and O O O O
basic O O O O
field O O O O
work O O O O
approaches O O O O
in O O O O
the O O O O
quantification O O O O
of O O O O
the O O O O
structure O O O O
of O O O O
interaction O O O O
networks O O O O
to O O O O
sustain O O O O
natural O O O O
ecosystems O O O O
in O O O O
a O O O O
changing O O O O
world O O O O
. O O O O
    
The O O O O
osmosensing O O O O
signal O O O O
transduction O O O O
pathway O O O O
from O O O O
Botrytis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cinerea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
regulates O O O O
cell O O O O
wall O O O O
integrity O O O O
and O O O O
MAP O O O O
kinase O O O O
pathways O O O O
control O O O O
melanin O O O O
biosynthesis O O O O
with O O O O
influence O O O O
of O O O O
light O O O O
. O O O O
    
Mitogen O O O O
activated O O O O
protein O O O O
kinase O O O O
( O O O O
MAPK O O O O
) O O O O
signal O O O O
transduction O O O O
pathways O O O O
are O O O O
ubiquitous O O O O
among O O O O
eukaryotic O O O O
organisms O O O O
with O O O O
evolutionary O O O O
conserved O O O O
modules O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
generally O O O O
classified O O O O
as O O O O
osmotic O O O O
and O O O O
cell O O O O
wall O O O O
integrity O O O O
pathways O O O O
, O O O O
functional O O O O
divergences O O O O
have O O O O
been O O O O
observed O O O O
for O O O O
HOG1 O O O O
- O O O O
and O O O O
SLT2 O O O O
- O O O O
related O O O O
MAPK O O O O
pathways O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
show O O O O
that O O O O
the O O O O
osmotic O O O O
signal O O O O
transduction O O O O
cascade O O O O
is O O O O
involved O O O O
in O O O O
cell O O O O
wall O O O O
integrity O O O O
in O O O O
the O O O O
phytopathogenic O O O O
ascomycete O O O O
Botrytis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cinerea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
deletion O O O O
mutants O O O O
of O O O O
the O O O O
upstream O O O O
histidine O O O O
kinase O O O O
Bos1 O O O O
and O O O O
of O O O O
the O O O O
MAPK O O O O
Sak1 O O O O
showed O O O O
modified O O O O
tolerance O O O O
to O O O O
cell O O O O
wall O O O O
degrading O O O O
enzymes O O O O
and O O O O
cell O O O O
wall O O O O
interfering O O O O
agents O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
increased O O O O
staining O O O O
of O O O O
Beta1 O O O O
- O O O O
3 O O O O
glucan O O O O
and O O O O
chitin O O O O
compared O O O O
to O O O O
the O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Sak1 O O O O
MAPK O O O O
was O O O O
phosphorylated O O O O
upon O O O O
cell O O O O
wall O O O O
challenging O O O O
. O O O O
    
Sak1 O O O O
interfered O O O O
with O O O O
the O O O O
phosphorylation O O O O
status O O O O
of O O O O
the O O O O
SLT2 O O O O
type O O O O
MAPK O O O O
Bmp3 O O O O
hinting O O O O
to O O O O
cross O O O O
talk O O O O
between O O O O
both O O O O
MAPK O O O O
pathways O O O O
. O O O O
    
All O O O O
signal O O O O
transduction O O O O
components O O O O
interfered O O O O
with O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
melanin O O O O
biosynthesis O O O O
genes O O O O
in O O O O
dark O O O O
and O O O O
bright O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
a O O O O
coordinated O O O O
control O O O O
of O O O O
melanin O O O O
biosynthesis O O O O
. O O O O
    
Antimalarial O O O O
drug O O O O
resistance O O O O
of O O O O
Plasmodium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
falciparum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
India O O O O
: O O O O
changes O O O O
over O O O O
time O O O O
and O O O O
space O O O O
. O O O O
    
After O O O O
the O O O O
launch O O O O
of O O O O
the O O O O
National O O O O
Malaria O O O O
Control O O O O
Programme O O O O
in O O O O
1953 O O O O
, O O O O
the O O O O
number O O O O
of O O O O
malaria O O O O
cases O O O O
reported O O O O
in O O O O
India O O O O
fell O O O O
to O O O O
an O O O O
all O O O O
- O O O O
time O O O O
low O O O O
of O O O O
0 O O O O
* O O O O
1 O O O O
million O O O O
in O O O O
1965 O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
initial O O O O
success O O O O
could O O O O
not O O O O
be O O O O
maintained O O O O
and O O O O
a O O O O
resurgence O O O O
of O O O O
malaria O O O O
began O O O O
in O O O O
the O O O O
late O O O O
1960s O O O O
. O O O O
    
Resistance O O O O
of O O O O
Plasmodium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
falciparum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
to O O O O
chloroquine O O O O
was O O O O
first O O O O
reported O O O O
in O O O O
1973 O O O O
and O O O O
increases O O O O
in O O O O
antimalarial O O O O
resistance O O O O
, O O O O
along O O O O
with O O O O
rapid O O O O
urbanisation O O O O
and O O O O
labour O O O O
migration O O O O
, O O O O
complicated O O O O
the O O O O
challenge O O O O
that O O O O
India O O O O
' O O O O
s O O O O
large O O O O
geographical O O O O
area O O O O
and O O O O
population O O O O
size O O O O
already O O O O
pose O O O O
for O O O O
malaria O O O O
control O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
several O O O O
institutions O O O O
have O O O O
done O O O O
drug O O O O
- O O O O
resistance O O O O
monitoring O O O O
in O O O O
India O O O O
, O O O O
a O O O O
complete O O O O
analysis O O O O
of O O O O
countrywide O O O O
data O O O O
across O O O O
institutions O O O O
does O O O O
not O O O O
exist O O O O
. O O O O
    
We O O O O
did O O O O
a O O O O
systematic O O O O
review O O O O
of O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
falciparum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
malaria O O O O
drug O O O O
- O O O O
efficacy O O O O
studies O O O O
in O O O O
India O O O O
to O O O O
summarise O O O O
drug O O O O
- O O O O
resistance O O O O
data O O O O
and O O O O
describe O O O O
changes O O O O
over O O O O
the O O O O
past O O O O
30 O O O O
years O O O O
to O O O O
inform O O O O
future O O O O
policy O O O O
. O O O O
    
Continued O O O O
use O O O O
of O O O O
chloroquine O O O O
for O O O O
treatment O O O O
of O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
falciparum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
malaria O O O O
in O O O O
India O O O O
will O O O O
likely O O O O
be O O O O
ineffective O O O O
. O O O O
    
Resistance O O O O
to O O O O
sulfa O O O O
- O O O O
pyrimethamine O O O O
should O O O O
be O O O O
closely O O O O
monitored O O O O
to O O O O
protect O O O O
the O O O O
effectiveness O O O O
of O O O O
treatment O O O O
with O O O O
artesunate O O O O
plus O O O O
sulfadoxine O O O O
- O O O O
pyrimethamine O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
the O O O O
new O O O O
first O O O O
- O O O O
line O O O O
treatment O O O O
for O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
falciparum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
malaria O O O O
. O O O O
    
Strategies O O O O
to O O O O
reduce O O O O
the O O O O
emergence O O O O
and O O O O
spread O O O O
of O O O O
future O O O O
drug O O O O
resistance O O O O
need O O O O
to O O O O
be O O O O
proactive O O O O
and O O O O
supported O O O O
by O O O O
intensive O O O O
monitoring O O O O
. O O O O
    
Endotoxin O O O O
removal O O O O
devices O O O O
for O O O O
the O O O O
treatment O O O O
of O O O O
sepsis O O O O
and O O O O
septic O O O O
shock O O O O
. O O O O
    
A O O O O
substantial O O O O
body O O O O
of O O O O
experimental O O O O
and O O O O
clinical O O O O
evidence O O O O
suggests O O O O
that O O O O
neutralising O O O O
or O O O O
removing O O O O
lipopolysaccharide O O O O
endotoxin O O O O
would O O O O
be O O O O
an O O O O
effective O O O O
adjunctive O O O O
approach O O O O
to O O O O
the O O O O
management O O O O
of O O O O
Gram O O O O
- O O O O
negative O O O O
sepsis O O O O
. O O O O
    
Polymyxins O O O O
are O O O O
a O O O O
group O O O O
of O O O O
cyclic O O O O
cationic O O O O
polypeptide O O O O
antibiotics O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
they O O O O
have O O O O
useful O O O O
antimicrobial O O O O
activity O O O O
against O O O O
Gram O O O O
- O O O O
negative O O O O
bacteria O O O O
, O O O O
their O O O O
clinical O O O O
use O O O O
has O O O O
been O O O O
limited O O O O
because O O O O
of O O O O
toxicity O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
in O O O O
addition O O O O
to O O O O
their O O O O
antimicrobial O O O O
property O O O O
, O O O O
polymyxins O O O O
can O O O O
bind O O O O
to O O O O
and O O O O
neutralise O O O O
endotoxin O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
investigators O O O O
have O O O O
explored O O O O
the O O O O
possibility O O O O
of O O O O
using O O O O
polymyxin O O O O
bound O O O O
to O O O O
a O O O O
solid O O O O
- O O O O
phase O O O O
carrier O O O O
for O O O O
specific O O O O
haem O O O O
- O O O O
adsorption O O O O
in O O O O
patients O O O O
with O O O O
sepsis O O O O
, O O O O
thereby O O O O
retaining O O O O
the O O O O
lipopolysaccharide O O O O
- O O O O
binding O O O O
properties O O O O
but O O O O
minimising O O O O
systemic O O O O
toxic O O O O
effects O O O O
. O O O O
    
This O O O O
system O O O O
has O O O O
been O O O O
widely O O O O
used O O O O
in O O O O
Japan O O O O
for O O O O
many O O O O
years O O O O
, O O O O
but O O O O
convincing O O O O
clinical O O O O
evidence O O O O
of O O O O
efficacy O O O O
is O O O O
lacking O O O O
. O O O O
    
A O O O O
recent O O O O
Italian O O O O
study O O O O
has O O O O
some O O O O
promising O O O O
data O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
polymyxin O O O O
has O O O O
been O O O O
the O O O O
principal O O O O
agent O O O O
used O O O O
to O O O O
explore O O O O
this O O O O
approach O O O O
, O O O O
other O O O O
molecules O O O O
have O O O O
the O O O O
ability O O O O
to O O O O
bind O O O O
endotoxin O O O O
, O O O O
and O O O O
some O O O O
of O O O O
these O O O O
have O O O O
very O O O O
recently O O O O
been O O O O
proposed O O O O
as O O O O
the O O O O
basis O O O O
for O O O O
other O O O O
endotoxin O O O O
- O O O O
removal O O O O
devices O O O O
. O O O O
    
The O O O O
available O O O O
evidence O O O O
is O O O O
reviewed O O O O
to O O O O
assess O O O O
the O O O O
potential O O O O
use O O O O
of O O O O
such O O O O
devices O O O O
in O O O O
clinical O O O O
practice O O O O
. O O O O
    
Genomics O O O O
of O O O O
biotrophic O O O O
, O O O O
plant O O O O
- O O O O
infecting O O O O
plasmodiophorids O O O O
using O O O O
in O O O O
vitro O O O O
dual O O O O
cultures O O O O
. O O O O
    
The O O O O
plasmodiophorids O O O O
are O O O O
a O O O O
phylogenetically O O O O
distinct O O O O
group O O O O
of O O O O
parasitic O O O O
protists O O O O
that O O O O
infect O O O O
plants O O O O
and O O O O
stramenopiles O O O O
, O O O O
causing O O O O
several O O O O
important O O O O
agricultural O O O O
diseases O O O O
. O O O O
    
Because O O O O
of O O O O
the O O O O
obligate O O O O
intracellular O O O O
part O O O O
of O O O O
their O O O O
lifecycle O O O O
, O O O O
none O O O O
of O O O O
the O O O O
plasmodiophorids O O O O
has O O O O
been O O O O
axenically O O O O
cultured O O O O
. O O O O
    
Further O O O O
, O O O O
the O O O O
molecular O O O O
biology O O O O
of O O O O
the O O O O
plasmodiophorids O O O O
is O O O O
poorly O O O O
understood O O O O
because O O O O
pure O O O O
cultures O O O O
are O O O O
not O O O O
available O O O O
from O O O O
any O O O O
species O O O O
. O O O O
    
We O O O O
report O O O O
on O O O O
an O O O O
in O O O O
- O O O O
vitro O O O O
dual O O O O
culture O O O O
system O O O O
of O O O O
the O O O O
plasmodiophorids O O O O
Plasmodiophora B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
brassicae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Spongospora B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
subterranea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
with O O O O
their O O O O
respective O O O O
plant O O O O
hosts O O O O
, O O O O
Brassica B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
rapa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Solanum B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tuberosum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
We O O O O
show O O O O
that O O O O
these O O O O
plasmodiophorids O O O O
are O O O O
capable O O O O
of O O O O
initiating O O O O
and O O O O
maintaining O O O O
stable O O O O
, O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
plant O O O O
cell O O O O
callus O O O O
cultures O O O O
in O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
exogenous O O O O
plant O O O O
growth O O O O
regulators O O O O
. O O O O
    
We O O O O
show O O O O
that O O O O
callus O O O O
cultures O O O O
harbouring O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
subterranea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
provide O O O O
an O O O O
excellent O O O O
starting O O O O
material O O O O
for O O O O
gene O O O O
discovery O O O O
from O O O O
this O O O O
organism O O O O
by O O O O
constructing O O O O
a O O O O
pilot O O O O
- O O O O
scale O O O O
DNA O O O O
library O O O O
. O O O O
    
Bioinformatic O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
sequences O O O O
established O O O O
that O O O O
almost O O O O
all O O O O
of O O O O
the O O O O
DNA O O O O
clones O O O O
from O O O O
this O O O O
library O O O O
were O O O O
from O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
subterranea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
rather O O O O
than O O O O
the O O O O
plant O O O O
host O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Spongospora O O O O
genome O O O O
was O O O O
found O O O O
to O O O O
be O O O O
rich O O O O
in O O O O
retrotransposable O O O O
elements O O O O
, O O O O
and O O O O
Spongospora O O O O
protein O O O O
- O O O O
coding O O O O
genes O O O O
were O O O O
shown O O O O
to O O O O
contain O O O O
introns O O O O
. O O O O
    
The O O O O
sequence O O O O
of O O O O
a O O O O
near O O O O
full O O O O
- O O O O
length O O O O
non O O O O
- O O O O
LTR O O O O
retrotransposon O O O O
was O O O O
obtained O O O O
, O O O O
the O O O O
first O O O O
transposable O O O O
element O O O O
reported O O O O
from O O O O
a O O O O
cercozoan O O O O
protist O O O O
. O O O O
    
Molecular O O O O
characterization O O O O
of O O O O
three O O O O
genes O O O O
encoding O O O O
aminopeptidases O O O O
N O O O O
in O O O O
the O O O O
poplar B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
leaf O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
beetle O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Chrysomela B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tremulae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Three O O O O
genes O O O O
encoding O O O O
proteins O O O O
showing O O O O
sequence O O O O
similarity O O O O
and O O O O
features O O O O
typical O O O O
of O O O O
insect O O O O
APNs O O O O
were O O O O
characterized O O O O
in O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tremulae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
designed O O O O
as O O O O
CtAPN1 O O O O
, O O O O
CtAPN2 O O O O
and O O O O
CtAPN3 O O O O
. O O O O
    
Expression O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
three O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tremulae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
APN O O O O
genes O O O O
showed O O O O
that O O O O
CtAPN2 O O O O
transcript O O O O
is O O O O
more O O O O
abundant O O O O
in O O O O
the O O O O
fat O O O O
body O O O O
, O O O O
whereas O O O O
both O O O O
CtAPN1 O O O O
and O O O O
CtAPN3 O O O O
are O O O O
specifically O O O O
expressed O O O O
in O O O O
the O O O O
midgut O O O O
. O O O O
    
Despite O O O O
a O O O O
similar O O O O
genomic O O O O
organization O O O O
, O O O O
lepidopteran O O O O
and O O O O
coleopteran O O O O
APNs O O O O
are O O O O
phylogenetically O O O O
distant O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
APN O O O O
gene O O O O
duplication O O O O
events O O O O
occurred O O O O
after O O O O
these O O O O
two O O O O
insect O O O O
orders O O O O
split O O O O
. O O O O
    
Sequence O O O O
and O O O O
expression O O O O
comparisons O O O O
of O O O O
CtAPN1 O O O O
, O O O O
CtAPN2 O O O O
and O O O O
CtAPN3 O O O O
cDNAs O O O O
in O O O O
a O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tremulae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Bacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
thuringiensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Bt B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
- O O O O
susceptible O O O O
and O O O O
in O O O O
a O O O O
Bt B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
resistant O O O O
strain O O O O
did O O O O
not O O O O
show O O O O
any O O O O
polymorphism O O O O
at O O O O
the O O O O
amino O O O O
acid O O O O
level O O O O
or O O O O
difference O O O O
at O O O O
the O O O O
transcription O O O O
level O O O O
. O O O O
    
Alternative O O O O
community O O O O
compositional O O O O
and O O O O
dynamical O O O O
states O O O O
: O O O O
the O O O O
dual O O O O
consequences O O O O
of O O O O
assembly O O O O
history O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Much O O O O
work O O O O
on O O O O
ecological O O O O
consequences O O O O
of O O O O
community O O O O
assembly O O O O
history O O O O
has O O O O
focused O O O O
on O O O O
the O O O O
formation O O O O
of O O O O
history O O O O
- O O O O
induced O O O O
alternative O O O O
stable O O O O
equilibria O O O O
. O O O O
    
We O O O O
hypothesize O O O O
that O O O O
assembly O O O O
history O O O O
may O O O O
affect O O O O
not O O O O
only O O O O
community O O O O
composition O O O O
but O O O O
also O O O O
population O O O O
dynamics O O O O
, O O O O
with O O O O
assembled O O O O
communities O O O O
differing O O O O
in O O O O
species O O O O
composition O O O O
potentially O O O O
residing O O O O
in O O O O
different O O O O
dynamical O O O O
states O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
provided O O O O
an O O O O
empirical O O O O
test O O O O
of O O O O
the O O O O
aforementioned O O O O
hypothesis O O O O
using O O O O
a O O O O
laboratory O O O O
microcosm O O O O
experiment O O O O
that O O O O
manipulated O O O O
both O O O O
the O O O O
colonization O O O O
order O O O O
of O O O O
three O O O O
bacterivorous O O O O
protist O O O O
species O O O O
in O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
a O O O O
protist O O O O
predator O O O O
and O O O O
environmental O O O O
productivity O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
priority O O O O
effects O O O O
and O O O O
random O O O O
divergence O O O O
emerged O O O O
, O O O O
resulting O O O O
in O O O O
two O O O O
different O O O O
community O O O O
compositional O O O O
states O O O O
: O O O O
one O O O O
characterized O O O O
by O O O O
the O O O O
dominance O O O O
of O O O O
one O O O O
prey O O O O
species O O O O
and O O O O
the O O O O
other O O O O
by O O O O
the O O O O
extinction O O O O
of O O O O
the O O O O
same O O O O
prey O O O O
. O O O O
    
