Streptococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ursoris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
isolated O O O O
from O O O O
the O O O O
oral O O O O
cavities O O O O
of O O O O
bears O O O O
. O O O O
    
Three O O O O
Gram O O O O
- O O O O
positive O O O O
, O O O O
catalase O O O O
- O O O O
negative O O O O
, O O O O
coccus O O O O
- O O O O
shaped O O O O
organisms O O O O
were O O O O
isolated O O O O
from O O O O
the O O O O
oral O O O O
cavities O O O O
of O O O O
bears O O O O
. O O O O
    
The O O O O
isolates O O O O
were O O O O
tentatively O O O O
identified O O O O
as O O O O
a O O O O
streptococcal O O O O
species O O O O
based O O O O
on O O O O
the O O O O
results O O O O
of O O O O
biochemical O O O O
tests O O O O
. O O O O
    
Comparative O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequencing O O O O
studies O O O O
confirmed O O O O
that O O O O
the O O O O
organisms O O O O
were O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Streptococcus O O O O
, O O O O
but O O O O
they O O O O
did O O O O
not O O O O
correspond O O O O
to O O O O
any O O O O
recognized O O O O
species O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
. O O O O
    
The O O O O
nearest O O O O
phylogenetic O O O O
relative O O O O
of O O O O
the O O O O
new O O O O
isolates O O O O
was O O O O
Streptococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ratti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ATCC O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
19645 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
( O O O O
98 O O O O
. O O O O
6 O O O O
% O O O O
) O O O O
, O O O O
however O O O O
, O O O O
DNA O O O O
- O O O O
DNA O O O O
hybridization O O O O
analysis O O O O
showed O O O O
that O O O O
the O O O O
isolates O O O O
displayed O O O O
less O O O O
than O O O O
15 O O O O
% O O O O
DNA O O O O
- O O O O
DNA O O O O
relatedness O O O O
with O O O O
the O O O O
type O O O O
strain O O O O
of O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ratti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Colonies O O O O
of O O O O
the O O O O
novel O O O O
strains O O O O
grown O O O O
on O O O O
mitis O O O O
salivarius O O O O
agar O O O O
showed O O O O
an O O O O
extracellular O O O O
polysaccharide O O O O
- O O O O
producing O O O O
colony O O O O
morphology O O O O
. O O O O
    
Based O O O O
on O O O O
phenotypic O O O O
and O O O O
phylogenetic O O O O
evidence O O O O
, O O O O
it O O O O
is O O O O
proposed O O O O
that O O O O
the O O O O
novel O O O O
isolates O O O O
are O O O O
classified O O O O
in O O O O
the O O O O
genus O O O O
Streptococcus O O O O
as O O O O
Streptococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ursoris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
    
The O O O O
type O O O O
strain O O O O
of O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ursoris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
NUM B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
1615 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
= O O O O
JCM O O O O
16316 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
DSM O O O O
22768 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Larkinella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bovis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
, O O O O
isolated O O O O
from O O O O
fermented O O O O
bovine O O O O
products O O O O
, O O O O
and O O O O
emended O O O O
descriptions O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Larkinella O O O O
and O O O O
of O O O O
Larkinella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
insperata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Vancanneyt O O O O
et O O O O
al O O O O
. O O O O
    
2006 O O O O
. O O O O
    
A O O O O
novel O O O O
bacterial O O O O
strain O O O O
, O O O O
designated O O O O
M2T2B15 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
, O O O O
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
fermented O O O O
bovine O O O O
products O O O O
and O O O O
was O O O O
characterized O O O O
by O O O O
using O O O O
a O O O O
polyphasic O O O O
approach O O O O
. O O O O
    
Colonies O O O O
were O O O O
reddish O O O O
pink O O O O
and O O O O
circular O O O O
with O O O O
entire O O O O
margins O O O O
. O O O O
    
Cells O O O O
were O O O O
strictly O O O O
aerobic O O O O
, O O O O
Gram O O O O
- O O O O
reaction O O O O
- O O O O
negative O O O O
, O O O O
oxidase O O O O
- O O O O
and O O O O
catalase O O O O
- O O O O
positive O O O O
rods O O O O
that O O O O
lacked O O O O
flagella O O O O
and O O O O
were O O O O
motile O O O O
by O O O O
gliding O O O O
. O O O O
    
Flexirubin O O O O
- O O O O
type O O O O
pigments O O O O
were O O O O
absent O O O O
. O O O O
    
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
analysis O O O O
indicated O O O O
that O O O O
strain O O O O
M2T2B15 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
was O O O O
related O O O O
most O O O O
closely O O O O
to O O O O
Larkinella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
insperata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
LMG O O O O
22510 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
( O O O O
94 O O O O
. O O O O
4 O O O O
% O O O O
similarity O O O O
) O O O O
but O O O O
shared O O O O
& O O O O
lt O O O O
; O O O O
87 O O O O
% O O O O
similarity O O O O
with O O O O
other O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
phylum O O O O
Bacteroidetes O O O O
. O O O O
    
The O O O O
major O O O O
cellular O O O O
fatty O O O O
acids O O O O
were O O O O
C O O O O
( O O O O
16 O O O O
: O O O O
1 O O O O
) O O O O
omega5c O O O O
, O O O O
iso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
15 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
and O O O O
iso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
17 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
3 O O O O
- O O O O
OH O O O O
. O O O O
    
The O O O O
polar O O O O
lipids O O O O
were O O O O
phosphatidylethanolamine O O O O
, O O O O
phosphatidylserine O O O O
, O O O O
two O O O O
unidentified O O O O
aminophospholipids O O O O
and O O O O
two O O O O
unidentified O O O O
polar O O O O
lipids O O O O
. O O O O
    
Menaquinone O O O O
7 O O O O
( O O O O
MK O O O O
- O O O O
7 O O O O
) O O O O
was O O O O
the O O O O
major O O O O
respiratory O O O O
quinone O O O O
. O O O O
    
The O O O O
G O O O O
+ O O O O
C O O O O
content O O O O
of O O O O
the O O O O
DNA O O O O
of O O O O
strain O O O O
M2T2B15 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
was O O O O
52 O O O O
& O O O O
amp O O O O
; O O O O
emsp14 O O O O
; O O O O
mol O O O O
% O O O O
. O O O O
    
The O O O O
phenotypic O O O O
, O O O O
genotypic O O O O
and O O O O
phylogenetic O O O O
data O O O O
presented O O O O
clearly O O O O
indicate O O O O
that O O O O
strain O O O O
M2T2B15 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
represents O O O O
a O O O O
novel O O O O
species O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Larkinella O O O O
, O O O O
for O O O O
which O O O O
the O O O O
name O O O O
Larkinella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bovis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
    
is O O O O
proposed O O O O
. O O O O
    
The O O O O
type O O O O
strain O O O O
is O O O O
M2T2B15 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
( O O O O
= O O O O
KACC O O O O
14040 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
NBRC O O O O
106324 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Emended O O O O
descriptions O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Larkinella O O O O
and O O O O
of O O O O
Larkinella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
insperata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Vancanneyt O O O O
et O O O O
al O O O O
. O O O O
    
2006 O O O O
are O O O O
also O O O O
proposed O O O O
. O O O O
    
Methanobacterium O O O O
arcticum O O O O
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
, O O O O
a O O O O
methanogenic O O O O
archaeon O O O O
from O O O O
Holocene O O O O
Arctic O O O O
permafrost O O O O
. O O O O
    
A O O O O
mesophilic O O O O
, O O O O
non O O O O
- O O O O
motile O O O O
, O O O O
hydrogenotrophic O O O O
, O O O O
rod O O O O
- O O O O
shaped O O O O
methanogen O O O O
, O O O O
designated O O O O
M2 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
Holocene O O O O
permafrost O O O O
sediments O O O O
of O O O O
the O O O O
Kolyma O O O O
lowland O O O O
in O O O O
the O O O O
Russian O O O O
Arctic O O O O
. O O O O
    
Cells O O O O
were O O O O
3 O O O O
- O O O O
6 O O O O
mum O O O O
long O O O O
and O O O O
0 O O O O
. O O O O
45 O O O O
- O O O O
0 O O O O
. O O O O
5 O O O O
mum O O O O
wide O O O O
. O O O O
    
Strain O O O O
M2 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
grew O O O O
on O O O O
H O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
/ O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
and O O O O
formate O O O O
. O O O O
    
Optimum O O O O
conditions O O O O
for O O O O
growth O O O O
were O O O O
37 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
, O O O O
pH O O O O
6 O O O O
. O O O O
8 O O O O
- O O O O
7 O O O O
. O O O O
2 O O O O
and O O O O
0 O O O O
. O O O O
1 O O O O
M O O O O
NaCl O O O O
. O O O O
    
The O O O O
DNA O O O O
G O O O O
+ O O O O
C O O O O
content O O O O
was O O O O
38 O O O O
. O O O O
1 O O O O
mol O O O O
% O O O O
. O O O O
    
On O O O O
the O O O O
basis O O O O
of O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
comparison O O O O
with O O O O
known O O O O
methanogens O O O O
, O O O O
strain O O O O
M2 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
affiliated O O O O
with O O O O
the O O O O
genus O O O O
Methanobacterium O O O O
and O O O O
was O O O O
most O O O O
closely O O O O
related O O O O
to O O O O
Methanobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
veterum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
MK4 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Methanobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bryantii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
DSM B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
863 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
both O O O O
99 O O O O
% O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
similarity O O O O
) O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
no O O O O
significant O O O O
DNA O O O O
- O O O O
DNA O O O O
relatedness O O O O
was O O O O
observed O O O O
between O O O O
strain O O O O
M2 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
these O O O O
type O O O O
strains O O O O
. O O O O
    
We O O O O
propose O O O O
that O O O O
strain O O O O
M2 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
represents O O O O
a O O O O
novel O O O O
species O O O O
, O O O O
with O O O O
the O O O O
name O O O O
Methanobacterium O O O O
arcticum O O O O
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
, O O O O
with O O O O
type O O O O
strain O O O O
M2 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
= O O O O
DSM O O O O
19844 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
VKM O O O O
B O O O O
- O O O O
2371 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Thiomonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
islandica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
, O O O O
a O O O O
moderately O O O O
thermophilic O O O O
, O O O O
hydrogen O O O O
- O O O O
and O O O O
sulfur O O O O
- O O O O
oxidizing O O O O
betaproteobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
isolated O O O O
from O O O O
a O O O O
hot O O O O
spring O O O O
. O O O O
    
A O O O O
novel O O O O
, O O O O
hydrogen O O O O
- O O O O
and O O O O
sulfur O O O O
- O O O O
oxidizing O O O O
bacterium O O O O
, O O O O
designated O O O O
strain O O O O
6C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
a O O O O
hot O O O O
spring O O O O
in O O O O
Graendalur O O O O
, O O O O
south O O O O
- O O O O
western O O O O
Iceland O O O O
. O O O O
    
Cells O O O O
of O O O O
this O O O O
organism O O O O
were O O O O
Gram O O O O
- O O O O
reaction O O O O
- O O O O
negative O O O O
, O O O O
rod O O O O
- O O O O
shaped O O O O
and O O O O
motile O O O O
. O O O O
    
The O O O O
strain O O O O
grew O O O O
aerobically O O O O
and O O O O
was O O O O
capable O O O O
of O O O O
chemolithotrophic O O O O
growth O O O O
on O O O O
thiosulfate O O O O
and O O O O
hydrogen O O O O
, O O O O
heterotrophic O O O O
growth O O O O
on O O O O
pyruvate O O O O
, O O O O
oxalate O O O O
, O O O O
acetate O O O O
and O O O O
on O O O O
glutamate O O O O
in O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
yeast O O O O
extract O O O O
and O O O O
mixotrophic O O O O
growth O O O O
on O O O O
several O O O O
organic O O O O
compounds O O O O
, O O O O
thiosulfate O O O O
and O O O O
/ O O O O
or O O O O
hydrogen O O O O
. O O O O
    
During O O O O
growth O O O O
on O O O O
thiosulfate O O O O
, O O O O
the O O O O
final O O O O
product O O O O
was O O O O
sulfate O O O O
, O O O O
resulting O O O O
in O O O O
a O O O O
drop O O O O
in O O O O
pH O O O O
from O O O O
6 O O O O
. O O O O
8 O O O O
to O O O O
2 O O O O
. O O O O
7 O O O O
. O O O O
    
Heterotrophic O O O O
growth O O O O
on O O O O
pyruvate O O O O
was O O O O
observed O O O O
at O O O O
pH O O O O
4 O O O O
- O O O O
7 O O O O
( O O O O
optimum O O O O
pH O O O O
4 O O O O
) O O O O
and O O O O
35 O O O O
- O O O O
50 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
( O O O O
optimum O O O O
45 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
DNA O O O O
G O O O O
+ O O O O
C O O O O
content O O O O
was O O O O
65 O O O O
. O O O O
2 O O O O
mol O O O O
% O O O O
. O O O O
    
As O O O O
determined O O O O
by O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
analysis O O O O
, O O O O
strain O O O O
6C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
represents O O O O
a O O O O
distinct O O O O
species O O O O
belonging O O O O
to O O O O
the O O O O
class O O O O
Betaproteobacteria B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
is O O O O
most O O O O
closely O O O O
related O O O O
to O O O O
Thiomonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
intermedia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
DSM B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
18155 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Thiomonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
perometabolis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
DSM B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
18570 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
DNA O O O O
- O O O O
DNA O O O O
hybridization O O O O
between O O O O
strain O O O O
6C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Thiomonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
intermedia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
DSM B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
18155 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Thiomonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
perometabolis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
DSM B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
18570 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gave O O O O
relatedness O O O O
values O O O O
below O O O O
32 O O O O
% O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
, O O O O
together O O O O
with O O O O
physiological O O O O
characteristics O O O O
, O O O O
showed O O O O
that O O O O
strain O O O O
6C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
represents O O O O
a O O O O
novel O O O O
species O O O O
within O O O O
the O O O O
genus O O O O
Thiomonas O O O O
, O O O O
for O O O O
which O O O O
the O O O O
name O O O O
Thiomonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
islandica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
    
is O O O O
proposed O O O O
. O O O O
    
The O O O O
type O O O O
strain O O O O
is O O O O
6C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
= O O O O
DSM B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
21436 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
= O O O O
JCM B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
16107 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
. O O O O
    
Nocardioides B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
caricicola O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
an O O O O
endophytic O O O O
bacterium O O O O
isolated O O O O
from O O O O
a O O O O
halophyte O O O O
, O O O O
Carex B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
scabrifolia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Steud O O O O
. O O O O
    
A O O O O
Gram O O O O
- O O O O
staining O O O O
- O O O O
positive O O O O
, O O O O
coccoid O O O O
to O O O O
rod O O O O
- O O O O
shaped O O O O
bacterium O O O O
, O O O O
designated O O O O
strain O O O O
YC6903 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
, O O O O
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
a O O O O
halophytic O O O O
plant O O O O
( O O O O
Carex B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
scabrifolia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Steud O O O O
. O O O O
) O O O O
collected O O O O
from O O O O
sand O O O O
dunes O O O O
at O O O O
Namhae O O O O
Island O O O O
, O O O O
Korea O O O O
, O O O O
and O O O O
its O O O O
taxonomic O O O O
position O O O O
was O O O O
investigated O O O O
by O O O O
using O O O O
a O O O O
polyphasic O O O O
approach O O O O
. O O O O
    
Strain O O O O
YC6903 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
grew O O O O
optimally O O O O
at O O O O
30 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
and O O O O
at O O O O
pH O O O O
8 O O O O
. O O O O
0 O O O O
. O O O O
    
Phylogenetic O O O O
analysis O O O O
based O O O O
on O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequences O O O O
indicated O O O O
that O O O O
strain O O O O
YC6903 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
belongs O O O O
to O O O O
the O O O O
genus O O O O
Nocardioides O O O O
in O O O O
the O O O O
family O O O O
Nocardioidaceae O O O O
. O O O O
    
Strain O O O O
YC6903 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
was O O O O
related O O O O
most O O O O
closely O O O O
to O O O O
Nocardioides B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pyridinolyticus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
OS4 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
( O O O O
97 O O O O
. O O O O
0 O O O O
% O O O O
16S O O O O
rRNA O O O O
gene O O O O
sequence O O O O
similarity O O O O
) O O O O
, O O O O
Nocardioides B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
dokdonensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
FR1436 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
( O O O O
96 O O O O
. O O O O
6 O O O O
% O O O O
) O O O O
, O O O O
Nocardioides B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aquiterrae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
GW O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
9 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
( O O O O
96 O O O O
. O O O O
6 O O O O
% O O O O
) O O O O
and O O O O
Nocardioides B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
hankookensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
DS O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
30 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
( O O O O
96 O O O O
. O O O O
6 O O O O
% O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
cell O O O O
- O O O O
wall O O O O
peptidoglycan O O O O
contained O O O O
LL O O O O
- O O O O
diaminopimelic O O O O
acid O O O O
and O O O O
MK O O O O
- O O O O
8 O O O O
( O O O O
H O O O O
( O O O O
4 O O O O
) O O O O
) O O O O
was O O O O
the O O O O
major O O O O
respiratory O O O O
quinone O O O O
. O O O O
    
The O O O O
mean O O O O
( O O O O
+ O O O O
/ O O O O
- O O O O
SD O O O O
) O O O O
level O O O O
of O O O O
DNA O O O O
- O O O O
DNA O O O O
relatedness O O O O
between O O O O
strain O O O O
YC6903 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
and O O O O
N B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pyridinolyticus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
OS4 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
was O O O O
53 O O O O
. O O O O
5 O O O O
+ O O O O
/ O O O O
- O O O O
5 O O O O
. O O O O
5 O O O O
% O O O O
. O O O O
    
The O O O O
predominant O O O O
cellular O O O O
fatty O O O O
acid O O O O
of O O O O
strain O O O O
YC6903 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
was O O O O
iso O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
16 O O O O
: O O O O
0 O O O O
) O O O O
( O O O O
28 O O O O
. O O O O
9 O O O O
% O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
DNA O O O O
G O O O O
+ O O O O
C O O O O
content O O O O
was O O O O
71 O O O O
. O O O O
7 O O O O
mol O O O O
% O O O O
. O O O O
    
Phenotypic O O O O
, O O O O
phylogenetic O O O O
and O O O O
chemotaxonomic O O O O
data O O O O
indicated O O O O
that O O O O
strain O O O O
YC6903 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
represents O O O O
a O O O O
novel O O O O
species O O O O
of O O O O
the O O O O
genus O O O O
Nocardioides O O O O
, O O O O
for O O O O
which O O O O
the O O O O
name O O O O
Nocardioides B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
caricicola O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
    
is O O O O
proposed O O O O
. O O O O
    
The O O O O
type O O O O
strain O O O O
is O O O O
YC6903 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
T O O O O
) O O O O
( O O O O
= O O O O
KACC O O O O
13778 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
= O O O O
DSM O O O O
22177 O O O O
( O O O O
T O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Radionuclide O O O O
and O O O O
hybrid O O O O
imaging O O O O
of O O O O
recurrent O O O O
prostate O O O O
cancer O O O O
. O O O O
    
Prostate O O O O
cancer O O O O
is O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
most O O O O
common O O O O
cancers O O O O
in O O O O
men O O O O
, O O O O
leading O O O O
to O O O O
substantial O O O O
morbidity O O O O
and O O O O
mortality O O O O
. O O O O
    
After O O O O
definitive O O O O
therapy O O O O
with O O O O
surgery O O O O
or O O O O
radiation O O O O
, O O O O
many O O O O
patients O O O O
have O O O O
biochemical O O O O
relapse O O O O
of O O O O
disease O O O O
- O O O O
- O O O O
ie O O O O
, O O O O
an O O O O
increase O O O O
in O O O O
their O O O O
prostate O O O O
- O O O O
specific O O O O
antigen O O O O
level O O O O
- O O O O
- O O O O
which O O O O
often O O O O
precedes O O O O
clinically O O O O
apparent O O O O
disease O O O O
by O O O O
months O O O O
or O O O O
even O O O O
years O O O O
. O O O O
    
Therefore O O O O
, O O O O
imaging O O O O
of O O O O
the O O O O
site O O O O
and O O O O
extent O O O O
of O O O O
tumour O O O O
recurrence O O O O
( O O O O
local O O O O
, O O O O
regional O O O O
, O O O O
distant O O O O
, O O O O
or O O O O
a O O O O
combination O O O O
) O O O O
is O O O O
of O O O O
great O O O O
interest O O O O
. O O O O
    
Conventional O O O O
morphological O O O O
imaging O O O O
methods O O O O
showed O O O O
limited O O O O
accuracy O O O O
for O O O O
assessment O O O O
of O O O O
recurrent O O O O
prostate O O O O
cancer O O O O
; O O O O
however O O O O
, O O O O
in O O O O
recent O O O O
years O O O O
, O O O O
functional O O O O
and O O O O
molecular O O O O
imaging O O O O
have O O O O
offered O O O O
the O O O O
possibility O O O O
of O O O O
imaging O O O O
molecular O O O O
or O O O O
cellular O O O O
processes O O O O
of O O O O
individual O O O O
tumours O O O O
, O O O O
often O O O O
with O O O O
more O O O O
accuracy O O O O
than O O O O
morphological O O O O
imaging O O O O
. O O O O
    
Hybrid O O O O
imaging O O O O
modalities O O O O
( O O O O
PET O O O O
- O O O O
CT O O O O
, O O O O
and O O O O
single O O O O
- O O O O
photon O O O O
emission O O O O
CT O O O O
[ O O O O
SPECT O O O O
] O O O O
- O O O O
CT O O O O
) O O O O
have O O O O
been O O O O
introduced O O O O
that O O O O
combine O O O O
functional O O O O
and O O O O
morphological O O O O
data O O O O
and O O O O
allow O O O O
whole O O O O
- O O O O
body O O O O
imaging O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
review O O O O
the O O O O
contribution O O O O
of O O O O
radionuclide O O O O
imaging O O O O
and O O O O
hybrid O O O O
imaging O O O O
for O O O O
assessment O O O O
of O O O O
recurrent O O O O
prostate O O O O
cancer O O O O
( O O O O
local O O O O
vs O O O O
regional O O O O
vs O O O O
distant O O O O
disease O O O O
) O O O O
. O O O O
    
We O O O O
discuss O O O O
available O O O O
data O O O O
on O O O O
PET O O O O
- O O O O
CT O O O O
and O O O O
SPECT O O O O
- O O O O
CT O O O O
, O O O O
and O O O O
provide O O O O
an O O O O
overview O O O O
of O O O O
experimental O O O O
tracers O O O O
and O O O O
their O O O O
preclinical O O O O
and O O O O
clinical O O O O
development O O O O
. O O O O
    
Finally O O O O
, O O O O
we O O O O
present O O O O
a O O O O
perspective O O O O
on O O O O
the O O O O
potential O O O O
of O O O O
future O O O O
hybrid O O O O
magnetic O O O O
resonance O O O O
- O O O O
PET O O O O
imaging O O O O
. O O O O
    
Fertility O O O O
- O O O O
sparing O O O O
surgery O O O O
in O O O O
patients O O O O
with O O O O
cervical O O O O
cancer O O O O
. O O O O
    
There O O O O
are O O O O
several O O O O
types O O O O
of O O O O
fertility O O O O
saving O O O O
procedures O O O O
that O O O O
can O O O O
be O O O O
done O O O O
in O O O O
patients O O O O
with O O O O
cervical O O O O
cancer O O O O
, O O O O
which O O O O
differ O O O O
in O O O O
terms O O O O
of O O O O
surgical O O O O
approach O O O O
and O O O O
extent O O O O
of O O O O
paracervical O O O O
resection O O O O
. O O O O
    
This O O O O
review O O O O
assesses O O O O
oncological O O O O
and O O O O
pregnancy O O O O
results O O O O
after O O O O
different O O O O
procedures O O O O
. O O O O
    
The O O O O
oncological O O O O
results O O O O
of O O O O
vaginal O O O O
radical O O O O
trachelectomies O O O O
( O O O O
VRT O O O O
) O O O O
and O O O O
abdominal O O O O
radical O O O O
trachelectomies O O O O
( O O O O
ART O O O O
) O O O O
are O O O O
similar O O O O
for O O O O
tumours O O O O
less O O O O
than O O O O
2 O O O O
cm O O O O
in O O O O
size O O O O
, O O O O
and O O O O
are O O O O
now O O O O
considered O O O O
safe O O O O
surgical O O O O
procedures O O O O
. O O O O
    
Oncological O O O O
outcomes O O O O
of O O O O
VRT O O O O
and O O O O
ART O O O O
in O O O O
tumours O O O O
larger O O O O
than O O O O
2 O O O O
cm O O O O
are O O O O
also O O O O
identical O O O O
, O O O O
but O O O O
the O O O O
results O O O O
cannot O O O O
be O O O O
considered O O O O
satisfactory O O O O
. O O O O
    
Preliminary O O O O
findings O O O O
of O O O O
less O O O O
radical O O O O
procedures O O O O
( O O O O
ie O O O O
, O O O O
deep O O O O
cone O O O O
and O O O O
simple O O O O
trachelectomy O O O O
) O O O O
in O O O O
patients O O O O
with O O O O
tumours O O O O
less O O O O
than O O O O
2 O O O O
cm O O O O
, O O O O
and O O O O
negative O O O O
sentinel O O O O
and O O O O
other O O O O
pelvic O O O O
lymph O O O O
nodes O O O O
, O O O O
are O O O O
comparable O O O O
with O O O O
the O O O O
results O O O O
of O O O O
VRT O O O O
and O O O O
ART O O O O
. O O O O
    
Downstaging O O O O
tumours O O O O
larger O O O O
than O O O O
2 O O O O
cm O O O O
by O O O O
neoadjuvant O O O O
chemotherapy O O O O
is O O O O
still O O O O
an O O O O
experimental O O O O
procedure O O O O
and O O O O
will O O O O
need O O O O
multicentre O O O O
cooperation O O O O
to O O O O
verify O O O O
its O O O O
oncological O O O O
safety O O O O
. O O O O
    
Pregnancy O O O O
results O O O O
vary O O O O
statistically O O O O
with O O O O
the O O O O
different O O O O
methods O O O O
. O O O O
    
Morphology O O O O
and O O O O
ultrastructure O O O O
of O O O O
multiple O O O O
life O O O O
cycle O O O O
stages O O O O
of O O O O
the O O O O
photosynthetic O O O O
relative O O O O
of O O O O
apicomplexa O O O O
, O O O O
Chromera B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
velia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Chromera B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
velia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
a O O O O
photosynthetic O O O O
alga O O O O
with O O O O
a O O O O
secondary O O O O
plastid O O O O
that O O O O
represents O O O O
the O O O O
closest O O O O
known O O O O
photosynthetic O O O O
relative O O O O
of O O O O
the O O O O
apicomplexan O O O O
parasites O O O O
. O O O O
    
The O O O O
original O O O O
description O O O O
of O O O O
this O O O O
organism O O O O
was O O O O
based O O O O
on O O O O
brownish O O O O
, O O O O
immotile O O O O
coccoid O O O O
cells O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
the O O O O
predominating O O O O
stage O O O O
of O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
velia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
the O O O O
culture O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
provide O O O O
a O O O O
detailed O O O O
light O O O O
and O O O O
electron O O O O
microscopy O O O O
description O O O O
of O O O O
coccoid O O O O
cells O O O O
of O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
velia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
a O O O O
previously O O O O
undocumented O O O O
bi O O O O
- O O O O
flagellated O O O O
stage O O O O
that O O O O
is O O O O
highly O O O O
motile O O O O
and O O O O
moves O O O O
in O O O O
a O O O O
characteristic O O O O
zig O O O O
- O O O O
zag O O O O
pattern O O O O
. O O O O
    
Transformation O O O O
from O O O O
a O O O O
coccoid O O O O
into O O O O
a O O O O
flagellate O O O O
stage O O O O
occurs O O O O
in O O O O
exponentially O O O O
growing O O O O
cultures O O O O
, O O O O
and O O O O
is O O O O
accelerated O O O O
by O O O O
exposure O O O O
to O O O O
light O O O O
. O O O O
    
The O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
velia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cells O O O O
contain O O O O
a O O O O
pseudoconoid O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
likely O O O O
homologous O O O O
to O O O O
the O O O O
corresponding O O O O
structure O O O O
in O O O O
the O O O O
apical O O O O
complex O O O O
of O O O O
Apicomplexa O O O O
, O O O O
cortical O O O O
alveoli O O O O
subtended O O O O
by O O O O
subpellicular O O O O
microtubules O O O O
, O O O O
mitochondrion O O O O
with O O O O
tubular O O O O
cristae O O O O
, O O O O
a O O O O
micropyle O O O O
, O O O O
and O O O O
a O O O O
distinctive O O O O
chromerosome O O O O
, O O O O
an O O O O
apparently O O O O
novel O O O O
type O O O O
of O O O O
extrusion O O O O
organelle O O O O
. O O O O
    
Ultrastructural O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
flagellate O O O O
supports O O O O
its O O O O
close O O O O
association O O O O
with O O O O
colpodellids O O O O
and O O O O
apicomplexans O O O O
and O O O O
provides O O O O
important O O O O
insight O O O O
into O O O O
their O O O O
evolution O O O O
. O O O O
    
Introns O O O O
, O O O O
alternative O O O O
splicing O O O O
, O O O O
spliced O O O O
leader O O O O
trans O O O O
- O O O O
splicing O O O O
and O O O O
differential O O O O
expression O O O O
of O O O O
pcna O O O O
and O O O O
cyclin O O O O
in O O O O
Perkinsus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
marinus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
To O O O O
gain O O O O
understanding O O O O
on O O O O
the O O O O
structure O O O O
and O O O O
regulation O O O O
of O O O O
growth O O O O
- O O O O
related O O O O
genes O O O O
of O O O O
the O O O O
parasitic O O O O
alveolate O O O O
Perkinsus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
marinus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
we O O O O
analyzed O O O O
genes O O O O
encoding O O O O
proliferating O O O O
cell O O O O
nuclear O O O O
antigen O O O O
( O O O O
pcna O O O O
) O O O O
and O O O O
cyclins O O O O
( O O O O
cyclin O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Comparison O O O O
of O O O O
the O O O O
full O O O O
- O O O O
length O O O O
cDNAs O O O O
with O O O O
the O O O O
corresponding O O O O
genomic O O O O
sequences O O O O
revealedtrans O O O O
- O O O O
splicing O O O O
of O O O O
the O O O O
mRNAs O O O O
of O O O O
these O O O O
genes O O O O
with O O O O
a O O O O
conserved O O O O
21 O O O O
- O O O O
22 O O O O
nt O O O O
spliced O O O O
leader O O O O
. O O O O
    
Over O O O O
10 O O O O
copies O O O O
of O O O O
pcna O O O O
were O O O O
detected O O O O
, O O O O
with O O O O
identical O O O O
gene O O O O
structures O O O O
and O O O O
similar O O O O
nucleotide O O O O
( O O O O
nt O O O O
) O O O O
sequences O O O O
( O O O O
88 O O O O
- O O O O
99 O O O O
% O O O O
) O O O O
, O O O O
encoding O O O O
largely O O O O
identical O O O O
amino O O O O
acid O O O O
sequences O O O O
( O O O O
aa O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Two O O O O
distinct O O O O
types O O O O
ofcyclin O O O O
( O O O O
Pmacyclin1 O O O O
and O O O O
Pmacyclin2 O O O O
) O O O O
were O O O O
identified O O O O
, O O O O
with O O O O
66 O O O O
- O O O O
69 O O O O
% O O O O
nt O O O O
and O O O O
81 O O O O
- O O O O
85 O O O O
% O O O O
aa O O O O
similarities O O O O
. O O O O
Pmacyclin2 O O O O
was O O O O
organized O O O O
in O O O O
tandem O O O O
repeats O O O O
, O O O O
and O O O O
was O O O O
alternatively O O O O
spliced O O O O
, O O O O
giving O O O O
rise O O O O
to O O O O
five O O O O
subtypes O O O O
of O O O O
transcripts O O O O
. O O O O
    
For O O O O
both O O O O
pcna O O O O
and O O O O
cyclin O O O O
genes O O O O
, O O O O
6 O O O O
- O O O O
10 O O O O
introns O O O O
were O O O O
found O O O O
. O O O O
    
Quantitative O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
assays O O O O
showed O O O O
that O O O O
pcna O O O O
and O O O O
Pmacyclin2 O O O O
expression O O O O
levels O O O O
were O O O O
low O O O O
with O O O O
small O O O O
variations O O O O
during O O O O
a O O O O
28 O O O O
- O O O O
h O O O O
time O O O O
course O O O O
, O O O O
whereas O O O O
Pmacyclin1 O O O O
transcript O O O O
abundance O O O O
was O O O O
10 O O O O
- O O O O
100 O O O O
times O O O O
higher O O O O
, O O O O
and O O O O
increased O O O O
markedly O O O O
during O O O O
active O O O O
cell O O O O
division O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
it O O O O
is O O O O
a O O O O
mitoticcyclinand O O O O
can O O O O
be O O O O
a O O O O
useful O O O O
growth O O O O
marker O O O O
for O O O O
this O O O O
species O O O O
. O O O O
    
The O O O O
gene O O O O
structure O O O O
and O O O O
expression O O O O
features O O O O
along O O O O
with O O O O
phylogenetic O O O O
results O O O O
position O O O O
this O O O O
organism O O O O
between O O O O
dinoflagellates O O O O
and O O O O
apicomplexans O O O O
, O O O O
but O O O O
its O O O O
definitive O O O O
affiliation O O O O
among O O O O
alveolates O O O O
requires O O O O
further O O O O
studies O O O O
. O O O O
    
Highly O O O O
diverse O O O O
and O O O O
seasonally O O O O
dynamic O O O O
protist O O O O
community O O O O
in O O O O
a O O O O
pristine O O O O
peat O O O O
bog O O O O
. O O O O
    
Culture O O O O
- O O O O
independent O O O O
molecular O O O O
methods O O O O
based O O O O
on O O O O
the O O O O
amplification O O O O
, O O O O
cloning O O O O
and O O O O
sequencing O O O O
of O O O O
small O O O O
- O O O O
subunit O O O O
ribosomal O O O O
RNA O O O O
genes O O O O
( O O O O
SSU O O O O
rDNAs O O O O
) O O O O
are O O O O
powerful O O O O
tools O O O O
to O O O O
study O O O O
the O O O O
diversity O O O O
of O O O O
microorganisms O O O O
. O O O O
    
Despite O O O O
so O O O O
, O O O O
the O O O O
eukaryotic O O O O
microbial O O O O
diversity O O O O
of O O O O
many O O O O
ecosystems O O O O
, O O O O
including O O O O
peatlands O O O O
has O O O O
not O O O O
yet O O O O
received O O O O
much O O O O
attention O O O O
. O O O O
    
We O O O O
analysed O O O O
the O O O O
eukaryotic O O O O
diversity O O O O
by O O O O
molecular O O O O
surveys O O O O
in O O O O
water O O O O
from O O O O
the O O O O
centre O O O O
of O O O O
a O O O O
pristine O O O O
Sphagnum O O O O
- O O O O
dominated O O O O
peatland O O O O
in O O O O
the O O O O
Jura O O O O
Mountains O O O O
of O O O O
Switzerland O O O O
during O O O O
a O O O O
complete O O O O
seasonal O O O O
cycle O O O O
. O O O O
    
The O O O O
clone O O O O
libraries O O O O
constructed O O O O
from O O O O
five O O O O
different O O O O
temporal O O O O
samplings O O O O
revealed O O O O
a O O O O
high O O O O
diversity O O O O
of O O O O
protists O O O O
with O O O O
representatives O O O O
of O O O O
all O O O O
major O O O O
eukaryotic O O O O
phyla O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
, O O O O
four O O O O
sequence O O O O
types O O O O
could O O O O
not O O O O
be O O O O
assigned O O O O
to O O O O
any O O O O
known O O O O
high O O O O
- O O O O
level O O O O
eukaryotic O O O O
taxon O O O O
but O O O O
branched O O O O
together O O O O
with O O O O
a O O O O
rather O O O O
good O O O O
statistic O O O O
support O O O O
, O O O O
raising O O O O
the O O O O
possibility O O O O
of O O O O
a O O O O
novel O O O O
, O O O O
deep O O O O
branching O O O O
eukaryotic O O O O
clade O O O O
. O O O O
    
The O O O O
analysis O O O O
of O O O O
seasonal O O O O
patterns O O O O
of O O O O
phylotypes O O O O
showed O O O O
a O O O O
clear O O O O
change O O O O
in O O O O
the O O O O
eukaryotic O O O O
communities O O O O
between O O O O
the O O O O
warm O O O O
period O O O O
( O O O O
late O O O O
spring O O O O
and O O O O
summer O O O O
) O O O O
and O O O O
the O O O O
cold O O O O
period O O O O
( O O O O
autumn O O O O
and O O O O
winter O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Chrysophytes O O O O
dominated O O O O
the O O O O
samples O O O O
in O O O O
the O O O O
cold O O O O
period O O O O
while O O O O
testate O O O O
amoebae O O O O
( O O O O
Arcellinida O O O O
and O O O O
Euglyphida O O O O
) O O O O
and O O O O
a O O O O
few O O O O
other O O O O
groups O O O O
peaked O O O O
in O O O O
summer O O O O
. O O O O
    
A O O O O
few O O O O
phylotypes O O O O
( O O O O
such O O O O
as O O O O
a O O O O
cryptomonad O O O O
and O O O O
a O O O O
perkinsid O O O O
) O O O O
were O O O O
abundant O O O O
at O O O O
given O O O O
sampling O O O O
times O O O O
and O O O O
then O O O O
almost O O O O
disappeared O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
bloom O O O O
- O O O O
like O O O O
dynamics O O O O
. O O O O
    
Comparing O O O O
potential O O O O
COI O O O O
and O O O O
SSU O O O O
rDNA O O O O
barcodes O O O O
for O O O O
assessing O O O O
the O O O O
diversity O O O O
and O O O O
phylogenetic O O O O
relationships O O O O
of O O O O
cyphoderiid O O O O
testate O O O O
amoebae O O O O
( O O O O
Rhizaria O O O O
: O O O O
Euglyphida O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
mitochondrial O O O O
Cytochrome O O O O
Oxidase O O O O
Subunit O O O O
1 O O O O
gene O O O O
( O O O O
COI O O O O
) O O O O
has O O O O
been O O O O
promoted O O O O
as O O O O
an O O O O
ideal O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
DNA O O O O
barcode O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
for O O O O
animal O O O O
species O O O O
and O O O O
other O O O O
groups O O O O
of O O O O
eukaryotes O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
utility O O O O
of O O O O
the O O O O
COI O O O O
marker O O O O
for O O O O
species O O O O
level O O O O
discrimination O O O O
and O O O O
for O O O O
phylogenetic O O O O
analyses O O O O
has O O O O
yet O O O O
to O O O O
be O O O O
tested O O O O
within O O O O
the O O O O
Rhizaria O O O O
. O O O O
    
Accordingly O O O O
, O O O O
we O O O O
analysed O O O O
mitochondrial O O O O
COI O O O O
gene O O O O
sequences O O O O
and O O O O
nuclear O O O O
small O O O O
subunit O O O O
rDNA O O O O
( O O O O
SSU O O O O
) O O O O
sequences O O O O
from O O O O
several O O O O
morphospecies O O O O
of O O O O
euglyphid O O O O
testate O O O O
amoebae O O O O
( O O O O
Cercozoa O O O O
, O O O O
Rhizaria O O O O
) O O O O
in O O O O
order O O O O
to O O O O
evaluate O O O O
the O O O O
utility O O O O
of O O O O
these O O O O
DNA O O O O
markers O O O O
for O O O O
species O O O O
discrimination O O O O
and O O O O
phylogenetic O O O O
reconstructions O O O O
. O O O O
    
Sequences O O O O
were O O O O
obtained O O O O
from O O O O
eleven O O O O
populations O O O O
belonging O O O O
to O O O O
six O O O O
Cyphoderia O O O O
morphospecies O O O O
that O O O O
were O O O O
isolated O O O O
from O O O O
field O O O O
samples O O O O
in O O O O
North O O O O
America O O O O
and O O O O
Europe O O O O
. O O O O
    
Mean O O O O
inter O O O O
- O O O O
population O O O O
COI O O O O
sequence O O O O
dissimilarities O O O O
were O O O O
on O O O O
average O O O O
2 O O O O
. O O O O
9 O O O O
times O O O O
greater O O O O
than O O O O
in O O O O
the O O O O
SSU O O O O
, O O O O
while O O O O
the O O O O
intra O O O O
- O O O O
population O O O O
sequence O O O O
dissimilarities O O O O
were O O O O
higher O O O O
in O O O O
the O O O O
SSU O O O O
( O O O O
0 O O O O
- O O O O
0 O O O O
. O O O O
95 O O O O
% O O O O
) O O O O
than O O O O
in O O O O
the O O O O
COI O O O O
( O O O O
0 O O O O
% O O O O
) O O O O
; O O O O
this O O O O
suggests O O O O
that O O O O
the O O O O
COI O O O O
fragment O O O O
is O O O O
valuable O O O O
for O O O O
discriminating O O O O
Cyphoderiidae O O O O
isolates O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
study O O O O
also O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
COI O O O O
sequences O O O O
are O O O O
useful O O O O
for O O O O
inferring O O O O
phylogenetic O O O O
relationships O O O O
among O O O O
Cyphoderiidae O O O O
isolates O O O O
. O O O O
    
COI O O O O
and O O O O
SSU O O O O
tree O O O O
topologies O O O O
were O O O O
very O O O O
similar O O O O
even O O O O
though O O O O
the O O O O
COI O O O O
fragment O O O O
used O O O O
in O O O O
these O O O O
analyses O O O O
( O O O O
500bp O O O O
) O O O O
was O O O O
much O O O O
shorter O O O O
than O O O O
the O O O O
SSU O O O O
sequences O O O O
( O O O O
1600bp O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Altogether O O O O
, O O O O
these O O O O
results O O O O
demonstrate O O O O
the O O O O
utility O O O O
of O O O O
the O O O O
COI O O O O
as O O O O
a O O O O
potential O O O O
taxonomic O O O O
DNA O O O O
barcode O O O O
for O O O O
assessing O O O O
cyphoderiid O O O O
species O O O O
diversity O O O O
and O O O O
for O O O O
inferring O O O O
phylogenetic O O O O
relationships O O O O
within O O O O
the O O O O
group O O O O
. O O O O
    
Expanding O O O O
character O O O O
sampling O O O O
for O O O O
ciliate O O O O
phylogenetic O O O O
inference O O O O
using O O O O
mitochondrial O O O O
SSU O O O O
- O O O O
rDNA O O O O
as O O O O
a O O O O
molecular O O O O
marker O O O O
. O O O O
    
Molecular O O O O
systematics O O O O
of O O O O
ciliates O O O O
, O O O O
particularly O O O O
at O O O O
deep O O O O
nodes O O O O
, O O O O
has O O O O
largely O O O O
focused O O O O
on O O O O
increasing O O O O
taxon O O O O
sampling O O O O
using O O O O
the O O O O
nuclear O O O O
small O O O O
subunit O O O O
rDNA O O O O
( O O O O
nSSU O O O O
- O O O O
rDNA O O O O
) O O O O
locus O O O O
. O O O O
    
These O O O O
previous O O O O
analyses O O O O
have O O O O
generally O O O O
been O O O O
congruent O O O O
with O O O O
morphologically O O O O
- O O O O
based O O O O
classifications O O O O
, O O O O
although O O O O
there O O O O
is O O O O
extensive O O O O
non O O O O
- O O O O
monophyly O O O O
at O O O O
many O O O O
levels O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
caution O O O O
is O O O O
needed O O O O
in O O O O
interpreting O O O O
these O O O O
results O O O O
as O O O O
nSSU O O O O
- O O O O
rDNA O O O O
is O O O O
just O O O O
a O O O O
single O O O O
molecular O O O O
marker O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
the O O O O
mitochondrial O O O O
small O O O O
subunit O O O O
rDNA O O O O
( O O O O
mtSSU O O O O
- O O O O
rDNA O O O O
) O O O O
is O O O O
evaluated O O O O
for O O O O
deep O O O O
ciliate O O O O
nodes O O O O
using O O O O
the O O O O
Colpodea O O O O
as O O O O
an O O O O
example O O O O
. O O O O
    
Overall O O O O
, O O O O
well O O O O
- O O O O
supported O O O O
nodes O O O O
in O O O O
the O O O O
mtSSU O O O O
- O O O O
rDNA O O O O
and O O O O
concatenated O O O O
topologies O O O O
are O O O O
well O O O O
supported O O O O
in O O O O
the O O O O
nSSU O O O O
- O O O O
rDNA O O O O
topology O O O O
; O O O O
e O O O O
. O O O O
g O O O O
. O O O O
, O O O O
the O O O O
non O O O O
- O O O O
monophyly O O O O
of O O O O
the O O O O
Cyrtolophosidida O O O O
. O O O O
    
The O O O O
two O O O O
moderately O O O O
- O O O O
to O O O O
well O O O O
- O O O O
supported O O O O
incongruences O O O O
between O O O O
the O O O O
loci O O O O
are O O O O
the O O O O
placement O O O O
of O O O O
the O O O O
Sorogenida O O O O
and O O O O
Colpoda B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aspera O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
Our O O O O
analyses O O O O
of O O O O
mtSSU O O O O
- O O O O
rDNA O O O O
support O O O O
the O O O O
conclusion O O O O
, O O O O
originally O O O O
derived O O O O
from O O O O
nSSU O O O O
- O O O O
rDNA O O O O
, O O O O
that O O O O
the O O O O
morphological O O O O
characters O O O O
used O O O O
in O O O O
taxonomic O O O O
circumscriptions O O O O
of O O O O
the O O O O
Colpodea O O O O
represent O O O O
a O O O O
mixture O O O O
of O O O O
ancestral O O O O
and O O O O
derived O O O O
states O O O O
. O O O O
    
This O O O O
demonstration O O O O
of O O O O
the O O O O
efficacy O O O O
of O O O O
the O O O O
mtSSU O O O O
- O O O O
rDNA O O O O
will O O O O
enable O O O O
phylogenetic O O O O
reconstructions O O O O
of O O O O
deep O O O O
nodes O O O O
in O O O O
the O O O O
ciliate O O O O
tree O O O O
of O O O O
life O O O O
to O O O O
move O O O O
from O O O O
a O O O O
single O O O O
- O O O O
locus O O O O
to O O O O
a O O O O
multi O O O O
- O O O O
locus O O O O
approach O O O O
. O O O O
    
Diversification O O O O
and O O O O
evolution O O O O
of O O O O
the O O O O
avirulence O O O O
gene O O O O
AVR O O O O
- O O O O
Pita1 O O O O
in O O O O
field O O O O
isolates O O O O
of O O O O
Magnaporthe B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
oryzae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Rice O O O O
blast O O O O
disease O O O O
is O O O O
the O O O O
single O O O O
most O O O O
destructive O O O O
plant O O O O
disease O O O O
that O O O O
threatens O O O O
stable O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
production O O O O
worldwide O O O O
. O O O O
    
Race O O O O
- O O O O
specific O O O O
resistance O O O O
to O O O O
the O O O O
rice O O O O
blast O O O O
pathogen O O O O
has O O O O
not O O O O
been O O O O
durable O O O O
and O O O O
the O O O O
mechanism O O O O
by O O O O
which O O O O
the O O O O
resistance O O O O
is O O O O
overcome O O O O
remains O O O O
largely O O O O
unknown O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
report O O O O
the O O O O
molecular O O O O
mechanisms O O O O
of O O O O
diversification O O O O
and O O O O
the O O O O
instability O O O O
of O O O O
the O O O O
avirulence O O O O
gene O O O O
AVR O O O O
- O O O O
Pita1 O O O O
in O O O O
field O O O O
strains O O O O
of O O O O
Magnaporthe B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
oryzae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
interacting O O O O
with O O O O
the O O O O
host O O O O
resistance O O O O
gene O O O O
Pi O O O O
- O O O O
ta O O O O
and O O O O
triggering O O O O
race O O O O
- O O O O
specific O O O O
resistance O O O O
. O O O O
    
Two O O O O
- O O O O
base O O O O
- O O O O
pair O O O O
insertions O O O O
resulting O O O O
in O O O O
frame O O O O
- O O O O
shift O O O O
mutations O O O O
and O O O O
partial O O O O
and O O O O
complete O O O O
deletions O O O O
of O O O O
AVR O O O O
- O O O O
Pita1 O O O O
were O O O O
identified O O O O
in O O O O
virulent O O O O
isolates O O O O
. O O O O
    
Moreover O O O O
, O O O O
a O O O O
total O O O O
of O O O O
38 O O O O
AVR O O O O
- O O O O
Pita1 O O O O
haplotypes O O O O
encoding O O O O
27 O O O O
AVR O O O O
- O O O O
Pita1 O O O O
variants O O O O
were O O O O
identified O O O O
among O O O O
151 O O O O
avirulent O O O O
isolates O O O O
. O O O O
    
Most O O O O
DNA O O O O
sequence O O O O
variation O O O O
was O O O O
found O O O O
to O O O O
occur O O O O
in O O O O
the O O O O
exon O O O O
region O O O O
resulting O O O O
in O O O O
amino O O O O
acid O O O O
substitution O O O O
. O O O O
    
These O O O O
findings O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
AVR O O O O
- O O O O
Pita1 O O O O
is O O O O
under O O O O
positive O O O O
selection O O O O
and O O O O
mutations O O O O
of O O O O
AVR O O O O
- O O O O
Pita1 O O O O
are O O O O
responsible O O O O
for O O O O
defeating O O O O
race O O O O
- O O O O
specific O O O O
resistance O O O O
in O O O O
nature O O O O
. O O O O
    
Analysis O O O O
of O O O O
spatial O O O O
niche O O O O
structure O O O O
in O O O O
coexisting O O O O
tidepool O O O O
fishes O O O O
: O O O O
 O O O O
models O O O O
based O O O O
on O O O O
multi O O O O
- O O O O
scale O O O O
experiments O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Fundamental O O O O
and O O O O
realized O O O O
spatial O O O O
niches O O O O
were O O O O
investigated O O O O
through O O O O
a O O O O
combination O O O O
of O O O O
laboratory O O O O
and O O O O
mesocosm O O O O
experiments O O O O
, O O O O
field O O O O
observations O O O O
and O O O O
 O O O O
model O O O O
analysis O O O O
in O O O O
three O O O O
intertidal O O O O
gobiid O O O O
species O O O O
( O O O O
Bathygobius B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fuscus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Chaenogobius B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
annularis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gulosus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
. O O O O
    
Null O O O O
models O O O O
based O O O O
on O O O O
the O O O O
results O O O O
of O O O O
single O O O O
- O O O O
species O O O O
experiments O O O O
were O O O O
used O O O O
to O O O O
assess O O O O
interspecific O O O O
spatial O O O O
use O O O O
and O O O O
coexistence O O O O
on O O O O
two O O O O
different O O O O
scales O O O O
: O O O O
( O O O O
i O O O O
) O O O O
microhabitats O O O O
within O O O O
a O O O O
tidepool O O O O
( O O O O
' O O O O
microhabitat O O O O
' O O O O
scale O O O O
) O O O O
; O O O O
and O O O O
( O O O O
ii O O O O
) O O O O
distribution O O O O
among O O O O
a O O O O
set O O O O
of O O O O
tidepools O O O O
( O O O O
' O O O O
habitat O O O O
- O O O O
wide O O O O
' O O O O
scale O O O O
) O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Patterns O O O O
of O O O O
microhabitat O O O O
use O O O O
varied O O O O
from O O O O
single O O O O
to O O O O
paired O O O O
treatments O O O O
, O O O O
depending O O O O
on O O O O
paired O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Realized O O O O
overlap O O O O
of O O O O
microhabitat O O O O
use O O O O
was O O O O
smaller O O O O
than O O O O
would O O O O
be O O O O
expected O O O O
from O O O O
single O O O O
- O O O O
individual O O O O
situations O O O O
for O O O O
intraspecific O O O O
combinations O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
for O O O O
interspecific O O O O
ones O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Patterns O O O O
of O O O O
tidepool O O O O
occupancy O O O O
( O O O O
a O O O O
measure O O O O
of O O O O
spatial O O O O
niche O O O O
breadth O O O O
) O O O O
in O O O O
the O O O O
mesocosm O O O O
were O O O O
influenced O O O O
by O O O O
interspecific O O O O
interactions O O O O
. O O O O
    
Two O O O O
Chaenogobius O O O O
species O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fuscus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
decreased O O O O
tidepool O O O O
occupancy O O O O
in O O O O
the O O O O
hetero O O O O
- O O O O
specific O O O O
treatments O O O O
compared O O O O
with O O O O
the O O O O
mono O O O O
- O O O O
specific O O O O
ones O O O O
. O O O O
    
For O O O O
all O O O O
interspecific O O O O
combinations O O O O
, O O O O
spatial O O O O
overlap O O O O
( O O O O
habitat O O O O
- O O O O
wide O O O O
scale O O O O
) O O O O
was O O O O
significantly O O O O
lower O O O O
than O O O O
the O O O O
values O O O O
expected O O O O
from O O O O
mono O O O O
- O O O O
specific O O O O
situations O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
also O O O O
indicated O O O O
a O O O O
possible O O O O
trade O O O O
- O O O O
off O O O O
between O O O O
competitiveness O O O O
and O O O O
growth O O O O
efficiency O O O O
in O O O O
these O O O O
fishes O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Interspecific O O O O
spatial O O O O
overlap O O O O
in O O O O
the O O O O
field O O O O
was O O O O
similar O O O O
to O O O O
that O O O O
in O O O O
the O O O O
mesocosm O O O O
experiment O O O O
and O O O O
the O O O O
pattern O O O O
of O O O O
coexistence O O O O
of O O O O
gobiids O O O O
can O O O O
be O O O O
explained O O O O
by O O O O
the O O O O
results O O O O
of O O O O
our O O O O
experiments O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
demonstrates O O O O
that O O O O
niches O O O O
of O O O O
intertidal O O O O
fishes O O O O
may O O O O
experience O O O O
modifications O O O O
under O O O O
the O O O O
influence O O O O
of O O O O
species O O O O
interactions O O O O
and O O O O
that O O O O
 O O O O
models O O O O
based O O O O
on O O O O
controlled O O O O
experiments O O O O
can O O O O
greatly O O O O
facilitate O O O O
the O O O O
deciphering O O O O
of O O O O
such O O O O
changes O O O O
in O O O O
niche O O O O
structure O O O O
. O O O O
    
Linking O O O O
disease O O O O
and O O O O
community O O O O
ecology O O O O
through O O O O
behavioural O O O O
indicators O O O O
: O O O O
immunochallenge O O O O
of O O O O
white B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
footed O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
mice O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
its O O O O
ecological O O O O
impacts O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Pathogens O O O O
and O O O O
immune O O O O
challenges O O O O
can O O O O
induce O O O O
changes O O O O
in O O O O
host O O O O
phenotype O O O O
in O O O O
ways O O O O
that O O O O
indirectly O O O O
impact O O O O
important O O O O
community O O O O
interactions O O O O
, O O O O
including O O O O
those O O O O
that O O O O
affect O O O O
host O O O O
- O O O O
pathogen O O O O
interactions O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
To O O O O
explore O O O O
host O O O O
behavioural O O O O
response O O O O
to O O O O
immune O O O O
challenge O O O O
, O O O O
we O O O O
exposed O O O O
wild O O O O
white B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
footed O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
mice O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Peromyscus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
leucopus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
to O O O O
an O O O O
immunogen O O O O
from O O O O
an O O O O
endemic O O O O
, O O O O
zoonotic O O O O
pathogen O O O O
, O O O O
the O O O O
spirochete O O O O
Borrelia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
burgdorferi O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
White B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
footed O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
mice O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
are O O O O
a O O O O
major O O O O
reservoir O O O O
host O O O O
of O O O O
Lyme O O O O
disease O O O O
( O O O O
LD O O O O
) O O O O
spirochetes O O O O
in O O O O
northeastern O O O O
USA O O O O
and O O O O
an O O O O
abundant O O O O
member O O O O
of O O O O
forest O O O O
communities O O O O
. O O O O
    
The O O O O
activity O O O O
patterns O O O O
, O O O O
foraging O O O O
behaviour O O O O
, O O O O
and O O O O
space O O O O
use O O O O
of O O O O
white B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
footed O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
mice O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
have O O O O
implications O O O O
for O O O O
population O O O O
growth O O O O
rates O O O O
of O O O O
community O O O O
members O O O O
upon O O O O
which O O O O
mice O O O O
incidentally O O O O
prey O O O O
( O O O O
i O O O O
. O O O O
e O O O O
. O O O O
gypsy O O O O
moths O O O O
and O O O O
native O O O O
thrushes O O O O
) O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
potentially O O O O
determining O O O O
host O O O O
- O O O O
vector O O O O
encounter O O O O
rates O O O O
and O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
risk O O O O
of O O O O
LD O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Immunochallenge O O O O
led O O O O
to O O O O
specific O O O O
humoral O O O O
( O O O O
antibody O O O O
) O O O O
and O O O O
cellular O O O O
( O O O O
i O O O O
. O O O O
e O O O O
. O O O O
elevated O O O O
neutrophils O O O O
and O O O O
eosinophils O O O O
) O O O O
immune O O O O
responses O O O O
, O O O O
supporting O O O O
use O O O O
of O O O O
the O O O O
immunogen O O O O
as O O O O
a O O O O
surrogate O O O O
for O O O O
pathogenic O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Immunochallenged O O O O
mice O O O O
had O O O O
reduced O O O O
wheel O O O O
- O O O O
running O O O O
activity O O O O
early O O O O
in O O O O
the O O O O
night O O O O
when O O O O
measured O O O O
in O O O O
the O O O O
lab O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
mouse O O O O
activity O O O O
, O O O O
as O O O O
measured O O O O
by O O O O
track O O O O
plates O O O O
in O O O O
natural O O O O
field O O O O
experiments O O O O
, O O O O
did O O O O
not O O O O
differ O O O O
between O O O O
mice O O O O
exposed O O O O
to O O O O
the O O O O
immunogen O O O O
and O O O O
unexposed O O O O
mice O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Foraging O O O O
behaviour O O O O
of O O O O
wild O O O O
mice O O O O
in O O O O
the O O O O
field O O O O
- O O O O
assessed O O O O
with O O O O
giving O O O O
- O O O O
up O O O O
densities O O O O
of O O O O
seed O O O O
at O O O O
artificial O O O O
feeding O O O O
stations O O O O
- O O O O
was O O O O
affected O O O O
by O O O O
exposure O O O O
to O O O O
the O O O O
immunogen O O O O
. O O O O
    
Whereas O O O O
immunochallenge O O O O
did O O O O
not O O O O
influence O O O O
whether O O O O
foraging O O O O
mice O O O O
gained O O O O
information O O O O
on O O O O
patch O O O O
quality O O O O
while O O O O
foraging O O O O
, O O O O
it O O O O
led O O O O
to O O O O
reductions O O O O
in O O O O
predator O O O O
avoidance O O O O
during O O O O
foraging O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
the O O O O
proportion O O O O
of O O O O
space O O O O
used O O O O
by O O O O
foraging O O O O
mice O O O O
may O O O O
be O O O O
greater O O O O
as O O O O
a O O O O
result O O O O
of O O O O
immunochallenge O O O O
. O O O O
    
This O O O O
increased O O O O
space O O O O
use O O O O
is O O O O
predicted O O O O
to O O O O
increase O O O O
encounter O O O O
rates O O O O
with O O O O
patchily O O O O
distributed O O O O
LD O O O O
vectors O O O O
( O O O O
ticks O O O O
) O O O O
and O O O O
with O O O O
incidental O O O O
prey O O O O
items O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
immunochallenge O O O O
in O O O O
white B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
footed O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
mice O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
potentially O O O O
pathogenic O O O O
infection O O O O
, O O O O
have O O O O
the O O O O
potential O O O O
to O O O O
indirectly O O O O
impact O O O O
community O O O O
interactions O O O O
, O O O O
including O O O O
those O O O O
important O O O O
for O O O O
pathogen O O O O
transmission O O O O
. O O O O
    
Amino O O O O
acid O O O O
divergence O O O O
between O O O O
the O O O O
CHS O O O O
domain O O O O
contributes O O O O
to O O O O
the O O O O
different O O O O
intracellular O O O O
behaviour O O O O
of O O O O
Family O O O O
II O O O O
fungal O O O O
chitin O O O O
synthases O O O O
in O O O O
Saccharomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cerevisiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Family O O O O
II O O O O
chitin O O O O
synthases O O O O
( O O O O
CS O O O O
) O O O O
, O O O O
including O O O O
classes O O O O
IV O O O O
and O O O O
V O O O O
enzymes O O O O
, O O O O
share O O O O
conserved O O O O
catalytic O O O O
domains O O O O
flanked O O O O
by O O O O
transmembrane O O O O
regions O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
addressed O O O O
the O O O O
characterization O O O O
of O O O O
Family O O O O
II O O O O
fungal O O O O
CSs O O O O
by O O O O
heterologous O O O O
expression O O O O
in O O O O
Saccharomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cerevisiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Full O O O O
- O O O O
length O O O O
CSs O O O O
from O O O O
classes O O O O
V O O O O
or O O O O
IV O O O O
were O O O O
not O O O O
functional O O O O
when O O O O
expressed O O O O
in O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cerevisiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
accumulated O O O O
in O O O O
different O O O O
intracellular O O O O
compartments O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
exchange O O O O
between O O O O
different O O O O
class O O O O
IV O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
of O O O O
class O O O O
V O O O O
, O O O O
CHS O O O O
domains O O O O
resulted O O O O
in O O O O
functional O O O O
proteins O O O O
both O O O O
in O O O O
vivo O O O O
and O O O O
in O O O O
vitro O O O O
. O O O O
    
The O O O O
different O O O O
domains O O O O
afford O O O O
the O O O O
chimeric O O O O
proteins O O O O
distinct O O O O
intracellular O O O O
behaviours O O O O
, O O O O
ranging O O O O
from O O O O
endoplasmic O O O O
reticulum O O O O
retention O O O O
to O O O O
reduced O O O O
endocytic O O O O
turnover O O O O
at O O O O
the O O O O
plasma O O O O
membrane O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
allow O O O O
a O O O O
role O O O O
in O O O O
chitin O O O O
synthesis O O O O
to O O O O
be O O O O
assigned O O O O
to O O O O
all O O O O
class O O O O
IV O O O O
enzymes O O O O
, O O O O
but O O O O
they O O O O
also O O O O
highlight O O O O
the O O O O
involvement O O O O
of O O O O
the O O O O
intracellular O O O O
globular O O O O
domain O O O O
of O O O O
these O O O O
CSs O O O O
, O O O O
not O O O O
only O O O O
in O O O O
enzymatic O O O O
activity O O O O
but O O O O
also O O O O
in O O O O
the O O O O
regulation O O O O
of O O O O
their O O O O
intracellular O O O O
turnover O O O O
. O O O O
    
Activation O O O O
of O O O O
the O O O O
heat O O O O
shock O O O O
transcription O O O O
factor O O O O
Hsf1 O O O O
is O O O O
essential O O O O
for O O O O
the O O O O
full O O O O
virulence O O O O
of O O O O
the O O O O
fungal O O O O
pathogen O O O O
Candida B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
evolutionarily O O O O
conserved O O O O
heat O O O O
shock O O O O
transcription O O O O
factor O O O O
Hsf1 O O O O
plays O O O O
a O O O O
central O O O O
role O O O O
in O O O O
thermal O O O O
adaptation O O O O
in O O O O
the O O O O
major O O O O
fungal O O O O
pathogen O O O O
of O O O O
humans B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
Candida B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Hsf1 O O O O
becomes O O O O
hyperphosphorylated O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
heat O O O O
shock O O O O
and O O O O
activates O O O O
the O O O O
transcription O O O O
of O O O O
genes O O O O
with O O O O
heat O O O O
shock O O O O
elements O O O O
( O O O O
HSEs O O O O
) O O O O
in O O O O
their O O O O
promoters O O O O
, O O O O
these O O O O
genes O O O O
contributing O O O O
to O O O O
thermal O O O O
adaptation O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
relevance O O O O
of O O O O
Hsf1 O O O O
activation O O O O
to O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virulence O O O O
is O O O O
not O O O O
clear O O O O
as O O O O
this O O O O
pathogen O O O O
is O O O O
thought O O O O
to O O O O
be O O O O
obligately O O O O
associated O O O O
with O O O O
warm O O O O
blooded O O O O
animals O O O O
, O O O O
and O O O O
this O O O O
issue O O O O
has O O O O
not O O O O
been O O O O
tested O O O O
because O O O O
HSF1 O O O O
is O O O O
essential O O O O
for O O O O
viability O O O O
in O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
the O O O O
HSE O O O O
regulon O O O O
is O O O O
active O O O O
in O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cells O O O O
infecting O O O O
the O O O O
kidney O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
show O O O O
the O O O O
CE2 O O O O
region O O O O
of O O O O
Hsf1 O O O O
is O O O O
required O O O O
for O O O O
activation O O O O
and O O O O
that O O O O
the O O O O
phosphorylation O O O O
of O O O O
specific O O O O
residues O O O O
in O O O O
this O O O O
domain O O O O
contributes O O O O
to O O O O
Hsf1 O O O O
activation O O O O
. O O O O
    
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
HSF1 O O O O
mutants O O O O
that O O O O
lack O O O O
this O O O O
CE2 O O O O
region O O O O
are O O O O
viable O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
they O O O O
are O O O O
unable O O O O
to O O O O
activate O O O O
HSE O O O O
- O O O O
containing O O O O
genes O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
heat O O O O
shock O O O O
, O O O O
and O O O O
they O O O O
are O O O O
thermosensitive O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
this O O O O
HSF1 O O O O
CE2 O O O O
deletion O O O O
mutant O O O O
we O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
Hsf1 O O O O
activation O O O O
, O O O O
and O O O O
hence O O O O
thermal O O O O
adaptation O O O O
, O O O O
contributes O O O O
significantly O O O O
to O O O O
the O O O O
virulence O O O O
of O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Early O O O O
response O O O O
of O O O O
plant O O O O
cell O O O O
to O O O O
carbon O O O O
deprivation O O O O
: O O O O
in O O O O
vivo O O O O
31P O O O O
- O O O O
NMR O O O O
spectroscopy O O O O
shows O O O O
a O O O O
quasi O O O O
- O O O O
instantaneous O O O O
disruption O O O O
on O O O O
cytosolic O O O O
sugars O O O O
, O O O O
phosphorylated O O O O
intermediates O O O O
of O O O O
energy O O O O
metabolism O O O O
, O O O O
phosphate O O O O
partitioning O O O O
, O O O O
and O O O O
intracellular O O O O
pHs O O O O
. O O O O
    
* O O O O
In O O O O
plant O O O O
cells O O O O
, O O O O
sugar O O O O
starvation O O O O
triggers O O O O
a O O O O
cascade O O O O
of O O O O
effects O O O O
at O O O O
the O O O O
scale O O O O
of O O O O
1 O O O O
- O O O O
2 O O O O
days O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
very O O O O
early O O O O
metabolic O O O O
response O O O O
has O O O O
not O O O O
yet O O O O
been O O O O
investigated O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Soluble O O O O
phosphorus O O O O
( O O O O
P O O O O
) O O O O
compounds O O O O
and O O O O
intracellular O O O O
pHs O O O O
were O O O O
analysed O O O O
each O O O O
2 O O O O
. O O O O
5 O O O O
min O O O O
intervals O O O O
in O O O O
heterotrophic O O O O
sycamore B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
Acer B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pseudoplatanus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
cells O O O O
using O O O O
in O O O O
vivo O O O O
phosphorus O O O O
nuclear O O O O
magnetic O O O O
resonance O O O O
( O O O O
( O O O O
31 O O O O
) O O O O
P O O O O
- O O O O
NMR O O O O
) O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Upon O O O O
external O O O O
- O O O O
sugar O O O O
withdrawal O O O O
, O O O O
the O O O O
glucose O O O O
6 O O O O
- O O O O
P O O O O
concentration O O O O
dropped O O O O
in O O O O
the O O O O
cytosol O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
in O O O O
plastids O O O O
. O O O O
    
The O O O O
released O O O O
inorganic O O O O
phosphate O O O O
( O O O O
Pi O O O O
) O O O O
accumulated O O O O
transiently O O O O
in O O O O
the O O O O
cytosol O O O O
before O O O O
influx O O O O
into O O O O
the O O O O
vacuole O O O O
; O O O O
nucleotide O O O O
triphosphate O O O O
concentration O O O O
doubled O O O O
, O O O O
intracellular O O O O
pH O O O O
increased O O O O
and O O O O
cell O O O O
respiration O O O O
decreased O O O O
. O O O O
    
It O O O O
was O O O O
deduced O O O O
that O O O O
the O O O O
cytosolic O O O O
free O O O O
- O O O O
sugar O O O O
concentration O O O O
was O O O O
low O O O O
, O O O O
corresponding O O O O
to O O O O
only O O O O
0 O O O O
. O O O O
5 O O O O
mM O O O O
sucrose O O O O
in O O O O
sugar O O O O
- O O O O
supplied O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
* O O O O
The O O O O
release O O O O
of O O O O
sugar O O O O
from O O O O
the O O O O
vacuole O O O O
and O O O O
from O O O O
plastids O O O O
is O O O O
insufficient O O O O
to O O O O
fully O O O O
sustain O O O O
the O O O O
cell O O O O
metabolism O O O O
during O O O O
starvation O O O O
, O O O O
particularly O O O O
in O O O O
the O O O O
very O O O O
short O O O O
term O O O O
. O O O O
    
Similarly O O O O
to O O O O
Pi O O O O
- O O O O
starvation O O O O
, O O O O
the O O O O
cell O O O O
' O O O O
s O O O O
first O O O O
response O O O O
to O O O O
sugar O O O O
starvation O O O O
occurs O O O O
in O O O O
the O O O O
cytosol O O O O
and O O O O
is O O O O
of O O O O
a O O O O
metabolic O O O O
nature O O O O
. O O O O
    
Unlike O O O O
the O O O O
cytoplasm O O O O
, O O O O
cytosolic O O O O
homeostasis O O O O
is O O O O
not O O O O
maintained O O O O
during O O O O
starvation O O O O
. O O O O
    
The O O O O
important O O O O
metabolic O O O O
changes O O O O
following O O O O
cytosolic O O O O
sugar O O O O
exhaustion O O O O
deliver O O O O
early O O O O
endogenous O O O O
signals O O O O
that O O O O
may O O O O
contribute O O O O
to O O O O
trigger O O O O
rescue O O O O
metabolism O O O O
. O O O O
    
Habitat O O O O
contrasts O O O O
reveal O O O O
a O O O O
shift O O O O
in O O O O
the O O O O
trophic O O O O
position O O O O
of O O O O
ant O O O O
assemblages O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Trophic O O O O
structure O O O O
within O O O O
a O O O O
guild O O O O
can O O O O
be O O O O
influenced O O O O
by O O O O
factors O O O O
such O O O O
as O O O O
resource O O O O
availability O O O O
and O O O O
competition O O O O
. O O O O
    
While O O O O
ants O O O O
occupy O O O O
a O O O O
wide O O O O
range O O O O
of O O O O
positions O O O O
in O O O O
food O O O O
webs O O O O
, O O O O
and O O O O
ant O O O O
community O O O O
composition O O O O
changes O O O O
with O O O O
habitat O O O O
, O O O O
it O O O O
is O O O O
not O O O O
well O O O O
understood O O O O
if O O O O
ant O O O O
genera O O O O
tend O O O O
to O O O O
maintain O O O O
their O O O O
position O O O O
in O O O O
the O O O O
trophic O O O O
structure O O O O
, O O O O
or O O O O
if O O O O
trophic O O O O
position O O O O
varies O O O O
across O O O O
habitats O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
used O O O O
ratios O O O O
of O O O O
stable O O O O
isotopes O O O O
of O O O O
carbon O O O O
and O O O O
nitrogen O O O O
to O O O O
test O O O O
for O O O O
differences O O O O
in O O O O
the O O O O
trophic O O O O
structure O O O O
and O O O O
position O O O O
of O O O O
assemblages O O O O
of O O O O
ants O O O O
among O O O O
habitat O O O O
types O O O O
. O O O O
    
We O O O O
tested O O O O
for O O O O
differences O O O O
between O O O O
assemblages O O O O
in O O O O
replicate O O O O
sites O O O O
of O O O O
the O O O O
land O O O O
use O O O O
categories O O O O
: O O O O
( O O O O
i O O O O
) O O O O
pastures O O O O
with O O O O
old O O O O
large O O O O
trees O O O O
; O O O O
( O O O O
ii O O O O
) O O O O
recently O O O O
revegetated O O O O
pastures O O O O
with O O O O
small O O O O
young O O O O
trees O O O O
; O O O O
and O O O O
( O O O O
iii O O O O
) O O O O
remnant O O O O
woodlands O O O O
. O O O O
    
Known O O O O
insect O O O O
herbivores O O O O
and O O O O
predatory O O O O
spiders O O O O
provided O O O O
baselines O O O O
for O O O O
herbivorous O O O O
and O O O O
predaceous O O O O
arthropods O O O O
. O O O O
    
Soil O O O O
samples O O O O
were O O O O
used O O O O
to O O O O
correct O O O O
for O O O O
the O O O O
base O O O O
level O O O O
of O O O O
isotopic O O O O
enrichment O O O O
at O O O O
each O O O O
site O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
no O O O O
significant O O O O
interactions O O O O
between O O O O
land O O O O
use O O O O
and O O O O
ant O O O O
genus O O O O
for O O O O
isotope O O O O
enrichment O O O O
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
trophic O O O O
structure O O O O
is O O O O
conserved O O O O
across O O O O
land O O O O
use O O O O
categories O O O O
. O O O O
    
The O O O O
fixed O O O O
relative O O O O
positions O O O O
of O O O O
genera O O O O
in O O O O
the O O O O
trophic O O O O
structure O O O O
might O O O O
be O O O O
re O O O O
- O O O O
enforced O O O O
by O O O O
competition O O O O
or O O O O
some O O O O
other O O O O
factor O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
entire O O O O
ant O O O O
assemblage O O O O
had O O O O
significantly O O O O
lower O O O O
delta O O O O
( O O O O
15 O O O O
) O O O O
N O O O O
values O O O O
in O O O O
revegetated O O O O
sites O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
ants O O O O
feed O O O O
lower O O O O
down O O O O
in O O O O
the O O O O
food O O O O
chain O O O O
i O O O O
. O O O O
e O O O O
. O O O O
they O O O O
are O O O O
more O O O O
' O O O O
herbivorous O O O O
' O O O O
in O O O O
revegetated O O O O
sites O O O O
. O O O O
    
This O O O O
may O O O O
be O O O O
a O O O O
result O O O O
of O O O O
the O O O O
high O O O O
availability O O O O
of O O O O
plant O O O O
sugars O O O O
, O O O O
honeydew O O O O
and O O O O
herbivorous O O O O
arthropod O O O O
prey O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Surprisingly O O O O
, O O O O
ants O O O O
in O O O O
remnants O O O O
and O O O O
pastures O O O O
with O O O O
trees O O O O
displayed O O O O
similar O O O O
isotopic O O O O
compositions O O O O
. O O O O
    
Interactions O O O O
within O O O O
ant O O O O
assemblages O O O O
are O O O O
thus O O O O
likely O O O O
to O O O O
be O O O O
resilient O O O O
to O O O O
changes O O O O
in O O O O
land O O O O
use O O O O
, O O O O
but O O O O
ant O O O O
diets O O O O
in O O O O
early O O O O
successional O O O O
habitats O O O O
may O O O O
reflect O O O O
the O O O O
simplicity O O O O
of O O O O
communities O O O O
, O O O O
which O O O O
may O O O O
have O O O O
comparatively O O O O
lower O O O O
rates O O O O
of O O O O
saprophagy O O O O
and O O O O
predation O O O O
. O O O O
    
Hypoxia O O O O
responsive O O O O
gene O O O O
expression O O O O
is O O O O
mediated O O O O
by O O O O
various O O O O
subsets O O O O
of O O O O
transcription O O O O
factors O O O O
and O O O O
miRNAs O O O O
that O O O O
are O O O O
determined O O O O
by O O O O
the O O O O
actual O O O O
oxygen O O O O
availability O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Reduced O O O O
oxygen O O O O
availability O O O O
is O O O O
not O O O O
only O O O O
associated O O O O
with O O O O
flooding O O O O
, O O O O
but O O O O
occurs O O O O
also O O O O
during O O O O
growth O O O O
and O O O O
development O O O O
. O O O O
    
It O O O O
is O O O O
largely O O O O
unknown O O O O
how O O O O
hypoxia O O O O
is O O O O
perceived O O O O
and O O O O
what O O O O
signaling O O O O
cascade O O O O
is O O O O
involved O O O O
in O O O O
activating O O O O
adaptive O O O O
responses O O O O
. O O O O
    
* O O O O
We O O O O
analysed O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
over O O O O
1900 O O O O
transcription O O O O
factors O O O O
( O O O O
TFs O O O O
) O O O O
and O O O O
180 O O O O
microRNA O O O O
primary O O O O
transcripts O O O O
( O O O O
pri O O O O
- O O O O
miRNAs O O O O
) O O O O
in O O O O
Arabidopsis O O O O
roots O O O O
exposed O O O O
to O O O O
different O O O O
hypoxic O O O O
conditions O O O O
by O O O O
means O O O O
of O O O O
quantitative O O O O
PCR O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
analysed O O O O
the O O O O
promoters O O O O
of O O O O
genes O O O O
induced O O O O
by O O O O
hypoxia O O O O
with O O O O
respect O O O O
to O O O O
over O O O O
- O O O O
represented O O O O
DNA O O O O
elements O O O O
that O O O O
can O O O O
act O O O O
as O O O O
potential O O O O
TF O O O O
binding O O O O
sites O O O O
and O O O O
their O O O O
in O O O O
vivo O O O O
interaction O O O O
was O O O O
verified O O O O
. O O O O
    
* O O O O
We O O O O
identified O O O O
various O O O O
subsets O O O O
of O O O O
TFs O O O O
that O O O O
responded O O O O
differentially O O O O
through O O O O
time O O O O
and O O O O
in O O O O
an O O O O
oxygen O O O O
concentration O O O O
- O O O O
dependent O O O O
manner O O O O
. O O O O
    
The O O O O
regulatory O O O O
potential O O O O
of O O O O
selected O O O O
TFs O O O O
and O O O O
their O O O O
predicted O O O O
DNA O O O O
binding O O O O
elements O O O O
was O O O O
validated O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
pri O O O O
- O O O O
miRNAs O O O O
was O O O O
differentially O O O O
regulated O O O O
under O O O O
hypoxia O O O O
, O O O O
only O O O O
one O O O O
corresponding O O O O
mature O O O O
miRNA O O O O
changed O O O O
accordingly O O O O
. O O O O
    
Putative O O O O
target O O O O
transcripts O O O O
of O O O O
the O O O O
miRNAs O O O O
were O O O O
not O O O O
significantly O O O O
affected O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Our O O O O
results O O O O
show O O O O
that O O O O
the O O O O
regulation O O O O
of O O O O
hypoxia O O O O
- O O O O
induced O O O O
genes O O O O
is O O O O
controlled O O O O
via O O O O
simultaneous O O O O
interaction O O O O
of O O O O
various O O O O
combinations O O O O
of O O O O
TFs O O O O
. O O O O
    
Under O O O O
anoxic O O O O
conditions O O O O
, O O O O
an O O O O
additional O O O O
set O O O O
of O O O O
TFs O O O O
is O O O O
induced O O O O
. O O O O
    
Regulation O O O O
of O O O O
gene O O O O
expression O O O O
via O O O O
miRNAs O O O O
appears O O O O
to O O O O
play O O O O
a O O O O
minor O O O O
role O O O O
during O O O O
hypoxia O O O O
. O O O O
    
Rarity O O O O
, O O O O
life O O O O
history O O O O
and O O O O
scaling O O O O
of O O O O
the O O O O
dynamics O O O O
in O O O O
time O O O O
and O O O O
space O O O O
of O O O O
British O O O O
birds O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Many O O O O
patterns O O O O
in O O O O
macroecology O O O O
are O O O O
closely O O O O
related O O O O
to O O O O
the O O O O
total O O O O
abundance O O O O
of O O O O
a O O O O
species O O O O
in O O O O
a O O O O
region O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
show O O O O
that O O O O
interspecific O O O O
differences O O O O
in O O O O
the O O O O
pattern O O O O
of O O O O
population O O O O
fluctuations O O O O
of O O O O
British O O O O
bird O O O O
species O O O O
can O O O O
be O O O O
predicted O O O O
from O O O O
knowledge O O O O
of O O O O
their O O O O
overall O O O O
abundance O O O O
and O O O O
some O O O O
basic O O O O
life O O O O
- O O O O
history O O O O
characteristics O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
identify O O O O
a O O O O
rarity O O O O
syndrome O O O O
that O O O O
arises O O O O
through O O O O
an O O O O
increased O O O O
stochastic O O O O
influence O O O O
on O O O O
population O O O O
fluctuations O O O O
with O O O O
decreasing O O O O
population O O O O
size O O O O
, O O O O
mainly O O O O
resulting O O O O
from O O O O
an O O O O
inverse O O O O
density O O O O
- O O O O
dependent O O O O
effect O O O O
of O O O O
demographic O O O O
stochasticity O O O O
. O O O O
    
