#!/bin/bash
#$ -cwd
#$ -l gpu_1=1
#$ -l h_rt=1:00:00
#$ -j y
#$ -m abe
#$ -M oshima.sho.44a@st.kyoto-u.ac.jp
#$ -o /home/8/uu04598/logs_1/test.log

# 必要なモジュールをロード
module load cuda/12.1.0
source ~/myenv/bin/activate

# 実行するスクリプト
python /home/8/uu04598/SupGCL/Finetuning/cancer_rel_class.py \
    --method  w_o_pretrain \
    --data /home/8/uu04598/Breast_GCL/data/graph_data_object/tcga_graphs.pkl \
    --labels /home/8/uu04598/Breast_GCL/data/node_GOdata/gene_with_cancer_relation.csv \

# python /home/8/uu04598/SupGCL/Finetuning/CC_class.py \
#     --method  w_o_pretrain \
#     --data /home/8/uu04598/Breast_GCL/data/graph_data_object/tcga_graphs.pkl \
#     --labels /home/8/uu04598/Breast_GCL/data/node_GOdata/gene_with_CC_multilabels_4class.csv \

# python /home/8/uu04598/SupGCL/Finetuning/subtype_class.py \
#     --method supgcl  \
#     --ckpt /home/8/uu04598/Breast_GCL/Pretrain/SupGCL/checkpoints/latest/bs4_lr0.000237_epoch3000_tauN0.25_tauG0.25_dim64_subsamp8/ep1500.pt  \
#     --data /home/8/uu04598/Breast_GCL/data/graph_data_object/tcga_graphs.pkl \
#     --subtype /home/8/uu04598/Breast_GCL/data/survival_data/subtype.csv

# python /home/8/uu04598/SupGCL/Finetuning/subtype_class.py \
#     --method w_o_pretrain  \
#     --data /home/8/uu04598/Breast_GCL/data/graph_data_object/tcga_graphs.pkl \
#     --subtype /home/8/uu04598/Breast_GCL/data/survival_data/subtype.csv