While O O O O
communities O O O O
in O O O O
the O O O O
former O O O O
state O O O O
exhibited O O O O
noncyclic O O O O
dynamics O O O O
, O O O O
the O O O O
majority O O O O
of O O O O
communities O O O O
in O O O O
the O O O O
latter O O O O
state O O O O
exhibited O O O O
cyclic O O O O
dynamics O O O O
driven O O O O
by O O O O
the O O O O
interaction O O O O
between O O O O
another O O O O
prey O O O O
and O O O O
the O O O O
predator O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Temporal O O O O
variability O O O O
of O O O O
total O O O O
prey O O O O
community O O O O
biovolume O O O O
consequently O O O O
differed O O O O
among O O O O
communities O O O O
with O O O O
different O O O O
histories O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Changing O O O O
productivity O O O O
altered O O O O
priority O O O O
effects O O O O
on O O O O
the O O O O
structure O O O O
and O O O O
dynamics O O O O
of O O O O
communities O O O O
experiencing O O O O
only O O O O
certain O O O O
histories O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
support O O O O
the O O O O
dual O O O O
( O O O O
compositional O O O O
and O O O O
dynamical O O O O
) O O O O
consequences O O O O
of O O O O
assembly O O O O
history O O O O
and O O O O
emphasize O O O O
the O O O O
importance O O O O
of O O O O
incorporating O O O O
the O O O O
dynamical O O O O
view O O O O
into O O O O
the O O O O
field O O O O
of O O O O
community O O O O
assembly O O O O
. O O O O
    
Barcoding O O O O
diatoms O O O O
: O O O O
exploring O O O O
alternatives O O O O
to O O O O
COI O O O O
- O O O O
5P O O O O
. O O O O
    
Diatoms O O O O
are O O O O
a O O O O
diverse O O O O
lineage O O O O
with O O O O
species O O O O
that O O O O
can O O O O
be O O O O
difficult O O O O
to O O O O
identify O O O O
or O O O O
cryptic O O O O
, O O O O
but O O O O
DNA O O O O
barcoding O O O O
, O O O O
a O O O O
molecular O O O O
technique O O O O
, O O O O
can O O O O
assist O O O O
identification O O O O
and O O O O
facilitate O O O O
studies O O O O
of O O O O
speciation O O O O
and O O O O
biogeography O O O O
. O O O O
    
The O O O O
most O O O O
common O O O O
region O O O O
used O O O O
for O O O O
DNA O O O O
barcoding O O O O
, O O O O
COI O O O O
- O O O O
5P O O O O
, O O O O
can O O O O
distinguish O O O O
diatom O O O O
species O O O O
, O O O O
but O O O O
has O O O O
not O O O O
displayed O O O O
universality O O O O
( O O O O
i O O O O
. O O O O
e O O O O
. O O O O
, O O O O
successful O O O O
PCR O O O O
amplification O O O O
from O O O O
diverse O O O O
taxa O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Therefore O O O O
, O O O O
we O O O O
have O O O O
assessed O O O O
the O O O O
following O O O O
alternative O O O O
markers O O O O
: O O O O
- O O O O
1400bp O O O O
of O O O O
rbcL O O O O
; O O O O
748bp O O O O
at O O O O
the O O O O
3 O O O O
' O O O O
end O O O O
of O O O O
rbcL O O O O
( O O O O
rbcL O O O O
- O O O O
3P O O O O
) O O O O
; O O O O
LSU O O O O
D2 O O O O
/ O O O O
D3 O O O O
and O O O O
UPA O O O O
. O O O O
    
Sellaphora O O O O
isolates O O O O
were O O O O
used O O O O
to O O O O
determine O O O O
each O O O O
marker O O O O
' O O O O
s O O O O
ability O O O O
to O O O O
discriminate O O O O
among O O O O
closely O O O O
related O O O O
species O O O O
and O O O O
culture O O O O
collection O O O O
material O O O O
was O O O O
utilized O O O O
to O O O O
explore O O O O
further O O O O
marker O O O O
universality O O O O
. O O O O
    
All O O O O
of O O O O
the O O O O
alternative O O O O
markers O O O O
investigated O O O O
have O O O O
greater O O O O
universality O O O O
than O O O O
COI O O O O
- O O O O
5P O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
full O O O O
and O O O O
partial O O O O
( O O O O
3P O O O O
) O O O O
rbcL O O O O
regions O O O O
had O O O O
the O O O O
power O O O O
to O O O O
discriminate O O O O
between O O O O
all O O O O
species O O O O
, O O O O
but O O O O
rbcL O O O O
- O O O O
3P O O O O
can O O O O
be O O O O
sequenced O O O O
more O O O O
easily O O O O
. O O O O
    
LSU O O O O
D2 O O O O
/ O O O O
D3 O O O O
could O O O O
distinguish O O O O
between O O O O
all O O O O
but O O O O
the O O O O
most O O O O
closely O O O O
related O O O O
species O O O O
( O O O O
96 O O O O
% O O O O
) O O O O
, O O O O
whereas O O O O
UPA O O O O
only O O O O
distinguished O O O O
20 O O O O
% O O O O
of O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
observations O O O O
suggest O O O O
that O O O O
rbcL O O O O
- O O O O
3P O O O O
should O O O O
be O O O O
used O O O O
as O O O O
the O O O O
primary O O O O
marker O O O O
for O O O O
diatom O O O O
barcoding O O O O
, O O O O
while O O O O
LSU O O O O
D2 O O O O
/ O O O O
D3 O O O O
should O O O O
be O O O O
sequenced O O O O
as O O O O
a O O O O
secondary O O O O
marker O O O O
to O O O O
facilitate O O O O
environmental O O O O
surveys O O O O
. O O O O
    
Genetic O O O O
and O O O O
molecular O O O O
characterization O O O O
of O O O O
a O O O O
blue O O O O
light O O O O
photoreceptor O O O O
MGWC O O O O
- O O O O
1 O O O O
in O O O O
Magnaporth B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
oryzae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Three O O O O
key O O O O
factors O O O O
involved O O O O
in O O O O
successful O O O O
plant O O O O
disease O O O O
development O O O O
include O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
a O O O O
susceptible O O O O
host O O O O
, O O O O
a O O O O
virulent O O O O
pathogen O O O O
, O O O O
and O O O O
a O O O O
disease O O O O
- O O O O
conducive O O O O
environment O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
understanding O O O O
of O O O O
how O O O O
environmental O O O O
factors O O O O
influence O O O O
disease O O O O
- O O O O
conducive O O O O
or O O O O
disease O O O O
- O O O O
suppressive O O O O
conditions O O O O
, O O O O
and O O O O
how O O O O
a O O O O
pathogen O O O O
advantageously O O O O
capitalizes O O O O
on O O O O
them O O O O
, O O O O
is O O O O
quite O O O O
limited O O O O
. O O O O
    
Utilizing O O O O
the O O O O
model O O O O
pathosystem O O O O
Magnaporthe B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
oryzae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O O O O
Oryza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sativa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
we O O O O
found O O O O
a O O O O
significant O O O O
light O O O O
- O O O O
dependent O O O O
disease O O O O
suppression O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
genetic O O O O
data O O O O
suggest O O O O
that O O O O
the O O O O
blue O O O O
- O O O O
light O O O O
receptor O O O O
MGWC O O O O
- O O O O
1 O O O O
in O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
oryzae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
involved O O O O
in O O O O
light O O O O
- O O O O
dependent O O O O
disease O O O O
suppression O O O O
during O O O O
the O O O O
dark O O O O
- O O O O
phase O O O O
( O O O O
disease O O O O
- O O O O
conducive O O O O
light O O O O
condition O O O O
) O O O O
immediately O O O O
after O O O O
pathogen O O O O
- O O O O
host O O O O
contact O O O O
. O O O O
    
Sensing O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
darkness O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
is O O O O
accomplished O O O O
by O O O O
MGWC O O O O
- O O O O
1 O O O O
, O O O O
a O O O O
blue O O O O
- O O O O
light O O O O
receptor O O O O
in O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
oryzae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
To O O O O
explore O O O O
the O O O O
potential O O O O
molecular O O O O
mechanisms O O O O
of O O O O
light O O O O
- O O O O
dependent O O O O
disease O O O O
suppression O O O O
we O O O O
performed O O O O
a O O O O
genome O O O O
- O O O O
wide O O O O
microarray O O O O
experiment O O O O
and O O O O
identified O O O O
several O O O O
groups O O O O
of O O O O
gene O O O O
families O O O O
that O O O O
are O O O O
differentially O O O O
regulated O O O O
during O O O O
the O O O O
light O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
dark O O O O
transition O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
genetic O O O O
and O O O O
molecular O O O O
data O O O O
provide O O O O
insights O O O O
into O O O O
how O O O O
a O O O O
fungal O O O O
pathogen O O O O
utilizes O O O O
ambient O O O O
light O O O O
signals O O O O
for O O O O
successful O O O O
disease O O O O
development O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
tunable O O O O
diode O O O O
laser O O O O
spectroscopy O O O O
to O O O O
measure O O O O
carbon O O O O
isotope O O O O
discrimination O O O O
and O O O O
mesophyll O O O O
conductance O O O O
to O O O O
CO2 O O O O
diffusion O O O O
dynamically O O O O
at O O O O
different O O O O
CO2 O O O O
concentrations O O O O
. O O O O
    
In O O O O
C3 O O O O
leaves O O O O
, O O O O
the O O O O
mesophyll O O O O
conductance O O O O
to O O O O
CO2 O O O O
diffusion O O O O
, O O O O
g O O O O
( O O O O
m O O O O
) O O O O
, O O O O
determines O O O O
the O O O O
drawdown O O O O
in O O O O
CO2 O O O O
concentration O O O O
from O O O O
intercellular O O O O
airspace O O O O
to O O O O
the O O O O
chloroplast O O O O
stroma O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
g O O O O
( O O O O
m O O O O
) O O O O
and O O O O
stomatal O O O O
conductance O O O O
limit O O O O
photosynthetic O O O O
rate O O O O
and O O O O
vary O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
the O O O O
environment O O O O
. O O O O
    
We O O O O
investigated O O O O
the O O O O
response O O O O
of O O O O
g O O O O
( O O O O
m O O O O
) O O O O
to O O O O
changes O O O O
in O O O O
CO2 O O O O
in O O O O
two O O O O
Arabidopsis O O O O
genotypes O O O O
( O O O O
including O O O O
a O O O O
mutant O O O O
with O O O O
open O O O O
stomata O O O O
, O O O O
ost1 O O O O
) O O O O
, O O O O
tobacco O O O O
and O O O O
wheat O O O O
. O O O O
    
We O O O O
combined O O O O
measurements O O O O
of O O O O
gas O O O O
exchange O O O O
with O O O O
carbon O O O O
isotope O O O O
discrimination O O O O
using O O O O
tunable O O O O
diode O O O O
laser O O O O
absorption O O O O
spectroscopy O O O O
with O O O O
a O O O O
CO2 O O O O
calibration O O O O
system O O O O
specially O O O O
designed O O O O
for O O O O
a O O O O
range O O O O
of O O O O
CO2 O O O O
and O O O O
O2 O O O O
concentrations O O O O
. O O O O
    
CO2 O O O O
was O O O O
initially O O O O
increased O O O O
from O O O O
200 O O O O
to O O O O
1000 O O O O
ppm O O O O
and O O O O
then O O O O
decreased O O O O
stepwise O O O O
to O O O O
200 O O O O
ppm O O O O
and O O O O
increased O O O O
stepwise O O O O
back O O O O
to O O O O
1000 O O O O
ppm O O O O
, O O O O
or O O O O
the O O O O
sequence O O O O
was O O O O
reversed O O O O
. O O O O
    
In O O O O
2 O O O O
% O O O O
O2 O O O O
a O O O O
step O O O O
increase O O O O
from O O O O
200 O O O O
to O O O O
1000 O O O O
ppm O O O O
significantly O O O O
decreased O O O O
g O O O O
( O O O O
m O O O O
) O O O O
by O O O O
26 O O O O
- O O O O
40 O O O O
% O O O O
in O O O O
all O O O O
three O O O O
species O O O O
, O O O O
whereas O O O O
following O O O O
a O O O O
step O O O O
decrease O O O O
from O O O O
1000 O O O O
to O O O O
200 O O O O
ppm O O O O
, O O O O
the O O O O
26 O O O O
- O O O O
38 O O O O
% O O O O
increase O O O O
in O O O O
g O O O O
( O O O O
m O O O O
) O O O O
was O O O O
not O O O O
statistically O O O O
significant O O O O
. O O O O
    
The O O O O
response O O O O
of O O O O
g O O O O
( O O O O
m O O O O
) O O O O
to O O O O
CO2 O O O O
was O O O O
less O O O O
in O O O O
21 O O O O
% O O O O
O2 O O O O
. O O O O
    
Comparing O O O O
wild O O O O
type O O O O
against O O O O
the O O O O
ost1 O O O O
revealed O O O O
that O O O O
mesophyll O O O O
and O O O O
stomatal O O O O
conductance O O O O
varied O O O O
independently O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
CO2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
discuss O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
isotope O O O O
fractionation O O O O
factors O O O O
on O O O O
estimating O O O O
g O O O O
( O O O O
m O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Maternal O O O O
, O O O O
neonatal O O O O
, O O O O
and O O O O
child O O O O
health O O O O
in O O O O
southeast O O O O
Asia O O O O
: O O O O
towards O O O O
greater O O O O
regional O O O O
collaboration O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
maternal O O O O
and O O O O
child O O O O
mortality O O O O
are O O O O
on O O O O
the O O O O
decline O O O O
in O O O O
southeast O O O O
Asia O O O O
, O O O O
there O O O O
are O O O O
still O O O O
major O O O O
disparities O O O O
, O O O O
and O O O O
greater O O O O
equity O O O O
is O O O O
key O O O O
to O O O O
achieve O O O O
the O O O O
Millennium O O O O
Development O O O O
Goals O O O O
. O O O O
    
We O O O O
used O O O O
comparable O O O O
cross O O O O
- O O O O
national O O O O
data O O O O
sources O O O O
to O O O O
document O O O O
mortality O O O O
trends O O O O
from O O O O
1990 O O O O
to O O O O
2008 O O O O
and O O O O
to O O O O
assess O O O O
major O O O O
causes O O O O
of O O O O
maternal O O O O
and O O O O
child O O O O
deaths O O O O
. O O O O
    
We O O O O
present O O O O
inequalities O O O O
in O O O O
intervention O O O O
coverage O O O O
by O O O O
two O O O O
common O O O O
measures O O O O
of O O O O
wealth O O O O
quintiles O O O O
and O O O O
rural O O O O
or O O O O
urban O O O O
status O O O O
. O O O O
    
Case O O O O
studies O O O O
of O O O O
reduction O O O O
in O O O O
mortality O O O O
in O O O O
Thailand O O O O
and O O O O
Indonesia O O O O
indicate O O O O
the O O O O
varying O O O O
extents O O O O
of O O O O
success O O O O
and O O O O
point O O O O
to O O O O
some O O O O
factors O O O O
that O O O O
accelerate O O O O
progress O O O O
. O O O O
    
We O O O O
developed O O O O
a O O O O
Lives O O O O
Saved O O O O
Tool O O O O
analysis O O O O
for O O O O
the O O O O
region O O O O
and O O O O
for O O O O
country O O O O
subgroups O O O O
to O O O O
estimate O O O O
deaths O O O O
averted O O O O
by O O O O
cause O O O O
and O O O O
intervention O O O O
. O O O O
    
We O O O O
identified O O O O
three O O O O
major O O O O
patterns O O O O
of O O O O
maternal O O O O
and O O O O
child O O O O
mortality O O O O
reduction O O O O
: O O O O
early O O O O
, O O O O
rapid O O O O
downward O O O O
trends O O O O
( O O O O
Brunei O O O O
, O O O O
Singapore O O O O
, O O O O
Malaysia O O O O
, O O O O
and O O O O
Thailand O O O O
) O O O O
; O O O O
initially O O O O
high O O O O
declines O O O O
( O O O O
sustained O O O O
by O O O O
Vietnam O O O O
but O O O O
faltering O O O O
in O O O O
the O O O O
Philippines O O O O
and O O O O
Indonesia O O O O
) O O O O
; O O O O
and O O O O
high O O O O
initial O O O O
rates O O O O
with O O O O
a O O O O
downward O O O O
trend O O O O
( O O O O
Laos O O O O
, O O O O
Cambodia O O O O
, O O O O
and O O O O
Myanmar O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Economic O O O O
development O O O O
seems O O O O
to O O O O
provide O O O O
an O O O O
important O O O O
context O O O O
that O O O O
should O O O O
be O O O O
coupled O O O O
with O O O O
broader O O O O
health O O O O
- O O O O
system O O O O
interventions O O O O
. O O O O
    
Increasing O O O O
coverage O O O O
and O O O O
consideration O O O O
of O O O O
the O O O O
health O O O O
- O O O O
system O O O O
context O O O O
is O O O O
needed O O O O
, O O O O
and O O O O
regional O O O O
support O O O O
from O O O O
the O O O O
Association O O O O
of O O O O
Southeast O O O O
Asian O O O O
Nations O O O O
can O O O O
provide O O O O
increased O O O O
policy O O O O
support O O O O
to O O O O
achieve O O O O
maternal O O O O
, O O O O
neonatal O O O O
, O O O O
and O O O O
child O O O O
health O O O O
goals O O O O
. O O O O
    
Cataloging O O O O
and O O O O
profiling O O O O
genes O O O O
expressed O O O O
in O O O O
Lentinula B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
edodes O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fruiting O O O O
body O O O O
by O O O O
massive O O O O
cDNA O O O O
pyrosequencing O O O O
and O O O O
LongSAGE O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
investigated O O O O
the O O O O
molecular O O O O
mechanism O O O O
of O O O O
the O O O O
fruiting O O O O
body O O O O
development O O O O
and O O O O
sporulation O O O O
in O O O O
the O O O O
cap O O O O
of O O O O
the O O O O
Shiitake B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mushroom O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Lentinula B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
edodes O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Although O O O O
there O O O O
has O O O O
been O O O O
much O O O O
research O O O O
into O O O O
L B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
edodes O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
there O O O O
remain O O O O
significant O O O O
gaps O O O O
in O O O O
our O O O O
knowledge O O O O
of O O O O
how O O O O
the O O O O
species O O O O
reproduces O O O O
. O O O O
    