This O O O O
syndrome O O O O
involves O O O O
an O O O O
increase O O O O
in O O O O
the O O O O
annual O O O O
changes O O O O
in O O O O
population O O O O
size O O O O
with O O O O
increasing O O O O
rarity O O O O
in O O O O
the O O O O
United O O O O
Kingdom O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
relationship O O O O
between O O O O
the O O O O
magnitude O O O O
of O O O O
temporal O O O O
variation O O O O
and O O O O
local O O O O
mean O O O O
population O O O O
size O O O O
differs O O O O
between O O O O
species O O O O
dependent O O O O
on O O O O
their O O O O
life O O O O
history O O O O
, O O O O
i O O O O
. O O O O
e O O O O
. O O O O
species O O O O
with O O O O
larger O O O O
clutch O O O O
size O O O O
and O O O O
lower O O O O
survival O O O O
tended O O O O
to O O O O
have O O O O
larger O O O O
annual O O O O
changes O O O O
in O O O O
population O O O O
size O O O O
than O O O O
low O O O O
- O O O O
reproducing O O O O
long O O O O
- O O O O
lived O O O O
species O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
probability O O O O
of O O O O
local O O O O
disappearance O O O O
from O O O O
a O O O O
study O O O O
plot O O O O
depended O O O O
on O O O O
the O O O O
population O O O O
size O O O O
and O O O O
was O O O O
hence O O O O
closely O O O O
related O O O O
to O O O O
the O O O O
overall O O O O
abundance O O O O
of O O O O
the O O O O
species O O O O
in O O O O
UK O O O O
. O O O O
    
For O O O O
a O O O O
given O O O O
population O O O O
size O O O O
, O O O O
this O O O O
probability O O O O
was O O O O
also O O O O
related O O O O
to O O O O
species O O O O
- O O O O
specific O O O O
life O O O O
- O O O O
history O O O O
characteristics O O O O
, O O O O
being O O O O
higher O O O O
in O O O O
species O O O O
with O O O O
larger O O O O
clutch O O O O
sizes O O O O
and O O O O
smaller O O O O
survival O O O O
rates O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Rareness O O O O
results O O O O
in O O O O
a O O O O
spatial O O O O
decoupling O O O O
of O O O O
the O O O O
temporal O O O O
variation O O O O
in O O O O
population O O O O
size O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
These O O O O
patterns O O O O
show O O O O
that O O O O
once O O O O
a O O O O
species O O O O
has O O O O
become O O O O
rare O O O O
, O O O O
e O O O O
. O O O O
g O O O O
. O O O O
due O O O O
to O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
activities O O O O
, O O O O
key O O O O
population O O O O
dynamical O O O O
characteristics O O O O
will O O O O
change O O O O
because O O O O
of O O O O
density O O O O
- O O O O
dependent O O O O
stochastic O O O O
effects O O O O
, O O O O
which O O O O
in O O O O
turn O O O O
are O O O O
dependent O O O O
on O O O O
species O O O O
- O O O O
specific O O O O
life O O O O
- O O O O
history O O O O
characteristics O O O O
. O O O O
    
Mannitol O O O O
permeation O O O O
and O O O O
radial O O O O
flow O O O O
of O O O O
water O O O O
in O O O O
maize B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
roots O O O O
. O O O O
    
* O O O O
The O O O O
postulated O O O O
nonselective O O O O
hydraulic O O O O
route O O O O
through O O O O
the O O O O
root O O O O
apoplast O O O O
has O O O O
not O O O O
yet O O O O
been O O O O
supported O O O O
by O O O O
experimental O O O O
findings O O O O
on O O O O
solvent O O O O
drag O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Therefore O O O O
, O O O O
mannitol O O O O
transport O O O O
from O O O O
the O O O O
medium O O O O
to O O O O
the O O O O
shoot O O O O
of O O O O
young O O O O
maize B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
plants O O O O
was O O O O
studied O O O O
at O O O O
different O O O O
rates O O O O
of O O O O
transpiration O O O O
in O O O O
hydroculture O O O O
. O O O O
    
The O O O O
concentration O O O O
of O O O O
mannitol O O O O
was O O O O
determined O O O O
by O O O O
gas O O O O
chromatography O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Mannitol O O O O
utilization O O O O
in O O O O
shoot O O O O
metabolism O O O O
was O O O O
not O O O O
detectable O O O O
. O O O O
    
Experiments O O O O
with O O O O
exuding O O O O
roots O O O O
showed O O O O
that O O O O
the O O O O
radial O O O O
transport O O O O
of O O O O
mannitol O O O O
was O O O O
mainly O O O O
apoplastic O O O O
. O O O O
    
The O O O O
ratio O O O O
alpha O O O O
between O O O O
the O O O O
mannitol O O O O
concentration O O O O
in O O O O
xylem O O O O
vessels O O O O
and O O O O
that O O O O
of O O O O
the O O O O
external O O O O
medium O O O O
was O O O O
calculated O O O O
from O O O O
mannitol O O O O
translocation O O O O
to O O O O
the O O O O
shoot O O O O
or O O O O
measurement O O O O
of O O O O
the O O O O
mannitol O O O O
concentration O O O O
in O O O O
the O O O O
root O O O O
exudate O O O O
, O O O O
where O O O O
it O O O O
reached O O O O
c O O O O
. O O O O
    
0 O O O O
. O O O O
07 O O O O
in O O O O
the O O O O
steady O O O O
state O O O O
. O O O O
    
In O O O O
transpiring O O O O
plants O O O O
, O O O O
alpha O O O O
decreased O O O O
with O O O O
increasing O O O O
water O O O O
flux O O O O
from O O O O
0 O O O O
. O O O O
04 O O O O
to O O O O
values O O O O
below O O O O
0 O O O O
. O O O O
01 O O O O
. O O O O
    
These O O O O
findings O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
the O O O O
root O O O O
reflection O O O O
coefficient O O O O
for O O O O
mannitol O O O O
is O O O O
above O O O O
0 O O O O
. O O O O
99 O O O O
. O O O O
    
* O O O O
It O O O O
is O O O O
concluded O O O O
that O O O O
the O O O O
radial O O O O
movement O O O O
of O O O O
water O O O O
to O O O O
the O O O O
vessels O O O O
is O O O O
under O O O O
complete O O O O
protoplastic O O O O
control O O O O
, O O O O
whereas O O O O
solutes O O O O
can O O O O
diffuse O O O O
on O O O O
an O O O O
apoplastic O O O O
path O O O O
. O O O O
    
The O O O O
absence O O O O
of O O O O
a O O O O
significant O O O O
volume O O O O
flux O O O O
through O O O O
the O O O O
root O O O O
apoplast O O O O
is O O O O
of O O O O
physiological O O O O
importance O O O O
as O O O O
it O O O O
prevents O O O O
the O O O O
coupling O O O O
of O O O O
the O O O O
apoplastic O O O O
permeation O O O O
of O O O O
ballast O O O O
solutes O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
NaCl O O O O
, O O O O
to O O O O
transpiration O O O O
. O O O O
    
Genomic O O O O
evidence O O O O
of O O O O
repeat O O O O
- O O O O
induced O O O O
point O O O O
mutation O O O O
( O O O O
RIP O O O O
) O O O O
in O O O O
filamentous O O O O
ascomycetes O O O O
. O O O O
    
The O O O O
genomes O O O O
of O O O O
49 O O O O
filamentous O O O O
ascomycetes O O O O
( O O O O
subphylum O O O O
Pezizomycotina O O O O
) O O O O
were O O O O
examined O O O O
by O O O O
two O O O O
independent O O O O
methods O O O O
for O O O O
evidence O O O O
of O O O O
multiple O O O O
C O O O O
- O O O O
> O O O O
T O O O O
transitions O O O O
typical O O O O
of O O O O
RIP O O O O
. O O O O
    
At O O O O
least O O O O
one O O O O
transposable O O O O
element O O O O
or O O O O
other O O O O
repeat O O O O
family O O O O
was O O O O
identified O O O O
in O O O O
each O O O O
genome O O O O
, O O O O
and O O O O
members O O O O
were O O O O
assessed O O O O
for O O O O
transition O O O O
and O O O O
transversion O O O O
mutations O O O O
relative O O O O
to O O O O
a O O O O
model O O O O
of O O O O
their O O O O
intact O O O O
progenitor O O O O
. O O O O
    
Occurrence O O O O
of O O O O
RIP O O O O
was O O O O
indicated O O O O
where O O O O
family O O O O
members O O O O
differed O O O O
by O O O O
excess O O O O
of O O O O
directional O O O O
transitions O O O O
over O O O O
transversions O O O O
. O O O O
    
Transition O O O O
mutations O O O O
were O O O O
quantified O O O O
by O O O O
an O O O O
algorithm O O O O
taking O O O O
double O O O O
mutations O O O O
in O O O O
CpG O O O O
and O O O O
CpC O O O O
dinucleotides O O O O
into O O O O
account O O O O
. O O O O
    
A O O O O
second O O O O
method O O O O
assessed O O O O
dinucleotide O O O O
frequency O O O O
distribution O O O O
anomalies O O O O
in O O O O
whole O O O O
genomes O O O O
, O O O O
a O O O O
procedure O O O O
that O O O O
allowed O O O O
quantification O O O O
of O O O O
fractions O O O O
of O O O O
the O O O O
non O O O O
- O O O O
coding O O O O
genome O O O O
that O O O O
had O O O O
been O O O O
subject O O O O
to O O O O
extensive O O O O
directional O O O O
mutation O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
of O O O O
both O O O O
methods O O O O
revealed O O O O
that O O O O
RIP O O O O
- O O O O
like O O O O
activity O O O O
varied O O O O
greatly O O O O
, O O O O
both O O O O
in O O O O
extent O O O O
of O O O O
mutation O O O O
and O O O O
in O O O O
dinucleotide O O O O
context O O O O
for O O O O
C O O O O
- O O O O
> O O O O
T O O O O
transitions O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
most O O O O
extreme O O O O
case O O O O
, O O O O
75 O O O O
% O O O O
of O O O O
a O O O O
Blastomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
dermatitidis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
genome O O O O
had O O O O
suffered O O O O
conspicuous O O O O
GC O O O O
- O O O O
depletion O O O O
, O O O O
all O O O O
of O O O O
it O O O O
in O O O O
the O O O O
non O O O O
- O O O O
coding O O O O
fraction O O O O
. O O O O
    
Many O O O O
genomes O O O O
carried O O O O
both O O O O
intact O O O O
repeats O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
others O O O O
that O O O O
had O O O O
suffered O O O O
heavily O O O O
from O O O O
transitions O O O O
. O O O O
    
Only O O O O
one O O O O
species O O O O
, O O O O
Chaetomium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
globosum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
showed O O O O
no O O O O
evidence O O O O
of O O O O
directional O O O O
mutation O O O O
. O O O O
    
Accelerometry O O O O
estimates O O O O
field O O O O
metabolic O O O O
rate O O O O
in O O O O
giant B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
Australian O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cuttlefish O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Sepia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
apama O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
during O O O O
breeding O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Estimating O O O O
the O O O O
metabolic O O O O
rate O O O O
of O O O O
animals O O O O
in O O O O
nature O O O O
is O O O O
central O O O O
to O O O O
understanding O O O O
the O O O O
physiological O O O O
, O O O O
behavioural O O O O
and O O O O
evolutionary O O O O
ecology O O O O
of O O O O
animals O O O O
. O O O O
    
Doubly O O O O
labelled O O O O
water O O O O
and O O O O
heart O O O O
- O O O O
rate O O O O
methods O O O O
are O O O O
the O O O O
most O O O O
commonly O O O O
used O O O O
approaches O O O O
, O O O O
but O O O O
both O O O O
have O O O O
limitations O O O O
that O O O O
preclude O O O O
their O O O O
application O O O O
to O O O O
some O O O O
systems O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Accelerometry O O O O
has O O O O
emerged O O O O
as O O O O
a O O O O
powerful O O O O
tool O O O O
for O O O O
estimating O O O O
energy O O O O
expenditure O O O O
in O O O O
a O O O O
range O O O O
of O O O O
animals O O O O
, O O O O
but O O O O
is O O O O
yet O O O O
to O O O O
be O O O O
used O O O O
to O O O O
estimate O O O O
field O O O O
metabolic O O O O
rate O O O O
in O O O O
aquatic O O O O
taxa O O O O
. O O O O
    
We O O O O
combined O O O O
two O O O O
- O O O O
dimensional O O O O
accelerometry O O O O
and O O O O
swim O O O O
- O O O O
tunnel O O O O
respirometry O O O O
to O O O O
estimate O O O O
patterns O O O O
of O O O O
energy O O O O
expenditure O O O O
in O O O O
giant B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
Australian O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cuttlefish O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Sepia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
apama O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
during O O O O
breeding O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
oxygen O O O O
consumption O O O O
rate O O O O
( O O O O
Vo2 O O O O
) O O O O
and O O O O
swimming O O O O
speed O O O O
showed O O O O
strong O O O O
positive O O O O
associations O O O O
with O O O O
body O O O O
acceleration O O O O
, O O O O
with O O O O
coefficients O O O O
of O O O O
determination O O O O
comparable O O O O
to O O O O
those O O O O
using O O O O
similar O O O O
accelerometers O O O O
on O O O O
terrestrial O O O O
vertebrates O O O O
. O O O O
    
Despite O O O O
increased O O O O
activity O O O O
during O O O O
the O O O O
day O O O O
, O O O O
field O O O O
metabolic O O O O
rate O O O O
rarely O O O O
approached O O O O
Vo2 O O O O
, O O O O
and O O O O
night O O O O
- O O O O
time O O O O
Vo2 O O O O
was O O O O
similar O O O O
to O O O O
that O O O O
at O O O O
rest O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
are O O O O
consistent O O O O
with O O O O
the O O O O
life O O O O
- O O O O
history O O O O
strategy O O O O
of O O O O
this O O O O
species O O O O
, O O O O
which O O O O
has O O O O
a O O O O
poor O O O O
capacity O O O O
to O O O O
exercise O O O O
anaerobically O O O O
, O O O O
and O O O O
a O O O O
mating O O O O
strategy O O O O
that O O O O
is O O O O
visually O O O O
based O O O O
. O O O O
    
With O O O O
the O O O O
logistical O O O O
difficulties O O O O
associated O O O O
with O O O O
observation O O O O
in O O O O
aquatic O O O O
environments O O O O
, O O O O
accelerometry O O O O
is O O O O
likely O O O O
to O O O O
prove O O O O
a O O O O
valuable O O O O
tool O O O O
for O O O O
estimating O O O O
energy O O O O
expenditure O O O O
in O O O O
aquatic O O O O
animals O O O O
. O O O O
    
Generation O O O O
of O O O O
Se O O O O
- O O O O
fortified O O O O
broccoli B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
as O O O O
functional O O O O
food O O O O
: O O O O
impact O O O O
of O O O O
Se O O O O
fertilization O O O O
on O O O O
S O O O O
metabolism O O O O
. O O O O
    
Selenium O O O O
( O O O O
Se O O O O
) O O O O
- O O O O
fortified O O O O
broccoli B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
Brassica B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
oleracea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
var O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
italica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
has O O O O
been O O O O
proposed O O O O
as O O O O
a O O O O
functional O O O O
food O O O O
for O O O O
cancer O O O O
prevention O O O O
, O O O O
based O O O O
on O O O O
its O O O O
high O O O O
glucosinolate O O O O
( O O O O
GSL O O O O
) O O O O
content O O O O
and O O O O
capacity O O O O
for O O O O
Se O O O O
accumulation O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
as O O O O
selenate O O O O
and O O O O
sulphate O O O O
share O O O O
the O O O O
initial O O O O
assimilation O O O O
route O O O O
, O O O O
Se O O O O
fertilization O O O O
could O O O O
interfere O O O O
with O O O O
sulphur O O O O
metabolism O O O O
and O O O O
plant O O O O
growth O O O O
. O O O O
    
Consequently O O O O
, O O O O
GSL O O O O
accumulation O O O O
could O O O O
be O O O O
compromised O O O O
. O O O O
    
To O O O O
evaluate O O O O
these O O O O
potentially O O O O
adverse O O O O
effects O O O O
of O O O O
Se O O O O
fertilization O O O O
, O O O O
we O O O O
performed O O O O
a O O O O
comprehensive O O O O
study O O O O
on O O O O
sand O O O O
- O O O O
grown O O O O
young O O O O
broccoli B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
plants O O O O
( O O O O
weekly O O O O
selenate O O O O
applications O O O O
of O O O O
0 O O O O
. O O O O
8 O O O O
mumol O O O O
plant O O O O
( O O O O
- O O O O
1 O O O O
) O O O O
via O O O O
the O O O O
root O O O O
) O O O O
and O O O O
field O O O O
- O O O O
grown O O O O
adult O O O O
broccoli B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
plants O O O O
during O O O O
head O O O O
formation O O O O
( O O O O
single O O O O
foliar O O O O
selenate O O O O
application O O O O
: O O O O
25 O O O O
. O O O O
3 O O O O
or O O O O
253 O O O O
mumol O O O O
plant O O O O
( O O O O
- O O O O
1 O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
show O O O O
that O O O O
under O O O O
these O O O O
conditions O O O O
, O O O O
Se O O O O
application O O O O
does O O O O
not O O O O
affect O O O O
plant O O O O
growth O O O O
, O O O O
contents O O O O
of O O O O
cysteine O O O O
, O O O O
glutathione O O O O
, O O O O
total O O O O
GSL O O O O
, O O O O
glucoraphanin O O O O
( O O O O
major O O O O
aliphatic O O O O
GSL O O O O
) O O O O
or O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
BoMYB28 O O O O
( O O O O
encoding O O O O
a O O O O
functionally O O O O
confirmed O O O O
master O O O O
regulator O O O O
for O O O O
aliphatic O O O O
GSL O O O O
biosynthesis O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Conversely O O O O
, O O O O
due O O O O
to O O O O
the O O O O
changed O O O O
expression O O O O
of O O O O
sulphate O O O O
transporters O O O O
( O O O O
BoSULTR1 O O O O
; O O O O
1 O O O O
, O O O O
1 O O O O
; O O O O
2 O O O O
, O O O O
2 O O O O
; O O O O
1 O O O O
, O O O O
and O O O O
2 O O O O
; O O O O
2 O O O O
) O O O O
, O O O O
sulphate O O O O
and O O O O
total O O O O
S O O O O
contents O O O O
increased O O O O
in O O O O
the O O O O
shoot O O O O
of O O O O
young O O O O
plants O O O O
while O O O O
decreasing O O O O
in O O O O
the O O O O
root O O O O
. O O O O
    
We O O O O
conclude O O O O
that O O O O
broccoli B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
can O O O O
be O O O O
fertilized O O O O
with O O O O
Se O O O O
without O O O O
reduction O O O O
in O O O O
GSL O O O O
content O O O O
, O O O O
even O O O O
with O O O O
Se O O O O
accumulation O O O O
exceeding O O O O
the O O O O
level O O O O
recommended O O O O
for O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
consumption O O O O
. O O O O
    
Arbuscular O O O O
mycorrhizal O O O O
hyphopodia O O O O
and O O O O
germinated O O O O
spore O O O O
exudates O O O O
trigger O O O O
Ca2 O O O O
+ O O O O
spiking O O O O
in O O O O
the O O O O
legume O O O O
and O O O O
nonlegume O O O O
root O O O O
epidermis O O O O
. O O O O
    
* O O O O
The O O O O
aim O O O O
of O O O O
this O O O O
study O O O O
was O O O O
to O O O O
investigate O O O O
Ca O O O O
( O O O O
2 O O O O
+ O O O O
) O O O O
responses O O O O
to O O O O
endosymbiotic O O O O
arbuscular O O O O
mycorrhizal O O O O
( O O O O
AM O O O O
) O O O O
fungi O O O O
in O O O O
the O O O O
host O O O O
root O O O O
epidermis O O O O
following O O O O
pre O O O O
- O O O O
infection O O O O
hyphopodium O O O O
formation O O O O
in O O O O
both O O O O
legumes O O O O
and O O O O
nonlegumes O O O O
, O O O O
and O O O O
to O O O O
determine O O O O
to O O O O
what O O O O
extent O O O O
these O O O O
responses O O O O
could O O O O
be O O O O
mimicked O O O O
by O O O O
germinated O O O O
fungal B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
spore O O O O
exudate O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Root O O O O
organ O O O O
cultures O O O O
of O O O O
both O O O O
Medicago B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
truncatula O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Daucus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
carota O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
expressing O O O O
the O O O O
nuclear O O O O
- O O O O
localized O O O O
cameleon O O O O
reporter O O O O
NupYC2 O O O O
. O O O O
1 O O O O
, O O O O
were O O O O
used O O O O
to O O O O
monitor O O O O
AM O O O O
- O O O O
elicited O O O O
Ca O O O O
( O O O O
2 O O O O
+ O O O O
) O O O O
responses O O O O
in O O O O
host O O O O
root O O O O
tissues O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Ca O O O O
( O O O O
2 O O O O
+ O O O O
) O O O O
spiking O O O O
was O O O O
observed O O O O
in O O O O
cells O O O O
contacted O O O O
by O O O O
AM O O O O
hyphopodia O O O O
for O O O O
both O O O O
hosts O O O O
, O O O O
with O O O O
highest O O O O
frequencies O O O O
correlating O O O O
with O O O O
the O O O O
epidermal O O O O
nucleus O O O O
positioned O O O O
facing O O O O
the O O O O
fungal O O O O
contact O O O O
site O O O O
. O O O O
    
Treatment O O O O
with O O O O
AM O O O O
spore O O O O
exudate O O O O
also O O O O
elicited O O O O
Ca O O O O
( O O O O
2 O O O O
+ O O O O
) O O O O
spiking O O O O
within O O O O
the O O O O
AM O O O O
- O O O O
responsive O O O O
zone O O O O
of O O O O
the O O O O
root O O O O
and O O O O
, O O O O
in O O O O
both O O O O
cases O O O O
, O O O O
spiking O O O O
was O O O O
dependent O O O O
on O O O O
the O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
truncatula O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
common O O O O
SYM O O O O
genes O O O O
DMI1 O O O O
/ O O O O
2 O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
on O O O O
the O O O O
rhizobial O O O O
Nod O O O O
factor O O O O
perception O O O O
gene O O O O
NFP O O O O
. O O O O
    
* O O O O
These O O O O
findings O O O O
support O O O O
the O O O O
conclusion O O O O
that O O O O
AM O O O O
fungal O O O O
root O O O O
penetration O O O O
is O O O O
preceded O O O O
by O O O O
a O O O O
SYM O O O O
pathway O O O O
- O O O O
dependent O O O O
oscillatory O O O O
Ca O O O O
( O O O O
2 O O O O
+ O O O O
) O O O O
response O O O O
, O O O O
whose O O O O
evolutionary O O O O
origin O O O O
predates O O O O
the O O O O
divergence O O O O
between O O O O
asterid O O O O
and O O O O
rosid O O O O
clades O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
further O O O O
show O O O O
that O O O O
fungal O O O O
symbiotic O O O O
signals O O O O
are O O O O
already O O O O
generated O O O O
during O O O O
spore O O O O
germination O O O O
, O O O O
and O O O O
that O O O O
cameleon O O O O
- O O O O
expressing O O O O
root O O O O
organ O O O O
cultures O O O O
represent O O O O
a O O O O
novel O O O O
AM O O O O
- O O O O
specific O O O O
bio O O O O
- O O O O
assay O O O O
for O O O O
such O O O O
signals O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Perigord B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
black O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
truffle O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
responds O O O O
to O O O O
cold O O O O
temperature O O O O
with O O O O
an O O O O
extensive O O O O
reprogramming O O O O
of O O O O
its O O O O
transcriptional O O O O
activity O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Tuber B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
melanosporum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
genome O O O O
has O O O O
been O O O O
analysed O O O O
with O O O O
the O O O O
aim O O O O
of O O O O
identifying O O O O
and O O O O
characterizing O O O O
the O O O O
genes O O O O
involved O O O O
in O O O O
the O O O O
environmental O O O O
stress O O O O
response O O O O
. O O O O
    
A O O O O
whole O O O O
genome O O O O
array O O O O
( O O O O
7496 O O O O
genes O O O O
/ O O O O
probe O O O O
) O O O O
was O O O O
used O O O O
to O O O O
verify O O O O
the O O O O
fungal O O O O
transcriptional O O O O
profiling O O O O
upon O O O O
a O O O O
cold O O O O
temperature O O O O
period O O O O
( O O O O
7 O O O O
days O O O O
at O O O O
4 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
) O O O O
. O O O O
    
A O O O O
total O O O O
of O O O O
423 O O O O
genes O O O O
resulted O O O O
to O O O O
be O O O O
differentially O O O O
expressed O O O O
in O O O O
a O O O O
significant O O O O
manner O O O O
( O O O O
> O O O O
2 O O O O
. O O O O
5 O O O O
- O O O O
fold O O O O
; O O O O
p O O O O
- O O O O
value O O O O
& O O O O
lt O O O O
; O O O O
0 O O O O
. O O O O
05 O O O O
) O O O O
in O O O O
the O O O O
mycelia O O O O
exposed O O O O
to O O O O
cold O O O O
, O O O O
compared O O O O
to O O O O
the O O O O
control O O O O
ones O O O O
: O O O O
187 O O O O
of O O O O
these O O O O
genes O O O O
were O O O O
up O O O O
- O O O O
regulated O O O O
, O O O O
while O O O O
236 O O O O
were O O O O
down O O O O
- O O O O
regulated O O O O
. O O O O
    
Sixty O O O O
- O O O O
six O O O O
and O O O O
fifty O O O O
- O O O O
one O O O O
percent O O O O
, O O O O
respectively O O O O
, O O O O
of O O O O
the O O O O
up O O O O
- O O O O
or O O O O
down O O O O
- O O O O
regulated O O O O
transcripts O O O O
had O O O O
no O O O O
KOG O O O O
classification O O O O
and O O O O
were O O O O
clustered O O O O
as O O O O
unclassified O O O O
proteins O O O O
, O O O O
which O O O O
was O O O O
the O O O O
most O O O O
abundant O O O O
category O O O O
in O O O O
the O O O O
both O O O O
up O O O O
- O O O O
and O O O O
down O O O O
- O O O O
regulated O O O O
genes O O O O
. O O O O
    
A O O O O
gene O O O O
subset O O O O
, O O O O
containing O O O O
a O O O O
range O O O O
of O O O O
biological O O O O
functions O O O O
, O O O O
was O O O O
chosen O O O O
to O O O O
validate O O O O
the O O O O
microarray O O O O
experiment O O O O
through O O O O
quantitative O O O O
real O O O O
time O O O O
PCR O O O O
( O O O O
qRT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
analysis O O O O
confirmed O O O O
the O O O O
array O O O O
data O O O O
for O O O O
16 O O O O
out O O O O
of O O O O
22 O O O O
of O O O O
the O O O O
considered O O O O
genes O O O O
, O O O O
confirming O O O O
that O O O O
a O O O O
cold O O O O
temperature O O O O
period O O O O
influences O O O O
the O O O O
truffle O O O O
global O O O O
gene O O O O
expression O O O O
. O O O O
    
The O O O O
expressed O O O O
genes O O O O
, O O O O
which O O O O
mostly O O O O
resulted O O O O
to O O O O
be O O O O
genes O O O O
for O O O O
heat O O O O
shock O O O O
proteins O O O O
( O O O O
HSPs O O O O
) O O O O
and O O O O
genes O O O O
involved O O O O
in O O O O
cell O O O O
wall O O O O
and O O O O
lipid O O O O
metabolism O O O O
, O O O O
could O O O O
be O O O O
involved O O O O
in O O O O
mechanisms O O O O
, O O O O
which O O O O
are O O O O
responsible O O O O
for O O O O
fungal O O O O
adaptation O O O O
. O O O O
    
Since O O O O
truffle O O O O
ascomata O O O O
develop O O O O
during O O O O
the O O O O
winter O O O O
period O O O O
, O O O O
we O O O O
hypothesize O O O O
that O O O O
these O O O O
differentially O O O O
expressed O O O O
genes O O O O
may O O O O
help O O O O
the O O O O
truffle O O O O
to O O O O
adapt O O O O
to O O O O
low O O O O
temperatures O O O O
and O O O O
/ O O O O
or O O O O
perceive O O O O
environmental O O O O
signals O O O O
that O O O O
regulate O O O O
the O O O O
fructification O O O O
. O O O O
    
The O O O O
rapid O O O O
production O O O O
of O O O O
high O O O O
- O O O O
titer O O O O
porcine B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
endogenous O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
retrovirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
PERV O O O O
) O O O O
- O O O O
B O O O O
env O O O O
pseudotype O O O O
and O O O O
construction O O O O
of O O O O
an O O O O
EGFP O O O O
- O O O O
expressing O O O O
replication O O O O
competent O O O O
PERV O O O O
- O O O O
A O O O O
vector O O O O
. O O O O
    
Porcine B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
endogenous O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
retroviruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
PERVs B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
present O O O O
a O O O O
unique O O O O
concern O O O O
associated O O O O
with O O O O
xenotransplantation O O O O
because O O O O
they O O O O
have O O O O
been O O O O
shown O O O O
to O O O O
infect O O O O
certain O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cells O O O O
in O O O O
vitro O O O O
and O O O O
it O O O O
is O O O O
also O O O O
difficult O O O O
to O O O O
generate O O O O
herds O O O O
of O O O O
pigs B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
free O O O O
of O O O O
PERVs B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
A O O O O
simple O O O O
system O O O O
for O O O O
the O O O O
production O O O O
of O O O O
high O O O O
- O O O O
titer O O O O
MoMLV O O O O
- O O O O
PERV O O O O
pseudotypes O O O O
is O O O O
reported O O O O
; O O O O
an O O O O
EGFP O O O O
- O O O O
expressing O O O O
replication O O O O
- O O O O
competent O O O O
molecular O O O O
clone O O O O
that O O O O
allows O O O O
direct O O O O
measurement O O O O
of O O O O
titer O O O O
was O O O O
also O O O O
constructed O O O O
. O O O O
    
To O O O O
improve O O O O
the O O O O
MLV O O O O
- O O O O
based O O O O
retroviral B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
vector O O O O
system O O O O
, O O O O
a O O O O
2 O O O O
. O O O O
1 O O O O
- O O O O
kb O O O O
PERV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
B O O O O
env O O O O
product O O O O
was O O O O
amplified O O O O
from O O O O
PK O O O O
- O O O O
15 O O O O
genomic O O O O
DNA O O O O
and O O O O
cloned O O O O
into O O O O
the O O O O
pCL O O O O
- O O O O
Eco O O O O
retroviral O O O O
vector O O O O
. O O O O
    
The O O O O
titer O O O O
of O O O O
lacZ O O O O
( O O O O
PERV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
B O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
from O O O O
the O O O O
293 O O O O
cells O O O O
was O O O O
about O O O O
1 O O O O
. O O O O
0x10 O O O O
( O O O O
4 O O O O
) O O O O
CFU O O O O
/ O O O O
ml O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
, O O O O
the O O O O
titer O O O O
of O O O O
lacZ O O O O
( O O O O
PERV O O O O
- O O O O
B O O O O
) O O O O
from O O O O
a O O O O
conventional O O O O
murine O O O O
retroviral B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
vector O O O O
( O O O O
split O O O O
genome O O O O
) O O O O
was O O O O
found O O O O
to O O O O
be O O O O
1 O O O O
. O O O O
2x10 O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
CFU O O O O
/ O O O O
ml O O O O
when O O O O
the O O O O
PERV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
B O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
env O O O O
expression O O O O
vector O O O O
was O O O O
transfected O O O O
into O O O O
TELCeB6 O O O O
cells O O O O
, O O O O
which O O O O
harbor O O O O
MFGnlslacZ O O O O
and O O O O
the O O O O
gag O O O O
- O O O O
pol O O O O
- O O O O
expressing O O O O
vector O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
, O O O O
an O O O O
infectious O O O O
PERV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
clone O O O O
containing O O O O
enhanced O O O O
GFP O O O O
( O O O O
EGFP O O O O
) O O O O
by O O O O
using O O O O
a O O O O
PCR O O O O
- O O O O
based O O O O
method O O O O
was O O O O
developed O O O O
. O O O O
    
This O O O O
EGFP O O O O
- O O O O
expressing O O O O
PERV O O O O
- O O O O
A O O O O
- O O O O
IRES O O O O
- O O O O
EGFP O O O O
molecular O O O O
clone O O O O
was O O O O
found O O O O
to O O O O
be O O O O
stable O O O O
genetically O O O O
on O O O O
transfection O O O O
in O O O O
293 O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Rhizomastix O O O O
biflagellata O O O O
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
, O O O O
a O O O O
new O O O O
amoeboflagellate O O O O
of O O O O
uncertain O O O O
phylogenetic O O O O
position O O O O
isolated O O O O
from O O O O
frogs O O O O
. O O O O
    
The O O O O
genus O O O O
Rhizomastix O O O O
contains O O O O
five O O O O
species O O O O
of O O O O
amoeboflagellates O O O O
with O O O O
a O O O O
single O O O O
anterior O O O O
flagellum O O O O
, O O O O
which O O O O
live O O O O
as O O O O
intestinal O O O O
symbionts O O O O
of O O O O
insects O O O O
and O O O O
amphibians O O O O
. O O O O
    
Though O O O O
established O O O O
in O O O O
1911 O O O O
, O O O O
Rhizomastix O O O O
has O O O O
been O O O O
neglected O O O O
for O O O O
decades O O O O
and O O O O
its O O O O
phylogenetic O O O O
position O O O O
is O O O O
uncertain O O O O
. O O O O
    
This O O O O
paper O O O O
describes O O O O
the O O O O
morphology O O O O
of O O O O
the O O O O
first O O O O
cultivated O O O O
strain O O O O
of O O O O
Rhizomastix O O O O
. O O O O
    
The O O O O
organism O O O O
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
an O O O O
argentine O O O O
horned O O O O
frog O O O O
and O O O O
differs O O O O
from O O O O
the O O O O
known O O O O
Rhizomastix O O O O
species O O O O
by O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
biflagellate O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
The O O O O
isolate O O O O
is O O O O
described O O O O
as O O O O
Rhizomastix O O O O
biflagellata O O O O
sp O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
    
A O O O O
possible O O O O
relationship O O O O
of O O O O
Rhizomastix O O O O
to O O O O
Archamoebae O O O O
is O O O O
discussed O O O O
. O O O O
    
Whole O O O O
- O O O O
genome O O O O
sequences O O O O
of O O O O
thirteen O O O O
isolates O O O O
of O O O O
Borrelia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
burgdorferi O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Borrelia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
burgdorferi O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
a O O O O
causative O O O O
agent O O O O
of O O O O
Lyme O O O O
disease O O O O
in O O O O
North O O O O
America O O O O
and O O O O
Eurasia O O O O
. O O O O
    
The O O O O
first O O O O
complete O O O O
genome O O O O
sequence O O O O
of O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
burgdorferi O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
31 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
available O O O O
for O O O O
more O O O O
than O O O O
a O O O O
decade O O O O
, O O O O
has O O O O
assisted O O O O
research O O O O
on O O O O
the O O O O
pathogenesis O O O O
of O O O O
Lyme O O O O
disease O O O O
. O O O O
    
Because O O O O
a O O O O
single O O O O
genome O O O O
sequence O O O O
is O O O O
not O O O O
sufficient O O O O
to O O O O
understand O O O O
the O O O O
relationship O O O O
between O O O O
genotypic O O O O
and O O O O
geographic O O O O
variation O O O O
and O O O O
disease O O O O
phenotype O O O O
, O O O O
we O O O O
determined O O O O
the O O O O
whole O O O O
- O O O O
genome O O O O
sequences O O O O
of O O O O
13 O O O O
additional O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
burgdorferi O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
isolates O O O O
that O O O O
span O O O O
the O O O O
range O O O O
of O O O O
natural O O O O
variation O O O O
. O O O O
    
These O O O O
sequences O O O O
should O O O O
allow O O O O
improved O O O O
understanding O O O O
of O O O O
pathogenesis O O O O
and O O O O
provide O O O O
a O O O O
foundation O O O O
for O O O O
novel O O O O
detection O O O O
, O O O O
diagnosis O O O O
, O O O O
and O O O O
prevention O O O O
strategies O O O O
. O O O O
    
Association O O O O
between O O O O
nonsynonymous O O O O
mutations O O O O
of O O O O
starch O O O O
synthase O O O O
IIa O O O O
and O O O O
starch O O O O
quality O O O O
in O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
Oryza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sativa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
. O O O O
    
Starch O O O O
quality O O O O
is O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
most O O O O
important O O O O
agronomic O O O O
traits O O O O
in O O O O
Asian B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
rice O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Oryza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sativa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Starch O O O O
synthase O O O O
IIa O O O O
( O O O O
SsIIa O O O O
) O O O O
is O O O O
a O O O O
major O O O O
candidate O O O O
gene O O O O
for O O O O
starch O O O O
quality O O O O
variation O O O O
. O O O O
    
Within O O O O
SsIIa O O O O
, O O O O
three O O O O
nonsynonymous O O O O
mutations O O O O
in O O O O
exon O O O O
8 O O O O
have O O O O
been O O O O
shown O O O O
to O O O O
affect O O O O
enzyme O O O O
activity O O O O
when O O O O
expressed O O O O
in O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
To O O O O
search O O O O
for O O O O
the O O O O
variation O O O O
in O O O O
SsIIa O O O O
that O O O O
is O O O O
responsible O O O O
for O O O O
starch O O O O
quality O O O O
variation O O O O
in O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
we O O O O
sequenced O O O O
the O O O O
SsIIa O O O O
exon O O O O
8 O O O O
region O O O O
and O O O O
measured O O O O
starch O O O O
quality O O O O
as O O O O
starch O O O O
disintegration O O O O
in O O O O
alkali O O O O
for O O O O
289 O O O O
accessions O O O O
of O O O O
cultivated O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
57 O O O O
accessions O O O O
of O O O O
its O O O O
wild O O O O
ancestor O O O O
, O O O O
Oryza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
rufipogon O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
A O O O O
general O O O O
linear O O O O
model O O O O
and O O O O
nested O O O O
clade O O O O
analysis O O O O
were O O O O
used O O O O
to O O O O
identify O O O O
the O O O O
associations O O O O
between O O O O
the O O O O
three O O O O
nonsynonymous O O O O
single O O O O
nucleotide O O O O
polymorphisms O O O O
( O O O O
SNPs O O O O
) O O O O
and O O O O
starch O O O O
quality O O O O
. O O O O
    
Among O O O O
the O O O O
three O O O O
nonsynonymous O O O O
SNPs O O O O
, O O O O
we O O O O
found O O O O
strong O O O O
evidence O O O O
of O O O O
association O O O O
at O O O O
one O O O O
nucleotide O O O O
site O O O O
( O O O O
' O O O O
SNP O O O O
3 O O O O
' O O O O
) O O O O
, O O O O
corresponding O O O O
to O O O O
a O O O O
Leu O O O O
/ O O O O
Phe O O O O
replacement O O O O
at O O O O
codon O O O O
781 O O O O
. O O O O
    
A O O O O
second O O O O
SNP O O O O
, O O O O
corresponding O O O O
to O O O O
a O O O O
Val O O O O
/ O O O O
Met O O O O
replacement O O O O
at O O O O
codon O O O O
737 O O O O
, O O O O
could O O O O
potentially O O O O
show O O O O
an O O O O
association O O O O
with O O O O
increased O O O O
sample O O O O
sizes O O O O
. O O O O
    
Variation O O O O
in O O O O
SsIIa O O O O
enzyme O O O O
activity O O O O
is O O O O
associated O O O O
with O O O O
the O O O O
cohesiveness O O O O
of O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
grains O O O O
when O O O O
cooked O O O O
, O O O O
and O O O O
our O O O O
findings O O O O
are O O O O
consistent O O O O
with O O O O
selection O O O O
for O O O O
more O O O O
cohesive O O O O
grains O O O O
during O O O O
the O O O O
domestication O O O O
of O O O O
tropical B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
japonica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
rice O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Ecological O O O O
differentiation O O O O
in O O O O
xylem O O O O
cavitation O O O O
resistance O O O O
is O O O O
associated O O O O
with O O O O
stem O O O O
and O O O O
leaf O O O O
structural O O O O
traits O O O O
. O O O O
    
Cavitation O O O O
resistance O O O O
is O O O O
a O O O O
critical O O O O
determinant O O O O
of O O O O
drought O O O O
tolerance O O O O
in O O O O
tropical O O O O
tree O O O O
species O O O O
, O O O O
but O O O O
little O O O O
is O O O O
known O O O O
of O O O O
its O O O O
association O O O O
with O O O O
life O O O O
history O O O O
strategies O O O O
, O O O O
particularly O O O O
for O O O O
seasonal O O O O
dry O O O O
forests O O O O
, O O O O
a O O O O
system O O O O
critically O O O O
driven O O O O
by O O O O
variation O O O O
in O O O O
water O O O O
availability O O O O
. O O O O
    
We O O O O
analysed O O O O
vulnerability O O O O
curves O O O O
for O O O O
saplings O O O O
of O O O O
13 O O O O
tropical O O O O
dry O O O O
forest O O O O
tree O O O O
species O O O O
differing O O O O
in O O O O
life O O O O
history O O O O
and O O O O
leaf O O O O
phenology O O O O
. O O O O
    
We O O O O
examined O O O O
how O O O O
vulnerability O O O O
to O O O O
cavitation O O O O
( O O O O
P50 O O O O
) O O O O
related O O O O
to O O O O
dry O O O O
season O O O O
leaf O O O O
water O O O O
potentials O O O O
and O O O O
stem O O O O
and O O O O
leaf O O O O
traits O O O O
. O O O O
    
P50 O O O O
- O O O O
values O O O O
ranged O O O O
from O O O O
- O O O O
0 O O O O
. O O O O
8 O O O O
to O O O O
- O O O O
6 O O O O
. O O O O
2 O O O O
MPa O O O O
, O O O O
with O O O O
pioneers O O O O
on O O O O
average O O O O
38 O O O O
% O O O O
more O O O O
vulnerable O O O O
to O O O O
cavitation O O O O
than O O O O
shade O O O O
- O O O O
tolerants O O O O
. O O O O
    
Vulnerability O O O O
to O O O O
cavitation O O O O
was O O O O
related O O O O
to O O O O
structural O O O O
traits O O O O
conferring O O O O
tissue O O O O
stress O O O O
vulnerability O O O O
, O O O O
being O O O O
negatively O O O O
correlated O O O O
with O O O O
wood O O O O
density O O O O
, O O O O
and O O O O
surprisingly O O O O
maximum O O O O
vessel O O O O
length O O O O
. O O O O
    
Vulnerability O O O O
to O O O O
cavitation O O O O
was O O O O
negatively O O O O
related O O O O
to O O O O
the O O O O
Huber O O O O
- O O O O
value O O O O
and O O O O
leaf O O O O
dry O O O O
matter O O O O
content O O O O
, O O O O
and O O O O
positively O O O O
with O O O O
leaf O O O O
size O O O O
. O O O O
    
It O O O O
was O O O O
not O O O O
related O O O O
to O O O O
SLA O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
a O O O O
strong O O O O
trade O O O O
- O O O O
off O O O O
between O O O O
cavitation O O O O
resistance O O O O
and O O O O
hydraulic O O O O
efficiency O O O O
. O O O O
    
Most O O O O
species O O O O
in O O O O
the O O O O
field O O O O
were O O O O
operating O O O O
at O O O O
leaf O O O O
water O O O O
potentials O O O O
well O O O O
above O O O O
their O O O O
P50 O O O O
, O O O O
but O O O O
pioneers O O O O
and O O O O
deciduous O O O O
species O O O O
had O O O O
smaller O O O O
hydraulic O O O O
safety O O O O
margins O O O O
than O O O O
shade O O O O
- O O O O
tolerants O O O O
and O O O O
evergreens O O O O
. O O O O
    
A O O O O
trade O O O O
- O O O O
off O O O O
between O O O O
hydraulic O O O O
safety O O O O
and O O O O
efficiency O O O O
underlies O O O O
ecological O O O O
differentiation O O O O
across O O O O
these O O O O
tropical O O O O
dry O O O O
forest O O O O
tree O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Genetics O O O O
of O O O O
lung O O O O
- O O O O
cancer O O O O
susceptibility O O O O
. O O O O
    
Lung O O O O
cancer O O O O
is O O O O
the O O O O
most O O O O
common O O O O
form O O O O
of O O O O
cancer O O O O
death O O O O
worldwide O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
reduction O O O O
of O O O O
tobacco B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
consumption O O O O
remains O O O O
the O O O O
most O O O O
appropriate O O O O
strategy O O O O
to O O O O
reduce O O O O
lung O O O O
- O O O O
cancer O O O O
burden O O O O
, O O O O
identification O O O O
of O O O O
genes O O O O
involved O O O O
in O O O O
the O O O O
cause O O O O
of O O O O
disease O O O O
could O O O O
contribute O O O O
to O O O O
further O O O O
understanding O O O O
of O O O O
the O O O O
underlying O O O O
mechanisms O O O O
, O O O O
and O O O O
eventually O O O O
lead O O O O
to O O O O
additional O O O O
prevention O O O O
strategies O O O O
and O O O O
targeted O O O O
treatments O O O O
. O O O O
    
Common O O O O
gene O O O O
variants O O O O
involved O O O O
in O O O O
lung O O O O
cancer O O O O
have O O O O
been O O O O
recently O O O O
identified O O O O
through O O O O
large O O O O
, O O O O
collaborative O O O O
, O O O O
genome O O O O
- O O O O
wide O O O O
association O O O O
studies O O O O
. O O O O
    
These O O O O
studies O O O O
identified O O O O
three O O O O
separate O O O O
loci O O O O
that O O O O
are O O O O
associated O O O O
with O O O O
lung O O O O
cancer O O O O
( O O O O
5p15 O O O O
, O O O O
6p21 O O O O
, O O O O
and O O O O
15q25 O O O O
) O O O O
and O O O O
include O O O O
genes O O O O
that O O O O
regulate O O O O
acetylcholine O O O O
nicotinic O O O O
receptors O O O O
and O O O O
telomerase O O O O
production O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
much O O O O
about O O O O
genetic O O O O
risk O O O O
remains O O O O
to O O O O
be O O O O
discovered O O O O
, O O O O
and O O O O
rarer O O O O
gene O O O O
variants O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
those O O O O
of O O O O
the O O O O
CHEK2 O O O O
gene O O O O
, O O O O
likely O O O O
account O O O O
for O O O O
most O O O O
of O O O O
the O O O O
remaining O O O O
risk O O O O
. O O O O
    
There O O O O
is O O O O
also O O O O
a O O O O
need O O O O
for O O O O
studies O O O O
that O O O O
investigate O O O O
how O O O O
genetic O O O O
susceptibility O O O O
is O O O O
associated O O O O
with O O O O
clinical O O O O
outcome O O O O
measures O O O O
, O O O O
including O O O O
treatment O O O O
response O O O O
and O O O O
tumour O O O O
relapse O O O O
. O O O O
    
The O O O O
validation O O O O
of O O O O
a O O O O
real O O O O
- O O O O
time O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
assay O O O O
which O O O O
detects O O O O
influenza O O O O
A O O O O
and O O O O
types O O O O
simultaneously O O O O
for O O O O
influenza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H1N1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
2009 O O O O
) O O O O
and O O O O
oseltamivir O O O O
- O O O O
resistant O O O O
( O O O O
H275Y O O O O
) O O O O
influenza O O O O
A O O O O
H1N1 O O O O
( O O O O
2009 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Influenza O O O O
A O O O O
H1N1 O O O O
( O O O O
2009 O O O O
) O O O O
was O O O O
declared O O O O
by O O O O
the O O O O
World O O O O
Health O O O O
Organisation O O O O
( O O O O
WHO O O O O
) O O O O
as O O O O
the O O O O
first O O O O
influenza O O O O
pandemic O O O O
of O O O O
the O O O O
21st O O O O
century O O O O
. O O O O
    
Rapid O O O O
detection O O O O
of O O O O
influenza O O O O
A O O O O
and O O O O
differentiation O O O O
of O O O O
influenza O O O O
A O O O O
H1N1 O O O O
( O O O O
2009 O O O O
) O O O O
and O O O O
seasonal O O O O
influenza O O O O
A O O O O
is O O O O
beneficial O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
the O O O O
rapid O O O O
detection O O O O
of O O O O
antiviral O O O O
resistant O O O O
strains O O O O
of O O O O
influenza O O O O
A O O O O
H1N1 O O O O
( O O O O
2009 O O O O
) O O O O
would O O O O
be O O O O
useful O O O O
for O O O O
clinicians O O O O
to O O O O
allow O O O O
for O O O O
change O O O O
to O O O O
an O O O O
effective O O O O
treatment O O O O
at O O O O
a O O O O
much O O O O
earlier O O O O
stage O O O O
if O O O O
resistance O O O O
is O O O O
found O O O O
. O O O O
    
It O O O O
was O O O O
the O O O O
aim O O O O
of O O O O
this O O O O
study O O O O
to O O O O
develop O O O O
a O O O O
real O O O O
- O O O O
time O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
that O O O O
can O O O O
detect O O O O
all O O O O
influenza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
viruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
type O O O O
simultaneously O O O O
for O O O O
influenza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H1N1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
2009 O O O O
) O O O O
and O O O O
oseltamivir O O O O
resistant O O O O
( O O O O
H275Y O O O O
) O O O O
influenza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H1N1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
2009 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
This O O O O
multiplex O O O O
assay O O O O
will O O O O
allow O O O O
laboratories O O O O
to O O O O
screen O O O O
respiratory O O O O
samples O O O O
for O O O O
all O O O O
types O O O O
of O O O O
influenza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
influenza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H1N1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
2009 O O O O
) O O O O
virus O O O O
and O O O O
oseltamivir O O O O
resistant O O O O
( O O O O
H275Y O O O O
) O O O O
influenza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H1N1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
2009 O O O O
) O O O O
virus O O O O
in O O O O
a O O O O
rapid O O O O
and O O O O
cost O O O O
effective O O O O
format O O O O
, O O O O
ensuring O O O O
that O O O O
typing O O O O
methods O O O O
for O O O O
seasonal O O O O
and O O O O
avian O O O O
viruses O O O O
are O O O O
used O O O O
on O O O O
a O O O O
smaller O O O O
subset O O O O
of O O O O
samples O O O O
. O O O O
    
Since O O O O
most O O O O
virology O O O O
laboratories O O O O
already O O O O
offer O O O O
a O O O O
molecular O O O O
service O O O O
for O O O O
influenza O O O O
A O O O O
this O O O O
assay O O O O
could O O O O
easily O O O O
be O O O O
implemented O O O O
into O O O O
most O O O O
areas O O O O
at O O O O
little O O O O
cost O O O O
therefore O O O O
increasing O O O O
local O O O O
access O O O O
to O O O O
resistance O O O O
testing O O O O
. O O O O
    
Comparison O O O O
of O O O O
seasonal O O O O
variations O O O O
in O O O O
water O O O O
- O O O O
use O O O O
efficiency O O O O
calculated O O O O
from O O O O
the O O O O
carbon O O O O
isotope O O O O
composition O O O O
of O O O O
tree O O O O
rings O O O O
and O O O O
flux O O O O
data O O O O
in O O O O
a O O O O
temperate O O O O
forest O O O O
. O O O O
    
Tree O O O O
- O O O O
ring O O O O
delta O O O O
( O O O O
13 O O O O
) O O O O
C O O O O
is O O O O
often O O O O
interpreted O O O O
in O O O O
terms O O O O
of O O O O
intrinsic O O O O
water O O O O
- O O O O
use O O O O
efficiency O O O O
( O O O O
WUE O O O O
) O O O O
using O O O O
a O O O O
carbon O O O O
isotope O O O O
discrimination O O O O
model O O O O
established O O O O
at O O O O
the O O O O
leaf O O O O
level O O O O
. O O O O
    
We O O O O
examined O O O O
whether O O O O
intra O O O O
- O O O O
ring O O O O
delta O O O O
( O O O O
13 O O O O
) O O O O
C O O O O
could O O O O
be O O O O
used O O O O
to O O O O
assess O O O O
variations O O O O
in O O O O
intrinsic O O O O
WUE O O O O
( O O O O
W O O O O
( O O O O
g O O O O
) O O O O
, O O O O
the O O O O
ratio O O O O
of O O O O
carbon O O O O
assimilation O O O O
and O O O O
stomatal O O O O
conductance O O O O
to O O O O
water O O O O
) O O O O
and O O O O
variations O O O O
in O O O O
ecosystem O O O O
WUE O O O O
( O O O O
W O O O O
( O O O O
t O O O O
) O O O O
, O O O O
the O O O O
ratio O O O O
of O O O O
C O O O O
assimilation O O O O
and O O O O
transpiration O O O O
) O O O O
at O O O O
a O O O O
seasonal O O O O
scale O O O O
. O O O O
    
Intra O O O O
- O O O O
ring O O O O
delta O O O O
( O O O O
13 O O O O
) O O O O
C O O O O
was O O O O
measured O O O O
in O O O O
30 O O O O
- O O O O
to O O O O
60 O O O O
- O O O O
mum O O O O
- O O O O
thick O O O O
slices O O O O
in O O O O
eight O O O O
oak O O O O
trees O O O O
( O O O O
Quercus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
petraea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
. O O O O
    
Canopy O O O O
W O O O O
( O O O O
g O O O O
) O O O O
was O O O O
simulated O O O O
using O O O O
a O O O O
physiologically O O O O
process O O O O
- O O O O
based O O O O
model O O O O
. O O O O
    
High O O O O
between O O O O
- O O O O
tree O O O O
variability O O O O
was O O O O
observed O O O O
in O O O O
the O O O O
seasonal O O O O
variations O O O O
of O O O O
intra O O O O
- O O O O
ring O O O O
delta O O O O
( O O O O
13 O O O O
) O O O O
C O O O O
. O O O O
    
Six O O O O
trees O O O O
showed O O O O
significant O O O O
positive O O O O
correlations O O O O
between O O O O
W O O O O
( O O O O
g O O O O
) O O O O
calculated O O O O
from O O O O
intra O O O O
- O O O O
ring O O O O
delta O O O O
( O O O O
13 O O O O
) O O O O
C O O O O
and O O O O
canopy O O O O
W O O O O
( O O O O
g O O O O
) O O O O
averaged O O O O
over O O O O
several O O O O
days O O O O
during O O O O
latewood O O O O
formation O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
latewood O O O O
is O O O O
a O O O O
seasonal O O O O
recorder O O O O
of O O O O
W O O O O
( O O O O
g O O O O
) O O O O
trends O O O O
, O O O O
with O O O O
a O O O O
temporal O O O O
lag O O O O
corresponding O O O O
to O O O O
the O O O O
mixing O O O O
time O O O O
of O O O O
sugars O O O O
in O O O O
the O O O O
phloem O O O O
. O O O O
    
These O O O O
six O O O O
trees O O O O
also O O O O
showed O O O O
significant O O O O
negative O O O O
correlations O O O O
between O O O O
photosynthetic O O O O
discrimination O O O O
Delta O O O O
calculated O O O O
from O O O O
intra O O O O
- O O O O
ring O O O O
delta O O O O
( O O O O
13 O O O O
) O O O O
C O O O O
, O O O O
and O O O O
ecosystem O O O O
W O O O O
( O O O O
t O O O O
) O O O O
, O O O O
during O O O O
latewood O O O O
formation O O O O
. O O O O
    
Despite O O O O
the O O O O
observed O O O O
between O O O O
- O O O O
tree O O O O
variability O O O O
, O O O O
these O O O O
results O O O O
indicate O O O O
that O O O O
intra O O O O
- O O O O
ring O O O O
delta O O O O
( O O O O
13 O O O O
) O O O O
C O O O O
can O O O O
be O O O O
used O O O O
to O O O O
access O O O O
seasonal O O O O
variations O O O O
in O O O O
past O O O O
W O O O O
( O O O O
t O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Resistance O O O O
and O O O O
recovery O O O O
of O O O O
soil O O O O
microbial O O O O
communities O O O O
in O O O O
the O O O O
face O O O O
of O O O O
Alliaria B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
petiolata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
invasions O O O O
. O O O O
    
Invaders O O O O
can O O O O
gain O O O O
ecological O O O O
advantages O O O O
because O O O O
of O O O O
their O O O O
evolutionary O O O O
novelty O O O O
, O O O O
but O O O O
little O O O O
is O O O O
known O O O O
about O O O O
how O O O O
these O O O O
novel O O O O
advantages O O O O
will O O O O
change O O O O
over O O O O
time O O O O
as O O O O
the O O O O
invader O O O O
and O O O O
invaded O O O O
community O O O O
evolve O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
each O O O O
other O O O O
. O O O O
    
Invasive O O O O
plants O O O O
often O O O O
gain O O O O
such O O O O
an O O O O
advantage O O O O
through O O O O
alteration O O O O
of O O O O
soil O O O O
microbial O O O O
communities O O O O
. O O O O
    
In O O O O
soil O O O O
communities O O O O
sampled O O O O
from O O O O
sites O O O O
along O O O O
a O O O O
gradient O O O O
of O O O O
invasion O O O O
history O O O O
with O O O O
Alliaria B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
petiolata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
microbial O O O O
richness O O O O
tended O O O O
to O O O O
decline O O O O
, O O O O
but O O O O
the O O O O
community O O O O
' O O O O
s O O O O
resistance O O O O
to O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
petiolata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
' O O O O
s O O O O
effects O O O O
generally O O O O
increased O O O O
with O O O O
increasing O O O O
history O O O O
of O O O O
invasion O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
sensitive O O O O
microbial O O O O
taxa O O O O
appeared O O O O
to O O O O
recover O O O O
in O O O O
the O O O O
two O O O O
oldest O O O O
sites O O O O
, O O O O
leading O O O O
to O O O O
an O O O O
increase O O O O
in O O O O
richness O O O O
, O O O O
but O O O O
consequent O O O O
decrease O O O O
in O O O O
resistance O O O O
. O O O O
    
This O O O O
may O O O O
be O O O O
because O O O O
of O O O O
evolutionary O O O O
changes O O O O
in O O O O
the O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
petiolata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
populations O O O O
, O O O O
which O O O O
tend O O O O
to O O O O
reduce O O O O
their O O O O
investment O O O O
to O O O O
allelopathic O O O O
compounds O O O O
over O O O O
time O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
show O O O O
that O O O O
, O O O O
over O O O O
time O O O O
, O O O O
microbial O O O O
communities O O O O
can O O O O
develop O O O O
resistance O O O O
to O O O O
an O O O O
invasive O O O O
plant O O O O
but O O O O
at O O O O
the O O O O
cost O O O O
of O O O O
lower O O O O
richness O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
over O O O O
longer O O O O
time O O O O
- O O O O
scales O O O O
evolution O O O O
in O O O O
the O O O O
invasive O O O O
species O O O O
may O O O O
allow O O O O
for O O O O
the O O O O
recovery O O O O
of O O O O
soil O O O O
microbial O O O O
communities O O O O
. O O O O
    
Differentiating O O O O
between O O O O
effects O O O O
of O O O O
invasion O O O O
and O O O O
diversity O O O O
: O O O O
impacts O O O O
of O O O O
aboveground O O O O
plant O O O O
communities O O O O
on O O O O
belowground O O O O
fungal O O O O
communities O O O O
. O O O O
    
Exotic O O O O
plant O O O O
species O O O O
can O O O O
affect O O O O
soil O O O O
microbial O O O O
communities O O O O
with O O O O
the O O O O
potential O O O O
for O O O O
community O O O O
and O O O O
ecosystem O O O O
feedbacks O O O O
. O O O O
    
Yet O O O O
, O O O O
separating O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
exotics O O O O
from O O O O
confounded O O O O
changes O O O O
in O O O O
plant O O O O
community O O O O
diversity O O O O
still O O O O
remains O O O O
a O O O O
challenge O O O O
. O O O O
    
We O O O O
focused O O O O
on O O O O
how O O O O
plant O O O O
diversity O O O O
and O O O O
native O O O O
or O O O O
exotic O O O O
life O O O O
history O O O O
affected O O O O
root O O O O
fungi O O O O
because O O O O
of O O O O
their O O O O
significant O O O O
roles O O O O
in O O O O
community O O O O
and O O O O
ecosystem O O O O
processes O O O O
. O O O O
    
Specifically O O O O
, O O O O
we O O O O
examined O O O O
how O O O O
fungi O O O O
colonizing O O O O
plant O O O O
roots O O O O
were O O O O
affected O O O O
by O O O O
plant O O O O
richness O O O O
( O O O O
one O O O O
, O O O O
two O O O O
or O O O O
four O O O O
species O O O O
) O O O O
replicated O O O O
across O O O O
a O O O O
range O O O O
of O O O O
plant O O O O
community O O O O
mixtures O O O O
( O O O O
natives O O O O
, O O O O
exotics O O O O
, O O O O
native O O O O
- O O O O
exotic O O O O
mixtures O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Fungal O O O O
biomass O O O O
inside O O O O
roots O O O O
was O O O O
affected O O O O
independently O O O O
by O O O O
plant O O O O
richness O O O O
and O O O O
mixture O O O O
, O O O O
while O O O O
root O O O O
fungal O O O O
community O O O O
composition O O O O
was O O O O
affected O O O O
only O O O O
by O O O O
plant O O O O
richness O O O O
. O O O O
    
Extraradical O O O O
networks O O O O
also O O O O
increased O O O O
in O O O O
size O O O O
with O O O O
plant O O O O
richness O O O O
. O O O O
    
By O O O O
contrast O O O O
, O O O O
plant O O O O
biomass O O O O
was O O O O
a O O O O
function O O O O
of O O O O
plant O O O O
mixture O O O O
, O O O O
with O O O O
natives O O O O
consistently O O O O
smaller O O O O
than O O O O
exotics O O O O
and O O O O
native O O O O
- O O O O
exotic O O O O
mixtures O O O O
intermediate O O O O
. O O O O
    
Plant O O O O
invasions O O O O
may O O O O
have O O O O
an O O O O
impact O O O O
on O O O O
the O O O O
belowground O O O O
community O O O O
primarily O O O O
through O O O O
their O O O O
effects O O O O
on O O O O
diversity O O O O
, O O O O
at O O O O
least O O O O
in O O O O
the O O O O
short O O O O
- O O O O
term O O O O
. O O O O
    
Disentangling O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
diversity O O O O
and O O O O
invasion O O O O
on O O O O
belowground O O O O
microbial O O O O
communities O O O O
can O O O O
help O O O O
us O O O O
to O O O O
understand O O O O
both O O O O
the O O O O
controllers O O O O
of O O O O
belowground O O O O
resilience O O O O
and O O O O
mechanisms O O O O
of O O O O
successful O O O O
colonization O O O O
and O O O O
spread O O O O
of O O O O
exotic O O O O
plants O O O O
. O O O O
    
Neuropeptide O O O O
precursor O O O O
gene O O O O
discovery O O O O
in O O O O
the O O O O
Chagas O O O O
disease O O O O
vector O O O O
Rhodnius B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
prolixus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
We O O O O
show O O O O
a O O O O
straightforward O O O O
workflow O O O O
combining O O O O
homology O O O O
search O O O O
in O O O O
Rhodnius B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
prolixus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
genome O O O O
sequence O O O O
with O O O O
cloning O O O O
by O O O O
rapid O O O O
amplification O O O O
of O O O O
cDNA O O O O
ends O O O O
and O O O O
mass O O O O
spectrometry O O O O
. O O O O
    
We O O O O
have O O O O
identified O O O O
32 O O O O
genes O O O O
and O O O O
their O O O O
transcripts O O O O
that O O O O
encode O O O O
a O O O O
number O O O O
of O O O O
neuropeptide O O O O
precursors O O O O
leading O O O O
to O O O O
194 O O O O
putative O O O O
peptides O O O O
. O O O O
    
We O O O O
validated O O O O
by O O O O
mass O O O O
spectrometry O O O O
82 O O O O
of O O O O
those O O O O
predicted O O O O
neuropeptides O O O O
in O O O O
the O O O O
brain O O O O
of O O O O
R B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
prolixus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
to O O O O
achieve O O O O
the O O O O
first O O O O
comprehensive O O O O
genomic O O O O
, O O O O
transcriptomic O O O O
and O O O O
neuropeptidomic O O O O
analysis O O O O
of O O O O
an O O O O
insect O O O O
disease O O O O
vector O O O O
. O O O O
    
Comparisons O O O O
of O O O O
available O O O O
insect O O O O
neuropeptide O O O O
sequences O O O O
revealed O O O O
that O O O O
the O O O O
R B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
prolixus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
genome O O O O
contains O O O O
most O O O O
of O O O O
the O O O O
conserved O O O O
neuropeptides O O O O
in O O O O
insects O O O O
, O O O O
many O O O O
of O O O O
them O O O O
displaying O O O O
specific O O O O
features O O O O
at O O O O
the O O O O
sequence O O O O
level O O O O
. O O O O
    
Some O O O O
gene O O O O
families O O O O
reported O O O O
here O O O O
are O O O O
identified O O O O
for O O O O
the O O O O
first O O O O
time O O O O
in O O O O
the O O O O
order O O O O
Hemiptera O O O O
, O O O O
a O O O O
highly O O O O
biodiverse O O O O
group O O O O
of O O O O
insects O O O O
that O O O O
includes O O O O
many O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
animal O O O O
and O O O O
plant O O O O
disease O O O O
agents O O O O
. O O O O
    
The O O O O
alphaherpesvirus O O O O
US3 O O O O
/ O O O O
ORF66 O O O O
protein O O O O
kinases O O O O
direct O O O O
phosphorylation O O O O
of O O O O
the O O O O
nuclear O O O O
matrix O O O O
protein O O O O
matrin O O O O
3 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
protein O O O O
kinase O O O O
found O O O O
in O O O O
the O O O O
short O O O O
region O O O O
of O O O O
alphaherpesviruses O O O O
, O O O O
termed O O O O
US3 O O O O
in O O O O
herpes B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
simplex O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
type O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
HSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
and O O O O
pseudorabies B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
PRV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
and O O O O
ORF66 O O O O
in O O O O
varicella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
zoster O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
VZV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
, O O O O
affects O O O O
several O O O O
viral O O O O
and O O O O
host O O O O
cell O O O O
processes O O O O
, O O O O
and O O O O
its O O O O
specific O O O O
targets O O O O
remain O O O O
an O O O O
area O O O O
of O O O O
active O O O O
investigation O O O O
. O O O O
    
Reports O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
HSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
US3 O O O O
substrates O O O O
overlap O O O O
with O O O O
those O O O O
of O O O O
cellular O O O O
protein O O O O
kinase O O O O
A O O O O
( O O O O
PKA O O O O
) O O O O
prompted O O O O
the O O O O
use O O O O
of O O O O
an O O O O
antibody O O O O
specific O O O O
for O O O O
phosphorylated O O O O
PKA O O O O
substrates O O O O
to O O O O
identify O O O O
US3 O O O O
/ O O O O
ORF66 O O O O
targets O O O O
. O O O O
    
HSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
VZV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
and O O O O
PRV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
induced O O O O
very O O O O
different O O O O
substrate O O O O
profiles O O O O
that O O O O
were O O O O
US3 O O O O
/ O O O O
ORF66 O O O O
kinase O O O O
dependent O O O O
. O O O O
    
The O O O O
predominant O O O O
VZV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
phosphorylated O O O O
125 O O O O
- O O O O
kDa O O O O
species O O O O
was O O O O
identified O O O O
as O O O O
matrin O O O O
3 O O O O
, O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
major O O O O
nuclear O O O O
matrix O O O O
proteins O O O O
. O O O O
    
Matrin O O O O
3 O O O O
was O O O O
also O O O O
phosphorylated O O O O
by O O O O
HSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
PRV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
in O O O O
a O O O O
US3 O O O O
kinase O O O O
- O O O O
dependent O O O O
manner O O O O
and O O O O
by O O O O
VZV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ORF66 O O O O
kinase O O O O
at O O O O
a O O O O
novel O O O O
residue O O O O
( O O O O
KRRRT150EE O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Since O O O O
VZV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
directed O O O O
T150 O O O O
phosphorylation O O O O
was O O O O
not O O O O
blocked O O O O
by O O O O
PKA O O O O
inhibitors O O O O
and O O O O
was O O O O
not O O O O
induced O O O O
by O O O O
PKA O O O O
activation O O O O
, O O O O
and O O O O
since O O O O
PKA O O O O
predominantly O O O O
targeted O O O O
matrin O O O O
3 O O O O
S188 O O O O
, O O O O
it O O O O
was O O O O
concluded O O O O
that O O O O
phosphorylation O O O O
by O O O O
VZV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
was O O O O
PKA O O O O
independent O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
purified O O O O
VZV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ORF66 O O O O
kinase O O O O
did O O O O
not O O O O
phosphorylate O O O O
matrin O O O O
3 O O O O
in O O O O
vitro O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
additional O O O O
cellular O O O O
factors O O O O
were O O O O
required O O O O
. O O O O
    
In O O O O
VZV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
infected O O O O
cells O O O O
in O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
the O O O O
ORF66 O O O O
kinase O O O O
, O O O O
matrin O O O O
3 O O O O
displayed O O O O
intranuclear O O O O
changes O O O O
, O O O O
while O O O O
matrin O O O O
3 O O O O
showed O O O O
a O O O O
pronounced O O O O
cytoplasmic O O O O
distribution O O O O
in O O O O
late O O O O
- O O O O
stage O O O O
cells O O O O
infected O O O O
with O O O O
US3 O O O O
- O O O O
negative O O O O
HSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
or O O O O
PRV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
This O O O O
work O O O O
identifies O O O O
phosphorylation O O O O
of O O O O
the O O O O
nuclear O O O O
matrix O O O O
protein O O O O
matrin O O O O
3 O O O O
as O O O O
a O O O O
new O O O O
conserved O O O O
target O O O O
of O O O O
this O O O O
kinase O O O O
group O O O O
. O O O O
    
Small O O O O
- O O O O
molecule O O O O
inhibition O O O O
of O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
immunodeficiency O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
type O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
infection O O O O
by O O O O
virus O O O O
capsid O O O O
destabilization O O O O
. O O O O
    
Human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
immunodeficiency O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
type O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
infection O O O O
is O O O O
dependent O O O O
on O O O O
the O O O O
proper O O O O
disassembly O O O O
of O O O O
the O O O O
viral O O O O
capsid O O O O
, O O O O
or O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
uncoating O O O O
, O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
in O O O O
target O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
The O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
capsid O O O O
consists O O O O
of O O O O
a O O O O
conical O O O O
multimeric O O O O
complex O O O O
of O O O O
the O O O O
viral O O O O
capsid O O O O
protein O O O O
( O O O O
CA O O O O
) O O O O
arranged O O O O
in O O O O
a O O O O
hexagonal O O O O
lattice O O O O
. O O O O
    
Mutations O O O O
in O O O O
CA O O O O
that O O O O
destabilize O O O O
the O O O O
viral O O O O
capsid O O O O
result O O O O
in O O O O
impaired O O O O
infection O O O O
owing O O O O
to O O O O
defects O O O O
in O O O O
reverse O O O O
transcription O O O O
in O O O O
target O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
We O O O O
describe O O O O
here O O O O
the O O O O
mechanism O O O O
of O O O O
action O O O O
of O O O O
a O O O O
small O O O O
molecule O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
inhibitor O O O O
, O O O O
PF O O O O
- O O O O
3450074 O O O O
( O O O O
PF74 O O O O
) O O O O
, O O O O
which O O O O
targets O O O O
CA O O O O
. O O O O
    
PF74 O O O O
acts O O O O
at O O O O
an O O O O
early O O O O
stage O O O O
of O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
infection O O O O
and O O O O
inhibits O O O O
reverse O O O O
transcription O O O O
in O O O O
target O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
We O O O O
show O O O O
that O O O O
PF74 O O O O
binds O O O O
specifically O O O O
to O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
particles O O O O
, O O O O
and O O O O
substitutions O O O O
in O O O O
CA O O O O
that O O O O
confer O O O O
resistance O O O O
to O O O O
the O O O O
compound O O O O
prevent O O O O
binding O O O O
. O O O O
    
A O O O O
single O O O O
point O O O O
mutation O O O O
in O O O O
CA O O O O
that O O O O
stabilizes O O O O
the O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
core O O O O
also O O O O
conferred O O O O
strong O O O O
resistance O O O O
to O O O O
the O O O O
virus O O O O
without O O O O
inhibiting O O O O
compound O O O O
binding O O O O
. O O O O
    
Treatment O O O O
of O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
particles O O O O
or O O O O
purified O O O O
cores O O O O
with O O O O
PF74 O O O O
destabilized O O O O
the O O O O
viral O O O O
capsid O O O O
in O O O O
vitro O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
the O O O O
compound O O O O
induced O O O O
the O O O O
rapid O O O O
dissolution O O O O
of O O O O
the O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
capsid O O O O
in O O O O
target O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
PF74 O O O O
antiviral O O O O
activity O O O O
was O O O O
promoted O O O O
by O O O O
binding O O O O
of O O O O
the O O O O
host O O O O
protein O O O O
cyclophilin O O O O
A O O O O
to O O O O
the O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
capsid O O O O
, O O O O
and O O O O
PF74 O O O O
and O O O O
cyclosporine O O O O
exhibited O O O O
mutual O O O O
antagonism O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
data O O O O
suggest O O O O
that O O O O
PF74 O O O O
triggers O O O O
premature O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
uncoating O O O O
in O O O O
target O O O O
cells O O O O
, O O O O
thereby O O O O
mimicking O O O O
the O O O O
activity O O O O
of O O O O
the O O O O
retrovirus O O O O
restriction O O O O
factor O O O O
TRIM5alpha O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
highlights O O O O
uncoating O O O O
as O O O O
a O O O O
step O O O O
in O O O O
the O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
life O O O O
cycle O O O O
that O O O O
is O O O O
susceptible O O O O
to O O O O
small O O O O
molecule O O O O
intervention O O O O
. O O O O
    
PB2 O O O O
residue O O O O
158 O O O O
is O O O O
a O O O O
pathogenic O O O O
determinant O O O O
of O O O O
pandemic O O O O
H1N1 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
H5 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
influenza O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
a O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
viruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Influenza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
viruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
are O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
animal O O O O
pathogens O O O O
that O O O O
cause O O O O
morbidity O O O O
and O O O O
mortality O O O O
, O O O O
which O O O O
range O O O O
from O O O O
mild O O O O
to O O O O
severe O O O O
. O O O O
    
The O O O O
2009 O O O O
H1N1 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pandemic O O O O
was O O O O
caused O O O O
by O O O O
the O O O O
emergence O O O O
of O O O O
a O O O O
reassortant O O O O
H1N1 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
subtype O O O O
( O O O O
H1N1pdm B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
influenza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
containing O O O O
gene O O O O
segments O O O O
that O O O O
originally O O O O
circulated O O O O
in O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
avian O O O O
, O O O O
and O O O O
swine B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O O O O
reservoirs O O O O
. O O O O
    
The O O O O
molecular O O O O
determinants O O O O
of O O O O
replication O O O O
and O O O O
pathogenesis O O O O
of O O O O
H1N1pdm B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
viruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
humans B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
other O O O O
mammals O O O O
are O O O O
poorly O O O O
understood O O O O
. O O O O
    
Therefore O O O O
, O O O O
we O O O O
set O O O O
out O O O O
to O O O O
elucidate O O O O
viral O O O O
determinants O O O O
critical O O O O
to O O O O
the O O O O
pathogenesis O O O O
of O O O O
this O O O O
novel O O O O
reassortant O O O O
using O O O O
a O O O O
mouse B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
model O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
that O O O O
a O O O O
glutamate O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
glycine O O O O
substitution O O O O
at O O O O
residue O O O O
158 O O O O
of O O O O
the O O O O
PB2 O O O O
gene O O O O
( O O O O
PB2 O O O O
- O O O O
E158G O O O O
) O O O O
increased O O O O
the O O O O
morbidity O O O O
and O O O O
mortality O O O O
of O O O O
the O O O O
parental O O O O
H1N1pdm B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Results O O O O
from O O O O
mini O O O O
- O O O O
genome O O O O
replication O O O O
assays O O O O
in O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cells O O O O
and O O O O
virus O O O O
titration O O O O
in O O O O
mouse B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tissues O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
PB2 O O O O
- O O O O
E158G O O O O
is O O O O
a O O O O
pathogenic O O O O
determinant O O O O
, O O O O
because O O O O
it O O O O
significantly O O O O
increases O O O O
viral O O O O
replication O O O O
rates O O O O
. O O O O
    
The O O O O
virus O O O O
load O O O O
in O O O O
PB2 O O O O
- O O O O
E158G O O O O
- O O O O
infected O O O O
mouse B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
lungs O O O O
was O O O O
1 O O O O
, O O O O
300 O O O O
- O O O O
fold O O O O
higher O O O O
than O O O O
that O O O O
of O O O O
the O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
virus O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
data O O O O
also O O O O
show O O O O
that O O O O
PB2 O O O O
- O O O O
E158G O O O O
had O O O O
a O O O O
much O O O O
stronger O O O O
influence O O O O
on O O O O
the O O O O
RNA O O O O
replication O O O O
and O O O O
pathogenesis O O O O
of O O O O
H1N1pdm B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
viruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
than O O O O
PB2 O O O O
- O O O O
E627K O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
a O O O O
known O O O O
pathogenic O O O O
determinant O O O O
. O O O O
    
Remarkably O O O O
, O O O O
PB2 O O O O
- O O O O
E158G O O O O
substitutions O O O O
also O O O O
altered O O O O
the O O O O
pathotypes O O O O
of O O O O
two O O O O
avian O O O O
H5 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
viruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
this O O O O
residue O O O O
impacts O O O O
genetically O O O O
divergent O O O O
influenza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
viruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
this O O O O
region O O O O
of O O O O
PB2 O O O O
could O O O O
be O O O O
a O O O O
new O O O O
antiviral O O O O
target O O O O
. O O O O
    
Collectively O O O O
, O O O O
the O O O O
data O O O O
presented O O O O
in O O O O
this O O O O
study O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
PB2 O O O O
- O O O O
E158G O O O O
is O O O O
a O O O O
novel O O O O
pathogenic O O O O
determinant O O O O
of O O O O
influenza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
viruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
the O O O O
mouse B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
model O O O O
. O O O O
    
We O O O O
speculate O O O O
that O O O O
PB2 O O O O
- O O O O
E158G O O O O
may O O O O
be O O O O
important O O O O
in O O O O
the O O O O
adaptation O O O O
of O O O O
avian O O O O
PB2 O O O O
genes O O O O
to O O O O
other O O O O
mammals O O O O
, O O O O
and O O O O
BLAST O O O O
sequence O O O O
analysis O O O O
identified O O O O
a O O O O
naturally O O O O
occurring O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
H1N1pdm B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
isolate O O O O
that O O O O
has O O O O
this O O O O
substitution O O O O
. O O O O
    
Therefore O O O O
, O O O O
future O O O O
surveillance O O O O
efforts O O O O
should O O O O
include O O O O
scrutiny O O O O
of O O O O
this O O O O
region O O O O
of O O O O
PB2 O O O O
because O O O O
of O O O O
its O O O O
potential O O O O
impact O O O O
on O O O O
pathogenesis O O O O
. O O O O
    
Hepatitis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
C O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
NS2 O O O O
protein O O O O
serves O O O O
as O O O O
a O O O O
scaffold O O O O
for O O O O
virus O O O O
assembly O O O O
by O O O O
interacting O O O O
with O O O O
both O O O O
structural O O O O
and O O O O
nonstructural O O O O
proteins O O O O
. O O O O
    
Many O O O O
aspects O O O O
of O O O O
the O O O O
assembly O O O O
of O O O O
hepatitis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
C O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
HCV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
remain O O O O
incompletely O O O O
understood O O O O
. O O O O
    
To O O O O
characterize O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
NS2 O O O O
in O O O O
the O O O O
production O O O O
of O O O O
infectious O O O O
virus O O O O
, O O O O
we O O O O
determined O O O O
NS2 O O O O
interaction O O O O
partners O O O O
among O O O O
other O O O O
HCV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
proteins O O O O
during O O O O
productive O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
Pulldown O O O O
assays O O O O
showed O O O O
that O O O O
NS2 O O O O
forms O O O O
complexes O O O O
with O O O O
both O O O O
structural O O O O
and O O O O
nonstructural O O O O
proteins O O O O
, O O O O
including O O O O
E1 O O O O
, O O O O
E2 O O O O
, O O O O
p7 O O O O
, O O O O
NS3 O O O O
, O O O O
and O O O O
NS5A O O O O
. O O O O
    
Confocal O O O O
microscopy O O O O
also O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
NS2 O O O O
colocalizes O O O O
with O O O O
E1 O O O O
, O O O O
E2 O O O O
, O O O O
and O O O O
NS5A O O O O
in O O O O
dot O O O O
- O O O O
like O O O O
structures O O O O
near O O O O
lipid O O O O
droplets O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
NS5A O O O O
did O O O O
not O O O O
coprecipitate O O O O
with O O O O
E2 O O O O
and O O O O
interacted O O O O
only O O O O
weakly O O O O
with O O O O
NS3 O O O O
in O O O O
pulldown O O O O
assays O O O O
. O O O O
    
Also O O O O
, O O O O
there O O O O
was O O O O
no O O O O
demonstrable O O O O
interaction O O O O
between O O O O
p7 O O O O
and O O O O
E2 O O O O
or O O O O
NS3 O O O O
in O O O O
such O O O O
assays O O O O
. O O O O
    
Therefore O O O O
, O O O O
NS2 O O O O
is O O O O
uniquely O O O O
capable O O O O
of O O O O
interacting O O O O
with O O O O
both O O O O
structural O O O O
and O O O O
nonstructural O O O O
proteins O O O O
. O O O O
    