In O O O O
order O O O O
to O O O O
provide O O O O
molecular O O O O
resources O O O O
and O O O O
to O O O O
understand O O O O
the O O O O
molecular O O O O
mechanism O O O O
of O O O O
the O O O O
fruiting O O O O
body O O O O
development O O O O
in O O O O
basidiomycete O O O O
comprehensively O O O O
, O O O O
we O O O O
searched O O O O
for O O O O
the O O O O
genes O O O O
which O O O O
are O O O O
important O O O O
for O O O O
fruiting O O O O
body O O O O
development O O O O
and O O O O
sporulation O O O O
in O O O O
the O O O O
cap O O O O
of O O O O
mature O O O O
fruiting O O O O
body O O O O
of O O O O
L B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
edodes O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
by O O O O
using O O O O
the O O O O
whole O O O O
- O O O O
genome O O O O
approach O O O O
. O O O O
    
Massive O O O O
cDNA O O O O
pyrosequencing O O O O
was O O O O
used O O O O
to O O O O
generate O O O O
> O O O O
7000 O O O O
sequence O O O O
contigs O O O O
from O O O O
mature O O O O
fruiting O O O O
bodies O O O O
. O O O O
    
We O O O O
used O O O O
Gene O O O O
Ontology O O O O
to O O O O
categorize O O O O
the O O O O
contigs O O O O
to O O O O
form O O O O
the O O O O
catalog O O O O
of O O O O
genes O O O O
expressed O O O O
at O O O O
the O O O O
stage O O O O
of O O O O
the O O O O
mature O O O O
fruiting O O O O
body O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
assigned O O O O
the O O O O
contigs O O O O
into O O O O
the O O O O
KEGG O O O O
pathways O O O O
. O O O O
    
The O O O O
catalog O O O O
of O O O O
expressed O O O O
genes O O O O
indicates O O O O
that O O O O
the O O O O
mature O O O O
fruiting O O O O
bodies O O O O
( O O O O
1 O O O O
) O O O O
sense O O O O
the O O O O
external O O O O
environment O O O O
, O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
transmit O O O O
signals O O O O
to O O O O
express O O O O
genes O O O O
through O O O O
regulatory O O O O
systems O O O O
, O O O O
( O O O O
3 O O O O
) O O O O
produce O O O O
many O O O O
proteins O O O O
, O O O O
( O O O O
4 O O O O
) O O O O
degrade O O O O
unwanted O O O O
proteins O O O O
, O O O O
( O O O O
5 O O O O
) O O O O
perform O O O O
extensive O O O O
biosynthesis O O O O
, O O O O
( O O O O
6 O O O O
) O O O O
generate O O O O
energy O O O O
, O O O O
( O O O O
7 O O O O
) O O O O
regulate O O O O
the O O O O
internal O O O O
environment O O O O
, O O O O
( O O O O
8 O O O O
) O O O O
transport O O O O
molecules O O O O
, O O O O
( O O O O
9 O O O O
) O O O O
carry O O O O
out O O O O
cell O O O O
division O O O O
, O O O O
and O O O O
( O O O O
10 O O O O
) O O O O
differentiate O O O O
and O O O O
develop O O O O
. O O O O
    
After O O O O
establishing O O O O
the O O O O
catalog O O O O
of O O O O
expressed O O O O
genes O O O O
in O O O O
L B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
edodes O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
we O O O O
used O O O O
the O O O O
LongSAGE O O O O
approach O O O O
to O O O O
analyze O O O O
the O O O O
expression O O O O
levels O O O O
of O O O O
genes O O O O
found O O O O
in O O O O
mature O O O O
fruiting O O O O
bodies O O O O
before O O O O
( O O O O
FB O O O O
) O O O O
and O O O O
after O O O O
( O O O O
FBS O O O O
) O O O O
spores O O O O
appeared O O O O
. O O O O
    
Gene O O O O
- O O O O
expression O O O O
patterns O O O O
according O O O O
to O O O O
GO O O O O
categories O O O O
were O O O O
similar O O O O
in O O O O
these O O O O
two O O O O
stages O O O O
. O O O O
    
We O O O O
have O O O O
also O O O O
successfully O O O O
identified O O O O
genes O O O O
differentially O O O O
expressed O O O O
in O O O O
FB O O O O
and O O O O
FBS O O O O
. O O O O
    
Fold O O O O
- O O O O
changes O O O O
in O O O O
expression O O O O
levels O O O O
of O O O O
selected O O O O
genes O O O O
based O O O O
on O O O O
LongSAGE O O O O
tag O O O O
counts O O O O
were O O O O
similar O O O O
to O O O O
those O O O O
obtained O O O O
by O O O O
real O O O O
- O O O O
time O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
. O O O O
    
The O O O O
consistency O O O O
between O O O O
real O O O O
- O O O O
time O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
and O O O O
LongSAGE O O O O
results O O O O
indicates O O O O
reliability O O O O
of O O O O
the O O O O
LongSAGE O O O O
results O O O O
. O O O O
    
Overall O O O O
, O O O O
this O O O O
study O O O O
provides O O O O
valuable O O O O
information O O O O
on O O O O
the O O O O
fruiting O O O O
processes O O O O
of O O O O
L B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
edodes O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
through O O O O
a O O O O
combination O O O O
of O O O O
massive O O O O
cDNA O O O O
pyrosequencing O O O O
and O O O O
LongSAGE O O O O
sequencing O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
knowledge O O O O
thereby O O O O
obtained O O O O
may O O O O
provide O O O O
insight O O O O
into O O O O
the O O O O
improvement O O O O
of O O O O
the O O O O
yield O O O O
of O O O O
commercially O O O O
grown O O O O
Shiitake B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mushrooms O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
A O O O O
mutation O O O O
in O O O O
the O O O O
Cc O O O O
. O O O O
ubc2 O O O O
gene O O O O
affects O O O O
clamp O O O O
cell O O O O
morphogenesis O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
nuclear O O O O
migration O O O O
for O O O O
dikaryosis O O O O
in O O O O
Coprinopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cinerea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
formation O O O O
and O O O O
proliferation O O O O
of O O O O
the O O O O
dikaryon O O O O
in O O O O
the O O O O
agaricomycete O O O O
Coprinopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cinerea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
controlled O O O O
by O O O O
the O O O O
mating O O O O
type O O O O
genes O O O O
, O O O O
A O O O O
and O O O O
B O O O O
. O O O O
    
The O O O O
B O O O O
genes O O O O
, O O O O
which O O O O
encode O O O O
pheromones O O O O
and O O O O
pheromone O O O O
receptors O O O O
, O O O O
control O O O O
nuclear O O O O
migration O O O O
for O O O O
dikaryosis O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
the O O O O
fusion O O O O
of O O O O
the O O O O
clamp O O O O
cell O O O O
with O O O O
the O O O O
subterminal O O O O
cell O O O O
while O O O O
the O O O O
A O O O O
genes O O O O
, O O O O
which O O O O
encode O O O O
two O O O O
classes O O O O
of O O O O
homeodomain O O O O
proteins O O O O
, O O O O
control O O O O
conjugate O O O O
nuclear O O O O
division O O O O
associated O O O O
with O O O O
clamp O O O O
connection O O O O
development O O O O
. O O O O
    
We O O O O
characterized O O O O
the O O O O
mutant O O O O
, O O O O
B28 O O O O
, O O O O
which O O O O
was O O O O
newly O O O O
isolated O O O O
as O O O O
a O O O O
strain O O O O
that O O O O
fails O O O O
to O O O O
form O O O O
a O O O O
primary O O O O
hyphal O O O O
knot O O O O
, O O O O
the O O O O
first O O O O
visible O O O O
sign O O O O
toward O O O O
fruiting O O O O
, O O O O
from O O O O
a O O O O
homokaryotic O O O O
fruiting O O O O
strain O O O O
after O O O O
REMI O O O O
mutagenesis O O O O
. O O O O
    
Detailed O O O O
phenotypic O O O O
analysis O O O O
revealed O O O O
that O O O O
strain O O O O
B28 O O O O
exhibits O O O O
, O O O O
in O O O O
addition O O O O
to O O O O
the O O O O
fruiting O O O O
defect O O O O
, O O O O
a O O O O
defect O O O O
in O O O O
A O O O O
- O O O O
regulated O O O O
clamp O O O O
cell O O O O
morphogenesis O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
a O O O O
defect O O O O
in O O O O
B O O O O
- O O O O
regulated O O O O
nuclear O O O O
migration O O O O
for O O O O
dikaryosis O O O O
. O O O O
    
The O O O O
mutant O O O O
clamp O O O O
cells O O O O
are O O O O
unique O O O O
in O O O O
that O O O O
they O O O O
continue O O O O
growing O O O O
like O O O O
branches O O O O
without O O O O
fusing O O O O
with O O O O
the O O O O
subterminal O O O O
cells O O O O
, O O O O
in O O O O
contrast O O O O
to O O O O
the O O O O
unfused O O O O
pseudoclamp O O O O
which O O O O
are O O O O
normally O O O O
formed O O O O
in O O O O
A O O O O
- O O O O
on O O O O
B O O O O
- O O O O
off O O O O
strains O O O O
, O O O O
providing O O O O
evidence O O O O
for O O O O
the O O O O
existence O O O O
of O O O O
an O O O O
as O O O O
yet O O O O
unidentified O O O O
mechanism O O O O
for O O O O
the O O O O
growth O O O O
suppression O O O O
of O O O O
the O O O O
clamp O O O O
cell O O O O
. O O O O
    
Molecular O O O O
analysis O O O O
revealed O O O O
that O O O O
the O O O O
gene O O O O
responsible O O O O
for O O O O
the O O O O
phenotypes O O O O
, O O O O
designated O O O O
Cc O O O O
. O O O O
ubc2 O O O O
, O O O O
encodes O O O O
a O O O O
protein O O O O
similar O O O O
to O O O O
Ubc2 O O O O
, O O O O
an O O O O
adaptor O O O O
protein O O O O
for O O O O
filamentous O O O O
growth O O O O
, O O O O
pheromone O O O O
response O O O O
and O O O O
virulence O O O O
in O O O O
the O O O O
smut O O O O
fungus O O O O
Ustilago B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
maydis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
, O O O O
western O O O O
blot O O O O
analysis O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
the O O O O
Cc O O O O
. O O O O
ubc2 O O O O
- O O O O
1 O O O O
mutation O O O O
blocks O O O O
phosphorylation O O O O
of O O O O
a O O O O
presumptive O O O O
MAP O O O O
kinase O O O O
. O O O O
    
Increased O O O O
sampling O O O O
reveals O O O O
novel O O O O
lineages O O O O
of O O O O
Entamoeba O O O O
: O O O O
consequences O O O O
of O O O O
genetic O O O O
diversity O O O O
and O O O O
host O O O O
specificity O O O O
for O O O O
taxonomy O O O O
and O O O O
molecular O O O O
detection O O O O
. O O O O
    
To O O O O
expand O O O O
the O O O O
representation O O O O
for O O O O
phylogenetic O O O O
analysis O O O O
, O O O O
ten O O O O
additional O O O O
complete O O O O
Entamoeba O O O O
small O O O O
- O O O O
subunit O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequences O O O O
were O O O O
obtained O O O O
from O O O O
humans B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
non O O O O
- O O O O
human O O O O
primates O O O O
, O O O O
cattle B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
a O O O O
tortoise O O O O
. O O O O
    
For O O O O
some O O O O
novel O O O O
sequences O O O O
no O O O O
corresponding O O O O
morphological O O O O
data O O O O
were O O O O
available O O O O
, O O O O
and O O O O
we O O O O
suggest O O O O
that O O O O
these O O O O
organisms O O O O
should O O O O
be O O O O
referred O O O O
to O O O O
as O O O O
ribosomal O O O O
lineages O O O O
( O O O O
RL O O O O
) O O O O
rather O O O O
than O O O O
being O O O O
assigned O O O O
species O O O O
names O O O O
at O O O O
present O O O O
. O O O O
    
To O O O O
investigate O O O O
genetic O O O O
diversity O O O O
and O O O O
host O O O O
specificity O O O O
of O O O O
selected O O O O
Entamoeba O O O O
species O O O O
, O O O O
a O O O O
total O O O O
of O O O O
91 O O O O
new O O O O
partial O O O O
small O O O O
subunit O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequences O O O O
were O O O O
obtained O O O O
, O O O O
including O O O O
49 O O O O
from O O O O
Entamoeba B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
18 O O O O
from O O O O
Entamoeba B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
polecki O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
17 O O O O
from O O O O
Entamoeba B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
hartmanni O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
We O O O O
propose O O O O
a O O O O
new O O O O
nomenclature O O O O
for O O O O
significant O O O O
variants O O O O
within O O O O
established O O O O
Entamoeba O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Based O O O O
on O O O O
current O O O O
data O O O O
we O O O O
propose O O O O
that O O O O
the O O O O
uninucleated O O O O
- O O O O
cyst O O O O
- O O O O
producing O O O O
Entamoeba O O O O
infecting O O O O
humans B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
is O O O O
called O O O O
Entamoeba B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
polecki O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
divided O O O O
into O O O O
four O O O O
subtypes O O O O
( O O O O
ST1 O O O O
- O O O O
ST4 O O O O
) O O O O
and O O O O
that O O O O
Entamoeba B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
divided O O O O
into O O O O
two O O O O
subtypes O O O O
( O O O O
ST1 O O O O
- O O O O
ST2 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
New O O O O
hosts O O O O
for O O O O
several O O O O
species O O O O
were O O O O
detected O O O O
and O O O O
, O O O O
while O O O O
host O O O O
specificity O O O O
and O O O O
genetic O O O O
diversity O O O O
of O O O O
several O O O O
species O O O O
remain O O O O
to O O O O
be O O O O
clarified O O O O
, O O O O
it O O O O
is O O O O
clear O O O O
that O O O O
previous O O O O
reliance O O O O
on O O O O
cultivated O O O O
material O O O O
has O O O O
given O O O O
us O O O O
a O O O O
misleading O O O O
and O O O O
incomplete O O O O
picture O O O O
of O O O O
variation O O O O
within O O O O
the O O O O
genus O O O O
Entamoeba O O O O
. O O O O
    
Definition O O O O
and O O O O
classification O O O O
of O O O O
cancer O O O O
cachexia O O O O
: O O O O
an O O O O
international O O O O
consensus O O O O
. O O O O
    
To O O O O
develop O O O O
a O O O O
framework O O O O
for O O O O
the O O O O
definition O O O O
and O O O O
classification O O O O
of O O O O
cancer O O O O
cachexia O O O O
a O O O O
panel O O O O
of O O O O
experts O O O O
participated O O O O
in O O O O
a O O O O
formal O O O O
consensus O O O O
process O O O O
, O O O O
including O O O O
focus O O O O
groups O O O O
and O O O O
two O O O O
Delphi O O O O
rounds O O O O
. O O O O
    
Cancer O O O O
cachexia O O O O
was O O O O
defined O O O O
as O O O O
a O O O O
multifactorial O O O O
syndrome O O O O
defined O O O O
by O O O O
an O O O O
ongoing O O O O
loss O O O O
of O O O O
skeletal O O O O
muscle O O O O
mass O O O O
( O O O O
with O O O O
or O O O O
without O O O O
loss O O O O
of O O O O
fat O O O O
mass O O O O
) O O O O
that O O O O
cannot O O O O
be O O O O
fully O O O O
reversed O O O O
by O O O O
conventional O O O O
nutritional O O O O
support O O O O
and O O O O
leads O O O O
to O O O O
progressive O O O O
functional O O O O
impairment O O O O
. O O O O
    
Its O O O O
pathophysiology O O O O
is O O O O
characterised O O O O
by O O O O
a O O O O
negative O O O O
protein O O O O
and O O O O
energy O O O O
balance O O O O
driven O O O O
by O O O O
a O O O O
variable O O O O
combination O O O O
of O O O O
reduced O O O O
food O O O O
intake O O O O
and O O O O
abnormal O O O O
metabolism O O O O
. O O O O
    
The O O O O
agreed O O O O
diagnostic O O O O
criterion O O O O
for O O O O
cachexia O O O O
was O O O O
weight O O O O
loss O O O O
greater O O O O
than O O O O
5 O O O O
% O O O O
, O O O O
or O O O O
weight O O O O
loss O O O O
greater O O O O
than O O O O
2 O O O O
% O O O O
in O O O O
individuals O O O O
already O O O O
showing O O O O
depletion O O O O
according O O O O
to O O O O
current O O O O
bodyweight O O O O
and O O O O
height O O O O
( O O O O
body O O O O
- O O O O
mass O O O O
index O O O O
[ O O O O
BMI O O O O
] O O O O
& O O O O
lt O O O O
; O O O O
20 O O O O
kg O O O O
/ O O O O
m O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
) O O O O
or O O O O
skeletal O O O O
muscle O O O O
mass O O O O
( O O O O
sarcopenia O O O O
) O O O O
. O O O O
    
An O O O O
agreement O O O O
was O O O O
made O O O O
that O O O O
the O O O O
cachexia O O O O
syndrome O O O O
can O O O O
develop O O O O
progressively O O O O
through O O O O
various O O O O
stages O O O O
- O O O O
- O O O O
precachexia O O O O
to O O O O
cachexia O O O O
to O O O O
refractory O O O O
cachexia O O O O
. O O O O
    
Severity O O O O
can O O O O
be O O O O
classified O O O O
according O O O O
to O O O O
degree O O O O
of O O O O
depletion O O O O
of O O O O
energy O O O O
stores O O O O
and O O O O
body O O O O
protein O O O O
( O O O O
BMI O O O O
) O O O O
in O O O O
combination O O O O
with O O O O
degree O O O O
of O O O O
ongoing O O O O
weight O O O O
loss O O O O
. O O O O
    
Assessment O O O O
for O O O O
classification O O O O
and O O O O
clinical O O O O
management O O O O
should O O O O
include O O O O
the O O O O
following O O O O
domains O O O O
: O O O O
anorexia O O O O
or O O O O
reduced O O O O
food O O O O
intake O O O O
, O O O O
catabolic O O O O
drive O O O O
, O O O O
muscle O O O O
mass O O O O
and O O O O
strength O O O O
, O O O O
functional O O O O
and O O O O
psychosocial O O O O
impairment O O O O
. O O O O
    
Consensus O O O O
exists O O O O
on O O O O
a O O O O
framework O O O O
for O O O O
the O O O O
definition O O O O
and O O O O
classification O O O O
of O O O O
cancer O O O O
cachexia O O O O
. O O O O
    
After O O O O
validation O O O O
, O O O O
this O O O O
should O O O O
aid O O O O
clinical O O O O
trial O O O O
design O O O O
, O O O O
development O O O O
of O O O O
practice O O O O
guidelines O O O O
, O O O O
and O O O O
, O O O O
eventually O O O O
, O O O O
routine O O O O
clinical O O O O
management O O O O
. O O O O
    
Neuroinflammation O O O O
in O O O O
amyotrophic O O O O
lateral O O O O
sclerosis O O O O
: O O O O
role O O O O
of O O O O
glial O O O O
activation O O O O
in O O O O
motor O O O O
neuron O O O O
disease O O O O
. O O O O
    
Neurodegenerative O O O O
diseases O O O O
such O O O O
as O O O O
Alzheimer O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
, O O O O
Parkinson O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
, O O O O
and O O O O
amyotrophic O O O O
lateral O O O O
sclerosis O O O O
( O O O O
ALS O O O O
) O O O O
are O O O O
characterised O O O O
by O O O O
the O O O O
appearance O O O O
of O O O O
reactive O O O O
microglial O O O O
and O O O O
astroglial O O O O
cells O O O O
, O O O O
a O O O O
process O O O O
referred O O O O
to O O O O
as O O O O
neuroinflammation O O O O
. O O O O
    
In O O O O
transgenic O O O O
mouse B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
models O O O O
of O O O O
mutant O O O O
SOD1 O O O O
- O O O O
associated O O O O
familial O O O O
ALS O O O O
, O O O O
reactive O O O O
microglial O O O O
cells O O O O
and O O O O
astrocytes O O O O
actively O O O O
contribute O O O O
to O O O O
the O O O O
death O O O O
of O O O O
motor O O O O
neurons O O O O
. O O O O
    
The O O O O
biological O O O O
processes O O O O
that O O O O
drive O O O O
this O O O O
glial O O O O
reaction O O O O
are O O O O
complex O O O O
and O O O O
have O O O O
both O O O O
beneficial O O O O
and O O O O
deleterious O O O O
effects O O O O
on O O O O
motor O O O O
neurons O O O O
. O O O O
    
Therapeutic O O O O
interventions O O O O
targeting O O O O
these O O O O
cells O O O O
are O O O O
being O O O O
explored O O O O
. O O O O
    
An O O O O
improved O O O O
understanding O O O O
of O O O O
the O O O O
biological O O O O
processes O O O O
that O O O O
cause O O O O
neuroinflammation O O O O
will O O O O
help O O O O
to O O O O
define O O O O
its O O O O
medical O O O O
importance O O O O
and O O O O
to O O O O
identify O O O O
the O O O O
therapeutic O O O O
potential O O O O
of O O O O
interfering O O O O
with O O O O
this O O O O
reaction O O O O
. O O O O
    
Potassium O O O O
and O O O O
sodium O O O O
uptake O O O O
systems O O O O
in O O O O
fungi O O O O
. O O O O
    
The O O O O
transporter O O O O
diversity O O O O
of O O O O
Magnaporthe B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
oryzae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
report O O O O
an O O O O
inventory O O O O
of O O O O
the O O O O
K O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
uptake O O O O
systems O O O O
in O O O O
62 O O O O
fungal O O O O
species O O O O
for O O O O
which O O O O
the O O O O
complete O O O O
genome O O O O
sequences O O O O
are O O O O
available O O O O
. O O O O
    
This O O O O
inventory O O O O
reveals O O O O
that O O O O
three O O O O
types O O O O
of O O O O
K O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
uptake O O O O
systems O O O O
, O O O O
TRK O O O O
and O O O O
HAK O O O O
transporters O O O O
and O O O O
ACU O O O O
ATPases O O O O
, O O O O
are O O O O
widely O O O O
present O O O O
in O O O O
several O O O O
combinations O O O O
across O O O O
fungal O O O O
species O O O O
. O O O O
    
PAT O O O O
ATPases O O O O
are O O O O
less O O O O
frequently O O O O
present O O O O
and O O O O
are O O O O
exceptional O O O O
in O O O O
Ascomycota O O O O
. O O O O
    
The O O O O
genome O O O O
of O O O O
Magnaporthe B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
oryzae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
contains O O O O
four O O O O
TRK O O O O
, O O O O
one O O O O
HAK O O O O
, O O O O
and O O O O
two O O O O
ACU O O O O
genes O O O O
. O O O O
    
The O O O O
study O O O O
of O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
these O O O O
genes O O O O
at O O O O
high O O O O
K O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
, O O O O
K O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
starvation O O O O
, O O O O
and O O O O
in O O O O
infected O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
leaves O O O O
revealed O O O O
that O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
four O O O O
genes O O O O
, O O O O
ACU1 O O O O
, O O O O
ACU2 O O O O
, O O O O
HAK1 O O O O
, O O O O
and O O O O
TRK1 O O O O
is O O O O
much O O O O
lower O O O O
than O O O O
that O O O O
of O O O O
TRK2 O O O O
, O O O O
TRK3 O O O O
, O O O O
and O O O O
TRK4 O O O O
, O O O O
except O O O O
under O O O O
K O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
starvation O O O O
. O O O O
    
The O O O O
two O O O O
ACU O O O O
ATPases O O O O
were O O O O
cloned O O O O
and O O O O
functionally O O O O
identified O O O O
as O O O O
high O O O O
- O O O O
affinity O O O O
K O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
or O O O O
Na O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
uptake O O O O
systems O O O O
. O O O O
    
These O O O O
two O O O O
ATPases O O O O
endow O O O O
Saccharomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cerevisiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
with O O O O
the O O O O
capacity O O O O
to O O O O
grow O O O O
for O O O O
several O O O O
generations O O O O
in O O O O
low O O O O
Na O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
concentrations O O O O
when O O O O
K O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
was O O O O
absent O O O O
, O O O O
which O O O O
produces O O O O
a O O O O
dramatic O O O O
increase O O O O
of O O O O
cellular O O O O
Na O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
/ O O O O
K O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
ratio O O O O
. O O O O
    
Soil O O O O
nutrient O O O O
status O O O O
determines O O O O
how O O O O
elephant B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
utilize O O O O
trees O O O O
and O O O O
shape O O O O
environments O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Elucidation O O O O
of O O O O
the O O O O
mechanism O O O O
determining O O O O
the O O O O
spatial O O O O
scale O O O O
of O O O O
patch O O O O
selection O O O O
by O O O O
herbivores O O O O
has O O O O
been O O O O
complicated O O O O
by O O O O
the O O O O
way O O O O
in O O O O
which O O O O
resource O O O O
availability O O O O
at O O O O
a O O O O
specific O O O O
scale O O O O
is O O O O
measured O O O O
and O O O O
by O O O O
vigilance O O O O
behaviour O O O O
of O O O O
the O O O O
herbivores O O O O
themselves O O O O
. O O O O
    
To O O O O
reduce O O O O
these O O O O
complications O O O O
, O O O O
we O O O O
studied O O O O
patch O O O O
selection O O O O
by O O O O
an O O O O
animal O O O O
with O O O O
negligible O O O O
predation O O O O
risk O O O O
, O O O O
the O O O O
African B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
elephant O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
introduce O O O O
the O O O O
concept O O O O
of O O O O
nutrient O O O O
load O O O O
as O O O O
the O O O O
product O O O O
of O O O O
patch O O O O
size O O O O
, O O O O
number O O O O
of O O O O
patches O O O O
and O O O O
local O O O O
patch O O O O
nutrient O O O O
concentration O O O O
. O O O O
    
Nutrient O O O O
load O O O O
provides O O O O
a O O O O
novel O O O O
spatially O O O O
explicit O O O O
expression O O O O
of O O O O
the O O O O
total O O O O
available O O O O
nutrients O O O O
a O O O O
herbivore O O O O
can O O O O
select O O O O
from O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
hypothesized O O O O
that O O O O
elephant B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
would O O O O
select O O O O
nutrient O O O O
- O O O O
rich O O O O
patches O O O O
, O O O O
based O O O O
on O O O O
the O O O O
nutrient O O O O
load O O O O
per O O O O
2500 O O O O
m O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
down O O O O
to O O O O
the O O O O
individual O O O O
plant O O O O
scale O O O O
, O O O O
and O O O O
that O O O O
this O O O O
selection O O O O
will O O O O
depend O O O O
on O O O O
the O O O O
nitrogen O O O O
and O O O O
phosphorous O O O O
contents O O O O
of O O O O
plants O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
predicted O O O O
that O O O O
elephant B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
would O O O O
cause O O O O
more O O O O
adverse O O O O
impact O O O O
to O O O O
trees O O O O
of O O O O
lower O O O O
value O O O O
to O O O O
them O O O O
in O O O O
order O O O O
to O O O O
reach O O O O
plant O O O O
parts O O O O
with O O O O
higher O O O O
nutrient O O O O
concentrations O O O O
such O O O O
as O O O O
bark O O O O
and O O O O
root O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
elephant B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
should O O O O
maintain O O O O
nutrient O O O O
- O O O O
rich O O O O
trees O O O O
by O O O O
inducing O O O O
coppicing O O O O
of O O O O
trees O O O O
through O O O O
re O O O O
- O O O O
utilization O O O O
of O O O O
leaves O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Elephant B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
patch O O O O
selection O O O O
was O O O O
measured O O O O
in O O O O
a O O O O
homogenous O O O O
tree O O O O
species O O O O
stand O O O O
by O O O O
manipulating O O O O
the O O O O
spatial O O O O
distribution O O O O
of O O O O
soil O O O O
nutrients O O O O
in O O O O
a O O O O
large O O O O
field O O O O
experiment O O O O
using O O O O
NPK O O O O
fertilizer O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
Elephant B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
were O O O O
able O O O O
to O O O O
select O O O O
nutrient O O O O
- O O O O
rich O O O O
patches O O O O
and O O O O
utilized O O O O
Colophospermum B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mopane O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
trees O O O O
inside O O O O
these O O O O
patches O O O O
more O O O O
than O O O O
outside O O O O
, O O O O
at O O O O
scales O O O O
ranging O O O O
from O O O O
2500 O O O O
down O O O O
to O O O O
100 O O O O
m O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
7 O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
both O O O O
nitrogen O O O O
and O O O O
phosphorus O O O O
contents O O O O
of O O O O
leaves O O O O
from O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
mopane O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
trees O O O O
were O O O O
higher O O O O
in O O O O
fertilized O O O O
and O O O O
selected O O O O
patches O O O O
, O O O O
patch O O O O
choice O O O O
correlated O O O O
most O O O O
strongly O O O O
with O O O O
nitrogen O O O O
content O O O O
. O O O O
    
As O O O O
predicted O O O O
, O O O O
stripping O O O O
of O O O O
leaves O O O O
occurred O O O O
more O O O O
in O O O O
nutrient O O O O
- O O O O
rich O O O O
patches O O O O
, O O O O
while O O O O
adverse O O O O
impact O O O O
such O O O O
as O O O O
uprooting O O O O
of O O O O
trees O O O O
occurred O O O O
more O O O O
in O O O O
nutrient O O O O
- O O O O
poor O O O O
areas O O O O
. O O O O
    
8 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
emphasize O O O O
the O O O O
necessity O O O O
of O O O O
including O O O O
scale O O O O
- O O O O
dependent O O O O
selectivity O O O O
in O O O O
foraging O O O O
studies O O O O
and O O O O
how O O O O
elephant B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
foraging O O O O
behaviour O O O O
can O O O O
be O O O O
used O O O O
as O O O O
indicators O O O O
of O O O O
change O O O O
in O O O O
the O O O O
availability O O O O
of O O O O
nutrients O O O O
. O O O O
    
Social O O O O
immunity O O O O
in O O O O
honeybees B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
Apis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mellifera O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
: O O O O
transcriptome O O O O
analysis O O O O
of O O O O
varroa O O O O
- O O O O
hygienic O O O O
behaviour O O O O
. O O O O
    
Honeybees B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
have O O O O
evolved O O O O
a O O O O
social O O O O
immunity O O O O
consisting O O O O
of O O O O
the O O O O
cooperation O O O O
of O O O O
individuals O O O O
to O O O O
decrease O O O O
disease O O O O
in O O O O
the O O O O
hive O O O O
. O O O O
    
We O O O O
identified O O O O
a O O O O
set O O O O
of O O O O
genes O O O O
involved O O O O
in O O O O
this O O O O
social O O O O
immunity O O O O
by O O O O
analysing O O O O
the O O O O
brain O O O O
transcriptome O O O O
of O O O O
highly O O O O
varroa O O O O
- O O O O
hygienic O O O O
bees O O O O
, O O O O
who O O O O
efficiently O O O O
detect O O O O
and O O O O
remove O O O O
brood O O O O
infected O O O O
with O O O O
the O O O O
Varroa O O O O
destructor O O O O
mite O O O O
. O O O O
    
The O O O O
function O O O O
of O O O O
these O O O O
candidate O O O O
genes O O O O
does O O O O
not O O O O
seem O O O O
to O O O O
support O O O O
a O O O O
higher O O O O
olfactory O O O O
sensitivity O O O O
in O O O O
hygienic O O O O
bees O O O O
, O O O O
as O O O O
previously O O O O
hypothesized O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
comparing O O O O
their O O O O
genomic O O O O
profile O O O O
with O O O O
those O O O O
from O O O O
other O O O O
behaviours O O O O
suggests O O O O
a O O O O
link O O O O
with O O O O
brood O O O O
care O O O O
and O O O O
the O O O O
highly O O O O
varroa O O O O
- O O O O
hygienic O O O O
Africanized B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
honeybees O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
represent O O O O
a O O O O
first O O O O
step O O O O
toward O O O O
the O O O O
identification O O O O
of O O O O
genes O O O O
involved O O O O
in O O O O
social O O O O
immunity O O O O
and O O O O
thus O O O O
provide O O O O
first O O O O
insights O O O O
into O O O O
the O O O O
evolution O O O O
of O O O O
social O O O O
immunity O O O O
. O O O O
    
Long O O O O
- O O O O
term O O O O
outcomes O O O O
of O O O O
patients O O O O
with O O O O
aneurysmal O O O O
subarachnoid O O O O
haemorrhage O O O O
. O O O O
    
More O O O O
and O O O O
more O O O O
patients O O O O
survive O O O O
aneurysmal O O O O
subarachnoid O O O O
haemorrhage O O O O
( O O O O
aSAH O O O O
) O O O O
, O O O O
with O O O O
case O O O O
fatality O O O O
decreasing O O O O
by O O O O
17 O O O O
% O O O O
in O O O O
absolute O O O O
terms O O O O
over O O O O
the O O O O
past O O O O
three O O O O
decades O O O O
and O O O O
incidence O O O O
remaining O O O O
relatively O O O O
stable O O O O
at O O O O
nine O O O O
per O O O O
100 O O O O
, O O O O
000 O O O O
patient O O O O
- O O O O
years O O O O
. O O O O
    
The O O O O
mean O O O O
age O O O O
at O O O O
which O O O O
aSAH O O O O
occurs O O O O
is O O O O
reasonably O O O O
young O O O O
at O O O O
55 O O O O
years O O O O
, O O O O
and O O O O
people O O O O
of O O O O
this O O O O
age O O O O
in O O O O
the O O O O
general O O O O
population O O O O
have O O O O
a O O O O
good O O O O
life O O O O
expectancy O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
there O O O O
are O O O O
few O O O O
data O O O O
for O O O O
life O O O O
expectancy O O O O
after O O O O
aSAH O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
risks O O O O
of O O O O
late O O O O
recurrent O O O O
aSAH O O O O
and O O O O
other O O O O
vascular O O O O
diseases O O O O
are O O O O
unclear O O O O
. O O O O
    
The O O O O
course O O O O
of O O O O
associated O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
physical O O O O
and O O O O
cognitive O O O O
deficits O O O O
after O O O O
aSAH O O O O
is O O O O
not O O O O
well O O O O
established O O O O
, O O O O
leading O O O O
to O O O O
questions O O O O
about O O O O
potential O O O O
outcomes O O O O
to O O O O
quality O O O O
of O O O O
life O O O O
and O O O O
working O O O O
capacity O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
best O O O O
clinical O O O O
practices O O O O
. O O O O
    
Sporadic O O O O
and O O O O
familial O O O O
hemiplegic O O O O
migraine O O O O
: O O O O
pathophysiological O O O O
mechanisms O O O O
, O O O O
clinical O O O O
characteristics O O O O
, O O O O
diagnosis O O O O
, O O O O
and O O O O
management O O O O
. O O O O
    
Hemiplegic O O O O
migraine O O O O
is O O O O
a O O O O
rare O O O O
form O O O O
of O O O O
migraine O O O O
with O O O O
aura O O O O
that O O O O
involves O O O O
motor O O O O
aura O O O O
( O O O O
weakness O O O O
) O O O O
. O O O O
    
This O O O O
type O O O O
of O O O O
migraine O O O O
can O O O O
occur O O O O
as O O O O
a O O O O
sporadic O O O O
or O O O O
a O O O O
familial O O O O
disorder O O O O
. O O O O
    
Familial O O O O
forms O O O O
of O O O O
hemiplegic O O O O
migraine O O O O
are O O O O
dominantly O O O O
inherited O O O O
. O O O O
    
Data O O O O
from O O O O
genetic O O O O
studies O O O O
have O O O O
implicated O O O O
mutations O O O O
in O O O O
genes O O O O
that O O O O
encode O O O O
proteins O O O O
involved O O O O
in O O O O
ion O O O O
transportation O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
at O O O O
least O O O O
a O O O O
quarter O O O O
of O O O O
the O O O O
large O O O O
families O O O O
affected O O O O
and O O O O
most O O O O
sporadic O O O O
cases O O O O
do O O O O
not O O O O
have O O O O
a O O O O
mutation O O O O
in O O O O
the O O O O
three O O O O
genes O O O O
known O O O O
to O O O O
be O O O O
implicated O O O O
in O O O O
this O O O O
disorder O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
other O O O O
genes O O O O
are O O O O
still O O O O
to O O O O
be O O O O
identified O O O O
. O O O O
    