Among O O O O
mutations O O O O
in O O O O
p7 O O O O
, O O O O
NS2 O O O O
, O O O O
and O O O O
NS3 O O O O
that O O O O
prevent O O O O
production O O O O
of O O O O
infectious O O O O
virus O O O O
, O O O O
only O O O O
p7 O O O O
mutations O O O O
significantly O O O O
reduced O O O O
NS2 O O O O
- O O O O
mediated O O O O
protein O O O O
interactions O O O O
. O O O O
    
These O O O O
p7 O O O O
mutations O O O O
altered O O O O
the O O O O
intracellular O O O O
distribution O O O O
of O O O O
NS2 O O O O
and O O O O
E2 O O O O
and O O O O
appeared O O O O
to O O O O
modulate O O O O
the O O O O
membrane O O O O
topology O O O O
of O O O O
the O O O O
C O O O O
- O O O O
terminal O O O O
domain O O O O
of O O O O
NS2 O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
NS2 O O O O
acts O O O O
to O O O O
coordinate O O O O
virus O O O O
assembly O O O O
by O O O O
mediating O O O O
interactions O O O O
between O O O O
envelope O O O O
proteins O O O O
and O O O O
NS3 O O O O
and O O O O
NS5A O O O O
within O O O O
replication O O O O
complexes O O O O
adjacent O O O O
to O O O O
lipid O O O O
droplets O O O O
, O O O O
where O O O O
virus O O O O
particle O O O O
assembly O O O O
is O O O O
thought O O O O
to O O O O
occur O O O O
. O O O O
    
p7 O O O O
may O O O O
play O O O O
an O O O O
accessory O O O O
role O O O O
by O O O O
regulating O O O O
NS2 O O O O
membrane O O O O
topology O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
important O O O O
for O O O O
NS2 O O O O
- O O O O
mediated O O O O
protein O O O O
interactions O O O O
and O O O O
therefore O O O O
NS2 O O O O
function O O O O
. O O O O
    
Alcohol O O O O
dehydrogenase O O O O
and O O O O
hydrogenase O O O O
transcript O O O O
fluctuations O O O O
during O O O O
a O O O O
day O O O O
- O O O O
night O O O O
cycle O O O O
in O O O O
Chlamydomonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
reinhardtii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
: O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
anoxia O O O O
. O O O O
    
* O O O O
The O O O O
unicellular O O O O
green O O O O
alga O O O O
Chlamydomonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
reinhardtii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
contains O O O O
two O O O O
iron O O O O
( O O O O
Fe O O O O
) O O O O
- O O O O
hydrogenases O O O O
which O O O O
are O O O O
responsible O O O O
for O O O O
hydrogen O O O O
production O O O O
under O O O O
anoxia O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
present O O O O
work O O O O
the O O O O
patterns O O O O
of O O O O
expression O O O O
of O O O O
alcohol O O O O
dehydrogenase O O O O
, O O O O
a O O O O
typical O O O O
anaerobic O O O O
gene O O O O
in O O O O
plants O O O O
, O O O O
of O O O O
the O O O O
hydrogenases O O O O
genes O O O O
( O O O O
HYD1 O O O O
, O O O O
HYD2 O O O O
) O O O O
and O O O O
of O O O O
the O O O O
genes O O O O
responsible O O O O
for O O O O
their O O O O
maturation O O O O
( O O O O
HYDEF O O O O
, O O O O
HYDG O O O O
) O O O O
, O O O O
were O O O O
analysed O O O O
. O O O O
    
* O O O O
The O O O O
expression O O O O
patterns O O O O
were O O O O
analysed O O O O
by O O O O
real O O O O
- O O O O
time O O O O
reverse O O O O
- O O O O
transcription O O O O
polymerase O O O O
chain O O O O
reaction O O O O
in O O O O
Chlamydomonas O O O O
cultures O O O O
during O O O O
the O O O O
day O O O O
- O O O O
night O O O O
cycle O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
oxygen O O O O
availability O O O O
. O O O O
    
* O O O O
The O O O O
results O O O O
indicated O O O O
that O O O O
ADH1 O O O O
, O O O O
HYD1 O O O O
, O O O O
HYD2 O O O O
, O O O O
HYDEF O O O O
and O O O O
HYDG O O O O
were O O O O
expressed O O O O
following O O O O
precise O O O O
day O O O O
- O O O O
night O O O O
fluctuations O O O O
. O O O O
    
ADH1 O O O O
and O O O O
HYD2 O O O O
were O O O O
modulated O O O O
by O O O O
the O O O O
day O O O O
- O O O O
night O O O O
cycle O O O O
. O O O O
    
Low O O O O
oxygen O O O O
plays O O O O
an O O O O
important O O O O
role O O O O
for O O O O
the O O O O
induction O O O O
of O O O O
HYD1 O O O O
, O O O O
HYDEF O O O O
and O O O O
HYDG O O O O
, O O O O
while O O O O
ADH1 O O O O
and O O O O
HYD2 O O O O
expression O O O O
was O O O O
relatively O O O O
insensitive O O O O
to O O O O
oxygen O O O O
availability O O O O
. O O O O
    
* O O O O
The O O O O
regulation O O O O
of O O O O
the O O O O
anaerobic O O O O
gene O O O O
expression O O O O
in O O O O
Chlamydomonas O O O O
is O O O O
only O O O O
partly O O O O
explained O O O O
by O O O O
responses O O O O
to O O O O
anoxia O O O O
. O O O O
    
The O O O O
cell O O O O
cycle O O O O
and O O O O
light O O O O
- O O O O
dark O O O O
cycles O O O O
are O O O O
equally O O O O
important O O O O
elements O O O O
in O O O O
the O O O O
regulatory O O O O
network O O O O
modulating O O O O
the O O O O
anaerobic O O O O
response O O O O
in O O O O
Chlamydomonas O O O O
. O O O O
    
Evaluation O O O O
of O O O O
the O O O O
Virus O O O O
Counter O O O O
( O O O O
R O O O O
) O O O O
for O O O O
rapid O O O O
baculovirus O O O O
quantitation O O O O
. O O O O
    
The O O O O
utility O O O O
of O O O O
a O O O O
new O O O O
instrument O O O O
for O O O O
rapid O O O O
virus O O O O
quantitation O O O O
, O O O O
the O O O O
Virus O O O O
Counter O O O O
, O O O O
was O O O O
evaluated O O O O
in O O O O
a O O O O
blind O O O O
study O O O O
conducted O O O O
at O O O O
three O O O O
sites O O O O
. O O O O
    
This O O O O
instrument O O O O
is O O O O
a O O O O
substantially O O O O
improved O O O O
version O O O O
of O O O O
the O O O O
original O O O O
academic O O O O
research O O O O
instrument O O O O
described O O O O
previously O O O O
by O O O O
Stoffel O O O O
and O O O O
Rowlen O O O O
( O O O O
2005a O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
addition O O O O
of O O O O
hydrodynamic O O O O
focusing O O O O
, O O O O
a O O O O
self O O O O
- O O O O
contained O O O O
fluidics O O O O
system O O O O
and O O O O
customized O O O O
software O O O O
for O O O O
system O O O O
control O O O O
and O O O O
data O O O O
analysis O O O O
has O O O O
resulted O O O O
in O O O O
a O O O O
commercially O O O O
viable O O O O
and O O O O
available O O O O
design O O O O
. O O O O
    
Baculovirus O O O O
samples O O O O
were O O O O
provided O O O O
by O O O O
Protein O O O O
Sciences O O O O
Corporation O O O O
and O O O O
blinded O O O O
to O O O O
InDevR O O O O
and O O O O
Baylor O O O O
College O O O O
of O O O O
Medicine O O O O
. O O O O
    
Protein O O O O
Sciences O O O O
Corporation O O O O
and O O O O
Baylor O O O O
College O O O O
of O O O O
Medicine O O O O
analyzed O O O O
the O O O O
samples O O O O
by O O O O
plaque O O O O
assay O O O O
and O O O O
InDevR O O O O
analyzed O O O O
the O O O O
samples O O O O
using O O O O
the O O O O
Virus O O O O
Counter O O O O
. O O O O
    
Serial O O O O
dilution O O O O
of O O O O
stock O O O O
viruses O O O O
into O O O O
growth O O O O
media O O O O
and O O O O
buffer O O O O
allowed O O O O
for O O O O
comparison O O O O
of O O O O
measured O O O O
versus O O O O
intended O O O O
concentrations O O O O
. O O O O
    
Direct O O O O
log O O O O
- O O O O
scale O O O O
comparison O O O O
between O O O O
pooled O O O O
Virus O O O O
Counter O O O O
results O O O O
and O O O O
pooled O O O O
plaque O O O O
assay O O O O
results O O O O
indicated O O O O
a O O O O
linear O O O O
relationship O O O O
( O O O O
slope O O O O
= O O O O
1 O O O O
. O O O O
1 O O O O
+ O O O O
/ O O O O
- O O O O
0 O O O O
. O O O O
2 O O O O
, O O O O
R O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
= O O O O
0 O O O O
. O O O O
86 O O O O
) O O O O
with O O O O
statistically O O O O
significant O O O O
Pearson O O O O
correlation O O O O
( O O O O
r O O O O
= O O O O
0 O O O O
. O O O O
93 O O O O
, O O O O
p O O O O
& O O O O
lt O O O O
; O O O O
0 O O O O
. O O O O
001 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Applied O O O O
biotechnology O O O O
for O O O O
production O O O O
of O O O O
immunoglobulin O O O O
Y O O O O
specific O O O O
to O O O O
hepatitis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
A O O O O
new O O O O
protocol O O O O
for O O O O
producing O O O O
polyclonal O O O O
antibody O O O O
against O O O O
hepatitis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
HAV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
is O O O O
described O O O O
. O O O O
    
Twenty O O O O
hens B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
were O O O O
immunized O O O O
three O O O O
times O O O O
with O O O O
a O O O O
commercial O O O O
HAV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
vaccine O O O O
and O O O O
HAV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
from O O O O
a O O O O
cell O O O O
culture O O O O
with O O O O
three O O O O
types O O O O
of O O O O
adjuvants O O O O
: O O O O
CpG O O O O
oligodeoxynucleotides O O O O
( O O O O
CpG O O O O
- O O O O
ODN O O O O
) O O O O
, O O O O
incomplete O O O O
Freund O O O O
' O O O O
s O O O O
adjuvant O O O O
and O O O O
an O O O O
alum O O O O
adjuvant O O O O
. O O O O
    
In O O O O
each O O O O
of O O O O
the O O O O
last O O O O
two O O O O
booster O O O O
inoculations O O O O
, O O O O
blood O O O O
from O O O O
the O O O O
birds O O O O
was O O O O
collected O O O O
and O O O O
tested O O O O
for O O O O
HAV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
antibodies O O O O
. O O O O
    
Egg O O O O
yolk O O O O
was O O O O
separated O O O O
from O O O O
egg O O O O
white O O O O
and O O O O
immunoglobulin O O O O
Y O O O O
( O O O O
IgY O O O O
) O O O O
antibody O O O O
was O O O O
then O O O O
purified O O O O
by O O O O
polyethylene O O O O
glycol O O O O
6000 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
mean O O O O
yield O O O O
of O O O O
total O O O O
protein O O O O
in O O O O
yolk O O O O
was O O O O
22 O O O O
. O O O O
62 O O O O
mg O O O O
/ O O O O
mL O O O O
. O O O O
    
Specific O O O O
activity O O O O
of O O O O
the O O O O
antibody O O O O
was O O O O
tested O O O O
using O O O O
commercial O O O O
ELISA O O O O
, O O O O
Western O O O O
blotting O O O O
, O O O O
and O O O O
in O O O O
vitro O O O O
neutralization O O O O
assay O O O O
demonstrating O O O O
that O O O O
anti O O O O
- O O O O
HAV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
IgY O O O O
bound O O O O
specifically O O O O
. O O O O
    
After O O O O
the O O O O
first O O O O
immunization O O O O
, O O O O
birds O O O O
immunized O O O O
with O O O O
HAV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
from O O O O
cell O O O O
culture O O O O
plus O O O O
incomplete O O O O
Freund O O O O
' O O O O
s O O O O
adjuvant O O O O
with O O O O
/ O O O O
without O O O O
CpG O O O O
- O O O O
ODN O O O O
showed O O O O
highest O O O O
levels O O O O
of O O O O
anti O O O O
- O O O O
HAV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
IgY O O O O
in O O O O
serum O O O O
( O O O O
p O O O O
& O O O O
lt O O O O
; O O O O
0 O O O O
. O O O O
05 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Viral O O O O
combination O O O O
with O O O O
CpG O O O O
- O O O O
ODN O O O O
resulted O O O O
in O O O O
early O O O O
response O O O O
of O O O O
anti O O O O
- O O O O
HAV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
serum O O O O
in O O O O
hens B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
reflecting O O O O
the O O O O
amount O O O O
of O O O O
IgY O O O O
transferred O O O O
to O O O O
the O O O O
egg O O O O
yolk O O O O
( O O O O
p O O O O
& O O O O
lt O O O O
; O O O O
0 O O O O
. O O O O
05 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
egg O O O O
yolk O O O O
may O O O O
be O O O O
a O O O O
large O O O O
scale O O O O
source O O O O
of O O O O
specific O O O O
antibodies O O O O
against O O O O
hepatitis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Further O O O O
applications O O O O
of O O O O
this O O O O
method O O O O
have O O O O
yet O O O O
to O O O O
be O O O O
tested O O O O
. O O O O
    
Cotterillia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bromelicola O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gen O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
spec O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
a O O O O
gonostomatid O O O O
ciliate O O O O
( O O O O
Ciliophora O O O O
, O O O O
Hypotricha O O O O
) O O O O
from O O O O
tank O O O O
bromeliads O O O O
( O O O O
Bromeliaceae O O O O
) O O O O
with O O O O
de O O O O
novo O O O O
originating O O O O
dorsal O O O O
kineties O O O O
. O O O O
    
Cotterillia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bromelicola O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gen O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nov O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
spec O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
    
was O O O O
discovered O O O O
in O O O O
the O O O O
tanks O O O O
of O O O O
the O O O O
Mexican O O O O
bromeliad O O O O
Tillandsia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
heterophylla O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Its O O O O
morphology O O O O
, O O O O
ontogenesis O O O O
, O O O O
and O O O O
18S O O O O
rDNA O O O O
were O O O O
studied O O O O
with O O O O
standard O O O O
methods O O O O
. O O O O
    
Cotterillia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
has O O O O
many O O O O
cirral O O O O
rows O O O O
on O O O O
both O O O O
sides O O O O
of O O O O
the O O O O
body O O O O
. O O O O
    
Uniquely O O O O
, O O O O
and O O O O
thus O O O O
used O O O O
to O O O O
diagnose O O O O
the O O O O
new O O O O
genus O O O O
Cotterillia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
it O O O O
has O O O O
dorsal O O O O
kineties O O O O
originating O O O O
de O O O O
novo O O O O
, O O O O
producing O O O O
neokinetal O O O O
waves O O O O
where O O O O
the O O O O
parental O O O O
dorsal O O O O
kineties O O O O
reorganize O O O O
to O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
combined O O O O
rows O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
, O O O O
consisting O O O O
of O O O O
dorsal O O O O
bristles O O O O
anteriorly O O O O
and O O O O
of O O O O
cirri O O O O
posteriorly O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
up O O O O
to O O O O
four O O O O
generations O O O O
of O O O O
bristles O O O O
and O O O O
cirri O O O O
occur O O O O
on O O O O
the O O O O
dorsal O O O O
body O O O O
surface O O O O
. O O O O
    
Cotterillia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bromelicola O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
has O O O O
a O O O O
gonostomatid O O O O
body O O O O
and O O O O
adoral O O O O
zone O O O O
of O O O O
membranelles O O O O
, O O O O
while O O O O
the O O O O
dense O O O O
ciliature O O O O
and O O O O
the O O O O
neokinetal O O O O
waves O O O O
resemble O O O O
kahliellid O O O O
hypotrichs O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
de O O O O
novo O O O O
origin O O O O
of O O O O
anlage O O O O
1 O O O O
and O O O O
the O O O O
molecular O O O O
analyses O O O O
show O O O O
convincingly O O O O
that O O O O
Cotterillia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
belongs O O O O
to O O O O
the O O O O
Gonostomatidae O O O O
Small O O O O
and O O O O
Lynn O O O O
, O O O O
1985 O O O O
, O O O O
for O O O O
which O O O O
an O O O O
improved O O O O
diagnosis O O O O
is O O O O
provided O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
neokinetal O O O O
waves O O O O
originated O O O O
several O O O O
times O O O O
independently O O O O
. O O O O
    
The O O O O
molecular O O O O
differences O O O O
between O O O O
Trachelostyla O O O O
, O O O O
Gonostomum O O O O
, O O O O
and O O O O
Cotterillia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
are O O O O
small O O O O
( O O O O
= O O O O
< O O O O
5 O O O O
% O O O O
) O O O O
compared O O O O
to O O O O
their O O O O
distinct O O O O
morphologies O O O O
and O O O O
ontogeneses O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
the O O O O
18S O O O O
rDNA O O O O
underestimates O O O O
generic O O O O
diversity O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
study O O O O
emphasizes O O O O
the O O O O
need O O O O
of O O O O
combined O O O O
morphological O O O O
, O O O O
ontogenetic O O O O
, O O O O
and O O O O
molecular O O O O
investigations O O O O
to O O O O
unravel O O O O
the O O O O
complex O O O O
phylogeny O O O O
and O O O O
evolution O O O O
of O O O O
hypotrich O O O O
ciliates O O O O
. O O O O
    
The O O O O
nodulation O O O O
of O O O O
alfalfa O O O O
by O O O O
the O O O O
acid O O O O
- O O O O
tolerant O O O O
Rhizobium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
LPU83 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
does O O O O
not O O O O
require O O O O
sulfated O O O O
forms O O O O
of O O O O
lipochitooligosaccharide O O O O
nodulation O O O O
signals O O O O
. O O O O
    
The O O O O
induction O O O O
of O O O O
root O O O O
nodules O O O O
by O O O O
the O O O O
majority O O O O
of O O O O
rhizobia O O O O
has O O O O
a O O O O
strict O O O O
requirement O O O O
for O O O O
the O O O O
secretion O O O O
of O O O O
symbiosis O O O O
- O O O O
specific O O O O
lipochitooligosaccharides O O O O
( O O O O
nodulation O O O O
factors O O O O
[ O O O O
NFs O O O O
] O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
nature O O O O
of O O O O
the O O O O
chemical O O O O
substitution O O O O
on O O O O
the O O O O
NFs O O O O
depends O O O O
on O O O O
the O O O O
particular O O O O
rhizobium O O O O
and O O O O
contributes O O O O
to O O O O
the O O O O
host O O O O
specificity O O O O
imparted O O O O
by O O O O
the O O O O
NFs O O O O
. O O O O
    
We O O O O
present O O O O
here O O O O
a O O O O
description O O O O
of O O O O
the O O O O
genetic O O O O
organization O O O O
of O O O O
the O O O O
nod O O O O
gene O O O O
cluster O O O O
and O O O O
the O O O O
characterization O O O O
of O O O O
the O O O O
chemical O O O O
structure O O O O
of O O O O
the O O O O
NFs O O O O
associated O O O O
with O O O O
the O O O O
broad O O O O
- O O O O
host O O O O
- O O O O
range O O O O
Rhizobium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
LPU83 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
a O O O O
bacterium O O O O
capable O O O O
of O O O O
nodulating O O O O
at O O O O
least O O O O
alfalfa B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
bean O O O O
, O O O O
and O O O O
Leucena B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
leucocephala O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
nod O O O O
gene O O O O
cluster O O O O
was O O O O
located O O O O
on O O O O
the O O O O
plasmid O O O O
pLPU83b O O O O
. O O O O
    
The O O O O
organization O O O O
of O O O O
the O O O O
cluster O O O O
showed O O O O
synteny O O O O
with O O O O
those O O O O
of O O O O
the O O O O
alfalfa B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
nodulating O O O O
rhizobia O O O O
, O O O O
Sinorhizobium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
meliloti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Sinorhizobium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
medicae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Interestingly O O O O
, O O O O
the O O O O
strongest O O O O
sequence O O O O
similarity O O O O
observed O O O O
was O O O O
between O O O O
the O O O O
partial O O O O
nod O O O O
sequences O O O O
of O O O O
Rhizobium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mongolense O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
USDA O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1844 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
the O O O O
corresponding O O O O
LPU83 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nod O O O O
genes O O O O
sequences O O O O
. O O O O
    
The O O O O
phylogenetic O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
intergenic O O O O
region O O O O
nodEG O O O O
positions O O O O
strain O O O O
LPU83 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
the O O O O
type O O O O
strain O O O O
R B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
mongolense O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1844 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
the O O O O
same O O O O
branch O O O O
, O O O O
which O O O O
indicates O O O O
that O O O O
Rhizobium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
LPU83 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
might O O O O
represent O O O O
an O O O O
early O O O O
alfalfa B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
nodulating O O O O
genotype O O O O
. O O O O
    
The O O O O
NF O O O O
chemical O O O O
structures O O O O
obtained O O O O
for O O O O
the O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
strain O O O O
consist O O O O
of O O O O
a O O O O
trimeric O O O O
, O O O O
tetrameric O O O O
, O O O O
and O O O O
pentameric O O O O
chitin O O O O
backbone O O O O
that O O O O
shares O O O O
some O O O O
substitutions O O O O
with O O O O
both O O O O
alfalfa O O O O
- O O O O
and O O O O
bean O O O O
- O O O O
nodulating O O O O
rhizobia O O O O
. O O O O
    
Remarkably O O O O
, O O O O
while O O O O
in O O O O
strain O O O O
LPU83 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
most O O O O
of O O O O
the O O O O
NFs O O O O
were O O O O
sulfated O O O O
in O O O O
their O O O O
reducing O O O O
terminal O O O O
residue O O O O
, O O O O
none O O O O
of O O O O
the O O O O
NFs O O O O
isolated O O O O
from O O O O
the O O O O
nodH O O O O
mutant O O O O
LPU83 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
were O O O O
sulfated O O O O
. O O O O
    
The O O O O
evidence O O O O
obtained O O O O
supports O O O O
the O O O O
notion O O O O
that O O O O
the O O O O
sulfate O O O O
decoration O O O O
of O O O O
NFs O O O O
in O O O O
LPU83 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
is O O O O
not O O O O
necessary O O O O
for O O O O
alfalfa B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nodulation O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Rcs O O O O
signal O O O O
transduction O O O O
pathway O O O O
is O O O O
triggered O O O O
by O O O O
enterobacterial O O O O
common O O O O
antigen O O O O
structure O O O O
alterations O O O O
in O O O O
Serratia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
marcescens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
enterobacterial O O O O
common O O O O
antigen O O O O
( O O O O
ECA O O O O
) O O O O
is O O O O
a O O O O
highly O O O O
conserved O O O O
exopolysaccharide O O O O
in O O O O
Gram O O O O
- O O O O
negative O O O O
bacteria O O O O
whose O O O O
role O O O O
remains O O O O
largely O O O O
uncharacterized O O O O
. O O O O
    
In O O O O
a O O O O
previous O O O O
work O O O O
, O O O O
we O O O O
have O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
disrupting O O O O
the O O O O
integrity O O O O
of O O O O
the O O O O
ECA O O O O
biosynthetic O O O O
pathway O O O O
imposed O O O O
severe O O O O
deficiencies O O O O
to O O O O
the O O O O
Serratia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
marcescens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
motile O O O O
( O O O O
swimming O O O O
and O O O O
swarming O O O O
) O O O O
capacity O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
work O O O O
, O O O O
we O O O O
show O O O O
that O O O O
alterations O O O O
in O O O O
the O O O O
ECA O O O O
structure O O O O
activate O O O O
the O O O O
Rcs O O O O
phosphorelay O O O O
, O O O O
which O O O O
results O O O O
in O O O O
the O O O O
repression O O O O
of O O O O
the O O O O
flagellar O O O O
biogenesis O O O O
regulatory O O O O
cascade O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
, O O O O
a O O O O
detailed O O O O
analysis O O O O
of O O O O
wec O O O O
cluster O O O O
mutant O O O O
strains O O O O
, O O O O
which O O O O
provoke O O O O
the O O O O
disruption O O O O
of O O O O
the O O O O
ECA O O O O
biosynthesis O O O O
at O O O O
different O O O O
levels O O O O
of O O O O
the O O O O
pathway O O O O
, O O O O
suggests O O O O
that O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
the O O O O
periplasmic O O O O
ECA O O O O
cyclic O O O O
structure O O O O
could O O O O
constitute O O O O
a O O O O
potential O O O O
signal O O O O
detected O O O O
by O O O O
the O O O O
RcsF O O O O
- O O O O
RcsCDB O O O O
phosphorelay O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
identify O O O O
SMA1167 O O O O
as O O O O
a O O O O
member O O O O
of O O O O
the O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
marcescens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Rcs O O O O
regulon O O O O
and O O O O
show O O O O
that O O O O
high O O O O
osmolarity O O O O
induces O O O O
Rcs O O O O
activity O O O O
in O O O O
this O O O O
bacterium O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
provide O O O O
a O O O O
new O O O O
perspective O O O O
from O O O O
which O O O O
to O O O O
understand O O O O
the O O O O
phylogenetic O O O O
conservation O O O O
of O O O O
ECA O O O O
among O O O O
enterobacteria O O O O
and O O O O
the O O O O
basis O O O O
for O O O O
the O O O O
virulence O O O O
attenuation O O O O
detected O O O O
in O O O O
wec O O O O
mutant O O O O
strains O O O O
in O O O O
other O O O O
pathogenic O O O O
bacteria O O O O
. O O O O
    
A O O O O
cis O O O O
- O O O O
encoded O O O O
antisense O O O O
small O O O O
RNA O O O O
regulated O O O O
by O O O O
the O O O O
HP0165 O O O O
- O O O O
HP0166 O O O O
two O O O O
- O O O O
component O O O O
system O O O O
controls O O O O
expression O O O O
of O O O O
ureB O O O O
in O O O O
Helicobacter B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pylori O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Expression O O O O
of O O O O
urease O O O O
is O O O O
essential O O O O
for O O O O
gastric O O O O
colonization O O O O
by O O O O
Helicobacter B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pylori O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
increased O O O O
level O O O O
of O O O O
urease O O O O
in O O O O
gastric O O O O
acidity O O O O
is O O O O
due O O O O
, O O O O
in O O O O
part O O O O
, O O O O
to O O O O
acid O O O O
activation O O O O
of O O O O
the O O O O
two O O O O
- O O O O
component O O O O
system O O O O
( O O O O
TCS O O O O
) O O O O
consisting O O O O
of O O O O
the O O O O
membrane O O O O
sensor O O O O
HP0165 O O O O
and O O O O
its O O O O
response O O O O
regulator O O O O
, O O O O
HP0166 O O O O
, O O O O
which O O O O
regulates O O O O
transcription O O O O
of O O O O
the O O O O
seven O O O O
genes O O O O
of O O O O
the O O O O
urease O O O O
gene O O O O
cluster O O O O
. O O O O
    
We O O O O
now O O O O
find O O O O
that O O O O
there O O O O
are O O O O
two O O O O
major O O O O
ureAB O O O O
transcripts O O O O
: O O O O
a O O O O
2 O O O O
. O O O O
7 O O O O
- O O O O
kb O O O O
full O O O O
- O O O O
length O O O O
ureAB O O O O
transcript O O O O
and O O O O
a O O O O
1 O O O O
. O O O O
4 O O O O
- O O O O
kb O O O O
truncated O O O O
transcript O O O O
lacking O O O O
3 O O O O
' O O O O
ureB O O O O
. O O O O
    
Acidic O O O O
pH O O O O
( O O O O
pH O O O O
4 O O O O
. O O O O
5 O O O O
) O O O O
results O O O O
in O O O O
a O O O O
significant O O O O
increase O O O O
in O O O O
transcription O O O O
of O O O O
ureAB O O O O
, O O O O
while O O O O
neutral O O O O
pH O O O O
( O O O O
pH O O O O
7 O O O O
. O O O O
4 O O O O
) O O O O
increases O O O O
the O O O O
truncated O O O O
1 O O O O
. O O O O
4 O O O O
- O O O O
kb O O O O
transcript O O O O
. O O O O
    
Northern O O O O
blot O O O O
analysis O O O O
with O O O O
sense O O O O
RNA O O O O
and O O O O
strand O O O O
- O O O O
specific O O O O
oligonucleotide O O O O
probes O O O O
followed O O O O
by O O O O
5 O O O O
' O O O O
rapid O O O O
amplification O O O O
of O O O O
cDNA O O O O
ends O O O O
detects O O O O
an O O O O
antisense O O O O
small O O O O
RNA O O O O
( O O O O
sRNA O O O O
) O O O O
encoded O O O O
by O O O O
the O O O O
5 O O O O
' O O O O
ureB O O O O
noncoding O O O O
strand O O O O
consisting O O O O
of O O O O
- O O O O
290 O O O O
nucleotides O O O O
( O O O O
5 O O O O
' O O O O
ureB O O O O
- O O O O
sRNA O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Deletion O O O O
of O O O O
HP0165 O O O O
elevates O O O O
the O O O O
level O O O O
of O O O O
the O O O O
truncated O O O O
1 O O O O
. O O O O
4 O O O O
- O O O O
kb O O O O
transcript O O O O
along O O O O
with O O O O
that O O O O
of O O O O
the O O O O
5 O O O O
' O O O O
ureB O O O O
- O O O O
sRNA O O O O
at O O O O
both O O O O
pH O O O O
7 O O O O
. O O O O
4 O O O O
and O O O O
pH O O O O
4 O O O O
. O O O O
5 O O O O
. O O O O
    
Overexpression O O O O
of O O O O
5 O O O O
' O O O O
ureB O O O O
- O O O O
sRNA O O O O
increases O O O O
the O O O O
1 O O O O
. O O O O
4 O O O O
- O O O O
kb O O O O
transcript O O O O
, O O O O
decreases O O O O
the O O O O
2 O O O O
. O O O O
7 O O O O
- O O O O
kb O O O O
transcript O O O O
, O O O O
and O O O O
decreases O O O O
urease O O O O
activity O O O O
. O O O O
    
Electrophoretic O O O O
mobility O O O O
shift O O O O
assay O O O O
shows O O O O
that O O O O
unphosphorylated O O O O
HP0166 O O O O
binds O O O O
specifically O O O O
to O O O O
the O O O O
5 O O O O
' O O O O
ureB O O O O
- O O O O
sRNA O O O O
promoter O O O O
. O O O O
    
The O O O O
ability O O O O
of O O O O
the O O O O
HP0165 O O O O
- O O O O
HP0166 O O O O
TCS O O O O
to O O O O
both O O O O
increase O O O O
and O O O O
decrease O O O O
ureB O O O O
expression O O O O
at O O O O
low O O O O
and O O O O
high O O O O
pHs O O O O
, O O O O
respectively O O O O
, O O O O
facilitates O O O O
gastric O O O O
habitation O O O O
and O O O O
colonization O O O O
over O O O O
the O O O O
wide O O O O
range O O O O
of O O O O
intragastric O O O O
pHs O O O O
experienced O O O O
by O O O O
the O O O O
organism O O O O
. O O O O
    
Non O O O O
- O O O O
structural O O O O
protein O O O O
1 O O O O
( O O O O
NS1 O O O O
) O O O O
antibody O O O O
- O O O O
based O O O O
assays O O O O
to O O O O
differentiate O O O O
West B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
Nile O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
WN O O O O
) O O O O
virus O O O O
from O O O O
Japanese O O O O
encephalitis O O O O
virus O O O O
infections O O O O
in O O O O
horses O O O O
: O O O O
effects O O O O
of O O O O
WN B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
NS1 O O O O
antibodies O O O O
induced O O O O
by O O O O
inactivated O O O O
WN O O O O
vaccine O O O O
. O O O O
    
Antibodies O O O O
to O O O O
non O O O O
- O O O O
structural O O O O
protein O O O O
1 O O O O
( O O O O
NS1 O O O O
) O O O O
of O O O O
West O O O O
Nile O O O O
virus O O O O
( O O O O
WNV O O O O
) O O O O
have O O O O
been O O O O
used O O O O
to O O O O
differentiate O O O O
WNV O O O O
infection O O O O
from O O O O
infection O O O O
by O O O O
serologically O O O O
cross O O O O
- O O O O
reactive O O O O
flaviviruses O O O O
, O O O O
including O O O O
Japanese B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
encephalitis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
JEV O O O O
) O O O O
, O O O O
in O O O O
horses O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
since O O O O
the O O O O
inactivated O O O O
West O O O O
Nile O O O O
( O O O O
WN B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
vaccine O O O O
has O O O O
been O O O O
reported O O O O
to O O O O
induce O O O O
NS1 O O O O
antibodies O O O O
, O O O O
there O O O O
is O O O O
concern O O O O
about O O O O
the O O O O
reliability O O O O
of O O O O
using O O O O
NS1 O O O O
- O O O O
based O O O O
assays O O O O
for O O O O
testing O O O O
vaccinated O O O O
horses O O O O
. O O O O
    
Therefore O O O O
, O O O O
the O O O O
effect O O O O
of O O O O
inactivated O O O O
WN B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
vaccine O O O O
- O O O O
induced O O O O
antibodies O O O O
on O O O O
an O O O O
epitope O O O O
- O O O O
blocking O O O O
ELISA O O O O
and O O O O
complement O O O O
- O O O O
dependent O O O O
cytotoxicity O O O O
( O O O O
CDC O O O O
) O O O O
assay O O O O
were O O O O
investigated O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
assays O O O O
are O O O O
based O O O O
on O O O O
NS1 O O O O
antibodies O O O O
and O O O O
were O O O O
established O O O O
previously O O O O
to O O O O
differentiate O O O O
WNV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
from O O O O
JEV O O O O
infections O O O O
in O O O O
horses O O O O
. O O O O
    
Groups O O O O
of O O O O
three O O O O
horses O O O O
were O O O O
vaccinated O O O O
with O O O O
two O O O O
or O O O O
three O O O O
doses O O O O
of O O O O
a O O O O
commercial O O O O
inactivated O O O O
WN O O O O
vaccine O O O O
and O O O O
NS1 O O O O
antibodies O O O O
were O O O O
detected O O O O
by O O O O
a O O O O
conventional O O O O
ELISA O O O O
after O O O O
the O O O O
second O O O O
vaccination O O O O
. O O O O
    
Vaccine O O O O
- O O O O
induced O O O O
NS1 O O O O
antibodies O O O O
were O O O O
also O O O O
detected O O O O
by O O O O
blocking O O O O
ELISA O O O O
and O O O O
a O O O O
CDC O O O O
assay O O O O
and O O O O
affected O O O O
the O O O O
ability O O O O
of O O O O
these O O O O
assays O O O O
to O O O O
differentiate O O O O
WNV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
from O O O O
JEV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infections O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
effect O O O O
was O O O O
less O O O O
significant O O O O
in O O O O
the O O O O
CDC O O O O
assay O O O O
, O O O O
where O O O O
use O O O O
of O O O O
a O O O O
low O O O O
serum O O O O
concentration O O O O
ensured O O O O
effective O O O O
differentiation O O O O
. O O O O
    
The O O O O
more O O O O
efficient O O O O
detection O O O O
of O O O O
infection O O O O
- O O O O
induced O O O O
antibodies O O O O
over O O O O
vaccine O O O O
- O O O O
induced O O O O
antibodies O O O O
by O O O O
the O O O O
CDC O O O O
assay O O O O
was O O O O
potentially O O O O
attributable O O O O
to O O O O
the O O O O
different O O O O
IgG O O O O
isotype O O O O
profiles O O O O
of O O O O
these O O O O
antibodies O O O O
. O O O O
    
The O O O O
B O O O O
cell O O O O
response O O O O
is O O O O
redundant O O O O
and O O O O
highly O O O O
focused O O O O
on O O O O
V1V2 O O O O
during O O O O
early O O O O
subtype O O O O
C O O O O
infection O O O O
in O O O O
a O O O O
Zambian O O O O
seroconverter O O O O
. O O O O
    
High O O O O
- O O O O
titer O O O O
autologous O O O O
neutralizing O O O O
antibody O O O O
responses O O O O
have O O O O
been O O O O
demonstrated O O O O
during O O O O
early O O O O
subtype O O O O
C O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
immunodeficiency O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
type O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
characterization O O O O
of O O O O
this O O O O
response O O O O
against O O O O
autologous O O O O
virus O O O O
at O O O O
the O O O O
monoclonal O O O O
antibody O O O O
( O O O O
MAb O O O O
) O O O O
level O O O O
has O O O O
only O O O O
recently O O O O
begun O O O O
to O O O O
be O O O O
elucidated O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
describe O O O O
five O O O O
monoclonal O O O O
antibodies O O O O
derived O O O O
from O O O O
a O O O O
subtype O O O O
C O O O O
- O O O O
infected O O O O
seroconverter O O O O
and O O O O
their O O O O
neutralizing O O O O
activities O O O O
against O O O O
pseudoviruses O O O O
that O O O O
carry O O O O
envelope O O O O
glycoproteins O O O O
from O O O O
48 O O O O
days O O O O
( O O O O
0 O O O O
month O O O O
) O O O O
, O O O O
2 O O O O
months O O O O
, O O O O
and O O O O
8 O O O O
months O O O O
after O O O O
the O O O O
estimated O O O O
time O O O O
of O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
Sequence O O O O
analysis O O O O
indicated O O O O
that O O O O
the O O O O
MAbs O O O O
arose O O O O
from O O O O
three O O O O
distinct O O O O
B O O O O
cell O O O O
clones O O O O
, O O O O
and O O O O
their O O O O
pattern O O O O
of O O O O
neutralization O O O O
compared O O O O
to O O O O
that O O O O
in O O O O
patient O O O O
plasma O O O O
suggested O O O O
that O O O O
they O O O O
circulated O O O O
between O O O O
2 O O O O
and O O O O
8 O O O O
months O O O O
after O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
Neutralization O O O O
by O O O O
MAbs O O O O
representative O O O O
of O O O O
each O O O O
B O O O O
cell O O O O
clone O O O O
was O O O O
mapped O O O O
to O O O O
two O O O O
residues O O O O
: O O O O
position O O O O
134 O O O O
in O O O O
V1 O O O O
and O O O O
position O O O O
189 O O O O
in O O O O
V2 O O O O
. O O O O
    
Mutational O O O O
analysis O O O O
revealed O O O O
cooperative O O O O
effects O O O O
between O O O O
glycans O O O O
and O O O O
residues O O O O
at O O O O
these O O O O
two O O O O
positions O O O O
, O O O O
arguing O O O O
that O O O O
they O O O O
contribute O O O O
to O O O O
a O O O O
single O O O O
epitope O O O O
. O O O O
    
Analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
cognate O O O O
gp120 O O O O
sequence O O O O
through O O O O
homology O O O O
modeling O O O O
places O O O O
this O O O O
potential O O O O
epitope O O O O
near O O O O
the O O O O
interface O O O O
between O O O O
the O O O O
V1 O O O O
and O O O O
V2 O O O O
loops O O O O
. O O O O
    
Additionally O O O O
, O O O O
the O O O O
escape O O O O
mutation O O O O
R189S O O O O
in O O O O
V2 O O O O
, O O O O
which O O O O
conferred O O O O
resistance O O O O
against O O O O
all O O O O
three O O O O
MAbs O O O O
, O O O O
had O O O O
no O O O O
detrimental O O O O
effect O O O O
on O O O O
virus O O O O
replication O O O O
in O O O O
vitro O O O O
. O O O O
    
Taken O O O O
together O O O O
, O O O O
our O O O O
data O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
independent O O O O
B O O O O
cells O O O O
repeatedly O O O O
targeted O O O O
a O O O O
single O O O O
structure O O O O
in O O O O
V1V2 O O O O
during O O O O
early O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
Despite O O O O
this O O O O
assault O O O O
, O O O O
a O O O O
single O O O O
amino O O O O
acid O O O O
change O O O O
was O O O O
sufficient O O O O
to O O O O
confer O O O O
complete O O O O
escape O O O O
with O O O O
minimal O O O O
impact O O O O
on O O O O
replication O O O O
fitness O O O O
. O O O O
    
A O O O O
nuclear O O O O
inhibitor O O O O
of O O O O
NF O O O O
- O O O O
kappaB O O O O
encoded O O O O
by O O O O
a O O O O
poxvirus O O O O
. O O O O
    
Poxviruses O O O O
have O O O O
evolved O O O O
various O O O O
strategies O O O O
to O O O O
inhibit O O O O
cytoplasmic O O O O
events O O O O
leading O O O O
to O O O O
activation O O O O
of O O O O
the O O O O
nuclear O O O O
factor O O O O
kappaB O O O O
( O O O O
NF O O O O
- O O O O
kappaB O O O O
) O O O O
signaling O O O O
pathway O O O O
, O O O O
with O O O O
individual O O O O
viruses O O O O
often O O O O
encoding O O O O
multiple O O O O
NF O O O O
- O O O O
kappaB O O O O
inhibitors O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
the O O O O
novel O O O O
orf B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
ORFV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
- O O O O
encoded O O O O
protein O O O O
ORFV002 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
was O O O O
shown O O O O
to O O O O
inhibit O O O O
nuclear O O O O
events O O O O
regulating O O O O
NF O O O O
- O O O O
kappaB O O O O
transcriptional O O O O
activity O O O O
. O O O O
    
ORFV002 O O O O
expression O O O O
in O O O O
cell O O O O
cultures O O O O
significantly O O O O
decreased O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
- O O O O
virus O O O O
- O O O O
, O O O O
tumor O O O O
necrosis O O O O
factor O O O O
alpha O O O O
( O O O O
TNF O O O O
- O O O O
alpha O O O O
) O O O O
- O O O O
, O O O O
and O O O O
lipopolysaccharide O O O O
( O O O O
LPS O O O O
) O O O O
- O O O O
induced O O O O
NF O O O O
- O O O O
kappaB O O O O
- O O O O
mediated O O O O
gene O O O O
expression O O O O
. O O O O
    
Expression O O O O
of O O O O
ORFV002 O O O O
in O O O O
cells O O O O
, O O O O
while O O O O
not O O O O
affecting O O O O
phosphorylation O O O O
or O O O O
nuclear O O O O
translocation O O O O
of O O O O
NF O O O O
- O O O O
kappaB O O O O
- O O O O
p65 O O O O
, O O O O
markedly O O O O
decreased O O O O
TNF O O O O
- O O O O
alpha O O O O
- O O O O
and O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
- O O O O
virus O O O O
- O O O O
induced O O O O
acetylation O O O O
of O O O O
NF O O O O
- O O O O
kappaB O O O O
- O O O O
p65 O O O O
, O O O O
a O O O O
p300 O O O O
- O O O O
mediated O O O O
nuclear O O O O
modification O O O O
of O O O O
NF O O O O
- O O O O
kappaB O O O O
- O O O O
p65 O O O O
that O O O O
regulates O O O O
its O O O O
transactivating O O O O
activity O O O O
. O O O O
    
ORFV002 O O O O
was O O O O
shown O O O O
to O O O O
colocalize O O O O
and O O O O
interact O O O O
with O O O O
NF O O O O
- O O O O
kappaB O O O O
- O O O O
p65 O O O O
, O O O O
and O O O O
expression O O O O
of O O O O
ORFV002 O O O O
in O O O O
cell O O O O
cultures O O O O
resulted O O O O
in O O O O
a O O O O
reduced O O O O
interaction O O O O
of O O O O
NF O O O O
- O O O O
kappaB O O O O
- O O O O
p65 O O O O
with O O O O
p300 O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
ORFV002 O O O O
interferes O O O O
with O O O O
NF O O O O
- O O O O
kappaB O O O O
- O O O O
p65 O O O O
/ O O O O
p300 O O O O
association O O O O
. O O O O
    
Deletion O O O O
of O O O O
ORFV002 O O O O
from O O O O
the O O O O
OV O O O O
- O O O O
IA82 O O O O
genome O O O O
had O O O O
no O O O O
significant O O O O
effect O O O O
on O O O O
ORFV O O O O
pathogenesis O O O O
in O O O O
sheep O O O O
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
ORFV002 O O O O
is O O O O
nonessential O O O O
for O O O O
virus O O O O
virulence O O O O
in O O O O
the O O O O
natural O O O O
host O O O O
. O O O O
    
This O O O O
represents O O O O
the O O O O
first O O O O
description O O O O
of O O O O
a O O O O
nuclear O O O O
inhibitor O O O O
of O O O O
NF O O O O
- O O O O
kappaB O O O O
encoded O O O O
by O O O O
a O O O O
poxvirus O O O O
. O O O O
    
Norovirus O O O O
GII O O O O
. O O O O
4 O O O O
strain O O O O
antigenic O O O O
variation O O O O
. O O O O
    
Noroviruses O O O O
are O O O O
the O O O O
principal O O O O
cause O O O O
of O O O O
epidemic O O O O
gastroenteritis O O O O
worldwide O O O O
. O O O O
    
Multiple O O O O
reports O O O O
have O O O O
concluded O O O O
that O O O O
the O O O O
major O O O O
capsid O O O O
proteins O O O O
of O O O O
GII O O O O
. O O O O
4 O O O O
strains O O O O
, O O O O
which O O O O
cause O O O O
80 O O O O
% O O O O
of O O O O
norovirus O O O O
infections O O O O
worldwide O O O O
, O O O O
are O O O O
evolving O O O O
rapidly O O O O
, O O O O
resulting O O O O
in O O O O
new O O O O
epidemic O O O O
strains O O O O
. O O O O
    
Surrogate O O O O
neutralization O O O O
assays O O O O
using O O O O
sera O O O O
from O O O O
outbreaks O O O O
and O O O O
from O O O O
immunized O O O O
mice O O O O
suggest O O O O
that O O O O
, O O O O
as O O O O
with O O O O
influenza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
antigenic O O O O
variation O O O O
maintains O O O O
GII O O O O
. O O O O
4 O O O O
persistence O O O O
in O O O O
the O O O O
face O O O O
of O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
population O O O O
herd O O O O
immunity O O O O
. O O O O
    
To O O O O
test O O O O
this O O O O
hypothesis O O O O
, O O O O
mice O O O O
were O O O O
hyperimmunized O O O O
with O O O O
virus O O O O
- O O O O
like O O O O
particles O O O O
( O O O O
VLPs O O O O
) O O O O
representing O O O O
an O O O O
early O O O O
( O O O O
GII O O O O
. O O O O
4 O O O O
- O O O O
1987 O O O O
) O O O O
and O O O O
a O O O O
contemporary O O O O
( O O O O
GII O O O O
. O O O O
4 O O O O
- O O O O
2006 O O O O
) O O O O
GII O O O O
. O O O O
4 O O O O
strain O O O O
. O O O O
    
Anti O O O O
- O O O O
GII O O O O
. O O O O
4 O O O O
- O O O O
1987 O O O O
IgG O O O O
monoclonal O O O O
antibodies O O O O
( O O O O
MAbs O O O O
) O O O O
strongly O O O O
reacted O O O O
with O O O O
GII O O O O
. O O O O
4 O O O O
VLPs O O O O
derived O O O O
between O O O O
only O O O O
1987 O O O O
and O O O O
2002 O O O O
. O O O O
    
Ligand O O O O
binding O O O O
blockade O O O O
was O O O O
more O O O O
efficient O O O O
with O O O O
GII O O O O
. O O O O
4 O O O O
- O O O O
1987 O O O O
and O O O O
GII O O O O
. O O O O
4 O O O O
- O O O O
1997 O O O O
VLPs O O O O
than O O O O
with O O O O
GII O O O O
. O O O O
4 O O O O
- O O O O
2002 O O O O
. O O O O
    
Anti O O O O
- O O O O
GII O O O O
. O O O O
4 O O O O
- O O O O
2006 O O O O
IgG O O O O
MAbs O O O O
recognized O O O O
either O O O O
a O O O O
broad O O O O
panel O O O O
of O O O O
GII O O O O
. O O O O
4 O O O O
VLPs O O O O
( O O O O
1987 O O O O
to O O O O
2006 O O O O
) O O O O
or O O O O
a O O O O
subset O O O O
of O O O O
contemporary O O O O
( O O O O
2004 O O O O
to O O O O
2006 O O O O
) O O O O
VLPs O O O O
. O O O O
    
Most O O O O
2006 O O O O
antibodies O O O O
did O O O O
not O O O O
recognize O O O O
or O O O O
only O O O O
poorly O O O O
recognized O O O O
GII O O O O
. O O O O
4 O O O O
VLPs O O O O
of O O O O
2007 O O O O
or O O O O
2008 O O O O
, O O O O
documenting O O O O
rapid O O O O
antigenic O O O O
evolution O O O O
of O O O O
GII O O O O
. O O O O
4 O O O O
capsids O O O O
. O O O O
    
Generally O O O O
, O O O O
2006 O O O O
MAbs O O O O
blocked O O O O
homotypic O O O O
VLP O O O O
- O O O O
ligand O O O O
binding O O O O
but O O O O
were O O O O
unable O O O O
to O O O O
block O O O O
VLPs O O O O
representing O O O O
strains O O O O
primarily O O O O
circulating O O O O
during O O O O
or O O O O
earlier O O O O
than O O O O
2002 O O O O
. O O O O
    
These O O O O
analyses O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
both O O O O
subtle O O O O
and O O O O
significant O O O O
evolutionary O O O O
change O O O O
has O O O O
occurred O O O O
within O O O O
antibody O O O O
epitopes O O O O
between O O O O
epidemic O O O O
strains O O O O
, O O O O
providing O O O O
direct O O O O
evidence O O O O
that O O O O
the O O O O
GII O O O O
. O O O O
4 O O O O
noroviruses O O O O
are O O O O
undergoing O O O O
antigenic O O O O
variation O O O O
, O O O O
likely O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
herd O O O O
immunity O O O O
. O O O O
    
As O O O O
with O O O O
influenza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
HIV O O O O
, O O O O
and O O O O
hepatitis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
C O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
norovirus O O O O
antigenic O O O O
variation O O O O
will O O O O
significantly O O O O
influence O O O O
the O O O O
design O O O O
of O O O O
efficacious O O O O
vaccines O O O O
and O O O O
immunotherapeutics O O O O
against O O O O
these O O O O
important O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pathogens O O O O
. O O O O
    
Dominant O O O O
inhibition O O O O
of O O O O
Akt O O O O
/ O O O O
protein O O O O
kinase O O O O
B O O O O
signaling O O O O
by O O O O
the O O O O
matrix O O O O
protein O O O O
of O O O O
a O O O O
negative O O O O
- O O O O
strand O O O O
RNA O O O O
virus O O O O
. O O O O
    
Vesicular B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
stomatitis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
VSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
is O O O O
a O O O O
rhabdovirus O O O O
that O O O O
alters O O O O
host O O O O
nuclear O O O O
and O O O O
cytoplasmic O O O O
function O O O O
upon O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
We O O O O
have O O O O
investigated O O O O
the O O O O
effect O O O O
of O O O O
VSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infection O O O O
on O O O O
cellular O O O O
signaling O O O O
through O O O O
the O O O O
phosphatidylinositol O O O O
- O O O O
3 O O O O
kinase O O O O
( O O O O
PI3k O O O O
) O O O O
/ O O O O
Akt O O O O
signaling O O O O
pathway O O O O
. O O O O
    
Akt O O O O
phosphorylation O O O O
at O O O O
both O O O O
threonine O O O O
308 O O O O
( O O O O
Thr308 O O O O
) O O O O
and O O O O
serine O O O O
473 O O O O
( O O O O
Ser473 O O O O
) O O O O
was O O O O
inhibited O O O O
in O O O O
cells O O O O
infected O O O O
with O O O O
VSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
This O O O O
inhibition O O O O
was O O O O
rapid O O O O
( O O O O
beginning O O O O
within O O O O
the O O O O
first O O O O
2 O O O O
to O O O O
3 O O O O
h O O O O
postinfection O O O O
) O O O O
and O O O O
correlated O O O O
with O O O O
the O O O O
dephosphorylation O O O O
of O O O O
downstream O O O O
effectors O O O O
of O O O O
Akt O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
glycogen O O O O
synthase O O O O
kinase O O O O
3Beta O O O O
( O O O O
GSK3Beta O O O O
) O O O O
and O O O O
mammalian O O O O
target O O O O
of O O O O
rapamycin O O O O
( O O O O
mTOR O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
dephosphorylation O O O O
of O O O O
Akt O O O O
occurred O O O O
in O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
growth O O O O
factor O O O O
stimulation O O O O
and O O O O
was O O O O
not O O O O
overcome O O O O
through O O O O
constitutive O O O O
membrane O O O O
targeting O O O O
of O O O O
Akt O O O O
or O O O O
high O O O O
levels O O O O
of O O O O
phosphatidylinositol O O O O
- O O O O
3 O O O O
, O O O O
4 O O O O
, O O O O
5 O O O O
- O O O O
triphosphate O O O O
( O O O O
PIP3 O O O O
) O O O O
accumulation O O O O
in O O O O
the O O O O
membrane O O O O
. O O O O
    
Akt O O O O
dephosphorylation O O O O
was O O O O
not O O O O
a O O O O
result O O O O
of O O O O
alterations O O O O
in O O O O
PDK1 O O O O
phosphorylation O O O O
or O O O O
activity O O O O
, O O O O
changes O O O O
in O O O O
phosphatase O O O O
and O O O O
tensin O O O O
homologue O O O O
deleted O O O O
on O O O O
chromosome O O O O
10 O O O O
( O O O O
PTEN O O O O
) O O O O
levels O O O O
, O O O O
or O O O O
the O O O O
downregulation O O O O
of O O O O
PI3k O O O O
signaling O O O O
. O O O O
    
Inactivation O O O O
of O O O O
Akt O O O O
was O O O O
caused O O O O
by O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
the O O O O
viral O O O O
M O O O O
protein O O O O
in O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
other O O O O
viral O O O O
components O O O O
, O O O O
and O O O O
an O O O O
M O O O O
protein O O O O
mutant O O O O
that O O O O
does O O O O
not O O O O
inhibit O O O O
RNA O O O O
polymerase O O O O
II O O O O
( O O O O
Pol O O O O
II O O O O
) O O O O
transcription O O O O
and O O O O
nuclear O O O O
/ O O O O
cytoplasmic O O O O
transport O O O O
was O O O O
also O O O O
defective O O O O
in O O O O
inhibiting O O O O
Akt O O O O
phosphorylation O O O O
. O O O O
    
These O O O O
data O O O O
illustrate O O O O
that O O O O
VSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
utilizes O O O O
a O O O O
novel O O O O
mechanism O O O O
to O O O O
alter O O O O
this O O O O
central O O O O
player O O O O
in O O O O
cell O O O O
signaling O O O O
and O O O O
oncogenesis O O O O
. O O O O
    
It O O O O
also O O O O
suggests O O O O
an O O O O
inside O O O O
- O O O O
out O O O O
model O O O O
of O O O O
signal O O O O
transduction O O O O
where O O O O
VSV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
interruption O O O O
of O O O O
nuclear O O O O
events O O O O
has O O O O
a O O O O
rapid O O O O
and O O O O
significant O O O O
effect O O O O
on O O O O
membrane O O O O
signaling O O O O
events O O O O
. O O O O
    
Activation O O O O
of O O O O
plasmacytoid O O O O
dendritic O O O O
cells O O O O
by O O O O
Kaposi B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
' O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
s O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sarcoma O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
associated O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
herpesvirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Kaposi B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
' O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
s O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sarcoma O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
associated O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
herpesvirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
KSHV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
is O O O O
associated O O O O
with O O O O
multiple O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
malignancies O O O O
, O O O O
including O O O O
Kaposi O O O O
' O O O O
s O O O O
sarcoma O O O O
, O O O O
primary O O O O
effusion O O O O
lymphoma O O O O
, O O O O
and O O O O
multicentric O O O O
Castleman O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
. O O O O
    
Following O O O O
primary O O O O
infection O O O O
, O O O O
KSHV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
typically O O O O
goes O O O O
through O O O O
a O O O O
brief O O O O
period O O O O
of O O O O
lytic O O O O
replication O O O O
prior O O O O
to O O O O
the O O O O
establishment O O O O
of O O O O
latency O O O O
. O O O O
    
Plasmacytoid O O O O
dendritic O O O O
cells O O O O
( O O O O
pDCs O O O O
) O O O O
are O O O O
the O O O O
major O O O O
producers O O O O
of O O O O
type O O O O
1 O O O O
interferon O O O O
( O O O O
IFN O O O O
) O O O O
, O O O O
primarily O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
virus O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
Toll O O O O
- O O O O
like O O O O
receptors O O O O
( O O O O
TLRs O O O O
) O O O O
are O O O O
key O O O O
components O O O O
of O O O O
the O O O O
innate O O O O
immune O O O O
system O O O O
, O O O O
and O O O O
they O O O O
serve O O O O
as O O O O
pathogen O O O O
recognition O O O O
receptors O O O O
that O O O O
stimulate O O O O
the O O O O
host O O O O
antiviral O O O O
response O O O O
. O O O O
    
pDCs O O O O
express O O O O
exclusively O O O O
TLR7 O O O O
and O O O O
TLR9 O O O O
, O O O O
and O O O O
it O O O O
is O O O O
through O O O O
these O O O O
TLRs O O O O
that O O O O
the O O O O
type O O O O
1 O O O O
interferon O O O O
response O O O O
is O O O O
activated O O O O
in O O O O
pDCs O O O O
. O O O O
    
Currently O O O O
, O O O O
it O O O O
is O O O O
not O O O O
known O O O O
whether O O O O
KSHV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
is O O O O
recognized O O O O
by O O O O
pDCs O O O O
and O O O O
whether O O O O
activation O O O O
of O O O O
pDCs O O O O
occurs O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
KSHV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infection O O O O
. O O O O
    
We O O O O
now O O O O
report O O O O
evidence O O O O
that O O O O
KSHV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
can O O O O
infect O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pDCs O O O O
and O O O O
that O O O O
pDCs O O O O
are O O O O
activated O O O O
upon O O O O
KSHV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infection O O O O
, O O O O
as O O O O
measured O O O O
by O O O O
upregulation O O O O
of O O O O
CD83 O O O O
and O O O O
CD86 O O O O
and O O O O
by O O O O
IFN O O O O
- O O O O
alpha O O O O
secretion O O O O
. O O O O
    
We O O O O
further O O O O
show O O O O
that O O O O
induction O O O O
of O O O O
IFN O O O O
- O O O O
alpha O O O O
occurs O O O O
through O O O O
activation O O O O
of O O O O
TLR9 O O O O
signaling O O O O
and O O O O
that O O O O
a O O O O
TLR9 O O O O
inhibitor O O O O
diminishes O O O O
the O O O O
production O O O O
and O O O O
secretion O O O O
of O O O O
IFN O O O O
- O O O O
alpha O O O O
by O O O O
KSHV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
infected O O O O
pDCs O O O O
. O O O O
    
An O O O O
in O O O O
- O O O O
depth O O O O
analysis O O O O
of O O O O
original O O O O
antigenic O O O O
sin O O O O
in O O O O
dengue B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
infection O O O O
. O O O O
    
The O O O O
evolution O O O O
of O O O O
dengue B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
viruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
has O O O O
resulted O O O O
in O O O O
four O O O O
antigenically O O O O
similar O O O O
yet O O O O
distinct O O O O
serotypes O O O O
. O O O O
    
Infection O O O O
with O O O O
one O O O O
serotype O O O O
likely O O O O
elicits O O O O
lifelong O O O O
immunity O O O O
to O O O O
that O O O O
serotype O O O O
, O O O O
but O O O O
generally O O O O
not O O O O
against O O O O
the O O O O
other O O O O
three O O O O
. O O O O
    
Secondary O O O O
or O O O O
sequential O O O O
infections O O O O
are O O O O
common O O O O
, O O O O
as O O O O
multiple O O O O
viral O O O O
serotypes O O O O
frequently O O O O
cocirculate O O O O
. O O O O
    
Dengue B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infection O O O O
, O O O O
although O O O O
frequently O O O O
mild O O O O
, O O O O
can O O O O
lead O O O O
to O O O O
dengue B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
hemorrhagic O O O O
fever O O O O
( O O O O
DHF O O O O
) O O O O
which O O O O
can O O O O
be O O O O
life O O O O
threatening O O O O
. O O O O
    
DHF O O O O
is O O O O
more O O O O
common O O O O
in O O O O
secondary O O O O
dengue B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infections O O O O
, O O O O
implying O O O O
a O O O O
role O O O O
for O O O O
the O O O O
adaptive O O O O
immune O O O O
response O O O O
in O O O O
the O O O O
disease O O O O
. O O O O
    
There O O O O
is O O O O
currently O O O O
much O O O O
effort O O O O
toward O O O O
the O O O O
design O O O O
and O O O O
implementation O O O O
of O O O O
a O O O O
dengue O O O O
vaccine O O O O
but O O O O
these O O O O
efforts O O O O
are O O O O
made O O O O
more O O O O
difficult O O O O
by O O O O
the O O O O
challenge O O O O
of O O O O
inducing O O O O
durable O O O O
neutralizing O O O O
immunity O O O O
to O O O O
all O O O O
four O O O O
viruses O O O O
. O O O O
    
Domain O O O O
3 O O O O
of O O O O
the O O O O
dengue B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
envelope O O O O
protein O O O O
( O O O O
ED3 O O O O
) O O O O
has O O O O
been O O O O
suggested O O O O
as O O O O
one O O O O
such O O O O
candidate O O O O
because O O O O
it O O O O
contains O O O O
neutralizing O O O O
epitopes O O O O
and O O O O
it O O O O
was O O O O
originally O O O O
thought O O O O
that O O O O
relatively O O O O
few O O O O
cross O O O O
- O O O O
reactive O O O O
antibodies O O O O
are O O O O
directed O O O O
to O O O O
this O O O O
domain O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
performed O O O O
a O O O O
detailed O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
anti O O O O
- O O O O
ED3 O O O O
response O O O O
in O O O O
a O O O O
cohort O O O O
of O O O O
patients O O O O
suffering O O O O
either O O O O
primary O O O O
or O O O O
secondary O O O O
dengue B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infections O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
show O O O O
dramatic O O O O
evidence O O O O
of O O O O
original O O O O
antigenic O O O O
sin O O O O
in O O O O
secondary O O O O
infections O O O O
both O O O O
in O O O O
terms O O O O
of O O O O
binding O O O O
and O O O O
enhancement O O O O
activity O O O O
. O O O O
    
This O O O O
has O O O O
important O O O O
implications O O O O
for O O O O
dengue B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
vaccine O O O O
design O O O O
because O O O O
heterologous O O O O
boosting O O O O
is O O O O
likely O O O O
to O O O O
maintain O O O O
the O O O O
immunological O O O O
footprint O O O O
of O O O O
the O O O O
first O O O O
vaccination O O O O
. O O O O
    
On O O O O
the O O O O
basis O O O O
of O O O O
these O O O O
findings O O O O
, O O O O
we O O O O
propose O O O O
a O O O O
simple O O O O
in O O O O
vitro O O O O
enzyme O O O O
- O O O O
linked O O O O
immunosorbent O O O O
assay O O O O
( O O O O
ELISA O O O O
) O O O O
to O O O O
diagnose O O O O
the O O O O
original O O O O
dengue B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infection O O O O
in O O O O
secondary O O O O
dengue B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cases O O O O
. O O O O
    
When O O O O
it O O O O
is O O O O
too O O O O
hot O O O O
for O O O O
photosynthesis O O O O
: O O O O
heat O O O O
- O O O O
induced O O O O
instability O O O O
of O O O O
photosynthesis O O O O
in O O O O
relation O O O O
to O O O O
respiratory O O O O
burst O O O O
, O O O O
cell O O O O
permeability O O O O
changes O O O O
and O O O O
H2O2 O O O O
formation O O O O
. O O O O
    
Photosynthesis O O O O
rate O O O O
( O O O O
A O O O O
( O O O O
n O O O O
) O O O O
) O O O O
becomes O O O O
unstable O O O O
above O O O O
a O O O O
threshold O O O O
temperature O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
recovery O O O O
upon O O O O
return O O O O
to O O O O
low O O O O
temperature O O O O
varies O O O O
because O O O O
of O O O O
reasons O O O O
not O O O O
fully O O O O
understood O O O O
. O O O O
    
We O O O O
investigated O O O O
responses O O O O
of O O O O
A O O O O
( O O O O
n O O O O
) O O O O
, O O O O
dark O O O O
respiration O O O O
and O O O O
chlorophyll O O O O
fluorescence O O O O
to O O O O
supraoptimal O O O O
temperatures O O O O
of O O O O
varying O O O O
duration O O O O
and O O O O
kinetics O O O O
in O O O O
Phaseolus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
vulgaris O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
asking O O O O
whether O O O O
the O O O O
instability O O O O
of O O O O
photosynthesis O O O O
under O O O O
severe O O O O
heat O O O O
stress O O O O
is O O O O
associated O O O O
with O O O O
cellular O O O O
damage O O O O
. O O O O
    
Cellular O O O O
damage O O O O
was O O O O
assessed O O O O
by O O O O
Evans O O O O
blue O O O O
penetration O O O O
( O O O O
enhanced O O O O
membrane O O O O
permeability O O O O
) O O O O
and O O O O
by O O O O
H2O2 O O O O
generation O O O O
[ O O O O
3 O O O O
, O O O O
3 O O O O
' O O O O
- O O O O
diaminobenzidine O O O O
4HCl O O O O
( O O O O
DAB O O O O
) O O O O
- O O O O
staining O O O O
] O O O O
. O O O O
    
Critical O O O O
temperature O O O O
for O O O O
dark O O O O
fluorescence O O O O
( O O O O
F O O O O
( O O O O
0 O O O O
) O O O O
) O O O O
rise O O O O
( O O O O
T O O O O
( O O O O
F O O O O
) O O O O
) O O O O
was O O O O
at O O O O
46 O O O O
- O O O O
48 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
, O O O O
and O O O O
a O O O O
burst O O O O
of O O O O
respiration O O O O
was O O O O
observed O O O O
near O O O O
T O O O O
( O O O O
F O O O O
) O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
A O O O O
( O O O O
n O O O O
) O O O O
was O O O O
strongly O O O O
inhibited O O O O
already O O O O
before O O O O
T O O O O
( O O O O
F O O O O
) O O O O
was O O O O
reached O O O O
. O O O O
    
Membrane O O O O
permeability O O O O
increased O O O O
with O O O O
temperature O O O O
according O O O O
to O O O O
a O O O O
switch O O O O
- O O O O
type O O O O
response O O O O
, O O O O
with O O O O
enhanced O O O O
permeability O O O O
observed O O O O
above O O O O
48 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
. O O O O
    
Experiments O O O O
with O O O O
varying O O O O
heat O O O O
pulse O O O O
lengths O O O O
and O O O O
intensities O O O O
underscored O O O O
the O O O O
threshold O O O O
- O O O O
type O O O O
loss O O O O
of O O O O
photosynthetic O O O O
function O O O O
, O O O O
and O O O O
indicated O O O O
that O O O O
the O O O O
degree O O O O
of O O O O
photosynthetic O O O O
deterioration O O O O
and O O O O
cellular O O O O
damage O O O O
depended O O O O
on O O O O
accumulated O O O O
heat O O O O
- O O O O
dose O O O O
. O O O O
    
Beyond O O O O
the O O O O
' O O O O
point O O O O
of O O O O
no O O O O
return O O O O
' O O O O
, O O O O
propagation O O O O
of O O O O
cellular O O O O
damage O O O O
and O O O O
reduction O O O O
of O O O O
photosynthesis O O O O
continued O O O O
upon O O O O
transfer O O O O
to O O O O
lower O O O O
temperatures O O O O
and O O O O
photosynthetic O O O O
recovery O O O O
was O O O O
slow O O O O
or O O O O
absent O O O O
. O O O O
    
We O O O O
conclude O O O O
that O O O O
instability O O O O
of O O O O
photosynthesis O O O O
under O O O O
severe O O O O
heat O O O O
stress O O O O
is O O O O
associated O O O O
with O O O O
time O O O O
- O O O O
dependent O O O O
propagation O O O O
of O O O O
cellular O O O O
lesions O O O O
. O O O O
    
A O O O O
fluorescence O O O O
resonance O O O O
energy O O O O
transfer O O O O
- O O O O
based O O O O
fluorometer O O O O
assay O O O O
for O O O O
screening O O O O
anti O O O O
- O O O O
coxsackievirus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
B3 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
compounds O O O O
. O O O O
    
In O O O O
view O O O O
of O O O O
the O O O O
need O O O O
to O O O O
develop O O O O
a O O O O
simple O O O O
and O O O O
rapid O O O O
method O O O O
to O O O O
screen O O O O
for O O O O
antiviral O O O O
therapeutic O O O O
agents O O O O
, O O O O
a O O O O
fluorescence O O O O
resonance O O O O
energy O O O O
transfer O O O O
( O O O O
FRET O O O O
) O O O O
- O O O O
based O O O O
reporter O O O O
system O O O O
consisting O O O O
of O O O O
engineered O O O O
mammalian O O O O
cells O O O O
expressing O O O O
a O O O O
cyan O O O O
fluorescent O O O O
protein O O O O
- O O O O
yellow O O O O
fluorescent O O O O
protein O O O O
( O O O O
CFP O O O O
- O O O O
YFP O O O O
) O O O O
pair O O O O
linked O O O O
by O O O O
a O O O O
short O O O O
peptide O O O O
containing O O O O
the O O O O
cleavage O O O O
site O O O O
of O O O O
viral O O O O
protease O O O O
2A O O O O
( O O O O
2A O O O O
( O O O O
pro O O O O
) O O O O
) O O O O
was O O O O
developed O O O O
. O O O O
    
By O O O O
detecting O O O O
the O O O O
2A O O O O
( O O O O
pro O O O O
) O O O O
produced O O O O
early O O O O
during O O O O
the O O O O
virus O O O O
infection O O O O
cycle O O O O
, O O O O
the O O O O
CFP O O O O
- O O O O
YFP O O O O
pair O O O O
effectively O O O O
identifies O O O O
infectious O O O O
coxsackievirus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
B3 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
CVB3 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
, O O O O
a O O O O
picornavirus O O O O
that O O O O
causes O O O O
viral O O O O
myocarditis O O O O
in O O O O
humans B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
reporter O O O O
system O O O O
was O O O O
used O O O O
to O O O O
screen O O O O
a O O O O
library O O O O
of O O O O
2000 O O O O
drugs O O O O
and O O O O
natural O O O O
products O O O O
for O O O O
potential O O O O
antiviral O O O O
compounds O O O O
. O O O O
    
The O O O O
reporter O O O O
cells O O O O
were O O O O
treated O O O O
with O O O O
the O O O O
test O O O O
compounds O O O O
, O O O O
challenged O O O O
with O O O O
CVB3 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
and O O O O
then O O O O
examined O O O O
using O O O O
a O O O O
fluorometer O O O O
at O O O O
24h O O O O
post O O O O
- O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
Sixty O O O O
- O O O O
four O O O O
compounds O O O O
, O O O O
mostly O O O O
therapeutic O O O O
drugs O O O O
, O O O O
antimicrobial O O O O
compounds O O O O
and O O O O
compounds O O O O
with O O O O
unknown O O O O
functions O O O O
, O O O O
caused O O O O
at O O O O
least O O O O
50 O O O O
% O O O O
inhibition O O O O
of O O O O
2A O O O O
( O O O O
pro O O O O
) O O O O
activity O O O O
. O O O O
    
Three O O O O
known O O O O
antiviral O O O O
compounds O O O O
, O O O O
cosmosiin O O O O
, O O O O
ribavirin O O O O
and O O O O
baicalein O O O O
, O O O O
were O O O O
also O O O O
identified O O O O
in O O O O
the O O O O
screening O O O O
. O O O O
    
The O O O O
developed O O O O
method O O O O
is O O O O
an O O O O
effective O O O O
strategy O O O O
for O O O O
rapid O O O O
screening O O O O
, O O O O
and O O O O
identifies O O O O
compounds O O O O
that O O O O
inhibit O O O O
CVB3 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
2A O O O O
( O O O O
pro O O O O
) O O O O
. O O O O
    
This O O O O
method O O O O
should O O O O
be O O O O
a O O O O
valuable O O O O
aid O O O O
in O O O O
the O O O O
antiviral O O O O
drug O O O O
discovery O O O O
effort O O O O
. O O O O
    
One O O O O
- O O O O
step O O O O
real O O O O
- O O O O
time O O O O
reverse O O O O
transcription O O O O
- O O O O
PCR O O O O
assays O O O O
for O O O O
detecting O O O O
and O O O O
subtyping O O O O
pandemic B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
influenza O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H1N1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
2009 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
seasonal B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
influenza O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H1N1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
seasonal B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
influenza O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H3N2 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
viruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Pandemic B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
influenza O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H1N1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
2009 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H1N1pdm O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
has O O O O
caused O O O O
significant O O O O
outbreaks O O O O
worldwide O O O O
. O O O O
    
A O O O O
previous O O O O
one O O O O
- O O O O
step O O O O
real O O O O
- O O O O
time O O O O
reverse O O O O
transcription O O O O
- O O O O
PCR O O O O
( O O O O
rRT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
) O O O O
assay O O O O
for O O O O
detecting O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H1N1pdm O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
H1pdm O O O O
rRT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
assay O O O O
) O O O O
was O O O O
improved O O O O
since O O O O
the O O O O
former O O O O
probe O O O O
had O O O O
a O O O O
low O O O O
melting O O O O
temperature O O O O
and O O O O
low O O O O
tolerance O O O O
to O O O O
viral O O O O
mutation O O O O
. O O O O
    
To O O O O
help O O O O
with O O O O
the O O O O
screening O O O O
of O O O O
the O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H1N1pdm O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
rRT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
assays O O O O
were O O O O
also O O O O
developed O O O O
for O O O O
detecting O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
seasonal B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H1N1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
H1 O O O O
rRT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
assay O O O O
) O O O O
and O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H3N2 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
influenza O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
viruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
H3 O O O O
rRT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
assay O O O O
) O O O O
. O O O O
    
H1pdm O O O O
, O O O O
H1 O O O O
, O O O O
and O O O O
H3 O O O O
rRT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
assays O O O O
were O O O O
evaluated O O O O
using O O O O
in O O O O
vitro O O O O
- O O O O
transcribed O O O O
control O O O O
RNA O O O O
, O O O O
isolated O O O O
viruses O O O O
, O O O O
and O O O O
other O O O O
respiratory O O O O
pathogenic O O O O
viruses O O O O
, O O O O
and O O O O
were O O O O
shown O O O O
to O O O O
have O O O O
high O O O O
sensitivity O O O O
, O O O O
good O O O O
linearity O O O O
( O O O O
R O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
= O O O O
0 O O O O
. O O O O
99 O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
high O O O O
specificity O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
, O O O O
the O O O O
improved O O O O
H1pdm O O O O
rRT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
assay O O O O
could O O O O
detect O O O O
two O O O O
viral B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
strains O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
of O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H1N1pdm O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
namely O O O O
, O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Aichi O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
472 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
2009 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H1N1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pdm O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Sakai O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
89 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
2009 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H1N1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pdm O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
which O O O O
have O O O O
mutation O O O O
( O O O O
s O O O O
) O O O O
in O O O O
the O O O O
probe O O O O
- O O O O
binding O O O O
region O O O O
of O O O O
the O O O O
hemagglutinin O O O O
gene O O O O
, O O O O
without O O O O
loss O O O O
of O O O O
sensitivity O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
the O O O O
three O O O O
rRT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
assays O O O O
developed O O O O
, O O O O
90 O O O O
clinical O O O O
specimens O O O O
collected O O O O
between O O O O
May O O O O
and O O O O
October O O O O
2009 O O O O
were O O O O
then O O O O
tested O O O O
. O O O O
    
Of O O O O
these O O O O
, O O O O
26 O O O O
, O O O O
20 O O O O
, O O O O
and O O O O
2 O O O O
samples O O O O
were O O O O
identified O O O O
as O O O O
positive O O O O
for O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H1pdm O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H3 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
respectively O O O O
, O O O O
while O O O O
42 O O O O
samples O O O O
were O O O O
negative O O O O
for O O O O
influenza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
viruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
present O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
these O O O O
highly O O O O
sensitive O O O O
and O O O O
specific O O O O
H1pdm O O O O
, O O O O
H1 O O O O
, O O O O
and O O O O
H3 O O O O
rRT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
assays O O O O
are O O O O
useful O O O O
not O O O O
only O O O O
for O O O O
diagnosing O O O O
influenza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
viruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
but O O O O
also O O O O
for O O O O
the O O O O
surveillance O O O O
of O O O O
influenza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
viruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Comparison O O O O
of O O O O
commercial O O O O
systems O O O O
for O O O O
extraction O O O O
of O O O O
nucleic O O O O
acids O O O O
from O O O O
DNA O O O O
/ O O O O
RNA O O O O
respiratory O O O O
pathogens O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
compared O O O O
six O O O O
automated O O O O
nucleic O O O O
acid O O O O
extraction O O O O
systems O O O O
and O O O O
one O O O O
manual O O O O
kit O O O O
for O O O O
their O O O O
ability O O O O
to O O O O
recover O O O O
nucleic O O O O
acids O O O O
from O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nasal O O O O
wash O O O O
specimens O O O O
spiked O O O O
with O O O O
five O O O O
respiratory O O O O
pathogens O O O O
, O O O O
representing O O O O
Gram O O O O
- O O O O
positive O O O O
bacteria O O O O
( O O O O
Streptococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pyogenes O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
, O O O O
Gram O O O O
- O O O O
negative O O O O
bacteria O O O O
( O O O O
Legionella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pneumophila O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
, O O O O
DNA O O O O
viruses O O O O
( O O O O
adenovirus O O O O
) O O O O
, O O O O
segmented O O O O
RNA O O O O
viruses O O O O
( O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
influenza O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
, O O O O
and O O O O
non O O O O
- O O O O
segmented O O O O
RNA O O O O
viruses O O O O
( O O O O
respiratory B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
syncytial O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
robots O O O O
and O O O O
kit O O O O
evaluated O O O O
represent O O O O
major O O O O
commercially O O O O
available O O O O
methods O O O O
that O O O O
are O O O O
capable O O O O
of O O O O
simultaneous O O O O
extraction O O O O
of O O O O
DNA O O O O
and O O O O
RNA O O O O
from O O O O
respiratory O O O O
specimens O O O O
, O O O O
and O O O O
included O O O O
platforms O O O O
based O O O O
on O O O O
magnetic O O O O
- O O O O
bead O O O O
technology O O O O
( O O O O
KingFisher O O O O
mL O O O O
, O O O O
Biorobot O O O O
EZ1 O O O O
, O O O O
easyMAG O O O O
, O O O O
KingFisher O O O O
Flex O O O O
, O O O O
and O O O O
MagNA O O O O
Pure O O O O
Compact O O O O
) O O O O
or O O O O
glass O O O O
fiber O O O O
filter O O O O
technology O O O O
( O O O O
Biorobot O O O O
MDX O O O O
and O O O O
the O O O O
manual O O O O
kit O O O O
Allprep O O O O
) O O O O
. O O O O
    
All O O O O
methods O O O O
yielded O O O O
extracts O O O O
free O O O O
of O O O O
cross O O O O
- O O O O
contamination O O O O
and O O O O
RT O O O O
- O O O O
PCR O O O O
inhibition O O O O
. O O O O
    
All O O O O
automated O O O O
systems O O O O
recovered O O O O
L B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pneumophila O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
adenovirus O O O O
DNA O O O O
equivalently O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
MagNA O O O O
Pure O O O O
protocol O O O O
demonstrated O O O O
more O O O O
than O O O O
4 O O O O
- O O O O
fold O O O O
higher O O O O
DNA O O O O
recovery O O O O
from O O O O
the O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pyogenes O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
than O O O O
other O O O O
methods O O O O
. O O O O
    
The O O O O
KingFisher O O O O
mL O O O O
and O O O O
easyMAG O O O O
protocols O O O O
provided O O O O
1 O O O O
- O O O O
to O O O O
3 O O O O
- O O O O
log O O O O
wider O O O O
linearity O O O O
and O O O O
extracted O O O O
3 O O O O
- O O O O
to O O O O
4 O O O O
- O O O O
fold O O O O
more O O O O
RNA O O O O
from O O O O
the O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
influenza O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
respiratory B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
syncytial O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
These O O O O
findings O O O O
suggest O O O O
that O O O O
systems O O O O
differed O O O O
in O O O O
nucleic O O O O
acid O O O O
recovery O O O O
, O O O O
reproducibility O O O O
, O O O O
and O O O O
linearity O O O O
in O O O O
a O O O O
pathogen O O O O
specific O O O O
manner O O O O
. O O O O
    
Aerosol O O O O
drug O O O O
delivery O O O O
: O O O O
developments O O O O
in O O O O
device O O O O
design O O O O
and O O O O
clinical O O O O
use O O O O
. O O O O
    
Aerosolised O O O O
drugs O O O O
are O O O O
prescribed O O O O
for O O O O
use O O O O
in O O O O
a O O O O
range O O O O
of O O O O
inhaler O O O O
devices O O O O
and O O O O
systems O O O O
. O O O O
    
Delivering O O O O
drugs O O O O
by O O O O
inhalation O O O O
requires O O O O
a O O O O
formulation O O O O
that O O O O
can O O O O
be O O O O
successfully O O O O
aerosolised O O O O
and O O O O
a O O O O
delivery O O O O
system O O O O
that O O O O
produces O O O O
a O O O O
useful O O O O
aerosol O O O O
of O O O O
the O O O O
drug O O O O
; O O O O
the O O O O
particles O O O O
or O O O O
droplets O O O O
need O O O O
to O O O O
be O O O O
of O O O O
sufficient O O O O
size O O O O
and O O O O
mass O O O O
to O O O O
be O O O O
carried O O O O
to O O O O
the O O O O
distal O O O O
lung O O O O
or O O O O
deposited O O O O
on O O O O
proximal O O O O
airways O O O O
to O O O O
give O O O O
rise O O O O
to O O O O
a O O O O
therapeutic O O O O
effect O O O O
. O O O O
    