Results O O O O
from O O O O
functional O O O O
studies O O O O
indicate O O O O
that O O O O
neuronal O O O O
hyperexcitability O O O O
has O O O O
a O O O O
pivotal O O O O
role O O O O
in O O O O
the O O O O
pathogenesis O O O O
of O O O O
hemiplegic O O O O
migraine O O O O
. O O O O
    
The O O O O
clinical O O O O
manifestations O O O O
of O O O O
hemiplegic O O O O
migraine O O O O
range O O O O
from O O O O
attacks O O O O
with O O O O
short O O O O
- O O O O
duration O O O O
hemiparesis O O O O
to O O O O
severe O O O O
forms O O O O
with O O O O
recurrent O O O O
coma O O O O
and O O O O
prolonged O O O O
hemiparesis O O O O
, O O O O
permanent O O O O
cerebellar O O O O
ataxia O O O O
, O O O O
epilepsy O O O O
, O O O O
transient O O O O
blindness O O O O
, O O O O
or O O O O
mental O O O O
retardation O O O O
. O O O O
    
Diagnosis O O O O
relies O O O O
on O O O O
a O O O O
careful O O O O
patient O O O O
history O O O O
and O O O O
exclusion O O O O
of O O O O
potential O O O O
causes O O O O
of O O O O
symptomatic O O O O
attacks O O O O
. O O O O
    
The O O O O
principles O O O O
of O O O O
management O O O O
are O O O O
similar O O O O
to O O O O
those O O O O
for O O O O
common O O O O
varieties O O O O
of O O O O
migraine O O O O
, O O O O
except O O O O
that O O O O
vasoconstrictors O O O O
, O O O O
including O O O O
triptans O O O O
, O O O O
are O O O O
historically O O O O
contraindicated O O O O
but O O O O
are O O O O
often O O O O
used O O O O
off O O O O
- O O O O
label O O O O
to O O O O
stop O O O O
the O O O O
headache O O O O
, O O O O
and O O O O
prophylactic O O O O
treatment O O O O
can O O O O
include O O O O
lamotrigine O O O O
and O O O O
acetazolamide O O O O
. O O O O
    
An O O O O
Antarctic O O O O
hypotrichous O O O O
ciliate O O O O
, O O O O
Parasterkiella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
thompsoni O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Foissner O O O O
) O O O O
nov O O O O
. O O O O
gen O O O O
. O O O O
, O O O O
nov O O O O
. O O O O
comb O O O O
. O O O O
, O O O O
recorded O O O O
in O O O O
Argentinean O O O O
peat O O O O
- O O O O
bogs O O O O
: O O O O
morphology O O O O
, O O O O
morphogenesis O O O O
, O O O O
and O O O O
molecular O O O O
phylogeny O O O O
. O O O O
    
The O O O O
ciliate O O O O
Parasterkiella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
thompsoni O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Foissner O O O O
, O O O O
1996 O O O O
) O O O O
nov O O O O
. O O O O
gen O O O O
. O O O O
, O O O O
nov O O O O
. O O O O
comb O O O O
. O O O O
    
was O O O O
originally O O O O
described O O O O
from O O O O
Antarctica O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
present O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
report O O O O
the O O O O
morphology O O O O
, O O O O
morphogenesis O O O O
during O O O O
cell O O O O
division O O O O
, O O O O
and O O O O
molecular O O O O
phylogeny O O O O
inferred O O O O
from O O O O
the O O O O
18S O O O O
- O O O O
rDNA O O O O
sequence O O O O
of O O O O
a O O O O
population O O O O
isolated O O O O
from O O O O
the O O O O
Rancho O O O O
Hambre O O O O
peat O O O O
bog O O O O
, O O O O
Tierra O O O O
del O O O O
Fuego O O O O
Province O O O O
( O O O O
Argentina O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
study O O O O
is O O O O
based O O O O
on O O O O
live O O O O
and O O O O
protargol O O O O
- O O O O
impregnated O O O O
specimens O O O O
. O O O O
    
Molecular O O O O
phylogeny O O O O
was O O O O
inferred O O O O
from O O O O
trees O O O O
constructed O O O O
by O O O O
means O O O O
of O O O O
the O O O O
maximum O O O O
parsimony O O O O
, O O O O
neighbor O O O O
joining O O O O
, O O O O
and O O O O
Bayesian O O O O
analyses O O O O
. O O O O
    
The O O O O
interphase O O O O
morphology O O O O
matches O O O O
the O O O O
original O O O O
description O O O O
of O O O O
the O O O O
species O O O O
. O O O O
    
During O O O O
the O O O O
cell O O O O
division O O O O
, O O O O
stomatogenesis O O O O
begins O O O O
with O O O O
the O O O O
de O O O O
novo O O O O
proliferation O O O O
of O O O O
two O O O O
fields O O O O
of O O O O
basal O O O O
bodies O O O O
, O O O O
each O O O O
one O O O O
left O O O O
of O O O O
the O O O O
postoral O O O O
ventral O O O O
cirri O O O O
and O O O O
of O O O O
transverse O O O O
cirri O O O O
, O O O O
which O O O O
later O O O O
unify O O O O
. O O O O
    
Primordia O O O O
IV O O O O
- O O O O
VI O O O O
of O O O O
the O O O O
proter O O O O
develop O O O O
from O O O O
disaggregation O O O O
of O O O O
cirrus O O O O
IV O O O O
/ O O O O
3 O O O O
, O O O O
while O O O O
primordium O O O O
IV O O O O
of O O O O
the O O O O
opisthe O O O O
develops O O O O
from O O O O
cirrus O O O O
IV O O O O
/ O O O O
2 O O O O
and O O O O
primordia O O O O
V O O O O
and O O O O
VI O O O O
from O O O O
cirrus O O O O
V O O O O
/ O O O O
4 O O O O
. O O O O
    
Dorsal O O O O
morphogenesis O O O O
occurs O O O O
in O O O O
the O O O O
Urosomoida O O O O
pattern O O O O
- O O O O
that O O O O
is O O O O
, O O O O
the O O O O
fragmentation O O O O
of O O O O
kinety O O O O
3 O O O O
is O O O O
lacking O O O O
. O O O O
    
Three O O O O
macronuclear O O O O
nodules O O O O
are O O O O
generated O O O O
before O O O O
cytokinesis O O O O
. O O O O
    
Phylogenetic O O O O
analyses O O O O
consistently O O O O
placed O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
thompsoni O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
within O O O O
the O O O O
stylonychines O O O O
. O O O O
    
New O O O O
data O O O O
on O O O O
the O O O O
morphogenesis O O O O
of O O O O
the O O O O
dorsal O O O O
ciliature O O O O
justifies O O O O
the O O O O
transference O O O O
of O O O O
Sterkiella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
thompsoni O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
to O O O O
a O O O O
new O O O O
genus O O O O
Parasterkiella O O O O
. O O O O
    
Multiple O O O O
environmental O O O O
gradients O O O O
affect O O O O
spatial O O O O
variation O O O O
in O O O O
the O O O O
productivity O O O O
of O O O O
a O O O O
tropical O O O O
bird O O O O
population O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Spatial O O O O
variation O O O O
in O O O O
habitat O O O O
quality O O O O
and O O O O
its O O O O
demographic O O O O
consequences O O O O
have O O O O
important O O O O
implications O O O O
for O O O O
the O O O O
regulation O O O O
of O O O O
animal O O O O
populations O O O O
. O O O O
    
Theoretically O O O O
, O O O O
habitat O O O O
quality O O O O
is O O O O
typically O O O O
viewed O O O O
as O O O O
a O O O O
single O O O O
gradient O O O O
from O O O O
' O O O O
poor O O O O
' O O O O
to O O O O
' O O O O
good O O O O
' O O O O
, O O O O
but O O O O
in O O O O
wild O O O O
populations O O O O
it O O O O
is O O O O
possible O O O O
that O O O O
there O O O O
are O O O O
multiple O O O O
environmental O O O O
gradients O O O O
that O O O O
determine O O O O
spatial O O O O
variation O O O O
in O O O O
demography O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Understanding O O O O
environmental O O O O
gradients O O O O
is O O O O
important O O O O
to O O O O
gain O O O O
mechanistic O O O O
insights O O O O
into O O O O
important O O O O
population O O O O
processes O O O O
, O O O O
but O O O O
also O O O O
to O O O O
understand O O O O
how O O O O
populations O O O O
might O O O O
respond O O O O
to O O O O
environmental O O O O
change O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
explore O O O O
habitat O O O O
and O O O O
elevation O O O O
gradients O O O O
and O O O O
their O O O O
implications O O O O
for O O O O
population O O O O
persistence O O O O
using O O O O
detailed O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
data O O O O
on O O O O
600 O O O O
individuals O O O O
of O O O O
the O O O O
Mauritius B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
kestrel O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
These O O O O
data O O O O
allow O O O O
us O O O O
to O O O O
statistically O O O O
separate O O O O
spatial O O O O
variation O O O O
in O O O O
demography O O O O
from O O O O
variation O O O O
arising O O O O
out O O O O
of O O O O
individual O O O O
or O O O O
environmental O O O O
quality O O O O
and O O O O
explore O O O O
its O O O O
relationships O O O O
with O O O O
habitat O O O O
and O O O O
topography O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Birds O O O O
that O O O O
breed O O O O
earlier O O O O
in O O O O
the O O O O
season O O O O
have O O O O
higher O O O O
reproductive O O O O
success O O O O
, O O O O
and O O O O
we O O O O
found O O O O
that O O O O
the O O O O
timing O O O O
of O O O O
breeding O O O O
varies O O O O
significantly O O O O
between O O O O
territories O O O O
. O O O O
    
This O O O O
variation O O O O
is O O O O
primarily O O O O
driven O O O O
by O O O O
elevation O O O O
, O O O O
with O O O O
birds O O O O
breeding O O O O
progressively O O O O
later O O O O
as O O O O
elevation O O O O
increases O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Pre O O O O
- O O O O
fledging O O O O
survival O O O O
from O O O O
the O O O O
egg O O O O
to O O O O
fledgling O O O O
stage O O O O
( O O O O
independently O O O O
of O O O O
timing O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
recruitment O O O O
, O O O O
also O O O O
varied O O O O
significantly O O O O
between O O O O
territories O O O O
. O O O O
    
This O O O O
variation O O O O
is O O O O
driven O O O O
by O O O O
the O O O O
habitat O O O O
surrounding O O O O
breeding O O O O
sites O O O O
with O O O O
increasing O O O O
agricultural O O O O
encroachment O O O O
causing O O O O
survival O O O O
and O O O O
recruitment O O O O
to O O O O
decline O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Taken O O O O
together O O O O
, O O O O
our O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
there O O O O
are O O O O
likely O O O O
to O O O O
be O O O O
multiple O O O O
environmental O O O O
gradients O O O O
affecting O O O O
spatial O O O O
variation O O O O
in O O O O
productivity O O O O
in O O O O
wild O O O O
populations O O O O
, O O O O
and O O O O
hence O O O O
multiple O O O O
and O O O O
different O O O O
routes O O O O
through O O O O
which O O O O
environmental O O O O
change O O O O
might O O O O
have O O O O
consequences O O O O
for O O O O
population O O O O
dynamics O O O O
by O O O O
modifying O O O O
spatial O O O O
processes O O O O
. O O O O
    
Optimisation O O O O
of O O O O
breast O O O O
cancer O O O O
management O O O O
in O O O O
low O O O O
- O O O O
resource O O O O
and O O O O
middle O O O O
- O O O O
resource O O O O
countries O O O O
: O O O O
executive O O O O
summary O O O O
of O O O O
the O O O O
Breast O O O O
Health O O O O
Global O O O O
Initiative O O O O
consensus O O O O
, O O O O
2010 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
purpose O O O O
of O O O O
the O O O O
Breast O O O O
Health O O O O
Global O O O O
Initiative O O O O
( O O O O
BHGI O O O O
) O O O O
2010 O O O O
summit O O O O
was O O O O
to O O O O
provide O O O O
a O O O O
consensus O O O O
analysis O O O O
of O O O O
breast O O O O
cancer O O O O
control O O O O
issues O O O O
and O O O O
implementation O O O O
strategies O O O O
for O O O O
low O O O O
- O O O O
income O O O O
and O O O O
middle O O O O
- O O O O
income O O O O
countries O O O O
( O O O O
LMCs O O O O
) O O O O
, O O O O
where O O O O
advanced O O O O
stages O O O O
at O O O O
presentation O O O O
and O O O O
poor O O O O
diagnostic O O O O
and O O O O
treatment O O O O
capacities O O O O
contribute O O O O
to O O O O
lower O O O O
breast O O O O
cancer O O O O
survival O O O O
rates O O O O
than O O O O
in O O O O
high O O O O
- O O O O
income O O O O
countries O O O O
. O O O O
    
Health O O O O
system O O O O
and O O O O
patient O O O O
- O O O O
related O O O O
barriers O O O O
were O O O O
identified O O O O
that O O O O
create O O O O
common O O O O
clinical O O O O
scenarios O O O O
in O O O O
which O O O O
women O O O O
do O O O O
not O O O O
present O O O O
for O O O O
diagnosis O O O O
until O O O O
their O O O O
cancer O O O O
has O O O O
progressed O O O O
to O O O O
locally O O O O
advanced O O O O
or O O O O
metastatic O O O O
stages O O O O
. O O O O
    
As O O O O
countries O O O O
progress O O O O
to O O O O
higher O O O O
economic O O O O
status O O O O
, O O O O
the O O O O
rate O O O O
of O O O O
late O O O O
presentation O O O O
is O O O O
expected O O O O
to O O O O
decrease O O O O
, O O O O
and O O O O
diagnostic O O O O
and O O O O
treatment O O O O
resources O O O O
are O O O O
expected O O O O
to O O O O
improve O O O O
. O O O O
    
Health O O O O
- O O O O
care O O O O
systems O O O O
in O O O O
LMCs O O O O
share O O O O
many O O O O
challenges O O O O
including O O O O
national O O O O
or O O O O
regional O O O O
data O O O O
collection O O O O
, O O O O
programme O O O O
infrastructure O O O O
and O O O O
capacity O O O O
( O O O O
including O O O O
appropriate O O O O
equipment O O O O
and O O O O
drug O O O O
acquisitions O O O O
, O O O O
and O O O O
professional O O O O
training O O O O
and O O O O
accreditation O O O O
) O O O O
, O O O O
the O O O O
need O O O O
for O O O O
qualitative O O O O
and O O O O
quantitative O O O O
research O O O O
to O O O O
support O O O O
decision O O O O
making O O O O
, O O O O
and O O O O
strategies O O O O
to O O O O
improve O O O O
patient O O O O
access O O O O
and O O O O
compliance O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
public O O O O
, O O O O
health O O O O
- O O O O
care O O O O
professional O O O O
, O O O O
and O O O O
policy O O O O
- O O O O
maker O O O O
awareness O O O O
that O O O O
breast O O O O
cancer O O O O
is O O O O
a O O O O
cost O O O O
- O O O O
effective O O O O
, O O O O
treatable O O O O
disease O O O O
. O O O O
    
The O O O O
biggest O O O O
challenges O O O O
identified O O O O
for O O O O
low O O O O
- O O O O
income O O O O
countries O O O O
were O O O O
little O O O O
community O O O O
awareness O O O O
that O O O O
breast O O O O
cancer O O O O
is O O O O
treatable O O O O
, O O O O
inadequate O O O O
advanced O O O O
pathology O O O O
services O O O O
for O O O O
diagnosis O O O O
and O O O O
staging O O O O
, O O O O
and O O O O
fragmented O O O O
treatment O O O O
options O O O O
, O O O O
especially O O O O
for O O O O
the O O O O
administration O O O O
of O O O O
radiotherapy O O O O
and O O O O
the O O O O
full O O O O
range O O O O
of O O O O
systemic O O O O
treatments O O O O
. O O O O
    
The O O O O
biggest O O O O
challenges O O O O
identified O O O O
for O O O O
middle O O O O
- O O O O
resource O O O O
countries O O O O
were O O O O
the O O O O
establishment O O O O
and O O O O
maintenance O O O O
of O O O O
data O O O O
registries O O O O
, O O O O
the O O O O
coordination O O O O
of O O O O
multidisciplinary O O O O
centres O O O O
of O O O O
excellence O O O O
with O O O O
broad O O O O
outreach O O O O
programmes O O O O
to O O O O
provide O O O O
community O O O O
access O O O O
to O O O O
cancer O O O O
diagnosis O O O O
and O O O O
treatment O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
resource O O O O
- O O O O
appropriate O O O O
prioritisation O O O O
of O O O O
breast O O O O
cancer O O O O
control O O O O
programmes O O O O
within O O O O
the O O O O
framework O O O O
of O O O O
existing O O O O
, O O O O
functional O O O O
health O O O O
- O O O O
care O O O O
systems O O O O
. O O O O
    
Stillbirths O O O O
: O O O O
what O O O O
difference O O O O
can O O O O
we O O O O
make O O O O
and O O O O
at O O O O
what O O O O
cost O O O O
? O O O O
    
Worldwide O O O O
, O O O O
2 O O O O
* O O O O
65 O O O O
million O O O O
( O O O O
uncertainty O O O O
range O O O O
2 O O O O
* O O O O
08 O O O O
million O O O O
to O O O O
3 O O O O
* O O O O
79 O O O O
million O O O O
) O O O O
stillbirths O O O O
occur O O O O
yearly O O O O
, O O O O
of O O O O
which O O O O
98 O O O O
% O O O O
occur O O O O
in O O O O
countries O O O O
of O O O O
low O O O O
and O O O O
middle O O O O
income O O O O
. O O O O
    
Despite O O O O
the O O O O
fact O O O O
that O O O O
more O O O O
than O O O O
45 O O O O
% O O O O
of O O O O
the O O O O
global O O O O
burden O O O O
of O O O O
stillbirths O O O O
occur O O O O
intrapartum O O O O
, O O O O
the O O O O
perception O O O O
is O O O O
that O O O O
little O O O O
is O O O O
known O O O O
about O O O O
effective O O O O
interventions O O O O
, O O O O
especially O O O O
those O O O O
that O O O O
can O O O O
be O O O O
implemented O O O O
in O O O O
low O O O O
- O O O O
resource O O O O
settings O O O O
. O O O O
    
We O O O O
undertook O O O O
a O O O O
systematic O O O O
review O O O O
of O O O O
randomised O O O O
trials O O O O
and O O O O
observational O O O O
studies O O O O
of O O O O
interventions O O O O
which O O O O
could O O O O
reduce O O O O
the O O O O
burden O O O O
of O O O O
stillbirths O O O O
, O O O O
particularly O O O O
in O O O O
low O O O O
- O O O O
income O O O O
and O O O O
middle O O O O
- O O O O
income O O O O
countries O O O O
. O O O O
    
We O O O O
identified O O O O
several O O O O
interventions O O O O
with O O O O
sufficient O O O O
evidence O O O O
to O O O O
recommend O O O O
implementation O O O O
in O O O O
health O O O O
systems O O O O
, O O O O
including O O O O
periconceptional O O O O
folic O O O O
acid O O O O
supplementation O O O O
or O O O O
fortification O O O O
, O O O O
prevention O O O O
of O O O O
malaria O O O O
, O O O O
and O O O O
improved O O O O
detection O O O O
and O O O O
management O O O O
of O O O O
syphilis O O O O
during O O O O
pregnancy O O O O
in O O O O
endemic O O O O
areas O O O O
. O O O O
    
Basic O O O O
and O O O O
comprehensive O O O O
emergency O O O O
obstetric O O O O
care O O O O
were O O O O
identified O O O O
as O O O O
key O O O O
effective O O O O
interventions O O O O
to O O O O
reduce O O O O
intrapartum O O O O
stillbirths O O O O
. O O O O
    
Broad O O O O
- O O O O
scale O O O O
implementation O O O O
of O O O O
intervention O O O O
packages O O O O
across O O O O
68 O O O O
countries O O O O
listed O O O O
as O O O O
priorities O O O O
in O O O O
the O O O O
Countdown O O O O
to O O O O
2015 O O O O
report O O O O
could O O O O
avert O O O O
up O O O O
to O O O O
45 O O O O
% O O O O
of O O O O
stillbirths O O O O
according O O O O
to O O O O
a O O O O
model O O O O
generated O O O O
from O O O O
the O O O O
Lives O O O O
Saved O O O O
Tool O O O O
. O O O O
    
The O O O O
overall O O O O
costs O O O O
for O O O O
these O O O O
interventions O O O O
are O O O O
within O O O O
the O O O O
general O O O O
estimates O O O O
of O O O O
cost O O O O
- O O O O
effective O O O O
interventions O O O O
for O O O O
maternal O O O O
care O O O O
, O O O O
especially O O O O
in O O O O
view O O O O
of O O O O
the O O O O
effects O O O O
on O O O O
outcomes O O O O
across O O O O
maternal O O O O
, O O O O
fetal O O O O
, O O O O
and O O O O
neonatal O O O O
health O O O O
. O O O O
    
New O O O O
insights O O O O
into O O O O
the O O O O
excystation O O O O
process O O O O
and O O O O
oocyst O O O O
morphology O O O O
of O O O O
rodent O O O O
Eimeria O O O O
species O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
the O O O O
mechanism O O O O
of O O O O
excystation O O O O
of O O O O
the O O O O
rodent O O O O
parasites O O O O
Eimeria B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nieschulzi O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
from O O O O
rats O O O O
, O O O O
and O O O O
Eimeria B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
falciformis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
from O O O O
mice O O O O
, O O O O
was O O O O
investigated O O O O
. O O O O
    
In O O O O
vitro O O O O
, O O O O
oocysts O O O O
of O O O O
both O O O O
species O O O O
are O O O O
susceptible O O O O
to O O O O
the O O O O
protease O O O O
pepsin O O O O
, O O O O
and O O O O
sporocysts O O O O
and O O O O
sporozoites O O O O
can O O O O
be O O O O
excysted O O O O
in O O O O
a O O O O
similar O O O O
way O O O O
. O O O O
    
Scanning O O O O
electron O O O O
microscopy O O O O
( O O O O
SEM O O O O
) O O O O
revealed O O O O
a O O O O
collapse O O O O
of O O O O
the O O O O
oocysts O O O O
wall O O O O
at O O O O
both O O O O
polar O O O O
ends O O O O
after O O O O
pepsin O O O O
treatment O O O O
. O O O O
    
This O O O O
occurs O O O O
without O O O O
any O O O O
visible O O O O
damage O O O O
of O O O O
the O O O O
outer O O O O
wall O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
fluorescence O O O O
and O O O O
transmission O O O O
electron O O O O
microscopy O O O O
( O O O O
TEM O O O O
) O O O O
we O O O O
observed O O O O
that O O O O
pepsin O O O O
enters O O O O
sporulated O O O O
oocysts O O O O
at O O O O
both O O O O
polar O O O O
ends O O O O
and O O O O
causes O O O O
degradation O O O O
of O O O O
the O O O O
inner O O O O
oocyst O O O O
wall O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
scanning O O O O
electron O O O O
microscopy O O O O
we O O O O
could O O O O
identify O O O O
two O O O O
polar O O O O
caps O O O O
in O O O O
both O O O O
investigated O O O O
rodent O O O O
Eimeria O O O O
species O O O O
, O O O O
but O O O O
only O O O O
one O O O O
is O O O O
harbouring O O O O
the O O O O
micropyle O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
the O O O O
polar O O O O
caps O O O O
are O O O O
the O O O O
entry O O O O
site O O O O
for O O O O
the O O O O
pepsin O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
we O O O O
provide O O O O
evidence O O O O
that O O O O
the O O O O
oocyst O O O O
cap O O O O
and O O O O
micropyle O O O O
are O O O O
functionally O O O O
different O O O O
structures O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
complements O O O O
the O O O O
morphological O O O O
description O O O O
of O O O O
both O O O O
Eimeria O O O O
species O O O O
and O O O O
is O O O O
of O O O O
relevance O O O O
for O O O O
other O O O O
coccidian O O O O
species O O O O
. O O O O
    
First O O O O
description O O O O
of O O O O
the O O O O
early O O O O
stage O O O O
biology O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Mygona O O O O
: O O O O
the O O O O
natural O O O O
history O O O O
of O O O O
the O O O O
satyrine O O O O
butterfly O O O O
, O O O O
Mygona B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
irmina O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
eastern O O O O
Ecuador O O O O
. O O O O
    
The O O O O
immature O O O O
stages O O O O
and O O O O
natural O O O O
history O O O O
of O O O O
Mygona B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
irmina O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Doubleday O O O O
( O O O O
Lepidoptera O O O O
: O O O O
Nymphalidae O O O O
: O O O O
Satyrinae O O O O
: O O O O
Pronophilina O O O O
) O O O O
from O O O O
northeastern O O O O
Ecuadorian O O O O
cloud O O O O
forests O O O O
are O O O O
described O O O O
based O O O O
on O O O O
17 O O O O
rearings O O O O
. O O O O
    
The O O O O
dwarf O O O O
bamboo O O O O
, O O O O
Chusquea B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
c O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
f O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
scandens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Kunth O O O O
( O O O O
Poaceae O O O O
, O O O O
Bambusoidea O O O O
) O O O O
is O O O O
the O O O O
larval O O O O
food O O O O
plant O O O O
. O O O O
    
Eggs O O O O
are O O O O
laid O O O O
singly O O O O
on O O O O
the O O O O
bottom O O O O
side O O O O
of O O O O
mature O O O O
host O O O O
plant O O O O
leaves O O O O
. O O O O
    
Larvae O O O O
take O O O O
102 O O O O
- O O O O
109 O O O O
days O O O O
to O O O O
mature O O O O
from O O O O
egg O O O O
to O O O O
adult O O O O
. O O O O
    
Adults O O O O
are O O O O
encountered O O O O
most O O O O
frequently O O O O
on O O O O
sunny O O O O
days O O O O
, O O O O
flying O O O O
rapidly O O O O
over O O O O
areas O O O O
dominated O O O O
by O O O O
their O O O O
food O O O O
plant O O O O
or O O O O
feeding O O O O
on O O O O
the O O O O
ground O O O O
at O O O O
mammal O O O O
feces O O O O
. O O O O
    
Males O O O O
are O O O O
often O O O O
encountered O O O O
inside O O O O
large O O O O
forest O O O O
gaps O O O O
near O O O O
patches O O O O
of O O O O
bamboo O O O O
guarding O O O O
perches O O O O
in O O O O
the O O O O
mid O O O O
- O O O O
canopy O O O O
. O O O O
    
One O O O O
size O O O O
does O O O O
not O O O O
fit O O O O
all O O O O
: O O O O
flexible O O O O
models O O O O
are O O O O
required O O O O
to O O O O
understand O O O O
animal O O O O
movement O O O O
across O O O O
scales O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Large O O O O
data O O O O
sets O O O O
containing O O O O
precise O O O O
movement O O O O
data O O O O
from O O O O
free O O O O
- O O O O
roaming O O O O
animals O O O O
are O O O O
now O O O O
becoming O O O O
commonplace O O O O
. O O O O
    
One O O O O
means O O O O
of O O O O
analysing O O O O
individual O O O O
movement O O O O
data O O O O
is O O O O
through O O O O
discrete O O O O
, O O O O
random O O O O
walk O O O O
- O O O O
based O O O O
models O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Random O O O O
walk O O O O
models O O O O
are O O O O
easily O O O O
modified O O O O
to O O O O
incorporate O O O O
common O O O O
features O O O O
of O O O O
animal O O O O
movement O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
ways O O O O
that O O O O
these O O O O
modifications O O O O
affect O O O O
the O O O O
scaling O O O O
of O O O O
net O O O O
displacement O O O O
are O O O O
well O O O O
studied O O O O
. O O O O
    
Recently O O O O
, O O O O
ecologists O O O O
have O O O O
begun O O O O
to O O O O
explore O O O O
more O O O O
complex O O O O
statistical O O O O
models O O O O
with O O O O
multiple O O O O
latent O O O O
states O O O O
, O O O O
each O O O O
of O O O O
which O O O O
are O O O O
characterized O O O O
by O O O O
a O O O O
distribution O O O O
of O O O O
step O O O O
lengths O O O O
and O O O O
have O O O O
their O O O O
own O O O O
unimodal O O O O
distribution O O O O
of O O O O
turning O O O O
angles O O O O
centred O O O O
on O O O O
one O O O O
type O O O O
of O O O O
turn O O O O
( O O O O
e O O O O
. O O O O
g O O O O
. O O O O
reversals O O O O
) O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
introduce O O O O
the O O O O
compound O O O O
wrapped O O O O
Cauchy O O O O
distribution O O O O
, O O O O
which O O O O
allows O O O O
for O O O O
multimodal O O O O
distributions O O O O
of O O O O
turning O O O O
angles O O O O
within O O O O
a O O O O
single O O O O
state O O O O
. O O O O
    
When O O O O
used O O O O
as O O O O
a O O O O
single O O O O
state O O O O
model O O O O
, O O O O
the O O O O
parameters O O O O
provide O O O O
a O O O O
straightforward O O O O
summary O O O O
of O O O O
the O O O O
relative O O O O
contributions O O O O
of O O O O
different O O O O
turn O O O O
types O O O O
. O O O O
    
The O O O O
compound O O O O
wrapped O O O O
Cauchy O O O O
distribution O O O O
can O O O O
also O O O O
be O O O O
used O O O O
to O O O O
build O O O O
multiple O O O O
state O O O O
models O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
hypothesize O O O O
that O O O O
a O O O O
multiple O O O O
state O O O O
model O O O O
with O O O O
unimodal O O O O
distributions O O O O
of O O O O
turning O O O O
angles O O O O
will O O O O
best O O O O
describe O O O O
movement O O O O
at O O O O
finer O O O O
resolutions O O O O
, O O O O
while O O O O
a O O O O
multiple O O O O
state O O O O
model O O O O
using O O O O
our O O O O
multimodal O O O O
distribution O O O O
will O O O O
better O O O O
describe O O O O
movement O O O O
at O O O O
intermediate O O O O
temporal O O O O
resolutions O O O O
. O O O O
    
At O O O O
coarser O O O O
temporal O O O O
resolutions O O O O
, O O O O
a O O O O
single O O O O
state O O O O
model O O O O
using O O O O
our O O O O
multimodal O O O O
distribution O O O O
should O O O O
be O O O O
sufficient O O O O
. O O O O
    
We O O O O
parameterize O O O O
and O O O O
compare O O O O
the O O O O
performance O O O O
of O O O O
these O O O O
models O O O O
at O O O O
four O O O O
different O O O O
temporal O O O O
resolutions O O O O
( O O O O
1 O O O O
, O O O O
4 O O O O
, O O O O
12 O O O O
and O O O O
24 O O O O
h O O O O
) O O O O
using O O O O
data O O O O
from O O O O
eight O O O O
individuals O O O O
of O O O O
Loxodonta B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cyclotis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
find O O O O
support O O O O
for O O O O
our O O O O
hypotheses O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
assess O O O O
the O O O O
efficacy O O O O
of O O O O
the O O O O
different O O O O
models O O O O
in O O O O
extrapolating O O O O
to O O O O
coarser O O O O
temporal O O O O
resolution O O O O
by O O O O
comparing O O O O
properties O O O O
of O O O O
data O O O O
simulated O O O O
from O O O O
the O O O O
different O O O O
models O O O O
to O O O O
the O O O O
properties O O O O
of O O O O
the O O O O
observed O O O O
data O O O O
. O O O O
    
At O O O O
coarser O O O O
resolutions O O O O
, O O O O
simulated O O O O
data O O O O
sets O O O O
recreate O O O O
many O O O O
aspects O O O O
of O O O O
the O O O O
observed O O O O
data O O O O
; O O O O
however O O O O
, O O O O
only O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
models O O O O
accurately O O O O
predicts O O O O
step O O O O
length O O O O
, O O O O
and O O O O
all O O O O
models O O O O
underestimate O O O O
the O O O O
frequency O O O O
of O O O O
reversals O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
single O O O O
state O O O O
model O O O O
we O O O O
introduce O O O O
may O O O O
be O O O O
adequate O O O O
to O O O O
describe O O O O
movement O O O O
data O O O O
at O O O O
many O O O O
resolutions O O O O
and O O O O
can O O O O
be O O O O
interpreted O O O O
easily O O O O
. O O O O
    
Multiscalar O O O O
analyses O O O O
of O O O O
movement O O O O
such O O O O
as O O O O
the O O O O
ones O O O O
presented O O O O
here O O O O
are O O O O
a O O O O
useful O O O O
means O O O O
of O O O O
identifying O O O O
inconsistencies O O O O
in O O O O
our O O O O
understanding O O O O
of O O O O
movement O O O O
. O O O O
    
Effects O O O O
of O O O O
temperature O O O O
on O O O O
the O O O O
development O O O O
and O O O O
population O O O O
growth O O O O
of O O O O
the O O O O
sycamore B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
lace O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bug O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Corythucha B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ciliata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
sycamore B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
lace O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bug O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Corythucha B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ciliata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Say O O O O
) O O O O
( O O O O
Hemiptera O O O O
: O O O O
Tingidae O O O O
) O O O O
, O O O O
is O O O O
an O O O O
important O O O O
invasive O O O O
exotic O O O O
pest O O O O
of O O O O
Platanus O O O O
( O O O O
Proteales O O O O
: O O O O
Platanaceae O O O O
) O O O O
trees O O O O
in O O O O
China O O O O
. O O O O
    
The O O O O
objective O O O O
of O O O O
this O O O O
study O O O O
was O O O O
to O O O O
determine O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
temperature O O O O
on O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ciliata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
the O O O O
laboratory O O O O
so O O O O
that O O O O
forecasting O O O O
models O O O O
based O O O O
on O O O O
heat O O O O
accumulation O O O O
units O O O O
could O O O O
be O O O O
developed O O O O
for O O O O
the O O O O
pest O O O O
. O O O O
    
Development O O O O
and O O O O
fecundity O O O O
of O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ciliata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
reared O O O O
on O O O O
leaves O O O O
of O O O O
London B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
plane O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tree O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Platanus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
x O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
acerifolia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
were O O O O
investigated O O O O
at O O O O
seven O O O O
constant O O O O
temperatures O O O O
( O O O O
16 O O O O
, O O O O
19 O O O O
, O O O O
22 O O O O
, O O O O
26 O O O O
, O O O O
30 O O O O
, O O O O
33 O O O O
, O O O O
and O O O O
36 O O O O
^ O O O O
0 O O O O
C O O O O
) O O O O
and O O O O
at O O O O
a O O O O
relative O O O O
humidity O O O O
of O O O O
80 O O O O
% O O O O
with O O O O
a O O O O
photoperiod O O O O
of O O O O
14 O O O O
: O O O O
10 O O O O
( O O O O
L O O O O
: O O O O
D O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
developmental O O O O
time O O O O
was O O O O
found O O O O
to O O O O
significantly O O O O
decrease O O O O
with O O O O
increasing O O O O
temperature O O O O
. O O O O
    
The O O O O
developmental O O O O
time O O O O
from O O O O
egg O O O O
hatching O O O O
to O O O O
adult O O O O
emergence O O O O
was O O O O
respectively O O O O
47 O O O O
. O O O O
6 O O O O
, O O O O
35 O O O O
. O O O O
0 O O O O
, O O O O
24 O O O O
. O O O O
1 O O O O
, O O O O
20 O O O O
. O O O O
0 O O O O
, O O O O
and O O O O
17 O O O O
. O O O O
1 O O O O
days O O O O
at O O O O
the O O O O
temperatures O O O O
of O O O O
19 O O O O
, O O O O
22 O O O O
, O O O O
26 O O O O
, O O O O
30 O O O O
, O O O O
and O O O O
33 O O O O
^ O O O O
0 O O O O
C O O O O
. O O O O
    
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ciliata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
could O O O O
not O O O O
complete O O O O
full O O O O
development O O O O
at O O O O
16 O O O O
^ O O O O
0 O O O O
and O O O O
36 O O O O
^ O O O O
0 O O O O
C O O O O
. O O O O
    
The O O O O
developmental O O O O
threshold O O O O
temperature O O O O
( O O O O
C O O O O
) O O O O
estimated O O O O
for O O O O
egg O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
adult O O O O
was O O O O
11 O O O O
. O O O O
17 O O O O
^ O O O O
0 O O O O
C O O O O
, O O O O
with O O O O
a O O O O
thermal O O O O
constant O O O O
of O O O O
( O O O O
K O O O O
) O O O O
370 O O O O
. O O O O
57 O O O O
degree O O O O
- O O O O
days O O O O
. O O O O
    
Longevity O O O O
of O O O O
females O O O O
was O O O O
found O O O O
to O O O O
be O O O O
the O O O O
shortest O O O O
, O O O O
17 O O O O
. O O O O
7 O O O O
days O O O O
at O O O O
33 O O O O
^ O O O O
0 O O O O
C O O O O
and O O O O
the O O O O
longest O O O O
, O O O O
58 O O O O
. O O O O
9 O O O O
days O O O O
at O O O O
16 O O O O
^ O O O O
0 O O O O
C O O O O
, O O O O
and O O O O
that O O O O
of O O O O
males O O O O
was O O O O
the O O O O
shortest O O O O
, O O O O
19 O O O O
. O O O O
7 O O O O
days O O O O
at O O O O
33 O O O O
^ O O O O
0 O O O O
C O O O O
and O O O O
the O O O O
longest O O O O
, O O O O
59 O O O O
. O O O O
7 O O O O
days O O O O
at O O O O
16 O O O O
^ O O O O
0 O O O O
C O O O O
. O O O O
    