Patients O O O O
and O O O O
caregivers O O O O
must O O O O
use O O O O
and O O O O
maintain O O O O
these O O O O
aerosol O O O O
drug O O O O
delivery O O O O
devices O O O O
correctly O O O O
. O O O O
    
In O O O O
recent O O O O
years O O O O
, O O O O
several O O O O
technical O O O O
innovations O O O O
have O O O O
led O O O O
to O O O O
aerosol O O O O
drug O O O O
delivery O O O O
devices O O O O
with O O O O
efficient O O O O
drug O O O O
delivery O O O O
and O O O O
with O O O O
novel O O O O
features O O O O
that O O O O
take O O O O
into O O O O
account O O O O
factors O O O O
such O O O O
as O O O O
dose O O O O
tracking O O O O
, O O O O
portability O O O O
, O O O O
materials O O O O
of O O O O
manufacture O O O O
, O O O O
breath O O O O
actuation O O O O
, O O O O
the O O O O
interface O O O O
with O O O O
the O O O O
patient O O O O
, O O O O
combination O O O O
therapies O O O O
, O O O O
and O O O O
systemic O O O O
delivery O O O O
. O O O O
    
These O O O O
changes O O O O
have O O O O
improved O O O O
performance O O O O
in O O O O
all O O O O
four O O O O
categories O O O O
of O O O O
devices O O O O
: O O O O
metered O O O O
dose O O O O
inhalers O O O O
, O O O O
spacers O O O O
and O O O O
holding O O O O
chambers O O O O
, O O O O
dry O O O O
powder O O O O
inhalers O O O O
, O O O O
and O O O O
nebulisers O O O O
. O O O O
    
Additionally O O O O
, O O O O
several O O O O
therapies O O O O
usually O O O O
given O O O O
by O O O O
injection O O O O
are O O O O
now O O O O
prescribed O O O O
as O O O O
aerosols O O O O
for O O O O
use O O O O
in O O O O
a O O O O
range O O O O
of O O O O
drug O O O O
delivery O O O O
devices O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
Review O O O O
, O O O O
we O O O O
discuss O O O O
recent O O O O
developments O O O O
in O O O O
the O O O O
design O O O O
and O O O O
clinical O O O O
use O O O O
of O O O O
aerosol O O O O
devices O O O O
over O O O O
the O O O O
past O O O O
10 O O O O
- O O O O
15 O O O O
years O O O O
with O O O O
an O O O O
emphasis O O O O
on O O O O
the O O O O
treatment O O O O
of O O O O
respiratory O O O O
disorders O O O O
. O O O O
    
Regulation O O O O
of O O O O
horizontal O O O O
gene O O O O
transfer O O O O
in O O O O
Bacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
subtilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
by O O O O
activation O O O O
of O O O O
a O O O O
conserved O O O O
site O O O O
- O O O O
specific O O O O
protease O O O O
. O O O O
    
The O O O O
mobile O O O O
genetic O O O O
element O O O O
ICEBs1 O O O O
is O O O O
an O O O O
integrative O O O O
and O O O O
conjugative O O O O
element O O O O
( O O O O
a O O O O
conjugative O O O O
transposon O O O O
) O O O O
found O O O O
in O O O O
Bacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
subtilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
RecA O O O O
- O O O O
dependent O O O O
SOS O O O O
response O O O O
and O O O O
the O O O O
RapI O O O O
- O O O O
PhrI O O O O
cell O O O O
sensory O O O O
system O O O O
activate O O O O
ICEBs1 O O O O
gene O O O O
expression O O O O
by O O O O
stimulating O O O O
cleavage O O O O
of O O O O
ImmR O O O O
, O O O O
the O O O O
ICEBs1 O O O O
immunity O O O O
repressor O O O O
, O O O O
by O O O O
the O O O O
protease O O O O
ImmA O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
that O O O O
increasing O O O O
the O O O O
amount O O O O
of O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
ImmA O O O O
in O O O O
vivo O O O O
caused O O O O
partial O O O O
derepression O O O O
of O O O O
ICEBs1 O O O O
gene O O O O
expression O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
during O O O O
RapI O O O O
- O O O O
mediated O O O O
derepression O O O O
of O O O O
ICEBs1 O O O O
gene O O O O
expression O O O O
, O O O O
ImmA O O O O
levels O O O O
did O O O O
not O O O O
detectably O O O O
increase O O O O
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
RapI O O O O
likely O O O O
activates O O O O
the O O O O
protease O O O O
ImmA O O O O
by O O O O
increasing O O O O
its O O O O
specific O O O O
activity O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
isolated O O O O
and O O O O
characterized O O O O
mutations O O O O
in O O O O
immA O O O O
( O O O O
immA O O O O
( O O O O
h O O O O
) O O O O
) O O O O
that O O O O
cause O O O O
partial O O O O
derepression O O O O
of O O O O
ICEBs1 O O O O
gene O O O O
expression O O O O
in O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
inducing O O O O
signals O O O O
. O O O O
    
We O O O O
obtained O O O O
two O O O O
types O O O O
of O O O O
immA O O O O
( O O O O
h O O O O
) O O O O
mutations O O O O
: O O O O
one O O O O
type O O O O
caused O O O O
increased O O O O
amounts O O O O
of O O O O
the O O O O
mutant O O O O
proteins O O O O
in O O O O
vivo O O O O
but O O O O
no O O O O
detectable O O O O
effect O O O O
on O O O O
specific O O O O
activity O O O O
in O O O O
vitro O O O O
; O O O O
the O O O O
other O O O O
type O O O O
had O O O O
no O O O O
detectable O O O O
effect O O O O
on O O O O
the O O O O
amount O O O O
of O O O O
the O O O O
mutant O O O O
protein O O O O
in O O O O
vivo O O O O
but O O O O
caused O O O O
increased O O O O
specific O O O O
activity O O O O
of O O O O
the O O O O
protein O O O O
( O O O O
as O O O O
measured O O O O
in O O O O
vitro O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Together O O O O
, O O O O
these O O O O
findings O O O O
indicate O O O O
that O O O O
derepression O O O O
of O O O O
ICEBs1 O O O O
gene O O O O
expression O O O O
is O O O O
likely O O O O
caused O O O O
by O O O O
an O O O O
increase O O O O
in O O O O
the O O O O
specific O O O O
activity O O O O
of O O O O
ImmA O O O O
. O O O O
    
Homologs O O O O
of O O O O
ImmA O O O O
and O O O O
ImmR O O O O
are O O O O
found O O O O
in O O O O
many O O O O
mobile O O O O
genetic O O O O
elements O O O O
, O O O O
so O O O O
the O O O O
mechanisms O O O O
that O O O O
regulate O O O O
ImmA O O O O
- O O O O
mediated O O O O
cleavage O O O O
of O O O O
ImmR O O O O
may O O O O
be O O O O
widely O O O O
conserved O O O O
. O O O O
    
Orientation O O O O
of O O O O
SecA O O O O
and O O O O
SecB O O O O
in O O O O
complex O O O O
, O O O O
derived O O O O
from O O O O
disulfide O O O O
cross O O O O
- O O O O
linking O O O O
. O O O O
    
SecA O O O O
is O O O O
the O O O O
ATPase O O O O
that O O O O
acts O O O O
as O O O O
the O O O O
motor O O O O
for O O O O
protein O O O O
export O O O O
in O O O O
the O O O O
general O O O O
secretory O O O O
, O O O O
or O O O O
Sec O O O O
, O O O O
system O O O O
of O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
tetrameric O O O O
cytoplasmic O O O O
chaperone O O O O
SecB O O O O
binds O O O O
to O O O O
precursors O O O O
of O O O O
exported O O O O
proteins O O O O
before O O O O
they O O O O
can O O O O
become O O O O
stably O O O O
folded O O O O
and O O O O
delivers O O O O
them O O O O
to O O O O
SecA O O O O
. O O O O
    
During O O O O
this O O O O
delivery O O O O
step O O O O
, O O O O
SecB O O O O
binds O O O O
to O O O O
SecA O O O O
. O O O O
    
The O O O O
complex O O O O
between O O O O
SecA O O O O
and O O O O
SecB O O O O
that O O O O
is O O O O
maximally O O O O
active O O O O
in O O O O
translocation O O O O
contains O O O O
two O O O O
protomers O O O O
of O O O O
SecA O O O O
bound O O O O
to O O O O
a O O O O
tetramer O O O O
of O O O O
SecB O O O O
. O O O O
    
The O O O O
aminoacyl O O O O
residues O O O O
on O O O O
each O O O O
protein O O O O
that O O O O
are O O O O
involved O O O O
in O O O O
binding O O O O
the O O O O
other O O O O
have O O O O
previously O O O O
been O O O O
identified O O O O
by O O O O
site O O O O
- O O O O
directed O O O O
spin O O O O
labeling O O O O
and O O O O
electron O O O O
paramagnetic O O O O
resonance O O O O
( O O O O
EPR O O O O
) O O O O
spectroscopy O O O O
; O O O O
however O O O O
, O O O O
that O O O O
study O O O O
provided O O O O
no O O O O
information O O O O
concerning O O O O
the O O O O
relative O O O O
orientation O O O O
of O O O O
the O O O O
proteins O O O O
within O O O O
the O O O O
complex O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
used O O O O
our O O O O
extensive O O O O
collection O O O O
of O O O O
single O O O O
- O O O O
cysteine O O O O
variants O O O O
of O O O O
the O O O O
two O O O O
proteins O O O O
and O O O O
subjected O O O O
pairwise O O O O
combinations O O O O
of O O O O
SecA O O O O
and O O O O
SecB O O O O
to O O O O
brief O O O O
oxidation O O O O
to O O O O
identify O O O O
residues O O O O
in O O O O
close O O O O
proximity O O O O
. O O O O
    
These O O O O
data O O O O
were O O O O
used O O O O
to O O O O
generate O O O O
a O O O O
model O O O O
for O O O O
the O O O O
orientation O O O O
of O O O O
the O O O O
two O O O O
proteins O O O O
within O O O O
the O O O O
complex O O O O
. O O O O
    
Inactivation O O O O
of O O O O
the O O O O
RluD O O O O
pseudouridine O O O O
synthase O O O O
has O O O O
minimal O O O O
effects O O O O
on O O O O
growth O O O O
and O O O O
ribosome O O O O
function O O O O
in O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Salmonella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
enterica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
rluD O O O O
gene O O O O
encodes O O O O
a O O O O
pseudouridine O O O O
synthase O O O O
responsible O O O O
for O O O O
the O O O O
pseudouridine O O O O
( O O O O
Psi O O O O
) O O O O
modifications O O O O
at O O O O
positions O O O O
1911 O O O O
, O O O O
1915 O O O O
, O O O O
and O O O O
1917 O O O O
in O O O O
helix O O O O
69 O O O O
of O O O O
23S O O O O
rRNA O O O O
. O O O O
    
It O O O O
has O O O O
been O O O O
reported O O O O
that O O O O
deletion O O O O
of O O O O
rluD O O O O
in O O O O
K B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
12 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strains O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
of O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
E O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
associated O O O O
with O O O O
extremely O O O O
slow O O O O
growth O O O O
, O O O O
increased O O O O
readthrough O O O O
of O O O O
stop O O O O
codons O O O O
, O O O O
and O O O O
defects O O O O
in O O O O
50S O O O O
ribosomal O O O O
subunit O O O O
assembly O O O O
and O O O O
30S O O O O
- O O O O
50S O O O O
subunit O O O O
association O O O O
. O O O O
    
Suppressor O O O O
mutations O O O O
in O O O O
the O O O O
prfB O O O O
and O O O O
prfC O O O O
genes O O O O
encoding O O O O
release O O O O
factor O O O O
2 O O O O
( O O O O
RF2 O O O O
) O O O O
and O O O O
RF3 O O O O
that O O O O
restore O O O O
the O O O O
wild O O O O
type O O O O
- O O O O
growth O O O O
rate O O O O
and O O O O
also O O O O
correct O O O O
the O O O O
ribosomal O O O O
defects O O O O
have O O O O
now O O O O
been O O O O
isolated O O O O
. O O O O
    
These O O O O
suppressors O O O O
link O O O O
helix O O O O
69 O O O O
Psi O O O O
residues O O O O
with O O O O
the O O O O
termination O O O O
phase O O O O
of O O O O
protein O O O O
synthesis O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
further O O O O
genetic O O O O
analysis O O O O
reported O O O O
here O O O O
also O O O O
reveals O O O O
that O O O O
the O O O O
slow O O O O
growth O O O O
and O O O O
other O O O O
defects O O O O
associated O O O O
with O O O O
inactivation O O O O
of O O O O
rluD O O O O
in O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
K O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
12 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strains O O O O
are O O O O
due O O O O
to O O O O
a O O O O
defective O O O O
RF2 O O O O
protein O O O O
, O O O O
with O O O O
a O O O O
threonine O O O O
at O O O O
position O O O O
246 O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
present O O O O
in O O O O
all O O O O
K B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
12 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strains O O O O
. O O O O
    
This O O O O
is O O O O
in O O O O
contrast O O O O
to O O O O
the O O O O
more O O O O
typical O O O O
alanine O O O O
found O O O O
at O O O O
this O O O O
position O O O O
in O O O O
most O O O O
bacterial O O O O
RF2s O O O O
, O O O O
including O O O O
those O O O O
of O O O O
other O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strains O O O O
. O O O O
    
Inactivation O O O O
of O O O O
rluD O O O O
in O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strains O O O O
containing O O O O
the O O O O
prfB O O O O
allele O O O O
from O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
B O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
or O O O O
in O O O O
Salmonella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
enterica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
both O O O O
carrying O O O O
an O O O O
RF2 O O O O
with O O O O
Ala246 O O O O
, O O O O
has O O O O
negligible O O O O
effects O O O O
on O O O O
growth O O O O
, O O O O
termination O O O O
, O O O O
or O O O O
ribosome O O O O
function O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
indicate O O O O
that O O O O
, O O O O
in O O O O
contrast O O O O
to O O O O
those O O O O
in O O O O
wild O O O O
bacteria O O O O
, O O O O
termination O O O O
functions O O O O
in O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
K O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
12 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strains O O O O
carrying O O O O
a O O O O
partially O O O O
defective O O O O
RF2 O O O O
protein O O O O
are O O O O
especially O O O O
susceptible O O O O
to O O O O
perturbation O O O O
of O O O O
ribosome O O O O
- O O O O
RF O O O O
interactions O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
that O O O O
caused O O O O
by O O O O
loss O O O O
of O O O O
h69 O O O O
Psi O O O O
modifications O O O O
. O O O O
    
Effect O O O O
of O O O O
energetic O O O O
constraints O O O O
on O O O O
distribution O O O O
and O O O O
winter O O O O
survival O O O O
of O O O O
weasel O O O O
males O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
absolute O O O O
energy O O O O
needs O O O O
of O O O O
small O O O O
animals O O O O
are O O O O
generally O O O O
lower O O O O
than O O O O
those O O O O
of O O O O
larger O O O O
animals O O O O
. O O O O
    
This O O O O
should O O O O
drive O O O O
higher O O O O
mortality O O O O
of O O O O
larger O O O O
animals O O O O
, O O O O
when O O O O
the O O O O
environmental O O O O
conditions O O O O
deteriorate O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
demonstration O O O O
of O O O O
the O O O O
effect O O O O
of O O O O
energy O O O O
constraints O O O O
on O O O O
survivals O O O O
proved O O O O
difficult O O O O
, O O O O
because O O O O
the O O O O
range O O O O
of O O O O
body O O O O
mass O O O O
within O O O O
species O O O O
is O O O O
generally O O O O
too O O O O
small O O O O
to O O O O
produce O O O O
enough O O O O
variation O O O O
for O O O O
studying O O O O
such O O O O
an O O O O
effect O O O O
. O O O O
    
An O O O O
opportunity O O O O
for O O O O
an O O O O
intraspecific O O O O
study O O O O
comes O O O O
from O O O O
weasels O O O O
inhabiting O O O O
the O O O O
Bialowieza O O O O
Forest O O O O
( O O O O
north O O O O
- O O O O
eastern O O O O
Poland O O O O
) O O O O
, O O O O
which O O O O
are O O O O
characterized O O O O
by O O O O
a O O O O
threefold O O O O
variation O O O O
in O O O O
body O O O O
mass O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
assumed O O O O
that O O O O
in O O O O
summer O O O O
larger O O O O
weasel O O O O
males O O O O
are O O O O
favoured O O O O
by O O O O
sexual O O O O
selection O O O O
, O O O O
because O O O O
they O O O O
are O O O O
more O O O O
successful O O O O
when O O O O
competing O O O O
for O O O O
mates O O O O
. O O O O
    
We O O O O
then O O O O
tested O O O O
whether O O O O
they O O O O
suffer O O O O
higher O O O O
mortality O O O O
in O O O O
winter O O O O
, O O O O
because O O O O
they O O O O
have O O O O
difficulty O O O O
finding O O O O
sufficient O O O O
food O O O O
to O O O O
satisfy O O O O
their O O O O
energy O O O O
needs O O O O
and O O O O
/ O O O O
or O O O O
because O O O O
the O O O O
additional O O O O
foraging O O O O
time O O O O
would O O O O
result O O O O
in O O O O
increased O O O O
exposure O O O O
to O O O O
predation O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
measured O O O O
daily O O O O
energy O O O O
expenditures O O O O
( O O O O
DEE O O O O
) O O O O
of O O O O
overwintering O O O O
weasel O O O O
males O O O O
using O O O O
the O O O O
doubly O O O O
labelled O O O O
water O O O O
( O O O O
DLW O O O O
) O O O O
technique O O O O
. O O O O
    
We O O O O
constructed O O O O
an O O O O
energetic O O O O
model O O O O
predicting O O O O
how O O O O
individuals O O O O
of O O O O
different O O O O
size O O O O
are O O O O
able O O O O
to O O O O
balance O O O O
their O O O O
energy O O O O
budgets O O O O
feeding O O O O
on O O O O
large O O O O
and O O O O
small O O O O
prey O O O O
while O O O O
minimizing O O O O
time O O O O
spent O O O O
hunting O O O O
, O O O O
thereby O O O O
reducing O O O O
their O O O O
own O O O O
exposure O O O O
to O O O O
predation O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
range O O O O
of O O O O
body O O O O
mass O O O O
in O O O O
overwintering O O O O
weasels O O O O
predicted O O O O
by O O O O
our O O O O
model O O O O
corresponded O O O O
very O O O O
well O O O O
with O O O O
the O O O O
distribution O O O O
of O O O O
prey O O O O
body O O O O
mass O O O O
in O O O O
three O O O O
different O O O O
habitats O O O O
within O O O O
our O O O O
study O O O O
area O O O O
. O O O O
    
Larger O O O O
individuals O O O O
were O O O O
able O O O O
to O O O O
compensate O O O O
for O O O O
higher O O O O
food O O O O
requirements O O O O
by O O O O
using O O O O
habitats O O O O
with O O O O
larger O O O O
prey O O O O
species O O O O
than O O O O
those O O O O
available O O O O
to O O O O
smaller O O O O
male O O O O
weasels O O O O
. O O O O
    
This O O O O
effectively O O O O
offset O O O O
the O O O O
expected O O O O
negative O O O O
association O O O O
between O O O O
body O O O O
mass O O O O
and O O O O
winter O O O O
survival O O O O
predicted O O O O
from O O O O
considerations O O O O
of O O O O
energy O O O O
balance O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
show O O O O
how O O O O
energetic O O O O
constraints O O O O
affect O O O O
body O O O O
mass O O O O
and O O O O
spatial O O O O
segregation O O O O
of O O O O
a O O O O
species O O O O
at O O O O
the O O O O
intra O O O O
- O O O O
specific O O O O
level O O O O
not O O O O
only O O O O
across O O O O
large O O O O
geographical O O O O
ranges O O O O
, O O O O
but O O O O
also O O O O
within O O O O
a O O O O
relatively O O O O
small O O O O
area O O O O
. O O O O
    
Bud O O O O
set O O O O
in O O O O
poplar O O O O
- O O O O
- O O O O
genetic O O O O
dissection O O O O
of O O O O
a O O O O
complex O O O O
trait O O O O
in O O O O
natural O O O O
and O O O O
hybrid O O O O
populations O O O O
. O O O O
    
* O O O O
The O O O O
seasonal O O O O
timing O O O O
of O O O O
growth O O O O
events O O O O
is O O O O
crucial O O O O
to O O O O
tree O O O O
distribution O O O O
and O O O O
conservation O O O O
. O O O O
    
The O O O O
seasonal O O O O
growth O O O O
cycle O O O O
is O O O O
strongly O O O O
adapted O O O O
to O O O O
the O O O O
local O O O O
climate O O O O
that O O O O
is O O O O
changing O O O O
because O O O O
of O O O O
global O O O O
warming O O O O
. O O O O
    
We O O O O
studied O O O O
bud O O O O
set O O O O
as O O O O
one O O O O
cornerstone O O O O
of O O O O
the O O O O
seasonal O O O O
growth O O O O
cycle O O O O
in O O O O
an O O O O
integrative O O O O
approach O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Bud O O O O
set O O O O
was O O O O
dissected O O O O
at O O O O
the O O O O
phenotypic O O O O
level O O O O
into O O O O
several O O O O
components O O O O
, O O O O
and O O O O
phenotypic O O O O
components O O O O
with O O O O
most O O O O
genetic O O O O
variation O O O O
were O O O O
identified O O O O
. O O O O
    
While O O O O
phenotypic O O O O
variation O O O O
resided O O O O
in O O O O
the O O O O
timing O O O O
of O O O O
growth O O O O
cessation O O O O
, O O O O
and O O O O
even O O O O
so O O O O
more O O O O
in O O O O
the O O O O
duration O O O O
from O O O O
growth O O O O
cessation O O O O
to O O O O
bud O O O O
set O O O O
, O O O O
the O O O O
timing O O O O
of O O O O
growth O O O O
cessation O O O O
had O O O O
a O O O O
stronger O O O O
genetic O O O O
component O O O O
in O O O O
both O O O O
natural O O O O
and O O O O
hybrid O O O O
populations O O O O
. O O O O
    
* O O O O
Quantitative O O O O
trait O O O O
loci O O O O
( O O O O
QTL O O O O
) O O O O
were O O O O
identified O O O O
for O O O O
the O O O O
most O O O O
discriminative O O O O
phenotypic O O O O
bud O O O O
- O O O O
set O O O O
components O O O O
across O O O O
four O O O O
poplar O O O O
pedigrees O O O O
. O O O O
    
The O O O O
QTL O O O O
from O O O O
different O O O O
pedigrees O O O O
were O O O O
recurrently O O O O
detected O O O O
in O O O O
six O O O O
regions O O O O
of O O O O
the O O O O
poplar O O O O
genome O O O O
. O O O O
    
* O O O O
These O O O O
regions O O O O
of O O O O
1 O O O O
. O O O O
83 O O O O
- O O O O
4 O O O O
. O O O O
25 O O O O
Mbp O O O O
in O O O O
size O O O O
, O O O O
containing O O O O
between O O O O
202 O O O O
and O O O O
394 O O O O
genes O O O O
, O O O O
form O O O O
the O O O O
basis O O O O
for O O O O
further O O O O
molecular O O O O
- O O O O
genetic O O O O
dissection O O O O
of O O O O
bud O O O O
set O O O O
. O O O O
    
Alphacoronavirus O O O O
transmissible B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
gastroenteritis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nsp1 O O O O
protein O O O O
suppresses O O O O
protein O O O O
translation O O O O
in O O O O
mammalian O O O O
cells O O O O
and O O O O
in O O O O
cell O O O O
- O O O O
free O O O O
HeLa O O O O
cell O O O O
extracts O O O O
but O O O O
not O O O O
in O O O O
rabbit B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
reticulocyte O O O O
lysate O O O O
. O O O O
    
The O O O O
nsp1 O O O O
protein O O O O
of O O O O
transmissible B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
gastroenteritis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
TGEV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
, O O O O
an O O O O
alphacoronavirus O O O O
, O O O O
efficiently O O O O
suppressed O O O O
protein O O O O
synthesis O O O O
in O O O O
mammalian O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Unlike O O O O
the O O O O
nsp1 O O O O
protein O O O O
of O O O O
severe B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
acute O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
respiratory O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
syndrome O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
coronavirus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
a O O O O
betacoronavirus O O O O
, O O O O
the O O O O
TGEV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nsp1 O O O O
protein O O O O
was O O O O
unable O O O O
to O O O O
bind O O O O
40S O O O O
ribosomal O O O O
subunits O O O O
or O O O O
promote O O O O
host O O O O
mRNA O O O O
degradation O O O O
. O O O O
    
TGEV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nsp1 O O O O
also O O O O
suppressed O O O O
protein O O O O
translation O O O O
in O O O O
cell O O O O
- O O O O
free O O O O
HeLa O O O O
cell O O O O
extract O O O O
; O O O O
however O O O O
, O O O O
it O O O O
did O O O O
not O O O O
affect O O O O
translation O O O O
in O O O O
rabbit B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
reticulocyte O O O O
lysate O O O O
( O O O O
RRL O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
data O O O O
suggested O O O O
that O O O O
HeLa O O O O
cell O O O O
extracts O O O O
and O O O O
cultured O O O O
host O O O O
cells O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
RRL O O O O
, O O O O
contain O O O O
a O O O O
host O O O O
factor O O O O
( O O O O
s O O O O
) O O O O
that O O O O
is O O O O
essential O O O O
for O O O O
TGEV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nsp1 O O O O
- O O O O
induced O O O O
translational O O O O
suppression O O O O
. O O O O
    
Modification O O O O
of O O O O
nonstructural O O O O
protein O O O O
1 O O O O
of O O O O
influenza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
by O O O O
SUMO1 O O O O
. O O O O
    
Nonstructural O O O O
protein O O O O
1 O O O O
( O O O O
NS1 O O O O
) O O O O
is O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
major O O O O
factors O O O O
resulting O O O O
in O O O O
the O O O O
efficient O O O O
infection O O O O
rate O O O O
and O O O O
high O O O O
level O O O O
of O O O O
virulence O O O O
of O O O O
influenza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Although O O O O
consisting O O O O
of O O O O
only O O O O
approximately O O O O
230 O O O O
amino O O O O
acids O O O O
, O O O O
NS1 O O O O
has O O O O
the O O O O
ability O O O O
to O O O O
interfere O O O O
with O O O O
several O O O O
systems O O O O
of O O O O
the O O O O
host O O O O
viral O O O O
defense O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
present O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
NS1 O O O O
of O O O O
the O O O O
highly O O O O
pathogenic O O O O
avian O O O O
influenza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Duck O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Hubei O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
L O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
2004 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H5N1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
interacts O O O O
with O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
Ubc9 O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
the O O O O
E2 O O O O
conjugating O O O O
enzyme O O O O
for O O O O
sumoylation O O O O
, O O O O
and O O O O
we O O O O
show O O O O
that O O O O
SUMO1 O O O O
is O O O O
conjugated O O O O
to O O O O
H5N1 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
NS1 O O O O
in O O O O
both O O O O
transfected O O O O
and O O O O
infected O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
two O O O O
lysine O O O O
residues O O O O
in O O O O
the O O O O
C O O O O
terminus O O O O
of O O O O
NS1 O O O O
were O O O O
identified O O O O
as O O O O
SUMO1 O O O O
acceptor O O O O
sites O O O O
. O O O O
    
When O O O O
the O O O O
SUMO1 O O O O
acceptor O O O O
sites O O O O
were O O O O
removed O O O O
by O O O O
mutation O O O O
, O O O O
NS1 O O O O
underwent O O O O
rapid O O O O
degradation O O O O
. O O O O
    
Studies O O O O
of O O O O
different O O O O
influenza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strains O O O O
of O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
avian O O O O
origin O O O O
showed O O O O
that O O O O
the O O O O
majority O O O O
of O O O O
viruses O O O O
possess O O O O
an O O O O
NS1 O O O O
protein O O O O
that O O O O
is O O O O
modified O O O O
by O O O O
SUMO1 O O O O
, O O O O
except O O O O
for O O O O
the O O O O
recently O O O O
emerged O O O O
swine B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
origin O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
influenza O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
S O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
OIV O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
H1N1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Interestingly O O O O
, O O O O
growth O O O O
of O O O O
a O O O O
sumoylation O O O O
- O O O O
deficient O O O O
WSN O O O O
virus O O O O
mutant O O O O
was O O O O
retarded O O O O
compared O O O O
to O O O O
that O O O O
of O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
virus O O O O
. O O O O
    
Together O O O O
, O O O O
these O O O O
results O O O O
indicate O O O O
that O O O O
sumoylation O O O O
enhances O O O O
NS1 O O O O
stability O O O O
and O O O O
thus O O O O
promotes O O O O
rapid O O O O
growth O O O O
of O O O O
influenza B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Acclimation O O O O
to O O O O
high O O O O
CO2 O O O O
in O O O O
maize B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
is O O O O
related O O O O
to O O O O
water O O O O
status O O O O
and O O O O
dependent O O O O
on O O O O
leaf O O O O
rank O O O O
. O O O O
    
The O O O O
responses O O O O
of O O O O
C O O O O
( O O O O
3 O O O O
) O O O O
plants O O O O
to O O O O
rising O O O O
atmospheric O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
levels O O O O
are O O O O
considered O O O O
to O O O O
be O O O O
largely O O O O
dependent O O O O
on O O O O
effects O O O O
exerted O O O O
through O O O O
altered O O O O
photosynthesis O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
, O O O O
the O O O O
nature O O O O
of O O O O
the O O O O
responses O O O O
of O O O O
C O O O O
( O O O O
4 O O O O
) O O O O
plants O O O O
to O O O O
high O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
remains O O O O
controversial O O O O
because O O O O
of O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
- O O O O
dependent O O O O
effects O O O O
on O O O O
photosynthesis O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
atmospheric O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
availability O O O O
on O O O O
the O O O O
transcriptome O O O O
, O O O O
proteome O O O O
and O O O O
metabolome O O O O
profiles O O O O
of O O O O
two O O O O
ranks O O O O
of O O O O
source O O O O
leaves O O O O
in O O O O
maize B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
Zea B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mays O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
L O O O O
. O O O O
) O O O O
were O O O O
studied O O O O
in O O O O
plants O O O O
grown O O O O
under O O O O
ambient O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
conditions O O O O
( O O O O
350 O O O O
+ O O O O
/ O O O O
- O O O O
20 O O O O
muL O O O O
L O O O O
( O O O O
- O O O O
1 O O O O
) O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
) O O O O
or O O O O
with O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
enrichment O O O O
( O O O O
700 O O O O
+ O O O O
/ O O O O
- O O O O
20 O O O O
muL O O O O
L O O O O
( O O O O
- O O O O
1 O O O O
) O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Growth O O O O
at O O O O
high O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
had O O O O
no O O O O
effect O O O O
on O O O O
photosynthesis O O O O
, O O O O
photorespiration O O O O
, O O O O
leaf O O O O
C O O O O
/ O O O O
N O O O O
ratios O O O O
or O O O O
anthocyanin O O O O
contents O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
leaf O O O O
transpiration O O O O
rates O O O O
, O O O O
carbohydrate O O O O
metabolism O O O O
and O O O O
protein O O O O
carbonyl O O O O
accumulation O O O O
were O O O O
altered O O O O
at O O O O
high O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
in O O O O
a O O O O
leaf O O O O
- O O O O
rank O O O O
specific O O O O
manner O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
no O O O O
significant O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
- O O O O
dependent O O O O
changes O O O O
in O O O O
the O O O O
leaf O O O O
transcriptome O O O O
were O O O O
observed O O O O
, O O O O
qPCR O O O O
analysis O O O O
revealed O O O O
that O O O O
the O O O O
abundance O O O O
of O O O O
transcripts O O O O
encoding O O O O
a O O O O
Bowman O O O O
- O O O O
Birk O O O O
protease O O O O
inhibitor O O O O
and O O O O
a O O O O
serpin O O O O
were O O O O
changed O O O O
by O O O O
the O O O O
growth O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
level O O O O
in O O O O
a O O O O
leaf O O O O
rank O O O O
specific O O O O
manner O O O O
. O O O O
    
Moreover O O O O
, O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
- O O O O
dependent O O O O
changes O O O O
in O O O O
the O O O O
leaf O O O O
proteome O O O O
were O O O O
most O O O O
evident O O O O
in O O O O
the O O O O
oldest O O O O
source O O O O
leaves O O O O
. O O O O
    
Small O O O O
changes O O O O
in O O O O
water O O O O
status O O O O
may O O O O
be O O O O
responsible O O O O
for O O O O
the O O O O
observed O O O O
responses O O O O
to O O O O
high O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
, O O O O
) O O O O
particularly O O O O
in O O O O
the O O O O
older O O O O
leaf O O O O
ranks O O O O
. O O O O
    
Seasonal O O O O
dynamics O O O O
in O O O O
the O O O O
stable O O O O
carbon O O O O
isotope O O O O
composition O O O O
delta O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
3C O O O O
from O O O O
non O O O O
- O O O O
leafy O O O O
branch O O O O
, O O O O
trunk O O O O
and O O O O
coarse O O O O
root O O O O
CO2 O O O O
efflux O O O O
of O O O O
adult O O O O
deciduous O O O O
( O O O O
Fagus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sylvatica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
and O O O O
evergreen O O O O
( O O O O
Picea B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
abies O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
trees O O O O
. O O O O
    
Respiration O O O O
is O O O O
a O O O O
substantial O O O O
driver O O O O
of O O O O
carbon O O O O
( O O O O
C O O O O
) O O O O
flux O O O O
in O O O O
forest O O O O
ecosystems O O O O
and O O O O
stable O O O O
C O O O O
isotopes O O O O
provide O O O O
an O O O O
excellent O O O O
tool O O O O
for O O O O
its O O O O
investigation O O O O
. O O O O
    
We O O O O
studied O O O O
seasonal O O O O
dynamics O O O O
in O O O O
delta O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
3C O O O O
of O O O O
CO2 O O O O
efflux O O O O
( O O O O
delta O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
3C O O O O
( O O O O
E O O O O
) O O O O
) O O O O
from O O O O
non O O O O
- O O O O
leafy O O O O
branches O O O O
, O O O O
upper O O O O
and O O O O
lower O O O O
trunks O O O O
and O O O O
coarse O O O O
roots O O O O
of O O O O
adult O O O O
trees O O O O
, O O O O
comparing O O O O
deciduous O O O O
Fagus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sylvatica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
European B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
beech O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
with O O O O
evergreen O O O O
Picea B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
abies O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Norway B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
spruce O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
. O O O O
    
In O O O O
both O O O O
species O O O O
, O O O O
we O O O O
observed O O O O
strong O O O O
and O O O O
similar O O O O
seasonal O O O O
dynamics O O O O
in O O O O
the O O O O
delta O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
3C O O O O
( O O O O
E O O O O
) O O O O
of O O O O
above O O O O
- O O O O
ground O O O O
plant O O O O
components O O O O
, O O O O
whereas O O O O
delta O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
3C O O O O
( O O O O
E O O O O
) O O O O
of O O O O
coarse O O O O
roots O O O O
was O O O O
rather O O O O
stable O O O O
. O O O O
    
During O O O O
summer O O O O
, O O O O
delta O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
3C O O O O
( O O O O
E O O O O
) O O O O
of O O O O
trunks O O O O
was O O O O
about O O O O
- O O O O
28 O O O O
. O O O O
2 O O O O
% O O O O
( O O O O
Beech O O O O
) O O O O
and O O O O
- O O O O
26 O O O O
. O O O O
8 O O O O
% O O O O
( O O O O
Spruce O O O O
) O O O O
. O O O O
    
During O O O O
winter O O O O
dormancy O O O O
, O O O O
delta O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
3C O O O O
( O O O O
E O O O O
) O O O O
increased O O O O
by O O O O
5 O O O O
. O O O O
6 O O O O
- O O O O
9 O O O O
. O O O O
1 O O O O
% O O O O
. O O O O
    
The O O O O
observed O O O O
dynamics O O O O
are O O O O
likely O O O O
related O O O O
to O O O O
a O O O O
switch O O O O
from O O O O
growth O O O O
to O O O O
starch O O O O
accumulation O O O O
during O O O O
fall O O O O
and O O O O
remobilization O O O O
of O O O O
starch O O O O
, O O O O
low O O O O
TCA O O O O
cycle O O O O
activity O O O O
and O O O O
accumulation O O O O
of O O O O
malate O O O O
by O O O O
PEPc O O O O
during O O O O
winter O O O O
. O O O O
    
The O O O O
seasonal O O O O
delta O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
3C O O O O
( O O O O
E O O O O
) O O O O
pattern O O O O
of O O O O
branches O O O O
of O O O O
Beech O O O O
and O O O O
upper O O O O
trunks O O O O
of O O O O
Spruce O O O O
was O O O O
less O O O O
variable O O O O
, O O O O
probably O O O O
because O O O O
these O O O O
organs O O O O
were O O O O
additionally O O O O
supplied O O O O
by O O O O
winter O O O O
photosynthesis O O O O
. O O O O
    
In O O O O
view O O O O
of O O O O
our O O O O
results O O O O
and O O O O
pervious O O O O
studies O O O O
, O O O O
we O O O O
conclude O O O O
that O O O O
the O O O O
pronounced O O O O
increases O O O O
in O O O O
delta O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
3C O O O O
( O O O O
E O O O O
) O O O O
of O O O O
trunks O O O O
during O O O O
the O O O O
winter O O O O
results O O O O
from O O O O
interrupted O O O O
access O O O O
to O O O O
recent O O O O
photosynthates O O O O
. O O O O
    
The O O O O
atypical O O O O
OmpR O O O O
/ O O O O
PhoB O O O O
response O O O O
regulator O O O O
ChxR O O O O
from O O O O
Chlamydia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trachomatis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
forms O O O O
homodimers O O O O
in O O O O
vivo O O O O
and O O O O
binds O O O O
a O O O O
direct O O O O
repeat O O O O
of O O O O
nucleotide O O O O
sequences O O O O
. O O O O
    
Two O O O O
- O O O O
component O O O O
signal O O O O
transduction O O O O
systems O O O O
are O O O O
widespread O O O O
in O O O O
bacteria O O O O
and O O O O
are O O O O
essential O O O O
regulatory O O O O
mechanisms O O O O
for O O O O
many O O O O
biological O O O O
processes O O O O
. O O O O
    
These O O O O
systems O O O O
predominantly O O O O
rely O O O O
on O O O O
a O O O O
sensor O O O O
kinase O O O O
to O O O O
phosphorylate O O O O
a O O O O
response O O O O
regulator O O O O
for O O O O
controlling O O O O
activity O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
frequently O O O O
transcriptional O O O O
regulation O O O O
. O O O O
    
In O O O O
recent O O O O
years O O O O
, O O O O
an O O O O
increasing O O O O
number O O O O
of O O O O
atypical O O O O
response O O O O
regulators O O O O
have O O O O
been O O O O
discovered O O O O
in O O O O
phylogenetically O O O O
diverse O O O O
bacteria O O O O
. O O O O
    
These O O O O
atypical O O O O
response O O O O
regulators O O O O
are O O O O
not O O O O
controlled O O O O
by O O O O
phosphorylation O O O O
and O O O O
exhibit O O O O
transcriptional O O O O
activity O O O O
in O O O O
their O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
form O O O O
. O O O O
    
Relatively O O O O
little O O O O
is O O O O
known O O O O
regarding O O O O
the O O O O
mechanisms O O O O
utilized O O O O
by O O O O
these O O O O
atypical O O O O
response O O O O
regulators O O O O
and O O O O
the O O O O
conserved O O O O
characteristics O O O O
of O O O O
these O O O O
atypical O O O O
response O O O O
regulators O O O O
. O O O O
    
Chlamydia O O O O
spp O O O O
. O O O O
are O O O O
medically O O O O
important O O O O
bacteria O O O O
and O O O O
encode O O O O
an O O O O
atypical O O O O
OmpR O O O O
/ O O O O
PhoB O O O O
subfamily O O O O
response O O O O
regulator O O O O
termed O O O O
ChxR O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
protein O O O O
expression O O O O
analysis O O O O
supports O O O O
that O O O O
ChxR O O O O
is O O O O
likely O O O O
exerting O O O O
its O O O O
effect O O O O
during O O O O
the O O O O
middle O O O O
and O O O O
late O O O O
stages O O O O
of O O O O
the O O O O
chlamydial O O O O
developmental O O O O
cycle O O O O
, O O O O
stages O O O O
that O O O O
include O O O O
the O O O O
formation O O O O
of O O O O
infectious O O O O
elementary O O O O
bodies O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
detectable O O O O
phosphorylation O O O O
, O O O O
ChxR O O O O
formed O O O O
homodimers O O O O
in O O O O
vitro O O O O
and O O O O
in O O O O
vivo O O O O
, O O O O
similar O O O O
to O O O O
a O O O O
phosphorylated O O O O
OmpR O O O O
/ O O O O
PhoB O O O O
subfamily O O O O
response O O O O
regulator O O O O
. O O O O
    
ChxR O O O O
was O O O O
demonstrated O O O O
to O O O O
bind O O O O
to O O O O
its O O O O
own O O O O
promoter O O O O
in O O O O
vivo O O O O
, O O O O
supporting O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
ChxR O O O O
as O O O O
an O O O O
autoactivator O O O O
. O O O O
    
Detailed O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
ChxR O O O O
binding O O O O
sites O O O O
within O O O O
its O O O O
own O O O O
promoter O O O O
revealed O O O O
a O O O O
conserved O O O O
cis O O O O
- O O O O
acting O O O O
motif O O O O
that O O O O
includes O O O O
a O O O O
tandem O O O O
repeat O O O O
sequence O O O O
. O O O O
    
ChxR O O O O
binds O O O O
specifically O O O O
to O O O O
each O O O O
of O O O O
the O O O O
individual O O O O
sites O O O O
and O O O O
exhibits O O O O
a O O O O
relatively O O O O
large O O O O
spectrum O O O O
of O O O O
differential O O O O
affinity O O O O
. O O O O
    
Taken O O O O
together O O O O
, O O O O
these O O O O
observations O O O O
support O O O O
the O O O O
conclusion O O O O
that O O O O
ChxR O O O O
, O O O O
in O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
phosphorylation O O O O
, O O O O
exhibits O O O O
many O O O O
of O O O O
the O O O O
characteristics O O O O
of O O O O
a O O O O
phosphorylated O O O O
( O O O O
active O O O O
) O O O O
OmpR O O O O
/ O O O O
PhoB O O O O
subfamily O O O O
response O O O O
regulator O O O O
. O O O O
    
Cold O O O O
stress O O O O
contributes O O O O
to O O O O
aberrant O O O O
cytokinesis O O O O
during O O O O
male O O O O
meiosis O O O O
I O O O O
in O O O O
a O O O O
wheat B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
thermosensitive O O O O
genic O O O O
male O O O O
sterile O O O O
line O O O O
. O O O O
    
The O O O O
male O O O O
sterility O O O O
of O O O O
a O O O O
wheat B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
thermosensitive O O O O
genic O O O O
male O O O O
sterile O O O O
( O O O O
TGMS O O O O
) O O O O
line O O O O
is O O O O
strictly O O O O
controlled O O O O
by O O O O
temperature O O O O
. O O O O
    
When O O O O
the O O O O
TGMS O O O O
line O O O O
BS366 O O O O
was O O O O
exposed O O O O
to O O O O
10 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
from O O O O
the O O O O
pollen O O O O
mother O O O O
cell O O O O
stage O O O O
to O O O O
the O O O O
meiosis O O O O
stage O O O O
, O O O O
a O O O O
few O O O O
pollen O O O O
grains O O O O
were O O O O
formed O O O O
and O O O O
devoid O O O O
of O O O O
starch O O O O
. O O O O
    
We O O O O
report O O O O
here O O O O
a O O O O
large O O O O
- O O O O
scale O O O O
transcriptomic O O O O
study O O O O
using O O O O
the O O O O
Affymetrix O O O O
wheat B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
GeneChip O O O O
to O O O O
follow O O O O
gene O O O O
expression O O O O
in O O O O
BS366 O O O O
line O O O O
anthers O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
cold O O O O
stress O O O O
. O O O O
    
Notably O O O O
, O O O O
many O O O O
cytoskeletal O O O O
signaling O O O O
components O O O O
were O O O O
gradually O O O O
induced O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
cold O O O O
stress O O O O
in O O O O
BS366 O O O O
line O O O O
anthers O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
cytoskeleton O O O O
- O O O O
associated O O O O
genes O O O O
that O O O O
play O O O O
key O O O O
roles O O O O
in O O O O
the O O O O
dynamic O O O O
organization O O O O
of O O O O
the O O O O
cytoskeleton O O O O
were O O O O
dramatically O O O O
repressed O O O O
. O O O O
    
Histological O O O O
studies O O O O
revealed O O O O
that O O O O
the O O O O
separation O O O O
of O O O O
dyads O O O O
occurred O O O O
abnormally O O O O
during O O O O
male O O O O
meiosis O O O O
I O O O O
, O O O O
indicating O O O O
defective O O O O
male O O O O
meiotic O O O O
cytokinesis O O O O
. O O O O
    
Fluorescence O O O O
labelling O O O O
and O O O O
subcellular O O O O
histological O O O O
observations O O O O
revealed O O O O
that O O O O
the O O O O
phragmoplast O O O O
was O O O O
defectively O O O O
formed O O O O
and O O O O
the O O O O
cell O O O O
plate O O O O
was O O O O
abnormally O O O O
assembled O O O O
during O O O O
meiosis O O O O
I O O O O
under O O O O
cold O O O O
stress O O O O
. O O O O
    
Based O O O O
on O O O O
the O O O O
transcriptomic O O O O
analysis O O O O
and O O O O
observations O O O O
of O O O O
characterized O O O O
histological O O O O
changes O O O O
, O O O O
our O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
cold O O O O
stress O O O O
repressed O O O O
transcription O O O O
of O O O O
cytoskeleton O O O O
dynamic O O O O
factors O O O O
and O O O O
subsequently O O O O
caused O O O O
the O O O O
defective O O O O
cytokinesis O O O O
during O O O O
meiosis O O O O
I O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
may O O O O
explain O O O O
the O O O O
male O O O O
sterility O O O O
caused O O O O
by O O O O
low O O O O
temperature O O O O
in O O O O
wheat O O O O
TGMS O O O O
lines O O O O
. O O O O
    
Characterizing O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
RNA O O O O
silencing O O O O
components O O O O
in O O O O
Cryptococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
neoformans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
RNA O O O O
interference O O O O
( O O O O
RNAi O O O O
) O O O O
mediated O O O O
by O O O O
homology O O O O
- O O O O
dependent O O O O
degradation O O O O
of O O O O
the O O O O
target O O O O
mRNA O O O O
with O O O O
small O O O O
RNA O O O O
molecules O O O O
plays O O O O
a O O O O
key O O O O
role O O O O
in O O O O
controlling O O O O
transcription O O O O
and O O O O
translation O O O O
processes O O O O
in O O O O
a O O O O
number O O O O
of O O O O
eukaryotic O O O O
organisms O O O O
. O O O O
    
The O O O O
RNAi O O O O
machinery O O O O
is O O O O
also O O O O
evolutionarily O O O O
conserved O O O O
in O O O O
a O O O O
wide O O O O
variety O O O O
of O O O O
fungal O O O O
species O O O O
, O O O O
including O O O O
pathogenic O O O O
fungi O O O O
. O O O O
    
To O O O O
elucidate O O O O
the O O O O
physiological O O O O
functions O O O O
of O O O O
the O O O O
RNAi O O O O
pathway O O O O
in O O O O
Cryptococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
neoformans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
that O O O O
causes O O O O
fungal O O O O
meningitis O O O O
, O O O O
here O O O O
we O O O O
performed O O O O
genetic O O O O
analyses O O O O
for O O O O
genes O O O O
encoding O O O O
Argonaute O O O O
( O O O O
AGO1 O O O O
and O O O O
AGO2 O O O O
) O O O O
, O O O O
RNA O O O O
- O O O O
dependent O O O O
RNA O O O O
polymerase O O O O
( O O O O
RDP1 O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
Dicers O O O O
( O O O O
DCR1 O O O O
and O O O O
DCR2 O O O O
) O O O O
in O O O O
both O O O O
serotype O O O O
A O O O O
and O O O O
D O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
neoformans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
present O O O O
study O O O O
shows O O O O
that O O O O
Ago1 O O O O
, O O O O
Rdp1 O O O O
, O O O O
and O O O O
Dcr2 O O O O
are O O O O
the O O O O
major O O O O
components O O O O
of O O O O
the O O O O
RNAi O O O O
process O O O O
occurring O O O O
in O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
neoformans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
the O O O O
RNAi O O O O
machinery O O O O
is O O O O
not O O O O
involved O O O O
in O O O O
regulation O O O O
of O O O O
production O O O O
of O O O O
two O O O O
virulence O O O O
factors O O O O
( O O O O
capsule O O O O
and O O O O
melanin O O O O
) O O O O
, O O O O
sexual O O O O
differentiation O O O O
, O O O O
and O O O O
diverse O O O O
stress O O O O
response O O O O
. O O O O
    
Comparative O O O O
transcriptome O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
serotype O O O O
A O O O O
and O O O O
D O O O O
RNAi O O O O
mutants O O O O
revealed O O O O
that O O O O
only O O O O
modest O O O O
changes O O O O
occur O O O O
in O O O O
the O O O O
genome O O O O
- O O O O
wide O O O O
transcriptome O O O O
profiles O O O O
when O O O O
the O O O O
RNAi O O O O
process O O O O
was O O O O
perturbed O O O O
. O O O O
    
Notably O O O O
, O O O O
the O O O O
serotype O O O O
D O O O O
rdp1Delta O O O O
mutants O O O O
showed O O O O
an O O O O
increase O O O O
in O O O O
transcript O O O O
abundance O O O O
of O O O O
active O O O O
retrotransposons O O O O
and O O O O
transposons O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
T2 O O O O
and O O O O
T3 O O O O
, O O O O
the O O O O
latter O O O O
of O O O O
which O O O O
is O O O O
a O O O O
novel O O O O
serotype O O O O
D O O O O
- O O O O
specific O O O O
transposon O O O O
of O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
neoformans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
In O O O O
a O O O O
wild O O O O
type O O O O
background O O O O
both O O O O
T2 O O O O
and O O O O
T3 O O O O
were O O O O
found O O O O
to O O O O
be O O O O
weakly O O O O
active O O O O
mobile O O O O
elements O O O O
, O O O O
although O O O O
we O O O O
found O O O O
no O O O O
evidence O O O O
of O O O O
Cnl1 O O O O
retrotransposon O O O O
mobility O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
, O O O O
all O O O O
three O O O O
transposable O O O O
elements O O O O
exhibited O O O O
enhanced O O O O
mobility O O O O
in O O O O
the O O O O
rdp1Delta O O O O
mutant O O O O
strain O O O O
. O O O O
    
In O O O O
conclusion O O O O
, O O O O
the O O O O
RNAi O O O O
pathway O O O O
plays O O O O
an O O O O
important O O O O
role O O O O
in O O O O
controlling O O O O
transposon O O O O
activity O O O O
and O O O O
genome O O O O
integrity O O O O
of O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
neoformans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Fur O O O O
negatively O O O O
regulates O O O O
hns O O O O
and O O O O
is O O O O
required O O O O
for O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
HilA O O O O
and O O O O
virulence O O O O
in O O O O
Salmonella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
enterica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
serovar O O O O
Typhimurium O O O O
. O O O O
    
Iron O O O O
is O O O O
an O O O O
essential O O O O
element O O O O
for O O O O
the O O O O
survival O O O O
of O O O O
living O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
excess O O O O
iron O O O O
is O O O O
toxic O O O O
, O O O O
and O O O O
its O O O O
uptake O O O O
is O O O O
exquisitely O O O O
regulated O O O O
by O O O O
the O O O O
ferric O O O O
uptake O O O O
regulator O O O O
, O O O O
Fur O O O O
. O O O O
    
In O O O O
Salmonella O O O O
, O O O O
the O O O O
Salmonella O O O O
pathogenicity O O O O
island O O O O
1 O O O O
( O O O O
SPI O O O O
- O O O O
1 O O O O
) O O O O
encodes O O O O
a O O O O
type O O O O
three O O O O
secretion O O O O
system O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
required O O O O
for O O O O
invasion O O O O
of O O O O
host O O O O
epithelial O O O O
cells O O O O
in O O O O
the O O O O
small O O O O
intestine O O O O
. O O O O
    
A O O O O
major O O O O
activator O O O O
of O O O O
SPI O O O O
- O O O O
1 O O O O
is O O O O
HilA O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
encoded O O O O
within O O O O
SPI O O O O
- O O O O
1 O O O O
. O O O O
    
One O O O O
known O O O O
regulator O O O O
of O O O O
hilA O O O O
is O O O O
Fur O O O O
. O O O O
    
The O O O O
mechanism O O O O
of O O O O
hilA O O O O
regulation O O O O
by O O O O
Fur O O O O
is O O O O
unknown O O O O
. O O O O
    
We O O O O
report O O O O
here O O O O
that O O O O
Fur O O O O
is O O O O
required O O O O
for O O O O
virulence O O O O
in O O O O
Salmonella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
enterica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
serovar O O O O
Typhimurium O O O O
and O O O O
that O O O O
Fur O O O O
is O O O O
required O O O O
for O O O O
the O O O O
activation O O O O
of O O O O
hilA O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
of O O O O
other O O O O
HilA O O O O
- O O O O
dependent O O O O
genes O O O O
, O O O O
invF O O O O
and O O O O
sipC O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Fur O O O O
- O O O O
dependent O O O O
regulation O O O O
of O O O O
hilA O O O O
was O O O O
independent O O O O
of O O O O
PhoP O O O O
, O O O O
a O O O O
known O O O O
repressor O O O O
of O O O O
hilA O O O O
. O O O O
    
Instead O O O O
, O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
the O O O O
gene O O O O
coding O O O O
for O O O O
the O O O O
histone O O O O
- O O O O
like O O O O
protein O O O O
, O O O O
hns O O O O
, O O O O
was O O O O
significantly O O O O
derepressed O O O O
in O O O O
the O O O O
fur O O O O
mutant O O O O
. O O O O
    
Indeed O O O O
, O O O O
the O O O O
activation O O O O
of O O O O
hilA O O O O
by O O O O
Fur O O O O
was O O O O
dependent O O O O
on O O O O
28 O O O O
nucleotides O O O O
located O O O O
upstream O O O O
of O O O O
hns O O O O
. O O O O
    
Moreover O O O O
, O O O O
we O O O O
used O O O O
chromatin O O O O
immunoprecipitation O O O O
to O O O O
show O O O O
that O O O O
Fur O O O O
bound O O O O
, O O O O
in O O O O
vivo O O O O
, O O O O
to O O O O
the O O O O
upstream O O O O
region O O O O
of O O O O
hns O O O O
in O O O O
a O O O O
metal O O O O
- O O O O
dependent O O O O
fashion O O O O
. O O O O
    
Finally O O O O
, O O O O
deletion O O O O
of O O O O
fur O O O O
in O O O O
an O O O O
hns O O O O
mutant O O O O
resulted O O O O
in O O O O
Fur O O O O
- O O O O
independent O O O O
activation O O O O
of O O O O
hilA O O O O
. O O O O
    
In O O O O
conclusion O O O O
, O O O O
Fur O O O O
activates O O O O
hilA O O O O
by O O O O
repressing O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
hns O O O O
. O O O O
    
MexT O O O O
regulates O O O O
the O O O O
type O O O O
III O O O O
secretion O O O O
system O O O O
through O O O O
MexS O O O O
and O O O O
PtrC O O O O
in O O O O
Pseudomonas O O O O
aeruginosa O O O O
. O O O O
    
The O O O O
type O O O O
III O O O O
secretion O O O O
system O O O O
( O O O O
T3SS O O O O
) O O O O
is O O O O
the O O O O
most O O O O
important O O O O
virulence O O O O
factor O O O O
in O O O O
Pseudomonas O O O O
aeruginosa O O O O
, O O O O
and O O O O
its O O O O
expression O O O O
level O O O O
varies O O O O
in O O O O
different O O O O
isolates O O O O
. O O O O
    
We O O O O
studied O O O O
the O O O O
molecular O O O O
basis O O O O
for O O O O
such O O O O
differences O O O O
in O O O O
two O O O O
laboratory O O O O
strains O O O O
, O O O O
PAK O O O O
and O O O O
PAO1 O O O O
. O O O O
    
A O O O O
chromosomal O O O O
clone O O O O
library O O O O
from O O O O
the O O O O
high O O O O
- O O O O
T3SS O O O O
- O O O O
producer O O O O
strain O O O O
PAK O O O O
was O O O O
introduced O O O O
into O O O O
the O O O O
low O O O O
- O O O O
producer O O O O
strain O O O O
PAO1 O O O O
, O O O O
and O O O O
we O O O O
found O O O O
that O O O O
a O O O O
mexS O O O O
gene O O O O
from O O O O
PAK O O O O
confers O O O O
high O O O O
T3SS O O O O
expression O O O O
in O O O O
the O O O O
PAO1 O O O O
background O O O O
. O O O O
    
Further O O O O
tests O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
both O O O O
mexS O O O O
and O O O O
its O O O O
neighboring O O O O
mexT O O O O
gene O O O O
are O O O O
required O O O O
for O O O O
the O O O O
repression O O O O
of O O O O
the O O O O
T3SS O O O O
in O O O O
PAO1 O O O O
, O O O O
while O O O O
the O O O O
PAK O O O O
genome O O O O
encodes O O O O
a O O O O
defective O O O O
MexS O O O O
, O O O O
accounting O O O O
for O O O O
the O O O O
derepression O O O O
of O O O O
the O O O O
T3SS O O O O
in O O O O
PAK O O O O
and O O O O
the O O O O
dominant O O O O
negative O O O O
effect O O O O
when O O O O
it O O O O
is O O O O
introduced O O O O
into O O O O
PAO1 O O O O
. O O O O
    
MexS O O O O
is O O O O
a O O O O
probable O O O O
oxidoreductase O O O O
whose O O O O
expression O O O O
is O O O O
dependent O O O O
on O O O O
MexT O O O O
, O O O O
a O O O O
LysR O O O O
- O O O O
type O O O O
transcriptional O O O O
regulator O O O O
. O O O O
    
Various O O O O
genetic O O O O
data O O O O
support O O O O
the O O O O
idea O O O O
that O O O O
MexS O O O O
modulates O O O O
the O O O O
transcriptional O O O O
regulator O O O O
function O O O O
of O O O O
MexT O O O O
. O O O O
    
In O O O O
searching O O O O
for O O O O
the O O O O
MexT O O O O
- O O O O
dependent O O O O
repressor O O O O
of O O O O
the O O O O
T3SS O O O O
, O O O O
a O O O O
small O O O O
gene O O O O
product O O O O
of O O O O
PA2486 O O O O
( O O O O
ptrC O O O O
) O O O O
was O O O O
found O O O O
effective O O O O
in O O O O
suppressing O O O O
the O O O O
T3SS O O O O
upon O O O O
overexpression O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
deletion O O O O
of O O O O
ptrC O O O O
in O O O O
the O O O O
PAO1 O O O O
background O O O O
did O O O O
not O O O O
result O O O O
in O O O O
derepression O O O O
of O O O O
the O O O O
T3SS O O O O
, O O O O
indicating O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
another O O O O
repressor O O O O
for O O O O
the O O O O
T3SS O O O O
. O O O O
    
Interestingly O O O O
, O O O O
overexpression O O O O
of O O O O
functional O O O O
mexS O O O O
alone O O O O
was O O O O
sufficient O O O O
to O O O O
repress O O O O
T3SS O O O O
even O O O O
in O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
MexT O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
MexS O O O O
is O O O O
another O O O O
mediator O O O O
of O O O O
MexT O O O O
- O O O O
dependent O O O O
T3SS O O O O
repression O O O O
. O O O O
    
Overexpression O O O O
of O O O O
mexS O O O O
alone O O O O
had O O O O
no O O O O
effect O O O O
on O O O O
the O O O O
well O O O O
- O O O O
known O O O O
MexT O O O O
- O O O O
dependent O O O O
genes O O O O
, O O O O
including O O O O
those O O O O
encoding O O O O
MexEF O O O O
efflux O O O O
pump O O O O
, O O O O
elastase O O O O
, O O O O
and O O O O
pyocyanin O O O O
, O O O O
indicating O O O O
alternative O O O O
regulatory O O O O
mechanisms O O O O
. O O O O
    
A O O O O
model O O O O
has O O O O
been O O O O
proposed O O O O
for O O O O
the O O O O
MexS O O O O
/ O O O O
MexT O O O O
- O O O O
mediated O O O O
regulation O O O O
of O O O O
the O O O O
T3SS O O O O
, O O O O
the O O O O
MexEF O O O O
efflux O O O O
pump O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
production O O O O
of O O O O
elastase O O O O
and O O O O
pyocyanin O O O O
. O O O O
    
Complete O O O O
genome O O O O
sequence O O O O
of O O O O
the O O O O
haloaromatic O O O O
acid O O O O
- O O O O
degrading O O O O
bacterium O O O O
Achromobacter B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
xylosoxidans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
A8 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Achromobacter B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
xylosoxidans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
A8 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
soil O O O O
contaminated O O O O
with O O O O
polychlorinated O O O O
biphenyls O O O O
. O O O O
    
It O O O O
can O O O O
use O O O O
2 O O O O
- O O O O
chlorobenzoate O O O O
and O O O O
2 O O O O
, O O O O
5 O O O O
- O O O O
dichlorobenzoate O O O O
as O O O O
sole O O O O
sources O O O O
of O O O O
carbon O O O O
and O O O O
energy O O O O
. O O O O
    
This O O O O
property O O O O
makes O O O O
it O O O O
a O O O O
good O O O O
starting O O O O
microorganism O O O O
for O O O O
further O O O O
development O O O O
toward O O O O
a O O O O
bioremediation O O O O
tool O O O O
. O O O O
    
The O O O O
genome O O O O
of O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
xylosoxidans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
consists O O O O
of O O O O
a O O O O
7 O O O O
- O O O O
Mb O O O O
chromosome O O O O
and O O O O
two O O O O
large O O O O
plasmids O O O O
( O O O O
98 O O O O
kb O O O O
and O O O O
248 O O O O
kb O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Besides O O O O
genes O O O O
for O O O O
the O O O O
utilization O O O O
of O O O O
xenobiotic O O O O
organic O O O O
substrates O O O O
, O O O O
it O O O O
contains O O O O
genes O O O O
associated O O O O
with O O O O
pathogenesis O O O O
, O O O O
toxin O O O O
production O O O O
, O O O O
and O O O O
resistance O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
report O O O O
the O O O O
complete O O O O
genome O O O O
sequence O O O O
. O O O O
    
Complete O O O O
genome O O O O
sequences O O O O
of O O O O
three O O O O
Erwinia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
amylovora O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
phages O O O O
isolated O O O O
in O O O O
north O O O O
america O O O O
and O O O O
a O O O O
bacteriophage O O O O
induced O O O O
from O O O O
an O O O O
Erwinia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tasmaniensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O O O O
. O O O O
    
Fire O O O O
blight O O O O
, O O O O
a O O O O
plant O O O O
disease O O O O
of O O O O
economic O O O O
importance O O O O
caused O O O O
by O O O O
Erwinia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
amylovora O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
may O O O O
be O O O O
controlled O O O O
by O O O O
the O O O O
application O O O O
of O O O O
bacteriophages O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
provide O O O O
the O O O O
complete O O O O
genome O O O O
sequences O O O O
and O O O O
the O O O O
annotation O O O O
of O O O O
three O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
amylovora O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O O O O
specific O O O O
phages O O O O
isolated O O O O
in O O O O
North O O O O
America O O O O
and O O O O
genomic O O O O
information O O O O
about O O O O
a O O O O
bacteriophage O O O O
induced O O O O
by O O O O
mitomycin O O O O
C O O O O
treatment O O O O
of O O O O
an O O O O
Erwinia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tasmaniensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O O O O
that O O O O
is O O O O
antagonistic O O O O
for O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
amylovora O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
American O O O O
phages O O O O
resemble O O O O
two O O O O
already O O O O
- O O O O
described O O O O
viral O O O O
genomes O O O O
, O O O O
whereas O O O O
the O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tasmaniensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
phage O O O O
displays O O O O
a O O O O
singular O O O O
genomic O O O O
sequence O O O O
in O O O O
BLAST O O O O
searches O O O O
. O O O O
    
Promoter O O O O
discrimination O O O O
at O O O O
class O O O O
I O O O O
MarA O O O O
regulon O O O O
promoters O O O O
mediated O O O O
by O O O O
glutamic O O O O
acid O O O O
89 O O O O
of O O O O
the O O O O
MarA O O O O
transcriptional O O O O
activator O O O O
of O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Three O O O O
paralogous O O O O
transcriptional O O O O
activators O O O O
MarA O O O O
, O O O O
SoxS O O O O
, O O O O
and O O O O
Rob O O O O
, O O O O
activate O O O O
> O O O O
40 O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
promoters O O O O
. O O O O
    
To O O O O
understand O O O O
why O O O O
MarA O O O O
does O O O O
not O O O O
activate O O O O
certain O O O O
promoters O O O O
as O O O O
strongly O O O O
as O O O O
SoxS O O O O
, O O O O
we O O O O
compared O O O O
MarA O O O O
, O O O O
MarA O O O O
mutants O O O O
, O O O O
and O O O O
SoxS O O O O
for O O O O
their O O O O
abilities O O O O
to O O O O
activate O O O O
16 O O O O
promoters O O O O
and O O O O
to O O O O
bind O O O O
their O O O O
cognate O O O O
marbox O O O O
binding O O O O
sites O O O O
. O O O O
    
Replacement O O O O
of O O O O
the O O O O
MarA O O O O
glutamic O O O O
acid O O O O
residue O O O O
89 O O O O
with O O O O
alanine O O O O
greatly O O O O
increased O O O O
the O O O O
marbox O O O O
binding O O O O
and O O O O
activation O O O O
of O O O O
many O O O O
class O O O O
I O O O O
promoters O O O O
. O O O O
    
Like O O O O
cells O O O O
constitutive O O O O
for O O O O
SoxS O O O O
, O O O O
cells O O O O
expressing O O O O
the O O O O
MarA O O O O
with O O O O
the O O O O
E89A O O O O
mutation O O O O
were O O O O
more O O O O
resistant O O O O
to O O O O
superoxides O O O O
than O O O O
those O O O O
harboring O O O O
WT O O O O
MarA O O O O
. O O O O
    
The O O O O
activities O O O O
of O O O O
several O O O O
other O O O O
E89 O O O O
substitutions O O O O
ranked O O O O
as O O O O
follows O O O O
: O O O O
E89A O O O O
> O O O O
E89G O O O O
> O O O O
E89V O O O O
> O O O O
WT O O O O
> O O O O
E89D O O O O
. O O O O
    
Increased O O O O
binding O O O O
and O O O O
activation O O O O
occurred O O O O
only O O O O
at O O O O
class O O O O
I O O O O
promoters O O O O
when O O O O
the O O O O
12th O O O O
base O O O O
of O O O O
the O O O O
promoter O O O O
' O O O O
s O O O O
marbox O O O O
( O O O O
a O O O O
position O O O O
at O O O O
which O O O O
there O O O O
is O O O O
no O O O O
known O O O O
interaction O O O O
between O O O O
the O O O O
marbox O O O O
and O O O O
MarA O O O O
) O O O O
was O O O O
not O O O O
a O O O O
T O O O O
residue O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
WT O O O O
MarA O O O O
binding O O O O
to O O O O
a O O O O
synthetic O O O O
marbox O O O O
in O O O O
vitro O O O O
was O O O O
enhanced O O O O
when O O O O
the O O O O
phosphate O O O O
group O O O O
between O O O O
positions O O O O
12 O O O O
and O O O O
13 O O O O
was O O O O
eliminated O O O O
on O O O O
one O O O O
strand O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
relatively O O O O
minor O O O O
changes O O O O
in O O O O
a O O O O
single O O O O
amino O O O O
acid O O O O
side O O O O
chain O O O O
( O O O O
e O O O O
. O O O O
g O O O O
. O O O O
, O O O O
alanine O O O O
to O O O O
valine O O O O
or O O O O
glutamic O O O O
acid O O O O
to O O O O
aspartic O O O O
acid O O O O
) O O O O
can O O O O
strongly O O O O
influence O O O O
activity O O O O
despite O O O O
any O O O O
evidence O O O O
that O O O O
the O O O O
side O O O O
chain O O O O
is O O O O
involved O O O O
in O O O O
positive O O O O
interactions O O O O
with O O O O
either O O O O
DNA O O O O
or O O O O
RNA O O O O
polymerase O O O O
. O O O O
    
We O O O O
present O O O O
a O O O O
model O O O O
which O O O O
attributes O O O O
the O O O O
differences O O O O
in O O O O
binding O O O O
and O O O O
activation O O O O
to O O O O
the O O O O
interference O O O O
between O O O O
the O O O O
Beta O O O O
- O O O O
and O O O O
gamma O O O O
- O O O O
carbons O O O O
of O O O O
the O O O O
amino O O O O
acid O O O O
at O O O O
position O O O O
89 O O O O
and O O O O
the O O O O
phosphate O O O O
group O O O O
between O O O O
positions O O O O
12 O O O O
and O O O O
13 O O O O
. O O O O
    
A O O O O
model O O O O
- O O O O
driven O O O O
approach O O O O
to O O O O
quantify O O O O
migration O O O O
patterns O O O O
: O O O O
individual O O O O
, O O O O
regional O O O O
and O O O O
yearly O O O O
differences O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Animal O O O O
migration O O O O
has O O O O
long O O O O
intrigued O O O O
scientists O O O O
and O O O O
wildlife O O O O
managers O O O O
alike O O O O
, O O O O
yet O O O O
migratory O O O O
species O O O O
face O O O O
increasing O O O O
challenges O O O O
because O O O O
of O O O O
habitat O O O O
fragmentation O O O O
, O O O O
climate O O O O
change O O O O
and O O O O
over O O O O
- O O O O
exploitation O O O O
. O O O O
    
Central O O O O
to O O O O
the O O O O
understanding O O O O
migratory O O O O
species O O O O
is O O O O
the O O O O
objective O O O O
discrimination O O O O
between O O O O
migratory O O O O
and O O O O
nonmigratory O O O O
individuals O O O O
in O O O O
a O O O O
given O O O O
population O O O O
, O O O O
quantifying O O O O
the O O O O
timing O O O O
, O O O O
duration O O O O
and O O O O
distance O O O O
of O O O O
migration O O O O
and O O O O
the O O O O
ability O O O O
to O O O O
predict O O O O
migratory O O O O
movements O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
propose O O O O
a O O O O
uniform O O O O
statistical O O O O
framework O O O O
to O O O O
( O O O O
i O O O O
) O O O O
separate O O O O
migration O O O O
from O O O O
other O O O O
movement O O O O
behaviours O O O O
, O O O O
( O O O O
ii O O O O
) O O O O
quantify O O O O
migration O O O O
parameters O O O O
without O O O O
the O O O O
need O O O O
for O O O O
arbitrary O O O O
cut O O O O
- O O O O
off O O O O
criteria O O O O
and O O O O
( O O O O
iii O O O O
) O O O O
test O O O O
predictability O O O O
across O O O O
individuals O O O O
, O O O O
time O O O O
and O O O O
space O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
first O O O O
validated O O O O
our O O O O
novel O O O O
approach O O O O
by O O O O
simulating O O O O
data O O O O
based O O O O
on O O O O
established O O O O
theoretical O O O O
movement O O O O
patterns O O O O
. O O O O
    
We O O O O
then O O O O
formulated O O O O
the O O O O
expected O O O O
shapes O O O O
of O O O O
squared O O O O
displacement O O O O
patterns O O O O
as O O O O
nonlinear O O O O
models O O O O
for O O O O
a O O O O
suite O O O O
of O O O O
movement O O O O
behaviours O O O O
to O O O O
test O O O O
the O O O O
ability O O O O
of O O O O
our O O O O
method O O O O
to O O O O
distinguish O O O O
between O O O O
migratory O O O O
movement O O O O
and O O O O
other O O O O
movement O O O O
types O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
then O O O O
tested O O O O
our O O O O
approached O O O O
empirically O O O O
using O O O O
108 O O O O
wild O O O O
Global O O O O
Positioning O O O O
System O O O O
( O O O O
GPS O O O O
) O O O O
- O O O O
collared O O O O
moose B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
Alces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
alces O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
Scandinavia O O O O
as O O O O
a O O O O
study O O O O
system O O O O
because O O O O
they O O O O
exhibit O O O O
a O O O O
wide O O O O
range O O O O
of O O O O
movement O O O O
behaviours O O O O
, O O O O
including O O O O
resident O O O O
, O O O O
migrating O O O O
and O O O O
dispersing O O O O
individuals O O O O
, O O O O
within O O O O
the O O O O
same O O O O
population O O O O
. O O O O
    
Applying O O O O
our O O O O
approach O O O O
showed O O O O
that O O O O
87 O O O O
% O O O O
and O O O O
67 O O O O
% O O O O
of O O O O
our O O O O
Swedish O O O O
and O O O O
Norwegian O O O O
subpopulations O O O O
, O O O O
respectively O O O O
, O O O O
can O O O O
be O O O O
classified O O O O
as O O O O
migratory O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
nonlinear O O O O
mixed O O O O
effects O O O O
models O O O O
for O O O O
all O O O O
migratory O O O O
individuals O O O O
we O O O O
showed O O O O
that O O O O
the O O O O
distance O O O O
, O O O O
timing O O O O
and O O O O
duration O O O O
of O O O O
migration O O O O
differed O O O O
between O O O O
the O O O O
sexes O O O O
and O O O O
between O O O O
years O O O O
, O O O O
with O O O O
additional O O O O
individual O O O O
differences O O O O
accounting O O O O
for O O O O
a O O O O
large O O O O
part O O O O
of O O O O
the O O O O
variation O O O O
in O O O O
the O O O O
distance O O O O
of O O O O
migration O O O O
but O O O O
not O O O O
in O O O O
the O O O O
timing O O O O
or O O O O
duration O O O O
. O O O O
    
Overall O O O O
, O O O O
the O O O O
model O O O O
explained O O O O
most O O O O
of O O O O
the O O O O
variation O O O O
( O O O O
92 O O O O
% O O O O
) O O O O
and O O O O
also O O O O
had O O O O
high O O O O
predictive O O O O
power O O O O
for O O O O
the O O O O
same O O O O
individuals O O O O
over O O O O
time O O O O
( O O O O
69 O O O O
% O O O O
) O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
between O O O O
study O O O O
populations O O O O
( O O O O
74 O O O O
% O O O O
) O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
high O O O O
predictive O O O O
ability O O O O
of O O O O
the O O O O
approach O O O O
suggests O O O O
that O O O O
it O O O O
can O O O O
help O O O O
increase O O O O
our O O O O
understanding O O O O
of O O O O
the O O O O
drivers O O O O
of O O O O
migration O O O O
and O O O O
could O O O O
provide O O O O
key O O O O
quantitative O O O O
information O O O O
for O O O O
understanding O O O O
and O O O O
managing O O O O
a O O O O
broad O O O O
range O O O O
of O O O O
migratory O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Citrate O O O O
uptake O O O O
in O O O O
exchange O O O O
with O O O O
intermediates O O O O
in O O O O
the O O O O
citrate O O O O
metabolic O O O O
pathway O O O O
in O O O O
Lactococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
lactis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
IL1403 O O O O
. O O O O
    
Carbohydrate O O O O
/ O O O O
citrate O O O O
cometabolism O O O O
in O O O O
Lactococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
lactis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
results O O O O
in O O O O
the O O O O
formation O O O O
of O O O O
the O O O O
flavor O O O O
compound O O O O
acetoin O O O O
. O O O O
    
Resting O O O O
cells O O O O
of O O O O
strain O O O O
IL1403 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
pFL3 O O O O
) O O O O
rapidly O O O O
consumed O O O O
citrate O O O O
while O O O O
producing O O O O
acetoin O O O O
when O O O O
substoichiometric O O O O
concentrations O O O O
of O O O O
glucose O O O O
or O O O O
l O O O O
- O O O O
lactate O O O O
were O O O O
present O O O O
. O O O O
    
A O O O O
proton O O O O
motive O O O O
force O O O O
was O O O O
generated O O O O
by O O O O
electrogenic O O O O
exchange O O O O
of O O O O
citrate O O O O
and O O O O
lactate O O O O
catalyzed O O O O
by O O O O
the O O O O
citrate O O O O
transporter O O O O
CitP O O O O
and O O O O
proton O O O O
consumption O O O O
in O O O O
decarboxylation O O O O
reactions O O O O
in O O O O
the O O O O
pathway O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
glucose O O O O
or O O O O
l O O O O
- O O O O
lactate O O O O
, O O O O
citrate O O O O
consumption O O O O
was O O O O
biphasic O O O O
. O O O O
    
During O O O O
the O O O O
first O O O O
phase O O O O
, O O O O
hardly O O O O
any O O O O
citrate O O O O
was O O O O
consumed O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
second O O O O
phase O O O O
, O O O O
citrate O O O O
was O O O O
converted O O O O
rapidly O O O O
, O O O O
but O O O O
without O O O O
the O O O O
formation O O O O
of O O O O
acetoin O O O O
. O O O O
    
Instead O O O O
, O O O O
significant O O O O
amounts O O O O
of O O O O
the O O O O
intermediates O O O O
pyruvate O O O O
and O O O O
alpha O O O O
- O O O O
acetolactate O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
end O O O O
product O O O O
acetate O O O O
, O O O O
were O O O O
excreted O O O O
from O O O O
the O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
It O O O O
is O O O O
shown O O O O
that O O O O
the O O O O
intermediates O O O O
and O O O O
acetate O O O O
are O O O O
excreted O O O O
in O O O O
exchange O O O O
with O O O O
the O O O O
uptake O O O O
of O O O O
citrate O O O O
catalyzed O O O O
by O O O O
CitP O O O O
. O O O O
    
The O O O O
availability O O O O
of O O O O
exchangeable O O O O
substrates O O O O
in O O O O
the O O O O
cytoplasm O O O O
determines O O O O
both O O O O
the O O O O
rate O O O O
of O O O O
citrate O O O O
consumption O O O O
and O O O O
the O O O O
end O O O O
product O O O O
profile O O O O
. O O O O
    
It O O O O
follows O O O O
that O O O O
citrate O O O O
metabolism O O O O
in O O O O
L B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
lactis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
IL1403 O O O O
( O O O O
pFL3 O O O O
) O O O O
splits O O O O
up O O O O
in O O O O
two O O O O
routes O O O O
after O O O O
the O O O O
formation O O O O
of O O O O
pyruvate O O O O
, O O O O
one O O O O
the O O O O
well O O O O
- O O O O
characterized O O O O
route O O O O
yielding O O O O
acetoin O O O O
and O O O O
the O O O O
other O O O O
a O O O O
new O O O O
route O O O O
yielding O O O O
acetate O O O O
. O O O O
    
The O O O O
flux O O O O
distribution O O O O
between O O O O
the O O O O
two O O O O
branches O O O O
changes O O O O
from O O O O
85 O O O O
: O O O O
15 O O O O
in O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
l O O O O
- O O O O
lactate O O O O
to O O O O
30 O O O O
: O O O O
70 O O O O
in O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
pyruvate O O O O
. O O O O
    
The O O O O
proton O O O O
motive O O O O
force O O O O
generated O O O O
was O O O O
greatest O O O O
in O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
l O O O O
- O O O O
lactate O O O O
and O O O O
zero O O O O
in O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
pyruvate O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
the O O O O
pathway O O O O
to O O O O
acetate O O O O
does O O O O
not O O O O
generate O O O O
proton O O O O
motive O O O O
force O O O O
. O O O O
    
Interbacterial O O O O
macromolecular O O O O
transfer O O O O
by O O O O
the O O O O
Campylobacter B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fetus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
subsp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
venerealis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
type O O O O
IV O O O O
secretion O O O O
system O O O O
. O O O O
    
We O O O O
report O O O O
here O O O O
the O O O O
first O O O O
demonstration O O O O
of O O O O
intra O O O O
- O O O O
and O O O O
interspecies O O O O
conjugative O O O O
plasmid O O O O
DNA O O O O
transfer O O O O
for O O O O
Campylobacter B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fetus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Gene O O O O
regions O O O O
carried O O O O
by O O O O
a O O O O
Campylobacter B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
plasmid O O O O
were O O O O
identified O O O O
that O O O O
are O O O O
sufficient O O O O
for O O O O
conjugative O O O O
mobilization O O O O
to O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fetus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
recipients O O O O
. O O O O
    
A O O O O
broader O O O O
functional O O O O
range O O O O
is O O O O
predicted O O O O
. O O O O
    
Efficient O O O O
DNA O O O O
transfer O O O O
involves O O O O
the O O O O
virB9 O O O O
and O O O O
virD4 O O O O
genes O O O O
of O O O O
the O O O O
type O O O O
IV O O O O
bacterial O O O O
secretion O O O O
system O O O O
encoded O O O O
by O O O O
a O O O O
pathogenicity O O O O
island O O O O
of O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fetus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
subsp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
venerealis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Complementation O O O O
of O O O O
these O O O O
phenotypes O O O O
from O O O O
expression O O O O
constructions O O O O
based O O O O
on O O O O
the O O O O
promoter O O O O
of O O O O
the O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fetus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
surface O O O O
antigen O O O O
protein O O O O
( O O O O
sap O O O O
) O O O O
locus O O O O
was O O O O
temperature O O O O
dependent O O O O
, O O O O
and O O O O
a O O O O
temperature O O O O
regulation O O O O
of O O O O
the O O O O
sap O O O O
promoter O O O O
was O O O O
subsequently O O O O
confirmed O O O O
under O O O O
laboratory O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
Gene O O O O
transfer O O O O
was O O O O
sensitive O O O O
to O O O O
surface O O O O
or O O O O
entry O O O O
exclusion O O O O
functions O O O O
in O O O O
potential O O O O
recipient O O O O
cells O O O O
carrying O O O O
IncPalpha O O O O
plasmid O O O O
RP4 O O O O
implying O O O O
functional O O O O
relatedness O O O O
to O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fetus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
proteins O O O O
. O O O O
    
The O O O O
virB O O O O
/ O O O O
virD4 O O O O
locus O O O O
is O O O O
also O O O O
known O O O O
to O O O O
be O O O O
involved O O O O
in O O O O
bacterial O O O O
invasion O O O O
and O O O O
killing O O O O
of O O O O
cultured O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cells O O O O
in O O O O
vitro O O O O
. O O O O
    
Whether O O O O
specifically O O O O
secreted O O O O
effector O O O O
proteins O O O O
contribute O O O O
to O O O O
host O O O O
colonization O O O O
and O O O O
infection O O O O
activities O O O O
is O O O O
currently O O O O
unknown O O O O
. O O O O
    
Two O O O O
putative O O O O
effector O O O O
proteins O O O O
carrying O O O O
an O O O O
FIC O O O O
domain O O O O
conserved O O O O
in O O O O
a O O O O
few O O O O
bacterial O O O O
type O O O O
III O O O O
and O O O O
type O O O O
IV O O O O
secreted O O O O
proteins O O O O
of O O O O
pathogens O O O O
were O O O O
analyzed O O O O
for O O O O
secretion O O O O
by O O O O
the O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fetus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
or O O O O
heterologous O O O O
conjugative O O O O
systems O O O O
. O O O O
    
No O O O O
evidence O O O O
for O O O O
interbacterial O O O O
translocation O O O O
of O O O O
the O O O O
Fic O O O O
proteins O O O O
was O O O O
found O O O O
. O O O O
    
Canopy O O O O
connectivity O O O O
and O O O O
the O O O O
availability O O O O
of O O O O
diverse O O O O
nesting O O O O
resources O O O O
affect O O O O
species O O O O
coexistence O O O O
in O O O O
arboreal O O O O
ants O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Arboreal O O O O
ants O O O O
are O O O O
both O O O O
diverse O O O O
and O O O O
ecologically O O O O
dominant O O O O
in O O O O
the O O O O
tropics O O O O
. O O O O
    
Such O O O O
ecologically O O O O
important O O O O
groups O O O O
are O O O O
likely O O O O
to O O O O
be O O O O
particularly O O O O
useful O O O O
in O O O O
ongoing O O O O
empirical O O O O
efforts O O O O
to O O O O
understand O O O O
the O O O O
processes O O O O
that O O O O
regulate O O O O
species O O O O
diversity O O O O
and O O O O
coexistence O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
study O O O O
addresses O O O O
how O O O O
access O O O O
to O O O O
tree O O O O
- O O O O
based O O O O
resources O O O O
and O O O O
the O O O O
diversity O O O O
of O O O O
pre O O O O
- O O O O
existing O O O O
nesting O O O O
cavities O O O O
affect O O O O
species O O O O
diversity O O O O
and O O O O
coexistence O O O O
in O O O O
tropical O O O O
arboreal O O O O
ant O O O O
assemblages O O O O
. O O O O
    
We O O O O
focus O O O O
on O O O O
assemblage O O O O
- O O O O
level O O O O
responses O O O O
to O O O O
these O O O O
variables O O O O
at O O O O
local O O O O
scales O O O O
. O O O O
    
We O O O O
first O O O O
surveyed O O O O
arboreal O O O O
ant O O O O
diversity O O O O
across O O O O
three O O O O
naturally O O O O
occurring O O O O
levels O O O O
of O O O O
canopy O O O O
connectivity O O O O
and O O O O
a O O O O
gradient O O O O
of O O O O
tree O O O O
size O O O O
. O O O O
    
We O O O O
then O O O O
conducted O O O O
whole O O O O
- O O O O
tree O O O O
experimental O O O O
manipulations O O O O
of O O O O
canopy O O O O
connectivity O O O O
and O O O O
the O O O O
diversity O O O O
of O O O O
cavity O O O O
entrance O O O O
sizes O O O O
. O O O O
    
All O O O O
work O O O O
was O O O O
conducted O O O O
in O O O O
the O O O O
Brazilian O O O O
savanna O O O O
or O O O O
' O O O O
cerrado O O O O
' O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
survey O O O O
suggested O O O O
that O O O O
species O O O O
richness O O O O
was O O O O
equivalent O O O O
among O O O O
levels O O O O
of O O O O
connectivity O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
there O O O O
was O O O O
a O O O O
consistent O O O O
trend O O O O
of O O O O
lower O O O O
species O O O O
density O O O O
with O O O O
low O O O O
canopy O O O O
connectivity O O O O
. O O O O
    
This O O O O
was O O O O
confirmed O O O O
at O O O O
the O O O O
scale O O O O
of O O O O
individual O O O O
trees O O O O
, O O O O
with O O O O
low O O O O
- O O O O
connectivity O O O O
trees O O O O
having O O O O
significantly O O O O
fewer O O O O
species O O O O
across O O O O
all O O O O
tree O O O O
sizes O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
experiment O O O O
demonstrated O O O O
directly O O O O
that O O O O
low O O O O
canopy O O O O
connectivity O O O O
results O O O O
in O O O O
significantly O O O O
fewer O O O O
species O O O O
coexisting O O O O
per O O O O
tree O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
A O O O O
diverse O O O O
array O O O O
of O O O O
cavity O O O O
entrance O O O O
sizes O O O O
did O O O O
not O O O O
significantly O O O O
increase O O O O
overall O O O O
species O O O O
per O O O O
tree O O O O
. O O O O
    
Nevertheless O O O O
, O O O O
cavity O O O O
diversity O O O O
did O O O O
significantly O O O O
increase O O O O
the O O O O
species O O O O
using O O O O
new O O O O
cavities O O O O
on O O O O
each O O O O
tree O O O O
, O O O O
the O O O O
species O O O O
per O O O O
tree O O O O
unique O O O O
to O O O O
new O O O O
cavities O O O O
, O O O O
total O O O O
species O O O O
using O O O O
new O O O O
cavities O O O O
, O O O O
and O O O O
total O O O O
cavity O O O O
use O O O O
. O O O O
    
The O O O O
populations O O O O
of O O O O
occupied O O O O
cavities O O O O
were O O O O
consistent O O O O
with O O O O
newly O O O O
founded O O O O
colonies O O O O
and O O O O
new O O O O
nests O O O O
of O O O O
established O O O O
colonies O O O O
from O O O O
other O O O O
trees O O O O
. O O O O
    
Cavity O O O O
diversity O O O O
thus O O O O
appears O O O O
to O O O O
greatly O O O O
affect O O O O
new O O O O
colony O O O O
founding O O O O
and O O O O
colony O O O O
growth O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
contribute O O O O
strong O O O O
evidence O O O O
that O O O O
greater O O O O
resource O O O O
access O O O O
and O O O O
greater O O O O
cavity O O O O
diversity O O O O
have O O O O
positive O O O O
effects O O O O
on O O O O
species O O O O
coexistence O O O O
in O O O O
local O O O O
arboreal O O O O
ant O O O O
assemblages O O O O
. O O O O
    
More O O O O
generally O O O O
, O O O O
these O O O O
positive O O O O
effects O O O O
are O O O O
broadly O O O O
consistent O O O O
with O O O O
niche O O O O
differentiation O O O O
promoting O O O O
local O O O O
species O O O O
coexistence O O O O
in O O O O
diverse O O O O
arboreal O O O O
ant O O O O
assemblages O O O O
. O O O O
    
The O O O O
contributions O O O O
of O O O O
this O O O O
study O O O O
to O O O O
the O O O O
understanding O O O O
of O O O O
the O O O O
processes O O O O
of O O O O
species O O O O
coexistence O O O O
are O O O O
discussed O O O O
, O O O O
along O O O O
with O O O O
the O O O O
potential O O O O
of O O O O
the O O O O
focal O O O O
system O O O O
for O O O O
future O O O O
work O O O O
on O O O O
this O O O O
issue O O O O
. O O O O
    
Ontogeny O O O O
and O O O O
leaf O O O O
gas O O O O
exchange O O O O
mediate O O O O
the O O O O
carbon O O O O
isotopic O O O O
signature O O O O
of O O O O
herbaceous O O O O
plants O O O O
. O O O O
    
Values O O O O
( O O O O
Delta O O O O
( O O O O
i O O O O
) O O O O
) O O O O
predicted O O O O
by O O O O
a O O O O
simplified O O O O
photosynthetic O O O O
discrimination O O O O
model O O O O
, O O O O
based O O O O
only O O O O
on O O O O
diffusion O O O O
through O O O O
air O O O O
followed O O O O
by O O O O
carboxylation O O O O
, O O O O
are O O O O
often O O O O
used O O O O
to O O O O
infer O O O O
ecological O O O O
conditions O O O O
from O O O O
the O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
3C O O O O
signature O O O O
of O O O O
plant O O O O
organs O O O O
( O O O O
delta O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
3C O O O O
( O O O O
p O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Recent O O O O
studies O O O O
showed O O O O
that O O O O
additional O O O O
isotope O O O O
discrimination O O O O
( O O O O
d O O O O
that O O O O
includes O O O O
mesophyll O O O O
conductance O O O O
, O O O O
photorespiration O O O O
and O O O O
day O O O O
respiration O O O O
, O O O O
and O O O O
post O O O O
- O O O O
carboxylation O O O O
discrimination O O O O
) O O O O
can O O O O
strongly O O O O
affect O O O O
delta O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
3C O O O O
( O O O O
p O O O O
) O O O O
; O O O O
however O O O O
, O O O O
little O O O O
is O O O O
known O O O O
about O O O O
its O O O O
variability O O O O
during O O O O
plant O O O O
ontogeny O O O O
for O O O O
different O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Effect O O O O
of O O O O
ontogeny O O O O
on O O O O
leaf O O O O
gas O O O O
exchange O O O O
rates O O O O
, O O O O
Delta O O O O
( O O O O
i O O O O
) O O O O
, O O O O
observed O O O O
discrimination O O O O
( O O O O
Delta O O O O
( O O O O
p O O O O
) O O O O
) O O O O
and O O O O
d O O O O
in O O O O
leaf O O O O
, O O O O
phloem O O O O
and O O O O
root O O O O
of O O O O
seven O O O O
herbaceous O O O O
species O O O O
at O O O O
three O O O O
ontogenetic O O O O
stages O O O O
were O O O O
investigated O O O O
under O O O O
controlled O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
Functional O O O O
group O O O O
identity O O O O
and O O O O
ontogeny O O O O
significantly O O O O
affected O O O O
Delta O O O O
( O O O O
i O O O O
) O O O O
and O O O O
Delta O O O O
( O O O O
p O O O O
) O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
predicted O O O O
Delta O O O O
( O O O O
i O O O O
) O O O O
did O O O O
not O O O O
match O O O O
Delta O O O O
( O O O O
p O O O O
) O O O O
. O O O O
    
d O O O O
, O O O O
strongly O O O O
affected O O O O
by O O O O
functional O O O O
group O O O O
identity O O O O
and O O O O
ontogeny O O O O
, O O O O
varied O O O O
by O O O O
up O O O O
to O O O O
14 O O O O
% O O O O
. O O O O
    
d O O O O
scaled O O O O
tightly O O O O
with O O O O
stomatal O O O O
conductance O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
complex O O O O
controls O O O O
including O O O O
changes O O O O
in O O O O
mesophyll O O O O
conductance O O O O
. O O O O
    
The O O O O
magnitude O O O O
of O O O O
the O O O O
changes O O O O
in O O O O
delta O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
3C O O O O
( O O O O
p O O O O
) O O O O
due O O O O
to O O O O
ontogeny O O O O
was O O O O
similar O O O O
to O O O O
that O O O O
due O O O O
to O O O O
environmental O O O O
factors O O O O
reported O O O O
in O O O O
other O O O O
studies O O O O
. O O O O
    
d O O O O
and O O O O
ontogeny O O O O
should O O O O
, O O O O
therefore O O O O
, O O O O
be O O O O
considered O O O O
in O O O O
ecosystem O O O O
studies O O O O
, O O O O
integrated O O O O
in O O O O
ecosystem O O O O
models O O O O
using O O O O
delta O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
3C O O O O
( O O O O
p O O O O
) O O O O
and O O O O
limit O O O O
the O O O O
applicability O O O O
of O O O O
delta O O O O
^ O O O O
1 O O O O
^ O O O O
3C O O O O
( O O O O
leaf O O O O
) O O O O
as O O O O
a O O O O
proxy O O O O
for O O O O
water O O O O
- O O O O
use O O O O
efficiency O O O O
in O O O O
herbaceous O O O O
plants O O O O
. O O O O
    
The O O O O
pH O O O O
regulatory O O O O
factor O O O O
Pac1 O O O O
regulates O O O O
Tri O O O O
gene O O O O
expression O O O O
and O O O O
trichothecene O O O O
production O O O O
in O O O O
Fusarium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
graminearum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Fungi O O O O
manage O O O O
the O O O O
adaptation O O O O
to O O O O
extra O O O O
- O O O O
cellular O O O O
pH O O O O
through O O O O
the O O O O
PacC O O O O
transcription O O O O
factor O O O O
, O O O O
a O O O O
key O O O O
component O O O O
of O O O O
the O O O O
pH O O O O
regulatory O O O O
system O O O O
. O O O O
    
PacC O O O O
regulates O O O O
the O O O O
production O O O O
of O O O O
various O O O O
secondary O O O O
metabolites O O O O
in O O O O
filamentous O O O O
fungi O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
important O O O O
cereal O O O O
pathogen O O O O
Fusarium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
graminearum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
the O O O O
production O O O O
of O O O O
trichothecene O O O O
is O O O O
induced O O O O
only O O O O
under O O O O
acidic O O O O
pH O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
examined O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
the O O O O
PacC O O O O
homologue O O O O
from O O O O
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
graminearum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
FgPac1 O O O O
, O O O O
on O O O O
the O O O O
regulation O O O O
of O O O O
trichothecene O O O O
production O O O O
. O O O O
    
An O O O O
FgDeltaPac1 O O O O
deletion O O O O
mutant O O O O
was O O O O
constructed O O O O
in O O O O
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
graminearum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
which O O O O
showed O O O O
a O O O O
reduced O O O O
development O O O O
under O O O O
neutral O O O O
and O O O O
alkaline O O O O
pH O O O O
, O O O O
increased O O O O
sensitivity O O O O
to O O O O
H O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
O O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
and O O O O
an O O O O
earlier O O O O
Tri O O O O
gene O O O O
induction O O O O
and O O O O
toxin O O O O
accumulation O O O O
at O O O O
acidic O O O O
pH O O O O
. O O O O
    
A O O O O
strain O O O O
expressing O O O O
the O O O O
FgPac1 O O O O
( O O O O
c O O O O
) O O O O
constitutively O O O O
active O O O O
form O O O O
of O O O O
Pac1 O O O O
exhibited O O O O
a O O O O
strongly O O O O
repressed O O O O
Tri O O O O
gene O O O O
expression O O O O
and O O O O
reduced O O O O
toxin O O O O
accumulation O O O O
at O O O O
acidic O O O O
pH O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
Pac1 O O O O
negatively O O O O
regulates O O O O
Tri O O O O
gene O O O O
expression O O O O
and O O O O
toxin O O O O
production O O O O
in O O O O
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
graminearum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Tracking O O O O
a O O O O
century O O O O
of O O O O
global O O O O
expansion O O O O
and O O O O
evolution O O O O
of O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
to O O O O
drive O O O O
understanding O O O O
and O O O O
to O O O O
combat O O O O
disease O O O O
. O O O O
    
Since O O O O
the O O O O
isolation O O O O
of O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
multiple O O O O
transmissions O O O O
are O O O O
thought O O O O
to O O O O
have O O O O
occurred O O O O
between O O O O
man O O O O
and O O O O
other O O O O
old O O O O
- O O O O
world O O O O
primates O O O O
. O O O O
    
Assessment O O O O
of O O O O
samples O O O O
from O O O O
apes O O O O
and O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
beings O O O O
with O O O O
African O O O O
equatorial O O O O
forest O O O O
ancestry O O O O
has O O O O
traced O O O O
the O O O O
origin O O O O
of O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
to O O O O
chimpanzees B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
and O O O O
dated O O O O
its O O O O
most O O O O
recent O O O O
common O O O O
ancestor O O O O
to O O O O
1908 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
evolution O O O O
of O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
has O O O O
been O O O O
rapid O O O O
, O O O O
which O O O O
has O O O O
resulted O O O O
in O O O O
a O O O O
complex O O O O
classification O O O O
, O O O O
worldwide O O O O
spread O O O O
, O O O O
and O O O O
intermixing O O O O
of O O O O
strains O O O O
; O O O O
at O O O O
least O O O O
48 O O O O
circulating O O O O
recombinant O O O O
forms O O O O
are O O O O
currently O O O O
identified O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
to O O O O
posing O O O O
a O O O O
nearly O O O O
insurmountable O O O O
challenge O O O O
for O O O O
diagnosis O O O O
, O O O O
treatment O O O O
, O O O O
vaccine O O O O
development O O O O
, O O O O
and O O O O
prevention O O O O
, O O O O
this O O O O
extreme O O O O
and O O O O
divergent O O O O
evolution O O O O
has O O O O
led O O O O
to O O O O
differences O O O O
in O O O O
virulence O O O O
between O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
groups O O O O
, O O O O
subtypes O O O O
, O O O O
or O O O O
both O O O O
. O O O O
    
Coincidental O O O O
changes O O O O
in O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
migration O O O O
in O O O O
the O O O O
Congo O O O O
river O O O O
basin O O O O
also O O O O
affected O O O O
spread O O O O
of O O O O
disease O O O O
. O O O O
    
Research O O O O
over O O O O
the O O O O
past O O O O
25 O O O O
years O O O O
and O O O O
advances O O O O
in O O O O
genomic O O O O
sequencing O O O O
methods O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
deep O O O O
DNA O O O O
sequencing O O O O
, O O O O
have O O O O
greatly O O O O
improved O O O O
understanding O O O O
and O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
thousands O O O O
to O O O O
millions O O O O
of O O O O
full O O O O
infectious O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
genomes O O O O
. O O O O
    
A O O O O
caffeyl O O O O
- O O O O
coenzyme O O O O
A O O O O
synthetase O O O O
initiates O O O O
caffeate O O O O
activation O O O O
prior O O O O
to O O O O
caffeate O O O O
reduction O O O O
in O O O O
the O O O O
acetogenic O O O O
bacterium O O O O
Acetobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
woodii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
anaerobic O O O O
acetogenic O O O O
bacterium O O O O
Acetobacterium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
woodii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
couples O O O O
the O O O O
reduction O O O O
of O O O O
caffeate O O O O
with O O O O
electrons O O O O
derived O O O O
from O O O O
hydrogen O O O O
to O O O O
the O O O O
synthesis O O O O
of O O O O
ATP O O O O
by O O O O
a O O O O
chemiosmotic O O O O
mechanism O O O O
using O O O O
sodium O O O O
ions O O O O
as O O O O
coupling O O O O
ions O O O O
, O O O O
but O O O O
the O O O O
enzymes O O O O
involved O O O O
remain O O O O
to O O O O
be O O O O
established O O O O
. O O O O
    
Previously O O O O
, O O O O
the O O O O
electron O O O O
transfer O O O O
flavoproteins O O O O
EtfA O O O O
and O O O O
EtfB O O O O
were O O O O
found O O O O
to O O O O
be O O O O
involved O O O O
in O O O O
caffeate O O O O
respiration O O O O
. O O O O
    
By O O O O
inverse O O O O
PCR O O O O
, O O O O
we O O O O
identified O O O O
three O O O O
genes O O O O
upstream O O O O
of O O O O
etfA O O O O
and O O O O
etfB O O O O
: O O O O
carA O O O O
, O O O O
carB O O O O
, O O O O
and O O O O
carC O O O O
. O O O O
    
carA O O O O
encodes O O O O
a O O O O
potential O O O O
coenzyme O O O O
A O O O O
( O O O O
CoA O O O O
) O O O O
transferase O O O O
, O O O O
carB O O O O
an O O O O
acyl O O O O
- O O O O
CoA O O O O
synthetase O O O O
, O O O O
and O O O O
carC O O O O
an O O O O
acyl O O O O
- O O O O
CoA O O O O
dehydrogenase O O O O
. O O O O
    
carA O O O O
, O O O O
- O O O O
B O O O O
, O O O O
and O O O O
- O O O O
C O O O O
are O O O O
located O O O O
together O O O O
with O O O O
etfA O O O O
/ O O O O
carE O O O O
and O O O O
etfB O O O O
/ O O O O
carD O O O O
on O O O O
one O O O O
polycistronic O O O O
message O O O O
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
CarA O O O O
, O O O O
CarB O O O O
, O O O O
and O O O O
CarC O O O O
are O O O O
also O O O O
part O O O O
of O O O O
the O O O O
caffeate O O O O
respiration O O O O
pathway O O O O
. O O O O
    
The O O O O
genetic O O O O
data O O O O
suggest O O O O
an O O O O
initial O O O O
ATP O O O O
- O O O O
dependent O O O O
activation O O O O
of O O O O
caffeate O O O O
by O O O O
CarB O O O O
. O O O O
    
To O O O O
prove O O O O
the O O O O
proposed O O O O
function O O O O
of O O O O
CarB O O O O
, O O O O
the O O O O
protein O O O O
was O O O O
overproduced O O O O
in O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
the O O O O
recombinant O O O O
protein O O O O
was O O O O
purified O O O O
. O O O O
    
Purified O O O O
CarB O O O O
activates O O O O
caffeate O O O O
to O O O O
caffeyl O O O O
- O O O O
CoA O O O O
in O O O O
an O O O O
ATP O O O O
- O O O O
and O O O O
CoA O O O O
- O O O O
dependent O O O O
reaction O O O O
. O O O O
    
The O O O O
enzyme O O O O
has O O O O
broad O O O O
pH O O O O
and O O O O
temperature O O O O
optima O O O O
and O O O O
requires O O O O
K O O O O
( O O O O
+ O O O O
) O O O O
for O O O O
activity O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
to O O O O
caffeate O O O O
, O O O O
it O O O O
can O O O O
use O O O O
p O O O O
- O O O O
coumarate O O O O
, O O O O
ferulate O O O O
, O O O O
and O O O O
cinnamate O O O O
as O O O O
substrates O O O O
, O O O O
with O O O O
50 O O O O
, O O O O
15 O O O O
, O O O O
and O O O O
9 O O O O
% O O O O
, O O O O
respectively O O O O
, O O O O
of O O O O
the O O O O
activity O O O O
obtained O O O O
with O O O O
caffeate O O O O
. O O O O
    
Expression O O O O
of O O O O
the O O O O
car O O O O
operon O O O O
is O O O O
induced O O O O
not O O O O
only O O O O
by O O O O
caffeate O O O O
, O O O O
p O O O O
- O O O O
coumarate O O O O
, O O O O
ferulate O O O O
, O O O O
and O O O O
cinnamate O O O O
but O O O O
also O O O O
by O O O O
sinapate O O O O
. O O O O
    
There O O O O
is O O O O
no O O O O
induction O O O O
by O O O O
p O O O O
- O O O O
hydroxybenzoate O O O O
or O O O O
syringate O O O O
. O O O O
    
Complete O O O O
genome O O O O
sequence O O O O
of O O O O
Burkholderia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
rhizoxinica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
an O O O O
Endosymbiont O O O O
of O O O O
Rhizopus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
microsporus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Burkholderia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
rhizoxinica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
an O O O O
intracellular O O O O
symbiont O O O O
of O O O O
the O O O O
phytopathogenic O O O O
fungus O O O O
Rhizopus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
microsporus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
vertically O O O O
transmitted O O O O
endosymbiont O O O O
not O O O O
only O O O O
delivers O O O O
the O O O O
antimitotic O O O O
macrolide O O O O
rhizoxin O O O O
to O O O O
its O O O O
host O O O O
but O O O O
is O O O O
also O O O O
essential O O O O
for O O O O
vegetative O O O O
spore O O O O
formation O O O O
of O O O O
the O O O O
fungus O O O O
. O O O O
    
To O O O O
shed O O O O
light O O O O
on O O O O
the O O O O
genetic O O O O
equipment O O O O
of O O O O
this O O O O
model O O O O
organism O O O O
, O O O O
we O O O O
sequenced O O O O
the O O O O
whole O O O O
genome O O O O
of O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
rhizoxinica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
HKI O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
0454 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
thus O O O O
providing O O O O
the O O O O
first O O O O
genomic O O O O
insight O O O O
into O O O O
an O O O O
intracellular O O O O
mutualist O O O O
of O O O O
a O O O O
fungal O O O O
species O O O O
. O O O O
    
The O O O O
3 O O O O
. O O O O
75 O O O O
- O O O O
Mb O O O O
genome O O O O
consists O O O O
of O O O O
a O O O O
chromosome O O O O
and O O O O
two O O O O
strain O O O O
- O O O O
specific O O O O
plasmids O O O O
. O O O O
    
The O O O O
primary O O O O
metabolism O O O O
appears O O O O
to O O O O
be O O O O
specialized O O O O
for O O O O
the O O O O
uptake O O O O
of O O O O
fungal O O O O
metabolites O O O O
. O O O O
    
Besides O O O O
the O O O O
rhizoxin O O O O
biosynthesis O O O O
gene O O O O
cluster O O O O
, O O O O
there O O O O
are O O O O
14 O O O O
loci O O O O
coding O O O O
for O O O O
nonribosomal O O O O
peptide O O O O
synthetase O O O O
( O O O O
NRPS O O O O
) O O O O
assembly O O O O
lines O O O O
, O O O O
which O O O O
represent O O O O
novel O O O O
targets O O O O
for O O O O
genomic O O O O
mining O O O O
of O O O O
cryptic O O O O
natural O O O O
products O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
the O O O O
endosymbionts O O O O
are O O O O
equipped O O O O
with O O O O
a O O O O
repertoire O O O O
of O O O O
virulence O O O O
- O O O O
related O O O O
factors O O O O
, O O O O
which O O O O
can O O O O
now O O O O
be O O O O
studied O O O O
to O O O O
elucidate O O O O
molecular O O O O
mechanisms O O O O
underlying O O O O
bacterial O O O O
- O O O O
fungal O O O O
interaction O O O O
. O O O O
    
Network O O O O
topology O O O O
: O O O O
patterns O O O O
and O O O O
mechanisms O O O O
in O O O O
plant O O O O
- O O O O
herbivore O O O O
and O O O O
host O O O O
- O O O O
parasitoid O O O O
food O O O O
webs O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Biological O O O O
communities O O O O
are O O O O
organized O O O O
in O O O O
complex O O O O
interaction O O O O
networks O O O O
such O O O O
as O O O O
food O O O O
webs O O O O
, O O O O
which O O O O
topology O O O O
appears O O O O
to O O O O
be O O O O
non O O O O
- O O O O
random O O O O
. O O O O
    
Gradients O O O O
, O O O O
compartments O O O O
, O O O O
nested O O O O
subsets O O O O
and O O O O
even O O O O
combinations O O O O
of O O O O
these O O O O
structures O O O O
have O O O O
been O O O O
shown O O O O
in O O O O
bipartite O O O O
networks O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
in O O O O
most O O O O
studies O O O O
only O O O O
one O O O O
pattern O O O O
is O O O O
tested O O O O
against O O O O
randomness O O O O
and O O O O
mechanistic O O O O
hypotheses O O O O
are O O O O
generally O O O O
lacking O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
examined O O O O
the O O O O
topology O O O O
of O O O O
regional O O O O
, O O O O
coexisting O O O O
plant O O O O
- O O O O
herbivore O O O O
and O O O O
host O O O O
- O O O O
parasitoid O O O O
food O O O O
webs O O O O
to O O O O
discriminate O O O O
between O O O O
the O O O O
mentioned O O O O
network O O O O
patterns O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
evaluated O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
species O O O O
body O O O O
size O O O O
, O O O O
local O O O O
abundance O O O O
, O O O O
regional O O O O
frequency O O O O
and O O O O
phylogeny O O O O
as O O O O
determinants O O O O
of O O O O
network O O O O
topology O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
both O O O O
food O O O O
webs O O O O
to O O O O
be O O O O
compartmented O O O O
, O O O O
with O O O O
interaction O O O O
range O O O O
boundaries O O O O
imposed O O O O
by O O O O
host O O O O
phylogeny O O O O
. O O O O
    
Species O O O O
degree O O O O
within O O O O
compartments O O O O
was O O O O
mostly O O O O
related O O O O
to O O O O
their O O O O
regional O O O O
frequency O O O O
and O O O O
local O O O O
abundance O O O O
. O O O O
    
Only O O O O
one O O O O
compartment O O O O
showed O O O O
an O O O O
internal O O O O
nested O O O O
structure O O O O
in O O O O
the O O O O
distribution O O O O
of O O O O
interactions O O O O
between O O O O
species O O O O
, O O O O
but O O O O
species O O O O
position O O O O
within O O O O
this O O O O
compartment O O O O
was O O O O
unrelated O O O O
to O O O O
species O O O O
size O O O O
or O O O O
abundance O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
compartmentalization O O O O
may O O O O
be O O O O
more O O O O
common O O O O
than O O O O
previously O O O O
considered O O O O
, O O O O
and O O O O
that O O O O
network O O O O
structure O O O O
is O O O O
a O O O O
result O O O O
of O O O O
multiple O O O O
, O O O O
hierarchical O O O O
, O O O O
non O O O O
- O O O O
exclusive O O O O
processes O O O O
. O O O O
    
Gel O O O O
- O O O O
based O O O O
mass O O O O
spectrometric O O O O
and O O O O
computational O O O O
approaches O O O O
to O O O O
the O O O O
mitochondrial O O O O
proteome O O O O
of O O O O
Neurospora O O O O
. O O O O
    
We O O O O
have O O O O
used O O O O
gel O O O O
electrophoretic O O O O
techniques O O O O
including O O O O
isoelectric O O O O
focusing O O O O
, O O O O
blue O O O O
native O O O O
, O O O O
acid O O O O
- O O O O
urea O O O O
, O O O O
16 O O O O
- O O O O
benzyldimethyl O O O O
- O O O O
n O O O O
- O O O O
hexadecylammonium O O O O
chloride O O O O
or O O O O
SDS O O O O
first O O O O
dimensions O O O O
and O O O O
SDS O O O O
Laemmli O O O O
or O O O O
tricine O O O O
second O O O O
dimensions O O O O
to O O O O
separate O O O O
the O O O O
proteins O O O O
from O O O O
highly O O O O
- O O O O
purified O O O O
Neurospora O O O O
mitochondria O O O O
and O O O O
sub O O O O
- O O O O
mitochondrial O O O O
fractions O O O O
( O O O O
membrane O O O O
, O O O O
soluble O O O O
, O O O O
protein O O O O
complexes O O O O
and O O O O
ribonucleoproteins O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
products O O O O
of O O O O
260 O O O O
genes O O O O
, O O O O
many O O O O
of O O O O
them O O O O
in O O O O
multiple O O O O
processed O O O O
or O O O O
modified O O O O
forms O O O O
, O O O O
were O O O O
identified O O O O
by O O O O
MALDI O O O O
- O O O O
TOF O O O O
mass O O O O
spectrometry O O O O
. O O O O
    
This O O O O
work O O O O
confirms O O O O
the O O O O
existence O O O O
, O O O O
expression O O O O
, O O O O
and O O O O
mitochondrial O O O O
localization O O O O
of O O O O
the O O O O
products O O O O
of O O O O
55 O O O O
Neurospora O O O O
genes O O O O
previously O O O O
annotated O O O O
only O O O O
as O O O O
predicted O O O O
or O O O O
hypothetical O O O O
, O O O O
and O O O O
of O O O O
101 O O O O
genes O O O O
not O O O O
identified O O O O
in O O O O
previous O O O O
mass O O O O
spectrometry O O O O
studies O O O O
. O O O O
    
Combined O O O O
with O O O O
previous O O O O
mass O O O O
spectrometry O O O O
studies O O O O
, O O O O
and O O O O
re O O O O
- O O O O
evaluation O O O O
of O O O O
genome O O O O
annotations O O O O
, O O O O
we O O O O
have O O O O
compiled O O O O
a O O O O
curated O O O O
list O O O O
of O O O O
358 O O O O
proteins O O O O
identified O O O O
in O O O O
proteomic O O O O
studies O O O O
that O O O O
are O O O O
likely O O O O
to O O O O
be O O O O
bona O O O O
fide O O O O
mitochondrial O O O O
proteins O O O O
plus O O O O
80 O O O O
other O O O O
identified O O O O
proteins O O O O
that O O O O
may O O O O
be O O O O
mitochondrial O O O O
. O O O O
    
Literature O O O O
data O O O O
mining O O O O
and O O O O
computational O O O O
predictions O O O O
suggest O O O O
that O O O O
Neurospora O O O O
mitochondria O O O O
also O O O O
contain O O O O
another O O O O
299 O O O O
proteins O O O O
not O O O O
yet O O O O
identified O O O O
in O O O O
proteomics O O O O
projects O O O O
. O O O O
    
Taken O O O O
together O O O O
, O O O O
these O O O O
data O O O O
suggest O O O O
that O O O O
the O O O O
products O O O O
of O O O O
at O O O O
least O O O O
738 O O O O
genes O O O O
comprise O O O O
the O O O O
Neurospora O O O O
mitochondrial O O O O
proteome O O O O
. O O O O
    
Sequenced O O O O
dermatophyte O O O O
strains O O O O
: O O O O
growth O O O O
rate O O O O
, O O O O
conidiation O O O O
, O O O O
drug O O O O
susceptibilities O O O O
, O O O O
and O O O O
virulence O O O O
in O O O O
an O O O O
invertebrate O O O O
model O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
dermatophytes O O O O
are O O O O
the O O O O
most O O O O
common O O O O
cause O O O O
of O O O O
fungal O O O O
infections O O O O
in O O O O
the O O O O
world O O O O
, O O O O
their O O O O
basic O O O O
biology O O O O
is O O O O
not O O O O
well O O O O
understood O O O O
. O O O O
    
The O O O O
recent O O O O
sequencing O O O O
and O O O O
annotation O O O O
of O O O O
the O O O O
genomes O O O O
of O O O O
five O O O O
representative O O O O
dermatophyte O O O O
species O O O O
allows O O O O
for O O O O
the O O O O
creation O O O O
of O O O O
hypotheses O O O O
as O O O O
to O O O O
how O O O O
they O O O O
cause O O O O
disease O O O O
and O O O O
have O O O O
adapted O O O O
to O O O O
their O O O O
distinct O O O O
environments O O O O
. O O O O
    
An O O O O
understanding O O O O
of O O O O
the O O O O
microbiology O O O O
of O O O O
these O O O O
strains O O O O
will O O O O
be O O O O
essential O O O O
for O O O O
testing O O O O
these O O O O
hypotheses O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
is O O O O
the O O O O
first O O O O
to O O O O
generally O O O O
characterize O O O O
these O O O O
five O O O O
sequenced O O O O
strains O O O O
of O O O O
dermatophytes O O O O
for O O O O
their O O O O
microbiological O O O O
aspects O O O O
. O O O O
    
We O O O O
measured O O O O
the O O O O
growth O O O O
rate O O O O
on O O O O
solid O O O O
medium O O O O
and O O O O
found O O O O
differences O O O O
between O O O O
species O O O O
, O O O O
with O O O O
Microsporum B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
gypseum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
CBS118893 O O O O
having O O O O
the O O O O
fastest O O O O
growth O O O O
and O O O O
Trichophyton B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
rubrum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
CBS118892 O O O O
the O O O O
slowest O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
compared O O O O
different O O O O
media O O O O
for O O O O
conidia O O O O
production O O O O
and O O O O
found O O O O
that O O O O
the O O O O
highest O O O O
numbers O O O O
of O O O O
conidia O O O O
were O O O O
produced O O O O
when O O O O
dermatophytes O O O O
were O O O O
grown O O O O
on O O O O
MAT O O O O
agar O O O O
. O O O O
    
We O O O O
determined O O O O
the O O O O
Minimum O O O O
Inhibitory O O O O
Concentration O O O O
( O O O O
MIC O O O O
) O O O O
of O O O O
nine O O O O
antifungal O O O O
agents O O O O
and O O O O
confirmed O O O O
susceptibility O O O O
to O O O O
antifungals O O O O
commonly O O O O
used O O O O
as O O O O
selectable O O O O
markers O O O O
. O O O O
    
Finally O O O O
, O O O O
we O O O O
tested O O O O
virulence O O O O
in O O O O
the O O O O
Galleria B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mellonella O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
wax B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
moth O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
larvae O O O O
model O O O O
but O O O O
found O O O O
the O O O O
results O O O O
variable O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
increase O O O O
our O O O O
understanding O O O O
of O O O O
the O O O O
microbiology O O O O
and O O O O
molecular O O O O
biology O O O O
of O O O O
these O O O O
dermatophyte O O O O
strains O O O O
and O O O O
will O O O O
be O O O O
of O O O O
use O O O O
in O O O O
advancing O O O O
hypothesis O O O O
- O O O O
driven O O O O
research O O O O
about O O O O
dermatophytes O O O O
. O O O O
    
Relating O O O O
the O O O O
physical O O O O
properties O O O O
of O O O O
Pseudomonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aeruginosa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
lipopolysaccharides O O O O
to O O O O
virulence O O O O
by O O O O
atomic O O O O
force O O O O
microscopy O O O O
. O O O O
    
Lipopolysaccharides O O O O
( O O O O
LPS O O O O
) O O O O
are O O O O
an O O O O
important O O O O
class O O O O
of O O O O
macromolecules O O O O
that O O O O
are O O O O
components O O O O
of O O O O
the O O O O
outer O O O O
membrane O O O O
of O O O O
Gram O O O O
- O O O O
negative O O O O
bacteria O O O O
such O O O O
as O O O O
Pseudomonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aeruginosa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
aeruginosa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
contains O O O O
two O O O O
different O O O O
sugar O O O O
chains O O O O
, O O O O
the O O O O
homopolymer O O O O
common O O O O
antigen O O O O
( O O O O
A O O O O
band O O O O
) O O O O
and O O O O
the O O O O
heteropolymer O O O O
O O O O O
antigen O O O O
( O O O O
B O O O O
band O O O O
) O O O O
, O O O O
which O O O O
impart O O O O
serospecificity O O O O
. O O O O
    
The O O O O
characteristics O O O O
of O O O O
LPS O O O O
are O O O O
generally O O O O
assessed O O O O
after O O O O
isolation O O O O
rather O O O O
than O O O O
in O O O O
the O O O O
context O O O O
of O O O O
whole O O O O
bacteria O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
used O O O O
atomic O O O O
force O O O O
microscopy O O O O
( O O O O
AFM O O O O
) O O O O
to O O O O
probe O O O O
the O O O O
physical O O O O
properties O O O O
of O O O O
the O O O O
LPS O O O O
of O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
aeruginosa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
PA103 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
serogroup O O O O
O11 O O O O
) O O O O
in O O O O
situ O O O O
. O O O O
    
This O O O O
strain O O O O
contains O O O O
a O O O O
mixture O O O O
of O O O O
long O O O O
and O O O O
very O O O O
long O O O O
polymers O O O O
of O O O O
O O O O O
antigen O O O O
, O O O O
regulated O O O O
by O O O O
two O O O O
different O O O O
genes O O O O
. O O O O
    
For O O O O
this O O O O
analysis O O O O
, O O O O
we O O O O
studied O O O O
the O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
strain O O O O
and O O O O
four O O O O
mutants O O O O
, O O O O
DeltaWzz1 O O O O
( O O O O
producing O O O O
only O O O O
very O O O O
long O O O O
LPS O O O O
) O O O O
, O O O O
DeltaWzz2 O O O O
( O O O O
producing O O O O
only O O O O
long O O O O
LPS O O O O
) O O O O
, O O O O
DDeltaM O O O O
( O O O O
with O O O O
both O O O O
the O O O O
wzz1 O O O O
and O O O O
wzz2 O O O O
genes O O O O
deleted O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
Wzy O O O O
: O O O O
: O O O O
GM O O O O
( O O O O
producing O O O O
an O O O O
LPS O O O O
core O O O O
oligosaccharide O O O O
plus O O O O
one O O O O
unit O O O O
of O O O O
O O O O O
antigen O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Forces O O O O
of O O O O
adhesion O O O O
between O O O O
the O O O O
LPS O O O O
on O O O O
these O O O O
strains O O O O
and O O O O
the O O O O
silicon O O O O
nitride O O O O
AFM O O O O
tip O O O O
were O O O O
measured O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
Alexander O O O O
and O O O O
de O O O O
Gennes O O O O
model O O O O
of O O O O
steric O O O O
repulsion O O O O
between O O O O
a O O O O
flat O O O O
surface O O O O
and O O O O
a O O O O
polymer O O O O
brush O O O O
was O O O O
used O O O O
to O O O O
calculate O O O O
the O O O O
LPS O O O O
layer O O O O
thickness O O O O
( O O O O
which O O O O
we O O O O
refer O O O O
to O O O O
as O O O O
length O O O O
) O O O O
, O O O O
compressibility O O O O
, O O O O
and O O O O
spacing O O O O
between O O O O
the O O O O
individual O O O O
molecules O O O O
. O O O O
    
LPS O O O O
chains O O O O
were O O O O
longest O O O O
for O O O O
the O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
strain O O O O
and O O O O
DeltaWzz1 O O O O
, O O O O
at O O O O
170 O O O O
. O O O O
6 O O O O
and O O O O
212 O O O O
. O O O O
4 O O O O
nm O O O O
, O O O O
respectively O O O O
, O O O O
and O O O O
these O O O O
values O O O O
were O O O O
not O O O O
statistically O O O O
significantly O O O O
different O O O O
from O O O O
one O O O O
another O O O O
. O O O O
    
Wzy O O O O
: O O O O
: O O O O
GM O O O O
and O O O O
DDeltaM O O O O
have O O O O
reduced O O O O
LPS O O O O
lengths O O O O
, O O O O
at O O O O
34 O O O O
. O O O O
6 O O O O
and O O O O
37 O O O O
. O O O O
7 O O O O
nm O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
Adhesion O O O O
forces O O O O
were O O O O
not O O O O
correlated O O O O
with O O O O
LPS O O O O
length O O O O
, O O O O
but O O O O
a O O O O
relationship O O O O
between O O O O
adhesion O O O O
force O O O O
and O O O O
bacterial O O O O
pathogenicity O O O O
was O O O O
found O O O O
in O O O O
a O O O O
mouse B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
acute O O O O
pneumonia O O O O
model O O O O
of O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
The O O O O
adhesion O O O O
forces O O O O
with O O O O
the O O O O
AFM O O O O
probe O O O O
were O O O O
lower O O O O
for O O O O
strains O O O O
with O O O O
LPS O O O O
mutations O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
the O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
strain O O O O
is O O O O
optimized O O O O
for O O O O
maximal O O O O
adhesion O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
research O O O O
contributes O O O O
to O O O O
further O O O O
understanding O O O O
of O O O O
the O O O O
role O O O O
of O O O O
LPS O O O O
in O O O O
the O O O O
adhesion O O O O
and O O O O
virulence O O O O
of O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
aeruginosa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
minor O O O O
pilin O O O O
subunit O O O O
Sgp2 O O O O
is O O O O
necessary O O O O
for O O O O
assembly O O O O
of O O O O
the O O O O
pilus O O O O
encoded O O O O
by O O O O
the O O O O
srtG O O O O
cluster O O O O
of O O O O
Streptococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
suis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Gram O O O O
- O O O O
positive O O O O
pili O O O O
are O O O O
composed O O O O
of O O O O
covalently O O O O
bound O O O O
pilin O O O O
subunits O O O O
whose O O O O
assembly O O O O
is O O O O
mediated O O O O
via O O O O
a O O O O
pilus O O O O
- O O O O
specific O O O O
sortase O O O O
( O O O O
s O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Major O O O O
subunits O O O O
constitute O O O O
the O O O O
pilus O O O O
backbone O O O O
and O O O O
are O O O O
therefore O O O O
essential O O O O
for O O O O
pilus O O O O
formation O O O O
. O O O O
    
Minor O O O O
subunits O O O O
are O O O O
also O O O O
incorporated O O O O
into O O O O
the O O O O
pilus O O O O
, O O O O
but O O O O
they O O O O
are O O O O
considered O O O O
to O O O O
be O O O O
dispensable O O O O
for O O O O
backbone O O O O
formation O O O O
. O O O O
    
The O O O O
srtG O O O O
cluster O O O O
is O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
putative O O O O
pilus O O O O
gene O O O O
clusters O O O O
identified O O O O
in O O O O
the O O O O
major O O O O
swine B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pathogen O O O O
Streptococcus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
suis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
It O O O O
consists O O O O
of O O O O
one O O O O
sortase O O O O
gene O O O O
( O O O O
srtG O O O O
) O O O O
and O O O O
two O O O O
putative O O O O
pilin O O O O
subunit O O O O
genes O O O O
( O O O O
sgp1 O O O O
and O O O O
sgp2 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
by O O O O
constructing O O O O
mutants O O O O
for O O O O
each O O O O
of O O O O
the O O O O
genes O O O O
in O O O O
the O O O O
cluster O O O O
and O O O O
by O O O O
both O O O O
immunoblotting O O O O
and O O O O
immunogold O O O O
electron O O O O
microscopic O O O O
analysis O O O O
with O O O O
antibodies O O O O
against O O O O
Sgp1 O O O O
and O O O O
Sgp2 O O O O
, O O O O
we O O O O
found O O O O
that O O O O
the O O O O
srtG O O O O
cluster O O O O
mediates O O O O
the O O O O
expression O O O O
of O O O O
pilus O O O O
- O O O O
like O O O O
structures O O O O
in O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
suis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strain O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
89 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
/ O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
1591 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
pilus O O O O
, O O O O
Sgp1 O O O O
forms O O O O
the O O O O
backbone O O O O
, O O O O
whereas O O O O
Sgp2 O O O O
is O O O O
incorporated O O O O
as O O O O
the O O O O
minor O O O O
subunit O O O O
. O O O O
    
In O O O O
accordance O O O O
with O O O O
the O O O O
current O O O O
model O O O O
of O O O O
pilus O O O O
assembly O O O O
by O O O O
Gram O O O O
- O O O O
positive O O O O
organisms O O O O
, O O O O
the O O O O
major O O O O
subunit O O O O
Sgp1 O O O O
was O O O O
indispensable O O O O
for O O O O
backbone O O O O
formation O O O O
and O O O O
the O O O O
cognate O O O O
sortase O O O O
SrtG O O O O
mediated O O O O
the O O O O
polymerization O O O O
of O O O O
both O O O O
subunits O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
unlike O O O O
other O O O O
well O O O O
- O O O O
characterized O O O O
Gram O O O O
- O O O O
positive O O O O
bacterial O O O O
pili O O O O
, O O O O
the O O O O
minor O O O O
subunit O O O O
Sgp2 O O O O
was O O O O
required O O O O
for O O O O
polymerization O O O O
of O O O O
the O O O O
major O O O O
subunit O O O O
Sgp1 O O O O
. O O O O
    
Because O O O O
Sgp2 O O O O
homologues O O O O
are O O O O
encoded O O O O
in O O O O
several O O O O
other O O O O
Gram O O O O
- O O O O
positive O O O O
bacterial O O O O
pilus O O O O
gene O O O O
clusters O O O O
, O O O O
in O O O O
some O O O O
types O O O O
of O O O O
pili O O O O
, O O O O
minor O O O O
pilin O O O O
subunits O O O O
may O O O O
contribute O O O O
to O O O O
backbone O O O O
formation O O O O
by O O O O
a O O O O
novel O O O O
mechanism O O O O
. O O O O
    
Growth O O O O
and O O O O
reproductive O O O O
costs O O O O
of O O O O
larval O O O O
defence O O O O
in O O O O
the O O O O
aposematic O O O O
lepidopteran O O O O
Pieris B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
brassicae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Utilization O O O O
of O O O O
plant O O O O
secondary O O O O
compounds O O O O
for O O O O
antipredator O O O O
defence O O O O
is O O O O
common O O O O
in O O O O
immature O O O O
herbivorous O O O O
insects O O O O
. O O O O
    
Such O O O O
defences O O O O
may O O O O
incur O O O O
a O O O O
cost O O O O
to O O O O
the O O O O
animal O O O O
, O O O O
either O O O O
in O O O O
terms O O O O
of O O O O
survival O O O O
, O O O O
growth O O O O
rate O O O O
or O O O O
in O O O O
the O O O O
reproductive O O O O
success O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
A O O O O
common O O O O
defence O O O O
in O O O O
lepidopterans O O O O
is O O O O
the O O O O
regurgitation O O O O
of O O O O
semi O O O O
- O O O O
digested O O O O
material O O O O
containing O O O O
the O O O O
defensive O O O O
compounds O O O O
of O O O O
the O O O O
food O O O O
plant O O O O
, O O O O
a O O O O
defence O O O O
which O O O O
has O O O O
led O O O O
to O O O O
gut O O O O
specialization O O O O
in O O O O
this O O O O
order O O O O
. O O O O
    
Regurgitation O O O O
is O O O O
often O O O O
swift O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
cuticular O O O O
stimulation O O O O
and O O O O
deters O O O O
predators O O O O
from O O O O
consuming O O O O
or O O O O
parasitizing O O O O
the O O O O
larva O O O O
. O O O O
    
The O O O O
loss O O O O
of O O O O
food O O O O
and O O O O
other O O O O
gut O O O O
material O O O O
seems O O O O
likely O O O O
to O O O O
impact O O O O
on O O O O
fitness O O O O
, O O O O
but O O O O
evidence O O O O
is O O O O
lacking O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
raised O O O O
larvae O O O O
of O O O O
the O O O O
common O O O O
crop O O O O
pest O O O O
Pieris B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
brassicae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
on O O O O
commercial O O O O
cabbage B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
leaves O O O O
, O O O O
simulated O O O O
predator O O O O
attacks O O O O
throughout O O O O
the O O O O
larval O O O O
period O O O O
, O O O O
and O O O O
measured O O O O
life O O O O
- O O O O
history O O O O
responses O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
that O O O O
the O O O O
probability O O O O
of O O O O
survival O O O O
to O O O O
pupation O O O O
decreased O O O O
with O O O O
increasing O O O O
frequency O O O O
of O O O O
attacks O O O O
, O O O O
but O O O O
this O O O O
was O O O O
because O O O O
of O O O O
regurgitation O O O O
rather O O O O
than O O O O
the O O O O
stimulation O O O O
itself O O O O
. O O O O
    
There O O O O
was O O O O
a O O O O
growth O O O O
cost O O O O
to O O O O
the O O O O
defence O O O O
such O O O O
that O O O O
the O O O O
more O O O O
regurgitant O O O O
that O O O O
individuals O O O O
produced O O O O
over O O O O
the O O O O
growth O O O O
period O O O O
, O O O O
the O O O O
smaller O O O O
they O O O O
were O O O O
at O O O O
pupation O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
number O O O O
of O O O O
mature O O O O
eggs O O O O
in O O O O
adult O O O O
females O O O O
was O O O O
positively O O O O
related O O O O
to O O O O
pupal O O O O
mass O O O O
, O O O O
but O O O O
this O O O O
relationship O O O O
was O O O O
only O O O O
found O O O O
when O O O O
individuals O O O O
were O O O O
not O O O O
subjected O O O O
to O O O O
a O O O O
high O O O O
frequency O O O O
of O O O O
predator O O O O
simulation O O O O
. O O O O
    
This O O O O
suggests O O O O
that O O O O
there O O O O
might O O O O
be O O O O
cryptic O O O O
fitness O O O O
costs O O O O
to O O O O
common O O O O
defensive O O O O
responses O O O O
that O O O O
are O O O O
paid O O O O
despite O O O O
apparent O O O O
growth O O O O
rate O O O O
being O O O O
maintained O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
demonstrate O O O O
a O O O O
clear O O O O
life O O O O
- O O O O
history O O O O
cost O O O O
of O O O O
an O O O O
antipredator O O O O
defence O O O O
in O O O O
a O O O O
model O O O O
pest O O O O
species O O O O
and O O O O
show O O O O
that O O O O
under O O O O
certain O O O O
conditions O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
high O O O O
predation O O O O
threat O O O O
, O O O O
the O O O O
expected O O O O
relationship O O O O
between O O O O
female O O O O
body O O O O
size O O O O
and O O O O
potential O O O O
fecundity O O O O
can O O O O
be O O O O
disrupted O O O O
. O O O O
    
Huntington O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
: O O O O
from O O O O
molecular O O O O
pathogenesis O O O O
to O O O O
clinical O O O O
treatment O O O O
. O O O O
    
Huntington O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
is O O O O
a O O O O
progressive O O O O
, O O O O
fatal O O O O
, O O O O
neurodegenerative O O O O
disorder O O O O
caused O O O O
by O O O O
an O O O O
expanded O O O O
CAG O O O O
repeat O O O O
in O O O O
the O O O O
huntingtin O O O O
gene O O O O
, O O O O
which O O O O
encodes O O O O
an O O O O
abnormally O O O O
long O O O O
polyglutamine O O O O
repeat O O O O
in O O O O
the O O O O
huntingtin O O O O
protein O O O O
. O O O O
    
Huntington O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
has O O O O
served O O O O
as O O O O
a O O O O
model O O O O
for O O O O
the O O O O
study O O O O
of O O O O
other O O O O
more O O O O
common O O O O
neurodegenerative O O O O
disorders O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
Alzheimer O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
and O O O O
Parkinson O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
. O O O O
    
These O O O O
disorders O O O O
all O O O O
share O O O O
features O O O O
including O O O O
: O O O O
delayed O O O O
onset O O O O
; O O O O
selective O O O O
neuronal O O O O
vulnerability O O O O
, O O O O
despite O O O O
widespread O O O O
expression O O O O
of O O O O
disease O O O O
- O O O O
related O O O O
proteins O O O O
during O O O O
the O O O O
whole O O O O
lifetime O O O O
; O O O O
abnormal O O O O
protein O O O O
processing O O O O
and O O O O
aggregation O O O O
; O O O O
and O O O O
cellular O O O O
toxic O O O O
effects O O O O
involving O O O O
both O O O O
cell O O O O
autonomous O O O O
and O O O O
cell O O O O
- O O O O
cell O O O O
interaction O O O O
mechanisms O O O O
. O O O O
    
Pathogenic O O O O
pathways O O O O
of O O O O
Huntington O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
are O O O O
beginning O O O O
to O O O O
be O O O O
unravelled O O O O
, O O O O
offering O O O O
targets O O O O
for O O O O
treatments O O O O
. O O O O
    
Additionally O O O O
, O O O O
predictive O O O O
genetic O O O O
testing O O O O
and O O O O
findings O O O O
of O O O O
neuroimaging O O O O
studies O O O O
show O O O O
that O O O O
, O O O O
as O O O O
in O O O O
some O O O O
other O O O O
neurodegenerative O O O O
disorders O O O O
, O O O O
neurodegeneration O O O O
in O O O O
affected O O O O
individuals O O O O
begins O O O O
many O O O O
years O O O O
before O O O O
onset O O O O
of O O O O
diagnosable O O O O
signs O O O O
and O O O O
symptoms O O O O
of O O O O
Huntington O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
, O O O O
and O O O O
it O O O O
is O O O O
accompanied O O O O
by O O O O
subtle O O O O
cognitive O O O O
, O O O O
motor O O O O
, O O O O
and O O O O
psychiatric O O O O
changes O O O O
( O O O O
so O O O O
- O O O O
called O O O O
prodromal O O O O
disease O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
Huntington O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
is O O O O
also O O O O
emerging O O O O
as O O O O
a O O O O
model O O O O
for O O O O
strategies O O O O
to O O O O
develop O O O O
therapeutic O O O O
interventions O O O O
, O O O O
not O O O O
only O O O O
to O O O O
slow O O O O
progression O O O O
of O O O O
manifest O O O O
disease O O O O
but O O O O
also O O O O
to O O O O
delay O O O O
, O O O O
or O O O O
ideally O O O O
prevent O O O O
, O O O O
its O O O O
onset O O O O
. O O O O
    
Natural O O O O
history O O O O
and O O O O
intragenomic O O O O
dynamics O O O O
of O O O O
the O O O O
Transib O O O O
transposon O O O O
Hztransib O O O O
in O O O O
the O O O O
cotton B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bollworm O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Helicoverpa B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
zea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Hztransib O O O O
, O O O O
recently O O O O
identified O O O O
from O O O O
Helicoverpa B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
zea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
represents O O O O
the O O O O
first O O O O
intact O O O O
and O O O O
transcriptionally O O O O
active O O O O
Transib O O O O
element O O O O
. O O O O
    
Its O O O O
open O O O O
reading O O O O
frame O O O O
was O O O O
detected O O O O
in O O O O
Helicoverpa B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
armigera O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
from O O O O
which O O O O
H B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
zea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
evolved O O O O
, O O O O
and O O O O
in O O O O
Helicoverpa B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
assulta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
the O O O O
common O O O O
ancestor O O O O
of O O O O
H B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
zea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
H B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
armigera O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
but O O O O
its O O O O
remaining O O O O
parts O O O O
were O O O O
found O O O O
only O O O O
in O O O O
H B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
armigera O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Thirty O O O O
- O O O O
nine O O O O
Hztransib O O O O
insertion O O O O
sites O O O O
, O O O O
all O O O O
of O O O O
which O O O O
are O O O O
polymorphic O O O O
, O O O O
were O O O O
detected O O O O
from O O O O
eight O O O O
populations O O O O
of O O O O
H B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
zea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Out O O O O
of O O O O
the O O O O
39 O O O O
insertion O O O O
sites O O O O
, O O O O
35 O O O O
were O O O O
not O O O O
frequently O O O O
occupied O O O O
, O O O O
with O O O O
1 O O O O
- O O O O
33 O O O O
occurrences O O O O
in O O O O
a O O O O
total O O O O
of O O O O
128 O O O O
individuals O O O O
from O O O O
the O O O O
eight O O O O
populations O O O O
( O O O O
16 O O O O
larvae O O O O
per O O O O
population O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Its O O O O
copy O O O O
number O O O O
ranged O O O O
from O O O O
5 O O O O
. O O O O
8 O O O O
to O O O O
14 O O O O
. O O O O
2 O O O O
per O O O O
individual O O O O
, O O O O
with O O O O
putative O O O O
intact O O O O
copies O O O O
always O O O O
more O O O O
abundant O O O O
than O O O O
internally O O O O
deleted O O O O
ones O O O O
. O O O O
    
Taking O O O O
this O O O O
evidence O O O O
together O O O O
, O O O O
Hztransib O O O O
probably O O O O
transferred O O O O
to O O O O
H B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
zea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
from O O O O
H B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
armigera O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
most O O O O
likely O O O O
still O O O O
retains O O O O
its O O O O
capacity O O O O
to O O O O
maintain O O O O
structural O O O O
integrity O O O O
, O O O O
increase O O O O
copy O O O O
number O O O O
and O O O O
remobilize O O O O
in O O O O
H B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
zea O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Identification O O O O
of O O O O
an O O O O
extracellular O O O O
polysaccharide O O O O
network O O O O
essential O O O O
for O O O O
cytochrome O O O O
anchoring O O O O
and O O O O
biofilm O O O O
formation O O O O
in O O O O
Geobacter B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sulfurreducens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Transposon O O O O
insertions O O O O
in O O O O
Geobacter B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sulfurreducens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
GSU1501 O O O O
, O O O O
part O O O O
of O O O O
an O O O O
ATP O O O O
- O O O O
dependent O O O O
exporter O O O O
within O O O O
an O O O O
operon O O O O
of O O O O
polysaccharide O O O O
biosynthesis O O O O
genes O O O O
, O O O O
were O O O O
previously O O O O
shown O O O O
to O O O O
eliminate O O O O
insoluble O O O O
Fe O O O O
( O O O O
III O O O O
) O O O O
reduction O O O O
and O O O O
use O O O O
of O O O O
an O O O O
electrode O O O O
as O O O O
an O O O O
electron O O O O
acceptor O O O O
. O O O O
    
Replacement O O O O
of O O O O
GSU1501 O O O O
with O O O O
a O O O O
kanamycin O O O O
resistance O O O O
cassette O O O O
produced O O O O
a O O O O
similarly O O O O
defective O O O O
mutant O O O O
, O O O O
which O O O O
could O O O O
be O O O O
partially O O O O
complemented O O O O
by O O O O
expression O O O O
of O O O O
GSU1500 O O O O
to O O O O
GSU1505 O O O O
in O O O O
trans O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Delta1501 O O O O
mutant O O O O
demonstrated O O O O
limited O O O O
cell O O O O
- O O O O
cell O O O O
agglutination O O O O
, O O O O
enhanced O O O O
attachment O O O O
to O O O O
negatively O O O O
charged O O O O
surfaces O O O O
, O O O O
and O O O O
poor O O O O
attachment O O O O
to O O O O
positively O O O O
charged O O O O
poly O O O O
- O O O O
d O O O O
- O O O O
lysine O O O O
- O O O O
or O O O O
Fe O O O O
( O O O O
III O O O O
) O O O O
- O O O O
coated O O O O
surfaces O O O O
. O O O O
    
Wild O O O O
- O O O O
type O O O O
and O O O O
mutant O O O O
cells O O O O
attached O O O O
to O O O O
graphite O O O O
electrodes O O O O
, O O O O
but O O O O
when O O O O
electrodes O O O O
were O O O O
poised O O O O
at O O O O
an O O O O
oxidizing O O O O
potential O O O O
inducing O O O O
a O O O O
positive O O O O
surface O O O O
charge O O O O
( O O O O
+ O O O O
0 O O O O
. O O O O
24 O O O O
V O O O O
versus O O O O
the O O O O
standard O O O O
hydrogen O O O O
electrode O O O O
[ O O O O
SHE O O O O
] O O O O
) O O O O
, O O O O
Delta1501 O O O O
mutant O O O O
cells O O O O
detached O O O O
. O O O O
    
Scanning O O O O
electron O O O O
microscopy O O O O
revealed O O O O
fibrils O O O O
surrounding O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
G B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sulfurreducens O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
which O O O O
were O O O O
absent O O O O
from O O O O
the O O O O
Delta1501 O O O O
mutant O O O O
. O O O O
    
Similar O O O O
amounts O O O O
of O O O O
type O O O O
IV O O O O
pili O O O O
and O O O O
pilus O O O O
- O O O O
associated O O O O
cytochromes O O O O
were O O O O
detected O O O O
on O O O O
both O O O O
cell O O O O
types O O O O
, O O O O
but O O O O
shearing O O O O
released O O O O
a O O O O
stable O O O O
matrix O O O O
of O O O O
c O O O O
- O O O O
type O O O O
cytochromes O O O O
and O O O O
other O O O O
proteins O O O O
bound O O O O
to O O O O
polysaccharides O O O O
. O O O O
    
The O O O O
matrix O O O O
from O O O O
the O O O O
mutant O O O O
contained O O O O
60 O O O O
% O O O O
less O O O O
sugar O O O O
and O O O O
was O O O O
nearly O O O O
devoid O O O O
of O O O O
c O O O O
- O O O O
type O O O O
cytochromes O O O O
such O O O O
as O O O O
OmcZ O O O O
. O O O O
    
The O O O O
addition O O O O
of O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
extracellular O O O O
matrix O O O O
to O O O O
Delta1501 O O O O
cultures O O O O
restored O O O O
agglutination O O O O
and O O O O
Fe O O O O
( O O O O
III O O O O
) O O O O
reduction O O O O
. O O O O
    
The O O O O
polysaccharide O O O O
binding O O O O
dye O O O O
Congo O O O O
red O O O O
preferentially O O O O
bound O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
cells O O O O
and O O O O
extracellular O O O O
matrix O O O O
material O O O O
over O O O O
mutant O O O O
cells O O O O
, O O O O
and O O O O
Congo O O O O
red O O O O
inhibited O O O O
agglutination O O O O
and O O O O
Fe O O O O
( O O O O
III O O O O
) O O O O
reduction O O O O
by O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
demonstrate O O O O
a O O O O
crucial O O O O
role O O O O
for O O O O
the O O O O
xap O O O O
( O O O O
extracellular O O O O
anchoring O O O O
polysaccharide O O O O
) O O O O
locus O O O O
in O O O O
metal O O O O
oxide O O O O
attachment O O O O
, O O O O
cell O O O O
- O O O O
cell O O O O
agglutination O O O O
, O O O O
and O O O O
localization O O O O
of O O O O
essential O O O O
cytochromes O O O O
beyond O O O O
the O O O O
Geobacter O O O O
outer O O O O
membrane O O O O
. O O O O
    
Hyphal O O O O
and O O O O
cytoskeleton O O O O
polarization O O O O
in O O O O
Tuber B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
melanosporum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
: O O O O
a O O O O
genomic O O O O
and O O O O
cellular O O O O
analysis O O O O
. O O O O
    
Filamentous O O O O
polarized O O O O
growth O O O O
involves O O O O
a O O O O
series O O O O
of O O O O
events O O O O
including O O O O
polarization O O O O
of O O O O
the O O O O
cytoskeleton O O O O
to O O O O
selected O O O O
growth O O O O
sites O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
transport O O O O
of O O O O
secretory O O O O
vesicles O O O O
containing O O O O
the O O O O
components O O O O
required O O O O
for O O O O
growth O O O O
. O O O O
    
The O O O O
availability O O O O
of O O O O
fungal O O O O
genome O O O O
sequences O O O O
has O O O O
recently O O O O
led O O O O
to O O O O
the O O O O
identification O O O O
of O O O O
a O O O O
large O O O O
number O O O O
of O O O O
proteins O O O O
involved O O O O
in O O O O
these O O O O
processes O O O O
. O O O O
    
We O O O O
have O O O O
explored O O O O
the O O O O
Tuber B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
melanosporum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
genome O O O O
sequence O O O O
by O O O O
searching O O O O
for O O O O
homologs O O O O
of O O O O
genes O O O O
known O O O O
to O O O O
play O O O O
crucial O O O O
roles O O O O
in O O O O
the O O O O
morphogenesis O O O O
and O O O O
cell O O O O
polarity O O O O
of O O O O
yeasts B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
filamentous O O O O
fungi O O O O
. O O O O
    
One O O O O
hundred O O O O
and O O O O
forty O O O O
- O O O O
nine O O O O
genes O O O O
have O O O O
been O O O O
identified O O O O
and O O O O
functionally O O O O
grouped O O O O
according O O O O
to O O O O
the O O O O
deduced O O O O
amino O O O O
acid O O O O
sequences O O O O
( O O O O
44 O O O O
genes O O O O
involved O O O O
in O O O O
cell O O O O
polarity O O O O
/ O O O O
morphogenesis O O O O
, O O O O
39 O O O O
belonging O O O O
to O O O O
the O O O O
actin O O O O
cytoskeleton O O O O
and O O O O
66 O O O O
involved O O O O
in O O O O
membrane O O O O
dynamics O O O O
, O O O O
septation O O O O
and O O O O
exocytosis O O O O
) O O O O
. O O O O
    
A O O O O
detailed O O O O
gene O O O O
annotation O O O O
has O O O O
shown O O O O
that O O O O
most O O O O
components O O O O
of O O O O
the O O O O
cell O O O O
polarity O O O O
machinery O O O O
, O O O O
morphogenesis O O O O
and O O O O
cytoskeleton O O O O
found O O O O
in O O O O
yeasts B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
filamentous O O O O
fungi O O O O
are O O O O
conserved O O O O
, O O O O
although O O O O
the O O O O
degree O O O O
of O O O O
similarity O O O O
varies O O O O
from O O O O
strong O O O O
to O O O O
weak O O O O
. O O O O
    
Microscopic O O O O
analysis O O O O
of O O O O
quick O O O O
- O O O O
frozen O O O O
truffle O O O O
hyphae O O O O
detected O O O O
the O O O O
characteristic O O O O
subcellular O O O O
components O O O O
of O O O O
the O O O O
hyphal O O O O
tip O O O O
in O O O O
septate O O O O
filamentous O O O O
fungi O O O O
, O O O O
while O O O O
transcript O O O O
profiles O O O O
revealed O O O O
a O O O O
moderately O O O O
variable O O O O
pattern O O O O
during O O O O
the O O O O
biological O O O O
cycle O O O O
. O O O O
    
Proteomics O O O O
of O O O O
cryoprotective O O O O
dehydration O O O O
in O O O O
Megaphorura B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
arctica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Tullberg O O O O
1876 O O O O
( O O O O
Onychiuridae O O O O
: O O O O
Collembola O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Arctic B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
springtail O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Megaphorura B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
arctica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Tullberg O O O O
1876 O O O O
( O O O O
Onychiuridae O O O O
: O O O O
Collembola O O O O
) O O O O
, O O O O
is O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
few O O O O
organisms O O O O
known O O O O
to O O O O
survive O O O O
the O O O O
extreme O O O O
stresses O O O O
of O O O O
its O O O O
environment O O O O
by O O O O
using O O O O
cryoprotective O O O O
dehydration O O O O
. O O O O
    
We O O O O
have O O O O
undertaken O O O O
a O O O O
proteomics O O O O
study O O O O
comparing O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
arctica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
acclimated O O O O
at O O O O
- O O O O
2 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
, O O O O
the O O O O
temperature O O O O
known O O O O
to O O O O
induce O O O O
the O O O O
production O O O O
of O O O O
the O O O O
anhydroprotectant O O O O
trehalose O O O O
in O O O O
this O O O O
species O O O O
, O O O O
and O O O O
- O O O O
6 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
, O O O O
the O O O O
temperature O O O O
at O O O O
which O O O O
trehalose O O O O
expression O O O O
plateaus O O O O
, O O O O
against O O O O
control O O O O
animals O O O O
acclimated O O O O
at O O O O
+ O O O O
5 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
difference O O O O
gel O O O O
electrophoresis O O O O
, O O O O
and O O O O
liquid O O O O
chromatography O O O O
tandem O O O O
mass O O O O
spectrometry O O O O
, O O O O
we O O O O
identified O O O O
three O O O O
categories O O O O
of O O O O
differentially O O O O
expressed O O O O
proteins O O O O
with O O O O
specific O O O O
functions O O O O
, O O O O
up O O O O
- O O O O
regulated O O O O
in O O O O
both O O O O
the O O O O
- O O O O
2 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
and O O O O
- O O O O
6 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
animals O O O O
, O O O O
that O O O O
were O O O O
involved O O O O
in O O O O
metabolism O O O O
, O O O O
membrane O O O O
transport O O O O
and O O O O
protein O O O O
folding O O O O
. O O O O
    
Proteins O O O O
involved O O O O
in O O O O
cytoskeleton O O O O
organisation O O O O
were O O O O
only O O O O
up O O O O
- O O O O
regulated O O O O
in O O O O
the O O O O
- O O O O
6 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
animals O O O O
. O O O O
    
The O O O O
pyrokinin O O O O
/ O O O O
pheromone O O O O
biosynthesis O O O O
- O O O O
activating O O O O
neuropeptide O O O O
( O O O O
PBAN O O O O
) O O O O
family O O O O
of O O O O
peptides O O O O
and O O O O
their O O O O
receptors O O O O
in O O O O
Insecta O O O O
: O O O O
evolutionary O O O O
trace O O O O
indicates O O O O
potential O O O O
receptor O O O O
ligand O O O O
- O O O O
binding O O O O
domains O O O O
. O O O O
    
The O O O O
pyrokinin O O O O
/ O O O O
pheromone O O O O
biosynthesis O O O O
- O O O O
activating O O O O
neuropeptide O O O O
( O O O O
PBAN O O O O
) O O O O
family O O O O
of O O O O
G O O O O
- O O O O
protein O O O O
- O O O O
coupled O O O O
receptors O O O O
and O O O O
their O O O O
ligands O O O O
have O O O O
been O O O O
identified O O O O
in O O O O
various O O O O
insects O O O O
. O O O O
    
Physiological O O O O
functions O O O O
of O O O O
pyrokinin O O O O
peptides O O O O
include O O O O
muscle O O O O
contraction O O O O
, O O O O
whereas O O O O
PBAN O O O O
regulates O O O O
, O O O O
among O O O O
other O O O O
functions O O O O
, O O O O
pheromone O O O O
production O O O O
in O O O O
moths O O O O
which O O O O
indicates O O O O
the O O O O
pleiotropic O O O O
nature O O O O
of O O O O
these O O O O
peptides O O O O
. O O O O
    
Based O O O O
on O O O O
the O O O O
alignment O O O O
of O O O O
annotated O O O O
genomic O O O O
sequences O O O O
, O O O O
the O O O O
pyrokinin O O O O
/ O O O O
PBAN O O O O
family O O O O
of O O O O
receptors O O O O
have O O O O
similarity O O O O
with O O O O
the O O O O
corresponding O O O O
structures O O O O
of O O O O
the O O O O
capa O O O O
or O O O O
periviscerokinin O O O O
receptors O O O O
of O O O O
insects O O O O
and O O O O
the O O O O
neuromedin O O O O
U O O O O
receptors O O O O
of O O O O
vertebrates O O O O
. O O O O
    
In O O O O
our O O O O
study O O O O
, O O O O
evolutionary O O O O
trace O O O O
( O O O O
ET O O O O
) O O O O
analysis O O O O
on O O O O
the O O O O
insect O O O O
receptor O O O O
sequences O O O O
was O O O O
conducted O O O O
to O O O O
predict O O O O
the O O O O
putative O O O O
ligand O O O O
recognition O O O O
and O O O O
binding O O O O
sites O O O O
. O O O O
    
The O O O O
ET O O O O
analysis O O O O
of O O O O
four O O O O
class O O O O
- O O O O
specific O O O O
receptors O O O O
indicated O O O O
several O O O O
amino O O O O
acid O O O O
residues O O O O
that O O O O
are O O O O
conserved O O O O
in O O O O
the O O O O
transmembrane O O O O
domains O O O O
. O O O O
    
The O O O O
receptor O O O O
extracellular O O O O
domains O O O O
exhibit O O O O
several O O O O
class O O O O
- O O O O
specific O O O O
amino O O O O
acid O O O O
residues O O O O
, O O O O
which O O O O
could O O O O
indicate O O O O
putative O O O O
domains O O O O
for O O O O
activation O O O O
of O O O O
these O O O O
receptors O O O O
by O O O O
ligand O O O O
recognition O O O O
and O O O O
binding O O O O
. O O O O
    
acon O O O O
- O O O O
3 O O O O
, O O O O
the O O O O
Neurospora B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
crassa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ortholog O O O O
of O O O O
the O O O O
developmental O O O O
modifier O O O O
, O O O O
medA O O O O
, O O O O
complements O O O O
the O O O O
conidiation O O O O
defect O O O O
of O O O O
the O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
mutant O O O O
. O O O O
    
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Neurospora B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
crassa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
are O O O O
ascomycetes O O O O
that O O O O
produce O O O O
asexual O O O O
spores O O O O
through O O O O
morphologically O O O O
distinct O O O O
processes O O O O
. O O O O
    
MedA O O O O
, O O O O
a O O O O
protein O O O O
with O O O O
unknown O O O O
function O O O O
, O O O O
is O O O O
required O O O O
for O O O O
normal O O O O
asexual O O O O
and O O O O
sexual O O O O
development O O O O
in O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
We O O O O
determined O O O O
that O O O O
the O O O O
N B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
crassa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ortholog O O O O
of O O O O
medA O O O O
is O O O O
acon O O O O
- O O O O
3 O O O O
, O O O O
a O O O O
gene O O O O
required O O O O
for O O O O
early O O O O
conidiophore O O O O
development O O O O
and O O O O
female O O O O
fertility O O O O
. O O O O
    
To O O O O
test O O O O
hypotheses O O O O
about O O O O
the O O O O
evolutionary O O O O
origins O O O O
of O O O O
asexual O O O O
development O O O O
in O O O O
distinct O O O O
fungal O O O O
lineages O O O O
it O O O O
is O O O O
important O O O O
to O O O O
understand O O O O
the O O O O
degree O O O O
of O O O O
conservation O O O O
of O O O O
developmental O O O O
regulators O O O O
. O O O O
    
The O O O O
amino O O O O
acid O O O O
sequences O O O O
of O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
MedA O O O O
and O O O O
N B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
crassa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ACON O O O O
- O O O O
3 O O O O
shared O O O O
37 O O O O
% O O O O
identity O O O O
and O O O O
51 O O O O
% O O O O
similarity O O O O
. O O O O
    
acon O O O O
- O O O O
3 O O O O
is O O O O
induced O O O O
at O O O O
late O O O O
time O O O O
points O O O O
of O O O O
conidiation O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
, O O O O
medA O O O O
is O O O O
constitutively O O O O
expressed O O O O
and O O O O
MedA O O O O
protein O O O O
localizes O O O O
to O O O O
nuclei O O O O
in O O O O
all O O O O
tissue O O O O
types O O O O
. O O O O
    
Nonetheless O O O O
, O O O O
expression O O O O
of O O O O
acon O O O O
- O O O O
3 O O O O
using O O O O
its O O O O
native O O O O
promoter O O O O
complemented O O O O
the O O O O
conidiation O O O O
defects O O O O
of O O O O
the O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
DeltamedA O O O O
and O O O O
medA15 O O O O
mutants O O O O
. O O O O
    
We O O O O
conclude O O O O
that O O O O
the O O O O
biochemical O O O O
activity O O O O
of O O O O
the O O O O
medA O O O O
orthologs O O O O
is O O O O
conserved O O O O
for O O O O
conidiation O O O O
. O O O O
    
Towards O O O O
achievement O O O O
of O O O O
universal O O O O
health O O O O
care O O O O
in O O O O
India O O O O
by O O O O
2020 O O O O
: O O O O
a O O O O
call O O O O
to O O O O
action O O O O
. O O O O
    
To O O O O
sustain O O O O
the O O O O
positive O O O O
economic O O O O
trajectory O O O O
that O O O O
India O O O O
has O O O O
had O O O O
during O O O O
the O O O O
past O O O O
decade O O O O
, O O O O
and O O O O
to O O O O
honour O O O O
the O O O O
fundamental O O O O
right O O O O
of O O O O
all O O O O
citizens O O O O
to O O O O
adequate O O O O
health O O O O
care O O O O
, O O O O
the O O O O
health O O O O
of O O O O
all O O O O
Indian O O O O
people O O O O
has O O O O
to O O O O
be O O O O
given O O O O
the O O O O
highest O O O O
priority O O O O
in O O O O
public O O O O
policy O O O O
. O O O O
    
We O O O O
propose O O O O
the O O O O
creation O O O O
of O O O O
the O O O O
Integrated O O O O
National O O O O
Health O O O O
System O O O O
in O O O O
India O O O O
through O O O O
provision O O O O
of O O O O
universal O O O O
health O O O O
insurance O O O O
, O O O O
establishment O O O O
of O O O O
autonomous O O O O
organisations O O O O
to O O O O
enable O O O O
accountable O O O O
and O O O O
evidence O O O O
- O O O O
based O O O O
good O O O O
- O O O O
quality O O O O
health O O O O
- O O O O
care O O O O
practices O O O O
and O O O O
development O O O O
of O O O O
appropriately O O O O
trained O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
resources O O O O
, O O O O
the O O O O
restructuring O O O O
of O O O O
health O O O O
governance O O O O
to O O O O
make O O O O
it O O O O
coordinated O O O O
and O O O O
decentralised O O O O
, O O O O
and O O O O
legislation O O O O
of O O O O
health O O O O
entitlement O O O O
for O O O O
all O O O O
Indian O O O O
people O O O O
. O O O O
    
The O O O O
key O O O O
characteristics O O O O
of O O O O
our O O O O
proposal O O O O
are O O O O
to O O O O
strengthen O O O O
the O O O O
public O O O O
health O O O O
system O O O O
as O O O O
the O O O O
primary O O O O
provider O O O O
of O O O O
promotive O O O O
, O O O O
preventive O O O O
, O O O O
and O O O O
curative O O O O
health O O O O
services O O O O
in O O O O
India O O O O
, O O O O
to O O O O
improve O O O O
quality O O O O
and O O O O
reduce O O O O
the O O O O
out O O O O
- O O O O
of O O O O
- O O O O
pocket O O O O
expenditure O O O O
on O O O O
health O O O O
care O O O O
through O O O O
a O O O O
well O O O O
regulated O O O O
integration O O O O
of O O O O
the O O O O
private O O O O
sector O O O O
within O O O O
the O O O O
national O O O O
health O O O O
- O O O O
care O O O O
system O O O O
. O O O O
    
Dialogue O O O O
and O O O O
consensus O O O O
building O O O O
among O O O O
the O O O O
stakeholders O O O O
in O O O O
the O O O O
government O O O O
, O O O O
civil O O O O
society O O O O
, O O O O
and O O O O
private O O O O
sector O O O O
are O O O O
the O O O O
next O O O O
steps O O O O
to O O O O
formalise O O O O
the O O O O
actions O O O O
needed O O O O
and O O O O
to O O O O
monitor O O O O
their O O O O
achievement O O O O
. O O O O
    