Fecundity O O O O
was O O O O
the O O O O
highest O O O O
at O O O O
30 O O O O
^ O O O O
0 O O O O
C O O O O
, O O O O
being O O O O
286 O O O O
. O O O O
8 O O O O
eggs O O O O
per O O O O
female O O O O
over O O O O
an O O O O
oviposition O O O O
period O O O O
of O O O O
8 O O O O
. O O O O
9 O O O O
days O O O O
. O O O O
    
Female O O O O
lifetime O O O O
fecundity O O O O
was O O O O
reduced O O O O
at O O O O
other O O O O
temperatures O O O O
, O O O O
being O O O O
the O O O O
lowest O O O O
( O O O O
87 O O O O
. O O O O
7 O O O O
eggs O O O O
per O O O O
female O O O O
) O O O O
at O O O O
19 O O O O
^ O O O O
0 O O O O
C O O O O
. O O O O
    
The O O O O
population O O O O
trend O O O O
index O O O O
( O O O O
I O O O O
) O O O O
of O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ciliata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
the O O O O
highest O O O O
( O O O O
130 O O O O
. O O O O
1 O O O O
) O O O O
at O O O O
30 O O O O
^ O O O O
0 O O O O
C O O O O
and O O O O
the O O O O
lowest O O O O
( O O O O
24 O O O O
. O O O O
9 O O O O
) O O O O
at O O O O
19 O O O O
^ O O O O
0 O O O O
C O O O O
. O O O O
    
Therefore O O O O
, O O O O
the O O O O
optimal O O O O
developmental O O O O
temperature O O O O
for O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ciliata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
determined O O O O
to O O O O
be O O O O
30 O O O O
^ O O O O
0 O O O O
C O O O O
. O O O O
    
Parasitism O O O O
of O O O O
lepidopterous O O O O
stem O O O O
borers O O O O
in O O O O
cultivated O O O O
and O O O O
natural O O O O
habitats O O O O
. O O O O
    
Plant O O O O
infestation O O O O
, O O O O
stem O O O O
borer O O O O
density O O O O
, O O O O
parasitism O O O O
, O O O O
and O O O O
parasitoid O O O O
abundance O O O O
were O O O O
assessed O O O O
during O O O O
two O O O O
years O O O O
in O O O O
two O O O O
host O O O O
plants O O O O
, O O O O
Zea B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mays O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
L O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Cyperales O O O O
: O O O O
Poaceae O O O O
) O O O O
and O O O O
Sorghum B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bicolor O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
L O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Cyperales O O O O
: O O O O
Poaceae O O O O
) O O O O
, O O O O
in O O O O
cultivated O O O O
habitats O O O O
. O O O O
    
The O O O O
four O O O O
major O O O O
host O O O O
plants O O O O
( O O O O
Cyperus O O O O
spp O O O O
. O O O O
, O O O O
Panicum O O O O
spp O O O O
. O O O O
, O O O O
Pennisetum O O O O
spp O O O O
. O O O O
, O O O O
and O O O O
Sorghum O O O O
spp O O O O
. O O O O
) O O O O
found O O O O
in O O O O
natural O O O O
habitats O O O O
were O O O O
also O O O O
assessed O O O O
, O O O O
and O O O O
both O O O O
the O O O O
cultivated O O O O
and O O O O
natural O O O O
habitat O O O O
species O O O O
occurred O O O O
in O O O O
four O O O O
agroecological O O O O
zones O O O O
in O O O O
Kenya O O O O
. O O O O
    
Across O O O O
habitats O O O O
, O O O O
plant O O O O
infestation O O O O
( O O O O
23 O O O O
. O O O O
2 O O O O
% O O O O
) O O O O
, O O O O
stem O O O O
borer O O O O
density O O O O
( O O O O
2 O O O O
. O O O O
2 O O O O
per O O O O
plant O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
larval O O O O
parasitism O O O O
( O O O O
15 O O O O
. O O O O
0 O O O O
% O O O O
) O O O O
were O O O O
highest O O O O
in O O O O
maize B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
in O O O O
cultivated O O O O
habitats O O O O
. O O O O
    
Pupal O O O O
parasitism O O O O
was O O O O
not O O O O
higher O O O O
than O O O O
4 O O O O
. O O O O
7 O O O O
% O O O O
in O O O O
both O O O O
habitats O O O O
, O O O O
and O O O O
did O O O O
not O O O O
vary O O O O
with O O O O
locality O O O O
during O O O O
each O O O O
season O O O O
or O O O O
with O O O O
host O O O O
plant O O O O
between O O O O
each O O O O
season O O O O
. O O O O
    
Cotesia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sesamiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Cameron O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
flavipes O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Cameron O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Hymenoptera O O O O
: O O O O
Braconidae O O O O
) O O O O
were O O O O
the O O O O
key O O O O
parasitoids O O O O
in O O O O
cultivated O O O O
habitats O O O O
( O O O O
both O O O O
species O O O O
accounted O O O O
for O O O O
76 O O O O
. O O O O
4 O O O O
% O O O O
of O O O O
parasitized O O O O
stem O O O O
borers O O O O
in O O O O
cereal O O O O
crops O O O O
) O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
in O O O O
natural O O O O
habitats O O O O
( O O O O
the O O O O
two O O O O
Cotesia O O O O
species O O O O
accounted O O O O
for O O O O
14 O O O O
. O O O O
5 O O O O
% O O O O
of O O O O
parasitized O O O O
stem O O O O
borers O O O O
in O O O O
wild O O O O
host O O O O
plants O O O O
) O O O O
. O O O O
    
No O O O O
single O O O O
parasitoid O O O O
species O O O O
exerted O O O O
high O O O O
parasitism O O O O
rates O O O O
on O O O O
stem O O O O
borer O O O O
populations O O O O
in O O O O
wild O O O O
host O O O O
plants O O O O
. O O O O
    
Low O O O O
stem O O O O
borer O O O O
densities O O O O
across O O O O
seasons O O O O
in O O O O
natural O O O O
habitats O O O O
indicate O O O O
that O O O O
cereal O O O O
stem O O O O
borer O O O O
pests O O O O
do O O O O
not O O O O
necessarily O O O O
survive O O O O
the O O O O
non O O O O
- O O O O
cropping O O O O
season O O O O
feeding O O O O
actively O O O O
in O O O O
wild O O O O
host O O O O
plants O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
natural O O O O
habitats O O O O
provided O O O O
refuges O O O O
for O O O O
some O O O O
parasitoid O O O O
species O O O O
, O O O O
stem O O O O
borer O O O O
parasitism O O O O
was O O O O
generally O O O O
low O O O O
in O O O O
wild O O O O
host O O O O
plants O O O O
. O O O O
    
Overall O O O O
, O O O O
because O O O O
parasitoids O O O O
contribute O O O O
little O O O O
in O O O O
reducing O O O O
cereal O O O O
stem O O O O
borer O O O O
pest O O O O
populations O O O O
in O O O O
cultivated O O O O
habitats O O O O
, O O O O
there O O O O
is O O O O
need O O O O
to O O O O
further O O O O
enhance O O O O
their O O O O
effectiveness O O O O
in O O O O
the O O O O
field O O O O
to O O O O
regulate O O O O
these O O O O
pests O O O O
. O O O O
    
DNA O O O O
methylation O O O O
in O O O O
insects O O O O
: O O O O
on O O O O
the O O O O
brink O O O O
of O O O O
the O O O O
epigenomic O O O O
era O O O O
. O O O O
    
DNA O O O O
methylation O O O O
plays O O O O
an O O O O
important O O O O
role O O O O
in O O O O
gene O O O O
regulation O O O O
in O O O O
animals O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
evolution O O O O
and O O O O
function O O O O
of O O O O
DNA O O O O
methylation O O O O
has O O O O
only O O O O
recently O O O O
emerged O O O O
as O O O O
the O O O O
subject O O O O
of O O O O
widespread O O O O
study O O O O
in O O O O
insects O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
review O O O O
we O O O O
profile O O O O
the O O O O
known O O O O
distribution O O O O
of O O O O
DNA O O O O
methylation O O O O
systems O O O O
across O O O O
insect O O O O
taxa O O O O
and O O O O
synthesize O O O O
functional O O O O
inferences O O O O
from O O O O
studies O O O O
of O O O O
DNA O O O O
methylation O O O O
in O O O O
insects O O O O
and O O O O
vertebrates O O O O
. O O O O
    
Unlike O O O O
vertebrate O O O O
genomes O O O O
, O O O O
which O O O O
tend O O O O
to O O O O
be O O O O
globally O O O O
methylated O O O O
, O O O O
DNA O O O O
methylation O O O O
is O O O O
primarily O O O O
targeted O O O O
to O O O O
genes O O O O
in O O O O
insects O O O O
. O O O O
    
Nevertheless O O O O
, O O O O
mounting O O O O
evidence O O O O
suggests O O O O
that O O O O
a O O O O
specialized O O O O
role O O O O
exists O O O O
for O O O O
genic O O O O
methylation O O O O
in O O O O
the O O O O
regulation O O O O
of O O O O
transcription O O O O
, O O O O
and O O O O
possibly O O O O
mRNA O O O O
splicing O O O O
, O O O O
in O O O O
both O O O O
insects O O O O
and O O O O
mammals O O O O
. O O O O
    
Investigations O O O O
in O O O O
several O O O O
insect O O O O
taxa O O O O
further O O O O
reveal O O O O
that O O O O
DNA O O O O
methylation O O O O
is O O O O
preferentially O O O O
targeted O O O O
to O O O O
ubiquitously O O O O
expressed O O O O
genes O O O O
and O O O O
may O O O O
play O O O O
a O O O O
key O O O O
role O O O O
in O O O O
the O O O O
regulation O O O O
of O O O O
phenotypic O O O O
plasticity O O O O
. O O O O
    
We O O O O
suggest O O O O
that O O O O
insects O O O O
are O O O O
particularly O O O O
amenable O O O O
to O O O O
advancing O O O O
our O O O O
understanding O O O O
of O O O O
the O O O O
biological O O O O
functions O O O O
of O O O O
DNA O O O O
methylation O O O O
, O O O O
because O O O O
insects O O O O
are O O O O
evolutionarily O O O O
diverse O O O O
, O O O O
display O O O O
several O O O O
lineage O O O O
- O O O O
specific O O O O
losses O O O O
of O O O O
DNA O O O O
methylation O O O O
and O O O O
possess O O O O
tractable O O O O
patterns O O O O
of O O O O
DNA O O O O
methylation O O O O
in O O O O
moderately O O O O
sized O O O O
genomes O O O O
. O O O O
    
The O O O O
small O O O O
GTPase O O O O
BcCdc42 O O O O
affects O O O O
nuclear O O O O
division O O O O
, O O O O
germination O O O O
and O O O O
virulence O O O O
of O O O O
the O O O O
gray O O O O
mold O O O O
fungus O O O O
Botrytis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cinerea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
small O O O O
GTPase O O O O
Cdc42 O O O O
plays O O O O
a O O O O
central O O O O
role O O O O
in O O O O
various O O O O
processes O O O O
in O O O O
eukaryotic O O O O
cells O O O O
including O O O O
growth O O O O
, O O O O
differentiation O O O O
and O O O O
cytoskeleton O O O O
organization O O O O
. O O O O
    
Whereas O O O O
it O O O O
is O O O O
essential O O O O
in O O O O
the O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
Saccharomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cerevisiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
its O O O O
role O O O O
in O O O O
filamentous O O O O
fungi O O O O
differs O O O O
, O O O O
due O O O O
to O O O O
the O O O O
complementing O O O O
, O O O O
partly O O O O
overlapping O O O O
function O O O O
of O O O O
Rac O O O O
. O O O O
    
We O O O O
analyzed O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
the O O O O
Cdc42 O O O O
homologue O O O O
in O O O O
the O O O O
necrotrophic O O O O
, O O O O
broad O O O O
host O O O O
range O O O O
pathogen O O O O
Botrytis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cinerea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Deletion O O O O
mutants O O O O
of O O O O
bccdc42 O O O O
showed O O O O
various O O O O
growth O O O O
abnormalities O O O O
; O O O O
the O O O O
mutants O O O O
had O O O O
reduced O O O O
growth O O O O
rate O O O O
and O O O O
hyphal O O O O
branching O O O O
, O O O O
they O O O O
produced O O O O
fewer O O O O
conidia O O O O
, O O O O
which O O O O
were O O O O
enlarged O O O O
and O O O O
misshapen O O O O
and O O O O
had O O O O
germination O O O O
defects O O O O
. O O O O
    
Additionally O O O O
, O O O O
the O O O O
mutants O O O O
were O O O O
impaired O O O O
in O O O O
sclerotia O O O O
development O O O O
. O O O O
    
Cytological O O O O
studies O O O O
indicate O O O O
that O O O O
at O O O O
least O O O O
part O O O O
of O O O O
this O O O O
phenotype O O O O
could O O O O
be O O O O
attributed O O O O
to O O O O
disturbed O O O O
control O O O O
of O O O O
nuclear O O O O
division O O O O
: O O O O
conidia O O O O
and O O O O
hyphae O O O O
of O O O O
the O O O O
mutant O O O O
showed O O O O
twofold O O O O
higher O O O O
nucleus O O O O
/ O O O O
cytoplasm O O O O
ratio O O O O
compared O O O O
to O O O O
wild O O O O
type O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Apart O O O O
from O O O O
these O O O O
effects O O O O
on O O O O
vegetative O O O O
growth O O O O
and O O O O
differentiation O O O O
, O O O O
Deltabccdc42 O O O O
strains O O O O
were O O O O
attenuated O O O O
in O O O O
penetration O O O O
and O O O O
colonization O O O O
of O O O O
host O O O O
tissue O O O O
, O O O O
confirming O O O O
that O O O O
BcCdc42 O O O O
- O O O O
though O O O O
being O O O O
not O O O O
essential O O O O
like O O O O
in O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
is O O O O
involved O O O O
in O O O O
important O O O O
developmental O O O O
processes O O O O
in O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cinerea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
GintAMT2 O O O O
, O O O O
a O O O O
new O O O O
member O O O O
of O O O O
the O O O O
ammonium O O O O
transporter O O O O
family O O O O
in O O O O
the O O O O
arbuscular O O O O
mycorrhizal O O O O
fungus O O O O
Glomus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
intraradices O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
symbiotic O O O O
association O O O O
of O O O O
plants O O O O
and O O O O
arbuscular O O O O
mycorrhizal O O O O
( O O O O
AM O O O O
) O O O O
fungi O O O O
, O O O O
the O O O O
fungus O O O O
delivers O O O O
mineral O O O O
nutrients O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
phosphate O O O O
and O O O O
nitrogen O O O O
, O O O O
to O O O O
the O O O O
plant O O O O
while O O O O
receiving O O O O
carbon O O O O
. O O O O
    
Previously O O O O
, O O O O
we O O O O
identified O O O O
an O O O O
NH O O O O
( O O O O
4 O O O O
) O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
transporter O O O O
in O O O O
the O O O O
AM O O O O
fungus O O O O
Glomus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
intraradices O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
GintAMT1 O O O O
) O O O O
involved O O O O
in O O O O
NH O O O O
( O O O O
4 O O O O
) O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
uptake O O O O
from O O O O
the O O O O
soil O O O O
when O O O O
preset O O O O
at O O O O
low O O O O
concentrations O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
report O O O O
the O O O O
isolation O O O O
and O O O O
characterization O O O O
of O O O O
a O O O O
new O O O O
G B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
intraradicesNH O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
4 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
transporter O O O O
gene O O O O
( O O O O
GintAMT2 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mutant O O O O
complementation O O O O
assays O O O O
showed O O O O
that O O O O
GintAMT2 O O O O
encodes O O O O
a O O O O
functional O O O O
NH O O O O
( O O O O
4 O O O O
) O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
transporter O O O O
. O O O O
    
The O O O O
use O O O O
of O O O O
an O O O O
anti O O O O
- O O O O
GintAMT2 O O O O
polyclonal O O O O
antibody O O O O
revealed O O O O
a O O O O
plasma O O O O
membrane O O O O
location O O O O
of O O O O
GintAMT2 O O O O
. O O O O
    
GintAMT1 O O O O
and O O O O
GintAMT2 O O O O
were O O O O
differentially O O O O
expressed O O O O
during O O O O
the O O O O
fungal O O O O
life O O O O
cycle O O O O
and O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
N O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
to O O O O
GintAMT1 O O O O
, O O O O
GintAMT2 O O O O
transcript O O O O
levels O O O O
were O O O O
higher O O O O
in O O O O
the O O O O
intraradical O O O O
than O O O O
in O O O O
the O O O O
extraradical O O O O
fungal O O O O
structures O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
transcripts O O O O
of O O O O
both O O O O
genes O O O O
were O O O O
detected O O O O
in O O O O
arbuscule O O O O
- O O O O
colonized O O O O
cortical O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
GintAMT1 O O O O
expression O O O O
was O O O O
induced O O O O
under O O O O
low O O O O
N O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
Constitutive O O O O
expression O O O O
of O O O O
GintAMT2 O O O O
in O O O O
N O O O O
- O O O O
limiting O O O O
conditions O O O O
and O O O O
transitory O O O O
induction O O O O
after O O O O
N O O O O
re O O O O
- O O O O
supply O O O O
suggests O O O O
a O O O O
role O O O O
for O O O O
GintAMT2 O O O O
to O O O O
retrieve O O O O
NH O O O O
( O O O O
4 O O O O
) O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
leaked O O O O
out O O O O
during O O O O
fungal O O O O
metabolism O O O O
. O O O O
    
Modulation O O O O
of O O O O
fungal O O O O
sensitivity O O O O
to O O O O
staurosporine O O O O
by O O O O
targeting O O O O
proteins O O O O
identified O O O O
by O O O O
transcriptional O O O O
profiling O O O O
. O O O O
    
An O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
time O O O O
- O O O O
dependent O O O O
genetic O O O O
response O O O O
to O O O O
the O O O O
death O O O O
- O O O O
inducer O O O O
staurosporine O O O O
was O O O O
performed O O O O
in O O O O
Neurospora B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
crassa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
by O O O O
transcriptional O O O O
profiling O O O O
. O O O O
    