In O O O O
our O O O O
call O O O O
to O O O O
action O O O O
, O O O O
we O O O O
propose O O O O
that O O O O
India O O O O
must O O O O
achieve O O O O
health O O O O
care O O O O
for O O O O
all O O O O
by O O O O
2020 O O O O
. O O O O
    
Financing O O O O
health O O O O
care O O O O
for O O O O
all O O O O
: O O O O
challenges O O O O
and O O O O
opportunities O O O O
. O O O O
    
India O O O O
' O O O O
s O O O O
health O O O O
financing O O O O
system O O O O
is O O O O
a O O O O
cause O O O O
of O O O O
and O O O O
an O O O O
exacerbating O O O O
factor O O O O
in O O O O
the O O O O
challenges O O O O
of O O O O
health O O O O
inequity O O O O
, O O O O
inadequate O O O O
availability O O O O
and O O O O
reach O O O O
, O O O O
unequal O O O O
access O O O O
, O O O O
and O O O O
poor O O O O
- O O O O
quality O O O O
and O O O O
costly O O O O
health O O O O
- O O O O
care O O O O
services O O O O
. O O O O
    
Low O O O O
per O O O O
person O O O O
spending O O O O
on O O O O
health O O O O
and O O O O
insufficient O O O O
public O O O O
expenditure O O O O
result O O O O
in O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
highest O O O O
proportions O O O O
of O O O O
private O O O O
out O O O O
- O O O O
of O O O O
- O O O O
pocket O O O O
expenses O O O O
in O O O O
the O O O O
world O O O O
. O O O O
    
Citizens O O O O
receive O O O O
low O O O O
value O O O O
for O O O O
money O O O O
in O O O O
the O O O O
public O O O O
and O O O O
the O O O O
private O O O O
sectors O O O O
. O O O O
    
Financial O O O O
protection O O O O
against O O O O
medical O O O O
expenditures O O O O
is O O O O
far O O O O
from O O O O
universal O O O O
with O O O O
only O O O O
10 O O O O
% O O O O
of O O O O
the O O O O
population O O O O
having O O O O
medical O O O O
insurance O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Government O O O O
of O O O O
India O O O O
has O O O O
made O O O O
a O O O O
commitment O O O O
to O O O O
increase O O O O
public O O O O
spending O O O O
on O O O O
health O O O O
from O O O O
less O O O O
than O O O O
1 O O O O
% O O O O
to O O O O
3 O O O O
% O O O O
of O O O O
the O O O O
gross O O O O
domestic O O O O
product O O O O
during O O O O
the O O O O
next O O O O
few O O O O
years O O O O
. O O O O
    
Increased O O O O
public O O O O
funding O O O O
combined O O O O
with O O O O
flexibility O O O O
of O O O O
financial O O O O
transfers O O O O
from O O O O
centre O O O O
to O O O O
state O O O O
can O O O O
greatly O O O O
improve O O O O
the O O O O
performance O O O O
of O O O O
state O O O O
- O O O O
operated O O O O
public O O O O
systems O O O O
. O O O O
    
Enhanced O O O O
public O O O O
spending O O O O
can O O O O
be O O O O
used O O O O
to O O O O
introduce O O O O
universal O O O O
medical O O O O
insurance O O O O
that O O O O
can O O O O
help O O O O
to O O O O
substantially O O O O
reduce O O O O
the O O O O
burden O O O O
of O O O O
private O O O O
out O O O O
- O O O O
of O O O O
- O O O O
pocket O O O O
expenditures O O O O
on O O O O
health O O O O
. O O O O
    
Increased O O O O
public O O O O
spending O O O O
can O O O O
also O O O O
contribute O O O O
to O O O O
quality O O O O
assurance O O O O
in O O O O
the O O O O
public O O O O
and O O O O
private O O O O
sectors O O O O
through O O O O
effective O O O O
regulation O O O O
and O O O O
oversight O O O O
. O O O O
    
In O O O O
addition O O O O
to O O O O
an O O O O
increase O O O O
in O O O O
public O O O O
expenditures O O O O
on O O O O
health O O O O
, O O O O
the O O O O
Government O O O O
of O O O O
India O O O O
will O O O O
, O O O O
however O O O O
, O O O O
need O O O O
to O O O O
introduce O O O O
specific O O O O
methods O O O O
to O O O O
contain O O O O
costs O O O O
, O O O O
improve O O O O
the O O O O
efficiency O O O O
of O O O O
spending O O O O
, O O O O
increase O O O O
accountability O O O O
, O O O O
and O O O O
monitor O O O O
the O O O O
effect O O O O
of O O O O
expenditures O O O O
on O O O O
health O O O O
. O O O O
    
Continuing O O O O
challenge O O O O
of O O O O
infectious O O O O
diseases O O O O
in O O O O
India O O O O
. O O O O
    
In O O O O
India O O O O
, O O O O
the O O O O
range O O O O
and O O O O
burden O O O O
of O O O O
infectious O O O O
diseases O O O O
are O O O O
enormous O O O O
. O O O O
    
The O O O O
administrative O O O O
responsibilities O O O O
of O O O O
the O O O O
health O O O O
system O O O O
are O O O O
shared O O O O
between O O O O
the O O O O
central O O O O
( O O O O
federal O O O O
) O O O O
and O O O O
state O O O O
governments O O O O
. O O O O
    
Control O O O O
of O O O O
diseases O O O O
and O O O O
outbreaks O O O O
is O O O O
the O O O O
responsibility O O O O
of O O O O
the O O O O
central O O O O
Ministry O O O O
of O O O O
Health O O O O
, O O O O
which O O O O
lacks O O O O
a O O O O
formal O O O O
public O O O O
health O O O O
department O O O O
for O O O O
this O O O O
purpose O O O O
. O O O O
    
Tuberculosis O O O O
, O O O O
malaria O O O O
, O O O O
filariasis O O O O
, O O O O
visceral O O O O
leishmaniasis O O O O
, O O O O
leprosy O O O O
, O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infection O O O O
, O O O O
and O O O O
childhood O O O O
cluster O O O O
of O O O O
vaccine O O O O
- O O O O
preventable O O O O
diseases O O O O
are O O O O
given O O O O
priority O O O O
for O O O O
control O O O O
through O O O O
centrally O O O O
managed O O O O
vertical O O O O
programmes O O O O
. O O O O
    
Control O O O O
of O O O O
HIV B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infection O O O O
and O O O O
leprosy O O O O
, O O O O
but O O O O
not O O O O
of O O O O
tuberculosis O O O O
, O O O O
seems O O O O
to O O O O
be O O O O
on O O O O
track O O O O
. O O O O
    
Early O O O O
success O O O O
of O O O O
malaria O O O O
control O O O O
was O O O O
not O O O O
sustained O O O O
, O O O O
and O O O O
visceral O O O O
leishmaniasis O O O O
prevalence O O O O
has O O O O
increased O O O O
. O O O O
    
Inadequate O O O O
containment O O O O
of O O O O
the O O O O
vector O O O O
has O O O O
resulted O O O O
in O O O O
recurrent O O O O
outbreaks O O O O
of O O O O
dengue O O O O
fever O O O O
and O O O O
re O O O O
- O O O O
emergence O O O O
of O O O O
Chikungunya B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
virus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
disease O O O O
and O O O O
typhus O O O O
fever O O O O
. O O O O
    
Other O O O O
infectious O O O O
diseases O O O O
caused O O O O
by O O O O
faecally O O O O
transmitted O O O O
pathogens O O O O
( O O O O
enteric O O O O
fevers O O O O
, O O O O
cholera O O O O
, O O O O
hepatitis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
A O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
viruses O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
and O O O O
zoonoses O O O O
( O O O O
rabies O O O O
, O O O O
leptospirosis O O O O
, O O O O
anthrax O O O O
) O O O O
are O O O O
not O O O O
in O O O O
the O O O O
process O O O O
of O O O O
being O O O O
systematically O O O O
controlled O O O O
. O O O O
    
Big O O O O
gaps O O O O
in O O O O
the O O O O
surveillance O O O O
and O O O O
response O O O O
system O O O O
for O O O O
infectious O O O O
diseases O O O O
need O O O O
to O O O O
be O O O O
addressed O O O O
. O O O O
    
Replication O O O O
of O O O O
the O O O O
model O O O O
of O O O O
vertical O O O O
single O O O O
- O O O O
disease O O O O
control O O O O
for O O O O
all O O O O
infectious O O O O
diseases O O O O
will O O O O
not O O O O
be O O O O
efficient O O O O
or O O O O
viable O O O O
. O O O O
    
India O O O O
needs O O O O
to O O O O
rethink O O O O
and O O O O
revise O O O O
its O O O O
health O O O O
policy O O O O
to O O O O
broaden O O O O
the O O O O
agenda O O O O
of O O O O
disease O O O O
control O O O O
. O O O O
    
A O O O O
comprehensive O O O O
review O O O O
and O O O O
redesign O O O O
of O O O O
the O O O O
health O O O O
system O O O O
is O O O O
needed O O O O
urgently O O O O
to O O O O
ensure O O O O
equity O O O O
and O O O O
quality O O O O
in O O O O
health O O O O
care O O O O
. O O O O
    
We O O O O
recommend O O O O
the O O O O
creation O O O O
of O O O O
a O O O O
functional O O O O
public O O O O
health O O O O
infrastructure O O O O
that O O O O
is O O O O
shared O O O O
between O O O O
central O O O O
and O O O O
state O O O O
governments O O O O
, O O O O
with O O O O
professional O O O O
leadership O O O O
and O O O O
a O O O O
formally O O O O
trained O O O O
public O O O O
health O O O O
cadre O O O O
of O O O O
personnel O O O O
who O O O O
manage O O O O
an O O O O
integrated O O O O
control O O O O
mechanism O O O O
of O O O O
diseases O O O O
in O O O O
districts O O O O
that O O O O
includes O O O O
infectious O O O O
and O O O O
non O O O O
- O O O O
infectious O O O O
diseases O O O O
, O O O O
and O O O O
injuries O O O O
. O O O O
    
ATP O O O O
citrate O O O O
lyase O O O O
is O O O O
required O O O O
for O O O O
normal O O O O
sexual O O O O
and O O O O
asexual O O O O
development O O O O
in O O O O
Gibberella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
zeae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Adenosine O O O O
triphosphate O O O O
( O O O O
ATP O O O O
) O O O O
citrate O O O O
lyase O O O O
( O O O O
ACL O O O O
) O O O O
is O O O O
a O O O O
key O O O O
enzyme O O O O
in O O O O
the O O O O
production O O O O
of O O O O
cytosolic O O O O
acetyl O O O O
- O O O O
CoA O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
crucial O O O O
for O O O O
de O O O O
novo O O O O
lipid O O O O
synthesis O O O O
and O O O O
histone O O O O
acetylation O O O O
in O O O O
mammalian O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
characterized O O O O
the O O O O
mechanistic O O O O
roles O O O O
of O O O O
ACL O O O O
in O O O O
the O O O O
homothallic O O O O
ascomycete O O O O
fungus O O O O
Gibberella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
zeae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
which O O O O
causes O O O O
Fusarium O O O O
head O O O O
blight O O O O
in O O O O
major O O O O
cereal O O O O
crops O O O O
. O O O O
    
Deletion O O O O
of O O O O
ACL O O O O
in O O O O
the O O O O
fungus O O O O
resulted O O O O
in O O O O
a O O O O
complete O O O O
loss O O O O
of O O O O
self O O O O
and O O O O
female O O O O
fertility O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
a O O O O
reduction O O O O
in O O O O
asexual O O O O
reproduction O O O O
, O O O O
virulence O O O O
, O O O O
and O O O O
trichothecene O O O O
production O O O O
. O O O O
    
When O O O O
the O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
strain O O O O
was O O O O
spermatized O O O O
with O O O O
the O O O O
ACL O O O O
deletion O O O O
mutants O O O O
, O O O O
they O O O O
produced O O O O
viable O O O O
ascospores O O O O
, O O O O
however O O O O
ascospore O O O O
delimitation O O O O
was O O O O
not O O O O
properly O O O O
regulated O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
lipid O O O O
synthesis O O O O
was O O O O
not O O O O
affected O O O O
by O O O O
ACL O O O O
deletion O O O O
, O O O O
histone O O O O
acetylation O O O O
was O O O O
dramatically O O O O
reduced O O O O
in O O O O
the O O O O
ACL O O O O
deletion O O O O
mutants O O O O
during O O O O
sexual O O O O
development O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
the O O O O
defects O O O O
in O O O O
sexual O O O O
reproduction O O O O
were O O O O
caused O O O O
by O O O O
the O O O O
reduction O O O O
in O O O O
histone O O O O
acetylation O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
is O O O O
the O O O O
first O O O O
report O O O O
demonstrating O O O O
a O O O O
link O O O O
between O O O O
sexual O O O O
development O O O O
and O O O O
ACL O O O O
- O O O O
mediated O O O O
histone O O O O
acetylation O O O O
in O O O O
fungi O O O O
. O O O O
    
Expression O O O O
of O O O O
a O O O O
Brassica B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
napus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
heme O O O O
oxygenase O O O O
confers O O O O
plant O O O O
tolerance O O O O
to O O O O
mercury O O O O
toxicity O O O O
. O O O O
    
Plant O O O O
heme O O O O
oxygenases O O O O
( O O O O
HOs O O O O
) O O O O
regulate O O O O
biosynthesis O O O O
of O O O O
phytochrome O O O O
which O O O O
accounts O O O O
for O O O O
photo O O O O
- O O O O
acceptance O O O O
and O O O O
- O O O O
morphogenesis O O O O
. O O O O
    
Recent O O O O
studies O O O O
have O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
plant O O O O
HOs O O O O
also O O O O
regulate O O O O
many O O O O
other O O O O
physiological O O O O
processes O O O O
including O O O O
response O O O O
to O O O O
environmental O O O O
stimuli O O O O
. O O O O
    
To O O O O
elucidate O O O O
the O O O O
mechanism O O O O
by O O O O
which O O O O
HOs O O O O
regulate O O O O
plant O O O O
adaptation O O O O
to O O O O
heavy O O O O
metal O O O O
exposure O O O O
, O O O O
three O O O O
novel O O O O
HOs O O O O
genes O O O O
were O O O O
isolated O O O O
from O O O O
rapeseed B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
Brassica B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
napus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
and O O O O
their O O O O
expression O O O O
patterns O O O O
were O O O O
analysed O O O O
. O O O O
    
Alignment O O O O
of O O O O
deduced O O O O
protein O O O O
sequences O O O O
revealed O O O O
that O O O O
the O O O O
three O O O O
BnHOs O O O O
share O O O O
high O O O O
identity O O O O
with O O O O
their O O O O
corresponding O O O O
orthologos O O O O
( O O O O
AtHO1 O O O O
- O O O O
3 O O O O
) O O O O
from O O O O
Arabidopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
To O O O O
investigate O O O O
whether O O O O
the O O O O
BnHO O O O O
regulates O O O O
plant O O O O
tolerance O O O O
to O O O O
Hg O O O O
toxicity O O O O
, O O O O
we O O O O
constructed O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
napus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
transgenic O O O O
plants O O O O
overexpressing O O O O
BnHO O O O O
- O O O O
1 O O O O
. O O O O
    
Under O O O O
Hg O O O O
stress O O O O
, O O O O
the O O O O
transgenic O O O O
plants O O O O
had O O O O
1 O O O O
. O O O O
41 O O O O
- O O O O
1 O O O O
. O O O O
59 O O O O
folds O O O O
higher O O O O
biomass O O O O
than O O O O
the O O O O
untransformants O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
overexpression O O O O
of O O O O
BnHO O O O O
- O O O O
1 O O O O
resulted O O O O
in O O O O
less O O O O
accumulation O O O O
of O O O O
Hg O O O O
in O O O O
some O O O O
lines O O O O
of O O O O
transformants O O O O
than O O O O
in O O O O
untransformants O O O O
. O O O O
    
The O O O O
transgenic O O O O
plants O O O O
show O O O O
lower O O O O
abundance O O O O
of O O O O
reactive O O O O
oxygen O O O O
species O O O O
and O O O O
attenuated O O O O
oxidative O O O O
injury O O O O
compared O O O O
with O O O O
the O O O O
untransgenic O O O O
plants O O O O
. O O O O
    
We O O O O
cloned O O O O
the O O O O
promoter O O O O
sequences O O O O
of O O O O
BnHO O O O O
- O O O O
1 O O O O
from O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
napus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Analysis O O O O
revealed O O O O
that O O O O
the O O O O
1119 O O O O
bp O O O O
fragment O O O O
contains O O O O
a O O O O
conserved O O O O
Cd O O O O
responsive O O O O
element O O O O
( O O O O
CdRE O O O O
) O O O O
and O O O O
others O O O O
responding O O O O
to O O O O
multiple O O O O
environmental O O O O
stimuli O O O O
. O O O O
    
Transient O O O O
expression O O O O
in O O O O
tobacco B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
leaves O O O O
showed O O O O
differential O O O O
responses O O O O
to O O O O
heavy O O O O
metals O O O O
( O O O O
Zn O O O O
, O O O O
Cu O O O O
, O O O O
Pb O O O O
, O O O O
Hg O O O O
and O O O O
Cd O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
rate O O O O
- O O O O
limiting O O O O
step O O O O
for O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
assimilation O O O O
at O O O O
different O O O O
temperatures O O O O
is O O O O
influenced O O O O
by O O O O
the O O O O
leaf O O O O
nitrogen O O O O
content O O O O
in O O O O
several O O O O
C O O O O
( O O O O
3 O O O O
) O O O O
crop O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Effects O O O O
of O O O O
nitrogen O O O O
( O O O O
N O O O O
) O O O O
supply O O O O
on O O O O
the O O O O
limiting O O O O
step O O O O
of O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
assimilation O O O O
rate O O O O
( O O O O
A O O O O
) O O O O
at O O O O
380 O O O O
mumol O O O O
mol O O O O
( O O O O
- O O O O
1 O O O O
) O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
concentration O O O O
( O O O O
A O O O O
( O O O O
380 O O O O
) O O O O
) O O O O
at O O O O
several O O O O
leaf O O O O
temperatures O O O O
were O O O O
studied O O O O
in O O O O
several O O O O
crops O O O O
, O O O O
since O O O O
N O O O O
nutrition O O O O
alters O O O O
N O O O O
allocation O O O O
between O O O O
photosynthetic O O O O
components O O O O
. O O O O
    
Contents O O O O
of O O O O
leaf O O O O
N O O O O
, O O O O
ribulose O O O O
1 O O O O
* O O O O
5 O O O O
- O O O O
bisphosphate O O O O
carboxylase O O O O
/ O O O O
oxygenase O O O O
( O O O O
Rubisco O O O O
) O O O O
and O O O O
cytochrome O O O O
f O O O O
( O O O O
cyt O O O O
f O O O O
) O O O O
increased O O O O
with O O O O
increasing O O O O
N O O O O
supply O O O O
, O O O O
but O O O O
the O O O O
cyt O O O O
f O O O O
/ O O O O
Rubisco O O O O
ratio O O O O
decreased O O O O
. O O O O
    
Large O O O O
leaf O O O O
N O O O O
content O O O O
was O O O O
linked O O O O
to O O O O
a O O O O
high O O O O
stomatal O O O O
( O O O O
g O O O O
( O O O O
s O O O O
) O O O O
) O O O O
and O O O O
mesophyll O O O O
conductance O O O O
( O O O O
g O O O O
( O O O O
m O O O O
) O O O O
) O O O O
, O O O O
but O O O O
resulted O O O O
in O O O O
a O O O O
lower O O O O
intercellular O O O O
( O O O O
C O O O O
( O O O O
i O O O O
) O O O O
) O O O O
and O O O O
chloroplast O O O O
CO O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
concentration O O O O
( O O O O
C O O O O
( O O O O
c O O O O
) O O O O
) O O O O
because O O O O
the O O O O
increase O O O O
in O O O O
g O O O O
( O O O O
s O O O O
) O O O O
and O O O O
g O O O O
( O O O O
m O O O O
) O O O O
was O O O O
insufficient O O O O
to O O O O
compensate O O O O
for O O O O
change O O O O
in O O O O
A O O O O
( O O O O
380 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
A O O O O
- O O O O
C O O O O
( O O O O
c O O O O
) O O O O
response O O O O
was O O O O
used O O O O
to O O O O
estimate O O O O
the O O O O
maximum O O O O
rate O O O O
of O O O O
RuBP O O O O
carboxylation O O O O
( O O O O
V O O O O
( O O O O
cmax O O O O
) O O O O
) O O O O
and O O O O
chloroplast O O O O
electron O O O O
transport O O O O
( O O O O
J O O O O
( O O O O
max O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
J O O O O
( O O O O
max O O O O
) O O O O
/ O O O O
V O O O O
( O O O O
cmax O O O O
) O O O O
ratio O O O O
decreased O O O O
with O O O O
reductions O O O O
in O O O O
leaf O O O O
N O O O O
content O O O O
, O O O O
which O O O O
was O O O O
consistent O O O O
with O O O O
the O O O O
results O O O O
of O O O O
the O O O O
cyt O O O O
f O O O O
/ O O O O
Rubisco O O O O
ratio O O O O
. O O O O
    
Analysis O O O O
using O O O O
the O O O O
C O O O O
( O O O O
3 O O O O
) O O O O
photosynthesis O O O O
model O O O O
indicated O O O O
that O O O O
A O O O O
( O O O O
380 O O O O
) O O O O
tended O O O O
to O O O O
be O O O O
limited O O O O
by O O O O
RuBP O O O O
carboxylation O O O O
in O O O O
plants O O O O
grown O O O O
at O O O O
low O O O O
N O O O O
concentration O O O O
, O O O O
whereas O O O O
it O O O O
was O O O O
limited O O O O
by O O O O
RuBP O O O O
regeneration O O O O
in O O O O
plants O O O O
grown O O O O
at O O O O
high O O O O
N O O O O
concentration O O O O
. O O O O
    
We O O O O
conclude O O O O
that O O O O
the O O O O
limiting O O O O
step O O O O
of O O O O
A O O O O
( O O O O
380 O O O O
) O O O O
depends O O O O
on O O O O
leaf O O O O
N O O O O
content O O O O
and O O O O
is O O O O
mainly O O O O
determined O O O O
by O O O O
N O O O O
partitioning O O O O
between O O O O
Rubisco O O O O
and O O O O
electron O O O O
transport O O O O
components O O O O
. O O O O
    
Comparative O O O O
ionomics O O O O
and O O O O
metabolomics O O O O
in O O O O
extremophile O O O O
and O O O O
glycophytic O O O O
Lotus O O O O
species O O O O
under O O O O
salt O O O O
stress O O O O
challenge O O O O
the O O O O
metabolic O O O O
pre O O O O
- O O O O
adaptation O O O O
hypothesis O O O O
. O O O O
    
The O O O O
legume O O O O
genus O O O O
Lotus O O O O
includes O O O O
glycophytic O O O O
forage O O O O
crops O O O O
and O O O O
other O O O O
species O O O O
adapted O O O O
to O O O O
extreme O O O O
environments O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
saline O O O O
soils O O O O
. O O O O
    
Understanding O O O O
salt O O O O
tolerance O O O O
mechanisms O O O O
will O O O O
contribute O O O O
to O O O O
the O O O O
discovery O O O O
of O O O O
new O O O O
traits O O O O
which O O O O
may O O O O
enhance O O O O
the O O O O
breeding O O O O
efforts O O O O
towards O O O O
improved O O O O
performance O O O O
of O O O O
legumes O O O O
in O O O O
marginal O O O O
agricultural O O O O
environments O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
, O O O O
we O O O O
used O O O O
a O O O O
combination O O O O
of O O O O
ionomic O O O O
and O O O O
gas O O O O
chromatography O O O O
- O O O O
mass O O O O
spectrometry O O O O
( O O O O
GC O O O O
- O O O O
MS O O O O
) O O O O
- O O O O
based O O O O
metabolite O O O O
profilings O O O O
of O O O O
complete O O O O
shoots O O O O
( O O O O
pooling O O O O
leaves O O O O
, O O O O
petioles O O O O
and O O O O
stems O O O O
) O O O O
to O O O O
compare O O O O
the O O O O
extremophile O O O O
Lotus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
creticus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
adapted O O O O
to O O O O
highly O O O O
saline O O O O
coastal O O O O
regions O O O O
, O O O O
and O O O O
two O O O O
cultivated O O O O
glycophytic O O O O
grassland O O O O
forage O O O O
species O O O O
, O O O O
Lotus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
corniculatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Lotus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tenuis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
L B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
creticus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
exhibited O O O O
better O O O O
survival O O O O
after O O O O
exposure O O O O
to O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
lethal O O O O
salinity O O O O
and O O O O
was O O O O
more O O O O
efficient O O O O
at O O O O
excluding O O O O
Cl O O O O
- O O O O
from O O O O
the O O O O
shoots O O O O
than O O O O
the O O O O
glycophytes O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
, O O O O
Na O O O O
+ O O O O
levels O O O O
were O O O O
higher O O O O
in O O O O
the O O O O
extremophile O O O O
under O O O O
both O O O O
control O O O O
and O O O O
salt O O O O
stress O O O O
, O O O O
a O O O O
trait O O O O
often O O O O
observed O O O O
in O O O O
halophytes O O O O
. O O O O
    
Ionomics O O O O
demonstrated O O O O
a O O O O
differential O O O O
rearrangement O O O O
of O O O O
shoot O O O O
nutrient O O O O
levels O O O O
in O O O O
the O O O O
extremophile O O O O
upon O O O O
salt O O O O
exposure O O O O
. O O O O
    
Metabolite O O O O
profiling O O O O
showed O O O O
that O O O O
responses O O O O
to O O O O
NaCl O O O O
in O O O O
L B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
creticus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
shoots O O O O
were O O O O
globally O O O O
similar O O O O
to O O O O
those O O O O
of O O O O
the O O O O
glycophytes O O O O
, O O O O
providing O O O O
little O O O O
evidence O O O O
for O O O O
metabolic O O O O
pre O O O O
- O O O O
adaptation O O O O
to O O O O
salinity O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
is O O O O
the O O O O
first O O O O
comparing O O O O
salt O O O O
acclimation O O O O
responses O O O O
between O O O O
extremophile O O O O
and O O O O
non O O O O
- O O O O
extremophile O O O O
legumes O O O O
, O O O O
and O O O O
challenges O O O O
the O O O O
generalization O O O O
of O O O O
the O O O O
metabolic O O O O
salt O O O O
pre O O O O
- O O O O
adaptation O O O O
hypothesis O O O O
. O O O O
    
The O O O O
rise O O O O
of O O O O
chronic O O O O
non O O O O
- O O O O
communicable O O O O
diseases O O O O
in O O O O
southeast O O O O
Asia O O O O
: O O O O
time O O O O
for O O O O
action O O O O
. O O O O
    
Southeast O O O O
Asia O O O O
faces O O O O
an O O O O
epidemic O O O O
of O O O O
chronic O O O O
non O O O O
- O O O O
communicable O O O O
diseases O O O O
, O O O O
now O O O O
responsible O O O O
for O O O O
60 O O O O
% O O O O
of O O O O
deaths O O O O
in O O O O
the O O O O
region O O O O
. O O O O
    
The O O O O
problem O O O O
stems O O O O
from O O O O
environmental O O O O
factors O O O O
that O O O O
promote O O O O
tobacco B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
use O O O O
, O O O O
unhealthy O O O O
diet O O O O
, O O O O
and O O O O
inadequate O O O O
physical O O O O
activity O O O O
. O O O O
    
Disadvantaged O O O O
populations O O O O
are O O O O
the O O O O
hardest O O O O
hit O O O O
, O O O O
with O O O O
death O O O O
rates O O O O
inversely O O O O
proportional O O O O
to O O O O
a O O O O
country O O O O
' O O O O
s O O O O
gross O O O O
national O O O O
income O O O O
. O O O O
    
Families O O O O
shoulder O O O O
the O O O O
financial O O O O
burden O O O O
, O O O O
but O O O O
entire O O O O
economies O O O O
suffer O O O O
as O O O O
well O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
attempts O O O O
to O O O O
control O O O O
non O O O O
- O O O O
communicable O O O O
diseases O O O O
are O O O O
increasing O O O O
, O O O O
more O O O O
needs O O O O
to O O O O
be O O O O
done O O O O
. O O O O
    
Health O O O O
- O O O O
care O O O O
systems O O O O
need O O O O
to O O O O
be O O O O
redesigned O O O O
to O O O O
deliver O O O O
chronic O O O O
care O O O O
that O O O O
is O O O O
founded O O O O
on O O O O
existing O O O O
primary O O O O
health O O O O
- O O O O
care O O O O
facilities O O O O
, O O O O
but O O O O
supported O O O O
by O O O O
good O O O O
referral O O O O
systems O O O O
. O O O O
    
Surveillance O O O O
of O O O O
key O O O O
modifiable O O O O
risk O O O O
factors O O O O
is O O O O
needed O O O O
to O O O O
monitor O O O O
the O O O O
magnitude O O O O
of O O O O
the O O O O
problem O O O O
and O O O O
to O O O O
study O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
interventions O O O O
. O O O O
    
All O O O O
branches O O O O
of O O O O
government O O O O
and O O O O
all O O O O
sectors O O O O
of O O O O
society O O O O
have O O O O
to O O O O
get O O O O
involved O O O O
in O O O O
establishing O O O O
environments O O O O
that O O O O
are O O O O
conducive O O O O
to O O O O
healthy O O O O
living O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Association O O O O
of O O O O
Southeast O O O O
Asian O O O O
Nations O O O O
is O O O O
in O O O O
a O O O O
unique O O O O
position O O O O
to O O O O
make O O O O
a O O O O
united O O O O
stand O O O O
against O O O O
chronic O O O O
non O O O O
- O O O O
communicable O O O O
diseases O O O O
in O O O O
the O O O O
region O O O O
. O O O O
    
Inaction O O O O
will O O O O
affect O O O O
millions O O O O
of O O O O
lives O O O O
- O O O O
often O O O O
, O O O O
the O O O O
lives O O O O
of O O O O
those O O O O
who O O O O
have O O O O
the O O O O
least O O O O
. O O O O
    
Aberrant O O O O
genome O O O O
size O O O O
and O O O O
instability O O O O
of O O O O
Phytophthora B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ramorum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
oospore O O O O
progenies O O O O
. O O O O
    
The O O O O
functionality O O O O
of O O O O
the O O O O
sexual O O O O
cycle O O O O
in O O O O
the O O O O
heterothallic O O O O
pathogen O O O O
Phytophthora B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ramorum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
causal O O O O
agent O O O O
of O O O O
Sudden O O O O
Oak O O O O
Death O O O O
, O O O O
has O O O O
recently O O O O
been O O O O
demonstrated O O O O
. O O O O
    
Sexual O O O O
reproduction O O O O
could O O O O
create O O O O
genotypic O O O O
variation O O O O
and O O O O
increase O O O O
the O O O O
pathogen O O O O
' O O O O
s O O O O
ability O O O O
to O O O O
adapt O O O O
to O O O O
other O O O O
host O O O O
plants O O O O
or O O O O
changing O O O O
environments O O O O
. O O O O
    
Genetic O O O O
characterization O O O O
using O O O O
co O O O O
- O O O O
dominant O O O O
microsatellite O O O O
markers O O O O
and O O O O
flow O O O O
cytometry O O O O
of O O O O
single O O O O
- O O O O
oospore O O O O
progeny O O O O
of O O O O
crosses O O O O
between O O O O
a O O O O
European O O O O
A1 O O O O
isolate O O O O
and O O O O
North O O O O
American O O O O
or O O O O
European O O O O
A2 O O O O
isolates O O O O
revealed O O O O
a O O O O
considerable O O O O
number O O O O
of O O O O
non O O O O
- O O O O
Mendelian O O O O
inheritance O O O O
events O O O O
. O O O O
    
This O O O O
includes O O O O
inheritance O O O O
of O O O O
more O O O O
than O O O O
two O O O O
alleles O O O O
at O O O O
a O O O O
locus O O O O
and O O O O
non O O O O
- O O O O
inheritance O O O O
of O O O O
alleles O O O O
from O O O O
one O O O O
parent O O O O
at O O O O
another O O O O
locus O O O O
. O O O O
    
The O O O O
progenies O O O O
were O O O O
mitotically O O O O
unstable O O O O
: O O O O
zoospore O O O O
and O O O O
hyphal O O O O
tip O O O O
derivatives O O O O
of O O O O
the O O O O
progenies O O O O
showed O O O O
genotypic O O O O
rearrangements O O O O
and O O O O
phenotypic O O O O
variation O O O O
. O O O O
    
Flow O O O O
cytometry O O O O
confirmed O O O O
variation O O O O
and O O O O
instability O O O O
in O O O O
DNA O O O O
content O O O O
of O O O O
the O O O O
single O O O O
- O O O O
oospore O O O O
progenies O O O O
. O O O O
    
This O O O O
indicates O O O O
that O O O O
single O O O O
- O O O O
oospore O O O O
progenies O O O O
not O O O O
only O O O O
display O O O O
aberrant O O O O
genomic O O O O
and O O O O
phenotypic O O O O
variation O O O O
due O O O O
to O O O O
meiotic O O O O
irregularities O O O O
, O O O O
but O O O O
also O O O O
extra O O O O
variation O O O O
as O O O O
a O O O O
result O O O O
of O O O O
post O O O O
- O O O O
meiotic O O O O
genomic O O O O
rearrangements O O O O
. O O O O
    
Independent O O O O
duplications O O O O
of O O O O
alpha O O O O
- O O O O
amylase O O O O
in O O O O
different O O O O
strains O O O O
of O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
oryzae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
oryzae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
a O O O O
filamentous O O O O
fungus O O O O
that O O O O
has O O O O
arisen O O O O
through O O O O
the O O O O
ancient O O O O
domestication O O O O
of O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
flavus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
for O O O O
making O O O O
traditional O O O O
oriental O O O O
foods O O O O
and O O O O
beverages O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
many O O O O
centuries O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
oryzae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
has O O O O
been O O O O
used O O O O
for O O O O
fermenting O O O O
the O O O O
starch O O O O
in O O O O
rice O O O O
to O O O O
simple O O O O
sugars O O O O
, O O O O
it O O O O
has O O O O
undergone O O O O
selection O O O O
for O O O O
increased O O O O
secretion O O O O
of O O O O
starch O O O O
- O O O O
degrading O O O O
enzymes O O O O
. O O O O
    
In O O O O
particular O O O O
, O O O O
all O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
oryzae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strains O O O O
investigated O O O O
thus O O O O
far O O O O
have O O O O
two O O O O
or O O O O
more O O O O
copies O O O O
of O O O O
a O O O O
gene O O O O
encoding O O O O
alpha O O O O
- O O O O
amylase O O O O
, O O O O
whereas O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
flavus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
has O O O O
only O O O O
one O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
investigate O O O O
the O O O O
duplications O O O O
leading O O O O
to O O O O
these O O O O
copies O O O O
in O O O O
three O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
oryzae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
strains O O O O
. O O O O
    
We O O O O
find O O O O
evidence O O O O
of O O O O
at O O O O
least O O O O
three O O O O
separate O O O O
duplications O O O O
of O O O O
alpha O O O O
- O O O O
amylase O O O O
, O O O O
an O O O O
example O O O O
of O O O O
parallel O O O O
evolution O O O O
in O O O O
a O O O O
micro O O O O
- O O O O
organism O O O O
under O O O O
artificial O O O O
selection O O O O
. O O O O
    
At O O O O
least O O O O
two O O O O
of O O O O
these O O O O
duplications O O O O
appear O O O O
to O O O O
be O O O O
associated O O O O
with O O O O
activity O O O O
of O O O O
transposable O O O O
elements O O O O
of O O O O
the O O O O
Tc1 O O O O
/ O O O O
mariner O O O O
class O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
involve O O O O
a O O O O
9 O O O O
. O O O O
1 O O O O
kb O O O O
element O O O O
that O O O O
terminates O O O O
in O O O O
inverted O O O O
repeats O O O O
, O O O O
encodes O O O O
a O O O O
putative O O O O
transposase O O O O
and O O O O
another O O O O
putative O O O O
protein O O O O
of O O O O
unknown O O O O
function O O O O
, O O O O
and O O O O
contains O O O O
an O O O O
unusual O O O O
arrangement O O O O
of O O O O
four O O O O
short O O O O
internal O O O O
imperfect O O O O
repeats O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
unusual O O O O
Mariners O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
of O O O O
this O O O O
size O O O O
have O O O O
previously O O O O
been O O O O
identified O O O O
in O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
oryzae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fumigatus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
nidulans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
this O O O O
is O O O O
the O O O O
first O O O O
evidence O O O O
we O O O O
know O O O O
of O O O O
that O O O O
at O O O O
least O O O O
some O O O O
of O O O O
them O O O O
are O O O O
active O O O O
in O O O O
modern O O O O
times O O O O
and O O O O
that O O O O
their O O O O
activity O O O O
can O O O O
contribute O O O O
to O O O O
beneficial O O O O
genetic O O O O
changes O O O O
. O O O O
    
Response O O O O
of O O O O
ecosystems O O O O
to O O O O
realistic O O O O
extinction O O O O
sequences O O O O
. O O O O
    
Recent O O O O
research O O O O
suggests O O O O
that O O O O
effects O O O O
of O O O O
species O O O O
loss O O O O
on O O O O
the O O O O
structure O O O O
and O O O O
functioning O O O O
of O O O O
ecosystems O O O O
will O O O O
critically O O O O
depend O O O O
on O O O O
the O O O O
order O O O O
with O O O O
which O O O O
species O O O O
go O O O O
extinct O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
there O O O O
are O O O O
few O O O O
studies O O O O
of O O O O
the O O O O
response O O O O
of O O O O
natural O O O O
ecosystems O O O O
to O O O O
realistic O O O O
extinction O O O O
sequences O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
an O O O O
extinction O O O O
scenario O O O O
based O O O O
on O O O O
the O O O O
International O O O O
Union O O O O
for O O O O
Conservation O O O O
of O O O O
Nature O O O O
( O O O O
IUCN O O O O
) O O O O
Red O O O O
List O O O O
, O O O O
de O O O O
Visser O O O O
et O O O O
al O O O O
. O O O O
sequentially O O O O
deleted O O O O
species O O O O
from O O O O
a O O O O
topological O O O O
model O O O O
of O O O O
the O O O O
Serengeti O O O O
food O O O O
web O O O O
. O O O O
    
Under O O O O
this O O O O
scenario O O O O
, O O O O
large O O O O
- O O O O
bodied O O O O
species O O O O
like O O O O
top O O O O
predators O O O O
and O O O O
mega O O O O
- O O O O
herbivores O O O O
go O O O O
extinct O O O O
first O O O O
. O O O O
    
The O O O O
resulting O O O O
changes O O O O
in O O O O
the O O O O
trophic O O O O
structure O O O O
of O O O O
the O O O O
food O O O O
web O O O O
might O O O O
affect O O O O
the O O O O
robustness O O O O
of O O O O
the O O O O
ecosystem O O O O
to O O O O
future O O O O
disturbances O O O O
. O O O O
    
Host O O O O
characteristics O O O O
and O O O O
environmental O O O O
factors O O O O
differentially O O O O
drive O O O O
the O O O O
burden O O O O
and O O O O
pathogenicity O O O O
of O O O O
an O O O O
ectoparasite O O O O
: O O O O
a O O O O
multilevel O O O O
causal O O O O
analysis O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Understanding O O O O
the O O O O
ecological O O O O
factors O O O O
driving O O O O
the O O O O
burden O O O O
and O O O O
pathogenicity O O O O
of O O O O
parasites O O O O
is O O O O
challenging O O O O
. O O O O
    
Indeed O O O O
, O O O O
the O O O O
dynamics O O O O
of O O O O
host O O O O
- O O O O
parasite O O O O
interactions O O O O
is O O O O
driven O O O O
by O O O O
factors O O O O
organized O O O O
across O O O O
nested O O O O
hierarchical O O O O
levels O O O O
( O O O O
e O O O O
. O O O O
g O O O O
. O O O O
hosts O O O O
, O O O O
localities O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
indirect O O O O
effects O O O O
are O O O O
expected O O O O
owing O O O O
to O O O O
interactions O O O O
between O O O O
levels O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
we O O O O
combined O O O O
Bayesian O O O O
multilevel O O O O
models O O O O
, O O O O
path O O O O
analyses O O O O
and O O O O
a O O O O
model O O O O
selection O O O O
procedure O O O O
to O O O O
account O O O O
for O O O O
these O O O O
complexities O O O O
and O O O O
to O O O O
decipher O O O O
the O O O O
relative O O O O
effects O O O O
of O O O O
host O O O O
- O O O O
and O O O O
environment O O O O
- O O O O
related O O O O
factors O O O O
on O O O O
the O O O O
burden O O O O
and O O O O
the O O O O
pathogenicity O O O O
of O O O O
an O O O O
ectoparasite O O O O
( O O O O
Tracheliastes O O O O
polycolpus O O O O
) O O O O
on O O O O
its O O O O
fish O O O O
host O O O O
( O O O O
Leuciscus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
leuciscus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
tested O O O O
the O O O O
year O O O O
- O O O O
to O O O O
- O O O O
year O O O O
consistency O O O O
of O O O O
the O O O O
relationships O O O O
linking O O O O
these O O O O
factors O O O O
to O O O O
the O O O O
burden O O O O
and O O O O
the O O O O
pathogenic O O O O
effects O O O O
of O O O O
T O O O O
. O O O O
polycolpus O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
significant O O O O
relationships O O O O
between O O O O
the O O O O
parasite O O O O
burden O O O O
and O O O O
host O O O O
- O O O O
related O O O O
factors O O O O
: O O O O
body O O O O
length O O O O
and O O O O
age O O O O
were O O O O
positively O O O O
related O O O O
to O O O O
parasite O O O O
burden O O O O
and O O O O
heterozygous O O O O
hosts O O O O
displayed O O O O
a O O O O
higher O O O O
parasite O O O O
burden O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
, O O O O
both O O O O
host O O O O
- O O O O
and O O O O
environment O O O O
- O O O O
related O O O O
factors O O O O
were O O O O
linked O O O O
to O O O O
pathogenic O O O O
effects O O O O
. O O O O
    
Pathogenicity O O O O
was O O O O
correlated O O O O
negatively O O O O
with O O O O
host O O O O
body O O O O
length O O O O
and O O O O
positively O O O O
with O O O O
age O O O O
; O O O O
this O O O O
illustrates O O O O
that O O O O
some O O O O
factors O O O O
( O O O O
e O O O O
. O O O O
g O O O O
. O O O O
body O O O O
length O O O O
) O O O O
showed O O O O
inverse O O O O
relationships O O O O
with O O O O
parasite O O O O
burden O O O O
and O O O O
pathogenicity O O O O
. O O O O
    
Pathogenic O O O O
effects O O O O
were O O O O
stronger O O O O
in O O O O
cooler O O O O
upstream O O O O
sites O O O O
and O O O O
where O O O O
host O O O O
density O O O O
was O O O O
lower O O O O
. O O O O
    
Path O O O O
analyses O O O O
revealed O O O O
that O O O O
these O O O O
relationships O O O O
between O O O O
environment O O O O
- O O O O
related O O O O
factors O O O O
and O O O O
pathogenic O O O O
effects O O O O
were O O O O
direct O O O O
and O O O O
were O O O O
not O O O O
indirect O O O O
relationships O O O O
mediated O O O O
by O O O O
the O O O O
host O O O O
characteristics O O O O
. O O O O
    
Finally O O O O
, O O O O
we O O O O
found O O O O
that O O O O
the O O O O
strength O O O O
and O O O O
the O O O O
shape O O O O
of O O O O
certain O O O O
relationships O O O O
were O O O O
consistent O O O O
across O O O O
years O O O O
, O O O O
while O O O O
they O O O O
were O O O O
clearly O O O O
not O O O O
for O O O O
some O O O O
others O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
study O O O O
illustrates O O O O
that O O O O
considering O O O O
conjointly O O O O
causal O O O O
relationships O O O O
among O O O O
factors O O O O
and O O O O
the O O O O
hierarchical O O O O
structure O O O O
of O O O O
host O O O O
- O O O O
parasite O O O O
interactions O O O O
is O O O O
appropriate O O O O
for O O O O
dissecting O O O O
the O O O O
complex O O O O
links O O O O
between O O O O
hosts O O O O
, O O O O
parasites O O O O
and O O O O
their O O O O
common O O O O
environment O O O O
. O O O O
    
Experimental O O O O
evidence O O O O
for O O O O
emergent O O O O
facilitation O O O O
: O O O O
promoting O O O O
the O O O O
existence O O O O
of O O O O
an O O O O
invertebrate O O O O
predator O O O O
by O O O O
killing O O O O
its O O O O
prey O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Recent O O O O
theoretical O O O O
insights O O O O
have O O O O
shown O O O O
that O O O O
predator O O O O
species O O O O
may O O O O
help O O O O
each O O O O
other O O O O
to O O O O
persist O O O O
by O O O O
size O O O O
- O O O O
selective O O O O
foraging O O O O
on O O O O
a O O O O
shared O O O O
prey O O O O
. O O O O
    
By O O O O
feeding O O O O
on O O O O
a O O O O
certain O O O O
prey O O O O
stage O O O O
, O O O O
a O O O O
predator O O O O
may O O O O
induce O O O O
a O O O O
compensatory O O O O
response O O O O
in O O O O
another O O O O
stage O O O O
of O O O O
the O O O O
same O O O O
prey O O O O
species O O O O
, O O O O
thereby O O O O
favouring O O O O
other O O O O
predators O O O O
; O O O O
a O O O O
phenomenon O O O O
referred O O O O
to O O O O
as O O O O
emergent O O O O
facilitation O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
To O O O O
test O O O O
whether O O O O
emergent O O O O
facilitation O O O O
may O O O O
occur O O O O
in O O O O
a O O O O
natural O O O O
system O O O O
, O O O O
we O O O O
performed O O O O
an O O O O
enclosure O O O O
experiment O O O O
where O O O O
we O O O O
mimicked O O O O
fish O O O O
predation O O O O
by O O O O
selectively O O O O
removing O O O O
large O O O O
zooplankton O O O O
and O O O O
subsequently O O O O
following O O O O
the O O O O
response O O O O
of O O O O
the O O O O
invertebrate O O O O
predator O O O O
Bythotrephes B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
longimanus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Positive O O O O
responses O O O O
to O O O O
harvest O O O O
were O O O O
observed O O O O
in O O O O
the O O O O
biomass O O O O
of O O O O
juvenile O O O O
individuals O O O O
of O O O O
the O O O O
dominant O O O O
zooplankton O O O O
Holopedium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
gibberum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
in O O O O
Bythotrephes O O O O
densities O O O O
. O O O O
    
Hence O O O O
, O O O O
by O O O O
removing O O O O
large O O O O
prey O O O O
, O O O O
we O O O O
increased O O O O
the O O O O
biomass O O O O
of O O O O
small O O O O
prey O O O O
, O O O O
i O O O O
. O O O O
e O O O O
. O O O O
stage O O O O
- O O O O
specific O O O O
biomass O O O O
overcompensation O O O O
was O O O O
present O O O O
in O O O O
the O O O O
juvenile O O O O
stage O O O O
of O O O O
Holopedium O O O O
. O O O O
    
This O O O O
favoured O O O O
Bythotrephes O O O O
, O O O O
which O O O O
preferentially O O O O
feed O O O O
on O O O O
small O O O O
Holopedium O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
argue O O O O
that O O O O
the O O O O
stage O O O O
- O O O O
specific O O O O
overcompensation O O O O
occurred O O O O
as O O O O
a O O O O
result O O O O
of O O O O
increased O O O O
per O O O O
capita O O O O
fecundity O O O O
of O O O O
adult O O O O
Holopedium O O O O
and O O O O
as O O O O
a O O O O
result O O O O
of O O O O
competitive O O O O
release O O O O
following O O O O
harvest O O O O
. O O O O
    
If O O O O
shown O O O O
to O O O O
be O O O O
common O O O O
, O O O O
emergent O O O O
facilitation O O O O
may O O O O
be O O O O
a O O O O
major O O O O
mechanism O O O O
behind O O O O
observed O O O O
predator O O O O
extinctions O O O O
and O O O O
patterns O O O O
of O O O O
predator O O O O
invasions O O O O
. O O O O
    
A O O O O
clone O O O O
- O O O O
based O O O O
transcriptomics O O O O
approach O O O O
for O O O O
the O O O O
identification O O O O
of O O O O
genes O O O O
relevant O O O O
for O O O O
itaconic O O O O
acid O O O O
production O O O O
in O O O O
Aspergillus O O O O
. O O O O
    
Several O O O O
Aspergillus O O O O
species O O O O
are O O O O
well O O O O
- O O O O
known O O O O
for O O O O
the O O O O
production O O O O
of O O O O
a O O O O
variety O O O O
of O O O O
organic O O O O
acids O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
study O O O O
, O O O O
a O O O O
cloned O O O O
based O O O O
transcriptomics O O O O
approach O O O O
was O O O O
used O O O O
to O O O O
identify O O O O
genes O O O O
crucial O O O O
in O O O O
the O O O O
biosynthesis O O O O
pathway O O O O
for O O O O
one O O O O
of O O O O
these O O O O
acids O O O O
, O O O O
itaconic O O O O
acid O O O O
. O O O O
    
From O O O O
a O O O O
number O O O O
of O O O O
different O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
terreus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
controlled O O O O
batch O O O O
fermentations O O O O
, O O O O
those O O O O
cultures O O O O
with O O O O
the O O O O
largest O O O O
difference O O O O
in O O O O
itaconic O O O O
acid O O O O
titer O O O O
and O O O O
productivity O O O O
were O O O O
selected O O O O
for O O O O
mRNA O O O O
isolation O O O O
. O O O O
    
cDNAs O O O O
derived O O O O
from O O O O
these O O O O
mRNA O O O O
samples O O O O
were O O O O
used O O O O
for O O O O
subsequent O O O O
hybridization O O O O
of O O O O
glass O O O O
slide O O O O
arrays O O O O
based O O O O
on O O O O
a O O O O
collection O O O O
of O O O O
5000 O O O O
cDNA O O O O
clones O O O O
. O O O O
    
A O O O O
selection O O O O
of O O O O
13 O O O O
cDNA O O O O
clones O O O O
resulting O O O O
in O O O O
the O O O O
strongest O O O O
( O O O O
> O O O O
10 O O O O
- O O O O
fold O O O O
) O O O O
differential O O O O
hybridization O O O O
signals O O O O
were O O O O
identified O O O O
and O O O O
subsequently O O O O
the O O O O
inserts O O O O
of O O O O
these O O O O
clones O O O O
were O O O O
sequenced O O O O
. O O O O
    
Sequence O O O O
analysis O O O O
revealed O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
in O O O O
total O O O O
five O O O O
different O O O O
gene O O O O
inserts O O O O
among O O O O
the O O O O
sequenced O O O O
clones O O O O
. O O O O
    
From O O O O
one O O O O
of O O O O
these O O O O
sequences O O O O
, O O O O
encoding O O O O
a O O O O
gene O O O O
of O O O O
the O O O O
MmgE O O O O
- O O O O
PrpD O O O O
family O O O O
, O O O O
the O O O O
full O O O O
length O O O O
coding O O O O
region O O O O
was O O O O
shown O O O O
to O O O O
encode O O O O
one O O O O
of O O O O
the O O O O
crucial O O O O
itaconic O O O O
acid O O O O
pathway O O O O
enzymes O O O O
cis O O O O
- O O O O
aconitate O O O O
decarboxylase O O O O
, O O O O
by O O O O
heterologous O O O O
expression O O O O
in O O O O
Escherichia O O O O
coli O O O O
. O O O O
    
Expression O O O O
of O O O O
this O O O O
gene O O O O
in O O O O
Aspergillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
niger O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
which O O O O
is O O O O
a O O O O
natural O O O O
citric O O O O
acid O O O O
producer O O O O
, O O O O
resulted O O O O
in O O O O
itaconate O O O O
production O O O O
. O O O O
    
Genome O O O O
analysis O O O O
suggests O O O O
that O O O O
in O O O O
A B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
terreus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
the O O O O
cis O O O O
- O O O O
aconitate O O O O
decarboxylase O O O O
gene O O O O
is O O O O
part O O O O
of O O O O
an O O O O
itaconate O O O O
acid O O O O
related O O O O
gene O O O O
cluster O O O O
including O O O O
genes O O O O
encoding O O O O
two O O O O
pathway O O O O
specific O O O O
transporters O O O O
and O O O O
a O O O O
Zinc O O O O
finger O O O O
protein O O O O
. O O O O
    
Interestingly O O O O
, O O O O
this O O O O
cluster O O O O
is O O O O
directly O O O O
linked O O O O
to O O O O
the O O O O
large O O O O
lovastatin O O O O
gene O O O O
cluster O O O O
. O O O O
    
The O O O O
outcome O O O O
of O O O O
competition O O O O
between O O O O
the O O O O
two O O O O
chrysomonads O O O O
Ochromonas O O O O
sp O O O O
. O O O O
and O O O O
Poterioochromonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
malhamensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
depends O O O O
on O O O O
pH O O O O
. O O O O
    
We O O O O
investigated O O O O
the O O O O
effect O O O O
of O O O O
pH O O O O
on O O O O
the O O O O
competition O O O O
of O O O O
two O O O O
closely O O O O
related O O O O
chrysomonad O O O O
species O O O O
, O O O O
Poterioochromonas B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
malhamensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
originating O O O O
from O O O O
circumneutral O O O O
Lake O O O O
Constance O O O O
, O O O O
and O O O O
Ochromonas O O O O
sp O O O O
. O O O O
isolated O O O O
from O O O O
a O O O O
highly O O O O
acidic O O O O
mining O O O O
lake O O O O
in O O O O
Austria O O O O
( O O O O
pH O O O O
- O O O O
2 O O O O
. O O O O
6 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
We O O O O
performed O O O O
pairwise O O O O
growth O O O O
experiments O O O O
between O O O O
these O O O O
two O O O O
species O O O O
at O O O O
four O O O O
different O O O O
pH O O O O
ranging O O O O
from O O O O
2 O O O O
. O O O O
5 O O O O
to O O O O
7 O O O O
. O O O O
0 O O O O
. O O O O
    
Heterotrophic O O O O
bacteria O O O O
served O O O O
as O O O O
food O O O O
for O O O O
both O O O O
flagellates O O O O
. O O O O
    
Results O O O O
were O O O O
compared O O O O
to O O O O
growth O O O O
rates O O O O
measured O O O O
earlier O O O O
in O O O O
single O O O O
species O O O O
experiments O O O O
over O O O O
the O O O O
same O O O O
pH O O O O
range O O O O
. O O O O
    
We O O O O
tested O O O O
the O O O O
hypothesis O O O O
that O O O O
the O O O O
acidotolerant O O O O
species O O O O
benefits O O O O
from O O O O
competitive O O O O
release O O O O
under O O O O
conditions O O O O
of O O O O
acid O O O O
stress O O O O
. O O O O
    
The O O O O
neutrophilic O O O O
strain O O O O
numerically O O O O
dominated O O O O
over O O O O
the O O O O
acidotolerant O O O O
strain O O O O
at O O O O
pH O O O O
7 O O O O
. O O O O
0 O O O O
, O O O O
but O O O O
was O O O O
the O O O O
inferior O O O O
competitor O O O O
at O O O O
pH O O O O
2 O O O O
. O O O O
5 O O O O
. O O O O
    
At O O O O
pH O O O O
3 O O O O
. O O O O
5 O O O O
and O O O O
5 O O O O
. O O O O
0 O O O O
both O O O O
strains O O O O
coexisted O O O O
. O O O O
    
Surprisingly O O O O
, O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
malhamensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
prevailed O O O O
over O O O O
Ochromonas O O O O
sp O O O O
. O O O O
under O O O O
moderately O O O O
acidic O O O O
conditions O O O O
, O O O O
i O O O O
. O O O O
e O O O O
. O O O O
at O O O O
the O O O O
pH O O O O
where O O O O
growth O O O O
rates O O O O
of O O O O
the O O O O
latter O O O O
peaked O O O O
when O O O O
grown O O O O
alone O O O O
. O O O O
    
Since O O O O
bacterial O O O O
food O O O O
was O O O O
not O O O O
limiting O O O O
, O O O O
resource O O O O
competition O O O O
is O O O O
improbable O O O O
. O O O O
    
It O O O O
appears O O O O
more O O O O
likely O O O O
that O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
malhamensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ingested O O O O
cells O O O O
of O O O O
its O O O O
slightly O O O O
smaller O O O O
competitor O O O O
. O O O O
    
Adverse O O O O
effects O O O O
mediated O O O O
via O O O O
allelopathy O O O O
, O O O O
either O O O O
directly O O O O
on O O O O
the O O O O
competing O O O O
flagellate O O O O
or O O O O
indirectly O O O O
by O O O O
affecting O O O O
its O O O O
bacterial O O O O
food O O O O
, O O O O
might O O O O
also O O O O
have O O O O
affected O O O O
the O O O O
outcome O O O O
of O O O O
competition O O O O
. O O O O
    
Differentially O O O O
expressed O O O O
genes O O O O
in O O O O
silkworm B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cell O O O O
cultures O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
infection O O O O
by O O O O
Wolbachia O O O O
and O O O O
Cardinium O O O O
endosymbionts O O O O
. O O O O
    
Wolbachia O O O O
and O O O O
Cardinium O O O O
are O O O O
bacterial O O O O
endosymbionts O O O O
that O O O O
are O O O O
widely O O O O
distributed O O O O
amongst O O O O
arthropods O O O O
. O O O O
    
Both O O O O
cause O O O O
reproductive O O O O
alterations O O O O
, O O O O
such O O O O
as O O O O
cytoplasmic O O O O
incompatibility O O O O
, O O O O
parthenogenesis O O O O
and O O O O
feminization O O O O
. O O O O
    
Here O O O O
we O O O O
studied O O O O
differentially O O O O
expressed O O O O
genes O O O O
in O O O O
Wolbachia O O O O
- O O O O
and O O O O
Cardinium O O O O
- O O O O
infected O O O O
Bm O O O O
- O O O O
aff3 O O O O
silkworm B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cells O O O O
using O O O O
a O O O O
silkworm B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
microarray O O O O
. O O O O
    
Wolbachia O O O O
infection O O O O
did O O O O
not O O O O
alter O O O O
gene O O O O
expression O O O O
or O O O O
induce O O O O
or O O O O
suppress O O O O
immune O O O O
responses O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
, O O O O
Cardinium O O O O
infection O O O O
induced O O O O
many O O O O
immune O O O O
- O O O O
related O O O O
genes O O O O
, O O O O
including O O O O
antimicrobial O O O O
peptides O O O O
, O O O O
pattern O O O O
recognition O O O O
receptors O O O O
and O O O O
a O O O O
serine O O O O
protease O O O O
. O O O O
    
Host O O O O
immune O O O O
responses O O O O
differed O O O O
, O O O O
possibly O O O O
because O O O O
of O O O O
the O O O O
different O O O O
cell O O O O
wall O O O O
structures O O O O
of O O O O
Wolbachia O O O O
and O O O O
Cardinium O O O O
because O O O O
the O O O O
former O O O O
lacks O O O O
genes O O O O
encoding O O O O
lipopolysaccharide O O O O
components O O O O
and O O O O
two O O O O
racemases O O O O
for O O O O
peptidoglycan O O O O
formation O O O O
. O O O O
    
A O O O O
few O O O O
possibly O O O O
non O O O O
- O O O O
immune O O O O
- O O O O
related O O O O
genes O O O O
were O O O O
differentially O O O O
expressed O O O O
, O O O O
but O O O O
their O O O O
involvement O O O O
in O O O O
host O O O O
reproductive O O O O
alteration O O O O
was O O O O
unclear O O O O
. O O O O
    
Neuropeptide O O O O
Y O O O O
- O O O O
like O O O O
signalling O O O O
and O O O O
nutritionally O O O O
mediated O O O O
gene O O O O
expression O O O O
and O O O O
behaviour O O O O
in O O O O
the O O O O
honey O O O O
bee O O O O
. O O O O
    
Previous O O O O
research O O O O
has O O O O
led O O O O
to O O O O
the O O O O
idea O O O O
that O O O O
derived O O O O
traits O O O O
can O O O O
arise O O O O
through O O O O
the O O O O
evolution O O O O
of O O O O
novel O O O O
roles O O O O
for O O O O
conserved O O O O
genes O O O O
. O O O O
    
We O O O O
explored O O O O
whether O O O O
neuropeptide O O O O
Y O O O O
( O O O O
NPY O O O O
) O O O O
- O O O O
like O O O O
signalling O O O O
, O O O O
a O O O O
conserved O O O O
pathway O O O O
that O O O O
regulates O O O O
food O O O O
- O O O O
related O O O O
behaviour O O O O
, O O O O
is O O O O
involved O O O O
in O O O O
a O O O O
derived O O O O
, O O O O
nutritionally O O O O
- O O O O
related O O O O
trait O O O O
, O O O O
the O O O O
division O O O O
of O O O O
labour O O O O
in O O O O
worker O O O O
honey O O O O
bees O O O O
. O O O O
    
Transcripts O O O O
encoding O O O O
two O O O O
NPY O O O O
- O O O O
like O O O O
peptides O O O O
were O O O O
expressed O O O O
in O O O O
separate O O O O
populations O O O O
of O O O O
brain O O O O
neurosecretory O O O O
cells O O O O
, O O O O
consistent O O O O
with O O O O
endocrine O O O O
functions O O O O
. O O O O
    
NPY O O O O
- O O O O
related O O O O
genes O O O O
were O O O O
upregulated O O O O
in O O O O
the O O O O
brains O O O O
of O O O O
older O O O O
foragers O O O O
compared O O O O
with O O O O
younger O O O O
bees O O O O
performing O O O O
brood O O O O
care O O O O
( O O O O
' O O O O
nurses O O O O
' O O O O
) O O O O
. O O O O
    
A O O O O
subset O O O O
of O O O O
these O O O O
changes O O O O
can O O O O
be O O O O
attributed O O O O
to O O O O
nutrition O O O O
, O O O O
but O O O O
neuropeptide O O O O
F O O O O
peptide O O O O
treatments O O O O
did O O O O
not O O O O
influence O O O O
sugar O O O O
intake O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
contrast O O O O
with O O O O
recent O O O O
reports O O O O
of O O O O
more O O O O
robust O O O O
associations O O O O
between O O O O
division O O O O
of O O O O
labour O O O O
and O O O O
the O O O O
related O O O O
insulin O O O O
- O O O O
signalling O O O O
pathway O O O O
and O O O O
suggest O O O O
that O O O O
some O O O O
elements O O O O
of O O O O
molecular O O O O
pathways O O O O
associated O O O O
with O O O O
feeding O O O O
behaviour O O O O
may O O O O
be O O O O
more O O O O
evolutionarily O O O O
labile O O O O
than O O O O
others O O O O
. O O O O
    
Apolipoprotein O O O O
E O O O O
in O O O O
Alzheimer O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
and O O O O
other O O O O
neurological O O O O
disorders O O O O
. O O O O
    
Apolipoprotein O O O O
E O O O O
( O O O O
APOE O O O O
) O O O O
is O O O O
a O O O O
299 O O O O
- O O O O
aminoacid O O O O
protein O O O O
encoded O O O O
by O O O O
the O O O O
APOE O O O O
gene O O O O
. O O O O
    
Three O O O O
common O O O O
polymorphisms O O O O
in O O O O
the O O O O
APOE O O O O
gene O O O O
, O O O O
epsilo2 O O O O
, O O O O
epsilo3 O O O O
, O O O O
and O O O O
epsilo4 O O O O
, O O O O
result O O O O
in O O O O
a O O O O
single O O O O
aminoacid O O O O
change O O O O
in O O O O
the O O O O
APOE O O O O
protein O O O O
. O O O O
    
APOE O O O O
epsilo2 O O O O
, O O O O
epsilo3 O O O O
, O O O O
and O O O O
epsilo4 O O O O
alleles O O O O
strongly O O O O
alter O O O O
, O O O O
in O O O O
a O O O O
dose O O O O
- O O O O
dependent O O O O
manner O O O O
, O O O O
the O O O O
likelihood O O O O
of O O O O
developing O O O O
Alzheimer O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
and O O O O
cerebral O O O O
amyloid O O O O
angiopathy O O O O
. O O O O
    
In O O O O
particular O O O O
, O O O O
APOE O O O O
epsilo4 O O O O
is O O O O
associated O O O O
with O O O O
increased O O O O
risk O O O O
for O O O O
Alzheimer O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
whereas O O O O
APOE O O O O
epsilo2 O O O O
is O O O O
associated O O O O
with O O O O
decreased O O O O
risk O O O O
. O O O O
    
The O O O O
effects O O O O
of O O O O
APOE O O O O
genotype O O O O
on O O O O
risk O O O O
of O O O O
these O O O O
diseases O O O O
are O O O O
likely O O O O
to O O O O
be O O O O
mediated O O O O
by O O O O
differential O O O O
effects O O O O
of O O O O
APOE O O O O
on O O O O
amyloid O O O O
- O O O O
Beta O O O O
accumulation O O O O
in O O O O
the O O O O
brain O O O O
and O O O O
its O O O O
vasculature O O O O
. O O O O
    
Response O O O O
to O O O O
treatment O O O O
for O O O O
Alzheimer O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
might O O O O
differ O O O O
according O O O O
to O O O O
APOE O O O O
genotype O O O O
. O O O O
    
Because O O O O
convincing O O O O
evidence O O O O
ties O O O O
the O O O O
APOE O O O O
genotype O O O O
to O O O O
risk O O O O
of O O O O
Alzheimer O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
and O O O O
cerebral O O O O
amyloid O O O O
angiopathy O O O O
, O O O O
APOE O O O O
has O O O O
been O O O O
studied O O O O
in O O O O
other O O O O
neurological O O O O
diseases O O O O
. O O O O
    
APOE O O O O
epsilo4 O O O O
is O O O O
associated O O O O
with O O O O
poor O O O O
outcome O O O O
after O O O O
traumatic O O O O
brain O O O O
injury O O O O
and O O O O
brain O O O O
haemorrhage O O O O
, O O O O
although O O O O
the O O O O
mechanisms O O O O
underlying O O O O
these O O O O
associations O O O O
are O O O O
unclear O O O O
. O O O O
    
The O O O O
possibility O O O O
that O O O O
APOE O O O O
has O O O O
a O O O O
role O O O O
in O O O O
these O O O O
and O O O O
other O O O O
neurological O O O O
diseases O O O O
has O O O O
been O O O O
of O O O O
great O O O O
interest O O O O
, O O O O
but O O O O
convincing O O O O
associations O O O O
have O O O O
not O O O O
yet O O O O
emerged O O O O
. O O O O
    
Titrating O O O O
the O O O O
cost O O O O
of O O O O
plant O O O O
toxins O O O O
against O O O O
predators O O O O
: O O O O
determining O O O O
the O O O O
tipping O O O O
point O O O O
for O O O O
foraging O O O O
herbivores O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Foraging O O O O
herbivores O O O O
must O O O O
deal O O O O
with O O O O
plant O O O O
characteristics O O O O
that O O O O
inhibit O O O O
feeding O O O O
and O O O O
they O O O O
must O O O O
avoid O O O O
being O O O O
eaten O O O O
. O O O O
    
Principally O O O O
, O O O O
toxins O O O O
limit O O O O
food O O O O
intake O O O O
, O O O O
while O O O O
predation O O O O
risk O O O O
alters O O O O
how O O O O
long O O O O
animals O O O O
are O O O O
prepared O O O O
to O O O O
harvest O O O O
resources O O O O
. O O O O
    
Each O O O O
of O O O O
these O O O O
factors O O O O
strongly O O O O
affects O O O O
how O O O O
herbivores O O O O
use O O O O
food O O O O
patches O O O O
, O O O O
and O O O O
both O O O O
constraints O O O O
can O O O O
pose O O O O
immediate O O O O
proximate O O O O
costs O O O O
and O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
consequences O O O O
to O O O O
fitness O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
a O O O O
generalist O O O O
mammalian O O O O
herbivore O O O O
, O O O O
the O O O O
common B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
brushtail O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
possum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Trichosurus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
vulpecula O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
, O O O O
our O O O O
aim O O O O
was O O O O
to O O O O
quantitatively O O O O
compare O O O O
the O O O O
influence O O O O
of O O O O
plant O O O O
toxin O O O O
and O O O O
predation O O O O
risk O O O O
on O O O O
foraging O O O O
decisions O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
performed O O O O
a O O O O
titration O O O O
experiment O O O O
by O O O O
offering O O O O
animals O O O O
a O O O O
choice O O O O
between O O O O
non O O O O
- O O O O
toxic O O O O
food O O O O
at O O O O
a O O O O
risky O O O O
patch O O O O
paired O O O O
with O O O O
food O O O O
with O O O O
one O O O O
of O O O O
five O O O O
toxin O O O O
concentrations O O O O
at O O O O
a O O O O
safe O O O O
patch O O O O
. O O O O
    
This O O O O
allowed O O O O
us O O O O
to O O O O
identify O O O O
the O O O O
tipping O O O O
point O O O O
, O O O O
where O O O O
the O O O O
cost O O O O
of O O O O
toxin O O O O
in O O O O
the O O O O
safe O O O O
food O O O O
patch O O O O
was O O O O
equivalent O O O O
to O O O O
the O O O O
perceived O O O O
predation O O O O
risk O O O O
in O O O O
the O O O O
alternative O O O O
patch O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
At O O O O
low O O O O
toxin O O O O
concentration O O O O
, O O O O
animals O O O O
ate O O O O
more O O O O
from O O O O
the O O O O
safe O O O O
than O O O O
the O O O O
risky O O O O
patch O O O O
. O O O O
    
As O O O O
toxin O O O O
concentration O O O O
increased O O O O
at O O O O
the O O O O
safe O O O O
patch O O O O
, O O O O
intake O O O O
shifted O O O O
until O O O O
animals O O O O
ate O O O O
mainly O O O O
from O O O O
the O O O O
risky O O O O
patch O O O O
. O O O O
    
This O O O O
shift O O O O
was O O O O
associated O O O O
with O O O O
behavioural O O O O
changes O O O O
: O O O O
animals O O O O
spent O O O O
more O O O O
time O O O O
and O O O O
fed O O O O
longer O O O O
at O O O O
the O O O O
risky O O O O
patch O O O O
, O O O O
while O O O O
vigilance O O O O
increased O O O O
at O O O O
both O O O O
risky O O O O
and O O O O
safe O O O O
patches O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
demonstrate O O O O
that O O O O
the O O O O
variation O O O O
in O O O O
toxin O O O O
concentration O O O O
, O O O O
which O O O O
occurs O O O O
intraspecifically O O O O
among O O O O
plants O O O O
, O O O O
can O O O O
critically O O O O
influence O O O O
the O O O O
relative O O O O
cost O O O O
of O O O O
predation O O O O
risk O O O O
on O O O O
foraging O O O O
. O O O O
    
We O O O O
show O O O O
that O O O O
herbivores O O O O
quantify O O O O
, O O O O
compare O O O O
and O O O O
balance O O O O
these O O O O
two O O O O
different O O O O
but O O O O
proximate O O O O
costs O O O O
, O O O O
altering O O O O
their O O O O
foraging O O O O
patterns O O O O
in O O O O
the O O O O
process O O O O
. O O O O
    
This O O O O
has O O O O
potential O O O O
ecological O O O O
and O O O O
evolutionary O O O O
implications O O O O
for O O O O
the O O O O
production O O O O
of O O O O
plant O O O O
defence O O O O
compounds O O O O
in O O O O
relation O O O O
to O O O O
spatial O O O O
variation O O O O
in O O O O
predation O O O O
risk O O O O
to O O O O
herbivores O O O O
. O O O O
    
What O O O O
determines O O O O
variation O O O O
in O O O O
home O O O O
range O O O O
size O O O O
across O O O O
spatiotemporal O O O O
scales O O O O
in O O O O
a O O O O
large O O O O
browsing O O O O
herbivore O O O O
? O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Most O O O O
studies O O O O
of O O O O
intraspecific O O O O
variation O O O O
in O O O O
home O O O O
range O O O O
size O O O O
have O O O O
investigated O O O O
only O O O O
a O O O O
single O O O O
or O O O O
a O O O O
few O O O O
factors O O O O
and O O O O
often O O O O
at O O O O
one O O O O
specific O O O O
scale O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
considering O O O O
multiple O O O O
spatial O O O O
and O O O O
temporal O O O O
scales O O O O
when O O O O
defining O O O O
a O O O O
home O O O O
range O O O O
is O O O O
important O O O O
as O O O O
mechanisms O O O O
that O O O O
affect O O O O
variation O O O O
in O O O O
home O O O O
range O O O O
size O O O O
may O O O O
differ O O O O
depending O O O O
on O O O O
the O O O O
scale O O O O
under O O O O
investigation O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
aim O O O O
to O O O O
quantify O O O O
the O O O O
relative O O O O
effect O O O O
of O O O O
various O O O O
individual O O O O
, O O O O
forage O O O O
and O O O O
climatic O O O O
determinants O O O O
of O O O O
variation O O O O
in O O O O
home O O O O
range O O O O
size O O O O
across O O O O
multiple O O O O
spatiotemporal O O O O
scales O O O O
in O O O O
a O O O O
large O O O O
browsing O O O O
herbivore O O O O
, O O O O
the O O O O
moose O O O O
( O O O O
Alces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
alces O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
, O O O O
living O O O O
at O O O O
the O O O O
southern O O O O
limit O O O O
of O O O O
its O O O O
distribution O O O O
in O O O O
Norway O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Total O O O O
home O O O O
range O O O O
size O O O O
and O O O O
core O O O O
home O O O O
range O O O O
areas O O O O
were O O O O
estimated O O O O
for O O O O
daily O O O O
to O O O O
monthly O O O O
scales O O O O
in O O O O
summer O O O O
and O O O O
winter O O O O
using O O O O
both O O O O
local O O O O
convex O O O O
hull O O O O
( O O O O
LoCoH O O O O
) O O O O
and O O O O
fixed O O O O
kernel O O O O
home O O O O
range O O O O
methods O O O O
. O O O O
    
Variance O O O O
in O O O O
home O O O O
range O O O O
size O O O O
was O O O O
analysed O O O O
using O O O O
linear O O O O
mixed O O O O
- O O O O
effects O O O O
models O O O O
for O O O O
repeated O O O O
measurements O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Reproductive O O O O
status O O O O
was O O O O
the O O O O
most O O O O
influential O O O O
individual O O O O
- O O O O
level O O O O
factor O O O O
explaining O O O O
variance O O O O
in O O O O
moose O O O O
home O O O O
range O O O O
size O O O O
, O O O O
with O O O O
females O O O O
accompanied O O O O
by O O O O
a O O O O
calf O O O O
having O O O O
smaller O O O O
summer O O O O
ranges O O O O
across O O O O
all O O O O
scales O O O O
. O O O O
    
Variation O O O O
in O O O O
home O O O O
range O O O O
size O O O O
was O O O O
strongly O O O O
correlated O O O O
with O O O O
spatiotemporal O O O O
changes O O O O
in O O O O
quantity O O O O
and O O O O
quality O O O O
of O O O O
natural O O O O
food O O O O
resources O O O O
. O O O O
    
Home O O O O
range O O O O
size O O O O
decreased O O O O
with O O O O
increasing O O O O
browse O O O O
density O O O O
at O O O O
daily O O O O
scales O O O O
, O O O O
but O O O O
the O O O O
relationship O O O O
changed O O O O
to O O O O
positive O O O O
at O O O O
longer O O O O
temporal O O O O
scales O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
, O O O O
browse O O O O
quality O O O O
was O O O O
consistently O O O O
negatively O O O O
correlated O O O O
with O O O O
home O O O O
range O O O O
size O O O O
except O O O O
at O O O O
the O O O O
monthly O O O O
scale O O O O
during O O O O
winter O O O O
when O O O O
depletion O O O O
of O O O O
high O O O O
- O O O O
quality O O O O
forage O O O O
occurs O O O O
. O O O O
    
Local O O O O
climate O O O O
affected O O O O
total O O O O
home O O O O
range O O O O
size O O O O
more O O O O
than O O O O
core O O O O
areas O O O O
. O O O O
    
Temperature O O O O
, O O O O
precipitation O O O O
and O O O O
snow O O O O
depth O O O O
influenced O O O O
home O O O O
range O O O O
size O O O O
directly O O O O
at O O O O
short O O O O
temporal O O O O
scales O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
relative O O O O
effects O O O O
of O O O O
intrinsic O O O O
and O O O O
extrinsic O O O O
determinants O O O O
of O O O O
variation O O O O
in O O O O
home O O O O
range O O O O
size O O O O
differed O O O O
with O O O O
spatiotemporal O O O O
scale O O O O
, O O O O
providing O O O O
clear O O O O
evidence O O O O
that O O O O
home O O O O
range O O O O
size O O O O
is O O O O
scale O O O O
dependent O O O O
in O O O O
this O O O O
large O O O O
browser O O O O
. O O O O
    
Insight O O O O
into O O O O
the O O O O
behavioural O O O O
responses O O O O
of O O O O
populations O O O O
to O O O O
climatic O O O O
stochasticity O O O O
and O O O O
forage O O O O
variability O O O O
is O O O O
essential O O O O
in O O O O
view O O O O
of O O O O
current O O O O
and O O O O
future O O O O
climate O O O O
change O O O O
, O O O O
especially O O O O
for O O O O
populations O O O O
with O O O O
thermoregulatory O O O O
restrictions O O O O
living O O O O
at O O O O
the O O O O
southern O O O O
limit O O O O
of O O O O
their O O O O
distribution O O O O
. O O O O
    
Npc1 O O O O
is O O O O
involved O O O O
in O O O O
sterol O O O O
trafficking O O O O
in O O O O
the O O O O
filamentous O O O O
fungus O O O O
Fusarium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
graminearum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
ortholog O O O O
of O O O O
the O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
gene O O O O
NPC1 O O O O
was O O O O
identified O O O O
in O O O O
the O O O O
plant O O O O
pathogenic O O O O
, O O O O
filamentous O O O O
fungus O O O O
Fusarium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
graminearum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
by O O O O
shared O O O O
amino O O O O
acid O O O O
sequence O O O O
, O O O O
protein O O O O
domain O O O O
structure O O O O
and O O O O
cellular O O O O
localization O O O O
of O O O O
the O O O O
mature O O O O
fungal O O O O
protein O O O O
. O O O O
    
The O O O O
FusariumNpc1 O O O O
gene O O O O
shares O O O O
34 O O O O
% O O O O
amino O O O O
acid O O O O
sequence O O O O
identity O O O O
and O O O O
51 O O O O
% O O O O
similarity O O O O
to O O O O
the O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
gene O O O O
, O O O O
has O O O O
similar O O O O
domain O O O O
structure O O O O
and O O O O
is O O O O
constitutively O O O O
expressed O O O O
, O O O O
although O O O O
up O O O O
- O O O O
regulated O O O O
in O O O O
ungerminated O O O O
macroconidia O O O O
and O O O O
ascospores O O O O
. O O O O
    
GFP O O O O
- O O O O
tagged O O O O
Npc1p O O O O
localizes O O O O
to O O O O
the O O O O
fungal O O O O
vacuolar O O O O
membrane O O O O
. O O O O
    
Cultures O O O O
derived O O O O
from O O O O
a O O O O
Deltanpc1 O O O O
mutant O O O O
strain O O O O
contain O O O O
significantly O O O O
more O O O O
ergosterol O O O O
than O O O O
cultures O O O O
of O O O O
the O O O O
wildtype O O O O
. O O O O
    
Staining O O O O
with O O O O
the O O O O
fluorescent O O O O
, O O O O
sterol O O O O
binding O O O O
dye O O O O
filipin O O O O
, O O O O
shows O O O O
that O O O O
ergosterol O O O O
accumulates O O O O
in O O O O
vacuoles O O O O
of O O O O
the O O O O
Deltanpc1 O O O O
mutant O O O O
but O O O O
not O O O O
the O O O O
wildtype O O O O
strain O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Deltanpc1 O O O O
mutant O O O O
has O O O O
a O O O O
temperature O O O O
dependent O O O O
reduction O O O O
in O O O O
growth O O O O
and O O O O
greater O O O O
sensitivity O O O O
to O O O O
the O O O O
ergosterol O O O O
synthesis O O O O
inhibiting O O O O
fungicide O O O O
tebuconazole O O O O
compared O O O O
with O O O O
the O O O O
wildtype O O O O
strain O O O O
or O O O O
the O O O O
mutant O O O O
complemented O O O O
with O O O O
wildtype O O O O
Npc1 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
mutant O O O O
also O O O O
is O O O O
significantly O O O O
reduced O O O O
in O O O O
pathogenicity O O O O
to O O O O
wheat B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
are O O O O
consistent O O O O
with O O O O
the O O O O
interpretation O O O O
that O O O O
Npc1p O O O O
is O O O O
important O O O O
for O O O O
normal O O O O
transport O O O O
of O O O O
ergosterol O O O O
from O O O O
the O O O O
vacuole O O O O
and O O O O
is O O O O
essential O O O O
for O O O O
proper O O O O
membrane O O O O
function O O O O
under O O O O
particular O O O O
environmental O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
Genetic O O O O
diversity O O O O
and O O O O
phylogenetic O O O O
position O O O O
of O O O O
the O O O O
subclass O O O O
Astomatia O O O O
( O O O O
Ciliophora O O O O
) O O O O
based O O O O
on O O O O
a O O O O
sampling O O O O
of O O O O
six O O O O
genera O O O O
from O O O O
West O O O O
African O O O O
oligochaetes O O O O
( O O O O
Glossoscolecidae O O O O
, O O O O
Megascolecidae O O O O
) O O O O
, O O O O
including O O O O
description O O O O
of O O O O
the O O O O
new O O O O
genus O O O O
Paraclausilocola O O O O
n O O O O
. O O O O
gen O O O O
. O O O O
    