Staurosporine O O O O
induced O O O O
two O O O O
major O O O O
genes O O O O
encoding O O O O
an O O O O
ABC O O O O
transporter O O O O
and O O O O
a O O O O
protein O O O O
with O O O O
similarity O O O O
to O O O O
regulatory O O O O
subunits O O O O
of O O O O
potassium O O O O
channels O O O O
. O O O O
    
The O O O O
transcriptional O O O O
response O O O O
is O O O O
dependent O O O O
on O O O O
the O O O O
activity O O O O
of O O O O
a O O O O
novel O O O O
transcription O O O O
factor O O O O
. O O O O
    
Deletion O O O O
mutants O O O O
in O O O O
differentially O O O O
expressed O O O O
genes O O O O
displayed O O O O
altered O O O O
sensitivity O O O O
to O O O O
staurosporine O O O O
, O O O O
underscoring O O O O
significant O O O O
proteins O O O O
involved O O O O
in O O O O
the O O O O
response O O O O
to O O O O
the O O O O
drug O O O O
. O O O O
    
A O O O O
 O O O O
- O O O O
mutant O O O O
of O O O O
the O O O O
ABC O O O O
transporter O O O O
( O O O O
abc3 O O O O
) O O O O
is O O O O
extremely O O O O
sensitive O O O O
to O O O O
staurosporine O O O O
, O O O O
accumulates O O O O
more O O O O
staurosporine O O O O
than O O O O
the O O O O
wild O O O O
type O O O O
strain O O O O
and O O O O
is O O O O
defective O O O O
in O O O O
energy O O O O
- O O O O
dependent O O O O
export O O O O
of O O O O
the O O O O
drug O O O O
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
the O O O O
ABC3 O O O O
protein O O O O
is O O O O
the O O O O
first O O O O
described O O O O
staurosporine O O O O
transporter O O O O
. O O O O
    
It O O O O
was O O O O
located O O O O
in O O O O
the O O O O
plasma O O O O
membrane O O O O
by O O O O
immunofluorescence O O O O
microscopy O O O O
. O O O O
    
The O O O O
combination O O O O
of O O O O
inhibitors O O O O
of O O O O
ABC O O O O
transporters O O O O
or O O O O
of O O O O
potassium O O O O
channels O O O O
with O O O O
staurosporine O O O O
leads O O O O
to O O O O
an O O O O
enhanced O O O O
activity O O O O
against O O O O
N B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
crassa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
pathogenic O O O O
fungi O O O O
paving O O O O
the O O O O
way O O O O
to O O O O
the O O O O
development O O O O
of O O O O
more O O O O
potent O O O O
and O O O O
specific O O O O
antifungals O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
highlight O O O O
the O O O O
general O O O O
use O O O O
of O O O O
transcriptional O O O O
profiling O O O O
for O O O O
the O O O O
identification O O O O
of O O O O
novel O O O O
proteins O O O O
involved O O O O
in O O O O
cell O O O O
death O O O O
and O O O O
their O O O O
potential O O O O
use O O O O
as O O O O
drug O O O O
targets O O O O
. O O O O
    
Novel O O O O
Fusarium O O O O
head O O O O
blight O O O O
pathogens O O O O
from O O O O
Nepal O O O O
and O O O O
Louisiana O O O O
revealed O O O O
by O O O O
multilocus O O O O
genealogical O O O O
concordance O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
was O O O O
conducted O O O O
to O O O O
assess O O O O
evolutionary O O O O
relationships O O O O
, O O O O
species O O O O
diversity O O O O
and O O O O
trichothecene O O O O
toxin O O O O
potential O O O O
of O O O O
five O O O O
Fusarium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
graminearum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
complex O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
FGSC B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
isolates O O O O
identified O O O O
as O O O O
genetically O O O O
novel O O O O
during O O O O
prior O O O O
Fusarium O O O O
head O O O O
blight O O O O
( O O O O
FHB O O O O
) O O O O
surveys O O O O
in O O O O
Nepal O O O O
and O O O O
Louisiana O O O O
. O O O O
    
Results O O O O
of O O O O
a O O O O
multilocus O O O O
genotyping O O O O
( O O O O
MLGT O O O O
) O O O O
assay O O O O
for O O O O
B O O O O
- O O O O
trichothecene O O O O
species O O O O
determination O O O O
indicated O O O O
these O O O O
isolates O O O O
might O O O O
represent O O O O
novel O O O O
species O O O O
within O O O O
the O O O O
FGSC B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
GCPSR O O O O
- O O O O
based O O O O
phylogenetic O O O O
analyses O O O O
of O O O O
a O O O O
12 O O O O
- O O O O
gene O O O O
dataset O O O O
, O O O O
comprising O O O O
portions O O O O
of O O O O
seven O O O O
loci O O O O
totaling O O O O
13 O O O O
. O O O O
1kb O O O O
of O O O O
aligned O O O O
DNA O O O O
sequence O O O O
data O O O O
, O O O O
provided O O O O
strong O O O O
support O O O O
for O O O O
the O O O O
genealogical O O O O
exclusivity O O O O
of O O O O
the O O O O
Nepalese O O O O
and O O O O
Louisianan O O O O
isolates O O O O
. O O O O
    
Accordingly O O O O
, O O O O
both O O O O
species O O O O
are O O O O
formally O O O O
recognized O O O O
herein O O O O
as O O O O
novel O O O O
FGSC B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
species O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Fusarium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nepalense O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
resolved O O O O
as O O O O
the O O O O
sister O O O O
lineage O O O O
of O O O O
Fusarium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ussurianum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
+ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Fusarium O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
asiaticum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
within O O O O
an O O O O
Asian O O O O
subclade O O O O
of O O O O
the O O O O
FGSC B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Fusarium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
louisianense O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
strongly O O O O
supported O O O O
as O O O O
a O O O O
reciprocally O O O O
monophyletic O O O O
sister O O O O
of O O O O
Fusarium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
gerlachii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
+ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
F O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
graminearum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
this O O O O
subclade O O O O
might O O O O
be O O O O
endemic O O O O
to O O O O
North O O O O
America O O O O
. O O O O
    
Multilocus O O O O
Bayesian O O O O
species O O O O
tree O O O O
analyses O O O O
augment O O O O
these O O O O
results O O O O
and O O O O
provide O O O O
evidence O O O O
for O O O O
a O O O O
distinct O O O O
lineage O O O O
within O O O O
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
graminearum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
predominately O O O O
from O O O O
the O O O O
Gulf O O O O
Coast O O O O
of O O O O
Louisiana O O O O
. O O O O
    
As O O O O
predicted O O O O
by O O O O
the O O O O
MLGT O O O O
assay O O O O
, O O O O
mycotoxin O O O O
analyses O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nepalense O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
louisianense O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
could O O O O
produce O O O O
15ADON O O O O
and O O O O
nivalenol O O O O
, O O O O
respectively O O O O
, O O O O
in O O O O
planta O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
, O O O O
both O O O O
species O O O O
were O O O O
only O O O O
able O O O O
to O O O O
induce O O O O
mild O O O O
FHB O O O O
symptoms O O O O
on O O O O
wheat O O O O
in O O O O
pathogenicity O O O O
experiments O O O O
. O O O O
    
Comparative O O O O
Impact O O O O
of O O O O
Artificial O O O O
Selection O O O O
for O O O O
Fungicide O O O O
Resistance O O O O
on O O O O
Beauveria B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bassiana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Metarhizium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
brunneum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Hypocreales O O O O
fungi O O O O
such O O O O
as O O O O
Beauveria B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bassiana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Balsamo O O O O
) O O O O
Vuillemin O O O O
and O O O O
Metarhizium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
brunneum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Petch O O O O
can O O O O
be O O O O
negatively O O O O
affected O O O O
by O O O O
fungicides O O O O
thereby O O O O
reducing O O O O
their O O O O
biocontrol O O O O
potential O O O O
. O O O O
    
In O O O O
a O O O O
previous O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
demonstrated O O O O
enhanced O O O O
fungicide O O O O
resistance O O O O
in O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bassiana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
through O O O O
artificial O O O O
selection O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
it O O O O
is O O O O
not O O O O
clear O O O O
if O O O O
the O O O O
enhanced O O O O
resistance O O O O
was O O O O
because O O O O
of O O O O
improved O O O O
germination O O O O
, O O O O
vegetative O O O O
growth O O O O
, O O O O
or O O O O
both O O O O
. O O O O
    
Additionally O O O O
, O O O O
the O O O O
enhanced O O O O
fungicide O O O O
resistance O O O O
has O O O O
only O O O O
been O O O O
demonstrated O O O O
in O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bassiana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
therefore O O O O
it O O O O
is O O O O
of O O O O
interest O O O O
to O O O O
investigate O O O O
the O O O O
potential O O O O
to O O O O
enhance O O O O
resistance O O O O
in O O O O
other O O O O
fungi O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
the O O O O
objectives O O O O
in O O O O
this O O O O
study O O O O
were O O O O
to O O O O
determine O O O O
the O O O O
potential O O O O
to O O O O
enhance O O O O
fungicide O O O O
resistance O O O O
in O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
brunneum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
through O O O O
artificial O O O O
selection O O O O
, O O O O
and O O O O
investigate O O O O
if O O O O
selection O O O O
is O O O O
based O O O O
on O O O O
germination O O O O
, O O O O
vegetative O O O O
growth O O O O
, O O O O
or O O O O
both O O O O
in O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bassiana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
brunneum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Selection O O O O
for O O O O
resistance O O O O
to O O O O
fenbuconazole O O O O
, O O O O
and O O O O
triphenyltin O O O O
hydroxide O O O O
was O O O O
assessed O O O O
through O O O O
inhibition O O O O
evaluations O O O O
on O O O O
solid O O O O
media O O O O
, O O O O
and O O O O
germination O O O O
and O O O O
mycelial O O O O
growth O O O O
in O O O O
liquid O O O O
media O O O O
. O O O O
    
Increased O O O O
resistance O O O O
after O O O O
selection O O O O
was O O O O
observed O O O O
for O O O O
all O O O O
fungicide O O O O
- O O O O
fungus O O O O
combinations O O O O
on O O O O
solid O O O O
and O O O O
or O O O O
liquid O O O O
media O O O O
. O O O O
    
Selection O O O O
resulted O O O O
in O O O O
increased O O O O
resistance O O O O
to O O O O
fenbuconazole O O O O
in O O O O
both O O O O
fungi O O O O
in O O O O
solid O O O O
and O O O O
liquid O O O O
media O O O O
; O O O O
in O O O O
liquid O O O O
culture O O O O
fungicide O O O O
resistance O O O O
in O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bassiana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
manifested O O O O
by O O O O
increased O O O O
germination O O O O
and O O O O
mycelial O O O O
growth O O O O
, O O O O
whereas O O O O
in O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
brunneum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fungicide O O O O
resistance O O O O
concerned O O O O
only O O O O
mycelial O O O O
growth O O O O
. O O O O
    
Selection O O O O
for O O O O
resistance O O O O
to O O O O
triphenyltin O O O O
hydroxide O O O O
varied O O O O
in O O O O
the O O O O
different O O O O
media O O O O
. O O O O
    
For O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bassiana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
triphenyltin O O O O
hydroxide O O O O
resistance O O O O
was O O O O
enhanced O O O O
on O O O O
solid O O O O
media O O O O
but O O O O
not O O O O
in O O O O
liquid O O O O
, O O O O
whereas O O O O
enhanced O O O O
resistance O O O O
of O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
brunneum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
detected O O O O
in O O O O
both O O O O
media O O O O
. O O O O
    
Fungicide O O O O
sensitivity O O O O
and O O O O
selection O O O O
potential O O O O
differs O O O O
based O O O O
on O O O O
the O O O O
medium O O O O
and O O O O
fungal O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Selection O O O O
for O O O O
fungicide O O O O
resistance O O O O
, O O O O
had O O O O
negative O O O O
effects O O O O
on O O O O
other O O O O
beneficial O O O O
traits O O O O
when O O O O
fungicide O O O O
pressure O O O O
was O O O O
removed O O O O
, O O O O
for O O O O
example O O O O
, O O O O
some O O O O
selected O O O O
populations O O O O
showed O O O O
decreased O O O O
germination O O O O
or O O O O
growth O O O O
, O O O O
relative O O O O
to O O O O
their O O O O
nonselected O O O O
control O O O O
populations O O O O
. O O O O
    
Additionally O O O O
, O O O O
reduced O O O O
virulence O O O O
to O O O O
the O O O O
greater B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
wax O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
moth O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Galleria B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mellonella O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
L O O O O
. O O O O
) O O O O
, O O O O
was O O O O
observed O O O O
in O O O O
all O O O O
fungal O O O O
populations O O O O
that O O O O
were O O O O
exposed O O O O
to O O O O
fungicide O O O O
resistance O O O O
regimes O O O O
. O O O O
    
We O O O O
conclude O O O O
that O O O O
it O O O O
is O O O O
possible O O O O
to O O O O
use O O O O
genetic O O O O
selection O O O O
to O O O O
enhance O O O O
fungicide O O O O
resistance O O O O
in O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bassiana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
brunneum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
but O O O O
before O O O O
use O O O O
the O O O O
resulting O O O O
populations O O O O
should O O O O
be O O O O
screened O O O O
for O O O O
inadvertent O O O O
negative O O O O
impacts O O O O
on O O O O
beneficial O O O O
traits O O O O
. O O O O
    
Dispersion O O O O
Models O O O O
and O O O O
Sampling O O O O
of O O O O
Cacao O O O O
Mirid O O O O
Bug O O O O
Sahlbergella O O O O
singularis O O O O
( O O O O
Hemiptera O O O O
: O O O O
Miridae O O O O
) O O O O
on O O O O
Theobroma B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
Cacao O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
Southern O O O O
Cameroon O O O O
. O O O O
    
The O O O O
spatio O O O O
- O O O O
temporal O O O O
distribution O O O O
of O O O O
Sahlbergella O O O O
singularis O O O O
Haglung O O O O
, O O O O
a O O O O
major O O O O
pest O O O O
of O O O O
cacao B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trees O O O O
( O O O O
Theobroma B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cacao O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
( O O O O
Malvaceae O O O O
) O O O O
, O O O O
was O O O O
studied O O O O
for O O O O
2 O O O O
yr O O O O
in O O O O
traditional O O O O
cacao B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
forest O O O O
gardens O O O O
in O O O O
the O O O O
humid O O O O
forest O O O O
area O O O O
of O O O O
southern O O O O
Cameroon O O O O
. O O O O
    
The O O O O
first O O O O
objective O O O O
was O O O O
to O O O O
analyze O O O O
the O O O O
dispersion O O O O
of O O O O
this O O O O
insect O O O O
on O O O O
cacao B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trees O O O O
. O O O O
    
The O O O O
second O O O O
objective O O O O
was O O O O
to O O O O
develop O O O O
sampling O O O O
plans O O O O
based O O O O
on O O O O
fixed O O O O
levels O O O O
of O O O O
precision O O O O
for O O O O
estimating O O O O
S O O O O
. O O O O
singularis O O O O
populations O O O O
. O O O O
    
The O O O O
following O O O O
models O O O O
were O O O O
used O O O O
to O O O O
analyze O O O O
the O O O O
data O O O O
: O O O O
Taylor O O O O
' O O O O
s O O O O
power O O O O
law O O O O
, O O O O
Iwao O O O O
' O O O O
s O O O O
patchiness O O O O
regression O O O O
, O O O O
the O O O O
Nachman O O O O
model O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
negative O O O O
binomial O O O O
distribution O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
document O O O O
that O O O O
Taylor O O O O
' O O O O
s O O O O
power O O O O
law O O O O
was O O O O
a O O O O
better O O O O
fit O O O O
for O O O O
the O O O O
data O O O O
than O O O O
the O O O O
Iwao O O O O
and O O O O
Nachman O O O O
models O O O O
. O O O O
    
Taylor O O O O
' O O O O
s O O O O
b O O O O
and O O O O
Iwao O O O O
' O O O O
s O O O O
Beta O O O O
were O O O O
both O O O O
significantly O O O O
& O O O O
gt O O O O
; O O O O
1 O O O O
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
S O O O O
. O O O O
singularis O O O O
aggregated O O O O
on O O O O
specific O O O O
trees O O O O
. O O O O
    
This O O O O
result O O O O
was O O O O
further O O O O
supported O O O O
by O O O O
the O O O O
calculated O O O O
common O O O O
k O O O O
of O O O O
1 O O O O
. O O O O
75444 O O O O
. O O O O
    
Iwao O O O O
' O O O O
s O O O O
alpha O O O O
was O O O O
significantly O O O O
& O O O O
lt O O O O
; O O O O
0 O O O O
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
the O O O O
basic O O O O
distribution O O O O
component O O O O
of O O O O
S O O O O
. O O O O
singularis O O O O
was O O O O
the O O O O
individual O O O O
insect O O O O
. O O O O
    
Comparison O O O O
of O O O O
negative O O O O
binomial O O O O
( O O O O
NBD O O O O
) O O O O
and O O O O
Nachman O O O O
models O O O O
indicated O O O O
that O O O O
the O O O O
NBD O O O O
model O O O O
was O O O O
appropriate O O O O
for O O O O
studying O O O O
S O O O O
. O O O O
singularis O O O O
distribution O O O O
. O O O O
    
Optimal O O O O
sample O O O O
sizes O O O O
for O O O O
fixed O O O O
precision O O O O
levels O O O O
of O O O O
0 O O O O
. O O O O
10 O O O O
, O O O O
0 O O O O
. O O O O
15 O O O O
, O O O O
and O O O O
0 O O O O
. O O O O
25 O O O O
were O O O O
estimated O O O O
with O O O O
Taylor O O O O
' O O O O
s O O O O
regression O O O O
coefficients O O O O
. O O O O
    
Required O O O O
sample O O O O
sizes O O O O
increased O O O O
dramatically O O O O
with O O O O
increasing O O O O
levels O O O O
of O O O O
precision O O O O
. O O O O
    
This O O O O
is O O O O
the O O O O
first O O O O
study O O O O
on O O O O
S O O O O
. O O O O
singularis O O O O
dispersion O O O O
in O O O O
cacao B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
plantations O O O O
. O O O O
    
Sampling O O O O
plans O O O O
, O O O O
presented O O O O
here O O O O
, O O O O
should O O O O
be O O O O
a O O O O
tool O O O O
for O O O O
research O O O O
on O O O O
population O O O O
dynamics O O O O
and O O O O
pest O O O O
management O O O O
decisions O O O O
of O O O O
mirid O O O O
bugs O O O O
on O O O O
cacao B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