To O O O O
more O O O O
confidently O O O O
assess O O O O
phylogenetic O O O O
relationships O O O O
among O O O O
astome O O O O
ciliates O O O O
, O O O O
we O O O O
obtained O O O O
small O O O O
subunit O O O O
( O O O O
SSU O O O O
) O O O O
rRNA O O O O
sequences O O O O
from O O O O
nine O O O O
species O O O O
distributed O O O O
in O O O O
six O O O O
genera O O O O
and O O O O
three O O O O
families O O O O
: O O O O
Almophrya B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bivacuolata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Eudrilophrya B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
complanata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Metaracoelophrya O O O O
sp O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
, O O O O
Metaracoelophrya O O O O
sp O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
, O O O O
Metaracoelophrya B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
intermedia O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Metaradiophrya O O O O
sp O O O O
. O O O O
, O O O O
Njinella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
prolifera O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Paraclausilocola B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
constricta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
n O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
gen O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
n O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
Paraclausilocola B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
elongata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
n O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sp O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
    
The O O O O
two O O O O
new O O O O
species O O O O
in O O O O
the O O O O
proposed O O O O
new O O O O
clausilocolid O O O O
genus O O O O
Paraclausilocola O O O O
n O O O O
. O O O O
gen O O O O
. O O O O
    
are O O O O
astomes O O O O
with O O O O
no O O O O
attachment O O O O
apparatus O O O O
, O O O O
two O O O O
files O O O O
of O O O O
contractile O O O O
vacuoles O O O O
, O O O O
and O O O O
an O O O O
arc O O O O
- O O O O
like O O O O
anterior O O O O
suture O O O O
that O O O O
has O O O O
differentiations O O O O
of O O O O
thigmotactic O O O O
ciliature O O O O
on O O O O
the O O O O
anterior O O O O
ends O O O O
of O O O O
the O O O O
left O O O O
kineties O O O O
of O O O O
the O O O O
upper O O O O
surface O O O O
. O O O O
    
Phylogenetic O O O O
analyses O O O O
were O O O O
undertaken O O O O
using O O O O
neighbor O O O O
- O O O O
joining O O O O
, O O O O
Bayesian O O O O
inference O O O O
, O O O O
maximum O O O O
likelihood O O O O
, O O O O
and O O O O
maximum O O O O
parsimony O O O O
. O O O O
    
The O O O O
nine O O O O
species O O O O
of O O O O
astomes O O O O
formed O O O O
a O O O O
strongly O O O O
supported O O O O
clade O O O O
, O O O O
showing O O O O
the O O O O
subclass O O O O
Astomatia O O O O
to O O O O
be O O O O
monophyletic O O O O
and O O O O
a O O O O
weakly O O O O
supported O O O O
sister O O O O
clade O O O O
to O O O O
the O O O O
scuticociliates O O O O
. O O O O
    
There O O O O
were O O O O
two O O O O
strongly O O O O
supported O O O O
clades O O O O
within O O O O
the O O O O
astomes O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
genera O O O O
assigned O O O O
to O O O O
the O O O O
same O O O O
family O O O O
were O O O O
found O O O O
in O O O O
different O O O O
clades O O O O
, O O O O
and O O O O
genera O O O O
assigned O O O O
to O O O O
the O O O O
same O O O O
order O O O O
were O O O O
found O O O O
in O O O O
both O O O O
clades O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
astome O O O O
taxa O O O O
appear O O O O
to O O O O
be O O O O
paraphyletic O O O O
when O O O O
morphology O O O O
is O O O O
used O O O O
to O O O O
assign O O O O
species O O O O
to O O O O
genera O O O O
. O O O O
    
Negotiating O O O O
a O O O O
noisy O O O O
, O O O O
information O O O O
- O O O O
rich O O O O
environment O O O O
in O O O O
search O O O O
of O O O O
cryptic O O O O
prey O O O O
: O O O O
olfactory O O O O
predators O O O O
need O O O O
patchiness O O O O
in O O O O
prey O O O O
cues O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Olfactory O O O O
predator O O O O
search O O O O
processes O O O O
differ O O O O
fundamentally O O O O
to O O O O
those O O O O
based O O O O
on O O O O
vision O O O O
, O O O O
particularly O O O O
when O O O O
odour O O O O
cues O O O O
are O O O O
deposited O O O O
rather O O O O
than O O O O
airborne O O O O
or O O O O
emanating O O O O
from O O O O
a O O O O
point O O O O
source O O O O
. O O O O
    
When O O O O
searching O O O O
for O O O O
visually O O O O
cryptic O O O O
prey O O O O
that O O O O
may O O O O
have O O O O
moved O O O O
some O O O O
distance O O O O
from O O O O
a O O O O
deposited O O O O
odour O O O O
cue O O O O
, O O O O
cue O O O O
context O O O O
and O O O O
spatial O O O O
variability O O O O
are O O O O
the O O O O
most O O O O
likely O O O O
sources O O O O
of O O O O
information O O O O
about O O O O
prey O O O O
location O O O O
available O O O O
to O O O O
an O O O O
olfactory O O O O
predator O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
tested O O O O
whether O O O O
the O O O O
house B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mouse O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Mus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
domesticus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
, O O O O
a O O O O
model O O O O
olfactory O O O O
predator O O O O
, O O O O
would O O O O
use O O O O
cue O O O O
context O O O O
and O O O O
spatial O O O O
variability O O O O
when O O O O
searching O O O O
for O O O O
buried O O O O
food O O O O
items O O O O
; O O O O
specifically O O O O
, O O O O
we O O O O
tested O O O O
the O O O O
effect O O O O
of O O O O
varying O O O O
cue O O O O
patchiness O O O O
, O O O O
odour O O O O
strength O O O O
, O O O O
and O O O O
cue O O O O
- O O O O
prey O O O O
association O O O O
on O O O O
mouse B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
foraging O O O O
success O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Within O O O O
mouse B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O O O O
and O O O O
predator O O O O
- O O O O
proof O O O O
enclosures O O O O
, O O O O
we O O O O
created O O O O
grids O O O O
of O O O O
100 O O O O
sand O O O O
- O O O O
filled O O O O
Petri O O O O
dishes O O O O
and O O O O
buried O O O O
peanut B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pieces O O O O
in O O O O
a O O O O
set O O O O
number O O O O
of O O O O
these O O O O
patches O O O O
to O O O O
represent O O O O
visually O O O O
cryptic O O O O
' O O O O
prey O O O O
' O O O O
. O O O O
    
By O O O O
adding O O O O
peanut B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
oil O O O O
to O O O O
selected O O O O
dishes O O O O
, O O O O
we O O O O
varied O O O O
the O O O O
spatial O O O O
distribution O O O O
of O O O O
prey O O O O
odour O O O O
relative O O O O
to O O O O
the O O O O
distribution O O O O
of O O O O
prey O O O O
patches O O O O
in O O O O
each O O O O
grid O O O O
, O O O O
to O O O O
reflect O O O O
different O O O O
levels O O O O
of O O O O
cue O O O O
patchiness O O O O
( O O O O
Experiment O O O O
1 O O O O
) O O O O
, O O O O
odour O O O O
strength O O O O
( O O O O
Experiment O O O O
2 O O O O
) O O O O
and O O O O
cue O O O O
- O O O O
prey O O O O
association O O O O
( O O O O
Experiment O O O O
3 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
We O O O O
measured O O O O
the O O O O
overnight O O O O
foraging O O O O
success O O O O
of O O O O
individual O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
percentage O O O O
of O O O O
searched O O O O
patches O O O O
containing O O O O
prey O O O O
) O O O O
, O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
their O O O O
foraging O O O O
activity O O O O
( O O O O
percentage O O O O
of O O O O
patches O O O O
searched O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
prey O O O O
survival O O O O
( O O O O
percentage O O O O
of O O O O
unsearched O O O O
prey O O O O
patches O O O O
) O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Mouse B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
foraging O O O O
success O O O O
was O O O O
highest O O O O
where O O O O
odour O O O O
cues O O O O
were O O O O
patchy O O O O
rather O O O O
than O O O O
uniform O O O O
( O O O O
Experiment O O O O
1 O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
where O O O O
cues O O O O
were O O O O
tightly O O O O
associated O O O O
with O O O O
prey O O O O
location O O O O
, O O O O
rather O O O O
than O O O O
randomly O O O O
or O O O O
uniformly O O O O
distributed O O O O
( O O O O
Experiment O O O O
3 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
when O O O O
cues O O O O
at O O O O
prey O O O O
patches O O O O
were O O O O
ten O O O O
times O O O O
stronger O O O O
than O O O O
a O O O O
uniformly O O O O
distributed O O O O
weak O O O O
background O O O O
odour O O O O
, O O O O
mice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
did O O O O
not O O O O
improve O O O O
their O O O O
foraging O O O O
success O O O O
over O O O O
that O O O O
experienced O O O O
when O O O O
cues O O O O
were O O O O
of O O O O
uniform O O O O
strength O O O O
and O O O O
distribution O O O O
( O O O O
Experiment O O O O
2 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
spatial O O O O
variability O O O O
and O O O O
cue O O O O
context O O O O
are O O O O
important O O O O
means O O O O
by O O O O
which O O O O
olfactory O O O O
predators O O O O
can O O O O
use O O O O
deposited O O O O
odour O O O O
cues O O O O
to O O O O
locate O O O O
visually O O O O
cryptic O O O O
prey O O O O
. O O O O
    
They O O O O
also O O O O
indicate O O O O
that O O O O
chemical O O O O
crypsis O O O O
can O O O O
disrupt O O O O
these O O O O
search O O O O
processes O O O O
as O O O O
effectively O O O O
as O O O O
background O O O O
matching O O O O
in O O O O
visually O O O O
based O O O O
predator O O O O
- O O O O
prey O O O O
systems O O O O
. O O O O
    
Behaviour O O O O
during O O O O
elevated O O O O
water O O O O
temperatures O O O O
: O O O O
can O O O O
physiology O O O O
explain O O O O
movement O O O O
of O O O O
juvenile O O O O
Atlantic B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
salmon O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
to O O O O
cool O O O O
water O O O O
? O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Temperature O O O O
governs O O O O
most O O O O
physiological O O O O
processes O O O O
in O O O O
animals O O O O
. O O O O
    
Ectotherms O O O O
behaviourally O O O O
thermoregulate O O O O
by O O O O
selecting O O O O
habitats O O O O
with O O O O
temperatures O O O O
regulating O O O O
their O O O O
body O O O O
temperature O O O O
for O O O O
optimal O O O O
physiological O O O O
functioning O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
ectotherms O O O O
can O O O O
experience O O O O
temperature O O O O
extremes O O O O
forcing O O O O
the O O O O
organisms O O O O
to O O O O
seek O O O O
temperature O O O O
refuge O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Fish O O O O
actively O O O O
avoid O O O O
potentially O O O O
lethal O O O O
temperatures O O O O
by O O O O
moving O O O O
to O O O O
cool O O O O
- O O O O
water O O O O
sites O O O O
created O O O O
by O O O O
inflowing O O O O
tributaries O O O O
and O O O O
groundwater O O O O
seeps O O O O
. O O O O
    
Juvenile O O O O
Atlantic B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
salmon O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Salmo B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
salar O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
of O O O O
different O O O O
age O O O O
classes O O O O
exhibit O O O O
different O O O O
behavioural O O O O
responses O O O O
to O O O O
elevated O O O O
temperatures O O O O
( O O O O
> O O O O
23 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Yearling O O O O
( O O O O
1 O O O O
+ O O O O
) O O O O
and O O O O
2 O O O O
- O O O O
year O O O O
- O O O O
old O O O O
( O O O O
2 O O O O
+ O O O O
) O O O O
Atlantic B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
salmon O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
often O O O O
cease O O O O
feeding O O O O
, O O O O
abandon O O O O
territorial O O O O
behaviour O O O O
and O O O O
swim O O O O
continuously O O O O
in O O O O
aggregations O O O O
in O O O O
cool O O O O
- O O O O
water O O O O
sites O O O O
; O O O O
whereas O O O O
young O O O O
- O O O O
of O O O O
- O O O O
the O O O O
- O O O O
year O O O O
( O O O O
0 O O O O
+ O O O O
) O O O O
fish O O O O
continue O O O O
defending O O O O
territories O O O O
and O O O O
foraging O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
This O O O O
study O O O O
determined O O O O
whether O O O O
the O O O O
behavioural O O O O
shift O O O O
in O O O O
older O O O O
individuals O O O O
( O O O O
2 O O O O
+ O O O O
) O O O O
occurred O O O O
when O O O O
basal O O O O
metabolic O O O O
rate O O O O
, O O O O
driven O O O O
by O O O O
increasing O O O O
water O O O O
temperature O O O O
, O O O O
reached O O O O
the O O O O
maximum O O O O
metabolic O O O O
rate O O O O
such O O O O
that O O O O
anaerobic O O O O
pathways O O O O
were O O O O
recruited O O O O
to O O O O
provide O O O O
energy O O O O
to O O O O
support O O O O
vital O O O O
processes O O O O
. O O O O
    
Behaviour O O O O
( O O O O
feeding O O O O
and O O O O
stress O O O O
responses O O O O
) O O O O
, O O O O
oxygen O O O O
consumption O O O O
, O O O O
muscle O O O O
lactate O O O O
and O O O O
glycogen O O O O
, O O O O
and O O O O
circulating O O O O
blood O O O O
lactate O O O O
and O O O O
glucose O O O O
concentrations O O O O
were O O O O
measured O O O O
in O O O O
wild O O O O
0 O O O O
+ O O O O
and O O O O
2 O O O O
+ O O O O
Atlantic B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
salmon O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
acclimated O O O O
to O O O O
water O O O O
temperatures O O O O
between O O O O
16 O O O O
and O O O O
28 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Results O O O O
indicate O O O O
that O O O O
oxygen O O O O
consumption O O O O
of O O O O
the O O O O
2 O O O O
+ O O O O
fish O O O O
increased O O O O
with O O O O
temperature O O O O
and O O O O
reached O O O O
a O O O O
plateau O O O O
at O O O O
24 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
, O O O O
a O O O O
temperature O O O O
that O O O O
corresponded O O O O
to O O O O
cessation O O O O
of O O O O
feeding O O O O
and O O O O
a O O O O
significant O O O O
increase O O O O
in O O O O
muscle O O O O
and O O O O
blood O O O O
lactate O O O O
levels O O O O
. O O O O
    
By O O O O
contrast O O O O
, O O O O
oxygen O O O O
consumption O O O O
in O O O O
0 O O O O
+ O O O O
fish O O O O
did O O O O
not O O O O
reach O O O O
a O O O O
plateau O O O O
, O O O O
feeding O O O O
continued O O O O
and O O O O
muscle O O O O
lactate O O O O
did O O O O
not O O O O
increase O O O O
, O O O O
even O O O O
at O O O O
the O O O O
highest O O O O
temperatures O O O O
tested O O O O
( O O O O
28 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
) O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
To O O O O
conclude O O O O
, O O O O
the O O O O
experiment O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
the O O O O
0 O O O O
+ O O O O
and O O O O
2 O O O O
+ O O O O
fish O O O O
had O O O O
different O O O O
physiological O O O O
responses O O O O
to O O O O
the O O O O
elevated O O O O
water O O O O
temperatures O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
wild O O O O
2 O O O O
+ O O O O
Atlantic B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
salmon O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
employ O O O O
behavioural O O O O
responses O O O O
( O O O O
e O O O O
. O O O O
g O O O O
. O O O O
movement O O O O
to O O O O
cool O O O O
- O O O O
water O O O O
sites O O O O
) O O O O
at O O O O
elevated O O O O
temperatures O O O O
in O O O O
an O O O O
effort O O O O
to O O O O
mitigate O O O O
physiological O O O O
imbalances O O O O
associated O O O O
with O O O O
an O O O O
inability O O O O
to O O O O
support O O O O
basal O O O O
metabolism O O O O
through O O O O
aerobic O O O O
metabolic O O O O
processes O O O O
. O O O O
    
Food O O O O
web O O O O
complexity O O O O
and O O O O
allometric O O O O
scaling O O O O
relationships O O O O
in O O O O
stream O O O O
mesocosms O O O O
: O O O O
implications O O O O
for O O O O
experimentation O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Mesocosms O O O O
are O O O O
used O O O O
extensively O O O O
by O O O O
ecologists O O O O
to O O O O
gain O O O O
a O O O O
mechanistic O O O O
understanding O O O O
of O O O O
ecosystems O O O O
based O O O O
on O O O O
the O O O O
often O O O O
untested O O O O
assumption O O O O
that O O O O
these O O O O
systems O O O O
can O O O O
replicate O O O O
the O O O O
key O O O O
attributes O O O O
of O O O O
natural O O O O
assemblages O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Previous O O O O
investigations O O O O
of O O O O
stream O O O O
mesocosm O O O O
utility O O O O
have O O O O
explored O O O O
community O O O O
composition O O O O
, O O O O
but O O O O
here O O O O
for O O O O
the O O O O
first O O O O
time O O O O
, O O O O
we O O O O
extend O O O O
the O O O O
approach O O O O
to O O O O
consider O O O O
the O O O O
replicability O O O O
and O O O O
realism O O O O
of O O O O
food O O O O
webs O O O O
in O O O O
four O O O O
outdoor O O O O
channels O O O O
( O O O O
4 O O O O
m O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
four O O O O
food O O O O
webs O O O O
were O O O O
similarly O O O O
complex O O O O
, O O O O
consisting O O O O
of O O O O
diverse O O O O
assemblages O O O O
( O O O O
61 O O O O
- O O O O
71 O O O O
taxa O O O O
) O O O O
with O O O O
dense O O O O
feeding O O O O
interactions O O O O
( O O O O
directed O O O O
connectance O O O O
0 O O O O
. O O O O
09 O O O O
- O O O O
0 O O O O
. O O O O
11 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Mesocosm O O O O
food O O O O
web O O O O
structural O O O O
attributes O O O O
were O O O O
within O O O O
the O O O O
range O O O O
reported O O O O
for O O O O
82 O O O O
well O O O O
- O O O O
characterized O O O O
food O O O O
webs O O O O
from O O O O
natural O O O O
streams O O O O
and O O O O
rivers O O O O
. O O O O
    
When O O O O
compared O O O O
with O O O O
112 O O O O
additional O O O O
food O O O O
webs O O O O
from O O O O
standing O O O O
freshwater O O O O
, O O O O
marine O O O O
, O O O O
estuarine O O O O
and O O O O
terrestrial O O O O
environments O O O O
, O O O O
stream O O O O
food O O O O
webs O O O O
( O O O O
including O O O O
mesocosms O O O O
) O O O O
had O O O O
similar O O O O
characteristic O O O O
path O O O O
lengths O O O O
, O O O O
but O O O O
typically O O O O
lower O O O O
mean O O O O
food O O O O
chain O O O O
length O O O O
and O O O O
exponents O O O O
for O O O O
the O O O O
species O O O O
- O O O O
link O O O O
relationship O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
Body O O O O
size O O O O
( O O O O
M O O O O
) O O O O
abundance O O O O
( O O O O
N O O O O
) O O O O
allometric O O O O
scaling O O O O
coefficients O O O O
for O O O O
trivariate O O O O
taxonomic O O O O
mesocosm O O O O
food O O O O
webs O O O O
( O O O O
- O O O O
0 O O O O
. O O O O
53 O O O O
to O O O O
- O O O O
0 O O O O
. O O O O
49 O O O O
) O O O O
and O O O O
individual O O O O
size O O O O
distributions O O O O
( O O O O
- O O O O
0 O O O O
. O O O O
60 O O O O
to O O O O
- O O O O
0 O O O O
. O O O O
58 O O O O
) O O O O
were O O O O
consistent O O O O
and O O O O
similar O O O O
to O O O O
those O O O O
from O O O O
natural O O O O
systems O O O O
, O O O O
suggesting O O O O
that O O O O
patterns O O O O
of O O O O
energy O O O O
flux O O O O
between O O O O
mesocosm O O O O
consumers O O O O
and O O O O
resources O O O O
were O O O O
realistic O O O O
approximations O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
stream O O O O
mesocosms O O O O
of O O O O
this O O O O
scale O O O O
can O O O O
support O O O O
replicate O O O O
food O O O O
webs O O O O
with O O O O
a O O O O
degree O O O O
of O O O O
biocomplexity O O O O
that O O O O
is O O O O
comparable O O O O
to O O O O
' O O O O
natural O O O O
' O O O O
streams O O O O
. O O O O
    
The O O O O
findings O O O O
highlight O O O O
the O O O O
potential O O O O
value O O O O
of O O O O
mesocosms O O O O
as O O O O
model O O O O
systems O O O O
for O O O O
performing O O O O
experimental O O O O
manipulations O O O O
to O O O O
test O O O O
ecological O O O O
theories O O O O
, O O O O
at O O O O
spatiotemporal O O O O
scales O O O O
of O O O O
relevance O O O O
to O O O O
natural O O O O
ecosystems O O O O
. O O O O
    
Tuberculosis O O O O
. O O O O
    
Tuberculosis O O O O
results O O O O
in O O O O
an O O O O
estimated O O O O
1 O O O O
* O O O O
7 O O O O
million O O O O
deaths O O O O
each O O O O
year O O O O
and O O O O
the O O O O
worldwide O O O O
number O O O O
of O O O O
new O O O O
cases O O O O
( O O O O
more O O O O
than O O O O
9 O O O O
million O O O O
) O O O O
is O O O O
higher O O O O
than O O O O
at O O O O
any O O O O
other O O O O
time O O O O
in O O O O
history O O O O
. O O O O
    
22 O O O O
low O O O O
- O O O O
income O O O O
and O O O O
middle O O O O
- O O O O
income O O O O
countries O O O O
account O O O O
for O O O O
more O O O O
than O O O O
80 O O O O
% O O O O
of O O O O
the O O O O
active O O O O
cases O O O O
in O O O O
the O O O O
world O O O O
. O O O O
    
Due O O O O
to O O O O
the O O O O
devastating O O O O
effect O O O O
of O O O O
HIV O O O O
on O O O O
susceptibility O O O O
to O O O O
tuberculosis O O O O
, O O O O
sub O O O O
- O O O O
Saharan O O O O
Africa O O O O
has O O O O
been O O O O
disproportionately O O O O
affected O O O O
and O O O O
accounts O O O O
for O O O O
four O O O O
of O O O O
every O O O O
five O O O O
cases O O O O
of O O O O
HIV O O O O
- O O O O
associated O O O O
tuberculosis O O O O
. O O O O
    
In O O O O
many O O O O
regions O O O O
highly O O O O
endemic O O O O
for O O O O
tuberculosis O O O O
, O O O O
diagnosis O O O O
continues O O O O
to O O O O
rely O O O O
on O O O O
century O O O O
- O O O O
old O O O O
sputum O O O O
microscopy O O O O
; O O O O
there O O O O
is O O O O
no O O O O
vaccine O O O O
with O O O O
adequate O O O O
effectiveness O O O O
and O O O O
tuberculosis O O O O
treatment O O O O
regimens O O O O
are O O O O
protracted O O O O
and O O O O
have O O O O
a O O O O
risk O O O O
of O O O O
toxic O O O O
effects O O O O
. O O O O
    
Increasing O O O O
rates O O O O
of O O O O
drug O O O O
- O O O O
resistant O O O O
tuberculosis O O O O
in O O O O
eastern O O O O
Europe O O O O
, O O O O
Asia O O O O
, O O O O
and O O O O
sub O O O O
- O O O O
Saharan O O O O
Africa O O O O
now O O O O
threaten O O O O
to O O O O
undermine O O O O
the O O O O
gains O O O O
made O O O O
by O O O O
worldwide O O O O
tuberculosis O O O O
control O O O O
programmes O O O O
. O O O O
    
Moreover O O O O
, O O O O
our O O O O
fundamental O O O O
understanding O O O O
of O O O O
the O O O O
pathogenesis O O O O
of O O O O
this O O O O
disease O O O O
is O O O O
inadequate O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
increased O O O O
investment O O O O
has O O O O
allowed O O O O
basic O O O O
science O O O O
and O O O O
translational O O O O
and O O O O
applied O O O O
research O O O O
to O O O O
produce O O O O
new O O O O
data O O O O
, O O O O
leading O O O O
to O O O O
promising O O O O
progress O O O O
in O O O O
the O O O O
development O O O O
of O O O O
improved O O O O
tuberculosis O O O O
diagnostics O O O O
, O O O O
biomarkers O O O O
of O O O O
disease O O O O
activity O O O O
, O O O O
drugs O O O O
, O O O O
and O O O O
vaccines O O O O
. O O O O
    
The O O O O
growing O O O O
scientific O O O O
momentum O O O O
must O O O O
be O O O O
accompanied O O O O
by O O O O
much O O O O
greater O O O O
investment O O O O
and O O O O
political O O O O
commitment O O O O
to O O O O
meet O O O O
this O O O O
huge O O O O
persisting O O O O
challenge O O O O
to O O O O
public O O O O
health O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
Seminar O O O O
presents O O O O
current O O O O
perspectives O O O O
on O O O O
the O O O O
scale O O O O
of O O O O
the O O O O
epidemic O O O O
, O O O O
the O O O O
pathogen O O O O
and O O O O
the O O O O
host O O O O
response O O O O
, O O O O
present O O O O
and O O O O
emerging O O O O
methods O O O O
for O O O O
disease O O O O
control O O O O
( O O O O
including O O O O
diagnostics O O O O
, O O O O
drugs O O O O
, O O O O
biomarkers O O O O
, O O O O
and O O O O
vaccines O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
ongoing O O O O
challenge O O O O
of O O O O
tuberculosis O O O O
control O O O O
in O O O O
adults O O O O
in O O O O
the O O O O
21st O O O O
century O O O O
. O O O O
    
Characterization O O O O
of O O O O
an O O O O
omega O O O O
- O O O O
class O O O O
glutathione O O O O
S O O O O
- O O O O
transferase O O O O
in O O O O
the O O O O
stress O O O O
response O O O O
of O O O O
the O O O O
silkmoth B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
glutathione O O O O
S O O O O
- O O O O
transferase O O O O
( O O O O
GST O O O O
) O O O O
superfamily O O O O
is O O O O
involved O O O O
in O O O O
detoxification O O O O
of O O O O
various O O O O
xenobiotics O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
real O O O O
- O O O O
time O O O O
PCR O O O O
, O O O O
mRNA O O O O
encoding O O O O
an O O O O
omega O O O O
- O O O O
class O O O O
GST O O O O
of O O O O
Bombyx B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mori O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
bmGSTO O O O O
) O O O O
was O O O O
shown O O O O
to O O O O
be O O O O
induced O O O O
after O O O O
exposure O O O O
to O O O O
various O O O O
environmental O O O O
stresses O O O O
. O O O O
    
A O O O O
soluble O O O O
form O O O O
of O O O O
recombinant O O O O
protein O O O O
( O O O O
rbmGSTO O O O O
) O O O O
was O O O O
functionally O O O O
overexpressed O O O O
in O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cells O O O O
and O O O O
purified O O O O
to O O O O
homogeneity O O O O
. O O O O
    
Cys O O O O
38 O O O O
and O O O O
Pro O O O O
39 O O O O
were O O O O
found O O O O
to O O O O
be O O O O
highly O O O O
conserved O O O O
in O O O O
omega O O O O
- O O O O
class O O O O
GSTs O O O O
, O O O O
and O O O O
their O O O O
roles O O O O
were O O O O
investigated O O O O
by O O O O
site O O O O
- O O O O
directed O O O O
mutagenesis O O O O
/ O O O O
kinetic O O O O
analysis O O O O
. O O O O
    
Mutations O O O O
of O O O O
Cys O O O O
38 O O O O
and O O O O
Pro O O O O
39 O O O O
residues O O O O
affected O O O O
the O O O O
catalytic O O O O
efficiency O O O O
of O O O O
enzymes O O O O
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
Cys O O O O
38 O O O O
and O O O O
Pro O O O O
39 O O O O
residues O O O O
is O O O O
important O O O O
for O O O O
bmGSTO O O O O
activity O O O O
. O O O O
    
Thus O O O O
, O O O O
bmGSTO O O O O
could O O O O
contribute O O O O
to O O O O
increasing O O O O
the O O O O
environmental O O O O
stress O O O O
resistance O O O O
of O O O O
lepidopteran O O O O
insects O O O O
. O O O O
    
Treatment O O O O
advances O O O O
in O O O O
neonatal O O O O
neuroprotection O O O O
and O O O O
neurointensive O O O O
care O O O O
. O O O O
    
Knowledge O O O O
of O O O O
the O O O O
nature O O O O
, O O O O
prognosis O O O O
, O O O O
and O O O O
ways O O O O
to O O O O
treat O O O O
brain O O O O
lesions O O O O
in O O O O
neonatal O O O O
infants O O O O
has O O O O
increased O O O O
remarkably O O O O
. O O O O
    
Neonatal O O O O
hypoxic O O O O
- O O O O
ischaemic O O O O
encephalopathy O O O O
( O O O O
HIE O O O O
) O O O O
in O O O O
term O O O O
infants O O O O
, O O O O
mirrors O O O O
a O O O O
progressive O O O O
cascade O O O O
of O O O O
excito O O O O
- O O O O
oxidative O O O O
events O O O O
that O O O O
unfold O O O O
in O O O O
the O O O O
brain O O O O
after O O O O
an O O O O
asphyxial O O O O
insult O O O O
. O O O O
    
In O O O O
the O O O O
laboratory O O O O
, O O O O
this O O O O
cascade O O O O
can O O O O
be O O O O
blocked O O O O
to O O O O
protect O O O O
brain O O O O
tissue O O O O
through O O O O
the O O O O
process O O O O
of O O O O
neuroprotection O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
proof O O O O
of O O O O
a O O O O
clinical O O O O
effect O O O O
was O O O O
lacking O O O O
until O O O O
the O O O O
publication O O O O
of O O O O
three O O O O
positive O O O O
randomised O O O O
controlled O O O O
trials O O O O
of O O O O
moderate O O O O
hypothermia O O O O
for O O O O
term O O O O
infants O O O O
with O O O O
HIE O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
have O O O O
greatly O O O O
improved O O O O
treatment O O O O
prospects O O O O
for O O O O
babies O O O O
with O O O O
asphyxia O O O O
and O O O O
altered O O O O
understanding O O O O
of O O O O
the O O O O
theory O O O O
of O O O O
neuroprotection O O O O
. O O O O
    
The O O O O
studies O O O O
show O O O O
that O O O O
moderate O O O O
hypothermia O O O O
within O O O O
6 O O O O
h O O O O
of O O O O
asphyxia O O O O
improves O O O O
survival O O O O
without O O O O
cerebral O O O O
palsy O O O O
or O O O O
other O O O O
disability O O O O
by O O O O
about O O O O
40 O O O O
% O O O O
and O O O O
reduces O O O O
death O O O O
or O O O O
neurological O O O O
disability O O O O
by O O O O
nearly O O O O
30 O O O O
% O O O O
. O O O O
    
The O O O O
search O O O O
is O O O O
on O O O O
to O O O O
discover O O O O
adjuvant O O O O
treatments O O O O
that O O O O
can O O O O
further O O O O
enhance O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
hypothermia O O O O
. O O O O
    
Origin O O O O
and O O O O
evolution O O O O
of O O O O
the O O O O
canal O O O O
raphe O O O O
system O O O O
in O O O O
diatoms O O O O
. O O O O
    
One O O O O
lineage O O O O
of O O O O
pennate O O O O
diatoms O O O O
has O O O O
a O O O O
slit O O O O
through O O O O
the O O O O
siliceous O O O O
cell O O O O
wall O O O O
, O O O O
called O O O O
a O O O O
"""" O O O O
raphe O O O O
, O O O O
"""" O O O O
that O O O O
functions O O O O
in O O O O
motility O O O O
. O O O O
    
Raphid O O O O
pennate O O O O
diatoms O O O O
number O O O O
in O O O O
the O O O O
perhaps O O O O
tens O O O O
of O O O O
thousands O O O O
of O O O O
species O O O O
, O O O O
with O O O O
the O O O O
diversity O O O O
of O O O O
raphe O O O O
forms O O O O
potentially O O O O
matching O O O O
this O O O O
number O O O O
. O O O O
    
Three O O O O
lineages O O O O
- O O O O
the O O O O
Bacillariales O O O O
, O O O O
Rhopalodiales O O O O
, O O O O
and O O O O
Surirellales O O O O
- O O O O
possess O O O O
a O O O O
complex O O O O
and O O O O
presumably O O O O
highly O O O O
derived O O O O
raphe O O O O
that O O O O
is O O O O
physically O O O O
separated O O O O
from O O O O
the O O O O
cell O O O O
interior O O O O
, O O O O
most O O O O
often O O O O
by O O O O
a O O O O
set O O O O
of O O O O
siliceous O O O O
braces O O O O
. O O O O
    
Because O O O O
the O O O O
relationship O O O O
among O O O O
these O O O O
three O O O O
lineages O O O O
is O O O O
unclear O O O O
, O O O O
the O O O O
number O O O O
of O O O O
origins O O O O
of O O O O
the O O O O
canal O O O O
raphe O O O O
system O O O O
and O O O O
the O O O O
homology O O O O
of O O O O
it O O O O
and O O O O
its O O O O
constitutive O O O O
parts O O O O
among O O O O
these O O O O
lineages O O O O
, O O O O
is O O O O
equally O O O O
unclear O O O O
. O O O O
    
We O O O O
reconstructed O O O O
the O O O O
phylogeny O O O O
of O O O O
raphid O O O O
pennate O O O O
diatoms O O O O
and O O O O
included O O O O
, O O O O
for O O O O
the O O O O
first O O O O
time O O O O
, O O O O
members O O O O
of O O O O
all O O O O
three O O O O
canal O O O O
raphid O O O O
diatom O O O O
lineages O O O O
, O O O O
and O O O O
used O O O O
the O O O O
phylogeny O O O O
to O O O O
test O O O O
specific O O O O
hypotheses O O O O
about O O O O
the O O O O
origin O O O O
of O O O O
the O O O O
canal O O O O
raphe O O O O
. O O O O
    
The O O O O
canal O O O O
raphe O O O O
appears O O O O
to O O O O
have O O O O
evolved O O O O
twice O O O O
, O O O O
once O O O O
in O O O O
the O O O O
common O O O O
ancestor O O O O
of O O O O
Bacillariales O O O O
and O O O O
once O O O O
in O O O O
the O O O O
common O O O O
ancestor O O O O
of O O O O
Rhopalodiales O O O O
and O O O O
Surirellales O O O O
, O O O O
which O O O O
form O O O O
a O O O O
monophyletic O O O O
group O O O O
in O O O O
our O O O O
analyses O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
recommend O O O O
careful O O O O
follow O O O O
- O O O O
up O O O O
morphogenesis O O O O
studies O O O O
of O O O O
the O O O O
canal O O O O
raphe O O O O
in O O O O
these O O O O
two O O O O
lineages O O O O
to O O O O
determine O O O O
the O O O O
underlying O O O O
developmental O O O O
basis O O O O
for O O O O
this O O O O
remarkable O O O O
case O O O O
of O O O O
parallel O O O O
evolution O O O O
. O O O O
    
Osteoporosis O O O O
: O O O O
now O O O O
and O O O O
the O O O O
future O O O O
. O O O O
    
Osteoporosis O O O O
is O O O O
a O O O O
common O O O O
disease O O O O
characterised O O O O
by O O O O
a O O O O
systemic O O O O
impairment O O O O
of O O O O
bone O O O O
mass O O O O
and O O O O
microarchitecture O O O O
that O O O O
results O O O O
in O O O O
fragility O O O O
fractures O O O O
. O O O O
    
With O O O O
an O O O O
ageing O O O O
population O O O O
, O O O O
the O O O O
medical O O O O
and O O O O
socioeconomic O O O O
effect O O O O
of O O O O
osteoporosis O O O O
, O O O O
particularly O O O O
postmenopausal O O O O
osteoporosis O O O O
, O O O O
will O O O O
increase O O O O
further O O O O
. O O O O
    
A O O O O
detailed O O O O
knowledge O O O O
of O O O O
bone O O O O
biology O O O O
with O O O O
molecular O O O O
insights O O O O
into O O O O
the O O O O
communication O O O O
between O O O O
bone O O O O
- O O O O
forming O O O O
osteoblasts O O O O
and O O O O
bone O O O O
- O O O O
resorbing O O O O
osteoclasts O O O O
and O O O O
the O O O O
orchestrating O O O O
signalling O O O O
network O O O O
has O O O O
led O O O O
to O O O O
the O O O O
identification O O O O
of O O O O
novel O O O O
therapeutic O O O O
targets O O O O
. O O O O
    
Novel O O O O
treatment O O O O
strategies O O O O
have O O O O
been O O O O
developed O O O O
that O O O O
aim O O O O
to O O O O
inhibit O O O O
excessive O O O O
bone O O O O
resorption O O O O
and O O O O
increase O O O O
bone O O O O
formation O O O O
. O O O O
    
The O O O O
most O O O O
promising O O O O
novel O O O O
treatments O O O O
include O O O O
: O O O O
denosumab O O O O
, O O O O
a O O O O
monoclonal O O O O
antibody O O O O
for O O O O
receptor O O O O
activator O O O O
of O O O O
NF O O O O
- O O O O
kappaB O O O O
ligand O O O O
, O O O O
a O O O O
key O O O O
osteoclast O O O O
cytokine O O O O
; O O O O
odanacatib O O O O
, O O O O
a O O O O
specific O O O O
inhibitor O O O O
of O O O O
the O O O O
osteoclast O O O O
protease O O O O
cathepsin O O O O
K O O O O
; O O O O
and O O O O
antibodies O O O O
against O O O O
the O O O O
proteins O O O O
sclerostin O O O O
and O O O O
dickkopf O O O O
- O O O O
1 O O O O
, O O O O
two O O O O
endogenous O O O O
inhibitors O O O O
of O O O O
bone O O O O
formation O O O O
. O O O O
    
This O O O O
overview O O O O
discusses O O O O
these O O O O
novel O O O O
therapies O O O O
and O O O O
explains O O O O
their O O O O
underlying O O O O
physiology O O O O
. O O O O
    
Increasing O O O O
burden O O O O
of O O O O
liver O O O O
disease O O O O
in O O O O
patients O O O O
with O O O O
HIV O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
Introduction O O O O
of O O O O
effective O O O O
combined O O O O
antiretroviral O O O O
therapy O O O O
has O O O O
made O O O O
HIV O O O O
infection O O O O
a O O O O
chronic O O O O
illness O O O O
. O O O O
    
Substantial O O O O
reductions O O O O
in O O O O
the O O O O
number O O O O
of O O O O
AIDS O O O O
- O O O O
related O O O O
deaths O O O O
have O O O O
been O O O O
accompanied O O O O
by O O O O
an O O O O
increase O O O O
in O O O O
liver O O O O
- O O O O
related O O O O
morbidity O O O O
and O O O O
mortality O O O O
due O O O O
to O O O O
co O O O O
- O O O O
infection O O O O
with O O O O
chronic O O O O
hepatitis O O O O
B O O O O
and O O O O
C O O O O
viruses O O O O
. O O O O
    
Increases O O O O
in O O O O
non O O O O
- O O O O
alcoholic O O O O
fatty O O O O
liver O O O O
disease O O O O
and O O O O
drug O O O O
- O O O O
induced O O O O
hepatotoxicity O O O O
, O O O O
together O O O O
with O O O O
development O O O O
of O O O O
hepatocellular O O O O
carcinoma O O O O
, O O O O
also O O O O
potentiate O O O O
the O O O O
burden O O O O
of O O O O
liver O O O O
disease O O O O
in O O O O
individuals O O O O
with O O O O
HIV O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
We O O O O
provide O O O O
an O O O O
overview O O O O
of O O O O
the O O O O
key O O O O
causes O O O O
, O O O O
disease O O O O
mechanisms O O O O
of O O O O
pathogenesis O O O O
, O O O O
and O O O O
recommendations O O O O
for O O O O
treatment O O O O
options O O O O
including O O O O
the O O O O
evolving O O O O
role O O O O
of O O O O
liver O O O O
transplantation O O O O
. O O O O
    
Adaptive O O O O
trade O O O O
- O O O O
offs O O O O
in O O O O
juvenile O O O O
salmonid O O O O
metabolism O O O O
associated O O O O
with O O O O
habitat O O O O
partitioning O O O O
between O O O O
coho B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
salmon O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
steelhead B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trout O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
in O O O O
coastal O O O O
streams O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Adaptive O O O O
trade O O O O
- O O O O
offs O O O O
are O O O O
fundamental O O O O
to O O O O
the O O O O
evolution O O O O
of O O O O
diversity O O O O
and O O O O
the O O O O
coexistence O O O O
of O O O O
similar O O O O
taxa O O O O
and O O O O
occur O O O O
when O O O O
complimentary O O O O
combinations O O O O
of O O O O
traits O O O O
maximize O O O O
efficiency O O O O
of O O O O
resource O O O O
exploitation O O O O
or O O O O
survival O O O O
at O O O O
different O O O O
points O O O O
on O O O O
environmental O O O O
gradients O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
Standard O O O O
metabolic O O O O
rate O O O O
( O O O O
SMR O O O O
) O O O O
is O O O O
a O O O O
key O O O O
physiological O O O O
trait O O O O
that O O O O
reflects O O O O
adaptations O O O O
to O O O O
baseline O O O O
metabolic O O O O
performance O O O O
, O O O O
whereas O O O O
active O O O O
metabolism O O O O
reflects O O O O
adaptations O O O O
to O O O O
variable O O O O
metabolic O O O O
output O O O O
associated O O O O
with O O O O
performance O O O O
related O O O O
to O O O O
foraging O O O O
, O O O O
predator O O O O
avoidance O O O O
, O O O O
aggressive O O O O
interactions O O O O
or O O O O
migratory O O O O
movements O O O O
. O O O O
    
Benefits O O O O
of O O O O
high O O O O
SMR O O O O
and O O O O
active O O O O
metabolism O O O O
may O O O O
change O O O O
along O O O O
a O O O O
resource O O O O
( O O O O
productivity O O O O
) O O O O
gradient O O O O
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
a O O O O
trade O O O O
- O O O O
off O O O O
exists O O O O
among O O O O
active O O O O
metabolism O O O O
, O O O O
resting O O O O
metabolism O O O O
and O O O O
energy O O O O
intake O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
measured O O O O
and O O O O
compared O O O O
SMR O O O O
, O O O O
maximal O O O O
metabolic O O O O
rate O O O O
( O O O O
MMR O O O O
) O O O O
, O O O O
aerobic O O O O
scope O O O O
( O O O O
AS O O O O
) O O O O
, O O O O
swim O O O O
performance O O O O
( O O O O
UCrit O O O O
) O O O O
and O O O O
growth O O O O
of O O O O
juvenile O O O O
hatchery O O O O
and O O O O
wild O O O O
steelhead B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
coho B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
salmon O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
held O O O O
on O O O O
high O O O O
- O O O O
and O O O O
low O O O O
- O O O O
food O O O O
rations O O O O
in O O O O
order O O O O
to O O O O
better O O O O
understand O O O O
the O O O O
potential O O O O
significance O O O O
of O O O O
variation O O O O
in O O O O
SMR O O O O
to O O O O
growth O O O O
, O O O O
differentiation O O O O
between O O O O
species O O O O
, O O O O
and O O O O
patterns O O O O
of O O O O
habitat O O O O
use O O O O
along O O O O
a O O O O
productivity O O O O
gradient O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
that O O O O
differences O O O O
in O O O O
SMR O O O O
, O O O O
MMR O O O O
, O O O O
AS O O O O
, O O O O
swim O O O O
performance O O O O
and O O O O
growth O O O O
rate O O O O
between O O O O
steelhead B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trout O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
coho B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
salmon O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
were O O O O
reduced O O O O
in O O O O
hatchery O O O O
- O O O O
reared O O O O
fish O O O O
compared O O O O
with O O O O
wild O O O O
fish O O O O
. O O O O
    
Wild O O O O
steelhead B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
had O O O O
a O O O O
higher O O O O
MMR O O O O
, O O O O
AS O O O O
, O O O O
swim O O O O
performance O O O O
and O O O O
growth O O O O
rate O O O O
than O O O O
wild O O O O
coho B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
but O O O O
adaptations O O O O
between O O O O
species O O O O
do O O O O
not O O O O
appear O O O O
to O O O O
involve O O O O
differences O O O O
in O O O O
SMR O O O O
or O O O O
to O O O O
trade O O O O
- O O O O
off O O O O
increased O O O O
growth O O O O
rate O O O O
against O O O O
lower O O O O
swim O O O O
performance O O O O
, O O O O
as O O O O
commonly O O O O
observed O O O O
for O O O O
high O O O O
- O O O O
growth O O O O
strains O O O O
. O O O O
    
Instead O O O O
, O O O O
we O O O O
hypothesize O O O O
that O O O O
wild O O O O
steelhead B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
may O O O O
be O O O O
trading O O O O
off O O O O
higher O O O O
growth O O O O
rate O O O O
for O O O O
lower O O O O
food O O O O
consumption O O O O
efficiency O O O O
, O O O O
similar O O O O
to O O O O
strategies O O O O
adopted O O O O
by O O O O
anadromous O O O O
vs O O O O
. O O O O
resident O O O O
brook B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trout O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Atlantic B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
salmon O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
vs O O O O
. O O O O
brook B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
trout O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
This O O O O
highlights O O O O
potential O O O O
differences O O O O
in O O O O
food O O O O
consumption O O O O
and O O O O
digestion O O O O
strategies O O O O
as O O O O
cryptic O O O O
adaptations O O O O
ecologically O O O O
differentiating O O O O
salmonid O O O O
species O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
hypothesize O O O O
that O O O O
divergent O O O O
digestive O O O O
strategies O O O O
, O O O O
which O O O O
are O O O O
common O O O O
and O O O O
well O O O O
documented O O O O
among O O O O
terrestrial O O O O
vertebrates O O O O
, O O O O
may O O O O
be O O O O
an O O O O
important O O O O
but O O O O
overlooked O O O O
aspect O O O O
of O O O O
adaptive O O O O
strategies O O O O
of O O O O
juvenile O O O O
salmonids O O O O
, O O O O
and O O O O
fish O O O O
in O O O O
general O O O O
. O O O O
    
Natal O O O O
conditions O O O O
alter O O O O
age O O O O
- O O O O
specific O O O O
reproduction O O O O
but O O O O
not O O O O
survival O O O O
or O O O O
senescence O O O O
in O O O O
a O O O O
long O O O O
- O O O O
lived O O O O
bird O O O O
of O O O O
prey O O O O
. O O O O
    
1 O O O O
. O O O O
    
Natal O O O O
conditions O O O O
and O O O O
senescence O O O O
are O O O O
two O O O O
major O O O O
factors O O O O
shaping O O O O
life O O O O
- O O O O
history O O O O
traits O O O O
of O O O O
wild O O O O
animals O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
such O O O O
factors O O O O
have O O O O
rarely O O O O
been O O O O
investigated O O O O
together O O O O
, O O O O
and O O O O
it O O O O
remains O O O O
largely O O O O
unknown O O O O
whether O O O O
they O O O O
interact O O O O
to O O O O
affect O O O O
age O O O O
- O O O O
specific O O O O
performance O O O O
. O O O O
    
2 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
used O O O O
27 O O O O
years O O O O
of O O O O
longitudinal O O O O
data O O O O
collected O O O O
on O O O O
tawny B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
owls O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
with O O O O
estimates O O O O
of O O O O
prey O O O O
density O O O O
( O O O O
field O O O O
voles O O O O
) O O O O
from O O O O
Kielder O O O O
Forest O O O O
( O O O O
UK O O O O
) O O O O
to O O O O
investigate O O O O
how O O O O
prey O O O O
density O O O O
at O O O O
birth O O O O
affects O O O O
ageing O O O O
patterns O O O O
in O O O O
reproduction O O O O
and O O O O
survival O O O O
. O O O O
    
3 O O O O
. O O O O
    
Natal O O O O
conditions O O O O
experienced O O O O
by O O O O
tawny B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
owls O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
measured O O O O
in O O O O
terms O O O O
of O O O O
vole O O O O
density O O O O
, O O O O
dramatically O O O O
varied O O O O
among O O O O
cohorts O O O O
and O O O O
explained O O O O
87 O O O O
% O O O O
of O O O O
the O O O O
deviance O O O O
in O O O O
first O O O O
- O O O O
year O O O O
apparent O O O O
survival O O O O
( O O O O
annual O O O O
estimates O O O O
ranging O O O O
from O O O O
0 O O O O
* O O O O
07 O O O O
to O O O O
0 O O O O
* O O O O
33 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
4 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
evidence O O O O
for O O O O
senescence O O O O
in O O O O
survival O O O O
for O O O O
females O O O O
as O O O O
well O O O O
as O O O O
for O O O O
males O O O O
. O O O O
    
Model O O O O
- O O O O
averaged O O O O
estimates O O O O
showed O O O O
that O O O O
adult O O O O
survival O O O O
probability O O O O
declined O O O O
linearly O O O O
with O O O O
age O O O O
for O O O O
females O O O O
from O O O O
age O O O O
1 O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
, O O O O
male O O O O
survival O O O O
probability O O O O
, O O O O
lower O O O O
on O O O O
average O O O O
than O O O O
for O O O O
female O O O O
, O O O O
declined O O O O
after O O O O
a O O O O
plateau O O O O
at O O O O
age O O O O
1 O O O O
- O O O O
3 O O O O
. O O O O
    
5 O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
found O O O O
evidence O O O O
for O O O O
reproductive O O O O
senescence O O O O
( O O O O
number O O O O
of O O O O
offspring O O O O
) O O O O
. O O O O
    
For O O O O
females O O O O
, O O O O
reproductive O O O O
performance O O O O
increased O O O O
until O O O O
age O O O O
9 O O O O
then O O O O
declined O O O O
. O O O O
    
Males O O O O
showed O O O O
an O O O O
earlier O O O O
decline O O O O
in O O O O
reproductive O O O O
performance O O O O
with O O O O
an O O O O
onset O O O O
of O O O O
senescence O O O O
at O O O O
age O O O O
3 O O O O
. O O O O
    
6 O O O O
. O O O O
    
Long O O O O
- O O O O
lasting O O O O
effects O O O O
of O O O O
natal O O O O
environmental O O O O
conditions O O O O
were O O O O
sex O O O O
specific O O O O
. O O O O
    
Female O O O O
reproductive O O O O
performance O O O O
was O O O O
substantially O O O O
related O O O O
to O O O O
natal O O O O
conditions O O O O
( O O O O
difference O O O O
of O O O O
0 O O O O
* O O O O
24 O O O O
fledgling O O O O
per O O O O
breeding O O O O
event O O O O
between O O O O
females O O O O
born O O O O
in O O O O
the O O O O
first O O O O
or O O O O
third O O O O
quartile O O O O
of O O O O
vole O O O O
density O O O O
) O O O O
, O O O O
whereas O O O O
male O O O O
performance O O O O
was O O O O
not O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
no O O O O
evidence O O O O
for O O O O
tawny B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
owls O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
born O O O O
in O O O O
years O O O O
with O O O O
low O O O O
prey O O O O
density O O O O
having O O O O
accelerated O O O O
rates O O O O
of O O O O
senescence O O O O
. O O O O
    
7 O O O O
. O O O O
    
Our O O O O
results O O O O
, O O O O
combined O O O O
with O O O O
previous O O O O
findings O O O O
, O O O O
suggest O O O O
the O O O O
way O O O O
natal O O O O
environmental O O O O
conditions O O O O
affect O O O O
senescence O O O O
varies O O O O
not O O O O
only O O O O
across O O O O
species O O O O
but O O O O
also O O O O
within O O O O
species O O O O
according O O O O
to O O O O
gender O O O O
and O O O O
the O O O O
demographic O O O O
trait O O O O
considered O O O O
. O O O O
    
Post O O O O
- O O O O
splenectomy O O O O
and O O O O
hyposplenic O O O O
states O O O O
. O O O O
    
The O O O O
spleen O O O O
is O O O O
crucial O O O O
in O O O O
regulating O O O O
immune O O O O
homoeostasis O O O O
through O O O O
its O O O O
ability O O O O
to O O O O
link O O O O
innate O O O O
and O O O O
adaptive O O O O
immunity O O O O
and O O O O
in O O O O
protecting O O O O
against O O O O
infections O O O O
. O O O O
    
The O O O O
impairment O O O O
of O O O O
splenic O O O O
function O O O O
is O O O O
defined O O O O
as O O O O
hyposplenism O O O O
, O O O O
an O O O O
acquired O O O O
disorder O O O O
caused O O O O
by O O O O
several O O O O
haematological O O O O
and O O O O
immunological O O O O
diseases O O O O
. O O O O
    
The O O O O
term O O O O
asplenia O O O O
refers O O O O
to O O O O
the O O O O
absence O O O O
of O O O O
the O O O O
spleen O O O O
, O O O O
a O O O O
condition O O O O
that O O O O
is O O O O
rarely O O O O
congenital O O O O
and O O O O
mostly O O O O
post O O O O
- O O O O
surgical O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
hyposplenism O O O O
and O O O O
asplenia O O O O
might O O O O
predispose O O O O
individuals O O O O
to O O O O
thromboembolic O O O O
events O O O O
, O O O O
in O O O O
this O O O O
Review O O O O
we O O O O
focus O O O O
on O O O O
infectious O O O O
complications O O O O
, O O O O
which O O O O
are O O O O
the O O O O
most O O O O
widely O O O O
recognised O O O O
consequences O O O O
of O O O O
these O O O O
states O O O O
. O O O O
    
Because O O O O
of O O O O
the O O O O
high O O O O
mortality O O O O
, O O O O
the O O O O
fulminant O O O O
course O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
refractoriness O O O O
to O O O O
common O O O O
treatment O O O O
of O O O O
overwhelming O O O O
infections O O O O
caused O O O O
by O O O O
encapsulated O O O O
bacteria O O O O
, O O O O
prevention O O O O
through O O O O
vaccination O O O O
and O O O O
antibiotic O O O O
prophylaxis O O O O
is O O O O
the O O O O
basis O O O O
of O O O O
the O O O O
management O O O O
of O O O O
patients O O O O
who O O O O
have O O O O
had O O O O
splenectomy O O O O
or O O O O
have O O O O
hyposplenism O O O O
. O O O O
    
In O O O O
this O O O O
Review O O O O
, O O O O
we O O O O
critically O O O O
assess O O O O
clinical O O O O
and O O O O
diagnostic O O O O
aspects O O O O
of O O O O
splenic O O O O
dysfunction O O O O
and O O O O
highlight O O O O
new O O O O
perspectives O O O O
in O O O O
the O O O O
prevention O O O O
of O O O O
overwhelming O O O O
post O O O O
- O O O O
splenectomy O O O O
infections O O O O
. O O O O
    
Priority O O O O
actions O O O O
for O O O O
the O O O O
non O O O O
- O O O O
communicable O O O O
disease O O O O
crisis O O O O
. O O O O
    
The O O O O
UN O O O O
High O O O O
- O O O O
Level O O O O
Meeting O O O O
on O O O O
Non O O O O
- O O O O
Communicable O O O O
Diseases O O O O
( O O O O
NCDs O O O O
) O O O O
in O O O O
September O O O O
, O O O O
2011 O O O O
, O O O O
is O O O O
an O O O O
unprecedented O O O O
opportunity O O O O
to O O O O
create O O O O
a O O O O
sustained O O O O
global O O O O
movement O O O O
against O O O O
premature O O O O
death O O O O
and O O O O
preventable O O O O
morbidity O O O O
and O O O O
disability O O O O
from O O O O
NCDs O O O O
, O O O O
mainly O O O O
heart O O O O
disease O O O O
, O O O O
stroke O O O O
, O O O O
cancer O O O O
, O O O O
diabetes O O O O
, O O O O
and O O O O
chronic O O O O
respiratory O O O O
disease O O O O
. O O O O
    
The O O O O
increasing O O O O
global O O O O
crisis O O O O
in O O O O
NCDs O O O O
is O O O O
a O O O O
barrier O O O O
to O O O O
development O O O O
goals O O O O
including O O O O
poverty O O O O
reduction O O O O
, O O O O
health O O O O
equity O O O O
, O O O O
economic O O O O
stability O O O O
, O O O O
and O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
security O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Lancet O O O O
NCD O O O O
Action O O O O
Group O O O O
and O O O O
the O O O O
NCD O O O O
Alliance O O O O
propose O O O O
five O O O O
overarching O O O O
priority O O O O
actions O O O O
for O O O O
the O O O O
response O O O O
to O O O O
the O O O O
crisis O O O O
- O O O O
- O O O O
leadership O O O O
, O O O O
prevention O O O O
, O O O O
treatment O O O O
, O O O O
international O O O O
cooperation O O O O
, O O O O
and O O O O
monitoring O O O O
and O O O O
accountability O O O O
- O O O O
- O O O O
and O O O O
the O O O O
delivery O O O O
of O O O O
five O O O O
priority O O O O
interventions O O O O
- O O O O
- O O O O
tobacco B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
control O O O O
, O O O O
salt O O O O
reduction O O O O
, O O O O
improved O O O O
diets O O O O
and O O O O
physical O O O O
activity O O O O
, O O O O
reduction O O O O
in O O O O
hazardous O O O O
alcohol O O O O
intake O O O O
, O O O O
and O O O O
essential O O O O
drugs O O O O
and O O O O
technologies O O O O
. O O O O
    
The O O O O
priority O O O O
interventions O O O O
were O O O O
chosen O O O O
for O O O O
their O O O O
health O O O O
effects O O O O
, O O O O
cost O O O O
- O O O O
effectiveness O O O O
, O O O O
low O O O O
costs O O O O
of O O O O
implementation O O O O
, O O O O
and O O O O
political O O O O
and O O O O
financial O O O O
feasibility O O O O
. O O O O
    
The O O O O
most O O O O
urgent O O O O
and O O O O
immediate O O O O
priority O O O O
is O O O O
tobacco B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
control O O O O
. O O O O
    
We O O O O
propose O O O O
as O O O O
a O O O O
goal O O O O
for O O O O
2040 O O O O
, O O O O
a O O O O
world O O O O
essentially O O O O
free O O O O
from O O O O
tobacco B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
where O O O O
less O O O O
than O O O O
5 O O O O
% O O O O
of O O O O
people O O O O
use O O O O
tobacco O O O O
. O O O O
    
Implementation O O O O
of O O O O
the O O O O
priority O O O O
interventions O O O O
, O O O O
at O O O O
an O O O O
estimated O O O O
global O O O O
commitment O O O O
of O O O O
about O O O O
US O O O O
$ O O O O
9 O O O O
billion O O O O
per O O O O
year O O O O
, O O O O
will O O O O
bring O O O O
enormous O O O O
benefits O O O O
to O O O O
social O O O O
and O O O O
economic O O O O
development O O O O
and O O O O
to O O O O
the O O O O
health O O O O
sector O O O O
. O O O O
    
If O O O O
widely O O O O
adopted O O O O
, O O O O
these O O O O
interventions O O O O
will O O O O
achieve O O O O
the O O O O
global O O O O
goal O O O O
of O O O O
reducing O O O O
NCD O O O O
death O O O O
rates O O O O
by O O O O
2 O O O O
% O O O O
per O O O O
year O O O O
, O O O O
averting O O O O
tens O O O O
of O O O O
millions O O O O
of O O O O
premature O O O O
deaths O O O O
in O O O O
this O O O O
decade O O O O
. O O O O
    
Serotype O O O O
replacement O O O O
in O O O O
disease O O O O
after O O O O
pneumococcal O O O O
vaccination O O O O
. O O O O
    
Vaccination O O O O
with O O O O
heptavalent O O O O
pneumococcal O O O O
conjugate O O O O
vaccine O O O O
( O O O O
PCV7 O O O O
) O O O O
has O O O O
significantly O O O O
reduced O O O O
the O O O O
burden O O O O
of O O O O
pneumococcal O O O O
disease O O O O
and O O O O
has O O O O
had O O O O
an O O O O
important O O O O
public O O O O
health O O O O
benefit O O O O
. O O O O
    
Because O O O O
this O O O O
vaccine O O O O
targets O O O O
only O O O O
seven O O O O
of O O O O
the O O O O
more O O O O
than O O O O
92 O O O O
pneumococcal O O O O
serotypes O O O O
, O O O O
concerns O O O O
have O O O O
been O O O O
raised O O O O
that O O O O
non O O O O
- O O O O
vaccine O O O O
serotypes O O O O
( O O O O
NVTs O O O O
) O O O O
could O O O O
increase O O O O
in O O O O
prevalence O O O O
and O O O O
reduce O O O O
the O O O O
benefits O O O O
of O O O O
vaccination O O O O
. O O O O
    
Indeed O O O O
, O O O O
among O O O O
asymptomatic O O O O
carriers O O O O
, O O O O
the O O O O
prevalence O O O O
of O O O O
NVTs O O O O
has O O O O
increased O O O O
substantially O O O O
, O O O O
and O O O O
consequently O O O O
, O O O O
there O O O O
has O O O O
been O O O O
little O O O O
or O O O O
no O O O O
net O O O O
change O O O O
in O O O O
the O O O O
bacterial O O O O
carriage O O O O
prevalence O O O O
. O O O O
    
In O O O O
many O O O O
populations O O O O
, O O O O
pneumococcal O O O O
disease O O O O
caused O O O O
by O O O O
NVT O O O O
has O O O O
increased O O O O
, O O O O
but O O O O
in O O O O
most O O O O
cases O O O O
this O O O O
increase O O O O
has O O O O
been O O O O
less O O O O
than O O O O
the O O O O
increase O O O O
in O O O O
NVT O O O O
carriage O O O O
. O O O O
    
We O O O O
review O O O O
the O O O O
evidence O O O O
for O O O O
serotype O O O O
replacement O O O O
in O O O O
carriage O O O O
and O O O O
disease O O O O
, O O O O
and O O O O
address O O O O
the O O O O
surveillance O O O O
biases O O O O
that O O O O
might O O O O
affect O O O O
these O O O O
findings O O O O
. O O O O
    
We O O O O
then O O O O
discuss O O O O
possible O O O O
reasons O O O O
for O O O O
the O O O O
discrepancy O O O O
between O O O O
near O O O O
- O O O O
complete O O O O
replacement O O O O
in O O O O
carriage O O O O
and O O O O
partial O O O O
replacement O O O O
for O O O O
disease O O O O
, O O O O
including O O O O
differences O O O O
in O O O O
invasiveness O O O O
between O O O O
vaccine O O O O
serotypes O O O O
. O O O O
    
We O O O O
contend O O O O
that O O O O
the O O O O
magnitude O O O O
of O O O O
serotype O O O O
replacement O O O O
in O O O O
disease O O O O
can O O O O
be O O O O
attributed O O O O
, O O O O
in O O O O
part O O O O
, O O O O
to O O O O
a O O O O
combination O O O O
of O O O O
lower O O O O
invasiveness O O O O
of O O O O
the O O O O
replacing O O O O
serotypes O O O O
, O O O O
biases O O O O
in O O O O
the O O O O
pre O O O O
- O O O O
vaccine O O O O
carriage O O O O
data O O O O
( O O O O
unmasking O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
biases O O O O
in O O O O
the O O O O
disease O O O O
surveillance O O O O
systems O O O O
that O O O O
could O O O O
underestimate O O O O
the O O O O
true O O O O
amount O O O O
of O O O O
replacement O O O O
. O O O O
    
We O O O O
conclude O O O O
by O O O O
discussing O O O O
the O O O O
future O O O O
potential O O O O
for O O O O
serotype O O O O
replacement O O O O
in O O O O
disease O O O O
and O O O O
the O O O O
need O O O O
for O O O O
continuing O O O O
surveillance O O O O
. O O O O
    
Stillbirths O O O O
: O O O O
how O O O O
can O O O O
health O O O O
systems O O O O
deliver O O O O
for O O O O
mothers O O O O
and O O O O
babies O O O O
? O O O O
    
The O O O O
causes O O O O
of O O O O
stillbirths O O O O
are O O O O
inseparable O O O O
from O O O O
the O O O O
causes O O O O
of O O O O
maternal O O O O
and O O O O
neonatal O O O O
deaths O O O O
. O O O O
    
This O O O O
report O O O O
focuses O O O O
on O O O O
prevention O O O O
of O O O O
stillbirths O O O O
by O O O O
scale O O O O
- O O O O
up O O O O
of O O O O
care O O O O
for O O O O
mothers O O O O
and O O O O
babies O O O O
at O O O O
the O O O O
health O O O O
- O O O O
system O O O O
level O O O O
, O O O O
with O O O O
consideration O O O O
for O O O O
effects O O O O
and O O O O
cost O O O O
. O O O O
    
In O O O O
countries O O O O
with O O O O
high O O O O
mortality O O O O
rates O O O O
, O O O O
emergency O O O O
obstetric O O O O
care O O O O
has O O O O
the O O O O
greatest O O O O
effect O O O O
on O O O O
maternal O O O O
and O O O O
neonatal O O O O
deaths O O O O
, O O O O
and O O O O
on O O O O
stillbirths O O O O
. O O O O
    
Syphilis O O O O
detection O O O O
and O O O O
treatment O O O O
is O O O O
of O O O O
moderate O O O O
effect O O O O
but O O O O
of O O O O
lower O O O O
cost O O O O
and O O O O
is O O O O
highly O O O O
feasible O O O O
. O O O O
    
Advanced O O O O
antenatal O O O O
care O O O O
, O O O O
including O O O O
induction O O O O
for O O O O
post O O O O
- O O O O
term O O O O
pregnancies O O O O
, O O O O
and O O O O
detection O O O O
and O O O O
management O O O O
of O O O O
hypertensive O O O O
disease O O O O
, O O O O
fetal O O O O
growth O O O O
restriction O O O O
, O O O O
and O O O O
gestational O O O O
diabetes O O O O
, O O O O
will O O O O
further O O O O
reduce O O O O
mortality O O O O
, O O O O
but O O O O
at O O O O
higher O O O O
cost O O O O
. O O O O
    
These O O O O
interventions O O O O
are O O O O
best O O O O
packaged O O O O
and O O O O
provided O O O O
through O O O O
linked O O O O
service O O O O
delivery O O O O
methods O O O O
tailored O O O O
to O O O O
suit O O O O
existing O O O O
health O O O O
- O O O O
care O O O O
systems O O O O
. O O O O
    
If O O O O
99 O O O O
% O O O O
coverage O O O O
is O O O O
reached O O O O
in O O O O
68 O O O O
priority O O O O
countries O O O O
by O O O O
2015 O O O O
, O O O O
up O O O O
to O O O O
1 O O O O
* O O O O
1 O O O O
million O O O O
( O O O O
45 O O O O
% O O O O
) O O O O
third O O O O
- O O O O
trimester O O O O
stillbirths O O O O
, O O O O
201 O O O O
000 O O O O
( O O O O
54 O O O O
% O O O O
) O O O O
maternal O O O O
deaths O O O O
, O O O O
and O O O O
1 O O O O
* O O O O
4 O O O O
million O O O O
( O O O O
43 O O O O
% O O O O
) O O O O
neonatal O O O O
deaths O O O O
could O O O O
be O O O O
saved O O O O
per O O O O
year O O O O
at O O O O
an O O O O
additional O O O O
total O O O O
cost O O O O
of O O O O
US O O O O
$ O O O O
10 O O O O
* O O O O
9 O O O O
billion O O O O
or O O O O
$ O O O O
2 O O O O
* O O O O
32 O O O O
per O O O O
person O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
in O O O O
the O O O O
range O O O O
of O O O O
$ O O O O
0 O O O O
* O O O O
96 O O O O
- O O O O
2 O O O O
* O O O O
32 O O O O
for O O O O
other O O O O
ingredients O O O O
- O O O O
based O O O O
intervention O O O O
packages O O O O
with O O O O
only O O O O
recurrent O O O O
costs O O O O
. O O O O
    
The O O O O
contribution O O O O
of O O O O
the O O O O
S O O O O
- O O O O
phase O O O O
checkpoint O O O O
genes O O O O
MEC1 O O O O
and O O O O
SGS1 O O O O
to O O O O
genome O O O O
stability O O O O
maintenance O O O O
in O O O O
Candida B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Genome O O O O
rearrangements O O O O
, O O O O
a O O O O
common O O O O
feature O O O O
of O O O O
Candida B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
isolates O O O O
, O O O O
are O O O O
often O O O O
associated O O O O
with O O O O
the O O O O
acquisition O O O O
of O O O O
antifungal O O O O
drug O O O O
resistance O O O O
. O O O O
    
In O O O O
Saccharomyces B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cerevisiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
perturbations O O O O
in O O O O
the O O O O
S O O O O
- O O O O
phase O O O O
checkpoints O O O O
result O O O O
in O O O O
the O O O O
same O O O O
sort O O O O
of O O O O
Gross O O O O
Chromosomal O O O O
Rearrangements O O O O
( O O O O
GCRs O O O O
) O O O O
observed O O O O
in O O O O
C B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
albicans O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Several O O O O
proteins O O O O
are O O O O
involved O O O O
in O O O O
the O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cerevisiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cell O O O O
cycle O O O O
checkpoints O O O O
, O O O O
including O O O O
Mec1p O O O O
, O O O O
a O O O O
protein O O O O
kinase O O O O
of O O O O
the O O O O
PIKK O O O O
( O O O O
phosphatidyl O O O O
inositol O O O O
3 O O O O
- O O O O
kinase O O O O
- O O O O
like O O O O
kinase O O O O
) O O O O
family O O O O
and O O O O
the O O O O
central O O O O
player O O O O
in O O O O
the O O O O
DNA O O O O
damage O O O O
checkpoint O O O O
. O O O O
    
Sgs1p O O O O
, O O O O
the O O O O
ortholog O O O O
of O O O O
BLM O O O O
, O O O O
the O O O O
Bloom O O O O
' O O O O
s O O O O
syndrome O O O O
gene O O O O
, O O O O
is O O O O
a O O O O
RecQ O O O O
- O O O O
related O O O O
DNA O O O O
helicase O O O O
; O O O O
cells O O O O
from O O O O
BLM O O O O
patients O O O O
are O O O O
characterized O O O O
by O O O O
an O O O O
increase O O O O
in O O O O
genome O O O O
instability O O O O
. O O O O
    
Yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
strains O O O O
bearing O O O O
deletions O O O O
in O O O O
MEC1 O O O O
or O O O O
SGS1 O O O O
are O O O O
viable O O O O
( O O O O
in O O O O
contrast O O O O
to O O O O
the O O O O
inviability O O O O
seen O O O O
with O O O O
loss O O O O
of O O O O
MEC1 O O O O
in O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cerevisiae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
but O O O O
the O O O O
different O O O O
deletion O O O O
mutants O O O O
have O O O O
significantly O O O O
different O O O O
phenotypes O O O O
. O O O O
    
The O O O O
mec1Delta O O O O
/ O O O O
Delta O O O O
colonies O O O O
have O O O O
a O O O O
wild O O O O
- O O O O
type O O O O
colony O O O O
morphology O O O O
, O O O O
while O O O O
the O O O O
sgs1Delta O O O O
/ O O O O
Delta O O O O
mutants O O O O
are O O O O
slow O O O O
- O O O O
growing O O O O
, O O O O
producing O O O O
wrinkled O O O O
colonies O O O O
with O O O O
pseudohyphal O O O O
- O O O O
like O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
The O O O O
mec1Delta O O O O
/ O O O O
Delta O O O O
mutants O O O O
are O O O O
only O O O O
sensitive O O O O
to O O O O
ethylmethane O O O O
sulfonate O O O O
( O O O O
EMS O O O O
) O O O O
, O O O O
methylmethane O O O O
sulfonate O O O O
( O O O O
MMS O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
hydroxyurea O O O O
( O O O O
HU O O O O
) O O O O
but O O O O
the O O O O
sgs1Delta O O O O
/ O O O O
Delta O O O O
mutants O O O O
exhibit O O O O
a O O O O
high O O O O
sensitivity O O O O
to O O O O
all O O O O
DNA O O O O
- O O O O
damaging O O O O
agents O O O O
tested O O O O
. O O O O
    
In O O O O
an O O O O
assay O O O O
for O O O O
chromosome O O O O
1 O O O O
integrity O O O O
, O O O O
the O O O O
mec1Delta O O O O
/ O O O O
Delta O O O O
mutants O O O O
exhibit O O O O
an O O O O
increase O O O O
in O O O O
genome O O O O
instability O O O O
; O O O O
no O O O O
change O O O O
was O O O O
observed O O O O
in O O O O
the O O O O
sgs1Delta O O O O
/ O O O O
Delta O O O O
mutants O O O O
. O O O O
    
Finally O O O O
, O O O O
loss O O O O
of O O O O
MEC1 O O O O
does O O O O
not O O O O
affect O O O O
sensitivity O O O O
to O O O O
the O O O O
antifungal O O O O
drug O O O O
fluconazole O O O O
, O O O O
while O O O O
loss O O O O
of O O O O
SGS1 O O O O
leads O O O O
to O O O O
an O O O O
increased O O O O
susceptibility O O O O
to O O O O
fluconazole O O O O
. O O O O
    
Neither O O O O
deletion O O O O
elevated O O O O
the O O O O
level O O O O
of O O O O
antifungal O O O O
drug O O O O
resistance O O O O
acquisition O O O O
. O O O O
    
Postural O O O O
deformities O O O O
in O O O O
Parkinson O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
. O O O O
    
Postural O O O O
deformities O O O O
are O O O O
frequent O O O O
and O O O O
disabling O O O O
complications O O O O
of O O O O
Parkinson O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
( O O O O
PD O O O O
) O O O O
and O O O O
atypical O O O O
parkinsonism O O O O
. O O O O
    
These O O O O
deformities O O O O
include O O O O
camptocormia O O O O
, O O O O
antecollis O O O O
, O O O O
Pisa O O O O
syndrome O O O O
, O O O O
and O O O O
scoliosis O O O O
. O O O O
    
Recognition O O O O
of O O O O
specific O O O O
postural O O O O
syndromes O O O O
might O O O O
have O O O O
differential O O O O
diagnostic O O O O
value O O O O
in O O O O
patients O O O O
presenting O O O O
with O O O O
parkinsonism O O O O
. O O O O
    
The O O O O
evidence O O O O
to O O O O
date O O O O
suggests O O O O
that O O O O
postural O O O O
deformities O O O O
have O O O O
a O O O O
multifactorial O O O O
pathophysiology O O O O
. O O O O
    
Contributing O O O O
factors O O O O
include O O O O
muscular O O O O
rigidity O O O O
; O O O O
axial O O O O
dystonia O O O O
; O O O O
weakness O O O O
caused O O O O
by O O O O
myopathy O O O O
; O O O O
body O O O O
scheme O O O O
defects O O O O
due O O O O
to O O O O
centrally O O O O
impaired O O O O
proprioception O O O O
; O O O O
and O O O O
structural O O O O
changes O O O O
in O O O O
the O O O O
spine O O O O
. O O O O
    
The O O O O
relative O O O O
contribution O O O O
of O O O O
these O O O O
different O O O O
factors O O O O
varies O O O O
between O O O O
patients O O O O
and O O O O
across O O O O
specific O O O O
syndromes O O O O
. O O O O
    
Improved O O O O
understanding O O O O
of O O O O
the O O O O
mechanisms O O O O
underlying O O O O
postural O O O O
deformities O O O O
in O O O O
PD O O O O
might O O O O
ultimately O O O O
lead O O O O
us O O O O
to O O O O
more O O O O
effective O O O O
management O O O O
strategies O O O O
for O O O O
these O O O O
disabling O O O O
and O O O O
drug O O O O
- O O O O
refractory O O O O
complications O O O O
. O O O O
    
Tortricid O O O O
moths O O O O
reared O O O O
from O O O O
the O O O O
invasive O O O O
weed O O O O
Mexican B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
palo O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
verde O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Parkinsonia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aculeata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
with O O O O
comments O O O O
on O O O O
their O O O O
host O O O O
specificity O O O O
, O O O O
biology O O O O
, O O O O
geographic O O O O
distribution O O O O
, O O O O
and O O O O
systematics O O O O
. O O O O
    
As O O O O
part O O O O
of O O O O
efforts O O O O
to O O O O
identify O O O O
native O O O O
herbivores O O O O
of O O O O
Mexican B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
palo O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
verde O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Parkinsonia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aculeata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
L O O O O
. O O O O
    
( O O O O
Leguminosae O O O O
: O O O O
Caesalpinioideae O O O O
) O O O O
, O O O O
as O O O O
potential O O O O
biological O O O O
control O O O O
agents O O O O
against O O O O
this O O O O
invasive O O O O
weed O O O O
in O O O O
Australia O O O O
, O O O O
ten O O O O
species O O O O
of O O O O
Tortricidae O O O O
( O O O O
Lepidoptera O O O O
) O O O O
were O O O O
reared O O O O
from O O O O
Guatemala O O O O
, O O O O
Mexico O O O O
, O O O O
Nicaragua O O O O
, O O O O
and O O O O
Venezuela O O O O
: O O O O
Amorbia O O O O
concavana O O O O
( O O O O
Zeller O O O O
) O O O O
, O O O O
Platynota O O O O
rostrana O O O O
( O O O O
Walker O O O O
) O O O O
, O O O O
Platynota O O O O
helianthes O O O O
( O O O O
Meyrick O O O O
) O O O O
, O O O O
Platynota B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
stultana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Walsingham O O O O
( O O O O
all O O O O
Tortricinae O O O O
: O O O O
Sparganothini O O O O
) O O O O
, O O O O
Rudenia O O O O
leguminana O O O O
( O O O O
Busck O O O O
) O O O O
, O O O O
Cochylis O O O O
sp O O O O
. O O O O
    
( O O O O
both O O O O
Tortricinae O O O O
: O O O O
Cochylini O O O O
) O O O O
, O O O O
Ofatulena O O O O
duodecemstriata O O O O
( O O O O
Walsingham O O O O
) O O O O
, O O O O
O O O O O
. O O O O
luminosa O O O O
Heinrich O O O O
, O O O O
Ofatulena O O O O
sp O O O O
. O O O O
    
( O O O O
all O O O O
Olethreutinae O O O O
: O O O O
Grapholitini O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
Crocidosema O O O O
lantana O O O O
Busck O O O O
( O O O O
Olethreutinae O O O O
: O O O O
Eucosmini O O O O
) O O O O
. O O O O
    
Significant O O O O
geographic O O O O
range O O O O
extensions O O O O
are O O O O
provided O O O O
for O O O O
O O O O O
. O O O O
duodecemstriata O O O O
and O O O O
R O O O O
. O O O O
leguminana O O O O
. O O O O
    
These O O O O
are O O O O
the O O O O
first O O O O
documented O O O O
records O O O O
of O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
aculeata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
as O O O O
a O O O O
host O O O O
plant O O O O
for O O O O
all O O O O
but O O O O
O O O O O
. O O O O
luminosa O O O O
. O O O O
    
The O O O O
four O O O O
species O O O O
of O O O O
Sparganothini O O O O
are O O O O
polyphagous O O O O
; O O O O
in O O O O
contrast O O O O
, O O O O
the O O O O
two O O O O
Cochylini O O O O
and O O O O
three O O O O
Grapholitini O O O O
likely O O O O
are O O O O
specialists O O O O
on O O O O
Leguminosae O O O O
. O O O O
    
Ofatulena O O O O
luminosa O O O O
is O O O O
possibly O O O O
host O O O O
specific O O O O
on O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
aculeata O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Host O O O O
trials O O O O
with O O O O
Rudenia O O O O
leguminana O O O O
also O O O O
provide O O O O
some O O O O
evidence O O O O
of O O O O
specificity O O O O
, O O O O
in O O O O
contrast O O O O
to O O O O
historical O O O O
rearing O O O O
records O O O O
. O O O O
    
To O O O O
examine O O O O
the O O O O
possibility O O O O
that O O O O
R O O O O
. O O O O
leguminana O O O O
is O O O O
a O O O O
complex O O O O
of O O O O
species O O O O
, O O O O
two O O O O
data O O O O
sets O O O O
of O O O O
molecular O O O O
markers O O O O
were O O O O
examined O O O O
: O O O O
( O O O O
1 O O O O
) O O O O
a O O O O
combined O O O O
data O O O O
set O O O O
of O O O O
two O O O O
mitochondrial O O O O
markers O O O O
( O O O O
a O O O O
781 O O O O
- O O O O
basepair O O O O
region O O O O
of O O O O
cytochrome O O O O
c O O O O
oxidase O O O O
I O O O O
( O O O O
COI O O O O
) O O O O
and O O O O
a O O O O
685 O O O O
- O O O O
basepair O O O O
region O O O O
of O O O O
cytochrome O O O O
c O O O O
oxidase O O O O
II O O O O
) O O O O
and O O O O
one O O O O
nuclear O O O O
marker O O O O
( O O O O
a O O O O
531 O O O O
- O O O O
basepair O O O O
region O O O O
of O O O O
the O O O O
28S O O O O
domain O O O O
2 O O O O
) O O O O
; O O O O
and O O O O
( O O O O
2 O O O O
) O O O O
the O O O O
650 O O O O
- O O O O
basepair O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
barcode O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
region O O O O
of O O O O
COI O O O O
. O O O O
    
Analyses O O O O
of O O O O
both O O O O
data O O O O
sets O O O O
strongly O O O O
suggest O O O O
that O O O O
individuals O O O O
examined O O O O
in O O O O
this O O O O
study O O O O
belong O O O O
to O O O O
more O O O O
than O O O O
one O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Evidence O O O O
for O O O O
the O O O O
higher O O O O
importance O O O O
of O O O O
signal O O O O
size O O O O
over O O O O
body O O O O
size O O O O
in O O O O
aposematic O O O O
signaling O O O O
in O O O O
insects O O O O
. O O O O
    
To O O O O
understand O O O O
the O O O O
evolution O O O O
of O O O O
warning O O O O
coloration O O O O
, O O O O
it O O O O
is O O O O
important O O O O
to O O O O
distinguish O O O O
between O O O O
different O O O O
aspects O O O O
of O O O O
conspicuous O O O O
color O O O O
patterns O O O O
. O O O O
    
As O O O O
an O O O O
example O O O O
, O O O O
both O O O O
pattern O O O O
element O O O O
size O O O O
and O O O O
body O O O O
size O O O O
of O O O O
prey O O O O
have O O O O
been O O O O
shown O O O O
to O O O O
enhance O O O O
the O O O O
effectiveness O O O O
of O O O O
warning O O O O
signals O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
it O O O O
is O O O O
unclear O O O O
whether O O O O
the O O O O
effect O O O O
of O O O O
body O O O O
size O O O O
is O O O O
merely O O O O
a O O O O
side O O O O
effect O O O O
of O O O O
proportionally O O O O
increasing O O O O
pattern O O O O
elements O O O O
, O O O O
or O O O O
if O O O O
there O O O O
is O O O O
an O O O O
effect O O O O
of O O O O
body O O O O
size O O O O
per O O O O
se O O O O
. O O O O
    
These O O O O
possibilities O O O O
were O O O O
evaluated O O O O
by O O O O
offering O O O O
different O O O O
sized O O O O
artificial O O O O
caterpillars O O O O
with O O O O
either O O O O
fixed O O O O
or O O O O
proportionally O O O O
increasing O O O O
aposematic O O O O
color O O O O
signal O O O O
elements O O O O
to O O O O
wild O O O O
great B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
tits O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Parus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
major O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
L O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
    
( O O O O
Passeriformes O O O O
: O O O O
Paridae O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
birds O O O O
' O O O O
hesitation O O O O
time O O O O
to O O O O
attack O O O O
each O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
caterpillar O O O O
& O O O O
quot O O O O
; O O O O
was O O O O
used O O O O
as O O O O
a O O O O
measure O O O O
of O O O O
the O O O O
warning O O O O
effect O O O O
. O O O O
    
The O O O O
hesitation O O O O
time O O O O
showed O O O O
a O O O O
significant O O O O
, O O O O
positive O O O O
size O O O O
- O O O O
dependence O O O O
with O O O O
the O O O O
caterpillars O O O O
whose O O O O
pattern O O O O
elements O O O O
increased O O O O
proportionally O O O O
with O O O O
their O O O O
body O O O O
size O O O O
. O O O O
    
In O O O O
contrast O O O O
, O O O O
no O O O O
size O O O O
dependence O O O O
was O O O O
found O O O O
in O O O O
the O O O O
larvae O O O O
with O O O O
fixed O O O O
- O O O O
size O O O O
signal O O O O
elements O O O O
. O O O O
    
Such O O O O
a O O O O
difference O O O O
in O O O O
mortality O O O O
curves O O O O
is O O O O
consistent O O O O
with O O O O
the O O O O
idea O O O O
that O O O O
pattern O O O O
element O O O O
size O O O O
is O O O O
a O O O O
more O O O O
important O O O O
aspect O O O O
than O O O O
body O O O O
size O O O O
in O O O O
enhancing O O O O
a O O O O
warning O O O O
signal O O O O
. O O O O
    
Since O O O O
no O O O O
evidence O O O O
of O O O O
an O O O O
effect O O O O
of O O O O
body O O O O
size O O O O
per O O O O
se O O O O
on O O O O
signal O O O O
efficiency O O O O
was O O O O
found O O O O
, O O O O
this O O O O
study O O O O
does O O O O
not O O O O
support O O O O
the O O O O
hypothesis O O O O
that O O O O
aposematic O O O O
insects O O O O
gain O O O O
more O O O O
from O O O O
large O O O O
size O O O O
than O O O O
cryptic O O O O
ones O O O O
. O O O O
    
Wolbachia O O O O
wSinvictaA B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infections O O O O
in O O O O
natural O O O O
populations O O O O
of O O O O
the O O O O
fire B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ant O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Solenopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
invicta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
: O O O O
testing O O O O
for O O O O
phenotypic O O O O
effects O O O O
. O O O O
    
Wolbachia O O O O
are O O O O
intracellular O O O O
bacteria O O O O
that O O O O
commonly O O O O
infect O O O O
many O O O O
arthropods O O O O
and O O O O
some O O O O
nematodes O O O O
. O O O O
    
In O O O O
arthropods O O O O
, O O O O
these O O O O
maternally O O O O
transmitted O O O O
bacteria O O O O
often O O O O
induce O O O O
a O O O O
variety O O O O
of O O O O
phenotypic O O O O
effects O O O O
to O O O O
enhance O O O O
their O O O O
own O O O O
spread O O O O
within O O O O
host O O O O
populations O O O O
. O O O O
    
Wolbachia O O O O
phenotypic O O O O
effects O O O O
generally O O O O
either O O O O
provide O O O O
benefits O O O O
to O O O O
infected O O O O
host O O O O
females O O O O
( O O O O
cytoplasmic O O O O
incompatibility O O O O
, O O O O
positive O O O O
fitness O O O O
effects O O O O
) O O O O
or O O O O
bias O O O O
host O O O O
sex O O O O
ratio O O O O
in O O O O
favor O O O O
of O O O O
females O O O O
( O O O O
male O O O O
- O O O O
killing O O O O
, O O O O
parthenogenesis O O O O
, O O O O
feminization O O O O
) O O O O
, O O O O
all O O O O
of O O O O
which O O O O
increase O O O O
the O O O O
relative O O O O
production O O O O
of O O O O
infected O O O O
females O O O O
in O O O O
host O O O O
populations O O O O
. O O O O
    
Wolbachia O O O O
surveys O O O O
have O O O O
found O O O O
infections O O O O
to O O O O
be O O O O
exceedingly O O O O
common O O O O
in O O O O
ants O O O O
, O O O O
but O O O O
little O O O O
is O O O O
known O O O O
at O O O O
this O O O O
juncture O O O O
as O O O O
to O O O O
what O O O O
phenotypic O O O O
effects O O O O
, O O O O
if O O O O
any O O O O
, O O O O
they O O O O
induce O O O O
in O O O O
this O O O O
group O O O O
. O O O O
    
Previous O O O O
studies O O O O
have O O O O
demonstrated O O O O
that O O O O
individuals O O O O
from O O O O
native O O O O
populations O O O O
of O O O O
the O O O O
invasive O O O O
fire B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ant O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Solenopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
invicta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
commonly O O O O
harbor O O O O
one O O O O
or O O O O
more O O O O
of O O O O
three O O O O
Wolbachia O O O O
variants O O O O
. O O O O
    
One O O O O
of O O O O
the O O O O
variants O O O O
, O O O O
wSinvictaA O O O O
, O O O O
typically O O O O
occurs O O O O
at O O O O
low O O O O
prevalence O O O O
in O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
invicta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
populations O O O O
, O O O O
appears O O O O
to O O O O
have O O O O
been O O O O
transmitted O O O O
horizontally O O O O
into O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
invicta O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
three O O O O
or O O O O
more O O O O
times O O O O
, O O O O
and O O O O
has O O O O
been O O O O
lost O O O O
repeatedly O O O O
from O O O O
host O O O O
lineages O O O O
over O O O O
time O O O O
. O O O O
    
In O O O O
order O O O O
to O O O O
determine O O O O
the O O O O
phenotypic O O O O
effects O O O O
and O O O O
likely O O O O
population O O O O
dynamics O O O O
of O O O O
wSinvictaA B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
infections O O O O
in O O O O
these O O O O
ants O O O O
, O O O O
brood O O O O
production O O O O
patterns O O O O
of O O O O
newly O O O O
mated O O O O
fire B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ant O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
queens O O O O
were O O O O
studied O O O O
during O O O O
simulated O O O O
claustral O O O O
founding O O O O
and O O O O
measured O O O O
wSinvictaA B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
transmission O O O O
fidelity O O O O
within O O O O
mature O O O O
single O O O O
- O O O O
queen O O O O
families O O O O
. O O O O
    
No O O O O
clear O O O O
evidence O O O O
was O O O O
found O O O O
for O O O O
Wolbachia O O O O
- O O O O
induced O O O O
cytoplasmic O O O O
incompatibility O O O O
, O O O O
significant O O O O
fitness O O O O
effects O O O O
, O O O O
or O O O O
male O O O O
- O O O O
killing O O O O
. O O O O
    
Maternal O O O O
transmission O O O O
was O O O O
perfect O O O O
to O O O O
both O O O O
virgin O O O O
queens O O O O
and O O O O
males O O O O
. O O O O
    
Possible O O O O
mechanisms O O O O
for O O O O
how O O O O
this O O O O
variant O O O O
could O O O O
be O O O O
maintained O O O O
in O O O O
host O O O O
populations O O O O
are O O O O
discussed O O O O
. O O O O
    
Growth O O O O
inhibition O O O O
of O O O O
Beauveria B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bassiana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
by O O O O
bacteria O O O O
isolated O O O O
from O O O O
the O O O O
cuticular O O O O
surface O O O O
of O O O O
the O O O O
corn B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
leafhopper O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Dalbulus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
maidis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
the O O O O
planthopper O O O O
, O O O O
Delphacodes B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
kuscheli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
two O O O O
important O O O O
vectors O O O O
of O O O O
maize O O O O
pathogens O O O O
. O O O O
    
The O O O O
phytosanitary O O O O
importance O O O O
of O O O O
the O O O O
corn B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
leafhopper O O O O
, O O O O
Dalbulus O O O O
maidis O O O O
( O O O O
De O O O O
Long O O O O
and O O O O
Wolcott O O O O
) O O O O
( O O O O
Hemiptera O O O O
: O O O O
Cicadellidae O O O O
) O O O O
and O O O O
the O O O O
planthopper O O O O
, O O O O
Delphacodes O O O O
kuscheli O O O O
Fennah O O O O
( O O O O
Hemiptera O O O O
: O O O O
Delphacidae O O O O
) O O O O
lies O O O O
in O O O O
their O O O O
ability O O O O
to O O O O
transmit O O O O
phloem O O O O
- O O O O
associated O O O O
plant O O O O
pathogens O O O O
, O O O O
mainly O O O O
viruses O O O O
and O O O O
mollicutes O O O O
, O O O O
and O O O O
to O O O O
cause O O O O
considerable O O O O
mechanical O O O O
damage O O O O
to O O O O
corn O O O O
plants O O O O
during O O O O
feeding O O O O
and O O O O
oviposition O O O O
. O O O O
    
Fungi O O O O
, O O O O
particularly O O O O
some O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
Ascomycota O O O O
, O O O O
are O O O O
likely O O O O
candidates O O O O
for O O O O
biocontrol O O O O
agents O O O O
against O O O O
these O O O O
insect O O O O
pests O O O O
, O O O O
but O O O O
several O O O O
studies O O O O
revealed O O O O
their O O O O
failure O O O O
to O O O O
invade O O O O
the O O O O
insect O O O O
cuticle O O O O
possibly O O O O
because O O O O
of O O O O
the O O O O
presence O O O O
of O O O O
inhibitory O O O O
compounds O O O O
such O O O O
as O O O O
phenols O O O O
, O O O O
quinones O O O O
, O O O O
and O O O O
lipids O O O O
and O O O O
also O O O O
by O O O O
the O O O O
antibiosis O O O O
effect O O O O
of O O O O
the O O O O
microbiota O O O O
living O O O O
on O O O O
the O O O O
cuticular O O O O
surface O O O O
of O O O O
the O O O O
host O O O O
. O O O O
    
The O O O O
present O O O O
work O O O O
aims O O O O
to O O O O
understand O O O O
interactions O O O O
between O O O O
the O O O O
entomopathogenic O O O O
fungus O O O O
Beauveria B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bassiana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Balsamao O O O O
- O O O O
Crivelli O O O O
) O O O O
Vuillemin O O O O
( O O O O
Hypocreales O O O O
: O O O O
Cordycipitaceae O O O O
) O O O O
and O O O O
bacterial O O O O
antagonists O O O O
isolated O O O O
from O O O O
the O O O O
cuticular O O O O
surface O O O O
of O O O O
D B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
maidis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
D B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
kuscheli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
A O O O O
total O O O O
of O O O O
155 O O O O
bacterial O O O O
isolates O O O O
were O O O O
recovered O O O O
from O O O O
the O O O O
insect O O O O
' O O O O
s O O O O
cuticle O O O O
and O O O O
tested O O O O
against O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bassiana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Ninety O O O O
- O O O O
one O O O O
out O O O O
of O O O O
155 O O O O
strains O O O O
inhibited O O O O
the O O O O
growth O O O O
of O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bassiana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Bacterial O O O O
strains O O O O
isolated O O O O
from O O O O
D B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
maidis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
were O O O O
significantly O O O O
more O O O O
antagonistic O O O O
against O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
bassiana O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
than O O O O
those O O O O
isolates O O O O
from O O O O
D B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
kuscheli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Among O O O O
the O O O O
most O O O O
effective O O O O
antagonistic O O O O
strains O O O O
, O O O O
six O O O O
isolates O O O O
of O O O O
Bacillus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
thuringiensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Berliner O O O O
( O O O O
Bacillales O O O O
: O O O O
Bacillaeae O O O O
( O O O O
after O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
subtilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
) O O O O
, O O O O
one O O O O
isolate O O O O
of O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
mycoides O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Flugge O O O O
, O O O O
eight O O O O
isolates O O O O
of O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
megaterium O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
de O O O O
Bary O O O O
, O O O O
five O O O O
isolates O O O O
of O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pumilus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Meyer O O O O
and O O O O
Gottheil O O O O
, O O O O
one O O O O
isolate O O O O
of O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
licheniformis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Weigmann O O O O
) O O O O
Chester O O O O
, O O O O
and O O O O
four O O O O
isolates O O O O
of O O O O
B B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
subtilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Ehrenberg O O O O
) O O O O
Cohn O O O O
were O O O O
identified O O O O
. O O O O
    
Mig1 O O O O
is O O O O
involved O O O O
in O O O O
mycelial O O O O
formation O O O O
and O O O O
expression O O O O
of O O O O
the O O O O
genes O O O O
encoding O O O O
extracellular O O O O
enzymes O O O O
in O O O O
Saccharomycopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fibuligera O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
A11 O O O O
. O O O O
    
The O O O O
MIG1 O O O O
gene O O O O
of O O O O
Saccharomycopsis B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fibuligera O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
A11 O O O O
was O O O O
cloned O O O O
from O O O O
its O O O O
genomic O O O O
DNA O O O O
using O O O O
the O O O O
degenerated O O O O
primers O O O O
and O O O O
inverse O O O O
PCR O O O O
. O O O O
    
The O O O O
MIG1 O O O O
gene O O O O
( O O O O
1152bp O O O O
, O O O O
accession O O O O
number O O O O
: O O O O
HM450676 O O O O
) O O O O
encoded O O O O
a O O O O
384 O O O O
- O O O O
amino O O O O
acid O O O O
protein O O O O
very O O O O
similar O O O O
to O O O O
Mig1s O O O O
from O O O O
other O O O O
fungi O O O O
. O O O O
    
Besides O O O O
their O O O O
highly O O O O
conserved O O O O
zinc O O O O
fingers O O O O
, O O O O
the O O O O
Mig1 O O O O
proteins O O O O
displayed O O O O
short O O O O
conserved O O O O
motifs O O O O
of O O O O
possible O O O O
significance O O O O
in O O O O
glucose O O O O
repression O O O O
. O O O O
    
The O O O O
MIG1 O O O O
gene O O O O
in O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fibuligera O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
A11 O O O O
was O O O O
disrupted O O O O
by O O O O
integrating O O O O
the O O O O
HPT O O O O
( O O O O
hygromycin O O O O
B O O O O
phosphotransferase O O O O
) O O O O
gene O O O O
into O O O O
ORF O O O O
( O O O O
Open O O O O
Reading O O O O
Frame O O O O
) O O O O
of O O O O
the O O O O
MIG1 O O O O
gene O O O O
. O O O O
    
The O O O O
disruptant O O O O
A11 O O O O
- O O O O
c O O O O
obtained O O O O
could O O O O
grow O O O O
in O O O O
the O O O O
media O O O O
containing O O O O
hygromycin O O O O
and O O O O
2 O O O O
- O O O O
deoxy O O O O
- O O O O
d O O O O
- O O O O
glucose O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
alpha O O O O
- O O O O
Amylase O O O O
, O O O O
glucoamylse O O O O
, O O O O
acid O O O O
protease O O O O
and O O O O
Beta O O O O
- O O O O
glucosidase O O O O
production O O O O
by O O O O
the O O O O
disruptant O O O O
and O O O O
expression O O O O
of O O O O
their O O O O
genes O O O O
in O O O O
the O O O O
disruptant O O O O
were O O O O
greatly O O O O
enhanced O O O O
. O O O O
    
This O O O O
confirms O O O O
that O O O O
Mig1 O O O O
, O O O O
the O O O O
transcriptional O O O O
repressor O O O O
, O O O O
indeed O O O O
regulates O O O O
expression O O O O
of O O O O
the O O O O
genes O O O O
and O O O O
production O O O O
of O O O O
the O O O O
extracellular O O O O
enzymes O O O O
in O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
fibuligera O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
A11 O O O O
. O O O O
    
At O O O O
the O O O O
same O O O O
time O O O O
, O O O O
it O O O O
was O O O O
found O O O O
that O O O O
cell O O O O
budding O O O O
was O O O O
enhanced O O O O
and O O O O
mycelial O O O O
formation O O O O
was O O O O
reduced O O O O
in O O O O
the O O O O
disruptant O O O O
. O O O O
    
Morphological O O O O
differences O O O O
and O O O O
molecular O O O O
phylogeny O O O O
of O O O O
freshwater O O O O
blooming O O O O
species O O O O
, O O O O
Peridiniopsis O O O O
spp O O O O
. O O O O
    
( O O O O
Dinophyceae O O O O
) O O O O
from O O O O
China O O O O
. O O O O
    
In O O O O
2008 O O O O
- O O O O
2010 O O O O
, O O O O
several O O O O
freshwater O O O O
dinoflagellate O O O O
blooms O O O O
caused O O O O
by O O O O
Peridiniopsis O O O O
spp O O O O
. O O O O
were O O O O
observed O O O O
in O O O O
China O O O O
. O O O O
    
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
penardii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
niei O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sampled O O O O
from O O O O
various O O O O
geographical O O O O
localities O O O O
were O O O O
examined O O O O
by O O O O
means O O O O
of O O O O
light O O O O
and O O O O
scanning O O O O
electron O O O O
microscopy O O O O
. O O O O
    
After O O O O
comparing O O O O
morphological O O O O
and O O O O
molecular O O O O
differences O O O O
, O O O O
the O O O O
new O O O O
freshwater O O O O
variety O O O O
Peridiniopsis O O O O
penardii O O O O
var O O O O
. O O O O
robusta O O O O
var O O O O
. O O O O
nov O O O O
. O O O O
    
( O O O O
Peridiniales O O O O
, O O O O
Dinophyceae O O O O
) O O O O
found O O O O
in O O O O
Manwan O O O O
Reservoir O O O O
, O O O O
Yunnan O O O O
Province O O O O
was O O O O
described O O O O
. O O O O
    
The O O O O
new O O O O
variety O O O O
differed O O O O
from O O O O
P O O O O
. O O O O
penardii O O O O
since O O O O
it O O O O
possessed O O O O
numerous O O O O
robust O O O O
antapical O O O O
spines O O O O
and O O O O
a O O O O
conspicuous O O O O
apical O O O O
spine O O O O
. O O O O
    
Molecular O O O O
phylogenetic O O O O
analyses O O O O
based O O O O
on O O O O
SSU O O O O
, O O O O
LSU O O O O
and O O O O
ITS O O O O
indicated O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
niei O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
P O O O O
. O O O O
penardii O O O O
and O O O O
P O O O O
. O O O O
penardii O O O O
var O O O O
. O O O O
robusta O O O O
were O O O O
closely O O O O
related O O O O
with O O O O
P O O O O
. O O O O
kevei O O O O
, O O O O
and O O O O
clustered O O O O
into O O O O
a O O O O
monophyletic O O O O
clade O O O O
. O O O O
    
The O O O O
new O O O O
variety O O O O
possessed O O O O
an O O O O
endosymbiotic O O O O
diatom O O O O
which O O O O
was O O O O
similar O O O O
to O O O O
P O O O O
. O O O O
penardii O O O O
and O O O O
P O O O O
. O O O O
kevei O O O O
, O O O O
whereas O O O O
the O O O O
endosymbiont O O O O
was O O O O
not O O O O
present O O O O
in O O O O
cells O O O O
of O O O O
P B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
niei O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
endosymbiont O O O O
SSU O O O O
and O O O O
ITS O O O O
phylogenies O O O O
showed O O O O
that O O O O
the O O O O
endosymbionts O O O O
of O O O O
these O O O O
three O O O O
dinoflagellates O O O O
were O O O O
closely O O O O
related O O O O
to O O O O
members O O O O
of O O O O
Thalassiosirales O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
it O O O O
was O O O O
concluded O O O O
that O O O O
the O O O O
endosymbionts O O O O
might O O O O
originate O O O O
from O O O O
Discostella O O O O
- O O O O
like O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Beta O O O O
- O O O O
Thymosin O O O O
is O O O O
upregulated O O O O
by O O O O
the O O O O
steroid O O O O
hormone O O O O
20 O O O O
- O O O O
hydroxyecdysone O O O O
and O O O O
microorganisms O O O O
. O O O O
    
Thymosins O O O O
have O O O O
diverse O O O O
biological O O O O
activities O O O O
including O O O O
actin O O O O
- O O O O
sequestering O O O O
and O O O O
tissue O O O O
repair O O O O
in O O O O
vertebrates O O O O
, O O O O
however O O O O
, O O O O
there O O O O
is O O O O
little O O O O
information O O O O
about O O O O
the O O O O
function O O O O
of O O O O
thymosins O O O O
in O O O O
invertebrates O O O O
. O O O O
    
We O O O O
isolated O O O O
a O O O O
Beta O O O O
- O O O O
thymosin O O O O
gene O O O O
in O O O O
Helicoverpa B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
armigera O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
It O O O O
has O O O O
two O O O O
transcript O O O O
variants O O O O
, O O O O
HaTHY1 O O O O
and O O O O
HaTHY2 O O O O
, O O O O
encoding O O O O
19 O O O O
. O O O O
0 O O O O
kDa O O O O
and O O O O
14 O O O O
. O O O O
5 O O O O
kDa O O O O
peptides O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
HaTHY1 O O O O
was O O O O
mainly O O O O
transcribed O O O O
in O O O O
the O O O O
integument O O O O
and O O O O
midgut O O O O
, O O O O
while O O O O
HaTHY2 O O O O
was O O O O
principally O O O O
presented O O O O
in O O O O
the O O O O
fat O O O O
body O O O O
and O O O O
haemocytes O O O O
. O O O O
    
The O O O O
transcript O O O O
levels O O O O
of O O O O
HaTHY2 O O O O
showed O O O O
some O O O O
fluctuation O O O O
; O O O O
there O O O O
was O O O O
an O O O O
obvious O O O O
increase O O O O
at O O O O
the O O O O
metamorphic O O O O
stage O O O O
in O O O O
the O O O O
integument O O O O
or O O O O
fat O O O O
body O O O O
. O O O O
    
HaTHY O O O O
was O O O O
able O O O O
to O O O O
be O O O O
upregulated O O O O
by O O O O
20 O O O O
- O O O O
hydroxyecdysone O O O O
or O O O O
by O O O O
bacterial O O O O
and O O O O
viral O O O O
challenge O O O O
. O O O O
    
These O O O O
data O O O O
suggest O O O O
that O O O O
HaTHY O O O O
is O O O O
upregulated O O O O
by O O O O
the O O O O
steroid O O O O
hormone O O O O
and O O O O
by O O O O
responses O O O O
to O O O O
microorganism O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
The O O O O
cell O O O O
cycle O O O O
gene O O O O
MoCDC15 O O O O
regulates O O O O
hyphal O O O O
growth O O O O
, O O O O
asexual O O O O
development O O O O
and O O O O
plant O O O O
infection O O O O
in O O O O
the O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
blast O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pathogen O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Magnaporthe B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
oryzae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Rice O O O O
blast O O O O
, O O O O
caused O O O O
by O O O O
the O O O O
pathogen O O O O
Magnaporthe B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
oryzae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
is O O O O
a O O O O
serious O O O O
hindrance O O O O
to O O O O
rice B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
production O O O O
and O O O O
has O O O O
emerged O O O O
as O O O O
an O O O O
important O O O O
model O O O O
for O O O O
the O O O O
characterization O O O O
of O O O O
molecular O O O O
mechanisms O O O O
relevant O O O O
to O O O O
pathogenic O O O O
development O O O O
in O O O O
plants O O O O
. O O O O
    
Similar O O O O
to O O O O
other O O O O
pathogenic O O O O
fungi O O O O
, O O O O
conidiation O O O O
plays O O O O
a O O O O
central O O O O
role O O O O
in O O O O
initiation O O O O
of O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
oryzae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
infection O O O O
and O O O O
spread O O O O
over O O O O
a O O O O
large O O O O
area O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
relatively O O O O
little O O O O
is O O O O
known O O O O
regarding O O O O
the O O O O
molecular O O O O
mechanisms O O O O
that O O O O
underlie O O O O
conidiation O O O O
in O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
oryzae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
To O O O O
better O O O O
characterize O O O O
these O O O O
mechanisms O O O O
, O O O O
we O O O O
identified O O O O
a O O O O
conidiation O O O O
- O O O O
defective O O O O
mutant O O O O
, O O O O
ATMT0225B6 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
MoCDC15 B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
T O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
DNA O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
, O O O O
in O O O O
which O O O O
a O O O O
T O O O O
- O O O O
DNA O O O O
insertion O O O O
disrupted O O O O
a O O O O
gene O O O O
that O O O O
encodes O O O O
a O O O O
homolog O O O O
of O O O O
fission O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cdc15 O O O O
, O O O O
and O O O O
generated O O O O
a O O O O
second O O O O
strain O O O O
containing O O O O
a O O O O
disruption O O O O
in O O O O
the O O O O
same O O O O
allele O O O O
( O O O O
DeltaMoCDC15 O O O O
( O O O O
T O O O O
- O O O O
DNA O O O O
) O O O O
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
cdc15 O O O O
gene O O O O
has O O O O
been O O O O
shown O O O O
to O O O O
act O O O O
as O O O O
a O O O O
coordinator O O O O
of O O O O
the O O O O
cell O O O O
cycle O O O O
in O O O O
yeast B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Functional O O O O
analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
MoCDC15 O O O O
( O O O O
T O O O O
- O O O O
DNA O O O O
) O O O O
and O O O O
DeltaMoCDC15 O O O O
( O O O O
T O O O O
- O O O O
DNA O O O O
) O O O O
mutants O O O O
revealed O O O O
that O O O O
MoCDC15 O O O O
is O O O O
required O O O O
for O O O O
conidiation O O O O
, O O O O
preinfection O O O O
development O O O O
and O O O O
pathogenicity O O O O
in O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
oryzae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Conidia O O O O
from O O O O
these O O O O
mutants O O O O
were O O O O
viable O O O O
, O O O O
but O O O O
failed O O O O
to O O O O
adhere O O O O
to O O O O
hydrophobic O O O O
surface O O O O
, O O O O
a O O O O
crucial O O O O
step O O O O
required O O O O
for O O O O
subsequent O O O O
pathogenic O O O O
development O O O O
. O O O O
    
All O O O O
phenotypic O O O O
defects O O O O
observed O O O O
in O O O O
mutants O O O O
were O O O O
rescued O O O O
in O O O O
a O O O O
strain O O O O
complemented O O O O
with O O O O
wild B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
type O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
MoCDC15 O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Together O O O O
, O O O O
these O O O O
data O O O O
indicate O O O O
that O O O O
MoCDC15 O O O O
functions O O O O
as O O O O
a O O O O
coordinator O O O O
of O O O O
several O O O O
biological O O O O
processes O O O O
important O O O O
for O O O O
pathogenic O O O O
development O O O O
in O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
oryzae O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Inactivation O O O O
of O O O O
a O O O O
macronuclear O O O O
intra O O O O
- O O O O
S O O O O
- O O O O
phase O O O O
checkpoint O O O O
in O O O O
Tetrahymena B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
thermophila O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
with O O O O
caffeine O O O O
affects O O O O
the O O O O
integrity O O O O
of O O O O
the O O O O
micronuclear O O O O
genome O O O O
. O O O O
    
Aphidicolin O O O O
( O O O O
APH O O O O
) O O O O
, O O O O
an O O O O
inhibitor O O O O
of O O O O
DNA O O O O
polymerase O O O O
alpha O O O O
, O O O O
arrested O O O O
cell O O O O
divisions O O O O
in O O O O
Tetrahymena B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
thermophila O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Surprisingly O O O O
, O O O O
low O O O O
concentrations O O O O
of O O O O
APH O O O O
induced O O O O
an O O O O
increase O O O O
of O O O O
macronuclear O O O O
DNA O O O O
content O O O O
and O O O O
cell O O O O
size O O O O
in O O O O
non O O O O
- O O O O
dividing O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
In O O O O
spite O O O O
of O O O O
the O O O O
cell O O O O
size O O O O
increase O O O O
, O O O O
most O O O O
proliferation O O O O
of O O O O
basal O O O O
bodies O O O O
, O O O O
ciliogenesis O O O O
and O O O O
development O O O O
of O O O O
new O O O O
oral O O O O
primordia O O O O
were O O O O
prevented O O O O
by O O O O
the O O O O
APH O O O O
treatment O O O O
. O O O O
    
The O O O O
division O O O O
arrest O O O O
induced O O O O
by O O O O
APH O O O O
was O O O O
partly O O O O
overridden O O O O
by O O O O
caffeine O O O O
( O O O O
CAF O O O O
) O O O O
treatment O O O O
, O O O O
which O O O O
caused O O O O
the O O O O
fragmentation O O O O
( O O O O
"""" O O O O
pulverization O O O O
"""" O O O O
) O O O O
of O O O O
the O O O O
chromosomes O O O O
in O O O O
G2 O O O O
micronuclei O O O O
. O O O O
    
Somatic O O O O
progeny O O O O
of O O O O
dividers O O O O
with O O O O
pulverized O O O O
micronuclei O O O O
( O O O O
APH O O O O
+ O O O O
CAF O O O O
strains O O O O
) O O O O
contained O O O O
aneuploid O O O O
and O O O O
amicronucleate O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
The O O O O
amicronucleate O O O O
cells O O O O
, O O O O
after O O O O
losing O O O O
their O O O O
oral O O O O
structures O O O O
and O O O O
most O O O O
of O O O O
their O O O O
cilia O O O O
, O O O O
and O O O O
undergoing O O O O
progressive O O O O
disorganization O O O O
of O O O O
cortical O O O O
structures O O O O
, O O O O
assumed O O O O
an O O O O
irregular O O O O
shape O O O O
( O O O O
"""" O O O O
crinkled O O O O
"""" O O O O
) O O O O
and O O O O
were O O O O
nonviable O O O O
. O O O O
    
"""" O O O O
Crinkled O O O O
"""" O O O O
cells O O O O
were O O O O
not O O O O
formed O O O O
after O O O O
APH O O O O
+ O O O O
CAF O O O O
treatment O O O O
of O O O O
the O O O O
amicronuclear O O O O
BI3840 O O O O
strain O O O O
, O O O O
which O O O O
contains O O O O
some O O O O
mic O O O O
- O O O O
specific O O O O
sequences O O O O
in O O O O
its O O O O
macronucleus O O O O
. O O O O
    
Most O O O O
of O O O O
the O O O O
APH O O O O
+ O O O O
CAF O O O O
strains O O O O
had O O O O
a O O O O
typical O O O O
"""" O O O O
* O O O O
"""" O O O O
- O O O O
like O O O O
conjugation O O O O
phenotype O O O O
: O O O O
they O O O O
did O O O O
not O O O O
produce O O O O
pronuclei O O O O
, O O O O
but O O O O
received O O O O
them O O O O
unilaterally O O O O
from O O O O
their O O O O
mates O O O O
and O O O O
retained O O O O
old O O O O
macronuclei O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
4 O O O O
among O O O O
100 O O O O
APH O O O O
+ O O O O
CAF O O O O
clones O O O O
induced O O O O
arrest O O O O
at O O O O
meiotic O O O O
metaphase O O O O
I O O O O
in O O O O
their O O O O
wt O O O O
mates O O O O
. O O O O
    
It O O O O
is O O O O
likely O O O O
that O O O O
the O O O O
origin O O O O
of O O O O
such O O O O
clones O O O O
was O O O O
enhanced O O O O
by O O O O
chromosome O O O O
pulverization O O O O
. O O O O
    
Analysis O O O O
of O O O O
the O O O O
Fusarium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
graminearum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
species O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
complex O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
from O O O O
wheat B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
barley B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
maize B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
in O O O O
South O O O O
Africa O O O O
provides O O O O
evidence O O O O
of O O O O
species O O O O
- O O O O
specific O O O O
differences O O O O
in O O O O
host O O O O
preference O O O O
. O O O O
    
Species O O O O
identity O O O O
and O O O O
trichothecene O O O O
toxin O O O O
potential O O O O
of O O O O
560 O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
Fusarium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
graminearum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
species O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
complex O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
FGSC B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
) O O O O
collected O O O O
from O O O O
diseased O O O O
wheat B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
barley B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
maize B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
in O O O O
South O O O O
Africa O O O O
was O O O O
determined O O O O
using O O O O
a O O O O
microsphere O O O O
- O O O O
based O O O O
multilocus O O O O
genotyping O O O O
assay O O O O
. O O O O
    
Although O O O O
three O O O O
trichothecene O O O O
types O O O O
( O O O O
3 O O O O
- O O O O
ADON O O O O
, O O O O
15 O O O O
- O O O O
ADON O O O O
and O O O O
NIV O O O O
) O O O O
were O O O O
represented O O O O
among O O O O
these O O O O
isolates O O O O
, O O O O
strains O O O O
with O O O O
the O O O O
15 O O O O
- O O O O
ADON O O O O
type O O O O
predominated O O O O
on O O O O
all O O O O
three O O O O
hosts O O O O
. O O O O
    
A O O O O
significant O O O O
difference O O O O
, O O O O
however O O O O
, O O O O
was O O O O
identified O O O O
in O O O O
the O O O O
composition O O O O
of O O O O
FGSC B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
pathogens O O O O
associated O O O O
with O O O O
Gibberella O O O O
ear O O O O
rot O O O O
( O O O O
GER O O O O
) O O O O
of O O O O
maize B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
as O O O O
compared O O O O
to O O O O
Fusarium O O O O
head O O O O
blight O O O O
( O O O O
FHB O O O O
) O O O O
of O O O O
wheat B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
or O O O O
barley B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
P O O O O
& O O O O
lt O O O O
; O O O O
0 O O O O
. O O O O
001 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
graminearum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
accounted O O O O
for O O O O
more O O O O
than O O O O
85 O O O O
% O O O O
of O O O O
the O O O O
FGSC B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
isolates O O O O
associated O O O O
with O O O O
FHB O O O O
of O O O O
wheat B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
barley B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
N O O O O
= O O O O
425 O O O O
) O O O O
, O O O O
and O O O O
was O O O O
also O O O O
the O O O O
dominant O O O O
species O O O O
among O O O O
isolates O O O O
from O O O O
maize B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
roots O O O O
( O O O O
N O O O O
= O O O O
35 O O O O
) O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
with O O O O
the O O O O
exception O O O O
of O O O O
a O O O O
single O O O O
isolate O O O O
identified O O O O
as O O O O
an O O O O
interspecific O O O O
hybrid O O O O
between O O O O
Fusariumboothii B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
and O O O O
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
graminearum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
GER O O O O
of O O O O
maize B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
( O O O O
N O O O O
= O O O O
100 O O O O
) O O O O
was O O O O
exclusively O O O O
associated O O O O
with O O O O
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
boothii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
predominance O O O O
of O O O O
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
graminearum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
among O O O O
FHB O O O O
isolates O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
near O O O O
exclusivity O O O O
of O O O O
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
boothii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
among O O O O
GER O O O O
isolates O O O O
, O O O O
was O O O O
observed O O O O
across O O O O
all O O O O
cultivars O O O O
, O O O O
collection O O O O
dates O O O O
, O O O O
and O O O O
provinces O O O O
sampled O O O O
. O O O O
    
Because O O O O
these O O O O
results O O O O
suggest O O O O
a O O O O
difference O O O O
in O O O O
host O O O O
preference O O O O
among O O O O
species O O O O
of O O O O
the O O O O
FGSC B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
, O O O O
we O O O O
hypothesize O O O O
that O O O O
F B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
graminearum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
may O O O O
be O O O O
less O O O O
well O O O O
adapted O O O O
to O O O O
infect O O O O
maize B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ears O O O O
than O O O O
other O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
FGSC B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Suitability O O O O
of O O O O
different O O O O
media O O O O
for O O O O
in O O O O
vitro O O O O
cultivation O O O O
of O O O O
the O O O O
ruminal O O O O
protozoa O O O O
species O O O O
Entodinium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
caudatum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Eudiplodinium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
maggii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
Epidinium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ecaudatum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Three O O O O
protozoal O O O O
cultivation O O O O
media O O O O
were O O O O
tested O O O O
to O O O O
determine O O O O
the O O O O
medium O O O O
which O O O O
best O O O O
facilitated O O O O
growth O O O O
and O O O O
viability O O O O
of O O O O
key O O O O
B O O O O
- O O O O
type O O O O
ciliates O O O O
isolated O O O O
from O O O O
the O O O O
sheep O O O O
rumen O O O O
. O O O O
    
Entodinium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
caudatum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Eudiplodinium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
maggii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
were O O O O
grown O O O O
anaerobically O O O O
in O O O O
50 O O O O
- O O O O
ml O O O O
flasks O O O O
for O O O O
32 O O O O
days O O O O
in O O O O
Caudatum O O O O
- O O O O
type O O O O
( O O O O
C O O O O
) O O O O
, O O O O
Kisidayova O O O O
( O O O O
K O O O O
) O O O O
or O O O O
Dehority O O O O
( O O O O
M O O O O
) O O O O
medium O O O O
. O O O O
    
On O O O O
day O O O O
32 O O O O
, O O O O
in O O O O
media O O O O
K O O O O
and O O O O
M O O O O
, O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
caudatum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cell O O O O
counts O O O O
were O O O O
high O O O O
with O O O O
5 O O O O
. O O O O
6x10 O O O O
( O O O O
3 O O O O
) O O O O
and O O O O
7 O O O O
. O O O O
8x10 O O O O
( O O O O
3 O O O O
) O O O O
mL O O O O
( O O O O
- O O O O
1 O O O O
) O O O O
, O O O O
respectively O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
proportion O O O O
of O O O O
dead O O O O
cells O O O O
was O O O O
low O O O O
with O O O O
0 O O O O
. O O O O
6 O O O O
and O O O O
1 O O O O
. O O O O
4 O O O O
% O O O O
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
maggii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
concentrations O O O O
when O O O O
grown O O O O
in O O O O
medium O O O O
M O O O O
and O O O O
C O O O O
were O O O O
2 O O O O
. O O O O
7x10 O O O O
( O O O O
3 O O O O
) O O O O
and O O O O
2 O O O O
. O O O O
4x10 O O O O
( O O O O
3 O O O O
) O O O O
mL O O O O
( O O O O
- O O O O
1 O O O O
) O O O O
, O O O O
respectively O O O O
, O O O O
with O O O O
3 O O O O
. O O O O
9 O O O O
and O O O O
14 O O O O
. O O O O
1 O O O O
% O O O O
dead O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Medium O O O O
M O O O O
, O O O O
which O O O O
favoured O O O O
growth O O O O
of O O O O
both O O O O
protozoa O O O O
species O O O O
, O O O O
was O O O O
tested O O O O
again O O O O
and O O O O
Epidinium B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
ecaudatum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
included O O O O
. O O O O
    
Protozoa O O O O
were O O O O
grown O O O O
for O O O O
a O O O O
4 O O O O
- O O O O
month O O O O
period O O O O
and O O O O
samples O O O O
were O O O O
taken O O O O
in O O O O
the O O O O
last O O O O
two O O O O
months O O O O
on O O O O
days O O O O
1 O O O O
, O O O O
7 O O O O
, O O O O
35 O O O O
and O O O O
57 O O O O
. O O O O
    
Average O O O O
cell O O O O
concentrations O O O O
were O O O O
10 O O O O
. O O O O
0 O O O O
, O O O O
0 O O O O
. O O O O
8 O O O O
and O O O O
0 O O O O
. O O O O
5x10 O O O O
( O O O O
3 O O O O
) O O O O
mL O O O O
( O O O O
- O O O O
1 O O O O
) O O O O
for O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
caudatum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
maggii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
and O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
ecaudatum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
respectively O O O O
. O O O O
    
In O O O O
conclusion O O O O
, O O O O
medium O O O O
M O O O O
would O O O O
appear O O O O
to O O O O
be O O O O
the O O O O
best O O O O
choice O O O O
for O O O O
cultivating O O O O
these O O O O
three O O O O
species O O O O
in O O O O
one O O O O
medium O O O O
. O O O O
    
Synganglion O O O O
transcriptome O O O O
and O O O O
developmental O O O O
global O O O O
gene O O O O
expression O O O O
in O O O O
adult O O O O
females O O O O
of O O O O
the O O O O
American B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
dog O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tick O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Dermacentor B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
variabilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Acari O O O O
: O O O O
Ixodidae O O O O
) O O O O
. O O O O
    
454 O O O O
Pyrosequencing O O O O
was O O O O
used O O O O
to O O O O
characterize O O O O
the O O O O
expressed O O O O
genes O O O O
from O O O O
the O O O O
synganglion O O O O
and O O O O
associated O O O O
neurosecretory O O O O
organs O O O O
of O O O O
unfed O O O O
and O O O O
partially O O O O
fed O O O O
virgin O O O O
and O O O O
mated O O O O
replete O O O O
females O O O O
of O O O O
the O O O O
American B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
dog O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
tick O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Dermacentor B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
variabilis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
A O O O O
total O O O O
of O O O O
14 O O O O
, O O O O
881 O O O O
contiguous O O O O
sequences O O O O
( O O O O
contigs O O O O
) O O O O
was O O O O
assembled O O O O
, O O O O
with O O O O
an O O O O
average O O O O
size O O O O
of O O O O
229 O O O O
bp O O O O
. O O O O
    
Gene O O O O
ontology O O O O
terms O O O O
for O O O O
Level O O O O
2 O O O O
biological O O O O
processes O O O O
were O O O O
assigned O O O O
to O O O O
4366 O O O O
contigs O O O O
. O O O O
    
Seven O O O O
acetylcholinesterases O O O O
, O O O O
a O O O O
muscarinic O O O O
acetylcholine O O O O
( O O O O
ACh O O O O
) O O O O
receptor O O O O
, O O O O
two O O O O
nicotinic O O O O
ACh O O O O
receptor O O O O
Beta O O O O
- O O O O
subunits O O O O
, O O O O
two O O O O
ACh O O O O
unc O O O O
- O O O O
18 O O O O
regulators O O O O
, O O O O
two O O O O
dopamine O O O O
receptors O O O O
, O O O O
two O O O O
gamma O O O O
aminobutyric O O O O
acid O O O O
( O O O O
GABA O O O O
) O O O O
receptors O O O O
, O O O O
two O O O O
GABA O O O O
transporters O O O O
, O O O O
two O O O O
norepinephrine O O O O
transporters O O O O
and O O O O
an O O O O
octopamine O O O O
receptor O O O O
are O O O O
described O O O O
. O O O O
    
Microarrays O O O O
were O O O O
conducted O O O O
to O O O O
examine O O O O
global O O O O
gene O O O O
expression O O O O
and O O O O
quantitative O O O O
real O O O O
- O O O O
time O O O O
polymerase O O O O
chain O O O O
reaction O O O O
was O O O O
used O O O O
to O O O O
verify O O O O
expression O O O O
of O O O O
selected O O O O
neuropeptides O O O O
. O O O O
    
Hierarchical O O O O
clustering O O O O
of O O O O
all O O O O
differentially O O O O
expressed O O O O
transcripts O O O O
grouped O O O O
part O O O O
- O O O O
fed O O O O
and O O O O
replete O O O O
ticks O O O O
as O O O O
being O O O O
more O O O O
similar O O O O
in O O O O
terms O O O O
of O O O O
differentially O O O O
expressed O O O O
genes O O O O
with O O O O
unfed O O O O
ticks O O O O
as O O O O
the O O O O
outgroup O O O O
. O O O O
    
Nine O O O O
putative O O O O
neuropeptides O O O O
( O O O O
allatostatin O O O O
, O O O O
bursicon O O O O
- O O O O
Beta O O O O
, O O O O
preprocorazonin O O O O
, O O O O
glycoprotein O O O O
hormone O O O O
alpha O O O O
, O O O O
insulin O O O O
- O O O O
like O O O O
peptide O O O O
, O O O O
three O O O O
orcokinins O O O O
, O O O O
preprosulphakinin O O O O
) O O O O
and O O O O
a O O O O
gonadotropin O O O O
releasing O O O O
hormone O O O O
receptor O O O O
were O O O O
differentially O O O O
expressed O O O O
, O O O O
and O O O O
their O O O O
developmental O O O O
expression O O O O
and O O O O
role O O O O
in O O O O
reproduction O O O O
was O O O O
investigated O O O O
. O O O O
    
The O O O O
presence O O O O
of O O O O
eclosion O O O O
hormone O O O O
, O O O O
corazonin O O O O
and O O O O
bursicon O O O O
in O O O O
the O O O O
synganglion O O O O
, O O O O
which O O O O
in O O O O
insects O O O O
regulate O O O O
behaviour O O O O
and O O O O
cuticle O O O O
development O O O O
associated O O O O
with O O O O
moulting O O O O
, O O O O
suggest O O O O
that O O O O
this O O O O
system O O O O
may O O O O
be O O O O
used O O O O
in O O O O
ticks O O O O
to O O O O
regulate O O O O
blood O O O O
feeding O O O O
, O O O O
cuticle O O O O
expansion O O O O
and O O O O
development O O O O
related O O O O
to O O O O
female O O O O
reproduction O O O O
; O O O O
adult O O O O
ticks O O O O
do O O O O
not O O O O
moult O O O O
. O O O O
    
Endogenous O O O O
regulation O O O O
of O O O O
the O O O O
growth O O O O
- O O O O
rate O O O O
responses O O O O
of O O O O
a O O O O
spring O O O O
- O O O O
dwelling O O O O
strain O O O O
of O O O O
the O O O O
freshwater O O O O
alga O O O O
, O O O O
Chlorella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
minutissima O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
to O O O O
light O O O O
and O O O O
temperature O O O O
. O O O O
    
The O O O O
paper O O O O
presents O O O O
a O O O O
laboratory O O O O
investigation O O O O
of O O O O
the O O O O
temperature O O O O
- O O O O
and O O O O
light O O O O
- O O O O
dependence O O O O
of O O O O
autotrophic O O O O
growth O O O O
of O O O O
the O O O O
alga O O O O
Chlorella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
minutissima O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
It O O O O
was O O O O
isolated O O O O
from O O O O
the O O O O
storage O O O O
basin O O O O
of O O O O
a O O O O
spring O O O O
in O O O O
the O O O O
mountains O O O O
of O O O O
the O O O O
Massif O O O O
Central O O O O
, O O O O
France O O O O
. O O O O
    
The O O O O
alga O O O O
was O O O O
grown O O O O
at O O O O
temperatures O O O O
between O O O O
( O O O O
10 O O O O
and O O O O
35 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
) O O O O
and O O O O
under O O O O
irradiances O O O O
from O O O O
30 O O O O
to O O O O
550 O O O O
mumol O O O O
m O O O O
( O O O O
- O O O O
2 O O O O
) O O O O
s O O O O
( O O O O
- O O O O
1 O O O O
) O O O O
, O O O O
under O O O O
a O O O O
light O O O O
/ O O O O
dark O O O O
cycle O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
were O O O O
fitted O O O O
to O O O O
selected O O O O
descriptive O O O O
models O O O O
, O O O O
seeking O O O O
to O O O O
express O O O O
, O O O O
as O O O O
far O O O O
as O O O O
possible O O O O
, O O O O
the O O O O
observed O O O O
physiological O O O O
behaviour O O O O
of O O O O
the O O O O
strain O O O O
and O O O O
the O O O O
minimum O O O O
irradiance O O O O
required O O O O
to O O O O
sustain O O O O
net O O O O
growth O O O O
. O O O O
    
At O O O O
all O O O O
temperatures O O O O
, O O O O
the O O O O
maximum O O O O
rates O O O O
of O O O O
growth O O O O
observed O O O O
are O O O O
strikingly O O O O
slower O O O O
than O O O O
those O O O O
of O O O O
other O O O O
Chlorella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
strains O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
of O O O O
other O O O O
small O O O O
algae O O O O
, O O O O
reported O O O O
in O O O O
the O O O O
literature O O O O
, O O O O
even O O O O
when O O O O
correction O O O O
is O O O O
made O O O O
for O O O O
continuous O O O O
light O O O O
. O O O O
    
The O O O O
Q10 O O O O
statistic O O O O
for O O O O
growth O O O O
at O O O O
temperatures O O O O
& O O O O
gt O O O O
; O O O O
20 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
rates O O O O
is O O O O
also O O O O
noticeably O O O O
lower O O O O
than O O O O
in O O O O
other O O O O
species O O O O
, O O O O
while O O O O
the O O O O
apparent O O O O
threshold O O O O
of O O O O
any O O O O
growth O O O O
is O O O O
about O O O O
8 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
. O O O O
    
Growth O O O O
rates O O O O
are O O O O
readily O O O O
light O O O O
- O O O O
saturated O O O O
at O O O O
all O O O O
temperatures O O O O
but O O O O
with O O O O
little O O O O
evidence O O O O
of O O O O
adaptation O O O O
of O O O O
photosynthesis O O O O
to O O O O
low O O O O
photon O O O O
- O O O O
flux O O O O
rates O O O O
. O O O O
    
No O O O O
short O O O O
- O O O O
term O O O O
flexibility O O O O
in O O O O
these O O O O
properties O O O O
( O O O O
over O O O O
a O O O O
time O O O O
- O O O O
scale O O O O
of O O O O
days O O O O
) O O O O
was O O O O
demonstrated O O O O
during O O O O
the O O O O
course O O O O
of O O O O
our O O O O
experiments O O O O
. O O O O
    
We O O O O
deduce O O O O
that O O O O
the O O O O
algal O O O O
strain O O O O
had O O O O
become O O O O
genetically O O O O
adapted O O O O
to O O O O
the O O O O
relatively O O O O
constant O O O O
, O O O O
even O O O O
- O O O O
temperature O O O O
and O O O O
low O O O O
- O O O O
light O O O O
conditions O O O O
of O O O O
the O O O O
spring O O O O
- O O O O
water O O O O
habitat O O O O
whence O O O O
it O O O O
was O O O O
originally O O O O
isolated O O O O
. O O O O
    
Characterization O O O O
of O O O O
the O O O O
oxysterol O O O O
- O O O O
binding O O O O
protein O O O O
gene O O O O
family O O O O
in O O O O
the O O O O
yellow B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fever O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
mosquito O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Aedes B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aegypti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
The O O O O
oxysterol O O O O
- O O O O
binding O O O O
protein O O O O
( O O O O
OSBP O O O O
) O O O O
and O O O O
OSBP O O O O
- O O O O
related O O O O
proteins O O O O
( O O O O
ORPs O O O O
) O O O O
are O O O O
sterol O O O O
- O O O O
binding O O O O
proteins O O O O
that O O O O
may O O O O
be O O O O
involved O O O O
in O O O O
cellular O O O O
sterol O O O O
transportation O O O O
, O O O O
sterol O O O O
metabolism O O O O
and O O O O
signal O O O O
transduction O O O O
pathways O O O O
. O O O O
    
Four O O O O
ORP O O O O
genes O O O O
were O O O O
cloned O O O O
from O O O O
Aedes B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
aegypti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Based O O O O
on O O O O
amino O O O O
acid O O O O
sequence O O O O
homology O O O O
to O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
proteins O O O O
, O O O O
they O O O O
are O O O O
AeOSBP O O O O
, O O O O
AeORP1 O O O O
, O O O O
AeORP8 O O O O
and O O O O
AeORP9 O O O O
. O O O O
    
Splicing O O O O
variants O O O O
of O O O O
AeOSBP O O O O
and O O O O
AeORP8 O O O O
were O O O O
identified O O O O
. O O O O
    
The O O O O
temporal O O O O
and O O O O
spatial O O O O
transcription O O O O
patterns O O O O
of O O O O
members O O O O
of O O O O
the O O O O
AeOSBP O O O O
gene O O O O
family O O O O
through O O O O
developmental O O O O
stages O O O O
and O O O O
the O O O O
gonotrophic O O O O
cycle O O O O
were O O O O
profiled O O O O
. O O O O
    
AeORP1 O O O O
transcription O O O O
seemed O O O O
to O O O O
be O O O O
head O O O O
tissue O O O O
- O O O O
specific O O O O
, O O O O
whereas O O O O
AeOSBP O O O O
and O O O O
AeORP9 O O O O
expression O O O O
was O O O O
induced O O O O
by O O O O
a O O O O
bloodmeal O O O O
. O O O O
    
Furthermore O O O O
, O O O O
over O O O O
- O O O O
expression O O O O
of O O O O
AeORPs O O O O
facilitated O O O O
[ O O O O
( O O O O
3 O O O O
) O O O O
H O O O O
] O O O O
- O O O O
cholesterol O O O O
uptake O O O O
in O O O O
Ae B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
aegypti O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cultured O O O O
Aag O O O O
- O O O O
2 O O O O
cells O O O O
. O O O O
    
Identification O O O O
and O O O O
expression O O O O
analysis O O O O
of O O O O
nervous O O O O
wreck O O O O
, O O O O
which O O O O
is O O O O
preferentially O O O O
expressed O O O O
in O O O O
the O O O O
brain O O O O
of O O O O
the O O O O
male O O O O
silkworm B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
moth O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Bombyx B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mori O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Sexually O O O O
dimorphic O O O O
neural O O O O
circuits O O O O
are O O O O
essential O O O O
for O O O O
reproductive O O O O
behaviour O O O O
. O O O O
    
The O O O O
molecular O O O O
basis O O O O
of O O O O
sexual O O O O
dimorphism O O O O
in O O O O
the O O O O
silkworm B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
moth O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Bombyx B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
mori O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
brain O O O O
, O O O O
however O O O O
, O O O O
is O O O O
unclear O O O O
. O O O O
    
We O O O O
conducted O O O O
cDNA O O O O
subtraction O O O O
screening O O O O
and O O O O
identified O O O O
nervous O O O O
wreck O O O O
( O O O O
Bmnwk O O O O
) O O O O
, O O O O
a O O O O
synaptic O O O O
growth O O O O
regulatory O O O O
gene O O O O
, O O O O
whose O O O O
expression O O O O
is O O O O
higher O O O O
in O O O O
the O O O O
male O O O O
brain O O O O
than O O O O
in O O O O
the O O O O
female O O O O
brain O O O O
of O O O O
the O O O O
silkworm B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O O O O
    
Bmnwk O O O O
was O O O O
preferentially O O O O
expressed O O O O
in O O O O
the O O O O
brain O O O O
at O O O O
the O O O O
late O O O O
pupae O O O O
and O O O O
adult O O O O
stages O O O O
. O O O O
    
In O O O O
situ O O O O
hybridization O O O O
revealed O O O O
that O O O O
Bmnwk O O O O
is O O O O
highly O O O O
expressed O O O O
in O O O O
the O O O O
optic O O O O
lobe O O O O
of O O O O
the O O O O
male O O O O
moth O O O O
brain O O O O
. O O O O
    
These O O O O
findings O O O O
suggest O O O O
that O O O O
Bmnwk O O O O
has O O O O
a O O O O
role O O O O
in O O O O
the O O O O
development O O O O
and O O O O
/ O O O O
or O O O O
maintenance O O O O
of O O O O
the O O O O
optic O O O O
lobe O O O O
in O O O O
the O O O O
male O O O O
silkworm B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
brain O O O O
. O O O O
    
Infraciliature O O O O
of O O O O
eight O O O O
Triplumaria O O O O
species O O O O
( O O O O
Ciliophora O O O O
, O O O O
Entodiniomorphida O O O O
) O O O O
from O O O O
Asian B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
elephants O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
with O O O O
the O O O O
description O O O O
of O O O O
six O O O O
new O O O O
species O O O O
. O O O O
    
Intestinal O O O O
ciliates O O O O
excreted O O O O
in O O O O
the O O O O
feces O O O O
of O O O O
Asian B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
elephants O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
were O O O O
surveyed O O O O
. O O O O
    
Fourteen O O O O
species O O O O
in O O O O
the O O O O
order O O O O
Entodiniomorphida O O O O
were O O O O
detected O O O O
. O O O O
    
Nine O O O O
Triplumaria O O O O
species O O O O
in O O O O
the O O O O
family O O O O
Cycloposthiidae O O O O
were O O O O
found O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
the O O O O
silver O O O O
impregnation O O O O
, O O O O
two O O O O
known O O O O
species O O O O
, O O O O
T O O O O
. O O O O
antis O O O O
and O O O O
T O O O O
. O O O O
dvoinosi O O O O
, O O O O
were O O O O
redescribed O O O O
and O O O O
six O O O O
new O O O O
species O O O O
, O O O O
T O O O O
. O O O O
sukuna O O O O
n O O O O
. O O O O
    
sp O O O O
. O O O O
, O O O O
T O O O O
. O O O O
zuze O O O O
n O O O O
. O O O O
    
sp O O O O
. O O O O
, O O O O
T O O O O
. O O O O
solea O O O O
n O O O O
. O O O O
    
sp O O O O
. O O O O
, O O O O
T O O O O
. O O O O
suwako O O O O
n O O O O
. O O O O
    
sp O O O O
. O O O O
, O O O O
T O O O O
. O O O O
fulgora O O O O
n O O O O
. O O O O
    
sp O O O O
. O O O O
, O O O O
and O O O O
T O O O O
. O O O O
harpagonis O O O O
n O O O O
. O O O O
    
sp O O O O
. O O O O
, O O O O
were O O O O
described O O O O
. O O O O
    
T O O O O
. O O O O
sukuna O O O O
, O O O O
T O O O O
. O O O O
zuze O O O O
, O O O O
T O O O O
. O O O O
solea O O O O
, O O O O
and O O O O
T O O O O
. O O O O
suwako O O O O
have O O O O
the O O O O
perivestibular O O O O
polybrachykinety O O O O
along O O O O
the O O O O
vestibular O O O O
opening O O O O
. O O O O
    
The O O O O
buccal O O O O
infraciliary O O O O
bands O O O O
of O O O O
T O O O O
. O O O O
suwako O O O O
are O O O O
similar O O O O
to O O O O
those O O O O
of O O O O
T B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
selenica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
found O O O O
from O O O O
elephants O O O O
and O O O O
the O O O O
buccal O O O O
infraciliary O O O O
bands O O O O
of O O O O
T O O O O
. O O O O
sukuna O O O O
, O O O O
T O O O O
. O O O O
zuze O O O O
, O O O O
and O O O O
T O O O O
. O O O O
solea O O O O
are O O O O
similar O O O O
to O O O O
those O O O O
of O O O O
T O O O O
. O O O O
grypoclunis O O O O
described O O O O
from O O O O
rhinoceroses O O O O
. O O O O
    
T O O O O
. O O O O
antis O O O O
, O O O O
T O O O O
. O O O O
dvoinosi O O O O
, O O O O
T O O O O
. O O O O
fulgora O O O O
, O O O O
and O O O O
T O O O O
. O O O O
harpagonis O O O O
have O O O O
the O O O O
vestibular O O O O
polybrachykinety O O O O
extending O O O O
down O O O O
inside O O O O
the O O O O
vestibulum O O O O
as O O O O
found O O O O
in O O O O
rumen O O O O
ciliates O O O O
in O O O O
the O O O O
family O O O O
Ophryoscolecidae O O O O
. O O O O
    
The O O O O
caudalial O O O O
ciliary O O O O
zones O O O O
of O O O O
T O O O O
. O O O O
dvoinosi O O O O
and O O O O
T O O O O
. O O O O
fulgora O O O O
were O O O O
retractable O O O O
as O O O O
found O O O O
in O O O O
rumen O O O O
ophryoscolecids O O O O
. O O O O
    
Raabena B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
bella O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
Pseudoentodinium O O O O
elephantis O O O O
showed O O O O
high O O O O
composition O O O O
values O O O O
over O O O O
30 O O O O
% O O O O
. O O O O
    
Ciliate O O O O
densities O O O O
in O O O O
the O O O O
three O O O O
fecal O O O O
samples O O O O
were O O O O
0 O O O O
. O O O O
15 O O O O
, O O O O
1 O O O O
. O O O O
09 O O O O
, O O O O
and O O O O
2 O O O O
. O O O O
07x10 O O O O
( O O O O
4 O O O O
) O O O O
/ O O O O
ml O O O O
. O O O O
    
Prolixicin O O O O
: O O O O
a O O O O
novel O O O O
antimicrobial O O O O
peptide O O O O
isolated O O O O
from O O O O
Rhodnius B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
prolixus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
with O O O O
differential O O O O
activity O O O O
against O O O O
bacteria O O O O
and O O O O
Trypanosoma B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cruzi O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
We O O O O
identified O O O O
and O O O O
characterized O O O O
the O O O O
activity O O O O
of O O O O
prolixicin O O O O
, O O O O
a O O O O
novel O O O O
antimicrobial O O O O
peptide O O O O
( O O O O
AMP O O O O
) O O O O
isolated O O O O
from O O O O
the O O O O
hemipteran O O O O
insect O O O O
, O O O O
Rhodnius B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
prolixus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Sequence O O O O
analysis O O O O
reveals O O O O
one O O O O
region O O O O
of O O O O
prolixicin O O O O
that O O O O
may O O O O
be O O O O
related O O O O
to O O O O
the O O O O
diptericin O O O O
/ O O O O
attacin O O O O
family O O O O
of O O O O
AMPs O O O O
. O O O O
    
Prolixicin O O O O
is O O O O
an O O O O
11 O O O O
- O O O O
kDa O O O O
peptide O O O O
containing O O O O
a O O O O
putative O O O O
21 O O O O
amino O O O O
acid O O O O
signal O O O O
peptide O O O O
, O O O O
two O O O O
putative O O O O
phosphorylation O O O O
sites O O O O
and O O O O
no O O O O
glycosylation O O O O
sites O O O O
. O O O O
    
It O O O O
is O O O O
produced O O O O
by O O O O
both O O O O
adult O O O O
fat O O O O
body O O O O
and O O O O
midgut O O O O
tissues O O O O
in O O O O
response O O O O
to O O O O
bacterial O O O O
infection O O O O
of O O O O
the O O O O
haemolymph O O O O
or O O O O
the O O O O
midgut O O O O
. O O O O
    
Unlike O O O O
most O O O O
insect O O O O
antibacterial O O O O
peptides O O O O
, O O O O
the O O O O
prolixicin O O O O
gene O O O O
does O O O O
not O O O O
seem O O O O
to O O O O
be O O O O
regulated O O O O
by O O O O
NF O O O O
- O O O O
kappaB O O O O
binding O O O O
sites O O O O
, O O O O
but O O O O
its O O O O
promoter O O O O
region O O O O
contains O O O O
several O O O O
GATA O O O O
sites O O O O
. O O O O
    
Recombinant O O O O
prolixicin O O O O
has O O O O
strong O O O O
activity O O O O
against O O O O
the O O O O
Gram O O O O
- O O O O
negative O O O O
bacterium O O O O
Escherichia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
coli O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
differential O O O O
activity O O O O
against O O O O
several O O O O
Gram O O O O
- O O O O
negative O O O O
and O O O O
Gram O O O O
- O O O O
positive O O O O
bacteria O O O O
. O O O O
    
No O O O O
significant O O O O
toxicity O O O O
was O O O O
demonstrated O O O O
against O O O O
Trypanosoma B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cruzi O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
the O O O O
human B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
parasite O O O O
transmitted O O O O
by O O O O
R B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
prolixus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Development O O O O
Time O O O O
and O O O O
Body O O O O
Size O O O O
in O O O O
Eupolyphaga B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sinensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Along O O O O
a O O O O
Latitudinal O O O O
Gradient O O O O
From O O O O
China O O O O
. O O O O
    
The O O O O
responses O O O O
of O O O O
organisms O O O O
to O O O O
temperature O O O O
variations O O O O
may O O O O
be O O O O
via O O O O
short O O O O
term O O O O
responses O O O O
of O O O O
the O O O O
phenotype O O O O
( O O O O
phenotypic O O O O
plasticity O O O O
) O O O O
, O O O O
or O O O O
they O O O O
could O O O O
involve O O O O
long O O O O
- O O O O
term O O O O
evolutionary O O O O
change O O O O
and O O O O
adaptation O O O O
( O O O O
via O O O O
selection O O O O
) O O O O
to O O O O
the O O O O
genotype O O O O
. O O O O
    
These O O O O
could O O O O
involve O O O O
changes O O O O
to O O O O
the O O O O
mean O O O O
size O O O O
of O O O O
the O O O O
animal O O O O
or O O O O
to O O O O
the O O O O
thermal O O O O
reaction O O O O
norm O O O O
. O O O O
    
We O O O O
examined O O O O
the O O O O
effects O O O O
of O O O O
various O O O O
temperatures O O O O
( O O O O
of O O O O
22 O O O O
, O O O O
25 O O O O
, O O O O
28 O O O O
, O O O O
and O O O O
31 O O O O
^ O O O O
0C O O O O
) O O O O
on O O O O
development O O O O
time O O O O
, O O O O
adult O O O O
body O O O O
size O O O O
and O O O O
preadult O O O O
survivorship O O O O
in O O O O
three O O O O
populations O O O O
of O O O O
the O O O O
cockroach O O O O
, O O O O
Eupolyphaga B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
sinensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Walker O O O O
) O O O O
, O O O O
collected O O O O
at O O O O
different O O O O
latitudes O O O O
. O O O O
    
We O O O O
found O O O O
substantial O O O O
temperature O O O O
- O O O O
induced O O O O
plasticity O O O O
in O O O O
development O O O O
time O O O O
, O O O O
body O O O O
size O O O O
, O O O O
and O O O O
preadult O O O O
survivorship O O O O
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
developmental O O O O
temperatures O O O O
have O O O O
strong O O O O
impacts O O O O
on O O O O
growth O O O O
and O O O O
life O O O O
history O O O O
traits O O O O
of O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sinensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Genetic O O O O
differences O O O O
for O O O O
development O O O O
time O O O O
, O O O O
body O O O O
size O O O O
, O O O O
and O O O O
preadult O O O O
survivorship O O O O
were O O O O
detected O O O O
among O O O O
populations O O O O
, O O O O
and O O O O
the O O O O
three O O O O
traits O O O O
exhibited O O O O
highly O O O O
significant O O O O
variations O O O O
in O O O O
the O O O O
responses O O O O
of O O O O
different O O O O
populations O O O O
to O O O O
various O O O O
temperature O O O O
conditions O O O O
, O O O O
indicating O O O O
genetic O O O O
differences O O O O
among O O O O
populations O O O O
in O O O O
terms O O O O
of O O O O
thermal O O O O
reaction O O O O
norms O O O O
. O O O O
    
We O O O O
also O O O O
found O O O O
that O O O O
two O O O O
populations O O O O
seem O O O O
to O O O O
support O O O O
the O O O O
beneficial O O O O
acclimation O O O O
hypothesis O O O O
whereas O O O O
the O O O O
third O O O O
mid O O O O
- O O O O
latitude O O O O
population O O O O
does O O O O
not O O O O
. O O O O
    
The O O O O
results O O O O
are O O O O
likely O O O O
because O O O O
of O O O O
differences O O O O
in O O O O
season O O O O
length O O O O
and O O O O
voltinism O O O O
, O O O O
indicating O O O O
that O O O O
not O O O O
only O O O O
temperature O O O O
regime O O O O
but O O O O
also O O O O
its O O O O
interactions O O O O
with O O O O
generation O O O O
time O O O O
( O O O O
and O O O O
development O O O O
time O O O O
) O O O O
, O O O O
voltinism O O O O
, O O O O
and O O O O
season O O O O
length O O O O
are O O O O
likely O O O O
to O O O O
have O O O O
considerable O O O O
effects O O O O
on O O O O
insect O O O O
development O O O O
time O O O O
and O O O O
body O O O O
size O O O O
. O O O O
    
Overall O O O O
, O O O O
changes O O O O
in O O O O
development O O O O
time O O O O
, O O O O
body O O O O
size O O O O
, O O O O
and O O O O
preadult O O O O
survivorship O O O O
in O O O O
E B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sinensis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
can O O O O
all O O O O
be O O O O
regarded O O O O
as O O O O
adaptations O O O O
to O O O O
changing O O O O
thermal O O O O
regimes O O O O
. O O O O
    
Culture O O O O
Independent O O O O
Survey O O O O
of O O O O
the O O O O
Microbiota O O O O
of O O O O
the O O O O
Glassy B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Winged O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Sharpshooter O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Homalodisca B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
vitripennis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
Using O O O O
454 O O O O
Pyrosequencing O O O O
. O O O O
    
The O O O O
glassy B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
- O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
winged O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
sharpshooter O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
Homalodisca B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
vitripennis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Germar O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
is O O O O
an O O O O
invasive O O O O
pest O O O O
that O O O O
has O O O O
spread O O O O
across O O O O
the O O O O
southern O O O O
and O O O O
western O O O O
United O O O O
States O O O O
. O O O O
    
H B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
vitripennis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
is O O O O
highly O O O O
polyphagous O O O O
and O O O O
voracious O O O O
, O O O O
feeding O O O O
on O O O O
at O O O O
least O O O O
100 O O O O
plant O O O O
species O O O O
and O O O O
consuming O O O O
up O O O O
to O O O O
100 O O O O
times O O O O
its O O O O
weight O O O O
in O O O O
xylem O O O O
fluid O O O O
daily O O O O
. O O O O
    
The O O O O
insect O O O O
is O O O O
a O O O O
vector O O O O
of O O O O
the O O O O
phytopathogen O O O O
Xylella B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fastidiosa O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Wells O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
which O O O O
is O O O O
the O O O O
causative O O O O
agent O O O O
of O O O O
Pierce O O O O
' O O O O
s O O O O
disease O O O O
in O O O O
grapevines O O O O
. O O O O
    
To O O O O
evaluate O O O O
the O O O O
microbial O O O O
flora O O O O
associated O O O O
with O O O O
H B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
vitripennis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
, O O O O
total O O O O
DNA O O O O
extracts O O O O
from O O O O
hemolymph O O O O
, O O O O
alimentary O O O O
canal O O O O
excretions O O O O
, O O O O
and O O O O
whole O O O O
insect O O O O
bodies O O O O
were O O O O
subjected O O O O
to O O O O
16S O O O O
rDNA O O O O
pyrosequencing O O O O
using O O O O
the O O O O
bTEFAP O O O O
methodology O O O O
and O O O O
the O O O O
resulting O O O O
sequences O O O O
( O O O O
370 O O O O
- O O O O
520 O O O O
bp O O O O
in O O O O
length O O O O
) O O O O
were O O O O
compared O O O O
with O O O O
a O O O O
curated O O O O
high O O O O
quality O O O O
16S O O O O
database O O O O
derived O O O O
from O O O O
GenBank O O O O
http O O O O
: O O O O
/ O O O O
/ O O O O
www O O O O
. O O O O
ncbi O O O O
. O O O O
nlm O O O O
. O O O O
nih O O O O
. O O O O
gov O O O O
. O O O O
    
Species O O O O
from O O O O
the O O O O
genera O O O O
Wolbachia O O O O
, O O O O
Delftia O O O O
( O O O O
formerly O O O O
Pseudomonas O O O O
) O O O O
, O O O O
Pectobacterium O O O O
, O O O O
Moraxella O O O O
, O O O O
Serratia O O O O
, O O O O
Bacillus O O O O
, O O O O
and O O O O
many O O O O
others O O O O
were O O O O
detected O O O O
and O O O O
a O O O O
comprehensive O O O O
picture O O O O
of O O O O
the O O O O
microbiome O O O O
associated O O O O
with O O O O
H B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
vitripennis O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
was O O O O
established O O O O
. O O O O
    
Some O O O O
of O O O O
the O O O O
bacteria O O O O
identified O O O O
in O O O O
this O O O O
report O O O O
are O O O O
initial O O O O
discoveries O O O O
; O O O O
providing O O O O
a O O O O
breadth O O O O
of O O O O
knowledge O O O O
to O O O O
the O O O O
microbial O O O O
flora O O O O
of O O O O
this O O O O
insect O O O O
pest O O O O
can O O O O
serve O O O O
as O O O O
a O O O O
reservoir O O O O
of O O O O
information O O O O
for O O O O
developing O O O O
biological O O O O
control O O O O
strategies O O O O
. O O O O
    
Infection O O O O
by O O O O
Mycorrhizal O O O O
Fungi O O O O
Increases O O O O
Natural O O O O
Enemy O O O O
Abundance O O O O
on O O O O
Tobacco O O O O
( O O O O
Nicotiana B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
rustica O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
) O O O O
. O O O O
    
The O O O O
presence O O O O
of O O O O
arbuscular O O O O
mycorrhizal O O O O
fungi O O O O
( O O O O
AMF O O O O
) O O O O
influences O O O O
plant O O O O
nutrient O O O O
uptake O O O O
, O O O O
growth O O O O
, O O O O
and O O O O
plant O O O O
defensive O O O O
chemistry O O O O
, O O O O
thereby O O O O
directly O O O O
influencing O O O O
multi O O O O
- O O O O
trophic O O O O
interactions O O O O
. O O O O
    
Different O O O O
fungal O O O O
isolates O O O O
( O O O O
genotypes O O O O
of O O O O
the O O O O
same O O O O
fungal O O O O
species O O O O
) O O O O
have O O O O
been O O O O
shown O O O O
to O O O O
differ O O O O
in O O O O
nutrient O O O O
uptake O O O O
ability O O O O
. O O O O
    
Plants O O O O
infected O O O O
with O O O O
different O O O O
AMF O O O O
genotypes O O O O
may O O O O
vary O O O O
in O O O O
foliar O O O O
nutrient O O O O
or O O O O
defensive O O O O
chemical O O O O
levels O O O O
, O O O O
potentially O O O O
influencing O O O O
multi O O O O
- O O O O
trophic O O O O
interactions O O O O
. O O O O
    
Using O O O O
a O O O O
completely O O O O
randomized O O O O
design O O O O
, O O O O
we O O O O
compared O O O O
the O O O O
effect O O O O
of O O O O
two O O O O
isolates O O O O
of O O O O
the O O O O
mycorrhizal O O O O
fungus O O O O
Glomus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
etunicatum O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
W O O O O
. O O O O
    
N O O O O
. O O O O
    
Becker O O O O
& O O O O
amp O O O O
; O O O O
Gerdemann O O O O
on O O O O
silver B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
leaf O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
whitefly O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
( O O O O
Bemisia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
argentifolii O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Bellows O O O O
& O O O O
amp O O O O
; O O O O
Perring O O O O
) O O O O
( O O O O
Hemiptera O O O O
: O O O O
Aleyrodidae O O O O
) O O O O
and O O O O
parasitic O O O O
wasp O O O O
( O O O O
Eretmocerus B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
eremicus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Rose O O O O
& O O O O
amp O O O O
; O O O O
Zolnerowich O O O O
) O O O O
( O O O O
Hymenoptera O O O O
: O O O O
Aphelinidae O O O O
) O O O O
abundance O O O O
. O O O O
    
Whitefly O O O O
populations O O O O
were O O O O
not O O O O
influenced O O O O
by O O O O
AMF O O O O
infection O O O O
. O O O O
    
Parasite O O O O
populations O O O O
were O O O O
higher O O O O
on O O O O
plants O O O O
infected O O O O
with O O O O
the O O O O
isolate O O O O
collected O O O O
from O O O O
Georgia O O O O
, O O O O
even O O O O
after O O O O
controlling O O O O
for O O O O
whitefly O O O O
abundance O O O O
and O O O O
plant O O O O
architecture O O O O
. O O O O
    
We O O O O
propose O O O O
that O O O O
AMF O O O O
indirectly O O O O
influences O O O O
parasite O O O O
abundance O O O O
and O O O O
parasitism O O O O
through O O O O
a O O O O
change O O O O
in O O O O
leaf O O O O
surface O O O O
chemicals O O O O
that O O O O
affect O O O O
parasitic O O O O
wasps O O O O
. O O O O
    
Because O O O O
of O O O O
the O O O O
ubiquity O O O O
of O O O O
and O O O O
genetic O O O O
variation O O O O
in O O O O
AMF O O O O
, O O O O
multi O O O O
- O O O O
trophic O O O O
interactions O O O O
are O O O O
likely O O O O
to O O O O
be O O O O
strongly O O O O
influenced O O O O
by O O O O
belowground O O O O
processes O O O O
. O O O O
    
The O O O O
ability O O O O
of O O O O
selected O O O O
pupal O O O O
parasitoids O O O O
( O O O O
hymenoptera O O O O
: O O O O
pteromalidae O O O O
) O O O O
to O O O O
locate O O O O
stable B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fly O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
hosts O O O O
in O O O O
a O O O O
soiled O O O O
equine O O O O
bedding O O O O
substrate O O O O
. O O O O
    
The O O O O
ability O O O O
of O O O O
Spalangia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
cameroni O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Perkins O O O O
, O O O O
Spalangia B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
endius O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Walker O O O O
, O O O O
and O O O O
Muscidifurax B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
raptorellus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
Kogan O O O O
and O O O O
Legner O O O O
to O O O O
locate O O O O
and O O O O
attack O O O O
stable B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fly O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
hosts O O O O
was O O O O
evaluated O O O O
under O O O O
laboratory O O O O
conditions O O O O
. O O O O
    
Postfeeding O O O O
third O O O O
- O O O O
instar O O O O
stable B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fly O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
larvae O O O O
were O O O O
released O O O O
and O O O O
allowed O O O O
to O O O O
pupate O O O O
in O O O O
two O O O O
arena O O O O
types O O O O
: O O O O
large O O O O
4 O O O O
. O O O O
8 O O O O
liter O O O O
chambers O O O O
containing O O O O
a O O O O
field O O O O
- O O O O
collected O O O O
, O O O O
soiled O O O O
equine O O O O
bedding O O O O
substrate O O O O
; O O O O
or O O O O
120 O O O O
- O O O O
ml O O O O
plastic O O O O
cups O O O O
containing O O O O
wood O O O O
chips O O O O
. O O O O
    
At O O O O
the O O O O
time O O O O
of O O O O
fly O O O O
pupariation O O O O
, O O O O
parasitoids O O O O
were O O O O
released O O O O
and O O O O
permitted O O O O
72 O O O O
h O O O O
to O O O O
locate O O O O
and O O O O
attack O O O O
hosts O O O O
. O O O O
    
On O O O O
average O O O O
, O O O O
parasitism O O O O
rates O O O O
of O O O O
freely O O O O
accessible O O O O
stable B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
fly O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
pupae O O O O
in O O O O
cups O O O O
were O O O O
not O O O O
significantly O O O O
different O O O O
between O O O O
parasitoid O O O O
species O O O O
. O O O O
    
However O O O O
, O O O O
parasitism O O O O
rates O O O O
in O O O O
chambers O O O O
containing O O O O
either O O O O
Spalangia O O O O
spp O O O O
. O O O O
were O O O O
= O O O O
50 O O O O
- O O O O
fold O O O O
more O O O O
than O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
raptorellus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
. O O O O
    
Additional O O O O
intraspecies O O O O
analysis O O O O
revealed O O O O
that O O O O
parasitism O O O O
rates O O O O
both O O O O
by O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
cameroni O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
and O O O O
S B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
endius O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
were O O O O
not O O O O
significantly O O O O
different O O O O
when O O O O
pupae O O O O
were O O O O
freely O O O O
accessible O O O O
or O O O O
within O O O O
bedding O O O O
, O O O O
whereas O O O O
M B-ENTITY I-ENTITY B-ENTITY B-ENTITY
. O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
raptorellus O I-ENTITY I-ENTITY I-ENTITY
attacked O O O O
significantly O O O O
more O O O O
pupae O O O O
in O O O O
cups O O O O
than O O O O
in O O O O
the O O O O
larger O O O O
chambers O O O O
where O O O O
hosts O O O O
were O O O O
distributed O O O O
within O O O O
bedding O O O O
. O O O O
    
These O O O O
results O O O O
suggest O O O O
that O O O O
Spalangia O O O O
spp O O O O
. O O O O
are O O O O
more O O O O
suited O O O O
to O O O O
successfully O O O O
locate O O O O
and O O O O
attack O O O O
hosts O O O O
in O O O O
habitats O O O O
created O O O O
by O O O O
equine O O O O
husbandry O O O O
in O O O O
Florida O O O O
. O O O O
    
Therefore O O O O
, O O O O
commercially O O O O
available O O O O
parasitoid O O O O
mixtures O O O O
containing O O O O
Muscidifurax O O O O
spp O O O O
. O O O O
may O O O O
be O O O O
ineffective O O O O
if O O O O
used O O O O
as O O O O
a O O O O
control O O O O
measure O O O O
at O O O O
Florida O O O O
equine O O O O
facilities O O O O
. O O O O
    
